View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0896_high_29 (Length: 263)

Name: NF0896_high_29
Description: NF0896
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0896_high_29
NF0896_high_29
[»] chr8 (65 HSPs)
chr8 (1-234)||(43079662-43079895)
chr8 (1-234)||(43082033-43082266)
chr8 (1-234)||(24873223-24873456)
chr8 (1-234)||(18810768-18811000)
chr8 (1-234)||(27829357-27829589)
chr8 (1-234)||(27827046-27827278)
chr8 (1-234)||(32339369-32339602)
chr8 (1-234)||(608794-609027)
chr8 (1-234)||(14807811-14808044)
chr8 (1-234)||(44720903-44721136)
chr8 (1-234)||(3874070-3874303)
chr8 (1-234)||(28283262-28283494)
chr8 (39-234)||(18812980-18813174)
chr8 (1-234)||(4424078-4424311)
chr8 (1-234)||(15809279-15809511)
chr8 (1-234)||(28251609-28251842)
chr8 (1-193)||(27106981-27107172)
chr8 (1-234)||(22684695-22684931)
chr8 (1-234)||(30480545-30480778)
chr8 (1-192)||(27911075-27911264)
chr8 (1-192)||(27957494-27957683)
chr8 (1-234)||(15068041-15068274)
chr8 (1-186)||(14477336-14477520)
chr8 (1-234)||(15072770-15073004)
chr8 (1-183)||(14419285-14419466)
chr8 (1-185)||(1225226-1225409)
chr8 (1-186)||(5372269-5372453)
chr8 (1-183)||(13858578-13858759)
chr8 (1-193)||(36865598-36865786)
chr8 (1-158)||(33541507-33541663)
chr8 (39-232)||(43530213-43530406)
chr8 (1-234)||(41384804-41385037)
chr8 (1-234)||(25952581-25952814)
chr8 (24-193)||(21482397-21482561)
chr8 (31-193)||(15956051-15956208)
chr8 (1-234)||(41382733-41382955)
chr8 (24-193)||(3005716-3005880)
chr8 (24-193)||(21480589-21480753)
chr8 (1-138)||(5622877-5623013)
chr8 (1-193)||(15185799-15185985)
chr8 (32-193)||(31162303-31162460)
chr8 (1-140)||(26775261-26775400)
chr8 (64-198)||(181622-181758)
chr8 (29-160)||(37214317-37214438)
chr8 (1-104)||(35872555-35872653)
chr8 (79-193)||(31578362-31578476)
chr8 (76-234)||(31035252-31035411)
chr8 (23-157)||(31573847-31573975)
chr8 (1-52)||(12517248-12517299)
chr8 (16-110)||(31035144-31035235)
chr8 (94-180)||(13985176-13985262)
chr8 (1-41)||(3886153-3886193)
chr8 (93-157)||(17847677-17847740)
chr8 (37-122)||(2468261-2468341)
chr8 (148-193)||(2468214-2468259)
chr8 (97-157)||(3276347-3276405)
chr8 (79-157)||(3895957-3896035)
chr8 (94-157)||(9021228-9021289)
chr8 (94-157)||(16752643-16752704)
chr8 (94-157)||(16757388-16757449)
chr8 (94-157)||(28327908-28327969)
chr8 (94-157)||(28895502-28895563)
chr8 (94-157)||(30423212-30423274)
chr8 (97-157)||(590797-590855)
chr8 (97-157)||(33032657-33032715)
[»] chr4 (109 HSPs)
chr4 (1-234)||(44599880-44600113)
chr4 (1-234)||(16934185-16934418)
chr4 (3-234)||(22782780-22783011)
chr4 (1-234)||(16931831-16932064)
chr4 (1-234)||(18847211-18847444)
chr4 (3-234)||(22780415-22780646)
chr4 (1-234)||(9176516-9176749)
chr4 (1-234)||(11006279-11006512)
chr4 (1-234)||(18709206-18709438)
chr4 (1-234)||(51015304-51015536)
chr4 (1-234)||(11008610-11008841)
chr4 (1-234)||(22046728-22046960)
chr4 (1-234)||(8631461-8631694)
chr4 (4-234)||(38409266-38409495)
chr4 (1-234)||(22044433-22044665)
chr4 (1-234)||(22132434-22132665)
chr4 (1-234)||(2484915-2485147)
chr4 (1-230)||(9174192-9174421)
chr4 (1-234)||(11435013-11435245)
chr4 (1-234)||(22134659-22134890)
chr4 (1-234)||(5198478-5198711)
chr4 (9-234)||(26086019-26086243)
chr4 (1-234)||(31849641-31849874)
chr4 (1-234)||(9148311-9148543)
chr4 (1-234)||(24348276-24348509)
chr4 (1-234)||(40637132-40637365)
chr4 (1-234)||(7941379-7941614)
chr4 (1-234)||(37089414-37089646)
chr4 (4-219)||(3824627-3824842)
chr4 (1-234)||(6764897-6765135)
chr4 (4-234)||(14633380-14633609)
chr4 (2-193)||(24880510-24880700)
chr4 (1-234)||(47868459-47868692)
chr4 (2-234)||(24879048-24879281)
chr4 (1-234)||(24888854-24889087)
chr4 (1-234)||(48486377-48486610)
chr4 (5-217)||(5637524-5637736)
chr4 (1-193)||(22802818-22803009)
chr4 (1-234)||(47210794-47211015)
chr4 (1-234)||(36921535-36921769)
chr4 (1-193)||(12395929-12396120)
chr4 (1-193)||(16453367-16453558)
chr4 (5-234)||(38928219-38928449)
chr4 (1-234)||(22800904-22801137)
chr4 (1-234)||(33415530-33415762)
chr4 (1-234)||(47274785-47275017)
chr4 (1-193)||(12400891-12401082)
chr4 (1-193)||(40091499-40091690)
chr4 (1-192)||(36378350-36378540)
chr4 (1-234)||(36919626-36919860)
chr4 (1-234)||(14787473-14787706)
chr4 (1-193)||(37313150-37313341)
chr4 (16-193)||(13544032-13544208)
chr4 (1-234)||(17662287-17662509)
chr4 (1-193)||(18409431-18409622)
chr4 (1-185)||(56030502-56030685)
chr4 (1-193)||(19095940-19096132)
chr4 (1-217)||(619506-619722)
chr4 (16-193)||(19322769-19322942)
chr4 (19-186)||(36380425-36380591)
chr4 (17-193)||(41997566-41997741)
chr4 (1-193)||(52942543-52942721)
chr4 (1-172)||(3937314-3937484)
chr4 (1-162)||(6132930-6133090)
chr4 (24-193)||(18534917-18535082)
chr4 (1-219)||(53405188-53405411)
chr4 (24-193)||(18537559-18537724)
chr4 (56-193)||(16455354-16455490)
chr4 (23-193)||(38890310-38890476)
chr4 (26-179)||(27499128-27499280)
chr4 (16-193)||(8756336-8756510)
chr4 (89-193)||(2891437-2891540)
chr4 (138-234)||(11437557-11437653)
chr4 (91-234)||(13547302-13547445)
chr4 (1-104)||(38270158-38270261)
chr4 (139-234)||(5635518-5635614)
chr4 (31-193)||(30136640-30136798)
chr4 (78-193)||(12102221-12102336)
chr4 (77-193)||(15032633-15032748)
chr4 (1-104)||(24446756-24446854)
chr4 (121-234)||(4215483-4215597)
chr4 (23-177)||(28453767-28453915)
chr4 (78-234)||(31983569-31983727)
chr4 (1-60)||(2891375-2891434)
chr4 (16-79)||(5101070-5101133)
chr4 (23-155)||(9863791-9863917)
chr4 (79-146)||(25357772-25357838)
chr4 (79-193)||(47150978-47151092)
chr4 (16-157)||(40999071-40999208)
chr4 (23-156)||(10112952-10113080)
chr4 (94-234)||(16185877-16186018)
chr4 (23-122)||(10114412-10114505)
chr4 (93-155)||(3982300-3982362)
chr4 (94-157)||(5336903-5336964)
chr4 (129-167)||(38270120-38270158)
chr4 (145-186)||(5101130-5101171)
chr4 (16-157)||(9022380-9022516)
chr4 (97-157)||(16489352-16489410)
chr4 (97-157)||(25699752-25699810)
chr4 (94-157)||(4570094-4570155)
chr4 (94-157)||(7050378-7050439)
chr4 (94-157)||(11853549-11853610)
chr4 (115-157)||(23001523-23001566)
chr4 (97-157)||(4556180-4556238)
chr4 (97-157)||(4558314-4558372)
chr4 (97-157)||(8529270-8529328)
chr4 (97-157)||(15316961-15317019)
chr4 (97-157)||(18586969-18587027)
chr4 (97-157)||(31300427-31300485)
[»] chr1 (100 HSPs)
chr1 (1-234)||(16226171-16226404)
chr1 (1-234)||(47179717-47179950)
chr1 (1-234)||(47177366-47177599)
chr1 (1-234)||(46431752-46431984)
chr1 (1-234)||(9463288-9463521)
chr1 (1-234)||(28840684-28840916)
chr1 (1-234)||(51750043-51750276)
chr1 (1-234)||(9459461-9459694)
chr1 (1-226)||(20302463-20302687)
chr1 (1-234)||(6823019-6823251)
chr1 (1-234)||(31735565-31735798)
chr1 (1-229)||(28842499-28842726)
chr1 (1-234)||(10399872-10400105)
chr1 (1-227)||(20291461-20291686)
chr1 (1-234)||(27336984-27337215)
chr1 (1-234)||(21948232-21948464)
chr1 (1-234)||(2617520-2617753)
chr1 (1-234)||(15294878-15295111)
chr1 (1-234)||(39932077-39932310)
chr1 (1-234)||(47906274-47906507)
chr1 (1-186)||(13215085-13215269)
chr1 (1-234)||(13761841-13762073)
chr1 (1-234)||(15823550-15823783)
chr1 (1-234)||(17324680-17324913)
chr1 (1-230)||(27339179-27339407)
chr1 (5-234)||(51752373-51752600)
chr1 (1-234)||(12302549-12302782)
chr1 (64-234)||(16231630-16231800)
chr1 (7-193)||(24325673-24325858)
chr1 (1-234)||(50307590-50307824)
chr1 (1-193)||(16428657-16428848)
chr1 (9-193)||(38925564-38925747)
chr1 (1-219)||(48665181-48665400)
chr1 (1-193)||(6823889-6824087)
chr1 (4-193)||(39462526-39462714)
chr1 (1-193)||(18307113-18307304)
chr1 (1-193)||(50076758-50076949)
chr1 (1-234)||(41646924-41647157)
chr1 (1-193)||(17186214-17186405)
chr1 (1-193)||(18839591-18839782)
chr1 (1-193)||(50078907-50079098)
chr1 (4-234)||(6995744-6995974)
chr1 (4-193)||(9241172-9241360)
chr1 (1-193)||(25127876-25128067)
chr1 (1-192)||(2510412-2510601)
chr1 (1-193)||(6756531-6756721)
chr1 (4-186)||(25251368-25251549)
chr1 (1-193)||(3579702-3579893)
chr1 (1-193)||(31425101-31425296)
chr1 (4-193)||(14098056-14098244)
chr1 (1-185)||(31422967-31423151)
chr1 (1-185)||(28998347-28998530)
chr1 (1-185)||(29004063-29004246)
chr1 (1-186)||(4131473-4131656)
chr1 (4-193)||(11457561-11457749)
chr1 (1-193)||(17324069-17324258)
chr1 (1-193)||(31489919-31490108)
chr1 (16-185)||(50248666-50248834)
chr1 (1-234)||(2949275-2949508)
chr1 (93-234)||(23785935-23786076)
chr1 (1-193)||(17318897-17319082)
chr1 (21-192)||(15669481-15669648)
chr1 (1-193)||(40133948-40134139)
chr1 (1-185)||(28207160-28207343)
chr1 (16-193)||(42922252-42922425)
chr1 (89-234)||(51757623-51757767)
chr1 (43-193)||(16432440-16432589)
chr1 (1-217)||(47451652-47451862)
chr1 (16-193)||(8347359-8347532)
chr1 (24-193)||(14183678-14183843)
chr1 (64-193)||(25248638-25248766)
chr1 (89-193)||(16429049-16429152)
chr1 (16-193)||(8349138-8349311)
chr1 (16-193)||(18800659-18800832)
chr1 (24-193)||(49495297-49495461)
chr1 (77-193)||(6115189-6115304)
chr1 (24-193)||(13125544-13125711)
chr1 (139-234)||(23816027-23816123)
chr1 (16-186)||(26520206-26520379)
chr1 (79-193)||(30738716-30738830)
chr1 (79-157)||(155788-155865)
chr1 (77-193)||(30790487-30790602)
chr1 (75-193)||(16561544-16561662)
chr1 (79-193)||(26613326-26613440)
chr1 (23-157)||(27916525-27916653)
chr1 (20-157)||(28279292-28279424)
chr1 (79-155)||(26332613-26332688)
chr1 (94-157)||(4144804-4144865)
chr1 (97-234)||(21353391-21353525)
chr1 (79-157)||(14353047-14353126)
chr1 (1-37)||(16432409-16432445)
chr1 (94-157)||(2232597-2232658)
chr1 (94-157)||(14997040-14997101)
chr1 (1-36)||(25248756-25248791)
chr1 (21-122)||(26332719-26332814)
chr1 (79-186)||(49959129-49959237)
chr1 (97-157)||(2401342-2401400)
chr1 (97-157)||(9526469-9526527)
chr1 (1-37)||(16231605-16231641)
chr1 (97-157)||(25134074-25134132)
[»] chr3 (119 HSPs)
chr3 (1-234)||(50493983-50494216)
chr3 (7-234)||(28413072-28413299)
chr3 (1-234)||(455891-456124)
chr3 (1-234)||(458268-458501)
chr3 (1-234)||(6065836-6066069)
chr3 (1-234)||(6063486-6063719)
chr3 (1-234)||(10621570-10621803)
chr3 (1-234)||(38210354-38210587)
chr3 (1-234)||(746741-746974)
chr3 (1-234)||(25388890-25389122)
chr3 (1-232)||(4103938-4104168)
chr3 (1-234)||(38890024-38890257)
chr3 (1-234)||(3859512-3859744)
chr3 (1-230)||(5191637-5191865)
chr3 (1-234)||(4308321-4308554)
chr3 (1-183)||(35777405-35777587)
chr3 (1-234)||(18099210-18099443)
chr3 (5-234)||(43228279-43228508)
chr3 (1-234)||(10084429-10084662)
chr3 (1-234)||(25533426-25533659)
chr3 (1-234)||(43226070-43226302)
chr3 (1-234)||(11170388-11170621)
chr3 (1-234)||(30005825-30006058)
chr3 (1-193)||(6561794-6561985)
chr3 (1-193)||(22114387-22114578)
chr3 (1-193)||(28102084-28102275)
chr3 (21-234)||(1321483-1321696)
chr3 (1-234)||(18096940-18097173)
chr3 (1-234)||(42990288-42990521)
chr3 (1-234)||(45882923-45883156)
chr3 (1-217)||(43423520-43423736)
chr3 (15-234)||(1313407-1313626)
chr3 (4-234)||(9604647-9604877)
chr3 (16-234)||(53917704-53917922)
chr3 (1-234)||(10956067-10956300)
chr3 (1-234)||(10958363-10958596)
chr3 (1-234)||(27101221-27101454)
chr3 (1-186)||(18162647-18162831)
chr3 (1-193)||(3314668-3314859)
chr3 (1-234)||(5522667-5522888)
chr3 (1-234)||(1626723-1626956)
chr3 (1-234)||(51727047-51727279)
chr3 (1-193)||(32264121-32264312)
chr3 (1-183)||(5926856-5927037)
chr3 (1-234)||(10191350-10191582)
chr3 (1-234)||(29956670-29956903)
chr3 (1-193)||(39715453-39715644)
chr3 (1-217)||(43421472-43421688)
chr3 (1-173)||(28100143-28100314)
chr3 (39-234)||(7606628-7606822)
chr3 (1-219)||(26720532-26720749)
chr3 (1-178)||(24979691-24979867)
chr3 (16-193)||(53915578-53915754)
chr3 (4-234)||(51943358-51943587)
chr3 (1-193)||(47148977-47149168)
chr3 (5-234)||(880491-880721)
chr3 (1-234)||(36011811-36012044)
chr3 (1-193)||(53468538-53468728)
chr3 (5-178)||(12268061-12268235)
chr3 (4-178)||(28181009-28181182)
chr3 (1-234)||(35917983-35918222)
chr3 (16-185)||(48361761-48361929)
chr3 (1-193)||(54691656-54691847)
chr3 (1-193)||(28761511-28761701)
chr3 (32-186)||(15780886-15781039)
chr3 (16-193)||(23637025-23637198)
chr3 (1-180)||(31151333-31151507)
chr3 (43-234)||(51674806-51674997)
chr3 (24-193)||(13420268-13420432)
chr3 (1-193)||(889855-890044)
chr3 (30-234)||(6484372-6484577)
chr3 (1-150)||(42992270-42992417)
chr3 (78-234)||(5886261-5886415)
chr3 (78-234)||(5899734-5899888)
chr3 (39-186)||(32219106-32219252)
chr3 (68-193)||(25688243-25688367)
chr3 (65-193)||(6231849-6231975)
chr3 (24-193)||(17795269-17795433)
chr3 (24-193)||(19103709-19103873)
chr3 (24-186)||(25635391-25635549)
chr3 (39-166)||(28137415-28137541)
chr3 (43-217)||(53591210-53591384)
chr3 (16-234)||(23633458-23633671)
chr3 (1-109)||(41849136-41849244)
chr3 (24-186)||(561866-562024)
chr3 (38-193)||(4666535-4666691)
chr3 (1-193)||(54884141-54884329)
chr3 (17-186)||(1673975-1674140)
chr3 (81-234)||(11168165-11168318)
chr3 (16-186)||(53597238-53597404)
chr3 (1-85)||(11163134-11163218)
chr3 (16-234)||(36871341-36871557)
chr3 (95-193)||(3306839-3306936)
chr3 (1-71)||(47701798-47701868)
chr3 (61-158)||(4560401-4560497)
chr3 (1-70)||(6231433-6231502)
chr3 (126-186)||(24181488-24181548)
chr3 (16-122)||(24177278-24177380)
chr3 (17-71)||(27635830-27635884)
chr3 (79-234)||(1620501-1620657)
chr3 (145-234)||(47701711-47701801)
chr3 (16-154)||(13419883-13420015)
chr3 (1-60)||(3306783-3306842)
chr3 (79-193)||(14634524-14634638)
chr3 (1-48)||(15780844-15780891)
chr3 (24-122)||(25633930-25634024)
chr3 (141-234)||(27635698-27635792)
chr3 (79-157)||(11066652-11066731)
chr3 (97-157)||(27762107-27762165)
chr3 (94-157)||(10094195-10094256)
chr3 (94-157)||(10201075-10201136)
chr3 (94-157)||(16462203-16462264)
chr3 (94-157)||(22626105-22626166)
chr3 (94-157)||(47883003-47883064)
chr3 (111-157)||(11007633-11007679)
chr3 (61-106)||(7606828-7606873)
chr3 (97-234)||(29913998-29914132)
chr3 (97-157)||(47878292-47878350)
chr3 (97-157)||(54193229-54193287)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-234)||(54-287)
[»] chr7 (94 HSPs)
chr7 (1-234)||(7351694-7351927)
chr7 (3-234)||(7349315-7349546)
chr7 (3-234)||(1046967-1047197)
chr7 (1-234)||(1049338-1049570)
chr7 (1-234)||(31155953-31156186)
chr7 (1-234)||(40836785-40837017)
chr7 (1-234)||(38394000-38394233)
chr7 (1-234)||(3035735-3035971)
chr7 (1-234)||(7472022-7472255)
chr7 (1-234)||(20297376-20297609)
chr7 (1-233)||(7470065-7470297)
chr7 (1-234)||(44724593-44724826)
chr7 (1-234)||(48457667-48457900)
chr7 (1-234)||(1849995-1850228)
chr7 (1-234)||(3878591-3878824)
chr7 (1-234)||(20626052-20626285)
chr7 (1-234)||(20629943-20630176)
chr7 (1-234)||(20642362-20642595)
chr7 (4-234)||(25542547-25542775)
chr7 (1-234)||(40946342-40946575)
chr7 (1-230)||(18345555-18345784)
chr7 (3-234)||(20299475-20299707)
chr7 (1-193)||(20137193-20137384)
chr7 (3-220)||(11757245-11757463)
chr7 (1-234)||(27306272-27306504)
chr7 (1-234)||(28487567-28487800)
chr7 (4-193)||(443612-443800)
chr7 (1-232)||(35643-35874)
chr7 (1-193)||(13099560-13099751)
chr7 (1-193)||(28485580-28485771)
chr7 (6-193)||(25276160-25276346)
chr7 (1-186)||(11355272-11355456)
chr7 (1-193)||(21680041-21680232)
chr7 (1-193)||(24748608-24748799)
chr7 (1-193)||(31435131-31435322)
chr7 (1-219)||(44578-44796)
chr7 (1-193)||(42331081-42331274)
chr7 (1-217)||(4295993-4296210)
chr7 (1-186)||(21678080-21678264)
chr7 (1-193)||(37412211-37412403)
chr7 (1-193)||(27832717-27832908)
chr7 (1-234)||(9680833-9681067)
chr7 (1-193)||(39146071-39146262)
chr7 (4-234)||(21592185-21592415)
chr7 (16-234)||(43253559-43253776)
chr7 (16-193)||(9679088-9679264)
chr7 (1-181)||(26804583-26804765)
chr7 (1-234)||(42223171-42223405)
chr7 (1-234)||(21990164-21990397)
chr7 (5-193)||(22828717-22828904)
chr7 (1-193)||(24258477-24258668)
chr7 (57-234)||(7092254-7092431)
chr7 (93-234)||(2935374-2935515)
chr7 (93-234)||(1606486-1606626)
chr7 (65-234)||(38396713-38396881)
chr7 (5-186)||(22251641-22251813)
chr7 (57-234)||(7094502-7094678)
chr7 (93-234)||(9027236-9027376)
chr7 (93-234)||(22137184-22137324)
chr7 (16-183)||(24813593-24813755)
chr7 (93-234)||(40552211-40552351)
chr7 (93-234)||(22108173-22108313)
chr7 (93-234)||(40549933-40550073)
chr7 (16-193)||(24817438-24817610)
chr7 (21-193)||(20091629-20091797)
chr7 (1-105)||(18567627-18567731)
chr7 (24-186)||(24465578-24465735)
chr7 (16-186)||(7188571-7188737)
chr7 (24-135)||(22392502-22392608)
chr7 (16-157)||(11081540-11081675)
chr7 (126-193)||(6348920-6348987)
chr7 (127-193)||(26295586-26295652)
chr7 (79-156)||(16297146-16297222)
chr7 (142-193)||(22393876-22393927)
chr7 (79-193)||(6332311-6332425)
chr7 (1-48)||(38396330-38396377)
chr7 (82-188)||(40281466-40281572)
chr7 (79-157)||(11084467-11084544)
chr7 (16-157)||(6048903-6049039)
chr7 (94-157)||(21369642-21369703)
chr7 (94-230)||(25351353-25351486)
chr7 (79-157)||(26210631-26210710)
chr7 (94-157)||(2120899-2120960)
chr7 (94-157)||(3320171-3320232)
chr7 (94-157)||(3324919-3324980)
chr7 (94-157)||(7069780-7069841)
chr7 (94-157)||(7074787-7074848)
chr7 (94-157)||(25357047-25357108)
chr7 (94-157)||(25405393-25405454)
chr7 (94-157)||(25410130-25410191)
chr7 (94-157)||(42006663-42006724)
chr7 (136-234)||(6046641-6046741)
chr7 (97-157)||(30246973-30247031)
chr7 (97-157)||(44512646-44512704)
[»] chr5 (85 HSPs)
chr5 (1-234)||(15552249-15552482)
chr5 (1-234)||(31179413-31179646)
chr5 (1-234)||(31545084-31545317)
chr5 (1-234)||(31542739-31542971)
chr5 (1-234)||(34477095-34477329)
chr5 (1-234)||(2174923-2175155)
chr5 (1-234)||(38882110-38882342)
chr5 (1-234)||(34479460-34479694)
chr5 (5-234)||(4236637-4236866)
chr5 (1-234)||(21684494-21684726)
chr5 (5-234)||(6745077-6745305)
chr5 (1-234)||(25804029-25804262)
chr5 (1-234)||(10529141-10529374)
chr5 (1-234)||(39854487-39854720)
chr5 (1-232)||(16776162-16776392)
chr5 (1-234)||(21948030-21948263)
chr5 (1-234)||(25921515-25921748)
chr5 (1-234)||(6747310-6747541)
chr5 (1-219)||(18469015-18469233)
chr5 (1-234)||(18466688-18466921)
chr5 (1-234)||(18511254-18511487)
chr5 (4-234)||(27910457-27910687)
chr5 (1-219)||(27912540-27912758)
chr5 (5-193)||(1189693-1189880)
chr5 (1-185)||(16092292-16092475)
chr5 (1-193)||(40221526-40221717)
chr5 (1-178)||(18509417-18509593)
chr5 (1-193)||(17072887-17073078)
chr5 (1-192)||(25904107-25904297)
chr5 (4-178)||(6756501-6756674)
chr5 (1-193)||(39398077-39398268)
chr5 (19-234)||(658395-658610)
chr5 (1-193)||(31472697-31472888)
chr5 (5-193)||(34530750-34530937)
chr5 (64-234)||(4410090-4410259)
chr5 (1-193)||(10474407-10474598)
chr5 (1-234)||(2954420-2954653)
chr5 (16-193)||(18596664-18596840)
chr5 (5-193)||(17818574-17818761)
chr5 (1-160)||(20045014-20045172)
chr5 (4-186)||(31466070-31466250)
chr5 (93-234)||(3373179-3373320)
chr5 (4-193)||(37705864-37706052)
chr5 (4-219)||(26097740-26097954)
chr5 (1-234)||(2818377-2818611)
chr5 (5-234)||(24126864-24127093)
chr5 (93-234)||(10749796-10749937)
chr5 (39-234)||(10586873-10587068)
chr5 (5-156)||(20043058-20043208)
chr5 (1-193)||(695893-696072)
chr5 (24-217)||(36402387-36402580)
chr5 (73-234)||(39798123-39798284)
chr5 (93-234)||(10757273-10757413)
chr5 (93-234)||(23665140-23665280)
chr5 (93-234)||(23793307-23793447)
chr5 (93-234)||(15354617-15354757)
chr5 (93-234)||(15356893-15357033)
chr5 (93-234)||(38960174-38960314)
chr5 (1-185)||(12556016-12556198)
chr5 (76-234)||(20505883-20506041)
chr5 (1-178)||(21288768-21288949)
chr5 (100-234)||(23741901-23742034)
chr5 (1-149)||(26098379-26098526)
chr5 (16-193)||(6661270-6661443)
chr5 (64-234)||(41585786-41585956)
chr5 (21-234)||(9020246-9020456)
chr5 (59-234)||(2723964-2724130)
chr5 (1-180)||(20053851-20054020)
chr5 (23-193)||(17413251-17413416)
chr5 (78-193)||(36208656-36208771)
chr5 (93-234)||(23667415-23667555)
chr5 (126-193)||(42770938-42771005)
chr5 (1-73)||(20507665-20507737)
chr5 (79-193)||(15143547-15143661)
chr5 (31-166)||(42770805-42770934)
chr5 (97-192)||(4897828-4897923)
chr5 (23-157)||(2144684-2144815)
chr5 (26-157)||(4754187-4754312)
chr5 (1-37)||(4410065-4410101)
chr5 (94-157)||(1170811-1170872)
chr5 (94-157)||(31782578-31782639)
chr5 (94-157)||(35385573-35385634)
chr5 (16-152)||(29748370-29748502)
chr5 (97-157)||(25452498-25452556)
chr5 (79-157)||(35430259-35430338)
[»] chr6 (71 HSPs)
chr6 (1-234)||(12195557-12195790)
chr6 (1-234)||(20915398-20915631)
chr6 (1-234)||(26932604-26932837)
chr6 (1-234)||(19704609-19704844)
chr6 (1-234)||(14507218-14507450)
chr6 (1-234)||(4816273-4816506)
chr6 (1-234)||(28241363-28241596)
chr6 (1-234)||(2628928-2629160)
chr6 (7-234)||(11983071-11983298)
chr6 (1-234)||(1230291-1230524)
chr6 (1-234)||(30034645-30034878)
chr6 (61-234)||(5273258-5273431)
chr6 (1-193)||(9019965-9020156)
chr6 (1-193)||(13057233-13057424)
chr6 (1-234)||(14458809-14459040)
chr6 (1-234)||(30967240-30967473)
chr6 (1-193)||(3390418-3390609)
chr6 (1-193)||(25477313-25477504)
chr6 (1-234)||(26065025-26065254)
chr6 (1-234)||(26084994-26085223)
chr6 (4-193)||(3629948-3630136)
chr6 (1-233)||(15530166-15530397)
chr6 (1-193)||(3632022-3632213)
chr6 (1-193)||(32280035-32280226)
chr6 (1-234)||(15532723-15532956)
chr6 (1-193)||(13039793-13039984)
chr6 (1-193)||(15541224-15541415)
chr6 (1-171)||(19227514-19227683)
chr6 (1-185)||(3233822-3234006)
chr6 (16-186)||(30728919-30729088)
chr6 (1-193)||(12161641-12161830)
chr6 (24-193)||(15719708-15719872)
chr6 (10-193)||(22490688-22490870)
chr6 (93-234)||(26066166-26066307)
chr6 (93-234)||(33308988-33309128)
chr6 (93-232)||(33311257-33311395)
chr6 (1-193)||(24338531-24338723)
chr6 (93-234)||(29754751-29754892)
chr6 (93-234)||(26068437-26068578)
chr6 (21-193)||(3027938-3028106)
chr6 (23-234)||(16455467-16455676)
chr6 (82-193)||(1069803-1069913)
chr6 (39-193)||(14466399-14466553)
chr6 (24-193)||(17012105-17012270)
chr6 (1-86)||(1072067-1072152)
chr6 (28-192)||(15367101-15367260)
chr6 (78-193)||(12186156-12186271)
chr6 (1-87)||(32447504-32447591)
chr6 (1-87)||(13870611-13870697)
chr6 (77-193)||(26945258-26945374)
chr6 (1-61)||(8995518-8995578)
chr6 (1-70)||(17852581-17852650)
chr6 (28-193)||(19696508-19696670)
chr6 (4-53)||(10584163-10584212)
chr6 (79-198)||(7542461-7542581)
chr6 (79-155)||(11138423-11138499)
chr6 (24-107)||(15346445-15346524)
chr6 (79-198)||(20526922-20527041)
chr6 (23-157)||(22858075-22858203)
chr6 (138-192)||(15346522-15346576)
chr6 (80-193)||(28037814-28037927)
chr6 (102-157)||(5165936-5165989)
chr6 (94-157)||(13878727-13878788)
chr6 (94-157)||(13883475-13883536)
chr6 (94-157)||(16785919-16785980)
chr6 (94-157)||(26887345-26887406)
chr6 (94-157)||(31248835-31248896)
chr6 (94-157)||(35201447-35201508)
chr6 (94-157)||(3577636-3577696)
chr6 (97-157)||(17036058-17036116)
chr6 (97-157)||(17694972-17695030)
[»] chr2 (78 HSPs)
chr2 (1-234)||(35215628-35215861)
chr2 (1-234)||(35218005-35218238)
chr2 (1-234)||(42064495-42064727)
chr2 (1-234)||(13910087-13910319)
chr2 (1-234)||(27104779-27105010)
chr2 (1-234)||(23452279-23452512)
chr2 (5-234)||(19502053-19502282)
chr2 (1-232)||(19504390-19504620)
chr2 (1-234)||(45280026-45280260)
chr2 (1-234)||(42452763-42452994)
chr2 (1-234)||(24162265-24162487)
chr2 (1-193)||(42923593-42923784)
chr2 (1-234)||(19007620-19007853)
chr2 (1-186)||(40032149-40032333)
chr2 (4-217)||(28196620-28196833)
chr2 (1-234)||(21520735-21520968)
chr2 (1-186)||(15539566-15539750)
chr2 (1-234)||(22287378-22287611)
chr2 (1-193)||(11739644-11739835)
chr2 (5-193)||(6258901-6259086)
chr2 (5-193)||(34979663-34979850)
chr2 (2-217)||(17848424-17848636)
chr2 (1-193)||(3022143-3022334)
chr2 (1-193)||(17849097-17849288)
chr2 (4-234)||(43623622-43623840)
chr2 (93-234)||(36558906-36559047)
chr2 (93-234)||(36561183-36561324)
chr2 (4-193)||(44289152-44289340)
chr2 (6-234)||(45239019-45239246)
chr2 (4-193)||(6264233-6264417)
chr2 (93-234)||(45332223-45332364)
chr2 (1-193)||(31732861-31733040)
chr2 (16-193)||(14837268-14837438)
chr2 (16-193)||(11578193-11578365)
chr2 (27-193)||(18800398-18800559)
chr2 (71-234)||(5375388-5375550)
chr2 (16-186)||(17897337-17897502)
chr2 (1-179)||(38020182-38020349)
chr2 (31-193)||(28459274-28459435)
chr2 (24-193)||(22874137-22874301)
chr2 (16-193)||(20146693-20146866)
chr2 (1-94)||(22407591-22407684)
chr2 (1-106)||(22163117-22163222)
chr2 (1-74)||(5377631-5377704)
chr2 (77-193)||(40699429-40699545)
chr2 (31-193)||(27136209-27136368)
chr2 (16-156)||(35107294-35107427)
chr2 (94-193)||(20589763-20589862)
chr2 (135-234)||(22407496-22407596)
chr2 (64-164)||(38414194-38414291)
chr2 (148-234)||(7462990-7463077)
chr2 (23-198)||(43139381-43139551)
chr2 (93-157)||(17921769-17921833)
chr2 (111-188)||(37963028-37963105)
chr2 (94-157)||(28458949-28459011)
chr2 (94-157)||(2740941-2741002)
chr2 (78-155)||(26345661-26345738)
chr2 (80-137)||(27583479-27583535)
chr2 (79-157)||(34575230-34575308)
chr2 (97-157)||(37170873-37170931)
chr2 (94-157)||(2736205-2736266)
chr2 (93-155)||(7502990-7503052)
chr2 (93-155)||(10942634-10942696)
chr2 (93-155)||(10948503-10948565)
chr2 (94-157)||(17462436-17462497)
chr2 (94-157)||(20054886-20054947)
chr2 (158-193)||(22707837-22707872)
chr2 (94-157)||(22712637-22712698)
chr2 (94-157)||(22717346-22717407)
chr2 (94-157)||(39686983-39687044)
chr2 (94-157)||(45567409-45567470)
chr2 (93-193)||(15693974-15694075)
chr2 (1-35)||(38020123-38020157)
chr2 (97-234)||(17943540-17943674)
chr2 (39-155)||(35028595-35028707)
chr2 (97-157)||(12781342-12781400)
chr2 (97-157)||(17932637-17932695)
chr2 (97-157)||(27517760-27517818)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (1-232)||(2893-3123)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (1-234)||(6212-6445)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (1-234)||(69334-69566)
scaffold0025 (1-92)||(73207-73298)
scaffold0025 (55-103)||(73160-73208)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (1-234)||(29184-29416)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-234)||(41525-41758)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-234)||(79198-79431)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (16-234)||(11515-11733)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (4-234)||(183683-183912)
scaffold0005 (1-234)||(52024-52257)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (4-234)||(14424-14654)
scaffold0131 (6-193)||(15037-15223)
[»] scaffold0370 (1 HSPs)
scaffold0370 (55-234)||(1495-1673)
[»] scaffold0511 (1 HSPs)
scaffold0511 (1-234)||(2055-2287)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (1-234)||(4010-4242)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-169)||(35652-35819)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (1-234)||(79872-80105)
scaffold0004 (94-157)||(188363-188424)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (16-193)||(85258-85434)
[»] scaffold0224 (1 HSPs)
scaffold0224 (16-193)||(15906-16079)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (93-234)||(22221-22361)
scaffold0140 (93-234)||(24496-24636)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (21-193)||(16735-16903)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (16-193)||(1727-1892)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (79-193)||(4901-5014)
[»] scaffold0552 (1 HSPs)
scaffold0552 (1-109)||(993-1106)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (94-157)||(57550-57613)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (94-157)||(224819-224880)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (97-157)||(16328-16386)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 65)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 43079662 - 43079895
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43079662 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 43079761  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43079762 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 43079861  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43079862 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 43079895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 43082033 - 43082266
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43082033 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 43082132  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  43082133 atcaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 43082232  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082233 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 43082266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24873456 - 24873223
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  24873456 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacactagggtttgtgggttgattcacctttggaaacact 24873357  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||     
T  24873356 attaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccgattgatttctctttgtaacg 24873257  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24873256 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 24873223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 18810768 - 18811000
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18810768 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 18810867  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18810868 attaggatt-gagtctcttggttacgggaataggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 18810966  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18810967 atactcatcatatagtggattggagggctgctct 18811000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 27829357 - 27829589
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27829357 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 27829456  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27829457 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 27829555  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27829556 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27829589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 27827046 - 27827278
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27827046 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 27827145  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27827146 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggctgggaccttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 27827244  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27827245 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27827278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 32339369 - 32339602
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  32339369 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggtaaacact 32339468  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  32339469 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 32339567  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32339568 gatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 32339602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 608794 - 609027
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  608794 aagggtttagaaatgcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacact 608893  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  608894 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 608992  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  608993 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 609027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 14807811 - 14808044
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14807811 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 14807910  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14807911 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 14808009  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14808010 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 14808044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 44720903 - 44721136
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaa-cac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  44720903 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactatgttttgtatagagtctgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaacac 44721002  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaac 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44721003 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 44721101  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44721102 ggtactcatcatatagtggattggagagctgctct 44721136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 3874070 - 3874303
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3874070 aagggtttagaaagacaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 3874169  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3874170 attaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 3874268  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3874269 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3874303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28283494 - 28283262
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28283494 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgactctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacact 28283395  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  28283394 attaggatt-gaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggtggtagacttattcttgcaacccattgatttctctttgtaacg 28283296  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28283295 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28283262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Original strand, 18812980 - 18813174
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  ||     
T  18812980 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttgggtacgggaagaggctgt 18813078  T
Q  139 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18813079 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacaatactcatcatatagtggattggagggctgctct 18813174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 4424078 - 4424311
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4424078 aaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcgcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccgtgggaaacact 4424177  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  4424178 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttatcttttgtaac 4424276  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |  ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  4424277 attactcatcatatagtggatcagagggctgctct 4424311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15809279 - 15809511
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  15809279 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttt-ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 15809377  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15809378 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaaactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 15809476  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15809477 gttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 15809511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28251842 - 28251609
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28251842 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacact 28251743  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||     
T  28251742 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttataacccattgatttctcttttgtaat 28251644  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28251643 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28251609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27107172 - 27106981
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27107172 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacact 27107073  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27107072 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatagatatctctt 27106981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22684931 - 22684695
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  22684931 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacact 22684832  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc---attgatttctct-tggt 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||    
T  22684831 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccaatattgatttctctattgt 22684733  T
Q  197 aacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||   |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22684732 aacgttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 22684695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30480778 - 30480545
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30480778 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 30480679  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg-gtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  30480678 attaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 30480580  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       | ||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  30480579 gttagtcatcatatagtgaaatggatggctgctct 30480545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 27911075 - 27911264
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27911075 aagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 27911173  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27911174 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctct 27911264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 27957494 - 27957683
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27957494 aagggtttagaag-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 27957592  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  27957593 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaactcattgatatctct 27957683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15068041 - 15068274
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| |||    
T  15068041 aagggtttagaaaggcaacaacaaaaccagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaatact 15068140  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  15068141 attaggatt-gagtcttttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 15068239  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  15068240 gttactcatcatataatggaacggagggctgctct 15068274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 14477336 - 14477520
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  14477336 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgct 14477435  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14477436 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgat 14477520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15072770 - 15073004
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||    
T  15072770 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttttagggttgattcaccttggaaaacact 15072869  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaaga-gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  15072870 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagagggttgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 15072968  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   |||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  15072969 cgttactcatcatacagtggaacggagggctgctct 15073004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 14419466 - 14419285
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14419466 aagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggagcaaacattggggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 14419367  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 183  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14419366 attaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 14419285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 1225226 - 1225409
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1225226 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtaaagagtttgtctctttggaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 1225325  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1225326 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattga 1225409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 5372453 - 5372269
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  5372453 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttatatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttgggaaacact 5372354  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5372353 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgagtataattaggcggcagacttattcttgtaactcattgat 5372269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13858759 - 13858578
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13858759 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 13858660  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 183  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  13858659 attaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaagcgggagacttattcttgcagcccatt 13858578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 36865598 - 36865786
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36865598 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 36865697  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| ||||||||    | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  36865698 attaggattg-agtctcttc---acgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 36865786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 33541663 - 33541507
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33541663 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacact 33541564  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 158  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33541563 attaggatt-gagtatcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggc 33541507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 232
Target Start/End: Original strand, 43530213 - 43530406
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 138  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||  |||    
T  43530213 tagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgaaggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctctcggttacgggaagaggctgg 43530311  T
Q  139 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43530312 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcctgtaacccattgatttctcttttgtaacgctactcatcatatagtggatcggagggctgct 43530406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 41384804 - 41385037
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||     
T  41384804 aagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacacc 41384903  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  41384904 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggagctttaggtagaattaggtgggagaatttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 41385002  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  41385003 gttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 41385037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25952581 - 25952814
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| |    
T  25952581 aagggtttagaaaggcaacaataaaattagggtt-gtatatagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacaat 25952679  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||     
T  25952680 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagaaattgagacattgggtagaattaggcagaagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaa 25952778  T
Q  200 aaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  25952779 attactcatcattatagtggaacggagggctgctct 25952814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 21482397 - 21482561
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21482397 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgagtcaccttgggaaacactattaagattg-agtctcttggtt 21482491  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21482492 atgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagtgacttattcttgtaacccattgatatctctt 21482561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Original strand, 15956051 - 15956208
Alignment:
Q  31 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| | |||||    
T  15956051 ggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactgttaggattgaa-tcttttggtcacgggaa 15956145  T
Q  131 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15956146 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15956208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 41382733 - 41382955
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||           ||    
T  41382733 aagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagaatttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgtttcac-----------ct 41382821  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  41382822 attatgattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 41382920  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  41382921 gttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 41382955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3005880 - 3005716
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||   |||||||| |||||||   || |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||     
T  3005880 aaactagagtttgtatagagtttg-ctcttaacaacaaacaatagggtt---ggattgattcactttggaaaacactattagcattg-agtctcttggtc 3005786  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3005785 acggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 3005716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 21480589 - 21480753
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  21480589 aaactagggtttgtatggagtttg-ctcttggcaacaaacactaggttt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaattg-agtctcttggtt 21480683  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21480684 acgggaagatattggggtttttggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaacccattgatatctctt 21480753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5623013 - 5622877
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  || ||||||| |    
T  5623013 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctattgggaacaaacactagggtttgagggttgattcatctttggaaacatt 5622914  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 138  Q
    ||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  5622913 atttggatt-gagtctcttgattacgggaagagattgg 5622877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15185985 - 15185799
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||   || |||||||||| ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  15185985 aagggtttagaaagaaaataacaaaactatggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtaaaacact 15185886  T
Q  101 attaggattg-gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| |||| |  ||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15185885 attagaattgagtctctcttggttacgggaagaga-------tttgggtagaattaggcgagagacctattcttgtaacccattgatatctctt 15185799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Original strand, 31162303 - 31162460
Alignment:
Q  32 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 131  Q
    ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||  ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||    
T  31162303 gtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactaacgttag--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaccggaag 31162398  T
Q  132 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31162399 agattgggactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaactcattgatatctctt 31162460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 26775261 - 26775400
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||    
T  26775261 aagggtttagaaaggcaacaacaatactagggtttgtatatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcaccttggaaaacact 26775360  T
Q  101 attaggattggagtctc-ttggttatgggaagagattggga 140  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||| || |||| |||||    
T  26775361 attagaatt-gagtctctttggttatgcgatgagactggga 26775400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 64 - 198
Target Start/End: Original strand, 181622 - 181758
Alignment:
Q  64 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt-aggattggagtctcttggttatg--ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 160  Q
    |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  181622 actagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatttaggatta-agtctcttagttacgcgggaagagaatgggactttgggtagaattaggcgg 181720  T
Q  161 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaa 198  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  181721 aagacttattcttgtaacccattgatatctctttgtaa 181758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 37214438 - 37214317
Alignment:
Q  29 agggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatggg 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||          | |||||||||||||| |||    
T  37214438 agggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaaca----------ttgagtctcttggttacggg 37214349  T
Q  129 aagagattgggactttgggtagaattaggcgg 160  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37214348 aagcgattggaactttgggtagaattaggcgg 37214317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 35872653 - 35872555
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35872653 aagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 35872559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31578476 - 31578362
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  31578476 ttgattcaccttgggaaacactgttatgattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 31578378  T
Q  178 cccattgatttctctt 193  Q
    ||  ||||| ||||||    
T  31578377 ccttttgatatctctt 31578362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 76 - 234
Target Start/End: Original strand, 31035252 - 31035411
Alignment:
Q  76 gggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttg 174  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||   | |||||||||||||    
T  31035252 gggttgattcaccttgggaaacaccgttatgattg-agtctcttggtcacaggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaagacttattcttg 31035350  T
Q  175 taacccattgatttctcttggtaacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||    |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  31035351 taaccctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 31035411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31573975 - 31573847
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||| ||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  31573975 aaaactaggatttgta--gagttt-tctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggt 31573882  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31573881 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 31573847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 12517299 - 12517248
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 52  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12517299 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct 12517248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 31035144 - 31035235
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattg 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31035144 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt--gggattgattcaccttgggaaacaccattaggattg 31035235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13985262 - 13985176
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  13985262 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacaggaagagattcgggactttgggtagaattaggtttgaaactgattcttgtaaccc 13985176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 3886193 - 3886153
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatag 41  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3886193 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatag 3886153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 17847677 - 17847740
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17847677 gaaacactattaggattgaa-tctcttgatcacgggaagagattgagactttgggtagaattagg 17847740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 37 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 2468341 - 2468261
Alignment:
Q  37 tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  2468341 tatagagtttg-ctcttggcaacaaatactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattagaatt-gagtctcttggt 2468261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2468259 - 2468214
Alignment:
Q  148 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  2468259 tagaattagacgggagacttattcttgtagcccattgatatctctt 2468214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 3276347 - 3276405
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3276347 cactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3276405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 3895957 - 3896035
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| || | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  3895957 ttgattcactttggagaaacactattgcgattg-agtctcttcgtcacgggaagaaattgggactttgagtataattagg 3896035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 9021289 - 9021228
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9021289 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9021228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16752704 - 16752643
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16752704 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16752643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16757449 - 16757388
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16757449 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16757388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 28327908 - 28327969
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28327908 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28327969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 28895502 - 28895563
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  28895502 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 28895563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 30423212 - 30423274
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  30423212 aaacacttttaggattg-agtctcttggtcgcgggaagagattggaactttggatagaattagg 30423274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 590797 - 590855
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  590797 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 590855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 33032657 - 33032715
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  33032657 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 33032715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 109)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44600113 - 44599880
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44600113 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 44600014  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  44600013 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacg 44599914  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44599913 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 44599880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16934418 - 16934185
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16934418 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacact 16934319  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16934318 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 16934219  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16934218 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16934185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22783011 - 22782780
Alignment:
Q  3 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22783011 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgt 22782912  T
Q  103 taggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  22782911 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgat 22782812  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782811 actcatcatatagtggattggagggctgctct 22782780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16932064 - 16931831
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16932064 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacact 16931965  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16931964 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 16931865  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931864 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16931831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 18847211 - 18847444
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18847211 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 18847310  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18847311 attagcattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 18847410  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18847411 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 18847444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22780646 - 22780415
Alignment:
Q  3 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  22780646 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactgt 22780547  T
Q  103 taggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  22780546 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgat 22780447  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780446 actcatcatatagtggattggagggctgctct 22780415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9176749 - 9176516
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9176749 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 9176650  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9176649 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 9176550  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9176549 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 9176516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11006512 - 11006279
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11006512 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 11006413  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  11006412 attaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatg 11006313  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11006312 gtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11006279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18709438 - 18709206
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18709438 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgagttgattcaccttgggaaacact 18709339  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  18709338 attagggttg-agtctcttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 18709240  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18709239 aaactcatcatatagtggattggaggactgctct 18709206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 51015304 - 51015536
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51015304 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 51015403  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51015404 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 51015502  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  51015503 atactcatcatatagtggatcggaggtctgctct 51015536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11008841 - 11008610
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11008841 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 11008742  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||      
T  11008741 attaggattggagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatt--tctttgtaatg 11008644  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11008643 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 11008610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22046960 - 22046728
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22046960 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 22046861  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22046860 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 22046762  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22046761 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 22046728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8631694 - 8631461
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8631694 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 8631595  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8631594 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 8631496  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8631495 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 8631461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 38409266 - 38409495
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38409266 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatt 38409365  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaa 203  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  38409366 aggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgata 38409464  T
Q  204 ctcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38409465 ctcatcatatagtggatcggagggctgctct 38409495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22044665 - 22044433
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  22044665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattccccttgggaaacact 22044566  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  22044565 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatttctctttgtaacg 22044467  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22044466 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 22044433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22132665 - 22132434
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22132665 aagggtttagaaaggcaacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttcg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 22132567  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22132566 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 22132468  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22132467 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 22132434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2485147 - 2484915
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2485147 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttctgggttgattcaccttgggaaacact 2485048  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2485047 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagagataggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 2484949  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2484948 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2484915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9174421 - 9174192
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  9174421 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggttcgtgagttgattcaccttgggaaacact 9174322  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  9174321 attaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacg 9174222  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctg 230  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9174221 gtactcatcatatagtggattggagggctg 9174192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 11435013 - 11435245
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11435013 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 11435112  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  11435113 attaggatt-gagtctcctggttaccggaagagtctaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 11435211  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11435212 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11435245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22134890 - 22134659
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22134890 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttca-aacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 22134792  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22134791 attaggattg-agtctcttggttatgggaaaaggctgggacattgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 22134693  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22134692 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 22134659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 5198478 - 5198711
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5198478 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcactttgggaaacact 5198577  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  5198578 attaggatt-gagtcttttggttacgggaagagattggggctttgtgtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 5198676  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5198677 gatactcatcatatagtggattggagggctgctct 5198711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 9 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26086243 - 26086019
Alignment:
Q  9 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 108  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26086243 agaaaaacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggat 26086144  T
Q  109 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcat 208  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26086143 tg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgttttctctttgtaacgatactcat 26086045  T
Q  209 catatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||    
T  26086044 catatagtggatcggaaggctgctct 26086019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31849874 - 31849641
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31849874 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacac 31849775  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaac 199  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31849774 tattaggattg-agtctcttgcttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 31849676  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31849675 gatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31849641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 9148311 - 9148543
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9148311 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 9148410  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9148411 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 9148509  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9148510 ttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 9148543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 24348276 - 24348509
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24348276 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 24348375  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24348376 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 24348474  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24348475 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 24348509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 40637132 - 40637365
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40637132 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 40637231  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40637232 attagga-tcgagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 40637330  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  40637331 gttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 40637365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 7941379 - 7941614
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaa--cactagggtttgtgggttgattcactttgggaaaca 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941379 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttacgagcaaatgcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaaca 7941478  T
Q  99 ctattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggta 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7941479 ctattaggattg-agtctcttggttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgta 7941577  T
Q  198 acaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7941578 acgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 7941614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37089646 - 37089414
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37089646 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 37089547  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  37089546 attaggatt-gagtctcttgattacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 37089448  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  37089447 ttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 37089414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3824842 - 3824627
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3824842 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3824743  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||       
T  3824742 aggatt-gagtctattggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 3824644  T
Q  203 actcatcatatagtgga 219  Q
    |||||||||||||||||    
T  3824643 actcatcatatagtgga 3824627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 6764897 - 6765135
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttc-----ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaa 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  6764897 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaa 6764996  T
Q  96 acactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttg 194  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  6764997 acactgttaggattg-agtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttt 6765095  T
Q  195 gtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6765096 gtaacgttactcatcatatagtggattggagggctgctct 6765135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 14633380 - 14633609
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14633380 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 14633479  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||        
T  14633480 aggatt-gagtctcttggtta-cggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgtt 14633577  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14633578 actcatcatatagtgaaacggagggctgctct 14633609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 193
Target Start/End: Original strand, 24880510 - 24880700
Alignment:
Q  2 agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacacta 101  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  24880510 agggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttggttcaccttgggaaacacta 24880609  T
Q  102 ttaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24880610 ttaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 24880700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 47868459 - 47868692
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  47868459 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctccttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttggaaaacact 47868558  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47868559 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 47868657  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  47868658 gatactcatcatatagtggaacggatggctgctct 47868692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 2 - 234
Target Start/End: Original strand, 24879048 - 24879281
Alignment:
Q  2 agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacacta 101  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24879048 agggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaccagggtttgagggttgattcaccttgggaaacacta 24879147  T
Q  102 ttaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt--ggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |  |||    
T  24879148 ttaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaac 24879246  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | || |||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24879247 gatacacatcatatagtgaaacggagggctgctct 24879281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 24888854 - 24889087
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24888854 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggctttgagggttgattcaccttgggaaacact 24888953  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||    
T  24888954 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcatgtaacccattgatatctcttttgtaac 24889052  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  24889053 gttacttatcatatagtggaacggagggctgctct 24889087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 48486377 - 48486610
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  48486377 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 48486476  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  48486477 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgaaatctcttttgtaac 48486575  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  48486576 gttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 48486610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 5 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 5637736 - 5637524
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5637736 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 5637637  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaa 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |    
T  5637636 ggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 5637538  T
Q  204 ctcatcatatagtg 217  Q
    ||||||||||||||    
T  5637537 ctcatcatatagtg 5637524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22803009 - 22802818
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22803009 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 22802910  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22802909 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22802818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47211015 - 47210794
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||    
T  47211015 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtg------------ttgggaaacact 47210928  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47210927 attaggattg-agtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 47210829  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47210828 gatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 47210794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36921769 - 36921535
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36921769 aagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 36921670  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||    
T  36921669 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaa 36921571  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  36921570 cgttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 36921535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12396120 - 12395929
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12396120 aaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctagccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 12396021  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12396020 attaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctctt 12395929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 16453367 - 16453558
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16453367 aagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagagtttgtacaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 16453466  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16453467 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattgggactttgggtagtattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 16453558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38928449 - 38928219
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38928449 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 38928350  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||       
T  38928349 aggattg-agtctcttggttacgggaaaagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 38928251  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  38928250 actcatcatatagtaaaacggagggctgctct 38928219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22801137 - 22800904
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  22801137 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 22801038  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  22801037 attaggatt-gagtctcttgattacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 22800939  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  22800938 gttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 22800904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33415762 - 33415530
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33415762 aagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt-ggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 33415664  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||     
T  33415663 attaagatcg-agtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 33415565  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  33415564 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 33415530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 47274785 - 47275017
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  47274785 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacact 47274883  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||     
T  47274884 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 47274982  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  47274983 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 47275017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12401082 - 12400891
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12401082 aaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctggccaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 12400983  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  12400982 attaagattg-agtctcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattgttgtaacccattgatatctctt 12400891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 40091690 - 40091499
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40091690 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtttagagtttgtctctttggaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 40091591  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40091590 attatgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 40091499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 36378350 - 36378540
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  36378350 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacact 36378449  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  36378450 attaggatt-aagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaactcattgatatctct 36378540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36919860 - 36919626
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  36919860 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggataaagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 36919761  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg-gtaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||    
T  36919760 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaa 36919662  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   | ||||||||||||||| | || |||||||||    
T  36919661 cgttattcatcatatagtggaatagatggctgctct 36919626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14787706 - 14787473
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  14787706 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacact 14787607  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  14787606 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 14787508  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  14787507 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 14787473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37313341 - 37313150
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| ||| ||||||||    
T  37313341 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagagttgattcaccttgagaaacact 37313242  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  37313241 attaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 37313150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 13544032 - 13544208
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  13544032 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 13544129  T
Q  115 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13544130 ctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 13544208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17662509 - 17662287
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17662509 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt-----------ttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 17662421  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17662420 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 17662322  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17662321 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 17662287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18409622 - 18409431
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || || || ||||||    
T  18409622 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcacttggcaacaaacactagggtttgagggttgattaaccttcgggaacact 18409523  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18409522 attaggatt-gagtctcttagttataggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 18409431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Original strand, 56030502 - 56030685
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  56030502 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 56030601  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  56030602 attaggatt-gagtttcttggttacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 56030685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19095940 - 19096132
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  19095940 aagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacac 19096039  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  19096040 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctctt 19096132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 619722 - 619506
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  619722 aagggtttataaagacaacaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacact 619623  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  619622 attaggatt-gactgtcttggttaagggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggaaaattattcttataacccattgatatctcttttgtaac 619524  T
Q  200 aaaactcatcatatagtg 217  Q
       |||||||||||||||    
T  619523 gttactcatcatatagtg 619506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 19322769 - 19322942
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  19322769 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 19322864  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  19322865 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 19322942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 19 - 186
Target Start/End: Original strand, 36380425 - 36380591
Alignment:
Q  19 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctct 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || || || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  36380425 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaaaaaccattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtatct 36380523  T
Q  119 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  36380524 tggttaccggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 36380591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 193
Target Start/End: Original strand, 41997566 - 41997741
Alignment:
Q  17 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtct 116  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41997566 aacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtct 41997664  T
Q  117 cttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||| |||| ||||| |||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  41997665 cttagttacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccctttaatatctctt 41997741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52942721 - 52942543
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  52942721 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacact 52942622  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||             ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  52942621 attaggatt-gagtctcttggttacggg-------------tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 52942543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3937484 - 3937314
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3937484 aagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagagtttgtatagagtttgtttcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 3937385  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 172  Q
    ||| ||| | ||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3937384 att-ggaattgagtctcttggttacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtgggagacttattct 3937314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 6132930 - 6133090
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  6132930 aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctattggcaacaaacactagggtttgagggttgagtcaccctgggaaacact 6133029  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga 162  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6133030 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggga 6133090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18535082 - 18534917
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18535082 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgagaaacactattaggattg-agtctcttggtc 18534987  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18534986 acgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18534917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 53405188 - 53405411
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  53405188 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaa-actaggttttgagggttgattcaccttgagaaacact 53405286  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga------cttattcttgtaacccattgatttctc-tt 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || |||||  || |||||| |||||||||| ||||||||      ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53405287 attaagatt-gagtctcttggttacggaaagaggctgagactttaggtagaattaagcgggagacttattcttattcttgtaacccattgatttctcttt 53405385  T
Q  194 ggtaacaaaactcatcatatagtgga 219  Q
     | ||| | |||||||||||||||||    
T  53405386 tgaaacgatactcatcatatagtgga 53405411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18537724 - 18537559
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| |  ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  18537724 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaccactagggttgg--ggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggtc 18537629  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18537628 acgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18537559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 56 - 193
Target Start/End: Original strand, 16455354 - 16455490
Alignment:
Q  56 gaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatta 155  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16455354 gaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaatta 16455452  T
Q  156 ggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  16455453 ggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 16455490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38890476 - 38890310
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||| |  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  38890476 aaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacattagggttgg--ggttgattcatattgggaaacactattaggattg-agtctcttgat 38890381  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     | |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38890380 cacgggaagagattgagactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 38890310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 26 - 179
Target Start/End: Original strand, 27499128 - 27499280
Alignment:
Q  26 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttat 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||   || ||||||||||||||||| |||||| |||||||     
T  27499128 actagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcctgagaaacactattaggatt-gagtctattggttac 27499226  T
Q  126 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 179  Q
    |  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27499227 gataagagattgaggctttgggtataattaggcgggagacttatttttgtaacc 27499280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8756510 - 8756336
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  8756510 caacaagaaaattaggatttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactaggattg-agtc 8756415  T
Q  116 tctt-ggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| ||| | |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  8756414 tctttggtcacgggaagagattgagactttgagtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 8756336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 193
Target Start/End: Original strand, 2891437 - 2891540
Alignment:
Q  89 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2891437 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttgttcttgtaacccattgatat 2891535  T
Q  189 ctctt 193  Q
    |||||    
T  2891536 ctctt 2891540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 138 - 234
Target Start/End: Original strand, 11437557 - 11437653
Alignment:
Q  138 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11437557 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 11437653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 91 - 234
Target Start/End: Original strand, 13547302 - 13547445
Alignment:
Q  91 gggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttct 190  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |    
T  13547302 gggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatat 13547400  T
Q  191 c-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | || ||||    ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13547401 cttttgtaaagttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 13547445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 38270261 - 38270158
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  38270261 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtcttttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 38270162  T
Q  101 atta 104  Q
    ||||    
T  38270161 atta 38270158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5635614 - 5635518
Alignment:
Q  139 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5635614 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5635518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Original strand, 30136640 - 30136798
Alignment:
Q  31 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 130  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||| | | |||    
T  30136640 ggtttgtatagagttta-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactactatgattgg-gtctcttggtcacgagaa 30136735  T
Q  131 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||| ||||||    
T  30136736 gaaattgtgactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtgactcatcgatatctctt 30136798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 12102221 - 12102336
Alignment:
Q  78 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  12102221 gttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtatcttggtcatgggaaaagattggaactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgta 12102319  T
Q  177 acccattgatttctctt 193  Q
    ||||| |||| ||||||    
T  12102320 acccactgatatctctt 12102336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15032748 - 15032633
Alignment:
Q  77 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 176  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||||||  | | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15032748 ggttgattcatatttggaaacactattaggattg-agtctcttggacacgagaaaagatttggacttttggtagaattaggcgggagatttattcttgta 15032650  T
Q  177 acccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| ||||||    
T  15032649 acccattgatatctctt 15032633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 24446854 - 24446756
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||     ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  24446854 aagggtttagaaaggcaac-----aactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacgaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 24446760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 4215483 - 4215597
Alignment:
Q  121 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtgga 219  Q
    |||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||||    
T  4215483 gttacgggaagaggttgtgacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 4215582  T
Q  220 ttggagggctgctct 234  Q
      ||| |||||||||    
T  4215583 acggatggctgctct 4215597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 23 - 177
Target Start/End: Original strand, 28453767 - 28453915
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||||| | || ||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  28453767 aaaactagggtttgca--gagtttg-ctcttggcaagaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggt 28453860  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 177  Q
    || ||||||||||| |||| |||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  28453861 tacgggaagagatttggaccttgggtagaattaggttgaagactaattcttgtaa 28453915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 78 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31983727 - 31983569
Alignment:
Q  78 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 176  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||    
T  31983727 gttgattcaccttgggaaacactattaagatta-agtctcttggtcatgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgta 31983629  T
Q  177 acccattgatttc-tcttggtaacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||| ||||| || | || |||| |  |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  31983628 accctttgatatcttttttgtaaaattactcatcattatagtggaacggagggctgctct 31983569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 2891375 - 2891434
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 60  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2891375 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaca 2891434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 79
Target Start/End: Original strand, 5101070 - 5101133
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggt 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5101070 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcactttggaacaaacactagggtttgagggt 5101133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 23 - 155
Target Start/End: Original strand, 9863791 - 9863917
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| |||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  9863791 aaaactagggtttgta--gagtttgt-tcttggcaacaaacactaaggttgg--gtttgattcaccttgggaaaccctattaggattg-agtcttttggt 9863884  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaatta 155  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9863885 cacgggaagagattgagactttgggtagaatta 9863917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 146
Target Start/End: Original strand, 25357772 - 25357838
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgg 146  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25357772 ttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagagattgggactttgg 25357838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47151092 - 47150978
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  47151092 ttgattcaccttgggaaacactgttaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagaatttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 47150994  T
Q  178 cccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  47150993 ccctttgatatctctt 47150978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40999208 - 40999071
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||| ||    | ||||||||| | || ||||| ||||||||||| ||||    
T  40999208 caacaagaaaactaggggttgtatagagtttg-ctcttgacaacaaacactaggattga--gattgattcacctaggaaaacattattaggattg-agtc 40999113  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  40999112 tcttggtcacgggaagagatcgagactttgggtagaattagg 40999071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 10112952 - 10113080
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  10112952 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtctcttggt 10113045  T
Q  123 tatggg-aagagattgggactttgggtagaattag 156  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  10113046 cacggggaagagattaggactttgggtagaattag 10113080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16186018 - 16185877
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||||| | |||    
T  16186018 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggaactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgatatatct 16185920  T
Q  193 tggtaacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | ||||    |||||||| |||||||||   ||||||||||||    
T  16185919 ttgtaaagttactcatcattatagtggaacagagggctgctct 16185877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 122
Target Start/End: Original strand, 10114412 - 10114505
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||||||||  |||| || ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10114412 aaaactagggtttgta--gagtctg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcactttaggaaacactattaggatt-gagtctcttggt 10114505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3982362 - 3982300
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 155  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3982362 gaaacactattaggattg-agtttcttggtcacgggaagagatttgggactttgggtagaatta 3982300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5336964 - 5336903
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5336964 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5336903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38270158 - 38270120
Alignment:
Q  129 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 167  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38270158 aagagattgagactttgggtagaattaggcgggagactt 38270120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 145 - 186
Target Start/End: Original strand, 5101130 - 5101171
Alignment:
Q  145 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5101130 gggtagacttaggcaggagacttattcttgtaacccattgat 5101171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Original strand, 9022380 - 9022516
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagt 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||| |||||| ||||||||| | | |    
T  9022380 caacatcaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttggagaaacagtattaggatagaatt 9022474  T
Q  115 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
     ||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  9022475 -tcttggtcacgggaagagattgagactttgggttgaattagg 9022516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 16489352 - 16489410
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  16489352 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 16489410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 25699752 - 25699810
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25699752 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggacttt-ggtagaattagg 25699810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 4570094 - 4570155
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4570094 aaacactattaggatcg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 4570155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7050439 - 7050378
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7050439 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7050378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 11853549 - 11853610
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  11853549 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 11853610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23001566 - 23001523
Alignment:
Q  115 ctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23001566 ctcttggttatgggaagagattcgggactttaggtagaattagg 23001523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4556238 - 4556180
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  4556238 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 4556180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 4558314 - 4558372
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  4558314 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 4558372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 8529270 - 8529328
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  8529270 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 8529328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 15316961 - 15317019
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  15316961 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 15317019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 18586969 - 18587027
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  18586969 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 18587027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 31300427 - 31300485
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31300427 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31300485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 100)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 16226171 - 16226404
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16226171 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 16226270  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  16226271 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 16226370  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16226371 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 47179717 - 47179950
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47179717 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 47179816  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  47179817 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 47179916  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47179917 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47179950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 47177366 - 47177599
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47177366 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaagcactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 47177465  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  47177466 attaggatgggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 47177565  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47177566 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 47177599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 46431984 - 46431752
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46431984 aagggtttagaaaggcaacaacaaaagtagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 46431885  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  46431884 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggatgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 46431786  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46431785 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 46431752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9463521 - 9463288
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9463521 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 9463422  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9463421 attaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacg 9463322  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9463321 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 9463288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 28840684 - 28840916
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28840684 aagggtttagaaaggaaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 28840783  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28840784 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 28840882  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28840883 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 28840916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 51750043 - 51750276
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51750043 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 51750142  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51750143 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 51750241  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51750242 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 51750276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9459694 - 9459461
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9459694 aagggtttagaaagtcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 9459595  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  9459594 attaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatccttgtaacccattgatttctctttgtaacg 9459495  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9459494 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 9459461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 226
Target Start/End: Original strand, 20302463 - 20302687
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20302463 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 20302562  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20302563 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 20302661  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagg 226  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||    
T  20302662 atactcatcagatagtggatcggagg 20302687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 6823019 - 6823251
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  6823019 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatact 6823117  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  6823118 attaggattg-agtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaac 6823216  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6823217 gatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 6823251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31735798 - 31735565
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31735798 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 31735699  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||| | || |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  31735698 attaaggtt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatttctcttttgtaac 31735600  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31735599 gatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 31735565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 28842499 - 28842726
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28842499 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacattgggaaacact 28842598  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  28842599 attaggatt-gagtctattggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 28842697  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggct 229  Q
      |||||||||||||||||  ||||||||    
T  28842698 ttactcatcatatagtggaacggagggct 28842726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10400105 - 10399872
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  10400105 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacact 10400006  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10400005 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 10399907  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10399906 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10399872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 20291461 - 20291686
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20291461 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaagttttgagggttgattcaccttgggaaacact 20291560  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20291561 attaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagactaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 20291659  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggaggg 227  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  20291660 attctcatcatatagtggatcggaggg 20291686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27337215 - 27336984
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27337215 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataga-tttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 27337117  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27337116 attaggattgg-gtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 27337018  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27337017 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27336984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21948464 - 21948232
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  21948464 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcacctt-ggaaacact 21948366  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21948365 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagacgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 21948267  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21948266 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 21948232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 2617520 - 2617753
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  2617520 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 2617619  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2617620 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 2617718  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2617719 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2617753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15295111 - 15294878
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15295111 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 15295012  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15295011 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 15294913  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15294912 gttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 15294878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 39932077 - 39932310
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  39932077 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattaaccttgggaaacact 39932176  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  39932177 attaggatt-gaatctcttggttacgggaagagactgagactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 39932275  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  39932276 gatactcatcatatagtggaacggagggctgctct 39932310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 47906274 - 47906507
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  47906274 aagggtttagaatggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacact 47906373  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  47906374 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 47906472  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  47906473 gttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 47906507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 13215085 - 13215269
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13215085 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 13215184  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13215185 attatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 13215269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 13761841 - 13762073
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||    
T  13761841 aagggtttagaaaggcaacaacataactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgggggttgattcaacttggaaaacact 13761940  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  13761941 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagtctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 13762039  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  13762040 ttactcatcatatagtggaccggagggcttctct 13762073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15823550 - 15823783
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15823550 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 15823649  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct-tggtaac 199  Q
    ||||  ||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||    
T  15823650 attaatatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctattgtaac 15823748  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  15823749 gttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 15823783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17324913 - 17324680
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17324913 aagggtttagaatggcaacaacaaaactggggtttgtatagagtttgtctctatggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 17324814  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  17324813 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaac 17324715  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  17324714 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 17324680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27339407 - 27339179
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27339407 aagggcttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaatact 27339308  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||| |||| ||||||||| |||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  27339307 attacgatt-gagtctcttagttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggcgacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 27339209  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctg 230  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||    
T  27339208 ttactcatcatatagtggatcggagggctg 27339179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 51752373 - 51752600
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  51752373 gtttagaaaggtaacaacaaaattagggcttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgtgaaacactatta 51752472  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaac 204  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||    
T  51752473 g-attg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatac 51752570  T
Q  205 tcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51752571 tcaccatatagtggattggagggctgctct 51752600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12302782 - 12302549
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12302782 aagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 12302683  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  |||| || |||||    
T  12302682 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttataactcattgacatctcttttgtaac 12302584  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  12302583 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 12302549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 16231630 - 16231800
Alignment:
Q  64 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16231630 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagcctttgggtagaattaggcgggag 16231729  T
Q  164 acttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16231730 acttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 16231800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 7 - 193
Target Start/End: Original strand, 24325673 - 24325858
Alignment:
Q  7 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24325673 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttaggaaacactattagg 24325772  T
Q  107 attggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24325773 att-gagtctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 24325858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 50307824 - 50307590
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  50307824 aagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 50307725  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||    
T  50307724 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 50307626  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  50307625 cgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 50307590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 16428657 - 16428848
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  16428657 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgacaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 16428756  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16428757 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 16428848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38925747 - 38925564
Alignment:
Q  9 agaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggat 108  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  38925747 agaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggat 38925648  T
Q  109 tggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38925647 t-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 38925564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 48665181 - 48665400
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  48665181 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 48665280  T
Q  101 attaggattggagtctcttggtta-tgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  48665281 attaggatt-gagtctcttggttaccgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaa 48665379  T
Q  199 caaaactcatcatatagtgga 219  Q
    |   |||||||||||||||||    
T  48665380 cgttactcatcatatagtgga 48665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6823889 - 6824087
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6823889 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 6823988  T
Q  101 attaggattggagtctctt-------ggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||| || ||||||       ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6823989 attacgatt-gaatctcttggttacgggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggcagacttattcttgtaacccattgatttctctt 6824087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 39462526 - 39462714
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  39462526 ggtttagaaatgcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttttagggttgattcaccttgggaaacactatt 39462625  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  39462626 aggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttgtaaccctttgatatctctt 39462714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18307113 - 18307304
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  18307113 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacact 18307212  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  18307213 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtgacgcattgatatctctt 18307304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50076949 - 50076758
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  50076949 aaggatttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 50076850  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  50076849 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaatccattgatatctctt 50076758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 41646924 - 41647157
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||   ||||||||||| ||||||||||||    
T  41646924 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacttggtttttatggttgattcaccttgggaaacact 41647023  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  41647024 attaggatt-gagtcacttggttacgggaagagattgcgactttgggtagaattaggctggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaac 41647122  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41647123 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 41647157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17186405 - 17186214
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17186405 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 17186306  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    || |||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  17186305 atcaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatttgaactttgggtagaattagaagggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 17186214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 18839591 - 18839782
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  18839591 aagggtttagataggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacagtagggttttagggttgattcaccttgggaaacact 18839690  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18839691 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagagaatgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18839782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50079098 - 50078907
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  50079098 aagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgcatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 50078999  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50078998 attaggatt-aagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 50078907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6995974 - 6995744
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6995974 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactatt 6995875  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| ||  ||||       
T  6995874 aagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggatactttttcttgtaactcattgacatctcttttataacgtt 6995776  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  6995775 actcatcatatagtgaaacggagggctgctct 6995744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9241360 - 9241172
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  9241360 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacattatt 9241261  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  9241260 aggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 9241172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 25127876 - 25128067
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  25127876 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtgtcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgtgaaacact 25127975  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  25127976 atttggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaattcattgatatctctt 25128067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2510601 - 2510412
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  2510601 aagggtttataaaggcaaccacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcacctttggaaacact 2510502  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2510501 attaggatt-gagtcttttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggc-agagacttattcttgtaacccattgatttctct 2510412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6756531 - 6756721
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6756531 aagggcttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 6756630  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||| |||||  || ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  6756631 tattaggattg-agtct--tgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatatctctt 6756721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25251549 - 25251368
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  25251549 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtataacgtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacactatt 25251450  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25251449 aggatt-gagtctctcggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgat 25251368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3579893 - 3579702
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||     
T  3579893 aagggttcagaaaggcagcaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacaca 3579794  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3579793 attaggatt-gagtctcttgattacggaaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3579702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31425296 - 31425101
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  31425296 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtatctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacac 31425197  T
Q  100 tattaggattg-gag-tctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31425196 tattaggattgagtgatctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaggcttattcttgtaactcattgatatctctt 31425101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14098244 - 14098056
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  14098244 ggtttaaaaaggcaactacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttggaaaacactatt 14098145  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14098144 aggatt-gagtctcttggttacgggaagagattagagctttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 14098056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31423151 - 31422967
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaac-aaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||    
T  31423151 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctctttggcattaaacactagggtttgaaagttgattcaccttgggaaacac 31423052  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31423051 tattagaattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 31422967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28998530 - 28998347
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  28998530 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 28998431  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28998430 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 28998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29004246 - 29004063
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29004246 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttgcgaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 29004147  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  29004146 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattga 29004063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 4131656 - 4131473
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||    
T  4131656 aaggatttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgatttaccttgggaaacact 4131557  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  4131556 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggcgagaaacttattcttgtaacccattgat 4131473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11457749 - 11457561
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  11457749 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgattcttggcaacaattactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 11457650  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11457649 atgattg-agtctcttggttacgcgaagagattgggggtttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 11457561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17324069 - 17324258
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||| ||||| || |||||||||||  | ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17324069 aagggttcagaaaggccacaacaaaact--gatttttatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 17324166  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17324167 attaggattg-agtctcttgaatatgggaagagattggaactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 17324258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 31489919 - 31490108
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31489919 aagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatag--tttgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacact 31490016  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31490017 attaggattgaatt-tcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctctt 31490108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 50248834 - 50248666
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  50248834 caacaacaaaactatgatttatatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtc 50248736  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    |||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50248735 tcttggttacaggaagagatcgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattga 50248666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2949508 - 2949275
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  2949508 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaggggttgatggttgattcaccttgggaaacact 2949409  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  2949408 attaggatt-gagtctcttgtttacgagaatagattggggctttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 2949310  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |   ||||||||||||    
T  2949309 gttactcatcatatagtgaaacagagggctgctct 2949275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 23785935 - 23786076
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23785935 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 23786034  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23786035 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23786076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17318897 - 17319082
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||       
T  17318897 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtttagagtttgtctcttggcaacaaacactagggttggaaggttgattcaccttgggaaac--- 17318993  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
       |||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  17318994 ---aggatt-gagtctcttggttacgggaacagattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacttattgatatctctt 17319082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 15669648 - 15669481
Alignment:
Q  21 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15669648 acaaaagtagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 15669553  T
Q  121 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15669552 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctct 15669481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 40133948 - 40134139
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  40133948 aagggtttagaatgacaacaacaaaacgaaggtttgtatagaatttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatact 40134047  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  40134048 actaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgaggttttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 40134139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 28207343 - 28207160
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||    
T  28207343 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtaaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagagtttattcaccttgggaaacact 28207244  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||| |||||  || ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  28207243 attaggatt-gtgtctcttggttacaggaagagattggggctttgaatataattacgcgggagactttttcttgtaactcattga 28207160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 42922252 - 42922425
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  42922252 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtc 42922347  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42922348 tcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 42922425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 89 - 234
Target Start/End: Original strand, 51757623 - 51757767
Alignment:
Q  89 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51757623 ttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctatcgattt 51757721  T
Q  189 ctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51757722 ctctttgtaacgatactcaccatatagtggattggagggctgctct 51757767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 193
Target Start/End: Original strand, 16432440 - 16432589
Alignment:
Q  43 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggact 142  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||    
T  16432440 gtttgtctcttggcgacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacattattaggattgaa-tctcttggttatgggaagagattgaaact 16432538  T
Q  143 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16432539 ttgggtagaattatgcgggacaattattcttgtaacccattgatatctctt 16432589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Original strand, 47451652 - 47451862
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |            
T  47451652 aagggtttggaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcacattag------tg 47451745  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
     |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  47451746 tttaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggaaactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 47451844  T
Q  200 aaaactcatcatatagtg 217  Q
       |||||||||||||||    
T  47451845 gttactcatcatatagtg 47451862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8347532 - 8347359
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| | |||| |  ||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    
T  8347532 caacaagaaaactagggtttgtatagagattg-ctcttggcaacaaacaccaaggttag--ggttgattcaccttaggaaacactattatgattg-agtc 8347437  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| | | |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8347436 tcttgatcacgggaagagattgagactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 8347359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14183843 - 14183678
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  14183843 aaactagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattataattg-agtctcttggtt 14183748  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  14183747 acgggaagagattagaattttgggtagaattaggcggaagacttattcttgcaacccattgatatctctt 14183678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 64 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25248766 - 25248638
Alignment:
Q  64 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  25248766 actagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatta-agtctctcggttacaggaagagattgagacttttggtagaattaggcgggag 25248668  T
Q  164 acttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25248667 acttattcttgtaacccattgatatctctt 25248638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 89 - 193
Target Start/End: Original strand, 16429049 - 16429152
Alignment:
Q  89 ttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 188  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  16429049 ttgggaaacactattaggattg-agtcttttggttacgggaagagattgggaatttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatat 16429147  T
Q  189 ctctt 193  Q
    |||||    
T  16429148 ctctt 16429152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8349311 - 8349138
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||     
T  8349311 caacaagaaaattaaggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggtttattcaccttgggaaacactattaggattg-agtt 8349216  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |  |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||    
T  8349215 tgatggtcacgggaagagattaggactttaggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaactcattggtatctctt 8349138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18800832 - 18800659
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||| |  |||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  18800832 caacaagaaaactacggtttgtatagagtttg-ctcttggccacaaatactagggttgg--ggttgattcaccctgagaaacactattaggattg-agtc 18800737  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||| | ||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18800736 tctaggtcacgggtagagatttgaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtatcccattgatatctctt 18800659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49495461 - 49495297
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||| ||||   | |||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||| |||||     
T  49495461 aaactagggtttgcatatagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gagttgattcaccttgggaaacactaataaaattg-agtcttttggtc 49495367  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  49495366 acggtaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatatctctt 49495297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6115304 - 6115189
Alignment:
Q  77 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 176  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6115304 ggttgattcaccttgaaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacatgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggggacttattcttgta 6115206  T
Q  177 acccattgatttctctt 193  Q
    ||| |||||| ||||||    
T  6115205 accaattgatatctctt 6115189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13125711 - 13125544
Alignment:
Q  24 aaactagggtttg-tatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||| || ||||||||| || ||||||||    
T  13125711 aaactagggtttggtatagagtttg-ctcttggcgacaaacactagggttga--ggttgattcacattgggaaacgctgttaggattg-aggctcttggt 13125616  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13125615 caagggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaccctttgatatctctt 13125544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 139 - 234
Target Start/End: Original strand, 23816027 - 23816123
Alignment:
Q  139 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  23816027 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatataatggatcggagggatgctct 23816123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26520379 - 26520206
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||| | ||    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26520379 caacaagaaaactagggtttctatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaagattga--ggttgattcaccttgggaaacactattatgattg-agtc 26520284  T
Q  116 tcttggttat------gggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||| |       ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||    
T  26520283 tcttggtcacagtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggaaacttattcttgtaacccattgat 26520206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30738830 - 30738716
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  30738830 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcataggaagagattgggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 30738732  T
Q  178 cccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  30738731 ccctttgatgtctctt 30738716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 155788 - 155865
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  155788 ttgattcaccttgggaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacgggaagagattgggactttggatagaattagg 155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30790602 - 30790487
Alignment:
Q  77 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgt 175  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||| ||||||| | |||||||| | ||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  30790602 ggttgatttaccttgggaaacactgttaggat--gagtcttttggttacgcgaagagatggagactttgtgtagaattaggtttggagacttattcttgt 30790505  T
Q  176 aacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  30790504 aacccattgatatctctt 30790487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 16561544 - 16561662
Alignment:
Q  75 tgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattctt 173  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  | || || |||||| |||||||||||||| ||||   | ||||||||||||    
T  16561544 tgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-aagtctcttggccacggaaatagattgagactttgggtagaaataggtttgaagacttattctt 16561642  T
Q  174 gtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  16561643 gtaaccctttgatatctctt 16561662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26613440 - 26613326
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||||||||||    
T  26613440 ttgattcaccttgggaaacactattcggattg-agtcacttggtcacaggaagagattgaggctttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 26613342  T
Q  178 cccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  26613341 ccctttgatatctctt 26613326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Original strand, 27916525 - 27916653
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  27916525 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttggaa--ttgattcaccttggaaaacactattagaattg-agtctcttggt 27916618  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
     |   |||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  27916619 cacatgaagagattgtgactttgggtggaattagg 27916653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 157
Target Start/End: Original strand, 28279292 - 28279424
Alignment:
Q  20 aacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctct 118  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||| |||||   |||||||||||||||| |  | ||||||| | |||| |||||||||||||||||| ||  |||    
T  28279292 aacaaaattagggtttgta--gagtttg-ctcttgacaacaaacactagggttgg--gattgattccccttggagaaacactattaggattg-agcttct 28279385  T
Q  119 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28279386 tggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattagg 28279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26332688 - 26332613
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatta 155  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| | | |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26332688 ttgattcaccttcggaaacactattaggattt-agtctcttggtcacgagaagagattgagactttgtgtagaatta 26332613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4144865 - 4144804
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  4144865 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagactgggac-ttgggtagaattagg 4144804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21353525 - 21353391
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttgg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||| |    
T  21353525 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 21353431  T
Q  196 taacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  21353430 taaagaaactcatcattatagtggatcggagagctgctct 21353391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 14353047 - 14353126
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg-gactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  14353047 ttgattcaccttggagaaacactattaggattt-agtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaattagg 14353126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 16432409 - 16432445
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 37  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16432409 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 16432445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 2232597 - 2232658
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2232597 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2232658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 14997040 - 14997101
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14997040 aaacactgttaggattg-agtctcttggttactggaagagattgagac-ttgggtagaattagg 14997101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 25248791 - 25248756
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttg 36  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25248791 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttg 25248756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26332814 - 26332719
Alignment:
Q  21 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26332814 acaaaaatagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagg-tttg-ggtttgattcaccttcggaaacactattaggatt-tagtctcttg 26332721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 186
Target Start/End: Original strand, 49959129 - 49959237
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgta 176  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| || |||||||   || ||| |||||| ||    
T  49959129 ttgattcaccttggagaaacactattaggaatg-agtctcttggtcatgagaagagattcgagactttggataaaattaggtttgaaactgattctttta 49959227  T
Q  177 acccattgat 186  Q
    |||| |||||    
T  49959228 accctttgat 49959237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2401400 - 2401342
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2401400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2401342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 9526469 - 9526527
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  9526469 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 9526527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 16231605 - 16231641
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 37  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16231605 aagggtctagaaaagcaacaagaaaactagggtttgt 16231641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 25134074 - 25134132
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25134074 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25134132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 119)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 50493983 - 50494216
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  50493983 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 50494082  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  50494083 attaggattggagtctcttggttacgggaagggattgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 50494182  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50494183 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 50494216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28413299 - 28413072
Alignment:
Q  7 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28413299 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattagg 28413200  T
Q  107 attggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactc 206  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28413199 attgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactc 28413100  T
Q  207 atcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28413099 atcatatagtggattggagggctgctct 28413072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 455891 - 456124
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  455891 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 455990  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  455991 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 456090  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456091 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 458268 - 458501
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  458268 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 458367  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  458368 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 458467  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  458468 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 458501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6066069 - 6065836
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6066069 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 6065970  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6065969 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 6065870  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6065869 aaactcatcatatagtggattggatggctgctct 6065836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6063719 - 6063486
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6063719 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtcttttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 6063620  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6063619 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 6063520  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6063519 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 6063486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10621803 - 10621570
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10621803 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 10621704  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  10621703 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 10621604  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10621603 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 10621570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38210354 - 38210587
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38210354 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 38210453  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  38210454 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacg 38210553  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38210554 aaactcatcatatagtggattggagagctgctct 38210587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 746741 - 746974
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  746741 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 746840  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  746841 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 746940  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  746941 ttactcatcatatagtggatcggaggactgctct 746974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25388890 - 25389122
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  25388890 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaacact 25388988  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  25388989 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacatattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 25389088  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25389089 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 25389122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4104168 - 4103938
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4104168 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagcttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 4104069  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  4104068 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 4103970  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgct 232  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4103969 atactcatcatatagtggatcggagggctgct 4103938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38890024 - 38890257
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38890024 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 38890123  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38890124 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 38890222  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38890223 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38890257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 3859512 - 3859744
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3859512 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 3859611  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  3859612 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctctttgtaaca 3859710  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  3859711 atactcatcatatagtggatcgtagggctgctct 3859744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 5191637 - 5191865
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5191637 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 5191736  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5191737 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactcattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 5191835  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctg 230  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||||||    
T  5191836 atactcatcatatagtggatcagagggctg 5191865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4308554 - 4308321
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4308554 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 4308455  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4308454 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 4308356  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4308355 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 4308321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 35777405 - 35777587
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35777405 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 35777504  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35777505 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcatt 35777587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18099443 - 18099210
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18099443 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 18099344  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18099343 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 18099245  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  18099244 attactcatcatatagtggaacggagggctgctct 18099210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 43228279 - 43228508
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43228279 gtttagaaaggcaacaacaaaactagcgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 43228378  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaa 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |    
T  43228379 ggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 43228477  T
Q  204 ctcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43228478 ctcatcatatagtggatcggagggctgctct 43228508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10084662 - 10084429
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10084662 aagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 10084563  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  10084562 attagga-tcgagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttgatttctcttttgtaac 10084464  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10084463 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10084429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25533426 - 25533659
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25533426 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 25533525  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25533526 attaggatt-gagtcttttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 25533624  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25533625 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 25533659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 43226070 - 43226302
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43226070 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactacg-tttgtatagagtttgtctcgttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 43226168  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  43226169 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 43226267  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43226268 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 43226302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 11170388 - 11170621
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  11170388 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgcggattgattcaccttgggaaacact 11170487  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  11170488 attaggatt-gagtgtcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 11170586  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11170587 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 11170621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 30005825 - 30006058
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30005825 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 30005924  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  30005925 attaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaac 30006023  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30006024 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 30006058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 6561794 - 6561985
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6561794 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 6561893  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6561894 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 6561985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22114578 - 22114387
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22114578 aagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacact 22114479  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22114478 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 22114387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28102275 - 28102084
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  28102275 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacgct 28102176  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28102175 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 28102084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 1321483 - 1321696
Alignment:
Q  21 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1321483 acaaaactcgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttg 1321581  T
Q  121 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtgga 219  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||||||||||||||||    
T  1321582 gttacaggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatatagtgga 1321681  T
Q  220 ttggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||    
T  1321682 tcggagggctgctct 1321696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18097173 - 18096940
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18097173 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 18097074  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||||    
T  18097073 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttcccttttgtaac 18096975  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  18096974 gttactcatcatatagtggaacggagagctgctct 18096940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 42990288 - 42990521
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42990288 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 42990387  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  42990388 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaac 42990486  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||| ||| || |||||||||||||    
T  42990487 gttactcatcatatggtgaatcggagggctgctct 42990521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 45882923 - 45883156
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  45882923 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctctttggaacaaacaataaggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 45883022  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  45883023 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaac 45883121  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  45883122 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 45883156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43423736 - 43423520
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43423736 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 43423637  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  43423636 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaac 43423538  T
Q  200 aaaactcatcatatagtg 217  Q
       |||||||||||||||    
T  43423537 gttactcatcatatagtg 43423520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 15 - 234
Target Start/End: Original strand, 1313407 - 1313626
Alignment:
Q  15 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1313407 gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagt 1313505  T
Q  115 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatat 213  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||   |||||||||||    
T  1313506 ctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatat 1313605  T
Q  214 agtggattggagggctgctct 234  Q
    |||| |  |||||||||||||    
T  1313606 agtgaaacggagggctgctct 1313626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9604877 - 9604647
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9604877 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctctttgaaagaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 9604778  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||       
T  9604777 aggatt-gagtctcttggttacggaaagaggttgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtt 9604679  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9604678 actcatcatatagtggatcggagggctgctct 9604647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 53917922 - 53917704
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  53917922 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 53917824  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatata 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    ||||||||||||    
T  53917823 tcttggttacgggaagagattgggattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttactcatcatata 53917724  T
Q  215 gtggattggagggctgctct 234  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  53917723 gtgaaacggagggctgctct 53917704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10956300 - 10956067
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |    
T  10956300 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacatt 10956201  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  10956200 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaac 10956102  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10956101 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 10956067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10958596 - 10958363
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  10958596 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacact 10958497  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  10958496 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgacactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaac 10958398  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  10958397 gttactcttcatatagtggaacggagggctgctct 10958363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27101454 - 27101221
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27101454 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 27101355  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||    
T  27101354 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagaatgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgcaac 27101256  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  27101255 gttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 27101221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18162647 - 18162831
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  18162647 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttttgaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacact 18162746  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18162747 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgat 18162831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 3314668 - 3314859
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3314668 aagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 3314767  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3314768 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3314859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5522888 - 5522667
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5522888 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggt-----------ttgtctcttcggaacaaacactcgggtttgtgggttgatttaccttgggaaacact 5522800  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5522799 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 5522701  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5522700 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5522667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1626956 - 1626723
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  1626956 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctctttggaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacact 1626857  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||     
T  1626856 attaggatt-gagtctcttggttacggggagagattgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaag 1626758  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  1626757 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 1626723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51727279 - 51727047
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  51727279 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtatgtatagagtttgtctctttggaacaaacact-gggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 51727181  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  51727180 attaggattg-agtctcttggttacggtaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 51727082  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  51727081 gttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 51727047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32264312 - 32264121
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  32264312 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 32264213  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32264212 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctggaactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 32264121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 5927037 - 5926856
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  5927037 aagggtttagaaatgcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcgccttgggaaacact 5926938  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 183  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5926937 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 5926856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10191582 - 10191350
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10191582 aagggtttagaaaggcaataacaaaactagggtttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 10191483  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||| | ||||||||||||||  |||||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||    
T  10191482 attagga-tcgagtctcttggttacaggaagaggct-ggactttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccgttcatttctcttttgtaac 10191385  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10191384 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10191350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 29956670 - 29956903
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29956670 aagggtttagaaattcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacattaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 29956769  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| || ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  29956770 attaggatt-gaatctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaac 29956868  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  29956869 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 29956903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 39715453 - 39715644
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  39715453 aagggtttagagaggcaacaccaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 39715552  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39715553 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctctt 39715644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43421688 - 43421472
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  43421688 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 43421589  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  43421588 attagaatt-gagtctcttggttacgggaaaagattggggatttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 43421490  T
Q  200 aaaactcatcatatagtg 217  Q
       |||||||||||||||    
T  43421489 gttactcatcatatagtg 43421472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28100314 - 28100143
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||    
T  28100314 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacgct 28100215  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctt 173  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28100214 attaggatt-gagtcttttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattctt 28100143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7606822 - 7606628
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||    
T  7606822 tagagtttgtctcttcggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgg 7606724  T
Q  139 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7606723 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatttctatttgtaacgttactcgtcatatagtggatcggagggctgctct 7606628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 26720532 - 26720749
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  | |||    
T  26720532 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggtta-act 26720630  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||    
T  26720631 attaggatt-gagtttcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttttaaccctttgatttctcttttgtaac 26720729  T
Q  200 aaaactcatcatatagtgga 219  Q
     | |||||||||||||||||    
T  26720730 gatactcatcatatagtgga 26720749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 24979691 - 24979867
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  24979691 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatact 24979790  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24979791 attaggatt-gagtctcttggttacggaaagagattgagactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaac 24979867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53915754 - 53915578
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  53915754 caacaacaaaactagggtttgtatagattttgtctcttgggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgtgaaacattattaggattg-agtc 53915656  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53915655 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 53915578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 51943358 - 51943587
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  51943358 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 51943457  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || |||||       
T  51943458 aggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttaggtagaattaggcgggagactt-ttcttgtaactcattgacgtctcttttgtaacgtt 51943555  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  51943556 actcatcatatagtgaaacggatggctgctct 51943587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47149168 - 47148977
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaa-caaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || ||||  ||||||||||| |||| ||||||    
T  47149168 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaaacaaacactgggatttgatggttgattcaccttgg-aaacac 47149070  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  47149069 tattatgattg-agtctcttggttacgggaagagattgggtctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 47148977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 880721 - 880491
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  880721 gtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagttcgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 880622  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    || |||| ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||        
T  880621 agcattg-agtctcttggttacggaaagagattggggctttgggtagaattagacgggagagttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagtt 880523  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  880522 actcatcatatagtaaaatggagggctgctct 880491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 36011811 - 36012044
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36011811 aaggatttagaaagacaacaacgaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactatggtttgagggttgattcacgttgggaaacact 36011910  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| || | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  36011911 attaggatt-gaatatcttggttacgggaagagattgtgactttgggtagaattagttgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 36012009  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  36012010 gttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 36012044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53468728 - 53468538
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||    
T  53468728 aagggtttagaatggcaacaacaaaaccagg-tttgtatagagtttgtctctttggaagaaacactagggtttgagcattgattcaccttgggaaacact 53468630  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  53468629 attaggattgaa-tctcttggttacggggagagattgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 53468538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 5 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12268235 - 12268061
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaa-ctagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactat 102  Q
    |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  12268235 gtttagaaagacaacaacaaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttcggaaacactat 12268136  T
Q  103 taggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 178  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12268135 taggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 12268061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 28181009 - 28181182
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28181009 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactgggatttgagggttgattcactttgggaaacaccatt 28181108  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 178  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  28181109 aggatt-gagtctattggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacgtattcttataac 28181182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35918222 - 35917983
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac------tagggtttgtgggttgattcactttggga 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      ||| ||||| |||||||||||| ||| ||    
T  35918222 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgcga 35918123  T
Q  95 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-tt 193  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35918122 aacactattagaattg-agtctcttggttacgagaagagactgggaatttgggtagaaataggagggagacttattcttgtaacccattgatttctcttt 35918024  T
Q  194 ggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     |||||   |||||| ||||||||||  |||| ||||||||    
T  35918023 tgtaacgttactcattatatagtggaacggagagctgctct 35917983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 48361929 - 48361761
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48361929 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaaaactagggtttgagggttgattcacattgggaaacactattaggatt-gagtc 48361831  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  48361830 tcttagttacgggaagagattggggcttttggtagaattaggcggaagactttttcttgtaactcattga 48361761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 54691847 - 54691656
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  54691847 aaggttttagaaaggcgacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 54691748  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||    
T  54691747 attaggatt-gaattttttggttatgggaagagattagggctttgagttgaattaggcgggagacttattcttgtatttcattgatatctctt 54691656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28761701 - 28761511
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | |||||||||| |||| |||||||    
T  28761701 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacacaagggtttgagagttgattcaccttggaaaacact 28761603  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28761602 attaggattg-agtctcttggttacaggaagatattgagactttaggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatatctctt 28761511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 15780886 - 15781039
Alignment:
Q  32 gtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaag 131  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  15780886 gtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattacgatt-gagtctcttggttacgggaag 15780984  T
Q  132 agattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||  || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15780985 aggctgagactttcggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 15781039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 23637025 - 23637198
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23637025 caacaagaaaactagggtttgtatagagtctg-ctcttggcaacaaacactagggtttg--ggttgatttaccttgagaaacactattaggattg-agtc 23637120  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23637121 tcttgttcatgggaagatattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 23637198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 31151333 - 31151507
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  31151333 aagggtttagaaat-caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacact 31151428  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 180  Q
    |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31151429 attaggattg-agtctcttggtcacgggaaaagattgggactttgggtagaattaggcgggtgacttattcttgtaaccc 31151507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51674997 - 51674806
Alignment:
Q  43 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggact 142  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |    
T  51674997 gtttgtccctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagagattgggatt 51674899  T
Q  143 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||||    |||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  51674898 ttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatactgaaatggagggctgctct 51674806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13420432 - 13420268
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  13420432 aaactagggtttgtatagagttt-tctctaggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtc 13420338  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  13420337 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 13420268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 890044 - 889855
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  890044 aagggtttagaatggcaacaa--aacctagggtttgtatagagtttgtctatttggcaacaaacactggggtttgatggttgattcaccttgggaaacac 889947  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  889946 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagag-ttggggctttgggtagaattaggcaggagagttattcttgtaacccactgatatctctt 889855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 6484372 - 6484577
Alignment:
Q  30 gggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatggg 128  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||    
T  6484372 gggtttgtgtagagtttgtctcttcggcaacaaataccggggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggtttg-agtctcttggttacggg 6484470  T
Q  129 aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttc-tcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggaggg 227  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || ||||    ||||||||||||||| |  ||||||    
T  6484471 aagagattggggttttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatatcttttttgtaaagttactcatcatatagtgaaacggaggg 6484570  T
Q  228 ctgctct 234  Q
    |||||||    
T  6484571 ctgctct 6484577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 42992270 - 42992417
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  42992270 aagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgagaaacact 42992369  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtag 150  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  42992370 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagagagt-ggactttgggtag 42992417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 234
Target Start/End: Original strand, 5886261 - 5886415
Alignment:
Q  78 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5886261 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5886358  T
Q  178 cccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||| |||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5886359 cccattgatttgtctttgaaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5886415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 78 - 234
Target Start/End: Original strand, 5899734 - 5899888
Alignment:
Q  78 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5899734 gttgattcaccttgg-aaacactattagggttg-agtctcttggttacgggaagtgattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa 5899831  T
Q  178 cccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||| | |||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5899832 cccattgatttctctttgcaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 5899888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 39 - 186
Target Start/End: Original strand, 32219106 - 32219252
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 138  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  32219106 tagagtttgtctctttgtaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatcaggattg-agtctcttggttgcgggaagagattgg 32219204  T
Q  139 gactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  32219205 gactttgggcagaattaggcggaagacttatttttgtaacccattgat 32219252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 68 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 25688367 - 25688243
Alignment:
Q  68 gggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagactt 167  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25688367 gggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactt 25688269  T
Q  168 attcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  25688268 attcttgtaacccattgatatctctt 25688243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 193
Target Start/End: Original strand, 6231849 - 6231975
Alignment:
Q  65 ctagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 164  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6231849 ctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattagtgttg-agtctcttggttacgggaagagattggga-tttgggtagaattaggcgggaga 6231946  T
Q  165 cttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6231947 cttattcttgtaacccattgatatctctt 6231975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 17795269 - 17795433
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  17795269 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 17795363  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17795364 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 17795433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 19103709 - 19103873
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||| || ||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||     
T  19103709 aaactagagtctgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcactttgggaaaaactattaggattg-agtctcttggtc 19103803  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | || ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19103804 acggaaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 19103873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 25635391 - 25635549
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  25635391 aaactagggtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattggttcaccttgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 25635486  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25635487 acgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgat 25635549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28137541 - 28137415
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 138  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28137541 tagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacactattagga-tgaagtctcttggttacgggaagagattgg 28137443  T
Q  139 gactttgggtagaattaggcgggagact 166  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||    
T  28137442 ggctttgggtagaattaggcggaagact 28137415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 217
Target Start/End: Original strand, 53591210 - 53591384
Alignment:
Q  43 gtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggact 142  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| | ||| ||||| ||| |    
T  53591210 gtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattcgaattg-agtctcttggttacgagaatagatttggatt 53591308  T
Q  143 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  53591309 ttgggtagaattaggcgggagacttattcttctaatccattgatatctcatttgtaacgttactcatcatatagtg 53591384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Original strand, 23633458 - 23633671
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  |||||||| ||   |||||||||||||||||||| ||||    
T  23633458 caacaagaaaactagggtttgtatagtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgatttacc--gggaaacactattaggattg-agtc 23633551  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatca-tata 214  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    |||||||| ||||    
T  23633552 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccgatgatatctctttgtaaagttactcatcattata 23633651  T
Q  215 gtggattggagggctgctct 234  Q
    ||| |  |||||||||||||    
T  23633652 gtgaaaaggagggctgctct 23633671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 41849136 - 41849244
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||    
T  41849136 aagggtttagaataacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaactct 41849235  T
Q  101 attaggatt 109  Q
    |||||||||    
T  41849236 attaggatt 41849244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 562024 - 561866
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||     
T  562024 aaactagggtttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttca--ggttgattcacattgggaaacactattaggattt-agtctcttggtc 561929  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  561928 acgtgaagagattgagactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaagtcattgat 561866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 193
Target Start/End: Original strand, 4666535 - 4666691
Alignment:
Q  38 atagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 137  Q
    |||| |||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  4666535 atagggtttgtctcttgacaacagacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattatgattg-agtctctaggttacgggaagagattg 4666633  T
Q  138 ggactttgggtagaattaggcgggaga--cttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4666634 agactttgggtagaattaggcgggagatccttattcttgtaatccattgatatctctt 4666691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 54884141 - 54884329
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||||    
T  54884141 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagaatttgta--gagtttgtttctttggaacaaacactagggtttgatggttgattcatcttggaaaacact 54884238  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    
T  54884239 attaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattgaaactttgaatagaattaggagggagacttatt-ttgtaatctattgatatctctt 54884329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 17 - 186
Target Start/End: Original strand, 1673975 - 1674140
Alignment:
Q  17 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtct 116  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  1673975 aacaagaaaactagtgtttgtatatagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttag--gattgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtct 1674070  T
Q  117 cttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1674071 cttgatcacgggaagagattgggactttgggtagaaatagacgggagacttattcgtgtaaccctttgat 1674140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 81 - 234
Target Start/End: Original strand, 11168165 - 11168318
Alignment:
Q  81 gattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 180  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11168165 gattcaccttgggaaacactattaggattg-agtgtcttggttacgggaagaggctgggaatttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaaccc 11168263  T
Q  181 attgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||| || |||||   ||| |||||||| ||||  |||||||||||||    
T  11168264 attgatttctcttttgtaacgttacttatcatatattggaacggagggctgctct 11168318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 53597238 - 53597404
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||   |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  53597238 caacaagaaaactaggggttgtatagagttt-tctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 53597333  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  53597334 tcttggtcatgagaatagattgagattttgagtagaattaggcaagagacttattcttgtaacccgttgat 53597404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 11163134 - 11163218
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattc 85  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11163134 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtggattgattc 11163218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36871557 - 36871341
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |  | ||||||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||    
T  36871557 caacaagaaaactagggcttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacaccagggttag--gattgattcaccttggaaaacactgttaagattg-agtc 36871462  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatca-tat 213  Q
    ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||||    | |||||| |||    
T  36871461 tcttggtcacggaaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgcaaccctttgttatctctttgtaaagttaatcatcattat 36871362  T
Q  214 agtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||  |||||||||||||    
T  36871361 agtggaacggagggctgctct 36871341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Original strand, 3306839 - 3306936
Alignment:
Q  95 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3306839 aacactattaggattg-agtctcttggttacagaaagatattggagttttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctt 3306936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 47701868 - 47701798
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 71  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  47701868 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacaccagggt 47701798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 4560497 - 4560401
Alignment:
Q  61 aacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 158  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4560497 aacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagcctgttggttaccggaagagattggagctttgggtagaattaggc 4560401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 6231433 - 6231502
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 70  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  6231433 aaggatttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaggg 6231502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 186
Target Start/End: Original strand, 24181488 - 24181548
Alignment:
Q  126 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24181488 gggaaaagattgggactttgggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgat 24181548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 122
Target Start/End: Original strand, 24177278 - 24177380
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  24177278 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactaaggtt--ggggttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtc 24177373  T
Q  116 tcttggt 122  Q
    |||||||    
T  24177374 tcttggt 24177380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 27635884 - 27635830
Alignment:
Q  17 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27635884 aacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggt 27635830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1620657 - 1620501
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | || ||  |||||||||    
T  1620657 ttgattcaccttggaaaacactattaggattag-gtcttttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaaggctagttcttgtaa 1620559  T
Q  178 cccattgatttctcttggtaacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||| ||||| |||||| ||||    |||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  1620558 ccctttgatatctctttgtaaacttactcatcattatagtggaacggagggctgctct 1620501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 145 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 47701801 - 47701711
Alignment:
Q  145 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  47701801 gggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaggttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 47701711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 154
Target Start/End: Original strand, 13419883 - 13420015
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  13419883 caacaagaaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattagga-tcaagtc 13419976  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatt 154  Q
    ||||||| | || ||||||||   | |||||||||||||    
T  13419977 tcttggtcacggaaagagattcaaattttgggtagaatt 13420015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 3306783 - 3306842
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaca 60  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3306783 aagggtttagaaatacaacaacaaaactaggatttgaatagagtttgtctctttggaaca 3306842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 14634638 - 14634524
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || | | |||||||||| |||||||||||| ||||||   | ||||| ||||||||||    
T  14634638 ttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gtgtctcttagtcacgagaagagattgagactttgggtagcattaggtttgaagactgattcttgtaa 14634540  T
Q  178 cccattgatttctctt 193  Q
     || ||||| ||||||    
T  14634539 acctttgatatctctt 14634524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 15780844 - 15780891
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 48  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15780844 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 15780891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 122
Target Start/End: Original strand, 25633930 - 25634024
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |   || ||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25633930 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggct--gggattgattcaccttgggagacattattaggatt-gagtctcttggt 25634024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27635792 - 27635698
Alignment:
Q  141 ctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || |||||   ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  27635792 ctttgggtaaaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 27635698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 11066652 - 11066731
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11066652 ttgattcaccttggagaaacactattaggattgaa-tcttttgatcacgggaagagattcgggactttgggtagaattagg 11066731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27762165 - 27762107
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27762165 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 27762107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10094256 - 10094195
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10094256 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10094195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10201136 - 10201075
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  10201136 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 10201075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 16462203 - 16462264
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16462203 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16462264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22626166 - 22626105
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22626166 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22626105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 47883064 - 47883003
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47883064 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47883003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11007679 - 11007633
Alignment:
Q  111 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11007679 gagtctcttggtcacaggaagagattgagactttgggtagaattagg 11007633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 61 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 7606873 - 7606828
Alignment:
Q  61 aacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 106  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7606873 aacagtaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 7606828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29914132 - 29913998
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttgg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||| |    
T  29914132 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctctttg 29914038  T
Q  196 taacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||  |||||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  29914037 taaagaaactcatcattatagtggatcgaagagctgctct 29913998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 47878350 - 47878292
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  47878350 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 47878292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 54193229 - 54193287
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  54193229 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 54193287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 54 - 287
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 153  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  154 attaggattggagtctcttggttacgtgaagagattgagactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 253  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 94)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7351927 - 7351694
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7351927 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggctttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 7351828  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  7351827 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 7351728  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7351727 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 7351694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7349546 - 7349315
Alignment:
Q  3 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactat 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7349546 gggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 7349447  T
Q  103 taggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaa 202  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  7349446 taggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaa 7349347  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7349346 actcatcatatagtggattggagggctgctct 7349315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1047197 - 1046967
Alignment:
Q  3 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactat 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1047197 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactat 1047098  T
Q  103 taggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaa 202  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  1047097 taggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgat 1046999  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1046998 actcatcatatagtggattggagggctgctct 1046967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1049570 - 1049338
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1049570 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 1049471  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    || ||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  1049470 atcaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 1049372  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1049371 atactcatcatatagtggattggagggctgctct 1049338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31156186 - 31155953
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31156186 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactaggatttgtgggttgattcaccttgggaaacact 31156087  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  31156086 attaggattggagtctcttgggtacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 31155987  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31155986 gtactcatcctatagtggattggagggctgctct 31155953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40837017 - 40836785
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40837017 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 40836918  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  40836917 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 40836819  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40836818 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 40836785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38394000 - 38394233
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38394000 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 38394099  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  38394100 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 38394198  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38394199 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38394233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 3035735 - 3035971
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3035735 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 3035834  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaaga---gattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggt 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   |  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  3035835 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaagaggctgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgc 3035933  T
Q  197 aacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3035934 aacgatactcatcatatagtggattggagggctgctct 3035971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7472255 - 7472022
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7472255 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 7472156  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7472155 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggcgggacacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 7472057  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7472056 gttactcatcatatagtggatcggatggctgctct 7472022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20297376 - 20297609
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20297376 aagggtttagaatggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 20297475  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20297476 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaaataggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 20297574  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20297575 gatactcatcatatagtggattggagggctgctct 20297609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7470297 - 7470065
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7470297 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagattgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacact 7470198  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  7470197 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 7470099  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 233  Q
       |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7470098 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctc 7470065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 44724593 - 44724826
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  44724593 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 44724692  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  44724693 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 44724791  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44724792 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 44724826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 48457667 - 48457900
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||    
T  48457667 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttcattcacctagggaaacact 48457766  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  48457767 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 48457865  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  48457866 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 48457900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 1849995 - 1850228
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  1849995 aagggtttagaaaggcaacaaaaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 1850094  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1850095 attaggatt-gagtttcttgcttacgggaagaggctgggactttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 1850193  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1850194 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 1850228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 3878591 - 3878824
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||    
T  3878591 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggcttgtgggttgattcaccttggtaaacact 3878690  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  3878691 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 3878789  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3878790 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 3878824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20626052 - 20626285
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20626052 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 20626151  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20626152 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 20626250  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20626251 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 20626285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20629943 - 20630176
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20629943 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 20630042  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20630043 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 20630141  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20630142 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 20630176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20642362 - 20642595
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20642362 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctgtttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 20642461  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20642462 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggatggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 20642560  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20642561 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 20642595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 25542547 - 25542775
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  25542547 ggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaaaaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgg-aaagactatt 25542645  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaa 203  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |    
T  25542646 aggattg-agtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgtta 25542744  T
Q  204 ctcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  25542745 ctcatcatatagtggatcggagagctgctct 25542775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 40946342 - 40946575
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40946342 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaaacaaacactagggtttgtgggttgatttactttggaaaacact 40946441  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  40946442 attaggatt-gagtctcttagttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacctattgatttctcttttgtaac 40946540  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  40946541 gttactcatcatatagtggatcgaagggctgctct 40946575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 18345555 - 18345784
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18345555 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgcaacaaatactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 18345654  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18345655 attaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 18345753  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctg 230  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||    
T  18345754 gatactcatcatatagtggatcggagggctg 18345784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 234
Target Start/End: Original strand, 20299475 - 20299707
Alignment:
Q  3 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcactttgggaaacacta 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  20299475 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 20299574  T
Q  102 ttaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  20299575 ttaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacg 20299673  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  20299674 ttactcatcatatagtggatcggagggttgctct 20299707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20137384 - 20137193
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20137384 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 20137285  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20137284 attaagatt-gagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 20137193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 220
Target Start/End: Original strand, 11757245 - 11757463
Alignment:
Q  3 gggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcactttgggaaacacta 101  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||    
T  11757245 gggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggttttgagggttgattcaccttgggaaacacta 11757344  T
Q  102 ttaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaaca 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||     
T  11757345 ttaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacg 11757443  T
Q  201 aaactcatcatatagtggat 220  Q
      ||||||||||||||||||    
T  11757444 ttactcatcatatagtggat 11757463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 27306504 - 27306272
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27306504 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt-tatagagtttgtctctttggaacaaaaactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 27306406  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||||    
T  27306405 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgcaacccattgatatctcttttgtaac 27306307  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27306306 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 27306272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 28487567 - 28487800
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  28487567 aagggtttagaaaggtaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttcgaaactaacactagggttcgtgggttgattcacctttggaaacact 28487666  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28487667 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 28487765  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| ||  ||||| ||||||    
T  28487766 gttactcatcatatagtgaatcagagggttgctct 28487800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Original strand, 443612 - 443800
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  443612 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 443711  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  443712 aggatt-gagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaatccattgatatctctt 443800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 35643 - 35874
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  35643 aagggttcagaaagacaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 35742  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35743 attatgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 35841  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgct 232  Q
       |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  35842 gttactcatcatatagtggaacggagagctgct 35874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13099751 - 13099560
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13099751 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacact 13099652  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13099651 attaagatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 13099560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28485580 - 28485771
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  28485580 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgcgggttgattcacctttggaaacact 28485679  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28485680 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgagtataattaggcgggagatttattcttgtaatccattgatttctctt 28485771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Original strand, 25276160 - 25276346
Alignment:
Q  6 tttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattag 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  25276160 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacactattag 25276259  T
Q  106 gattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25276260 gatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaaccattgatatctctt 25276346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 11355272 - 11355456
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11355272 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 11355371  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11355372 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgat 11355456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 21680041 - 21680232
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  21680041 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacact 21680140  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  21680141 attaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgggactttgggtagaattagacgggagatttattcttgtaacccaatgatatctctt 21680232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 24748608 - 24748799
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  24748608 aagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccctgggaaacact 24748707  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24748708 attacgatt-gagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 24748799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31435322 - 31435131
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31435322 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 31435223  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31435222 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctggaactttgggtagaattaggtggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 31435131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 44578 - 44796
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||    
T  44578 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttaggaaacact 44677  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  44678 attatgatt-gagtcttttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattatgtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 44776  T
Q  200 aaaactcatcatatagtgga 219  Q
       |||||||||||||||||    
T  44777 gttactcatcatatagtgga 44796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42331274 - 42331081
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  42331274 aagggtttagaatgacaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 42331175  T
Q  101 attaggattggagtctcttggtt--atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42331174 attaggatt-gagtctcttggttacacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 42331081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 4296210 - 4295993
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  4296210 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgatggttgattcaccttgggaaacac 4296111  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| || ||||    
T  4296110 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 4296012  T
Q  199 caaaactcatcatatagtg 217  Q
    |   |||||||||||||||    
T  4296011 cgttactcatcatatagtg 4295993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21678080 - 21678264
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21678080 aagggtttagaaaggcaacatcaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 21678179  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21678180 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagatattgggactttgggtagcattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgat 21678264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37412403 - 37412211
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  37412403 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 37412304  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  37412303 tattaggattg-agtctcttggttacaggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 37412211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27832908 - 27832717
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27832908 aagggtttaaaaaggcaacaacagaactaaggtttgtatagagtttgtctcttggcaacatacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 27832809  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27832808 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtaaaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 27832717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 9680833 - 9681067
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||    
T  9680833 aagggtttagaagggcaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcacctcgggaaacac 9680932  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | || || ||||    
T  9680933 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggtagacttattcttgtaactcattgatatatcttttgtaa 9681031  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
        ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  9681032 agttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 9681067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39146262 - 39146071
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||    
T  39146262 aagggtttagatagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttggaaaacact 39146163  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  39146162 attatgatt-gagtctcttggttacgggaagagattggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctctt 39146071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21592415 - 21592185
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||    
T  21592415 ggtttagaaatgcaacaacaaaagtaggatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggcaagcactatt 21592316  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    ||||||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| || |||||       
T  21592315 aggatt-tagtctcttggttacgcgaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgacatctcttttgtaacgtt 21592217  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21592216 actcatcatatagtgaaacggagggctgctct 21592185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43253776 - 43253559
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  43253776 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 43253679  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatata 214  Q
    ||||| ||| || |||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||   ||||||||||||    
T  43253678 tcttgattacggaaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 43253579  T
Q  215 gtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||  ||||||||||||    
T  43253578 gtggatcagagggctgctct 43253559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 9679088 - 9679264
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||    
T  9679088 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgaggattgattcaccttgggaaacactattaggattg-agt 9679185  T
Q  115 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9679186 ctcttggttacgtgaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 9679264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 26804583 - 26804765
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacac---tagggtttgtgggttgattcactttgggaaac 97  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  26804583 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagtagggtttgagggttgattcaccttgggaaac 26804682  T
Q  98 actattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 181  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26804683 actattaggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 26804765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 42223171 - 42223405
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  42223171 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacac 42223270  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||    
T  42223271 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggagctttggatagaattaggcggaaaacttattcttgaaacctattgatatctcttttgtaa 42223369  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   ||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  42223370 cgttactcatcatatagtgaaatggatggctgctct 42223405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21990164 - 21990397
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  21990164 aagggtttagaatgacaacaacaaaactatgatttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 21990263  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  21990264 attagaatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgagtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgatatctcttttgtaac 21990362  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  21990363 gttactcatcatatagtggaacagagggctgctct 21990397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22828904 - 22828717
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||   |||||||||||| |||||  ||||||||||  || | |||||||||||    
T  22828904 gtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttatctcttgaaaacaaacactagagtttgatggttgattcagattagaaaacactatta 22828805  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22828804 ggattg-agtctcttggttatgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 24258477 - 24258668
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  24258477 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactatggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 24258576  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24258577 attaggatt-gagtctcttggtcacgggaaaagattgagactttggatagaattaggcggaaaacttattcttgtaacccattgatatctctt 24258668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 57 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7092431 - 7092254
Alignment:
Q  57 aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 156  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7092431 aacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaatactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7092333  T
Q  157 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7092332 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 7092254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 2935374 - 2935515
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2935374 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 2935473  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  2935474 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 2935515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 1606486 - 1606626
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1606486 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 1606584  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  1606585 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 1606626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 65 - 234
Target Start/End: Original strand, 38396713 - 38396881
Alignment:
Q  65 ctagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga 164  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38396713 ctaggttttgtgggttgattcaccttgggaaacactgttaggatcg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggaga 38396811  T
Q  165 cttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  38396812 cttatttttgtaacccattgatttctctttgtaactttactcatcatatagtggatcggagggcttctct 38396881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22251813 - 22251641
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||        ||    
T  22251813 gtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttggga--------ta 22251722  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22251721 ggattg-agtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 22251641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 57 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7094678 - 7094502
Alignment:
Q  57 aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 156  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7094678 aacaaaca-tagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttaattacgggaagagattggggctttgggtagaattag 7094581  T
Q  157 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  7094580 gcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 7094502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 9027376 - 9027236
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9027376 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 9027278  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  9027277 ttgtaacgttactcatcaaatagtggataggagggctgctct 9027236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 22137184 - 22137324
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22137184 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 22137282  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22137283 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 22137324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 24813755 - 24813593
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||   |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24813755 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaagaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaagcactattaggattg-agtc 24813661  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 183  Q
    ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24813660 tcttggtgacgggaagtgattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccatt 24813593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 40552211 - 40552351
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40552211 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 40552309  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40552310 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 40552351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 22108173 - 22108313
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22108173 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 22108271  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22108272 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 22108313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 40549933 - 40550073
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40549933 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 40550031  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40550032 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 40550073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24817610 - 24817438
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||| || || ||||||||||| ||||    
T  24817610 caacaagagaactagggtttgtatagagtttg-ctctttgcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttggaaagcagtattaggattg-agtc 24817516  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  24817515 tcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatgtctctt 24817438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20091797 - 20091629
Alignment:
Q  21 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||| | ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  20091797 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctattggcaacaaagattagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattaaa-tctcttg 20091702  T
Q  121 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20091701 gtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 20091629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 18567627 - 18567731
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18567627 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 18567726  T
Q  101 attag 105  Q
    |||||    
T  18567727 attag 18567731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 24 - 186
Target Start/End: Original strand, 24465578 - 24465735
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |  ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  24465578 aaactagggtttgtatagcgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gaattgattcaccttgggaaacaatattaggattg-agtctcttggtc 24465672  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  24465673 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagatttattcttttaactcattgat 24465735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Original strand, 7188571 - 7188737
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  7188571 caacaataaaaatagggtttgtatagggtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtc 7188666  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  7188667 tcttggtcacgggaatagattgagactttgggtagaattaagcgggagacttatttttataacccattgat 7188737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 24 - 135
Target Start/End: Original strand, 22392502 - 22392608
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || || | ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  22392502 aaactagggtttgtatagaatttg-ctattggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtc 22392596  T
Q  124 atgggaagagat 135  Q
    | ||||||||||    
T  22392597 acgggaagagat 22392608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Original strand, 11081540 - 11081675
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11081540 caacaacaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcactttgggaaacactattaggatt-gagtc 11081633  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||| | | ||||||||||| ||| |||| ||| |||||||    
T  11081634 tcttgatcacgggaagagattaggattttgtgtaaaattagg 11081675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Original strand, 6348920 - 6348987
Alignment:
Q  126 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  6348920 gggaaaagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatatctctt 6348987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 193
Target Start/End: Original strand, 26295586 - 26295652
Alignment:
Q  127 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26295586 ggaagcgattgtgactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 26295652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 79 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16297222 - 16297146
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 156  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16297222 ttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattag 16297146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 142 - 193
Target Start/End: Original strand, 22393876 - 22393927
Alignment:
Q  142 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22393876 tttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22393927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Original strand, 6332311 - 6332425
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaa 177  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |   |||||||||| |||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  6332311 ttgattcagtttggaaaacactattaagattg-agtctcttggtcacaagaagagattgagactttaggtagaattaggcttgaagacttattcttgtaa 6332409  T
Q  178 cccattgatttctctt 193  Q
    ||| || || ||||||    
T  6332410 ccctttaatatctctt 6332425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 38396330 - 38396377
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgt 48  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38396330 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagtgtttgt 38396377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 40281572 - 40281466
Alignment:
Q  82 attcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggga-gacttattcttgtaaccc 180  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  40281572 attcaccttgggaaacaccgttaggattg-agtctgttggtcacgggaagagattgagacttttggtggaattaggtttgaagacttattcttgtaaccc 40281474  T
Q  181 attgattt 188  Q
     |||||||    
T  40281473 tttgattt 40281466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 11084467 - 11084544
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11084467 ttgatttaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgagaagagattcgaactttgggtaaaattagg 11084544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 16 - 157
Target Start/End: Original strand, 6048903 - 6049039
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttg-ggaaacactattaggattggagt 114  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |   |||||| | ||||||||||| |||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||||| || |    
T  6048903 caacatcaaaactagggtttgtaaagaat---tctcttggcaacaaacacta-ggtttg-ggattgattcaccttgaagaaacactattaggatt-gaat 6048996  T
Q  115 ctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||| | | ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  6048997 ctcttggtcacgagaagatattgagactttggatagaattagg 6049039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 21369642 - 21369703
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21369642 aaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattgggac-ttgggtaaaattagg 21369703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Original strand, 25351353 - 25351486
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||    
T  25351353 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactgattcttgtaactca---atatctct 25351447  T
Q  193 tggtaacaaaactcatca-tatagtggattggagggctg 230  Q
    | ||||  |||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  25351448 ttgtaaagaaactcatcattatagtggatcggagagctg 25351486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 26210631 - 26210710
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26210631 ttgattcaccttggagaaatactattaggattg-agtctcttggtaacggaaagagattcgggactttcggtagaattagg 26210710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 2120899 - 2120960
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  2120899 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 2120960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3320232 - 3320171
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3320232 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3320171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3324980 - 3324919
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  3324980 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 3324919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 7069780 - 7069841
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7069780 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7069841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 7074787 - 7074848
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  7074787 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 7074848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 25357047 - 25357108
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25357047 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25357108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 25405393 - 25405454
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25405393 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25405454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 25410130 - 25410191
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25410130 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25410191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 42006663 - 42006724
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  42006663 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 42006724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 136 - 234
Target Start/End: Original strand, 6046641 - 6046741
Alignment:
Q  136 tgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctc 233  Q
    ||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||    |||||||| ||||||||| || || |||||||    
T  6046641 tgggactttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaaacctttgatatctctttgtaaagttactcatcattatagtggaatgaagagctgctc 6046740  T
Q  234 t 234  Q
    |    
T  6046741 t 6046741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 30246973 - 30247031
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  30246973 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 30247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44512704 - 44512646
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  44512704 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 44512646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 85)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 15552249 - 15552482
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15552249 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttatctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 15552348  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  15552349 attaggattggagtctcttgattacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 15552448  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552449 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 15552482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31179646 - 31179413
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31179646 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 31179547  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||     
T  31179546 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattcatttctctttgtaacg 31179447  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31179446 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 31179413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 31545084 - 31545317
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31545084 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 31545183  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31545184 attaggattagagtctcttggttacgggaagaaattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 31545283  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31545284 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 31545317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 31542739 - 31542971
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31542739 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 31542838  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  31542839 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattctcg-aacccattgatttctctttgtaaca 31542937  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31542938 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 31542971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34477329 - 34477095
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34477329 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 34477230  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaac 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34477229 attatgattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 34477130  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34477129 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 34477095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 2174923 - 2175155
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2174923 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 2175022  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2175023 attatgatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 2175121  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  2175122 ttacttatcatatagtggatcggagggctgctct 2175155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38882110 - 38882342
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38882110 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 38882209  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  38882210 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 38882308  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  38882309 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 38882342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 34479694 - 34479460
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34479694 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 34479595  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaac 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34479594 attatgattggagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 34479495  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34479494 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 34479460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 4236637 - 4236866
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  4236637 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacactatta 4236736  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaa 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |    
T  4236737 ggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 4236835  T
Q  204 ctcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4236836 ctcatcatatagtggatcggagggctgctct 4236866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21684726 - 21684494
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||    
T  21684726 aagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacact 21684627  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21684626 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaaca 21684528  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21684527 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 21684494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 6745077 - 6745305
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6745077 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 6745175  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaa 203  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |    
T  6745176 ggattg-agtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgtta 6745274  T
Q  204 ctcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6745275 ctcatcatatagtggatcggagggctgctct 6745305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25804029 - 25804262
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25804029 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 25804128  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25804129 attaggatt-gagtctcttggttacgagaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 25804227  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25804228 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 25804262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10529374 - 10529141
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10529374 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttttatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 10529275  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  10529274 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 10529176  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  10529175 gttactcatcatatagtgaatcggaaggctgctct 10529141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 39854487 - 39854720
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  39854487 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 39854586  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  39854587 attaggatt-gagtctcatggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 39854685  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39854686 gctactcatcatatagtggatcggagggctgctct 39854720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 16776162 - 16776392
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16776162 aagggtttacaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 16776261  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||    
T  16776262 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatttctcttttgtaac 16776359  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgct 232  Q
       ||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  16776360 gttacttatcatatagtggatcggagggctgct 16776392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 21948030 - 21948263
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21948030 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 21948129  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  21948130 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagaggctgggactttgggtggaattaggcgggagacttattcttgtaaccccttgatatctcttttgtaac 21948228  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  21948229 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 21948263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25921748 - 25921515
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25921748 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgtgaaacact 25921649  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25921648 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactctgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 25921550  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  25921549 gttactcatcatatagtggaacggagagctgctct 25921515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 6747310 - 6747541
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  6747310 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagagtttgtataaaatttgtctctttgaaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacact 6747408  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||     
T  6747409 attaggattg-agtctcttggttacgggaagagactgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctttttgtaacg 6747507  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6747508 ttactcgtcatatagtggatcggagggctgctct 6747541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 18469015 - 18469233
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18469015 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 18469114  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18469115 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttaggtagaattaggcgggagactttttcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 18469213  T
Q  200 aaaactcatcatatagtgga 219  Q
     | ||||||||| |||||||    
T  18469214 gatactcatcatctagtgga 18469233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 18466688 - 18466921
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18466688 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttgaaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 18466787  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18466788 attaggatt-gagtctcttggttacggaaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 18466886  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | |||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  18466887 gatactcatcatataatggaacggagagctgctct 18466921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 18511487 - 18511254
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18511487 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 18511388  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||     
T  18511387 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaaa 18511289  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  18511288 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 18511254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 27910457 - 27910687
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  27910457 ggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 27910556  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  27910557 aggatt-gaatctcttggttacgggaagaggctgtgactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgat 27910655  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||| ||||  |||| ||||||||    
T  27910656 actcatcatataatggaacggagagctgctct 27910687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 27912540 - 27912758
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27912540 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaataataggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 27912639  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27912640 attaggatt-gagtctcttggttacgtgaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 27912738  T
Q  200 aaaactcatcatatagtgga 219  Q
     | |||||||||||||||||    
T  27912739 gatactcatcatatagtgga 27912758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1189880 - 1189693
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1189880 gtttagaaaggcaacaacaaaactacggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcactttgggaaacactatta 1189781  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  1189780 tgatt-gagtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 1189693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 16092475 - 16092292
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16092475 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagggtttgtatagagtctgtctctttgcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 16092376  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092375 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 16092292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 40221526 - 40221717
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  40221526 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttggaaaacact 40221625  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40221626 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagagattgggacttttggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 40221717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18509593 - 18509417
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  18509593 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 18509494  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18509493 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagaatgggactttgggtagaattaagcgggagacttattcttgtaac 18509417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17072887 - 17073078
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  17072887 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 17072986  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17072987 attaggatt-gaatctcttggttaggggaagagattggggctttcgatagaattaggcggaagacttattcttgtaactcattgatatctctt 17073078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 25904107 - 25904297
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25904107 aagggtttagaaagacaacaacaaaactagggattgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 25904206  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25904207 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattagggctttgagtataattaggcgggagacttattcttgtaacacattgatatctct 25904297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 178
Target Start/End: Original strand, 6756501 - 6756674
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6756501 ggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattctccttgggaaacactatt 6756600  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 178  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6756601 aggatt-gagtatcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 6756674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39398268 - 39398077
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  39398268 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacactagg-tttgagggttgattcaccttgggaaacac 39398170  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39398169 tattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattggaactttgggtagaattaggcagtagacttattcttgtaacccattgatatctctt 39398077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 658610 - 658395
Alignment:
Q  19 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctct 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  658610 caacaaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacactattagga-tcgagtctct 658512  T
Q  119 tggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtg 217  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  658511 tggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 658412  T
Q  218 gattggagggctgctct 234  Q
     |  ||| |||||||||    
T  658411 aaacggatggctgctct 658395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31472888 - 31472697
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31472888 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 31472789  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  31472788 attaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgggatgcatcttcttctaacccattgatatctctt 31472697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34530937 - 34530750
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34530937 gtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgaaggttgattcaccttgggaaacactatta 34530838  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  34530837 ggatt-gagtctcttggctacgggaagagattaggactttgagtagaattaggcgggagatttattcttgtaactcattgatatctctt 34530750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Original strand, 4410090 - 4410259
Alignment:
Q  64 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 163  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410090 actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggag 4410188  T
Q  164 acttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4410189 acttattcttgtaacctattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggattggagagctgctct 4410259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10474598 - 10474407
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  10474598 aaggatttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactggggtttgagggttgatacaccttgggaaacact 10474499  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  10474498 attaagatt-gaatctcttggttacaggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 10474407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 2954420 - 2954653
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || | |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2954420 aagggtttagaaagacagcaacaaaactagggtttgtgtataatttgtctctttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcactttggaaaacac 2954519  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaac 199  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  2954520 tattaggattg-agtctcttagttacgagaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctttgtaaa 2954618  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||| ||||||    
T  2954619 gttactcatcatatagtgaagcggagggatgctct 2954653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 18596664 - 18596840
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  18596664 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacaatatggtttgagggttgattcaccttggaaaacactgttaggatt-gagtc 18596762  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  18596763 tcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgatatctctt 18596840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17818761 - 17818574
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  17818761 gtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagttcgtctctttggaacaaacactagggtttgatggttgatttaccttgggaaacactatta 17818662  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     || | |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17818661 agact-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 17818574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 20045014 - 20045172
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20045014 aagggtttaggaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 20045113  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 160  Q
    |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20045114 attatgatt-gagtctcttggttccgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 20045172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 31466250 - 31466070
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  31466250 ggtttaaaaaagtaacgacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacaccagggtttgacggttgattcaccttgagaaacagtatt 31466151  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31466150 aggatt-gagtctcttggttacgggaagagatttggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgat 31466070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3373320 - 3373179
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3373320 gaaacactattaggattgaagtctcttagttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 3373221  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3373220 ttgtaacgaaactcatcatatagtggattggagggttgctct 3373179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 37706052 - 37705864
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37706052 ggtttagaaaggcaacgacaaatctagggtttgtatagactttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 37705953  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37705952 aggatt-gagtctcttggttacgtgaagagattagggttttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 37705864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 219
Target Start/End: Original strand, 26097740 - 26097954
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  26097740 ggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttggatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagagggttgattcacctt-ggaaacactatt 26097838  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||| | |||||||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || |||||       
T  26097839 aggaat-gagtctcttggttacgggaaaatgctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaacgtt 26097937  T
Q  203 actcatcatatagtgga 219  Q
    |||||||||||||||||    
T  26097938 actcatcatatagtgga 26097954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2818611 - 2818377
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtggg-ttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||    
T  2818611 aagggtttagaaaggtaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggtttgattcaccttggaaaacac 2818512  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || ||||    
T  2818511 tattacgatt-gagtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaa 2818413  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   ||||||||||||||| |  ||||| |||||||    
T  2818412 cgttactcatcatatagtgaaacggaggactgctct 2818377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 24126864 - 24127093
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||  | |||||| || ||||||||||||||||    
T  24126864 gtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgtcaacaaatactagggtttgaagattgattgaccttgggaaacactatta 24126963  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaa 203  Q
    |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||    |    
T  24126964 ggatta-agtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgatagacttattcttgtaactcattgatatctcttttgtaaggtta 24127062  T
Q  204 ctcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  24127063 ctcatcatatagtgaaacggagggctgctct 24127093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 10749796 - 10749937
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10749796 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 10749895  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10749896 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 10749937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 39 - 234
Target Start/End: Original strand, 10586873 - 10587068
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 137  Q
    ||||||||||||||| || |||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| || |||||||||    
T  10586873 tagagtttgtctctttgggaacaaacgatagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggattc-agtctcttgcttacggaaagagattg 10586971  T
Q  138 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10586972 agactttgggtagaattaggcaggagacttattcttttaacccattgatttctctttgtaacgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 10587068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 5 - 156
Target Start/End: Original strand, 20043058 - 20043208
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20043058 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 20043157  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 156  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20043158 ggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgagactttggatagaattag 20043208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 695893 - 696072
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||           ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  695893 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtat-----------ctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg-aaacact 695980  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  695981 attaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 696072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 24 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36402580 - 36402387
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  36402580 aaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaatactattaggatt-gaatctcttggtt 36402482  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtg 217  Q
    | |||| |||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||| || |||||   |||||||||||||||    
T  36402481 acgggaggagattggaactttgggtaaaattaggctggagacttattattgtaatccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtg 36402387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 73 - 234
Target Start/End: Original strand, 39798123 - 39798284
Alignment:
Q  73 tgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattct 172  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39798123 tgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgtggctttgggtagaattaggcgggagacttattct 39798221  T
Q  173 tgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||  | ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  39798222 tgtaacccattgatttctcttttataatgatactcatcgtatagtggatcggagggctgctct 39798284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 10757273 - 10757413
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10757273 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgg-aagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttttct 10757371  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  10757372 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 10757413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 23665140 - 23665280
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23665140 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 23665238  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23665239 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23665280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23793447 - 23793307
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23793447 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 23793349  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23793348 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23793307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15354757 - 15354617
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15354757 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 15354659  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15354658 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctct 15354617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15357033 - 15356893
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15357033 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctct 15356935  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  15356934 ttgtaacgttactcattaaatagtggatcggagggctgctct 15356893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 38960314 - 38960174
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38960314 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattagacgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 38960216  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  38960215 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 38960174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12556198 - 12556016
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12556198 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactaaggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 12556099  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||    
T  12556098 attaggatt-gtgtctcttggctacgggaagagatt-ggagttttggtagaattagacaagagactttttcttgtaactcattga 12556016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20506041 - 20505883
Alignment:
Q  76 gggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 175  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20506041 gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgt 20505943  T
Q  176 aacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||| ||||||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  20505942 aacacattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 20505883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 21288768 - 21288949
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtt------tgtgggttgattcactttggga 94  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||      || |||||||||||| |||  |    
T  21288768 aagggtttagaatagcaacaataaaaatagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggttagggtttgagggttgattcaccttga-a 21288866  T
Q  95 aacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 178  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  21288867 aacactattaggattg-agtatcttggttacgggaagagattaggactttggatagaattaagcgggagattttttcttgtaac 21288949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23742034 - 23741901
Alignment:
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaac 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23742034 tattaggattggagtctcttgattacgagaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaacccattgatttctctttgtaac 23741936  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  23741935 gttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 23741901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 26098526 - 26098379
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  |||||||    
T  26098526 aagggtttagaatggcaacaagaagactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgacaaacact 26098427  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggta 149  Q
    |||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||    
T  26098426 attatgatt-gagtctcttggttacggaaagagattggggttttgggta 26098379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6661443 - 6661270
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |  |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6661443 caacaagaaaattagggtatgtatagagtttgt-tcttggcaacaaacactagagttgg--ggttgattcaccatgggaaacactattaggattg-agtc 6661348  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | ||||||| |||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6661347 tcttggtcacgggaagaaattgagattttgggtacaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 6661270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41585956 - 41585786
Alignment:
Q  64 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  41585956 actagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactagtaggattg-agtctcttggctacgggaagagattggggctttgggtagaattaggcaggag 41585858  T
Q  164 acttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||| ||||||  ||||||| |||| || ||||    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  41585857 acttatttttgtaagtcattgatatctcttttgtaatgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 41585786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 9020246 - 9020456
Alignment:
Q  21 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||| | ||||||||||||||||   |  ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  9020246 acaaaagtagggtttgtatagagttg--ctcttggcaacaaacactagggttgaag--ttgattcaccttggaaaacactattaagattg-agtttcttg 9020340  T
Q  121 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatca-tatagtgg 218  Q
    || | |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |  |||||||| ||||||||    
T  9020341 gtcacgggaagagattggagctttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtgg 9020440  T
Q  219 attggagggctgctct 234  Q
    || ||| |||||||||    
T  9020441 atcggatggctgctct 9020456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 59 - 234
Target Start/End: Original strand, 2723964 - 2724130
Alignment:
Q  59 caaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc 158  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||         |||||||||||||    
T  2723964 caaacactagggtttgagggatgattcaccttgggaaacaccattaggatt-gagtctcttggttacgggaagagatt---------ggtagaattaggc 2724053  T
Q  159 gggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  2724054 gggtgatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaagattactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 2724130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 20053851 - 20054020
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||  |||||||| |||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||    
T  20053851 aagggtttagaag-gcaacacaaaaactagagtttatataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgggaaacact 20053946  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccc 180  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20053947 attaggatt-gagtctcttggtt-tg----gagattgggactttaagtagaattaggtgggagacttattcttgtaaccc 20054020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 23 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17413416 - 17413251
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17413416 aaaactatggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggt 17413323  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     | |||||||||||| |||||| ||||||||||||   | | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17413322 caagggaagagattgagactttaggtagaattaggtttgaaaacttattcttgtaaccctttgatatctctt 17413251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Original strand, 36208656 - 36208771
Alignment:
Q  78 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 176  Q
    |||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   | |||||||||||||||    
T  36208656 gttgattcaccttgggaaacattactaagattg-agtctcttggtaacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttgtagacttattcttgta 36208754  T
Q  177 acccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||| ||||||    
T  36208755 acccattgatatctctt 36208771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 23667415 - 23667555
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||  | || ||| |||| |||||||||||||||||    
T  23667415 gaaacactataaggattggactctcttgcttacagaaagagattgggactttggaaagaattaggcgaaaaac-tatgcttgcaacccattgatttctct 23667513  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||| ||||| |||||||||||||    
T  23667514 ttgtaacgtcactcatcaaataatggatcggagggctgctct 23667555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 193
Target Start/End: Original strand, 42770938 - 42771005
Alignment:
Q  126 gggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  42770938 gggaagagattgagactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacctattgatatctctt 42771005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20507737 - 20507665
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt 73  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  20507737 aagggtttagaaaggcaacaaaaaaattaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacacaagggttt 20507665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Original strand, 15143547 - 15143661
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| || |||| |||| ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||    
T  15143547 ttgattcacctttggaagcactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagatttggattttgggtagaattaggtttgaagacttattcttgtaa 15143645  T
Q  178 cccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||||| ||||||    
T  15143646 ccctttgatatctctt 15143661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 166
Target Start/End: Original strand, 42770805 - 42770934
Alignment:
Q  31 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 130  Q
    ||||| |||||| |||| ||||| | ||||||||||| |||| |  |||| ||||||  ||||||||  |||||||| || ||||||||||| | |||||    
T  42770805 ggtttatatagaatttg-ctcttggcaacaaacactaaggttgg--ggttcattcaccatgggaaac--tattaggactg-agtctcttggtcacgggaa 42770898  T
Q  131 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagact 166  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  42770899 gagattgagactttgggtagaattagacgagagact 42770934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 4897828 - 4897923
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggc-gggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||  ||||| |||||    
T  4897828 cactgttaggattg-agtatcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattaggcttgaagactgattcttgtaaccatttgatatctct 4897923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2144815 - 2144684
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa-acactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| |  | ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  2144815 aaaactagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaacacactagggttgg--gattgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttg 2144722  T
Q  121 gttatgggaagagattg-ggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||   |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  2144721 gtcgcgggaagagattcaggactttgggtggaattagg 2144684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 157
Target Start/End: Original strand, 4754187 - 4754312
Alignment:
Q  26 actagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttat 125  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| |||  |||||||||||| |||| || |||||||| |     
T  4754187 actagggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgaaaaacactattagaattg-agcctcttggtcac 4754280  T
Q  126 gggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4754281 tggaagagattgtgactttggatagaattagg 4754312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Original strand, 4410065 - 4410101
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgt 37  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4410065 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgt 4410101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 1170811 - 1170872
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  1170811 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 1170872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31782639 - 31782578
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  31782639 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattggga-attgggtagaattagg 31782578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35385634 - 35385573
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  35385634 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 35385573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 152
Target Start/End: Original strand, 29748370 - 29748502
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagt 114  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||   ||||| | |||||||| ||||||| |  | |||||||   |||| ||||||||| |||||||| |||    
T  29748370 caacaagaaaactagggtttgtagagaatt---ctcttggcaacaaacagtagggttag--gattgattcgtcttggagaaacactaataggattg-agt 29748463  T
Q  115 ctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaa 152  Q
    |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29748464 ctcttggtcacgggaatagattcgggactttgggtagaa 29748502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 25452498 - 25452556
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  25452498 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 25452556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Original strand, 35430259 - 35430338
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||||   ||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  35430259 ttgattcaccttggagaaacactattacaattg-agtctcttggtctagggaagagattcgggtctttgggtagaattagg 35430338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 71)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12195790 - 12195557
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12195790 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 12195691  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  12195690 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgagtagaattaatcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 12195591  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12195590 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 12195557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20915631 - 20915398
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20915631 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 20915532  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  20915531 attaggattggagtctcttggttacgagaagagattgggacttcgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 20915432  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20915431 gtactcatcatatagtggattggagggctgctct 20915398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26932837 - 26932604
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  26932837 aagggcttagaaaagcaataacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagaagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacact 26932738  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  26932737 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 26932638  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26932637 aaactcatcatatagtggattggagggttgctct 26932604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19704844 - 19704609
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19704844 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 19704745  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt--ctcttggtaa 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  19704744 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctctttgtaa 19704645  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19704644 cggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 19704609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14507450 - 14507218
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14507450 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 14507351  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14507350 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 14507252  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  14507251 atacttatcatatagtgaatcggagggctgctct 14507218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 4816506 - 4816273
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4816506 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 4816407  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4816406 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 4816308  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4816307 ggtactcatcatatagtggattggagggctgctct 4816273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28241596 - 28241363
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28241596 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 28241497  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28241496 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 28241398  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28241397 gttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 28241363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2629160 - 2628928
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2629160 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggaacaaacactaggttttaagggttgattcaccttgggaaacact 2629061  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2629060 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggagaatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 2628962  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2628961 gtactcatcatatagtggatcggagggctgctct 2628928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 7 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11983298 - 11983071
Alignment:
Q  7 ttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagg 106  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11983298 ttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacactattagg 11983199  T
Q  107 attggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaact 205  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||   |||    
T  11983198 att-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttact 11983100  T
Q  206 catcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11983099 catcatatagtggatcggagggctgctct 11983071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1230524 - 1230291
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1230524 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 1230425  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1230424 attaggatt-gactctcttggttattggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 1230326  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  1230325 gttactcatcatatagtggaacggatggctgctct 1230291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 30034878 - 30034645
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30034878 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattagagtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 30034779  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30034778 attaggatt-gagtcaattggttaagggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 30034680  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  30034679 gttactcatcatatagcggatcggagggctgctct 30034645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 61 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5273431 - 5273258
Alignment:
Q  61 aacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5273431 aacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgg 5273332  T
Q  161 gagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5273331 gagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgaaactcatcttatagtggattggagggctgctct 5273258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 9019965 - 9020156
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9019965 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaatcactaggttttgagggttgattcaccttgggaaacact 9020064  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9020065 attaggatt-gagtctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 9020156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 13057233 - 13057424
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  13057233 aagggtttagaaaggcaagaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 13057332  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13057333 attaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 13057424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14459040 - 14458809
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||||||||||||    
T  14459040 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggctgattcc--ttgggaaacact 14458943  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14458942 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 14458844  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  14458843 gttactcatcatatagtggatcagagggctgctct 14458809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 30967240 - 30967473
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30967240 aagggtttagaaagacaacaacaaaactatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 30967339  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30967340 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgaaactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 30967438  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  30967439 gttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 30967473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 3390418 - 3390609
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  3390418 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttttctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 3390517  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3390518 attaggatt-gagtctcttggttacagaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3390609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 25477313 - 25477504
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25477313 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 25477412  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25477413 attaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 25477504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 26065025 - 26065254
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26065025 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 26065121  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  26065122 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacg 26065220  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  26065221 ttactcgttatatagtggatcggagggctgctct 26065254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 26084994 - 26085223
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  26084994 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaa---acactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 26085090  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  26085091 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgacttctctttgtaacg 26085189  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  26085190 ttactcgttatatagtggatcggagggctgctct 26085223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3630136 - 3629948
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3630136 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 3630037  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3630036 aggatt-gaatctcttggttacgggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3629948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15530397 - 15530166
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15530397 aagggcttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 15530298  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  15530297 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggttgaattaggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaac 15530200  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 233  Q
       |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  15530199 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctc 15530166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3632213 - 3632022
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  3632213 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttaagggttgattcatcttgggaaacact 3632114  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3632113 attaggatt-gagtctctttgttacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcaggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 3632022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 32280035 - 32280226
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  32280035 aagggtttaaaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 32280134  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32280135 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgggacttcaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 32280226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15532956 - 15532723
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  15532956 aagggtttagaaaggtaacaacaaaactagggtttgtataaagtttgtttctttggaacaaacaatagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 15532857  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||     
T  15532856 attaggatt-gagtctcttggtcatgggaagagattgggacttttggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 15532758  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  15532757 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 15532723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 13039793 - 13039984
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  13039793 aagggtttagaaaggcaagaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 13039892  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13039893 attaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattgagactttgcgtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 13039984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15541415 - 15541224
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15541415 aagggtttagaaaggcaaaaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 15541316  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15541315 attagaatt-gagtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtaggattaggcgggagacgtattcttgtaacccattgatatctctt 15541224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 19227683 - 19227514
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19227683 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggatcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 19227584  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattc 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19227583 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattc 19227514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 3234006 - 3233822
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  3234006 aaggatttagaaagacaacaacaaaactaaggtttgtatatagtttgtctctttggtaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 3233907  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattga 185  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3233906 tattaggattg-agtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaactcattga 3233822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 30729088 - 30728919
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  30729088 caacaacaaaacttgggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggatttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gactc 30728990  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  30728989 tcttggttacgggaagaggctggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaactcattgat 30728919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12161830 - 12161641
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  12161830 aagggtttagaaatgcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctct--ggaacaaacactagggtttgagggttgtttcacgttgggaaacact 12161733  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| || | |||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12161732 attaaga-tcgagtctattggttacgggaagagattgagactttaggtataattaagtgggagatttattcttgtaacccattgatatctctt 12161641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 15719708 - 15719872
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||   | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||     
T  15719708 aaactagggtttgtatagagtttg-cttttggcaacaaacactagggtt---gagttgattcaccttggaaaacactattaggattg-agtctcttggtc 15719802  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15719803 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15719872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 193
Target Start/End: Original strand, 22490688 - 22490870
Alignment:
Q  10 gaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggatt 109  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||    || ||| ||| |||||||||||||||||    
T  22490688 gaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatatagtttgcctctttggaacaaacactagggtttgaggaggtatacaccttgcgaaacactattaggatt 22490787  T
Q  110 ggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22490788 g-agtctcttggttacggaaagagattgggactttgggtagaattatgcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22490870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26066307 - 26066166
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26066307 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26066208  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   ||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26066207 ttgtaacgttacttatcaaatagtggatcggagggctgctct 26066166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 33308988 - 33309128
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33308988 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 33309086  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33309087 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 33309128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 93 - 232
Target Start/End: Original strand, 33311257 - 33311395
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33311257 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagac-tattcttgtaacccattgatttctct 33311355  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgct 232  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  33311356 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgct 33311395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24338723 - 24338531
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg-tttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| ||||||    
T  24338723 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgcataaagtttgtgtcttagcaacaaacactaggggtttgagggttgatttaccttggaaaacac 24338624  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24338623 tattaagattg-agtcttttggttatggaaagagattaagactttgggtagaattagtcagaagacttattcttgtaacccattgatatctctt 24338531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 29754892 - 29754751
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29754892 gaaacactattaggattggagtctcttggttacggaaagagattgggactttaggtagaattaggcggaagacttattcttgtaacccattgatttctct 29754793  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29754792 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 29754751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 26068578 - 26068437
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26068578 gaaacactattaggattggagtctcttgcttacgggaagagattgggactttaggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 26068479  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||    ||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  26068478 ttgtaacgttgctcatcaaatagtggatcggagggctgctct 26068437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3028106 - 3027938
Alignment:
Q  21 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3028106 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttg 3028011  T
Q  121 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    || | | |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3028010 gtcacgtgaagagattgagactttgagtagaattaggctggagatttatttttgtaacccattgatatctctt 3027938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 23 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16455676 - 16455467
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |    
T  16455676 aaaactagggtttgtacagagttt-tctcttggcaacgaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacactgttaggatta-agtctcttgct 16455581  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatca-tatagtggat 220  Q
     | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| || |||| |  |||||||| |||||||||     
T  16455580 cacggaaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaaccctttgatatctcttttgtaaaattactcatcattatagtggaa 16455481  T
Q  221 tggagggctgctct 234  Q
     |||||||||||||    
T  16455480 cggagggctgctct 16455467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1069913 - 1069803
Alignment:
Q  82 attcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 181  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1069913 attcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccca 1069815  T
Q  182 ttgatttctctt 193  Q
    ||||| ||||||    
T  1069814 ttgatatctctt 1069803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 39 - 193
Target Start/End: Original strand, 14466399 - 14466553
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggttt-gtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 137  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||| | || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||    
T  14466399 tagagtttgtctattggcaacaaacactagggttttgaggattgattcatcttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacggaaagagattg 14466497  T
Q  138 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14466498 ggagtttgagtagaattaggcgagagacatattcttgtaactcattgatatctctt 14466553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 17012105 - 17012270
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||| |||||||||||     
T  17012105 aaactagggtttgtataaagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttctgaaacaatattaggattg-agtctcttggtc 17012200  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | | ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17012201 acgagaagagattgatgcttttggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 17012270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 1072152 - 1072067
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattca 86  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1072152 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagtgtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgagttgattca 1072067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 15367101 - 15367260
Alignment:
Q  28 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgg 127  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||   ||    
T  15367101 taggggttgtattgtgtttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttaggattg-agtctcttcgtcgcgg 15367195  T
Q  128 gaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    ||||||||||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15367196 gaagagattgaaactttgggtaaaattaatcgggagacttattcttgtaacccattaatatctct 15367260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12186271 - 12186156
Alignment:
Q  78 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 176  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||    
T  12186271 gttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtctcttgttcacgggaagagattgagactttgggtacaattaggtttggagacttattcttgta 12186173  T
Q  177 acccattgatttctctt 193  Q
    || ||||||| ||||||    
T  12186172 actcattgatatctctt 12186156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 32447591 - 32447504
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactag-ggtttgtgggttgattcac 87  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  32447591 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagagttttgagggttgattcac 32447504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 13870697 - 13870611
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcac 87  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13870697 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttatataaagtttgtctcttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcac 13870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Original strand, 26945258 - 26945374
Alignment:
Q  77 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 175  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  26945258 ggttgagtcaccttgggaaacactattaggatta-agtctcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtttgtagacttatttttgt 26945356  T
Q  176 aacccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||||||| ||||||    
T  26945357 aactcattgatatctctt 26945374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 8995518 - 8995578
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaa 61  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8995518 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaa 8995578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 17852581 - 17852650
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactaggg 70  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17852581 aagggtttagaatgacaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactaggg 17852650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Original strand, 19696508 - 19696670
Alignment:
Q  28 tagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgg 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||      ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| || |  |    
T  19696508 tagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaatcactagggttcaaa--ttgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtctctttgtcactg 19696603  T
Q  128 gaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||   | |||||||||||||||| || ||||| ||||||    
T  19696604 aaagagattgagactttggttagaattaggtttgaagacttattcttgtaatcctttgatatctctt 19696670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 10584163 - 10584212
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctt 53  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10584163 ggtttataaaagcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctt 10584212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 7542581 - 7542461
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga-ttgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgta 176  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||   | ||||| ||| |||||    
T  7542581 ttgattcacttggagaaacactattatgatt-gagtctcttggtcacgggaagagatttgggaatttggatagaattaggtttgaagactaatttttgta 7542483  T
Q  177 acccattgatttctcttggtaa 198  Q
    |||| ||||| |||||| ||||    
T  7542482 accctttgatatctctttgtaa 7542461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 155
Target Start/End: Original strand, 11138423 - 11138499
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatta 155  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11138423 ttgattcaccttggagaaacactattaggatt-gagtcacttggtcacgggaagagatggggactttaggtagaatta 11138499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 107
Target Start/End: Original strand, 15346445 - 15346524
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattagga 107  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15346445 aaactagggtttgtataaaatttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactcttagga 15346524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 79 - 198
Target Start/End: Original strand, 20526922 - 20527041
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaa 177  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |   |||||||||  |||||| ||||||||||||   | ||||| ||||||||||    
T  20526922 ttgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacaagaagagattaagacttttggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaa 20527020  T
Q  178 cccattgatttctcttggtaa 198  Q
    ||  ||||| |||||| ||||    
T  20527021 ccttttgatatctctttgtaa 20527041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 23 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22858203 - 22858075
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  22858203 aaaactagggtttgta--gaattt-tctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcaccttgggaaacactattatgatt-gagtctcttggt 22858110  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
     |   |||||||||| |||||| |||||| |||||    
T  22858109 cacaagaagagattgagactttaggtagatttagg 22858075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 192
Target Start/End: Original strand, 15346522 - 15346576
Alignment:
Q  138 ggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15346522 ggactttgagtaaaattaagcggaagacttattcttgtaacccattgatatctct 15346576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28037927 - 28037814
Alignment:
Q  80 tgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggaga-cttattcttgtaac 178  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||| | | || || |||||| |||||||||||||||||||    | | ||||||||||||||    
T  28037927 tgattcaccttgggaaacactgttaggatt-gagtcccttgttcacggaaatagattgagactttgggtagaattaggtttaaaatcttattcttgtaac 28037829  T
Q  179 ccattgatttctctt 193  Q
    || ||||| ||||||    
T  28037828 cctttgatatctctt 28037814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5165989 - 5165936
Alignment:
Q  102 ttaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5165989 ttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgggac-ttgggtagaattagg 5165936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 13878727 - 13878788
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13878727 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13878788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 13883475 - 13883536
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13883475 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 13883536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 16785919 - 16785980
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16785919 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16785980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26887406 - 26887345
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  26887406 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 26887345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31248896 - 31248835
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  31248896 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 31248835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35201508 - 35201447
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  35201508 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 35201447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3577696 - 3577636
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||  ||||||||||||    
T  3577696 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggactt--ggtagaattagg 3577636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 17036058 - 17036116
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17036058 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17036116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17695030 - 17694972
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17695030 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17694972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 78)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35215861 - 35215628
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35215861 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 35215762  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  35215761 attaggattggagtctcttggttacgggaagagtttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaacg 35215662  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215661 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 35215628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 35218238 - 35218005
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35218238 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttatatagagtttgtctcttaggagcaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 35218139  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||     
T  35218138 attaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccgttgatttctctttgtaacg 35218039  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35218038 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 35218005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 42064495 - 42064727
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42064495 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 42064594  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42064595 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttggatagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 42064693  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42064694 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 42064727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13910319 - 13910087
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |    
T  13910319 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcaccttgggaaacaat 13910220  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13910219 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagactggaactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 13910121  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  13910120 atactcatcatatagtggatcagatggctgctct 13910087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 27104779 - 27105010
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27104779 aagggttcagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgaaacaaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 27104877  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27104878 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaaca 27104976  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27104977 ttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 27105010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23452512 - 23452279
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23452512 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgagaaacact 23452413  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  23452412 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttggatagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 23452314  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23452313 gatactcatcatatagtggattggagggctgctct 23452279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19502282 - 19502053
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19502282 gtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactatta 19502183  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaa 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | |    
T  19502182 ggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgata 19502084  T
Q  204 ctcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19502083 ctcatcatatagtggatcgaagggctgctct 19502053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19504620 - 19504390
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19504620 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacacaagggtttgttggttgattcaccttgggaaacact 19504521  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19504520 attaggatt-gagtctcttggtta-cggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 19504423  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgct 232  Q
     | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19504422 gatactcatcatatagtggatcggagggctgct 19504390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45280260 - 45280026
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaa-gcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||| ||||    
T  45280260 aagggtttagaaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggtttagagggttgattcaccttgggatacac 45280161  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  45280160 tattaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaa 45280062  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45280061 cgttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 45280026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 42452763 - 42452994
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42452763 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtataaagtttgtctct--gtaacaaacactagagtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 42452860  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  42452861 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 42452959  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42452960 gttactcatcatatagtggatcggagggctgctct 42452994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24162487 - 24162265
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24162487 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 24162388  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||| |||| |||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||      
T  24162387 attaagatt-gagtctcttggtt----------gctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaatg 24162299  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24162298 ctactcatcatatagtggattggatggctgctct 24162265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 42923784 - 42923593
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  42923784 aagggtttagaatggcaacaacaaaactaggatttgtatagagtttgtctcttgggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 42923685  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42923684 attaggatt-gagtctcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccattgatatctctt 42923593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 19007620 - 19007853
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  19007620 aagggtttagaaaggcaacaacaaaattatggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacact 19007719  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  19007720 attagaatt-gagtttcttggttatgggaagagattggggctttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 19007818  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  | |||||||||||    
T  19007819 gttactcatcatatagtgaaacgaagggctgctct 19007853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 40032333 - 40032149
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  40032333 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 40032234  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40032233 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggttaggactttgggtagaattaggcgtgagacttattcttgtaacccattgat 40032149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 4 - 217
Target Start/End: Original strand, 28196620 - 28196833
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  28196620 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacattagggtttaagggttgattcaccttgggaaacactatt 28196719  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||      
T  28196720 aggatt-gagtctcttggttatgggaagagattgaggctttgggtagaattaggcggaagatttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacatt 28196818  T
Q  203 actcatcatatagtg 217  Q
    |||||||||||||||    
T  28196819 actcatcatatagtg 28196833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21520968 - 21520735
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  21520968 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggcttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttaggaaacact 21520869  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||    
T  21520868 attaggatt-gagtctcttggttacaggaagaggctaggactttgggtagaattaggcgggagactaattcttgtaacccattgatatctcttttgtaac 21520770  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  21520769 gttactcatcatatagtgaaacggatggctgctct 21520735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15539750 - 15539566
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  15539750 aagggtttagaatgacaacaacaaaattagggtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 15539651  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15539650 attaggatt-gattctcttggttacgggaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 15539566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22287611 - 22287378
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  22287611 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtctgtctctttggaacaaacattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacggt 22287512  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || |||||    
T  22287511 attaggatt-gagtctcttagttacgggaagagattgacacttcgggtagaattgggcgggagacttattcttgtaacccgttgatatctcttttgtaac 22287413  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22287412 gttactcatcatatagtgaaatggagggctgctct 22287378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11739835 - 11739644
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  11739835 aagggtttagaaagacaacaacaaaattagggtttgtatggagtttgtctctttggaacaaacgctagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 11739736  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  11739735 attaggatt-gattctcttggttataggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagaattattcttggaatccattgatatctctt 11739644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6259086 - 6258901
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6259086 gtttagaaaggcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctatttggaataaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 6258987  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6258986 ggatt-gagtctcttggttacggga--agattggggctttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 6258901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34979850 - 34979663
Alignment:
Q  5 gtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatta 104  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34979850 gtttagaaaggtaacaaaaaaactagggtttgtataaagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatta 34979751  T
Q  105 ggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  34979750 agatt-gagtctcttggttacgggaagagattcggactttcggtagaattaggcgggagacttattcttgtaatccatttatatctctt 34979663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 217
Target Start/End: Original strand, 17848424 - 17848636
Alignment:
Q  2 agggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17848424 agggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaacacttgggtttgagggttgattcactttgggaaacact 17848523  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || |||||    
T  17848524 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgaggctttgggtaga---aggcgggagacttattcttgtaa-ccattgatatctcttttgtaac 17848618  T
Q  200 aaaactcatcatatagtg 217  Q
       |||||||||||||||    
T  17848619 gttactcatcatatagtg 17848636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 3022143 - 3022334
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  3022143 aagggtttataaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactacggtttgagggttgattcaccttaggaaacact 3022242  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3022243 attaggatt-gagtctcttggttaccggaagagattgaggttttaggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattaatatctctt 3022334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17849097 - 17849288
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||    
T  17849097 aagggtttagaaagataacaacaaaactagagttcgtatagagtttgcctctttggaagaaacactagggtttgagggttgattcaccttgagaaacact 17849196  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17849197 attaagattg-agtctcttggttacggtaagagattgagactttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 17849288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43623840 - 43623622
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||    
T  43623840 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc------------actaggttttgagggttgattcaccttgggaaacaatatt 43623753  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||       
T  43623752 aggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtt 43623654  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  43623653 actcatcatatagtggaacggagggctgctct 43623622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36559047 - 36558906
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36559047 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36558948  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36558947 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 36558906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 36561324 - 36561183
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36561324 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 36561225  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  36561224 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 36561183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44289340 - 44289152
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44289340 ggtttaggaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtctgtctcttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 44289241  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || | ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  44289240 aggatt-gagtcacttggttacgggaagagattgggacttagggtagaattaagtggaaaacttattcttgtaacccgttgatatctctt 44289152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45239246 - 45239019
Alignment:
Q  6 tttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattag 105  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  45239246 tttagaaagacaaaaacaaaactagggtttgtatagactttctct-ttggcaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 45239148  T
Q  106 gattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaac 204  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||    ||    
T  45239147 gattg-agtctcttggttacgggaagagattggggtttttggtagaattaagcgggatacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaagttac 45239049  T
Q  205 tcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  45239048 tcatcatatagtgaaacggagggctgctct 45239019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6264417 - 6264233
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  6264417 ggtttagaaaggcaacaacaaa----gggtttgtatagagtttgtctctttggtacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 6264322  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||  ||||||||||||| |  || |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6264321 aggatt-aagtctcttggttacgataaaagattggggctttggatagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 6264233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 45332364 - 45332223
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45332364 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattaggactttgggtagaattaggcgggagacttattattgtaacccattgatttctct 45332265  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | ||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45332264 ttgtaaaggtactcatcatatagtgaattggagggctgctct 45332223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31733040 - 31732861
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31733040 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctcttggcaacaaacactaaggtttgagggttgattcacgttgggaaacact 31732941  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
     |||||||| ||||||||||||            ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31732940 gttaggatt-gagtctcttggt------------ttgggactttgggtagaattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 31732861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 14837268 - 14837438
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14837268 caacaacaaaactagggtttgtacatagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactattaggatt-gagtc 14837366  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||      ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  14837367 tct------tgggaagagattgagactttaagtagaattaggcgggggacttattcttgtaactcattgatatctctt 14837438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11578365 - 11578193
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| | |||||||  ||||||| |  ||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  11578365 caacaaaaaaactagggtttgtatagaatttttctcttggcaacaaac--tagggttgg--ggttgattcacctcgggaaacactattaggattg-agtc 11578271  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11578270 tcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 11578193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 27 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18800559 - 18800398
Alignment:
Q  27 ctagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatg 126  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |      
T  18800559 ctagggtttgtatagaggttg-ctcttggcaacaaacactagggtt---gggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcaca 18800465  T
Q  127 ggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18800464 ggaagagattggggctttgggtagaattaggagggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 18800398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5375550 - 5375388
Alignment:
Q  71 tttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttatt 170  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5375550 tttgagggttgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggc-ggagacttatt 5375453  T
Q  171 cttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  5375452 cttgtaacccattgatatctcttttgtaacattactcatcatatagtggaacggagggctgctct 5375388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 16 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17897502 - 17897337
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17897502 caacaataaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttcgcaacaaacactagg--ttgaga-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtc 17897408  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgat 186  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17897407 tcttggtcatgagaaaagattgagattttgagtagaattaggcgggagacttattcttgtaaccctttgat 17897337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 38020182 - 38020349
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||    
T  38020182 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtgtagagtttgtctcttggaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccatggtaaacact 38020281  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacc 179  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||          ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38020282 attaggatt-gagtctcttggtattg----------ggggctttgggtagaattaggcgggagacttatttttgtaacc 38020349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28459435 - 28459274
Alignment:
Q  31 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  28459435 ggtttgtatagagcttgtctcttggcaacaaaaactaggatttgagggtggattcaccttggcaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaa 28459337  T
Q  131 gagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28459336 gagtttggggcttcaggtataattaggtgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 28459274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 24 - 193
Target Start/End: Original strand, 22874137 - 22874301
Alignment:
Q  24 aaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggtt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||   |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||     
T  22874137 aaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactatggtt---gggttgattcaccttggaaaacagtattaggattg-agtctcttagtc 22874231  T
Q  124 atgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22874232 acgggaagagattgaggctttcggtagaattaggtgggagacttatttttgtaacccattgatatctctt 22874301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20146866 - 20146693
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||| |  | ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||    
T  20146866 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttgcc-cttggcaacaaacactatggttgg--gattgattcaccttgggaaacaatagtaggattg-agtc 20146771  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  20146770 tcttggtcacgggaaaagattgagattttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaactctttgatatctctt 20146693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22407684 - 22407591
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttggga 94  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22407684 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggga 22407591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22163222 - 22163117
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  22163222 aaggatttagaaaggcaacaacaacactagggtttgtatagagtttgtctctttagaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttggaaaacact 22163123  T
Q  101 attagg 106  Q
    ||||||    
T  22163122 attagg 22163117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 5377704 - 5377631
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttg 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  5377704 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactaaggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactaggttttg 5377631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 193
Target Start/End: Original strand, 40699429 - 40699545
Alignment:
Q  77 ggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgt 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||    
T  40699429 ggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacgagaagagattgggactttgggtagaattaggtttgaagacttatttttgt 40699527  T
Q  176 aacccattgatttctctt 193  Q
    || || ||||| ||||||    
T  40699528 aatcctttgatatctctt 40699545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27136368 - 27136209
Alignment:
Q  31 ggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaa 130  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| | || ||    
T  27136368 ggtttatatagagcttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--ggttgattcatcttggaaaacactattaggattgaa-tctcttggtcacggaaa 27136273  T
Q  131 gagattgggactttgggtagaattaggcg-ggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    || |||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  27136272 gaaattgggactttgagtagaattaggtttggagacttattcttgtaactcattgatatctctt 27136209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Original strand, 35107294 - 35107427
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    || ||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  35107294 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaaca----gggttg-ggattgattcaccttgagaaacattattaggattg-agtc 35107386  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattag 156  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35107387 tcttggtcacgggaagagattgtgactttgggtagaattag 35107427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 20589763 - 20589862
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20589763 aaacactgttaggattg-agtctcttggtcacgggaagagattgagactttgggtagaattaggtttggagacttattcttttaacccattgatatctct 20589861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22407596 - 22407496
Alignment:
Q  135 ttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctc 233  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||   ||||||||||||||| |  ||||||||||||    
T  22407596 ttgggacttttggtagaattaggggggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctc 22407497  T
Q  234 t 234  Q
    |    
T  22407496 t 22407496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 64 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 38414291 - 38414194
Alignment:
Q  64 actagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggag 163  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38414291 actagggtttgagg-ttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaa-agattgggacttttggtagaattaggcgggag 38414195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 148 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7463077 - 7462990
Alignment:
Q  148 tagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||   || ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  7463077 tagaattaggcgggagacttattcttgtaactcattgatttctcttttgtaacgttacccattatatagtggatcggagggctgctct 7462990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 23 - 198
Target Start/End: Original strand, 43139381 - 43139551
Alignment:
Q  23 aaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggt 122  Q
    |||||| |||||||||  ||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  43139381 aaaacttgggtttgta--gagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttga--gattgattcatcttgggaaacattattaggattg-agtctcttggt 43139474  T
Q  123 tatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaa 198  Q
     | ||||||| |||| |||||| |||||||||||| |   ||||| ||| ||||||||  |||||||||||| ||||    
T  43139475 cacgggaagatattgagactttaggtagaattaggtctaaagactaattattgtaaccttttgatttctctttgtaa 43139551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 157
Target Start/End: Original strand, 17921769 - 17921833
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17921769 gaaacactattaggattg-agtctcttggttacaggaagagattcgggactttgggtagaattagg 17921833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 37963105 - 37963028
Alignment:
Q  111 gagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgattt 188  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| | |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37963105 gagtctcttggtcacctgaagagattgaggctttgggtagaattagacgagagacttattcttgtaatccattgattt 37963028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28459011 - 28458949
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28459011 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacggaaagatattgggactttgggtagaattagg 28458949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 2740941 - 2741002
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2740941 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggttgggac-ttgggtagaattagg 2741002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 78 - 155
Target Start/End: Original strand, 26345661 - 26345738
Alignment:
Q  78 gttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 155  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| | |||||||||||||||||    
T  26345661 gttgattcaccttagcaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacggaaagagattcgagactttgggtagaatta 26345738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 27583535 - 27583479
Alignment:
Q  80 tgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattg 137  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  27583535 tgattcaccttggaaaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagagattg 27583479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34575308 - 34575230
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgg-gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34575308 ttgattcaccttggagaaacactattaggat-ggagtctcttggtctcgggaa-agattcgggactttgggtagaattagg 34575230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 37170931 - 37170873
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  37170931 cactattaggattg-agtctcttggtcatgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 37170873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 2736205 - 2736266
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  2736205 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggacttt-ggtagaattagg 2736266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 155
Target Start/End: Original strand, 7502990 - 7503052
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagaga-ttgggactttgggtagaatta 155  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  7502990 gaaacactattaggatt-gagtatcttggtcaagggaagagatttgagactttgggtagaatta 7503052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10942696 - 10942634
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10942696 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10942634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 10948565 - 10948503
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaatta 155  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || | ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  10948565 gaaacactattaggattg-agtctctttgtcacgggaagaaattcgggactttgggtagaatta 10948503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 17462436 - 17462497
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17462436 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17462497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20054947 - 20054886
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  20054947 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 20054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 158 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22707872 - 22707837
Alignment:
Q  158 cgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22707872 cgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 22707837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22712698 - 22712637
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22712698 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22712637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22717407 - 22717346
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  22717407 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 22717346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 39686983 - 39687044
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  39686983 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 39687044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 45567409 - 45567470
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  45567409 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 45567470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 193
Target Start/End: Original strand, 15693974 - 15694075
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttct 190  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||  ||||| |||    
T  15693974 gaaacactattaggataa-agtctcttggtcacaggaagagatttgggactttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaaccttttgatatct 15694072  T
Q  191 ctt 193  Q
    |||    
T  15694073 ctt 15694075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Original strand, 38020123 - 38020157
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggttt 35  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38020123 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggttt 38020157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 97 - 234
Target Start/End: Original strand, 17943540 - 17943674
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg-cgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttgg 195  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||| ||   || |||||| |    
T  17943540 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattaggtttgaagactaattcttgtaactca---atatctctttg 17943634  T
Q  196 taacaaaactcatca-tatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  17943635 taaagaaactcatcattatagtggatcagagagctgctct 17943674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 39 - 155
Target Start/End: Original strand, 35028595 - 35028707
Alignment:
Q  39 tagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgg 138  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||    | ||||||| | |||| ||||||||||| ||||| ||||||||| | | | ||||||||||     
T  35028595 tagagtttg-ctcttggtaacaaacactagggttga--gattgattcgcattggaaaacactattatgattg-agtctcttgatcacgagaagagattga 35028690  T
Q  139 gactttgggtagaatta 155  Q
     ||||||||||||||||    
T  35028691 cactttgggtagaatta 35028707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12781400 - 12781342
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  12781400 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 12781342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 17932637 - 17932695
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  17932637 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 17932695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27517818 - 27517760
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  27517818 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 27517760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 232
Target Start/End: Original strand, 2893 - 3123
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2893 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttggaaaacact 2992  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  2993 attaggattg-agtctcttggttatgggaagaggcttggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 3091  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgct 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3092 aaactcatcatatagtggattggagggctgct 3123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 6212 - 6445
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6212 aagggtttagaaaagcaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 6311  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6312 attaggattgaagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagatttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 6411  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  6412 ttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 6445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 178; Significance: 4e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 69566 - 69334
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  69566 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacact 69467  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  69466 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggttgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacg 69368  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
      |||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  69367 ttactcatcatatagtggatcggagagctgctct 69334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 73298 - 73207
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgg 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  73298 aagggtttagaaaggcaacaacaaatctagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgg 73207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 55 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 73208 - 73160
Alignment:
Q  55 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  73208 ggaaaaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 73160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 29184 - 29416
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||    
T  29184 aagggtttaaaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttatgggttgattcgccttgggatacact 29283  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaaca 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29284 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaggttggggctttgagtagaattaggcaggagacttattcttgtaactcattgatttctctttgtaaca 29382  T
Q  201 aaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29383 atactcatcatatagtggatcggagggctgctct 29416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41758 - 41525
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41758 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 41659  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  41658 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgggactttcggtagaattagacgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 41560  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  41559 gttactcatcatatagtgaatcggagggctgctct 41525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 79198 - 79431
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  79198 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttaagggttgattcaccttgggaaacact 79297  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  79298 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagaggctgagaatttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaac 79396  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  79397 gttactcatcatatagtggaacggagggctgctct 79431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 16 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11733 - 11515
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  11733 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttcgaacaaacactagggtttgagggttgattttccttgggaaacactattaggattg-agtc 11635  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaaactcatcatata 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||    
T  11634 tcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggatacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaacgttactcatcatata 11535  T
Q  215 gtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  11534 gtggattggagagctgctct 11515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 183912 - 183683
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  183912 ggtttagaaaggcaacaacaaaactagagtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 183813  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||        
T  183812 aggatt-gagtctcttggtta-cggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttttgtaatgtt 183715  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  183714 actcatcatatagtgaaacggagggctgctct 183683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 52024 - 52257
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  52024 aagggtttagaatggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctttttggaacaaacactagggtttgaggattgattcaccttgggaaacact 52123  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||  |||| || |||||    
T  52124 attaggatt-gagtctcttggttacgggaagagattgtgactttggatagaattaggtgggagactttttcttgtaactcattgacatctcttttgtaac 52222  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  52223 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 52257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 144; Significance: 8e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14654 - 14424
Alignment:
Q  4 ggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactatt 103  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  14654 ggtttagaaagacaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttgaaacaaacactagggtttgagggttgattcaccttgggaaacactatt 14555  T
Q  104 aggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaacaaa 202  Q
    ||||||  ||||||||||||| ||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||       
T  14554 aggatt-tagtctcttggttacgggaagaggctgagactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaacgtt 14456  T
Q  203 actcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14455 actcatcatatagtggaacggagggctgctct 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 6 - 193
Target Start/End: Original strand, 15037 - 15223
Alignment:
Q  6 tttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattag 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15037 tttagaaaggcaacaacaaaactagggtttttataaagtttgtctctttggaacaaacactagagtttgagggttgattcaccttgggaaacactattag 15136  T
Q  106 gattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15137 gatt-gagtctcttggttacggaaagagattcagactttgggtagaattatgcgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0370 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0370
Description:

Target: scaffold0370; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 55 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1673 - 1495
Alignment:
Q  55 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1673 ggaacaaacactagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacactattaggattg-agtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaatt 1575  T
Q  155 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1574 aggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctttgtaacgatactcatcatatagtggatcggagggctgctct 1495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0511 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0511
Description:

Target: scaffold0511; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 2055 - 2287
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2055 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtacagagtttgtctcttcggaataaa-actagggtttgtgggttgattcaccttgggaaacact 2153  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctcttg-gtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  2154 attaggattg-agtctcttggttacgggaaaaggctgggactttgggtagaattaggcgggaaacttattcttgtaacccattaatttctcttttgtaac 2252  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
        |||||||||||||| || |||||||| ||||    
T  2253 gttcctcatcatatagtgaatcggagggctactct 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 4010 - 4242
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  4010 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtata-agtttgtctctttggaactaacactagggtttgagggttgattcatcttgggaaacact 4108  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaac 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||     
T  4109 attaggattg-agtctcttggttacgggaagaagctgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatatctcttttgtaaa 4207  T
Q  200 aaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
       ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  4208 gttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 4242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 35652 - 35819
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacact 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||    
T  35652 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggaacaaacactagggtttgagggttaattcacctagggaaacact 35751  T
Q  101 attaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 169  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35752 attaggatt-aagtctcttggttacgggaagaggctgggactttgggtagaattaggcgggagacttat 35819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 79872 - 80105
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcgg-aacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacac 99  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  79872 aagggtttagaaagacaacaataaaactagggtttgtatagagtttgtctctttggcaacaaaaattagggtttgagggttgattcaccttgggaaacac 79971  T
Q  100 tattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctc-ttggtaa 198  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||| || ||||    
T  79972 tattaggatt-aagtctcttggttacgggaagagattggggctttgggtag-attaggcaggagacttattcctgtaactcattgacatctcttttgtaa 80069  T
Q  199 caaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    |   ||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  80070 cgttactcatcatatagtgaaacggagggctgctct 80105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 188424 - 188363
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  188424 aaacactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 188363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Original strand, 85258 - 85434
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||    
T  85258 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttagcaacaaacactaaagtttgagggttgattcaccttggaaaacactactaggatt-gagtc 85356  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    | ||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  85357 ttttggttacgagaagagattgtgactttgagtagaatcagacgggagacttattcttgtaacccattgatatctctt 85434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0224 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0224
Description:

Target: scaffold0224; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16079 - 15906
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||    ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  16079 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcctagcaacaaacactagggttga--ggttgattcaccttgcgaaaaactattaggattg-agtc 15984  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15983 tcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 15906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 22221 - 22361
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22221 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctct 22319  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  22320 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 22361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 93 - 234
Target Start/End: Original strand, 24496 - 24636
Alignment:
Q  93 gaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctct 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24496 gaaacactattaggattggagtctcttggttacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcggaagac-tattcttgtaactcattgatttctct 24594  T
Q  193 tggtaacaaaactcatcatatagtggattggagggctgctct 234  Q
    | |||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24595 ttgtaacgttactcatcaaatagtggatcggagggctgctct 24636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16903 - 16735
Alignment:
Q  21 acaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttg 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |  | ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16903 acaaaactagggtttgtatagagtttg-ctcttggcaacaaacactagggttgg--gattgattcaccttaggaaacactattaggattg-agtcacttg 16808  T
Q  121 gttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16807 gtgacgggaagagattgagactttgggtagaattaggccagagacttattcttgtaacccattgatatctctt 16735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 16 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1892 - 1727
Alignment:
Q  16 caacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctcttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaaacactattaggattggagtc 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||     
T  1892 caacaagaaaactagggtttgtatagagtttc---------aacaaacactagggtt-gtgg-ttgattcaccttgggaaacacaattaggattg-agtt 1805  T
Q  116 tcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaacccattgatttctctt 193  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1804 tcttggtcacgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagagttattcttgtaacccattgatatctctt 1727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 193
Target Start/End: Original strand, 4901 - 5014
Alignment:
Q  79 ttgattcactttgggaaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattaggcgggagacttattcttgtaac 178  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4901 ttgattcatgttgggaaacactattaggattg-agtctcttggtcatgagaagagattgaagcttttggtagaattaggcgggagacttatttttgtaac 4999  T
Q  179 ccattgatttctctt 193  Q
    |||||||| ||||||    
T  5000 ccattgatatctctt 5014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0552 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0552
Description:

Target: scaffold0552; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 1106 - 993
Alignment:
Q  1 aagggtttagaaaagcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctc-----ttcggaacaaacactagggtttgtgggttgattcactttgggaa 95  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     || ||||||||||||| | || | |||||||| ||| ||| |||    
T  1106 aagggtttagaaaggcaacaacaaaactagggtttgtatagagtttgtctctttagtttggaacaaacactacgtttggagggttgatccaccttgcgaa 1007  T
Q  96 acactattaggatt 109  Q
    | ||| ||||||||    
T  1006 atacttttaggatt 993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 57613 - 57550
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagatt-gggactttgggtagaattagg 157  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  57613 aaacactattaggattgaa-tctcttggtcattggaagagattcgggactttgggtggaattagg 57550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 94 - 157
Target Start/End: Original strand, 224819 - 224880
Alignment:
Q  94 aaacactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  224819 aaacactattaggatt-gagtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 224880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 157
Target Start/End: Original strand, 16328 - 16386
Alignment:
Q  97 cactattaggattggagtctcttggttatgggaagagattgggactttgggtagaattagg 157  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  16328 cactattaggattg-agtctcttggtcacgggaagaggctgggac-ttgggtagaattagg 16386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 136 times since January 2019
Visitors: 6713