View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0899_high_6 (Length: 415)

Name: NF0899_high_6
Description: NF0899
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0899_high_6
NF0899_high_6
[»] chr4 (55 HSPs)
chr4 (7-386)||(27505635-27506014)
chr4 (14-315)||(27479800-27480101)
chr4 (14-306)||(27523343-27523635)
chr4 (29-382)||(27486795-27487168)
chr4 (14-315)||(27469359-27469660)
chr4 (15-315)||(27526053-27526350)
chr4 (18-302)||(27513720-27514004)
chr4 (14-315)||(27476589-27476887)
chr4 (12-303)||(27516547-27516835)
chr4 (32-315)||(27473793-27474074)
chr4 (44-303)||(27498329-27498585)
chr4 (31-300)||(27500295-27500561)
chr4 (12-315)||(27466722-27467021)
chr4 (14-218)||(27460474-27460678)
chr4 (14-149)||(27502075-27502210)
chr4 (52-253)||(27444772-27444973)
chr4 (45-303)||(27501231-27501486)
chr4 (38-303)||(27502771-27503030)
chr4 (50-253)||(27557450-27557653)
chr4 (52-233)||(27431126-27431307)
chr4 (38-258)||(27507777-27507997)
chr4 (67-233)||(27414297-27414463)
chr4 (52-303)||(27554225-27554471)
chr4 (67-233)||(17970280-17970446)
chr4 (74-212)||(27503924-27504062)
chr4 (73-230)||(27424513-27424670)
chr4 (74-215)||(27524523-27524664)
chr4 (33-230)||(27567239-27567436)
chr4 (74-255)||(27570049-27570230)
chr4 (73-230)||(27411455-27411612)
chr4 (74-255)||(27425771-27425952)
chr4 (75-212)||(27475580-27475717)
chr4 (74-247)||(27563346-27563519)
chr4 (67-249)||(27415589-27415768)
chr4 (74-212)||(27468327-27468465)
chr4 (67-249)||(27585653-27585835)
chr4 (67-212)||(27514893-27515038)
chr4 (74-188)||(27412690-27412804)
chr4 (74-255)||(27420367-27420548)
chr4 (76-249)||(27565953-27566126)
chr4 (323-379)||(27479715-27479771)
chr4 (74-230)||(27485943-27486099)
chr4 (75-230)||(27478884-27479039)
chr4 (78-213)||(27489961-27490096)
chr4 (67-230)||(27556372-27556535)
chr4 (75-230)||(27571607-27571762)
chr4 (67-230)||(27421924-27422091)
chr4 (74-230)||(27506682-27506838)
chr4 (75-230)||(27419072-27419227)
chr4 (61-104)||(27495646-27495689)
chr4 (67-230)||(27559233-27559396)
chr4 (36-172)||(27423264-27423400)
chr4 (55-203)||(27446158-27446306)
chr4 (74-230)||(27497322-27497478)
chr4 (67-104)||(27600663-27600700)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (14-210)||(1759252-1759452)
chr5 (38-303)||(1754206-1754467)
chr5 (74-230)||(1756757-1756913)
chr5 (67-230)||(1754672-1754835)
chr5 (326-382)||(1754502-1754558)
[»] chr3 (14 HSPs)
chr3 (44-233)||(50904762-50904951)
chr3 (58-233)||(55084767-55084942)
chr3 (40-233)||(38028732-38028925)
chr3 (74-233)||(38043884-38044043)
chr3 (67-233)||(50909941-50910107)
chr3 (40-233)||(38040047-38040240)
chr3 (40-233)||(38036759-38036952)
chr3 (60-230)||(38024861-38025031)
chr3 (60-230)||(38031313-38031483)
chr3 (97-233)||(38033802-38033938)
chr3 (58-233)||(48840696-48840870)
chr3 (68-233)||(50911863-50912028)
chr3 (140-202)||(48838719-48838781)
chr3 (66-104)||(55088043-55088081)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (67-233)||(3073550-3073716)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (40-233)||(21604720-21604913)
chr8 (60-230)||(21607282-21607452)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 372; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 386
Target Start/End: Original strand, 27505635 - 27506014
Alignment:
Q  7 tccaataatatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggt 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505635 tccaatgatatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggt 27505734  T
Q  107 catattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctac 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505735 catattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctac 27505834  T
Q  207 gtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27505835 gtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatg 27505934  T
Q  307 tgttgaaaataaagacttgtttgtaaatagaatgctcaagtttctgaatttcaaatgcttttggttgtgaatgattgtgt 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27505935 tgttgaaaataaagacttgtttgtaaatagaatgctcaagtttctgaatttcaaatgcttttggttgtgaatggttgtgt 27506014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27480101 - 27479800
Alignment:
Q  14 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattc 113  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27480101 atatcttcaaaaaggtaattcaattcaagtgagaattaatatctaagaaaatgtcttctctgcaaggaatggtgagaccacccattggatgatcatattc 27480002  T
Q  114 aaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27480001 aaattgttcctcagcttggttcaacaacttttggaatgatgtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaacgcttcattttctctcctacgtatact 27479902  T
Q  214 gctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgttgaa 313  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27479901 gctagatagccttttggcacgtccaaaccttttgaagatgatgcccttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgttgaa 27479802  T
Q  314 aa 315  Q
    ||    
T  27479801 aa 27479800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 14 - 306
Target Start/End: Original strand, 27523343 - 27523635
Alignment:
Q  14 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27523343 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagttagaccacccattggatggtcatattc 27523442  T
Q  114 aaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 213  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523443 aaattgttcctcggcttcgctcaacaattcttggaatgaagtttggttcaaatatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 27523542  T
Q  214 gctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatg 306  Q
    |||||||| |||||||| || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27523543 gctagatagccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatgcccttgatctgatgatactacgtaaacgaaaacccattgttgtatgtatg 27523635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 29 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 27487168 - 27486795
Alignment:
Q  29 taattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagc 128  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27487168 taattcaattcaagtgagaagtaatatctaagaaaatgtcttctttgcaaggaatagtaagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcttcagc 27487069  T
Q  129 ttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagataccccttt 228  Q
    |||||||||||||||||| || || | |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27487068 ttggttcaacaattcttgaaacgatggttggtttaagtatgataaagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatcccttt 27486969  T
Q  229 ggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgttgaaaa------------- 315  Q
    || || |||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||                 
T  27486968 ggaacgtccacagcttttgaagatgatgcccttgatctgatgatacttggtaaacggaaacccattgttgtatgtatgtgttgaaaagagaagcttgatc 27486869  T
Q  316 -------taaagacttgtttgtaaatagaatgctcaagtttctgaatttcaaatgcttttggttgtgaatgatt 382  Q
            |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27486868 taaaaatgaaagacttgtttgtaaatagaaggctcaactttctgaatttcaaatgcttttggttgtgagtgatt 27486795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27469660 - 27469359
Alignment:
Q  14 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27469660 atatcttcaaagagctaattcaattgaagtgagaggtgatatctaagaaaatttcttctctgcaaggaatagttagaccacccattggatgttcatattc 27469561  T
Q  114 aaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 213  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27469560 aaattgttcttcagcttggctcaacagttcttgtaatgatgtttgcttcaaatatgatatagggatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 27469461  T
Q  214 gctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgttgaa 313  Q
    |||||||| |||||||| || |||| | |||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27469460 gctagatatccctttggaacgtccacagcttttgaagatgatactcttgatctgatgagacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgtttaa 27469361  T
Q  314 aa 315  Q
    ||    
T  27469360 aa 27469359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 315
Target Start/End: Original strand, 27526053 - 27526350
Alignment:
Q  15 tatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattca 114  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  27526053 tatcttccgagagccaattcaattcaaacgagaagtgatctctaagaaaacgtcttctctgcaaggaatagtgagaccacccgttggatgatcatattca 27526152  T
Q  115 aattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactg 214  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  27526153 aattgttcctcagcttggctcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctccaacatacactg 27526252  T
Q  215 ctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgttgaaa 314  Q
    ||||||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||| |   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27526253 ctagatatccctttggaacatcgacaccttttgaagatgatgccct---tttgatgatactaggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgttgaaa 27526349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 18 - 302
Target Start/End: Original strand, 27513720 - 27514004
Alignment:
Q  18 cttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaat 117  Q
    |||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  27513720 cttcaaagatttgattcaattcaagcgagaagtgatatctaagaatacttcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatgatcatattcatat 27513819  T
Q  118 tgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgcta 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27513820 tgttcttcagcttggttcaacaattcttggaacgaggtttggttcaagtatgatattgggatcacaaaccgcttcattttctctcctacatacactgcta 27513919  T
Q  218 gatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatg 302  Q
    |||| || |||||||| || | | |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27513920 gatatccttttggcacgtcaacagcttttgaagatgatacccttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatg 27514004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27476887 - 27476589
Alignment:
Q  14 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27476887 atatcttcaaagagctaattcaatttaagtgagaggtaatatccaagaaaatgtcttctctgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattc 27476788  T
Q  114 aaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 213  Q
    |||||||||||||  |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||    
T  27476787 aaattgttcctcactttggctcagcagttcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctcaccaacatacact 27476688  T
Q  214 gctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatg-cctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgtatgtgttga 312  Q
    |||||||| |||||||| || ||||    |||||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27476687 gctagatatccctttggaacgtccacggtttttgaagatgatgtccttt----tgatgatactaggtaaacggaaacccattgttgtatgtatgtgttga 27476592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 303
Target Start/End: Original strand, 27516547 - 27516835
Alignment:
Q  12 taatatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatat 111  Q
    |||||||| ||  |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27516547 taatatctgcatggagctacttcaattcaagttagaagtgatatctaagaaaacttcttctttgcaaggaatagtgagaccccccattggatggtcatat 27516646  T
Q  112 tcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtaca 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||| | || |||||| ||||    
T  27516647 tcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatgtcctttcctacataca 27516746  T
Q  212 ctgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatg-cctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 303  Q
    | |||||||| |||||||| ||  ||| |  |||||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27516747 cagctagatatccctttggaacgcccacagattttgaagatgatgaccttt----tgatgatactaggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 27516835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27474074 - 27473793
Alignment:
Q  32 ttcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttg 131  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||    
T  27474074 ttcaattcaagcgagaagtgatgtctaagaaaacgtcttctccgcaaggaatggtgagaccacccattggatgatcatattcaaattgttcctcactttg 27473975  T
Q  132 gttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggc 231  Q
    | ||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  27473974 gctcagcaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatctcctctcctacgtacacagctagatatccctttgga 27473875  T
Q  232 acctccaaaccttttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgta-tgtatgtgttgaaaa 315  Q
    ||  ||| |  |||||||||||||||| |   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27473874 acacccacagattttgaagatgatgccct---tttgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtattgtatgtgttaaaaa 27473793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 44 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27498585 - 27498329
Alignment:
Q  44 gagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattc 143  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  27498585 gagaagtgatatctaagaacatgtcttctccgcaaggaatagtgagaccacccattggatgatcatattcgaattgttcctcggcttggttcaacaagtc 27498486  T
Q  144 ttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaacct 243  Q
    |||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||| |||||| || || ||||||||||| ||||||||||  ||||  |||    
T  27498485 ttggaacgatggttggttcaagtatgatatagggatcacaaaacgtttcatttcctctccaacatatactgctagatatccctttggcatgtccacgcct 27498386  T
Q  244 tttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 303  Q
    |||||||| |||| | |   ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  27498385 tttgaagacgatgtcct---tctgatgatacctggtaaacgaaaacccattttcgtatgt 27498329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 300
Target Start/End: Original strand, 27500295 - 27500561
Alignment:
Q  31 attcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagctt 130  Q
    ||||||||||||  |||| |||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | || ||||| |||| ||    
T  27500295 attcaattcaagcaagaagtgaattctaagaaaaggtcttctctgcaaggaatagtgatgccacccattggatggtcatatccgaactgttcttcagatt 27500394  T
Q  131 ggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    || ||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  27500395 ggctcagcaattcttggaatgaactttggtttaagtatgatatagggatcacaaatcgcttcattttctctcctacgtacactgctagatatccttttgg 27500494  T
Q  231 cacctccaaaccttttgaagatgatg-cctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgta 300  Q
     || |||| |  |||||||||||||| |||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27500495 tacgtccacagattttgaagatgatgaccttt----tgatgatactaggtaaacgaaaacccattgttgta 27500561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27467021 - 27466722
Alignment:
Q  12 taatatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatat 111  Q
    |||||||||||  |||||| |||||||||||  |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27467021 taatatcttca--gagctacttcaattcaagctagaagtgatgtctaagaaaacttcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatgatcatat 27466924  T
Q  112 tcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtaca 211  Q
    |||||||||||||||  |||| ||| || |||||||||| |  |||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||| | || |||||||||||    
T  27466923 tcaaattgttcctcactttggctcagcagttcttggaataatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatctcctttcctacgtaca 27466824  T
Q  212 ctgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgatg-cctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgta-tgtatgtgt 309  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||| |  |||||||||||||| |||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  27466823 ctgctagatatccctttggaacgcccacagattttgaagatgatgaccttt----tgatgatactaggtaaacggaaacccattgtcgtattgtatgtgt 27466728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27460678 - 27460474
Alignment:
Q  14 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27460678 atatcttcaaagagctaattcaaattaagtgagaggtgatatccaagaaaatgtcttctctgcaaggaatggtgagaccacccattggatgatcatattc 27460579  T
Q  114 aaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 213  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||| ||| |||||||| | |||||| | |||||||| |||||||    
T  27460578 aaattgttcctcactttggctcagcaattcttggaatgatttttgcttcaaatatgatatagggatcacaaatctcttcatgtcctctcctatgtacact 27460479  T
Q  214 gctag 218  Q
    |||||    
T  27460478 gctag 27460474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 149
Target Start/End: Original strand, 27502075 - 27502210
Alignment:
Q  14 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27502075 atatcttcaaagagctaattcaatttaagtgagaggtgatatctaagaaaatgtcttctctgcaaggaatagttagaccacccattggatgatcatattc 27502174  T
Q  114 aaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaa 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502175 aaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaa 27502210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 52 - 253
Target Start/End: Original strand, 27444772 - 27444973
Alignment:
Q  52 atatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatg 151  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||    
T  27444772 atatctaagaaaacgtcttctctgcaaggaattgtgagaccacccattggatggtcatatccgaattgttcctcggcttgattcaataattcttgaaatg 27444871  T
Q  152 aggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaaga 251  Q
    | | |||| ||||||||||||  || |||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27444872 atgattggctcaagtatgatattgggatcacaaacctcttcatttcctctccaacgtatactgcaagatatccctttggcacatccacgccttttgaaga 27444971  T
Q  252 tg 253  Q
    ||    
T  27444972 tg 27444973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27501486 - 27501231
Alignment:
Q  45 agaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattct 144  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  27501486 agaagtgatatctaagaacatgtcttctctacaaggaatagtgagaccacccgttggatgatcgtattcaaattgttcctcggcttggttcaacaagtct 27501387  T
Q  145 tggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaacctt 244  Q
    || ||  | | |||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||||| || || ||||||||| | |||||||| ||||| | |||||    
T  27501386 tgaaacaatggttggtttaagtatgatattgggatcacaaaccgtttcatttcctctccaacatatactgctagacatccctttggaacctcgacacctt 27501287  T
Q  245 ttgaagatgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 303  Q
    |||||||||||| | |   ||| | |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27501286 ttgaagatgatgtcct---tcttaggataccaggtaaacgaaaacccattcttgtatgt 27501231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 27502771 - 27503030
Alignment:
Q  38 tcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaa 137  Q
    ||||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| |||     
T  27502771 tcaagcgagaagtgatatctacgaaaaaatcttcttcacaaggaatagtaagaccacccattggatggtcatatccaaattcttccacagcttggctcag 27502870  T
Q  138 caattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctcc 237  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| || || || ||||| || |||||||| |||    
T  27502871 caagtcttgaaatgaagtttgattcaaatatgacattggaatcacaaaccgcttcatcttctctcctacataaacggcaagatatccttttggcacatcc 27502970  T
Q  238 aaaccttttgaagatgatg-cctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 303  Q
    || |||||||||||||||| |||||       |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  27502971 aagccttttgaagatgatgaccttt-------tgatacctggtaaatgaaaacccattcttgtatgt 27503030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 50 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 27557653 - 27557450
Alignment:
Q  50 tgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaa 149  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  27557653 tgatatctaagaaaacatcttctctgcatggaatagtgagaccacccattggatgaacatattcaaattgttcctcagcttgattcagcaattcttgaaa 27557554  T
Q  150 tgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaa 249  Q
    ||| | |||||| |||||||| |  || |||||||||| |||||||| |||||| || || || || ||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||    
T  27557553 tgatggttggtttaagtatgacattgggatcacaaacctcttcatttcctctccaacatatacggcaagatatccccttggcacatccacaccctttgaa 27557454  T
Q  250 gatg 253  Q
    ||||    
T  27557453 gatg 27557450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 27431126 - 27431307
Alignment:
Q  52 atatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatg 151  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  27431126 atatttaagaaaacgtcttctctgcaaggaattgtgagaccaccggttggatggtcatatccaaattgttcctcggcttgattcaacaattcttgaaatg 27431225  T
Q  152 aggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    | | |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||  || || || || ||||| | ||| |||||||||||    
T  27431226 acggttggttcaagtatgatattgggatcacaaacctcttcatttcatccccaacatatactgcaatatatccctttggcac 27431307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 258
Target Start/End: Original strand, 27507777 - 27507997
Alignment:
Q  38 tcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaa 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||   |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||| ||| | |     
T  27507777 tcaagcgagaagtgatatctaagaaaagatcttcttcacaaggaattgtaagaccacccattggatggtcatatccaaattcttcgacagcctggctgag 27507876  T
Q  138 caattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctcc 237  Q
    ||| ||||| | ||| ||||| ||||| ||||| |  ||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| || || || ||||||||||  |||    
T  27507877 caactcttgaagtgaagtttgattcaaatatgacattggaattacaaaccgcttcatttttactcctacgtacaccgcaaggtatccctttggcatatcc 27507976  T
Q  238 aaaccttttgaagatgatgcc 258  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  27507977 aagccttttgaagatgatgcc 27507997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Original strand, 27414297 - 27414463
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || | ||| || |  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  27414297 tcttcactgcacggaattgtaagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaatgagggttggttcaagt 27414396  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||    
T  27414397 atgatacaggaatcacaaaccgtctcattttatctccaacgtagactgcaagatagccttttggcac 27414463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27554471 - 27554225
Alignment:
Q  52 atatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatg 151  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |    
T  27554471 atatctaagaaaacgtcttctctacaaggaattgtgagactacccgttggatgatcatatccaaattgttcctcagcttgattcagcaattcttgaaacg 27554372  T
Q  152 aggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaaga 251  Q
    | | |||| | ||  | || |  |  ||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  27554371 atggttggcttaacaaagaaattgatatcacaaaccgcttcatttcctctccaacatatactgcaaggtatccctttggcacatccactccttttgaaga 27554272  T
Q  252 tgatgcctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 303  Q
    ||      ||| | ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  27554271 tg-----cttggtttgaggataccaggtaaacgaaaacccattcttgtatgt 27554225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17970446 - 17970280
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| |||||| ||  |  ||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  17970446 tcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccgaattcttcctctgcccgactcagcaagtattgaaatgaagtttggttcaagt 17970347  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  17970346 atgacgtagggatcacaaaccgcttcatttcctctccaacgtacaccgcaagatatccctttggcac 17970280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27504062 - 27503924
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  27504062 tgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgactcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaagtatgatac 27503963  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 212  Q
    |||||  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27503962 aggaactacaaaccgcgccaatttctctccaacatacac 27503924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 73 - 230
Target Start/End: Original strand, 27424513 - 27424670
Alignment:
Q  73 ctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgata 172  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| |||| ||| || | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27424513 ctgcacggaatggtaagaccacccattggatgatcatatccatattcttcttcagattgatttagcaattcttgaaatgaaggttggttcaagtatgata 27424612  T
Q  173 caggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    | ||||||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27424613 ctggaatcacaaaccgcctcatttgatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27424670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 74 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 27524664 - 27524523
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  27524664 tgcacggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcagcttgattcaacaagtcttgaaatgaaggttggttcaaatatgatac 27524565  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgc 215  Q
    |||||  |  |||||| ||| ||||||||| || ||||||||    
T  27524564 aggaactatgaaccgcgtcagtttctctccaacatacactgc 27524523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 33 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27567436 - 27567239
Alignment:
Q  33 tcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttgg 132  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||| || | |||     
T  27567436 tcaattcaagtgagaagtgagttctaagaaagcatcttcgctgcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcataaccaaattcttcttctgtttga 27567337  T
Q  133 ttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    || |  |||||||| || || | |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27567336 tttagtaattcttgaaacgatggttggttcaagtatgatactggaatcacgaaccgtctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27567239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Original strand, 27570049 - 27570230
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| | || | ||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||| | |||| | |||||||||||    
T  27570049 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccgaactcttcctcagcttgactcagcaagtcttgaaatgaaggttggcttaagtatgatac 27570148  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgat 255  Q
     || |||||| ||||| ||  ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||| ||||    
T  27570149 ggggatcacataccgcgtctgtttctctccaacatatactgcaagatatccctttggcacatccacagcttttgaagctgat 27570230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 73 - 230
Target Start/End: Original strand, 27411455 - 27411612
Alignment:
Q  73 ctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgata 172  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || ||||| || |  |||||||| || || | |||||||||||||||||    
T  27411455 ctgcaaggaattgtgagaccacccataggatgatcatatccaaattcttcttctgcttgatttagtaattcttgaaacgatggttggttcaagtatgata 27411554  T
Q  173 caggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    | |||||||| |||||  ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27411555 ctggaatcacgaaccgtctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27411612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27425952 - 27425771
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | |||||||  |||  |||| || ||||| ||||| | |||||||||||||||||     
T  27425952 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttcctcaaattgactcaataagtcttgaaatgatggttggttcaagtatgatat 27425853  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgat 255  Q
     || |||||| |||||||   ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||| | |||| |||| ||||    
T  27425852 tgggatcacataccgcttttgtttctctccaacatatactgcaagatatccctttggcacgtccacagctttcgaagctgat 27425771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 212
Target Start/End: Original strand, 27475580 - 27475717
Alignment:
Q  75 gcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgataca 174  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | |||||| |||||  ||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||    
T  27475580 gcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgactcaacaagtcttgaaatgaaggttgattcaagtatgataca 27475679  T
Q  175 ggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 212  Q
    ||||  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27475680 ggaactacaaaccgcgccaatttctctccaacatacac 27475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 74 - 247
Target Start/End: Original strand, 27563346 - 27563519
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||| || |||||  ||| ||| ||||| ||  | ||||||||||||||||||||    
T  27563346 tgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcttcggcttgactcagcaaatcttgaaacaatgtttggttcaagtatgatac 27563445  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttg 247  Q
     || |||||||  | |||   ||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||    
T  27563446 ggggatcacaattctcttttgtttatctccaacgtacactgcaagatagccctttggcacgtccacaacttttg 27563519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27415768 - 27415589
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||| ||||| || || | |||||||||||    
T  27415768 tcttctgtgcaaggaatggtgaggccacccatggaatgatcatatccaaactcttcctcagcttgactcaacaagtcttgaaacgatggttggttcaagt 27415669  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaa 249  Q
    ||||||  || |||||||| ||||   |||  | ||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  27415668 atgatatggggatcacaaatcgct---tttgttttccaacatacactgcaagatatccctttggcacatccacaacttttgaa 27415589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 74 - 212
Target Start/End: Original strand, 27468327 - 27468465
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| | |||  ||||||| ||||| ||||| | |||||| |||||||||||    
T  27468327 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcctcggattgactcaacaagtcttgaaatgaaggttggtttaagtatgatac 27468426  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 212  Q
    ||| |  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27468427 agggactacaaaccgcaccagtttctctccaacatacac 27468465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 27585835 - 27585653
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| | ||| || |||||  ||| ||| ||||| ||  | | |||||||||||    
T  27585835 tcttctgtgcaaggaatggtgagacctcccattggatgatcatatccaaactcttcttcggcttgactcatcaaatcttgaaacaatggttggttcaagt 27585736  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaa 249  Q
    ||||||| || |||||||| | |||   ||| || || ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  27585735 atgatacggggatcacaaatctcttttgtttatcaccaacgcacactgcgagatatccctttggcacgtccacaacttttgaa 27585653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 67 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 27515038 - 27514893
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    |||||| | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| |||||| | |||  ||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||    
T  27515038 tcttctgtacaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcctcggattgactcaacaagtcttgaaatgaaggttgattcaagt 27514939  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacac 212  Q
    |||||||||| |  |||||||||  || ||||||||| || |||||    
T  27514938 atgatacagggactacaaaccgcaccagtttctctccaacatacac 27514893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 74 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 27412804 - 27412690
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | ||| ||||||||  |||| || ||||| ||| | | |||||||||||||||||     
T  27412804 tgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcttcagcttgactcaataagtcttgaaataatggttggttcaagtatgatat 27412705  T
Q  174 aggaatcacaaaccg 188  Q
     || |||||||||||    
T  27412704 tgggatcacaaaccg 27412690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 27420548 - 27420367
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||| | ||||||| ||||  ||| |||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||    
T  27420548 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaactcttcctcaacttgactcagcaagccttgaaatgaaggttggctcaagtatgatac 27420449  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaagatgat 255  Q
     || || | | ||||| ||  ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||| |  |||||||| ||||    
T  27420448 ggggattaaataccgcgtctgtttctctccaacatatactgcaagatatccctttggcacgtccacagattttgaagctgat 27420367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 76 - 249
Target Start/End: Original strand, 27565953 - 27566126
Alignment:
Q  76 caaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacag 175  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||   | ||||||| ||||  ||| ||| ||||| ||  | | |||||||| ||||||||  |    
T  27565953 caaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccatgctcttcctcaacttgtatcagcaagtcttgaaacaatggttggttcaggtatgatatgg 27566052  T
Q  176 gaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctccaaaccttttgaa 249  Q
    | |||||||| |||||   ||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||| | ||||||||    
T  27566053 ggatcacaaatcgcttttgtttctctccaacatacactgcaagatatccctttggcacgtccacaacttttgaa 27566126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 323 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 27479771 - 27479715
Alignment:
Q  323 ttgtttgtaaatagaatgctcaagtttctgaatttcaaatgcttttggttgtgaatg 379  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  27479771 ttgtttgtaaacagaaggctcaagtttctgactttcaaatggttttggttgtgaatg 27479715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Original strand, 27485943 - 27486099
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || ||||| |  | ||||||||| ||  | | |||||||||||||||||     
T  27485943 tgcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggttcaagtatgatat 27486042  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
     || |  ||||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  27486043 tgggacaacaaaccgcttctgtttctctccaacatacactgcaacatagccctttgg 27486099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 230
Target Start/End: Original strand, 27478884 - 27479039
Alignment:
Q  75 gcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgataca 174  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || ||||| |  | ||||||||| ||  | | |||||||||||||||||      
T  27478884 gcaaggaatggtgaggccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggttcaagtatgatatt 27478983  T
Q  175 ggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    || |  ||||||||||||  ||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  27478984 gggacaacaaaccgcttctgtttctctccaacatacactgcaacatagccctttgg 27479039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 27490096 - 27489961
Alignment:
Q  78 aggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacagga 177  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | || ||| |||||||| |||||     
T  27490096 aggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttcctcggcttgattcaacaaatcttgaaatgatggtttgtttaagtatgacacaggg 27489997  T
Q  178 atcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacact 213  Q
    |  |||||||| ||   ||||||||| || ||||||    
T  27489996 actacaaaccgtttttgtttctctccaacatacact 27489961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 27556372 - 27556535
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||| || ||||| |  |  |||||||| ||||| | |||||||||      
T  27556372 tcttcactgcatggaattgtgagaccacccatagaatgatcatatccaaattcttcttctgcttgatgtagtaattcttgaaatgaaggttggttcaata 27556471  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    |||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27556472 atgaaatgggaatcacaaatcgcttcattttttctccaacataaactgcgagatagccttttgg 27556535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27571762 - 27571607
Alignment:
Q  75 gcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgataca 174  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || | ||| || |  |||||||| || || |  ||| |||| ||||||||     
T  27571762 gcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaacgatggctggctcaaatatgatact 27571663  T
Q  175 ggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27571662 ggaatcacgaaccgcctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27571607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 27421924 - 27422091
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattca----aattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttc 162  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| ||    |||| ||| || ||||| || |  |||||||| ||| | | |||||||    
T  27421924 tcttcactgcaaggaattgtgagaccacccgttggatgatcgtatccatccaaattcttcttctgcttgatttagtaattcttgaaataatggttggttc 27422023  T
Q  163 aagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27422024 aagtatgatactggaatcacgaaccgtttcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27422091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27506838 - 27506682
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||| ||| || ||||| |  | ||||||||| ||  | | |||||| ||||||||||     
T  27506838 tgcaaggaatggtgagtccacccatgggatgatcatatccaaattcttcttccgcttgatgtagcaattcttgaaacaatggttggtttaagtatgatat 27506739  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
     || |||||||||||| ||  ||||||||| || || ||||| | ||| ||||||||    
T  27506738 tgggatcacaaaccgcgtctgtttctctccgacatatactgcaacatagccctttgg 27506682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 230
Target Start/End: Original strand, 27419072 - 27419227
Alignment:
Q  75 gcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgataca 174  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || | ||| || |  |||||||| || || |  ||| |||| ||||||||     
T  27419072 gcaaggaattgtaagaccacccattggatgatcatatccaaattcttcttctgattgatttagtaattcttgaaacgatggctggctcaaatatgatact 27419171  T
Q  175 ggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    |||||||| |||||| ||||| | ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27419172 ggaatcacgaaccgcctcattctatctccaacatagactgcgagatagccttttgg 27419227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27495689 - 27495646
Alignment:
Q  61 aaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatg 104  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27495689 aaaatatcttctctgcaaggaatggtgagaccacccattggatg 27495646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Original strand, 27559233 - 27559396
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | ||| || | |||| | || || | ||| ||||| | ||| |||||      
T  27559233 tcttcactgcaaggaattgtgagaccacccattggatgatcatatccaaactcttcttctgattggcttaataactattgaaatgaagattgattcaata 27559332  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    |||| | |||||||| ||| | ||||||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||    
T  27559333 atgaaataggaatcagaaatctcttcattttgtctccaacataaactgcgagatagccttttgg 27559396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 36 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27423400 - 27423264
Alignment:
Q  36 attcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttc 135  Q
    ||||||||||||| | |||| |  |||||  |||||  |||||||||  ||||| |||||||| ||||| |  ||  |||| | |||||| |||||  ||    
T  27423400 attcaagtgagaagttatatgttggaaaacatcttccgtgcaaggaacggtgaggccacccatgggatgattgtaaccaaactcttcctcggcttgactc 27423301  T
Q  136 aacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgata 172  Q
    ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||    
T  27423300 aacaattcttgaaatgaaggttggttcaagtatgata 27423264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 55 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 27446306 - 27446158
Alignment:
Q  55 tctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgagg 154  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||||| | ||| || | |||| | ||| | ||||| ||||| |    
T  27446306 tctaagaaaacatcttcactgcaaggaatcgagagaccatccattcgatgatcatattcaaactcttcttctgattggcttaacgactcttgaaatgaag 27446207  T
Q  155 tttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcc 203  Q
     ||| |||||  ||||    ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27446206 gttgattcaataatgaagttggaatcacaaatcgcttcattttttctcc 27446158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Original strand, 27497322 - 27497478
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||  | ||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||| | ||| ||  | | |||||| |||||||| |     
T  27497322 tgcaaggaatggtgaggccacctgtgggatgatcatatccaaactcttcctcagcttgactcaacaaatattgaaacaatggttggtttaagtatgagat 27497421  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    ||| ||||||||||||||   ||| ||||| || |||||||| | ||| ||||||||    
T  27497422 agggatcacaaaccgcttttgtttatctccaacatacactgcaacatagccctttgg 27497478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 67 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27600700 - 27600663
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatg 104  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27600700 tcttctttgcaaggaattgtgagaccacccattggatg 27600663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 1759452 - 1759252
Alignment:
Q  14 atatcttcaaagagctaattcaattcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattc 113  Q
    |||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||    
T  1759452 atattttcagagagctgattcaattcaagtgagaagtgatatctaagaaaacttcttctctgcaaagaatggtgagaccacccattggatggttgtattc 1759353  T
Q  114 aaattgttcctcag----cttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgta 209  Q
    ||||||||||||||    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1759352 aaattgttcctcagcttgcttggctcaacaattcttggaatgatgtttggtttaaatatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgta 1759253  T
Q  210 c 210  Q
    |    
T  1759252 c 1759252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 303
Target Start/End: Original strand, 1754206 - 1754467
Alignment:
Q  38 tcaagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaa 137  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| || ||| |     
T  1754206 tcaagcgagaagtgatatctaagaaaaggt-ttctctacaaggaatagtgagaccacccatcggatgatcatattcaaactgttcctcagatttgtttag 1754304  T
Q  138 caattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcacctcc 237  Q
    ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| || || || |||||||| || |||||| | |||    
T  1754305 caatttttgaaatgacgattggttcaagtatgatacggggatcacaaaccgcttcatttcttctccaacatatacagctagatatccttttggctcgtcc 1754404  T
Q  238 aaaccttttgaagatgatg-cctttgatctgatgatacttggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 303  Q
    |  |||||||  ||||||| |||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1754405 acgccttttggggatgatgtccttt----tgatgatactaggtaaacgaaaacccattgttgtatgt 1754467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 74 - 230
Target Start/End: Original strand, 1756757 - 1756913
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| || || |||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||| | ||| || || | |||||||||||||||||     
T  1756757 tgcaaggaatggtgaggccacccatggggtgatcatatccaaattcttcttcagcttgactcaacaagtattgaaacgatggttggttcaagtatgatat 1756856  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
     || |||||||||||||||  ||||||||| || | |||||| ||||| ||||||||    
T  1756857 tgggatcacaaaccgcttctgtttctctccaacattcactgcaagatagccctttgg 1756913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1754835 - 1754672
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    |||||| ||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||| | |||| |||||||  |||||||   ||| || || | ||| |||||||    
T  1754835 tcttctgtgcaaagaatggtgaggccacccattggatgatcatatccaaactcttccgcagcttgactcaacaaggattgaaacgatggttgattcaagt 1754736  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    ||||||  || ||||||  ||| |||  ||||||||| |  |||||||| | ||| ||||||||    
T  1754735 atgatattgggatcacatgccgtttctgtttctctccaatatacactgcaacatagccctttgg 1754672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 382
Target Start/End: Original strand, 1754502 - 1754558
Alignment:
Q  326 tttgtaaatagaatgctcaagtttctgaatttcaaatgcttttggttgtgaatgatt 382  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||    
T  1754502 tttgtatatagaagactcaagtttctgaatttcaaatgccttggaatgtgaatgatt 1754558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 14)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 233
Target Start/End: Original strand, 50904762 - 50904951
Alignment:
Q  44 gagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattc 143  Q
    ||||| ||||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||  ||||| ||| |  ||||||| ||    
T  50904762 gagaagtgatatgcaaaaaaacctcttctctgcaaggaatggtgaggccacccattggatgatcatatccgaattcatcctctgctcgactcaacaagtc 50904861  T
Q  144 ttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| || | | | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  50904862 ttgaaatgaagtttggttcaagtaggacatatggatcacaaaccgcttcatttcttctccaacgtacactgcaagatatccctttggcac 50904951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 55084942 - 55084767
Alignment:
Q  58 aagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggttt 157  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| |||||| |||||| ||  |  ||||||| ||||| ||||| | ||    
T  55084942 aagaaaacatcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccaaattcttcctccgcccgactcaacaagtcttgaaatgatggtt 55084843  T
Q  158 ggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| |||| ||||||||    
T  55084842 ggttcaagtaagacatagggatcacaaaccgcttcattttctctccaacatacactgcaagacacccttttggcac 55084767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 38028732 - 38028925
Alignment:
Q  40 aagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaaca 139  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||  |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||    
T  38028732 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccaaattcttcctcggcttgactcaaca 38028831  T
Q  140 attcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
      | ||| ||||| | |||||||||||||||    || || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38028832 ggttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctccaacgtacactgcaagatagccctttggcac 38028925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 74 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38044043 - 38043884
Alignment:
Q  74 tgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatac 173  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||  ||| ||| ||||| || || ||||| ||||||||||| |     
T  38044043 tgcaaggaattgtgaggccgcccattggatgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcagcaagtcttgaaacgaagtttgattcaagtatgacat 38043944  T
Q  174 aggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||    
T  38043943 agggatcacaaaccgcttcatttcctctccaaagtacactgcaagatagctctttggcac 38043884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50910107 - 50909941
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||| | ||| ||||| | |||||||||||    
T  50910107 tcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaattcttcctccacttgattcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagt 50910008  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    |||| |  || || |||||||||  ||||| |||||| || |||||||| ||||| |||||||||||    
T  50910007 atgacatggggataacaaaccgcagcatttgctctccaacatacactgcaagataaccctttggcac 50909941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 38040047 - 38040240
Alignment:
Q  40 aagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaaca 139  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||  |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||  ||||||    
T  38040047 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccgaattcttcctcggcttgactcaaca 38040146  T
Q  140 attcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
      | ||| ||||| | |||||||||||||||    || || ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38040147 ggttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctccaacgtacactgcaagatagccctttggcac 38040240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 38036759 - 38036952
Alignment:
Q  40 aagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaaca 139  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||  | |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||  ||||||    
T  38036759 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtattctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatccgaattcttcctcggcttgactcaaca 38036858  T
Q  140 attcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    | | ||| ||||| | ||||||||||||||  |  || |  |||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38036859 aattttgaaatgaagcttggttcaagtatggcatggggacaacaaaccgtttcatttgctctccaacgtacactgcaagatagccctttggcac 38036952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 38024861 - 38025031
Alignment:
Q  60 gaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttgg 159  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||| |||||  |||| || | ||| || || | ||||    
T  38024861 gaaaatgtcttctgtgcaaggaatcgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagttttgaaaggaagcttgg 38024960  T
Q  160 ttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    ||||||||||| |  || || |||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  38024961 ttcaagtatgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatatactgcaagatagccctttgg 38025031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 38031313 - 38031483
Alignment:
Q  60 gaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttgg 159  Q
    |||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||| |||||  |||| || | ||| || || | ||||    
T  38031313 gaaaatgtcttctgtgcaaggaatcgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagttttgaaaggaagcttgg 38031412  T
Q  160 ttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    ||||||||||| |  || || |||||||||||||||| |||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  38031413 ttcaagtatgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatatactgcaagatagccctttgg 38031483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 233
Target Start/End: Original strand, 38033802 - 38033938
Alignment:
Q  97 attggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattt 196  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| | |||||||||||||||    || || ||||||||||||||||    
T  38033802 attggatggtcatatccaaattcttcctcggcttgactcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaaccgcttcattt 38033901  T
Q  197 tctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
     |||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  38033902 gctctccaatgtacactgcaagatagccctttggcac 38033938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 58 - 233
Target Start/End: Original strand, 48840696 - 48840870
Alignment:
Q  58 aagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggttt 157  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| || |||  |||  | |||||| ||||| ||||||| ||    
T  48840696 aagaaaacatcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcatatccaaattctttctccacttact-caacaagtcttgaaatgaggctt 48840794  T
Q  158 ggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    ||||||||||||  |  || || ||||| |||||||| | |||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  48840795 ggttcaagtatggcatggggattacaaatcgcttcatctcctctccgacgtacaatgcaagatatccctttggcac 48840870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 233
Target Start/End: Original strand, 50911863 - 50912028
Alignment:
Q  68 cttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagta 167  Q
    ||||| |||||||||| || || ||||||||||| || |||||| |||||| |||||| |||||  ||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||    
T  50911863 cttctgtgcaaggaattgttaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaacaagttttgaaatgaagcttggttcaagta 50911962  T
Q  168 tgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    |||    || ||||||||||| ||||| || ||||| || || || || ||||| |||||||||||    
T  50911963 tgacttggggatcacaaaccgtttcatcttgtctccaacatataccgcaagatagccctttggcac 50912028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Original strand, 48838719 - 48838781
Alignment:
Q  140 attcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctc 202  Q
    ||||||| ||||| | |||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  48838719 attcttgaaatgaagattggttcaggtaggacacgggaatcacaaaccgcttcatttcctctc 48838781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 104
Target Start/End: Original strand, 55088043 - 55088081
Alignment:
Q  66 ctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatg 104  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  55088043 ctcttctttgcatggaatagtgagaccacccattggatg 55088081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 67 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3073716 - 3073550
Alignment:
Q  67 tcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttggttcaagt 166  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||| | |||| |||||| ||  |  ||| ||| | ||| ||||| |||||||||||||    
T  3073716 tcttctgtgcaaggaattgtgaggccacccattggatgatcgtatccgaattcttcctctgcccgactcagcaagtattgaaatgaagtttggttcaagt 3073617  T
Q  167 atgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
    ||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  3073616 atgacgtagggatcacaaaccgcttcatttcctctccaacgtacaccgcaagatatccctttggcac 3073550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 233
Target Start/End: Original strand, 21604720 - 21604913
Alignment:
Q  40 aagtgagaaatgatatctaagaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaaca 139  Q
    ||||||||| | ||||  |||||||  |||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||||  ||||||    
T  21604720 aagtgagaagtaatatgcaagaaaacgtcttctgtgcaaggaattgtgaggccgcccattggatggtcatatcctaattcttcctcgtcttgactcaaca 21604819  T
Q  140 attcttggaatgaggtttggttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttggcac 233  Q
      | ||| ||||| | |||||||||||||||    || || ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  21604820 tgttttgaaatgaagcttggttcaagtatgacgtggggataacaaatcgcttcatttgctctcctacttacactgcaagatagccctttggcac 21604913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 230
Target Start/End: Original strand, 21607282 - 21607452
Alignment:
Q  60 gaaaatctcttctctgcaaggaatagtgagaccacccattggatggtcatattcaaattgttcctcagcttggttcaacaattcttggaatgaggtttgg 159  Q
    |||||| |||||| |||||||||  ||||| ||||||||||| || |||||| |||||| |||||| |||||  |||| || | ||| || || | | ||    
T  21607282 gaaaatatcttctgtgcaaggaaccgtgaggccacccattgggtgatcatatccaaattcttcctctgcttgactcaataagttttgaaaggaagctcgg 21607381  T
Q  160 ttcaagtatgatacaggaatcacaaaccgcttcattttctctcctacgtacactgctagatacccctttgg 230  Q
    ||||||||||| |  || || |||||||||||||||| |||||| || || || || ||||| ||||||||    
T  21607382 ttcaagtatgacatggggataacaaaccgcttcatttgctctccaacatataccgcaagatatccctttgg 21607452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 393 times since January 2019
Visitors: 6714