View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0900_low_38 (Length: 310)

Name: NF0900_low_38
Description: NF0900
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0900_low_38
NF0900_low_38
[»] chr5 (80 HSPs)
chr5 (11-250)||(25421532-25421771)
chr5 (11-250)||(25431395-25431633)
chr5 (11-253)||(23390375-23390617)
chr5 (11-246)||(24493569-24493803)
chr5 (11-246)||(8286728-8286964)
chr5 (11-242)||(9077952-9078183)
chr5 (14-240)||(24529223-24529449)
chr5 (11-246)||(13025311-13025545)
chr5 (11-246)||(13095495-13095729)
chr5 (11-250)||(22075018-22075258)
chr5 (11-242)||(1096467-1096698)
chr5 (11-178)||(21808343-21808510)
chr5 (11-246)||(21292856-21293090)
chr5 (11-178)||(21729018-21729185)
chr5 (14-226)||(22412187-22412388)
chr5 (14-177)||(29329934-29330096)
chr5 (14-177)||(264768-264930)
chr5 (14-177)||(39363384-39363546)
chr5 (14-176)||(10732941-10733102)
chr5 (14-226)||(11581151-11581361)
chr5 (14-177)||(20909012-20909174)
chr5 (14-177)||(42245365-42245527)
chr5 (21-226)||(18418590-18418793)
chr5 (11-119)||(21997547-21997655)
chr5 (14-177)||(29345980-29346142)
chr5 (14-177)||(36154783-36154942)
chr5 (14-177)||(29348453-29348615)
chr5 (14-177)||(29350926-29351088)
chr5 (14-177)||(39245136-39245298)
chr5 (14-177)||(20902008-20902172)
chr5 (14-177)||(2154613-2154776)
chr5 (14-177)||(32027393-32027555)
chr5 (17-177)||(18319033-18319193)
chr5 (30-232)||(22144068-22144271)
chr5 (14-177)||(10775675-10775838)
chr5 (14-177)||(31061068-31061231)
chr5 (14-177)||(20917952-20918110)
chr5 (17-177)||(24067110-24067270)
chr5 (13-165)||(17517168-17517320)
chr5 (14-122)||(38619434-38619541)
chr5 (15-122)||(23064512-23064618)
chr5 (148-246)||(22107259-22107357)
chr5 (115-242)||(21986037-21986164)
chr5 (11-87)||(21329541-21329618)
chr5 (60-186)||(18356364-18356488)
chr5 (15-193)||(21565546-21565723)
chr5 (15-218)||(21873254-21873453)
chr5 (11-134)||(21502154-21502277)
chr5 (30-218)||(37723922-37724108)
chr5 (11-87)||(19660879-19660956)
chr5 (30-129)||(20026942-20027043)
chr5 (11-226)||(40725853-40726069)
chr5 (60-186)||(20910745-20910869)
chr5 (11-180)||(26011988-26012154)
chr5 (15-87)||(22959576-22959649)
chr5 (11-109)||(36314577-36314675)
chr5 (15-189)||(18769947-18770118)
chr5 (15-189)||(22032323-22032492)
chr5 (77-226)||(20766035-20766174)
chr5 (14-68)||(20806850-20806904)
chr5 (15-100)||(26704075-26704160)
chr5 (15-100)||(26973808-26973893)
chr5 (15-188)||(23572084-23572254)
chr5 (11-87)||(19668898-19668975)
chr5 (27-80)||(26732884-26732937)
chr5 (30-191)||(22178161-22178323)
chr5 (30-80)||(26740697-26740747)
chr5 (15-178)||(20766974-20767136)
chr5 (15-178)||(20805552-20805714)
chr5 (30-79)||(23469822-23469871)
chr5 (60-130)||(29448052-29448123)
chr5 (15-85)||(23501402-23501472)
chr5 (30-79)||(21328268-21328317)
chr5 (34-79)||(21731514-21731559)
chr5 (34-79)||(21809634-21809679)
chr5 (15-100)||(23201360-23201445)
chr5 (15-79)||(14079149-14079213)
chr5 (15-79)||(23512098-23512162)
chr5 (38-74)||(26680605-26680641)
chr5 (38-74)||(26952212-26952248)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (11-253)||(13211-13453)
[»] chr2 (75 HSPs)
chr2 (11-241)||(23060513-23060742)
chr2 (11-235)||(23076442-23076666)
chr2 (11-246)||(22731120-22731355)
chr2 (11-246)||(22738066-22738300)
chr2 (11-246)||(23285865-23286096)
chr2 (11-246)||(22337115-22337350)
chr2 (11-250)||(23654268-23654507)
chr2 (11-242)||(23660023-23660253)
chr2 (14-250)||(298696-298933)
chr2 (11-246)||(38002-38235)
chr2 (14-177)||(22105412-22105575)
chr2 (11-246)||(20309108-20309340)
chr2 (17-177)||(21155060-21155219)
chr2 (14-177)||(18808943-18809105)
chr2 (14-177)||(23130862-23131024)
chr2 (14-177)||(23133329-23133491)
chr2 (14-177)||(23709532-23709694)
chr2 (14-177)||(23712013-23712175)
chr2 (14-177)||(26505379-26505541)
chr2 (14-177)||(26507857-26508019)
chr2 (14-177)||(34402522-34402684)
chr2 (14-177)||(39682313-39682475)
chr2 (12-177)||(32214921-32215085)
chr2 (11-232)||(23708518-23708738)
chr2 (14-177)||(571397-571559)
chr2 (14-177)||(6725995-6726157)
chr2 (14-177)||(23135590-23135752)
chr2 (14-177)||(24367774-24367936)
chr2 (16-177)||(43137301-43137461)
chr2 (14-177)||(24898195-24898358)
chr2 (14-177)||(24900678-24900841)
chr2 (14-177)||(24903155-24903318)
chr2 (14-177)||(24905632-24905795)
chr2 (14-177)||(24908107-24908270)
chr2 (14-177)||(32039498-32039660)
chr2 (14-177)||(45029854-45030016)
chr2 (14-177)||(28577099-28577261)
chr2 (14-177)||(24529528-24529691)
chr2 (14-177)||(38967374-38967537)
chr2 (18-165)||(25616192-25616339)
chr2 (166-253)||(27753730-27753817)
chr2 (11-226)||(19671830-19672043)
chr2 (11-180)||(23103348-23103516)
chr2 (30-250)||(32451811-32452031)
chr2 (15-195)||(22799063-22799243)
chr2 (15-195)||(23019643-23019823)
chr2 (16-137)||(28405981-28406103)
chr2 (30-178)||(7687-7835)
chr2 (11-88)||(8946657-8946734)
chr2 (15-179)||(7679589-7679751)
chr2 (11-74)||(23040247-23040310)
chr2 (17-91)||(24643036-24643109)
chr2 (15-137)||(25175854-25175976)
chr2 (30-232)||(20520092-20520295)
chr2 (12-87)||(22134251-22134326)
chr2 (11-109)||(23071972-23072070)
chr2 (15-218)||(40622123-40622327)
chr2 (26-87)||(18786947-18787009)
chr2 (30-130)||(23207296-23207398)
chr2 (32-81)||(23287384-23287433)
chr2 (100-177)||(24642856-24642933)
chr2 (15-178)||(25963669-25963832)
chr2 (32-80)||(26392403-26392451)
chr2 (30-232)||(22413035-22413240)
chr2 (30-193)||(23791292-23791456)
chr2 (15-195)||(22740897-22741081)
chr2 (30-130)||(23004767-23004869)
chr2 (30-226)||(24697512-24697709)
chr2 (32-100)||(23038048-23038116)
chr2 (107-194)||(22459500-22459587)
chr2 (30-79)||(9241945-9241994)
chr2 (38-74)||(24655396-24655432)
chr2 (38-74)||(24869903-24869939)
chr2 (30-81)||(25108906-25108958)
chr2 (38-74)||(25961592-25961628)
[»] chr8 (76 HSPs)
chr8 (11-255)||(18818286-18818530)
chr8 (11-246)||(21923814-21924049)
chr8 (11-246)||(20536208-20536443)
chr8 (11-241)||(23406379-23406611)
chr8 (11-242)||(22626736-22626966)
chr8 (11-242)||(7372778-7373001)
chr8 (12-242)||(28648934-28649164)
chr8 (11-246)||(21918886-21919121)
chr8 (11-253)||(18879116-18879352)
chr8 (8-242)||(6759255-6759487)
chr8 (12-246)||(23648554-23648788)
chr8 (11-242)||(16092231-16092463)
chr8 (11-237)||(22875065-22875291)
chr8 (11-246)||(31971257-31971490)
chr8 (11-246)||(45130884-45131117)
chr8 (11-246)||(16199532-16199765)
chr8 (14-177)||(14409444-14409606)
chr8 (14-177)||(1484402-1484564)
chr8 (14-177)||(5853292-5853454)
chr8 (18-177)||(16413316-16413474)
chr8 (14-177)||(20046195-20046357)
chr8 (14-177)||(20403227-20403389)
chr8 (14-177)||(22001753-22001915)
chr8 (14-226)||(41598188-41598399)
chr8 (14-177)||(4483281-4483442)
chr8 (14-177)||(4542373-4542535)
chr8 (14-177)||(15203231-15203393)
chr8 (14-177)||(19896265-19896430)
chr8 (11-232)||(21389353-21389571)
chr8 (11-227)||(21395888-21396101)
chr8 (11-227)||(21790381-21790594)
chr8 (13-165)||(18678069-18678221)
chr8 (14-177)||(14823774-14823935)
chr8 (11-214)||(21778697-21778897)
chr8 (14-226)||(26219717-26219918)
chr8 (12-177)||(26223917-26224081)
chr8 (13-165)||(32121734-32121886)
chr8 (14-177)||(25484275-25484430)
chr8 (18-177)||(45290694-45290853)
chr8 (14-157)||(26225268-26225409)
chr8 (11-137)||(38855246-38855372)
chr8 (8-122)||(19937061-19937174)
chr8 (29-193)||(13508024-13508188)
chr8 (30-226)||(19801333-19801527)
chr8 (149-246)||(25363026-25363123)
chr8 (11-134)||(6520368-6520491)
chr8 (29-193)||(13597556-13597720)
chr8 (15-130)||(21285601-21285716)
chr8 (27-122)||(15070571-15070665)
chr8 (30-193)||(20498581-20498744)
chr8 (11-226)||(17612018-17612231)
chr8 (15-195)||(23776772-23776952)
chr8 (11-109)||(17140916-17141014)
chr8 (11-108)||(21490995-21491092)
chr8 (11-126)||(5866280-5866395)
chr8 (26-129)||(983407-983512)
chr8 (11-82)||(23760893-23760962)
chr8 (30-193)||(37116366-37116530)
chr8 (38-188)||(20465982-20466132)
chr8 (25-137)||(21673718-21673830)
chr8 (15-87)||(26355742-26355815)
chr8 (30-214)||(17439423-17439609)
chr8 (11-61)||(21249384-21249434)
chr8 (11-61)||(21255222-21255272)
chr8 (15-188)||(30643235-30643408)
chr8 (30-134)||(19154883-19154989)
chr8 (30-130)||(24353039-24353140)
chr8 (30-193)||(17266932-17267096)
chr8 (175-226)||(26222987-26223039)
chr8 (15-227)||(17353843-17354060)
chr8 (30-79)||(20502154-20502203)
chr8 (32-81)||(22525579-22525628)
chr8 (15-178)||(17926659-17926822)
chr8 (38-74)||(20533467-20533503)
chr8 (15-79)||(24755714-24755778)
chr8 (30-78)||(28397569-28397617)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (11-247)||(13442274-13442510)
chr3 (11-253)||(17487856-17488098)
chr3 (11-253)||(17499338-17499580)
chr3 (11-246)||(23083247-23083482)
chr3 (11-241)||(26686887-26687117)
chr3 (11-253)||(20698315-20698556)
chr3 (11-241)||(43840932-43841162)
chr3 (25-246)||(14576719-14576939)
chr3 (11-242)||(14972854-14973085)
chr3 (14-226)||(24153115-24153326)
chr3 (11-242)||(18438534-18438765)
chr3 (11-250)||(12399209-12399448)
chr3 (25-246)||(14572603-14572823)
chr3 (14-242)||(40213611-40213838)
chr3 (11-242)||(25476275-25476506)
chr3 (29-232)||(42386428-42386632)
chr3 (11-242)||(11424653-11424880)
chr3 (12-250)||(30029841-30030078)
chr3 (14-193)||(29172567-29172745)
chr3 (14-177)||(9707607-9707769)
chr3 (14-177)||(17463178-17463340)
chr3 (14-177)||(34159326-34159488)
chr3 (14-177)||(45606907-45607069)
chr3 (14-177)||(55476491-55476653)
chr3 (13-177)||(13544024-13544187)
chr3 (14-177)||(7781347-7781509)
chr3 (14-177)||(8899094-8899256)
chr3 (18-177)||(12567564-12567722)
chr3 (14-177)||(16454281-16454443)
chr3 (14-177)||(17672626-17672788)
chr3 (14-177)||(28848611-28848773)
chr3 (14-177)||(38961891-38962053)
chr3 (14-177)||(50242822-50242984)
chr3 (14-177)||(13151790-13151953)
chr3 (14-177)||(13154255-13154418)
chr3 (14-177)||(6469134-6469296)
chr3 (14-177)||(10247723-10247885)
chr3 (16-177)||(16282811-16282971)
chr3 (14-177)||(17446655-17446816)
chr3 (30-177)||(53070653-53070799)
chr3 (11-177)||(43550478-43550644)
chr3 (16-177)||(41123892-41124049)
chr3 (14-157)||(36166598-36166739)
chr3 (14-140)||(15977515-15977640)
chr3 (14-128)||(55500942-55501055)
chr3 (13-165)||(46822267-46822419)
chr3 (14-217)||(12119684-12119887)
chr3 (14-122)||(8499518-8499625)
chr3 (13-189)||(12511059-12511236)
chr3 (14-226)||(21618449-21618650)
chr3 (11-226)||(24340628-24340844)
chr3 (14-122)||(15412429-15412536)
chr3 (14-193)||(27165250-27165429)
chr3 (30-226)||(52523633-52523831)
chr3 (149-227)||(14179570-14179648)
chr3 (14-190)||(53301492-53301669)
chr3 (14-130)||(10556985-10557101)
chr3 (149-250)||(16796685-16796786)
chr3 (14-111)||(44494809-44494905)
chr3 (29-226)||(23274705-23274903)
chr3 (11-226)||(37642170-37642386)
chr3 (11-134)||(14234487-14234610)
chr3 (15-193)||(16103784-16103960)
chr3 (14-111)||(17737236-17737335)
chr3 (11-126)||(13210333-13210448)
chr3 (15-193)||(16097332-16097509)
chr3 (11-130)||(15470927-15471043)
chr3 (14-75)||(28194693-28194755)
chr3 (25-130)||(32307691-32307795)
chr3 (15-182)||(856140-856304)
chr3 (15-87)||(12174303-12174376)
chr3 (14-67)||(45577947-45578000)
chr3 (15-87)||(49668120-49668193)
chr3 (93-193)||(2051138-2051238)
chr3 (15-178)||(11298481-11298644)
chr3 (15-87)||(9512924-9512997)
chr3 (15-87)||(9520899-9520972)
chr3 (11-226)||(22147431-22147646)
chr3 (30-130)||(37251168-37251270)
chr3 (30-130)||(43925977-43926079)
chr3 (15-100)||(15878083-15878168)
chr3 (15-79)||(23077530-23077594)
chr3 (25-87)||(1644718-1644780)
chr3 (30-134)||(12377940-12378046)
chr3 (12-74)||(14665398-14665460)
chr3 (30-130)||(22110352-22110454)
chr3 (32-81)||(13919350-13919399)
chr3 (12-161)||(14668554-14668702)
chr3 (15-79)||(14878569-14878633)
chr3 (175-226)||(36166747-36166799)
chr3 (30-79)||(606378-606428)
chr3 (32-78)||(9577646-9577691)
chr3 (15-80)||(15060284-15060349)
chr3 (30-79)||(15246037-15246086)
chr3 (38-74)||(3389994-3390030)
chr3 (16-80)||(15051509-15051573)
chr3 (15-79)||(17525211-17525275)
chr3 (15-63)||(26196500-26196548)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (11-246)||(51913-52148)
scaffold0011 (11-250)||(167861-168099)
scaffold0011 (30-79)||(38204-38253)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (11-253)||(1851-2093)
[»] chr7 (82 HSPs)
chr7 (11-253)||(9509189-9509431)
chr7 (11-246)||(12698831-12699067)
chr7 (14-226)||(18456319-18456530)
chr7 (14-242)||(3564254-3564482)
chr7 (11-246)||(38227481-38227715)
chr7 (11-250)||(26211995-26212235)
chr7 (11-246)||(10589039-10589273)
chr7 (11-247)||(16386132-16386369)
chr7 (14-193)||(16213684-16213861)
chr7 (13-246)||(40443393-40443624)
chr7 (14-177)||(24702238-24702400)
chr7 (11-177)||(18430709-18430874)
chr7 (14-226)||(48273392-48273594)
chr7 (14-177)||(456321-456483)
chr7 (14-177)||(11972496-11972658)
chr7 (14-177)||(14949122-14949284)
chr7 (14-177)||(15376713-15376875)
chr7 (14-177)||(16232520-16232682)
chr7 (14-177)||(18640272-18640434)
chr7 (14-177)||(20385123-20385285)
chr7 (14-177)||(21189595-21189757)
chr7 (14-177)||(32125491-32125653)
chr7 (14-177)||(41522917-41523079)
chr7 (14-177)||(41525379-41525541)
chr7 (14-177)||(44116509-44116671)
chr7 (15-177)||(11393287-11393448)
chr7 (11-177)||(13647325-13647491)
chr7 (26-244)||(15143925-15144143)
chr7 (14-177)||(27216860-27217022)
chr7 (18-164)||(24275175-24275320)
chr7 (14-175)||(16410059-16410219)
chr7 (11-217)||(2280033-2280238)
chr7 (14-177)||(24704688-24704847)
chr7 (14-177)||(3386333-3386495)
chr7 (11-246)||(27847719-27847951)
chr7 (14-226)||(17061866-17062077)
chr7 (14-140)||(13831373-13831498)
chr7 (15-180)||(14932685-14932851)
chr7 (15-180)||(15356120-15356286)
chr7 (15-180)||(15360234-15360400)
chr7 (14-194)||(20110556-20110724)
chr7 (14-122)||(13869346-13869453)
chr7 (18-177)||(38898376-38898535)
chr7 (30-226)||(12756622-12756817)
chr7 (11-130)||(67745-67864)
chr7 (11-130)||(22072913-22073033)
chr7 (11-187)||(15211456-15211633)
chr7 (14-177)||(26355983-26356156)
chr7 (14-177)||(26358435-26358608)
chr7 (11-226)||(19486649-19486865)
chr7 (26-232)||(1867895-1868101)
chr7 (11-126)||(34200786-34200901)
chr7 (11-134)||(47831807-47831930)
chr7 (11-109)||(28505321-28505419)
chr7 (15-137)||(18005650-18005772)
chr7 (11-134)||(16219715-16219835)
chr7 (34-232)||(15008398-15008597)
chr7 (15-134)||(811129-811248)
chr7 (33-193)||(12255730-12255892)
chr7 (11-126)||(16495402-16495517)
chr7 (15-189)||(17138006-17138177)
chr7 (60-141)||(2530129-2530208)
chr7 (26-130)||(16056343-16056446)
chr7 (15-124)||(44014182-44014291)
chr7 (15-188)||(12187019-12187189)
chr7 (17-100)||(18154873-18154956)
chr7 (11-108)||(11996051-11996148)
chr7 (11-126)||(15754893-15755008)
chr7 (29-214)||(10063740-10063921)
chr7 (26-88)||(12901338-12901401)
chr7 (12-161)||(2832413-2832561)
chr7 (15-100)||(19649521-19649606)
chr7 (26-81)||(14044761-14044817)
chr7 (26-81)||(14354791-14354847)
chr7 (38-188)||(12321685-12321835)
chr7 (99-194)||(15113031-15113125)
chr7 (99-194)||(15116568-15116662)
chr7 (30-81)||(18203831-18203882)
chr7 (30-193)||(20220129-20220290)
chr7 (38-74)||(9446216-9446252)
chr7 (38-74)||(20569654-20569690)
chr7 (37-88)||(48991206-48991258)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (11-253)||(44052829-44053071)
chr4 (11-246)||(12902757-12902992)
chr4 (11-246)||(7893703-7893935)
chr4 (11-250)||(7088877-7089116)
chr4 (11-246)||(16239856-16240090)
chr4 (13-246)||(22636437-22636669)
chr4 (11-228)||(16270140-16270356)
chr4 (16-242)||(14038653-14038879)
chr4 (14-242)||(16377413-16377639)
chr4 (11-195)||(7798774-7798958)
chr4 (18-250)||(23374241-23374473)
chr4 (11-183)||(6899891-6900062)
chr4 (14-226)||(44928829-44929042)
chr4 (14-226)||(14280316-14280518)
chr4 (11-136)||(52873363-52873488)
chr4 (14-226)||(54798669-54798872)
chr4 (14-177)||(18215274-18215436)
chr4 (12-177)||(19618172-19618336)
chr4 (14-177)||(12307-12469)
chr4 (14-193)||(1837494-1837671)
chr4 (14-177)||(15118352-15118514)
chr4 (14-177)||(52312510-52312672)
chr4 (8-177)||(19242693-19242861)
chr4 (14-177)||(3515007-3515169)
chr4 (14-177)||(23803265-23803427)
chr4 (14-177)||(44615288-44615450)
chr4 (14-177)||(44773087-44773249)
chr4 (14-177)||(50222339-50222501)
chr4 (11-246)||(14053188-14053422)
chr4 (11-246)||(17046487-17046719)
chr4 (14-177)||(18239419-18239581)
chr4 (14-177)||(51463868-51464030)
chr4 (14-226)||(44102214-44102425)
chr4 (18-177)||(15355324-15355483)
chr4 (12-177)||(14970707-14970871)
chr4 (14-177)||(12610950-12611105)
chr4 (14-177)||(7641192-7641344)
chr4 (30-193)||(13790-13953)
chr4 (26-226)||(52243099-52243302)
chr4 (14-157)||(8574844-8574985)
chr4 (11-226)||(15367690-15367905)
chr4 (11-226)||(15402703-15402918)
chr4 (11-97)||(3096293-3096379)
chr4 (11-226)||(15371202-15371417)
chr4 (11-226)||(15373483-15373698)
chr4 (30-175)||(21815587-21815731)
chr4 (13-177)||(22353835-22353999)
chr4 (26-193)||(43198492-43198661)
chr4 (126-240)||(3096759-3096872)
chr4 (11-226)||(15370018-15370232)
chr4 (30-250)||(6190481-6190701)
chr4 (11-226)||(16223532-16223747)
chr4 (149-246)||(17047958-17048055)
chr4 (17-177)||(20149832-20149992)
chr4 (11-134)||(39706286-39706409)
chr4 (60-186)||(43256106-43256230)
chr4 (11-82)||(15551817-15551889)
chr4 (26-129)||(12288211-12288316)
chr4 (15-87)||(12774011-12774084)
chr4 (15-195)||(15093775-15093955)
chr4 (15-188)||(15121747-15121917)
chr4 (15-87)||(8846360-8846433)
chr4 (15-178)||(16356905-16357068)
chr4 (15-186)||(16488023-16488194)
chr4 (30-193)||(46640395-46640558)
chr4 (15-178)||(16348617-16348780)
chr4 (93-175)||(15464888-15464970)
chr4 (32-81)||(17333298-17333347)
chr4 (30-193)||(53082091-53082254)
chr4 (175-226)||(8574784-8574836)
chr4 (208-242)||(15091093-15091127)
chr4 (12-74)||(20157517-20157579)
chr4 (38-74)||(11250619-11250655)
chr4 (15-79)||(12570014-12570078)
chr4 (38-74)||(15353365-15353401)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (14-242)||(22886-23113)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (11-246)||(38761-38995)
scaffold0145 (11-228)||(32942-33158)
scaffold0145 (9-177)||(9744-9912)
[»] chr6 (81 HSPs)
chr6 (11-250)||(17287678-17287917)
chr6 (11-253)||(20638162-20638404)
chr6 (11-246)||(20360846-20361081)
chr6 (11-242)||(29060540-29060771)
chr6 (11-243)||(22780116-22780348)
chr6 (12-255)||(18409704-18409947)
chr6 (11-242)||(25629245-25629476)
chr6 (11-238)||(19303435-19303661)
chr6 (11-242)||(20593773-20594004)
chr6 (11-178)||(16496244-16496411)
chr6 (11-178)||(20076700-20076863)
chr6 (14-177)||(2291180-2291342)
chr6 (14-177)||(12742317-12742479)
chr6 (14-177)||(18334592-18334754)
chr6 (14-177)||(19005046-19005208)
chr6 (14-177)||(19858919-19859081)
chr6 (14-177)||(22782227-22782389)
chr6 (14-177)||(24422547-24422709)
chr6 (14-177)||(33861794-33861956)
chr6 (14-177)||(33864278-33864440)
chr6 (12-177)||(30676710-30676874)
chr6 (14-177)||(1595549-1595711)
chr6 (14-177)||(8055029-8055191)
chr6 (14-177)||(25754809-25754971)
chr6 (14-177)||(26924640-26924802)
chr6 (12-177)||(34963371-34963535)
chr6 (14-177)||(25656629-25656791)
chr6 (14-177)||(1540911-1541073)
chr6 (14-177)||(25688502-25688664)
chr6 (30-226)||(18456735-18456930)
chr6 (26-232)||(25644335-25644543)
chr6 (14-177)||(3852017-3852179)
chr6 (11-246)||(16920519-16920751)
chr6 (11-186)||(35245586-35245758)
chr6 (17-177)||(16448526-16448686)
chr6 (14-177)||(20556894-20557054)
chr6 (11-250)||(25603267-25603506)
chr6 (11-193)||(20109140-20109322)
chr6 (30-164)||(18461895-18462028)
chr6 (11-246)||(22831503-22831737)
chr6 (38-242)||(15041441-15041644)
chr6 (30-195)||(18821782-18821946)
chr6 (13-177)||(19847949-19848114)
chr6 (11-250)||(25611605-25611844)
chr6 (13-165)||(23992429-23992578)
chr6 (11-226)||(8227416-8227632)
chr6 (11-87)||(27333262-27333339)
chr6 (11-87)||(27394002-27394079)
chr6 (11-72)||(25714417-25714478)
chr6 (30-246)||(11185524-11185737)
chr6 (11-130)||(23019408-23019525)
chr6 (60-186)||(27415887-27416011)
chr6 (11-126)||(28496477-28496592)
chr6 (11-126)||(29808888-29809003)
chr6 (15-160)||(21766695-21766839)
chr6 (26-126)||(9098518-9098620)
chr6 (15-130)||(19652199-19652313)
chr6 (26-129)||(19668386-19668491)
chr6 (11-126)||(1561303-1561418)
chr6 (32-88)||(33443068-33443124)
chr6 (11-58)||(22080799-22080846)
chr6 (15-184)||(18907111-18907280)
chr6 (25-82)||(4185870-4185928)
chr6 (15-100)||(19873120-19873205)
chr6 (15-100)||(22432249-22432334)
chr6 (15-100)||(22438799-22438884)
chr6 (30-193)||(23076749-23076913)
chr6 (15-195)||(25642120-25642304)
chr6 (15-76)||(19862978-19863039)
chr6 (193-241)||(5834388-5834436)
chr6 (101-233)||(16965210-16965341)
chr6 (8-52)||(19008799-19008843)
chr6 (193-241)||(20177096-20177144)
chr6 (193-241)||(22158847-22158895)
chr6 (30-81)||(35008167-35008219)
chr6 (25-82)||(4186381-4186439)
chr6 (34-79)||(16493169-16493214)
chr6 (30-79)||(18453201-18453250)
chr6 (15-79)||(15894491-15894555)
chr6 (119-178)||(18180596-18180656)
chr6 (38-74)||(19790837-19790873)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (12-242)||(50210103-50210333)
chr1 (11-250)||(27250611-27250850)
chr1 (14-242)||(34509783-34510011)
chr1 (11-242)||(22532269-22532500)
chr1 (11-250)||(21026680-21026919)
chr1 (12-244)||(20135188-20135420)
chr1 (12-225)||(22468604-22468816)
chr1 (88-246)||(22354458-22354616)
chr1 (14-193)||(23593719-23593897)
chr1 (14-226)||(433012-433222)
chr1 (14-177)||(13988866-13989028)
chr1 (14-177)||(21923291-21923453)
chr1 (14-177)||(29776688-29776850)
chr1 (13-177)||(21840766-21840929)
chr1 (14-177)||(21475087-21475249)
chr1 (14-177)||(31612313-31612475)
chr1 (12-193)||(16361915-16362095)
chr1 (123-253)||(22356053-22356184)
chr1 (123-253)||(22357739-22357870)
chr1 (14-177)||(29298137-29298298)
chr1 (11-177)||(45574842-45575008)
chr1 (11-217)||(13212821-13213027)
chr1 (14-177)||(16275363-16275526)
chr1 (14-214)||(21346961-21347161)
chr1 (11-246)||(38801277-38801508)
chr1 (8-214)||(21342090-21342296)
chr1 (8-122)||(15860064-15860177)
chr1 (14-177)||(22123067-22123230)
chr1 (14-177)||(21707167-21707329)
chr1 (14-177)||(21711709-21711871)
chr1 (11-111)||(20847175-20847275)
chr1 (30-193)||(21896195-21896358)
chr1 (30-192)||(21861510-21861672)
chr1 (149-227)||(48603652-48603730)
chr1 (17-177)||(40389157-40389317)
chr1 (15-195)||(21787979-21788159)
chr1 (60-186)||(33797570-33797694)
chr1 (12-79)||(20454606-20454673)
chr1 (26-232)||(16758664-16758872)
chr1 (11-193)||(33681010-33681188)
chr1 (30-220)||(35260992-35261180)
chr1 (15-137)||(22921864-22921986)
chr1 (25-130)||(21754059-21754163)
chr1 (15-100)||(21714546-21714631)
chr1 (11-137)||(22237630-22237753)
chr1 (30-193)||(50614055-50614219)
chr1 (30-193)||(50621883-50622047)
chr1 (11-126)||(14295557-14295672)
chr1 (27-126)||(20918620-20918719)
chr1 (15-126)||(20248283-20248394)
chr1 (30-178)||(41049990-41050138)
chr1 (26-87)||(52928014-52928076)
chr1 (30-130)||(16368287-16368388)
chr1 (12-74)||(24783150-24783212)
chr1 (191-250)||(20847101-20847161)
chr1 (15-79)||(42865266-42865330)
chr1 (148-226)||(21477653-21477732)
chr1 (30-81)||(21533923-21533974)
chr1 (27-79)||(20958124-20958176)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (11-242)||(3041-3271)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (11-246)||(3470-3705)
scaffold0292 (11-242)||(343-573)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (11-241)||(8424-8650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (11-253)||(6000-6245)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (11-250)||(25896-26134)
scaffold0026 (11-250)||(39858-40096)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (11-242)||(39913-40143)
scaffold0080 (30-130)||(19885-19987)
scaffold0080 (38-190)||(18597-18749)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (11-246)||(8479-8710)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (29-253)||(24180-24406)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (13-242)||(39479-39707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (13-242)||(75105-75333)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (11-250)||(931-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (11-242)||(4508-4738)
scaffold0228 (11-242)||(12090-12320)
scaffold0228 (11-242)||(22042-22272)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (12-242)||(17105-17337)
scaffold0056 (30-226)||(79235-79430)
scaffold0056 (15-79)||(14139-14203)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (18-242)||(25955-26179)
scaffold0122 (14-157)||(44682-44825)
scaffold0122 (148-242)||(33385-33479)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (11-242)||(16490-16721)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (11-250)||(4849-5088)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (63-241)||(13144-13322)
scaffold0175 (11-86)||(34123-34199)
scaffold0175 (11-67)||(273-329)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (11-246)||(20910-21146)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (14-242)||(339840-340065)
scaffold0003 (14-177)||(158450-158612)
scaffold0003 (60-186)||(71350-71474)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (12-215)||(3103-3306)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (11-246)||(32067-32299)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (11-246)||(1952-2187)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (11-246)||(13497-13730)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (11-228)||(32863-33077)
scaffold0120 (11-228)||(45928-46142)
scaffold0120 (11-222)||(16113-16323)
scaffold0120 (11-72)||(17389-17450)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (11-246)||(15351-15584)
scaffold0114 (15-188)||(7295-7465)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (11-246)||(4712-4946)
scaffold0358 (76-246)||(1-170)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (11-246)||(10312-10544)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (101-253)||(124675-124827)
scaffold0021 (12-189)||(174767-174943)
scaffold0021 (11-80)||(121766-121835)
scaffold0021 (30-129)||(136370-136471)
scaffold0021 (30-129)||(145078-145179)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (74-237)||(3424-3588)
scaffold0327 (15-160)||(289-434)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (11-141)||(28414-28544)
scaffold0046 (11-126)||(11292-11407)
scaffold0046 (11-126)||(1997-2112)
scaffold0046 (11-64)||(4552-4605)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (93-242)||(27912-28061)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (14-177)||(4694-4856)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (14-226)||(16784-16995)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (14-177)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (14-177)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (14-177)||(94411-94573)
scaffold0023 (18-177)||(17440-17598)
scaffold0023 (14-174)||(44454-44614)
scaffold0023 (15-218)||(38394-38596)
scaffold0023 (15-138)||(100378-100501)
scaffold0023 (11-82)||(119875-119947)
scaffold0023 (15-137)||(40169-40291)
scaffold0023 (88-218)||(23581-23710)
scaffold0023 (15-87)||(101503-101576)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (18-177)||(501088-501246)
scaffold0001 (14-217)||(85539-85742)
scaffold0001 (15-137)||(160688-160809)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (11-246)||(16282-16514)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (17-177)||(4300-4459)
scaffold0761 (15-160)||(6281-6425)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (13-177)||(10772-10935)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (32-242)||(4545-4754)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (14-177)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (14-177)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (14-177)||(136680-136842)
scaffold0028 (14-177)||(139149-139311)
scaffold0028 (14-177)||(144087-144249)
scaffold0028 (14-177)||(134211-134373)
scaffold0028 (14-177)||(141618-141780)
scaffold0028 (29-137)||(62216-62321)
scaffold0028 (15-97)||(132662-132745)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (11-246)||(938-1170)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (70-246)||(6669-6845)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (14-177)||(106-268)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (14-177)||(82072-82234)
scaffold0037 (26-193)||(22610-22776)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (11-178)||(128751-128917)
scaffold0031 (30-229)||(20328-20524)
scaffold0031 (15-100)||(65830-65915)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (11-246)||(1289-1521)
scaffold0106 (11-246)||(7266-7498)
scaffold0106 (14-79)||(15291-15356)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (12-177)||(11286-11450)
scaffold0029 (15-188)||(12763-12933)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (13-177)||(9241-9404)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (14-177)||(40400-40562)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (70-242)||(853-1021)
scaffold0395 (11-77)||(4888-4954)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (12-177)||(12249-12413)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-221)||(46995-47202)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (11-246)||(51582-51814)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (14-217)||(2088-2291)
scaffold0247 (11-226)||(17932-18148)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (14-217)||(161049-161252)
scaffold0007 (94-217)||(164550-164674)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (14-177)||(4214-4377)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (14-177)||(12064-12220)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (14-177)||(29931-30094)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (26-193)||(8481-8650)
scaffold0621 (11-137)||(6535-6661)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (14-157)||(116430-116571)
scaffold0022 (30-193)||(128909-129072)
scaffold0022 (34-130)||(78345-78442)
scaffold0022 (175-226)||(116579-116631)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (11-133)||(11442-11564)
scaffold0235 (195-246)||(11399-11450)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (26-217)||(16014-16206)
scaffold0357 (30-217)||(13147-13336)
scaffold0357 (30-81)||(2680-2732)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (14-193)||(38641-38820)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (26-217)||(27663-27855)
scaffold0165 (170-246)||(3640-3716)
scaffold0165 (170-246)||(7704-7780)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (17-177)||(1280-1440)
scaffold0101 (15-219)||(8871-9080)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (30-193)||(53488-53651)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (14-246)||(5017-5246)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (149-246)||(1052-1149)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (30-250)||(51766-51985)
scaffold0034 (11-130)||(32538-32654)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (15-176)||(29558-29720)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (30-232)||(60614-60818)
scaffold0010 (25-193)||(129919-130086)
scaffold0010 (30-78)||(666-714)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (11-193)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (11-193)||(38195-38377)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (14-126)||(15664-15776)
scaffold0261 (15-100)||(1339-1424)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (26-193)||(10481-10647)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (11-134)||(6121-6244)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (32-193)||(7998-8161)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (15-137)||(19268-19390)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (171-242)||(10323-10394)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (11-87)||(6611-6688)
scaffold0333 (11-87)||(13991-14068)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (38-218)||(16264-16442)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (11-87)||(15821-15898)
scaffold0020 (15-78)||(178898-178961)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (30-193)||(12587-12749)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (60-186)||(15362-15486)
scaffold0107 (30-79)||(36199-36248)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (15-137)||(2801-2923)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (15-137)||(14692-14814)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (15-218)||(26828-27027)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (15-218)||(23843-24048)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (25-137)||(5657-5769)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (11-82)||(1083-1155)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (15-195)||(4741-4921)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (15-193)||(133-310)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (11-187)||(192920-193098)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (15-218)||(21721-21920)
scaffold0210 (15-218)||(29613-29812)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (38-180)||(29117-29262)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (15-87)||(1086-1159)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (15-182)||(1881-2045)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (30-137)||(1051-1158)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (190-246)||(17873-17929)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (11-126)||(1075-1190)
scaffold0184 (38-74)||(4284-4320)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (15-193)||(45732-45909)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (68-193)||(225465-225588)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (11-134)||(12766-12889)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (15-82)||(2694-2762)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (15-87)||(28813-28887)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (26-226)||(25121-25321)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (11-87)||(23927-24001)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (26-87)||(8118-8180)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (11-134)||(12942-13062)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (15-100)||(36454-36539)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (26-130)||(10542-10646)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (203-251)||(20595-20643)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (25-87)||(6826-6889)
scaffold0556 (86-130)||(8090-8134)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (30-93)||(11982-12044)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (30-178)||(6237-6386)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (30-193)||(97024-97188)
scaffold0006 (30-193)||(106302-106466)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (102-190)||(1169-1257)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (34-164)||(38339-38470)
scaffold0139 (15-100)||(19980-20065)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (15-178)||(1830-1993)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (15-109)||(32102-32197)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (26-129)||(103632-103737)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (15-188)||(159-333)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (15-161)||(897-1042)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (15-218)||(69794-70000)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (30-129)||(569-669)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (32-81)||(206575-206624)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (15-79)||(10575-10639)
scaffold0297 (15-75)||(15736-15796)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (15-178)||(44081-44244)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (38-188)||(46670-46820)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (99-164)||(13092-13157)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (15-79)||(6095-6159)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (38-161)||(2056-2178)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (15-188)||(17054-17228)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (30-88)||(2694-2753)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (38-76)||(4999-5037)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (30-130)||(267679-267781)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (68-137)||(2213-2281)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (30-79)||(7450-7499)
scaffold0111 (30-79)||(14569-14618)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (38-74)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (30-78)||(3276-3324)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (15-79)||(14664-14728)
scaffold0081 (15-79)||(23679-23743)
scaffold0081 (15-79)||(39103-39167)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (15-79)||(18236-18300)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (30-78)||(30350-30398)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 80)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421771
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25421631  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25421632 attgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25421731  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25421732 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25421771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431633
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25431493  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25431494 attgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25431593  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25431594 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25431633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390375
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23390518  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23390517 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 23390418  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23390417 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 23390375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493803
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagctt 24493767  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493768 cacagattataattaacatcattattaagtcttaat 24493803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286728
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa-caacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatc 8286865  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286864 aattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 8286765  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286764 tcacataatataattaacatcttcattaagtcttaat 8286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078183
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 9078051  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078052 agtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9078151  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078152 cacagattataattaacatcatcattaagtct 9078183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529449
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  214 agattataattaacatcatcattaagt 240  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatcattaagt 24529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025545
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13025509  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025510 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13025545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095729
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13095693  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095694 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13095729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075258
Alignment:
Q  11 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatc 22075117  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22075118 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 22075217  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22075218 tcacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 22075258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096698
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatca 1096566  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1096567 aatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 1096666  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1096667 cataggttataattaacatcctcattaagtct 1096698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21808411  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808410 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292856
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  111 --attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 208  Q
      |||  || ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| |    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaac 21292894  T
Q  209 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 21292856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729018
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 21729018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T
Q  214 agattataattaa 226  Q
    |||||||||||||    
T  22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732941
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 176  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 10732941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581151
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 212  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaa-tcatcataaatcaacttca 11581165  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    |||||||| |||||    
T  11581164 cagattatcattaa 11581151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 226
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418793
Alignment:
Q  21 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagt 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||| |    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcatttgcaatt 18418687  T
Q  120 caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagatt 218  Q
    || ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||    
T  18418688 ca-caacatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggtt 18418785  T
Q  219 ataattaa 226  Q
    ||||||||    
T  18418786 ataattaa 18418793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 21997556  T
Q  111 attgcaagt 119  Q
    | |||||||    
T  21997555 aatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154783
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 36154783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245298
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| ||  || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 39245298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902008
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 20902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154613
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 2154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  117 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144271
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaac 227  Q
    || ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||  ||||||| |||| |||||||| | || |||||     
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaat 22144266  T
Q  228 atcat 232  Q
    |||||    
T  22144267 atcat 22144271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061231
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||| | | || ||||||   ||| || || |||||||||||| |||||||||||    
T  31061167 gcaagtcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcaca 31061231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20917952
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||      
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaa-- 20918014  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
      ||||||||||| ||| || ||||||  | || ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  20918013 --aagtcaacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcaca 20917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067270
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  117 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24067209 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 24067270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517168
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 165  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 17517168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  114 gcaagtcaa 122  Q
    |||||||||    
T  38619533 gcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 122
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  115 caagtcaa 122  Q
    ||||||||    
T  23064611 caagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 148 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22107357 - 22107259
Alignment:
Q  148 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22107357 ttcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 22107259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986037
Alignment:
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 214  Q
    ||||||||||||||||| | |||  | | |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  215 gattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21986064 aattatagttaacatcatcatcaagtct 21986037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329541
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356488
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||   | |||||||||    
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgc 18356461  T
Q  160 atataacattatatcacatcataatca 186  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||    
T  18356462 ataaaacattatatcacattataatca 18356488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565723
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 21873254 - 21873453
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | || |||||| | |||||||||||      
T  21873254 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatct 21873353  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 214  Q
    ||  |   |||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||    
T  21873354 cattt---caacatcttaaccattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcaca 21873449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502154
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||| |||| ||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | ||||||||| || |||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaa 21502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 218
Target Start/End: Original strand, 37723922 - 37724108
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||| |  || ||| ||||||    
T  37723922 cttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaaattcatcaacat 37724018  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-atataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 218  Q
    || ||  ||||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||  ||||  ||  |||||||||||||||||    
T  37724019 ctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaaacattatatcacatcatattcaacactaacatctc-aaaacagcttcacagatt 37724108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660879
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |   ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaaca 20026944  T
Q  128 tc 129  Q
    ||    
T  20026943 tc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726069
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaag-catcatgatataataatatc 40725951  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 40726051  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  40726052 ttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910745
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 158  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||||    
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaacattcaaataattctt-aagtaatg 20910773  T
Q  159 catataacattatatcacatcataatca 186  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20910772 cataaaacattatatcacattataatca 20910745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011988
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatc 26012058  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 180  Q
    || ||  | |||||||||||| ||| | ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatca 26011988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959576
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18769947
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 18770021  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaaca 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  18770020 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 18769947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032492
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||  ||||| ||| |||||     
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaaaca-atcatg--ataattataccaatt- 22032418  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaaca 189  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  22032419 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 22032492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 77 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766035
Alignment:
Q  77 cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 176  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||  ||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtacgac 20766086  T
Q  177 atcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20766085 atcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 20766035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc 68  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704160
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26704160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973893
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 23572084 - 23572254
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  23572084 catcatcttaatcatcttatatggactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 23572181  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 188  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  23572182 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 23572254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19668975
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 19668975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  27 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 80  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||| |   ||||| || | |||||||| ||||| |||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 22178224  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 191  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||    
T  22178223 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20766974 - 20767136
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    |||| |||||||| |  | ||||||||||||     
T  20766974 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcaaatcacaacaacaacataagttcataatatcaatt- 20767072  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
      | ||||||||||||  |  ||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  20767073 -cattcaacaacatctagatcattcaataacatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 20767136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20805552 - 20805714
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||| || |  | ||||||||||||     
T  20805552 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaagaacaaaataatttcataatatcaatt- 20805650  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
      | ||||||||||||  |  ||||||| | | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  20805651 -cattcaacaacatctagatcattcaataacatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 20805714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 23469822 - 23469871
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  23469822 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 23469871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 130
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448123
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 29448123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 23501472 - 23501402
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca 85  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  23501472 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcacaggcagaataca 23501402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21328317 - 21328268
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||    
T  21328317 cttagaccgactcatgcagcttaattaatagacagcagcaacataggcag 21328268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21731559 - 21731514
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  21731559 gaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 21731514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 21809679 - 21809634
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  21809679 gaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 21809634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 23201360 - 23201445
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  23201360 catcatcttgttcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 23201445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 14079149 - 14079213
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| | | | ||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14079149 catcatcttaatcatcttatatcaattcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggcag 14079213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 23512098 - 23512162
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||| ||| |||| |  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23512098 catcatcttattcatcttataatgactcatgcactttagttaaataacaatagcagcataggcag 23512162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 26680605 - 26680641
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26680605 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26680641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 26952212 - 26952248
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26952212 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26952248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13453
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 13310  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13311 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13410  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13411 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 13453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 75)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060742
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23060612  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060613 attgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23060712  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23060713 caca-attataattaacatcatcattaagtc 23060742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076666
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 23076541  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23076542 attgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagctt 23076641  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23076642 cacagattataattaacatcatcat 23076666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731120
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22731256  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731255 attgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22731156  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22731155 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22731120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738066
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22738202  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738201 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22738102  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22738101 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22738066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286096
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatca 23285960  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 23286060  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286061 cacagattataattaacatcttcattaagtcttaat 23286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337350
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatca 22337214  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  22337215 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaactt 22337314  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337315 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaat 22337350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654268
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23654307 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 23654268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660253
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatca 23660121  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23660221  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660222 tacaaattataattaacatcatcaataagtct 23660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298696
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||    
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 212  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  213 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 298696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38002
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38137  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||| | | ||| || |||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||    
T  38136 atttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagctt 38038  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaat 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309340
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 20309303  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20309304 tcacagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 20309340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  117 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708518
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 208  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagc 23708542  T
Q  209 ttcacagattataattaacatcat 232  Q
    ||||||||| || ||||| |||||    
T  23708541 ttcacagatcatcattaatatcat 23708518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135752
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 23135752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaa-tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  116 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029854
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcaca 45029854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgca-acagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529528
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| |||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 24529528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||| | ||||| ||||||||||||| |    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 18 - 165
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616339
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 165  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 25616339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 166 - 253
Target Start/End: Original strand, 27753730 - 27753817
Alignment:
Q  166 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753730 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 27753817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672043
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19671928  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 208  Q
     |  |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| || | ||||    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatc-tcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaa-tcatcatagatcagc 19672025  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||| |||||    
T  19672026 ttcacagattatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103348
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-atataacattatatcacatca 180  Q
    | | ||| ||| |||||||| ||  ||||| | ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgcaattaaacattatatcacatca 23103348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451811
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||   | | |||||||||||| ||| |||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacattaacatcccat-aacagcttcacaaattgtaattaa 32451835  T
Q  227 catcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  32451834 tatcatattcaagtcttaatgcta 32451811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22799243 - 22799063
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  22799243 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaattt 22799144  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22799143 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 22799063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019643
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||||||||| | ||||||||||||     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 23019643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7687
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  7736 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacat 7687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 88
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946734
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679751
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaa-t 7679686  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatc 179  Q
    | |||||| ||||||| |||| | ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatc 7679751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 17 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643036
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-tcagtatacaaaaaca 24643036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175976
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520092
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||| | |||| |   ||||| |||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaat-gcaaatcaacaaca 20520197  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| ||| || ||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| || | | |||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  20520196 tctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcattaa 20520098  T
Q  227 catcat 232  Q
     |||||    
T  20520097 tatcat 20520092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134251
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071972
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622123
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattatatcaatt 40622230  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaata-----ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacag 207  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||     | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | |||||    
T  40622229 -caattcatcaacatcttatgtatacagtacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacag 40622134  T
Q  208 cttcacagatt 218  Q
    |||||||||||    
T  40622133 cttcacagatt 40622123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786947
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa 18786947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207398
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgaca 23207395  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  23207396 tct 23207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 81
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  100 taataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25963832 - 25963669
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | ||||||||||||     
T  25963832 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 25963734  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25963733 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 25963669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413035
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataata--atatcaattgcaagtcaacaa 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |  ||||||| ||||| |||||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatatcaaatgcaaatcaacaa 22413141  T
Q  126 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataatt 224  Q
    ||||| ||    |||   ||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||    
T  22413140 catctcaa--catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattaacatt 22413043  T
Q  225 aacatcat 232  Q
    || |||||    
T  22413042 aatatcat 22413035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791456
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | ||| || |||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaaca 23791391  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| ||| |  |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||    
T  23791392 tctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 23791456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22741081 - 22740897
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||     |||| ||||||  |||||    
T  22741081 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 22740982  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22740981 aataaaaa--caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 22740897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004869
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| | |||| |   || || ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  23004867 tct 23004869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24697709 - 24697512
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtata-caaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  ||||| || |||| ||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  24697709 cttagaccgactcatgcaacatagttaataaacaaacaacaacgtaggcagtacatcaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 24697610  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| |||  ||||  || | |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||| ||  ||| ||| |||||||||||||| || |||||    
T  24697609 tctcaaac-ttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataaaatcatattatacagcttcacagatcatcattaa 24697512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Original strand, 23038048 - 23038116
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  23038048 tagacggactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 23038116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 107 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459500
Alignment:
Q  107 atcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 194  Q
    ||||| || |||||| |||||||| |||||||||  ||||  |||||||||| |||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaataacatcaac 22459500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 9241945 - 9241994
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||    
T  9241945 cttagaccgacacatgcagcttaatcaatttacaacagcaacataggcag 9241994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24655432 - 24655396
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655432 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 24655396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Original strand, 24869903 - 24869939
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24869903 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 24869939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25108958
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 81  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 25108958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 25961628 - 25961592
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25961628 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 25961592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 76)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818286
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 18818431  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818430 attgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 18818331  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18818330 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccta 18818286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923814
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatca 21923950  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21923949 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 21923850  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923849 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 21923814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536443
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 20536307  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  20536308 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaactt 20536407  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536408 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 20536443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406611
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23406478  T
Q  111 attgcaagtcaac--aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 208  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23406479 attgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaac 23406578  T
Q  209 ttcacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406579 ttcacatattataattaacatcctcattaagtc 23406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626966
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22626834  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 22626934  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626935 cacagattataattaacatcctcattaagtct 22626966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373001
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7372877  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372878 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc--------ttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 7372969  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7372970 cacagattataattaacatcctcattaagtct 7373001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648934
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 28648965  T
Q  212 acagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28648964 acatattataattaacatcatcattaagtct 28648934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918886
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 21919022  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21919021 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagct 21918923  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21918922 tcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaat 21918886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879116
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatca 18879258  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  18879257 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagctt 18879159  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18879158 cacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcc 18879116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 8 - 242
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759487
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 6759354  T
Q  108 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaaca 206  Q
    |||| |||||||   |||||||| || ||| || | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6759355 tcaaatgcaagt---caacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaaca 6759451  T
Q  207 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759452 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 6759487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648788
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctta 23648753  T
Q  212 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23648754 acagattataattaacatcatcattaggtcttaat 23648788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092231
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 16092364  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16092363 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaact 16092264  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092263 tcgcatattataattaacatcatccttaagtct 16092231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 237
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875291
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22875163  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 209  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagct 22875263  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcatta 237  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22875264 tcacagattataattaacatcaccatta 22875291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971490
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  31971356 attccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatctt 31971454  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 31971490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130884
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  111 attgc-aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    ||| | || ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagct 45130921  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 45130884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199532
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattcaaa--caacatgacataataatatc 16199668  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  16199667 aatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagct 16199569  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16199568 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 16199532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598399
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 212  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||| ||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagtttca 41598385  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    ||||| || |||||    
T  41598386 cagatcatcattaa 41598399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgac---ataataatatca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389353
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  210 tcacagattataattaacatcat 232  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395888
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21395906  T
Q  210 tcacagattataattaac 227  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21395905 tcacagattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790381
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||  |||||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21790399  T
Q  210 tcacagattataattaac 227  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21790398 tcacagattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678069
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 18678069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778697
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21778702  T
Q  210 tcaca 214  Q
    |||||    
T  21778701 tcaca 21778697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219918
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| |  |||||||||||||||||| |    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttca 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttca 26219904  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
     ||||||| |||||    
T  26219905 tagattatcattaa 26219918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224081
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||  |||| || || |||||||||||  |||||||||||    
T  26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcaca 26224081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121886
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 32121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290694
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 45290755  T
Q  118 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | ||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  45290754 gccaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcaca 45290694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225268
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||| ||||||  |||||||||||||||||| |    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 157  Q
     |||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855246
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataaga 19937076  T
Q  108 tcaattgcaagtcaa 122  Q
    |||| ||||||||||    
T  19937075 tcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13508188 - 13508024
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  13508188 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13508090  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13508089 tctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13508024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801333
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 226  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataa-caacatcaagtcatcgtaaatcagcttcacagatcatcattaa 19801333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 25363123 - 25363026
Alignment:
Q  149 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  25363123 tcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 25363026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520491
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 6520491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13597720 - 13597556
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  13597720 acttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 13597622  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13597621 tcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285716
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| |    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  114 gcaagtcaacaacatct 130  Q
    |||| ||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatct 21285716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 122
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  27 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||  | ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612018
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 17612133  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||   ||||||||  |||| |||| ||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattata---aacatcaaatcatcataaatcagc 17612036  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  17612035 ttcacagatcatcattaa 17612018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23776952 - 23776772
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| | || |||||| |  |||||||||||     
T  23776952 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaattt 23776853  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23776852 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaaca 23776772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141014
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatc 17141014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491092
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 108  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866280
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa-aacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  124 aacatc 129  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23760962 - 23760893
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 82  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23760962 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 23760893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116530
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37116465  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  37116466 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 37116530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 20466132 - 20465982
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  20466132 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 20466034  T
Q  138 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 188  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  20466033 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 20465982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673830
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 21673816  T
Q  124 aacatcttaaatat 137  Q
    ||||||| ||||||    
T  21673817 aacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355742
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 26355742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439423
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17439510  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcaca 214  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || |||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||    
T  17439509 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattatcaacattaaatcatattataacagcttcaca 17439423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249434
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 61  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255272
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 61  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 30643408 - 30643235
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | ||||||||||||     
T  30643408 catcatcttaatcatcttgaatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt- 30643310  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 188  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| |||| || |||||||||    
T  30643309 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcatattataatcaac 30643235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154883
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |  || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaaca 19154890  T
Q  128 tcttaaa 134  Q
     ||||||    
T  19154889 acttaaa 19154883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353140
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 24353137  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  24353138 tct 24353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266932
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | ||||     ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 17266997  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||  ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||    
T  17266996 tctcaaaca-tcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 17266932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 26223039 - 26222987
Alignment:
Q  175 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  26223039 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 26222987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353843
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataata-----atatc 109  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||     |||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 17353961  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg-catataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 208  Q
    || | ||||  | || ||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||  ||  ||||| || |||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||    
T  17353960 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgaaatcaaacatcatctcacatcatattcaacataaacatttcat-aacagc 17353862  T
Q  209 ttcacagattataattaac 227  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  17353861 ttcacagattacaattaac 17353843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20502203 - 20502154
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  20502203 cttagaccgactcatgcagcttaattaacatacaacagcaacataggcag 20502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 81
Target Start/End: Original strand, 22525579 - 22525628
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22525579 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacttaggcagta 22525628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17926822 - 17926659
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||   | || |||| ||| |  | | ||||||||||     
T  17926822 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcaaaacaacagcataatttcacaatatcaatt- 17926724  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  17926723 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 17926659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20533503 - 20533467
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20533503 gactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacata 20533467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 24755714 - 24755778
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  24755714 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 24755778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 28397569 - 28397617
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 78  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||    
T  28397569 cttagaccgactcatgcagcttaattaatagacaacaacaacataggca 28397617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442510
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13442373  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442374 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13442473  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442474 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 13442510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488098
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17487955  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17487956 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17488055  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488056 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17488098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499580
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17499437  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17499438 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17499537  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499538 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17499580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083247
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 23083383  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23083382 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagctt 23083283  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23083282 cacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaat 23083247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687117
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 26686986  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686987 attgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 26687086  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26687087 cacagattataattaacatcctcattaagtc 26687117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698315
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatca 20698457  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  20698456 attgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagctt 20698358  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698357 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatcc 20698315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841162
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 43841031  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43841032 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 43841131  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43841132 cacagattataattaacatcctcgttaagtc 43841162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576719
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14576840 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcacagattataatt 14576741  T
Q  225 aacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  14576740 aacatcatcattaaatcttaat 14576719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973085
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 14972953  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972954 aatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 14973053  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973054 catagattataattaacatcatcattaagtct 14973085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24153128  T
Q  214 agattataattaa 226  Q
    |||||||||||||    
T  24153127 agattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438765
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 18438633  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18438634 aatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagctt 18438733  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438734 cacagattatagttaacatcatcattaagtct 18438765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399448
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 12399308  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  12399309 aatgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagctt 12399408  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  12399409 cacagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgcta 12399448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 246
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572823
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatt 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14572702 acatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataatt 14572801  T
Q  225 aacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  14572802 aacatcatcattaagtcttaat 14572823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213611
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  214 agattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213639 agattataattaacatcatcattaagtct 40213611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476275
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 25476407  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25476406 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 25476307  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25476306 cacagattgtaattaacatcctcattaagtct 25476275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 29 - 232
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaac 227  Q
    || ||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  228 atcat 232  Q
    |||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424653
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataacaatatca 11424782  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    || |||| ||||||   ||| || ||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  11424781 atagcaaatcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagctt 11424685  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11424684 cacagattaaaattaacatcaacattaagtct 11424653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 30029841 - 30030078
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||| |||||||||| |||||||     
T  30029841 catcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcat 30029940  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  30029941 ttgcaattca-caacgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttc 30030039  T
Q  212 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  30030040 acatattatattaaacatcatcattaagtcttaaagcta 30030078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172567
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaa 29172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848611
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 28848611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469134
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcaca 6469134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  116 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070653
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 53070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550478
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatca 43550545  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  43550544 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 43550478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 16 - 177
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  116 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166739
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977640
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 140  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 15977640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 128
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  114 gcaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822419
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 165  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 46822419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119684
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 211  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| |  || |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  12119788 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 12119690  T
Q  212 acagat 217  Q
    ||||||    
T  12119689 acagat 12119684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  114 gcaagtcaa 122  Q
    |||||||||    
T  8499617 gcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 189
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511236
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat-aacattatatcacatcataatcaaca 189  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| || |||| | ||||||||| || ||||||    
T  12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgcacataaacaatgtatcacatcttattcaaca 12511236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 21618449 - 21618650
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21618449 tcatcttctcaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 21618546  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttca 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21618547 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttca 21618636  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
     ||||||| |||||    
T  21618637 tagattatcattaa 21618650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340628
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 24340646  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  24340645 ttcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  114 gcaagtcaa 122  Q
    |||||||||    
T  15412528 gcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165429
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||||||||| |||  ||||||||     
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 27165429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523633
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |   ||||| |||| |||||| | ||||| |||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaaca 52523732  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  52523731 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa-tcatcttataacagcttctcagatcatcattaa 52523633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 14179570 - 14179648
Alignment:
Q  149 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14179570 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301492
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||     
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  113 tgcaagtca-acaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacat 190  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| | | ||||  |||||||||||  |||| ||||||    
T  53301570 tgcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacat 53301492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 130
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557101
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatct 130  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  10557084 gcaagccaatcaacatct 10557101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 149 - 250
Target Start/End: Original strand, 16796685 - 16796786
Alignment:
Q  149 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 248  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  16796685 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatgc 16796784  T
Q  249 ta 250  Q
    ||    
T  16796785 ta 16796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494905
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274903
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaa-acagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| |||||||||  |||| ||||||||| | |||||  |||| ||||||| |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||| || |||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaatcatcataattcagcttcacagatcatcattaa 23274903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642170
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 37642188  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  37642187 ttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234610
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 14234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103960
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 111
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737335
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta---tacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||   ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210333
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | ||||| ||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097509
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||| | |||| |||||| | |    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 15470927 - 15471043
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  15470927 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 15471022  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatct 130  Q
     | ||||||||| ||||||||    
T  15471023 gaatgcaagtcatcaacatct 15471043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 75
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatag 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Original strand, 32307691 - 32307795
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  32307691 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 32307788  T
Q  124 aacatct 130  Q
    |||||||    
T  32307789 aacatct 32307795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856304
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 856237  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcata 182  Q
     ||| ||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||    
T  856238 -caattcaacaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatacata-aacattataatacatcata 856304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174303
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12174303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668120
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 49668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 93 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 192  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  193 a 193  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11298644 - 11298481
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||     
T  11298644 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt- 11298546  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  11298545 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 11298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9512997
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9512997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520972
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9520972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147431
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| ||  |||| |||| ||||    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacat-aaatcatcataaatcagc 22147449  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  22147448 ttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251168
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 37251171  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  37251170 tct 37251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926079
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 43926076  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  43926077 tct 43926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878083
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 1644780 - 1644718
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644780 atcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 134
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378046
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T
Q  128 tcttaaa 134  Q
     ||||||    
T  12378040 acttaaa 12378046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665460
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacata 14665460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110352
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagca 22110355  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  22110354 tct 22110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 81
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668702
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  ||||  || || | ||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagtataactttataatatcaa 14668653  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcat 161  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14668654 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcat 14668702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14878633 - 14878569
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878633 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 36166747 - 36166799
Alignment:
Q  175 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  36166747 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 36166799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606378
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 79  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag 606378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 78
Target Start/End: Original strand, 9577646 - 9577691
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 78  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  9577646 tagaccgactcatgcagcttatttatat-acaacagcaacataggca 9577691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Original strand, 15060284 - 15060349
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 80  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15060284 catcatcttattcatcttacaatgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15060349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 15246037 - 15246086
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  15246037 cttagaccgactcatgcagtttaattaatagacaacagcaacataggcag 15246086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 3390030 - 3389994
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390030 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 3389994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 15051509 - 15051573
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15051509 atcatcttattcatcttacaatgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagt 15051573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 17525275 - 17525211
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||| || |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  17525275 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggcag 17525211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 63  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52148
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 52012  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52013 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagctt 52112  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52113 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 52148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167861
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 168000  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  167999 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 167901  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  167900 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 167861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 38253 - 38204
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  38253 cttagaccgacacatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 38204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2093
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 1950  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1951 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 2050  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2051 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 2093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 82)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509431
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatca 9509288  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509289 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9509388  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9509389 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 9509431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699067
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatc 12698930  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698931 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 12699030  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12699031 tcacagattataattaacatcctcattaactcttaat 12699067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18456332  T
Q  214 agattataattaa 226  Q
    |||||||||||||    
T  18456331 agattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564254
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    | ||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
Q  214 agattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3564282 aggttataattaacatcatcattaagtct 3564254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227715
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatctt 38227679  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227680 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 38227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212235
Alignment:
Q  11 acatcatcat-cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||| ||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 26212094  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26212095 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagct 26212194  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26212195 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 26212235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589273
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatca 10589138  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  10589139 attgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 10589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 11 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386132
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||  |    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 16386170  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 247  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16386169 tcacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatg 16386132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213861
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataa-caacatcaa 16213861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443624
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  || |||||||||||||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 40443589  T
Q  212 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  40443590 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 40443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430874
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatca 18430807  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18430808 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273594
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 212  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatc-tcaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 48273580  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    |||||||| |||||    
T  48273581 cagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116671
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcaca 44116671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647491
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatca 13647424  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13647425 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143925
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||| || || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  126 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataatt 224  Q
    ||||| || ||| || | ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  225 aacatcatcattaagtctta 244  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtctta 15143925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 18 - 164
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 164  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 175
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410219
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 175  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatca 16410219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280033
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagc 208  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagc 2280042  T
Q  209 ttcacagat 217  Q
    |||||||||    
T  2280041 ttcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaa---gacataataatatcaaat 24704783  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386495
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcaca 3386495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847719
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||   ||  |||||||||| |||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtacaa---cagtatgacataattatatc 27847855  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  27847854 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 27847756  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  27847755 tcacagattatagttaatctcattattaagtcttaat 27847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061866
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||||     
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 211  Q
    ||||||||| |||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 17061881  T
Q  212 acagattataattaa 226  Q
    |||||| || |||||    
T  17061880 acagatcattattaa 17061866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 140
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831498
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 140  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 13831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932685
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  115 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 180  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 14932685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356120
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  115 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 180  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15356120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360234
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  115 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 180  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatca 15360234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 194
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110724
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 194  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaac 20110724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 122
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  114 gcaagtcaa 122  Q
    |||||||||    
T  13869445 gcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  118 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756622
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtc 12756719  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 226  Q
    | || ||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||| |||||||| || |||||    
T  12756718 tcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcatcacagatcatcattaa 12756622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67864
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 67843  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatct 130  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatct 67864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073033
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatct 130  Q
    || || |||||||||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatct 22073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Original strand, 15211456 - 15211633
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacaacatgacataataatat 108  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||    
T  15211456 acatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatat 15211555  T
Q  109 caattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa 187  Q
    || ||  || ||| |||||||| || |||||||| | ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15211556 catttataattca-caacatctcaattattcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatcaa 15211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26355983
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaaacaacatgacataat 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  104 aatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358435
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaaacaacatgacataat 103  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  104 aatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486649
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 19486667  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  19486666 ttcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| ||||||||| |||| | |||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacaatatcaat-gcaaatgaac 1868003  T
Q  124 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataat 223  Q
    ||||||| ||| || ||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||||| |||||||||||| || ||    
T  1868002 aacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatcat 1867904  T
Q  224 taacatcat 232  Q
    ||| |||||    
T  1867903 taatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200901
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831930
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | | | || ||||| |||| ||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 47831930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505321
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16219835 - 16219715
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  16219835 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 16219740  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | ||||||||| ||||||||||||    
T  16219739 gaatgcaagtcatcaacatcttaaa 16219715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008398
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||| |||| |   ||||| |||| ||||||||| |||| ||||||||| ||     
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaat-gcaaatcaacaacacctc 15008499  T
Q  132 aaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaacatc 230  Q
    ||| || ||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15008498 aaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatatc 15008400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811129
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
    ||||||||  |||||| ||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaa 811129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
Q  33 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaa--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| || || || ||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaat-caattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatc 12255794  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    | ||| |||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12255793 tcaaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495517
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaac 16495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138006
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 17138080  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaaca 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| ||||||    
T  17138079 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 17138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530129
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 141  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaa 2530129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056446
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  125 acatct 130  Q
    ||||||    
T  16056441 acatct 16056446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 124
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014291
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  114 gcaagtcaaca 124  Q
    |||| ||||||    
T  44014281 gcaaatcaaca 44014291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187189
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  |||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaattacaatcatg--ataattataccaatt 12187116  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 188  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  12187117 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 12187189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 17 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154873
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacat 18154873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996051
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 108  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754893
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | ||||| ||||||||    
T  15754909 gaatgcaaatcaacaac 15754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10063921 - 10063740
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||    
T  10063921 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacacaagtaaacaaca 10063823  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcaca 214  Q
    ||| |||||||||  |||| |||||      ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||    
T  10063822 tctcaaatattcacatataattcaa-----acatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcaca 10063740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 88
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901401
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 88  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 12901401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832413
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||    ||  ||||| || || | ||||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcccatcaacaatataactttataatatcaa 2832462  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcat 161  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2832461 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcat 2832413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649521
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||| |||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacat 19649521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044817
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 26 - 81
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354847
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 12321835 - 12321685
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  12321835 gactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 12321737  T
Q  138 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 188  Q
    || || ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  12321736 tccataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 12321685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113125
Alignment:
Q  99 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 194  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||  ||||  |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataattaacatcaac 15113125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 194
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116662
Alignment:
Q  99 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaac 194  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||  ||||  |||||||||  |||||  |||||||||||| ||||  |||||||||    
T  15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatc-tcaatattcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataaataacatcaac 15116662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 81  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220129
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| |||||   | |||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaaca 20220194  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| || | |||||||||    
T  20220193 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaa 20220129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 9446252 - 9446216
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446252 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 9446216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20569690 - 20569654
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569690 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 20569654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 88
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991258
Alignment:
Q  37 cgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 88  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa 48991258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053071
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 44052928  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44052929 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagctt 44053028  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053029 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 44053071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902992
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 12902856  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12902857 attgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 12902956  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12902957 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 12902992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893935
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7893802  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||    
T  7893803 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagctt 7893899  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7893900 cacagattataattaacatcatcgttaagtcttaat 7893935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089116
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7088976  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||    
T  7088977 attgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaactt 7089076  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7089077 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 7089116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239856
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16239892  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239891 cgcagattataattaacatcatcattaagtcttaat 16239856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 246
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636669
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 212  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttca 22636635  T
Q  213 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22636636 cagattataattaacatcctcgttaagtcttaat 22636669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270140
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16270158  T
Q  211 cacagattataattaaca 228  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16270157 cacagattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 16 - 242
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038879
Alignment:
Q  16 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgc 115  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  116 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacag 215  Q
    ||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
Q  216 attataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038853 attataattaatatcatcattaagtct 14038879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377413
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  214 agattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377441 agattataattaacatcatcattaagtct 16377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 195
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798958
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7798873  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  7798874 attgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaaca 7798958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374241
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  |||||||||||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 217  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
Q  218 tataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  23374273 tatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 23374241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900062
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatca 6899989  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataa 183  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataa 6900062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928829
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 212  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacataaaatcatcataaatcagcttca 44928843  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    ||||| || |||||    
T  44928842 cagatcatcattaa 44928829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280518
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 212  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | | ||| ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatatagattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 14280504  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    |||||||| |||||    
T  14280505 cagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 52873389  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaata 136  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  52873388 attgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798669
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttca 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttca 54798683  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    |||||||| |||||    
T  54798682 cagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837494
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataa-caacatcaa 1837494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 8 - 177
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataata 19242791  T
Q  108 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19242792 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053188
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacat-cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 208  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||   || ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggc 14053226  T
Q  209 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14053225 ttcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 14053188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046719
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||   |||||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatagaa---caacatgacataattatatc 17046583  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagct 17046682  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  17046683 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 17046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239419
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 18239419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102425
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 212  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 44102411  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    ||||| || |||||    
T  44102412 cagatcatcattaa 44102425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  118 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970707
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12611041  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12611042 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatcaaat 7641256  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7641255 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243099
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |   ||||| |||| |||||||| || || |||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaatcagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaac 52243203  T
Q  124 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataa 222  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| ||||||||||||||| || |    
T  52243202 aacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatca 52243103  T
Q  223 ttaa 226  Q
    ||||    
T  52243102 ttaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574844
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 157  Q
    | || |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367905
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15367788  T
Q  111 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15367789 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15367887  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15367888 ttcacagatcatcattaa 15367905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402918
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15402801  T
Q  111 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15402802 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15402900  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15402901 ttcacagatcatcattaa 15402918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatga 97  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371417
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15371300  T
Q  111 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
    | |||||||||| |||  ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15371301 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15371399  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15371400 ttcacagatcatcattaa 15371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373698
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15373581  T
Q  111 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
    | |||||||||| |||  ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15373582 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15373680  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15373681 ttcacagatcatcattaa 15373698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815587
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 175  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 21815587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |  ||||||||||||||| |||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | ||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaa--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||| |||  ||||| ||||  ||||||| |||||||||     
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaa-caattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcat 43198563  T
Q  123 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43198562 caatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 240
Target Start/End: Original strand, 3096759 - 3096872
Alignment:
Q  126 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataatta 225  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3096759 catcataaatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataatta 3096857  T
Q  226 acatcatcattaagt 240  Q
    || ||||||||||||    
T  3096858 acctcatcattaagt 3096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370232
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15370116  T
Q  111 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| | | |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  15370117 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagc 15370214  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  15370215 ttcacagatcatcattaa 15370232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190701
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| | |||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcata-atcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  || | |||||||||||  ||| |||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattagatcacatcatacatcaacattaacatctcat-aacagcttcacgaattgtaattaa 6190677  T
Q  227 catcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  6190678 tatcatattcaagtcttaatgcta 6190701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223747
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatct 16223630  T
Q  111 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||  |||| ||||||||   |||| |||| ||||    
T  16223631 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataa-caacatcacatcatcataaatcagc 16223729  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  16223730 ttcacagatcatcattaa 16223747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17048055 - 17047958
Alignment:
Q  149 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||   || |||||||||||||||    
T  17048055 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaat 17047958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149992
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  117 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  20149931 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 20149992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706286
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaa 39706286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256106
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 43256134  T
Q  159 catataacattatatcacatcataatca 186  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  43256133 catataatattatatcacattataatca 43256106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551889
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-aacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaac 12288217  T
Q  124 aacatc 129  Q
    ||||||    
T  12288216 aacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774084
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12774084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Original strand, 15093775 - 15093955
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||  ||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  15093775 catcatcttaatcatcttgtattgactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagcatgacttcataatatcaattt 15093874  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    ||  || ||||||| ||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15093875 catttctacaacatattaatcattcaataatatattaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaaca 15093955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15121917 - 15121747
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| | || |||||||||  ||||| || || ||||  ||||| |||||||||    
T  15121917 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatatcagcataggcagattacaacaataatcatg--ataattatatcaatt 15121820  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 188  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  15121819 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 15121747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846433
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16357068 - 16356905
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | ||||||||||||     
T  16357068 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 16356970  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    ||  || |||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16356969 catttccacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16356905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16488194 - 16488023
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||||| || ||| || | ||||||||||||     
T  16488194 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaatt- 16488096  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatca 186  Q
    |   ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||||||    
T  16488095 cttttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatca 16488023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640395
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| || || |||| ||||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataaca 46640459  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||    |||  |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||||| | |||||||||    
T  46640458 tctcaa--catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaa 46640395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16348780 - 16348617
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | ||||||||||||     
T  16348780 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 16348682  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    ||  || |||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16348681 catttccacaacatcttgataattcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16348617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15464970 - 15464888
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 175  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  15464970 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 81
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333347
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082091
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| | |||| |   ||||| |||| ||||||||  |||| |||| ||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaa-agcaaatcaataaca 53082156  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||    
T  53082155 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaa 53082091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8574836 - 8574784
Alignment:
Q  175 acatcataatcaacatcaacacat-cttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||    
T  8574836 acatcataatcaacatcaacacatcctaaaacagcttcatagattatcattaa 8574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 242
Target Start/End: Original strand, 15091093 - 15091127
Alignment:
Q  208 cttcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15091093 cttcacagattataattaacatcttcattaagtct 15091127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157517
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaatagcagcata 20157517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11250655 - 11250619
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250655 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 11250619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 12570014 - 12570078
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  12570014 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 12570078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 15353401 - 15353365
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353401 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 15353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23113
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
Q  214 agattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23085 agattataaataacatcatcattaagtct 23113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38995
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38859  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 38959  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 38995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33158
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 33040  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 33140  T
Q  211 cacagattataattaaca 228  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  33141 cacagattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 9 - 177
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9912
Alignment:
Q  9 ggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatat 9842  T
Q  109 caattgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  9843 caagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 81)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287678
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatca 17287818  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17287817 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagctt 17287718  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17287717 cacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 17287678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638162
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 20638305  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| | | ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638304 attgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20638205  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20638204 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcc 20638162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360846
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatca 20360982  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20360981 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 20360882  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20360881 cacatattataattaacctcatcattaagtcttaat 20360846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060771
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 29060639  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060640 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 29060739  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060740 cacagattataattaatatcatcattaagtct 29060771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 11 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780116
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatca 22780249  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780248 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22780149  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtctt 243  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780148 cacagattatgattaacatcatcattaagtctt 22780116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409704
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
     |||||||||||||||||| ||  || || | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18409748  T
Q  212 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 255  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18409747 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccta 18409704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629245
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatca 25629377  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629376 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 25629277  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629276 cacagattataattaacaacatcattaagtct 25629245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303435
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 19303563  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagctt 19303463  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaa 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303462 cacagattataattaacatcatcattaa 19303435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594004
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 20593872  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20593873 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20593972  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20593973 cacagattataattatcattatcattaagtct 20594004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496411
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 16496343  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16496344 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 16496411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076863
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    | |||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20076799 aatgcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595711
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcaca 1595711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656791
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| || ||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcaca 25656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540911
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 1540911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688664
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcaca 25688664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456930
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 226  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 18456930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644543
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||| |||||||| || |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataat 223  Q
    |||||| ||| |||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||| || |||||||||  |||| || | ||||||||||||| || ||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaaatcatcatatatcagcttcacagatcatcat 25644534  T
Q  224 taacatcat 232  Q
    ||| |||||    
T  25644535 taatatcat 25644543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| ||||||| || |    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920519
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||   || ||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatacaa---catcatgacataagtatatc 16920655  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | | | ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||  |||||    
T  16920654 aaattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagct 16920556  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16920555 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 16920519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 186
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatacaa---caacatgacataataatatc 35245682  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatca 186  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  35245683 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  117 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556894
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| ||   ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctcaa--tttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20556894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25603506 - 25603267
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  25603506 acatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatc 25603407  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    | ||  || || || |||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  25603406 atttataattc-actacatctcaattattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagct 25603308  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||    
T  25603307 tcacagattctattaaacatcgtcattaagtcttaaagcta 25603267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109322
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| | |||| ||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 164  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831737
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||   | |||||||||||| |||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttcaa---cgacatgacataatcatatc 22831599  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaat--attcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 207  Q
    || | ||| ||| |||||||||| ||  || |||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||    
T  22831600 aaattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcag 22831698  T
Q  208 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  22831699 cttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaat 22831737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041441
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||   |||| |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  138 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 237  Q
    ||||| | |  |||||||||||| || |||||| | || ||| |||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15041544 tcaataaaatctcaagtaatgcacat-acattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatta 15041446  T
Q  238 agtct 242  Q
     ||||    
T  15041445 ggtct 15041441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821782
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-cat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||| |||||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa-cgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaaca 195  Q
    || || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaaca 18821782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847949
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| ||  |||||| |||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19848014 tgcaattcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 19847949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25611844 - 25611605
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  25611844 acatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatc 25611745  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    | ||  || || || |||||| || |||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||   | | |||||||||||||||    
T  25611744 atttataattc-actacatctcaattattcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagct 25611646  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||| ||||| |  | |||||| |||||||||| ||| ||||    
T  25611645 tcatagattctgttaaacatcgtcattaagtcctaaagcta 25611605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992578
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 165  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  23992529 tgcaatt---caacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 23992578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227416
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 8227434  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  8227433 ttcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333262
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27394002
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 246
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185737
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||   |||||||||||||||| ||||||| | ||| ||| || |||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcat 11185620  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaaca 228  Q
    |||   ||| |||  || |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||| || ||||| ||||||  || ||||||||||||   |||||     
T  11185621 cttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacggttaacc 11185719  T
Q  229 tcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||  |||||||||||||    
T  11185720 tcactattaagtcttaat 11185737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019525
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23019504  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatct 130  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatct 23019525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415887
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaatta-tacttcaagtaatg 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||| | ||||||    
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 27415915  T
Q  159 catataacattatatcacatcataatca 186  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27415914 cataaaacattatatcacattataatca 27415887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496477
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808888
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 21766695 - 21766839
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||| |  | ||||||||||||     
T  21766695 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt- 21766793  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 160  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  21766794 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 21766839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098518
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaa--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||  ||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgc-aaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaa 9098522  T
Q  123 caac 126  Q
    ||||    
T  9098521 caac 9098518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 130
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652313
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  114 gcaagtcaacaacatct 130  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatct 19652313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgcaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 19668485  T
Q  124 aacatc 129  Q
    ||||||    
T  19668486 aacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561418
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | ||||| ||||||||    
T  1561402 gaatgcaaatcaacaac 1561418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 58  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 184
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907280
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | ||||||||||||     
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt- 18907209  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataat 184  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||    
T  18907210 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataat 18907280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185870
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtat 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtat 4185870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873205
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 19873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 22432249 - 22432334
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 22438799 - 22438884
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||  |||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076913
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||| | | |  || ||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
     |||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  23076849 acttaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 23076913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25642304 - 25642120
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||     |||| ||||||  |||||    
T  25642304 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 25642205  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  25642204 aataaaaa--caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaaca 25642120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863039
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg 76  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagg 19863039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 5834436 - 5834388
Alignment:
Q  193 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  5834436 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 5834388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16965341 - 16965210
Alignment:
Q  101 aataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 200  Q
    ||||||||||||| ||| |||| | |||||||||  |||||  |||  |||  |||||||||  ||||||  |||| || |||| ||||||||||  |||    
T  16965341 aataatatcaattacaattcaatagcatcttaaaccttcaacaatatctcacataatgcataatacattaattcacttcttaataaacatcaacatgtct 16965242  T
Q  201 taaacagcttcacagattataattaacatcatc 233  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  16965241 taaacagctt-acagattgtatttaacatcatc 16965210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 52
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctta 52  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Original strand, 20177096 - 20177144
Alignment:
Q  193 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  20177096 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 20177144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 22158895 - 22158847
Alignment:
Q  193 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22158895 acacatcttaaacagctttacatattataattagcatcaccattaagtc 22158847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008219
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 35008219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 25 - 82
Target Start/End: Original strand, 4186381 - 4186439
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtat 82  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  4186381 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtat 4186439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 79
Target Start/End: Original strand, 16493169 - 16493214
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  16493169 gaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 16493214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 18453201 - 18453250
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  18453201 cttagaccgacttatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 18453250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15894555 - 15894491
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  15894555 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 15894491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 178
Target Start/End: Original strand, 18180596 - 18180656
Alignment:
Q  119 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18180596 tcaacaacatcttaatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 18180656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19790873 - 19790837
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19790873 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 19790837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210103
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
     |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 50210134  T
Q  212 acagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210133 acagattataattaacatcatcattaagtct 50210103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250611
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 27250751  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27250750 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 27250651  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  27250650 cacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgcta 27250611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510011
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  214 agattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509983 agattataattaacatcatcattaagtct 34510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532500
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcc 22532368  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532369 attgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22532468  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  22532469 cacagttcataaataacatcatcattaagtct 22532500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026919
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||  ||||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatca 21026779  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21026780 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagctt 21026879  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21026880 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 21026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135420
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttc 20135387  T
Q  212 acagattataattaacatcatcattaagtctta 244  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20135388 acagattataattaacaacatcattaggtctta 20135420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468604
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  212 acagattataatta 225  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354458
Alignment:
Q  88 aacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa 187  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  188 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22354458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593719
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 23593719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433222
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 212  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||| |    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttta 433208  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    ||||| || |||||    
T  433209 cagatcatcattaa 433222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362095
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaa 16362095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22356184 - 22356053
Alignment:
Q  123 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattata 221  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22356184 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22356085  T
Q  222 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356084 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22356053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 123 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 22357870 - 22357739
Alignment:
Q  123 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa-catcaacacatcttaaacagcttcacagattata 221  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22357870 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22357771  T
Q  222 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357770 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22357739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574842
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacca 45574909  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | |||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45574908 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212821
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13212929  T
Q  111 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| || |    
T  13212928 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcaac 13212830  T
Q  209 ttcacagat 217  Q
    |||||||||    
T  13212829 ttcacagat 13212821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 214
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347161
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 211  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 21347158  T
Q  212 aca 214  Q
    |||    
T  21347159 aca 21347161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801277
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| | |||   |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaacagcaa---gacataattatatc 38801413  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  38801313 tcacaaattatagttaatctcattattaagtcttaat 38801277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 214
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342296
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 107  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 21342188  T
Q  108 tcaattgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-c 205  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |    
T  21342189 tcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatc 21342287  T
Q  206 agcttcaca 214  Q
    |||||||||    
T  21342288 agcttcaca 21342296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  8 tggacatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 107  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 15860079  T
Q  108 tcaattgcaagtcaa 122  Q
    | || ||||||||||    
T  15860078 ttaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707329
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21707329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711871
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21711871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847175
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatca 20847176  T
Q  111 a 111  Q
    |    
T  20847175 a 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896195
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    || ||| |||||  |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 21896195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 192  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 227
Target Start/End: Original strand, 48603652 - 48603730
Alignment:
Q  149 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48603652 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389317
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  117 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  40389256 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 40389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21788159 - 21787979
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| |||| |||||| |  |||||||||||     
T  21788159 catcatcttattcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaattt 21788060  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21788059 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaaca 21787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797694
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 158  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 33797666  T
Q  159 catataacattatatcacatcataatca 186  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33797667 cataaaacattatatcacattataatca 33797694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 232
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758872
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa-aacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |   ||||| |||| |||||||| | |||  ||||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaac 16758763  T
Q  124 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataa 222  Q
    ||||||   || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||| || |    
T  16758764 aacatc-acaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatca 16758862  T
Q  223 ttaacatcat 232  Q
    |||| |||||    
T  16758863 ttaatatcat 16758872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 33681010 - 33681188
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  33681010 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 33681105  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
     | ||||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33681106 gaatgcaagtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260992
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| |||||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattat 220  Q
    || ||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| || | |||||||||  ||||||| |||| ||||||| |||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921864
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 25 - 130
Target Start/End: Original strand, 21754059 - 21754163
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||    
T  21754059 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 21754156  T
Q  124 aacatct 130  Q
    |||||||    
T  21754157 aacatct 21754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714631
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 21714631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 22237630 - 22237753
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  22237630 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 22237725  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||    
T  22237726 gaatgcaagtcatcaacatctcaaatat 22237753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614055
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50614120  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||    
T  50614119 tctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaa 50614055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621883
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 50621948  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| |  |||||||||||    
T  50621947 tctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaa 50621883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295557
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaac 14295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918719
Alignment:
Q  27 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | || || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 126
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  114 gcaagtcaacaac 126  Q
    |||| ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049990
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    ||| ||    |||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  41050038 tctcaa--catcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacat 41049990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928014
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 52928014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368287
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaa--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 16368291  T
Q  127 atct 130  Q
    ||||    
T  16368290 atct 16368287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783150
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    ||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 24783150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20847161 - 20847101
Alignment:
Q  191 caacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || |||||||||||||||||||    
T  20847161 caacacatctttaaacagcttcatagattatggttaacctcttcattaagtcttaatgcta 20847101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865266
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcag 42865266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 148 - 226
Target Start/End: Original strand, 21477653 - 21477732
Alignment:
Q  148 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  21477653 ttcaagtaatgcgtatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaa 21477732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21533974 - 21533923
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||    
T  21533974 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacaacaacaacatacgcagta 21533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 79
Target Start/End: Original strand, 20958124 - 20958176
Alignment:
Q  27 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  20958124 caacttagaccgactcatccagtttaattaatatacaacagcaacataggcag 20958176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3041
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 3173  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 3073  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3072 cacaggttataattaacatcatcattaagtct 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3705
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 3569  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3570 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 3669  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3670 catagattataattaacatcctcattaagtcttaat 3705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 343 - 573
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaat-agcatgacgtaataatatca 441  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 541  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  542 catatattataattaacatcctcattaagtct 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 11 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8424
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8455  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8454 cacagattataattaacatcctcattaagtc 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6000
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 107  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  108 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 207  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 6046  T
Q  208 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045 cttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 6000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26134
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 25994  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 26094  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26095 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 26134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40096
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 39956  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 40056  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40057 cacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 40096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40143
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 40011  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagctt 40111  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40112 cacagattataattaacatcatcattaagtct 40143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19885
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaaca 19888  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  19887 tct 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18749 - 18597
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||  || || | |||||||||||| |   ||||||||||||| |  ||    
T  18749 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaatt-cgtttcaacaacatcttgatcat 18651  T
Q  138 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaacat 190  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  18650 tcaataatatttcaagtaatggaattaatcattaaatcacattataatcaacat 18597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8710
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatca 8578  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8579 attgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagctt 8674  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8675 cacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaat 8710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 171; Significance: 8e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24180
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataa-tcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  227 catcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24206 catcctcaataagtcttaatactatcc 24180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39707
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 39677  T
Q  213 cagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39678 tagattataattaacatcattattaagtct 39707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75105
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||     
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 212  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 75135  T
Q  213 cagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75134 tagattataattaacatcattattaagtct 75105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 931
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 1070  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  1069 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 971  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  970 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4738
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 4606  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4607 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 4706  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4707 cacagattataattaacatcatcattaagtct 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12320
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 12188  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12189 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 12288  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12289 cacagattataattaacatcatcattaagtct 12320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22272
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 22140  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22141 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22240  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22241 cacagattataattaacatcatcattaagtct 22272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17105
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa--caacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagct 17138  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17137 ttacagattataattaacatcatgattaagtct 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79235
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 226  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| ||||||||| ||| || |||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttcactgatcatcattaa 79235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 14203 - 14139
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  14203 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcag 14139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 18 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25955
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagat 217  Q
     |||||||| ||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  218 tataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25979 tataattaacatcatcattaagtct 25955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44682
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 148 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 33479 - 33385
Alignment:
Q  148 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33479 ttcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcattaagtct 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 11 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16490
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 16622  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | || ||||||||| ||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621 aatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16522  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16521 cacagactataattaacatcatcattaagtct 16490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5088
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 4948  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4949 aatgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 5048  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||||||||||| |||||    
T  5049 cacagattatagctaaccccttcattaagtcttattgcta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 63 - 241
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13322
Alignment:
Q  63 aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcata 162  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  163 taacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtc 241  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtc 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34199
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaa 86  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Original strand, 273 - 329
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 67  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21146
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagct 21109  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21110 tcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaat 21146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339840
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 213  Q
     |||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  214 agattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  339868 agattataattaacgtcatcattaagtct 339840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71474
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaatta-tacttcaagtaatg 158  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||| | ||||||    
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 71446  T
Q  159 catataacattatatcacatcataatca 186  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  71447 cataaaacattatatcacattataatca 71474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 211  Q
     || || |||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3107  T
Q  212 acag 215  Q
    ||||    
T  3106 acag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32299
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatca 32164  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  32165 atttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 32263  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 32299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2187
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatca 2051  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||||    
T  2052 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagctt 2151  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
     ||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  2152 tacatattattaataaccttatcattaagtcttaat 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13730
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||| | | ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||    
T  13596 atttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 13730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32863
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 32882  T
Q  210 tcacagattataattaaca 228  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  32881 tcacagattataactaaca 32863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 228
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46142
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca-catcttaaacagct 209  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  | ||| ||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatcagcatca--taaaatagct 46123  T
Q  210 tcacagattataattaaca 228  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  46124 tcacagattataactaaca 46142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 222
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16323
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatca 16212  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagct 209  Q
    | |||||| ||||| ||||| || ||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  16213 aatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagct 16310  T
Q  210 tcacagattataa 222  Q
    |||||||||||||    
T  16311 tcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 72  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15351
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  |||  || ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||    
T  15485 atttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15386 cacagattataattaaccttattattaagtcttaat 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7465
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||| ||| |    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattata-caaat 7391  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 188  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||    
T  7392 tcaattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaac 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4946
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatca 4811  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||    
T  4812 attgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaactt 4910  T
Q  211 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4911 cacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 246
Target Start/End: Original strand, 1 - 170
Alignment:
Q  76 gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 175  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
Q  176 catcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10312
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| ||||||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10348 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 101 - 253
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124827
Alignment:
Q  101 aataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 200  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 124774  T
Q  201 taaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  124775 taaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 124827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174943
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    |||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat-aacattatatcacatcataatcaaca 189  Q
    | | ||| |||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaactaaacattatatcacgtcatattcaaca 174943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 80  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 136372  T
Q  128 tc 129  Q
    ||    
T  136371 tc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| |||||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacacaaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 145080  T
Q  128 tc 129  Q
    ||    
T  145079 tc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 74 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  74 aggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatat 173  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  174 cacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatcatcatta 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 289 - 434
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| ||||| || || | |||| | |||||     
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacaatataacttcataacaacaattt 388  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 160  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||    
T  389 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttaaagtaatgca 434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 11 - 141
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28544
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 28513  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 141  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28514 attgcaattcaacaacatcttatatattcaa 28544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11407
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2112
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 64
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 64  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 93 - 242
Target Start/End: Original strand, 27912 - 28061
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27912 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 28011  T
Q  193 acacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28012 acaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtct 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 14 - 226
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16995
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttca 212  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |||| || ||||||  |||| |||| ||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-catcatcaaatcatcataaatcagcttca 16981  T
Q  213 cagattataattaa 226  Q
    ||||| || |||||    
T  16982 cagatcatcattaa 16995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 174
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44614
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatc 174  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38394
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   |||| ||||||||||| |  |||||||||||     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcaca 214  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcaca 38398  T
Q  215 gatt 218  Q
    ||||    
T  38397 gatt 38394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100501
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatatt 138  Q
    |||| |||||||||||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119947
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40169
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 23710 - 23581
Alignment:
Q  88 aacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaa 187  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  23710 aacaacatgacttcttaatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaa 23611  T
Q  188 catcaacacatcttaaacagcttcacagatt 218  Q
    ||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  23610 cattaacatttcat-aacagcttcacagatt 23581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 18 - 177
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  18 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  118 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85539
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 211  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 85545  T
Q  212 acagat 217  Q
    ||||||    
T  85544 acagat 85539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160809
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||| | ||||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16514
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataattatatc 16378  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| |||||| |||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  16379 aaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 16477  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16478 tcacagattatagttaacctcattattaagtcttaat 16514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  117 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    | |||||||| ||| || || |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 6425 - 6281
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | ||||||||||||     
T  6425 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacatcataacttcataatatcaatt- 6327  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 160  Q
    ||  |||||||| |||| |  ||||||| ||| |||||||||||||    
T  6326 catttcaacaacttcttgatcattcaataatatttcaagtaatgca 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 242
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4754
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatctt 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | || || || || |||||||||| |  || |||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  132 aaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctt-aaacagcttcacagattataattaacatc 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatca--acatcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  231 atcattaagtct 242  Q
     ||| |||||||    
T  4743 ttcaataagtct 4754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13554
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 29 - 137
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62321
Alignment:
Q  29 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| | ||||   ||||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca---caacaaca 62311  T
Q  128 tcttaaatat 137  Q
    ||| ||||||    
T  62312 tctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132745
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatga 97  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatga 132745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 938
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||   || ||||||||||| |||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatacaa---catcatgacataattatatc 1074  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||    
T  1073 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagct 975  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  974 tcacagattatagttaacctcattcttaagacttaat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 70 - 246
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6845
Alignment:
Q  70 acataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacatt 169  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  170 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaat 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |   |  | | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaa-aaaaacagcatgacataataatatca 128849  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  128850 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20328
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaaca 228  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||  ||||||||  |||| |||| ||||||||||||| || |||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa--aacatcaaatcatcataaatcagcttcacagatcatcattaaca 20329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 65915 - 65830
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  65915 catcatcttgatcatcttttacctactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 65830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1521
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  1485 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7498
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatc 7362  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  7363 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 7461  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7462 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 12763 - 12933
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| | || |||||||||   |||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  12763 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 12860  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaac 188  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  12861 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 12933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
Q  13 atcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 70 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 853
Alignment:
Q  70 acataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacatt 169  Q
    |||||||||||||||||   || |||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1021 acataggcagtatacaa---cagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatt 926  T
Q  170 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  925 atatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtct 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggc 77  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
Q  12 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
Q  112 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 221
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47202
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   | || |||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac---agcagcatgacataataatatc 47091  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||| ||||||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagct 47190  T
Q  210 tcacagattata 221  Q
    ||||||||||||    
T  47191 tcacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51814
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| |    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataac 51678  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 209  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||| ||||| ||||||  |||||    
T  51679 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagct 51777  T
Q  210 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||    
T  51778 tcacagattatagttaacctcactcttaagtcttaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2088
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 211  Q
    |||||||||  ||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||  |||| |||| |||||||    
T  2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcagcttc 2094  T
Q  212 acagat 217  Q
    ||||||    
T  2093 acagat 2088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17932
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| || || || ||||| |||||||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagc 208  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  |||| |||| ||||    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 17950  T
Q  209 ttcacagattataattaa 226  Q
    ||||||||| || |||||    
T  17949 ttcacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161049
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttc 211  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| ||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caatatcaaatcatcataaatcagcttc 161055  T
Q  212 acagat 217  Q
    ||||||    
T  161054 acagat 161049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164550
Alignment:
Q  94 atgacataataatatcaattgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatca 192  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatca 164576  T
Q  193 acacatcttaaa-cagcttcacagat 217  Q
    |  |||| |||| |||||||||||||    
T  164575 aatcatcataaatcagcttcacagat 164550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  114 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 29931 - 30094
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatc-aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  29931 tcatcatcttaattgaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 30029  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    || ||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  30030 tgtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcaca 30094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat--aacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 137
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6661
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 157
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116571
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128909
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaa--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 128975  T
Q  127 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  128974 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 128909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 130
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78442
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 226
Target Start/End: Original strand, 116579 - 116631
Alignment:
Q  175 acatcataatcaacatcaacacatcttaaa-cagcttcacagattataattaa 226  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  116579 acatcataatcaacattaacatatcctaaaacagcttcacagattatcattaa 116631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11442
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T
Q  111 attgcaagtcaacaacatcttaa 133  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||    
T  11464 atttcaattcatcaacatgttaa 11442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11399
Alignment:
Q  195 acatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11450 acatgttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 11399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16014
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 217  Q
    |||||| ||| ||||   |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 217
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  129 cttaaat-attcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 217  Q
    || |||  |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagta 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38641
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||     
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| |  |||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||  |||| |||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaa 38641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagat 217  Q
    |||||| ||| |||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3716
Alignment:
Q  170 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 170 - 246
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7780
Alignment:
Q  170 atatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1280
Alignment:
Q  17 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  117 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 177  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  1341 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 9080 - 8871
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataata-----atatc 109  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||     |||||    
T  9080 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataataatagcagcataggcagattacaacaacattatgacatcatataacgatatc 8981  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatg-catataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 208  Q
    || | ||||  | || ||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||  ||  ||||| || |||||||||| ||||||||||||  || | ||||||    
T  8980 aaatacaagcaagcatcatctcaatcattcattcataattcaagtaatgaaatcaaacatcatctcacatcatattcaacatcaacatttcat-aacagc 8882  T
Q  209 ttcacagatta 219  Q
    |||||||||||    
T  8881 ttcacagatta 8871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53488
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5017
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||   |||| ||||||||||| |||||||     
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatcaaa 5150  T
Q  113 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 212  Q
    | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| || |||  ||| ||||    
T  5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttca 5051  T
Q  213 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    || |||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  5050 catattataattaaccttattattaaatcttaat 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 149 - 246
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1149
Alignment:
Q  149 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  1052 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51766
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||||| | || |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatca 51888  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcat-aatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |  || | |||||||||||| ||| |||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat-aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  227 catcatcattaagtcttaatgcta 250  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgcta 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 130
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32654
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 32634  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatct 130  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatct 32654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29720
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  115 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 176  Q
    |||  ||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  29658 caatttcaacaagactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcac 29720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60614
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||  ||||||||| |||| |||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaacagctcatgatataccaatatcaat-gcaaatcaacaaca 60720  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataattaa 226  Q
    ||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  60719 tctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcattaa 60620  T
Q  227 catcat 232  Q
     |||||    
T  60619 tatcat 60614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 193
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130086
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| |    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
Q  124 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  130018 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattgtaaacaacatcaa 130086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 666 - 714
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  666 cttagaccgacacatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggca 714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11646
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38195
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||| |||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 14 - 126
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15776
Alignment:
Q  14 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaat 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |     
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  113 tgcaagtcaacaac 126  Q
    || || ||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 1339 - 1424
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  1339 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttgtttaagtaacaatagcaacataggcagattacaacaacattatgacat 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  125 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  10548 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6121
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6146  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaa 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  |   ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaatcagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacatc 8062  T
Q  130 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8061 ttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19390
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10394
Alignment:
Q  171 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtct 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6688
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 6688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14068
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16264
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||  |    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatta-atttcaacaacatcttaatca 16345  T
Q  137 ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagatt 218  Q
    |||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||||    
T  16344 ttcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaacatttcat-aacagcttcacagatt 16264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15821
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 15821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 78
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 78  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12749
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  129 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    || ||||| | |  |||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 60 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15362
Alignment:
Q  60 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 158  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 15390  T
Q  159 catataacattatatcacatcataatca 186  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15389 cataaaacattatatcacattataatca 15362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 36199 - 36248
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||    
T  36199 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacaacaacataggcag 36248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2801
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14692
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||| ||||||| | |    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 26828 - 27027
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||    
T  26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattatatcaatt 26925  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 212  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  26926 -caattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 27021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 23843 - 24048
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  ||||||| || ||| ||||      
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacatcat-ataacaatat 23941  T
Q  115 caagt----caacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 210  Q
    ||| |    || |||||||| ||  ||||| | ||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||  |||| ||||||||    
T  23942 caaataaaacagcaacatctcaatcattcattcatagttcaagtaatgaaattaacattatatcacatcatattcaacactaacatctctt-aacagctt 24040  T
Q  211 cacagatt 218  Q
    ||||||||    
T  24041 cacagatt 24048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5769
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 5755  T
Q  124 aacatcttaaatat 137  Q
    ||||||| ||||||    
T  5756 aacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1083
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4741
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||   |||| |||| | |||| | ||||||||||||     
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaca 195  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacattaaca 4741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Original strand, 133 - 310
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| | || |||| |||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaa 310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 193098 - 192920
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacaacatgacataataatat 108  Q
    |||||| ||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| |||||    
T  193098 acatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatat 192999  T
Q  109 caattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca-tataacattatatcacatcataatcaa 187  Q
    || ||  || || ||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||| | || |||||||||||||| |||||||||    
T  192998 catttataattc-acaacatctcaattattcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatcaa 192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21721
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 21823  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 212  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  21822 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 21727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29613
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 29715  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttca 212  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||| ||| |||||| | ||||||||||    
T  29714 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca-caa-acatctcataacagcttca 29619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 38 - 180
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29262
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaa-gtcaacaacatcttaa--a 134  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || | |||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  |    
T  29117 gactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaattttaacaacaccttaaata 29216  T
Q  135 tattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 180  Q
    |||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  29217 tattcaataaaacttcaagtaatacacacaacattatatcacatca 29262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1159
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 182
Target Start/End: Original strand, 1881 - 2045
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa-catgacataataatatcaatt 113  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 1978  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcata 182  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  1979 -caattcatcaacatcttatgtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcata 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 30 - 137
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| | | | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  129 cttaaatat 137  Q
    || ||||||    
T  1150 ctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 190 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17873
Alignment:
Q  190 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 17873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1075
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  110 aattgcaagtcaacaac 126  Q
     | || || ||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaac 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 4320 - 4284
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4320 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 15 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45732
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaatt 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  114 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    | |||||| |||||||| || || ||||  ||| |||| || ||| |||||  ||||||| |||| |||| |||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 193
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225588
Alignment:
Q  68 caacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataaca 167  Q
    |||||||| |||||| ||||| || | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaa-cagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaa 225562  T
Q  168 ttatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||    
T  225563 ttatatcacattataaacaacatcaa 225588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12889
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 12864  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 12889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2694
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 82  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 15 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--acagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 226
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25321
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| ||||  ||||||| ||||| |||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaac 25219  T
Q  124 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatctta-aacagcttcacagattataa 222  Q
    ||||||| ||| | |||  |||| |||| |||||| |||||  | |||||||||| || | |||||||||  | ||||| ||||||||||||||| || |    
T  25220 aacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattatta-caacatcaaatcgtcttataacagcttcacagatcatca 25317  T
Q  223 ttaa 226  Q
    ||||    
T  25318 ttaa 25321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24001 - 23927
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24001 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 23927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8118
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaa 8118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 134
Target Start/End: Original strand, 12942 - 13062
Alignment:
Q  11 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12942 acatcatcatctt---caacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatc 13037  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 134  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  13038 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36539
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||   ||||| ||||| |||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggcaaattacaacaacaatatgacat 36539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 130
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10646
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  125 acatct 130  Q
    ||||||    
T  10641 acatct 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 203 - 251
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20643
Alignment:
Q  203 aacagcttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctat 20643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 25 - 87
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6889
Alignment:
Q  25 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 87  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8134
Alignment:
Q  86 aaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 130  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatct 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 93
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12044
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaac 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtataccaaaacaac 12044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6237
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || | |||||||| ||||| |||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 6287  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 178  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  6286 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacat 6237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97188
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 97123  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  97124 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 97188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106466
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 106401  T
Q  128 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaa 193  Q
    ||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| || | |||||||||    
T  106402 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaa 106466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1169
Alignment:
Q  102 ataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacat 190  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaataatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 1169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 164
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38470
Alignment:
Q  34 gaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatctt 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||     
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatctc 38438  T
Q  132 aaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 164  Q
    ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||    
T  38439 aaaca-tcatatataattcatgtaatgcatata 38470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 100
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20065
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacat 100  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaatagtagcataggcagattacaacaacagtatgacat 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 1830 - 1993
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | ||||||||||||     
T  1830 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 1928  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  1929 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 1993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 109
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32197
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatc 109  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatc 32197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103632
Alignment:
Q  26 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaa--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| |||| |||||||| |||||  |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtata-aaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaa 103639  T
Q  123 caacatc 129  Q
    |||||||    
T  103638 caacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Original strand, 159 - 333
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  |||||||| || | ||||||||||||     
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacataacttcataatatcaattc 258  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata-acattatatcacatcataatcaac 188  Q
        ||||||||||||| |  ||||||| ||| |||||||||||||  ||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  259 attttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattagtcattaaatcacattataatcaac 333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 161
Target Start/End: Original strand, 897 - 1042
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | ||||||||||||     
T  897 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 995  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcat 161  Q
    ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  996 catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcat 1042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 218
Target Start/End: Original strand, 69794 - 70000
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||     |||| ||||||  |||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 69893  T
Q  110 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagc 208  Q
    |||   ||  || |||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||  || | ||||||    
T  69894 aat--aaaaacagcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacactaacatctcat-aacagc 69990  T
Q  209 ttcacagatt 218  Q
    ||||||||||    
T  69991 ttcacagatt 70000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 30 - 129
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 667  T
Q  128 tc 129  Q
    ||    
T  668 tc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  32 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 81  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15736
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatag 75  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15796 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatag 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 44081 - 44244
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | ||||||||||||     
T  44081 catcatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt- 44179  T
Q  115 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 178  Q
    ||  || |||||||||| |  ||||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  44180 catttccacaacatcttgataattcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 44244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 46820 - 46670
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||   |||| || | ||| || | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  46820 gactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgatcat 46722  T
Q  138 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 188  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  46721 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 46670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 99 - 164
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13157
Alignment:
Q  99 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 164  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatata 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 2178 - 2056
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | |||||||||| | ||  ||||||||||||| |  ||    
T  2178 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaa-tccatttcaacaacatcttgatcat 2080  T
Q  138 tcaattatacttcaagtaatgcat 161  Q
    ||||| | | ||||||||||||||    
T  2079 tcaatgaaatttcaagtaatgcat 2056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 15 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 17228 - 17054
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattg 114  Q
    |||||||||||||| |||  |  |||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  |||| ||| || | ||||||||||||     
T  17228 catcatcttaatcatcttgtatagactcatggaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcataacttcataatatcaatt- 17130  T
Q  115 caagtc-aacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcataatcaac 188  Q
    ||  || ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  17129 catttccaacaacatcttgaacattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 17054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 30 - 88
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2753
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 5037 - 4999
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg 76  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5037 gactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacatagg 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 130
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267781
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |    
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaata 267778  T
Q  128 tct 130  Q
    |||    
T  267779 tct 267781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2213
Alignment:
Q  68 caacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 137  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 7450 - 7499
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  7450 cttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaacataggcag 7499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 14569 - 14618
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  14569 cttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaacataggcag 14618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7328
Alignment:
Q  38 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 74  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7364 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 3276 - 3324
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 78  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  3276 cttagaccgacacatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggca 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14728
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  14664 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 14728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23743
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  23679 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 23743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39167
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    |||||||||||||| |||| |  ||||||| || ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  39103 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 39167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 15 - 79
Target Start/End: Original strand, 18236 - 18300
Alignment:
Q  15 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 79  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  18236 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaattaacaatagcagcataggcag 18300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 78
Target Start/End: Original strand, 30350 - 30398
Alignment:
Q  30 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 78  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  30350 cttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaacataggca 30398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 232 times since January 2019
Visitors: 6702