View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0909_low_30 (Length: 253)

Name: NF0909_low_30
Description: NF0909
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0909_low_30
NF0909_low_30
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (1-155)||(32741169-32741323)
chr6 (1-154)||(29518494-29518647)
chr6 (1-153)||(29518912-29519064)
chr6 (1-153)||(3409251-3409403)
chr6 (1-153)||(2378118-2378270)
chr6 (1-153)||(35210196-35210348)
chr6 (1-153)||(3058218-3058370)
chr6 (1-143)||(2377756-2377898)
chr6 (3-153)||(26544041-26544191)
chr6 (1-145)||(2579886-2580030)
chr6 (1-153)||(3409652-3409804)
chr6 (9-153)||(3415450-3415594)
chr6 (1-153)||(14748356-14748504)
chr6 (1-152)||(1846741-1846892)
chr6 (1-143)||(2578457-2578598)
chr6 (1-143)||(16107680-16107822)
chr6 (1-154)||(1127351-1127504)
chr6 (1-145)||(10074377-10074521)
chr6 (1-139)||(16454913-16455051)
chr6 (1-145)||(10074005-10074149)
chr6 (1-143)||(16454577-16454719)
chr6 (1-139)||(2843560-2843699)
chr6 (1-140)||(2579506-2579645)
chr6 (1-143)||(5832041-5832182)
chr6 (2-142)||(1950200-1950340)
chr6 (37-140)||(32460630-32460733)
chr6 (1-142)||(6999810-6999951)
chr6 (1-145)||(10073630-10073772)
chr6 (1-145)||(593721-593867)
chr6 (9-144)||(2578857-2578991)
chr6 (1-143)||(2579123-2579261)
chr6 (20-139)||(9062383-9062501)
chr6 (1-145)||(10911565-10911710)
chr6 (1-143)||(16108065-16108195)
chr6 (13-145)||(6071132-6071264)
chr6 (25-150)||(5958641-5958766)
chr6 (4-145)||(12092499-12092640)
chr6 (1-145)||(12085048-12085191)
chr6 (26-145)||(8481927-8482045)
chr6 (1-145)||(12071705-12071849)
chr6 (29-130)||(2975567-2975668)
chr6 (72-125)||(35210498-35210551)
chr6 (1-145)||(31714671-31714812)
chr6 (33-77)||(22605301-22605345)
chr6 (26-77)||(11637760-11637811)
chr6 (10-141)||(17135092-17135223)
chr6 (62-108)||(14789279-14789325)
chr6 (4-138)||(30618634-30618766)
chr6 (33-77)||(21130103-21130147)
chr6 (1-41)||(3409405-3409445)
chr6 (9-53)||(10902452-10902496)
chr6 (27-69)||(11638053-11638095)
[»] chr2 (76 HSPs)
chr2 (3-153)||(36178621-36178771)
chr2 (1-153)||(14745681-14745833)
chr2 (1-153)||(37106180-37106332)
chr2 (4-153)||(41283492-41283641)
chr2 (1-155)||(37105914-37106068)
chr2 (1-153)||(5542639-5542791)
chr2 (1-153)||(5543012-5543164)
chr2 (1-143)||(15880265-15880407)
chr2 (1-145)||(962598-962742)
chr2 (1-143)||(6421387-6421529)
chr2 (1-138)||(15511509-15511646)
chr2 (1-145)||(42514649-42514793)
chr2 (1-143)||(36005894-36006035)
chr2 (1-127)||(36178185-36178311)
chr2 (1-153)||(14745307-14745460)
chr2 (1-129)||(6422126-6422254)
chr2 (1-145)||(35580738-35580881)
chr2 (1-140)||(33731653-33731792)
chr2 (1-145)||(38796632-38796778)
chr2 (6-141)||(28254258-28254391)
chr2 (1-143)||(6712978-6713121)
chr2 (1-153)||(1769884-1770036)
chr2 (1-145)||(40679643-40679787)
chr2 (38-153)||(36178320-36178435)
chr2 (1-143)||(40733519-40733661)
chr2 (1-145)||(37632611-37632755)
chr2 (27-145)||(28531354-28531472)
chr2 (1-134)||(40163386-40163520)
chr2 (1-153)||(7598601-7598745)
chr2 (1-143)||(5367457-5367599)
chr2 (1-145)||(7598228-7598372)
chr2 (4-132)||(23346250-23346377)
chr2 (38-145)||(16542449-16542556)
chr2 (37-145)||(31468800-31468904)
chr2 (1-143)||(40733885-40734026)
chr2 (1-145)||(29676903-29677052)
chr2 (3-145)||(12529044-12529186)
chr2 (57-142)||(31899496-31899581)
chr2 (4-145)||(30313178-30313318)
chr2 (33-137)||(37895107-37895211)
chr2 (1-83)||(6421793-6421875)
chr2 (29-142)||(31259658-31259774)
chr2 (27-145)||(33561491-33561609)
chr2 (67-145)||(38796298-38796376)
chr2 (1-137)||(29676543-29676673)
chr2 (3-145)||(16590888-16591025)
chr2 (31-143)||(29874067-29874179)
chr2 (28-145)||(30323464-30323581)
chr2 (1-92)||(36784274-36784365)
chr2 (1-91)||(3673122-3673212)
chr2 (27-145)||(37894732-37894850)
chr2 (88-145)||(36785664-36785721)
chr2 (1-73)||(3672773-3672845)
chr2 (13-145)||(29873563-29873695)
chr2 (1-83)||(6421688-6421770)
chr2 (14-144)||(31385738-31385868)
chr2 (40-129)||(28254165-28254254)
chr2 (37-145)||(33953821-33953929)
chr2 (27-142)||(9231252-9231367)
chr2 (38-142)||(12910231-12910335)
chr2 (38-145)||(41678419-41678527)
chr2 (97-143)||(6421306-6421352)
chr2 (1-142)||(3594192-3594333)
chr2 (4-145)||(33954279-33954419)
chr2 (27-81)||(35580478-35580534)
chr2 (27-103)||(30312831-30312907)
chr2 (32-91)||(25390313-25390372)
chr2 (27-78)||(28226404-28226455)
chr2 (83-130)||(42515031-42515078)
chr2 (1-55)||(31899116-31899170)
chr2 (46-103)||(2336666-2336723)
chr2 (109-145)||(3673085-3673121)
chr2 (27-75)||(8904498-8904546)
chr2 (27-74)||(28226726-28226772)
chr2 (29-78)||(13792536-13792585)
chr2 (109-145)||(3672719-3672755)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (1-153)||(44290838-44290991)
chr1 (1-153)||(44290472-44290624)
chr1 (4-155)||(41759473-41759624)
chr1 (1-154)||(3537613-3537766)
chr1 (1-145)||(41142372-41142517)
chr1 (1-145)||(41157375-41157519)
chr1 (1-143)||(26661536-26661678)
chr1 (1-145)||(41156991-41157135)
chr1 (1-153)||(48588502-48588654)
chr1 (23-154)||(3550711-3550842)
chr1 (1-143)||(37556113-37556255)
chr1 (1-145)||(29798199-29798343)
chr1 (19-151)||(32594748-32594880)
chr1 (1-143)||(17294579-17294722)
chr1 (1-145)||(34364507-34364651)
chr1 (1-145)||(34364925-34365069)
chr1 (1-144)||(40082408-40082550)
chr1 (3-145)||(5319981-5320123)
chr1 (2-148)||(38804370-38804516)
chr1 (10-143)||(26661921-26662054)
chr1 (1-145)||(31767175-31767319)
chr1 (1-153)||(50052038-50052189)
chr1 (3-137)||(14318875-14319009)
chr1 (1-143)||(34649440-34649582)
chr1 (1-153)||(45493988-45494145)
chr1 (1-141)||(9955911-9956053)
chr1 (1-143)||(11977282-11977424)
chr1 (1-153)||(32168712-32168853)
chr1 (1-142)||(37555733-37555873)
chr1 (1-145)||(3875345-3875489)
chr1 (4-145)||(39066217-39066358)
chr1 (1-145)||(45084382-45084520)
chr1 (1-145)||(22077509-22077653)
chr1 (1-145)||(24600328-24600472)
chr1 (3-145)||(66488-66630)
chr1 (1-145)||(37850614-37850758)
chr1 (66-153)||(3537226-3537313)
chr1 (51-145)||(41184489-41184583)
chr1 (25-153)||(44043810-44043943)
chr1 (1-145)||(24132002-24132143)
chr1 (3-144)||(22793279-22793421)
chr1 (1-145)||(66103-66247)
chr1 (1-139)||(5575110-5575246)
chr1 (1-145)||(30630652-30630796)
chr1 (1-143)||(45839629-45839775)
chr1 (1-135)||(5528768-5528902)
chr1 (4-145)||(19283472-19283613)
chr1 (1-120)||(22077124-22077243)
chr1 (37-145)||(44685456-44685564)
chr1 (29-145)||(22077871-22077986)
chr1 (64-145)||(21378118-21378199)
chr1 (13-145)||(1188614-1188746)
chr1 (1-74)||(11977015-11977088)
chr1 (27-103)||(10351202-10351278)
chr1 (27-145)||(1187404-1187522)
chr1 (19-118)||(4956218-4956319)
chr1 (1-75)||(50051703-50051776)
chr1 (113-153)||(50051777-50051817)
chr1 (98-145)||(35154150-35154197)
chr1 (86-145)||(50469180-50469239)
chr1 (79-145)||(4878803-4878869)
chr1 (51-96)||(41184152-41184197)
chr1 (1-130)||(44091909-44092038)
chr1 (30-90)||(35154046-35154106)
chr1 (80-153)||(4266875-4266948)
chr1 (5-145)||(5996890-5997029)
chr1 (27-63)||(12466365-12466401)
chr1 (113-145)||(22077248-22077280)
chr1 (77-136)||(30630912-30630972)
chr1 (93-145)||(47379891-47379943)
chr1 (3-46)||(21378075-21378118)
chr1 (26-72)||(9956212-9956258)
chr1 (4-74)||(47380184-47380254)
chr1 (27-63)||(31973375-31973411)
chr1 (9-145)||(50556451-50556587)
[»] chr8 (78 HSPs)
chr8 (1-153)||(3669679-3669831)
chr8 (1-153)||(3670052-3670204)
chr8 (1-153)||(30441073-30441229)
chr8 (1-143)||(3038304-3038446)
chr8 (1-143)||(34834878-34835020)
chr8 (1-143)||(34835211-34835353)
chr8 (1-145)||(45122071-45122215)
chr8 (1-155)||(1014259-1014413)
chr8 (8-154)||(20870594-20870742)
chr8 (6-142)||(147454-147590)
chr8 (1-153)||(1013885-1014037)
chr8 (7-143)||(33113387-33113523)
chr8 (1-145)||(9608745-9608889)
chr8 (3-143)||(30359273-30359413)
chr8 (3-143)||(40518584-40518724)
chr8 (1-143)||(25561829-25561972)
chr8 (1-143)||(34835476-34835619)
chr8 (1-143)||(34835742-34835885)
chr8 (1-143)||(37544504-37544646)
chr8 (4-143)||(40518071-40518212)
chr8 (1-131)||(45122638-45122768)
chr8 (1-145)||(6876876-6877021)
chr8 (1-138)||(9482618-9482755)
chr8 (1-145)||(45121924-45122068)
chr8 (3-138)||(70290-70425)
chr8 (1-120)||(9483201-9483320)
chr8 (1-145)||(9309355-9309498)
chr8 (3-145)||(41972158-41972303)
chr8 (1-143)||(1513929-1514071)
chr8 (1-151)||(40579520-40579670)
chr8 (1-145)||(5420651-5420795)
chr8 (3-135)||(18372010-18372142)
chr8 (8-143)||(30359611-30359746)
chr8 (1-153)||(6731896-6732039)
chr8 (1-145)||(8918778-8918922)
chr8 (1-145)||(5915872-5916011)
chr8 (1-142)||(32640546-32640682)
chr8 (8-145)||(45123006-45123143)
chr8 (1-143)||(45121670-45121811)
chr8 (1-141)||(18380033-18380171)
chr8 (1-145)||(9308977-9309125)
chr8 (3-145)||(147829-147962)
chr8 (4-145)||(4154685-4154824)
chr8 (8-122)||(9609108-9609222)
chr8 (67-156)||(41416251-41416338)
chr8 (1-138)||(6651510-6651638)
chr8 (1-138)||(18371675-18371807)
chr8 (31-151)||(32305478-32305591)
chr8 (32-142)||(43274824-43274934)
chr8 (27-143)||(8794113-8794229)
chr8 (1-145)||(9507777-9507926)
chr8 (41-141)||(18372988-18373085)
chr8 (73-142)||(18372785-18372854)
chr8 (37-143)||(18372656-18372758)
chr8 (3-145)||(12283873-12284014)
chr8 (73-142)||(18372342-18372411)
chr8 (55-142)||(3037776-3037865)
chr8 (1-70)||(40579283-40579352)
chr8 (72-135)||(25561729-25561792)
chr8 (27-145)||(4154321-4154438)
chr8 (13-145)||(9620704-9620834)
chr8 (1-141)||(43398082-43398225)
chr8 (40-140)||(20130454-20130553)
chr8 (1-63)||(8919158-8919220)
chr8 (13-145)||(5274775-5274907)
chr8 (1-67)||(41129066-41129132)
chr8 (4-68)||(20995433-20995497)
chr8 (7-64)||(16524446-16524503)
chr8 (101-142)||(18372485-18372526)
chr8 (53-109)||(18373236-18373292)
chr8 (46-142)||(40991756-40991852)
chr8 (4-91)||(40417733-40417820)
chr8 (37-74)||(12156708-12156745)
chr8 (88-145)||(20995502-20995559)
chr8 (68-145)||(33831978-33832055)
chr8 (1-51)||(43274649-43274699)
chr8 (46-87)||(11442911-11442952)
chr8 (113-145)||(18645713-18645745)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (1-145)||(1085630-1085774)
chr7 (1-145)||(7517580-7517724)
chr7 (1-153)||(37533025-37533176)
chr7 (1-145)||(23391-23535)
chr7 (7-151)||(29157559-29157703)
chr7 (1-143)||(30244272-30244414)
chr7 (16-145)||(7554025-7554154)
chr7 (1-138)||(11845198-11845335)
chr7 (1-153)||(37533378-37533530)
chr7 (1-143)||(45754718-45754859)
chr7 (1-137)||(19122740-19122875)
chr7 (1-145)||(36939747-36939891)
chr7 (1-145)||(40094788-40094932)
chr7 (4-143)||(6054562-6054701)
chr7 (1-143)||(45433243-45433385)
chr7 (1-145)||(22567053-22567196)
chr7 (4-153)||(14681502-14681649)
chr7 (1-143)||(45434638-45434780)
chr7 (1-143)||(30245079-30245217)
chr7 (1-145)||(24177435-24177579)
chr7 (26-145)||(22566702-22566820)
chr7 (1-139)||(34218048-34218186)
chr7 (3-143)||(47129097-47129237)
chr7 (1-145)||(8128455-8128599)
chr7 (25-145)||(16569196-16569316)
chr7 (25-145)||(16596346-16596466)
chr7 (6-145)||(118318-118459)
chr7 (2-142)||(9901648-9901786)
chr7 (9-145)||(36622960-36623096)
chr7 (10-142)||(24838724-24838857)
chr7 (1-140)||(30032572-30032711)
chr7 (3-145)||(40230307-40230449)
chr7 (19-145)||(1085280-1085407)
chr7 (11-142)||(20599317-20599450)
chr7 (28-145)||(36534825-36534942)
chr7 (3-145)||(41854635-41854776)
chr7 (24-145)||(43241495-43241616)
chr7 (1-103)||(30253534-30253632)
chr7 (57-145)||(28301613-28301701)
chr7 (1-124)||(37167808-37167925)
chr7 (50-142)||(41910657-41910749)
chr7 (1-99)||(28300267-28300366)
chr7 (72-145)||(30245494-30245567)
chr7 (72-145)||(30255339-30255412)
chr7 (75-145)||(30244701-30244771)
chr7 (77-145)||(36109007-36109075)
chr7 (1-64)||(47129450-47129513)
chr7 (40-140)||(44361517-44361616)
chr7 (1-62)||(28300582-28300644)
chr7 (27-78)||(21416181-21416232)
chr7 (28-76)||(23569043-23569091)
chr7 (1-57)||(37532765-37532821)
chr7 (27-145)||(4124128-4124246)
chr7 (108-151)||(14681281-14681324)
chr7 (95-145)||(40094502-40094552)
chr7 (33-78)||(21619091-21619136)
chr7 (1-62)||(45755010-45755071)
chr7 (5-77)||(40094431-40094503)
chr7 (93-143)||(36967335-36967385)
chr7 (27-145)||(37345916-37346036)
chr7 (33-77)||(27391815-27391859)
chr7 (1-44)||(30244453-30244496)
chr7 (1-44)||(30253671-30253714)
chr7 (9-103)||(15902342-15902436)
chr7 (3-44)||(30245256-30245297)
chr7 (2-50)||(4719311-4719359)
chr7 (38-78)||(27598052-27598092)
[»] chr5 (78 HSPs)
chr5 (1-153)||(6500443-6500594)
chr5 (1-145)||(40296329-40296473)
chr5 (1-155)||(18603134-18603288)
chr5 (2-152)||(41170627-41170777)
chr5 (1-153)||(32487386-32487537)
chr5 (1-154)||(27502050-27502203)
chr5 (1-145)||(13415774-13415918)
chr5 (1-148)||(36492231-36492378)
chr5 (1-153)||(624188-624340)
chr5 (1-145)||(3295029-3295172)
chr5 (1-153)||(6500815-6500966)
chr5 (1-145)||(15370099-15370243)
chr5 (1-142)||(3295359-3295498)
chr5 (3-142)||(25327938-25328077)
chr5 (1-143)||(26074614-26074756)
chr5 (25-153)||(9498692-9498820)
chr5 (1-138)||(11416991-11417128)
chr5 (1-145)||(26074160-26074304)
chr5 (1-145)||(41632782-41632926)
chr5 (1-144)||(299490-299633)
chr5 (1-143)||(26075175-26075318)
chr5 (1-143)||(42405612-42405752)
chr5 (1-135)||(34753039-34753173)
chr5 (3-143)||(6224198-6224338)
chr5 (1-145)||(12662666-12662810)
chr5 (3-157)||(623806-623960)
chr5 (3-145)||(35150007-35150148)
chr5 (1-145)||(36568583-36568725)
chr5 (1-143)||(1028531-1028673)
chr5 (10-148)||(29549278-29549416)
chr5 (7-155)||(5723811-5723959)
chr5 (4-133)||(33747783-33747912)
chr5 (13-143)||(26074807-26074938)
chr5 (1-119)||(15370428-15370546)
chr5 (1-143)||(24489220-24489360)
chr5 (1-140)||(38427553-38427691)
chr5 (1-143)||(300961-301095)
chr5 (1-145)||(26590924-26591068)
chr5 (1-143)||(35167852-35167994)
chr5 (70-155)||(7768840-7768925)
chr5 (13-144)||(36521922-36522053)
chr5 (1-142)||(2411010-2411151)
chr5 (50-143)||(42508614-42508707)
chr5 (22-142)||(35914852-35914972)
chr5 (27-142)||(36522277-36522392)
chr5 (65-143)||(26074320-26074398)
chr5 (27-145)||(31509623-31509742)
chr5 (8-142)||(41635212-41635346)
chr5 (20-131)||(31509745-31509857)
chr5 (27-78)||(13042606-13042657)
chr5 (4-59)||(26900034-26900089)
chr5 (64-143)||(39309686-39309764)
chr5 (27-143)||(13786041-13786157)
chr5 (9-61)||(795254-795306)
chr5 (7-74)||(9498343-9498410)
chr5 (9-88)||(36527117-36527196)
chr5 (1-58)||(38427306-38427363)
chr5 (50-143)||(42524719-42524811)
chr5 (27-87)||(32445943-32446003)
chr5 (31-78)||(13112604-13112651)
chr5 (85-142)||(6225047-6225104)
chr5 (105-153)||(5660290-5660338)
chr5 (20-108)||(19275566-19275653)
chr5 (27-65)||(13042784-13042822)
chr5 (27-65)||(13112782-13112820)
chr5 (103-145)||(35150747-35150789)
chr5 (103-145)||(35151038-35151080)
chr5 (8-87)||(13785653-13785732)
chr5 (96-154)||(22298956-22299015)
chr5 (27-78)||(36389016-36389067)
chr5 (33-63)||(5963765-5963795)
chr5 (13-91)||(9510546-9510624)
chr5 (1-43)||(24489583-24489625)
chr5 (11-47)||(795152-795189)
chr5 (33-74)||(34103625-34103666)
chr5 (3-55)||(5660340-5660392)
chr5 (110-142)||(13785732-13785764)
chr5 (33-77)||(41341523-41341567)
[»] chr4 (101 HSPs)
chr4 (1-145)||(25483336-25483480)
chr4 (1-153)||(50630767-50630919)
chr4 (1-154)||(41370348-41370501)
chr4 (1-155)||(55933136-55933290)
chr4 (1-143)||(36629239-36629381)
chr4 (1-145)||(54017607-54017751)
chr4 (1-145)||(52884695-52884840)
chr4 (1-148)||(50002423-50002570)
chr4 (3-145)||(1731661-1731803)
chr4 (1-143)||(39404400-39404542)
chr4 (7-153)||(49880152-49880297)
chr4 (1-130)||(54108928-54109056)
chr4 (1-145)||(3340807-3340951)
chr4 (1-145)||(10245920-10246063)
chr4 (1-143)||(39792872-39793014)
chr4 (4-145)||(4955332-4955473)
chr4 (1-145)||(52884887-52885034)
chr4 (4-143)||(34646664-34646803)
chr4 (1-142)||(50459724-50459865)
chr4 (1-145)||(22027973-22028117)
chr4 (1-145)||(36608673-36608817)
chr4 (1-135)||(54343020-54343147)
chr4 (1-143)||(36572021-36572163)
chr4 (1-143)||(39404020-39404162)
chr4 (8-136)||(44620362-44620490)
chr4 (1-145)||(44620660-44620803)
chr4 (1-127)||(18932761-18932887)
chr4 (16-130)||(45496820-45496934)
chr4 (3-146)||(54108537-54108679)
chr4 (1-126)||(54936215-54936339)
chr4 (1-145)||(22183276-22183420)
chr4 (1-145)||(32941135-32941279)
chr4 (1-145)||(49076843-49076986)
chr4 (1-136)||(44621011-44621146)
chr4 (1-145)||(2740700-2740842)
chr4 (3-145)||(22028383-22028527)
chr4 (1-142)||(49302907-49303050)
chr4 (4-139)||(20825842-20825977)
chr4 (1-139)||(20826223-20826361)
chr4 (36-145)||(2741071-2741180)
chr4 (7-144)||(16888834-16888971)
chr4 (1-145)||(3244463-3244607)
chr4 (1-145)||(4390113-4390257)
chr4 (1-144)||(16889548-16889691)
chr4 (27-143)||(41707503-41707618)
chr4 (22-153)||(6975489-6975620)
chr4 (1-143)||(19504707-19504840)
chr4 (1-145)||(34004597-34004739)
chr4 (3-145)||(54741194-54741334)
chr4 (1-91)||(23817693-23817783)
chr4 (1-145)||(3341128-3341272)
chr4 (4-143)||(43174508-43174648)
chr4 (37-132)||(54017750-54017845)
chr4 (1-143)||(45489344-45489485)
chr4 (51-145)||(49076510-49076604)
chr4 (8-143)||(40067045-40067181)
chr4 (1-94)||(31691203-31691298)
chr4 (1-145)||(51768072-51768216)
chr4 (1-145)||(3700365-3700501)
chr4 (1-99)||(18879852-18879950)
chr4 (27-145)||(28034229-28034347)
chr4 (1-105)||(43827480-43827583)
chr4 (13-140)||(760194-760320)
chr4 (4-103)||(15841383-15841482)
chr4 (93-156)||(50788087-50788150)
chr4 (56-145)||(10246347-10246436)
chr4 (27-124)||(48111736-48111833)
chr4 (79-137)||(44620304-44620362)
chr4 (1-123)||(3271806-3271933)
chr4 (13-145)||(23556890-23557022)
chr4 (79-145)||(44621426-44621492)
chr4 (27-78)||(11197293-11197344)
chr4 (27-142)||(34544107-34544225)
chr4 (1-139)||(45489726-45489864)
chr4 (79-143)||(44620946-44621011)
chr4 (57-145)||(11348396-11348484)
chr4 (27-139)||(15841023-15841134)
chr4 (27-78)||(10396198-10396249)
chr4 (27-78)||(10396483-10396534)
chr4 (1-120)||(39698956-39699077)
chr4 (4-53)||(43174233-43174282)
chr4 (26-78)||(922485-922537)
chr4 (38-77)||(1868119-1868158)
chr4 (29-87)||(11706584-11706641)
chr4 (4-82)||(11783568-11783646)
chr4 (33-79)||(51681604-51681650)
chr4 (116-153)||(18932887-18932924)
chr4 (31-91)||(2891864-2891924)
chr4 (1-65)||(41370738-41370802)
chr4 (97-145)||(45050601-45050649)
chr4 (27-78)||(11197003-11197054)
chr4 (122-153)||(18933103-18933134)
chr4 (47-90)||(45484774-45484817)
chr4 (8-67)||(50788013-50788072)
chr4 (1-35)||(19895406-19895440)
chr4 (27-101)||(31249896-31249970)
chr4 (27-69)||(41707279-41707321)
chr4 (104-145)||(11706636-11706677)
chr4 (49-82)||(29802604-29802637)
chr4 (108-153)||(41370693-41370738)
chr4 (27-63)||(34946151-34946187)
[»] chr3 (83 HSPs)
chr3 (1-153)||(22304561-22304713)
chr3 (3-143)||(43346807-43346947)
chr3 (1-143)||(37990653-37990795)
chr3 (1-153)||(39934969-39935123)
chr3 (1-143)||(35946524-35946666)
chr3 (1-143)||(37990991-37991133)
chr3 (1-145)||(15772854-15772998)
chr3 (4-154)||(39389061-39389211)
chr3 (5-145)||(12114580-12114720)
chr3 (1-145)||(29644916-29645060)
chr3 (1-145)||(32589704-32589847)
chr3 (1-145)||(33803266-33803410)
chr3 (1-145)||(54017830-54017974)
chr3 (1-145)||(54018212-54018356)
chr3 (3-145)||(42342404-42342546)
chr3 (1-145)||(29644595-29644739)
chr3 (1-143)||(32462914-32463057)
chr3 (1-145)||(41359779-41359919)
chr3 (4-143)||(52634678-52634816)
chr3 (4-153)||(4823647-4823796)
chr3 (1-145)||(21832359-21832501)
chr3 (1-143)||(22303969-22304104)
chr3 (1-145)||(25739439-25739583)
chr3 (1-155)||(50612461-50612620)
chr3 (13-138)||(3135099-3135224)
chr3 (1-145)||(42342104-42342248)
chr3 (1-145)||(15773192-15773338)
chr3 (1-145)||(31190017-31190153)
chr3 (2-145)||(53577364-53577507)
chr3 (1-145)||(45395667-45395811)
chr3 (1-143)||(25755396-25755538)
chr3 (1-145)||(39914252-39914396)
chr3 (27-145)||(8327904-8328022)
chr3 (1-143)||(32462572-32462715)
chr3 (1-144)||(53117989-53118131)
chr3 (1-143)||(3135468-3135617)
chr3 (1-145)||(1634329-1634473)
chr3 (26-143)||(49336726-49336843)
chr3 (8-143)||(45901715-45901851)
chr3 (1-142)||(11661954-11662095)
chr3 (8-153)||(51886553-51886692)
chr3 (2-143)||(33175674-33175820)
chr3 (1-145)||(9240149-9240293)
chr3 (13-145)||(47964544-47964676)
chr3 (1-153)||(37726496-37726640)
chr3 (1-87)||(22303673-22303759)
chr3 (29-135)||(42584864-42584970)
chr3 (21-119)||(33362327-33362425)
chr3 (1-145)||(44160561-44160702)
chr3 (38-153)||(3384317-3384432)
chr3 (90-153)||(22304238-22304301)
chr3 (53-142)||(7767380-7767469)
chr3 (13-145)||(39336257-39336387)
chr3 (27-143)||(11661537-11661638)
chr3 (37-142)||(46546375-46546480)
chr3 (89-145)||(43346650-43346706)
chr3 (17-103)||(39336000-39336086)
chr3 (27-145)||(47964955-47965073)
chr3 (1-75)||(54017562-54017636)
chr3 (7-103)||(12749211-12749307)
chr3 (3-71)||(41359507-41359575)
chr3 (35-95)||(52634990-52635050)
chr3 (13-142)||(25317161-25317290)
chr3 (27-143)||(25991405-25991521)
chr3 (27-78)||(53596027-53596078)
chr3 (27-78)||(53596342-53596393)
chr3 (33-90)||(17731950-17732007)
chr3 (33-90)||(19033181-19033238)
chr3 (27-78)||(53596542-53596593)
chr3 (31-78)||(48127859-48127906)
chr3 (1-41)||(8328374-8328414)
chr3 (113-145)||(12747878-12747910)
chr3 (33-77)||(16871005-16871049)
chr3 (33-77)||(17735037-17735081)
chr3 (33-77)||(19036306-19036350)
chr3 (1-63)||(7766797-7766857)
chr3 (1-36)||(22304302-22304337)
chr3 (1-65)||(43978879-43978947)
chr3 (33-78)||(16143505-16143550)
chr3 (33-74)||(16869843-16869884)
chr3 (79-140)||(36986040-36986101)
chr3 (79-140)||(37011479-37011540)
chr3 (46-82)||(50329391-50329427)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (1-143)||(528-670)
scaffold0702 (1-153)||(161-308)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (1-143)||(1120-1262)
scaffold0391 (27-98)||(1731-1802)
scaffold0391 (94-145)||(3092-3143)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (1-145)||(5396-5541)
scaffold0734 (10-145)||(5777-5917)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (25-145)||(5357-5477)
scaffold0078 (1-145)||(4982-5126)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-145)||(47360-47504)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (29-145)||(17496-17614)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (68-143)||(10192-10267)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (13-143)||(39459-39588)
scaffold0113 (20-143)||(39840-39963)
[»] scaffold0807 (1 HSPs)
scaffold0807 (67-157)||(2863-2953)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (67-107)||(10406-10446)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32741323 - 32741169
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741323 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 32741224  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32741223 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 32741169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29518647 - 29518494
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518647 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 29518548  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518547 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 29518494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 29519064 - 29518912
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519064 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 29518965  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29518964 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 29518912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3409403 - 3409251
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409403 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 3409304  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409303 cctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 2378270 - 2378118
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378270 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 2378171  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2378170 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 2378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 35210348 - 35210196
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210348 tcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 35210249  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210248 cctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 35210196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3058370 - 3058218
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  3058370 tcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatacttataaggtgttcaa 3058271  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3058270 cctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttgcaaaccaaca 3058218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 2377898 - 2377756
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377898 tcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 2377799  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2377798 cctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 2377756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 26544191 - 26544041
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26544191 gaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaacc 26544092  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26544091 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 26544041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 2579886 - 2580030
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2579886 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctgtgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaa 2579985  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579986 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2580030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3409804 - 3409652
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3409804 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaa 3409705  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3409704 cttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttgcaaaccaaca 3409652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3415594 - 3415450
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3415594 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaacctttact 3415495  T
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3415494 attttatgtgatgtgggacatataactcacactcgcaaaccaaca 3415450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 14748356 - 14748504
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14748356 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaa 14748451  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14748452 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaatcaaca 14748504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 1846892 - 1846741
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1846892 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttacttataaggtgttcaa 1846793  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 152  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  1846792 cctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttgcaacccaac 1846741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 2578457 - 2578598
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2578457 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaa 2578556  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2578557 cctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttg 2578598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16107822 - 16107680
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16107822 tcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtttaa 16107723  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  16107722 cctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttg 16107680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 1127504 - 1127351
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||| |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1127504 tcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 1127405  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1127404 cctttactattttacccgatgtgggatatataactcacagttgcaaaccaacaa 1127351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 10074377 - 10074521
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074377 tcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 10074476  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  10074477 cctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttgca 10074521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16455051 - 16454913
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16455051 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgttcaa 16454952  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16454951 cctttactcttttatctgatgtgggacacataactcaca 16454913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 10074005 - 10074149
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10074005 tcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 10074104  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10074105 cgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttgca 10074149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16454719 - 16454577
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454719 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 16454620  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454619 cttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttg 16454577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2843699 - 2843560
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2843699 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttca 2843600  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2843599 acttttattattttatccgatgtgaaacatataactcaca 2843560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Original strand, 2579506 - 2579645
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | | |    
T  2579506 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggccctcttacttataaggtatccga 2579605  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2579606 cctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 5832041 - 5832182
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5832041 tcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagggg-tggctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 5832139  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5832140 cctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttg 5832182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950340
Alignment:
Q  2 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  102 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 1950340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 37 - 140
Target Start/End: Original strand, 32460630 - 32460733
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32460630 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactc 32460729  T
Q  137 acac 140  Q
    ||||    
T  32460730 acac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 6999810 - 6999951
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  6999810 tcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatataaggtgttcaa 6999909  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6999910 cttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacactt 6999951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 10073630 - 10073772
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10073630 tcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagccaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaa 10073729  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10073730 cctttac--ttttctccgatgtgggacatataactaacacttgca 10073772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 593721 - 593867
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca--ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 98  Q
    ||||| |||||||||||  ||||| |||||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  593721 tcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggtttatgagtcctcttacttataaggtgttc 593820  T
Q  99 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  593821 aacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 593867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 144
Target Start/End: Original strand, 2578857 - 2578991
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  2578857 agaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtttatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact 2578956  T
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  2578957 -ttttatccgatgagggacatataaatcacacttgc 2578991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 2579123 - 2579261
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  2579123 tcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagttatgggtttatggttcct----cttataaggtgttcaa 2579218  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2579219 cttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttg 2579261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 20 - 139
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  20 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 119  Q
    ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  120 tgtgggacatataactcaca 139  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10911710 - 10911565
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||| |||  || |||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10911710 tcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 10911611  T
Q  101 cctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10911610 cctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttgca 10911565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16108195 - 16108065
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108195 tcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 16108108  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16108107 catttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttg 16108065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071132
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacacttgca 6071132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 5958641 - 5958766
Alignment:
Q  25 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 124  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  5958641 caagagagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtaa 5958740  T
Q  125 gacatataactcacacttgcaaacca 150  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||    
T  5958741 cacatataactcacaattgcacacca 5958766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 12092499 - 12092640
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||| ||| ||||| ||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||    
T  12092499 aggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgctcaacct 12092598  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
      ||| || ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  12092599 ccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttgca 12092640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12085048 - 12085191
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| |   |||||| ||||||||    
T  12085048 tcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggccatggttttatgagtcctttctattataaagtgttcaa 12085147  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
     ||  ||| || |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  12085148 actccact-ttctatctgatgcaggacatataactcacacttgca 12085191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481927
Alignment:
Q  26 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| ||    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgt-gg 8481947  T
Q  126 acatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttgca 8481927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12071705 - 12071849
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||| |   |||||| ||||||||    
T  12071705 tcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtttatgagtcctttctattataaagtgttcaa 12071804  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
     ||  | | || |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  12071805 actccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttgca 12071849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 2975668 - 2975567
Alignment:
Q  29 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 128  Q
    ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||||||||    
T  2975668 agagacatcacactcttattcaaaactttaagacaaaggatttatgggtcatcttgcttataaggtgttcaacatttacttttctatttgatgtgggaca 2975569  T
Q  129 ta 130  Q
    ||    
T  2975568 ta 2975567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 35210551 - 35210498
Alignment:
Q  72 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 125  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210551 atgggtcctcttacttacaaggtattcaacctttactattttatccgatgtggg 35210498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31714812 - 31714671
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | | | || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||    ||||||    
T  31714812 tcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctctca-ttatataacgttcaa 31714715  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||  ||| || |||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  31714714 cctccacttttctatccgatgtaggacatat-agtcacacttgca 31714671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 22605301 - 22605345
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22605301 acaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 22605345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 77
Target Start/End: Original strand, 11637760 - 11637811
Alignment:
Q  26 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11637760 aagagagacaccacactcttatccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 11637811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 141
Target Start/End: Original strand, 17135092 - 17135223
Alignment:
Q  10 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 109  Q
    |||||||| ||||||| | |||| |  |||||||||| ||||||| ||    ||||| |||||||  ||||||| |||||||||| || ||| ||||||     
T  17135092 gaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgcttataaggtattaaacatttactt 17135191  T
Q  110 ttttatccgatgtgggacatataactcacact 141  Q
     | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17135192 ctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 108
Target Start/End: Original strand, 14789279 - 14789325
Alignment:
Q  62 caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14789279 caattggtttatgggtcctcttacttgtaaggtgttcaacctttact 14789325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 30618634 - 30618766
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||  ||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||    
T  30618634 aggcaagagcaaccacataagtaagagagacaccacatttttacccataaccttaagacaa-cggtttat-ggtcatcttacttataaagtgttcatcct 30618731  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
      ||| ||| | ||||||| |||| | ||||||||    
T  30618732 ccactttttcaaccgatgtaggacttctaactcac 30618766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 21130103 - 21130147
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21130103 acaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggt 21130147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 3409445 - 3409405
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 41  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  3409445 tcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Original strand, 10902452 - 10902496
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 53  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  10902452 agaacaaccatacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 10902496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 69
Target Start/End: Original strand, 11638053 - 11638095
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 69  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  11638053 agagagacaccatactcttacccaaaatcctaaggcaatgggt 11638095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 76)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 36178621 - 36178771
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36178621 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 36178720  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36178721 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaactaaca 36178771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 14745681 - 14745833
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745681 tcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 14745780  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14745781 cctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 14745833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37106332 - 37106180
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106332 tcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 37106233  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37106232 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37106180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Original strand, 41283492 - 41283641
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283492 aggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 41283591  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41283592 ttactattttatccgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 41283641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37106068 - 37105914
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37106068 tcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttacttataaggtgttcaa 37105969  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37105968 cctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgcaaacccacaaa 37105914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 5542639 - 5542791
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542639 tcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 5542738  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5542739 cctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5542791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 5543012 - 5543164
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5543012 tcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaa 5543111  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5543112 cctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 5543164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 15880407 - 15880265
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15880407 tcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 15880308  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15880307 cctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 15880265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 962742 - 962598
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  962742 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaa 962643  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  962642 cctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 962598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6421529 - 6421387
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6421529 tcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 6421430  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6421429 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6421387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 15511509 - 15511646
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15511509 tcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataacgtgttcaa 15511608  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511609 cctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 42514793 - 42514649
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42514793 tcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 42514694  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42514693 cctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttgca 42514649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 36005894 - 36006035
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36005894 tcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 36005993  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005994 cttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttg 36006035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 36178185 - 36178311
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  36178185 tcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaa 36178284  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggac 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36178285 cctttactattttatccgatgtgggac 36178311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 14745307 - 14745460
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccac-acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  14745307 tcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaagatgttca 14745406  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14745407 accattactattttattcgatgtgggacatataactcacagttgcaaaccaaca 14745460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 6422254 - 6422126
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  6422254 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgttcaa 6422155  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacat 129  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6422154 cctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 35580738 - 35580881
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35580738 tcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcacttataaggtgttcaa 35580836  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580837 catttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35580881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 33731792 - 33731653
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  33731792 tcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttacttataaggtgctcaa 33731693  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||    
T  33731692 cctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 38796632 - 38796778
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccaca--ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796632 tcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 38796731  T
Q  99 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796732 aacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 38796778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 6 - 141
Target Start/End: Original strand, 28254258 - 28254391
Alignment:
Q  6 gctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 105  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28254258 gctagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaccttt 28254355  T
Q  106 actattttatccgatgtgggacatataactcacact 141  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28254356 acttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6713121 - 6712978
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6713121 tcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 6713022  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6713021 acatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 6712978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 1770036 - 1769884
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | | || || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1770036 tcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 1769937  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1769936 cttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcacaccaaca 1769884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 40679643 - 40679787
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40679643 tcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaa 40679742  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  40679743 cccttacttttctatccgatatgggacatataactcacatttgca 40679787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178435
Alignment:
Q  38 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  138 cacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||    
T  36178420 cacttgcaaaccaaca 36178435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40733661 - 40733519
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40733661 tcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 40733562  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40733561 catttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 40733519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 37632611 - 37632755
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||    
T  37632611 tcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatgggtcctcttacttataaaatgtcaaa 37632710  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37632711 cctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 37632755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 28531354 - 28531472
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28531354 agagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttacttataaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtggga 28531453  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28531454 catataactcacacttgca 28531472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 40163386 - 40163520
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg-caatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40163386 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagacactaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttca 40163485  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataac 134  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40163486 acctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 7598745 - 7598601
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7598745 tcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 7598654  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7598653 cctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacaccaaca 7598601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367457
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttg 5367457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7598372 - 7598228
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7598372 tcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaa 7598273  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || ||| |||||| | |||||||| |||||||||||    
T  7598272 cctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttgca 7598228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23346377 - 23346250
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  23346377 aggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggctatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacct 23346279  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatata 132  Q
    ||||| || ||| ||||||| ||||||||    
T  23346278 ttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542449
Alignment:
Q  38 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  138 cacttgca 145  Q
    ||||||||    
T  16542456 cacttgca 16542449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 31468800 - 31468904
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31468800 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 31468895  T
Q  137 acacttgca 145  Q
    |||||||||    
T  31468896 acacttgca 31468904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40734026 - 40733885
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||||||| ||    
T  40734026 tcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgtaggtt-atgagccctcttacttataaggtgttaaa 40733928  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
     ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40733927 tctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 40733885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29677052 - 29676903
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc-----ctcttacttataaggtg 95  Q
    |||||| | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||     |||| || |||||||||    
T  29677052 tcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctctcacctataaggtg 29676953  T
Q  96 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29676952 ttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 29676903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 12529044 - 12529186
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12529044 gaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgttcaatc 12529143  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12529144 tttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgca 12529186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 57 - 142
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  57 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30313318 - 30313178
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  30313318 aggccagagcaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacct 30313220  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
      ||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30313219 ccacttttctatccgatgtgagacatataacacacgcttgca 30313178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 137
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||| |||||| |||| | || ||||||||||||||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  133 actca 137  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6421875 - 6421793
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6421875 tcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 142
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  29 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc---gatgtggg 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||   |||||| |    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  126 acatataactcacactt 142  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 33561491 - 33561609
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||| |    
T  33561491 agagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaa 33561590  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33561591 catataactcacacttgca 33561609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 145
Target Start/End: Original strand, 38796298 - 38796376
Alignment:
Q  67 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38796298 ggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 38796376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 29676673 - 29676543
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  29676673 tcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcacttataatgtgttcaa 29676580  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
     ||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  29676579 tctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16591025 - 16590888
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | | ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||||    
T  16591025 gaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------tgttcaacc 16590932  T
Q  103 tttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||| | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16590931 tttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttgca 16590888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 143
Target Start/End: Original strand, 29874067 - 29874179
Alignment:
Q  31 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 130  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||  ||| || |||| |||||||||||||    
T  29874067 agacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacata 29874166  T
Q  131 taactcacacttg 143  Q
    |||| ||||||||    
T  29874167 taacacacacttg 29874179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323464
Alignment:
Q  28 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||  | | || |||| ||| ||||||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  128 atataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  30323481 atataacacacacttgca 30323464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 36784274 - 36784365
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 92  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36784274 tcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 3673212 - 3673122
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 91  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3673212 tcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894850
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||||||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  37894832 catataactcacatttgca 37894850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785721
Alignment:
Q  88 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36785721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 3672845 - 3672773
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 73  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3672845 tcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Original strand, 29873563 - 29873695
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  29873563 caaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttc 29873662  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  29873663 tatctgatgtgggacatgtaacacacccttgca 29873695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 6421770 - 6421688
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctt 83  Q
    |||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  6421770 tcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 14 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385738
Alignment:
Q  14 aaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatttt 113  Q
    |||||||||||  | ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  114 atccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    | |||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacacttgc 31385738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 40 - 129
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  40 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacat 129  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Original strand, 33953821 - 33953929
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||  ||| || |||| |||||||||| ||||||||    
T  33953821 cacactcttacccaaaattttaaggcaacaggtttatgggtcctctcacttatatagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacttataactc 33953920  T
Q  137 acacttgca 145  Q
    ||| |||||    
T  33953921 acatttgca 33953929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 9231367 - 9231252
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||  |||||| |||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| || |||| ||| || ||    
T  9231367 agagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatttataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgaga 9231268  T
Q  127 catataactcacactt 142  Q
    ||||||||||| ||||    
T  9231267 catataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 12910335 - 12910231
Alignment:
Q  38 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  ||| | | |||||||||| ||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  12910335 acactcttacccaaaaccttaagacaatgaatttataagtcatttcacttataaggggttcaacctgtacttttccatccgatgtggaacatataactca 12910236  T
Q  138 cactt 142  Q
     ||||    
T  12910235 aactt 12910231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 145
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678527
Alignment:
Q  38 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataact 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||   || || |||| |||||| |||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaagg-tttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  136 cacacttgca 145  Q
    ||||||||||    
T  41678518 cacacttgca 41678527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6421352 - 6421306
Alignment:
Q  97 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6421352 tcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 6421306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 3594192 - 3594333
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| ||||| || ||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||| |||| | |||||||| |||||| |    
T  3594192 tcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcacttataaagtgttcga 3594291  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||  ||| || ||| || ||||  ||||| |||||||||||    
T  3594292 cctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 33954279 - 33954419
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||| |||||||||| | |||  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| | | |||||| ||| | | | |||||   |||| |||||    
T  33954279 aggccagaacaaccatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcgtaaggca-tagatttatgagtcatttaagttatataatgtttaacct 33954377  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33954378 caacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgca 33954419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 81
Target Start/End: Original strand, 35580478 - 35580534
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc 81  Q
    |||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35580478 agagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctc 35580534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30312907 - 30312831
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||    
T  30312907 agagagactacacacttttacccaaaaccttaaggaaataagtttatgggtcatctaagttataaagtgttcaacct 30312831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 91
Target Start/End: Original strand, 25390313 - 25390372
Alignment:
Q  32 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 91  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  25390313 gacaccacacttctacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcttcttagttataa 25390372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 28226455 - 28226404
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  28226455 agagagacaccacactcttacctaaaaccctaagacaatgtgtttatgggtc 28226404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 42515078 - 42515031
Alignment:
Q  83 tacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 130  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  42515078 tacttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 31899116 - 31899170
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 55  Q
    |||||| ||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31899116 tcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 46 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 2336723 - 2336666
Alignment:
Q  46 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2336723 acccaaaatcttaaggcattgaatttatgggtcctctcacttataaagtgttcaacct 2336666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3673121 - 3673085
Alignment:
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3673121 attttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3673085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 8904546 - 8904498
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 75  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  8904546 agagagacaccacacttttacccaaaaccatatggcaattggtttatgg 8904498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28226772 - 28226726
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  28226772 agagagacaccacactcttaccaaaaacc-taagacaatgggtttatg 28226726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 78
Target Start/End: Original strand, 13792536 - 13792585
Alignment:
Q  29 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||    
T  13792536 agagacatcacactcttacccaaaacctcaagtcaatgggtgtacgggtc 13792585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3672755 - 3672719
Alignment:
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3672755 attttattcgatgtgggacatataactcatacttgca 3672719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 44290838 - 44290991
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290838 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 44290937  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290938 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 44290472 - 44290624
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44290472 tcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaa 44290571  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44290572 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 44290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 41759624 - 41759473
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |    
T  41759624 aggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttacttataaggtgttcaactt 41759525  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41759524 ttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 41759473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 3537613 - 3537766
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3537613 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttataggtcctcttactcataaggtgttcaa 3537712  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  3537713 cctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacgtacaaaccaacaa 3537766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41142517 - 41142372
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41142517 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaggtgttca 41142418  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41142417 acctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41142372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41157519 - 41157375
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157519 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 41157420  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157419 cttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 41157375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 26661536 - 26661678
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26661536 tcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaa 26661635  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26661636 cctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 26661678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41157135 - 41156991
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41157135 tcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 41157036  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  41157035 cctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttgca 41156991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 48588502 - 48588654
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48588502 tcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttataaggtgttcaa 48588601  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48588602 cctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttgcaaaccaaca 48588654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 23 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3550842 - 3550711
Alignment:
Q  23 agcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgt 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3550842 agcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgt 3550743  T
Q  123 gggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3550742 gggacatataactcacacttgccaaccaacaa 3550711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37556255 - 37556113
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  37556255 tcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatgttcaa 37556157  T
Q  101 cctttacta-ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37556156 cctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37556113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 29798343 - 29798199
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29798343 tcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 29798244  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  29798243 cctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 29798199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 19 - 151
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594880
Alignment:
Q  19 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 118  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  119 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacacttgcaaaccaa 32594880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 17294722 - 17294579
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaacca-cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17294722 tcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttca 17294623  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17294622 acctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 17294579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34364651 - 34364507
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  34364651 tcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctcttacttataaggtgttcaa 34364552  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364551 cctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 34364507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 34365069 - 34364925
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||| ||||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34365069 tcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 34364970  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34364969 cctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 34364925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 40082550 - 40082408
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  40082550 tcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatga-tcctcttacttataaggtgttcaa 40082452  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40082451 cctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgc 40082408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 5319981 - 5320123
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  5319981 gaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaact 5320080  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5320081 tttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 5320123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804516
Alignment:
Q  2 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  102 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 148  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaac 38804516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 143
Target Start/End: Original strand, 26661921 - 26662054
Alignment:
Q  10 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||     
T  26661921 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactc 26662020  T
Q  110 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26662021 ttttatctgatatgggatatataactcacacttg 26662054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 31767175 - 31767319
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31767175 tcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 31767274  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31767275 cctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttgca 31767319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 50052038 - 50052189
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50052038 tcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaaataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaa 50052136  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  50052137 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttaaaaaccaaca 50052189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 14319009 - 14318875
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14319009 gaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacc 14318910  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  14318909 tttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34649582 - 34649440
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||   |||||||||||||||||    
T  34649582 tcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcacttataaggtgttcaa 34649483  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34649482 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34649440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 45493988 - 45494145
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa----ggtgt 96  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||     |||||    
T  45493988 tcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggatcatcttacttatatatatggtgt 45494087  T
Q  97 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-aactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45494088 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttgcaaaccaaca 45494145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 9956053 - 9955911
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt-atgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  9956053 tcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttca 9955954  T
Q  100 acctttac-tattttatccgatgtgggacatataactcacact 141  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9955953 acctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11977424 - 11977282
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  11977424 tcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttacttataaggtgttcaa 11977325  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11977324 catttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttg 11977282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 32168712 - 32168853
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||    
T  32168712 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaa 32168805  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32168806 cctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32168853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37555873 - 37555733
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||  ||||||||||||||||| || |||||    
T  37555873 tcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgtattcaa 37555775  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37555774 ccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 3875345 - 3875489
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||    
T  3875345 tcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgtacaa 3875444  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  3875445 cctttacttttttatccgatgtgtgacatataactgactcttgca 3875489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 39066217 - 39066358
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  39066217 aggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagttataaggtgttcaacct 39066316  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39066317 ttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttgca 39066358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45084520 - 45084382
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45084520 tcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaagacg------ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 45084427  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45084426 cctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttgca 45084382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22077509 - 22077653
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| ||| |||||||| || |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077509 tcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 22077608  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22077609 cctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 22077653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 24600328 - 24600472
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||    
T  24600328 tcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataatatgttcaa 24600427  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24600428 cctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 24600472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 66488 - 66630
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  66488 gaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacc 66587  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66588 tttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttgca 66630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 37850614 - 37850758
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||  || | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37850614 tcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacattaggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaa 37850713  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37850714 cctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 37850758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 3537226 - 3537313
Alignment:
Q  66 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3537226 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3537313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 145
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184583
Alignment:
Q  51 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 41184583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043943
Alignment:
Q  25 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct------ttactattttatccg 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |      |||||||||||| ||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttactattactattttattcg 44043909  T
Q  119 atgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  44043910 atgtgggacatataact-acacttgcaaaccaaca 44043943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 24132002 - 24132143
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  24132002 tcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggcaatgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaa 24132098  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24132099 cctttacttttctatccgatgagggacatataactcacagttgca 24132143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 3 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 22793421 - 22793279
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa-tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||    
T  22793421 gaggccagaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaac 22793322  T
Q  102 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    || |||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22793321 ctctacttttctatacgatgtgggacatataactcacacttgc 22793279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 66103 - 66247
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc-a 99  Q
    ||||||| |||||||||| |||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66103 tcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 66200  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacat-ataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  66201 acctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttgca 66247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 5575246 - 5575110
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| || |||  |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5575246 tcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggtgttcaa 5575149  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  5575148 cctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 30630652 - 30630796
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||| |||||||||||| |||  | || ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  ||    
T  30630652 tcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgtcaaa 30630751  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30630752 cctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgca 30630796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45839775 - 45839629
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc-- 98  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||||      
T  45839775 tcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgttcga 45839676  T
Q  99 ---aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
       |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45839675 ttcaacctttatt-ttctatccgatgtgggacatataactcatacttg 45839629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 5528768 - 5528902
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||| || ||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||    
T  5528768 tcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagatgttcaa 5528867  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataact 135  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  5528868 cctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 19283472 - 19283613
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| | ||| || ||| |||||||    
T  19283472 aggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgatgagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacct 19283571  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
      ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19283572 ccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttgca 19283613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 22077124 - 22077243
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||| || |||  || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22077124 tcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtattcaa 22077223  T
Q  101 cctttactattttatccgat 120  Q
    |||||||| || ||||||||    
T  22077224 cctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44685564 - 44685456
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa-cctttactattttatccgatgtgggacatataact 135  Q
    |||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  44685564 cacactgttacccaaa-cattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataact 44685466  T
Q  136 cacacttgca 145  Q
    ||||||||||    
T  44685465 cacacttgca 44685456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Original strand, 22077871 - 22077986
Alignment:
Q  29 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 128  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||||| |   |||    
T  22077871 agagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaaca 22077969  T
Q  129 tataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||    
T  22077970 tataactcacacttgca 22077986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 64 - 145
Target Start/End: Original strand, 21378118 - 21378199
Alignment:
Q  64 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21378118 atgggtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttgca 21378199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Original strand, 1188614 - 1188746
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    |||||||| |||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||||  | ||||||||  ||| ||     
T  1188614 caaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttc 1188713  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1188714 tatccgatatggaacatataactcacacttgca 1188746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 11977088 - 11977015
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 74  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  11977088 tcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatg 11977015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 1187404 - 1187522
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||| ||    
T  1187404 agagagacgtcacacttttactcaaaatcttaaggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgaga 1187503  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  1187504 catataattcacacttgca 1187522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 4956319 - 4956218
Alignment:
Q  19 cacaagcaagagagacac--cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatc 116  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||| ||||| ||||| |||  |||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  4956319 cacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatgttcaacctttacttttctatc 4956220  T
Q  117 cg 118  Q
    ||    
T  4956219 cg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 50051703 - 50051776
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 75  Q
    |||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  50051703 tcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaagataatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 153
Target Start/End: Original strand, 50051777 - 50051817
Alignment:
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50051777 tatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 50051817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 98 - 145
Target Start/End: Original strand, 35154150 - 35154197
Alignment:
Q  98 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35154150 caacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 35154197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 145
Target Start/End: Original strand, 50469180 - 50469239
Alignment:
Q  86 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50469180 ttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttgca 50469239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 4878869 - 4878803
Alignment:
Q  79 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||| ||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4878869 ctctcacttataaaatgttcaagcttcactattttatccgatgtggaacatataactcacaattgca 4878803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 96
Target Start/End: Original strand, 41184152 - 41184197
Alignment:
Q  51 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  41184152 aaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaagtgt 41184197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 44092038 - 44091909
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||| |||||||| | |||||  ||| |||| ||||||||||||||| || |||||   | | | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  44092038 tcgaggccagaacaacaaaacaagtgagaaagacgccacactcttacccacaatcttaaaatattagatttatgggttctctcacttataaagtgttcaa 44091939  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacata 130  Q
    |||||||| ||  ||| |||||| ||||||    
T  44091938 cctttacttttacatctgatgtgtgacata 44091909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 35154046 - 35154106
Alignment:
Q  30 gagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 90  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  35154046 gagacaccacactcttgccaaaaaccttaagacaatcagtttatgggccctcttacttata 35154106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 153
Target Start/End: Original strand, 4266875 - 4266948
Alignment:
Q  80 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4266875 tcttacttctaatgtgttcaacatttactcttttatctaatgtaggacatataactcacatttgtaaaacaaca 4266948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 5996890 - 5997029
Alignment:
Q  5 ggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 104  Q
    ||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| | ||||| |||||| | ||||||  ||||||| |      
T  5996890 ggctagagcaaccacacaaatgagagagacaccacactctcactcaaaaccttaa-acaatggatatatggatcctctcatttataaaatgttcaagcac 5996988  T
Q  105 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
     ||| || || |  |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5996989 cacttttctaacttatgtgggacatataacccacgcttgca 5997029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 12466401 - 12466365
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 63  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12466401 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 12466365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Original strand, 22077248 - 22077280
Alignment:
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077248 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 22077280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 77 - 136
Target Start/End: Original strand, 30630912 - 30630972
Alignment:
Q  77 tcctcttacttataaggtgttcaaccttt-actattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||  ||||||||||||    
T  30630912 tcctcttacttataaggtgttcagcctttaatttttttatccgatgtaagacatataactc 30630972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 145
Target Start/End: Original strand, 47379891 - 47379943
Alignment:
Q  93 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  47379891 gtgttcaacctccacttttctatccgatgtgggatatataactcacacttgca 47379943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Original strand, 21378075 - 21378118
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  21378075 gaggctagaacaaccacacaagcaatatagacgccacactctta 21378118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 72
Target Start/End: Original strand, 9956212 - 9956258
Alignment:
Q  26 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttta 72  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  9956212 aagagagacatcacactcttacccaaaacattaagacaatgtgttta 9956258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 74
Target Start/End: Original strand, 47380184 - 47380254
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 74  Q
    ||||| || |||||| |||||  |||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  47380184 aggcttgagcaaccagacaagtgagagagatgtcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Original strand, 31973375 - 31973411
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 63  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  31973375 agagagacatcacactcttacccaaaatcttaaggca 31973411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 50556587 - 50556451
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||| |||| ||| |||  ||||||||||||  ||| |||||| || | |||| ||||||||  ||||||||||   ||    
T  50556587 agaacaatcacacaagtgagagagataccaaacttttattcaaaaccttaagaaaataggtttacggattctctcacttataaattgttcaacctccgct 50556488  T
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
     || |||  |||||| || ||||||| ||||||||||    
T  50556487 tttctatatgatgtgtgatatataacccacacttgca 50556451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 78)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3669831 - 3669679
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3669831 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 3669732  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3669731 cctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3669679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3670204 - 3670052
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  3670204 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgggtcctcatacttataaggtgttaaa 3670105  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3670104 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 3670052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 30441229 - 30441073
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta----taaggtgt 96  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    ||||||||    
T  30441229 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggccctcttacttataattaaggtgt 30441130  T
Q  97 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30441129 tcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 30441073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 3038304 - 3038446
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  3038304 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaagtgttcaa 3038403  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3038404 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3038446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34835020 - 34834878
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  34835020 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggtgtttaa 34834921  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34834920 cctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 34834878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34835353 - 34835211
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34835353 tcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 34835254  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34835253 cctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttg 34835211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 45122071 - 45122215
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  45122071 tcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaa 45122170  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45122171 cctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 45122215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 1014259 - 1014413
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1014259 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggtgttcaa 1014358  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1014359 cctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 1014413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 20870594 - 20870742
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20870594 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttac 20870693  T
Q  108 tattttatccgatgtgggac--atataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    ||||||||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20870694 tattttatctgatgtggaacatatataactcacacttgcaaaccaacaa 20870742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 6 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 147590 - 147454
Alignment:
Q  6 gctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 105  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  147590 gctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaaccttt 147491  T
Q  106 actattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  147490 actcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 147454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 1013885 - 1014037
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1013885 tcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggtgttcaa 1013984  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1013985 cttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgcaaaccaaca 1014037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 7 - 143
Target Start/End: Original strand, 33113387 - 33113523
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33113387 ctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagacgttcaaccttta 33113486  T
Q  107 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  33113487 ctattttatccgatgtaggacatataactcaaacttg 33113523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9608889 - 9608745
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9608889 tcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaa 9608790  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9608789 cctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 9608745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30359413 - 30359273
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  30359413 gaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgcttataaggtgttcaaca 30359314  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30359313 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 30359273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40518724 - 40518584
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40518724 gaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaacc 40518625  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40518624 tttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 25561829 - 25561972
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561829 tcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 25561928  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25561929 acgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25561972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34835619 - 34835476
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34835619 tcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttaaa 34835520  T
Q  101 cctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835519 cctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34835885 - 34835742
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34835885 tcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttaaa 34835786  T
Q  101 cctttactattttatc-cgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||    
T  34835785 cctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttg 34835742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 37544504 - 37544646
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  37544504 tcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaatggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaa 37544603  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37544604 cctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttg 37544646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40518212 - 40518071
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40518212 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttacttataaggtgttcaacct 40518113  T
Q  104 ttac--tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  40518112 ttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45122768 - 45122638
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122768 tcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 45122669  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatat 131  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  45122668 cctttactattttatccgatgcgggccatat 45122638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 6876876 - 6877021
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6876876 tcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatttataaggtgttcaa 6876975  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggac-atataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6876976 cctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttgca 6877021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 9482618 - 9482755
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9482618 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 9482717  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    |||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9482718 cctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 45121924 - 45122068
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  45121924 tcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaa 45122023  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122024 cctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttgca 45122068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 138
Target Start/End: Original strand, 70290 - 70425
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  70290 gaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaaca 70389  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  70390 tttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 9483201 - 9483320
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9483201 tcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 9483300  T
Q  101 cctttactattttatccgat 120  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  9483301 cctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9309498 - 9309355
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9309498 tcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaa 9309400  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9309399 catttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 9309355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41972303 - 41972158
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa---aaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||| ||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  41972303 gaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcacttataaggtgttca 41972204  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41972203 acctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 41972158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 1513929 - 1514071
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| |||| |||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1513929 tcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttacttataaggtgttcaa 1514028  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  1514029 cctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttg 1514071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 40579520 - 40579670
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40579520 tcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 40579619  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 151  Q
    ||||||||||||||||| || ||  |||||||| ||||||||| |||||||    
T  40579620 cctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttggaaaccaa 40579670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5420795 - 5420651
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||  || |||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5420795 tcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaa 5420696  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5420695 cctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttgca 5420651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 135
Target Start/End: Original strand, 18372010 - 18372142
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18372010 gaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacc 18372109  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataact 135  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18372110 tttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30359746 - 30359611
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 107  Q
    |||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30359746 tagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttac 30359647  T
Q  108 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30359646 tcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 30359611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6732039 - 6731896
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||         |||||    
T  6732039 tcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttact---------ttcaa 6731949  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6731948 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaacaaca 6731896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 8918778 - 8918922
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8918778 tcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcaataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaa 8918877  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |  |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  8918878 cctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttgca 8918922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5916011 - 5915872
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||||| ||    
T  5916011 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctta----taaagtgttaaa 5915916  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  5915915 c-tttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttgca 5915872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 32640546 - 32640682
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||     |||||||    
T  32640546 tcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgttcaa 32640640  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  32640641 cctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 8 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45123143 - 45123006
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttt 105  Q
    |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  45123143 tagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatcttactta--aggtgtttaaccttt 45123046  T
Q  106 actattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45123045 actattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 45123006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 45121670 - 45121811
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  45121670 tcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataaggtgatcaa 45121769  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  45121770 cctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttg 45121811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 18380033 - 18380171
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| ||||||| || | ||||||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18380033 tcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttacttataaggtgttcaa 18380130  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 141  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18380131 cctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9309125 - 9308977
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacact---cttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 97  Q
    |||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  9309125 tcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataacatgtt 9309027  T
Q  98 caacctttactattttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  9309026 caacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttgca 9308977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 147962 - 147829
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||         ||||| | ||||||||     
T  147962 gaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgttcaaca 147872  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  147871 tttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttgca 147829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 4154685 - 4154824
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||| ||| |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  4154685 aggccagagcaaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacct 4154782  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
      ||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4154783 ccacttttctatcagatgtgggacatataactcacacttgca 4154824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 107  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  108 tattttatccgatgt 122  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 156
Target Start/End: Original strand, 41416251 - 41416338
Alignment:
Q  67 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaat 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  41416251 ggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact--cacttgcaaaccaacaaat 41416338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 6651638 - 6651510
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||         | |||||    
T  6651638 tcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctctta---------ttttcaa 6651548  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6651547 cctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 18371675 - 18371807
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| |||||| ||||| |||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     |||||||    
T  18371675 tcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggca-tgggtttatgggtcttcttacttaa----tgttcaa 18371769  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371770 cctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 32305591 - 32305478
Alignment:
Q  31 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacata 130  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||    
T  32305591 agacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcc-------gacata 32305499  T
Q  131 taactcacacttgcaaaccaa 151  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  32305498 taactcacacttgcaaaccaa 32305478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 142
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274934
Alignment:
Q  32 gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  132 aactcacactt 142  Q
    |||||||||||    
T  43274924 aactcacactt 43274934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794113
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||||||||| ||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  127 catataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  8794129 catataactcacacttg 8794113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9507926 - 9507777
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||||| | |||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9507926 tcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtattcaa 9507827  T
Q  101 cctttact---attttatccgatgtg--ggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||    |||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  9507826 cctttactgtacttttatccaatatggaggagatataactcacacttgca 9507777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 41 - 141
Target Start/End: Original strand, 18372988 - 18373085
Alignment:
Q  41 ctcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18372988 ctcttacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacac 18373084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  73 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 143
Target Start/End: Original strand, 18372656 - 18372758
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||    
T  18372656 cacactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatc 18372751  T
Q  137 acacttg 143  Q
    |||||||    
T  18372752 acacttg 18372758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 12284014 - 12283873
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  || ||||||| ||| | |||||| |||| | ||||||     
T  12284014 gaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagatattcaaca 12283916  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||    
T  12283915 tttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttgca 12283873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 142
Target Start/End: Original strand, 18372342 - 18372411
Alignment:
Q  73 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372342 tgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 55 - 142
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  55 cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac--atataactcacactt 142  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 40579283 - 40579352
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt 70  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  40579283 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatgggtt 40579352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 72 - 135
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  72 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154438
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| || |||| ||||| |||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatgggt-ctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  4154420 catataactcacatttgca 4154438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Original strand, 9620704 - 9620834
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    ||||||||||||  ||||||||| || |||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| | |||| ||     
T  9620704 caaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttc 9620801  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  9620802 tatctgttgtgagacatataactcacacttgca 9620834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 43398082 - 43398225
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctc---ttacttataaggtgtt 97  Q
    |||||| |||| ||||| ||| || || ||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||||    
T  43398082 tcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataaggtgtt 43398181  T
Q  98 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacact 141  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  43398182 caacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  40 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 8919158 - 8919220
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 63  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8919158 tcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274775
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    |||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||| ||  | |||||| ||||||||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||| | |||| | |||||||||||| |||||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatacttgca 5274775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 41129132 - 41129066
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 67  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  41129132 tcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatgg 41129066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 68
Target Start/End: Original strand, 20995433 - 20995497
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggg 68  Q
    |||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20995433 aggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatggg 20995497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 16524503 - 16524446
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 64  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  16524503 ctagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 142
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 109
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373292
Alignment:
Q  53 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 109  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttacta 18373292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 40991852 - 40991756
Alignment:
Q  46 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||| || ||  | ||||||||| | ||||||||||||    
T  40991852 acccaaaaccttgaggcattgggtttatgggtcctctcacttatgaagtgttcaacctccacttttctaagcaatgtgggacttctaactcacactt 40991756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 91
Target Start/End: Original strand, 40417733 - 40417820
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 91  Q
    |||| ||| ||| ||||||||  |||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||    
T  40417733 aggcaagagcaatcacacaagtgagagagacaccacacttttatccaaaatcttaacgcaatggatttacgagtcatcttacttataa 40417820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 37 - 74
Target Start/End: Original strand, 12156708 - 12156745
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 74  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12156708 cacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatg 12156745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 88 - 145
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995559
Alignment:
Q  88 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 20995559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 33832055 - 33831978
Alignment:
Q  68 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || | | | | ||| |||||||||||||||||||||    
T  33832055 gtttataggtcctcttacttataaagtgttcaacttctacttttctcttcaacgtgagacatataactcacacttgca 33831978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 43274649 - 43274699
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaa 51  Q
    |||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  43274649 tcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 46 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442911
Alignment:
Q  46 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 87  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctctcactt 11442911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645745
Alignment:
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttgca 18645745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 1085630 - 1085774
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1085630 tcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaa 1085729  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1085730 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1085774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7517724 - 7517580
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517724 tcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 7517625  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517624 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 7517580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 37533025 - 37533176
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533025 tcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacact-ttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 37533123  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533124 cctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 37533176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 23391 - 23535
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23391 tcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 23490  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23491 cctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgca 23535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 29157703 - 29157559
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 106  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29157703 ctagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaaccttta 29157604  T
Q  107 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 151  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29157603 ctattttatccggtgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 29157559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30244414 - 30244272
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30244414 tcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtcttcaa 30244315  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30244314 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 30244272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554025
Alignment:
Q  16 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 115  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  116 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttgca 7554025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 11845335 - 11845198
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11845335 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 11845236  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11845235 cctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 37533378 - 37533530
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37533378 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 37533477  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||| | |||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37533478 cctttactattttattcaatgtagaacatataactcacacttacaaatcaaca 37533530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45754859 - 45754718
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  45754859 tcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgttcaa 45754760  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45754759 catttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttg 45754718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 19122875 - 19122740
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19122875 tcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 19122776  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19122775 cctttactattttatccgatgt-ggacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 36939747 - 36939891
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36939747 tcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 36939846  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36939847 cttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttgca 36939891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 40094788 - 40094932
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40094788 tcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttgaa 40094887  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40094888 cctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttgca 40094932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6054701 - 6054562
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6054701 aggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacat 6054602  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6054601 ttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttg 6054562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45433385 - 45433243
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  45433385 tcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatgagttctcttacttataaggtgttcaa 45433286  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45433285 cctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttg 45433243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22567053 - 22567196
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22567053 tcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 22567152  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  22567153 cctttactcttttatccgatgt-ggacatattactcacacttgca 22567196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 14681649 - 14681502
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||||||||||  |   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14681649 aggctagaacaaccacacttgt--gagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttacaaggtgttcaacct 14681552  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14681551 ttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaaca 14681502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45434780 - 45434638
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45434780 tcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 45434681  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45434680 cctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 45434638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 30245217 - 30245079
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30245217 tcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaa 30245122  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30245121 cctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttg 30245079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 24177579 - 24177435
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  24177579 tcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataaggtgttcag 24177480  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24177479 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttgca 24177435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 145
Target Start/End: Original strand, 22566702 - 22566820
Alignment:
Q  26 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 125  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22566702 aagagagac-ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggg 22566800  T
Q  126 acatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  22566801 acatattactcacacttgca 22566820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 34218048 - 34218186
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  34218048 tcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaa 34218147  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34218148 catttacttttttatccgatgtgagacatataactcaca 34218186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 47129237 - 47129097
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  47129237 gaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcgatgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacc 47129138  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47129137 tttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 47129097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 8128455 - 8128599
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8128455 tcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttacatataaggtgttcaa 8128554  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8128555 cctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttgca 8128599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569196
Alignment:
Q  25 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  125 gacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttgca 16569196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596466
Alignment:
Q  25 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 124  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||     
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  125 gacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttgca 16596466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 145
Target Start/End: Original strand, 118318 - 118459
Alignment:
Q  6 gctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  118318 gctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatggatcctcttacttattaggtgttcaacct 118417  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  118418 ttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttgca 118459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 9901786 - 9901648
Alignment:
Q  2 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||    
T  9901786 cgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgtataagatgttcaac 9901688  T
Q  102 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9901687 ctttactgttttatccgatgt-ggacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 9 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 36623096 - 36622960
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||  |||| ||||||||||    
T  36623096 agaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttact 36622997  T
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36622996 attttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36622960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 142
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838857
Alignment:
Q  10 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc-tcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
     |||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacactt 24838857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 30032711 - 30032572
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  30032711 tcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttacttataaggtgttcaa 30032612  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    |  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30032611 cacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacac 30032572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 40230307 - 40230449
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||| ||||| ||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  40230307 gaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaact 40230406  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40230407 tttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttgca 40230449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085407
Alignment:
Q  19 cacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 118  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  119 atgtgggacat-ataactcacacttgca 145  Q
    || |||||||| | ||||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttgca 1085407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 20599450 - 20599317
Alignment:
Q  11 aacaaccacacaagcaagagagacaccacactct--tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||    
T  20599450 aacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttatttataaagtgtttatcctttact 20599351  T
Q  109 attttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20599350 tttttatccgatatgggacatataactcacactt 20599317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 36534825 - 36534942
Alignment:
Q  28 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggac 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||    
T  36534825 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatccgaggtgggac 36534924  T
Q  128 atataactcacacttgca 145  Q
    |||||| | |||||||||    
T  36534925 atataagttacacttgca 36534942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41854776 - 41854635
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||    
T  41854776 gaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgcttataaggtgttcaacc 41854677  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||    
T  41854676 tttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttgca 41854635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 24 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241495
Alignment:
Q  24 gcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 123  Q
    |||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  124 ggacatataactcacacttgca 145  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttgca 43241495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 30253632 - 30253534
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  30253632 tcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaa 30253537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 145
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301701
Alignment:
Q  57 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 28301701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 37167925 - 37167808
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||       |||||||    
T  37167925 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctcttact------ctgttcaa 37167832  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgg 124  Q
    | |||||||||||||| |||||||    
T  37167831 catttactattttatctgatgtgg 37167808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 50 - 142
Target Start/End: Original strand, 41910657 - 41910749
Alignment:
Q  50 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41910657 aaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctcagttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 28300267 - 28300366
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-gggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    |||||||  ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  28300267 tcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatggggttctcttacttataaggtgttca 28300366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30245567 - 30245494
Alignment:
Q  72 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30245567 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgca 30245494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30255412 - 30255339
Alignment:
Q  72 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30255412 atgggccctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttgca 30255339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 30244771 - 30244701
Alignment:
Q  75 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30244771 ggtcctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 30244701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 77 - 145
Target Start/End: Original strand, 36109007 - 36109075
Alignment:
Q  77 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  36109007 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttgca 36109075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 47129513 - 47129450
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 64  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129513 tcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 40 - 140
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  40 actcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 28300582 - 28300644
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctta-cccaaaaccttaaggc 62  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28300582 tcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416232
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 21416232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 76
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  28 gagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 76  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Original strand, 37532765 - 37532821
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt 57  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37532765 tcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124246
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||  | | || || ||||||| |||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacctcaaattttctaaccgatgtagga 4124227  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    ||| ||| ||||| |||||    
T  4124228 catgtaattcacagttgca 4124246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 14681324 - 14681281
Alignment:
Q  108 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14681324 tattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaa 14681281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 145
Target Start/End: Original strand, 40094502 - 40094552
Alignment:
Q  95 gttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40094502 gttcaacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttgca 40094552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Original strand, 21619091 - 21619136
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21619091 acaccacacttttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 21619136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 45755071 - 45755010
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 62  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45755071 tcgaggcttgaacaaccacacaagtaagggagacaccacacttttacccaaaattttaaggc 45755010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 77
Target Start/End: Original strand, 40094431 - 40094503
Alignment:
Q  5 ggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  40094431 ggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggt 40094503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 143
Target Start/End: Original strand, 36967335 - 36967385
Alignment:
Q  93 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36967335 gtgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 36967385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 37346036 - 37345916
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||| |||||  ||| || |||| ||| |  ||    
T  37346036 agagagacgtcacactcttactcaaaactttaaggcaatatgtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttctatcagatatatga 37345937  T
Q  127 c--atataactcacacttgca 145  Q
    |  ||||||||||||||||||    
T  37345936 catatataactcacacttgca 37345916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 27391815 - 27391859
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  27391815 acaccacactcttacctaaaaccttaaggcagtggatttatgggt 27391859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 30244496 - 30244453
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 44  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30244496 tcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30244453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 30253714 - 30253671
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 44  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30253714 tcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30253671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 9 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15902436 - 15902342
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | ||||| ||  | | |||||||| |||||||||||    
T  15902436 agaacaatcacacaagtgagagcgacaccacacttttatccaaaaccttaagacaacgagcttatgtgtgatttcacttataaagtgttcaacct 15902342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 30245297 - 30245256
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct 44  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  30245297 gaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactct 30245256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 50
Target Start/End: Original strand, 4719311 - 4719359
Alignment:
Q  2 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccca 50  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  4719311 cgaggctagagcaaccgcacaaacaagagaaataccacactcttaccca 4719359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 27598092 - 27598052
Alignment:
Q  38 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  27598092 acactcttacgcaaaaccctaagacaatgggtttatgggtc 27598052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 78)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6500594 - 6500443
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  6500594 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaaaggtcctcttacttataaggtgttcaa 6500495  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500494 cctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 40296329 - 40296473
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296329 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 40296428  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40296429 ccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 40296473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 18603134 - 18603288
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18603134 tcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 18603233  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  18603234 cctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgaaaactaacaaa 18603288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 41170777 - 41170627
Alignment:
Q  2 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41170777 cgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaac 41170678  T
Q  102 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaac 152  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  41170677 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattacaaaccaac 41170627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32487537 - 32487386
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32487537 tcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttat-aggtgttcaa 32487439  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32487438 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 32487386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 27502050 - 27502203
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27502050 tcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaaggcaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaa 27502149  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27502150 cctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 27502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 13415774 - 13415918
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415774 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 13415873  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13415874 cctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 13415918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 36492231 - 36492378
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36492231 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttacttataaggtgttcaa 36492330  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 148  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36492331 cctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 36492378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 624340 - 624188
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  624340 tcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttataacgtgttcaa 624241  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  624240 cctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 624188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 3295029 - 3295172
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3295029 tcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaa 3295128  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3295129 cctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttgca 3295172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 6500966 - 6500815
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6500966 tcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtccttttatttataaggtgttcaa 6500867  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6500866 cctttactattttatccgatgt-ggacatataactcacacttgcaaaccaaca 6500815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15370243 - 15370099
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15370243 tcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttacttataagatgttcaa 15370144  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370143 cctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15370099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 3295359 - 3295498
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3295359 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 3295457  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3295458 cctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25328077 - 25327938
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25328077 gaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaact 25327978  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25327977 tttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26074756 - 26074614
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074756 tcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 26074657  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26074656 cctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 26074614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Original strand, 9498692 - 9498820
Alignment:
Q  25 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  9498692 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtga 9498791  T
Q  125 gacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9498792 gacatataactcacatttgcaaaccaaca 9498820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 11416991 - 11417128
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11416991 tcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaa 11417090  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11417091 cctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 26074160 - 26074304
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  26074160 tcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtgttcaa 26074259  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26074260 cctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 26074304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 41632926 - 41632782
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41632926 tcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 41632827  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  41632826 cctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttgca 41632782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 299633 - 299490
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  299633 tcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaa 299534  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  299533 cctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 299490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 26075175 - 26075318
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26075175 tcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 26075274  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  26075275 acctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 26075318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 42405612 - 42405752
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  42405612 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagag--acaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttacttgtaaggtgttcaa 42405709  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42405710 cctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttg 42405752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 34753039 - 34753173
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34753039 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaa 34753138  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataact 135  Q
    | |||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  34753139 cttttacttttctatccaatgtgggacatataact 34753173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 6224338 - 6224198
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6224338 gaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 6224239  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6224238 tttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttg 6224198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 12662666 - 12662810
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||    
T  12662666 tcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttacttataaaatgttcaa 12662765  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12662766 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12662810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 623960 - 623806
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| ||  ||||||| ||| ||||||||||    
T  623960 gaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttacttgtaaagtgttcaacc 623861  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaatt 157  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623860 tttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaacaaatt 623806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35150148 - 35150007
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35150148 gaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtc-tcttacttataaggtgttcaacc 35150050  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150049 ttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 35150007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 36568583 - 36568725
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||    
T  36568583 tcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttacgggtcatctcacttataaggtgttcaa 36568680  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36568681 cttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 36568725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 1028531 - 1028673
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  1028531 tcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcat 1028630  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1028631 cctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1028673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549416
Alignment:
Q  10 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacta 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  110 ttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 148  Q
    ||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttgcaaac 29549416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 155
Target Start/End: Original strand, 5723811 - 5723959
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||   || |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5723811 ctagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaactttta 5723910  T
Q  107 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5723911 ttattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 5723959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 4 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 33747912 - 33747783
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || || |||||    
T  33747912 aggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttataaagtatttaacct 33747813  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataa 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33747812 ttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074938
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactctt-acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 111  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  112 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 26074938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 15370546 - 15370428
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370546 tcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 15370447  T
Q  101 cctttactattttatccga 119  Q
    | |||||| ||| ||||||    
T  15370446 catttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 24489220 - 24489360
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||    
T  24489220 tcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttacgcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtttaa 24489317  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||| || || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24489318 ccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 38427691 - 38427553
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  38427691 tcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctct-acttataagatgttcaa 38427593  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38427592 cctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 301095 - 300961
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||        |||||||||||||||| |||||    
T  301095 tcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggcaatggatt--------ctcttacttataaggtattcaa 301004  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  301003 cctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttg 300961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 26590924 - 26591068
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26590924 tcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggtgttcaa 26591023  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||  || |||| ||| |||| ||| |||||||||||    
T  26591024 cctttacttttcgattcgatatggaacatttaaatcacacttgca 26591068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 35167852 - 35167994
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| |||||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  35167852 tcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctacttataaggtgttcaa 35167951  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||| |||||| || | |||||||| |||||    
T  35167952 cctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttg 35167994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 70 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768840
Alignment:
Q  70 ttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttgaaaaccaacaaa 7768840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 144
Target Start/End: Original strand, 36521922 - 36522053
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    |||||||||||   |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |  |||||||||||  ||| ||     
T  36521922 caaccacacaaatgagagagatgacacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttc 36522021  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36522022 tatctgatgtgggacatataactcacacttgc 36522053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2411151 - 2411010
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||  |||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  2411151 tcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttacttacaagatgttcaa 2411052  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    | ||||||  | ||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  2411051 cttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 50 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508614
Alignment:
Q  50 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttg 42508614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 35914972 - 35914852
Alignment:
Q  22 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 121  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| |||| |  ||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35914972 aagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggcaatggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatg 35914873  T
Q  122 tgggacatataactcacactt 142  Q
    || ||||||||||||| ||||    
T  35914872 tgtgacatataactcatactt 35914852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522392
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |  | | || ||||| ||||| ||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  127 catataactcacactt 142  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 26074398 - 26074320
Alignment:
Q  65 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26074398 tgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31509742 - 31509623
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 125  Q
    |||||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||||||| |    
T  31509742 agagagacactacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgag 31509643  T
Q  126 acatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31509642 acatataactcacacttgca 31509623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 142
Target Start/End: Original strand, 41635212 - 41635346
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 107  Q
    |||| |||||| ||||| || ||||| || ||||||||||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41635212 tagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagacaatggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttac 41635311  T
Q  108 tattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    | ||||||| |||| |  |||||||||||| ||||    
T  41635312 tcttttatctgatgggaaacatataactcatactt 41635346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  20 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccg 118  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  119 atgtgggacatat 131  Q
    ||||| |||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042606
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 13042606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 59
Target Start/End: Original strand, 26900034 - 26900089
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 59  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26900034 aggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39309764 - 39309686
Alignment:
Q  64 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  39309764 atgggtttatgg-tcctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 39309686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Original strand, 13786041 - 13786157
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| | |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||  |    
T  13786041 agagagacatcacactcttatccaaaatcttaagacaatagatttacgggtcatcttacttataaagtgttcaaccatcact-ttttatccgatgtgaaa 13786139  T
Q  127 cat-ataactcacacttg 143  Q
    ||| || |||||||||||    
T  13786140 cataattactcacacttg 13786157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 61  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 7 - 74
Target Start/End: Original strand, 9498343 - 9498410
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 74  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  9498343 ctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 88
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527196
Alignment:
Q  9 agaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 88  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatggatcctctcactta 36527196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 38427363 - 38427306
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctta 58  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  38427363 tcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 50 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524719
Alignment:
Q  50 aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| || |||||| |||||| ||||||||| | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttg 42524719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 32446003 - 32445943
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 87  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  32446003 agagagacaccacactttaacccaaaaccttaaggcgttgggtttatgggtcctctcactt 32445943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 13112651 - 13112604
Alignment:
Q  31 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13112651 agacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtc 13112604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 6225104 - 6225047
Alignment:
Q  85 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  6225104 cttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 105 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 5660338 - 5660290
Alignment:
Q  105 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  5660338 tactattttattcgatgtggaacatataactcacatttgcaaaccaaca 5660290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 20 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 19275653 - 19275566
Alignment:
Q  20 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttact 108  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||    
T  19275653 acaagcgagacagacgccacaatcttacccaaaatcttaagacaatgaatttatgggtcttcttccttataa-gtgttcaacctctact 19275566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13042822 - 13042784
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 65  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13042822 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 13112820 - 13112782
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 65  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13112820 agagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaat 13112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150747
Alignment:
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35150747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151038
Alignment:
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 35151038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 87
Target Start/End: Original strand, 13785653 - 13785732
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 87  Q
    ||||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||    
T  13785653 tagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaaggttatgggtttatagatcctattactt 13785732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 154
Target Start/End: Original strand, 22298956 - 22299015
Alignment:
Q  96 ttcaacctttactatttt-atccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22298956 ttcaacctttattatttttatctgatgtgagacatataacccacacatgcaaaccaacaa 22299015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Original strand, 36389016 - 36389067
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||    
T  36389016 agagaaacaccacactctgacccaaaaccctaaggcactgagtttatgggtc 36389067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 5963795 - 5963765
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5963795 acaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5963765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Original strand, 9510546 - 9510624
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 91  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | | | ||||| ||||  |||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9510546 caaccacacaagtaagagagacactatatttttacctaaaattttaaggcattaggtttatggctcctctcacttataa 9510624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 24489625 - 24489583
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactc 43  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  24489625 tcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactc 24489583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 11 - 47
Target Start/End: Original strand, 795152 - 795189
Alignment:
Q  11 aacaaccacacaa-gcaagagagacaccacactcttac 47  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  795152 aacaaccacacaaagcaagagagacaccacactcttac 795189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 34103666 - 34103625
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 74  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  34103666 acaccacactcttattcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 34103625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 5660392 - 5660340
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacc 55  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||| ||||||||    
T  5660392 gaggctagaacaaccacacaaacaagaaaaacaccatacttttatccaaaacc 5660340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 142
Target Start/End: Original strand, 13785732 - 13785764
Alignment:
Q  110 ttttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13785732 ttttatccgatttgggacatataactcacactt 13785764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 41341567 - 41341523
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  41341567 acaccacattcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtgtatgggt 41341523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 101)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 25483480 - 25483336
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  25483480 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagatgttcaa 25483381  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25483380 cctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgca 25483336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 50630767 - 50630919
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50630767 tcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaa 50630866  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50630867 cctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttgcaaaccaaca 50630919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 41370501 - 41370348
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41370501 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggttttcaa 41370402  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41370401 catttactattttatccgatttgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 41370348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 55933136 - 55933290
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933136 tcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 55933235  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55933236 cccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 55933290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36629381 - 36629239
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36629381 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaa 36629282  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36629281 cttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 54017607 - 54017751
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  54017607 tcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaa 54017706  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  54017707 cctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttgca 54017751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52884840 - 52884695
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  52884840 tcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtgttca 52884741  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884740 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 50002570 - 50002423
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  50002570 tcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttaaaaagtgttcaa 50002471  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaac 148  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50002470 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaac 50002423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 1731661 - 1731803
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  1731661 gaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttatttataagatgttcaacc 1731760  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1731761 tttactgttttatctgatgtgggacatataactcacatttgca 1731803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39404542 - 39404400
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39404542 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcca 39404443  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39404442 cctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 39404400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 49880297 - 49880152
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 106  Q
    |||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880297 ctagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 49880199  T
Q  107 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49880198 ctattttattcaatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 49880152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 54109056 - 54108928
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54109056 tcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 54108958  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacata 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54108957 cctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3340951 - 3340807
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3340951 tcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgctcaa 3340852  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3340851 cctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttgca 3340807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10246063 - 10245920
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10246063 tcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttatgg-tcctcttacttataaggtgttcaa 10245965  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10245964 cctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgca 10245920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 39792872 - 39793014
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  39792872 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttacggttcctctttcttataaggtgttcaa 39792971  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792972 catttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 39793014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 4 - 145
Target Start/End: Original strand, 4955332 - 4955473
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4955332 aggctagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacct 4955431  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  4955432 taactattttatccgatatgagacatataactcacacttgca 4955473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 52885034 - 52884887
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagaga--caccacactcttaccc-aaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52885034 tcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgtt 52884935  T
Q  98 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52884934 caacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 52884887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Original strand, 34646664 - 34646803
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |    
T  34646664 aggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagttataaggtgttcaacat 34646763  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34646764 ttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 34646803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 50459865 - 50459724
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  50459865 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaa 50459766  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  50459765 cctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22027973 - 22028117
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22027973 tcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggcaatatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 22028072  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22028073 cctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttgca 22028117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 36608673 - 36608817
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  36608673 tcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttacttatgaggtgttcaa 36608772  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36608773 cttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttgca 36608817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Original strand, 54343020 - 54343147
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||    
T  54343020 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttacttataaggtgttcaa 54343112  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataact 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54343113 cctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 36572163 - 36572021
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36572163 tcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttacttataaggtgttcaa 36572064  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36572063 catttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 36572021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39404162 - 39404020
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  39404162 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaa 39404063  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  39404062 cctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttg 39404020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 8 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44620490 - 44620362
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 107  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44620490 tagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttac 44620391  T
Q  108 tattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  44620390 tgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44620803 - 44620660
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44620803 tcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttatgg-tttatgggtcctcttacttataaagtgttcaa 44620705  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44620704 cctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttgca 44620660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 18932761 - 18932887
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18932761 tcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatttataaggtattcaa 18932860  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggac 127  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  18932861 cctttactattttatccgatgtaggac 18932887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  16 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  116 ccgatgtgggacata 130  Q
    |||||||||||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 54108679 - 54108537
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54108679 gaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttacttataaggtgttcaac 54108580  T
Q  102 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaa 146  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||    
T  54108579 ctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttgcaa 54108537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 54936339 - 54936215
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54936339 tcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaa 54936241  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    
T  54936240 cctttactattttatctgatgtggga 54936215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 22183276 - 22183420
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  22183276 tcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttacttataaattgttcaa 22183375  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22183376 catttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgca 22183420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 32941135 - 32941279
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||    
T  32941135 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataaggtgttcaa 32941234  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || | ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32941235 cctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttgca 32941279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 49076843 - 49076986
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  49076843 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggttatgggtttatgggttctcttac-tataaggtgttcaa 49076941  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076942 cctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttgca 49076986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 44621146 - 44621011
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44621146 tcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaa 44621047  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||    
T  44621046 cctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2740842 - 2740700
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2740842 tcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaa 2740745  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2740744 cctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 2740700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 22028383 - 22028527
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22028383 gaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttactaataaggtgttcaacc 22028482  T
Q  103 ttta--ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||   | ||||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  22028483 tttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttgca 22028527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 49303050 - 49302907
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac--ttataaggtgttc 98  Q
    |||||| |||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||    
T  49303050 tcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttttataagatgttc 49302951  T
Q  99 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  49302950 aacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20825977 - 20825842
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20825977 aggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatttataaggtgttcaacct 20825878  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20825877 ttactcttttatccgatgtggaacatataactcaca 20825842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20826361 - 20826223
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| | || ||| |||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20826361 tcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataacgtgttcaa 20826262  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826261 cttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 36 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 2741180 - 2741071
Alignment:
Q  36 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  2741180 ccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataact 2741081  T
Q  136 cacacttgca 145  Q
    ||||||||||    
T  2741080 cacacttgca 2741071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 144
Target Start/End: Original strand, 16888834 - 16888971
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaaccttta 106  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16888834 ctagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttacttataaggtattcaaccttta 16888933  T
Q  107 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16888934 cttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgc 16888971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 3244463 - 3244607
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  ||||||||  |||| ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3244463 tcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaa 3244562  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3244563 cctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttgca 3244607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 4390113 - 4390257
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||    
T  4390113 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttataaggtgttcaa 4390212  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  4390213 cctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttgca 4390257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 16889548 - 16889691
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  16889548 tcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttacttataaggtattcaa 16889647  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16889648 cctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttgc 16889691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707618
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  127 catataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttg 41707618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 22 - 153
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975620
Alignment:
Q  22 aagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 121  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  122 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    || ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  6975589 tgagacatataactcacatttgcaaactaaca 6975620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 19504840 - 19504707
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||         ||||||||    
T  19504840 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttcaa 19504750  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  19504749 cttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttg 19504707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 34004597 - 34004739
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34004597 tcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg-aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaa 34004695  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  34004696 cctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttgca 34004739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 54741194 - 54741334
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    |||||||||||||| ||||  |  ||||||| || ||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54741194 gaggctagaacaacaacacgtg--agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 54741291  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  54741292 tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgca 54741334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 23817693 - 23817783
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 91  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  23817693 tcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3341272 - 3341128
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| || || ||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  |||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3341272 tcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttacttataaagtgtttaa 3341173  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3341172 cctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgca 3341128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 43174648 - 43174508
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||| |||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43174648 aggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatgtgtcctcttacttataaggtgttcaacct 43174549  T
Q  104 ttact-attttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||  ||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  43174548 ttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttg 43174508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 132
Target Start/End: Original strand, 54017750 - 54017845
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatata 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  54017750 cacactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 45489344 - 45489485
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||  || | |||||| | || |||||||||||| |||||||||    
T  45489344 tcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttacttatatggtgttcaa 45489442  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  45489443 cctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttg 45489485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 145
Target Start/End: Original strand, 49076510 - 49076604
Alignment:
Q  51 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  49076510 aaactttaagacaatgggtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttgca 49076604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 40067181 - 40067045
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac-cttta 106  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  40067181 tagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttttta 40067082  T
Q  107 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40067081 cacttttatccgatgtagaacatataactcacacttg 40067045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 31691298 - 31691203
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga--gacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggt 94  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31691298 tcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 51768072 - 51768216
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||| | || ||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  51768072 tcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaa 51768171  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| || ||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  51768172 catttactcttatattcgatataggacatataactcacatttgca 51768216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 3700501 - 3700365
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||   ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||        ||| |||||||||||||||||||    
T  3700501 tcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagt--------ccttttacttataaggtgttcaa 3700410  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3700409 catttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 3700365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 18879950 - 18879852
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18879950 tcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttacttataaggtgttca 18879852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 28034347 - 28034229
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| |||| |||||||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||    
T  28034347 agagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcggga 28034248  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  28034247 catataattcacacttgca 28034229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43827583 - 43827480
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  43827583 tcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatttataaggagttcaa 43827485  T
Q  101 ccttt 105  Q
     ||||    
T  43827484 tcttt 43827480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 760320 - 760194
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    |||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||| | | ||     
T  760320 caaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctcacttataaagttctcaaccttcatttttc 760222  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  760221 tattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 103
Target Start/End: Original strand, 15841383 - 15841482
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||| || |||||||||||    
T  15841383 aggctagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacct 15841482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788150
Alignment:
Q  93 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaat 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttgcaaaccaacaaat 50788150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246347
Alignment:
Q  56 ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttgca 10246347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 124
Target Start/End: Original strand, 48111736 - 48111833
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 124  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48111736 agagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgaggtgg 48111833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 79 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 44620362 - 44620304
Alignment:
Q  79 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620362 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactca 44620304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 3271933 - 3271806
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaa-gagagacac-cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt---ataaggtg 95  Q
    |||||||||||||||||||| ||  || |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||||    
T  3271933 tcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacacacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctcttacttataataaggtg 3271834  T
Q  96 ttcaacctttactattttatccgatgtg 123  Q
    || ||| |||||| || |||| ||||||    
T  3271833 tttaacttttacttttctatctgatgtg 3271806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557022
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    |||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| | |||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||   |||| |||||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttgca 23557022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 79 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44621492 - 44621426
Alignment:
Q  79 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44621492 ctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttgca 44621426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197293
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 11197293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34544225 - 34544107
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 125  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| ||| |||||||  ||| || ||| ||||||| |    
T  34544225 agagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgag 34544126  T
Q  126 --acatataactcacactt 142  Q
      | |||||||||||||||    
T  34544125 atatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 45489726 - 45489864
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||       |||||| || || ||||||||||| | | |||||    
T  45489726 tcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaaactttaaggtttaaggatcatcttacttatatgatattcaa 45489825  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 139  Q
     ||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  45489826 tctttactcttttatccaatgtgatacatataactcaca 45489864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 79 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 44621011 - 44620946
Alignment:
Q  79 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatg-tgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  44621011 ctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttg 44620946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 57 - 145
Target Start/End: Original strand, 11348396 - 11348484
Alignment:
Q  57 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||  | ||||| |||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||    
T  11348396 taaggcaatgaatatatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccactattttatctgatgtagaacatataactcacaattgca 11348484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 139
Target Start/End: Original strand, 15841023 - 15841134
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||||| |||  ||| || |||| ||| |||||    
T  15841023 agagagacaatacactcttacccaaaac-ttaaagcaatgggtttatagatcctctcacttataaaatgttcagcctccacttttctatctgatatggga 15841121  T
Q  127 catataactcaca 139  Q
    ||||||| |||||    
T  15841122 catataattcaca 15841134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10396249 - 10396198
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396249 agagagacaccaccctcttacctaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 10396534 - 10396483
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10396534 agagagagaccacactcttatccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggtc 10396483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Original strand, 39698956 - 39699077
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt--aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 98  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||  || |  | || ||||||| |||||||||||| ||  |||||    
T  39698956 tcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaaaacgacacggatttatggatcctcttacttagaatatgttc 39699055  T
Q  99 aacctttactattttatccgat 120  Q
    |||||||||| || ||||||||    
T  39699056 aacctttacttttatatccgat 39699077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 43174282 - 43174233
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa 53  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  43174282 aggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 922537 - 922485
Alignment:
Q  26 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||||    
T  922537 aagagagacaccacactcttatccaaacccctaagacaatgggtttatgggtc 922485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868119
Alignment:
Q  38 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggt 1868119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 87
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706641
Alignment:
Q  29 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 87  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat-agtcctcttactt 11706641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 82
Target Start/End: Original strand, 11783568 - 11783646
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 82  Q
    |||||||| |||| | |||||| ||||| ||  |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  11783568 aggctagagcaactatacaagcgagagaaacgacacactcttacccaaaactttatggcaataggtgtatgggtcctct 11783646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 51681650 - 51681604
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcc 79  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||    
T  51681650 acaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtatatgagtcc 51681604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 18932887 - 18932924
Alignment:
Q  116 ccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18932887 ccgatgtgggacatataactcagacttgcaaaccaaca 18932924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 2891864 - 2891924
Alignment:
Q  31 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataa 91  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||    
T  2891864 agacatcacactttaacccaaaaccttaagacattaggtttatggatcctcttacttataa 2891924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 41370802 - 41370738
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 65  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  41370802 tcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 45050649 - 45050601
Alignment:
Q  97 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  45050649 tcaacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttgca 45050601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 11197054 - 11197003
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||    
T  11197054 agagagacacctcactcttacctaaaatcctaaggcaatgggtttaagggtc 11197003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 122 - 153
Target Start/End: Original strand, 18933103 - 18933134
Alignment:
Q  122 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18933103 tgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 18933134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 47 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 45484817 - 45484774
Alignment:
Q  47 cccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 90  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||    
T  45484817 cccaaaaccttaaggcattgggtttatgggttctctcacttata 45484774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 50788013 - 50788072
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgg 67  Q
    |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50788013 tagagcaaccaaataagcgacagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgg 50788072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 35
Target Start/End: Complemental strand, 19895440 - 19895406
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagaca 35  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895440 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 101
Target Start/End: Original strand, 31249896 - 31249970
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||| | | | || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31249896 agagagagaccacactttaacccaaaacttgacgtcattaggtttatgggtcctctaacttataaagtgttcaac 31249970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 69
Target Start/End: Original strand, 41707279 - 41707321
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggt 69  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  41707279 agagagataccacacttttacccaaaaccttaaggtaatgggt 41707321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 104 - 145
Target Start/End: Original strand, 11706636 - 11706677
Alignment:
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  11706636 ttacttttttatccgatgtgggacatacaactcacccttgca 11706677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 29802637 - 29802604
Alignment:
Q  49 caaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 82  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29802637 caaaaccttaaggcattgggtttatgggtcctct 29802604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 108 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41370738 - 41370693
Alignment:
Q  108 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  41370738 tattttatccgatatgggatatataactcactctttcaaaccaaca 41370693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Original strand, 34946151 - 34946187
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  34946151 agagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggca 34946187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 83)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22304713 - 22304561
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22304713 tcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttacttataaggtattcaa 22304614  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22304613 cctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttgcaaaccaaca 22304561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 3 - 143
Target Start/End: Original strand, 43346807 - 43346947
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43346807 gaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacc 43346906  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43346907 tttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 43346947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 37990653 - 37990795
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37990653 tcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 37990752  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37990753 catttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 37990795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 39934969 - 39935123
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39934969 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaa 39935068  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataa--ctcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39935069 cctttactcttttatccgatgtaggacatataactctcacacttgcaaaccaaca 39935123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 35946666 - 35946524
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946666 tcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 35946567  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35946566 cctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35946524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 37990991 - 37991133
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37990991 tcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaa 37991090  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37991091 cctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttg 37991133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15772998 - 15772854
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15772998 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 15772899  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15772898 catttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttgca 15772854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39389211 - 39389061
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||||   |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  39389211 aggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtgttcaacct 39389112  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 154  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39389111 ttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgcaaaccaacaa 39389061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 5 - 145
Target Start/End: Original strand, 12114580 - 12114720
Alignment:
Q  5 ggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 104  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12114580 ggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 12114679  T
Q  105 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12114680 tacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttgca 12114720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 29644916 - 29645060
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29644916 tcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaa 29645015  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29645016 cctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgca 29645060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 32589847 - 32589704
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32589847 tcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 32589748  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  32589747 cctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttgca 32589704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 33803266 - 33803410
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33803266 tcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttacttatatggtgttcaa 33803365  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33803366 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacaattgca 33803410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 54017830 - 54017974
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54017830 tcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 54017929  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54017930 cctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 54017974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 54018212 - 54018356
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54018212 tcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 54018311  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
     ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54018312 tctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttgca 54018356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 145
Target Start/End: Original strand, 42342404 - 42342546
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc 102  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42342404 gaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttgaacc 42342503  T
Q  103 tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42342504 tttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgca 42342546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 29644595 - 29644739
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29644595 tcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaa 29644694  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29644695 cctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttgca 29644739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 32462914 - 32463057
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  32462914 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttataaggtattcaa 32463013  T
Q  101 cc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32463014 ccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 32463057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 41359779 - 41359919
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41359779 tcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaa 41359878  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  41359879 cctttactattgtatccgatgtggg----ataactcacacttgca 41359919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 52634816 - 52634678
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  52634816 aggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttacttataaggcgttcaacct 52634718  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52634717 ttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52634678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 4823796 - 4823647
Alignment:
Q  4 aggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||||| || || |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  4823796 aggctagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaactt 4823697  T
Q  104 ttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4823696 ttactattttatccgatgtgagacttataactcacacttgcaaaccaaca 4823647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 21832359 - 21832501
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21832359 tcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgccac--tcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaa 21832456  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21832457 cctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttgca 21832501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 22303969 - 22304104
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||       |    
T  22303969 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-------a 22304061  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22304062 cctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 22304104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 25739439 - 25739583
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  25739439 tcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaa 25739538  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25739539 cttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 25739583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 50612461 - 50612620
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtt-----tatgggtcctcttacttataaggtg 95  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||  |||     |||| ||||||||||||||||||||    
T  50612461 tcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctcttacttataaggtg 50612560  T
Q  96 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 155  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50612561 ttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaa 50612620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 138
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcac 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 42342104 - 42342248
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  || ||    
T  42342104 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttataaggcattgaa 42342203  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||    
T  42342204 catttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttgca 42342248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 15773338 - 15773192
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaag--agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 98  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15773338 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttc 15773239  T
Q  99 aacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773238 aacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgca 15773192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 31190153 - 31190017
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31190153 tcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaacttataaggtgttcaa 31190062  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31190061 cctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgca 31190017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 53577507 - 53577364
Alignment:
Q  2 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaac 101  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| |||| || |||| ||||||||    
T  53577507 cgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatttttaagatgttcaac 53577408  T
Q  102 ctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  53577407 ctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttgca 53577364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 45395667 - 45395811
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  45395667 tcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttataacgtgtttaa 45395766  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45395767 cctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttgca 45395811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25755538 - 25755396
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25755538 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttacttataaggtattcaa 25755439  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  25755438 cctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 25755396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 39914396 - 39914252
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39914396 tcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgttcaa 39914297  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39914296 cctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttgca 39914252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 8328022 - 8327904
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8328022 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttctcttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtggga 8327923  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||    
T  8327922 catataactcacacttgca 8327904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 32462572 - 32462715
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  32462572 tcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagcaataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaa 32462671  T
Q  101 cc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    || |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  32462672 ccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttg 32462715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 53117989 - 53118131
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  53117989 tcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tgaatcctctcacttataaggtgttcaa 53118087  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgc 144  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  53118088 cctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgc 53118131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 3135468 - 3135617
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat--gggtcctcttac-----ttataagg 93  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||     | ||||||    
T  3135468 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggggtcctcttactaatataataagg 3135567  T
Q  94 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  3135568 tgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttg 3135617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 1634329 - 1634473
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||| | | |  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  1634329 tcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatgggtcctcttacttataatgtgtttaa 1634427  T
Q  101 cc-tttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    || |||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1634428 ccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgca 1634473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 143
Target Start/End: Original strand, 49336726 - 49336843
Alignment:
Q  26 aagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggg 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |    
T  49336726 aagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataaggtggtcaacctttacttttctatccgatgtgag 49336825  T
Q  126 acatataactcacacttg 143  Q
    |||| |||||||||||||    
T  49336826 acatgtaactcacacttg 49336843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 8 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 45901851 - 45901715
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacc-ttta 106  Q
    ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  45901851 tagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctcttacttataaggtgttcaaccttttt 45901752  T
Q  107 ctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45901751 ttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45901715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 11662095 - 11661954
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa-ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||| |||| |||||||||||    
T  11662095 tcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcacttttaaggtgttca 11661997  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11661996 acctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 8 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 51886692 - 51886553
Alignment:
Q  8 tagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 107  Q
    |||||||| |||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||      |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  51886692 tagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgggtcctcttacttatatgatgttcaacctttac 51886599  T
Q  108 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51886598 tattttattcgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 51886553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 143
Target Start/End: Original strand, 33175674 - 33175820
Alignment:
Q  2 cgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac--tcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat---gggtcctcttacttataaggtgt 96  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  33175674 cgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcacacactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttattatgggttctcttacttataaggtgt 33175773  T
Q  97 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  33175774 tcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttg 33175820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 9240293 - 9240149
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| |||| ||| |   |||||||||||||| ||||| || ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9240293 tcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcag 9240194  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    | ||||||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9240193 cttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttgca 9240149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964676
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  | |||||||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttgca 47964676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 37726640 - 37726496
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||| | ||  |||||||||| ||||||||| |||||||||| |        ||||||||||||||||| |||||    
T  37726640 tcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatggat--------cctcttacttataaggtattcaa 37726549  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726548 catttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaaccaaca 37726496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 22303673 - 22303759
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 87  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22303673 tcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 22303759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 135
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  29 agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggaca 128  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  129 tataact 135  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 119
Target Start/End: Original strand, 33362327 - 33362425
Alignment:
Q  21 caagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 119  Q
    ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33362327 caagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttattattttatccga 33362425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Original strand, 44160561 - 44160702
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||| | ||  || ||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44160561 tcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatttataaggtgttcaa 44160657  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||| | |||||||| || ||  |||||||||| |||||||||    
T  44160658 cctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttgca 44160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 38 - 153
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384432
Alignment:
Q  38 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 137  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  138 cacttgcaaaccaaca 153  Q
    | |||||| |||||||    
T  3384417 cgcttgcacaccaaca 3384432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304238
Alignment:
Q  90 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 22304238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 142
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  53 accttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 145
Target Start/End: Original strand, 39336257 - 39336387
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |   ||     
T  39336257 caaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagcaatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttc 39336354  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39336355 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 39336387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 11661638 - 11661537
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||               ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11661638 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc---------------cctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtggga 11661554  T
Q  127 catataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||    
T  11661553 catataactcacacttg 11661537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 37 - 142
Target Start/End: Original strand, 46546375 - 46546480
Alignment:
Q  37 cacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactc 136  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||  ||  ||  |||| |||| |||||||||||||    
T  46546375 cacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactc 46546474  T
Q  137 acactt 142  Q
    ||||||    
T  46546475 acactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 89 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346650
Alignment:
Q  89 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttgca 43346650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 17 - 103
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  17 cacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | | | |||||| |||||||||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 145
Target Start/End: Original strand, 47964955 - 47965073
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||   |||| |||||  ||| || ||||||||||   |    
T  47964955 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcacttatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaa 47965054  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||    
T  47965055 catataactcacacttgca 47965073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 54017562 - 54017636
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 75  Q
    ||||||| | ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54017562 tcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 12749307 - 12749211
Alignment:
Q  7 ctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacct 103  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  12749307 ctagaacaaccacataagtaagagtgagtccacactcttatcaaaaaccttaatgcaattggtttatgggtcctcacacttataaagtgttcaacct 12749211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 3 - 71
Target Start/End: Original strand, 41359507 - 41359575
Alignment:
Q  3 gaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttt 71  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41359507 gaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgggttt 41359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 52635050 - 52634990
Alignment:
Q  35 accacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 95  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52635050 accacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317161
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattt 112  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||| || ||| |||||||  ||| ||     
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctctcagttacaaagtgctcaacctccacttttc 25317191  T
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacactt 142  Q
     ||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  25317190 catctggtgtgggacacataactcacactt 25317161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 25991521 - 25991405
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||||||    
T  25991521 agagagagaccacactttaacccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtggga 25991422  T
Q  127 catataactcacacttg 143  Q
    ||||| |||||||||||    
T  25991421 catattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596027
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596342
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggtc 53596342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17732007
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 90  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 17732007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 90
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033238
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 90  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttccctttcttata 19033238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 53596593 - 53596542
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  53596593 agagagacaccacactcttacctaaaatcttaagtcaatgggtttatgggtc 53596542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 78
Target Start/End: Original strand, 48127859 - 48127906
Alignment:
Q  31 agacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  48127859 agacaccacactcttatccaaaacattaaagcaatgggtttatgggtc 48127906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 8328414 - 8328374
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacac 41  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8328414 tcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 145
Target Start/End: Original strand, 12747878 - 12747910
Alignment:
Q  113 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12747878 tatccgatgtgggacatataactcacacttgca 12747910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871049
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 16871049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 17735037 - 17735081
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  17735037 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 17735081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 77
Target Start/End: Original strand, 19036306 - 19036350
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 77  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19036306 acaccgcactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggt 19036350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 7766797 - 7766857
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 63  Q
    |||||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  7766797 tcgaggctagaacaaccatacaagt--gagagacgccacaatcttacctaaaaccttaaggca 7766857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 22304337 - 22304302
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacac 36  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304337 tcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 43978879 - 43978947
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactct----tacccaaaaccttaaggcaat 65  Q
    |||||| |||||||| ||||||||  |||||||| |||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  43978879 tcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143505
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtc 78  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggtc 16143505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 16869843 - 16869884
Alignment:
Q  33 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 74  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16869843 acaccacactcttgctcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 16869884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Original strand, 36986040 - 36986101
Alignment:
Q  79 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36986040 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 36986101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 79 - 140
Target Start/End: Original strand, 37011479 - 37011540
Alignment:
Q  79 ctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacac 140  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37011479 ctctcacttataaagttctcaaccttcacttttctattcgatgtgggacatataactcacac 37011540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 82
Target Start/End: Original strand, 50329391 - 50329427
Alignment:
Q  46 acccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctct 82  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  50329391 acccaaaaccttaaggcattggatttatgggtcctct 50329427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 528 - 670
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  528 tcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 627  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  628 cctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttg 670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Original strand, 161 - 308
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |||   |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  161 tcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atgg-tttatgg-tcctcttacttataaggtgttcaa 255  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaaca 308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 1120 - 1262
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  1120 tcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttataaggtgttcaa 1219  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1220 cctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 1262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 27 - 98
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1802
Alignment:
Q  27 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgttc 1802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 145
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3143
Alignment:
Q  94 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacctgca 3143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5541 - 5396
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctt-aaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttca 99  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5541 tcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggtgttca 5442  T
Q  100 acctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5441 acctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttgca 5396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5917 - 5777
Alignment:
Q  10 gaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-----cttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 104  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5917 gaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctt 5818  T
Q  105 tactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817 tactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttgca 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5357
Alignment:
Q  25 caagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgg 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  125 gacatataactcacacttgca 145  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttgca 5357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 5126 - 4982
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | || ||    
T  5126 tcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataagatattaaa 5027  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
    |||||||| || | ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  5026 cctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttgca 4982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 47504 - 47360
Alignment:
Q  1 tcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaa 100  Q
    |||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  47504 tcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttacttataaggtgttcaa 47405  T
Q  101 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgca 145  Q
     ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  47404 actttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttgca 47360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 29 - 145
Target Start/End: Original strand, 17496 - 17614
Alignment:
Q  29 agagacaccacactcttacccaaaa--ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggga 126  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17496 agagacaccatactcttacccaaaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtga 17595  T
Q  127 catataactcacacttgca 145  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17596 catataactcacacttgca 17614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10267
Alignment:
Q  68 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 10267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  13 caaccacacaagcaagagagacacc-acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactatt 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||   |||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaa-cttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  112 ttatccgatgtgggacatataactcacacttg 143  Q
     ||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 39963 - 39840
Alignment:
Q  20 acaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccga 119  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||| ||||||  |||||| |||  ||||||   || ||| |||||||| | || |||||   ||| || |||||||    
T  39963 acaagcgagagagacaccacatttttaaccaaaattttaaggtaataagtttatatctcatctcacttataaagagtccaaccaccacttttctatccga 39864  T
Q  120 tgtgggacatataactcacacttg 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39863 tgtgggacatataactcacacttg 39840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0807 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0807
Description:

Target: scaffold0807; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 67 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 2953 - 2863
Alignment:
Q  67 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaaccaacaaatt 157  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  | |||||  || ||||||||| |||||||| |||| |||||    
T  2953 ggtttatggatcctcttatatataaagtgttcaacctttacatttttaaacaatgtgaaacttataactcatacttgcaatccaataaatt 2863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 67 - 107
Target Start/End: Original strand, 10406 - 10446
Alignment:
Q  67 ggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 107  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10406 ggtttatggatcctcttacatataaagtgttcaacctttac 10446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 99 times since January 2019
Visitors: 6713