View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0913_high_57 (Length: 259)

Name: NF0913_high_57
Description: NF0913
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0913_high_57
NF0913_high_57
[»] chr3 (33 HSPs)
chr3 (32-259)||(31224635-31224862)
chr3 (32-259)||(15447681-15447905)
chr3 (64-259)||(31415348-31415543)
chr3 (32-174)||(11912950-11913092)
chr3 (49-183)||(6808157-6808291)
chr3 (62-258)||(49969963-49970170)
chr3 (32-169)||(1988912-1989050)
chr3 (62-169)||(20630191-20630297)
chr3 (72-169)||(49389772-49389870)
chr3 (62-169)||(18439941-18440047)
chr3 (93-174)||(40812015-40812096)
chr3 (32-208)||(12269598-12269773)
chr3 (62-174)||(12269486-12269597)
chr3 (72-174)||(5841958-5842061)
chr3 (113-208)||(18439845-18439940)
chr3 (89-174)||(30175304-30175389)
chr3 (102-174)||(40807173-40807245)
chr3 (102-174)||(22307386-22307458)
chr3 (113-184)||(1465419-1465490)
chr3 (102-174)||(17538284-17538356)
chr3 (113-208)||(49389639-49389734)
chr3 (90-174)||(1465531-1465616)
chr3 (125-154)||(12852390-12852419)
chr3 (224-259)||(1465675-1465711)
chr3 (62-169)||(12852453-12852559)
chr3 (220-252)||(15447921-15447953)
chr3 (220-259)||(17519823-17519863)
chr3 (220-259)||(17534685-17534725)
chr3 (224-259)||(22307505-22307541)
chr3 (224-259)||(30175436-30175472)
chr3 (220-252)||(31224878-31224910)
chr3 (220-252)||(31415300-31415332)
chr3 (224-259)||(41173241-41173277)
[»] chr8 (18 HSPs)
chr8 (32-259)||(21579887-21580115)
chr8 (32-259)||(29763549-29763775)
chr8 (61-259)||(41680832-41681029)
chr8 (32-174)||(42560208-42560350)
chr8 (72-183)||(32807285-32807396)
chr8 (32-224)||(18760514-18760706)
chr8 (141-248)||(22965704-22965811)
chr8 (63-169)||(27472391-27472496)
chr8 (63-169)||(38550086-38550191)
chr8 (53-259)||(39833805-39834023)
chr8 (62-169)||(1327119-1327225)
chr8 (32-131)||(3273212-3273310)
chr8 (102-174)||(39936813-39936885)
chr8 (91-169)||(20982747-20982825)
chr8 (99-170)||(21415211-21415281)
chr8 (133-259)||(6102532-6102669)
chr8 (102-150)||(19139966-19140014)
chr8 (220-252)||(21580131-21580163)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (35-259)||(36685934-36686158)
chr7 (32-259)||(30820937-30821164)
chr7 (64-259)||(38480181-38480376)
chr7 (32-183)||(11085019-11085170)
chr7 (32-183)||(11092757-11092908)
chr7 (33-174)||(15213728-15213869)
chr7 (45-183)||(9320423-9320561)
chr7 (32-166)||(15439322-15439457)
chr7 (62-259)||(8468256-8468454)
chr7 (62-259)||(14270138-14270336)
chr7 (63-259)||(45847735-45847932)
chr7 (32-169)||(37727607-37727745)
chr7 (62-174)||(17232537-17232648)
chr7 (44-174)||(11391870-11392001)
chr7 (102-174)||(12371455-12371527)
chr7 (102-174)||(13148275-13148347)
chr7 (113-208)||(9389705-9389800)
chr7 (93-174)||(8851959-8852040)
chr7 (102-174)||(11066645-11066717)
chr7 (113-208)||(17232649-17232744)
chr7 (125-154)||(39267712-39267741)
chr7 (224-259)||(59314-59350)
chr7 (132-184)||(8468472-8468524)
chr7 (224-259)||(8852087-8852123)
chr7 (224-259)||(11066562-11066598)
chr7 (102-174)||(12127967-12128039)
chr7 (224-259)||(12371372-12371408)
chr7 (62-158)||(18302100-18302194)
chr7 (220-252)||(30821180-30821212)
chr7 (105-165)||(32434396-32434456)
chr7 (224-259)||(32434511-32434547)
chr7 (220-252)||(36686174-36686206)
[»] chr5 (24 HSPs)
chr5 (32-259)||(12122202-12122429)
chr5 (32-259)||(21557726-21557953)
chr5 (32-259)||(21555060-21555288)
chr5 (34-259)||(31455634-31455862)
chr5 (32-259)||(30615700-30615926)
chr5 (34-259)||(31455021-31455249)
chr5 (91-259)||(17875158-17875326)
chr5 (45-184)||(24212387-24212526)
chr5 (45-183)||(35852643-35852781)
chr5 (32-174)||(36460199-36460341)
chr5 (32-184)||(5889092-5889245)
chr5 (62-169)||(5889269-5889375)
chr5 (62-224)||(29915167-29915328)
chr5 (62-171)||(21871656-21871763)
chr5 (62-171)||(21875936-21876043)
chr5 (220-252)||(12122445-12122477)
chr5 (129-205)||(21741557-21741633)
chr5 (90-174)||(21741653-21741738)
chr5 (125-154)||(21871593-21871622)
chr5 (125-154)||(21875873-21875902)
chr5 (125-154)||(22120217-22120246)
chr5 (220-252)||(21555304-21555336)
chr5 (220-252)||(31454973-31455005)
chr5 (220-252)||(31455586-31455618)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (32-259)||(33186046-33186273)
chr4 (45-183)||(15880717-15880855)
chr4 (32-208)||(13844567-13844744)
chr4 (32-174)||(35812171-35812312)
chr4 (32-208)||(46642862-46643038)
chr4 (63-259)||(362075-362272)
chr4 (62-169)||(52873251-52873357)
chr4 (72-174)||(9923326-9923427)
chr4 (72-174)||(11479432-11479533)
chr4 (62-174)||(46642750-46642861)
chr4 (62-168)||(13844461-13844566)
chr4 (62-171)||(15868794-15868901)
chr4 (32-111)||(14185252-14185331)
chr4 (65-171)||(630862-630966)
chr4 (32-170)||(21189704-21189842)
chr4 (113-181)||(15190360-15190428)
chr4 (113-181)||(15099393-15099461)
chr4 (102-166)||(19609509-19609573)
chr4 (220-259)||(10357358-10357398)
chr4 (90-173)||(15099265-15099349)
chr4 (125-154)||(630796-630825)
chr4 (125-154)||(13812831-13812860)
chr4 (125-154)||(15868731-15868760)
chr4 (224-259)||(10357306-10357342)
chr4 (224-259)||(15099169-15099205)
chr4 (224-259)||(19609418-19609454)
chr4 (220-252)||(33185998-33186030)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (33-259)||(1510-1736)
[»] chr2 (20 HSPs)
chr2 (33-259)||(24865452-24865678)
chr2 (44-259)||(22500933-22501148)
chr2 (44-259)||(22508867-22509082)
chr2 (33-249)||(7672240-7672450)
chr2 (32-148)||(2524410-2524526)
chr2 (34-259)||(6576307-6576543)
chr2 (91-174)||(24883630-24883713)
chr2 (91-158)||(22501128-22501195)
chr2 (91-158)||(22509062-22509129)
chr2 (72-174)||(24436221-24436321)
chr2 (102-174)||(24781643-24781715)
chr2 (102-174)||(5032127-5032199)
chr2 (220-259)||(9975019-9975059)
chr2 (224-259)||(5032246-5032282)
chr2 (220-252)||(20915151-20915183)
chr2 (220-252)||(22500885-22500917)
chr2 (220-252)||(22508819-22508851)
chr2 (224-259)||(22689774-22689810)
chr2 (224-259)||(22694370-22694406)
chr2 (224-259)||(24781762-24781798)
[»] scaffold0071 (2 HSPs)
scaffold0071 (32-259)||(14284-14511)
scaffold0071 (220-252)||(14236-14268)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (32-259)||(20734128-20734354)
chr6 (45-183)||(2201139-2201277)
chr6 (47-183)||(22420987-22421123)
chr6 (35-174)||(34296953-34297092)
chr6 (32-184)||(27851220-27851373)
chr6 (32-208)||(25956537-25956714)
chr6 (66-258)||(19399692-19399895)
chr6 (49-174)||(18927853-18927977)
chr6 (62-169)||(25956715-25956821)
chr6 (63-169)||(31630622-31630727)
chr6 (62-171)||(27851087-27851195)
chr6 (102-174)||(27322221-27322293)
chr6 (72-174)||(28708651-28708754)
chr6 (102-174)||(18708677-18708749)
chr6 (102-174)||(23151069-23151141)
chr6 (224-258)||(27573027-27573061)
chr6 (224-259)||(17318992-17319028)
chr6 (224-259)||(18708594-18708630)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (32-259)||(6359-6585)
scaffold0737 (220-259)||(5634-5674)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (45-259)||(10839-11053)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (53-259)||(51274290-51274496)
chr1 (34-169)||(12328538-12328673)
chr1 (45-153)||(8885447-8885555)
chr1 (32-208)||(28194365-28194542)
chr1 (32-204)||(43697405-43697578)
chr1 (72-154)||(51326892-51326974)
chr1 (62-158)||(28194543-28194638)
chr1 (62-169)||(43543031-43543137)
chr1 (62-169)||(43697294-43697400)
chr1 (113-208)||(49261357-49261452)
chr1 (63-169)||(46382652-46382755)
chr1 (119-208)||(20636866-20636955)
chr1 (93-174)||(48301040-48301121)
chr1 (101-174)||(20636764-20636837)
chr1 (143-183)||(8882176-8882216)
chr1 (191-259)||(41305818-41305888)
chr1 (35-67)||(51326966-51326998)
chr1 (113-208)||(35981696-35981791)
chr1 (102-173)||(41227507-41227578)
chr1 (90-174)||(35981808-35981893)
chr1 (224-259)||(35981952-35981988)
chr1 (224-259)||(48300957-48300993)
chr1 (220-252)||(51274512-51274544)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (76-237)||(450-611)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (32-174)||(4644-4786)
scaffold0599 (32-174)||(226-368)
[»] scaffold0116 (4 HSPs)
scaffold0116 (32-208)||(43700-43877)
scaffold0116 (32-208)||(47620-47797)
scaffold0116 (62-169)||(43878-43984)
scaffold0116 (62-102)||(47798-47837)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (61-174)||(6769-6882)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (40-183)||(59295-59437)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (43-180)||(15419-15556)
scaffold0061 (43-180)||(24477-24614)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (32-174)||(3093-3234)
scaffold0371 (223-259)||(3010-3047)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (62-171)||(85167-85275)
scaffold0009 (113-208)||(85276-85371)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (62-169)||(36142-36248)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (48-174)||(834-959)
[»] scaffold0810 (2 HSPs)
scaffold0810 (71-169)||(2966-3063)
scaffold0810 (32-101)||(3066-3136)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (62-169)||(10963-11069)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (62-169)||(362926-363032)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (49-174)||(5455-5579)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (49-174)||(76919-77042)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (102-174)||(10029-10101)
[»] scaffold1137 (3 HSPs)
scaffold1137 (113-208)||(2300-2395)
scaffold1137 (101-172)||(2424-2495)
scaffold1137 (224-259)||(2556-2592)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (72-174)||(2449-2552)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (103-174)||(9106-9177)
scaffold0375 (224-259)||(9224-9260)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (62-171)||(8379-8486)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (102-174)||(8189-8261)
scaffold0384 (224-259)||(8308-8344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (62-169)||(24739-24844)
scaffold0124 (125-154)||(24676-24705)
[»] scaffold0509 (2 HSPs)
scaffold0509 (102-174)||(9561-9633)
scaffold0509 (224-259)||(9680-9716)
[»] scaffold0632 (1 HSPs)
scaffold0632 (228-259)||(313-344)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (99-170)||(1920-1990)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (125-154)||(9926-9955)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (125-154)||(7670-7699)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (224-259)||(57894-57930)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (220-252)||(46993-47025)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (220-252)||(145833-145865)
scaffold0026 (224-259)||(145881-145917)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 33)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 31224635 - 31224862
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31224635 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 31224734  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31224735 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtttaagt 31224834  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224835 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 31224862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 15447681 - 15447905
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15447681 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 15447780  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447781 tgttatat---atgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 15447877  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15447878 tgttaagttgtaagatattgatccaaat 15447905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31415543 - 31415348
Alignment:
Q  64 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415543 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 31415444  T
Q  164 ttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415443 ttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 31415348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11913092 - 11912950
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11913092 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11912993  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11912992 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 11912950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6808291 - 6808157
Alignment:
Q  49 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgatt 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6808291 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatataatgatt 6808192  T
Q  149 attattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  6808191 attattgatggtgacttccttcatatgtctaaatg 6808157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 62 - 258
Target Start/End: Original strand, 49969963 - 49970170
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  49969963 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttg 49970062  T
Q  162 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat----------gtctaagttg-ttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||  || ||||  |||  ||||||||||||||| |||| || |||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||    
T  49970063 acttgctgcatattatttaatggtactgccttgctgttgtgatgtattattatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgtt 49970162  T
Q  251 gatccaaa 258  Q
    ||||||||    
T  49970163 gatccaaa 49970170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Original strand, 1988912 - 1989050
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  1988912 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgattcacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 1989011  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1989012 tggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 1989050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 20630191 - 20630297
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  20630191 atgatttactttgacgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 20630289  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  20630290 acttgctg 20630297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Original strand, 49389772 - 49389870
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatattta--tatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  49389772 ttgatgattaaatgtgaaaatatttagatatattgtgaa-gttgttgatatgaagttgtaattgttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 49389870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 18439941 - 18440047
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  18439941 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatctatatattgtgaaagatgatgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 18440039  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    || |||||    
T  18440040 acctgctg 18440047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40812096 - 40812015
Alignment:
Q  93 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40812096 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40812015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12269773 - 12269598
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || || |  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||     
T  12269773 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tga-aaaagatttatatattgtgaaagttgttgatatgaagttgtat 12269676  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    || ||| |||||| || |||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  12269675 tttttacatatgaagaatattatcggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtcatgaat 12269598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12269597 - 12269486
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  12269597 atgatttaagttgatgattaa-tgtgagaagatttataaattttgaaggacgttgatatgaagttgtaatgattatatttgatgattattgttgatgttg 12269499  T
Q  162 acttgctgcatat 174  Q
    || ||||||||||    
T  12269498 acgtgctgcatat 12269486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5842061 - 5841958
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  5842061 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgc 5841962  T
Q  171 atat 174  Q
    ||||    
T  5841961 atat 5841958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 18439845 - 18439940
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  18439845 gttgatatgtagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 18439940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Original strand, 30175304 - 30175389
Alignment:
Q  89 aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  30175304 aaatatttatatactgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggatatatgggatgattattgttgatgttgacttgcttcatat 30175389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40807245 - 40807173
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40807245 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40807173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 22307386 - 22307458
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22307386 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 22307458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Original strand, 1465419 - 1465490
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1465419 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctctatatgtttaaatga 1465490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17538356 - 17538284
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17538356 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtattgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 17538284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 49389639 - 49389734
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||  ||||  || ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  49389639 gttggtatgaagttgaaattgttatacatgaagatcattattaatgggtacttattgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 49389734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 1465531 - 1465616
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1465531 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttggatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 1465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 12852390 - 12852419
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852390 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 12852419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 1465675 - 1465711
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1465675 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 1465711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 12852453 - 12852559
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagtt-gtaattgttatatatgatgattattattgatggt 160  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||||| |||||  || ||| ||||||||||| |||||| |    
T  12852453 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgatgatgatatgaagtttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgtt 12852550  T
Q  161 gacttgctg 169  Q
    |||||||||    
T  12852551 gacttgctg 12852559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 15447921 - 15447953
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15447921 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 15447953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 259
Target Start/End: Original strand, 17519823 - 17519863
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17519823 agatgtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaat 17519863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 259
Target Start/End: Original strand, 17534685 - 17534725
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17534685 agatgtctaagttgtttaagttataagatgttgatccaaat 17534725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 22307505 - 22307541
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22307505 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 22307541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 30175436 - 30175472
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30175436 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 30175472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 31224878 - 31224910
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31224878 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31224910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31415332 - 31415300
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31415332 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31415300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 41173241 - 41173277
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41173241 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 41173277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 18)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 21579887 - 21580115
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21579887 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21579986  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaatacca-ttaagatgtctaag 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21579987 tgttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaagatgtctaag 21580086  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21580087 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 21580115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 29763549 - 29763775
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29763549 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 29763648  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763649 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 29763747  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29763748 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 29763775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 61 - 259
Target Start/End: Original strand, 41680832 - 41681029
Alignment:
Q  61 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggt 160  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680832 gatgatttatattgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatattgatatcaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggt 41680931  T
Q  161 gacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680932 gacttgctgcatatgtttaaatggtgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtc-aagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 41681029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 42560208 - 42560350
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  42560208 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaaattgtaat 42560307  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42560308 tgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 42560350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32807396 - 32807285
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32807396 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 32807297  T
Q  172 tatgtttaaatg 183  Q
    ||||| ||||||    
T  32807296 tatgtctaaatg 32807285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18760706 - 18760514
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18760706 cagagagtatgaataagatgattaatattgtgggtttaagtagatgattaaatgtgaaaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataat 18760607  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg 224  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||    |  |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18760606 ggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgatgccttgctattgtgatgtattaatatcattaagatg 18760514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22965811 - 22965704
Alignment:
Q  141 tgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagtt 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22965811 tgatgattattattgatggtgatttgatgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttatgatgaatcaatactattaagatgtctaagttgttaagtt 22965712  T
Q  241 gtaagatg 248  Q
     |||||||    
T  22965711 ttaagatg 22965704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 169
Target Start/End: Original strand, 27472391 - 27472496
Alignment:
Q  63 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  27472391 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttga 27472489  T
Q  163 cttgctg 169  Q
    |||||||    
T  27472490 cttgctg 27472496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 169
Target Start/End: Original strand, 38550086 - 38550191
Alignment:
Q  63 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  38550086 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttga 38550184  T
Q  163 cttgctg 169  Q
    |||||||    
T  38550185 cttgctg 38550191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39834023 - 39833805
Alignment:
Q  53 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg-ttatatatgatgattatt 151  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |||| |||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  39834023 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataacgtgaatgttgttgatatgaagttgcaaatggttatatatgaagattatt 39833924  T
Q  152 attgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga-cactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat---------gtctaagttg-ttaagtt 240  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  | |  ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||          ||||||||| |||||||    
T  39833923 attgatggttactcgctgtatatgtttaaatgatgattgccttgctgatgtgatgtattaatatcatgaagatctaatgttgatctaagttgtttaagtt 39833824  T
Q  241 gtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||    
T  39833823 gtaagatgttgatccaaat 39833805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 1327119 - 1327225
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  1327119 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaacgatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 1327217  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  1327218 acttgctg 1327225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3273310 - 3273212
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3273310 cagagagtatgaataagatgattaatgttatggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaaatgttggtatgaagttgtaat 3273212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 39936813 - 39936885
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  39936813 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatat 39936885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Original strand, 20982747 - 20982825
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  20982747 atatatatatattgtgaaagatattgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgatttgctg 20982825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 21415211 - 21415281
Alignment:
Q  99 atattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21415211 atattatgaaagatgttgatatga-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgc 21415281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 259
Target Start/End: Original strand, 6102532 - 6102669
Alignment:
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg-------- 224  Q
    ||||||| |||||||| || |||||| ||||||||| |||||  || ||||    |  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||            
T  6102532 gttatatttgatgattgttgttgatgttgacttgctccatattatttaatggtgttgccttgctgttgtgatgtattaatatcattaagatgctaatgtt 6102631  T
Q  225 --tctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6102632 ggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 6102669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19140014 - 19139966
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattat 150  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  19140014 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattat 19139966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 21580131 - 21580163
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21580131 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 21580163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 35 - 259
Target Start/End: Original strand, 36685934 - 36686158
Alignment:
Q  35 agaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  36685934 agaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgctgatatgaagttttaattgt 36686033  T
Q  135 tatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36686034 tatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgt 36686133  T
Q  235 taagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36686134 taagttgtaagatgttgatccaaat 36686158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 30820937 - 30821164
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30820937 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaagttgtaat 30821036  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30821037 tgttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 30821136  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30821137 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 30821164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 64 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38480376 - 38480181
Alignment:
Q  64 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38480376 gatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgac 38480277  T
Q  164 ttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||| |||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38480276 ttgctgcatatatttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatatctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 38480181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11085170 - 11085019
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11085170 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaactatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11085071  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11085070 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatacgattaaatg 11085019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11092908 - 11092757
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  11092908 cagagagtgtgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaat 11092809  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11092808 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgttgcatacgtttaaatg 11092757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 33 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15213869 - 15213728
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15213869 agagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacattgatatgaaattgtaatt 15213770  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15213769 gttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 15213728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 9320423 - 9320561
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9320423 taagatgattaatattgatgatttattttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 9320522  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9320523 gattattattgatggtgacttgttgcatatgtctaaatg 9320561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15439457 - 15439322
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  15439457 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 15439358  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15439357 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttg 15439322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8468454 - 8468256
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  8468454 atgatttactttgatgattaa-tgtgataatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 8468356  T
Q  162 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaa 258  Q
    |||||||| | ||  || ||||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8468355 acttgctgtaaattatttaatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaa 8468257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 259
Target Start/End: Original strand, 14270138 - 14270336
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  14270138 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 14270236  T
Q  162 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaa 258  Q
    |||||||| | ||  ||  |||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14270237 acttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaa 14270335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Original strand, 45847735 - 45847932
Alignment:
Q  63 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  45847735 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttga 45847833  T
Q  163 cttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||| | ||  ||  |||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45847834 cttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaat 45847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Original strand, 37727607 - 37727745
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  || | |||||||||||||    
T  37727607 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgctttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgtagatatgaagttgtaa 37727706  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37727707 tggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 37727745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17232648 - 17232537
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| || ||    
T  17232648 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttggaatggttgtattagatgattattgttgctgttg 17232550  T
Q  162 acttgctgcatat 174  Q
    |||||||| ||||    
T  17232549 acttgctgtatat 17232537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 11391870 - 11392001
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |    
T  11391870 ataagatgattaatgttgtggatttaaattgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattgg 11391969  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11391970 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 11392001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12371527 - 12371455
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12371527 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 12371455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 13148275 - 13148347
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13148275 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 13148347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 9389705 - 9389800
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  9389705 gttgatatgaagttgaaattgatatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 9389800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Original strand, 8851959 - 8852040
Alignment:
Q  93 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  8851959 atttatatattgtgaaagattttgatataaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttactgcatat 8852040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11066717 - 11066645
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  11066717 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttatattggatgatcattgttgttgttgacttgctgcatat 11066645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17232744 - 17232649
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  17232744 gttgatatggagttgcaaatgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgatgtcatgctgttgtgatgaat 17232649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 39267712 - 39267741
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267712 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 39267741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 59314 - 59350
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  59314 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 59350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8468524 - 8468472
Alignment:
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8468524 tgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatga 8468472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 8852087 - 8852123
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8852087 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 8852123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11066598 - 11066562
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11066598 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 11066562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 12127967 - 12128039
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12127967 ttgtgaaagatgtttatatgaagttgtaatggatatattggacgattattgttgatgttgacttactgcatat 12128039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12371408 - 12371372
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12371408 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 12371372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 18302194 - 18302100
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 158  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| ||||||    
T  18302194 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgaagatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatg 18302100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 30821180 - 30821212
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30821180 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 30821212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 165
Target Start/End: Original strand, 32434396 - 32434456
Alignment:
Q  105 tgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||||||    
T  32434396 tgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgctgatgttgactt 32434456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 32434511 - 32434547
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32434511 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 32434547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 36686174 - 36686206
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36686174 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 36686206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 24)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 12122202 - 12122429
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12122202 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 12122301  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12122302 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccattgagatgtttaagt 12122401  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122402 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 12122429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 21557726 - 21557953
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21557726 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21557825  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557826 tgttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttatgatgaattaataccattaagatgtctaagt 21557925  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557926 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 21557953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 21555060 - 21555288
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  21555060 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgacataaagttgtaat 21555159  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaatacca-ttaagatgtctaag 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21555160 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaagatgtctaag 21555259  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21555260 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 21555288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31455862 - 31455634
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  31455862 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatatgaagttgtaatcg 31455763  T
Q  134 ttatatatgat---gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaag 230  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31455762 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatgtctaag 31455663  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31455662 ttgttaagttgtaagatgttgatacaaat 31455634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 30615926 - 30615700
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30615926 cagagaggatgaataagatgattaatattgataatttacttttatgattaaatgtgaaaatatt-atatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 30615828  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30615827 tgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtcttgctgttgcgatgaattaataccattaagatgtataagt 30615728  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30615727 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 30615700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 31455249 - 31455021
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  31455249 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatattaagttgtaatcg 31455150  T
Q  134 ttatatatgat---gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaag 230  Q
    ||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31455149 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatgtctaag 31455050  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31455049 ttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 31455021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 91 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 17875326 - 17875158
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactct 190  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  17875326 atatttatataatgataaagacgttgatatgaagttctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatattat 17875227  T
Q  191 cttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17875226 cttgctgttgtgaagaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatattgatccaaat 17875158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24212526 - 24212387
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24212526 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 24212427  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24212426 gattaatattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatga 24212387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35852781 - 35852643
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  35852781 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatacgat 35852682  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35852681 gattattattgatggtggcttgctgcatatgtctaaatg 35852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36460341 - 36460199
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36460341 cagagaggatgaacaagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 36460242  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36460241 tgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 36460199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Original strand, 5889092 - 5889245
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  5889092 cagagaggatgattatgatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 5889191  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5889192 ttgttatacatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatga 5889245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 5889269 - 5889375
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  5889269 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 5889367  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  5889368 acttgctg 5889375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 62 - 224
Target Start/End: Original strand, 29915167 - 29915328
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  29915167 atgatctactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 29915265  T
Q  162 acttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg 224  Q
    |||||||| | ||  || |||| |  |  ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  29915266 acttgctgtaaattattgaatggcgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg 29915328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Original strand, 21871656 - 21871763
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  21871656 atgatttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 21871753  T
Q  162 acttgctgca 171  Q
    ||||||||||    
T  21871754 acttgctgca 21871763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Original strand, 21875936 - 21876043
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    |||||||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  21875936 atgatttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 21876033  T
Q  162 acttgctgca 171  Q
    ||||||||||    
T  21876034 acttgctgca 21876043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 12122445 - 12122477
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12122445 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 12122477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Original strand, 21741557 - 21741633
Alignment:
Q  129 aattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatg 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  21741557 aattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatg 21741633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 21741653 - 21741738
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21741653 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaaatcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 21741738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 21871593 - 21871622
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21871593 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 21871622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 21875873 - 21875902
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21875873 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 21875902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 22120217 - 22120246
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120217 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 22120246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 21555304 - 21555336
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21555304 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 21555336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31455005 - 31454973
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31455005 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31454973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 31455618 - 31455586
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31455618 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 31455586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33186273 - 33186046
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33186273 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaat 33186174  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33186173 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 33186074  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33186073 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 33186046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15880855 - 15880717
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15880855 taagatgatcaatattgatgatttactttgattattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 15880756  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15880755 gattattattgatggtgacttgctacatatgtctaaatg 15880717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13844744 - 13844567
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  13844744 cagagaggatgattaagatgatttaatattattgatttacgttgatgattaaatgtgaaaatatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 13844645  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  13844644 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttactgttgtgatgaat 13844567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 35812171 - 35812312
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35812171 cagagagtataaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtggaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 35812269  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
     |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35812270 ggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 35812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46643038 - 46642862
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || || |  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  46643038 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tgcgaaaagatttatatattgtgaaagttgttaatatgaagttgtaa 46642940  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  46642939 ttgttacatatgaagaatattattggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtgatgaat 46642862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 63 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 362272 - 362075
Alignment:
Q  63 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  362272 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttga 362174  T
Q  163 cttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||| | ||  ||  |||    |  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  362173 cttgctgtaaattatttgatggtgttgccttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaat 362075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 52873251 - 52873357
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  52873251 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 52873349  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  52873350 acttgctg 52873357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9923427 - 9923326
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9923427 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 9923329  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  9923328 tat 9923326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Original strand, 11479432 - 11479533
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11479432 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 11479530  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  11479531 tat 11479533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46642861 - 46642750
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  46642861 atgatttaatttgatgattaa-tgtgagaagatttataaactgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttg 46642763  T
Q  162 acttgctgcatat 174  Q
    || ||||||||||    
T  46642762 acgtgctgcatat 46642750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13844566 - 13844461
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||| ||    
T  13844566 atgatttactttgattattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgattattattgttgatgatg 13844468  T
Q  162 acttgct 168  Q
    |||||||    
T  13844467 acttgct 13844461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Original strand, 15868794 - 15868901
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  15868794 atgatttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattatatctgatgattattgttgatgttg 15868891  T
Q  162 acttgctgca 171  Q
    ||||||||||    
T  15868892 acttgctgca 15868901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14185331 - 14185252
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14185331 cagagagtatgaataagatgattaacgttgttgttttaagttgatggttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 14185252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 171
Target Start/End: Original strand, 630862 - 630966
Alignment:
Q  65 atttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgact 164  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  630862 atttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattattgatgttgact 630959  T
Q  165 tgctgca 171  Q
    |||||||    
T  630960 tgctgca 630966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 170
Target Start/End: Original strand, 21189704 - 21189842
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatga-ttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||  || |||||||  |||| || ||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||| | ||| ||     
T  21189704 cagagagaatgaatatgatgactaatgatgttgatttaagttgacgaattaaaagtggaaatatttatatgttatgaaagatgttgatatca-gttatac 21189802  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21189803 ttgttgtatatgatgattattattgttggtgacttgctgc 21189842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15190428 - 15190360
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaa 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15190428 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15099461 - 15099393
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaa 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15099461 gttgatatgaagttgaaattgttatacataaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15099393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19609573 - 19609509
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 166  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  19609573 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttg 19609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 259
Target Start/End: Original strand, 10357358 - 10357398
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10357358 agatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 10357398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15099349 - 15099265
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcata 173  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15099349 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcata 15099265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 630796 - 630825
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  630796 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 630825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 13812831 - 13812860
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812831 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 13812860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 15868731 - 15868760
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15868731 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 15868760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 10357306 - 10357342
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10357306 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 10357342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15099205 - 15099169
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15099205 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 15099169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19609454 - 19609418
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19609454 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 19609418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 33186030 - 33185998
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33186030 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 33185998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1736 - 1510
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1736 agagaggattaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 1637  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1636 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 1537  T
Q  233 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  1536 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 1510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 20)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 33 - 259
Target Start/End: Original strand, 24865452 - 24865678
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24865452 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatt 24865551  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24865552 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 24865651  T
Q  233 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24865652 gttaagttgtaagatgttgatccaaat 24865678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22501148 - 22500933
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22501148 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22501049  T
Q  144 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 243  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22501048 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 22500949  T
Q  244 agatgttgatccaaat 259  Q
    |||| |||||||||||    
T  22500948 agatattgatccaaat 22500933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 44 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22509082 - 22508867
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatga 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22509082 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22508983  T
Q  144 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 243  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22508982 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 22508883  T
Q  244 agatgttgatccaaat 259  Q
    |||| |||||||||||    
T  22508882 agatattgatccaaat 22508867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 7672240 - 7672450
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||    
T  7672240 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaag------tt 7672333  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7672334 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatacgtttaaatgatgctgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 7672433  T
Q  233 gttaagttgtaagatgt 249  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7672434 gttaagtcgtaagatgt 7672450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Original strand, 2524410 - 2524526
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  2524410 cagagagtatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatcaaattgtaat 2524509  T
Q  132 tgttatatatgatgatt 148  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2524510 tgttacatatgatgatt 2524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 34 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6576543 - 6576307
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  6576543 gagagtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaaagtgaaaaaatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgg 6576444  T
Q  134 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat---------- 223  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  || ||||   ||  |||||| |||||||| | ||||| |||||||||              
T  6576443 ttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatattatttaatggtgctgccttgctattgtgatgtaataatatcattaagatgctaatgttg 6576344  T
Q  224 gtctaagttg-ttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6576343 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 6576307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24883713 - 24883630
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24883713 atatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24883630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22501195 - 22501128
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22501195 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22501128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22509129 - 22509062
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22509129 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22509062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24436321 - 24436221
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||  ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  24436321 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaatggttacattggatgatt-ttgttgatgttgacttgctgca 24436224  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  24436223 tat 24436221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 24781643 - 24781715
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24781643 ttgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24781715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 5032127 - 5032199
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5032127 ttgtgaaaaatgttgatatgaagttataatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 5032199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 220 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9975059 - 9975019
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9975059 agatgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 9975019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 5032246 - 5032282
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5032246 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 5032282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 20915183 - 20915151
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20915183 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 20915151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22500917 - 22500885
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22500917 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 22500885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22508851 - 22508819
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22508851 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 22508819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22689810 - 22689774
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22689810 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 22689774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22694406 - 22694370
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22694406 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 22694370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 24781762 - 24781798
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24781762 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 24781798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14511 - 14284
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14511 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 14412  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14411 tgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 14312  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  14311 tgttaagttgtaagattttgatccaaat 14284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14268 - 14236
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14268 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 14236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 20734128 - 20734354
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20734128 cagagaggatgaataaaatgatttatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 20734227  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20734228 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtc-aagt 20734326  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20734327 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 20734354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2201277 - 2201139
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2201277 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatatgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 2201178  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2201177 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatg 2201139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22421123 - 22420987
Alignment:
Q  47 agatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatga 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22421123 agatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatga 22421024  T
Q  147 ttattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  22421023 ttattattgatagtgacttgttgcatatgtctaaatg 22420987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 34296953 - 34297092
Alignment:
Q  35 agaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34296953 agaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattagatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgt 34297052  T
Q  135 tatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34297053 tatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 34297092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27851373 - 27851220
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa- 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  27851373 cagagaggatgaataagatgatttatattgatgatttaccttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 27851274  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  27851273 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtgtatgtttaaatga 27851220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 25956537 - 25956714
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  25956537 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 25956636  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  25956637 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 25956714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 66 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 19399895 - 19399692
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  19399895 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgactt 19399796  T
Q  166 gctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagat----------gtctaagttg-ttaagttgtaagatgttgatc 254  Q
    |||||||||  || ||||   ||  |||||| |||||||| |||| || |||||||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19399795 gctgcatattatttaatggttctgccttgcttttgtgatgtattattatcattaagatgctaatgttggtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatc 19399696  T
Q  255 caaa 258  Q
    ||||    
T  19399695 caaa 19399692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18927977 - 18927853
Alignment:
Q  49 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgatt 148  Q
    ||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  18927977 atgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgatt 18927879  T
Q  149 attattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||    
T  18927878 attgttgatgttgacttgctgcatat 18927853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 25956715 - 25956821
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25956715 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 25956813  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  25956814 acttgctg 25956821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 63 - 169
Target Start/End: Original strand, 31630622 - 31630727
Alignment:
Q  63 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  31630622 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttga 31630720  T
Q  163 cttgctg 169  Q
    |||||||    
T  31630721 cttgctg 31630727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27851195 - 27851087
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| | |||| ||    
T  27851195 atgatttactttgatgcttaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgattattgtcgatgttg 27851097  T
Q  162 acttgctgca 171  Q
    ||||||||||    
T  27851096 acttgctgca 27851087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 27322221 - 27322293
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27322221 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 27322293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28708754 - 28708651
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28708754 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgc 28708655  T
Q  171 atat 174  Q
    ||||    
T  28708654 atat 28708651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18708749 - 18708677
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  18708749 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgtttatgttgacttgctgcatat 18708677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 23151069 - 23151141
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  23151069 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatat 23151141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 224 - 258
Target Start/End: Original strand, 27573027 - 27573061
Alignment:
Q  224 gtctaagttgttaagttgtaagatgttgatccaaa 258  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27573027 gtctaagttgtgaagttgtaagatgttgatccaaa 27573061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 17318992 - 17319028
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17318992 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 17319028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18708630 - 18708594
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18708630 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 18708594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 259
Target Start/End: Original strand, 6359 - 6585
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6359 cagagaggatgaataagatgattaataataatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 6458  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6459 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtc-aagt 6557  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6558 tgttaagttgtaagatgttgatccaaat 6585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 259
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5674
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5634 agatctctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 5674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 45 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11053 - 10839
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  11053 taagatgattaatgttgatgatttactatgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaatttttaattgttatatatgat 10954  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaa 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10953 gattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttttgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaa 10854  T
Q  245 gatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||||||    
T  10853 gatgttgatccaaat 10839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 53 - 259
Target Start/End: Original strand, 51274290 - 51274496
Alignment:
Q  53 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattatta 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51274290 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattatta 51274389  T
Q  153 ttgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51274390 ttgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgtttttgttttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 51274489  T
Q  253 tccaaat 259  Q
    |||||||    
T  51274490 tccaaat 51274496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Original strand, 12328538 - 12328673
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12328538 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatttgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagatgtaattg 12328637  T
Q  134 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12328638 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 12328673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8885555 - 8885447
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  8885555 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgtaatatatgat 8885456  T
Q  145 gattattat 153  Q
    |||| ||||    
T  8885455 gattgttat 8885447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 28194365 - 28194542
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  28194365 cagagaagatgattaggatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaaaatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 28194464  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  28194465 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 28194542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43697578 - 43697405
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  43697578 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaagatctatatagtgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43697479  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgat 204  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  43697478 atgttatatatgaagattattattgttggttacttgctgtatatgtttatatgatgctgtcttgctgttgtgat 43697405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51326974 - 51326892
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51326974 ttgatgattaaatgtgaacatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgttgattattatt 51326892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 62 - 158
Target Start/End: Original strand, 28194543 - 28194638
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 158  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28194543 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatg 28194638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43543137 - 43543031
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||  |||||||||| |||||| ||    
T  43543137 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttg 43543039  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  43543038 acttgctg 43543031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43697400 - 43697294
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  43697400 atgatttactttgatgattaa-tgtgagattattgatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttttatttgatgattattgttgatgatg 43697302  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  43697301 acttgctg 43697294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49261452 - 49261357
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  49261452 gttgatatgaagttgtaattgttatacatgaagattattattgatggttacttgttatatatgtttaaatgatactgtcttgctgtcgtgatgaat 49261357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 63 - 169
Target Start/End: Original strand, 46382652 - 46382755
Alignment:
Q  63 tgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtga 162  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| |||    
T  46382652 tgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttata--ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttttattagatgattattgttgatgttga 46382748  T
Q  163 cttgctg 169  Q
    |||||||    
T  46382749 cttgctg 46382755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20636955 - 20636866
Alignment:
Q  119 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  20636955 atgaagttgtaattgttatacatgaatattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 20636866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48301121 - 48301040
Alignment:
Q  93 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48301121 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttacatgagattattattgttgatgttgacttgctgcatat 48301040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20636837 - 20636764
Alignment:
Q  101 attgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20636837 attgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 20636764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8882216 - 8882176
Alignment:
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8882216 atgattattattgatggtaacttgctgcatatgtctaaatg 8882176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 259
Target Start/End: Original strand, 41305818 - 41305888
Alignment:
Q  191 cttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaa-gttg--ttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  41305818 cttgctgatgtgatgtattaatatcattaagatg-ctaatgttggtttaagttgtaagatgttgatccaaat 41305888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 51326998 - 51326966
Alignment:
Q  35 agaggatgaataagatgattaatattgatgatt 67  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51326998 agaggatgaataagatgattaatattgatgatt 51326966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 35981696 - 35981791
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  35981696 gttgatatgaagttgaaattgttgcacatgaagattactaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 35981791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 173
Target Start/End: Original strand, 41227507 - 41227578
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcata 173  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  41227507 ttgtgaaagatgtttatatgaagttttaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcata 41227578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 35981808 - 35981893
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  35981808 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgttgcatat 35981893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 35981952 - 35981988
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35981952 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 35981988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 48300993 - 48300957
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48300993 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 48300957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 51274512 - 51274544
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51274512 agatgtctaagttgttaagtcgtaagatgttga 51274544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 611 - 450
Alignment:
Q  76 tgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611 tgattaaatgagaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattataattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 512  T
Q  176 tttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaa 237  Q
    || ||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  511 ttaaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatatcattaagatgtctaagttgttaa 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4786 - 4644
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4786 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 4687  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4686 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 4644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 226
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  368 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattatatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 269  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  268 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43877
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  43700 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43799  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  43800 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 43877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 47620 - 47797
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  47620 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 47719  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  47720 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 47797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 43878 - 43984
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  43878 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatg 43976  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  43977 acttgctg 43984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 102
Target Start/End: Original strand, 47798 - 47837
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatat 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  47798 atgatttactttgatgatt-aatgtgagaatatttatatat 47837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 82; Significance: 8e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 174
Target Start/End: Original strand, 6769 - 6882
Alignment:
Q  61 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggt 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| |    
T  6769 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatggagttgtaatgattatatttgatgattattgttcatgtt 6868  T
Q  161 gacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||    
T  6869 gacttgctgcatat 6882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 183
Target Start/End: Original strand, 59295 - 59437
Alignment:
Q  40 atgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatat 139  Q
    |||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  59295 atgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatat 59393  T
Q  140 atgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  59394 tggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatg 59437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Original strand, 15419 - 15556
Alignment:
Q  43 aataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||  |    
T  15419 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 15518  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaa 180  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  15519 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Original strand, 24477 - 24614
Alignment:
Q  43 aataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||  |    
T  24477 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 24576  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaa 180  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  24577 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 24614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3234 - 3093
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  3234 cagagagtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatatcgtgaaaaatgttgatatgaagttgtaat 3136  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
     |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3135 ggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 223 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3047 - 3010
Alignment:
Q  223 tgtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3047 tgtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 3010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 85275 - 85167
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  85275 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttgtatttgatgattattgttgatgttg 85177  T
Q  162 acttgctgca 171  Q
    ||||||||||    
T  85176 acttgctgca 85167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 85371 - 85276
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  85371 gttgatatggagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgatgtatatgtttaaatgaagttgtcttgctgttgtgatgaat 85276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 36142 - 36248
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||    
T  36142 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttg 36240  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  36241 acttgctg 36248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 48 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 959 - 834
Alignment:
Q  48 gatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgat 147  Q
    |||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||    
T  959 gatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-attaatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgat 861  T
Q  148 tattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||    
T  860 tattgttgatgttgacttgctgcatat 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3063 - 2966
Alignment:
Q  71 tttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3063 tttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctg 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3066
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatata 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3136 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatata 3066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 10963 - 11069
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||    
T  10963 atgatttactttgatgattta-tgtgagaatatttatatattgtaaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttg 11061  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  11062 acttgctg 11069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 363032 - 362926
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  || |||  |||||||||| |||||| ||    
T  363032 atgatttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattttgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttg 362934  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  362933 acttgctg 362926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 5455 - 5579
Alignment:
Q  49 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgatt 148  Q
    ||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  5455 atgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaggtgttgatatgaagttgtaatgtttatattggatgatt 5553  T
Q  149 attattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||| |||||| | |||||||||||||    
T  5554 attgttgatgttaacttgctgcatat 5579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 77042 - 76919
Alignment:
Q  49 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgatt 148  Q
    ||||||||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  77042 atgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaaat--ttatatattgtgaaagatgtggatatgaagttgtaatggttatattggatgatt 76945  T
Q  149 attattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||| |||||  ||| ||||| |||||    
T  76944 attgttgattttgatttgctacatat 76919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 10029 - 10101
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10029 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 3)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2395
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  2300 gttgatatgaagttgaaattgttgtacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgtcttgctgtcgtgatgaat 2395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 172
Target Start/End: Original strand, 2424 - 2495
Alignment:
Q  101 attgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcat 172  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2424 attgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcat 2495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 2556 - 2592
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2556 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 2592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Original strand, 2449 - 2552
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  2449 ttgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgc 2548  T
Q  171 atat 174  Q
    ||||    
T  2549 atat 2552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 174
Target Start/End: Original strand, 9106 - 9177
Alignment:
Q  103 tgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9106 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 9224 - 9260
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9224 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 9260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 62 - 171
Target Start/End: Original strand, 8379 - 8486
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  8379 atgatttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 8476  T
Q  162 acttgctgca 171  Q
    ||||| ||||    
T  8477 acttgttgca 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 8189 - 8261
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  8189 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattgttgttgatgttgacttgctgcatat 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 8308 - 8344
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8308 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 8344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 62 - 169
Target Start/End: Original strand, 24739 - 24844
Alignment:
Q  62 atgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtg 161  Q
    ||||||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||    
T  24739 atgatttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttg 24836  T
Q  162 acttgctg 169  Q
    ||||||||    
T  24837 acttgctg 24844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 24676 - 24705
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 24705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 9561 - 9633
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  9561 ttgtgaaagatgttaatatgaagttgtaatggttatattggatgattaccgttgatgttgacttgctgcatat 9633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Original strand, 9680 - 9716
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9680 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 9716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 313
Alignment:
Q  228 aagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  344 aagttgttaagttgtaagatgttgatccaaat 313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1920
Alignment:
Q  99 atattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1990 atattatgaaagatgttgatatga-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgc 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9955 - 9926
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 9926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 7670 - 7699
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7670 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 7699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 57930 - 57894
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  57930 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 57894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Original strand, 46993 - 47025
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  46993 agatgtctaagttgttaagttgtaaaatgttga 47025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 145865 - 145833
Alignment:
Q  220 agatgtctaagttgttaagttgtaagatgttga 252  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  145865 agatgtctaagttgttaaattgtaagatgttga 145833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 224 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 145917 - 145881
Alignment:
Q  224 gtctaagttgtt-aagttgtaagatgttgatccaaat 259  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  145917 gtctaagttgtttaagttgtaagatgttgatccaaat 145881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 437 times since January 2019
Visitors: 6703