View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0913_low_86 (Length: 250)

Name: NF0913_low_86
Description: NF0913
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0913_low_86
NF0913_low_86
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (32-250)||(31224635-31224853)
chr3 (32-247)||(15447681-15447893)
chr3 (66-250)||(31415357-31415541)
chr3 (32-174)||(11912950-11913092)
chr3 (49-183)||(6808157-6808291)
chr3 (66-220)||(49969967-49970121)
chr3 (32-169)||(1988912-1989050)
chr3 (52-169)||(49389752-49389870)
chr3 (66-169)||(20630195-20630297)
chr3 (32-208)||(12269598-12269773)
chr3 (93-174)||(40812015-40812096)
chr3 (44-174)||(5841958-5842089)
chr3 (66-169)||(18439945-18440047)
chr3 (113-208)||(18439845-18439940)
chr3 (72-174)||(12269486-12269587)
chr3 (89-174)||(30175304-30175389)
chr3 (102-174)||(40807173-40807245)
chr3 (102-174)||(22307386-22307458)
chr3 (113-184)||(1465419-1465490)
chr3 (102-174)||(17538284-17538356)
chr3 (113-208)||(49389639-49389734)
chr3 (90-174)||(1465531-1465616)
chr3 (125-154)||(12852390-12852419)
[»] chr7 (24 HSPs)
chr7 (35-250)||(36685934-36686149)
chr7 (32-250)||(30820937-30821155)
chr7 (66-250)||(38480190-38480374)
chr7 (32-183)||(11085019-11085170)
chr7 (32-183)||(11092757-11092908)
chr7 (33-174)||(15213728-15213869)
chr7 (45-183)||(9320423-9320561)
chr7 (32-166)||(15439322-15439457)
chr7 (32-169)||(37727607-37727745)
chr7 (66-169)||(8468348-8468450)
chr7 (66-169)||(14270142-14270244)
chr7 (66-169)||(45847738-45847840)
chr7 (66-174)||(17232537-17232644)
chr7 (44-174)||(11391870-11392001)
chr7 (102-174)||(12371455-12371527)
chr7 (102-174)||(13148275-13148347)
chr7 (113-208)||(9389705-9389800)
chr7 (93-174)||(8851959-8852040)
chr7 (102-174)||(11066645-11066717)
chr7 (113-208)||(17232649-17232744)
chr7 (125-154)||(39267712-39267741)
chr7 (132-184)||(8468472-8468524)
chr7 (102-174)||(12127967-12128039)
chr7 (105-165)||(32434396-32434456)
[»] chr5 (20 HSPs)
chr5 (32-250)||(12122202-12122420)
chr5 (32-250)||(21557726-21557944)
chr5 (32-250)||(21555060-21555279)
chr5 (34-250)||(31455643-31455862)
chr5 (34-250)||(31455030-31455249)
chr5 (32-250)||(30615709-30615926)
chr5 (45-184)||(24212387-24212526)
chr5 (45-183)||(35852643-35852781)
chr5 (32-174)||(36460199-36460341)
chr5 (91-247)||(17875170-17875326)
chr5 (32-184)||(5889092-5889245)
chr5 (66-169)||(5889273-5889375)
chr5 (68-169)||(29915173-29915273)
chr5 (66-171)||(21871660-21871763)
chr5 (66-171)||(21875940-21876043)
chr5 (129-205)||(21741557-21741633)
chr5 (90-174)||(21741653-21741738)
chr5 (125-154)||(21871593-21871622)
chr5 (125-154)||(21875873-21875902)
chr5 (125-154)||(22120217-22120246)
[»] chr8 (16 HSPs)
chr8 (32-250)||(21579887-21580106)
chr8 (32-250)||(29763549-29763766)
chr8 (72-250)||(41680843-41681020)
chr8 (32-174)||(42560208-42560350)
chr8 (72-183)||(32807285-32807396)
chr8 (32-174)||(18760564-18760706)
chr8 (66-169)||(27472394-27472496)
chr8 (66-169)||(38550089-38550191)
chr8 (53-184)||(39833891-39834023)
chr8 (66-169)||(1327123-1327225)
chr8 (141-248)||(22965704-22965811)
chr8 (32-131)||(3273212-3273310)
chr8 (102-174)||(39936813-39936885)
chr8 (91-169)||(20982747-20982825)
chr8 (99-170)||(21415211-21415281)
chr8 (102-150)||(19139966-19140014)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (32-250)||(33186055-33186273)
chr4 (45-183)||(15880717-15880855)
chr4 (32-208)||(13844567-13844744)
chr4 (32-208)||(46642862-46643038)
chr4 (32-174)||(35812171-35812312)
chr4 (72-174)||(9923326-9923427)
chr4 (72-174)||(11479432-11479533)
chr4 (66-169)||(362167-362269)
chr4 (66-169)||(52873255-52873357)
chr4 (66-174)||(46642750-46642857)
chr4 (32-111)||(14185252-14185331)
chr4 (66-168)||(13844461-13844562)
chr4 (66-171)||(630863-630966)
chr4 (66-171)||(15868798-15868901)
chr4 (113-181)||(15190360-15190428)
chr4 (78-170)||(21189751-21189842)
chr4 (113-181)||(15099393-15099461)
chr4 (102-166)||(19609509-19609573)
chr4 (90-173)||(15099265-15099349)
chr4 (125-154)||(630796-630825)
chr4 (125-154)||(13812831-13812860)
chr4 (125-154)||(15868731-15868760)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (33-250)||(1519-1736)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (33-250)||(24865452-24865669)
chr2 (44-247)||(22500945-22501148)
chr2 (44-247)||(22508879-22509082)
chr2 (33-249)||(7672240-7672450)
chr2 (32-148)||(2524410-2524526)
chr2 (34-174)||(6576403-6576543)
chr2 (91-174)||(24883630-24883713)
chr2 (91-158)||(22501128-22501195)
chr2 (91-158)||(22509062-22509129)
chr2 (72-174)||(24436221-24436321)
chr2 (102-174)||(24781643-24781715)
chr2 (102-174)||(5032127-5032199)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (32-247)||(14296-14511)
[»] chr6 (15 HSPs)
chr6 (32-250)||(20734128-20734345)
chr6 (45-183)||(2201139-2201277)
chr6 (47-183)||(22420987-22421123)
chr6 (35-174)||(34296953-34297092)
chr6 (32-184)||(27851220-27851373)
chr6 (32-208)||(25956537-25956714)
chr6 (66-174)||(19399787-19399895)
chr6 (72-174)||(18927853-18927954)
chr6 (66-169)||(25956719-25956821)
chr6 (66-169)||(31630625-31630727)
chr6 (66-171)||(27851087-27851191)
chr6 (44-174)||(28708651-28708782)
chr6 (102-174)||(27322221-27322293)
chr6 (102-174)||(18708677-18708749)
chr6 (102-174)||(23151069-23151141)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (32-250)||(6359-6576)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (45-250)||(10848-11053)
[»] chr1 (19 HSPs)
chr1 (53-250)||(51274290-51274487)
chr1 (34-169)||(12328538-12328673)
chr1 (45-153)||(8885447-8885555)
chr1 (32-208)||(28194365-28194542)
chr1 (32-204)||(43697405-43697578)
chr1 (72-154)||(51326892-51326974)
chr1 (66-158)||(28194547-28194638)
chr1 (66-169)||(43543031-43543133)
chr1 (113-208)||(49261357-49261452)
chr1 (66-169)||(43697294-43697396)
chr1 (119-208)||(20636866-20636955)
chr1 (66-169)||(46382655-46382755)
chr1 (93-174)||(48301040-48301121)
chr1 (101-174)||(20636764-20636837)
chr1 (143-183)||(8882176-8882216)
chr1 (113-208)||(35981696-35981791)
chr1 (102-173)||(41227507-41227578)
chr1 (90-174)||(35981808-35981893)
chr1 (35-64)||(51326969-51326998)
[»] scaffold0599 (2 HSPs)
scaffold0599 (32-174)||(4644-4786)
scaffold0599 (32-174)||(226-368)
[»] scaffold0815 (1 HSPs)
scaffold0815 (76-237)||(450-611)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (32-208)||(43700-43877)
scaffold0116 (32-208)||(47620-47797)
scaffold0116 (66-169)||(43882-43984)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (61-174)||(6769-6882)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (40-183)||(59295-59437)
[»] scaffold0061 (2 HSPs)
scaffold0061 (43-180)||(15419-15556)
scaffold0061 (43-180)||(24477-24614)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (32-174)||(3093-3234)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (66-171)||(85167-85271)
scaffold0009 (113-208)||(85276-85371)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (66-169)||(36146-36248)
[»] scaffold0810 (2 HSPs)
scaffold0810 (71-169)||(2966-3063)
scaffold0810 (32-101)||(3066-3136)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (72-174)||(834-935)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (66-169)||(10967-11069)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (66-169)||(362926-363028)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (72-174)||(5478-5579)
[»] scaffold0679 (1 HSPs)
scaffold0679 (44-174)||(2421-2552)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (72-174)||(76919-77019)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (102-174)||(10029-10101)
[»] scaffold1137 (2 HSPs)
scaffold1137 (113-208)||(2300-2395)
scaffold1137 (101-172)||(2424-2495)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (103-174)||(9106-9177)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (102-174)||(8189-8261)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (66-171)||(8383-8486)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (102-174)||(9561-9633)
[»] scaffold0586 (1 HSPs)
scaffold0586 (99-170)||(1920-1990)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (66-169)||(24743-24844)
scaffold0124 (125-154)||(24676-24705)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (125-154)||(9926-9955)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (125-154)||(7670-7699)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 31224635 - 31224853
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31224635 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 31224734  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31224735 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtttaagt 31224834  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  31224835 tgttaagttgtaagatgtt 31224853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Original strand, 15447681 - 15447893
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15447681 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 15447780  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15447781 tgttatat---atgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 15447877  T
Q  232 tgttaagttgtaagat 247  Q
    ||||||||||||||||    
T  15447878 tgttaagttgtaagat 15447893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 66 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31415541 - 31415357
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31415541 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 31415442  T
Q  166 gctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31415441 gctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgtt 31415357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11913092 - 11912950
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11913092 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11912993  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  11912992 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 11912950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 6808291 - 6808157
Alignment:
Q  49 atgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgatt 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6808291 atgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatataatgatt 6808192  T
Q  149 attattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||| ||||||    
T  6808191 attattgatggtgacttccttcatatgtctaaatg 6808157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 66 - 220
Target Start/End: Original strand, 49969967 - 49970121
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  49969967 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgactt 49970066  T
Q  166 gctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaa 220  Q
    |||||||||  || ||||  |||  ||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  49970067 gctgcatattatttaatggtactgccttgctgttgtgatgtattattatcattaa 49970121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Original strand, 1988912 - 1989050
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || || || |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  1988912 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgattcacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 1989011  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  1989012 tggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 1989050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 49389752 - 49389870
Alignment:
Q  52 attaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatattta--tatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgatta 149  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  49389752 attaatattgttgtttaaagttgatgattaaatgtgaaaatatttagatatattgtgaa-gttgttgatatgaagttgtaattgttatatttgatgatta 49389850  T
Q  150 ttattgatggtgacttgctg 169  Q
    || |||||| ||||||||||    
T  49389851 ttgttgatgttgacttgctg 49389870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 20630195 - 20630297
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  20630195 tttactttgacgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 20630293  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  20630294 gctg 20630297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12269773 - 12269598
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||     
T  12269773 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tga-aaaagatttatatattgtgaaagttgttgatatgaagttgtat 12269676  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    || ||| |||||| || |||||| | |||| ||||| || ||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||    
T  12269675 tttttacatatgaagaatattatcggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtcatgaat 12269598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40812096 - 40812015
Alignment:
Q  93 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40812096 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40812015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 5842089 - 5841958
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    |||||||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| ||||||| ||    
T  5842089 ataagatggttaatgttgtggttttaaattgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatatttg 5841990  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5841989 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 5841958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 18439945 - 18440047
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||| |    
T  18439945 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatctatatattgtgaaagatgatgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacct 18440043  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  18440044 gctg 18440047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 18439845 - 18439940
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  18439845 gttgatatgtagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 18439940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12269587 - 12269486
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||    
T  12269587 ttgatgattaa-tgtgagaagatttataaattttgaaggacgttgatatgaagttgtaatgattatatttgatgattattgttgatgttgacgtgctgca 12269489  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  12269488 tat 12269486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 89 - 174
Target Start/End: Original strand, 30175304 - 30175389
Alignment:
Q  89 aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  30175304 aaatatttatatactgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggatatatgggatgattattgttgatgttgacttgcttcatat 30175389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40807245 - 40807173
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  40807245 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 40807173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 22307386 - 22307458
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  22307386 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 22307458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 113 - 184
Target Start/End: Original strand, 1465419 - 1465490
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  1465419 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctctatatgtttaaatga 1465490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17538356 - 17538284
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  17538356 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtattgattatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 17538284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 49389639 - 49389734
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||| ||||  ||||  || ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  49389639 gttggtatgaagttgaaattgttatacatgaagatcattattaatgggtacttattgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 49389734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 1465531 - 1465616
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| |||  || ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1465531 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttggatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 1465616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 12852390 - 12852419
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12852390 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 12852419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 24)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 35 - 250
Target Start/End: Original strand, 36685934 - 36686149
Alignment:
Q  35 agaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||    
T  36685934 agaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgctgatatgaagttttaattgt 36686033  T
Q  135 tatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgt 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  36686034 tatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgt 36686133  T
Q  235 taagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||    
T  36686134 taagttgtaagatgtt 36686149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 30820937 - 30821155
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  30820937 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaagttgtaat 30821036  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30821037 tgttatatatgatgattattattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 30821136  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30821137 tgttaagttgtaagatgtt 30821155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 66 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 38480374 - 38480190
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38480374 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 38480275  T
Q  166 gctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||| |||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||    
T  38480274 gctgcatatatttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatatctaagttgttaagttgtaagatgtt 38480190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11085170 - 11085019
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  11085170 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaactatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 11085071  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  11085070 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatacgattaaatg 11085019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 11092908 - 11092757
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  11092908 cagagagtgtgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaat 11092809  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11092808 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgttgcatacgtttaaatg 11092757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 33 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15213869 - 15213728
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  15213869 agagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacattgatatgaaattgtaatt 15213770  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15213769 gttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 15213728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Original strand, 9320423 - 9320561
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9320423 taagatgattaatattgatgatttattttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 9320522  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  9320523 gattattattgatggtgacttgttgcatatgtctaaatg 9320561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 15439457 - 15439322
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||  |||| |||||||||||||    
T  15439457 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatactatgtgaaagttgttgatatgaagttgtaa 15439358  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 166  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15439357 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttg 15439322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 169
Target Start/End: Original strand, 37727607 - 37727745
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  || | |||||||||||||    
T  37727607 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgctttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgtagatatgaagttgtaa 37727706  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    | ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37727707 tggttgtatttgatgattattgttgatgttgacttgctg 37727745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8468450 - 8468348
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  8468450 tttactttgatgattaa-tgtgataatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 8468352  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  8468351 gctg 8468348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 14270142 - 14270244
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  14270142 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 14270240  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  14270241 gctg 14270244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 45847738 - 45847840
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  45847738 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 45847836  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  45847837 gctg 45847840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17232644 - 17232537
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||| |||  |||||||||| ||| || ||||||    
T  17232644 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttggaatggttgtattagatgattattgttgctgttgactt 17232546  T
Q  166 gctgcatat 174  Q
    |||| ||||    
T  17232545 gctgtatat 17232537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 11391870 - 11392001
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    |||||||||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |    
T  11391870 ataagatgattaatgttgtggatttaaattgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattgg 11391969  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  11391970 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 11392001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 12371527 - 12371455
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  12371527 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 12371455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 13148275 - 13148347
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  13148275 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 13148347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 9389705 - 9389800
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  9389705 gttgatatgaagttgaaattgatatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 9389800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Original strand, 8851959 - 8852040
Alignment:
Q  93 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  8851959 atttatatattgtgaaagattttgatataaagttgtaatggttatatgggatgattattgttgatgttgacttactgcatat 8852040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11066717 - 11066645
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||| ||| || |||||||||||||||    
T  11066717 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttatattggatgatcattgttgttgttgacttgctgcatat 11066645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 17232744 - 17232649
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | || ||||||||||||||||    
T  17232744 gttgatatggagttgcaaatgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgatgtcatgctgttgtgatgaat 17232649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 39267712 - 39267741
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39267712 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 39267741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 8468524 - 8468472
Alignment:
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  8468524 tgttacatatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatga 8468472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 12127967 - 12128039
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| | |||||  || ||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  12127967 ttgtgaaagatgtttatatgaagttgtaatggatatattggacgattattgttgatgttgacttactgcatat 12128039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 165
Target Start/End: Original strand, 32434396 - 32434456
Alignment:
Q  105 tgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||| ||||||    
T  32434396 tgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgctgatgttgactt 32434456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 20)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 12122202 - 12122420
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12122202 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 12122301  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12122302 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgcggcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccattgagatgtttaagt 12122401  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  12122402 tgttaagttgtaagatgtt 12122420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 21557726 - 21557944
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21557726 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21557825  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21557826 tgttatatatgatgattattattgatagtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttatgatgaattaataccattaagatgtctaagt 21557925  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  21557926 tgttaagttgtaagatgtt 21557944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 21555060 - 21555279
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  21555060 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttagtttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgacataaagttgtaat 21555159  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaatacca-ttaaaatgtttaag 230  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21555160 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaagatgtctaag 21555259  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21555260 ttgttaagttgtaagatgtt 21555279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31455862 - 31455643
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  31455862 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatatgaagttgtaatcg 31455763  T
Q  134 ttatatatga---tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaag 230  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31455762 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatgtctaag 31455663  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31455662 ttgttaagttgtaagatgtt 31455643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 34 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31455249 - 31455030
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |    
T  31455249 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaacgttgatattaagttgtaatcg 31455150  T
Q  134 ttatatatga---tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaag 230  Q
    ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    
T  31455149 ttataaatgatattgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaagtaataccattaagatgtctaag 31455050  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  31455049 ttgttaagttgtaagatgtt 31455030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30615926 - 30615709
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30615926 cagagaggatgaataagatgattaatattgataatttacttttatgattaaatgtgaaaatatt-atatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 30615828  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  30615827 tgttataattgatgattattaatgatggtgacttgctgcatatgtttaaacgatgatgtcttgctgttgcgatgaattaataccattaagatgtataagt 30615728  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30615727 tgttaagttgtaagatgtt 30615709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 45 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 24212526 - 24212387
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24212526 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgat 24212427  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24212426 gattaatattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatga 24212387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 35852781 - 35852643
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  35852781 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatacgat 35852682  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35852681 gattattattgatggtggcttgctgcatatgtctaaatg 35852643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 36460341 - 36460199
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  36460341 cagagaggatgaacaagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 36460242  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36460241 tgttatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 36460199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 91 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17875326 - 17875170
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactct 190  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  17875326 atatttatataatgataaagacgttgatatgaagttctaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatattat 17875227  T
Q  191 cttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgtaagat 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  17875226 cttgctgttgtgaagaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagat 17875170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Original strand, 5889092 - 5889245
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  5889092 cagagaggatgattatgatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 5889191  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5889192 ttgttatacatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatga 5889245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 5889273 - 5889375
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  5889273 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgactt 5889371  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  5889372 gctg 5889375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 68 - 169
Target Start/End: Original strand, 29915173 - 29915273
Alignment:
Q  68 tactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgc 167  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||||    
T  29915173 tactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgacttgc 29915271  T
Q  168 tg 169  Q
    ||    
T  29915272 tg 29915273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 21871660 - 21871763
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  21871660 tttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgactt 21871757  T
Q  166 gctgca 171  Q
    ||||||    
T  21871758 gctgca 21871763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 21875940 - 21876043
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||||||||| |||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  21875940 tttactttgacgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgactt 21876037  T
Q  166 gctgca 171  Q
    ||||||    
T  21876038 gctgca 21876043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 205
Target Start/End: Original strand, 21741557 - 21741633
Alignment:
Q  129 aattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatg 205  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | ||||||||| ||||||    
T  21741557 aattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatg 21741633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 21741653 - 21741738
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  21741653 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaaatcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 21741738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 21871593 - 21871622
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21871593 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 21871622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 21875873 - 21875902
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21875873 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 21875902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 22120217 - 22120246
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120217 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 22120246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 16)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 21579887 - 21580106
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21579887 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 21579986  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaatacca-ttaaaatgtttaag 230  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  21579987 tgttatatatgataattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccatttaagatgtctaag 21580086  T
Q  231 ttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21580087 ttgttaagttgtaagatgtt 21580106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 29763549 - 29763766
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29763549 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 29763648  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29763649 tgttatatatgatgattattatcgatggtga-ttgctgcatatgtttaaatgatgatgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 29763747  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29763748 tgttaagttgtaagatgtt 29763766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 72 - 250
Target Start/End: Original strand, 41680843 - 41681020
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680843 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatattgatatcaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 41680942  T
Q  172 tatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||    | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  41680943 tatgtttaaatggtgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatg-tcaagttgttaagttgtaagatgtt 41681020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 42560208 - 42560350
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||    
T  42560208 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaatacgttgatatgaaattgtaat 42560307  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42560308 tgttatatatgatgattattattgatgttgacttgctgcatat 42560350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 72 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 32807396 - 32807285
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32807396 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 32807297  T
Q  172 tatgtttaaatg 183  Q
    ||||| ||||||    
T  32807296 tatgtctaaatg 32807285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18760706 - 18760564
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18760706 cagagagtatgaataagatgattaatattgtgggtttaagtagatgattaaatgtgaaaagatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataat 18760607  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
     ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18760606 ggttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 18760564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 27472394 - 27472496
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  27472394 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 27472492  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  27472493 gctg 27472496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 38550089 - 38550191
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  38550089 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 38550187  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  38550188 gctg 38550191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 53 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 39834023 - 39833891
Alignment:
Q  53 ttaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg-ttatatatgatgattatt 151  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| |  |||| |||||||||| || || |||||||||| |||||||    
T  39834023 ttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataacgtgaatgttgttgatatgaagttgcaaatggttatatatgaagattatt 39833924  T
Q  152 attgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  39833923 attgatggttactcgctgtatatgtttaaatga 39833891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 1327123 - 1327225
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  1327123 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaacgatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 1327221  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  1327222 gctg 1327225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22965811 - 22965704
Alignment:
Q  141 tgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagtt 240  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    | |||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  22965811 tgatgattattattgatggtgatttgatgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttatgatgaatcaatactattaagatgtctaagttgttaagtt 22965712  T
Q  241 gtaagatg 248  Q
     |||||||    
T  22965711 ttaagatg 22965704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3273310 - 3273212
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||   | ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3273310 cagagagtatgaataagatgattaatgttatggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaaatgttggtatgaagttgtaat 3273212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 39936813 - 39936885
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  39936813 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatat 39936885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 91 - 169
Target Start/End: Original strand, 20982747 - 20982825
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  20982747 atatatatatattgtgaaagatattgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgatttgctg 20982825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Original strand, 21415211 - 21415281
Alignment:
Q  99 atattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  21415211 atattatgaaagatgttgatatga-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgc 21415281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 19140014 - 19139966
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattat 150  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  19140014 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattat 19139966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 171; Significance: 6e-92; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33186273 - 33186055
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33186273 cagagaggatgaataagatgattaatattaatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaat 33186174  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33186173 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatttgtttaaatgatgatgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 33186074  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  33186073 tgttaagttgtaagatgtt 33186055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 15880855 - 15880717
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15880855 taagatgatcaatattgatgatttactttgattattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 15880756  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15880755 gattattattgatggtgacttgctacatatgtctaaatg 15880717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13844744 - 13844567
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  13844744 cagagaggatgattaagatgatttaatattattgatttacgttgatgattaaatgtgaaaatatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 13844645  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||    
T  13844644 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttactgttgtgatgaat 13844567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 46643038 - 46642862
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  |||  |||||||||||||    
T  46643038 cagagaggatgactaagatgatttaatattgttgtttaaagttgatgattaa-tgcgaaaagatttatatattgtgaaagttgttaatatgaagttgtaa 46642940  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  46642939 ttgttacatatgaagaatattattggtggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgccttgctgttgtgatgaat 46642862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Original strand, 35812171 - 35812312
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  35812171 cagagagtataaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtggaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaat 35812269  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
     |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  35812270 ggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 35812312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9923427 - 9923326
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9923427 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 9923329  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  9923328 tat 9923326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Original strand, 11479432 - 11479533
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  11479432 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 11479530  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  11479531 tat 11479533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 362269 - 362167
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  362269 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 362171  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  362170 gctg 362167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 52873255 - 52873357
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  52873255 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 52873353  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  52873354 gctg 52873357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 46642857 - 46642750
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||| |||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||| |    
T  46642857 tttaatttgatgattaa-tgtgagaagatttataaactgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgacgt 46642759  T
Q  166 gctgcatat 174  Q
    |||||||||    
T  46642758 gctgcatat 46642750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14185331 - 14185252
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14185331 cagagagtatgaataagatgattaacgttgttgttttaagttgatggttaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaga 14185252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13844562 - 13844461
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||| ||||||    
T  13844562 tttactttgattattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgattattattgttgatgatgactt 13844464  T
Q  166 gct 168  Q
    |||    
T  13844463 gct 13844461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 630863 - 630966
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  630863 tttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattattgatgttgactt 630960  T
Q  166 gctgca 171  Q
    ||||||    
T  630961 gctgca 630966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 15868798 - 15868901
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  15868798 tttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattatatctgatgattattgttgatgttgactt 15868895  T
Q  166 gctgca 171  Q
    ||||||    
T  15868896 gctgca 15868901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15190428 - 15190360
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaa 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15190428 gttgatatgaagttgaaattgttatacatgaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15190360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 170
Target Start/End: Original strand, 21189751 - 21189842
Alignment:
Q  78 attaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    |||||| ||| |||||||||||| || ||||||| |||| ||| | ||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21189751 attaaaagtggaaatatttatatgttatgaaagatgttgatatca-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttggtgacttgctgc 21189842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 113 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15099461 - 15099393
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaa 181  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| || | |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15099461 gttgatatgaagttgaaattgttatacataaagattattaatgatggttacttgctgtatatgtttaaa 15099393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 19609573 - 19609509
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttg 166  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||    
T  19609573 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttg 19609509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15099349 - 15099265
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcata 173  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  15099349 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcata 15099265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 630796 - 630825
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  630796 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 630825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 13812831 - 13812860
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13812831 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 13812860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 15868731 - 15868760
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15868731 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 15868760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1736 - 1519
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1736 agagaggattaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagttgtaatt 1637  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagtt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  1636 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 1537  T
Q  233 gttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1536 gttaagttgtaagatgtt 1519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 33 - 250
Target Start/End: Original strand, 24865452 - 24865669
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24865452 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatt 24865551  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagtt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  24865552 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 24865651  T
Q  233 gttaagttgtaagatgtt 250  Q
    ||||||||||||||||||    
T  24865652 gttaagttgtaagatgtt 24865669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22501148 - 22500945
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatga 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22501148 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22501049  T
Q  144 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgta 243  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22501048 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 22500949  T
Q  244 agat 247  Q
    ||||    
T  22500948 agat 22500945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 44 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22509082 - 22508879
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatga 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  22509082 ataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataaga 22508983  T
Q  144 tgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgta 243  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  22508982 tgattaatattgatggtaacttgctgcatatgtttaaatgatgctgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgta 22508883  T
Q  244 agat 247  Q
    ||||    
T  22508882 agat 22508879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 33 - 249
Target Start/End: Original strand, 7672240 - 7672450
Alignment:
Q  33 agagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaatt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      ||    
T  7672240 agagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaag------tt 7672333  T
Q  133 gttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagtt 232  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  7672334 gttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatacgtttaaatgatgctgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagtt 7672433  T
Q  233 gttaagttgtaagatgt 249  Q
    ||||||| |||||||||    
T  7672434 gttaagtcgtaagatgt 7672450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 32 - 148
Target Start/End: Original strand, 2524410 - 2524526
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  2524410 cagagagtatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatcaaattgtaat 2524509  T
Q  132 tgttatatatgatgatt 148  Q
    ||||| |||||||||||    
T  2524510 tgttacatatgatgatt 2524526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6576543 - 6576403
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |    
T  6576543 gagagtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaaagtgaaaaaatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgg 6576444  T
Q  134 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6576443 ttatatttgatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 6576403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 91 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24883713 - 24883630
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24883713 atatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24883630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22501195 - 22501128
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22501195 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22501128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22509129 - 22509062
Alignment:
Q  91 atatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 158  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22509129 atatttatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattaatattgatg 22509062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 24436321 - 24436221
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||| ||  ||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  24436321 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaaattgtaatggttacattggatgatt-ttgttgatgttgacttgctgca 24436224  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  24436223 tat 24436221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 24781643 - 24781715
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  24781643 ttgtgaaagttgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 24781715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 5032127 - 5032199
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||| | |||| ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  5032127 ttgtgaaaaatgttgatatgaagttataatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 5032199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 32 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14511 - 14296
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14511 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatattcatataatgtgaaagacgttgatatgaagttgtaat 14412  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  14411 tgttatataagatgattattattgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagt 14312  T
Q  232 tgttaagttgtaagat 247  Q
    ||||||||||||||||    
T  14311 tgttaagttgtaagat 14296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 15)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 20734128 - 20734345
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20734128 cagagaggatgaataaaatgatttatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 20734227  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  20734228 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctgttgtgatgaattaataccattaagatg-tcaagt 20734326  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  20734327 tgttaagttgtaagatgtt 20734345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 2201277 - 2201139
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2201277 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatatgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgat 2201178  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2201177 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtctaaatg 2201139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 47 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22421123 - 22420987
Alignment:
Q  47 agatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatga 146  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22421123 agatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgttatatatgatga 22421024  T
Q  147 ttattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  22421023 ttattattgatagtgacttgttgcatatgtctaaatg 22420987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 35 - 174
Target Start/End: Original strand, 34296953 - 34297092
Alignment:
Q  35 agaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgt 134  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34296953 agaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattagatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgt 34297052  T
Q  135 tatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  34297053 tatatatgatgattattattaatgttgacttgctgcatat 34297092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 27851373 - 27851220
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa- 130  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||     
T  27851373 cagagaggatgaataagatgatttatattgatgatttaccttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 27851274  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatga 184  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||    
T  27851273 ttgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtgtatgtttaaatga 27851220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 25956537 - 25956714
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  25956537 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 25956636  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  25956637 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 25956714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19399895 - 19399787
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  19399895 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatatttgatgattattgttgatgttgactt 19399796  T
Q  166 gctgcatat 174  Q
    |||||||||    
T  19399795 gctgcatat 19399787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18927954 - 18927853
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  18927954 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 18927856  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  18927855 tat 18927853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 25956719 - 25956821
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  25956719 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgactt 25956817  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  25956818 gctg 25956821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 31630625 - 31630727
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  31630625 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttataatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 31630723  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  31630724 gctg 31630727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27851191 - 27851087
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    |||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| | ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  27851191 tttactttgatgcttaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtattggttgtatttgatgattattgtcgatgttgactt 27851093  T
Q  166 gctgca 171  Q
    ||||||    
T  27851092 gctgca 27851087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28708782 - 28708651
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    |||||||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |    
T  28708782 ataagatggttaatgttgtggttttaaattgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattgg 28708683  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28708682 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 28708651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 27322221 - 27322293
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27322221 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 27322293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18708749 - 18708677
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  18708749 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgtttatgttgacttgctgcatat 18708677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 23151069 - 23151141
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  23151069 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcatat 23151141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 159; Significance: 9e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 32 - 250
Target Start/End: Original strand, 6359 - 6576
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  6359 cagagaggatgaataagatgattaataataatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 6458  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  6459 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatggtgttgtcttgctattgtgatgaattaataccattaagatg-tcaagt 6557  T
Q  232 tgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||||||||    
T  6558 tgttaagttgtaagatgtt 6576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 45 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11053 - 10848
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  11053 taagatgattaatgttgatgatttactatgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaatttttaattgttatatatgat 10954  T
Q  145 gattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgtaa 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  10953 gattattattgattgtgacttgctgcatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttttgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaa 10854  T
Q  245 gatgtt 250  Q
    ||||||    
T  10853 gatgtt 10848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 19)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 53 - 250
Target Start/End: Original strand, 51274290 - 51274487
Alignment:
Q  53 ttaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattatta 152  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51274290 ttaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatataagatgattatta 51274389  T
Q  153 ttgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaagttgtaagatgtt 250  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||    | | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  51274390 ttgatggtgacttgatgcatatgtttaaatgtttttgttttgttgttgtgatgaattaataccattaagatgtctaagttgttaagttgtaagatgtt 51274487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Original strand, 12328538 - 12328673
Alignment:
Q  34 gagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  12328538 gagaggatgaataagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatttgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaagatgtaattg 12328637  T
Q  134 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12328638 ttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 12328673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 8885555 - 8885447
Alignment:
Q  45 taagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgat 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  8885555 taagatgattaatattgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaattgtaatatatgat 8885456  T
Q  145 gattattat 153  Q
    |||| ||||    
T  8885455 gattgttat 8885447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 28194365 - 28194542
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||| ||||| || ||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  28194365 cagagaagatgattaggatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaaaatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 28194464  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  28194465 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 28194542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 32 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43697578 - 43697405
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  43697578 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaagatctatatagtgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43697479  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgat 204  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||  || |||||||||||||||    
T  43697478 atgttatatatgaagattattattgttggttacttgctgtatatgtttatatgatgctgtcttgctgttgtgat 43697405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 51326974 - 51326892
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51326974 ttgatgattaaatgtgaacatatttatatattatgaaagacgttgatatgaagttgtaattgttatatatgttgattattatt 51326892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 158
Target Start/End: Original strand, 28194547 - 28194638
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatg 158  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  28194547 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatg 28194638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43543133 - 43543031
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  || |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  43543133 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttgactt 43543035  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  43543034 gctg 43543031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 49261452 - 49261357
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||    
T  49261452 gttgatatgaagttgtaattgttatacatgaagattattattgatggttacttgttatatatgtttaaatgatactgtcttgctgtcgtgatgaat 49261357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 43697396 - 43697294
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  43697396 tttactttgatgattaa-tgtgagattattgatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttttatttgatgattattgttgatgatgactt 43697298  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  43697297 gctg 43697294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 20636955 - 20636866
Alignment:
Q  119 atgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  20636955 atgaagttgtaattgttatacatgaatattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 20636866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 46382655 - 46382755
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  46382655 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttata--ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttttattagatgattattgttgatgttgactt 46382751  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  46382752 gctg 46382755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48301121 - 48301040
Alignment:
Q  93 atttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  48301121 atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttacatgagattattattgttgatgttgacttgctgcatat 48301040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20636837 - 20636764
Alignment:
Q  101 attgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  20636837 attgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcatat 20636764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8882216 - 8882176
Alignment:
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  8882216 atgattattattgatggtaacttgctgcatatgtctaaatg 8882176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 35981696 - 35981791
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||| || ||||||| ||||| || ||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||    
T  35981696 gttgatatgaagttgaaattgttgcacatgaagattactaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgtcgtgatgaat 35981791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 173
Target Start/End: Original strand, 41227507 - 41227578
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcata 173  Q
    |||||||||| |||  ||||||||| |||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  41227507 ttgtgaaagatgtttatatgaagttttaatggttatattggatgattattgttaatgttgacttgctgcata 41227578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 90 - 174
Target Start/End: Original strand, 35981808 - 35981893
Alignment:
Q  90 aatatttatata-ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  35981808 aatatttatataattgtgaaagatgcttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgttgcatat 35981893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 51326998 - 51326969
Alignment:
Q  35 agaggatgaataagatgattaatattgatg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51326998 agaggatgaataagatgattaatattgatg 51326969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4786 - 4644
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4786 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 4687  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4686 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 4644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 368 - 226
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  368 cagagaggatgaataagatgattaataatgatgatttactttgatgattatatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattgtaat 269  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  268 tgttatatatgattattattattgatgttgacttgatgcatat 226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0815 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0815
Description:

Target: scaffold0815; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 611 - 450
Alignment:
Q  76 tgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 175  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  611 tgattaaatgagaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatgaaattataattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatg 512  T
Q  176 tttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaattaataccattaaaatgtttaagttgttaa 237  Q
    || ||||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  511 ttaaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaattaatatcattaagatgtctaagttgttaa 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 43700 - 43877
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  43700 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatggagttgcaa 43799  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  43800 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgctgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 43877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 208
Target Start/End: Original strand, 47620 - 47797
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaa 130  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||  |||| |||| ||||| ||    
T  47620 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatataatgtgaaagttgttgatatgtagttgcaa 47719  T
Q  131 ttgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  47720 atgttatatatgaagattattattgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgttgtcttgctgttgtgatgaat 47797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 43882 - 43984
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  43882 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgctgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgactt 43980  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  43981 gctg 43984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 61 - 174
Target Start/End: Original strand, 6769 - 6882
Alignment:
Q  61 gatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggt 160  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||| || ||| |    
T  6769 gatgatttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttgatatggagttgtaatgattatatttgatgattattgttcatgtt 6868  T
Q  161 gacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||||||||    
T  6869 gacttgctgcatat 6882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 40 - 183
Target Start/End: Original strand, 59295 - 59437
Alignment:
Q  40 atgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatat 139  Q
    |||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  59295 atgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaattgttatat 59393  T
Q  140 atgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatg 183  Q
      |||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  59394 tggatgattattgttgatgttgacttgctgcatattttttaatg 59437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Original strand, 15419 - 15556
Alignment:
Q  43 aataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||  |    
T  15419 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 15518  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaa 180  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  15519 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 15556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 43 - 180
Target Start/End: Original strand, 24477 - 24614
Alignment:
Q  43 aataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||  ||||||||||  |    
T  24477 aataagatgattaatgttgttgatttaagttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaaaatgttgatatgaagttgcgattgttatattcg 24576  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaa 180  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  24577 atgattatcattgatgttgatttgctgcatatatttaa 24614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 67; Significance: 7e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3234 - 3093
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaat 131  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||  |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  3234 cagagagtatgaataagatgattaatgttgtggatttaagttgatgattaaatgtgaaag-atttatatatcgtgaaaaatgttgatatgaagttgtaat 3136  T
Q  132 tgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
     |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  3135 ggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 85271 - 85167
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  85271 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatagttgtatttgatgattattgttgatgttgactt 85173  T
Q  166 gctgca 171  Q
    ||||||    
T  85172 gctgca 85167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 85371 - 85276
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||   | |||||||||||||||||||    
T  85371 gttgatatggagttgcaaatgttatatatgaagattattattgatggttacttgatgtatatgtttaaatgaagttgtcttgctgttgtgatgaat 85276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 36146 - 36248
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  36146 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattagatgattattgttgatgttgactt 36244  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  36245 gctg 36248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 71 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3063 - 2966
Alignment:
Q  71 tttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctg 169  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3063 tttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtatttgatgattattgttgatgatgacttgctg 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 3136 - 3066
Alignment:
Q  32 cagagaggatgaataagatgatt-aatattgatgttttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatata 101  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  3136 cagagaggatgattaagatgatttaatattgttgatttacgttgatgattaaatgtgaaaagatctatata 3066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 834
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  935 ttgatgattaaatgtgaaag-attaatatattgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgca 837  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  836 tat 834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 10967 - 11069
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  10967 tttactttgatgattta-tgtgagaatatttatatattgtaaaagatgttgatatgaagttgtaatggttgtattagatgattattgttgatgttgactt 11065  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  11066 gctg 11069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 363028 - 362926
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||  || |||  |||||||||| |||||| ||||||    
T  363028 tttactttgatgattaa-tgtgagaatatttatatattttgaaagatgttgatatgaagttgtaatgattgtattagatgattattgttgatgttgactt 362930  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  362929 gctg 362926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Original strand, 5478 - 5579
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  5478 ttgatgattaaatgtgaaag-atttatatattgtgaaaggtgttgatatgaagttgtaatgtttatattggatgattattgttgatgttaacttgctgca 5576  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  5577 tat 5579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0679 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0679
Description:

Target: scaffold0679; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 2421 - 2552
Alignment:
Q  44 ataagatgattaatattgatgttttactttgatgattaaatgtga-aaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatg 142  Q
    |||||||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| | |  || ||||||||||| |||||||  |    
T  2421 ataagatggttaatgttgtggttttaaattgatgattaaatgtacgaaagatttatatattgtgaaagatgctcataagaagttgtaatggttatattgg 2520  T
Q  143 atgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  2521 atgattattgttgatgttgacttgctgcatat 2552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 72 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 77019 - 76919
Alignment:
Q  72 ttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgca 171  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||  ||| ||||| ||    
T  77019 ttgatgattaaatgtgaaaat--ttatatattgtgaaagatgtggatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgattttgatttgctaca 76922  T
Q  172 tat 174  Q
    |||    
T  76921 tat 76919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 10029 - 10101
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  10029 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 10101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 208
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2395
Alignment:
Q  113 gttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatatgtttaaatgacactctcttgctgttgtgatgaat 208  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||    
T  2300 gttgatatgaagttgaaattgttgtacatgaagattattaatgatggttacttgttgtatatgtttaaatgatgctgtcttgctgtcgtgatgaat 2395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 172
Target Start/End: Original strand, 2424 - 2495
Alignment:
Q  101 attgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcat 172  Q
    ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||| ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2424 attgtgaaagatgtttatatgaagtcgtaatggttgtatttgacgattattgttgatgttgacttgctgcat 2495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 103 - 174
Target Start/End: Original strand, 9106 - 9177
Alignment:
Q  103 tgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9106 tgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattattgttgatgttgacttgctgcatat 9177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 8189 - 8261
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  8189 ttgtgaaagatgttgatatgaagttgtaatggttatattggatgattgttgttgatgttgacttgctgcatat 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 171
Target Start/End: Original strand, 8383 - 8486
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||| || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  8383 tttactttgatgattaa-tgagagaatatt-atatattgtgaatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgactt 8480  T
Q  166 gctgca 171  Q
    | ||||    
T  8481 gttgca 8486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 174
Target Start/End: Original strand, 9561 - 9633
Alignment:
Q  102 ttgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgcatat 174  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||  ||||||||   |||||| |||||||||||||||    
T  9561 ttgtgaaagatgttaatatgaagttgtaatggttatattggatgattaccgttgatgttgacttgctgcatat 9633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0586 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:

Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1920
Alignment:
Q  99 atattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgacttgctgc 170  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  1990 atattatgaaagatgttgatatga-gttatacttgttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgc 1920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 24743 - 24844
Alignment:
Q  66 tttactttgatgattaaatgtgaaaatatttatatattgtgaaagacgttggtatgaagttgtaattgttatatatgatgattattattgatggtgactt 165  Q
    ||||||||||||||||  || || |||||| |||||||||| | || | || ||||||||||||||  || ||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  24743 tttactttgatgattat-tgagagaatatt-atatattgtggatgatgatgatatgaagttgtaatgattgtatttgatgattattgttgatgttgactt 24840  T
Q  166 gctg 169  Q
    ||||    
T  24841 gctg 24844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 24676 - 24705
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24676 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 24705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9955 - 9926
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9955 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 9926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 125 - 154
Target Start/End: Original strand, 7670 - 7699
Alignment:
Q  125 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7670 ttgtaattgttatatatgatgattattatt 7699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 63 times since January 2019
Visitors: 6700