View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0914_high_32 (Length: 345)

Name: NF0914_high_32
Description: NF0914
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0914_high_32
NF0914_high_32
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (1-312)||(6311190-6311502)
chr8 (8-289)||(7289831-7290112)
chr8 (7-313)||(36979276-36979582)
chr8 (1-289)||(25328184-25328470)
chr8 (7-313)||(33037700-33038005)
chr8 (7-313)||(30655542-30655851)
chr8 (7-313)||(4759967-4760274)
chr8 (1-313)||(18853059-18853372)
chr8 (1-313)||(18870453-18870763)
chr8 (7-313)||(10689034-10689341)
chr8 (1-284)||(39784734-39785016)
chr8 (1-284)||(35745284-35745566)
chr8 (7-313)||(1261847-1262148)
chr8 (10-234)||(10684224-10684447)
chr8 (88-311)||(31071124-31071349)
chr8 (88-192)||(26287879-26287985)
chr8 (88-192)||(26301136-26301242)
chr8 (88-192)||(26313130-26313236)
chr8 (110-195)||(26403240-26403327)
chr8 (110-193)||(4456028-4456113)
chr8 (75-193)||(7412305-7412426)
chr8 (110-193)||(19175766-19175851)
chr8 (110-192)||(4696609-4696693)
chr8 (110-195)||(23799587-23799674)
chr8 (112-173)||(9765852-9765914)
chr8 (113-195)||(6127224-6127308)
chr8 (110-195)||(5702493-5702580)
chr8 (110-192)||(19752407-19752491)
chr8 (238-313)||(26288020-26288094)
chr8 (238-313)||(26301277-26301351)
chr8 (238-313)||(26313271-26313345)
chr8 (114-173)||(43079877-43079937)
chr8 (114-173)||(43082248-43082308)
chr8 (110-176)||(6813683-6813750)
chr8 (140-173)||(18810982-18811015)
chr8 (114-173)||(44721118-44721178)
[»] chr5 (45 HSPs)
chr5 (1-289)||(43592171-43592459)
chr5 (1-289)||(27449706-27449994)
chr5 (1-289)||(43598616-43598904)
chr5 (1-289)||(43604108-43604396)
chr5 (1-289)||(43609600-43609888)
chr5 (1-289)||(1457067-1457354)
chr5 (1-289)||(27444862-27445150)
chr5 (32-313)||(31180138-31180418)
chr5 (1-289)||(15044579-15044865)
chr5 (7-313)||(30631305-30631610)
chr5 (1-284)||(37556533-37556816)
chr5 (1-284)||(37561355-37561638)
chr5 (1-313)||(24135744-24136052)
chr5 (1-284)||(28807485-28807767)
chr5 (7-313)||(38219298-38219602)
chr5 (7-305)||(38192073-38192369)
chr5 (1-284)||(2785268-2785550)
chr5 (1-284)||(33791209-33791491)
chr5 (1-234)||(31401810-31402042)
chr5 (1-234)||(31396953-31397185)
chr5 (88-313)||(35387640-35387866)
chr5 (1-229)||(33768072-33768299)
chr5 (110-193)||(9353344-9353429)
chr5 (110-193)||(36932362-36932447)
chr5 (110-195)||(10281751-10281838)
chr5 (110-312)||(15464532-15464735)
chr5 (111-195)||(11916982-11917068)
chr5 (110-195)||(17003970-17004057)
chr5 (110-193)||(14520230-14520315)
chr5 (110-192)||(28832259-28832343)
chr5 (110-195)||(3880299-3880386)
chr5 (110-195)||(19588746-19588833)
chr5 (113-193)||(12084187-12084269)
chr5 (110-192)||(42127423-42127507)
chr5 (114-173)||(4410241-4410301)
chr5 (110-189)||(31300612-31300693)
chr5 (114-173)||(15552464-15552524)
chr5 (114-173)||(31179371-31179431)
chr5 (114-173)||(31542953-31543013)
chr5 (114-173)||(31545299-31545359)
chr5 (114-167)||(27910675-27910729)
chr5 (114-173)||(3373137-3373197)
chr5 (114-173)||(10749919-10749979)
chr5 (114-173)||(15354575-15354635)
chr5 (110-192)||(24553520-24553603)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-289)||(9224312-9224599)
chr4 (1-289)||(9229099-9229386)
chr4 (1-289)||(51520349-51520637)
chr4 (7-313)||(24741839-24742145)
chr4 (2-288)||(45357203-45357488)
chr4 (2-288)||(45347723-45348009)
chr4 (1-229)||(56146677-56146904)
chr4 (7-313)||(29760541-29760845)
chr4 (1-289)||(3813916-3814202)
chr4 (1-284)||(18855619-18855900)
chr4 (1-274)||(5732554-5732828)
chr4 (88-313)||(28468431-28468647)
chr4 (88-312)||(31985529-31985752)
chr4 (110-195)||(10047379-10047466)
chr4 (110-195)||(39245994-39246081)
chr4 (110-193)||(36315241-36315326)
chr4 (110-193)||(36329450-36329535)
chr4 (110-195)||(16623303-16623390)
chr4 (110-195)||(38152449-38152536)
chr4 (111-194)||(5143260-5143345)
chr4 (110-193)||(5396683-5396768)
chr4 (110-192)||(5269204-5269288)
chr4 (110-195)||(3796529-3796616)
chr4 (111-194)||(5147678-5147763)
chr4 (110-195)||(24333809-24333896)
chr4 (115-195)||(6743425-6743507)
chr4 (111-193)||(3777550-3777634)
chr4 (114-195)||(16630690-16630773)
chr4 (114-173)||(16931789-16931849)
chr4 (114-173)||(16934143-16934203)
chr4 (114-173)||(22780373-22780433)
chr4 (114-173)||(44599838-44599898)
chr4 (131-173)||(39774338-39774380)
chr4 (110-194)||(54867184-54867269)
chr4 (114-173)||(6765117-6765177)
chr4 (114-173)||(7941596-7941656)
chr4 (114-173)||(18709164-18709224)
chr4 (114-173)||(22782738-22782798)
[»] chr3 (54 HSPs)
chr3 (7-313)||(28503756-28504053)
chr3 (1-289)||(22173100-22173387)
chr3 (7-313)||(7167143-7167449)
chr3 (1-313)||(2671478-2671790)
chr3 (43-313)||(8738955-8739224)
chr3 (43-313)||(9091193-9091462)
chr3 (1-274)||(18656324-18656598)
chr3 (7-313)||(8477263-8477569)
chr3 (50-313)||(40372688-40372949)
chr3 (153-313)||(28501589-28501750)
chr3 (1-288)||(2676993-2677280)
chr3 (1-288)||(2672837-2673124)
chr3 (110-312)||(26928484-26928687)
chr3 (1-234)||(8512108-8512342)
chr3 (1-234)||(8516988-8517222)
chr3 (1-288)||(24968000-24968286)
chr3 (10-234)||(32475387-32475608)
chr3 (88-312)||(32143299-32143524)
chr3 (10-234)||(32480245-32480466)
chr3 (88-311)||(1305927-1306150)
chr3 (110-312)||(27452958-27453161)
chr3 (1-158)||(10207826-10207983)
chr3 (110-193)||(8370488-8370573)
chr3 (110-193)||(27974954-27975039)
chr3 (110-192)||(27986449-27986533)
chr3 (110-195)||(18552883-18552970)
chr3 (111-195)||(36029094-36029180)
chr3 (110-193)||(16264350-16264435)
chr3 (110-193)||(21711223-21711308)
chr3 (113-195)||(1736305-1736389)
chr3 (110-192)||(33386669-33386753)
chr3 (110-195)||(30709790-30709877)
chr3 (110-195)||(3716002-3716089)
chr3 (110-195)||(40592782-40592869)
chr3 (110-195)||(48438214-48438301)
chr3 (110-193)||(6794715-6794800)
chr3 (110-192)||(1417493-1417577)
chr3 (110-195)||(25795781-25795868)
chr3 (110-195)||(26298988-26299075)
chr3 (110-192)||(37466291-37466375)
chr3 (110-192)||(39039995-39040079)
chr3 (110-195)||(47923906-47923993)
chr3 (110-192)||(3328359-3328443)
chr3 (110-176)||(4386947-4387014)
chr3 (110-195)||(40844652-40844738)
chr3 (114-173)||(38210569-38210629)
chr3 (114-173)||(50494198-50494258)
chr3 (114-177)||(53894055-53894119)
chr3 (110-195)||(24695164-24695251)
chr3 (131-192)||(3323693-3323755)
chr3 (114-173)||(458483-458543)
chr3 (114-173)||(6063444-6063504)
chr3 (114-173)||(10621528-10621588)
chr3 (110-157)||(39153357-39153405)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-289)||(34967-35254)
[»] chr7 (48 HSPs)
chr7 (1-290)||(12406224-12406512)
chr7 (1-289)||(12396804-12397091)
chr7 (1-313)||(20357439-20357751)
chr7 (1-289)||(31109489-31109775)
chr7 (1-313)||(2057852-2058171)
chr7 (1-289)||(24024232-24024520)
chr7 (1-198)||(4866622-4866819)
chr7 (9-284)||(19992213-19992487)
chr7 (7-313)||(1533335-1533640)
chr7 (1-284)||(21812149-21812431)
chr7 (7-313)||(21639710-21640012)
chr7 (7-313)||(21645908-21646210)
chr7 (10-234)||(24261283-24261506)
chr7 (10-234)||(24266162-24266385)
chr7 (10-234)||(16879975-16880197)
chr7 (10-234)||(16884831-16885053)
chr7 (7-311)||(18408666-18408964)
chr7 (110-311)||(18413641-18413840)
chr7 (111-194)||(21983285-21983370)
chr7 (110-195)||(29159803-29159890)
chr7 (110-195)||(46516320-46516407)
chr7 (110-195)||(49091661-49091748)
chr7 (110-193)||(44848696-44848781)
chr7 (110-192)||(9190021-9190105)
chr7 (110-192)||(20284089-20284173)
chr7 (110-195)||(2647706-2647793)
chr7 (110-195)||(33332460-33332547)
chr7 (110-192)||(2580390-2580474)
chr7 (110-195)||(55948-56034)
chr7 (110-193)||(35960816-35960901)
chr7 (110-192)||(9185178-9185262)
chr7 (110-189)||(47263678-47263757)
chr7 (110-193)||(2479337-2479421)
chr7 (113-173)||(28617258-28617319)
chr7 (110-195)||(4796677-4796764)
chr7 (111-194)||(21988909-21988992)
chr7 (114-173)||(31155911-31155971)
chr7 (114-173)||(1049296-1049356)
chr7 (114-173)||(2935497-2935557)
chr7 (114-173)||(3035953-3036013)
chr7 (110-173)||(5817303-5817366)
chr7 (114-173)||(7351652-7351712)
chr7 (110-157)||(8153466-8153514)
chr7 (114-173)||(9027194-9027254)
chr7 (114-173)||(22108295-22108355)
chr7 (114-173)||(22137306-22137366)
chr7 (114-173)||(40550055-40550115)
chr7 (114-173)||(40552333-40552393)
[»] chr6 (36 HSPs)
chr6 (1-289)||(22010602-22010889)
chr6 (1-289)||(11856864-11857154)
chr6 (1-289)||(14737482-14737769)
chr6 (1-289)||(28184397-28184684)
chr6 (9-289)||(14742342-14742620)
chr6 (2-288)||(28155477-28155762)
chr6 (1-284)||(6438393-6438674)
chr6 (7-313)||(5674661-5674966)
chr6 (1-284)||(6005310-6005592)
chr6 (2-288)||(16838638-16838923)
chr6 (1-288)||(33330351-33330639)
chr6 (8-288)||(33335848-33336129)
chr6 (110-193)||(5757490-5757575)
chr6 (110-194)||(10077176-10077262)
chr6 (110-190)||(21356036-21356118)
chr6 (110-193)||(31086485-31086570)
chr6 (1-155)||(5343373-5343527)
chr6 (110-195)||(5572251-5572338)
chr6 (110-194)||(4629954-4630040)
chr6 (88-308)||(22708996-22709207)
chr6 (110-195)||(31979513-31979600)
chr6 (1-61)||(30125937-30125998)
chr6 (122-195)||(21801354-21801429)
chr6 (110-195)||(22963700-22963786)
chr6 (110-195)||(23824607-23824693)
chr6 (131-195)||(18232867-18232932)
chr6 (110-192)||(5017482-5017566)
chr6 (110-173)||(31936587-31936651)
chr6 (114-173)||(12195515-12195575)
chr6 (101-173)||(5273203-5273276)
chr6 (114-173)||(4816231-4816291)
chr6 (114-173)||(19704567-19704627)
chr6 (114-173)||(20915356-20915416)
chr6 (114-173)||(26932562-26932622)
chr6 (114-173)||(29754709-29754769)
chr6 (114-173)||(33309110-33309170)
[»] chr2 (45 HSPs)
chr2 (7-313)||(11098819-11099125)
chr2 (1-289)||(39811894-39812180)
chr2 (1-255)||(44312563-44312816)
chr2 (1-313)||(14291381-14291693)
chr2 (1-288)||(32246677-32246966)
chr2 (1-313)||(9296293-9296605)
chr2 (7-313)||(25398395-25398699)
chr2 (1-284)||(19344313-19344596)
chr2 (1-284)||(19349171-19349454)
chr2 (7-313)||(25403533-25403837)
chr2 (88-311)||(3491729-3491952)
chr2 (140-313)||(25407653-25407826)
chr2 (110-195)||(8040060-8040147)
chr2 (88-192)||(40738822-40738926)
chr2 (113-195)||(13569331-13569415)
chr2 (110-195)||(21629944-21630030)
chr2 (110-193)||(28259189-28259274)
chr2 (110-196)||(20522220-20522308)
chr2 (110-195)||(10445454-10445541)
chr2 (110-195)||(17865203-17865290)
chr2 (110-195)||(34682344-34682431)
chr2 (111-195)||(34388859-34388945)
chr2 (110-195)||(14699018-14699104)
chr2 (111-195)||(10707262-10707348)
chr2 (113-195)||(8390160-8390244)
chr2 (110-195)||(31056044-31056131)
chr2 (110-195)||(16940219-16940306)
chr2 (110-195)||(17010884-17010971)
chr2 (110-195)||(33528631-33528718)
chr2 (110-195)||(39482931-39483018)
chr2 (110-194)||(33118136-33118222)
chr2 (110-190)||(42039684-42039766)
chr2 (110-189)||(23078486-23078567)
chr2 (110-193)||(36757774-36757859)
chr2 (240-312)||(40738963-40739035)
chr2 (100-173)||(2838063-2838136)
chr2 (113-173)||(1345574-1345635)
chr2 (114-173)||(35215586-35215646)
chr2 (114-173)||(35217963-35218023)
chr2 (131-193)||(27149306-27149369)
chr2 (113-193)||(2869705-2869787)
chr2 (114-170)||(45332181-45332238)
chr2 (114-173)||(23452237-23452297)
chr2 (114-173)||(36558864-36558924)
chr2 (114-173)||(36561141-36561201)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (7-313)||(24787256-24787560)
chr1 (7-289)||(41398139-41398415)
chr1 (8-289)||(41390485-41390760)
chr1 (1-288)||(25444996-25445282)
chr1 (1-284)||(39445392-39445673)
chr1 (9-284)||(1054923-1055196)
chr1 (1-284)||(44023785-44024065)
chr1 (1-313)||(24202662-24202969)
chr1 (74-313)||(19358736-19358975)
chr1 (74-313)||(19361325-19361564)
chr1 (74-313)||(19379965-19380204)
chr1 (1-234)||(43988424-43988658)
chr1 (110-195)||(47703946-47704033)
chr1 (110-193)||(26644909-26644994)
chr1 (110-195)||(19072928-19073015)
chr1 (110-195)||(19120818-19120905)
chr1 (110-195)||(9476261-9476348)
chr1 (110-195)||(13598398-13598485)
chr1 (110-195)||(16124526-16124613)
chr1 (110-195)||(27104382-27104469)
chr1 (110-195)||(29651811-29651898)
chr1 (110-193)||(3281708-3281793)
chr1 (110-193)||(37069770-37069855)
chr1 (110-195)||(775672-775759)
chr1 (238-313)||(19366201-19366276)
chr1 (110-192)||(47098837-47098921)
chr1 (75-193)||(21536581-21536702)
chr1 (110-193)||(13604635-13604720)
chr1 (110-192)||(32889439-32889523)
chr1 (113-173)||(47102874-47102935)
chr1 (114-173)||(9459419-9459479)
chr1 (114-173)||(9463246-9463306)
chr1 (114-173)||(16226386-16226446)
chr1 (214-288)||(25439803-25439877)
chr1 (114-173)||(23786058-23786118)
chr1 (114-173)||(51752582-51752642)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (8-289)||(9549-9825)
scaffold0355 (8-83)||(1-72)
scaffold0355 (207-289)||(3754-3836)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-284)||(255-536)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (7-313)||(17845-18148)
scaffold0188 (7-313)||(23938-24241)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-234)||(2211-2443)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (1-257)||(19102-19357)
scaffold0197 (10-234)||(14269-14492)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-234)||(148916-149148)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (10-178)||(181980-182147)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (7-142)||(300-432)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (110-193)||(8431-8516)
scaffold0140 (114-173)||(22343-22403)
scaffold0140 (114-173)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (111-193)||(85684-85768)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (110-195)||(5683-5770)
scaffold0006 (110-195)||(2492-2579)
scaffold0006 (110-193)||(133292-133377)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (110-193)||(43973-44058)
scaffold0087 (75-193)||(36844-36965)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (110-195)||(10729-10816)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (110-192)||(45253-45337)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (114-173)||(269-329)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (113-195)||(17266-17350)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (140-173)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (114-173)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 312
Target Start/End: Original strand, 6311190 - 6311502
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  6311190 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaa 6311288  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6311289 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 6311388  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaagacagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccct--aaaagagaagtca 298  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||    
T  6311389 aagaaactctagccttcaagctttacacaagacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaaaagagaagtca 6311488  T
Q  299 ctagaggaagcttt 312  Q
    ||||||||||||||    
T  6311489 ctagaggaagcttt 6311502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 8 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 7290112 - 7289831
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7290112 aacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg 7290013  T
Q  108 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7290012 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaa-c 7289914  T
Q  208 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||||  |||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  7289913 tctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7289831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 36979276 - 36979582
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36979276 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacac 36979373  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaaga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  36979374 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 36979473  T
Q  205 agctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactaga 303  Q
    | |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36979474 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 36979572  T
Q  304 ggaagcttta 313  Q
    ||||||||||    
T  36979573 ggaagcttta 36979582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 25328470 - 25328184
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||| | || |||||    
T  25328470 ccaagccaacaacaacaaaacaacccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaaca 25328373  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25328372 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 25328273  T
Q  200 caagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25328272 caaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaa 25328184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 33038005 - 33037700
Alignment:
Q  7 caacaacaacaa--aacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaaca 104  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  33038005 caacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaag-aagaacaaaaca 33037908  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaaga 204  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33037907 ccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaaga 33037808  T
Q  205 agctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactaga 303  Q
    | |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||    
T  33037807 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccct-aaagagaagacactaga 33037710  T
Q  304 ggaagcttta 313  Q
    ||||||||||    
T  33037709 ggaagcttta 33037700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 30655542 - 30655851
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaa---- 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||        
T  30655542 caacaacaa-aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaaaaaa 30655639  T
Q  103 caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgca 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||| ||    
T  30655640 caccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 30655739  T
Q  202 agaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcact 300  Q
    |||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  30655740 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacact 30655838  T
Q  301 agaggaagcttta 313  Q
    |||||||||||||    
T  30655839 agaggaagcttta 30655851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4760274 - 4759967
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||     
T  4760274 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacat 4760176  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaaga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  4760175 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 4760076  T
Q  205 agctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactaga 303  Q
    | |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4760075 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 4759977  T
Q  304 ggaagcttta 313  Q
    ||||||||||    
T  4759976 ggaagcttta 4759967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18853372 - 18853059
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaaca-gccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||| |||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  18853372 ccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 18853275  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  18853274 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggt 18853175  T
Q  198 tgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagt 296  Q
    | |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  18853174 tacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaaga 18853076  T
Q  297 cactagaggaagcttta 313  Q
    |||||||||||||||||    
T  18853075 cactagaggaagcttta 18853059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18870763 - 18870453
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  18870763 ccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaa 18870668  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggtt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  18870667 aacaccaagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggtt 18870568  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtc 297  Q
     |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  18870567 acaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagac 18870469  T
Q  298 actagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  18870468 actagaggaagcttta 18870453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10689341 - 10689034
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  10689341 caacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaa-ggaagaacaaaacac 10689244  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaaga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||| |||||    
T  10689243 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaaga 10689144  T
Q  205 agctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc-tttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    | |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  10689143 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactag 10689045  T
Q  303 aggaagcttta 313  Q
    |||||||||||    
T  10689044 aggaagcttta 10689034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 39785016 - 39784734
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39785016 ccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaaca 39784918  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39784917 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 39784819  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  39784818 acaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 39784734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 35745284 - 35745566
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  35745284 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 35745380  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  35745381 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 35745479  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    || ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  35745480 ttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 35745566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1262148 - 1261847
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgata-aaaggaagaacaaa-ac 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  1262148 caacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca-agaga-atac--aagca--aacaagataag--atagaaaggaagaacaaacac 1262057  T
Q  104 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaa 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  1262056 accaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 1261957  T
Q  203 gaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcacta 301  Q
    |||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1261956 gaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacta 1261859  T
Q  302 gaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||    
T  1261858 gaggaagcttta 1261847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10684447 - 10684224
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  10684447 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 10684352  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  10684351 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 10684252  T
Q  206 gctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||    
T  10684251 --tctagcttatcaagctttacacaagaca 10684224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 88 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 31071349 - 31071124
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31071349 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 31071250  T
Q  185 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaacc 283  Q
    ||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  31071249 tgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaacc 31071152  T
Q  284 ctaaaagagaagtcactagaggaagctt 311  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  31071151 ctaaaagagaagacacaagaggaagctt 31071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 26287879 - 26287985
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26287879 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26287978  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  26287979 gttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 26301136 - 26301242
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26301136 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26301235  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  26301236 gttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 26313130 - 26313236
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26313130 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26313229  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  26313230 gttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456113
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 4456113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412426
Alignment:
Q  75 aagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    | ||||| ||||||||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaa 7412426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175766
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 19175766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799587
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23799587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  112 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127308
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6127308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702493
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaag 5702493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752407
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 26288020 - 26288094
Alignment:
Q  238 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26288020 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 26288094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 26301277 - 26301351
Alignment:
Q  238 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26301277 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 26301351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Original strand, 26313271 - 26313345
Alignment:
Q  238 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26313271 cctagtttctacccatttgtgtt-ccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 26313345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 176
Target Start/End: Original strand, 6813683 - 6813750
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 176  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813683 aagattgttaacccagttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaata 6813750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  140 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 45)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 43592171 - 43592459
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43592171 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43592270  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43592271 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43592370  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  43592371 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43592459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 27449706 - 27449994
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27449706 ccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 27449805  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27449806 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 27449905  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  27449906 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27449994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 43598616 - 43598904
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43598616 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43598715  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43598716 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43598815  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  43598816 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43598904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 43604108 - 43604396
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43604108 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43604207  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43604208 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43604307  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  43604308 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43604396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 43609600 - 43609888
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43609600 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43609699  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43609700 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43609799  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  43609800 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 43609888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 1457354 - 1457067
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  1457354 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-ggaagaacaa 1457256  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1457255 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 1457156  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1457155 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1457067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 27444862 - 27445150
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27444862 ccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 27444961  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27444962 aacaccgagaagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 27445061  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  27445062 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 27445150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 32 - 313
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180418
Alignment:
Q  32 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagc 31180236  T
Q  132 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  31180237 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaag 31180336  T
Q  232 acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31180337 acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaagagaagacactagaggaagcttta 31180418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 15044579 - 15044865
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15044579 ccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaa 15044677  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15044678 aacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 15044777  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  15044778 aaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 15044865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 30631305 - 30631610
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  30631305 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaa-ggaagaacaaaacacc 30631403  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  30631404 aagaagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaa 30631503  T
Q  207 ctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 305  Q
    |||||||  |||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30631504 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccct-aaagagaagtcactagagg 30631602  T
Q  306 aagcttta 313  Q
    ||||||||    
T  30631603 aagcttta 30631610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37556816 - 37556533
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  37556816 ccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaaca 37556718  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37556717 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtt 37556618  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||| |  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37556617 acaagta--tctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 37556533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 37561638 - 37561355
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  37561638 ccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaaca 37561540  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37561539 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtt 37561440  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||| |  |||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  37561439 acaagta--tctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 37561355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 24135744 - 24136052
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| |   |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24135744 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaacaa 24135838  T
Q  101 a-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  24135839 acacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggtt 24135938  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtc 297  Q
     ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |    
T  24135939 acaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaagagaagac 24136036  T
Q  298 actagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  24136037 actagaggaagcttta 24136052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 28807767 - 28807485
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaa 97  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  28807767 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaa 28807670  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  28807669 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaagg 28807571  T
Q  197 ttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    || ||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  28807570 ttacaagaa--tctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 28807485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 38219298 - 38219602
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  38219298 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 38219393  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  38219394 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 38219493  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    ||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38219494 aa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaag 38219591  T
Q  303 aggaagcttta 313  Q
    |||||||||||    
T  38219592 aggaagcttta 38219602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 305
Target Start/End: Original strand, 38192073 - 38192369
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  38192073 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 38192168  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  38192169 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 38192268  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    ||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  38192269 aa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaag 38192366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 2785268 - 2785550
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  2785268 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 2785364  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2785365 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2785463  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    || ||||||  |||||| | ||||||||||| || | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  2785464 ttacaagaa--tctagcttttcaagctttactcatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 2785550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 33791209 - 33791491
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  33791209 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 33791305  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  33791306 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 33791404  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    || ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  33791405 ttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 33791491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31402042 - 31401810
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  31402042 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac 31401946  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  31401945 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 31401847  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31401846 ttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31401810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31397185 - 31396953
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca- 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  | |     
T  31397185 ccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacaaac 31397089  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  31397088 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 31396989  T
Q  198 tgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
    | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  31396988 tacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 31396953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 313
Target Start/End: Original strand, 35387640 - 35387866
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  35387640 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagt 35387739  T
Q  186 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    |||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| | |   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35387740 gttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 35387837  T
Q  285 taaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  35387838 taaaagagaagacactagaggaagtttta 35387866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 33768072 - 33768299
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||  || ||||| ||||||||||||  ||||    
T  33768072 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--caggataaacgataaaaggaaaagaac 33768168  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  33768169 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 33768267  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacaca 229  Q
    || ||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  33768268 ttacaagaa--tctagcttttcaagctttacaca 33768299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353344
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 9353344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932362
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36932362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281838
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10281838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 312
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464735
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 207  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||      
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaagaa-a 15464630  T
Q  208 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcac-aggatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 305  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||| | |||    
T  15464631 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaataatgaaccctaaaagagaagacacaaaagg 15464728  T
Q  306 aagcttt 312  Q
    |||||||    
T  15464729 aagcttt 15464735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916982
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 11916982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520315
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaa 14520315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832343
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 3880299 - 3880386
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3880299 aagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3880386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588833
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 19588833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084187
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 12084187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127423
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31300693 - 31300612
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  31300693 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgtta 31300612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24553603 - 24553520
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  24553603 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaa 24553520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9224599 - 9224312
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9224599 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaa 9224501  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9224500 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttag 9224401  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9224400 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9224312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9229386 - 9229099
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9229386 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaa 9229288  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9229287 aacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttag 9229188  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9229187 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 9229099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 51520349 - 51520637
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51520349 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 51520448  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51520449 aacaccgagaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 51520548  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  51520549 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaa 51520637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 24741839 - 24742145
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24741839 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacac 24741936  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaaga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  24741937 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 24742036  T
Q  205 agctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactaga 303  Q
    | |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24742037 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 24742135  T
Q  304 ggaagcttta 313  Q
    ||||||||||    
T  24742136 ggaagcttta 24742145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45357488 - 45357203
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45357488 caagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 45357390  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45357389 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 45357290  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    ||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  45357289 aaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45357203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 45348009 - 45347723
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45348009 caagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 45347911  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45347910 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 45347811  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    ||| | |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  45347810 aag-acctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 45347723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 56146904 - 56146677
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56146904 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 56146805  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  56146804 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 56146705  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacaca 229  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  56146704 aagaa-ctctagccttcaagctttacaca 56146677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 29760541 - 29760845
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  29760541 caacaacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacacc 29760638  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  29760639 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 29760738  T
Q  206 gctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactaga 303  Q
     |  ||||   ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||| |||||||    
T  29760739 acaatagcctgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccct--aagagaagacactaga 29760835  T
Q  304 ggaagcttta 313  Q
    ||||||||||    
T  29760836 ggaagcttta 29760845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 3813916 - 3814202
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  3813916 ccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 3814013  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3814014 aaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtt 3814113  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
     |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3814114 acaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3814202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 18855619 - 18855900
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  18855619 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 18855716  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18855717 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 18855815  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  18855816 acaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 18855900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 5732554 - 5732828
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| || |||| | ||||||||    
T  5732554 ccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaa 5732651  T
Q  101 aa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732652 aaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 5732751  T
Q  196 gttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 274  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  5732752 gttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 5732828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 88 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28468647 - 28468431
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28468647 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 28468549  T
Q  186 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaa-gacagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    |||||||      | || ||    ||| |  ||||| ||||||||  |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  28468548 gttacaa------gaaaaaa----tagtttgcaagc-ttacacaataacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccc 28468460  T
Q  285 taaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28468459 taaaagagaagacacaagaggaagcttta 28468431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 88 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 31985752 - 31985529
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31985752 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaag 31985655  T
Q  185 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaacc 283  Q
    ||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||   ||||||    
T  31985654 tgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgtgttt-cccactctcacaatgtgaacc 31985558  T
Q  284 ctaaaagagaagtcactagaggaagcttt 312  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  31985557 ctaaaagagaagacacaaaaggaagcttt 31985529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047466
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10047466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246081
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 39246081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315241
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36315241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329450
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 36329450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623303
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16623303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396683
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaa 5396683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796529
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 3796529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  115 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777634
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 3777634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630690
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16630690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774338
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatcca 39774338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 54867184 - 54867269
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867184 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 54)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28504053 - 28503756
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  28504053 caacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga----------aaggaagaacaaaacacc 28503964  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  28503963 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaa 28503864  T
Q  207 ctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 305  Q
    |||||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28503863 ctctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 28503764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22173387 - 22173100
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22173387 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaa 22173289  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22173288 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 22173189  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||    
T  22173188 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaa 22173100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 7167143 - 7167449
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  7167143 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacacc 7167241  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 205  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  7167242 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 7167341  T
Q  206 gctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagag 304  Q
     |  ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7167342 acaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagag 7167440  T
Q  305 gaagcttta 313  Q
    |||||||||    
T  7167441 gaagcttta 7167449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 2671790 - 2671478
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  2671790 ccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 2671693  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2671692 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 2671593  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtc 297  Q
     |||||| |  ||| |  ||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  2671592 acaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagac 2671494  T
Q  298 actagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  2671493 actagaggaagcttta 2671478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 8739224 - 8738955
Alignment:
Q  43 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739224 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 8739127  T
Q  143 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccct 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||    
T  8739126 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 8739028  T
Q  241 agattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8739027 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagcttta 8738955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 43 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9091462 - 9091193
Alignment:
Q  43 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091462 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 9091365  T
Q  143 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccct 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||    
T  9091364 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 9091266  T
Q  241 agattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||| |  || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  9091265 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaaccctagaagagaagacactagaggaagcttta 9091193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Original strand, 18656324 - 18656598
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| || |||| | ||||||||    
T  18656324 ccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaa 18656421  T
Q  101 aa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656422 aaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 18656521  T
Q  196 gttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcaca 274  Q
    ||| |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18656522 gttacaaga--ctctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcaca 18656598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 8477263 - 8477569
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaac-agccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||| |   |||||||  |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  8477263 caacaacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccaca--aagataatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 8477357  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  8477358 ccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 8477457  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacaca--agacagaccctagattctaccctttggtgttt-ccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcact 300  Q
    || |  |||||  ||||| |||||||  | |||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  8477458 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacact 8477556  T
Q  301 agaggaagcttta 313  Q
    |||||||||||||    
T  8477557 agaggaagcttta 8477569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 50 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 40372949 - 40372688
Alignment:
Q  50 cacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 149  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372949 cacatagagataacaaagca-aaacaagataagcaagata-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 40372852  T
Q  150 gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattct 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  40372851 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattct 40372754  T
Q  248 accctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    |||| |  ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40372753 acccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaagagaagacactagaggaagcttta 40372688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 153 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501589
Alignment:
Q  153 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccc 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  252 tttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 28501589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2677280 - 2676993
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||    
T  2677280 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaac 2677183  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2677182 aaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2677084  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  2677083 ttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 2676993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2673124 - 2672837
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||    
T  2673124 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaac 2673027  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2673026 aaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2672928  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||| ||||    
T  2672927 ttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaa 2672837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928484
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||       
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 26928588  T
Q  209 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaa 307  Q
     |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  26928587 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaa 26928489  T
Q  308 gcttt 312  Q
    |||||    
T  26928488 gcttt 26928484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 8512108 - 8512342
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-cgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||  ||||||| | ||  |||    
T  8512108 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaa 8512204  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  8512205 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 8512304  T
Q  196 gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8512305 gttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8512342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 8516988 - 8517222
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-cgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||  ||||||| | ||  |||    
T  8516988 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaa 8517084  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  8517085 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 8517184  T
Q  196 gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8517185 gttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 8517222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 24968000 - 24968286
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  24968000 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac 24968096  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  24968097 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 24968195  T
Q  197 ttgcaagaagctctagcta-tcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    || ||||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||| ||| |||||||||||||  || ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  24968196 ttacaagaa--tctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgaga-tctaccctttggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaa 24968286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 32475387 - 32475608
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  32475387 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 32475482  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||     
T  32475483 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa- 32475580  T
Q  207 ctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32475581 -tctagcttatcaagctttacacaagaca 32475608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 312
Target Start/End: Original strand, 32143299 - 32143524
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32143299 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 32143397  T
Q  185 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaacc 283  Q
    ||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  |||||||    
T  32143398 tgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaacc 32143495  T
Q  284 ctaaaagagaagtcactagaggaagcttt 312  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32143496 ctaaaagagaagacacaagaggaagcttt 32143524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 32480245 - 32480466
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  32480245 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 32480340  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||     
T  32480341 accaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaa- 32480438  T
Q  207 ctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32480439 -tctagcttatcaagctttacacaagaca 32480466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 311
Target Start/End: Original strand, 1305927 - 1306150
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  1305927 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagt 1306025  T
Q  186 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    |||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  1306026 gttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccc 1306123  T
Q  285 taaaagagaagtcactagaggaagctt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  1306124 taaaagagaagacacaagaggaagctt 1306150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 110 - 312
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453161
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 207  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||      
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-a 27453056  T
Q  208 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagagga 306  Q
      |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||  |||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| | ||||    
T  27453057 aatagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaaaagga 27453155  T
Q  307 agcttt 312  Q
    ||||||    
T  27453156 agcttt 27453161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 10207826 - 10207983
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||    
T  10207826 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaac 10207923  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 158  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207924 aaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370488
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8370488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974954
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 27974954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552883
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 18552883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029180
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 36029180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264435
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 16264435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711308
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 21711308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736305
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 1736305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709790
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaag 30709790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3716002
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 3716002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592782
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaag 40592782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 48438214 - 48438301
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  48438214 aagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 48438301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 6794800 - 6794715
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6794800 aagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 6794715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795868
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| ||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaag 25795868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299075
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaag 26299075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466375
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923906
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| ||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaag 47923906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328359
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386947
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 176  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 40844652 - 40844738
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  40844652 aagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 40844738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 177  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 24695251 - 24695164
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  24695251 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaag 24695164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323693
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 3323693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 35254 - 34967
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35254 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaa 35156  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35155 aacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttag 35056  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  35055 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaa 34967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 48)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 290
Target Start/End: Original strand, 12406224 - 12406512
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12406224 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaa 12406322  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12406323 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 12406422  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaag 290  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12406423 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag 12406512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 12396804 - 12397091
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12396804 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaa 12396902  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12396903 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 12397002  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  | || ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  12397003 aagaa-ctctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaa 12397091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 20357751 - 20357439
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  20357751 ccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaaca 20357654  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttg 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20357653 aaataccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggtta 20357554  T
Q  200 caagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtca 298  Q
    |||||| |  ||||  |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||    
T  20357553 caagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagaca 20357454  T
Q  299 ctagaggaagcttta 313  Q
    |||||||||||||||    
T  20357453 ctagaggaagcttta 20357439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 31109775 - 31109489
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  31109775 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaa 31109678  T
Q  101 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttg 199  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31109677 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 31109578  T
Q  200 caagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    |||||  |||||||  ||||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31109577 caaga--ctctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 31109489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 2057852 - 2058171
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaa----caagataagcgataaaaggaag 95  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||    
T  2057852 ccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaag 2057951  T
Q  96 aacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2057952 aacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag 2058051  T
Q  195 ggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccc-tttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagag 292  Q
    |||| |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  2058052 ggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagag 2058150  T
Q  293 aagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  2058151 aagacactagaggaagcttta 2058171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 24024520 - 24024232
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24024520 ccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaa 24024422  T
Q  101 aa-caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24024421 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgtt 24024322  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
     |||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24024321 acaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaa 24024232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4866622 - 4866819
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4866622 ccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaaca 4866720  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866721 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 4866819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Original strand, 19992213 - 19992487
Alignment:
Q  9 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  19992213 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 19992310  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||      
T  19992311 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaaga-- 19992408  T
Q  207 ctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  19992409 ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 19992487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 1533640 - 1533335
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaac-agccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||  ||||||   |||||||  ||||| |||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  1533640 caacaacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccaca--aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 1533546  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  1533545 ccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 1533446  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcacta 301  Q
    || |  |||||  ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1533445 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacta 1533347  T
Q  302 gaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||    
T  1533346 gaggaagcttta 1533335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 21812431 - 21812149
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| || |||||    
T  21812431 ccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaaca 21812334  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  21812333 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aagtcttacaaaaggtt 21812235  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatc-aagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||||  ||||||| | || |||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  21812234 ccaaga--ctctagcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 21812149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 21639710 - 21640012
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  21639710 caacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 21639803  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||||    
T  21639804 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaag 21639903  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    ||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21639904 aa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactag 21640001  T
Q  303 aggaagcttta 313  Q
    |||||||||||    
T  21640002 aggaagcttta 21640012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 21645908 - 21646210
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||   |||| ||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  21645908 caacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaaaca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 21646001  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||| ||||    
T  21646002 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaag 21646101  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    ||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21646102 aa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactag 21646199  T
Q  303 aggaagcttta 313  Q
    |||||| ||||    
T  21646200 aggaagattta 21646210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24261506 - 24261283
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  24261506 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 24261411  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  24261410 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24261311  T
Q  206 gctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24261310 --tctagcttatcaagctttacacaagaca 24261283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24266385 - 24266162
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||     
T  24266385 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacacca 24266290  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  24266289 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24266190  T
Q  206 gctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24266189 --tctagcttatcaagctttacacaagaca 24266162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 16879975 - 16880197
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  16879975 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 16880070  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||     
T  16880071 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa- 16880169  T
Q  207 ctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16880170 -tctagcttatcaagctttacacaagaca 16880197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Original strand, 16884831 - 16885053
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  16884831 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 16884926  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||| ||||||     
T  16884927 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaa- 16885025  T
Q  207 ctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||    
T  16885026 -tctagcttatcaagctttacacaagaca 16885053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 7 - 311
Target Start/End: Original strand, 18408666 - 18408964
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||  || | |||| ||||||  |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  18408666 caacaacaacaaaaacagccgtagtctagtgtagagcaacaccaca--aacaaatac-aaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 18408759  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  18408760 ccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 18408858  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    ||    || ||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||    
T  18408859 aa-aaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaag 18408955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 110 - 311
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413840
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||       
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aa 18413738  T
Q  209 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaa 307  Q
     ||| |  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  18413739 atagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaag-gaagacacaagaggaa 18413836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159890
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29159890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516320
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 46516320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091748
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 49091748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848696
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 44848696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190021
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284173
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647706
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2647706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332460
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 33332460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580474
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56034
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 56034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 35960816 - 35960901
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960816 aagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 4796764 - 4796677
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  4796764 aagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaag 4796677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5817366 - 5817303
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817366 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatcca 5817303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 36)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 22010889 - 22010602
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010889 ccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 22010791  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22010790 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 22010691  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22010690 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 22010602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 11856864 - 11857154
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11856864 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaa 11856962  T
Q  101 aa---caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 197  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856963 aaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 11857062  T
Q  198 tgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    | |||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11857063 tacaagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14737769 - 14737482
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaa-gagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14737769 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaaca 14737671  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttg 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14737670 aaacaccgagaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 14737571  T
Q  200 caagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    |||||  |||||||  |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14737570 caaga--ctctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14737482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 28184397 - 28184684
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  28184397 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaaca 28184495  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttg 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  28184496 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28184595  T
Q  200 caagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||| |  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  28184596 caaca--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 28184684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 9 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 14742620 - 14742342
Alignment:
Q  9 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14742620 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccga 14742522  T
Q  109 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||    
T  14742521 gaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ct 14742424  T
Q  209 ctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    |||||  |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  14742423 ctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 14742342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28155762 - 28155477
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||    
T  28155762 caagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaa 28155664  T
Q  101 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttg 199  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28155663 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28155564  T
Q  200 caagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    ||||||  | ||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  28155563 caagaa--tttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 28155477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6438393 - 6438674
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  6438393 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 6438490  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6438491 aaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 6438589  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  6438590 acaaga--ctctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 6438674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5674966 - 5674661
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaac-agccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||   |||||||  ||||| |||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  5674966 caacaacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 5674872  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  5674871 ccaaagagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 5674772  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag--acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcacta 301  Q
    || |  |||||  ||||| |||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  5674771 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacta 5674673  T
Q  302 gaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||    
T  5674672 gaggaagcttta 5674661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 6005310 - 6005592
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  6005310 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 6005406  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  6005407 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 6005505  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    || ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  6005506 ttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 6005592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 2 - 288
Target Start/End: Original strand, 16838638 - 16838923
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaaca 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  16838638 caagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaaca 16838734  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gt 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16838735 aa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 16838833  T
Q  198 tgcaagaagctctagcta-tcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    | ||||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  16838834 tacaagaa--tctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 16838923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33330639 - 33330351
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  |||    
T  33330639 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaa 33330542  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  33330541 caaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 33330443  T
Q  196 gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  33330442 gttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 33330351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 8 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 33336129 - 33335848
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||| |||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||||| ||    
T  33336129 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-ca 33336033  T
Q  105 ccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaa 202  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||    
T  33336032 ccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaa 33335933  T
Q  203 gaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| ||||  ||||||  ||||||||||||    
T  33335932 gaa--tctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaa 33335848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757490
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 5757490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 190
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356118
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 190  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac 21356118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086485
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 5343373 - 5343527
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  |||    
T  5343373 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaa 5343469  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 155  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343470 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572251
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5572251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 308
Target Start/End: Original strand, 22708996 - 22709207
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22708996 aaaggaagaacaaacacaccaaaaa-attgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 22709094  T
Q  185 tgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaacc 283  Q
    ||||||||      | || |     |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  22709095 tgttacaa------gaaaaa-----tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaacc 22709182  T
Q  284 ctaaaagagaagtcactagaggaag 308  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||    
T  22709183 ctaaaagagaagacacaagaggaag 22709207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979600
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaag 31979600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30125998 - 30125937
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagata 61  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30125998 ccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagata 30125937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 122 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801354
Alignment:
Q  122 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaag 21801354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963786
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 22963786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824607
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 23824607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 131 - 195
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232932
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaag 18232932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 5273203 - 5273276
Alignment:
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273203 aacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 45)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 11099125 - 11098819
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  11099125 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag-gaagaaaggaagaacaaaacac 11099028  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaaga 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  11099027 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 11098928  T
Q  205 agctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactaga 303  Q
    | |  |||||  ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  11098927 aacaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactaga 11098829  T
Q  304 ggaagcttta 313  Q
    ||||||||||    
T  11098828 ggaagcttta 11098819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 39812180 - 39811894
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39812180 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaa 39812082  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39812081 aacaccgagaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 39811982  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||  |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  39811981 aaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 39811894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 44312816 - 44312563
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312816 ccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 44312718  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44312717 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 44312618  T
Q  201 aagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttg 255  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  44312617 aagaa-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Original strand, 14291381 - 14291693
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  14291381 ccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 14291478  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14291479 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 14291578  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtc 297  Q
     |||||| |  ||||  |||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  14291579 acaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagac 14291677  T
Q  298 actagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  14291678 actagaggaagcttta 14291693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 32246677 - 32246966
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagc---gataaaaggaagaa 97  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||    
T  32246677 ccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaa 32246775  T
Q  98 caaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 196  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246776 caaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 32246875  T
Q  197 ttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    || |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  32246876 ttacaaga--ctctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 32246966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 9296605 - 9296293
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||    
T  9296605 ccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaa-ggaagaaca 9296508  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9296507 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 9296408  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtc 297  Q
     |||||| |  ||||  |||||| ||| ||||| |||  ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  9296407 acaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagac 9296309  T
Q  298 actagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  9296308 actagaggaagcttta 9296293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 25398395 - 25398699
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  25398395 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 25398490  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  25398491 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 25398590  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    ||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25398591 aa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaag 25398688  T
Q  303 aggaagcttta 313  Q
    |||||||||||    
T  25398689 aggaagcttta 25398699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 19344313 - 19344596
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  19344313 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 19344409  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  19344410 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 19344509  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    || ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  19344510 ttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 19344596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 19349171 - 19349454
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  19349171 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 19349267  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  19349268 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 19349367  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    || ||||||  |||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||||  ||||||||    
T  19349368 ttacaagaa--tctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaaccc 19349454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Original strand, 25403533 - 25403837
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  25403533 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 25403628  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaag 203  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  25403629 ccaaaaagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 25403728  T
Q  204 aagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactag 302  Q
    ||    |||||  ||||| ||||||||| |||   ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  25403729 aa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaag 25403826  T
Q  303 aggaagcttta 313  Q
    |||||||||||    
T  25403827 aggaagcttta 25403837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 311
Target Start/End: Original strand, 3491729 - 3491952
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3491729 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 3491827  T
Q  186 gttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    |||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3491828 gttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 3491925  T
Q  285 taaaagagaagtcactagaggaagctt 311  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3491926 taaaagagaagacacaagaggaagctt 3491952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 140 - 313
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407826
Alignment:
Q  140 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagac 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||       
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagt 25407750  T
Q  238 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  25407751 cctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 25407826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040147
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 40738822 - 40738926
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40738822 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 40738919  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  40738920 gttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569415
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13569415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630030
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 21630030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259189
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 28259189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 196
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522308
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaagg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagg 20522308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445454
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaag 10445454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865290
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17865290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682344
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaag 34682344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388945
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 34388945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699018
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaag 14699018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707262
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 10707262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390160
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaag 8390160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16940306 - 16940219
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940306 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17010971 - 17010884
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010971 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528631
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 33528631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483018
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| |||||||||||    
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaag 39483018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 33118136 - 33118222
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  33118136 aagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaa 33118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039684
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 190  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttac 42039684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078486
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 189  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgtta 23078486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757774
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaa 36757774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 240 - 312
Target Start/End: Original strand, 40738963 - 40739035
Alignment:
Q  240 tagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttt 312  Q
    ||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | || |||||||    
T  40738963 tagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaatagtaagcttt 40739035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2838136 - 2838063
Alignment:
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2838136 aaacaccaagaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatcca 2838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345574
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149306
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaa 27149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869705
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 2869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24787560 - 24787256
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24787560 caacaacaa-aaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc 24787464  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||     
T  24787463 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaa 24787364  T
Q  207 ctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagagg 305  Q
    |  ||||  |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24787363 caatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacactagagg 24787264  T
Q  306 aagcttta 313  Q
    ||||||||    
T  24787263 aagcttta 24787256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 7 - 289
Target Start/End: Original strand, 41398139 - 41398415
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  41398139 caacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaaca 41398231  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41398232 ccgagaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 41398331  T
Q  205 agctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
      |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  41398332 --ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41398415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 289
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390760
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||     
T  41390485 aacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaacat 41390577  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  41390578 cgagaagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga- 41390676  T
Q  206 gctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
     |||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  41390677 -ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 41390760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25445282 - 25444996
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  25445282 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 25445185  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445184 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 25445085  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25445084 acaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 25444996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 39445392 - 39445673
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  39445392 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 39445489  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39445490 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 39445588  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  39445589 acaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 39445673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 1055196 - 1054923
Alignment:
Q  9 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  1055196 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 1055099  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaag 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||      
T  1055098 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttacaaga-- 1055002  T
Q  207 ctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  1055001 ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 1054923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 44024065 - 44023785
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  | |||| | ||||||||    
T  44024065 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaa 44023968  T
Q  101 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttg 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||     
T  44023967 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtta 44023869  T
Q  200 caagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  44023868 caaga--ctctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 44023785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24202969 - 24202662
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  24202969 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaa 24202876  T
Q  101 a-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  24202875 acacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggtt 24202776  T
Q  199 gcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtc 297  Q
     ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |    
T  24202775 acaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagac 24202678  T
Q  298 actagaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||||||    
T  24202677 actagaggaagcttta 24202662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358736
Alignment:
Q  74 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 270  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    |||||  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19358779  T
Q  271 cacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19358778 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19358736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361325
Alignment:
Q  74 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 270  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19361368  T
Q  271 cacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19361367 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19361325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 74 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379965
Alignment:
Q  74 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaagaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactct 270  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||    ||| |  ||||| ||||||||| |||   |||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa-aaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactct 19380008  T
Q  271 cacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    | ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19380007 ctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19379965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43988658 - 43988424
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-cgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||  | || ||| |||  |||    
T  43988658 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaa 43988562  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  43988561 caaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 43988462  T
Q  196 gttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
    ||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  43988461 gttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 43988424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703946
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644909
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaa 26644909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073015
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19073015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120905
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 19120905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476348
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124526
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16124526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104382
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 27104382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281793
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaa 3281793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069855
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaa 37069855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 238 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 19366276 - 19366201
Alignment:
Q  238 cctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcactagaggaagcttta 313  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19366276 cctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaagagaagacacaagaggaagcttta 19366201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098837
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21536702 - 21536581
Alignment:
Q  75 aagataagcgataaaaggaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 171  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536702 aagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 21536604  T
Q  172 caatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    || ||| | ||||||||||||||    
T  21536603 cactataatgaaagtgttacaaa 21536581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604635
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 13604635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 32889439 - 32889523
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32889439 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102874
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 25439877 - 25439803
Alignment:
Q  214 tatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaa 288  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25439877 tatcaagctttacacatgaacaaaccctagag-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 25439803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 168; Significance: 5e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 8 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 9825 - 9549
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  9825 aacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccg 9729  T
Q  108 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttgcaagaagc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  9728 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--c 9631  T
Q  208 tctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    ||||||  |||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  9630 tctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 9549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 1
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagc 83  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| || | |||||||||||||||||||    
T  72 aacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaac-aagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 3836 - 3754
Alignment:
Q  207 ctctagctatcaagctttacacaaga-cagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaa 289  Q
    |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3836 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 3754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 255 - 536
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  255 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 352  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  353 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 451  T
Q  199 gcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccc 284  Q
     |||||  ||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||    
T  452 acaaga--ctctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17845
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa--cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-ac 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  18148 caacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacac 18055  T
Q  104 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaa 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  18054 accaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 17955  T
Q  203 gaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcacta 301  Q
    |||    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |    
T  17954 gaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaa 17857  T
Q  302 gaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||    
T  17856 gaggaagcttta 17845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 24241 - 23938
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa--cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-ac 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||   ||||| |  |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||    
T  24241 caacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagaa--aacaagataagaaagaaa-ggaagaacaaacac 24148  T
Q  104 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttgcaa 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||    
T  24147 accaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 24048  T
Q  203 gaagctctagctatcaagctttacacaag-acagaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaggatgaaccctaaaagagaagtcacta 301  Q
    |||    |||||  ||||| ||||||||| |||   | ||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |    
T  24047 gaa-aaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagagaagacacaa 23950  T
Q  302 gaggaagcttta 313  Q
    ||||||||||||    
T  23949 gaggaagcttta 23938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 2443 - 2211
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||    
T  2443 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaac 2347  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2346 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2248  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  2247 ttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 2211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 19357 - 19102
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  19357 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac 19261  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |    
T  19260 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagag 19162  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagac-agaccctagattctaccctttggt 257  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  19161 ttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-tctaccctttggt 19102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14492 - 14269
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  14492 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 14397  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttgcaagaa 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  14396 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 14297  T
Q  206 gctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||    
T  14296 --tctagcttatcaagctttacacaagaca 14269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 149148 - 148916
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||    
T  149148 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaac 149052  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  149051 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 148953  T
Q  197 ttgcaagaagctctagc-tatcaagctttacacaagaca 234  Q
    || ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  148952 ttacaagaa--tctagcttatcaagctttacacaagaca 148916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 182147 - 181980
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  182147 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 182052  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 178  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182051 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 300
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  432 caacaacaa-aaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaa-gaaagaacaaaacacc 336  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 142  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  335 aagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8431
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 8431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 193
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85768
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaa 85768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133292
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaa 133292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43973
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 43973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36965 - 36844
Alignment:
Q  75 aagataagcgataaaaggaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 171  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| |    
T  36965 aagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacc 36867  T
Q  172 caatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  36866 cactatgatgaaagtgttacaaa 36844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10816
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 10816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 195
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17350
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaag 17350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  140 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 387 times since January 2019
Visitors: 6696