View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0914_low_34 (Length: 382)

Name: NF0914_low_34
Description: NF0914
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0914_low_34
NF0914_low_34
[»] chr7 (149 HSPs)
chr7 (1-374)||(40555206-40555580)
chr7 (1-374)||(8756859-8757233)
chr7 (1-374)||(4325271-4325645)
chr7 (1-372)||(832486-832858)
chr7 (1-372)||(1197666-1198038)
chr7 (1-363)||(13407998-13408361)
chr7 (2-359)||(12755170-12755528)
chr7 (1-349)||(58881-59232)
chr7 (4-374)||(47094293-47094666)
chr7 (1-372)||(17070756-17071124)
chr7 (1-363)||(13864858-13865212)
chr7 (1-332)||(13699352-13699685)
chr7 (1-367)||(14191549-14191919)
chr7 (1-367)||(14188755-14189125)
chr7 (3-173)||(32160667-32160838)
chr7 (1-176)||(18456111-18456287)
chr7 (3-173)||(16550469-16550640)
chr7 (3-173)||(16615022-16615193)
chr7 (1-174)||(11661520-11661694)
chr7 (1-154)||(15213935-15214088)
chr7 (1-176)||(13647655-13647831)
chr7 (1-176)||(34957584-34957760)
chr7 (1-171)||(30820719-30820890)
chr7 (3-173)||(709020-709191)
chr7 (4-171)||(36685715-36685884)
chr7 (1-155)||(32771763-32771917)
chr7 (3-172)||(47975376-47975546)
chr7 (1-147)||(48743746-48743892)
chr7 (10-155)||(14415956-14416101)
chr7 (3-173)||(16462452-16462623)
chr7 (1-171)||(17505467-17505638)
chr7 (1-171)||(17547576-17547747)
chr7 (1-202)||(37727390-37727591)
chr7 (4-169)||(46386553-46386719)
chr7 (1-169)||(13745239-13745408)
chr7 (10-174)||(18607702-18607867)
chr7 (1-169)||(33001334-33001503)
chr7 (10-169)||(13745672-13745832)
chr7 (1-176)||(29004235-29004411)
chr7 (1-176)||(38828474-38828650)
chr7 (4-155)||(12465726-12465877)
chr7 (4-169)||(13147938-13148104)
chr7 (4-169)||(44374366-44374532)
chr7 (4-169)||(44383231-44383397)
chr7 (33-169)||(13894515-13894652)
chr7 (10-170)||(14422204-14422365)
chr7 (1-173)||(48812254-48812427)
chr7 (3-115)||(29052620-29052732)
chr7 (6-149)||(8851627-8851770)
chr7 (4-135)||(12323396-12323527)
chr7 (1-167)||(19282514-19282681)
chr7 (4-155)||(32434055-32434206)
chr7 (1-155)||(15167410-15167564)
chr7 (4-155)||(11066903-11067054)
chr7 (4-155)||(15119761-15119912)
chr7 (8-169)||(12371695-12371857)
chr7 (10-174)||(147833-147998)
chr7 (10-174)||(16008793-16008958)
chr7 (10-174)||(18872575-18872740)
chr7 (4-155)||(12127630-12127781)
chr7 (4-155)||(32301617-32301768)
chr7 (4-155)||(14258787-14258938)
chr7 (46-176)||(14273761-14273892)
chr7 (13-148)||(16460407-16460542)
chr7 (1-176)||(16998839-16999021)
chr7 (10-155)||(10896466-10896611)
chr7 (37-154)||(13918266-13918383)
chr7 (10-174)||(14566417-14566582)
chr7 (38-154)||(25926993-25927109)
chr7 (10-169)||(15352270-15352430)
chr7 (12-148)||(16580102-16580238)
chr7 (12-148)||(16585425-16585561)
chr7 (4-155)||(20585791-20585938)
chr7 (10-169)||(14928804-14928964)
chr7 (197-374)||(36705328-36705507)
chr7 (4-155)||(20619721-20619872)
chr7 (245-374)||(11053845-11053974)
chr7 (1-94)||(14153435-14153528)
chr7 (245-372)||(3289530-3289657)
chr7 (245-363)||(21735208-21735328)
chr7 (161-297)||(10659588-10659725)
chr7 (1-89)||(15720250-15720338)
chr7 (4-169)||(18875312-18875478)
chr7 (1-169)||(39292200-39292368)
chr7 (38-100)||(1857092-1857154)
chr7 (1-94)||(4691359-4691452)
chr7 (1-94)||(24270445-24270538)
chr7 (2-169)||(21538653-21538820)
chr7 (1-94)||(3287486-3287579)
chr7 (1-94)||(9743544-9743637)
chr7 (287-368)||(11309504-11309585)
chr7 (1-94)||(48213408-48213501)
chr7 (177-374)||(15281477-15281674)
chr7 (2-139)||(3192757-3192894)
chr7 (1-94)||(18080181-18080274)
chr7 (10-94)||(8514218-8514302)
chr7 (2-126)||(15978520-15978644)
chr7 (47-139)||(28719911-28720003)
chr7 (1-155)||(43277206-43277361)
chr7 (1-64)||(46580387-46580450)
chr7 (313-366)||(836857-836910)
chr7 (313-366)||(1202037-1202090)
chr7 (1-94)||(14161318-14161411)
chr7 (1-94)||(20252805-20252898)
chr7 (1-169)||(25941858-25942026)
chr7 (245-368)||(15139343-15139465)
chr7 (232-371)||(17130437-17130578)
chr7 (245-368)||(19558034-19558156)
chr7 (267-368)||(1489956-1490056)
chr7 (245-350)||(15096394-15096498)
chr7 (1-94)||(15576294-15576387)
chr7 (96-176)||(46580468-46580549)
chr7 (271-347)||(3287163-3287238)
chr7 (271-347)||(43277555-43277630)
chr7 (271-347)||(46386817-46386892)
chr7 (73-148)||(20487885-20487960)
chr7 (3-53)||(1856865-1856915)
chr7 (3-53)||(13918038-13918088)
chr7 (3-53)||(25926765-25926815)
chr7 (271-347)||(11066715-11066790)
chr7 (5-53)||(11303724-11303772)
chr7 (271-335)||(12127894-12127957)
chr7 (5-53)||(16108326-16108374)
chr7 (5-53)||(23664590-23664638)
chr7 (271-347)||(37785095-37785170)
chr7 (304-350)||(10660028-10660074)
chr7 (271-345)||(20585605-20585678)
chr7 (245-374)||(33001175-33001303)
chr7 (267-368)||(13133288-13133388)
chr7 (271-374)||(18875655-18875759)
chr7 (10-86)||(8564063-8564139)
chr7 (279-347)||(12371525-12371592)
chr7 (271-335)||(12465990-12466053)
chr7 (5-53)||(29797087-29797135)
chr7 (5-53)||(29800906-29800954)
chr7 (271-335)||(32434320-32434383)
chr7 (271-335)||(44374205-44374268)
chr7 (271-335)||(44383070-44383133)
chr7 (10-86)||(46473562-46473638)
chr7 (10-53)||(14948765-14948808)
chr7 (10-53)||(24702705-24702748)
chr7 (10-53)||(24705152-24705195)
chr7 (10-53)||(32125967-32126010)
chr7 (10-53)||(41523394-41523437)
chr7 (10-53)||(41525856-41525899)
chr7 (1-31)||(13897805-13897835)
chr7 (245-367)||(14219722-14219843)
chr7 (121-169)||(21675491-21675540)
chr7 (279-347)||(13148210-13148277)
[»] chr6 (101 HSPs)
chr6 (1-374)||(610955-611329)
chr6 (1-369)||(18658426-18658795)
chr6 (1-374)||(29847966-29848342)
chr6 (2-374)||(13764565-13764941)
chr6 (1-189)||(19825952-19826141)
chr6 (1-149)||(8759979-8760127)
chr6 (1-171)||(27851421-27851592)
chr6 (3-173)||(15173920-15174091)
chr6 (1-149)||(8767726-8767874)
chr6 (1-176)||(20556556-20556732)
chr6 (1-169)||(28947764-28947933)
chr6 (1-176)||(19443743-19443919)
chr6 (1-171)||(20733910-20734080)
chr6 (1-176)||(25619420-25619596)
chr6 (1-171)||(34296732-34296903)
chr6 (4-169)||(19655695-19655861)
chr6 (1-181)||(15817221-15817402)
chr6 (186-350)||(19829601-19829767)
chr6 (1-176)||(14979085-14979261)
chr6 (1-176)||(16133133-16133309)
chr6 (1-132)||(1254215-1254346)
chr6 (4-169)||(7827392-7827558)
chr6 (4-169)||(17318588-17318754)
chr6 (1-155)||(25347561-25347715)
chr6 (245-374)||(13751062-13751191)
chr6 (4-169)||(18702984-18703150)
chr6 (4-169)||(18708919-18709085)
chr6 (1-155)||(20182999-20183152)
chr6 (1-155)||(22152839-22152992)
chr6 (4-149)||(15891177-15891322)
chr6 (4-169)||(31734128-31734292)
chr6 (1-155)||(18928158-18928312)
chr6 (4-169)||(23150733-23150898)
chr6 (10-173)||(23956278-23956442)
chr6 (4-155)||(19773175-19773326)
chr6 (10-117)||(25807605-25807712)
chr6 (5-174)||(4477073-4477243)
chr6 (245-363)||(19443990-19444108)
chr6 (1-155)||(25601740-25601894)
chr6 (4-169)||(27125943-27126109)
chr6 (245-372)||(24266982-24267109)
chr6 (4-155)||(27318021-27318172)
chr6 (1-123)||(755-877)
chr6 (245-363)||(16133380-16133498)
chr6 (1-155)||(20177181-20177334)
chr6 (1-139)||(22158657-22158794)
chr6 (39-149)||(23415152-23415262)
chr6 (1-154)||(23491634-23491787)
chr6 (1-154)||(23497232-23497385)
chr6 (37-154)||(27556905-27557022)
chr6 (1-125)||(23655804-23655928)
chr6 (10-146)||(23838443-23838579)
chr6 (4-155)||(15705077-15705228)
chr6 (1-139)||(5834198-5834335)
chr6 (232-374)||(31735619-31735761)
chr6 (1-93)||(25921226-25921318)
chr6 (271-374)||(24441140-24441242)
chr6 (1-94)||(18585114-18585207)
chr6 (1-94)||(32259342-32259435)
chr6 (245-374)||(22212216-22212346)
chr6 (1-94)||(18455535-18455628)
chr6 (1-94)||(20411135-20411228)
chr6 (1-94)||(29044806-29044899)
chr6 (3-155)||(22556684-22556836)
chr6 (10-106)||(31022169-31022265)
chr6 (1-93)||(34141088-34141180)
chr6 (1-93)||(34153704-34153796)
chr6 (1-92)||(18398416-18398507)
chr6 (161-374)||(24550904-24551117)
chr6 (1-155)||(13285144-13285297)
chr6 (5-63)||(22806276-22806334)
chr6 (4-54)||(27330438-27330488)
chr6 (4-54)||(27391178-27391228)
chr6 (2-94)||(15938690-15938782)
chr6 (10-94)||(17857164-17857248)
chr6 (298-372)||(5110524-5110598)
chr6 (271-374)||(17318852-17318956)
chr6 (271-374)||(31733926-31734030)
chr6 (298-372)||(5289883-5289957)
chr6 (3-53)||(23415441-23415491)
chr6 (3-53)||(27557199-27557249)
chr6 (271-374)||(15891433-15891537)
chr6 (245-326)||(23500890-23500970)
chr6 (5-53)||(12942666-12942714)
chr6 (271-347)||(23150996-23151071)
chr6 (271-347)||(27126207-27126282)
chr6 (5-53)||(28288974-28289022)
chr6 (10-53)||(15892051-15892094)
chr6 (267-350)||(19655914-19655996)
chr6 (114-176)||(25752963-25753026)
chr6 (114-176)||(25755133-25755196)
chr6 (2-94)||(22523433-22523525)
chr6 (10-53)||(1540554-1540597)
chr6 (1-44)||(7430069-7430112)
chr6 (10-53)||(12742794-12742837)
chr6 (1-44)||(14594088-14594131)
chr6 (10-53)||(17883140-17883183)
chr6 (10-53)||(33862270-33862313)
chr6 (271-332)||(7827234-7827294)
chr6 (121-169)||(25921150-25921199)
chr6 (271-347)||(18708747-18708821)
[»] chr3 (168 HSPs)
chr3 (1-374)||(3394465-3394839)
chr3 (1-374)||(13522873-13523248)
chr3 (1-374)||(179170-179544)
chr3 (1-374)||(18367221-18367595)
chr3 (1-364)||(14642013-14642379)
chr3 (1-331)||(6819367-6819698)
chr3 (1-372)||(6158612-6158986)
chr3 (1-258)||(12275880-12276138)
chr3 (1-372)||(37038033-37038408)
chr3 (4-347)||(10562950-10563295)
chr3 (1-374)||(42324684-42325060)
chr3 (1-174)||(10833802-10833976)
chr3 (1-176)||(8928128-8928304)
chr3 (1-174)||(10989266-10989440)
chr3 (1-202)||(1988695-1988896)
chr3 (1-189)||(50243132-50243322)
chr3 (9-173)||(13029747-13029912)
chr3 (1-176)||(2248433-2248609)
chr3 (1-176)||(24152907-24153083)
chr3 (1-169)||(11192501-11192670)
chr3 (9-173)||(13026155-13026320)
chr3 (1-176)||(43550140-43550316)
chr3 (3-173)||(16979326-16979497)
chr3 (1-154)||(11913157-11913310)
chr3 (1-176)||(16643418-16643594)
chr3 (4-169)||(14441588-14441754)
chr3 (1-176)||(14966415-14966591)
chr3 (4-169)||(5206120-5206286)
chr3 (10-171)||(10554685-10554847)
chr3 (4-169)||(17693488-17693654)
chr3 (4-169)||(40807416-40807582)
chr3 (1-155)||(43928786-43928940)
chr3 (4-169)||(44273894-44274060)
chr3 (4-169)||(54875949-54876115)
chr3 (3-173)||(6805426-6805597)
chr3 (4-155)||(17670175-17670326)
chr3 (4-155)||(17685309-17685460)
chr3 (4-155)||(40812268-40812419)
chr3 (4-169)||(17538527-17538693)
chr3 (1-155)||(50351463-50351617)
chr3 (5-169)||(14508268-14508432)
chr3 (246-374)||(13520490-13520618)
chr3 (1-171)||(31224416-31224588)
chr3 (4-155)||(15931973-15932124)
chr3 (1-171)||(55292104-55292275)
chr3 (1-155)||(17513015-17513169)
chr3 (1-147)||(18893067-18893213)
chr3 (1-155)||(53646523-53646677)
chr3 (3-170)||(18889783-18889951)
chr3 (1-146)||(19443955-19444100)
chr3 (10-173)||(41943-42107)
chr3 (10-173)||(35961359-35961523)
chr3 (4-155)||(12470237-12470388)
chr3 (1-132)||(13519741-13519872)
chr3 (4-155)||(17519339-17519490)
chr3 (4-155)||(17534201-17534352)
chr3 (4-155)||(50348492-50348643)
chr3 (1-155)||(17044401-17044555)
chr3 (1-155)||(33564564-33564718)
chr3 (4-169)||(35065047-35065212)
chr3 (4-169)||(35354019-35354185)
chr3 (10-174)||(9533544-9533709)
chr3 (10-174)||(14763433-14763598)
chr3 (245-374)||(14818239-14818368)
chr3 (4-139)||(43889265-43889400)
chr3 (4-169)||(2841929-2842094)
chr3 (10-148)||(20248456-20248594)
chr3 (10-155)||(3803270-3803415)
chr3 (245-374)||(10550483-10550612)
chr3 (10-174)||(23371179-23371344)
chr3 (4-155)||(12511283-12511434)
chr3 (4-155)||(22307049-22307200)
chr3 (10-148)||(14671266-14671404)
chr3 (10-155)||(38311475-38311621)
chr3 (1-126)||(14567675-14567800)
chr3 (10-174)||(51300810-51300975)
chr3 (38-154)||(15465337-15465453)
chr3 (4-132)||(18699939-18700067)
chr3 (38-154)||(26055128-26055244)
chr3 (4-139)||(41172836-41172971)
chr3 (4-154)||(5223566-5223716)
chr3 (14-148)||(10541934-10542068)
chr3 (161-374)||(11886294-11886511)
chr3 (245-363)||(17548259-17548377)
chr3 (10-147)||(16325013-16325150)
chr3 (234-374)||(20417293-20417432)
chr3 (4-139)||(49900179-49900322)
chr3 (245-374)||(52338673-52338802)
chr3 (161-350)||(12512441-12512633)
chr3 (245-374)||(52213185-52213314)
chr3 (1-169)||(14519683-14519851)
chr3 (267-374)||(23395790-23395897)
chr3 (1-94)||(9511629-9511722)
chr3 (1-94)||(9519604-9519697)
chr3 (4-85)||(17046631-17046712)
chr3 (1-169)||(6156126-6156294)
chr3 (1-169)||(14152862-14153031)
chr3 (1-169)||(50755845-50756013)
chr3 (73-176)||(52989493-52989597)
chr3 (12-173)||(22652248-22652409)
chr3 (4-81)||(5215156-5215233)
chr3 (214-374)||(14250795-14250954)
chr3 (1-65)||(51603063-51603127)
chr3 (245-331)||(13179399-13179485)
chr3 (2-92)||(17207839-17207929)
chr3 (73-169)||(11258887-11258984)
chr3 (1-94)||(15566009-15566102)
chr3 (1-94)||(18739391-18739484)
chr3 (1-155)||(25104665-25104818)
chr3 (1-94)||(54330769-54330862)
chr3 (307-374)||(12275813-12275880)
chr3 (1-92)||(12952539-12952630)
chr3 (73-148)||(14682765-14682840)
chr3 (1-68)||(19568874-19568941)
chr3 (271-374)||(5206384-5206488)
chr3 (1-94)||(17938022-17938115)
chr3 (271-374)||(41173101-41173205)
chr3 (1-61)||(46723089-46723149)
chr3 (245-368)||(54876146-54876268)
chr3 (298-372)||(3803096-3803170)
chr3 (298-372)||(11850404-11850478)
chr3 (271-374)||(35065310-35065414)
chr3 (271-347)||(14153200-14153275)
chr3 (1-94)||(24546332-24546429)
chr3 (271-347)||(44273721-44273796)
chr3 (245-368)||(17046429-17046551)
chr3 (267-350)||(17691490-17691572)
chr3 (3-53)||(15465631-15465681)
chr3 (304-369)||(54520701-54520766)
chr3 (271-347)||(2842192-2842267)
chr3 (271-335)||(11258726-11258789)
chr3 (5-53)||(12305599-12305647)
chr3 (271-347)||(15932237-15932312)
chr3 (271-347)||(17693315-17693390)
chr3 (110-169)||(19568940-19569000)
chr3 (271-335)||(19884253-19884316)
chr3 (271-347)||(22307313-22307388)
chr3 (271-347)||(35353846-35353921)
chr3 (271-347)||(40807243-40807318)
chr3 (3-53)||(5223860-5223910)
chr3 (3-53)||(26054900-26054950)
chr3 (5-43)||(54521309-54521347)
chr3 (245-350)||(14441453-14441557)
chr3 (267-344)||(17685528-17685604)
chr3 (2-94)||(8023718-8023810)
chr3 (271-347)||(14508098-14508173)
chr3 (271-335)||(16728542-16728605)
chr3 (256-344)||(17258945-17259032)
chr3 (271-335)||(17519603-17519666)
chr3 (271-335)||(17534465-17534528)
chr3 (271-335)||(17538366-17538429)
chr3 (119-170)||(18893009-18893061)
chr3 (5-53)||(29544479-29544527)
chr3 (271-347)||(50348836-50348911)
chr3 (10-53)||(7780989-7781032)
chr3 (267-350)||(11562664-11562746)
chr3 (1-44)||(14647566-14647609)
chr3 (10-53)||(15978009-15978052)
chr3 (267-374)||(19569054-19569160)
chr3 (10-53)||(28848264-28848307)
chr3 (269-326)||(11192390-11192446)
chr3 (232-297)||(16059521-16059585)
chr3 (4-53)||(22764096-22764145)
chr3 (121-169)||(24546257-24546306)
chr3 (271-350)||(6155872-6155951)
chr3 (4-36)||(11258984-11259016)
chr3 (1-29)||(13436799-13436827)
chr3 (271-335)||(45531351-45531414)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (1-374)||(2921-3295)
[»] chr4 (106 HSPs)
chr4 (1-374)||(15447879-15448248)
chr4 (1-368)||(10704719-10705087)
chr4 (1-368)||(10918489-10918857)
chr4 (1-350)||(9638244-9638596)
chr4 (98-374)||(9871126-9871405)
chr4 (9-169)||(3337519-3337680)
chr4 (1-189)||(630366-630556)
chr4 (1-173)||(15990455-15990628)
chr4 (3-173)||(10694712-10694883)
chr4 (3-173)||(10908478-10908649)
chr4 (3-173)||(40619946-40620117)
chr4 (1-174)||(56115299-56115473)
chr4 (10-174)||(33849157-33849322)
chr4 (1-176)||(12611264-12611440)
chr4 (3-173)||(15008382-15008553)
chr4 (1-176)||(23802927-23803103)
chr4 (1-174)||(24046997-24047171)
chr4 (10-174)||(18212981-18213146)
chr4 (4-169)||(25091073-25091239)
chr4 (1-176)||(51463530-51463706)
chr4 (1-171)||(16277790-16277961)
chr4 (4-155)||(37019104-37019255)
chr4 (1-171)||(53387400-53387571)
chr4 (4-169)||(19609744-19609910)
chr4 (4-169)||(53630939-53631105)
chr4 (1-169)||(33243759-33243928)
chr4 (1-169)||(35660266-35660435)
chr4 (161-374)||(51992736-51992952)
chr4 (4-169)||(10356902-10357068)
chr4 (1-202)||(33186289-33186490)
chr4 (161-347)||(32466931-32467119)
chr4 (1-176)||(10056885-10057061)
chr4 (10-173)||(28385659-28385823)
chr4 (1-148)||(9923638-9923785)
chr4 (4-155)||(14549061-14549212)
chr4 (4-169)||(42875219-42875385)
chr4 (245-374)||(4615774-4615903)
chr4 (245-374)||(27027950-27028079)
chr4 (245-371)||(20899468-20899594)
chr4 (245-374)||(14933149-14933278)
chr4 (1-169)||(16997950-16998114)
chr4 (1-149)||(11479074-11479222)
chr4 (4-155)||(15114658-15114808)
chr4 (4-122)||(15011979-15012097)
chr4 (245-372)||(13446669-13446796)
chr4 (245-374)||(14942354-14942484)
chr4 (4-169)||(14630246-14630412)
chr4 (4-169)||(11425375-11425531)
chr4 (40-173)||(15883917-15884051)
chr4 (1-155)||(10237961-10238114)
chr4 (1-139)||(19435160-19435298)
chr4 (161-372)||(15612192-15612407)
chr4 (1-169)||(16026392-16026559)
chr4 (245-372)||(2584919-2585046)
chr4 (245-366)||(18229880-18230003)
chr4 (10-154)||(3485347-3485488)
chr4 (1-169)||(19566382-19566550)
chr4 (245-372)||(6511791-6511918)
chr4 (269-371)||(21061743-21061846)
chr4 (1-155)||(15344312-15344464)
chr4 (1-95)||(25513237-25513331)
chr4 (2-139)||(15214509-15214646)
chr4 (1-90)||(45314800-45314889)
chr4 (1-61)||(22725548-22725608)
chr4 (92-174)||(43251116-43251200)
chr4 (1-94)||(2425084-2425177)
chr4 (1-94)||(26445380-26445473)
chr4 (1-78)||(55582703-55582780)
chr4 (5-155)||(44024071-44024220)
chr4 (1-94)||(46740694-46740787)
chr4 (10-66)||(18108350-18108406)
chr4 (2-116)||(20595895-20596009)
chr4 (1-94)||(40229798-40229892)
chr4 (271-374)||(16997745-16997849)
chr4 (271-335)||(25090912-25090975)
chr4 (304-372)||(49547992-49548060)
chr4 (267-374)||(16026819-16026924)
chr4 (245-368)||(53631136-53631258)
chr4 (89-155)||(13036328-13036394)
chr4 (271-374)||(37018816-37018920)
chr4 (10-94)||(13046117-13046201)
chr4 (5-53)||(15534658-15534706)
chr4 (271-347)||(19609571-19609646)
chr4 (267-347)||(33243981-33244060)
chr4 (271-347)||(42875046-42875121)
chr4 (267-354)||(9638052-9638138)
chr4 (33-155)||(12622807-12622928)
chr4 (33-94)||(14508257-14508318)
chr4 (271-374)||(19435507-19435611)
chr4 (1-53)||(14049054-14049106)
chr4 (5-53)||(49547411-49547459)
chr4 (10-53)||(12033416-12033459)
chr4 (272-335)||(14548885-14548947)
chr4 (267-326)||(14629945-14630003)
chr4 (2-89)||(19081805-19081892)
chr4 (10-53)||(19243177-19243220)
chr4 (2-53)||(30147392-30147443)
chr4 (10-53)||(44615765-44615808)
chr4 (10-53)||(50221982-50222025)
chr4 (267-372)||(3485134-3485238)
chr4 (121-169)||(14508182-14508231)
chr4 (121-169)||(26922254-26922303)
chr4 (279-374)||(20774-20870)
chr4 (1-45)||(14185427-14185471)
chr4 (267-367)||(16026641-16026740)
chr4 (5-53)||(36038347-36038395)
[»] chr1 (83 HSPs)
chr1 (1-374)||(21180788-21181162)
chr1 (1-374)||(7792315-7792689)
chr1 (1-374)||(44822585-44822958)
chr1 (3-374)||(16400882-16401255)
chr1 (1-337)||(24815315-24815649)
chr1 (1-374)||(38057114-38057490)
chr1 (1-375)||(8276455-8276830)
chr1 (1-367)||(22349808-22350177)
chr1 (3-173)||(29764099-29764274)
chr1 (1-176)||(2332673-2332849)
chr1 (1-176)||(20031353-20031529)
chr1 (3-178)||(50000884-50001061)
chr1 (3-173)||(46198190-46198361)
chr1 (1-197)||(22130528-22130726)
chr1 (1-174)||(28312763-28312937)
chr1 (1-176)||(13881079-13881255)
chr1 (1-149)||(21239758-21239906)
chr1 (10-174)||(296770-296935)
chr1 (4-169)||(41227170-41227336)
chr1 (161-374)||(19761848-19762064)
chr1 (4-155)||(19676146-19676297)
chr1 (4-155)||(42912485-42912636)
chr1 (4-169)||(20588099-20588265)
chr1 (4-169)||(20592637-20592803)
chr1 (4-169)||(21046515-21046681)
chr1 (4-169)||(41225917-41226083)
chr1 (10-170)||(20437699-20437860)
chr1 (1-155)||(51323710-51323864)
chr1 (11-174)||(294451-294624)
chr1 (1-169)||(12710308-12710477)
chr1 (4-149)||(16058780-16058925)
chr1 (3-155)||(23195016-23195168)
chr1 (10-169)||(51082636-51082796)
chr1 (10-169)||(14238084-14238244)
chr1 (245-373)||(52983361-52983489)
chr1 (161-374)||(45754670-45754888)
chr1 (4-169)||(4596311-4596477)
chr1 (10-155)||(16372185-16372331)
chr1 (245-374)||(18823821-18823950)
chr1 (1-139)||(7052518-7052656)
chr1 (245-363)||(13528502-13528620)
chr1 (1-139)||(38887550-38887688)
chr1 (1-139)||(45496397-45496535)
chr1 (1-176)||(45574515-45574680)
chr1 (245-374)||(18275130-18275259)
chr1 (234-371)||(51476194-51476330)
chr1 (4-139)||(20634100-20634235)
chr1 (161-340)||(24726565-24726746)
chr1 (287-368)||(10813273-10813354)
chr1 (1-169)||(22823870-22824038)
chr1 (1-169)||(50544272-50544440)
chr1 (245-374)||(18270476-18270605)
chr1 (1-155)||(1643031-1643184)
chr1 (1-94)||(6833710-6833803)
chr1 (2-139)||(16655819-16655955)
chr1 (1-94)||(39060591-39060684)
chr1 (1-155)||(14793025-14793178)
chr1 (1-94)||(24720157-24720250)
chr1 (10-169)||(17902234-17902393)
chr1 (1-165)||(44891873-44892036)
chr1 (4-94)||(18121100-18121190)
chr1 (245-369)||(13302007-13302130)
chr1 (1-49)||(21659685-21659733)
chr1 (271-335)||(20587937-20588000)
chr1 (271-335)||(20592475-20592538)
chr1 (267-374)||(42696935-42697041)
chr1 (271-347)||(42912297-42912372)
chr1 (267-374)||(1642655-1642760)
chr1 (272-347)||(21046780-21046854)
chr1 (271-374)||(4596575-4596679)
chr1 (271-347)||(16059044-16059119)
chr1 (271-374)||(19675969-19676073)
chr1 (1-93)||(9784806-9784898)
chr1 (2-53)||(13227340-13227391)
chr1 (10-53)||(16362395-16362438)
chr1 (10-53)||(21841243-21841286)
chr1 (10-53)||(21922934-21922977)
chr1 (2-53)||(29535528-29535579)
chr1 (10-53)||(41372948-41372991)
chr1 (3-45)||(10812834-10812876)
chr1 (281-310)||(24815140-24815169)
chr1 (270-347)||(41227433-41227509)
chr1 (271-347)||(20634365-20634440)
[»] chr5 (71 HSPs)
chr5 (1-368)||(24277069-24277437)
chr5 (1-368)||(24384776-24385144)
chr5 (1-368)||(17812617-17812985)
chr5 (1-271)||(17875317-17875588)
chr5 (3-173)||(263273-263444)
chr5 (7-173)||(17011142-17011309)
chr5 (1-176)||(18418825-18419001)
chr5 (1-171)||(36460388-36460559)
chr5 (1-181)||(22412414-22412595)
chr5 (1-176)||(6766074-6766250)
chr5 (3-176)||(29448251-29448425)
chr5 (1-169)||(32607788-32607957)
chr5 (1-168)||(27869038-27869206)
chr5 (1-176)||(30138627-30138802)
chr5 (1-155)||(21399466-21399620)
chr5 (2-148)||(21557508-21557654)
chr5 (1-171)||(21554841-21555013)
chr5 (4-169)||(20565974-20566140)
chr5 (1-155)||(22750379-22750533)
chr5 (1-174)||(22758354-22758528)
chr5 (4-155)||(19921069-19921220)
chr5 (2-155)||(8833663-8833815)
chr5 (10-155)||(22336755-22336900)
chr5 (10-155)||(41876065-41876210)
chr5 (1-171)||(31456216-31456387)
chr5 (10-155)||(22340293-22340438)
chr5 (10-173)||(33473036-33473200)
chr5 (163-374)||(10953187-10953401)
chr5 (1-155)||(26761836-26761990)
chr5 (10-174)||(38145210-38145375)
chr5 (4-155)||(33895348-33895499)
chr5 (10-176)||(42960790-42960957)
chr5 (1-139)||(20198051-20198189)
chr5 (10-174)||(28370728-28370893)
chr5 (245-372)||(8952760-8952885)
chr5 (1-139)||(36509239-36509377)
chr5 (10-174)||(37598589-37598754)
chr5 (10-155)||(19511621-19511767)
chr5 (3-89)||(40917438-40917524)
chr5 (1-92)||(16062983-16063074)
chr5 (4-94)||(22111095-22111185)
chr5 (1-94)||(16605067-16605160)
chr5 (1-94)||(8504332-8504425)
chr5 (108-202)||(12122092-12122186)
chr5 (245-326)||(22357666-22357747)
chr5 (5-94)||(23199856-23199945)
chr5 (2-139)||(28901372-28901508)
chr5 (2-139)||(28937767-28937903)
chr5 (2-169)||(1627845-1628012)
chr5 (4-94)||(18744145-18744235)
chr5 (1-61)||(24617386-24617446)
chr5 (1-61)||(24713617-24713677)
chr5 (1-61)||(24746645-24746705)
chr5 (4-94)||(14026274-14026364)
chr5 (298-372)||(41876310-41876384)
chr5 (1-61)||(24668660-24668720)
chr5 (1-61)||(24738429-24738489)
chr5 (1-61)||(24751198-24751258)
chr5 (268-371)||(25250623-25250725)
chr5 (268-371)||(25314408-25314510)
chr5 (34-94)||(30614008-30614068)
chr5 (5-53)||(37804540-37804588)
chr5 (191-295)||(20469779-20469884)
chr5 (233-374)||(23200256-23200394)
chr5 (26-155)||(26749549-26749677)
chr5 (34-169)||(30611973-30612108)
chr5 (245-356)||(21618749-21618859)
chr5 (10-77)||(31478884-31478950)
chr5 (1-44)||(43243121-43243164)
chr5 (121-169)||(16062906-16062955)
chr5 (267-344)||(32608089-32608164)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (1-374)||(8272-8646)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (1-363)||(6025-6388)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (1-374)||(51173-51547)
scaffold0042 (1-67)||(67191-67257)
scaffold0042 (232-335)||(28533-28633)
scaffold0042 (271-347)||(47299-47373)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (1-372)||(19107-19481)
[»] chr8 (103 HSPs)
chr8 (1-374)||(20454454-20454828)
chr8 (1-367)||(20455218-20455585)
chr8 (1-367)||(20460196-20460563)
chr8 (2-338)||(15635644-15635981)
chr8 (1-374)||(39694991-39695367)
chr8 (1-374)||(42266058-42266432)
chr8 (1-367)||(19882187-19882557)
chr8 (1-174)||(364203-364377)
chr8 (1-169)||(361675-361844)
chr8 (1-171)||(41680597-41680768)
chr8 (1-174)||(44522889-44523063)
chr8 (4-149)||(32950042-32950187)
chr8 (1-167)||(38185549-38185716)
chr8 (1-176)||(17460750-17460926)
chr8 (3-146)||(23478524-23478667)
chr8 (1-174)||(44432276-44432450)
chr8 (10-174)||(17795647-17795812)
chr8 (1-176)||(25483937-25484113)
chr8 (1-167)||(21861083-21861250)
chr8 (1-155)||(18024158-18024312)
chr8 (10-173)||(19880244-19880408)
chr8 (3-173)||(26454127-26454298)
chr8 (1-171)||(42559991-42560161)
chr8 (1-202)||(21579670-21579871)
chr8 (4-169)||(5760953-5761119)
chr8 (4-138)||(6102219-6102353)
chr8 (4-169)||(20178987-20179153)
chr8 (10-174)||(27941361-27941526)
chr8 (1-176)||(19808060-19808236)
chr8 (1-168)||(21321803-21321971)
chr8 (1-168)||(21326401-21326569)
chr8 (7-155)||(42818376-42818524)
chr8 (1-155)||(39363959-39364113)
chr8 (4-169)||(39936477-39936642)
chr8 (2-154)||(6573520-6573672)
chr8 (1-176)||(22237717-22237893)
chr8 (1-155)||(18833906-18834060)
chr8 (8-169)||(19140185-19140347)
chr8 (10-173)||(11775138-11775302)
chr8 (161-363)||(25849068-25849274)
chr8 (4-155)||(5082678-5082829)
chr8 (161-374)||(19699280-19699496)
chr8 (2-155)||(22207702-22207855)
chr8 (1-202)||(29763332-29763533)
chr8 (10-155)||(44476858-44477004)
chr8 (10-155)||(44480120-44480266)
chr8 (245-374)||(22584443-22584572)
chr8 (38-154)||(14397604-14397720)
chr8 (4-155)||(17437784-17437935)
chr8 (10-155)||(8728409-8728554)
chr8 (161-271)||(23409925-23410035)
chr8 (161-371)||(23418545-23418757)
chr8 (1-117)||(23660688-23660804)
chr8 (232-374)||(17907665-17907807)
chr8 (1-139)||(20084101-20084238)
chr8 (1-155)||(22483182-22483335)
chr8 (1-169)||(18815286-18815454)
chr8 (1-169)||(18816925-18817093)
chr8 (234-371)||(23888942-23889078)
chr8 (10-132)||(23914381-23914503)
chr8 (2-139)||(17501376-17501513)
chr8 (2-94)||(22344537-22344629)
chr8 (2-94)||(22356197-22356289)
chr8 (267-374)||(23947414-23947521)
chr8 (232-374)||(22244617-22244758)
chr8 (267-374)||(17217802-17217909)
chr8 (1-93)||(36405523-36405615)
chr8 (1-155)||(20517581-20517734)
chr8 (4-94)||(21399206-21399296)
chr8 (4-94)||(21793699-21793789)
chr8 (1-155)||(22258767-22258920)
chr8 (73-173)||(8414245-8414346)
chr8 (1-94)||(36732987-36733080)
chr8 (1-169)||(4381256-4381424)
chr8 (1-93)||(23670145-23670237)
chr8 (1-94)||(17978880-17978973)
chr8 (1-94)||(36305154-36305247)
chr8 (10-71)||(38988984-38989045)
chr8 (10-71)||(39020081-39020142)
chr8 (2-94)||(21513816-21513907)
chr8 (1-94)||(24907270-24907363)
chr8 (267-368)||(36728056-36728156)
chr8 (271-347)||(19140012-19140087)
chr8 (245-368)||(5760800-5760922)
chr8 (2-87)||(24624171-24624256)
chr8 (257-329)||(18302688-18302762)
chr8 (233-374)||(22259063-22259203)
chr8 (267-350)||(31723340-31723422)
chr8 (3-53)||(16198371-16198421)
chr8 (1-55)||(22474286-22474340)
chr8 (246-348)||(45471168-45471269)
chr8 (245-350)||(22318664-22318768)
chr8 (2-94)||(18118628-18118720)
chr8 (271-335)||(20179251-20179314)
chr8 (84-148)||(21345945-21346009)
chr8 (271-347)||(39936740-39936815)
chr8 (10-53)||(4542016-4542059)
chr8 (10-53)||(14397383-14397426)
chr8 (10-53)||(18677707-18677750)
chr8 (246-368)||(20024993-20025113)
chr8 (13-94)||(45559644-45559725)
chr8 (121-149)||(24238857-24238885)
chr8 (10-86)||(25757656-25757732)
[»] chr2 (91 HSPs)
chr2 (1-344)||(31520362-31520706)
chr2 (1-363)||(18388760-18389125)
chr2 (1-285)||(24883690-24883975)
chr2 (1-229)||(10039597-10039826)
chr2 (1-169)||(24273722-24273891)
chr2 (3-176)||(18358434-18358608)
chr2 (84-280)||(22501177-22501374)
chr2 (84-280)||(22509111-22509308)
chr2 (3-173)||(25183603-25183774)
chr2 (1-173)||(26903574-26903747)
chr2 (3-173)||(21081436-21081607)
chr2 (10-174)||(23338872-23339037)
chr2 (1-176)||(41301436-41301612)
chr2 (1-176)||(22173491-22173667)
chr2 (1-176)||(27472666-27472842)
chr2 (1-155)||(20915540-20915694)
chr2 (10-173)||(21915038-21915202)
chr2 (4-169)||(9975349-9975515)
chr2 (1-174)||(21073190-21073364)
chr2 (4-169)||(36839591-36839757)
chr2 (5-149)||(17306928-17307072)
chr2 (4-135)||(5031596-5031727)
chr2 (1-171)||(20590785-20590956)
chr2 (1-189)||(34858848-34859038)
chr2 (1-189)||(34873910-34874100)
chr2 (10-174)||(9242175-9242340)
chr2 (1-169)||(43707748-43707916)
chr2 (4-155)||(23068916-23069067)
chr2 (4-155)||(27484936-27485087)
chr2 (1-174)||(28349323-28349506)
chr2 (4-169)||(24781306-24781472)
chr2 (10-174)||(19662127-19662292)
chr2 (161-350)||(25045242-25045434)
chr2 (7-155)||(24515621-24515769)
chr2 (4-155)||(28652968-28653119)
chr2 (1-169)||(23969086-23969255)
chr2 (4-155)||(19201666-19201818)
chr2 (1-132)||(21368565-21368696)
chr2 (10-155)||(6482953-6483099)
chr2 (10-155)||(6486420-6486566)
chr2 (10-174)||(6260850-6261015)
chr2 (38-154)||(31345379-31345495)
chr2 (10-148)||(9785024-9785162)
chr2 (262-359)||(6478025-6478122)
chr2 (74-174)||(30643817-30643918)
chr2 (47-174)||(2524240-2524366)
chr2 (1-169)||(21316125-21316293)
chr2 (1-94)||(22690176-22690269)
chr2 (1-94)||(22694772-22694865)
chr2 (1-94)||(25587150-25587243)
chr2 (1-169)||(29113782-29113950)
chr2 (234-374)||(27860499-27860637)
chr2 (2-87)||(21335917-21336002)
chr2 (1-94)||(23609972-23610065)
chr2 (245-374)||(44071706-44071834)
chr2 (1-93)||(1384149-1384241)
chr2 (245-374)||(27851793-27851921)
chr2 (270-344)||(14693456-14693529)
chr2 (1-94)||(22686335-22686428)
chr2 (1-94)||(28345539-28345632)
chr2 (271-374)||(36839392-36839496)
chr2 (272-374)||(9975146-9975249)
chr2 (271-347)||(19358178-19358253)
chr2 (271-347)||(27485200-27485275)
chr2 (245-331)||(18391038-18391124)
chr2 (1-94)||(23778758-23778852)
chr2 (245-350)||(3538978-3539082)
chr2 (271-374)||(24515404-24515508)
chr2 (5-53)||(10684400-10684448)
chr2 (5-53)||(20261696-20261744)
chr2 (2-169)||(22332138-22332304)
chr2 (271-335)||(23969353-23969416)
chr2 (271-334)||(5031860-5031922)
chr2 (217-374)||(10897467-10897625)
chr2 (3-53)||(31345656-31345706)
chr2 (2-91)||(20272855-20272944)
chr2 (271-374)||(28653232-28653336)
chr2 (271-347)||(24781570-24781645)
chr2 (267-350)||(22259211-22259293)
chr2 (10-53)||(23136056-23136099)
chr2 (10-53)||(38967956-38967999)
chr2 (4-50)||(40911863-40911909)
chr2 (271-374)||(17306705-17306809)
chr2 (121-169)||(22686260-22686309)
chr2 (12-53)||(24897840-24897881)
chr2 (12-53)||(24900323-24900364)
chr2 (12-53)||(24902800-24902841)
chr2 (12-53)||(24905277-24905318)
chr2 (12-53)||(24907752-24907793)
chr2 (267-368)||(25141307-25141407)
chr2 (10-90)||(24302220-24302300)
[»] scaffold0630 (1 HSPs)
scaffold0630 (3-374)||(8277-8651)
[»] scaffold0220 (4 HSPs)
scaffold0220 (1-367)||(13166-13535)
scaffold0220 (1-374)||(15977-16353)
scaffold0220 (1-139)||(8687-8825)
scaffold0220 (161-371)||(17627-17841)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (1-374)||(159413-159789)
[»] scaffold0108 (2 HSPs)
scaffold0108 (1-374)||(5630-6006)
scaffold0108 (10-94)||(7254-7338)
[»] scaffold0308 (1 HSPs)
scaffold0308 (1-367)||(12554-12923)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (3-374)||(3407-3782)
[»] scaffold0825 (2 HSPs)
scaffold0825 (95-350)||(1372-1628)
scaffold0825 (1-77)||(1097-1173)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-297)||(36034-36333)
[»] scaffold0635 (1 HSPs)
scaffold0635 (1-229)||(7244-7473)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (33-374)||(20862-21198)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (4-243)||(77033-77273)
scaffold0001 (1-176)||(152673-152849)
scaffold0001 (10-173)||(176208-176372)
scaffold0001 (10-173)||(168855-169019)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (14-374)||(11983-12347)
scaffold0008 (267-350)||(136348-136430)
[»] scaffold0180 (2 HSPs)
scaffold0180 (1-169)||(28831-29000)
scaffold0180 (1-29)||(9996-10024)
[»] scaffold0515 (1 HSPs)
scaffold0515 (3-173)||(4446-4621)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (3-173)||(4446-4621)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (1-181)||(105320-105501)
scaffold0023 (1-174)||(162699-162873)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (1-176)||(12382-12558)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (1-169)||(1505-1674)
scaffold0334 (1-105)||(1-105)
[»] scaffold1783 (1 HSPs)
scaffold1783 (1-180)||(658-838)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (3-173)||(5874-6045)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (1-155)||(26361-26515)
scaffold0104 (1-155)||(27743-27897)
scaffold0104 (1-169)||(7639-7808)
scaffold0104 (1-169)||(14270-14439)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (1-169)||(21153-21322)
[»] scaffold0057 (2 HSPs)
scaffold0057 (5-173)||(70295-70464)
scaffold0057 (1-67)||(71934-72000)
[»] scaffold0462 (3 HSPs)
scaffold0462 (3-173)||(10636-10808)
scaffold0462 (5-94)||(815-903)
scaffold0462 (5-94)||(6321-6409)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (1-176)||(406-582)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (3-173)||(22234-22405)
[»] scaffold0026 (5 HSPs)
scaffold0026 (3-173)||(21497-21668)
scaffold0026 (1-149)||(124023-124171)
scaffold0026 (10-174)||(110902-111067)
scaffold0026 (4-155)||(146167-146318)
scaffold0026 (245-342)||(145987-146082)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (1-178)||(428-605)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (1-147)||(7576-7722)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (1-174)||(9419-9593)
[»] scaffold0109 (3 HSPs)
scaffold0109 (1-174)||(2754-2927)
scaffold0109 (10-169)||(449-609)
scaffold0109 (10-154)||(5752-5896)
[»] scaffold0061 (4 HSPs)
scaffold0061 (4-169)||(15052-15218)
scaffold0061 (4-169)||(24110-24276)
scaffold0061 (245-350)||(15249-15353)
scaffold0061 (245-350)||(24307-24411)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (1-154)||(433-586)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-172)||(15990-16162)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (1-149)||(6466-6614)
scaffold0123 (245-359)||(1984-2100)
scaffold0123 (3-94)||(16433-16524)
[»] scaffold0672 (1 HSPs)
scaffold0672 (1-167)||(8019-8186)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-167)||(21677-21844)
[»] scaffold0077 (6 HSPs)
scaffold0077 (1-174)||(22984-23158)
scaffold0077 (6-135)||(33794-33923)
scaffold0077 (1-149)||(17720-17868)
scaffold0077 (33-149)||(23385-23501)
scaffold0077 (1-123)||(22642-22765)
scaffold0077 (161-249)||(3055-3143)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (4-169)||(78484-78650)
[»] scaffold0737 (3 HSPs)
scaffold0737 (1-138)||(6140-6277)
scaffold0737 (4-155)||(5179-5330)
scaffold0737 (271-374)||(5443-5547)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (1-134)||(11101-11234)
scaffold0413 (245-374)||(10891-11020)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (1-173)||(11113-11286)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (1-169)||(9475-9644)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-176)||(82400-82575)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (3-127)||(29662-29786)
scaffold0034 (4-155)||(120345-120496)
[»] scaffold1283 (2 HSPs)
scaffold1283 (4-169)||(933-1099)
scaffold1283 (245-350)||(1130-1234)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (4-169)||(7851-8017)
scaffold0384 (277-347)||(8122-8191)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (1-174)||(138190-138364)
scaffold0003 (266-349)||(95525-95608)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (1-176)||(1573-1748)
scaffold0125 (1-155)||(27735-27889)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (161-372)||(53258-53471)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (4-135)||(106669-106800)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (4-169)||(22257-22423)
scaffold0080 (9-176)||(29145-29313)
scaffold0080 (9-176)||(34610-34778)
[»] scaffold2046 (1 HSPs)
scaffold2046 (245-374)||(325-454)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (5-169)||(13003-13168)
scaffold0111 (271-347)||(13264-13339)
scaffold0111 (271-347)||(19531-19606)
scaffold0111 (103-169)||(19368-19435)
[»] scaffold0019 (3 HSPs)
scaffold0019 (10-174)||(133165-133330)
scaffold0019 (10-174)||(133636-133801)
scaffold0019 (10-169)||(29578-29738)
[»] scaffold0083 (5 HSPs)
scaffold0083 (1-149)||(445-593)
scaffold0083 (1-149)||(5749-5897)
scaffold0083 (1-45)||(1480-1524)
scaffold0083 (245-347)||(645-745)
scaffold0083 (245-347)||(5949-6049)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (4-155)||(8769-8920)
scaffold0375 (271-345)||(9033-9106)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (4-155)||(143048-143199)
scaffold0020 (4-132)||(169463-169591)
[»] scaffold0529 (3 HSPs)
scaffold0529 (4-169)||(7937-8103)
scaffold0529 (24-138)||(8152-8266)
scaffold0529 (267-344)||(7588-7664)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (163-372)||(627-839)
[»] scaffold0188 (1 HSPs)
scaffold0188 (245-374)||(345-474)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (1-149)||(67535-67683)
scaffold0032 (1-90)||(62433-62522)
scaffold0032 (2-94)||(116869-116961)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (4-155)||(13131-13282)
scaffold0452 (6-139)||(8118-8251)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (4-155)||(126183-126334)
scaffold0011 (1-155)||(32889-33042)
[»] scaffold0371 (3 HSPs)
scaffold0371 (1-155)||(10910-11064)
scaffold0371 (33-126)||(17223-17316)
scaffold0371 (245-368)||(16825-16947)
[»] scaffold0241 (5 HSPs)
scaffold0241 (4-169)||(1984-2150)
scaffold0241 (4-86)||(5413-5495)
scaffold0241 (78-169)||(5137-5229)
scaffold0241 (245-350)||(4783-4887)
scaffold0241 (267-368)||(4955-5055)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (3-133)||(23669-23799)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (1-169)||(39519-39688)
[»] scaffold1766 (1 HSPs)
scaffold1766 (4-132)||(1160-1288)
[»] scaffold0546 (2 HSPs)
scaffold0546 (10-154)||(7411-7555)
scaffold0546 (1-44)||(10380-10423)
[»] scaffold0051 (3 HSPs)
scaffold0051 (1-149)||(64532-64680)
scaffold0051 (38-154)||(31386-31502)
scaffold0051 (3-53)||(31680-31730)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (8-155)||(1342-1489)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (4-155)||(7055-7206)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (15-169)||(22478-22633)
scaffold0146 (279-370)||(23618-23710)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (39-173)||(33334-33469)
scaffold0138 (3-53)||(33648-33698)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (4-155)||(58183-58334)
scaffold0064 (271-345)||(57997-58070)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (5-148)||(21094-21237)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (1-139)||(1155-1293)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-139)||(10392-10530)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (161-363)||(397720-397925)
scaffold0002 (245-331)||(127503-127589)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (245-374)||(5039-5168)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (245-374)||(3250-3379)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (245-374)||(6835-6964)
[»] scaffold0153 (1 HSPs)
scaffold0153 (1-117)||(4570-4686)
[»] scaffold0292 (1 HSPs)
scaffold0292 (4-155)||(6948-7099)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (4-155)||(21503-21654)
[»] scaffold0802 (1 HSPs)
scaffold0802 (1-155)||(5130-5284)
[»] scaffold0632 (2 HSPs)
scaffold0632 (4-169)||(585-751)
scaffold0632 (279-335)||(424-479)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (10-148)||(5798-5936)
[»] scaffold1633 (1 HSPs)
scaffold1633 (6-135)||(660-789)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (10-174)||(2199-2364)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (245-374)||(6121-6250)
scaffold0309 (245-374)||(8273-8402)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (37-154)||(19951-20068)
scaffold0293 (3-53)||(19724-19774)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (22-135)||(9711-9824)
scaffold0134 (271-347)||(9956-10031)
[»] scaffold0117 (4 HSPs)
scaffold0117 (245-374)||(40933-41062)
scaffold0117 (38-154)||(39515-39631)
scaffold0117 (1-66)||(21285-21350)
scaffold0117 (7-53)||(39809-39855)
[»] scaffold0429 (1 HSPs)
scaffold0429 (256-371)||(2709-2824)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (10-148)||(3712-3850)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (246-374)||(3093-3221)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (4-169)||(1131-1297)
scaffold1186 (267-326)||(830-888)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (4-169)||(186971-187137)
scaffold0005 (267-326)||(187380-187438)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (161-374)||(3482-3701)
[»] scaffold0200 (2 HSPs)
scaffold0200 (38-154)||(17836-17952)
scaffold0200 (3-53)||(18130-18180)
[»] scaffold0439 (3 HSPs)
scaffold0439 (1-155)||(11594-11748)
scaffold0439 (3-139)||(3871-4007)
scaffold0439 (267-344)||(3710-3786)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (10-154)||(30048-30192)
[»] scaffold0962 (1 HSPs)
scaffold0962 (280-371)||(1272-1363)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-155)||(18600-18753)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (1-139)||(168889-169027)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (245-362)||(34099-34216)
[»] scaffold0684 (1 HSPs)
scaffold0684 (1-91)||(1-91)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (245-367)||(59565-59687)
scaffold0004 (1-155)||(66495-66649)
scaffold0004 (191-331)||(109423-109563)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (1-93)||(65444-65536)
[»] scaffold0409 (4 HSPs)
scaffold0409 (226-371)||(444-589)
scaffold0409 (226-371)||(8699-8844)
scaffold0409 (2-164)||(2244-2406)
scaffold0409 (2-139)||(10499-10636)
[»] scaffold1204 (1 HSPs)
scaffold1204 (2-139)||(814-951)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (2-139)||(7957-8094)
[»] scaffold0401 (1 HSPs)
scaffold0401 (1-94)||(8315-8408)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (245-374)||(66226-66354)
[»] scaffold0256 (2 HSPs)
scaffold0256 (76-169)||(3059-3153)
scaffold0256 (1-65)||(2516-2580)
[»] scaffold0468 (1 HSPs)
scaffold0468 (2-139)||(11682-11819)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (1-94)||(18117-18210)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (1-94)||(7318-7411)
scaffold0230 (10-53)||(14424-14467)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-94)||(18589-18682)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (1-94)||(26011-26104)
scaffold0017 (121-169)||(25936-25985)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (2-164)||(11671-11833)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (1-155)||(56412-56565)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (183-368)||(2577-2765)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-168)||(10132-10289)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-94)||(62214-62307)
[»] scaffold0686 (1 HSPs)
scaffold0686 (1-59)||(767-825)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (5-139)||(13243-13377)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (1-94)||(8083-8176)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (1-169)||(34685-34849)
scaffold0113 (269-347)||(34517-34594)
[»] scaffold0086 (1 HSPs)
scaffold0086 (10-93)||(35989-36072)
[»] scaffold1817 (1 HSPs)
scaffold1817 (271-371)||(127-228)
[»] scaffold1662 (1 HSPs)
scaffold1662 (274-374)||(154-255)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-67)||(2411-2477)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (81-155)||(2377-2451)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (298-372)||(133-207)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (2-139)||(32695-32831)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (12-71)||(7851-7910)
[»] scaffold1160 (1 HSPs)
scaffold1160 (1-155)||(121-274)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (1-94)||(11810-11903)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (107-167)||(2362-2423)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (245-350)||(3797-3901)
[»] scaffold0436 (1 HSPs)
scaffold0436 (1-53)||(8495-8547)
[»] scaffold1695 (1 HSPs)
scaffold1695 (245-368)||(583-705)
[»] scaffold1278 (1 HSPs)
scaffold1278 (10-155)||(889-1033)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (1-54)||(24526-24579)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (271-347)||(9488-9563)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-53)||(3500-3552)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (10-53)||(53-96)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (10-53)||(9718-9761)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (10-53)||(21225-21268)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (267-350)||(20755-20837)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (10-53)||(11766-11809)
[»] scaffold2015 (1 HSPs)
scaffold2015 (1-31)||(146-176)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-43)||(16451-16493)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (279-374)||(60473-60569)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 149)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 40555206 - 40555580
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40555206 tttttgagatatgatgtaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 40555305  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40555306 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacccatattgtgagttgatcttgggataggaatagaagttgtt 40555405  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  40555406 aataagttataaacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatatggaaaatgtatgatatagaaaat 40555505  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  40555506 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 40555580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 8756859 - 8757233
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  8756859 tttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttgggataat 8756958  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8756959 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 8757058  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8757059 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 8757158  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8757159 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 8757233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4325645 - 4325271
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4325645 tttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgcgataat 4325546  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4325545 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 4325446  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  4325445 aataagttatagacttacagagagcttgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgttgaaaatgtatgatatagaaaat 4325346  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  4325345 atcgttgttattatcattcaagttgttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttattgtccctgct 4325271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 832486 - 832858
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  832486 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataat 832585  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  832586 tccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 832685  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  832686 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaattattaatgagtgttggttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgataaagaaaat 832785  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  832786 atcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 832858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 1197666 - 1198038
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1197666 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataat 1197765  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  1197766 tccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 1197865  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  1197866 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaattattaatgagtgttggttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgataaagaaaat 1197965  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1197966 atcgttttttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 1198038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13408361 - 13407998
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13408361 tttttgagatatgatgaaaattctccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 13408262  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||||||    
T  13408261 ttcaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttttttaagagtatttaacccatgttgtgagttgattttgggataggaatgggagttgtt 13408162  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13408161 aataagttatagacgtacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 13408062  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13408061 atcgttgtaattatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttg 13407998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 2 - 359
Target Start/End: Original strand, 12755170 - 12755528
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12755170 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatt 12755269  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatta-acccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtta 200  Q
    ||||  || ||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  12755270 ccaacccttaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttgacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgtta 12755369  T
Q  201 ataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaata 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12755370 ataagttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatcatgtggaaaatgtatgatatagaaaata 12755469  T
Q  301 tcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttat 359  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12755470 tcgttgtttatataattcaagttgttatgattaatatttctatgttgcaagttgcttat 12755528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 349
Target Start/End: Original strand, 58881 - 59232
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  58881 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 58980  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  58981 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 59080  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  59081 attaagttatagacttacagggagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaa 59180  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgca 349  Q
     |||  ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  59181 ttattattgtttatatcatttaaattgttattattgatgttgctatgttgca 59232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 4 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47094666 - 47094293
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47094666 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattcc 47094567  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat 202  Q
    ||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  47094566 aaacctcaaaactagtagtactatgatttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgttaat 47094467  T
Q  203 aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatg---tgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||||| ||| |    
T  47094466 aagttatagacttacagagagtctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaaatgtatgatata-aaatt 47094368  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||| ||||  || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  47094367 attattgtttatatcattcaagttgttgttatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 47094293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 17070756 - 17071124
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17070756 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttattgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 17070855  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17070856 ttcaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttgatcttgggatatgaatggaagttgtt 17070955  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | ||||||||||||||| ||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||    
T  17070956 attaagttatagacttatagagag------tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatataaaaa 17071049  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||    
T  17071050 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctg 17071124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 13864858 - 13865212
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13864858 tttttgagatatgaggaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtacaaccttttctaagttaatccaaaacttatgggataat 13864957  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtattaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtta 200  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||        ||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  13864958 tccaaggctcaaaagtagaagtactatgagttcaattaag-------agtat-ttaatccatgttatgagttgatcttgggataggaatgggagttgtta 13865049  T
Q  201 ataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaata 300  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  13865050 ataagttatagacgtacggagagcctgaatcaaattattaatgattgttggttagtttaagatatgtatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaata 13865149  T
Q  301 tcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13865150 tcgttgttattatcattgaagttgttattattaatattgctatgttgcaagctgcttatgttg 13865212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 13699352 - 13699685
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  13699352 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccatttctaagttaatctgaaacttatggaataat 13699451  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| |    
T  13699452 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctttggataggaatggaagttg-t 13699550  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||  ||||    
T  13699551 aataagttatagacttacagagagtctgaatcaaatgattaatgactgtcggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatagggaaa 13699650  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattatt 332  Q
     |||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13699651 ttattattgtttatatcattcaagttgttattatt 13699685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 14191549 - 14191919
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14191549 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 14191648  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatagaagttgt 198  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||| || |||  ||||||||    
T  14191649 tccaaacctcaaaactataagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaagttgt 14191747  T
Q  199 taataa-gttatagacttacagagagcctgaa--tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatataga 295  Q
    | ||||  |||  |   | ||||||| |||||  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| |||||||||    
T  14191748 ttataatattaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgattgttagttagtttaagatatctatattatgagggaaatgtgtgatataga 14191847  T
Q  296 aaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14191848 aaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctttgttgcaagttgcttatgttgttgt 14191919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Original strand, 14188755 - 14189125
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14188755 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtctttgtgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 14188854  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatagaagttgt 198  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | |||||| || |||  ||||||||    
T  14188855 tccaaacctcaaaactataagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttggggta-gaaacgaagttgt 14188953  T
Q  199 taataa-gttatagacttacagagagcctgaa--tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatataga 295  Q
    | ||||  |||  |   | ||||||| |||||  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||| ||||||| |    
T  14188954 ttataatattaatgttgttcagagagtctgaaattaagatgattaatgattgttagttagtttaagatatctatattatgagggaaatgtgtgatatata 14189053  T
Q  296 aaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  14189054 aaatatcgttgtttatatctttcaagttgttattattaatattgctttgttgtaagttgcttatgttgttgt 14189125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 32160667 - 32160838
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32160667 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 32160766  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  32160767 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 32160838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 18456111 - 18456287
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18456111 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataat 18456210  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18456211 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 18456287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 16550469 - 16550640
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16550469 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 16550568  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  16550569 caaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 16550640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16615193 - 16615022
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16615193 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattgagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 16615094  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  16615093 caaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 16615022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 11661694 - 11661520
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11661694 tttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 11661595  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  11661594 tccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 11661520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15214088 - 15213935
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15214088 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 15213989  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  15213988 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 15213935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 13647831 - 13647655
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13647831 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataat 13647732  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  13647731 accaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc 13647655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34957760 - 34957584
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34957760 tttttgagatatgattaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaggtaatccaaaacttatgggataat 34957661  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  34957660 tccaaggatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatc 34957584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 30820719 - 30820890
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  30820719 tttttaagatatgataaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagataatccaaaacttatgggataat 30820818  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  30820819 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagt 30820890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 709020 - 709191
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  709020 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcttaactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 709119  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  709120 caaacctcaaaactagaagtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 709191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 171
Target Start/End: Original strand, 36685715 - 36685884
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36685715 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatttc 36685814  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtg-tttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  36685815 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgttttaagagtatttaacccatgttgtgagt 36685884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32771917 - 32771763
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32771917 tttttgagatgtgatgaaaataatccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 32771818  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32771817 tccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 32771763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 172
Target Start/End: Original strand, 47975376 - 47975546
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47975376 tttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattt 47975475  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagtt 172  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  47975476 caaacatcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtt 47975546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 48743892 - 48743746
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48743892 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggagaacttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 48743793  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttta 147  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  48743792 tccaaagctcaaaactagatgtactatgagttcaattaaggtgttta 48743746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 14415956 - 14416101
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  14415956 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 14416055  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14416056 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 14416101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16462623 - 16462452
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16462623 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcatagctgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 16462524  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  16462523 caaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgattaacagtatttaacctatgttgtgagttg 16462452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 17505467 - 17505638
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17505467 tttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataat 17505566  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  17505567 tccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 17505638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17547747 - 17547576
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17547747 tttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataat 17547648  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  17547647 tccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 17547576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 37727390 - 37727591
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  37727390 tttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 37727489  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtg-tattaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||   ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  37727490 tccaaccatcaaaactagaagtactatgagttcaatcaaggtgtttaagagtttttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaat-gaagatgtt 37727588  T
Q  200 aat 202  Q
    |||    
T  37727589 aat 37727591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 46386553 - 46386719
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  46386553 ttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 46386652  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  46386653 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactatggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 46386719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 13745239 - 13745408
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  13745239 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcgatccaaaacttatggaataat 13745338  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||| |||||||||    
T  13745339 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttcagagtatttaacctatgttgtga 13745408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18607867 - 18607702
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18607867 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttaaggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 18607768  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18607767 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 18607702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33001503 - 33001334
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||||    
T  33001503 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttcttagttaatccaaaacttatggaataat 33001404  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||| |||||||||    
T  33001403 tccaaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagaatttaacctatgttgtga 33001334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 13745672 - 13745832
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  13745672 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcatagccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaataattccaaacct 13745771  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  13745772 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13745832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29004411 - 29004235
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29004411 tttttgagatatgatgaaaatactcaagggaggtcctagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccgtttccaagttaatcgaaaacttatgggataat 29004312  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    ||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  29004311 tccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 29004235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 38828650 - 38828474
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  38828650 tttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaat 38828551  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  38828550 tccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccacgttgtgagttgatc 38828474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 12465726 - 12465877
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12465726 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 12465825  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||| |||||    
T  12465826 aaacctcaaaactagaagtactatgacttcaattaggatgtttaagagtatt 12465877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 13147938 - 13148104
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  13147938 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 13148037  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  13148038 aaacctcaaaactacaagtattatgagatcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13148104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44374532 - 44374366
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44374532 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 44374433  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  44374432 agacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44374366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44383397 - 44383231
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44383397 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 44383298  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  44383297 agacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 44383231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13894652 - 13894515
Alignment:
Q  33 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13894652 gtcttagtgaaatcttattaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgattccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 13894553  T
Q  133 caattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  13894552 caattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13894515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14422365 - 14422204
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14422365 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 14422266  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgag 170  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  14422265 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgag 14422204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 48812427 - 48812254
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||    
T  48812427 tttttgagatatgatgaaaatactgcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataat 48812328  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  48812327 tccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 48812254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 115
Target Start/End: Original strand, 29052620 - 29052732
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29052620 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 29052719  T
Q  103 caaagctcaaaac 115  Q
    |||| ||||||||    
T  29052720 caaacctcaaaac 29052732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 6 - 149
Target Start/End: Original strand, 8851627 - 8851770
Alignment:
Q  6 gagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  8851627 gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaa 8851726  T
Q  106 agctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    | |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||    
T  8851727 acctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaag 8851770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 12323396 - 12323527
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12323396 ttgagatatgatgaaaatacttgaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 12323495  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 135  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12323496 aaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 12323527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19282681 - 19282514
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  19282681 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataat 19282582  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgt 167  Q
    | |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  19282581 ttcaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgt 19282514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 32434055 - 32434206
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||  | |||||| |    
T  32434055 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaatgaataatttc 32434154  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  32434155 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 32434206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15167564 - 15167410
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  15167564 tttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 15167465  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15167464 ttcaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 15167410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11067054 - 11066903
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  11067054 ttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattgc 11066955  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||  ||||||||| |||||    
T  11066954 aaacctcaaaactagaagtactatgatttcaactagggtgtttaagagtatt 11066903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 15119761 - 15119912
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15119761 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaatattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15119860  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  15119861 aaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 15119912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12371857 - 12371695
Alignment:
Q  8 gatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaag 107  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  12371857 gatatggtaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaac 12371758  T
Q  108 ctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  12371757 ctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12371695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 147998 - 147833
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  147998 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 147899  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  147898 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgaattga 147833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16008958 - 16008793
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  16008958 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 16008859  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16008858 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 16008793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18872740 - 18872575
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  18872740 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 18872641  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18872640 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 18872575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 12127630 - 12127781
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  12127630 ttgagatatgatgaaaatacttcagggaggtattagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaagttaaggaataattcc 12127729  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  12127730 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatt 12127781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32301768 - 32301617
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  32301768 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaattttatgaaaatacagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatggaataatttc 32301669  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  32301668 aaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 32301617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14258938 - 14258787
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14258938 ttgagatatgatgaaaggactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattcc 14258839  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  14258838 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 14258787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 46 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14273892 - 14273761
Alignment:
Q  46 cttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtt 145  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  14273892 cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtt 14273793  T
Q  146 taagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14273792 taagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 14273761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 148
Target Start/End: Original strand, 16460407 - 16460542
Alignment:
Q  13 gatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  16460407 gatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaa 16460506  T
Q  113 aactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  16460507 aactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 16460542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16999021 - 16998839
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  16999021 tttttgagagatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctatgttaatccaaaacttatagaataat 16998922  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagt------actatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| ||||      || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16998921 tccaaccctcaaaactagaagtaccatcaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 16998839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 10896466 - 10896611
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  10896466 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 10896565  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | |||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  10896566 cgaaactagaagtattatgagttcaattaagctgtttaagagtatt 10896611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 154
Target Start/End: Original strand, 13918266 - 13918383
Alignment:
Q  37 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13918266 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 13918365  T
Q  137 taatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  13918366 taaggtgtttaagagtat 13918383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14566582 - 14566417
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  14566582 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggct 14566483  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14566482 caaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 14566417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 25926993 - 25927109
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25926993 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 25927092  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    || ||||||||| ||||    
T  25927093 aaggtgtttaagagtat 25927109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 15352270 - 15352430
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  15352270 tatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 15352369  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  15352370 caagactagaagtactaggagtttaattaatgtgtttaaaagtatctaacctatgttgtga 15352430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 16580238 - 16580102
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctca 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  16580238 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctca 16580139  T
Q  112 aaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  16580138 aaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 16580102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 148
Target Start/End: Original strand, 16585425 - 16585561
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctca 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  16585425 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacctca 16585524  T
Q  112 aaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  16585525 aaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 16585561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20585938 - 20585791
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  20585938 ttgaggtatgatgaaaatactccaaggaggt----gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 20585843  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  20585842 aaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 20585791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 14928804 - 14928964
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  14928804 tatgatgaaaataatacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 14928903  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||    
T  14928904 caagactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaaaagtatctaacctatgttgtga 14928964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 197 - 374
Target Start/End: Original strand, 36705328 - 36705507
Alignment:
Q  197 gttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtga--aaaatgtatgatatag 294  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||||||| ||  |||||   ||||||||||||||      
T  36705328 gttattaagttacagacttacagagaacctgaatcaaatgattaatgattgttgaattgtttgagatatttgtacaatgtgttgaaaatgtatgatatga 36705427  T
Q  295 aaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  36705428 aaattattattgtttatatcattcaagttgttattgttcatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtctctgct 36705507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20619872 - 20619721
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20619872 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaataaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccataacttatggaataattcc 20619773  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| ||||||| || ||||| || || || |||||| | ||||||| |||||    
T  20619772 aaaactcaaaattagaagtattaggattttaattaaggggtttaagagtatt 20619721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11053974 - 11053845
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||     
T  11053974 ttgttggttaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctata 11053875  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  11053874 ttgcaagttctttatgttgttgtctatgct 11053845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14153435 - 14153528
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  14153435 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgg 14153528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 3289530 - 3289657
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||    
T  3289530 ttgttggttaattcaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattgacgttgctatg 3289629  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3289630 ttgcaagttgtttatgttgttgtctctg 3289657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Original strand, 21735208 - 21735328
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatat--tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgcta 342  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21735208 ttgttggttaacttaagctatttatataatatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgcta 21735307  T
Q  343 tgttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    |||||||| ||| ||||||||    
T  21735308 tgttgcaagttgtttatgttg 21735328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 297
Target Start/End: Original strand, 10659588 - 10659725
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||| || | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  10659588 atgttgtaagttgatcttgggatagaaatggaagttggtactgagttatagatttacagagagcctgaatcaaatgattaatgatttttggttag-ttga 10659686  T
Q  261 gatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  10659687 gatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaa 10659725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 15720338 - 15720250
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaact 89  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15720338 tttttgaggtatgataaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 15720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 18875312 - 18875478
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || |||||||||||| |||  |   |||    
T  18875312 ttgagatatgataaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaatccaaaacttgtggattgtctcc 18875411  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| |||||  | ||||| |||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  18875412 aaacctcaaaactagaagtaacaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 18875478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 39292200 - 39292368
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||||  |  |    
T  39292200 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaaatcaactcaaaacttatggattgtt 39292299  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  39292300 tccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39292368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 38 - 100
Target Start/End: Original strand, 1857092 - 1857154
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1857092 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1857154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 4691359 - 4691452
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  4691359 tttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 4691452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24270445 - 24270538
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || | |||||||||||    
T  24270445 tttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaaccgaaaacttatgg 24270538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 21538653 - 21538820
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |  |  ||    
T  21538653 ttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataatcatttctaagtcaacccaaaacttatagattgttt 21538752  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||  ||||||||    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  21538753 ccaaacttcaaaact-tgtgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21538820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3287579 - 3287486
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  3287579 tttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 3287486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9743544 - 9743637
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  9743544 tttttaagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 9743637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 287 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 11309585 - 11309504
Alignment:
Q  287 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||    
T  11309585 tgatatagaaaatattgttgtttatattattcaagttgttattattaatattgttatggggcaagttgcttatgttgttgtc 11309504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 48213408 - 48213501
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || | |||||||||||    
T  48213408 tttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaagtcaacctaaaacttatgg 48213501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15281674 - 15281477
Alignment:
Q  177 ttgggatatgaatagaagttgttaataa-gttatagacttacagagagcctgaatc-aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattat 274  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | || | ||||| ||| ||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |  ||  ||||||||    
T  15281674 ttgggataagaatggaagttgtttacaaaggtatagcctttcagagagtctgaatttaaatgattaatg-ttgttggttattttgaattacatatattat 15281576  T
Q  275 gtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctt-atgttgttgtctctgc 373  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
T  15281575 gtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttg-ttatatcatccaagttgttatta-taatgttgctatgttgcaagttgtttaatggtgttgtctctgc 15281478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 3192757 - 3192894
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||   |  ||    
T  3192757 ttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattgtgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgatttgttt 3192856  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    | |||  ||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  3192857 ctaaacttcaaaactagaagtattatgagtttaattaa 3192894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18080181 - 18080274
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  18080181 tttttgacttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatttaatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatgg 18080274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Original strand, 8514218 - 8514302
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  8514218 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 8514302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 126
Target Start/End: Original strand, 15978520 - 15978644
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||  || |||  |||||||||||  ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||| ||  ||    
T  15978520 ttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtctcggtaaaactttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggaatgttt 15978619  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtacta 126  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||    
T  15978620 ccaaacctcaaaactagaagtacta 15978644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 47 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28720003 - 28719911
Alignment:
Q  47 ttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  28720003 ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaatatttccaaacctcaaaactatgagtactaggagtttaattaa 28719911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 43277206 - 43277361
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttat-gaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataa 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||| || || ||  ||||||||||||  |      
T  43277206 tttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatcaaaaattccgcataactatttctaggtcaactcaaaacttatggattgt 43277305  T
Q  100 ttccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
     |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  43277306 ctccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 43277361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Original strand, 46580387 - 46580450
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcata 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  46580387 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagttcttactgaaattttatgaaaattcagcata 46580450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 366
Target Start/End: Original strand, 836857 - 836910
Alignment:
Q  313 tcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  836857 tcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttg 836910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 313 - 366
Target Start/End: Original strand, 1202037 - 1202090
Alignment:
Q  313 tcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1202037 tcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttg 1202090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 14161318 - 14161411
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  14161318 tttttgaggtttgataaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 14161411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20252805 - 20252898
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20252805 tttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatgg 20252898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25942026 - 25941858
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| |  |||| || || || ||||| |||||||  |       
T  25942026 tttttgagttatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcatgataatttctaggtcaacccaaatcttatggattgtc 25941927  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  25941926 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25941858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15139465 - 15139343
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||||| ||| ||||    
T  15139465 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaacattgtatgatatagaaa-tattgttgtttatatcaatcaagttgttagtgttaatgttgttatg 15139367  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||    
T  15139366 ttgcaagttgttattgttgttgtc 15139343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 232 - 371
Target Start/End: Original strand, 17130437 - 17130578
Alignment:
Q  232 aaatgattaatgattgttggttagtttaagata--tttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttatt 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||  |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||  ||||||||| |    
T  17130437 aaatgatcaatgattgttggttagtttgagataattatatattgtgttgaaaatgtatgatat-gaaattgttattgtttatatcatccaagttgttagt 17130535  T
Q  330 attaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttgtctct 371  Q
    |||||| | ||||||||| || |||  ||||||||||||||||    
T  17130536 attaatgtggctatgttgtaagttgttttatgttgttgtctct 17130578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Original strand, 19558034 - 19558156
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||    
T  19558034 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatatagttgttcatatcattcaagttgttgttattgatgttgttatg 19558132  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    |||||| ||| |  ||||||||||    
T  19558133 ttgcaagttgttattgttgttgtc 19558156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Original strand, 1489956 - 1490056
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  1489956 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatattgttatgatgcaagttgttattgttgttg 1490054  T
Q  367 tc 368  Q
    ||    
T  1490055 tc 1490056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 15096394 - 15096498
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  15096394 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatg 15096492  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
    ||||||    
T  15096493 ttgcaa 15096498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 15576294 - 15576387
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||| || ||||| ||||||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  15576294 tttttgagttatcataaaaatgctccaagaaggttttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 15576387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Original strand, 46580468 - 46580549
Alignment:
Q  96 ataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  46580468 ataatttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 46580549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3287238 - 3287163
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3287238 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 3287163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 43277555 - 43277630
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  43277555 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 43277630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 46386817 - 46386892
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  46386817 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 46386892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 73 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 20487960 - 20487885
Alignment:
Q  73 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||| | ||||||    
T  20487960 taagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactaggagtactaggtgtttaattaaggggtttaa 20487885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 1856865 - 1856915
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  1856865 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1856915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 13918038 - 13918088
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  13918038 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 13918088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 25926765 - 25926815
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  25926765 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 25926815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 11066790 - 11066715
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11066790 ttatgtggaaaatgtatgatatggaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 11066715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 11303772 - 11303724
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  11303772 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11303724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 12127894 - 12127957
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12127894 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaat 12127957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 16108326 - 16108374
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  16108326 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16108374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 23664590 - 23664638
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23664590 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23664638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 37785095 - 37785170
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  37785095 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 37785170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 350
Target Start/End: Original strand, 10660028 - 10660074
Alignment:
Q  304 ttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10660028 ttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaa 10660074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 20585678 - 20585605
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgt 345  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  20585678 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 20585605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33001303 - 33001175
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||| || ||||||  ||||| || |||||||  ||||||||    
T  33001303 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaaaa-tgtatgatatagaaaattatgttg-ttgtatcatccaagttattgttattaacgttgctatg 33001206  T
Q  345 ttgcaaattg-cttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  33001205 ttgcaagttgttttatgttgctgtctctgct 33001175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Original strand, 13133288 - 13133388
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  13133288 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgttg 13133386  T
Q  367 tc 368  Q
    ||    
T  13133387 tc 13133388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 18875655 - 18875759
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| |||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  18875655 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttatacaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 18875753  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  18875754 tctgct 18875759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Original strand, 8564063 - 8564139
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || |||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  8564063 tatgatgaaaatactccaagtgggtcttggtaaaactttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaacccaaa 8564139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 12371592 - 12371525
Alignment:
Q  279 aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  12371592 aaaaagtatgatatagaaaataaagtt-tttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 12371525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 12465990 - 12466053
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  12465990 ttatgtggaaaatgtatgatatagtaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 12466053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29797135 - 29797087
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  29797135 tgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29797087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29800954 - 29800906
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| | |||||||    
T  29800954 tgagatatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaatttttatgaa 29800906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 32434320 - 32434383
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  32434320 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttgttattaat 32434383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44374268 - 44374205
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44374268 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 44374205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44383133 - 44383070
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  44383133 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 44383070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 46473638 - 46473562
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||  |||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||    
T  46473638 tatgatgaaaatactccaagcgggtcttagtaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaa 46473562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 14948765 - 14948808
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14948765 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14948808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24702748 - 24702705
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24702748 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24702705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 24705195 - 24705152
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24705195 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24705152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 32126010 - 32125967
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  32126010 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 32125967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 41523437 - 41523394
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  41523437 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41523394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 41525899 - 41525856
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  41525899 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41525856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Complemental strand, 13897835 - 13897805
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaagga 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13897835 tttttgagatatgatgaaaatactccaagga 13897805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 367
Target Start/End: Original strand, 14219722 - 14219843
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||| || ||  | ||| ||||    
T  14219722 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aagtattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttggtgttgttatg 14219820  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
    |||||| ||| |  |||||||||    
T  14219821 ttgcaagttgttattgttgttgt 14219843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Original strand, 21675491 - 21675540
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  21675491 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21675540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 347
Target Start/End: Original strand, 13148210 - 13148277
Alignment:
Q  279 aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    |||| |||||||||||||||||   || |||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13148210 aaaaggtatgatatagaaaataatatt-tttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 13148277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 101)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 611329 - 610955
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  611329 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 611230  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  611229 tccaaagctcaaaactaaaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 611130  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  611129 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtctaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 611030  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  611029 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 610955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18658795 - 18658426
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18658795 tttttgaaatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataat 18658696  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18658695 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 18658596  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18658595 aataagttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggctagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaat 18658496  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtct 369  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658495 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtct 18658426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 29847966 - 29848342
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa--ttcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggata 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29847966 tttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttaatgaaatcttatgaaaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggata 29848065  T
Q  99 attccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttg 197  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29848066 attccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatagaagttg 29848165  T
Q  198 ttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  29848166 ttaataagttatagacttacaaagagcctgaatcaaattattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtgtgatatagaaa 29848265  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  29848266 atattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 29848342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 2 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 13764941 - 13764565
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13764941 ttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaaatattatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatt 13764842  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||||||| | ||| || || |||  |||||||||    
T  13764841 ccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgttttagagtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggta-gaaatgaagttgtt 13764743  T
Q  200 aataa-gttatagacttacagagagcctgaa--tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaa 296  Q
     ||||  |||  |   | || |||| |||||  | | |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||    
T  13764742 tataatattaatgttgttcaaagagtctgaaattaagatgactaatgattgttagttagtttaagttatttatattatgagggaaatgtgtgatatagaa 13764643  T
Q  297 aatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  13764642 aatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgctagttgcttatgttgttgtccctgct 13764565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 19825952 - 19826141
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19825952 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatcggataat 19826051  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaat 189  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19826052 tccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaaattatgttgtgagttgatcttgggataggaat 19826141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 8759979 - 8760127
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8759979 tttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataat 8760078  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8760079 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaag 8760127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 27851592 - 27851421
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  27851592 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 27851493  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  27851492 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 27851421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 15173920 - 15174091
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15173920 tttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 15174019  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  15174020 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaattgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttg 15174091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 8767726 - 8767874
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8767726 tttttgagatattatgaaagtactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataat 8767825  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8767826 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaag 8767874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 20556556 - 20556732
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20556556 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttataagttaatccaaaacttatgggataat 20556655  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20556656 tccaaccctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgttaaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 20556732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 28947933 - 28947764
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  28947933 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 28947834  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    | |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  28947833 ttcaaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 28947764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 19443743 - 19443919
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  19443743 tttttgagatatgaagaaaatactccacgtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatcgaaaacttatgggataat 19443842  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19443843 tccagaactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 19443919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 20733910 - 20734080
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20733910 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatct-atgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 20734008  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  20734009 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 20734080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25619420 - 25619596
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25619420 tttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 25619519  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25619520 tccaaccctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 25619596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 34296732 - 34296903
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34296732 tttttgggatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 34296831  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtgagt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  34296832 tccaaagctcaaaactagaaggactatgagtttaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagt 34296903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 19655695 - 19655861
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  19655695 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 19655794  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  19655795 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19655861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Original strand, 15817221 - 15817402
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15817221 tttttgagatatgatgataatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataat 15817320  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttggg 181  Q
    |||||  |||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15817321 tccaaccctcaaaactagaagtattatgaggtcaattaagttgtttaagattatttaacccatgttgtgagttgatcttggg 15817402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 186 - 350
Target Start/End: Original strand, 19829601 - 19829767
Alignment:
Q  186 gaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaat 283  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||    
T  19829601 gaatggaagttgttattaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaat 19829700  T
Q  284 gtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  19829701 gtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgatattattgatgttgctatgttgcaa 19829767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 14979085 - 14979261
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| | |||||    
T  14979085 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttggtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaatttaatccaaaacttatagaataat 14979184  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  14979185 ttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 14979261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 16133133 - 16133309
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||    
T  16133133 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaattcataggaaaattcagcataaccatttccaagttaatcggaaacttatgggataat 16133232  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    ||||   || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16133233 tccaggactaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 16133309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1254346 - 1254215
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1254346 tttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 1254247  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1254246 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagtt 1254215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7827558 - 7827392
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7827558 ttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 7827459  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  7827458 aaacctcaaaattagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7827392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 17318588 - 17318754
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  17318588 ttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaggtaatccaaaacttaaggaataatttc 17318687  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17318688 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17318754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25347715 - 25347561
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25347715 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataat 25347616  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||| |||||| |||| | |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  25347615 tccaaacctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatt 25347561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 13751062 - 13751191
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13751062 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgctatg 13751161  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13751162 ttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 13751191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18703150 - 18702984
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18703150 ttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 18703051  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  18703050 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 18702984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18709085 - 18708919
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18709085 ttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcatagtgaaatctaatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 18708986  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  18708985 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18708919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20183152 - 20182999
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20183152 tttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgat 20183053  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  20183052 tccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatt 20182999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 22152839 - 22152992
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22152839 tttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgat 22152938  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||| || ||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  22152939 tccaaacctc-aagctagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatt 22152992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 15891177 - 15891322
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  15891177 ttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 15891276  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  15891277 aaacctaaaaactagaagtactatgatttcaattagggtgtttaag 15891322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31734292 - 31734128
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  31734292 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 31734193  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  31734192 aaacctcaaaactagaagtac--tgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 31734128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18928312 - 18928158
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  18928312 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgat 18928213  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  18928212 tcaaaaactcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 18928158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 23150733 - 23150898
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  23150733 ttgagatatgatgaaaatattccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 23150832  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| ||||||| || ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  23150833 aaacctcaaaattagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 23150898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23956442 - 23956278
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  23956442 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 23956343  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  23956342 caaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttg 23956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 19773175 - 19773326
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19773175 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcataactgtttttaagttaatccaaaacttatggaataattcc 19773274  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  19773275 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 19773326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 25807712 - 25807605
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25807712 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 25807613  T
Q  110 caaaacta 117  Q
    ||||||||    
T  25807612 caaaacta 25807605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 5 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 4477243 - 4477073
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    |||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||    
T  4477243 tgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattcca 4477144  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  4477143 aggctcaaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 4477073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Original strand, 19443990 - 19444108
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19443990 ttgttggttaattcaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatg 19444089  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  19444090 ttgcaagttgcttatgttg 19444108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 25601740 - 25601894
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  25601740 tttttgcgttatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 25601839  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  25601840 tccaaacctcaaaactagaagtaataagagtttaattaaggggtttaagagtatt 25601894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 27125943 - 27126109
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  27125943 ttgagatacgatgaaaatactttaaaaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaagaataattcc 27126042  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  27126043 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 27126109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 24267109 - 24266982
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  24267109 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtgaaaaatgtatgatataaaaaatgtccttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatg 24267010  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24267009 ttgcaagttgcttatgttgctgtctctg 24266982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 27318021 - 27318172
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||   || |||||||     
T  27318021 ttgagatatgatgaaaatactccaaagaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaactagaggaataattca 27318120  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  27318121 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatatggtgtttaagagtatt 27318172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 877 - 755
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||| |||| |||||| |||||    
T  877 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataattgtttctaagttaatctaaaatttatggaataat 778  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagta 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||    
T  777 tccaaagctcaaaactagaagta 755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Original strand, 16133380 - 16133498
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16133380 ttgttggttaattcaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatg 16133479  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  16133480 ttgcaatttgcttatgttg 16133498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20177334 - 20177181
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| || || |||||    
T  20177334 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-caatccaaaacatagggaataat 20177236  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  20177235 tctaaacctcaaaactataagtactaggagttcaattaaggtgtctaagagtatt 20177181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 22158657 - 22158794
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| || || |||||    
T  22158657 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-aaatccaaaacatagggaataat 22158755  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22158756 tctaaacctcaaaactaaaagtactaggagttcaattaa 22158794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 39 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 23415262 - 23415152
Alignment:
Q  39 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatta 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  23415262 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatta 23415163  T
Q  139 atgtgtttaag 149  Q
    | |||||||||    
T  23415162 aggtgtttaag 23415152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 23491634 - 23491787
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |  |||||    
T  23491634 tttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataat 23491733  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  23491734 tccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 23491787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 23497232 - 23497385
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||| |  |||||    
T  23497232 tttttgagatatgatgacaatattccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgttactaagttaatccaaaacttaggtaataat 23497331  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    |||||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  23497332 tccaaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 23497385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27557022 - 27556905
Alignment:
Q  37 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| || |||| |||||||||||||    
T  27557022 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaattagaagttctatgagttcaat 27556923  T
Q  137 taatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  27556922 taaggtgtttaagagtat 27556905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23655928 - 23655804
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||||    
T  23655928 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataat 23655829  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtact 125  Q
    |||||| |||||||||| |||||||    
T  23655828 tccaaacctcaaaactagaagtact 23655804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23838579 - 23838443
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23838579 tatgatgaaaatactccaagtatgtcttagggaaatcttaagaaaattcagcacaaccattaccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 23838480  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttt 146  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  23838479 caaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgttt 23838443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 15705077 - 15705228
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  15705077 ttgagatatgatgaaaatacctcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaatttatggaataattcc 15705176  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  15705177 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 15705228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 5834198 - 5834335
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| || || |||||    
T  5834198 tttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatattatgaaaattcagcataaccgtttctaag-taatccaaaacatagggaataat 5834296  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5834297 tctaaatctcaaaactagaagtactaggagttcaattaa 5834335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 374
Target Start/End: Original strand, 31735619 - 31735761
Alignment:
Q  232 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  31735619 aaatgattaatg-ttgttggttaatttgaaatacatatattatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaaattgttattat 31735717  T
Q  332 taatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||| |||||||||| ||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  31735718 taatgttgctatgttacaagttgttttatgttgctgtctctgct 31735761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25921318 - 25921226
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  25921318 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 25921226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24441242 - 24441140
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctc 370  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||| |||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24441242 ttatgtggaaaaggtatgatattgaagataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctc 24441144  T
Q  371 tgct 374  Q
    ||||    
T  24441143 tgct 24441140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18585207 - 18585114
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||    
T  18585207 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatgg 18585114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 32259435 - 32259342
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  32259435 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 32259342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 22212216 - 22212346
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||    
T  22212216 ttgttggttaatttgagatacatatattatgtgaaaattgtatgatatagaaaataattttgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgttgtg 22212315  T
Q  345 ttgcaaattg-cttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||  |||||||| || |||||||    
T  22212316 ttgcaagttgttttatgttgctgcctctgct 22212346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18455535 - 18455628
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  18455535 tttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 18455628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 20411135 - 20411228
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  20411135 tttttgaggtatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 20411228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 29044899 - 29044806
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  29044899 tttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 29044806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22556836 - 22556684
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || || || |||||||||||||  |   ||    
T  22556836 tttgagttatgatgaacatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattttgcataaccatttctaggtcaacccaaaacttatggactgtctc 22556737  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||  ||||||||| |||||||| |||||  ||||| | ||||||| |||||    
T  22556736 caaacatcaaaactagaagtactaggagtttcattaaggggtttaagagtatt 22556684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 106
Target Start/End: Original strand, 31022169 - 31022265
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaa 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||  | |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  31022169 tatgatgaaaatacttcaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcactaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaa 31022265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 34141088 - 34141180
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  34141088 tttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34141180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 34153704 - 34153796
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||    
T  34153704 tttttgagatatgataaaaatactccaagaagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatg 34153796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 18398507 - 18398416
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttat 92  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||    
T  18398507 tttttgagttatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat 18398416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Original strand, 24550904 - 24551117
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagtt-gttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    |||||| |||||||||||||| ||   || |||||| |||| ||||||| || | |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||    
T  24550904 atgttgagagttgatcttggggtagagatggaagttagttattaagttacaggcatacagagaacctaaatcaaatgattaatgactgttgaattgttta 24551003  T
Q  260 agatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctt 357  Q
    | |||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||    | ||||||||| || ||||||||||||||  |  ||    
T  24551004 aaatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcatt---ctagttattattgatgttgctatgttgcaagatattt 24551100  T
Q  358 atgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||||||||||    
T  24551101 atgttgatgtctctgct 24551117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 13285297 - 13285144
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||  || |||||||||||||  |       
T  13285297 tttttgatttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagccaacccaaaacttatggattgtc 13285198  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||||||    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  13285197 tccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttcatttaaggtgtttaagagtatt 13285144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22806334 - 22806276
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcat 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22806334 tgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcat 22806276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 27330438 - 27330488
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27330438 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27330488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 54
Target Start/End: Original strand, 27391178 - 27391228
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaa 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27391178 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaa 27391228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 15938690 - 15938782
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  15938690 ttttgagttatgatgaaaatactctaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatgg 15938782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Original strand, 17857164 - 17857248
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  17857164 tatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 17857248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Original strand, 5110524 - 5110598
Alignment:
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5110524 atattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 5110598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 17318852 - 17318956
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  17318852 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 17318950  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  17318951 tctgct 17318956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 31734030 - 31733926
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || |||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  31734030 ttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccatttaagttgttattattaatgatgttatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 31733932  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  31733931 tctgct 31733926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Original strand, 5289883 - 5289957
Alignment:
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  5289883 atattgttgtttatatcattcgagttgttattattaccgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 5289957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23415491 - 23415441
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23415491 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23415441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 27557249 - 27557199
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  27557249 tttgagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaatttttatgaa 27557199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 15891433 - 15891537
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||   ||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  15891433 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataattttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 15891531  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  15891532 tctgct 15891537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23500970 - 23500890
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgtt 326  Q
    ||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  23500970 ttgttggataatttgagatacttatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 23500890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12942714 - 12942666
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12942714 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12942666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 23150996 - 23151071
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  23150996 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttgtaccattcaagttgttattattaattatgctatgttg 23151071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 27126207 - 27126282
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27126207 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 27126282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 28288974 - 28289022
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  28288974 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28289022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 15892051 - 15892094
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  15892051 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaa 15892094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Original strand, 19655914 - 19655996
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| |||| |||||    
T  19655914 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatattgttatgatgcaa 19655996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25753026 - 25752963
Alignment:
Q  114 actaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  25753026 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatc 25752963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 25755196 - 25755133
Alignment:
Q  114 actaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  25755196 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttagaccatgttgtgagttgatc 25755133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 22523433 - 22523525
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||| |||| ||||||||||  ||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||| || ||||||    
T  22523433 ttttgagttatggtgaaaatactaaaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccataagttatgg 22523525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 1540554 - 1540597
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  1540554 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 1540597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 7430112 - 7430069
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaa 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  7430112 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 7430069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12742837 - 12742794
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12742837 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12742794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14594088 - 14594131
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaa 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  14594088 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14594131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 17883140 - 17883183
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  17883140 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 17883183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33862313 - 33862270
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  33862313 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33862270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 7827294 - 7827234
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatt 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||   ||| ||||| |||| ||||||||||||||    
T  7827294 ttatgtgaaaaaggtatgatatagaaaataattttg-ttataccattcaagttgttattatt 7827234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25921199 - 25921150
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  25921199 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25921150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 18708821 - 18708747
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  18708821 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagtt-ttattattaatgatgctatgttg 18708747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 168)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 3394465 - 3394839
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394465 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 3394564  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  3394565 ttcaaagctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 3394664  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3394665 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatattcatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaat 3394764  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  3394765 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 3394839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 13522873 - 13523248
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaa-cttatgggataa 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  13522873 tttttgagatatgatgagaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaaacttatgcgataa 13522972  T
Q  100 ttccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgt 198  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  13522973 ttccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgt 13523072  T
Q  199 taataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaa 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  13523073 taataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaa 13523172  T
Q  299 tatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  13523173 tatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctgct 13523248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 179170 - 179544
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  179170 tttttgagatatgatgaaaataccccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 179269  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  179270 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttgaattaaggtgtttaacagtatttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaggttgtt 179369  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  179370 aagaagttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgcaaaatgtttgatatagaaaat 179469  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  179470 atcgttgttattatcattcaagttgttactattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 179544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 18367221 - 18367595
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18367221 tttttgagatatgatgaaaatatttcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataacccgttctaagttaatccaaaacttatggaataat 18367320  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||    
T  18367321 tccaaccctcaaagctagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggatagcaatgggagttgtt 18367420  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18367421 aataaattatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtatgatattgaaaat 18367520  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18367521 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgttatgttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 18367595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 14642013 - 14642379
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14642013 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 14642112  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  14642113 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatgaaagttgtt 14642212  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  14642213 attaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaa 14642312  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgt 364  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||    
T  14642313 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgt 14642379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 6819698 - 6819367
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6819698 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaaggataaccgtttctaagttaatccaaaacttgtgggataat 6819599  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||| |||| | |||| ||    
T  6819598 tccaaagctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgggttgatcttgggataggaatgggagttctt 6819499  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6819498 cataagttatatacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaat 6819399  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  6819398 atcgttgttattatcattcaagttgttattat 6819367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6158986 - 6158612
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158986 tttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 6158887  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6158886 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 6158787  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  6158786 attaagttatagactaaccgagagtctgaatcaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaa 6158687  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||    
T  6158686 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctg 6158612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 12276138 - 12275880
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12276138 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaagccaaaacttatgggataat 12276039  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12276038 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 12275939  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttt 258  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12275938 aataagttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttt 12275880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 37038408 - 37038033
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaa-tactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataa 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37038408 tttttgagatatgataaaaaatactccagagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataa 37038309  T
Q  100 ttccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgt 198  Q
    ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||    
T  37038308 ttcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttttgagttgatctttggataagaatggaagttgt 37038209  T
Q  199 taataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaa 296  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||    
T  37038208 tattaagttatagagttaaagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaa 37038109  T
Q  297 aatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    | |||  |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||    
T  37038108 attattattgtttatatcattcaaattgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtttctg 37038033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 10563295 - 10562950
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10563295 ttgagatatgatgaacatactcaaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataatttc 10563196  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat 202  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||| |    
T  10563195 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggata-ggatggaagttattatt 10563097  T
Q  203 aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaata 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||| ||    
T  10563096 aatttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatataaaaatta 10562997  T
Q  301 tcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    |  ||||||||||| || ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  10562996 ttattgtttatatcgttcaagttgttatttttaatgatgctatgttg 10562950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 42324684 - 42325060
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||  | |||||    
T  42324684 tttttgagatataatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttagaaaaattcagtataaccatttctaagttagtcaaaaacttagagaataat 42324783  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  42324784 ttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggatataaatggaagttgtt 42324883  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    |||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  42324884 aataaggtatagacttagatagagtctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatctatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaa 42324983  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||    
T  42324984 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattcatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctgct 42325060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 10833802 - 10833976
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10833802 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 10833901  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  10833902 tccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 10833976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 8928128 - 8928304
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8928128 tttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagataatccaaaacttatgggataat 8928227  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  8928228 tccaaggctaaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 8928304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 10989266 - 10989440
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989266 tttttaagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 10989365  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  10989366 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 10989440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 1988695 - 1988896
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988695 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgcaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 1988794  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  1988795 tccaaccctcaaaactataactactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaaccaatgttgtgagttgatcttgggataggaat-gaagatgtt 1988893  T
Q  200 aat 202  Q
    |||    
T  1988894 aat 1988896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 50243322 - 50243132
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50243322 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataat 50243223  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaat 189  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  50243222 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaat 50243132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 13029747 - 13029912
Alignment:
Q  9 atatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13029747 atatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagc 13029846  T
Q  109 tcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  13029847 tcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 13029912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 2248433 - 2248609
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2248433 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 2248532  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2248533 tccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 2248609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 24152907 - 24153083
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24152907 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataat 24153006  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  24153007 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtctaagagtacttaacccatgttgtgagttgatc 24153083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11192670 - 11192501
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11192670 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggccttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 11192571  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11192570 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11192501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 173
Target Start/End: Original strand, 13026155 - 13026320
Alignment:
Q  9 atatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13026155 atatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaaattatgggataattccaaagc 13026254  T
Q  109 tcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  13026255 tcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 13026320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 43550140 - 43550316
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43550140 tttttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataat 43550239  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43550240 accaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 43550316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16979497 - 16979326
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16979497 tttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttataaaaattcagcatgaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 16979398  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  16979397 caaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 16979326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 11913310 - 11913157
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11913310 tttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataat 11913211  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  11913210 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtat 11913157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 16643594 - 16643418
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  16643594 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 16643495  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  16643494 tccaacactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatc 16643418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14441754 - 14441588
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  14441754 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttc 14441655  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  14441654 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14441588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 14966591 - 14966415
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  14966591 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 14966492  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    || ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  14966491 tctaaacctaaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 14966415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 5206120 - 5206286
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5206120 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 5206219  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  5206220 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattatggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 5206286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 10554847 - 10554685
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  10554847 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataattcaaaggct 10554748  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  10554747 caaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 10554685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17693654 - 17693488
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  17693654 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 17693555  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17693554 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17693488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 40807582 - 40807416
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  40807582 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 40807483  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  40807482 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 40807416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43928940 - 43928786
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||    
T  43928940 tttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttgatccaaaacttatggaataat 43928841  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  43928840 tccaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgcttaagagtatt 43928786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 44274060 - 44273894
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  44274060 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 44273961  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  44273960 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtttttaagagtatttaacctatgttgtga 44273894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 54875949 - 54876115
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54875949 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 54876048  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  54876049 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 54876115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 6805426 - 6805597
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  6805426 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcctagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattc 6805525  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  6805526 caaacctcaaaattagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 6805597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 17670175 - 17670326
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17670175 ttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 17670274  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  17670275 aaacctcaaaactagaaatactatgagttcaattagggtgtttaagagtatt 17670326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 17685309 - 17685460
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17685309 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 17685408  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| || |||||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  17685409 aaacctcaaaactagaaatactatgaattcaattagggtgtttaagagtatt 17685460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 40812419 - 40812268
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40812419 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 40812320  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  40812319 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 40812268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17538693 - 17538527
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||     
T  17538693 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccttttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcg 17538594  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17538593 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17538527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 50351463 - 50351617
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||    
T  50351463 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtcgatccaaaacttatggaataat 50351562  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  50351563 tccaaacctcaaaacttgaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatt 50351617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14508432 - 14508268
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14508432 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttt-taagttaatccaaaacttaaggaataattcca 14508334  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  14508333 aacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 246 - 374
Target Start/End: Original strand, 13520490 - 13520618
Alignment:
Q  246 tgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgt 345  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  13520490 tgttggtttgtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattaatattgctatgt 13520589  T
Q  346 tgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13520590 tgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 13520618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 31224416 - 31224588
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31224416 tttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaatttcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 31224515  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtg-tttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  31224516 ttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgttttaagagtatttaacccatgctgtgagt 31224588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 15931973 - 15932124
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  15931973 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattcc 15932072  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  15932073 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 15932124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 55292104 - 55292275
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  55292104 tttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaacccaaaacttatgggataat 55292203  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||    
T  55292204 tccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacccatgttatgagt 55292275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17513169 - 17513015
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  17513169 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattgaataat 17513070  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  17513069 tccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatt 17513015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 18893213 - 18893067
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18893213 tttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcagaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 18893114  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttta 147  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  18893113 tccaaggctcaaaactacaagtaatatgagtttaattaaggtgttta 18893067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 53646523 - 53646677
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53646523 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 53646622  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  53646623 tccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 53646677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 3 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18889951 - 18889783
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18889951 tttgagttatgatggaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattccgcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatagttc 18889852  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgag 170  Q
    ||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18889851 caaggctcaaatctagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgag 18889783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19444100 - 19443955
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19444100 tttttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttattaaaattttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataat 19444001  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttt 146  Q
    |||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||| ||||||    
T  19444000 tccaaagctccaaactagaagtgccatgagttcaattaaggtgttt 19443955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 42107 - 41943
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  42107 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 42008  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  42007 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttg 41943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 35961359 - 35961523
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  35961359 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaaattagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 35961458  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  35961459 caaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 35961523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12470388 - 12470237
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  12470388 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataatttc 12470289  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  12470288 aaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatt 12470237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13519872 - 13519741
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13519872 tttttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 13519773  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  13519772 ttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 13519741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 17519339 - 17519490
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  17519339 ttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttc 17519438  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  17519439 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatt 17519490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 17534201 - 17534352
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||| || |||||| |    
T  17534201 ttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgttactaagataatccaaaacttaaggaataatttc 17534300  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  17534301 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaagagtatt 17534352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 50348492 - 50348643
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50348492 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaactcatgggataattcc 50348591  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||| | ||||||| |||||    
T  50348592 aaacctcaaaactataagtactaggggtttaattaaggggtttaagagtatt 50348643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17044555 - 17044401
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17044555 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 17044456  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||||||| || || ||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  17044455 tccaaacctcaaaattagaaatactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 17044401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33564718 - 33564564
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  33564718 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctatgttaatccaaaacttatggaataat 33564619  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  33564618 tccaatcctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 33564564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 35065047 - 35065212
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  35065047 ttgagatatgatgaaaatactcccatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatt-c 35065145  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  35065146 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 35065212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35354185 - 35354019
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  35354185 ttgagatatgatgaaaatactccaacgagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttc 35354086  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| |||||||  ||||| |||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  35354085 aaacctcaaaactagaagtactgggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 35354019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9533709 - 9533544
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9533709 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 9533610  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9533609 caaaattagaagtattatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 9533544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 14763433 - 14763598
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  14763433 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 14763532  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  14763533 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 14763598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 14818368 - 14818239
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  14818368 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctgta 14818269  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14818268 ttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 14818239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 43889265 - 43889400
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43889265 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatggaataattcc 43889364  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  43889365 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 43889400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 2841929 - 2842094
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||||| || |||||| |    
T  2841929 ttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc-gttccaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 2842027  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  2842028 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 2842094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 20248456 - 20248594
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||    
T  20248456 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaatatttccaaacct 20248555  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    | |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  20248556 cgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaa 20248594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 3803415 - 3803270
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| ||| |||| || ||||||||||| ||    
T  3803415 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatcaaaatcttagggaataattccaaacct 3803316  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  3803315 caaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatt 3803270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10550612 - 10550483
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10550612 ttgttggttaatttaagctatatattttatgtggaaaatgtatgatatagaaattatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatg 10550513  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  10550512 ttgcaagttgcttatgttgctgtctttgct 10550483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 23371179 - 23371344
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  23371179 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggct 23371278  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23371279 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 23371344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12511434 - 12511283
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12511434 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattcc 12511335  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  12511334 aaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 12511283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 22307049 - 22307200
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||     
T  22307049 ttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttactgaaatcctatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcccaaacttaaggaataattca 22307148  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  22307149 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 22307200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14671404 - 14671266
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14671404 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 14671305  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  14671304 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 14671266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 38311475 - 38311621
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc-aaagc 108  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| || |||||||| ||| |    
T  38311475 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttagggaataattccaaaacc 38311574  T
Q  109 tcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  38311575 tcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 38311621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 14567675 - 14567800
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  |||||    
T  14567675 tttttgatttatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgaaataat 14567774  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtacta 126  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||    
T  14567775 tccaaacctcaaaactagaagtacta 14567800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 51300975 - 51300810
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  51300975 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggct 51300876  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  51300875 caaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 51300810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 15465453 - 15465337
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15465453 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 15465354  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    || ||||||||| ||||    
T  15465353 aaggtgtttaagagtat 15465337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 18699939 - 18700067
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  18699939 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttttggaataattcc 18700038  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    ||| |||||||||| |||| ||| |||||    
T  18700039 aaacctcaaaactagaagtgctaggagtt 18700067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 26055128 - 26055244
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26055128 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 26055227  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    || ||||||||| ||||    
T  26055228 aaggtgtttaagagtat 26055244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 41172836 - 41172971
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||||| |    
T  41172836 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataatttc 41172935  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  41172936 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 41172971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 4 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 5223716 - 5223566
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||| | | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  5223716 ttgagttatgatcaaattactccacgtaggtcacagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgggataatacc 5223617  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  5223616 aaccctcaaaactagaagttctatgagttcaattaaggtgtttaagagtat 5223566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 148
Target Start/End: Original strand, 10541934 - 10542068
Alignment:
Q  14 atgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaa 113  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  10541934 atgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaa 10542033  T
Q  114 actaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  10542034 actagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 10542068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Original strand, 11886294 - 11886511
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||| ||||| |||||||     
T  11886294 atgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtttattaagttatagatttacagagaccctgatcaaaatgattaatgagtgttgtttagtttg 11886393  T
Q  260 agatatttat--attatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgc-t 356  Q
    ||||||||||  ||  |||  ||| |||||||||| |||| |||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||| |||| |    
T  11886394 agatatttatgtatcttgttgaaattgtatgatatggaaattattattgtttatatcatctaagttgttagtattaacgtggctatgttgcaagttgctt 11886493  T
Q  357 tatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  11886494 tatgttgctgtctctgct 11886511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Original strand, 17548259 - 17548377
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17548259 ttgttggttaattcaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaaaatcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatg 17548358  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  17548359 ttgcaagttgcttatgttg 17548377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 147
Target Start/End: Original strand, 16325013 - 16325150
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  16325013 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatcggataatttcaaggct 16325112  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttta 147  Q
     ||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||    
T  16325113 aaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgttta 16325150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 234 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20417432 - 20417293
Alignment:
Q  234 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatta 333  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20417432 atgattaatg-ttgttggttaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatataaaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattatta 20417334  T
Q  334 atattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  20417333 atattgatatgttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 20417293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 49900322 - 49900179
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc--------atttataagttaatccaaaacttatggg 95  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||||||||||||||||||||||     
T  49900322 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttctaagttaatccaaaacttatgga 49900223  T
Q  96 ataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  49900222 ataattccaaacctcaaaactagaagtactagaagtttaattaa 49900179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 52338673 - 52338802
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  52338673 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttatttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatg 52338772  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| |||  ||| ||||||||||    
T  52338773 ttgcaagttgattaaattgatgtctctgct 52338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 350
Target Start/End: Original strand, 12512441 - 12512633
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagtt-gttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    |||||| |||||||||||||| ||  |||  ||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||||    
T  12512441 atgttgagagttgatcttggggtagaaatgaaagttagttattaagttacagacttacagagaacctgaatcaaatgattgatgattgttgaattgttta 12512540  T
Q  260 agatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    |||||||| ||| |||||   |||||| ||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12512541 agatatttttataatgtgttgaaaatgaatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaa 12512633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 52213185 - 52213314
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| | | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||     
T  52213185 ttgttggttaatttaagttgtatatattatgtggaaaatgtattatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaaattgttattattgaagttgctatt 52213284  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52213285 ttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 52213314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14519851 - 14519683
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |       
T  14519851 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtc 14519752  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  14519751 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14519683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Original strand, 23395790 - 23395897
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||| ||| |||||||||||    
T  23395790 tatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatattgcaagttgtttatgttgttg 23395889  T
Q  367 tctctgct 374  Q
    ||||||||    
T  23395890 tctctgct 23395897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9511629 - 9511722
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  9511629 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 9511722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 9519604 - 9519697
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  9519604 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 9519697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 85
Target Start/End: Complemental strand, 17046712 - 17046631
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaa 85  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17046712 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaa 17046631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6156294 - 6156126
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  6156294 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 6156195  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  6156194 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 6156126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 14152862 - 14153031
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |       
T  14152862 tttttgagttatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaacttttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtc 14152961  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  14152962 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 14153031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 50755845 - 50756013
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||  |       
T  50755845 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggtggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatggattgtc 50755944  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  50755945 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50756013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 73 - 176
Target Start/End: Original strand, 52989493 - 52989597
Alignment:
Q  73 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||    
T  52989493 taagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagt 52989592  T
Q  172 tgatc 176  Q
    |||||    
T  52989593 tgatc 52989597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22652409 - 22652248
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctca 111  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   ||||||  |||    
T  22652409 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtatccaaacttca 22652310  T
Q  112 aaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    || ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  22652309 aagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 22652248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 5215233 - 5215156
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaat 81  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  5215233 ttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaat 5215156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 214 - 374
Target Start/End: Original strand, 14250795 - 14250954
Alignment:
Q  214 ttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatt--tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttat 311  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||  |||| | |||  |||||||||||||| |||| |||  ||||   |    
T  14250795 ttacagagaacctgaatcaaatgattaatgattgttgaattgtttaagatattcgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgt---t 14250891  T
Q  312 atcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||    
T  14250892 ataattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgctgtctctgct 14250954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 51603063 - 51603127
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataa 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51603063 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataa 51603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 13179485 - 13179399
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  13179485 ttgttggttaatttgagctacatatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 13179399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 17207929 - 17207839
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttat 92  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||    
T  17207929 ttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatgttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat 17207839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11258984 - 11258887
Alignment:
Q  73 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11258984 taagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11258887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15566102 - 15566009
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  15566102 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 15566009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18739484 - 18739391
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||    
T  18739484 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 18739391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 25104665 - 25104818
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||  |||| || |||||||||||||  |  |    
T  25104665 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttacgaaaattccgcataactatttccaagtcaacccaaaacttatggattgtt 25104764  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  |||||| |    ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25104765 tccaaacttcaaaa-tttgtgtactatcagttcaattaaggtgtttaagagtatt 25104818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 54330769 - 54330862
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  54330769 tttttgagttatgatgaaaacacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatgg 54330862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 307 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12275880 - 12275813
Alignment:
Q  307 tttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  12275880 tttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgtttcaagttgcttatgttgctgtttctgct 12275813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 12952630 - 12952539
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttat 92  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| ||||  |||| || |||||||||||    
T  12952630 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaatcccgcataactatttcaaagtcaacccaaaacttat 12952539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 73 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 14682840 - 14682765
Alignment:
Q  73 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  14682840 taagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 14682765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 19568874 - 19568941
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacca 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  19568874 tttttgagatatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaatcttagcaaaattcagtataacca 19568941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 5206384 - 5206488
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  5206384 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtc 5206482  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  5206483 tctgct 5206488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 17938115 - 17938022
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||    
T  17938115 tttttgatttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 17938022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 41173101 - 41173205
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  41173101 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 41173199  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  41173200 tctgct 41173205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 46723089 - 46723149
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  46723089 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactaaaatcttatgaaaattcagc 46723149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Original strand, 54876146 - 54876268
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| ||||    
T  54876146 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatattgttatg 54876244  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
     ||||| ||| |  ||||||||||    
T  54876245 atgcaagttgttattgttgttgtc 54876268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3803170 - 3803096
Alignment:
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3803170 atattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 3803096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Original strand, 11850404 - 11850478
Alignment:
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11850404 atattgttgtttatatcattctagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 11850478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 35065310 - 35065414
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  35065310 ttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 35065408  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  35065409 tctgct 35065414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 14153200 - 14153275
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14153200 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 14153275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24546429 - 24546332
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatga----aaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||    |||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||    
T  24546429 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaattaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactcatgg 24546332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44273796 - 44273721
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  44273796 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 44273721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17046551 - 17046429
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||    
T  17046551 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatattgttatg 17046453  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
     ||||| ||| |  ||||||||||    
T  17046452 atgcaagttgttattgttgttgtc 17046429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Original strand, 17691490 - 17691572
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||||||| |||| |||||    
T  17691490 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatattgttatgatgcaa 17691572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15465681 - 15465631
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  15465681 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15465631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 54520766 - 54520701
Alignment:
Q  304 ttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtct 369  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  54520766 ttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtct 54520701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 2842192 - 2842267
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  2842192 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagtttttattattaatgatgctatgttg 2842267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11258789 - 11258726
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  11258789 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 11258726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 12305647 - 12305599
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12305647 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12305599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 15932237 - 15932312
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  15932237 ttatgtggaaattgtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 15932312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 17693390 - 17693315
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||  |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  17693390 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-atataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 17693315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 169
Target Start/End: Original strand, 19568940 - 19569000
Alignment:
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  19568940 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19569000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 19884253 - 19884316
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  19884253 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgtt-tttataccattcaagttgttattattaat 19884316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 22307313 - 22307388
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  22307313 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 22307388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 35353921 - 35353846
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  35353921 ttatgtggaaaatgtatgttatagaaaataatgttgtt-ataccttttaagttgttattattaattatgctatgttg 35353846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40807318 - 40807243
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| ||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  40807318 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattaaagttattattattaatgatgctatgttg 40807243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 5223910 - 5223860
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  5223910 tttgcgatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 5223860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 26054900 - 26054950
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  26054900 tttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 26054950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 43
Target Start/End: Complemental strand, 54521347 - 54521309
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaa 43  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  54521347 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaa 54521309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 14441557 - 14441453
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| || ||||| ||||||||  | ||||||||| ||||    
T  14441557 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatgtcattcaagttgttgctgttaatattgttatg 14441459  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
     |||||    
T  14441458 atgcaa 14441453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 344
Target Start/End: Original strand, 17685528 - 17685604
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||| ||||    
T  17685528 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatagcattcaagttgttgttgttaatattgttatg 17685604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8023810 - 8023718
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| | || || ||| ||| | | ||||||| |||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  8023810 ttttgagttatgatgaaaatactacaagtaggttttggtgcaatttaacgaaaatttagcataactatttttaagtcaacccaaaacttatgg 8023718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14508173 - 14508098
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  14508173 ttatgtggaaaaggtattatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 14508098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16728605 - 16728542
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  16728605 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaacaatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 16728542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 344
Target Start/End: Original strand, 17258945 - 17259032
Alignment:
Q  256 tttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||||||    
T  17258945 tttaagatacatgtattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttattgtgattaatgttgctatg 17259032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 17519603 - 17519666
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17519603 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatg-tggtcataccattcaagttgttattattaat 17519666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 17534465 - 17534528
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | || | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  17534465 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaataatg-tggtcataccattcaagttgttattattaat 17534528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17538429 - 17538366
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17538429 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattaaagttgttattattaat 17538366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18893061 - 18893009
Alignment:
Q  119 aagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgag 170  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  18893061 aagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgag 18893009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 29544479 - 29544527
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||    
T  29544479 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaatttttatgaa 29544527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 50348836 - 50348911
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  50348836 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 50348911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 7780989 - 7781032
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  7780989 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 7781032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 11562746 - 11562664
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| |||| |||||    
T  11562746 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaatgttgttatgatgcaa 11562664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 14647566 - 14647609
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaa 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  14647566 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 14647609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15978052 - 15978009
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  15978052 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15978009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Original strand, 19569054 - 19569160
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| ||  | ||||| ||| |||| ||||| ||| |  ||||| ||    
T  19569054 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttattgctgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgctg 19569152  T
Q  367 tctctgct 374  Q
    ||||||||    
T  19569153 tctctgct 19569160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 28848264 - 28848307
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  28848264 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 28848307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 11192446 - 11192390
Alignment:
Q  269 tattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgtt 326  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  11192446 tattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgtt 11192390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 16059585 - 16059521
Alignment:
Q  232 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| | |||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16059585 aaatgattaatg-ttgttggttattttgaaatacatatattatgtggaaagtgtatgatatagaaa 16059521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 53
Target Start/End: Original strand, 22764096 - 22764145
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| | |||||||    
T  22764096 ttgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaatttttatgaa 22764145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 24546306 - 24546257
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  24546306 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24546257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 6155951 - 6155872
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgtt-attattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| ||| ||||| ||| || |||||||    
T  6155951 ttatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgattgttaatgttgttaagttgcaa 6155872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 36
Target Start/End: Complemental strand, 11259016 - 11258984
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtct 36  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11259016 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtct 11258984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 13436827 - 13436799
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaag 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13436827 tttttgagatatgatgaaaatactccaag 13436799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 45531351 - 45531414
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  45531351 ttatgtggaaaatgtatgatataaaagataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaat 45531414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3295 - 2921
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3295 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataat 3196  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3195 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgcgagttgatcttgggatatgaatggaagttgtt 3096  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  3095 aataagttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 2996  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  2995 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattactatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 2921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 106)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 15447879 - 15448248
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15447879 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 15447978  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||     || ||||||||     
T  15447979 tccaaccctcaaaactggaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttctgagttgatcttggga-----atggaagttgta 15448073  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15448074 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaat 15448173  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15448174 atcgttgtttatatcattcaagtttttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 15448248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10705087 - 10704719
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10705087 tttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 10704988  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10704987 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 10704888  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  10704887 aataagttatagacttacagagagccggaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgagcaaaatgtatggtataaaaaat 10704788  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10704787 atcgttgtttatataattcaagttgttattattaatattgttatgttgcaagttgcttttgttgttgtc 10704719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 10918857 - 10918489
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10918857 tttttgagatatgatgaaaatattgcaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 10918758  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  10918757 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 10918658  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||||    
T  10918657 aataagttatagacttacagagagccggaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgagcaaaatgtatggtataaaaaat 10918558  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  10918557 atcgttgtttatataattcaagttgttattattaatattgttatgttgcaagttgcttttgttgttgtc 10918489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 9638596 - 9638244
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9638596 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 9638497  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9638496 tccaaatctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 9638397  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  9638396 attaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaa 9638297  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  9638296 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaa 9638244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 98 - 374
Target Start/End: Original strand, 9871126 - 9871405
Alignment:
Q  98 aattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagtt 196  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  9871126 aattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagtttatcttgggataggaatggaagtt 9871225  T
Q  197 gttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||    
T  9871226 gttattaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatag 9871325  T
Q  295 aaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||| |||  |||||||||||| | |||||||||||||| || || |||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  9871326 aaattattattgtttatatcagtcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 9871405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3337680 - 3337519
Alignment:
Q  9 atatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagc 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3337680 atatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaagc 3337581  T
Q  109 tcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  3337580 tcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3337519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 630366 - 630556
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  630366 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttatgggataat 630465  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaat 189  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  630466 accaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatccttggggtatgaat 630556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15990628 - 15990455
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15990628 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataat 15990529  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  15990528 tccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttg 15990455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 10694712 - 10694883
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10694712 tttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattc 10694811  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  10694812 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttg 10694883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 10908478 - 10908649
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10908478 tttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttattccaaaacttatgggataattc 10908577  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||    
T  10908578 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttg 10908649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40620117 - 40619946
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  40620117 tttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattt 40620018  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatta-acccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  40620017 caaatctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtattatacctatgttgtgagttg 40619946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 56115299 - 56115473
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  56115299 tttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 56115398  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  56115399 tccaaagctcaaaagcagaagtactatgagttctattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 56115473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33849322 - 33849157
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33849322 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 33849223  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  33849222 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 33849157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12611440 - 12611264
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12611440 tttttgagatatgatgaaaatagtccaacgaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 12611341  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  12611340 accaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 12611264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15008553 - 15008382
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15008553 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggcataattc 15008454  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
     ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  15008453 gaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttg 15008382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 23802927 - 23803103
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23802927 tttttgagatgtgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 23803026  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23803027 accaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttatgagttgatc 23803103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 24046997 - 24047171
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | | | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24046997 tttttgagttatgatggaaatactctaggtaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 24047096  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24047097 tccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 24047171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18213146 - 18212981
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18213146 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 18213047  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18213046 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 18212981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25091239 - 25091073
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  25091239 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 25091140  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  25091139 aaacctcgaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaaccaatgttgtga 25091073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 51463530 - 51463706
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51463530 tttttgagatatgatgaaaatagtctaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaatttatgcgataat 51463629  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  51463630 accaaccctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggcgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 51463706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 16277790 - 16277961
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16277790 tttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggttttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataat 16277889  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  16277890 tccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 16277961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37019255 - 37019104
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  37019255 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttataagttaatccaaaacttaaggaataatttc 37019156  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||    
T  37019155 aaacctcaaaactagaagtactatgggttcaactaaggtgtttaagagtatt 37019104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 53387400 - 53387571
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53387400 tttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttatgggataat 53387499  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||  ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  53387500 tccaagactcaaaattagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 53387571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19609910 - 19609744
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  19609910 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttaaggtataattcc 19609811  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  19609810 aaacctcaaaactagaagtactatcagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19609744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 53630939 - 53631105
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  53630939 ttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattca 53631038  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  53631039 aaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 53631105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 33243759 - 33243928
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33243759 tttttgagttatgatgaaaatactccaaaggggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggatgat 33243858  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||  ||||| |||||||||    
T  33243859 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattgaggtgtttaagagtagctaacctatgttgtga 33243928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 35660435 - 35660266
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  35660435 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataat 35660336  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
      |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  35660335 ctcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 35660266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51992952 - 51992736
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | |||||    
T  51992952 atgttgtgagttgatcttgggttaggaatggaagttgtttattaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgactaataattgttgaattgttta 51992853  T
Q  260 agatatttatattatgtga--aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctt 357  Q
    |||||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  || ||    
T  51992852 agatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgttt 51992753  T
Q  358 atgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||||||||||    
T  51992752 atgttgctgtctctgct 51992736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 10356902 - 10357068
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  10356902 ttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 10357001  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  10357002 aaacctcaaaactagaagtattatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 10357068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33186490 - 33186289
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| || |||||  ||| ||||||| |||||||||||||| ||||     
T  33186490 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataacattttctaagttagtccaaaacttatggaataac 33186391  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  33186390 tccaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatcttggtataggaat-gaagttgtt 33186292  T
Q  200 aat 202  Q
    |||    
T  33186291 aat 33186289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Original strand, 32466931 - 32467119
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaa 260  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  32466931 atgttgagagttgatcctgggataggagtggaggttgttattaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattaatttaa 32467030  T
Q  261 gatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||||||| |||||   |||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||| |||| |||| ||| |||||||||||    
T  32467031 gatatttatataatgtgttgaaaacgtatgatatggaaaatattattgtttatatcattcaagctgttgttatcaatgttgctatgttg 32467119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 10057061 - 10056885
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  10057061 tttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 10056962  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||| |||||| ||| |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  10056961 tccaaacctcaaatctagaagtaccaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttatgagttgatc 10056885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28385823 - 28385659
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  28385823 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 28385724  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  28385723 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccaagttgtgagttg 28385659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9923785 - 9923638
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  9923785 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgat 9923686  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  9923685 tccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaa 9923638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14549212 - 14549061
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14549212 ttgagatatgatgaaagtactccatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 14549113  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  14549112 aaacctcaagactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 14549061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42875385 - 42875219
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||  | ||||||||    
T  42875385 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcgtaactgtttctaagttaatccaaaacttaatgaataattcc 42875286  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| | ||| |||||| |||||||||    
T  42875285 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaggagtatttaacctatgttgtga 42875219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 4615774 - 4615903
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4615774 ttgttggttaatttgagttacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatg 4615873  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4615874 ttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 4615903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27028079 - 27027950
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||  ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27028079 ttgttggttaatttaaactatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatg 27027980  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27027979 ttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 27027950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 245 - 371
Target Start/End: Original strand, 20899468 - 20899594
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20899468 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatg 20899567  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctct 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20899568 ttgcaagttgcttatgttgttgtctct 20899594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 14933149 - 14933278
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14933149 ttgttggttaatttaagctatatatgttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctatg 14933248  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  14933249 ttgcaagttgcttatgttgctgtttctgct 14933278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16998114 - 16997950
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  16998114 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataat 16998015  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| ||||     |||||||||||||||| || ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  16998014 tccaaacctca-----aaaagtactatgagttgaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16997950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 11479074 - 11479222
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||| || ||    
T  11479074 tttttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttccaagttaatccaaaacttatggaatgat 11479173  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  11479174 tccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaag 11479222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15114808 - 15114658
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15114808 ttgagatatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagtgaaat-ttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15114710  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| || ||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  15114709 aaaccttaaaactagaagtactaggagtttaattaaggagtttaagagtatt 15114658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 122
Target Start/End: Original strand, 15011979 - 15012097
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15011979 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 15012078  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagt 122  Q
    ||| |||||||||| ||||    
T  15012079 aaacctcaaaactagaagt 15012097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 13446796 - 13446669
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||    
T  13446796 ttgttggttaattcaagctacatatattatgtgaaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatg 13446697  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13446696 ttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 13446669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 14942354 - 14942484
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatt-tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctat 343  Q
    |||||||||| |||||| || | ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14942354 ttgttggttaatttaagctaatatatgttatgtggaaaatgtatgatctagaaaatatcgttgtttacatcattcaagttgttattattaatattgctat 14942453  T
Q  344 gttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  14942454 gttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 14942484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14630412 - 14630246
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   |||    
T  14630412 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctcc 14630313  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  14630312 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 14630246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 11425531 - 11425375
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||          ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11425531 ttgagatatgatgaaaatattccaaggaggtcttagtgaaa----------attcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 11425442  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  11425441 aaacctcaaaactagaagtactattagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 11425375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 40 - 173
Target Start/End: Original strand, 15883917 - 15884051
Alignment:
Q  40 tgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15883917 tgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttgatccaaaacttagggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 15884016  T
Q  140 tgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
     ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  15884017 ggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 15884051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 10237961 - 10238114
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |  |    
T  10237961 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtt 10238060  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  10238061 tccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttaaattaatgtgtttaagagtatt 10238114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 19435160 - 19435298
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||| | || |||| ||| || |||||    
T  19435160 tttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattatatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtctaaaatttagggaataat 19435259  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  19435260 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 19435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 15612407 - 15612192
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaa-tgattaatgattgttggttagttt 258  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  15612407 atgttatgagttgatcttgggataggaattgaagttgtttattaagtcacagatttacagagagcctgaatcaaaatgattattgattgttggttagttt 15612308  T
Q  259 aagatattt--atattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgct 356  Q
     ||||||||  ||||| |||  |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||  |||||| || ||||||| | | | ||||| || |||||    
T  15612307 gagatatttatatattgtgttgaaaatgtatgatatggaaattgttattgtttatatcatccaagttgctagtattaatgtggttgtgttgtaagttgct 15612208  T
Q  357 tatgttgttgtctctg 372  Q
     ||| || ||||||||    
T  15612207 gatgctgctgtctctg 15612192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 16026392 - 16026559
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| |||||||| |||||||||||||  |       
T  16026392 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataagtatttctaagttaacccaaaacttatggattgtc 16026491  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtattaacccatgttgtga 169  Q
    | |||| ||  ||| |    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16026492 tacaaa-cttcaaagtttgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattaacccatgttgtga 16026559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 2584919 - 2585046
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||    
T  2584919 ttgttggttaattcaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatg 2585018  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  2585019 ttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 2585046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 245 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 18230003 - 18229880
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatat--tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgcta 342  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18230003 ttgttggttaacttaagctatttataaaatatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttaatattaatattgcta 18229904  T
Q  343 tgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    |||||||| ||| |||||||||||    
T  18229903 tgttgcaagttgtttatgttgttg 18229880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 3485488 - 3485347
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||| || |     
T  3485488 tatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaattgtta--aaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattcc-aaccc 3485392  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  3485391 caagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 3485347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 19566382 - 19566550
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  19566382 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaattttgtgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 19566481  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  19566482 tccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19566550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 6511918 - 6511791
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||     
T  6511918 ttgttggttaattcaagctacatatattatgtagaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctata 6511819  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    || ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  6511818 tttcaagttgtttatgttgttgcctctg 6511791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 269 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21061846 - 21061743
Alignment:
Q  269 tattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttgt 367  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  21061846 tattatgtggaaaatgtttgatatagaaaatattgatgtttatatcattcaagttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgt 21061747  T
Q  368 ctct 371  Q
    ||||    
T  21061746 ctct 21061743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15344464 - 15344312
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||  |       
T  15344464 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatggattgtc 15344365  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||| ||  | ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15344364 tccaaa-ttcaaagct-tatgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 15344312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 25513331 - 25513237
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatggg 95  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25513331 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaagttccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggg 25513237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 15214509 - 15214646
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | ||| ||    
T  15214509 ttttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttattgaatattt 15214608  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  15214609 ccaaacctcgaaactggaagtactaggagtttaattaa 15214646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 45314800 - 45314889
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaactt 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  45314800 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactt 45314889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 22725548 - 22725608
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22725548 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 22725608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 174
Target Start/End: Original strand, 43251116 - 43251200
Alignment:
Q  92 tgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtg-tttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  43251116 tgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgttttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 43251200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 2425084 - 2425177
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  2425084 tttttgagttatgatgaaactactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 2425177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26445473 - 26445380
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  26445473 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaatttcggataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 26445380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 55582780 - 55582703
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagtt 78  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||||    
T  55582780 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtt 55582703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 155
Target Start/End: Original strand, 44024071 - 44024220
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || || || |||||||||||||  |   ||||    
T  44024071 tgagttattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctcca 44024170  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  44024171 aacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 44024220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 46740787 - 46740694
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  46740787 tttttgagttatgataaaaatactccaaagacgtcttagtgaaattttgtgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 46740694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 66
Target Start/End: Original strand, 18108350 - 18108406
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 66  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18108350 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 18108406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 116
Target Start/End: Original strand, 20595895 - 20596009
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| | ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||  |||| ||||| || || ||||||||||  | ||     
T  20595895 ttttgagttatgatgaaaatacttcaagtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataattatttgtaagtcaaccccaaacttatggtttgatg 20595994  T
Q  102 ccaaagctcaaaact 116  Q
    ||||| |||||||||    
T  20595995 ccaaacctcaaaact 20596009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 40229892 - 40229798
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtctt-agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |||| || || || |||||||||||||    
T  40229892 tttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttaagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatgg 40229798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16997849 - 16997745
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  16997849 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 16997751  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  16997750 tctgct 16997745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25090975 - 25090912
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25090975 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagttgttattattaat 25090912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 304 - 372
Target Start/End: Original strand, 49547992 - 49548060
Alignment:
Q  304 ttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  49547992 ttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 49548060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Original strand, 16026819 - 16026924
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||| |||| ||||| ||| |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  16026819 tatattatgtgaatattgtgtgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgctattgttaatgttgttatgatgcaagttg-ttatgttgttg 16026916  T
Q  367 tctctgct 374  Q
    ||| ||||    
T  16026917 tctttgct 16026924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Original strand, 53631136 - 53631258
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||    
T  53631136 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatattgttatg 53631234  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
     ||||| ||| |  ||||||||||    
T  53631235 atgcaagttgttattgttgttgtc 53631258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 155
Target Start/End: Original strand, 13036328 - 13036394
Alignment:
Q  89 ttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  13036328 ttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatt 13036394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 37018920 - 37018816
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  37018920 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 37018822  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  37018821 tctgct 37018816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Original strand, 13046117 - 13046201
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||| | || |||||| ||||||    
T  13046117 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtaaaattttacgaaaattcaacataaccatttctaaatcaacccaaaagttatgg 13046201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 15534706 - 15534658
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  15534706 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 15534658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19609646 - 19609571
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19609646 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttaaaccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 19609571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 347
Target Start/End: Original strand, 33243981 - 33244060
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  33243981 tatattgtgtgaataaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 33244060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42875121 - 42875046
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42875121 ttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 42875046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 9638138 - 9638052
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg 354  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||| |||||||||    
T  9638138 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatgttgttatgatgcaaattg 9638052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12622928 - 12622807
Alignment:
Q  33 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   ||||||  ||||| ||    ||||||||||||    
T  12622928 gtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttttaggtcaacccaaaacttatggattgtctccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagtt 12622830  T
Q  133 caattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||| ||||||||| |||||    
T  12622829 caattaaggtgtttaagagtatt 12622807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 14508318 - 14508257
Alignment:
Q  33 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  14508318 gtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 14508257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 19435507 - 19435611
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| |  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  19435507 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaacaatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 19435605  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  19435606 tctgct 19435611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14049106 - 14049054
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14049106 tttttgagatatcataaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14049054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 49547411 - 49547459
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||    
T  49547411 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttaatgaatttttatgaa 49547459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 12033416 - 12033459
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  12033416 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 12033459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 272 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14548947 - 14548885
Alignment:
Q  272 tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  14548947 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 14548885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14630003 - 14629945
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgtt 326  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  14630003 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 14629945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 89
Target Start/End: Original strand, 19081805 - 19081892
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaact 89  Q
    ||||||| ||||||||||| ||| ||||||  |||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||  |||| || ||||||||    
T  19081805 ttttgagttatgatgaaaacacttcaaggagatcttggtaaaattttacgaaaattcagcataaccgtttccaagtcaacccaaaact 19081892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 19243220 - 19243177
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  19243220 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19243177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 30147443 - 30147392
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  30147443 ttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 30147392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 44615808 - 44615765
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  44615808 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 44615765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 50221982 - 50222025
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  50221982 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 50222025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3485238 - 3485134
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgct-tatgttgtt 365  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||| ||||| |||  |||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||| | |||||||||    
T  3485238 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttg-ttataccatccaagtggttattattaatgttgctatgattcaagttgttgtatgttgtt 3485141  T
Q  366 gtctctg 372  Q
    |||||||    
T  3485140 gtctctg 3485134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14508231 - 14508182
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  14508231 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 14508182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Original strand, 26922254 - 26922303
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  26922254 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 26922303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20870 - 20774
Alignment:
Q  279 aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgc-ttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||| |||| | |   ||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| || || |||| |||||||| ||||||||||    
T  20870 aaaatgtatgatatggaaattgttagtgtttatatcatccaagttgttagtattaatctggctatgatgtaagttgctttatgttgctgtctctgct 20774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 14185471 - 14185427
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaat 45  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14185471 tttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagcgaaat 14185427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 367
Target Start/End: Original strand, 16026641 - 16026740
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || |||||  | ||||| ||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  16026641 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgctgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgttg 16026739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 36038395 - 36038347
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||    
T  36038395 tgagatatgataaaaatactcaaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 36038347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 83)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 21180788 - 21181162
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21180788 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaatttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 21180887  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  21180888 tccaattcttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgattttgggataggaatggaagttgtt 21180987  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21180988 aataagttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagcttaagatatttatattatgagaaaaatatatgatatagaaaat 21181087  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21181088 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 21181162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 7792315 - 7792689
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  7792315 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataat 7792414  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  7792415 tccaaggctcaaaactagaagtaatgtgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccatgttgtgatttgatcttgggataggaatggaagttgtt 7792514  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7792515 aataagttatagacatacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 7792614  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  7792615 atcgttgtaaatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgctgtctttgct 7792689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 44822585 - 44822958
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  44822585 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttacgggataat 44822684  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  44822685 tccaaacctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggata-gaatggaagttgtt 44822783  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44822784 attaggttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 44822883  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||    
T  44822884 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatatcactatgttgcaagttgcctatgttgctatctctgct 44822958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 3 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16401255 - 16400882
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16401255 tttgagatatgatcaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaatcgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 16401156  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaa 201  Q
    |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  16401155 caaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttttgagttgatcttgggacaggaatggaggttgttaa 16401056  T
Q  202 taagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatat 301  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  16401055 taagttatagacttacagaaagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgagaaaaatgtatgagatagaaaatat 16400956  T
Q  302 cgttgtttata-tcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16400955 cgttgtttatagtcattcaagttgttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 16400882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 337
Target Start/End: Original strand, 24815315 - 24815649
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24815315 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataat 24815414  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    || || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24815415 tctaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 24815514  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24815515 aataagttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 24815614  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatat 337  Q
    |||   |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24815615 atc---gtttatatcattcaagttgttattattaatat 24815649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 38057114 - 38057490
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  38057114 tttttgagatatgatgaaaatactccaagggggtattagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatacaaaacttatgggattat 38057213  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||    
T  38057214 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttaatcttgggataggaatgaaagttgtt 38057313  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  38057314 attaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttaatttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaa 38057413  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  38057414 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 38057490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 375
Target Start/End: Original strand, 8276455 - 8276830
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8276455 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataat 8276554  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8276555 tccaaacctcaaaactagaagtactataggttcaattaaggcgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 8276654  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||||| |    
T  8276655 attaagttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaatt 8276754  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgctc 375  Q
    ||  |||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||  |  |||||||| ||| |||||||    
T  8276755 attattgtatatatcattcaagttgttgttattgatgttgttatgttgcaagatatttatgttgatgtttctgctc 8276830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 22350177 - 22349808
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22350177 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 22350078  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  22350077 tccaaccctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 22349978  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  22349977 aataagttatagacttacaaagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaa 22349878  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
     |||  |||||||||||||| ||||| |||||||  || ||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  22349877 ttattattgtttatatcattcaagttattattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 22349808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 29764099 - 29764274
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29764099 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 29764198  T
Q  103 caaag----ctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  29764199 caaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 29764274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 2332673 - 2332849
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2332673 tttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 2332772  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  2332773 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 2332849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 20031353 - 20031529
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20031353 tttttgagatatgatgaaaatactcaatggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 20031452  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  20031453 tccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaggagtatttaacccatgttgtgagttgatc 20031529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 3 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50001061 - 50000884
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatcc-aaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  50001061 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaaacttatgagataatt 50000962  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatctt 178  Q
    | ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  50000961 caaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttggtctt 50000884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 46198190 - 46198361
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  46198190 tttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttaatgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattt 46198289  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||    
T  46198290 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttg 46198361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 22130528 - 22130726
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22130528 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcttttctaatttaatccaaaacttatgggataat 22130627  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatagaagttg 197  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| || |||| |||||||    
T  22130628 accaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtttatccttggggtaggaatggaagttg 22130726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28312937 - 28312763
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28312937 tttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 28312838  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    | ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28312837 ttcaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 28312763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 13881079 - 13881255
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13881079 tttttgtgatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 13881178  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13881179 tccaaccctcaaaactaaaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 13881255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 21239758 - 21239906
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  21239758 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataat 21239857  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21239858 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaag 21239906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 296935 - 296770
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  296935 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataattccaaggct 296836  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  296835 caaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 296770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 41227170 - 41227336
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41227170 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 41227269  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  41227270 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 41227336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Original strand, 19761848 - 19762064
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19761848 atgttgtgagttgatcttgagataggaaaggaagttgtttattaagttacaaacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattagttta 19761947  T
Q  260 agatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctt 357  Q
    |||||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||| |||  ||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||    
T  19761948 agatatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgattatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgttt 19762047  T
Q  358 atgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||||||||||    
T  19762048 atgttgatgtctctgct 19762064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19676297 - 19676146
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  19676297 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 19676198  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  19676197 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 19676146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 42912636 - 42912485
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  42912636 ttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 42912537  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||    
T  42912536 aaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatt 42912485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20588265 - 20588099
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20588265 ttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 20588166  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  20588165 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20588099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20592803 - 20592637
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20592803 ttgagatatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 20592704  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  20592703 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20592637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 21046515 - 21046681
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21046515 ttgagatatgatgaaaataatccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 21046614  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21046615 aaacctcaaaactagaagtactatgggttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 21046681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 41225917 - 41226083
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  41225917 ttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 41226016  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||   |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  41226017 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 41226083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 170
Target Start/End: Original strand, 20437699 - 20437860
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20437699 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 20437798  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgag 170  Q
     ||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20437799 taaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgag 20437860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 51323864 - 51323710
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||| |||||||||||| ||||     
T  51323864 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaattcaaaacttatggaataac 51323765  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  51323764 tccaaaccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 51323710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 294624 - 294451
Alignment:
Q  11 atgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggat---------aatt 101  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||         ||||    
T  294624 atgatggaaatactccaagtatgtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattgggataatt 294525  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  294524 ccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 294451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12710477 - 12710308
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||| ||||     
T  12710477 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccgaaacttatggaataac 12710378  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  12710377 tccaaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 12710308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Original strand, 16058780 - 16058925
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||    
T  16058780 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataattcc 16058879  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  16058880 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaag 16058925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 23195016 - 23195168
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||| |||||| |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23195016 tttgagttatgataaaaatactcctaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 23195115  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || |||||    
T  23195116 caaccctccaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatt 23195168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 51082796 - 51082636
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  51082796 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttaagaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 51082697  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  51082696 caagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 51082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 14238084 - 14238244
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  14238084 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctgagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 14238183  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  14238184 caagactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 14238244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 52983489 - 52983361
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  52983489 ttgttggttaatttaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgttatg 52983390  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgc 373  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  52983389 ttgcaagttgcttatgttgatgtctctgc 52983361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 45754888 - 45754670
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaa-tcaaatgattaatgattgttggttagttt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  45754888 atgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtttattaagttatagatttacagagagcctgaaataaaatgattaatgattgttggttagttt 45754789  T
Q  259 aagatattt--atattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg-c 355  Q
     ||||||||  ||||||| |  |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||||| ||| |||      
T  45754788 gagatatttatatattatattgaaaatgtatgatatggaaattgttattgtttatatcatccaagttgttagtattaatgtggctatgttacaagttgat 45754689  T
Q  356 ttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  45754688 ttatgttgcagtctctgct 45754670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 4596311 - 4596477
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  4596311 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 4596410  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||  |||||| ||  ||| ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  4596411 aaacctcaaaactagaagtaatataggttcaactagggtgcttaagagtatttaacctatgttgtga 4596477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16372331 - 16372185
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16372331 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 16372232  T
Q  110 -caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
     ||||| |||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  16372231 acaaaaataaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatt 16372185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18823950 - 18823821
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  18823950 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtggaaaatatatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgttatg 18823851  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  18823850 ttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 18823821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 7052518 - 7052656
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||| | ||||||||||| || |||||    
T  7052518 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtattagtgaaattttatgaaaattctgcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagggaataat 7052617  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  7052618 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 7052656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 245 - 363
Target Start/End: Original strand, 13528502 - 13528620
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13528502 ttgttggttaattcaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatg 13528601  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    |||||| ||||||||||||    
T  13528602 ttgcaagttgcttatgttg 13528620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 38887550 - 38887688
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||||    
T  38887550 tttttgaggtatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataat 38887649  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  38887650 tacaaaactcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 38887688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 45496535 - 45496397
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  45496535 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaactcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagggaataat 45496436  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    | |||| ||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  45496435 ttcaaacctccaaactagaagtactctgagtttaattaa 45496397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 45574515 - 45574680
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||           ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  45574515 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaat-----------tcagcataaccgtttctaaattaatccaaaacttatgggataat 45574603  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  45574604 accaaccctcaaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttaagcgtatttaacccatgttgtgagttgatc 45574680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18275259 - 18275130
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  18275259 ttgttggttaattcaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaacgttgctatg 18275160  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  18275159 ttgcaagttgtttatgttgttgtccctgct 18275130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 234 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 51476330 - 51476194
Alignment:
Q  234 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatta 333  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  51476330 atgattaatg-ttgttggttaatttaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagataataccgttgtttatattattcaagttgttattatta 51476232  T
Q  334 atattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctct 371  Q
    || |||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  51476231 atgttgctatgttgcaagttgtttatgttgttctctct 51476194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 4 - 139
Target Start/End: Original strand, 20634100 - 20634235
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||   | |||||| |    
T  20634100 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaacttggagaataatttc 20634199  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20634200 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 20634235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 161 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 24726746 - 24726565
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaa 260  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| || | || ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24726746 atgttgagagttgatcctcggataggagtggaggttgttattaagtcatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattaatttaa 24726647  T
Q  261 gatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgc 340  Q
    ||||||||||| |  |||  |||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||| |||| |||| ||| ||||    
T  24726646 gatatttatataacgtgttgaaaacgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagctgttgttatcaatgttgc 24726565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 287 - 368
Target Start/End: Original strand, 10813273 - 10813354
Alignment:
Q  287 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10813273 tgatatagaaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 10813354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 22823870 - 22824038
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  22823870 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 22823969  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  22823970 tccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 22824038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 50544440 - 50544272
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  50544440 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 50544341  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  50544340 tccaaatttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 50544272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18270605 - 18270476
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |  ||| ||||    
T  18270605 ttgttggttaattcaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattctagttgttattatttacgttgttatg 18270506  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  18270505 ttgcaagttgtttatgttgttgtccctgct 18270476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1643184 - 1643031
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |       
T  1643184 tttttgagttatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctatgtcaacccaaaacttatggattgtc 1643085  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1643084 tccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 1643031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6833803 - 6833710
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  6833803 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgaataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 6833710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16655955 - 16655819
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||    
T  16655955 ttttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgttt 16655857  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  16655856 ccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaa 16655819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39060684 - 39060591
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  39060684 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgtataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 39060591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 14793025 - 14793178
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |       
T  14793025 ttttagagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtc 14793124  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14793125 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 14793178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 24720157 - 24720250
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||| || ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  24720157 ttttttagttatgatgaaaatacttcatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 24720250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 17902234 - 17902393
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||  |||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |   ||||||  |    
T  17902234 tatgatgaaaatactccaaggtggtcttgatgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtctccaaaatt 17902333  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||| | |   ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  17902334 caaagc-atgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 17902393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 44892036 - 44891873
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||| ||||||  |       
T  44892036 tttttgagttatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatggattgtc 44891937  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtattaacccatgtt 165  Q
    ||||||  ||||| ||   | |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  44891936 tccaaacttcaaatcttgta-tactatgagtacaattaaggtgtttaagagtattaacctatgtt 44891873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18121190 - 18121100
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||  |||| || || || |||||||||||||    
T  18121190 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataattatttctaggtcaacccaaaacttatgg 18121100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 245 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 13302130 - 13302007
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||| ||| ||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||| ||||    
T  13302130 ttgttgtttaatttgagatctatatattatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttatg 13302032  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtct 369  Q
    |||||| ||  | ||||||||||||    
T  13302031 ttgcaagtttttgatgttgttgtct 13302007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 21659733 - 21659685
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatctta 49  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21659733 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta 21659685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20588000 - 20587937
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20588000 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagttgttattattaat 20587937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20592538 - 20592475
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20592538 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagttgttattattaat 20592475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42697041 - 42696935
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctt-atgttgtt 365  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||| |||| |||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||    
T  42697041 tatattatgtgaaaag-gtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcatccaagatgttgttattaatgttgctacgttgcaagttgttttatgttgtt 42696944  T
Q  366 gtctctgct 374  Q
    |||||||||    
T  42696943 gtctctgct 42696935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 42912372 - 42912297
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  42912372 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 42912297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1642760 - 1642655
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||| || ||  |||||||||| ||  || |||||||||||    
T  1642760 tatattatgtgaaaa-tgtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgttgatgctgctatgttgtaagatgtttatgttgttg 1642663  T
Q  367 tctctgct 374  Q
    ||||||||    
T  1642662 tctctgct 1642655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 347
Target Start/End: Original strand, 21046780 - 21046854
Alignment:
Q  272 tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21046780 tatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 21046854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 4596575 - 4596679
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  4596575 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaactaatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtc 4596673  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  4596674 tctgct 4596679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 16059044 - 16059119
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16059044 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 16059119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19676073 - 19675969
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||   ||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  19676073 ttatgtgcaaaaggtatgatatagaaaataattttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 19675975  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  19675974 tctgct 19675969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 9784806 - 9784898
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| |||| |||||||  |||||| || |  |||| || ||||||||||||    
T  9784806 tttttgagttatgatgaaaatacttcaaggagatcttggtgaaattttataaaaattccacataactatctccaagtcaacccaaaacttatg 9784898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 13227391 - 13227340
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  13227391 ttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 13227340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16362438 - 16362395
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  16362438 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 16362395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21841286 - 21841243
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21841286 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21841243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 21922934 - 21922977
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21922934 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21922977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 29535579 - 29535528
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| | |||||||    
T  29535579 ttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaatttttatgaa 29535528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 41372991 - 41372948
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  41372991 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 41372948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 45
Target Start/End: Original strand, 10812834 - 10812876
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaat 45  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10812834 tttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagcgaaat 10812876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 281 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24815169 - 24815140
Alignment:
Q  281 aatgtatgatatagaaaatatcgttgttta 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24815169 aatgtatgatatagaaaatatcgttgttta 24815140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 270 - 347
Target Start/End: Original strand, 41227433 - 41227509
Alignment:
Q  270 attatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| || ||||||| ||||||  ||||||||||    
T  41227433 attatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaatttgttatcattaatgatgctatgttg 41227509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 20634365 - 20634440
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| | |||||||| ||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20634365 ttatgtggaaaaggcatgatataaaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 20634440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 71)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Original strand, 24277069 - 24277437
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24277069 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 24277168  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24277169 tccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 24277268  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24277269 aataagttatagactttcagagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatatatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 24277368  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24277369 atcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 24277437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24385144 - 24384776
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385144 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 24385045  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  24385044 tccaaccctcaaaactataagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 24384945  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  24384944 aataagttatagactttcagagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatatatattatgaggaaaatgtatgatatagaaaat 24384845  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24384844 atcgttgtttataccattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 24384776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 17812985 - 17812617
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17812985 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagggataat 17812886  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  17812885 tccaaccctcaaaactagaagtactatgaattcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 17812786  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  17812785 aataagttatagacttacaaagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgagggaaatgtgtgatatagaaaat 17812686  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17812685 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtc 17812617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17875588 - 17875317
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||||    
T  17875588 tttttgagatatgataaaaatactccgaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccaagttaatccaaaacttatagaataat 17875489  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  17875488 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccctattgtgagttgatcttgggatatgaatggtagttgtt 17875389  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17875388 aataagttatagacttacagagagtctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatat 17875317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 263444 - 263273
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  263444 tttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattg 263345  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  263344 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 263273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 7 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 17011309 - 17011142
Alignment:
Q  7 agatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17011309 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaa 17011210  T
Q  107 gctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  17011209 cttcaaaactaaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 17011142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18419001 - 18418825
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18419001 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataatcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataat 18418902  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  18418901 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 18418825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 36460559 - 36460388
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36460559 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 36460460  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtgagt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  36460459 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagt 36460388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 22412595 - 22412414
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22412595 tttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaagttcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 22412496  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttggg 181  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22412495 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatcttggg 22412414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 6766250 - 6766074
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6766250 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtaaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 6766151  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  6766150 tccaaacctcaaaaatagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 6766074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29448425 - 29448251
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  29448425 tttgagatattatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattt 29448326  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  29448325 caaacctcaaaactagaagtagtatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 29448251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 32607788 - 32607957
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  32607788 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagctaatccaaaacttatggaataat 32607887  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  32607888 tccaaacctcaaaactagaagtactataagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 32607957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 27869038 - 27869206
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27869038 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaacatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 27869137  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtg 168  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||    
T  27869138 tccaaggctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttgagagtatttaacctatgttgtg 27869206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 30138627 - 30138802
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30138627 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaac-cttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaacccaaaatttatgggataat 30138725  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  30138726 ttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 30138802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 21399466 - 21399620
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21399466 tttttgagatatgataaaaatactccaaggaggttttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 21399565  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21399566 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 21399620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 148
Target Start/End: Original strand, 21557508 - 21557654
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21557508 ttttaagatatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaatcttacgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataatt 21557607  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    ||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21557608 ccaaacctaaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaa 21557654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 21554841 - 21555013
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21554841 tttttaagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtctaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 21554940  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttt-aagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21554941 ttcaaacctcaaaactagaagtactacgagttcaattaaggtgtttaaagagtatttaacccatgttgtgagt 21555013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 20566140 - 20565974
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  20566140 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 20566041  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| || |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  20566040 aaacctcaaaactagaattactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20565974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22750533 - 22750379
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22750533 tttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 22750434  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22750433 tccaaacctcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 22750379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 22758354 - 22758528
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| || ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22758354 ttttttagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 22758453  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  22758454 tccaaggctcaaaactagaagcactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 22758528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19921220 - 19921069
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  19921220 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaaatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 19921121  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| || ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  19921120 aaaccttaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 19921069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Original strand, 8833663 - 8833815
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8833663 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatt 8833762  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | |||| |||||  |||||||| |||||    
T  8833763 ccaaacctcaaaactagaagtactaggggttc-attaagttgtttaagagtatt 8833815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22336900 - 22336755
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22336900 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 22336801  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  22336800 caaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatt 22336755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 41876065 - 41876210
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||    
T  41876065 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaatcttagggaataattccaaacct 41876164  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||    
T  41876165 caaaactaaaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagagtatt 41876210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 31456387 - 31456216
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||    
T  31456387 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgggaaaattaagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaaaaat 31456288  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||  |||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  31456287 tccaaccctcaaaactagaaatactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacccatattgtgagt 31456216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22340438 - 22340293
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22340438 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttataggataattccaaggct 22340339  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||| |||||    
T  22340338 caaaactaaaagtaatatgagtgaaattaaggtgtttaagagtatt 22340293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Original strand, 33473036 - 33473200
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  33473036 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 33473135  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  33473136 caaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttg 33473200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 163 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10953401 - 10953187
Alignment:
Q  163 gttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaag 261  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||| || || |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||    
T  10953401 gttgtgagttgaccttgggataggaatggaagttatttattaagttacaggcttacagagaacctgaatcaaatgattaatgattgttgaattgtttaag 10953302  T
Q  262 atatttatattatgtga--aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttat 359  Q
    |||||| ||| |||||   |||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||| ||||||||||| || || ||||||||||||||  || ||||    
T  10953301 atatttgtataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgtttataccattcaagttgttattgttgatgttgctatgttgcaagatgtttat 10953202  T
Q  360 gttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||    
T  10953201 gttgttgtctctgct 10953187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26761990 - 26761836
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  26761990 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaacattcaacataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataac 26761891  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  26761890 tccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 26761836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 38145210 - 38145375
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  38145210 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 38145309  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  38145310 caaaactagaagtaatacgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 38145375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 33895348 - 33895499
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||| |||    
T  33895348 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatattgtgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatagaataaatcc 33895447  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  33895448 aaacctcaaaactataagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 33895499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42960957 - 42960790
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| | ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42960957 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttcgggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 42960858  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  42960857 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgcttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 42960790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 20198051 - 20198189
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  20198051 ttttttagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataat 20198150  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  20198151 tccaaacctcaaaacttgaagtactaggagtttaattaa 20198189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 28370728 - 28370893
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  28370728 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaactggtgggataattccaaggct 28370827  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28370828 caaaactagaagtaatatgagtgtaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 28370893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 245 - 372
Target Start/End: Original strand, 8952760 - 8952885
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8952760 ttgttggttaatttaagctatatatatt--gtggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatg 8952857  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  8952858 ttgcaagttgcttatgttgttgtctctg 8952885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 36509239 - 36509377
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||  | |||||    
T  36509239 tttttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttagagaataat 36509338  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  36509339 ttcaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 36509377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 37598589 - 37598754
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  37598589 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggacaattccaaggct 37598688  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| || || ||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  37598689 caaaactagaattaatatgagtgcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 37598754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19511767 - 19511621
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  19511767 tatgatggaaatactccaagtaggtcttagtggaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacct 19511668  T
Q  110 c-aaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | ||||||| ||| | ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  19511667 cgaaaactagaagcattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 19511621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 3 - 89
Target Start/End: Original strand, 40917438 - 40917524
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaact 89  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  40917438 tttgagatatgatgaaaatactcaaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaact 40917524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 16063074 - 16062983
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttat 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||    
T  16063074 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttat 16062983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22111185 - 22111095
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22111185 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 22111095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16605067 - 16605160
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  16605067 tttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttataagtcaacccaaaacttatgg 16605160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8504332 - 8504425
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  8504332 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 8504425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 108 - 202
Target Start/End: Original strand, 12122092 - 12122186
Alignment:
Q  108 ctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat 202  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12122092 ctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaat-gaagttgttaat 12122186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 326
Target Start/End: Original strand, 22357666 - 22357747
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgtt 326  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  22357666 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatgttgttgtttatatcattcaagttgtt 22357747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Original strand, 23199856 - 23199945
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  23199856 tgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 23199945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28901508 - 28901372
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||    
T  28901508 ttttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgttt 28901410  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  28901409 ccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaa 28901372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 28937903 - 28937767
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||  ||    
T  28937903 ttttgagatatggtggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaatt-agcataaccatttataagtaaatccaaaacttgtggaatgttt 28937805  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| ||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  28937804 ccaaacctcaaaattagaagtactaggagtttaattaa 28937767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Original strand, 1627845 - 1628012
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   |    
T  1627845 ttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttaatgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattttct 1627944  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  1627945 ccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaacgtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1628012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 18744235 - 18744145
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  18744235 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 18744145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 24617386 - 24617446
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24617386 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24617446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 24713617 - 24713677
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24713617 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24713677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 24746645 - 24746705
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24746645 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24746705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Original strand, 14026274 - 14026364
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | || |||| |||| ||||| || ||||||| |||||    
T  14026274 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaatcccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacatatgg 14026364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Original strand, 41876310 - 41876384
Alignment:
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  41876310 atattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 41876384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 24668660 - 24668720
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24668660 tttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24668720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 24738429 - 24738489
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24738429 tttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24738489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 24751198 - 24751258
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagc 61  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24751198 tttttgggttatgatgaaattactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagc 24751258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 371
Target Start/End: Original strand, 25250623 - 25250725
Alignment:
Q  268 atattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttg 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25250623 atattatgtgaaaa-tgtatgatatagaaaataatgttg-atatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttg 25250720  T
Q  367 tctct 371  Q
    |||||    
T  25250721 tctct 25250725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 371
Target Start/End: Original strand, 25314408 - 25314510
Alignment:
Q  268 atattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttg 366  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||||  || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25314408 atattatgtgaaaa-tgtatgatatagaaaataatgttg-atatatcatccaatttgttgttattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttg 25314505  T
Q  367 tctct 371  Q
    |||||    
T  25314506 tctct 25314510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 30614068 - 30614008
Alignment:
Q  34 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  30614068 tcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 30614008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 37804540 - 37804588
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  37804540 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 37804588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 295
Target Start/End: Original strand, 20469779 - 20469884
Alignment:
Q  191 gaagttgttaataagt-tatagacttacagagagcctgaatcaaa-tgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatg 288  Q
    ||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  20469779 gaagttgtttataaatgtatagcctttcagagagtctgaattaaaatgattaatg-ttgttggttaatttgagatacatatattatgtggaaattgtatg 20469877  T
Q  289 atataga 295  Q
    |||||||    
T  20469878 atataga 20469884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 233 - 374
Target Start/End: Original strand, 23200256 - 23200394
Alignment:
Q  233 aatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatt 332  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | | |||  |||||||||||||||  ||||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||| ||||||| ||    
T  23200256 aatgattaatg-ttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgttatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagatgttattgtt 23200352  T
Q  333 aatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     ||  |||||||||| ||  || |||||||||||||| ||||    
T  23200353 gatgctgctatgttgtaagatgtttatgttgttgtctatgct 23200394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26749677 - 26749549
Alignment:
Q  26 caaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtact 125  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| || || |||||| ||||||  |   ||||||  ||||| ||    |||||    
T  26749677 caaggaggtcttagcgaaattttatgaaaattccgcataactatttataggtcaacccaaaatttatggattgtctccaaacttcaaagct-tttgtact 26749579  T
Q  126 atgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26749578 atgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 26749549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 30612108 - 30611973
Alignment:
Q  34 tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttc 133  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||  |   ||||||  ||||||||    ||||||||||||     
T  30612108 tcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttgtaagtcaacccaaaatttatggattgtctccaaaattcaaaact-tgtgtactatgagttg 30612010  T
Q  134 aattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  30612009 aattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 30611973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 245 - 356
Target Start/End: Original strand, 21618749 - 21618859
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| || || || || ||| ||||    
T  21618749 ttgttggataatttgagataaatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttattgttgttgatgttgttatg 21618847  T
Q  345 ttgcaaattgct 356  Q
    || ||| |||||    
T  21618848 ttacaagttgct 21618859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 31478950 - 31478884
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagt 77  Q
    ||||||||||||||| || | | ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  31478950 tatgatgaaaatactaca-gtaggtcttggtgaaattttacgaaaattcagcataaccatttttaagt 31478884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 43243121 - 43243164
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaa 44  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  43243121 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttaatgaaa 43243164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16062955 - 16062906
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  16062955 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 16062906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 344
Target Start/End: Original strand, 32608089 - 32608164
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||    
T  32608089 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttg-ttatatcatccaagtggttattattaatgttgctatg 32608164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8646 - 8272
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8646 tttttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtgttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 8547  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  8546 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaatccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatggacgttgtt 8447  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8446 aataagttatagacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgtcggttagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaat 8347  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  8346 atcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaagttgcttatgttgctgtccctgct 8272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6388 - 6025
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  6388 tttttgagatatgatgaaaaaactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttttgggataat 6289  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  6288 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtttttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 6189  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6188 attaagttatagacttacagagagcttgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtgtgatatagaaaat 6089  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttg 363  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6088 atcgttgttattatcattcaagttgttattattaatatttctatgttgcaagttgcttatgttg 6025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 51547 - 51173
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51547 tttttgagatatgatcaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataat 51448  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  51447 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttaaaataaggtgtttaagagtatttaatcaatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagatgtt 51348  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  51347 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgcaaaatgtttgatataaaaaat 51248  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||| |||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  51247 atcgtagttattatcatttaagttattactattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtttctgct 51173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 67257 - 67191
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  67257 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacc 67191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 232 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28633 - 28533
Alignment:
Q  232 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | | |||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  28633 aaatgattaatg-ttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaa-tgtatgatacagaaactaatgttgtt-atatcattcaagttgttattat 28537  T
Q  332 taat 335  Q
    ||||    
T  28536 taat 28533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 47299 - 47373
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  47299 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaaaat-gttg-ttataccattcaagttgttataattaatgatgctatgttg 47373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 1 - 372
Target Start/End: Original strand, 19107 - 19481
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19107 tttttgagatatgatgaaaatactacaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 19206  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  19207 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 19306  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  19307 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaa 19406  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  19407 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctg 19481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 103)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 20454828 - 20454454
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454828 tttttgagatatgatgaaaatactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 20454729  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    || ||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||    
T  20454728 tcaaacccacaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgtaatttgtt 20454629  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||    
T  20454628 aataagttatagacttacaaagagtctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgagggaaatgtgtgatatagaaaat 20454529  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20454528 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 20454454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20455585 - 20455218
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20455585 tttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataat 20455486  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20455485 tccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgtaagttgtt 20455386  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||    
T  20455385 aataagttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattattagttagtttaagatatttatattatgatggaaatgtgtgatatagaaaat 20455286  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20455285 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgt 20455218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 20460563 - 20460196
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20460563 tttttgagatatgatgaaaataccccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataat 20460464  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||   |||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  20460463 tccatccctcaaaactagaagtactatgaggtcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgtaagttgtt 20460364  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||    
T  20460363 aataagttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattattagttagtttaagatatttatattatgatggaaatgtgtgatatagaaaat 20460264  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20460263 atcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgt 20460196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 2 - 338
Target Start/End: Original strand, 15635644 - 15635981
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15635644 ttttgagatataatgaagatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataatt 15635743  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtta 200  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15635744 ccaatcctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtta 15635843  T
Q  201 ataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaata 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  15635844 ataagttataggcttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgaggaaaatgtgtgatatagaaaata 15635943  T
Q  301 tcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatatt 338  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15635944 tcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatatt 15635981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 39694991 - 39695367
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  39694991 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataat 39695090  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  39695091 tcaaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatggaagttgtt 39695190  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||| |||    
T  39695191 attaagttatagacttatagagagactgaatcaaatgattaatgattgttggctagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatataaaaa 39695290  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  39695291 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 39695367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 42266058 - 42266432
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  42266058 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctta---aaattcagtataaccttttctaagttaatccaaagcttatggaataat 42266154  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  42266155 tccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttaatcttgggataggaatggaagttgtt 42266254  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  42266255 aataagttataaacttacagagagcataaatcaaatgattactgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaa 42266354  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa-attgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
      ||  |||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||    
T  42266355 tcattattgtttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgttttatgttgttgtttctgct 42266432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 19882557 - 19882187
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  19882557 tttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatcccaaacttatggaataat 19882458  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaatagaagttgt 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | ||| || || |||  ||||||||    
T  19882457 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttaaattaaggtgtttaagggtatttaacctatgttgtgagttggtccttagggta-gaaacgaagttgt 19882359  T
Q  199 taataa-gttatagacttacagagagcctg-aatcaa-atgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatataga 295  Q
    | ||||  |||  |   | ||||||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||    
T  19882358 ttataatattaatgttgttcagagagtctgcaattaagatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgagggaaatctgtgatataga 19882259  T
Q  296 aaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  19882258 aaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgcaagtttcttatgttgttgt 19882187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 364377 - 364203
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  364377 tttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 364278  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  364277 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaatccatgttgtgagttga 364203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 361675 - 361844
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  361675 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 361774  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  361775 tccaaagctcaaaactaggagtactatgagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 361844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 41680597 - 41680768
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  41680597 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 41680696  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  41680697 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagt 41680768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 44522889 - 44523063
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44522889 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctcatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 44522988  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  44522989 tccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 44523063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 32950187 - 32950042
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32950187 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattcc 32950088  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  32950087 aaagctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaag 32950042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 38185549 - 38185716
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38185549 tttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 38185648  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgt 167  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  38185649 tccaaggctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgt 38185716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 17460750 - 17460926
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17460750 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 17460849  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17460850 ttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatc 17460926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 23478667 - 23478524
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478667 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatgcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 23478568  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttt 146  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  23478567 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttt 23478524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 44432450 - 44432276
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44432450 tttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 44432351  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  44432350 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 44432276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17795812 - 17795647
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17795812 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 17795713  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||   ||| |||| ||||||||||||||||    
T  17795712 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacaagtatttaatccatgttgtgagttga 17795647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 25483937 - 25484113
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483937 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 25484036  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25484037 accaaccctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 25484113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 21861083 - 21861250
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  21861083 tttttgagatatgctgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtttatccaaaacttatgggataat 21861182  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgt 167  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  21861183 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgt 21861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 18024158 - 18024312
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||| |    
T  18024158 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggcatagt 18024257  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18024258 tccaaggctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 18024312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 19880408 - 19880244
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  19880408 tatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttattggataattccaaatct 19880309  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  19880308 cgaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttg 19880244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26454298 - 26454127
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||     
T  26454298 tttgagatataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataattt 26454199  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||    
T  26454198 caaacatcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtaagttg 26454127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 42559991 - 42560161
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  42559991 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataat 42560090  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||  |||||||||||    
T  42560091 tccaaagctc-aaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatgtaacttatgttgtgagt 42560161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 21579670 - 21579871
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  21579670 tttttgatttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 21579769  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  ||||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||    
T  21579770 tccaaccctcaaaattagaaatactatgagttcaattaaggtgtttaagagtgtttaacctatgttgtgagttgatcttggtataggaat-gaagttgtt 21579868  T
Q  200 aat 202  Q
    |||    
T  21579869 aat 21579871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5761119 - 5760953
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5761119 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaggttaatcaaaaacttatggaataattcc 5761020  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5761019 aaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5760953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 6102219 - 6102353
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6102219 ttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 6102318  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatta 138  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6102319 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatta 6102353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 20178987 - 20179153
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  20178987 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 20179086  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    | | |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  20179087 agacctcaaaactagaagtactatgagttcaaatagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 20179153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 27941361 - 27941526
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27941361 tatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaatgct 27941460  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27941461 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaatagtatttaacccatgttgtgagttga 27941526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 19808060 - 19808236
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  19808060 tttttgagatatgatgaaaatcctctaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 19808159  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19808160 tcaaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 19808236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 21321803 - 21321971
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21321803 tttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataat 21321902  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtg 168  Q
    ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21321903 tccaaggctaaaaattataagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtg 21321971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 21326401 - 21326569
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21326401 tttttgagttatgatcaaaatactccaagatggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccagttctaagttaatccaaaacttatgggataat 21326500  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtg 168  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  21326501 tccaaggctaaaaattaaaagtacaatgagttcaattaaagagtttaagagtatttaacctatgttgtg 21326569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 7 - 155
Target Start/End: Original strand, 42818376 - 42818524
Alignment:
Q  7 agatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  42818376 agatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaa 42818475  T
Q  107 gctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  42818476 cctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 42818524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 39364113 - 39363959
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  39364113 tttttgagatatgataaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcgtaggaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataat 39364014  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| || |||||    
T  39364013 tccaaacctccaaactagaagtgctatgagttcaattaaggtgtttgagagtatt 39363959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 39936477 - 39936642
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||    
T  39936477 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaagaaataattcc 39936576  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  39936577 aaatctcgaaactagaagtactatgagttcaact-aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39936642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 154
Target Start/End: Original strand, 6573520 - 6573672
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6573520 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatt 6573619  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||  |||||||| ||||    
T  6573620 ccaaacctcaaaactagaggtactaggggttcaattaagttgtttaagagtat 6573672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 22237717 - 22237893
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  22237717 tttttgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 22237816  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||   |||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  22237817 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattatgttgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 22237893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18834060 - 18833906
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18834060 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatcaaaaacttatggaataat 18833961  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  18833960 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 18833906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19140347 - 19140185
Alignment:
Q  8 gatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaag 107  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  19140347 gatatgatgcaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaac 19140248  T
Q  108 ctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  19140247 ctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaacagtatttaacctatgttgtga 19140185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11775302 - 11775138
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  11775302 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 11775203  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| |||||||| | ||| |||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  11775202 caaaactagaagtactaggggtttaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttg 11775138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Original strand, 25849068 - 25849274
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgg-ttagttt 258  Q
    |||||||||||| || ||  |||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  25849068 atgttgtgagttaattttaagataggaatggaagttgtttattaagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgagtgttggctaagttt 25849167  T
Q  259 aagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgct 356  Q
    ||||||||||||| |||||   |||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||  || |    
T  25849168 aagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctgtgttgcaagatggt 25849267  T
Q  357 tatgttg 363  Q
    |||||||    
T  25849268 tatgttg 25849274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 5082678 - 5082829
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  5082678 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtctgagtgaaattttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttc 5082777  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  5082778 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 5082829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19699496 - 19699280
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19699496 atgttgtgagttgatcttaggataggaatggaagttgtttattaagttatagatttacagagagcatgaatcaaatgattaatgattgttggttag-ttg 19699398  T
Q  260 agatatt--tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgc-t 356  Q
    |||||||  |||||| |||  |||||||||||||| |||| | |  |||||||||| ||  ||||||||| ||||||| | |||||| || || |||| |    
T  19699397 agatatttatatattgtgttgaaaatgtatgatatggaaattgttattgtttatattatccaagttgttagtattaatgtggctatgatgtaagttgctt 19699298  T
Q  357 tatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19699297 tatgttgttgtctctgct 19699280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 2 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22207855 - 22207702
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  22207855 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaaattaatccaaaacttatggaataatt 22207756  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||| || ||||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  22207755 ccaaacctgaaaactagaagtatcaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 22207702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 29763332 - 29763533
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||||| | |||||    
T  29763332 tttttgagttataatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaatttagaataatcatttctaagttaatccgaaacttatagaataat 29763431  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||   ||| ||  |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||    
T  29763432 tccaaccctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaagatgggaaagagtgtttaacctatgttgtgaattgatcttgggata-gaaatgaagttgtt 29763530  T
Q  200 aat 202  Q
    |||    
T  29763531 aat 29763533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44477004 - 44476858
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  44477004 tatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacct 44476905  T
Q  110 c-aaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  44476904 cgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 44476858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44480266 - 44480120
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  44480266 tatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacct 44480167  T
Q  110 c-aaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  44480166 cgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 44480120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 22584443 - 22584572
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| | |||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||    
T  22584443 ttgttggttaatctaagctacatatattatgtgaaaaatgtatgatattgaaaatatcgttgtttatatcattcaagtggttattattaatgttgctatg 22584542  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  22584543 ttgcaagttgtttatgttgctgtctctgct 22584572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Original strand, 14397604 - 14397720
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14397604 agtgaaatcttatgaaaattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 14397703  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    || ||||||||| ||||    
T  14397704 aaggtgtttaagagtat 14397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 17437784 - 17437935
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  17437784 ttgagatatgatgaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaatttaatccaaaacttatggaataattcc 17437883  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| || || || || || |||||| | ||||||| |||||    
T  17437884 aaatctcaaaactagaaataataggattttaattaaggagtttaagagtatt 17437935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Original strand, 8728409 - 8728554
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc-aaagc 108  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||| ||| |    
T  8728409 tatgatgaaaatactacaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aaacttagggaataattccaaaacc 8728507  T
Q  109 tcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  8728508 tcgaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 8728554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23410035 - 23409925
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23410035 atgttgtgagttgatcttgggatagaaatgaaagttgttattaagttatagatttacagagagcctgaattaaataattaatgattgttggttagtttaa 23409936  T
Q  261 gatatttatat 271  Q
    |||||||||||    
T  23409935 gatatttatat 23409925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23418757 - 23418545
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaa 260  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || | || ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  23418757 atgttgagagttgatcatgggataggagtggaggttgttattaagtcctagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttgattaatttaa 23418658  T
Q  261 gatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctta 358  Q
    ||||||||||| |  |||  ||||  |||||||| |||| |||  |||||||||||||| ||   ||| |||| ||| ||| ||||||||||  || |||    
T  23418657 gatatttatataacgtgttgaaaacatatgatatggaaattattattgtttatatcattcaaaccgttgttatcaatgttgttatgttgcaagatgttta 23418558  T
Q  359 tgttgttgtctct 371  Q
    |||||||||||||    
T  23418557 tgttgttgtctct 23418545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23660804 - 23660688
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23660804 tttttgagatatgatgaaattagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 23660705  T
Q  101 tccaaagctcaaaacta 117  Q
    |||||  ||||||||||    
T  23660704 tccaaccctcaaaacta 23660688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 232 - 374
Target Start/End: Original strand, 17907665 - 17907807
Alignment:
Q  232 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | | |||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  17907665 aaatgattaatg-ttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtggaaaaagtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgatattat 17907763  T
Q  332 taatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  17907764 taatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgttgtctctgct 17907807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 20084101 - 20084238
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||  | |||||    
T  20084101 tttttgagttataatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcagtccaaaacttagagaataat 20084200  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20084201 tccaaacctc-aaactagaagtactaggagtttaattaa 20084238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22483335 - 22483182
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  22483335 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 22483236  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22483235 tccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 22483182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 18815286 - 18815454
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  18815286 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 18815385  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  |||||  |    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  18815386 tccaaacttcaaagtttgt-gtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18815454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 18816925 - 18817093
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  18816925 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataattatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 18817024  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  18817025 tccaaacatcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 18817093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 234 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23889078 - 23888942
Alignment:
Q  234 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatta 333  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  23889078 atgattaatg-ttgttggttaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcgttcaagttgttattatta 23888980  T
Q  334 atattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctct 371  Q
    || | ||| |||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  23888979 atgtagctgtgttgcaagttgtttatgttgctgtctct 23888942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23914503 - 23914381
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  23914503 tatgatgaaaatacttcaagtaggtcctattgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataatttcaaacct 23914404  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    ||||| || |||||||| |||||    
T  23914403 caaaagtagaagtactaggagtt 23914381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 17501513 - 17501376
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||| | ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  17501513 ttttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaaattagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaatattt 17501414  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17501413 ccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 17501376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22344629 - 22344537
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22344629 ttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 22344537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22356289 - 22356197
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22356289 ttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 22356197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 23947521 - 23947414
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgtt 365  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| |    
T  23947521 tatattatgtggaaa-tgtatgatatagaaaatattattgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgct 23947423  T
Q  366 gtctctgct 374  Q
    |||||||||    
T  23947422 gtctctgct 23947414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 232 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 22244758 - 22244617
Alignment:
Q  232 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||||    
T  22244758 aaatgattaatg-ttgttggttaatt-aagctacatatattatgttgaaaatgtatgatatagaaaatattattgtttatatctttcaagttgttattat 22244661  T
Q  332 taatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||| || ||||||||||| |||  |||||||| ||||||||||    
T  22244660 taatgtttctatgttgcaagttgttttatgttgatgtctctgct 22244617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 267 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17217909 - 17217802
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgtt 365  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||| |    
T  17217909 tatattatgtggaaagtgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcatctaagttgttattattaatgttgctatgttgcaagttgttttatgttgct 17217811  T
Q  366 gtctctgct 374  Q
    |||||||||    
T  17217810 gtctctgct 17217802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 36405523 - 36405615
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || ||||||||||||    
T  36405523 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatg 36405615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 20517581 - 20517734
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||| || ||||||||||| ||||  |    
T  20517581 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactgtttctaagtcaacccaaaacttat-ggatcgt 20517679  T
Q  101 -tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
     ||||||  ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20517680 ctccaaacttcaaaact-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 20517734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21399296 - 21399206
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  21399296 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21399206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21793789 - 21793699
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  21793789 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 21793699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 22258767 - 22258920
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |       
T  22258767 ttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgta 22258866  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22258867 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 22258920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 73 - 173
Target Start/End: Original strand, 8414245 - 8414346
Alignment:
Q  73 taagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||    
T  8414245 taagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagt 8414344  T
Q  172 tg 173  Q
    ||    
T  8414345 tg 8414346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 36732987 - 36733080
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  36732987 tttttgagttatgatgaaaatactccaatgaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 36733080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 4381256 - 4381424
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||||||||   |       
T  4381256 tttttgagttacgataaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgaattttc 4381355  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  4381356 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 4381424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23670237 - 23670145
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| || || || ||||||||||||    
T  23670237 tttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaattttattaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatg 23670145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 17978880 - 17978973
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  17978880 tttttgagttatgatgaaaatatttcaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccggataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 17978973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 36305247 - 36305154
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||    
T  36305247 tttttgagttatgataaaaatactccaatgaggtcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtaaacccaaaactcatgg 36305154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 38989045 - 38988984
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 71  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  38989045 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactattt 38988984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 39020142 - 39020081
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 71  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  39020142 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactattt 39020081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 21513907 - 21513816
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||| ||||||    
T  21513907 ttttgagatatgatcaaaatactccaag-aggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaatttatgg 21513816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24907363 - 24907270
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| ||||| || | |||||||| |||||||||||| ||||||| | || ||||| || |||||||||||||    
T  24907363 tttttgagttatgacgaaaatactctaaggaggtttgagtgaaattttatgaaaattccgcataactaattctaagtcaacccaaaacttatgg 24907270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Original strand, 36728056 - 36728156
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| ||||| |||||  ||||||||    
T  36728056 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatgatgcaagttgctattgttgttg 36728154  T
Q  367 tc 368  Q
    ||    
T  36728155 tc 36728156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19140087 - 19140012
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19140087 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 19140012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5760922 - 5760800
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |  ||||||||| ||||    
T  5760922 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgtggttaatattgttatg 5760824  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
     ||||| ||| |  ||||||||||    
T  5760823 atgcaagttgttattgttgttgtc 5760800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 24624256 - 24624171
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaa 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||| ||||||||| |||||| |||| ||||| || ||||||    
T  24624256 ttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtctttgtgcaattttacgaaaattcaacataactatttctaagtgaacccaaaa 24624171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 329
Target Start/End: Original strand, 18302688 - 18302762
Alignment:
Q  257 ttaagatatttatattatgtga--aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttatt 329  Q
    ||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  18302688 ttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatataaattattattgtttatatcattcaagttgttatt 18302762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 233 - 374
Target Start/End: Original strand, 22259063 - 22259203
Alignment:
Q  233 aatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatt 332  Q
    ||||||||||| |||||||||| | | | |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  22259063 aatgattaatg-ttgttggttaatgtgaaatacatatattatgtgaaaag-gtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattatt 22259159  T
Q  333 aatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||  ||| ||||||  || ||| | ||||||||||||||||||    
T  22259160 aatgatgccatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctctgct 22259203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Original strand, 31723340 - 31723422
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||| |||| |||||    
T  31723340 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatgatgcaa 31723422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 16198421 - 16198371
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  16198421 tttgagatatgattaaaatactccacggaggtcttagtgaaattttatgaa 16198371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 22474340 - 22474286
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaa 55  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  22474340 tttttgaattatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaa 22474286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 348
Target Start/End: Original strand, 45471168 - 45471269
Alignment:
Q  246 tgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgt 345  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| || | |||||| ||||||| |    
T  45471168 tgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttattgtgattaatgttgctatat 45471266  T
Q  346 tgc 348  Q
    |||    
T  45471267 tgc 45471269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 22318664 - 22318768
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||| ||| | | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  22318664 ttgttggataatttgagatacatatattacgtggatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatg 22318762  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
    ||||||    
T  22318763 ttgcaa 22318768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 18118628 - 18118720
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||||| |||| || ||| ||||| | ||||| || || | ||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18118628 ttttgagataagatggaattacaccaagtaggtcttggtaaatttttacgaaaattcagcctaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatgg 18118720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 20179251 - 20179314
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20179251 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 20179314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 84 - 148
Target Start/End: Original strand, 21345945 - 21346009
Alignment:
Q  84 aaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  21345945 aaaacttagggaataattccaaatctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 21346009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 39936740 - 39936815
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  || ||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  39936740 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgtggtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 39936815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 4542016 - 4542059
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  4542016 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 4542059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 14397383 - 14397426
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  14397383 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaatttatgaa 14397426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Original strand, 18677707 - 18677750
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18677707 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18677750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 368
Target Start/End: Original strand, 20024993 - 20025113
Alignment:
Q  246 tgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgt 345  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| |||||| |||||||| |||||  | | |||||| |||||||||    
T  20024993 tgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatg-tatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttaatgtgattaatgttgctatgt 20025090  T
Q  346 tgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    ||||| ||| |  ||||||||||    
T  20025091 tgcaagttgttattgttgttgtc 20025113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 94
Target Start/End: Original strand, 45559644 - 45559725
Alignment:
Q  13 gatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||| |||  ||||||||||||| |||||  |||  |||||||| ||||| |||||||    
T  45559644 gatgaaaatactccaaatgagtcttagtaaaactttatgaaaattcaacataattattcctaagttaaaccaaaccttatgg 45559725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 24238885 - 24238857
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24238885 gtactatgagttcaattaatgtgtttaag 24238857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 25757732 - 25757656
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaa 86  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||  |||||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||    
T  25757732 tatgatgaaaatactccaagtgggtcttagcaaaactttatgaaaattcagcataattattcctaagttaaaccaaa 25757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 253; Significance: 1e-140; HSPs: 91)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 31520706 - 31520362
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  31520706 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcatagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatagaataat 31520607  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  31520606 tccaaccctcaaaactgaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaactcatgttgtgagtttatcttgggataggaatggaagttgtt 31520507  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31520506 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaat 31520407  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31520406 atcattgttattatcattcaagttgttattattaatattgttatg 31520362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 363
Target Start/End: Original strand, 18388760 - 18389125
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  18388760 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatctttggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 18388859  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||||| |||||||| || | ||| ||||  || |||||    
T  18388860 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattttactcatgttgagagttgatttttgtataggaatgtaatttgtt 18388959  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  18388960 aataagttatagacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaa 18389059  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttg 363  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||  || ||||||||    
T  18389060 ttattattgtttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttg 18389125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24883975 - 24883690
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24883975 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccctttctaagttaatctaaaacttatggaataat 24883876  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  24883875 tccaaccctcaaaactagaattactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtagtgagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 24883776  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgt 285  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||    
T  24883775 aataagttatagacttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatatattgtgaaagatgt 24883690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Original strand, 10039597 - 10039826
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10039597 tttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 10039696  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10039697 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatcttgggatatgaatggaagttgtt 10039796  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10039797 aataagttatagacttacagagaacctgaa 10039826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 24273722 - 24273891
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24273722 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 24273821  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  24273822 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 24273891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 176
Target Start/End: Original strand, 18358434 - 18358608
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18358434 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 18358533  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  18358534 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatc 18358608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22501374 - 22501177
Alignment:
Q  84 aaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttggga 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22501374 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatcttggga 22501275  T
Q  183 tatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaa 280  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22501274 taggaatggaagttgttaataagttatagacttacagaaagcccgaatcaaatgattaatgtttgttggttagtttaagatatttatataatgtgaaa 22501177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 84 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 22509308 - 22509111
Alignment:
Q  84 aaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttggga 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  22509308 aaaacttatggaataattccaaccctcaaaactagaggtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgtcgtgagttgatcttggga 22509209  T
Q  183 tatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaa 280  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22509208 taggaatggaagttgttaataagttatagacttacagaaagcccgaatcaaatgattaatgtttgttggttagtttaagatatttatataatgtgaaa 22509111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25183774 - 25183603
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25183774 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 25183675  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  25183674 caaacctcaaaactataagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 25183603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26903747 - 26903574
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26903747 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 26903648  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||    
T  26903647 tccaaagctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatattgtgagttg 26903574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 21081436 - 21081607
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21081436 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 21081535  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  21081536 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 21081607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 23338872 - 23339037
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23338872 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 23338971  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23338972 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 23339037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 41301436 - 41301612
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41301436 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgagataat 41301535  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  41301536 tccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 41301612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 22173491 - 22173667
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22173491 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 22173590  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22173591 tcaaaccctcaaaactcaaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 22173667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 27472842 - 27472666
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  27472842 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 27472743  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  27472742 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacttatgttatgagttgatc 27472666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20915694 - 20915540
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20915694 tttttgagatatgatgaaaatactccaatgatatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataat 20915595  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||    
T  20915594 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagctgtttaagagtatt 20915540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21915202 - 21915038
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  21915202 tatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacct 21915103  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  21915102 caaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 21915038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9975515 - 9975349
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  9975515 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 9975416  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  9975415 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 9975349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 21073190 - 21073364
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21073190 tttttgagttatgatggaaatactccaagtaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaattcaaaacttatgggataat 21073289  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||  |||||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  21073290 tccaatactcaaaactagaagcaatatgagttcaattaaggtatttcagagtatttaacccatgttgtgagttga 21073364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 36839757 - 36839591
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36839757 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataatcgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 36839658  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  36839657 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 36839591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 5 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 17307072 - 17306928
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  17307072 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttcttagttaatccaaaacttaaggaataattcca 17306973  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17306972 aaactcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgtttaag 17306928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 5031596 - 5031727
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5031596 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 5031695  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 135  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  5031696 aaacctcaaaactataagtactatgagttcaa 5031727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Original strand, 20590785 - 20590956
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20590785 tttttgagttatcatgaaaatactccaaggaggtcttactgaaatcttatgaaaattcagcataaccctttttaagttaatccaaaacttaagggataat 20590884  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagt 171  Q
    |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||||| |||||    
T  20590885 tccaagactcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtctaagagtatttaacccatgttatgagt 20590956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 34858848 - 34859038
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  34858848 tttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 34858947  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaat 189  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34858948 ttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaat 34859038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 34873910 - 34874100
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  34873910 tttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagagaaatcttaggaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 34874009  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgat-cttgggatatgaat 189  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||||| ||||    
T  34874010 ttcaaacctcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttgatccttgggataggaat 34874100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 9242340 - 9242175
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9242340 tatgatgaaaatactccaagtagatcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 9242241  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9242240 caaaactagaagtaatatgagtgcaactaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 9242175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 43707748 - 43707916
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  43707748 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc-gttctaagttaatctaaaacttatggaataat 43707846  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    || ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  43707847 tcgaaacctcaaaactagaagtaccatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 43707916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 23068916 - 23069067
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23068916 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 23069015  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  23069016 aaacctcaaaactataagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatt 23069067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 27484936 - 27485087
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27484936 ttgagatataatgaaaatactccaagtaggtcttagtggaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 27485035  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  27485036 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 27485087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 28349506 - 28349323
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggat--- 97  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||       
T  28349506 tttttgagatatgatggaaatactccaagtaggtcttcgtgaaatcttatgaaaattcagctcaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 28349407  T
Q  98 ------aattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||    
T  28349406 tgggataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgatttga 28349323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 24781306 - 24781472
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  24781306 ttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaatttaatccaaaacttaaggaataatttc 24781405  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  24781406 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagaatatttaacctatgttgtga 24781472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 19662127 - 19662292
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  19662127 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 19662226  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  19662227 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 19662292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25045434 - 25045242
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25045434 atgttgtgagttgatcttgggttaggaatgtaagttgtttattaagttatagacgtacagaaagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttggttta 25045335  T
Q  260 agatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    || ||||||||| |||||   |||||||| ||||| |||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25045334 agttatttatataatgtgttgaaaatgtaagatatggaaattattattgtttatatcattcaagttgttgttattgatgttgctatgttgcaa 25045242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24515769 - 24515621
Alignment:
Q  7 agatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaa 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || |||||||||||||||| || |||| | ||||    
T  24515769 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataatcgtttctacgttaatccaaaacttaaggaataaattcaaa 24515670  T
Q  107 gctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24515669 tctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 24515621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 28652968 - 28653119
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||| || ||||||||    
T  28652968 ttgagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatggaaattcagcataaccgtttttaggttaatccgaaacttaaggaataattcc 28653067  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  28653068 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 28653119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 23969086 - 23969255
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||| |  | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  23969086 tttttgagatacgatgaaaataattaatggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 23969185  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  23969186 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 23969255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 19201666 - 19201818
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaa-tactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||||||     
T  19201666 ttgagatatgatgaaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatttaataattt 19201765  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  19201766 caaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 19201818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 21368696 - 21368565
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| |||||    
T  21368696 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcaacataaccgtttctaagttaatccaaaaattatggaataat 21368597  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  21368596 tctaaacctcaaaactagaagtactaggagtt 21368565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6483099 - 6482953
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  6483099 tatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacct 6483000  T
Q  110 c-aaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  6482999 cgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 6482953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6486566 - 6486420
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||    
T  6486566 tatgatggaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataatttcaaacct 6486467  T
Q  110 c-aaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | ||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  6486466 cgaaaactagaagtattatgaattcaattaaggtgtttaagagtatt 6486420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 6260850 - 6261015
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  6260850 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 6260949  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| || || || ||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6260950 caaaactagaaatattacgagtgaaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 6261015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31345495 - 31345379
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31345495 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttataggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaatt 31345396  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    || ||||||||| ||||    
T  31345395 aaggtgtttaagagtat 31345379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 9785162 - 9785024
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9785162 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 9785063  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||| | ||||||    
T  9785062 caaaactagaagaactaggagtttaattaaggggtttaa 9785024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 262 - 359
Target Start/End: Original strand, 6478025 - 6478122
Alignment:
Q  262 atatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttat 359  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6478025 atatatatattatgtggaaaatggatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgttgcaagttgcttat 6478122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 74 - 174
Target Start/End: Original strand, 30643817 - 30643918
Alignment:
Q  74 aagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagtt 172  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  30643817 aagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggctcaaaactaaaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagtt 30643916  T
Q  173 ga 174  Q
    ||    
T  30643917 ga 30643918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 47 - 174
Target Start/End: Original strand, 2524240 - 2524366
Alignment:
Q  47 ttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttt 146  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || || |||    
T  2524240 ttatgaaaattcagcataacc-tcta-aagttaatctaaaacttatgggataattccaaacctcaaaactataagtactatgagttcaatcaaggtattt 2524337  T
Q  147 aagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  2524338 aagagtatttaacctatgttgtgagttga 2524366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 21316125 - 21316293
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  21316125 tttttgagttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcttaactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgtc 21316224  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  21316225 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21316293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22690269 - 22690176
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22690269 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 22690176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22694865 - 22694772
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  22694865 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctatgtcaacccaaaacttatgg 22694772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 25587150 - 25587243
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  25587150 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 25587243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29113950 - 29113782
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||  ||||| || |||||||||||||  |  |    
T  29113950 tttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactattcctaagtcaacccaaaacttatggattgtt 29113851  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  |||||| |    ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  29113850 tccaaacttcaaaa-tttgtgtactattagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 29113782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27860637 - 27860499
Alignment:
Q  234 atgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatta 333  Q
    |||||||||| ||||||||||  || |||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |    
T  27860637 atgattaatg-ttgttggttaaattgagatagatatattatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattatca 27860540  T
Q  334 atattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     | ||| |||||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  27860539 gtgttgttatgttgcaagttgttgatgttgttgtctttgct 27860499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 87
Target Start/End: Original strand, 21335917 - 21336002
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaa 87  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||    
T  21335917 ttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaagttttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaa 21336002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 23610065 - 23609972
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||    
T  23610065 tttttgagttatgatgaaaatactcgaaggaggtcttagtgaaattttatgcaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaacctatgg 23609972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44071834 - 44071706
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||||| | ||| ||||    
T  44071834 ttgttggataatttgagatacatatattatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcgttcaagttgttattattagtgttgttatg 44071736  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  44071735 ttgcaagttgttgatgttgttgtctttgct 44071706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 1384149 - 1384241
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||| ||||| ||  |||||||||||    
T  1384149 tttttgagttatgatgaaaatactccaacgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccacataactatttctaagtcaactcaaaacttatg 1384241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27851921 - 27851793
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| ||| | |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||| | | ||| ||||    
T  27851921 ttgttggttaatttgaaatacatatattatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattcaagttgttattatcagtgttgttatg 27851823  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  27851822 ttgcaagttattgatgttgttgtctttgct 27851793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14693529 - 14693456
Alignment:
Q  270 attatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  14693529 attatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgatg-ttatatcattcaagttgttatgattaatgttgctatg 14693456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22686428 - 22686335
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| ||| | || |||||||||||||    
T  22686428 tttttgaggtatgatgaaaacactctaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcacaactatttctaattcaacccaaaacttatgg 22686335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 28345539 - 28345632
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| |||| ||||  || | |||||||||||    
T  28345539 tttttgagttatgatgaaaacactccaaggaggtcttggtgaaattttacgaaaattccgcataactatttctaagccaaccaaaaacttatgg 28345632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 36839496 - 36839392
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattg-cttatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  36839496 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaatagtgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgtcgtatgttgttgtc 36839398  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  36839397 tctgct 36839392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9975249 - 9975146
Alignment:
Q  272 tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaa-ttgct-tatgttgttgtct 369  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  9975249 tatgtggaaaatgtatggtatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtaaagttgttgtatgttgttgtct 9975151  T
Q  370 ctgct 374  Q
    |||||    
T  9975150 ctgct 9975146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19358253 - 19358178
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19358253 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 19358178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 27485200 - 27485275
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27485200 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 27485275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Original strand, 18391038 - 18391124
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  18391038 ttgttggttaatttgagctacatatattatgtggaaaatatatgatatcggaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 18391124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 23778758 - 23778852
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatg-aaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| | ||||||| ||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||    
T  23778758 tttttgagttatgatgaaaatactctaaggaggttttagtgaaattttacgaaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaccttatgg 23778852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 3539082 - 3538978
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || || || ||| ||||    
T  3539082 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgttatg 3538984  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
    ||||||    
T  3538983 ttgcaa 3538978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24515508 - 24515404
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgc-aaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||  ||||||||||| || ||| | ||||||||||||    
T  24515508 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattgaagttgttatgattaatgatgctatgttgcgaagttgttgtatgttgttgtc 24515410  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  24515409 tctgct 24515404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Original strand, 10684400 - 10684448
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  10684400 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 10684448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 20261744 - 20261696
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  20261744 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 20261696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22332304 - 22332138
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| ||||  ||||| ||||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |  ||    
T  22332304 ttttgagttatggcgaaaacactccaatgaggtcttggtgaatt-ttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttt 22332206  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||  |||||| |    ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  22332205 ccaaacttcaaaaat-tgtgtactatgagttcaattaaggtgttcaagagtatttaacctatgttgtga 22332138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Original strand, 23969353 - 23969416
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  23969353 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttataccattcaagttgttattattaat 23969416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 334
Target Start/End: Original strand, 5031860 - 5031922
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaa 334  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  5031860 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaa 5031922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 374
Target Start/End: Original strand, 10897467 - 10897625
Alignment:
Q  217 cagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatt-atgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatca 315  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | ||| || ||  |||||| ||||| ||||  |||| |||| |||||||   |||||||| ||    
T  10897467 cagagagtctgaattaaatgattaatg-ttgttggtaaatttgagctacatatatttatgtggaaaagatatgttatacaaaatattcatgtttatacca 10897565  T
Q  316 tttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgct-tatgttgttgtctctgct 374  Q
    |  |||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  10897566 tccaagtggttattattaatgttgctatgattcaagttgttgtatgttgttgtctctgct 10897625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 31345706 - 31345656
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||    
T  31345706 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaatttttatgaa 31345656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20272944 - 20272855
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaactta 91  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||| || || | |||  |||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||    
T  20272944 ttttgagttatgatggaaatactccaagtaggtcttggtaaatttttaccaaaattcagcataaccgtttctatgtcaatccaaaactta 20272855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 28653232 - 28653336
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  28653232 ttatgtggaaaaggtatgatatagataataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 28653330  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  28653331 tctgct 28653336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 24781570 - 24781645
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  24781570 ttatgtggaaaagatatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 24781645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 22259293 - 22259211
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| |||||||| || | ||| ||| ||||||||||    
T  22259293 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatattattcaagttgttgttgtaaatgttgttatgttgcaa 22259211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 23136099 - 23136056
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  23136099 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 23136056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 38967999 - 38967956
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  38967999 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 38967956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 50
Target Start/End: Complemental strand, 40911909 - 40911863
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttat 50  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  40911909 ttgagatataatgaaaatactccaatgagatcttagtgaaatcttat 40911863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17306809 - 17306705
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||   ||| |||||  ||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  17306809 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatattg-ttataaaattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 17306711  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  17306710 tctgct 17306705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22686309 - 22686260
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  22686309 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22686260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 24897840 - 24897881
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24897840 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24897881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 24900323 - 24900364
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24900323 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24900364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 24902800 - 24902841
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24902800 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24902841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 24905277 - 24905318
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24905277 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24905318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 53
Target Start/End: Original strand, 24907752 - 24907793
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  24907752 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 24907793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25141407 - 25141307
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||| ||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  25141407 tatattatgtgaatattttatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgttg 25141309  T
Q  367 tc 368  Q
    ||    
T  25141308 tc 25141307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 90
Target Start/End: Complemental strand, 24302300 - 24302220
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaactt 90  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||  || |||  || |||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  24302300 tatgatgaaaatactacaagtaggtcttgatgcaattgtacgaaaattcagcataactatttttaagtgaacccaaaactt 24302220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 3 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8651 - 8277
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8651 tttgatatatgatgaaaatactccaaggaagtcttggtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 8552  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaa 201  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||     
T  8551 caaacctcaaaactacaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatattgggataggaatgaaagttgttat 8452  T
Q  202 taagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaaat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||| |    
T  8451 taagttatagacttacagagagcctgaatcaaattattaatgattgttggttagtttaagatatttatataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaatt 8352  T
Q  300 atcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  8351 attattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 8277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 13535 - 13166
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  13535 tttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataat 13436  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  13435 tcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagttgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgattggaagttgtt 13336  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||||    
T  13335 attaagttatagacttatagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgcaaatgtatgatatagaaa 13236  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||  || ||||||||||||    
T  13235 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgtttctatgttgcaagatgtttatgttgttgt 13166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 16353 - 15977
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353 tttttgcgatatgatgaaaatactttaaggaggtcttagtgaaatcttatgaatattcagcataatcatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 16254  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||  || |||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||||||    
T  16253 tctcaacctcaaaactagaagtactatgagttcaatgaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgagataggaatgaaagttgtt 16154  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||   ||||||||||||||||||    
T  16153 attaagttatagacttacagagagtctgaattaaatgattaatgattgttggttaatttaagatatttatataaggtgttgtaaatgtatgatatagaaa 16054  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||    
T  16053 ttattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgatgtttctgct 15977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8825 - 8687
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8825 tttttgaaatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacatatgagataat 8726  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8725 tcccaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaa 8687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17841 - 17627
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataa-gttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||   ||||||||||||| |||||||||||||     
T  17841 atgttgtgagttgatcttggcataggaatggaagttgtttataaagttatagatttacagagaccctgatcaaaatgattaatgagtgttggttagtttg 17742  T
Q  260 agatattta--tattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattg-ct 356  Q
    |||||||||  |||||| |  ||| |||||||||| |||| | |  |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||||||| |||  |    
T  17741 agatatttatgtattatattgaaattgtatgatatggaaattgttattgtttatatcatccaaggtgttagtattaatgtggctatgttgcaagttgttt 17642  T
Q  357 tatgttgttgtctct 371  Q
    ||||||| |||||||    
T  17641 tatgttgctgtctct 17627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Original strand, 159413 - 159789
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  159413 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaaattaatccaaaacttatgggataat 159512  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  159513 tcaaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgattaagagtattcaactcatgttgagagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 159612  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   ||||||||||||||  |||    
T  159613 aataagttatagacttacacagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatgaaaa 159712  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     |||  |||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||  || ||||| || ||||||||||    
T  159713 ttattattgtttatatcattcaagttgttattatcgatgttgctatgttgcaagatgtttatgctgctgtctctgct 159789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 2)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6006 - 5630
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| | ||||||||||| || |||||    
T  6006 tttttgagttatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttcaaagtcagtccaaaacttagggaataat 5907  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5906 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttgatcttgggatatgaatataagttgtt 5807  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatatta--tgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    | ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||||||    
T  5806 attaagttatagacttacagaaaggttgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttttataaggtgttgaaaatgtatgatatagaaa 5707  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
     |||  |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  5706 ttattattgtttatataattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 5630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 94
Target Start/End: Original strand, 7254 - 7338
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||| ||||||    
T  7254 tatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaacccaaaatttatgg 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 12923 - 12554
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12923 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 12824  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||| ||||  || |||||    
T  12823 tccaatccataaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcaactcatgttgagagttgatattggaataggaatgaaaattgtt 12724  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  12723 aataagttatagacttacagatagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaa 12624  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
     |||  |||||||||||||| ||||| |||||||  || ||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  12623 ttattattgtttatatcattcaagttattattatcgatgttgatatgttgcaagatgtttatgttgttgt 12554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 374
Target Start/End: Original strand, 3407 - 3782
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3407 tttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 3506  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagtt-gatcttgggatatgaatagaagttgtta 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||||| |  |||||| || |||  |||||||||     
T  3507 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagttggcccttggggta-gaaacgaagttgttt 3605  T
Q  201 ataa-gttatagacttacagagagcctgaa--tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||  |||  |   | ||| ||| |||||  | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||    
T  3606 ataatattaatgttgttcagggagtctgaaattaagatgattaatgattgttagttagtttaagatatttatattatgagggaaatgtgtgatatagaaa 3705  T
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  3706 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattactaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 3782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 2)
Name: scaffold0825
Description:

Target: scaffold0825; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 95 - 350
Target Start/End: Original strand, 1372 - 1628
Alignment:
Q  95 gataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  1372 gataattccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttgatcttgggataggaatgaaa 1471  T
Q  194 gttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatata 293  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  1472 gttgttaataagttttagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattattggttagtttaagatatttatattatgtggaaaatgtttgatata 1571  T
Q  294 gaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1572 gaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgatatgttgcaa 1628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0825; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 1097 - 1173
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1097 tttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagt 1173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 297
Target Start/End: Original strand, 36034 - 36333
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  36034 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggttttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 36133  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  36134 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtattcgactcatgttgagagttgatcttgggataggaatgaaagttgtt 36233  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaa 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||   |||||||||||||| ||||    
T  36234 aataagttatagacttacagagagcctaaatcaaatgattaatgattgttggttagtttgagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatggaaa 36333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0635 (Bit Score: 178; Significance: 6e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0635
Description:

Target: scaffold0635; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 7473 - 7244
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7473 tttttgagatatgatgaaaatactccagggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 7374  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7373 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgatgtgagttgatcttgggatatgaatggaagttgtt 7274  T
Q  200 aataagttatagacttacagagagcctgaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7273 aataagttatagacttacagagaacctgaa 7244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 173; Significance: 6e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 33 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 21198 - 20862
Alignment:
Q  33 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21198 gtctcagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactatgagtt 21099  T
Q  133 caattaatgtgtttaagtgtatt-aacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatc 231  Q
    ||||||| |  |||||| | ||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||        |||||||||||||||    
T  21098 caattaagggttttaagagcatttaacctatgttgtgagtttatcttgggataggaatgtaagttgttattaagtta--------cagagagcctgaatc 21007  T
Q  232 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttatt 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  21006 aaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatataatgtgttgaaaatgtatgatatagaaattattattgtttatatcattcaagttgttatt 20907  T
Q  330 attaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  20906 attgatgttgctatgttgcaagatgtttatgttgttgtttctgct 20862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 4 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 77273 - 77033
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  77273 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaattcaaaacttatgggataattcc 77174  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat 202  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  77173 aaacctcaaaactagaagtacaatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtgagttgatcttgggataggaatagaagttgttatt 77074  T
Q  203 aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatg 243  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  77073 aagttatagacttacagataacctgaatcaaatgattaatg 77033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 152673 - 152849
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  152673 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaactgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 152772  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  152773 tccaacccttaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtaagttgatc 152849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 176372 - 176208
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  176372 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 176273  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  176272 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctaagttgtgagttg 176208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 169019 - 168855
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  169019 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 168920  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||| | ||||||| ||| |||||| | |||||||||||    
T  168919 caaaactagaagtactaggggttcaattaaggagtttaagagtatttaacctaagttgtgagttg 168855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 14 - 374
Target Start/End: Original strand, 11983 - 12347
Alignment:
Q  14 atgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaa 113  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  11983 atgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatttagcataactgtttcaaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacctcaaa 12082  T
Q  114 actaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgt-attaacccatgttgtgag-ttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataa-gttata 210  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||| |||  |||||| || |||  |||||| || ||||  |||      
T  12083 actagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtaattaacctatgttgtgagtttgtccttggggta-gaaacgaagttatttataatattaat 12181  T
Q  211 gacttacagagagcctgaa--tcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtt 308  Q
    |   | |||||||  ||||  | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12182 gttgttcagagagtgtgaaattaagatgattaatgattgtaagttagtttaaaatatttatattatgagggaaatgtgtgatatagaaaatatcgttgtt 12281  T
Q  309 tatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12282 tatatcattcaaattgttattattaatattgctatgttgcaagttgcttatgttgttgtccctgct 12347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Original strand, 136348 - 136430
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  136348 tatattatgtgaaaattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttattaatgttattatgttgcaa 136430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Original strand, 28831 - 29000
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28831 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 28930  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  28931 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaaaagtatttaacctatgttgtga 29000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 29
Target Start/End: Complemental strand, 10024 - 9996
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaag 29  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10024 tttttgagatatgatgaaaatactccaag 9996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0515 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0515
Description:

Target: scaffold0515; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4621 - 4446
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4621 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 4522  T
Q  103 caaag----ctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  4521 caaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 4446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4621 - 4446
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4621 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 4522  T
Q  103 caaag----ctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||     |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  4521 caaattaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 4446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 126; Significance: 7e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 7e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 105501 - 105320
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  105501 tttttgagatatgatgaaaatacaccaaggaggtctaagtgaaattttatgaaaattcagcataacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 105402  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttggg 181  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  105401 tccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaagtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatcttggg 105320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 162873 - 162699
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  162873 tttttaagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacatatgggataat 162774  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||    
T  162773 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaattcatgttgtgagttga 162699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 12558 - 12382
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12558 tttttgagatatgaagaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 12459  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  12458 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagagtatttaacccattttgtgagttgatc 12382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1674 - 1505
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674 tttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctaagttaatccaaaacttatgggataat 1575  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  1574 tccaaagctcaaaacaagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 105 - 1
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  105 tttttgagatgtgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcggcataaccaattctatgttaatccaaaacttatgggataat 6  T
Q  101 tccaa 105  Q
    |||||    
T  5 tccaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1783 (Bit Score: 121; Significance: 7e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold1783
Description:

Target: scaffold1783; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 838 - 658
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  838 tttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 739  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatcttgg 180  Q
    |||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||    
T  738 tccaaccctccaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagattatttaacccatgttatgagttgatcttgg 658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6045 - 5874
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045 tttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 5946  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||| |||||  |||||||||||||    
T  5945 caaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatttaacatatgttgtgagttg 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26515 - 26361
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26515 tttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 26416  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26415 ttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 26361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27897 - 27743
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27897 tttttgagatatgatgaaaatactccaggtaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 27798  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27797 ttcaaagctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 27743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7808 - 7639
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7808 tttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataat 7709  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  7708 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 7639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 14439 - 14270
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  14439 tttttgagttatgatgaaaatactccaagaaggtctttgtgtaattttatgaaaattcagcataattgtttgtaagttaatccaaaacttatggaataat 14340  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  14339 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttagttaaggggtttaagagtatttaacctatgttgtga 14270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 21322 - 21153
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21322 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaagaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 21223  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |  ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  21222 tttaattctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 21153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 5 - 173
Target Start/End: Original strand, 70295 - 70464
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  70295 tgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatcaaaaacttatgagataattcca 70394  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    || |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  70395 aaactcaaaactagaagtactataagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttatgagttg 70464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 72000 - 71934
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc 67  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  72000 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcaggataacc 71934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10808 - 10636
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattta-taagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10808 tttgagatatgatgaaaatactccaaagaggacttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattttctaagttaatccaaaacttaagggataatt 10709  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  10708 ccaaaactcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 903 - 815
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || || |||||||||||||    
T  903 tgagttatgatgaaaatactc-aatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatgg 815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 6409 - 6321
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| |||| || || || |||||||||||||    
T  6409 tgagttatgatgaaaatactc-aatgaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcagaactatttctatgtcaacccaaaacttatgg 6321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 406
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  582 tttttgagatatgatgaaaatactccaaaaaggtcttagtgaaatcttgtgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 483  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||    
T  482 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagcatttaacccgtgttgtgagttgatc 406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Original strand, 22234 - 22405
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  22234 tttgacatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaagattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattt 22333  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  22334 caaacctaaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 22405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 21668 - 21497
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21668 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaatccagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattc 21569  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  21568 caaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttcacctatgttgtgagttg 21497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 124023 - 124171
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  124023 tttttgagatattatgaaaatactccaatgaggtgttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtgaatccaaaacttatgggataat 124122  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  124123 ttcaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaag 124171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 111067 - 110902
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  111067 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatccaaaacttgtgggataattccaaggct 110968  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  110967 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 110902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 146318 - 146167
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| ||||  |||||||     
T  146318 ttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagaataacagtttctaagttaatccaaaacatatgtaataattca 146219  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  146218 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaggatgtttaagagtatt 146167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 245 - 342
Target Start/End: Complemental strand, 146082 - 145987
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgcta 342  Q
    |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||  |||| |||||||||  |||| |||||||||||| ||||||    
T  146082 ttgttgattaatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaataatgttg-ttatatcatccaagtggttattattaatgttgcta 145987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 428
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  605 ttttttagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 506  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatctt 178  Q
     ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  505 accaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatctt 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 7722 - 7576
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  7722 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtcaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataat 7623  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgttta 147  Q
    || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7622 tcaaaagctcaaaattagaagtactatgagttcaattaaggtgttta 7576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 9419 - 9593
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9419 tttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaatcttatgataattcagcacaaccgtttccaagttaatccaaaacttatgggataat 9518  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9519 tccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtacaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 9593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2927 - 2754
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||    
T  2927 tttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatcc-aagcttatgggataat 2829  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  2828 tccaaagctcaaaactagaaatactacgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 2754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Original strand, 449 - 609
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  449 tatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 548  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtga 169  Q
    |||||||  |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  549 caaaactcgaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Original strand, 5752 - 5896
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  5752 tatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 5851  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  5852 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 5896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 15052 - 15218
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15052 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattcc 15151  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  15152 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 24110 - 24276
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24110 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatctaaaacttatggaataattcc 24209  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  24210 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 24276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 15249 - 15353
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||    
T  15249 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatattgttatg 15347  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
     |||||    
T  15348 atgcaa 15353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 24307 - 24411
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||    
T  24307 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatattgttatg 24405  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
     |||||    
T  24406 atgcaa 24411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 586 - 433
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  586 tttttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagtataaccatttctaagttaatccaaaacttatggaataat 487  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  486 tccaaagctcaaaactagaagtactttgagttcaattagggtgtttaagagtat 433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16162 - 15990
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16162 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 16063  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagtt 172  Q
    |||||  |||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  16062 tccaaccctcaaaactagaaatactataagttcaattaaggtgtttaatagtatttaacctatgttgtgagtt 15990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 6614 - 6466
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6614 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataatcatttataagttaatccaaaacttatgggataat 6515  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6514 ttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaag 6466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 359
Target Start/End: Original strand, 1984 - 2100
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatat--tatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgcta 342  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||  |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1984 ttgttggttaacttaagctatttatataatatgtggaaaatgtatgagatagaaaatatcgttgttattatcattcaagttgttattattaatattgcta 2083  T
Q  343 tgttgcaaattgcttat 359  Q
    |||||||| ||| ||||    
T  2084 tgttgcaagttgtttat 2100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16433
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  16524 tttgagttatgatgaaaatactccaaggatgtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 16433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0672 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0672
Description:

Target: scaffold0672; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 8019 - 8186
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8019 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 8118  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgt 167  Q
    | |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||||||    
T  8119 ttcaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttatgattatttaacccatgttgt 8186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21844 - 21677
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844 tttttgagatatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccgtttctaagttaatccaaaacttatgggataat 21745  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgt 167  Q
    |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||||||||    
T  21744 tccaaccctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtttttaagagtatttaacccatgttgt 21677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23158 - 22984
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23158 tttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacatccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 23059  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23058 tccaatgctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaatccatgttgtgagttga 22984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 6 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33923 - 33794
Alignment:
Q  6 gagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  33923 gagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaa 33824  T
Q  106 agctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 135  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  33823 acctcaaaactataagtactatgagttcaa 33794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 17720 - 17868
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17720 tttttgagttatgatggaaatactctagggatgtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacagccatttctaagttaatccaaaacttatgggataat 17819  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  17820 tccaaggctcaaaactagaagtaatatgagttcaattaaggtgtttaag 17868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 33 - 149
Target Start/End: Original strand, 23385 - 23501
Alignment:
Q  33 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23385 gtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggctcaaaactagaagtaatatgagtt 23484  T
Q  133 caattaatgtgtttaag 149  Q
    ||||||| |||||||||    
T  23485 caattaaggtgtttaag 23501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Original strand, 22642 - 22765
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaag-tcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataa 99  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | || || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22642 tttttgagttatgatggaaatactctaggggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataa 22741  T
Q  100 ttccaaagctcaaaactaaaagta 123  Q
    |||||| ||||||||||| |||||    
T  22742 ttccaaggctcaaaactagaagta 22765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #6
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 161 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 3143 - 3055
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgtt 249  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3143 atgttgtgagttgaccttgggatagaaatggaagttgttactgagttatagatttacatagagcctgaatcaaatgattaatgattgtt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 111; Significance: 6e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 78650 - 78484
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  78650 ttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 78551  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||||    
T  78550 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactaaggtgttaaagagtatttaacctatgttgtga 78484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 138
Target Start/End: Original strand, 6140 - 6277
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  6140 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttataaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 6239  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatta 138  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6240 tccaaagatcaaaactagaagtactatgagttcaatta 6277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 5179 - 5330
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5179 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 5278  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  5279 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 5330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 374
Target Start/End: Original strand, 5443 - 5547
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||  || ||| | ||||||||||||    
T  5443 ttatgtggaaaaagtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgttgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtc 5541  T
Q  369 tctgct 374  Q
    ||||||    
T  5542 tctgct 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11234 - 11101
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11234 tttttgatatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatctaaaacttatgggataat 11135  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttca 134  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11134 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttca 11101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 11020 - 10891
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||    
T  11020 ttgttggttaatttgagttacatatattatgtggaaaatgtatgatatatatgatattgttctttatatcattcaagttgttattattaatgtttctatg 10921  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  10920 ttgcaagttgtctatgttgttgtctctgct 10891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11286 - 11113
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  11286 tttttgagatatgatgaaaatacgccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 11187  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  11186 ttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 11113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9644 - 9475
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||    
T  9644 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattaagcataactatttctaagttaatccaaaacttatgagacaat 9545  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||| |||||||||    
T  9544 tccaaggctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggtgtttaagattatttaacctatgttgtga 9475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 82575 - 82400
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  82575 tttttgagatatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaattcaaaacttatgggataat 82476  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
     ||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  82475 accaaccctcaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtg-ttaagagtatttaacccatgttgtgagttgatc 82400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 3 - 127
Target Start/End: Original strand, 29662 - 29786
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29662 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataattc 29761  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactat 127  Q
    |||| |||||||||| |||||||||    
T  29762 caaacctcaaaactagaagtactat 29786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 120496 - 120345
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  120496 ttgagatatgatgaaaatacttcaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 120397  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  120396 aaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattaaggggtttaagagtatt 120345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 933 - 1099
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  933 ttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattca 1032  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  1033 aaacctcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 1099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 1130 - 1234
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||  | ||||||||| ||||    
T  1130 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgctgttaatattgttatg 1228  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
     |||||    
T  1229 atgcaa 1234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 7851 - 8017
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7851 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 7950  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  7951 aaacttcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 8017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 347
Target Start/End: Original strand, 8122 - 8191
Alignment:
Q  277 gaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  8122 gaaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 8191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 138364 - 138190
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  138364 tttttgagttatgatggaaatactctagggaggtcttcgtgaaaccttatgaaaattcagcacaaccatttctaagttaatccaaaacttatgtgataat 138265  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||    
T  138264 tccaaagctcaaaactagaagtactatgagttcaattaaggtgtttacgagtatttaatccatgttgtgagttga 138190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 95608 - 95525
Alignment:
Q  266 ttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgca 349  Q
    |||||||||||| || |||  ||||||||||| |||  ||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  95608 ttatattatgtggaagatggttgatatagaaattattattgcttatatcattcaagatgttattatttatattgctatgctgca 95525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 176
Target Start/End: Original strand, 1573 - 1748
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1573 tttttgagatatgatgaaaatactccatggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaacttatggaataat 1672  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  1673 tccaacccccaaaactagaagtactatgagttcaattaaggt-tttaagattatttaacccatgttgtgagttgatc 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27889 - 27735
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | |||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||| |||||    
T  27889 tttttgagatatgatgaaaataattccaggaggtcttactgaaattttatgaaaattcagcaaaaccgtttctaagtcaatccaaaacttatggaataat 27790  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27789 tccaaacctcaaaactagaagtactatgagtacaattaaggtgtttaagagtatt 27735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 161 - 372
Target Start/End: Original strand, 53258 - 53471
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53258 atgttgtgagttgatcctgggataggaatgaaagttgtttatcaagttataaacttacagagggcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 53357  T
Q  260 agatatttatattatg--tgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctt 357  Q
    |||||||||||| |||  |  |||||||||||||| |||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||    
T  53358 agatatttatataatgtattgaaaatgtatgatatggaaattattatt-tttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgttt 53456  T
Q  358 atgttgttgtctctg 372  Q
    |||||| ||||||||    
T  53457 atgttgctgtctctg 53471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 104; Significance: 9e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 4 - 135
Target Start/End: Original strand, 106669 - 106800
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  106669 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 106768  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 135  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  106769 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaa 106800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 103; Significance: 4e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 22257 - 22423
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  22257 ttgagatatgatgaaaatgctccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattcc 22356  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  22357 aaacctcaaaacttgaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 22423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 29313 - 29145
Alignment:
Q  9 atatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagc 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||   |    
T  29313 atatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggac 29214  T
Q  109 tcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  29213 taaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatc 29145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 9 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 34778 - 34610
Alignment:
Q  9 atatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagc 108  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||| |||||||||||||||||||||   |    
T  34778 atatgatgaaaatactccacggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttccatgttaatcaaaaacttatgggataattccaggac 34679  T
Q  109 tcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttgatc 176  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  34678 taaaaactagaagtattatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaagccatgttgtgagttgatc 34610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2046 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold2046
Description:

Target: scaffold2046; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 454 - 325
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  454 ttgttggttaatttaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatttcattcaagttgttattattaatattgctatg 355  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  354 ttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 5 - 169
Target Start/End: Original strand, 13003 - 13168
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  13003 tgagatatgttgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcacaaccatttttaagttaatccaaaacttaaggaataatttca 13102  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  13103 aacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 13168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 13264 - 13339
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13264 ttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 13339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 19531 - 19606
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||| ||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19531 ttatgtggaaaaggtataatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttg 19606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 103 - 169
Target Start/End: Original strand, 19368 - 19435
Alignment:
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  19368 caaacctcaaaactaaaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 19435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 133330 - 133165
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  133330 tatgatgaaaatactcaaagtaggtcttagggaaatcttatgaaaattcagcacaaccattttcaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 133231  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||   ||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  133230 caaaactagaagtaatatgagttcaattaagaggtttaagtgtatttaactcatgttgtgagttga 133165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 133636 - 133801
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  133636 tatgttgaaaatactccaagtaggtcttagggaaatcttatgaaatttcagcacaaccatttccaagttaatccaaaacttatgggataattccaaggct 133735  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    ||||| || ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  133736 caaaattagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 133801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 10 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 29738 - 29578
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  29738 tatgatgaaaatactacaaggaatacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacct 29639  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  29638 caagactagaagtactaagagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 29578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 445 - 593
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  445 tttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataat 544  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  545 tccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaag 593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 5749 - 5897
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  5749 tttttgagatatgatgaaaatactacaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtatatccatttctaagttaatccaaaacttatggaataat 5848  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5849 tccaaacctcaaaactagaaatactatgagttaaattaaggtgtttaag 5897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Complemental strand, 1524 - 1480
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaat 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1524 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaat 1480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 347
Target Start/End: Original strand, 645 - 745
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||    
T  645 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaaaag-gtatgatatagaaaataatgttg-ttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 742  T
Q  345 ttg 347  Q
    |||    
T  743 ttg 745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 347
Target Start/End: Original strand, 5949 - 6049
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||||  |||||||  ||||||||    
T  5949 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaaaag-gtatgatatagaaaataatgttg-ttatatcatccaagttgtagttattaacgttgctatg 6046  T
Q  345 ttg 347  Q
    |||    
T  6047 ttg 6049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 8769 - 8920
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  8769 ttgagatatgatgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 8868  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  8869 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 8920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Original strand, 9033 - 9106
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgt 345  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  9033 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttatatcattcaagttgttattattaatgatgctatgt 9106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 143199 - 143048
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  143199 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 143100  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  143099 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 143048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 169463 - 169591
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  169463 ttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 169562  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  169563 aaacctcaaaactagaagtactaggagtt 169591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8103 - 7937
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  8103 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 8004  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  8003 aaacctcaaaactagaagtactatgagtttaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 7937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 8152 - 8266
Alignment:
Q  24 tccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagta 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||     
T  8152 tccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataattgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtt 8251  T
Q  124 ctatgagttcaatta 138  Q
    |||||||||||||||    
T  8252 ctatgagttcaatta 8266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 267 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 7664 - 7588
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||| ||||    
T  7664 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaaattgttgttgttaatgttgttatg 7588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 163 - 372
Target Start/End: Original strand, 627 - 839
Alignment:
Q  163 gttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaag 261  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  627 gttgtgagttgatcttgggataggaatgaaagttatttattaagttatagatttacaaagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttggtttgag 726  T
Q  262 atatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttat 359  Q
    |||||| ||| |||||    |||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||    
T  727 atatttgtataatgtgttggaaatgtatgatatgaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattattgatgttgctatgttgcaagatgtttat 826  T
Q  360 gttgttgtctctg 372  Q
    |||||||||||||    
T  827 gttgttgtctctg 839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 345 - 474
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  345 ttgttggttaatttaagctatatattttatgtgaaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatg 444  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  445 ttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 67683 - 67535
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  | |||||    
T  67683 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagagaataat 67584  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    |||||| || ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||    
T  67583 tccaaatctgaaaactagaagtactaggatttcaattaaggtgtttaag 67535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 62433 - 62522
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaactt 90  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||    
T  62433 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaaccaaaactt 62522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 94
Target Start/End: Original strand, 116869 - 116961
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    ||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||   ||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  116869 ttttgagttatgaggaaaccattccaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattctatataactatttctaagtcaacccaaaacttatgg 116961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 13131 - 13282
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13131 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 13230  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| ||||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  13231 aaacctcaaaaatagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 13282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 6 - 139
Target Start/End: Original strand, 8118 - 8251
Alignment:
Q  6 gagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaa 105  Q
    ||||||||||| || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8118 gagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaactcaatccaaaacttatggaatatttccaa 8217  T
Q  106 agctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    | |||||||||| || ||||| ||||| ||||||    
T  8218 aactcaaaactagaaatactaggagtttaattaa 8251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 126334 - 126183
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  126334 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattct 126235  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  126234 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 126183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 33042 - 32889
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| || || || |||||||||||||  |       
T  33042 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactttttttaggtcaacccaaaacttatggattgtc 32943  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  32942 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 32889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 10910 - 11064
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  10910 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaattttatgaaaattcagaataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 11009  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    || ||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  11010 tcgaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 11064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17316 - 17223
Alignment:
Q  33 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtacta 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| |||||||||| ||||||||    
T  17316 gtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattttaaatctcaaaactagaagtacta 17223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 16947 - 16825
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  16947 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaaaattgtttgatatagaaa-tattcttgttcatatcatttaagttgttgttattaatgttgttatg 16849  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    |||||||||| |  ||||||||||    
T  16848 ttgcaaattgttattgttgttgtc 16825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 5)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2150 - 1984
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  2150 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 2051  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    | | |||||||||| ||||| ||||||||| ||||  || |||||| ||| |||||| |||||||||    
T  2050 atacctcaaaactagaagtattatgagttctattagggtatttaagggtatttaacctatgttgtga 1984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 4 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 5495 - 5413
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  5495 ttgagatatgatgaaaatactctaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaa 5413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 5229 - 5137
Alignment:
Q  78 taatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5229 taatccaaaacttaaggaataatttcaaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 5137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4887 - 4783
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||| | ||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| ||||    
T  4887 ttgttgattaatttgagatacatatattatgtgaatattgtataatatataaa-tattgttgtttatatcatttaaattgttgttgttaatgttgttatg 4789  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
     |||||    
T  4788 atgcaa 4783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5055 - 4955
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttg 366  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| ||| |||| ||||| ||| |  ||||||||    
T  5055 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttattgttgttaatgttgttatgatgcaagttgttattgttgttg 4957  T
Q  367 tc 368  Q
    ||    
T  4956 tc 4955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Original strand, 23669 - 23799
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23669 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaaccttatgaaaattcagcataagcgtttctaaattaatccaaaacttatgggataattc 23768  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttc 133  Q
    |||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  23769 caaccctcaaaactagaagtactatgagttc 23799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39688 - 39519
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  39688 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggagggcttagtgaaatcttatgaaaattcaggataatcgtttctatgttaatccaaaacttatggaataat 39589  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    | |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||   |||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  39588 ttcaaacctcaaaactagaagtactatgatttcaattaggatgtttaagagtatttaacctatgttgtga 39519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1766 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1766
Description:

Target: scaffold1766; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 132
Target Start/End: Original strand, 1160 - 1288
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  1160 ttgagatatgatgaaaatactctaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataatttc 1259  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagtt 132  Q
    ||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  1260 aaacctcaaaactagaagtactaggagtt 1288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 7555 - 7411
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  7555 tatgttgaaaatactccaaagaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 7456  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  7455 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtat 7411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 10380 - 10423
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaa 44  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10380 tttttaagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaa 10423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Original strand, 64532 - 64680
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  64532 tttttgagatatgatgaaaatactccaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttgtggaataat 64631  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaag 149  Q
    | |||| |||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||    
T  64632 ttcaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaaggtgtttaag 64680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31502 - 31386
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31502 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaatccttaaaactagaagttctatgagttcaatt 31403  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    || ||||||||| ||||    
T  31402 aaggtgtttaagagtat 31386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 31730 - 31680
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  31730 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 31680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1489 - 1342
Alignment:
Q  8 gatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaag 107  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1489 gatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaatttagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaac 1390  T
Q  108 ctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  1389 ctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 1342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 7055 - 7206
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7055 ttgagatattatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 7154  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  7155 aaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 7206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22633 - 22478
Alignment:
Q  15 tgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaa 114  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  22633 tgaaaatactccaaggaggtcgtagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataattccaaacctcaaaa 22534  T
Q  115 ctaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat-taacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||    
T  22533 ctagaagtactaggagtttaattaaggtgtttaagagtatctaacctatgttgtga 22478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23710 - 23618
Alignment:
Q  279 aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtctc 370  Q
    |||| ||||||| |||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||    
T  23710 aaaaggtatgatgtagaaaataatgttgtt-ataccatttaagttgttatcattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtctc 23618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33469 - 33334
Alignment:
Q  39 gtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatta 138  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  33469 gtgaaatcttatgaaaattcagaataaccatttctaagttaatccaaaacttatgagataattccaaacctcaaaactagaagcactatgagttcaatta 33370  T
Q  139 atgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttg 173  Q
    | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  33369 aggtgtttaagagtatttaacctatgttgtgagttg 33334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 33698 - 33648
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||    
T  33698 tttgagatatgatgaaaatactccgaggaggtcttagtgaatttttatgaa 33648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 58334 - 58183
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| || || ||||||||    
T  58334 ttgagatctgatgaaaatactccaaggagatcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataagcgtttctaagttaatccaaaacataaggaataattcc 58235  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||    
T  58234 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaactagggtgtttaagagtatt 58183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 58070 - 57997
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgt 345  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  58070 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccattcaagttgttattattaatgatgctatgt 57997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 5 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 21237 - 21094
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21237 tgagatatgatgaaaatactccaagtagatcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcca 21138  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  21137 aacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 21094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 1293 - 1155
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  1293 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggatatcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaataat 1194  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  1193 tccaaacctcaaaactagaagtactaggggttcaattaa 1155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 10392 - 10530
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| | |||||    
T  10392 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagcataaacgtttctaagttaatccaaaacttatagaataat 10491  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  10492 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 10530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 161 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 397925 - 397720
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttgggatatgaatagaagttgtt-aataagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagttta 259  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||||  ||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  397925 atgttgtgagttgattatgggataggaatgaaagctgtttaataagttatagactttcagagagcctgaattaaatgattaatgattgttggttagttca 397826  T
Q  260 agatatttatattatgtg--aaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgctt 357  Q
    |||||||||||| |||||    |||||||||||||  ||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||| || ||    
T  397825 agatatttatataatgtgttggaaatgtatgatatgaaaattattattgtttatatcattcaagttgttattcttgatgttgctattttgcaaaatgttt 397726  T
Q  358 atgttg 363  Q
    ||||||    
T  397725 atgttg 397720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 245 - 331
Target Start/End: Original strand, 127503 - 127589
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||    
T  127503 ttgttggttaatttgagctacatatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaagttgttattat 127589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5168 - 5039
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5168 ttgttggttaatttaagctatatattttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatg 5069  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5068 ttgcaagttgcttatgttgttgtctctgct 5039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3379 - 3250
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3379 ttgttggttaatttaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttataacattcaagttgttattgttaatattgctatg 3280  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3279 ttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 3250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6964 - 6835
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  6964 ttgttggttaatttaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttgtttatatcatttgagttgttattattaatgttgctatg 6865  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  6864 ttgcaagttgcttatgttgctgtctctgct 6835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0153 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0153
Description:

Target: scaffold0153; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4570
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||    
T  4686 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttagggaataat 4587  T
Q  101 tccaaagctcaaaacta 117  Q
    |||||| ||||||||||    
T  4586 tccaaacctcaaaacta 4570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7099 - 6948
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7099 ttgatatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttcttagttaatccaaaacttatggaataattcc 7000  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  6999 aaacctcaaaactagaagtactaagagtttaattaaggggtttaagagtatt 6948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 21654 - 21503
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21654 ttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttggtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattcc 21555  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  21554 aaaactcaaaactagaagtattaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 21503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0802 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0802
Description:

Target: scaffold0802; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 5130 - 5284
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  5130 tttttgagatatgatgaaaatacttcaagaaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcctaacagtttctaagttaatccaaaacttatggaatgat 5229  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||||| |||||    
T  5230 tccaaacctcaaaactagaagttctaggggttcaattaaggtgtttaagagtatt 5284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0632
Description:

Target: scaffold0632; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 751 - 585
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| || ||||| | ||| || ||||||||    
T  751 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataactgtttctaaggtagtccaatatttaaggaataattcc 652  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  651 aaacctcaaaactagaagtactatgagtccaactagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0632; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 479 - 424
Alignment:
Q  279 aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaat 335  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  479 aaaaggtatgatatagaaaataacgtt-tttataccattcaagttgttattattaat 424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Original strand, 5798 - 5936
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  5798 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 5897  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||    
T  5898 caaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaa 5936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 6 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 789 - 660
Alignment:
Q  6 gagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaa 105  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  789 gagatatgataaaaatactccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcaacataaccgtttctaagttaattcaaaacttaaggaataattccaa 690  T
Q  106 agctcaaaactaaaagtactatgagttcaa 135  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  689 acctcaaaactataagtactatgagttcaa 660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 10 - 174
Target Start/End: Original strand, 2199 - 2364
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  |||  ||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||    
T  2199 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagggaaattttatgaaaattcagcaaaacattttccaagttaatcaaaaactggtgggataattccaaggct 2298  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtgagttga 174  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2299 caaaactagaagtaatatgagtgcaattaaggtgtttaagagtatttaacccatgttgtgagttga 2364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6121
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  6250 ttgttggttaatttaagctatatattttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatg 6151  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6150 ttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 8402 - 8273
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8402 ttgttggttaatttaagctatatattttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtattgttgtttatatcattcaagttattattattaatattgctatg 8303  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  8302 ttgcaagttgtttatgttgttgtctctgct 8273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 154
Target Start/End: Original strand, 19951 - 20068
Alignment:
Q  37 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaat 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  19951 tagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaagttctatgagttcaat 20050  T
Q  137 taatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||| ||||||||| ||||    
T  20051 taaggtgtttaagagtat 20068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 19724 - 19774
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  19724 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 19774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 22 - 135
Target Start/End: Original strand, 9711 - 9824
Alignment:
Q  22 actccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaag 121  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||    
T  9711 actccaaggaggtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaaggaataattccaaacctcaaaactagaag 9810  T
Q  122 tactatgagttcaa 135  Q
    ||||||||||||||    
T  9811 tactatgagttcaa 9824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 9956 - 10031
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||| || || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9956 ttatgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttg-ttgtaccattcaagttgttattattaattatgctatgttg 10031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Original strand, 40933 - 41062
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  40933 ttgttggttaatttaagctatatattttatgtggaaaatgtatgatatagaaagtatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgatatg 41032  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  41033 ttgcaagttgcttatgttgctgtcactgct 41062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 39631 - 39515
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  39631 agtgaaatcttaagaaaattcaggataaccatttctaagttaatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactagaatttctatgagttcaatt 39532  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    || ||||||||| ||||    
T  39531 aaggtgtttaagagtat 39515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 21350 - 21285
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataac 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21350 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataac 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 39855 - 39809
Alignment:
Q  7 agatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  39855 agatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaacttttatgaa 39809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0429 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0429
Description:

Target: scaffold0429; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 256 - 371
Target Start/End: Original strand, 2709 - 2824
Alignment:
Q  256 tttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgc 355  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  2709 tttaagctatatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatatcattgtttatatcattcaagttgttatttttaatattgctatgttgcaagttgc 2808  T
Q  356 ttatgttgttgtctct 371  Q
    |||||||| |||||||    
T  2809 ttatgttgctgtctct 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 10 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 3850 - 3712
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  3850 tatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattcagcataactgtttctaagttaatccaaaacttatggaataattccaaacct 3751  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaa 148  Q
    |||||||| ||| |||| ||||| |||||| | ||||||    
T  3750 caaaactagaaggactaggagtttaattaaggggtttaa 3712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 246 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3221 - 3093
Alignment:
Q  246 tgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgt 345  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  3221 tgttggttaatttaagctatatatattatggggaaaatgtatgatatagaaaatgtcgttgtttatatcattcaagttgttgttattaatattgctatgt 3122  T
Q  346 tgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    ||||| |||||||  ||| ||||||||||    
T  3121 tgcaagttgcttaaattgatgtctctgct 3093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 1297 - 1131
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   |||    
T  1297 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctcc 1198  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1197 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 1131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 888 - 830
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgtt 326  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  888 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 79; Significance: 8e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 4 - 169
Target Start/End: Original strand, 186971 - 187137
Alignment:
Q  4 ttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcc 103  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |   |||    
T  186971 ttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaaatccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtctcc 187070  T
Q  104 aaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  187071 aaacctcaaaactagaagtactatgagttcaattagggtgtttaagtgtatttaacctatgttgtga 187137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 326
Target Start/End: Original strand, 187380 - 187438
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgtt 326  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  187380 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattattgtttatatcattcaagttgtt 187438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 161 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3701 - 3482
Alignment:
Q  161 atgttgtgagttgatcttggg--atatgaatagaagttgttaat-aagttatagacttacagagagcctgaatcaaatgattaatgattgttggttagtt 257  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||| ||||  |||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3701 atgttgtgagttgatcttgcgcgataggaatgaaagttgtttattaagttatagatttacagagaccctgaatcaaatgattaatgagttttggttagtt 3602  T
Q  258 taagatatttata--ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgc 355  Q
    | |||||||||||  ||||||  |||||||||||||| |||| | |  |||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |  ||||||||||| ||||    
T  3601 tgagatatttatactttatgttgaaaatgtatgatatggaaattgttattgtttatatcatccaagttgttagtatcaatgtgactatgttgcaagttgc 3502  T
Q  356 -ttatgttgttgtctctgct 374  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  3501 tttatgtttttgtctctgct 3482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0200
Description:

Target: scaffold0200; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 38 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17952 - 17836
Alignment:
Q  38 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaatt 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  17952 agtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttctaagtttatccaaaacttatgggataataccaaccctcaaaactataagttctatgagttcaatt 17853  T
Q  138 aatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||  |||||||| ||||    
T  17852 aagatgtttaagagtat 17836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0200; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 18180 - 18130
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  18180 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 18130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11748 - 11594
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||| || || |||||    
T  11748 tttttgagttattatcaaaatactccaaggaggtcttagcgaaatcttatgaaaattcagcacagccgtttctaagttaatccaaaacctagggaataat 11649  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||  ||||||||| |||||    
T  11648 tccaaacctcaaaactagaagtattaggagtttaattacggtgtttaagagtatt 11594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 3 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4007 - 3871
Alignment:
Q  3 tttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattc 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||  ||| ||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  4007 tttgagatatgatgaaaatactccatggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtttaacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataattc 3908  T
Q  103 caaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||| |||||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  3907 caaacctcaaaactggaagtactaggagtttaattaa 3871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 267 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 3786 - 3710
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||| ||||    
T  3786 tatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgttatg 3710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 30192 - 30048
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||    
T  30192 tatgatgaaaatactacaaggagtacttagtgaaattttatgaaaattcagcataaccgtttctaagttaatccaaaacttaggaaataattccaaacct 30093  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtat 154  Q
    ||| |||| ||||| || ||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  30092 caagactagaagtaataggagtttaattaaggtgtttaagagtat 30048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0962 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0962
Description:

Target: scaffold0962; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 280 - 371
Target Start/End: Original strand, 1272 - 1363
Alignment:
Q  280 aaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctct 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  1272 aaatgtatgatatataaaatatcgttgtttatatcattcaagttgttattattaatattgctatgttgtaagttgcttatgttgctgtctct 1363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18753 - 18600
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||  |       
T  18753 ttttcgagttatgatgaaaatactccaaggaagtcttagagaaatcttatgaaaattctgcataactatttctaagtcaatccaaaacttatggattgtc 18654  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18653 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 18600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 67; Significance: 1e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 169027 - 168889
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||| ||||| ||||||||||||| || |||||    
T  169027 tttttgagatatgatgaaaatactctaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttagtataacagtttctaagtcaatccaaaacttagggaataat 168928  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  168927 tccaaacctctaaactggaagtactaggagtttaattaa 168889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 245 - 362
Target Start/End: Original strand, 34099 - 34216
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| ||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34099 ttgttggttaatttgagttacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaagatattgttgtttatatcattcaagttgttattattaatgttgctatg 34198  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgtt 362  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  34199 ttgctagttgtttatgtt 34216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0684 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0684
Description:

Target: scaffold0684; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 91 - 1
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaactta 91  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  91 tttttgagatatgatggaaatagtccaaggaggtcttagtgaaatcttaggaaaattcagtataaccttttctaagttaatccaaaactta 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 245 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 59687 - 59565
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| || ||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||  ||| ||||    
T  59687 ttgttggttaattcaagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattgttttttatatcattcgagttgttattattaacgttgttatg 59588  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgt 367  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  59587 ttgcaagttgtttatgttgttgt 59565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 66495 - 66649
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| || |||| |||| ||||| || |||||||||||||  |       
T  66495 tttttgagttatgatgaaaacactccaagtaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcctaactatttctaagtcaacccaaaacttatggactgtc 66594  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||   ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  66595 tccaagcttcaaaactagaagtactaggagttcaattaaggtgcttaagagtatt 66649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 191 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 109563 - 109423
Alignment:
Q  191 gaagttgttaataa-gttatagacttacagagagcctgaatcaaa-tgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatg 288  Q
    ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  109563 gaagttgtttataaaggtatagccttacagagagtctgaattaaaatgattaatg-ttgttggttaatttgagatacatatattatgtggaaattgtatg 109465  T
Q  289 atatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattat 331  Q
    || ||| | ||||   |||| |||||||| |||||||||||||    
T  109464 atgtag-agatattaatgttcatatcattcaagttgttattat 109423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 65444 - 65536
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || ||||||||||||    
T  65444 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatg 65536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 589 - 444
Alignment:
Q  226 tgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgt 325  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| | ||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  589 tgaattaaatgattaatg-ttgttggtaaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgt 491  T
Q  326 tattattaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttgtctct 371  Q
    ||||||| || |||||| |||| || |||  ||||||||||||||||    
T  490 tattattcatgttgctacgttgtaagttgttttatgttgttgtctct 444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 226 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8844 - 8699
Alignment:
Q  226 tgaatcaaatgattaatgattgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgt 325  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| | ||| || ||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||    
T  8844 tgaattaaatgattaatg-ttgttggtaaatttgagctacatatattatgtggaaaatgtatgatatagaaaatattattgtgtatatcatctaagttgt 8746  T
Q  326 tattattaatattgctatgttgcaaattg-cttatgttgttgtctct 371  Q
    ||||||| || |||||| |||| || |||  ||||||||||||||||    
T  8745 tattattcatgttgctacgttgtaagttgttttatgttgttgtctct 8699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Original strand, 2244 - 2406
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||| | ||||| || || | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||    
T  2244 ttttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatattt 2343  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtattaacccatgt 164  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||   ||||||| || |||||| ||||    
T  2344 ccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaagaggtttaagagttttaacctatgt 2406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 10499 - 10636
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||| | ||||| || || | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||    
T  10499 ttttgagatatggtggaattaccccaagtaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatattt 10598  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| |||||||||| ||| |||| ||||| ||||||    
T  10599 ccaaacctcaaaactagaagaactaggagtttaattaa 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1204 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1204
Description:

Target: scaffold1204; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 814 - 951
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||| | ||| ||    
T  814 ttttgagatatgatggaattaccccaagcaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatacaaaacttatagaatattt 913  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  914 ccaaacctcgaaactagaagtactaggagtttaattaa 951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 8094 - 7957
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||| || || | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||  ||  ||    
T  8094 ttttgagatatgatggaattaccccaagaaagtcttggtaaatttttatgaaaattcagcataaccgtttctaagtcaatccaaaacatatgaaatgttt 7995  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  7994 ccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 7957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0401 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0401
Description:

Target: scaffold0401; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8408 - 8315
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  8408 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattctgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 8315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 245 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 66354 - 66226
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    |||||||||| ||| |||||  ||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||    
T  66354 ttgttggttaatttgagatacatatatgatgtggaaattgtatgatatagaaa-tattgttgttcatatcattaaagttgttattattaatgttgttatg 66256  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  66255 ttgcaagttgttgatgttgttgtctttgct 66226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 169
Target Start/End: Original strand, 3059 - 3153
Alignment:
Q  76 gttaatccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  3059 gttaatccaaaacttatggaataattccaaaactcaaaactagaagtattatgagttcaattagggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Original strand, 2516 - 2580
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataa 65  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2516 tttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtaaaatcttatgaaaattcagcataa 2580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0468 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0468
Description:

Target: scaffold0468; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 11682 - 11819
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||| || |||| |||||||||||  ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |  ||    
T  11682 ttttgagttatgatggaaatactccaaggcggtcttggtaaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttt 11781  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  11782 ccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 11819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18117 - 18210
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||    
T  18117 tttttgagttatgatgaaaatactccaagcaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatgg 18210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 7318 - 7411
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || || ||||||||||    
T  7318 tttttgagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaagtttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaaccccaaacttatgg 7411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 14467 - 14424
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  14467 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 18589 - 18682
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||    
T  18589 tttttgatttatgatgaaaatacttcaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattcggcataactatttctaagtcaaaccaaaacttatgg 18682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26104 - 26011
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||    
T  26104 tttttgagctatgatgaaaataccccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaactgatgg 26011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 121 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25985 - 25936
Alignment:
Q  121 gtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  25985 gtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 25936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 164
Target Start/End: Original strand, 11671 - 11833
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||||||||||| || || ||  ||||| | ||||| || || | ||||| ||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||| ||| ||    
T  11671 ttttgagatatggtggaattaacccaagcaggtcttggtaaatttttatggaaattcagcataaccgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatattt 11770  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtattaacccatgt 164  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||   ||||||| || |||||| ||||    
T  11771 ccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaagaggtttaagagttttaacctatgt 11833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 56565 - 56412
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| || || || |||||||||||||  |       
T  56565 ttttggagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtaaaattttatgaaaattccgcataactatttctaggtcaacccaaaacttatggattgtc 56466  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  56465 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 56412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 368
Target Start/End: Original strand, 2577 - 2765
Alignment:
Q  183 tatgaatagaagttgttaataa-gttatagacttacagagagcctgaatcaaa-tgattaatgattgttggttagttta-agatatttatattatgtgaa 279  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||| |||||||| |||  |||||  ||||||||||| |    
T  2577 tatgaatggaagttgtttataaaggtatagcctttcagagagtctgaattaaaatcattaatgat-gttggttaattttgagatacatatattatgtgga 2675  T
Q  280 aaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattatta-atattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | |||||||| |  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||||    
T  2676 aattgtatgatatagaaaatattgttgttcatatcattcaaatcgttattatcagttgttgctatgttgcaagttgtttatgttgatgtc 2765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 10289 - 10132
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||| || || |||          || |||||||||||||||| |||||    
T  10289 tttttgagatatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaatt-ttatgaaaagtccgcctaa----------gtcaatccaaaacttatggaataat 10201  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtg 168  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||| || ||| |||||| ||||||||    
T  10200 tccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttgagagtatttaacctatgttgtg 10132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 62307 - 62214
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | || || || || |||||||||||||    
T  62307 tttttgagttatgatgaaaatagtccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactacttctaggtcaacccaaaacttatgg 62214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 825 - 767
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattca 59  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  825 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgacattttatgaaaattca 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 139
Target Start/End: Original strand, 13243 - 13377
Alignment:
Q  5 tgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattcca 104  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| || |||||||||||||  |  | |||    
T  13243 tgagttatgatgaaaacactcgaaggaggtcttggtgaaattttatgaaaattccgcataactatttctaagtcaacccaaaacttatggattgttccca 13342  T
Q  105 aagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||  ||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  13343 aacttcaaaactataagtattacgagtttaattaa 13377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8083 - 8176
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| || |||||||||||||    
T  8083 tttttgagttatgaagaaaataccacaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaattccgcataactatttcttagtcaacccaaaacttatgg 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34849 - 34685
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||| ||    || |||||||||||||  |       
T  34849 ttttttagttatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttatgaaaataccgcataactatttcta----aacccaaaacttatggattttc 34754  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgtga 169  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  34753 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatttaacctatgttgtga 34685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 269 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34594 - 34517
Alignment:
Q  269 tattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| ||| || |||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||    
T  34594 tattatgtgaatattttatgatatagaaa-tattgttattcatatcattcaagttgttgttgttaatgttgctatgttg 34517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Original strand, 35989 - 36072
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatg 93  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||    
T  35989 tatgatgaaaatactcaaaggatgtcttagtgaaattttataaaaattccgcataactatttctaagtcaactcaaaacttatg 36072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1817 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1817
Description:

Target: scaffold1817; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 371
Target Start/End: Original strand, 127 - 228
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtc 368  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| | ||||||||||||    
T  127 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttgtt-ataccatttaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaaattgttgtatgttgttgtc 225  T
Q  369 tct 371  Q
    |||    
T  226 tct 228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 274 - 374
Target Start/End: Original strand, 154 - 255
Alignment:
Q  274 tgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg-caaattgct-tatgttgttgtctct 371  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||  || ||| | |||||||||||||||    
T  154 tgtggaaaatgtatgatatagaaaataatgttgtt-atatcattcaagttgttattattaatgatgctatgttgtgaagttgttgtatgttgttgtctct 252  T
Q  372 gct 374  Q
    |||    
T  253 gct 255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 2477 - 2411
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataacc 67  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| || ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  2477 tttttgagttatgatgaaaatactacaaagaggtcttagtgaagttttatgaaaattcagcataacc 2411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 81 - 155
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2451
Alignment:
Q  81 tccaaaacttatgggataattccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| |||||    
T  2377 tccaaaacttatggaataattccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaaggggtttaagagtatt 2451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 372
Target Start/End: Original strand, 133 - 207
Alignment:
Q  298 atatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgcttatgttgttgtctctg 372  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  133 atattgttgtttatatcattcgagttgttattattaacgttgctatgttgcaagttgtttatgttgctgtctctg 207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 32831 - 32695
Alignment:
Q  2 ttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataatt 101  Q
    |||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||  | || | ||||||||||| ||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||| ||  ||    
T  32831 tttttagatatgatggaattaccccaagcaagtcttgataaatttttatgaaaatt-agcataatcgtttctaaatcaatccaaaacttatggaatgttt 32733  T
Q  102 ccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaa 139  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  32732 ccaaacctcaaaactagaagtactaggagtttaattaa 32695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 7851 - 7910
Alignment:
Q  12 tgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccattt 71  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||    
T  7851 tgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaaattttacgaaaattccgcataactattt 7910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1160 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1160
Description:

Target: scaffold1160; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 274 - 121
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||||||||| |||||||||||  ||||||| |||| || || || | |||||||||||  |       
T  274 tttttgagttatgatgaaaatactgtaaggagatcttagtgaaattttatgaaaatttcgcataactatttctaggtcaacctaaaacttatggattgtc 175  T
Q  101 tccaaagctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    ||||||  ||||| ||    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  174 tccaaacttcaaagct-tgtgtactatgagttcaattaaggtgtttaagagtatt 121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 11810 - 11903
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgg 94  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||| || || || | |||||||||||    
T  11810 tttttgagttataatgaaaatactccaagggggtcttagtgaaattttatgaaaatttcacataactatttctaggtcaaccgaaaacttatgg 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2423 - 2362
Alignment:
Q  107 gctcaaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgta-ttaacccatgttgt 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2423 gctcaaaactagaagtactatgagttcaattaagatgtttaagagtatttaacccatgttgt 2362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 245 - 350
Target Start/End: Original strand, 3797 - 3901
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| |||||||| | |||||| || ||||| ||| ||||    
T  3797 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaataatatatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaggttgttgttgttaatgttgttatg 3895  T
Q  345 ttgcaa 350  Q
    ||||||    
T  3896 ttgcaa 3901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0436 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0436
Description:

Target: scaffold0436; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 8547 - 8495
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  8547 tttttgagatatgatgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 8495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 705 - 583
Alignment:
Q  245 ttgttggttagtttaagatatttatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatg 344  Q
    ||||||| || ||| |||||  ||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||| |||||||| || || || ||| ||||    
T  705 ttgttggataatttgagatacatatattatgtgaatattgtatgatatag-aaatattgttgttcatatcattcaagttgttgttgttgatgttgttatg 607  T
Q  345 ttgcaaattgcttatgttgttgtc 368  Q
    || ||| ||| |  ||||||||||    
T  606 ttacaagttgttattgttgttgtc 583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1278 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1278
Description:

Target: scaffold1278; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1033 - 889
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaaattcagcataaccatttataagttaatccaaaacttatgggataattccaaagct 109  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  |||  |||  |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||  |  |||||||       
T  1033 tatgatgaaaatactccaagtgggtcttaggaaaactttacaaaaattcagcataaccatttcttagtcaacccaaagcttatggtttgtttccaaactc 934  T
Q  110 caaaactaaaagtactatgagttcaattaatgtgtttaagtgtatt 155  Q
    |||||||  | ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  933 caaaact-tatgtactttgagttcaattaaggtgtttaagggtatt 889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 24526 - 24579
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaaa 54  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  24526 tttttgagttatgatgaaaatactccaaagagatcttagtgaaattttatgaaa 24579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 347
Target Start/End: Original strand, 9488 - 9563
Alignment:
Q  271 ttatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttg 347  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||  |||| ||||| | || |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  9488 ttatgtggaaaaggtatgatatagaaaataatgttg-ttatacctttcaagttgttattattaatgatgctatgttg 9563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 3552 - 3500
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  3552 tttttgagatatgacgaaaataatccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 3500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 96 - 53
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  96 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 53  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 9761 - 9718
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  9761 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 9718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 21268 - 21225
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  21268 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 21225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 267 - 350
Target Start/End: Original strand, 20755 - 20837
Alignment:
Q  267 tatattatgtgaaaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaa 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| |||||||| ||||| || || | ||| ||| ||||||||||    
T  20755 tatattatgtgaaaattgtatgatatag-aaatattgtcgttcatatcattcaagttattgttgtcaatgttgttatgttgcaa 20837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 53
Target Start/End: Complemental strand, 11809 - 11766
Alignment:
Q  10 tatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaaatcttatgaa 53  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||    
T  11809 tatgatgaaaatactccaaggaggtcttagtgaatttttatgaa 11766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2015 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold2015
Description:

Target: scaffold2015; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 31
Target Start/End: Original strand, 146 - 176
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaagga 31  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  146 tttttgagatatgatgaaaatactccaagga 176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 43
Target Start/End: Original strand, 16451 - 16493
Alignment:
Q  1 tttttgagatatgatgaaaatactccaaggaagtcttagtgaa 43  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16451 tttttgagttatgatgaaaatactccaagtaggtcttagtgaa 16493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 60569 - 60473
Alignment:
Q  279 aaaatgtatgatatagaaaatatcgttgtttatatcatttaagttgttattattaatattgctatgttgcaaattgc-ttatgttgttgtctctgct 374  Q
    |||||||||||||| |||| | |   ||||||||||||  ||||||||| ||||||| | |||||| || || |||| |||||||| ||||||||||    
T  60569 aaaatgtatgatatggaaattgttagtgtttatatcatccaagttgttagtattaatctggctatgatgtaagttgctttatgttgctgtctctgct 60473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 602 times since January 2019
Visitors: 6696