View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0917_low_38 (Length: 320)

Name: NF0917_low_38
Description: NF0917
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0917_low_38
NF0917_low_38
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (93-320)||(66300-66527)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (93-320)||(53559-53786)
scaffold0031 (120-256)||(36041-36171)
scaffold0031 (209-275)||(36352-36419)
scaffold0031 (120-173)||(65838-65891)
[»] chr7 (60 HSPs)
chr7 (93-320)||(11312642-11312869)
chr7 (109-320)||(12318137-12318348)
chr7 (111-320)||(13635354-13635563)
chr7 (113-320)||(15605157-15605365)
chr7 (111-320)||(16583268-16583476)
chr7 (109-315)||(15580701-15580907)
chr7 (120-312)||(12714885-12715077)
chr7 (120-312)||(12718689-12718881)
chr7 (120-312)||(16114262-16114454)
chr7 (120-312)||(16117415-16117607)
chr7 (120-312)||(16907094-16907286)
chr7 (120-312)||(18283387-18283579)
chr7 (120-312)||(39722287-39722479)
chr7 (120-318)||(70652-70850)
chr7 (120-318)||(74761-74959)
chr7 (120-312)||(18279424-18279616)
chr7 (120-312)||(26292416-26292608)
chr7 (120-312)||(12704552-12704744)
chr7 (120-312)||(12723600-12723792)
chr7 (120-318)||(33128-33326)
chr7 (114-320)||(9593361-9593566)
chr7 (114-319)||(18944-19148)
chr7 (112-320)||(11987225-11987433)
chr7 (96-318)||(14429883-14430112)
chr7 (118-318)||(12321628-12321836)
chr7 (176-320)||(9644384-9644529)
chr7 (93-258)||(2832389-2832561)
chr7 (111-319)||(8917439-8917646)
chr7 (111-275)||(13918710-13918872)
chr7 (96-258)||(9751703-9751871)
chr7 (111-275)||(25927433-25927595)
chr7 (114-233)||(7519331-7519447)
chr7 (111-320)||(13149167-13149375)
chr7 (111-275)||(1859016-1859178)
chr7 (115-250)||(16457312-16457446)
chr7 (119-315)||(3271846-3272050)
chr7 (118-254)||(2760153-2760297)
chr7 (111-319)||(13461773-13461981)
chr7 (118-258)||(39267847-39267994)
chr7 (111-254)||(2530342-2530484)
chr7 (93-150)||(14152048-14152105)
chr7 (115-315)||(6801229-6801428)
chr7 (111-320)||(16724516-16724723)
chr7 (111-320)||(17701530-17701737)
chr7 (111-233)||(18425450-18425566)
chr7 (120-256)||(45169961-45170091)
chr7 (240-308)||(2530040-2530108)
chr7 (111-289)||(35151618-35151795)
chr7 (111-319)||(14216927-14217134)
chr7 (111-319)||(15728337-15728544)
chr7 (118-254)||(9446110-9446253)
chr7 (111-170)||(16275504-16275563)
chr7 (119-166)||(42204017-42204064)
chr7 (209-279)||(45170268-45170339)
chr7 (109-155)||(24054477-24054523)
chr7 (254-315)||(16438924-16438985)
chr7 (119-155)||(15211484-15211520)
chr7 (122-229)||(18556996-18557101)
chr7 (96-172)||(19649530-19649606)
chr7 (182-318)||(20569482-20569619)
[»] chr6 (73 HSPs)
chr6 (93-320)||(17804191-17804418)
chr6 (93-320)||(25767053-25767280)
chr6 (113-315)||(22429920-22430122)
chr6 (120-312)||(1644726-1644918)
chr6 (120-320)||(14472292-14472491)
chr6 (120-312)||(19870611-19870803)
chr6 (120-312)||(11566883-11567075)
chr6 (120-312)||(23395089-23395281)
chr6 (120-312)||(8243882-8244074)
chr6 (120-320)||(18955648-18955848)
chr6 (120-320)||(22862967-22863167)
chr6 (120-312)||(23989941-23990133)
chr6 (120-312)||(18917159-18917351)
chr6 (120-312)||(12618738-12618929)
chr6 (114-320)||(12706705-12706910)
chr6 (114-320)||(16741222-16741427)
chr6 (96-318)||(18907111-18907341)
chr6 (111-275)||(23414658-23414820)
chr6 (111-275)||(27556416-27556578)
chr6 (93-233)||(27325581-27325730)
chr6 (111-275)||(5616745-5616908)
chr6 (115-315)||(19662787-19662985)
chr6 (96-260)||(16523330-16523500)
chr6 (115-315)||(2685209-2685407)
chr6 (111-320)||(9482178-9482386)
chr6 (123-320)||(22592689-22592884)
chr6 (176-312)||(21834782-21834916)
chr6 (246-320)||(27415827-27415901)
chr6 (123-316)||(12496333-12496525)
chr6 (118-254)||(20907933-20908076)
chr6 (113-275)||(27416124-27416278)
chr6 (119-254)||(18180517-18180658)
chr6 (119-318)||(19790665-19790873)
chr6 (119-233)||(21766718-21766839)
chr6 (111-256)||(16624144-16624283)
chr6 (120-256)||(31477765-31477895)
chr6 (207-286)||(15894347-15894427)
chr6 (120-256)||(16760316-16760446)
chr6 (120-256)||(22949129-22949259)
chr6 (120-256)||(22953085-22953215)
chr6 (120-256)||(23871573-23871703)
chr6 (120-256)||(23875529-23875659)
chr6 (194-275)||(31478076-31478158)
chr6 (111-319)||(1587617-1587824)
chr6 (96-172)||(15894479-15894555)
chr6 (111-319)||(20803439-20803647)
chr6 (111-170)||(1644300-1644359)
chr6 (119-174)||(19848034-19848089)
chr6 (111-170)||(31478265-31478324)
chr6 (182-275)||(1644455-1644548)
chr6 (118-172)||(27553612-27553666)
chr6 (109-174)||(15041589-15041654)
chr6 (207-286)||(21739940-21740020)
chr6 (96-155)||(22432249-22432308)
chr6 (96-155)||(22438799-22438858)
chr6 (119-174)||(23992454-23992509)
chr6 (118-254)||(22408255-22408398)
chr6 (96-173)||(19873120-19873197)
chr6 (111-289)||(21702300-21702477)
chr6 (121-166)||(23657468-23657513)
chr6 (118-166)||(27567656-27567704)
chr6 (209-275)||(16760068-16760135)
chr6 (96-155)||(19862978-19863037)
chr6 (209-275)||(22948881-22948948)
chr6 (209-275)||(22952837-22952904)
chr6 (209-275)||(23871325-23871392)
chr6 (209-275)||(23875281-23875348)
chr6 (193-252)||(25642137-25642196)
chr6 (118-243)||(22074174-22074307)
chr6 (119-172)||(25603425-25603478)
chr6 (119-172)||(25611763-25611816)
chr6 (119-155)||(16929647-16929683)
chr6 (119-155)||(16965367-16965403)
[»] chr3 (89 HSPs)
chr3 (93-320)||(20461385-20461612)
chr3 (93-320)||(7793234-7793462)
chr3 (93-320)||(327049-327277)
chr3 (111-320)||(15482675-15482884)
chr3 (93-315)||(2897713-2897935)
chr3 (111-320)||(31097439-31097649)
chr3 (120-320)||(30065970-30066170)
chr3 (120-320)||(11854757-11854957)
chr3 (120-312)||(15617398-15617590)
chr3 (120-312)||(7109722-7109914)
chr3 (120-312)||(7113657-7113849)
chr3 (120-312)||(22336743-22336935)
chr3 (120-312)||(27409537-27409729)
chr3 (120-312)||(28949748-28949940)
chr3 (120-320)||(55022891-55023091)
chr3 (120-320)||(11070092-11070292)
chr3 (120-320)||(11165414-11165614)
chr3 (120-312)||(22321688-22321880)
chr3 (120-318)||(14499349-14499547)
chr3 (111-320)||(15849970-15850176)
chr3 (177-320)||(11300396-11300539)
chr3 (96-318)||(18383803-18384032)
chr3 (119-318)||(19725798-19726004)
chr3 (118-318)||(322614-322821)
chr3 (93-258)||(14665398-14665570)
chr3 (93-258)||(14668554-14668726)
chr3 (111-320)||(16797939-16798147)
chr3 (111-275)||(5223077-5223239)
chr3 (111-275)||(15464878-15465040)
chr3 (119-318)||(12496280-12496487)
chr3 (111-320)||(16808766-16808974)
chr3 (96-318)||(11862793-11863023)
chr3 (119-318)||(11298415-11298621)
chr3 (111-275)||(12339479-12339641)
chr3 (115-315)||(17241990-17242188)
chr3 (96-317)||(11851581-11851810)
chr3 (96-286)||(12037871-12038068)
chr3 (111-219)||(8489459-8489564)
chr3 (115-275)||(11300696-11300854)
chr3 (119-318)||(3402842-3403050)
chr3 (123-320)||(38814409-38814605)
chr3 (118-318)||(1982697-1982905)
chr3 (119-318)||(3389822-3390030)
chr3 (123-320)||(3833699-3833895)
chr3 (111-229)||(11854430-11854545)
chr3 (111-256)||(16750543-16750682)
chr3 (104-172)||(12172804-12172872)
chr3 (120-256)||(4111204-4111334)
chr3 (119-318)||(11595025-11595233)
chr3 (120-256)||(15964993-15965123)
chr3 (120-256)||(15968917-15969047)
chr3 (120-256)||(15972841-15972971)
chr3 (120-256)||(19775789-19775919)
chr3 (207-286)||(12172924-12173004)
chr3 (120-256)||(4107352-4107482)
chr3 (120-256)||(37439591-37439721)
chr3 (182-275)||(4589039-4589132)
chr3 (103-172)||(23053128-23053197)
chr3 (111-170)||(4589228-4589287)
chr3 (222-312)||(15060427-15060518)
chr3 (111-170)||(19775360-19775419)
chr3 (194-275)||(19775526-19775608)
chr3 (119-172)||(12511084-12511137)
chr3 (119-172)||(46822292-46822345)
chr3 (120-172)||(11557425-11557477)
chr3 (111-170)||(16696798-16696857)
chr3 (96-174)||(23408428-23408506)
chr3 (221-285)||(23052996-23053061)
chr3 (119-155)||(14878574-14878610)
chr3 (226-285)||(15051655-15051715)
chr3 (96-172)||(15878092-15878168)
chr3 (96-172)||(23077518-23077594)
chr3 (123-170)||(15941938-15941985)
chr3 (209-275)||(15964745-15964812)
chr3 (209-275)||(15968669-15968736)
chr3 (209-275)||(15972593-15972660)
chr3 (96-155)||(17525216-17525275)
chr3 (119-174)||(30029867-30029922)
chr3 (119-318)||(42325964-42326172)
chr3 (119-172)||(15051531-15051584)
chr3 (119-172)||(15060307-15060360)
chr3 (119-172)||(16369423-16369476)
chr3 (119-172)||(16909765-16909818)
chr3 (222-286)||(16909885-16909950)
chr3 (96-172)||(856140-856216)
chr3 (123-209)||(1598477-1598560)
chr3 (222-285)||(16369543-16369607)
chr3 (266-318)||(26190895-26190947)
chr3 (96-144)||(26196500-26196548)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (93-320)||(24735397-24735624)
chr2 (120-320)||(10101530-10101730)
chr2 (120-312)||(24649378-24649570)
chr2 (120-312)||(12901405-12901597)
chr2 (120-312)||(27379326-27379518)
chr2 (120-312)||(27383372-27383564)
chr2 (120-312)||(27601817-27602009)
chr2 (182-320)||(19688641-19688779)
chr2 (120-312)||(24628372-24628564)
chr2 (120-312)||(41530903-41531089)
chr2 (111-275)||(31344890-31345052)
chr2 (207-312)||(15477711-15477816)
chr2 (96-318)||(22811797-22812028)
chr2 (119-318)||(25963603-25963809)
chr2 (115-315)||(22461079-22461277)
chr2 (123-320)||(19928387-19928583)
chr2 (119-275)||(25961464-25961628)
chr2 (111-320)||(23187088-23187296)
chr2 (111-320)||(23598351-23598559)
chr2 (123-315)||(18855351-18855541)
chr2 (118-286)||(21327485-21327662)
chr2 (96-235)||(21916069-21916215)
chr2 (118-257)||(21318584-21318731)
chr2 (119-318)||(40428486-40428694)
chr2 (118-235)||(37524697-37524821)
chr2 (120-256)||(30344946-30345076)
chr2 (119-315)||(24716420-24716622)
chr2 (207-286)||(24673697-24673777)
chr2 (120-256)||(1283410-1283540)
chr2 (118-254)||(24174822-24174965)
chr2 (111-229)||(41666962-41667078)
chr2 (118-166)||(24869902-24869950)
chr2 (118-254)||(24655290-24655433)
chr2 (119-172)||(22799167-22799220)
chr2 (119-174)||(25616212-25616267)
chr2 (237-318)||(21918202-21918284)
chr2 (96-166)||(24673569-24673639)
chr2 (111-169)||(27263285-27263343)
chr2 (111-226)||(60829-60941)
chr2 (96-172)||(23019747-23019823)
chr2 (193-252)||(22740914-22740973)
chr2 (206-318)||(22758601-22758715)
chr2 (96-172)||(40622251-40622327)
[»] chr4 (58 HSPs)
chr4 (93-318)||(36133849-36134074)
chr4 (120-312)||(9556551-9556743)
chr4 (120-320)||(17810293-17810493)
chr4 (120-312)||(4561227-4561419)
chr4 (120-320)||(14757307-14757507)
chr4 (120-312)||(5756831-5757023)
chr4 (114-320)||(1951646-1951851)
chr4 (120-320)||(27534047-27534247)
chr4 (114-319)||(18222264-18222468)
chr4 (111-258)||(22634369-22634516)
chr4 (120-312)||(33742399-33742590)
chr4 (114-319)||(18228739-18228943)
chr4 (114-318)||(17152374-17152576)
chr4 (96-310)||(16487972-16488194)
chr4 (111-275)||(43256343-43256505)
chr4 (119-318)||(16356839-16357045)
chr4 (111-320)||(3412811-3413017)
chr4 (111-320)||(16243285-16243493)
chr4 (93-258)||(20157407-20157579)
chr4 (111-275)||(18236904-18237067)
chr4 (123-315)||(26243555-26243746)
chr4 (96-258)||(13812966-13813135)
chr4 (119-318)||(16348551-16348757)
chr4 (123-320)||(19757486-19757682)
chr4 (123-320)||(19782124-19782320)
chr4 (123-315)||(23139296-23139486)
chr4 (111-312)||(2014791-2014991)
chr4 (246-320)||(43256046-43256120)
chr4 (118-260)||(5338926-5339076)
chr4 (124-320)||(9530460-9530654)
chr4 (120-256)||(10712874-10713004)
chr4 (120-256)||(10926644-10926774)
chr4 (207-286)||(12570142-12570222)
chr4 (120-256)||(14954122-14954252)
chr4 (120-256)||(25689891-25690021)
chr4 (111-227)||(28569423-28569537)
chr4 (96-172)||(12570014-12570090)
chr4 (111-170)||(14708668-14708727)
chr4 (118-318)||(15353193-15353402)
chr4 (182-318)||(25555599-25555736)
chr4 (123-238)||(45938173-45938284)
chr4 (119-318)||(11250447-11250655)
chr4 (120-256)||(12487732-12487862)
chr4 (111-170)||(15224807-15224866)
chr4 (119-166)||(25555503-25555550)
chr4 (111-169)||(18602766-18602824)
chr4 (111-318)||(42997337-42997543)
chr4 (111-167)||(18609340-18609396)
chr4 (217-318)||(23843608-23843711)
chr4 (217-318)||(44675762-44675865)
chr4 (209-275)||(14954433-14954500)
chr4 (119-174)||(15093798-15093853)
chr4 (96-155)||(23843478-23843537)
chr4 (209-275)||(25689643-25689710)
chr4 (194-256)||(15224973-15225035)
chr4 (235-320)||(18602630-18602715)
chr4 (229-286)||(15125071-15125130)
chr4 (182-254)||(16351800-16351871)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (111-320)||(12916-13125)
scaffold0044 (111-320)||(19200-19409)
scaffold0044 (111-226)||(62273-62386)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (113-320)||(16080329-16080536)
chr1 (93-315)||(24782990-24783212)
chr1 (111-320)||(36819193-36819403)
chr1 (120-320)||(1010744-1010944)
chr1 (120-312)||(20228702-20228894)
chr1 (120-312)||(16375351-16375543)
chr1 (120-312)||(21407376-21407568)
chr1 (120-312)||(52639562-52639754)
chr1 (114-320)||(19211883-19212088)
chr1 (120-319)||(23819185-23819383)
chr1 (96-288)||(18182037-18182237)
chr1 (111-275)||(33797295-33797457)
chr1 (114-320)||(20138099-20138304)
chr1 (96-286)||(22449184-22449382)
chr1 (118-286)||(3472843-3473017)
chr1 (115-315)||(12646888-12647086)
chr1 (93-156)||(21313122-21313185)
chr1 (246-320)||(33797680-33797754)
chr1 (124-315)||(18882393-18882583)
chr1 (125-320)||(46975494-46975688)
chr1 (118-311)||(8761526-8761728)
chr1 (119-254)||(17678538-17678679)
chr1 (119-318)||(18393850-18394059)
chr1 (120-256)||(1925084-1925214)
chr1 (120-256)||(20924098-20924228)
chr1 (215-318)||(21022767-21022871)
chr1 (111-256)||(39244096-39244235)
chr1 (111-256)||(39247651-39247790)
chr1 (111-256)||(41388196-41388335)
chr1 (119-310)||(45310261-45310462)
chr1 (207-286)||(22831296-22831375)
chr1 (182-275)||(20229075-20229168)
chr1 (207-286)||(6151976-6152056)
chr1 (118-254)||(3705016-3705159)
chr1 (119-318)||(45489629-45489837)
chr1 (217-318)||(42865097-42865200)
chr1 (119-174)||(21788081-21788136)
chr1 (120-171)||(33050067-33050118)
chr1 (111-228)||(20229208-20229323)
chr1 (119-174)||(22468735-22468790)
chr1 (96-166)||(21022631-21022701)
chr1 (96-153)||(6151848-6151905)
chr1 (119-172)||(20135214-20135267)
chr1 (96-153)||(22831446-22831503)
[»] chr5 (57 HSPs)
chr5 (93-260)||(17410434-17410601)
chr5 (111-320)||(23535474-23535681)
chr5 (120-312)||(20295868-20296060)
chr5 (120-320)||(15236665-15236865)
chr5 (120-312)||(19472613-19472805)
chr5 (96-318)||(21366552-21366781)
chr5 (114-315)||(42805436-42805636)
chr5 (114-319)||(18774219-18774424)
chr5 (115-315)||(26742636-26742835)
chr5 (111-275)||(20911101-20911263)
chr5 (114-319)||(18784062-18784267)
chr5 (115-320)||(20232568-20232771)
chr5 (93-258)||(24767493-24767665)
chr5 (111-275)||(18355970-18356132)
chr5 (115-315)||(24532938-24533136)
chr5 (115-315)||(26666021-26666219)
chr5 (115-315)||(26937618-26937816)
chr5 (123-320)||(33409253-33409449)
chr5 (246-320)||(18356474-18356548)
chr5 (191-320)||(20910685-20910813)
chr5 (119-318)||(20805575-20805780)
chr5 (123-320)||(16674177-16674373)
chr5 (115-315)||(21340657-21340855)
chr5 (119-315)||(23451371-23451573)
chr5 (119-318)||(20766997-20767202)
chr5 (120-256)||(10753385-10753515)
chr5 (123-320)||(17718324-17718520)
chr5 (182-311)||(22757219-22757349)
chr5 (120-185)||(40723607-40723672)
chr5 (119-254)||(1858929-1859070)
chr5 (111-312)||(21885082-21885282)
chr5 (119-318)||(12028451-12028659)
chr5 (119-315)||(23458615-23458817)
chr5 (119-315)||(23462876-23463078)
chr5 (119-296)||(123214-123399)
chr5 (118-166)||(26680604-26680652)
chr5 (118-166)||(26952211-26952259)
chr5 (118-254)||(24221899-24222042)
chr5 (194-275)||(10753122-10753204)
chr5 (122-312)||(26172488-26172677)
chr5 (118-166)||(31342169-31342217)
chr5 (111-170)||(10752956-10753015)
chr5 (119-174)||(17517240-17517295)
chr5 (119-166)||(17919198-17919245)
chr5 (111-169)||(4036232-4036290)
chr5 (111-169)||(25229441-25229499)
chr5 (111-169)||(25293597-25293655)
chr5 (217-318)||(14079278-14079381)
chr5 (96-172)||(23572084-23572160)
chr5 (209-275)||(11220521-11220588)
chr5 (209-275)||(11228930-11228997)
chr5 (209-275)||(11230919-11230986)
chr5 (209-274)||(11226940-11227006)
chr5 (119-172)||(23201383-23201436)
chr5 (119-172)||(23512121-23512174)
chr5 (119-155)||(21873277-21873313)
chr5 (182-254)||(31342219-31342291)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (111-320)||(2558-2766)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (124-320)||(13372-13568)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (111-315)||(18522-18726)
[»] scaffold0029 (6 HSPs)
scaffold0029 (120-312)||(65421-65613)
scaffold0029 (120-312)||(61505-61697)
scaffold0029 (120-320)||(80736-80933)
scaffold0029 (111-170)||(80307-80366)
scaffold0029 (96-172)||(12763-12839)
scaffold0029 (194-254)||(80473-80533)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (111-320)||(173304-173511)
scaffold0001 (118-254)||(422483-422626)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (111-320)||(228258-228466)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (120-320)||(3760-3960)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (120-312)||(4994-5186)
[»] chr8 (54 HSPs)
chr8 (120-312)||(43251834-43252026)
chr8 (120-312)||(19278176-19278368)
chr8 (120-312)||(21972478-21972670)
chr8 (120-312)||(21976563-21976755)
chr8 (114-320)||(16231360-16231565)
chr8 (114-320)||(22044900-22045105)
chr8 (152-312)||(22111904-22112064)
chr8 (118-286)||(20465957-20466133)
chr8 (118-318)||(30643177-30643386)
chr8 (177-319)||(18619555-18619698)
chr8 (191-320)||(22028648-22028778)
chr8 (114-320)||(23834188-23834394)
chr8 (118-318)||(15602903-15603111)
chr8 (111-319)||(30308640-30308846)
chr8 (111-275)||(14398039-14398201)
chr8 (118-318)||(15611355-15611563)
chr8 (119-318)||(16410141-16410347)
chr8 (119-318)||(17926593-17926799)
chr8 (111-256)||(21387086-21387228)
chr8 (123-320)||(23846900-23847096)
chr8 (111-249)||(21383666-21383801)
chr8 (119-318)||(20856311-20856518)
chr8 (123-319)||(15538473-15538668)
chr8 (123-319)||(15531914-15532108)
chr8 (120-256)||(18862600-18862730)
chr8 (120-256)||(21827969-21828099)
chr8 (119-254)||(16861277-16861418)
chr8 (207-286)||(24755842-24755922)
chr8 (120-251)||(21410971-21411096)
chr8 (120-251)||(21805463-21805588)
chr8 (222-318)||(377414-377511)
chr8 (111-289)||(32605223-32605400)
chr8 (96-172)||(24755714-24755790)
chr8 (123-209)||(17828580-17828663)
chr8 (119-174)||(18678141-18678196)
chr8 (119-174)||(32121759-32121814)
chr8 (119-254)||(39094875-39095018)
chr8 (222-286)||(19259500-19259565)
chr8 (118-171)||(22010716-22010769)
chr8 (111-289)||(32598691-32598868)
chr8 (111-171)||(17055412-17055472)
chr8 (119-233)||(23776807-23776929)
chr8 (119-172)||(23648580-23648633)
chr8 (120-172)||(377295-377347)
chr8 (217-318)||(19983223-19983326)
chr8 (209-275)||(18862911-18862978)
chr8 (209-275)||(21828280-21828347)
chr8 (119-172)||(17353984-17354037)
chr8 (119-172)||(19259632-19259685)
chr8 (119-172)||(21162099-21162152)
chr8 (119-172)||(21168772-21168825)
chr8 (205-254)||(22010629-22010678)
chr8 (96-172)||(16184720-16184796)
chr8 (217-318)||(19899225-19899328)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (111-320)||(19902-20110)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (120-312)||(35836-36027)
scaffold0109 (111-319)||(6957-7164)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (120-312)||(58612-58804)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (111-320)||(9550-9759)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (120-320)||(12443-12643)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (114-319)||(18246-18450)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (114-320)||(3415-3620)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (200-320)||(10469-10589)
scaffold0004 (96-173)||(69794-69871)
[»] scaffold0676 (2 HSPs)
scaffold0676 (96-315)||(4430-4657)
scaffold0676 (120-256)||(471-602)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (96-318)||(159-390)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (114-320)||(24853-25059)
scaffold0012 (120-256)||(189332-189462)
scaffold0012 (209-275)||(189643-189710)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (96-318)||(1494-1723)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (96-318)||(42627-42852)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (96-318)||(393-623)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (96-286)||(6227-6425)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (118-318)||(5608-5815)
scaffold0476 (118-318)||(6803-7010)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (96-260)||(17056-17228)
[»] scaffold1461 (1 HSPs)
scaffold1461 (172-320)||(1-150)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (118-318)||(18542-18750)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (114-320)||(23232-23437)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (119-286)||(46645-46820)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (120-315)||(15111-15313)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (119-318)||(9536-9741)
scaffold0104 (119-318)||(1853-2059)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (118-318)||(1376-1584)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (93-258)||(9990-10162)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (111-319)||(6143-6350)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (111-275)||(6693-6855)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (111-275)||(30897-31059)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (199-312)||(901-1014)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (119-318)||(1970-2178)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (111-320)||(9916-10124)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (104-258)||(2913-3074)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (176-318)||(21455-21597)
scaffold0037 (182-254)||(80642-80713)
scaffold0037 (111-170)||(80810-80869)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (111-275)||(20395-20557)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (96-248)||(73725-73883)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (119-318)||(920-1126)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (111-320)||(18367-18575)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (119-318)||(44104-44310)
[»] scaffold0042 (4 HSPs)
scaffold0042 (123-320)||(63878-64074)
scaffold0042 (123-320)||(75762-75958)
scaffold0042 (207-318)||(34796-34908)
scaffold0042 (96-172)||(34960-35036)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (111-275)||(207768-207942)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (246-320)||(71460-71534)
scaffold0003 (113-254)||(71083-71215)
scaffold0003 (118-254)||(414002-414145)
scaffold0003 (123-315)||(139736-139926)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (179-315)||(19181-19317)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (119-318)||(6302-6508)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (96-235)||(289-436)
scaffold0327 (261-318)||(452-509)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (119-318)||(35397-35605)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (123-315)||(36331-36521)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (111-320)||(5885-6093)
[»] scaffold0043 (2 HSPs)
scaffold0043 (111-312)||(77064-77264)
scaffold0043 (119-155)||(18259-18295)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (119-318)||(8583-8791)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (120-256)||(11456-11586)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (123-320)||(9445-9641)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (120-256)||(14042-14172)
scaffold0141 (209-275)||(14353-14420)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (119-318)||(19618-19826)
scaffold0017 (119-318)||(15096-15304)
scaffold0017 (119-155)||(193034-193070)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (118-233)||(7493-7615)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (119-315)||(30634-30836)
scaffold0008 (111-229)||(1889-2005)
[»] scaffold0158 (4 HSPs)
scaffold0158 (207-286)||(2960-3040)
scaffold0158 (207-286)||(6626-6706)
scaffold0158 (96-171)||(2832-2907)
scaffold0158 (96-171)||(6498-6573)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (185-318)||(4111-4245)
scaffold0184 (119-166)||(4273-4320)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (246-296)||(15326-15376)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (207-296)||(13985-14075)
scaffold0056 (96-172)||(14127-14203)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (222-318)||(6964-7061)
scaffold0311 (96-172)||(7128-7204)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (96-233)||(38451-38596)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (182-318)||(192203-192340)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (217-318)||(3872-3975)
scaffold0149 (217-318)||(8303-8406)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (96-176)||(4841-4921)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (111-170)||(9347-9406)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (206-286)||(32554-32636)
scaffold0111 (111-170)||(8512-8571)
scaffold0111 (111-170)||(15656-15715)
scaffold0111 (120-152)||(32459-32491)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (141-256)||(439-548)
[»] scaffold1552 (2 HSPs)
scaffold1552 (235-320)||(490-574)
scaffold1552 (111-169)||(381-439)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (96-172)||(6095-6171)
[»] scaffold0371 (1 HSPs)
scaffold0371 (111-170)||(15350-15409)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (120-256)||(32615-32745)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (111-229)||(16640-16756)
[»] scaffold0439 (2 HSPs)
scaffold0439 (118-172)||(2477-2531)
scaffold0439 (118-172)||(10337-10391)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (118-235)||(33569-33694)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (119-172)||(7311-7364)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (119-172)||(16389-16442)
[»] scaffold1220 (2 HSPs)
scaffold1220 (206-254)||(1909-1957)
scaffold1220 (121-172)||(1817-1868)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (96-172)||(26828-26904)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (96-172)||(21844-21920)
scaffold0210 (96-172)||(29736-29812)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (96-172)||(14664-14740)
scaffold0081 (96-172)||(23679-23755)
scaffold0081 (96-172)||(39103-39179)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (119-166)||(2191-2238)
scaffold0410 (182-254)||(11472-11544)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (206-318)||(15555-15669)
scaffold0297 (119-155)||(15737-15773)
[»] scaffold1873 (1 HSPs)
scaffold1873 (93-123)||(1250-1280)


Alignment Details
Target: scaffold0036 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 66527 - 66300
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66527 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 66428  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66427 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 66328  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  66327 gttaatatcttaaataggtctcattagt 66300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Original strand, 53559 - 53786
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53559 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 53658  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53659 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 53758  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  53759 gttaatatcttaaataggtctcattagt 53786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 36171 - 36041
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  36171 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 36078  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  36077 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 36041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36419 - 36352
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  36419 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 36352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 65891 - 65838
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag 173  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  65891 actcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacag 65838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 60)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Original strand, 11312642 - 11312869
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312642 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 11312741  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312742 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 11312841  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  11312842 gttaatatcttaaataggtctcattagt 11312869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 109 - 320
Target Start/End: Original strand, 12318137 - 12318348
Alignment:
Q  109 atcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  12318137 atcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcttaatc 12318236  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12318237 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 12318336  T
Q  309 ggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||    
T  12318337 ggtctcattagt 12318348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13635563 - 13635354
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  13635563 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgatcat 13635464  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  13635463 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctctgttaatatcttaaatagg 13635364  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
     |||||||||    
T  13635363 cctcattagt 13635354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 113 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15605365 - 15605157
Alignment:
Q  113 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  15605365 tattcagactcatgcattttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatcatt 15605266  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15605265 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaataggt 15605166  T
Q  312 ctcattagt 320  Q
    |||||||||    
T  15605165 ctcattagt 15605157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 16583268 - 16583476
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||    
T  16583268 cttattcagactcatgcaacgtagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttctcgatcat 16583367  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16583368 tcaacaataattcaagtaatgcaatcaatc-ataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttatatagg 16583466  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    ||||||||||    
T  16583467 tctcattagt 16583476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 109 - 315
Target Start/End: Original strand, 15580701 - 15580907
Alignment:
Q  109 atcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||    
T  15580701 atcttattcagactcatgcaacttagttaaataacgatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttttttatc 15580800  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||    
T  15580801 attcaataataattcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttttcagttaacatcctaaata 15580900  T
Q  309 ggtctca 315  Q
    |||||||    
T  15580901 ggtctca 15580907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 12714885 - 12715077
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12714885 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12714984  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  12714985 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 12715077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 12718689 - 12718881
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12718689 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12718788  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  12718789 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 12718881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 16114262 - 16114454
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16114262 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16114361  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  16114362 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 16114454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 16117415 - 16117607
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16117415 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16117514  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  16117515 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 16117607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16907286 - 16907094
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16907286 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16907187  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  16907186 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 16907094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 18283387 - 18283579
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18283387 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 18283486  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  18283487 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 18283579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 39722287 - 39722479
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39722287 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaactcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 39722386  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |  ||||||| ||||||||    
T  39722387 attcaagtaatgcaattaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatccttatctttaataggtc 39722479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 120 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 70850 - 70652
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  70850 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaattattcaataata 70751  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  70750 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 70652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 120 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 74959 - 74761
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||    
T  74959 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaattattcaataata 74860  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  74859 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 74761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 18279424 - 18279616
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18279424 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacaacttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 18279523  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  18279524 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 18279616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 26292416 - 26292608
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26292416 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttccttatcattcaataata 26292515  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  || || | |||||||| ||||||||    
T  26292516 attcaattaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaagtcacaatcattatctttaataggtc 26292608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12704744 - 12704552
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12704744 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcagcagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12704645  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  12704644 attcaagtaatgcattcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 12704552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 12723600 - 12723792
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12723600 actcatgtaacttagttaaataacaatatcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaatttattttcaacaacttcctgatcattcaataata 12723699  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  12723700 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 12723792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 318
Target Start/End: Original strand, 33128 - 33326
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  33128 actcatgcaactgagttaaataacaataacagcataatcggaacatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 33227  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  33228 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 33326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 9593361 - 9593566
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9593361 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattca 9593458  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  9593459 ataataattcaagtaaatgcaatcaatccataatttactttatattcacttaaaatttcataaaagcttcacagttctcagttaatatctttattaggtc 9593558  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  9593559 tcattagt 9593566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 114 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 19148 - 18944
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  19148 attcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaattccttgatcattca 19051  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  19050 ataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtc 18951  T
Q  313 tcattag 319  Q
    |||||||    
T  18950 tcattag 18944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 112 - 320
Target Start/End: Original strand, 11987225 - 11987433
Alignment:
Q  112 ttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||    
T  11987225 ttattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattttcaacagtttcttgatcatt 11987322  T
Q  212 caataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatc-ttaaatag 309  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| |||| |  || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || |||||    
T  11987323 caataataaatcaagtaaatgcaatcaatccataattcacttattattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatatcttttaatag 11987422  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||| ||||    
T  11987423 gtctcactagt 11987433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 14429883 - 14430112
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattca 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||       |||||||||||    
T  14429883 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagccgcataatcagatcacaacaacagtatacttcatcatatcaattca 14429982  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagt 287  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||     
T  14429983 t-ttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacaga 14430081  T
Q  288 tctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  14430082 tctcagttaacatcttaaataggtcacatta 14430112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12321836 - 12321628
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||        ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  12321836 agactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatca 12321738  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| || ||||||| |  ||||||  |||||| |||    
T  12321737 ttccataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagtttcacagattgcagttaacatcttatata 12321638  T
Q  309 ggtctcatta 318  Q
    |||| |||||    
T  12321637 ggtcacatta 12321628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 176 - 320
Target Start/End: Original strand, 9644384 - 9644529
Alignment:
Q  176 taatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcata 274  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||  ||||||||    
T  9644384 taataacaattcattttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataatttactttatattcacttaaaatttcata 9644483  T
Q  275 atagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  9644484 aaagcttcacagttctcagttaatatctttattaggtctcattagt 9644529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832389
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agct---taatatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||     | ||   |||||||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcccatcaacaatataactttataatatcaa 2832462  T
Q  185 ttcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  2832461 ttcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 2832389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Original strand, 8917439 - 8917646
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||   |||||| |||||||||||    
T  8917439 cttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcaacataatcaaatcacatcag--gtttaataacaaatcattcacaacaatttcttgatcat 8917536  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||| || | |||||| |||||    
T  8917537 tcaacaataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcttaaaagcttcagagttctcggtcaatatctttaatag 8917636  T
Q  310 gtctcattag 319  Q
    ||||||||||    
T  8917637 gtctcattag 8917646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 13918872 - 13918710
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  13918872 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 13918776  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  13918775 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttcataa 13918710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 96 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 9751871 - 9751703
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-------cttaatatcaattca 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||       | |||||||||||||    
T  9751871 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagtataattcataatatcaattca 9751772  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  9751771 t-tccaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 9751703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25927595 - 25927433
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  | |||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25927595 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--aacttaataaaaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 25927499  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  25927498 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 25927433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7519447 - 7519331
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7519447 attcagactcatccaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcattca 7519351  T
Q  214 ataataattcaagtaatgca 233  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  7519350 ataatatttcaagtaatgca 7519331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 13149167 - 13149375
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  13149167 cttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcat 13149264  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  13149265 tcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaatag 13149364  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    ||| |||||||    
T  13149365 gtcacattagt 13149375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1859178 - 1859016
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  1859178 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacaaca--agcttaataacaattc-ttttcaacaacatcttgatcat 1859082  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  1859081 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttcataa 1859016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 115 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16457446 - 16457312
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16457446 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattttcaacaatttcttgatcattcaa 16457349  T
Q  215 taataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcac 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||||    
T  16457348 taataattcaagtaaatacaatcaatccataattcac 16457312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Original strand, 3271846 - 3272050
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||||||||| ||| ||||| ||||||| |    
T  3271846 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattcat-ttctacaacatcttgatta 3271944  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| |||||||||  | ||| |||  |||||| |||    
T  3271945 ttcaataata-ttcaagtaatgcaattaatcagtaaatcacatcataatcagcttaatagttcataacagcttcacatatttcatttaacatcttatata 3272043  T
Q  309 ggtctca 315  Q
    |||||||    
T  3272044 ggtctca 3272050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Original strand, 2760153 - 2760297
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||         | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  2760153 agactcatgcaacttagttaaataacgaaagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataatatcaattcattttcaacaacatcatgatca 2760252  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  2760253 ttcaataatatctcaagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 2760297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Original strand, 13461773 - 13461981
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | | ||||| |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||   |||||| |||||||||||    
T  13461773 cttattcatactcatgcaaattagtttaattacaattgcagcataatcaaatcacatcag--gtttaataacaaatcattcacaacaatttcttgatcat 13461870  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||| |||| | ||| | ||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||||||| |  ||||| ||||    
T  13461871 tcaacaataattcaagtaaaaacaatcaatccataatttcacttcataatcaattaacaattcataaaagcttcagagttctcagtcaacatctttaata 13461970  T
Q  309 ggtctcattag 319  Q
    |||||||||||    
T  13461971 ggtctcattag 13461981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 118 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 39267994 - 39267847
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||         | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  39267994 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattaccacaacattaaaacttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatca 39267896  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||||| || ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  39267895 ttcaatactatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 39267847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 2530484 - 2530342
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatca-catcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||  ||||  ||||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||    
T  2530484 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcataatca--agcttaataacaattcattttcagcaatttcttgatca 2530387  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||| |||||  ||  ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  2530386 ttccataattttttgagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 2530342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 14152105 - 14152048
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagca 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14152105 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagca 14152048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Original strand, 6801229 - 6801428
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||  ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| | ||    
T  6801229 ttcagacccatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcatgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaa 6801325  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| | ||| | |||||||||||  || ||||||| ||||||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  6801326 caataattcaagtaagggcaatcaatccataatttcacttcataatcacttaatatatcataatggcttcacagttctcagtcaatatctccaataggtc 6801425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16724723 - 16724516
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  16724723 cttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatgaaatcacatcag--gttaaataacaagtcattctcaatag-ttcttgatcat 16724627  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaat-caatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| |||||||||| ||| |  ||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  16724626 tcaacaataattcaaataaatataattcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaa-cttcacagttctcagtcaatatctttaata 16724528  T
Q  309 ggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||    
T  16724527 ggtctcattagt 16724516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17701737 - 17701530
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  17701737 cttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatgaaatcacatcag--gttaaataacaagtcattctcaatag-ttcttgatcat 17701641  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaat-caatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| |||||||||| ||| |  ||| ||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  17701640 tcaacaataattcaaataaatataattcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaa-cttcacagttctcagtcaatatctttaata 17701542  T
Q  309 ggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||    
T  17701541 ggtctcattagt 17701530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 233
Target Start/End: Original strand, 18425450 - 18425566
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||    
T  18425450 cttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcat 18425543  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgca 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  18425544 tcaataatatttcaagtaatgca 18425566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 45170091 - 45169961
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  45170091 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 45169998  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  45169997 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 45169961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 240 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 2530108 - 2530040
Alignment:
Q  240 caataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  2530108 caatatatcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttcccagttaacatcttaaata 2530040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 35151618 - 35151795
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| | |||||| |||||    
T  35151618 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaatcatactcaatagcttcttcatcat 35151715  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttc 289  Q
    |||| ||||||||||| || |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  35151716 tcaacaataattcaagcaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttc 35151795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Original strand, 14216927 - 14217134
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  14216927 cttattcatattcatgcaacttagttcaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 14217024  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | | ||    
T  14217025 tcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataactcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttcttagtcaatatcattatta 14217123  T
Q  309 ggtctcattag 319  Q
    |||||||||||    
T  14217124 ggtctcattag 14217134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Original strand, 15728337 - 15728544
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  15728337 cttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 15728434  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| |  |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | | ||    
T  15728435 tcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcctaatcatttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatatcattatta 15728533  T
Q  309 ggtctcattag 319  Q
    |||||||||||    
T  15728534 ggtctcattag 15728544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 9446253 - 9446110
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||        | |||||||| ||||||||| ||| | | |    
T  9446253 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagttta 9446155  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  9446154 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 9446110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 16275504 - 16275563
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16275504 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 16275563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Original strand, 42204017 - 42204064
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42204017 gactcatgcaacttagttaaacaacaacagcagcataatcagatcaca 42204064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 45170339 - 45170268
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagc 279  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||    
T  45170339 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataatagc 45170268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 109 - 155
Target Start/End: Original strand, 24054477 - 24054523
Alignment:
Q  109 atcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24054477 atcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 24054523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 16438985 - 16438924
Alignment:
Q  254 ataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  16438985 ataatcacttaacatttcatataagcttcacagttctcagtccatatctttaataggtctca 16438924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Original strand, 15211484 - 15211520
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15211484 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcata 15211520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 229
Target Start/End: Original strand, 18556996 - 18557101
Alignment:
Q  122 tcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataat 221  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||| || ||||||    
T  18556996 tcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggttcaatagcaaatcattctcaatagtttcttgatcatttaacaataat 18557093  T
Q  222 tcaagtaa 229  Q
    ||||||||    
T  18557094 tcaagtaa 18557101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649530
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaaca 19649530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20569619 - 20569482
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagct 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||    
T  20569619 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaact 20569520  T
Q  281 tcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||  | |||| ||  ||||||||||||| ||||||    
T  20569519 tcacatgtatcagctaacatcttaaataggtttcatta 20569482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 73)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Original strand, 17804191 - 17804418
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804191 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 17804290  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804291 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 17804390  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17804391 gttaatatcttaaataggtctcattagt 17804418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25767280 - 25767053
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25767280 catcatcatttcaaatatcttattcagactcatgcaacttagttaagtaacaatagcagcataatcagatcacaccaacagcttaatatcaattcatctt 25767181  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25767180 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaattacattataatcacttagcatttcataatagtttcacagttctca 25767081  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  25767080 gttaatatcttaaataggtctcattagt 25767053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22430122 - 22429920
Alignment:
Q  113 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||     
T  22430122 tattcagactcatgcaacttagttaattaactatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgatcattt 22430023  T
Q  213 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  22430022 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataataacttcacagttctcagctaacatcttaaataggtc 22429923  T
Q  313 tca 315  Q
    |||    
T  22429922 tca 22429920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 1644726 - 1644918
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1644726 actcatgcaacttagtttaataacaatggcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 1644825  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  1644826 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 1644918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 14472292 - 14472491
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14472292 actcatgcaacttagttaat-aacaatagcagcataattagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 14472390  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  14472391 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 14472490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 19870611 - 19870803
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19870611 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 19870710  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||    
T  19870711 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatcttaaataggtc 19870803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 11566883 - 11567075
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11566883 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 11566982  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  11566983 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 11567075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 23395089 - 23395281
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23395089 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 23395188  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  23395189 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 23395281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 8243882 - 8244074
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8243882 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 8243981  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  8243982 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagctccacaattcacaatcattatctttaataggtc 8244074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18955848 - 18955648
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18955848 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcggatcatatcaacaacttaatatcaattcattttcaataacttcttaatcattcaataata 18955749  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  18955748 attcaagtaatgcaatcaatcaatcaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatcttatataggtctcattag 18955649  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  18955648 t 18955648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 22862967 - 22863167
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||    
T  22862967 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaactttctaatcattcaataata 22863066  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  22863067 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatacagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 22863166  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  22863167 t 22863167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 23989941 - 23990133
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23989941 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttattaccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 23990040  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  23990041 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 23990133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 18917351 - 18917159
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18917351 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataattatatcatatcaacagcccaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 18917252  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  18917251 attcaagcaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 18917159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12618929 - 12618738
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  12618929 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttgataccaattcat-ttcaacaactccctgatcattcaataata 12618831  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  12618830 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacataataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 12618738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 12706705 - 12706910
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12706705 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcagcaatttcttgatcattca 12706802  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  12706803 aaaataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcattttatattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtc 12706902  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  12706903 tcattagt 12706910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 16741222 - 16741427
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||   ||||||| ||||||||||||||    
T  16741222 attcagacacatgcaacttagtttaataacaattgtagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcactgtcaacaatttcttgatcattca 16741319  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  16741320 ataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcataaaagcttcacaattctcagtcaatatctttaataggtc 16741419  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||| ||||    
T  16741420 tcactagt 16741427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 18907111 - 18907341
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||        |||||||||    
T  18907111 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattc 18907210  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat-cacttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| || ||||||| |||||||||     
T  18907211 at-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatgaacttaacagttcataacagcttcacat 18907309  T
Q  287 ttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
     |  ||||||  |||||||||||||| |||||    
T  18907310 attgcagttaacatcttaaataggtcacatta 18907341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 23414658 - 23414820
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23414658 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 23414754  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  23414755 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 23414820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 27556416 - 27556578
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27556416 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 27556512  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  27556513 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 27556578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 93 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27325730 - 27325581
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaa 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||        | |||||||||    
T  27325730 catcatcatttcaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcatatcacatcaacagtataacttcataatatcaa 27325631  T
Q  185 ttcatcttc-aacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgca 233  Q
    ||||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  27325630 ttcattttcaaacaacaacttgatcattccataatatttcaagtaatgca 27325581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5616908 - 5616745
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||    
T  5616908 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaataacaaatcattctcagcaacttcttgatcat 5616811  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataa 275  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || |||||||    
T  5616810 tcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataa 5616745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Original strand, 19662787 - 19662985
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  19662787 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaa 19662883  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  19662884 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctccaataggtct 19662983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16523500 - 16523330
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattca 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||       |||||||||||    
T  16523500 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaactttatacttcatcatatcaattca 16523401  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 260  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16523400 t-ttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaggtaatgcaattaatcattaaatcacattataatca 16523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2685407 - 2685209
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| || |    
T  2685407 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcga 2685311  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  2685310 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctctaataggtct 2685211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9482386 - 9482178
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  9482386 cttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataagcaaatcacatcag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcat 9482289  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| |||| |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  9482288 tcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatctataattcatttcataatctcttaacaattcataaaaacttcacagtttacagtcattatctttaatag 9482189  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
     || |||||||    
T  9482188 ttcacattagt 9482178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 22592884 - 22592689
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  22592884 catgcaacttagttaaataacatttgtagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 22592787  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22592786 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataa-aacttcacagttcacagttattatctttaataggtcacattagt 22592689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21834916 - 21834782
Alignment:
Q  176 taatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcata 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||   |    
T  21834916 taatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatacatttaatcattaaatcacattataatcaacttagcagtt--aa 21834820  T
Q  275 atagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    | |||||||||| | |||||||  ||||||||||||||    
T  21834819 acagcttcacagatttcagttaacatcttaaataggtc 21834782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 27415901 - 27415827
Alignment:
Q  246 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27415901 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttctcagttaacatcttaaataggtctcattagt 27415827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 316
Target Start/End: Original strand, 12496333 - 12496525
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-atatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataat 221  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||   |||| ||  ||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  12496333 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcagatcaca---acaggttctataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaatatt 12496429  T
Q  222 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcat 316  Q
    |||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||| ||| ||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  12496430 tcaagtaaaggcaatcaatccatatttcagttcataatctcttaacagttcctaaaagcttcacagttcacagtcattatctttaataggtctcat 12496525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20908076 - 20907933
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||        |||||| ||||||||| |||||||||    
T  20908076 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcttgatca 20907978  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  20907977 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 20907933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 27416278 - 27416124
Alignment:
Q  113 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      |||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27416278 tattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatca------atcaa--gcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcattc 27416188  T
Q  213 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    | ||||| ||  ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  27416187 attaatatttagagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 27416124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Original strand, 18180517 - 18180658
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||        | ||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  18180517 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcttaatcatt 18180615  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  18180616 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 18180658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19790873 - 19790665
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  19790873 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacatcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 19790774  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  19790773 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 19790674  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    || ||||||    
T  19790673 gtttcatta 19790665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766839
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||| ||||| | ||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 21766816  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgca 233  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  21766817 tcaataatatttcaagtaatgca 21766839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Original strand, 16624144 - 16624283
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||   ||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||    
T  16624144 cttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatcaaa--cttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcat 16624237  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16624238 tcaataatacttcaagtaatgcatttaatcattaattcacaatata 16624283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 31477895 - 31477765
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  31477895 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 31477802  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  31477801 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 31477765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15894427 - 15894347
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15894427 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacag 15894347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 16760316 - 16760446
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  16760316 actcgtgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 16760409  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16760410 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 16760446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 22949129 - 22949259
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  22949129 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 22949222  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  22949223 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 22949259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 22953085 - 22953215
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  22953085 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 22953178  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  22953179 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 22953215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 23871573 - 23871703
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  23871573 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 23871666  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  23871667 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 23871703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 23875529 - 23875659
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  23875529 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 23875622  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  23875623 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 23875659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 31478158 - 31478076
Alignment:
Q  194 aacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31478158 aacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 31478076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 1587824 - 1587617
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  1587824 cttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 1587727  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| |  |||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||||| | |||| | | ||    
T  1587726 tcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcctaatcatttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatatcattatta 1587628  T
Q  309 ggtctcattag 319  Q
    |||||||||||    
T  1587627 ggtctcattag 1587617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15894555 - 15894479
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15894555 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 15894479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 20803647 - 20803439
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  20803647 cttattcatattcatgcagcttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 20803550  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| ||||||||||| ||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| ||| | |||| | | ||    
T  20803549 tcaacaataattcaagcaagtatatttcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataaaagcttcacagttctaagtcaatatcattatta 20803450  T
Q  309 ggtctcattag 319  Q
    |||||||||||    
T  20803449 ggtctcattag 20803439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 1644300 - 1644359
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1644300 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 1644359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19848089 - 19848034
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  19848089 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 19848034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 31478324 - 31478265
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  31478324 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 31478265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Original strand, 1644455 - 1644548
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  1644455 caattcat-ttcaacaacatcttgatcattcaaaaatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 1644548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 118 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 27553666 - 27553612
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27553666 agactcatgcaacttagttaaagaacaacagcagcataatcagatcacaacaaca 27553612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15041654 - 15041589
Alignment:
Q  109 atcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  15041654 atcttataaagactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagc 15041589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21740020 - 21739940
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  21740020 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaagtcacattataaccagcttaacatttcataacagcttcacag 21739940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 22432249 - 22432308
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 22432308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 22438799 - 22438858
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcata 22438858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 23992454 - 23992509
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  23992454 gactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 23992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22408398 - 22408255
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agcttaatatcaa---ttcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||     | ||| ||| |||   ||||| ||||||||| ||| |||||    
T  22408398 agactcgtgcaacttggttaaataacaaaagcagtataatcagatcacaacaactttataacttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagatca 22408300  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  22408299 ttcaagaatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 22408255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873197
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag 173  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacag 19873197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 21702300 - 21702477
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  21702300 cttattcataatcatgcaacttaattaaataacaattgcagcaaaatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcatactcaatagtttcttgatcat 21702397  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttc 289  Q
    |||| || |||||||| || |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  21702398 tcaacaaaaattcaagaaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttc 21702477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 121 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 23657513 - 23657468
Alignment:
Q  121 ctcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  23657513 ctcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcaca 23657468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 27567704 - 27567656
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  27567704 agactcatacaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcaca 27567656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 16760068 - 16760135
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  16760068 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 16760135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863037
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 19863037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 22948881 - 22948948
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22948881 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 22948948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 22952837 - 22952904
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  22952837 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 22952904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 23871325 - 23871392
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  23871325 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 23871392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 23875281 - 23875348
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  23875281 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 23875348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 25642196 - 25642137
Alignment:
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacat 252  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  25642196 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacat 25642137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 22074307 - 22074174
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| |||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||         ||||||||||| |||| |||| | |||||     
T  22074307 agactcatgcatcatagttaaataataataacagcacaagcagatcacaacaacagcataacttcatgattatcaattcat-ttcagcaacattttgatt 22074209  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaat 243  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  22074208 attcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaat 22074174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25603478 - 25603425
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||    
T  25603478 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaaca 25603425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 25611816 - 25611763
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||    
T  25611816 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaaca 25611763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16929683 - 16929647
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16929683 gactcatgcaacttggttaattaacagtagcagcata 16929647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16965403 - 16965367
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16965403 gactcatgcaacttggttaattaacagtagcagcata 16965367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 89)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20461612 - 20461385
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20461612 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacttaatatcaattcatctt 20461513  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461512 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 20461413  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20461412 gttaatatcttaaataggtctcattagt 20461385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 7793462 - 7793234
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataat-cagatcacatcaacagcttaatatcaattcatct 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793462 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataattcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatct 7793363  T
Q  192 tcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793362 tcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaacaaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctc 7793263  T
Q  292 agttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7793262 agttaatatcttaaataggtctcattagt 7793234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 327277 - 327049
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataa-tcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatct 191  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327277 catcatcaatttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataactaagatcacatcaacagcttaatatcaattcatct 327178  T
Q  192 tcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctc 291  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327177 tcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctc 327078  T
Q  292 agttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  327077 agttaatatcttaaataggtctcattagt 327049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 15482675 - 15482884
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  15482675 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgagcat 15482774  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15482775 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttaatatcttaaatagg 15482874  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    ||||||||||    
T  15482875 tctcattagt 15482884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 93 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 2897935 - 2897713
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  2897935 catcatcaacttgattatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaatttatttt 2897836  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  2897835 catcaacttcttgatcattcaataataattccagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttaaca 2897736  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||||  |||||||||||| ||||    
T  2897735 gttaacatcttaaataggcctca 2897713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 31097649 - 31097439
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31097649 cttattcagactcatgcaacatagttaattaacaattgcagcataatcagatcacatcaatagcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcat 31097550  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatt-tcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31097549 tcaacaataattcaagtagtggaatcaatcaatatatcacaacataatcacttagcattctcataaaagcttcacagttctcagttaatatcttaaatag 31097450  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||| ||||    
T  31097449 gtctcagtagt 31097439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 30065970 - 30066170
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  30065970 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 30066069  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  30066070 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 30066169  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  30066170 t 30066170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 11854757 - 11854957
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11854757 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacaacttaacatcaattcattttcaataacttcttgatcattcaataata 11854856  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11854857 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatcttagataggtctcattag 11854956  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  11854957 t 11854957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 15617398 - 15617590
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  15617398 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaagttcctgatcattcaataata 15617497  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  15617498 attcaagtaatgtaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 15617590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 7109722 - 7109914
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7109722 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 7109821  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  7109822 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 7109914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 7113657 - 7113849
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7113657 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 7113756  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  7113757 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 7113849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 22336743 - 22336935
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22336743 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 22336842  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  22336843 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 22336935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27409729 - 27409537
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27409729 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27409630  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  27409629 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 27409537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 28949748 - 28949940
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28949748 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 28949847  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  28949848 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 28949940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 55022891 - 55023091
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  55022891 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagtataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 55022990  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  55022991 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 55023090  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  55023091 t 55023091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 11070092 - 11070292
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  11070092 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaagaata 11070191  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11070192 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcgatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 11070291  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  11070292 t 11070292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11165614 - 11165414
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11165614 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 11165515  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  11165514 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttggcatttcaatatagtttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 11165415  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  11165414 t 11165414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 22321688 - 22321880
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22321688 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaatagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 22321787  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  22321788 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 22321880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 120 - 318
Target Start/End: Original strand, 14499349 - 14499547
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14499349 actcatgcaacttagttaaataacaataaccgcataatcagatcttatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 14499448  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| |||||||||||||    
T  14499449 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacaattagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcatta 14499547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15850176 - 15849970
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||  | |||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||    
T  15850176 cttattcagtctcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcagatcatatcaa--gtttaataacaattcattttca-caatttcttgatcat 15850080  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| | | |||||||||||||    
T  15850079 tcaacaataattcaagttatgcaatcaatccatatatcacaatataatcatttagcatttcataaaagcttcaccgatctcattaaatatcttaaatagg 15849980  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    ||||||||||    
T  15849979 tctcattagt 15849970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 177 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 11300539 - 11300396
Alignment:
Q  177 aatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataat 276  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  11300539 aatatcaattcattttcaataacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatat 11300440  T
Q  277 agcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| ||| ||  ||||||  |||||| |||||||||||||||    
T  11300439 agctttacaattaacagttaacatcttagataggtctcattagt 11300396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18384032 - 18383803
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattca 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||       |||||||||||    
T  18384032 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattca 18383933  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagt 287  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||| |     
T  18383932 t-ttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattaaaatcagcttaacagttcataacagcttcactga 18383834  T
Q  288 tctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  18383833 tctcagttaacatcttaaataggtcacatta 18383803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19726004 - 19725798
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctt-------aatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |       ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19726004 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcatgactcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcatt 19725906  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  || ||||||| | ||||||   ||||||||| ||    
T  19725905 caataatatttcaagtaatgtaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagtttcacagatttcagttgacatcttaaatggg 19725806  T
Q  311 tctcatta 318  Q
    || |||||    
T  19725805 tcacatta 19725798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Original strand, 322614 - 322821
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |   ||       |||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  322614 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcggcataatcagatcacaacaatattatacttcatcatatcaattcat-ttcatcaacatcttgatcat 322712  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||    
T  322713 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacacttcataacagcttcacagatcttagttaacatcttaaatag 322812  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  322813 gtcacatta 322821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665570
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ctt---aatatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     |||   ||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataatcagatcacatcaacagtataactttaaaatatcaa 14665497  T
Q  185 ttcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  14665498 ttcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 14665570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668726
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ct---taatatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||   |||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagtataactttataatatcaa 14668653  T
Q  185 ttcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||||    
T  14668654 ttcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcatattataat 14668726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16798147 - 16797939
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||   ||||||| ||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  16798147 cttattcatactcatgcaacatagtttaataacaagtgcaacataatcaaatcacatcaaa--cttaataacaaatcattttcaacaatttcttgatcat 16798050  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  16798049 tcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcgtaaaagcttcacaattctcagtcaatatctttaatag 16797950  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    ||  |||||||    
T  16797949 gttccattagt 16797939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 5223077 - 5223239
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5223077 cttattcatactcatacaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 5223173  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  5223174 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 5223239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 15464878 - 15465040
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15464878 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 15464974  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||| || || | |||||||| |||||||    
T  15464975 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacactacaaacaacttagcagttcataa 15465040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 12496280 - 12496487
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||         ||||||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  12496280 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattcat-ttctacaacatcttgatca 12496378  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || |||||||||| | |||||||  ||||||||||    
T  12496379 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaata 12496477  T
Q  309 ggtctcatta 318  Q
    |||| |||||    
T  12496478 ggtcacatta 12496487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16808974 - 16808766
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||||  ||| |||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| | |||||| ||||||| |||    
T  16808974 cttattcatactcatgcaatatagtttaataacaagtgcaacataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcatttgcaacaatttcttgaccat 16808877  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  16808876 tcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcgtaaaagcttcacaattctcagtcaatatctttaatag 16808777  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    ||  |||||||    
T  16808776 gttccattagt 16808766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 11862793 - 11863023
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcac------atca--acagcttaatatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      || |  ||  | ||||||||||||    
T  11862793 catcatcttaatcatcttgtaaagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcaccaaaatattataacttcataatatcaattc 11862892  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||||  ||||||||||    
T  11862893 at-ttcaacaacatcttggtcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcataatcagcttaacagttcatagcagcttcacag 11862991  T
Q  287 ttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
     | |||  ||  |||||||||||||| |||||    
T  11862992 atttcaaataacatcttaaataggtcacatta 11863023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11298621 - 11298415
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||| | ||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11298621 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 11298523  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  11298522 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacaaatttcagttaatatcttaaatag 11298424  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  11298423 gtcacatta 11298415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 12339479 - 12339641
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||||  | |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  12339479 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattctcatcaa--gtttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 12339575  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  12339576 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 12339641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Original strand, 17241990 - 17242188
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  17241990 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaa 17242086  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  17242087 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctctaataggtct 17242186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 96 - 317
Target Start/End: Original strand, 11851581 - 11851810
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| |||||         | ||||||||||||    
T  11851581 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacgatagtagcataattagatcacaacaacattataacttcataatatcaattc 11851680  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| || ||||||  |||||||||     
T  11851681 at-ttcaacaacatcttgttcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcataatcagcttaacagttcatagcagcttcacaa 11851779  T
Q  287 ttctcagttattatcttaaataggtctcatt 317  Q
     | |||| ||  |||||||||||||| ||||    
T  11851780 atttcagataacatcttaaataggtcacatt 11851810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 12038068 - 12037871
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attc 187  Q
    |||||| ||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||        ||||    
T  12038068 catcatcttaatcatcttatataaactcatgcaacttagttaaataacaa-agcagcataatcagatcacaacaacattataatttcataacaacaattc 12037970  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  12037969 at-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatctcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcaaaatggtttcacag 12037871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 8489564 - 8489459
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8489564 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 8489468  T
Q  211 tcaataata 219  Q
    |||||||||    
T  8489467 tcaataata 8489459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11300854 - 11300696
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||| ||| | |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11300854 ttcagactcatgcaacttagttaaataacaattgtagcataatcaaatcacat-aac-gtttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcattcaa 11300758  T
Q  215 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||| |||| || | |||||||| |||||||    
T  11300757 taatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcaaattacaaacaacttagcagttcataa 11300696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3403050 - 3402842
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  3403050 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcatgacaacaattcattttcaacaacatcaaggttat 3402951  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || |||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  3402950 tcaagaataaatcaaggaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataatagcttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 3402851  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  3402850 gtcacatta 3402842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 38814409 - 38814605
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  38814409 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 38814506  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || ||||||| || |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  38814507 caagtaaaggcaatcattccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcgcattagt 38814605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1982905 - 1982697
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||         | ||| | |||||||| ||||||||| | | | |||    
T  1982905 agactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacactataacttcataacaacaattcattttcaacaacatataggtca 1982806  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| ||||| || ||||||| | |||||||  |  ||||||  ||||||| |||    
T  1982805 ttcaaaaatagttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaataacttaacagttcataacaacttcacatattgcagttaacatcttaattag 1982706  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  1982705 gtcacatta 1982697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 3390030 - 3389822
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | |  |    
T  3390030 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcatgacaacaattcattttcaacaacatcaaggtttt 3389931  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  3389930 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 3389831  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  3389830 gtcacatta 3389822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 3833699 - 3833895
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  3833699 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaaca--ggtttaataacaagtcattctcaacaattgcttgatcattcaacaataatt 3833796  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| || ||||| |||||||| |||||||    
T  3833797 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcatcatctttaataggtcacattagt 3833895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 11854430 - 11854545
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |    
T  11854430 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcggcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttaatctt 11854526  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa 229  Q
    ||||||||| ||| |||||    
T  11854527 tcaataatatttcgagtaa 11854545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 16750682 - 16750543
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||    
T  16750682 cttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcat 16750589  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  16750588 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 16750543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 104 - 172
Target Start/End: Original strand, 12172804 - 12172872
Alignment:
Q  104 taattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12172804 taatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaaca 12172872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4111334 - 4111204
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  4111334 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 4111241  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  4111240 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 4111204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11595233 - 11595025
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  11595233 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 11595134  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  11595133 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 11595034  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    || ||||||    
T  11595033 gtttcatta 11595025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 15964993 - 15965123
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  15964993 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 15965086  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15965087 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15965123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 15968917 - 15969047
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  15968917 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 15969010  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15969011 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15969047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 15972841 - 15972971
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  15972841 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 15972934  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  15972935 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 15972971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 19775789 - 19775919
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  19775789 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 19775882  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  19775883 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 19775919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 12172924 - 12173004
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  12172924 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcacag 12173004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4107482 - 4107352
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  4107482 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 4107389  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||| ||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  4107388 tttcaactaatgcatttaatcattaattcacagtata 4107352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 37439721 - 37439591
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  37439721 actcatgcaacttagtttaacaacaattgtagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 37439628  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  37439627 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 37439591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 4589132 - 4589039
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  4589132 caattcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 4589039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 103 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23053197 - 23053128
Alignment:
Q  103 ttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  23053197 ttaatcatcttatatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 23053128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 4589287 - 4589228
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4589287 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 4589228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 312
Target Start/End: Original strand, 15060427 - 15060518
Alignment:
Q  222 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||    
T  15060427 tcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcacagattgcagttaccatcttatataggtc 15060518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 19775360 - 19775419
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19775360 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 19775419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Original strand, 19775526 - 19775608
Alignment:
Q  194 aacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  19775526 aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 19775608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 12511084 - 12511137
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  12511084 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaaca 12511137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 46822292 - 46822345
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  46822292 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaaca 46822345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11557477 - 11557425
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  11557477 actcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaaca 11557425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 16696798 - 16696857
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  16696798 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataaacaaatcacatcaa 16696857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 174
Target Start/End: Original strand, 23408428 - 23408506
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  23408428 catcatcttgatcatcttatactgactcatgcaacttggttaattaacaatagcaacatagacagattacaacaacagc 23408506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 221 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 23053061 - 23052996
Alignment:
Q  221 ttcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcaca 285  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||    
T  23053061 ttcaagtaatgcaattaataattaaatcacattataaacaacttaaaatttcataatagcttcaca 23052996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 14878610 - 14878574
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14878610 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 14878574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 226 - 285
Target Start/End: Original strand, 15051655 - 15051715
Alignment:
Q  226 gtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcaca 285  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  15051655 gtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcaca 15051715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878092
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 15878092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077518
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||  ||||||||| |||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcagatcacaacaaca 23077518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15941985 - 15941938
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  15941985 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa 15941938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 15964745 - 15964812
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15964745 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 15964812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 15968669 - 15968736
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15968669 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 15968736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 15972593 - 15972660
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  15972593 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 15972660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17525275 - 17525216
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    ||||||||| || |||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  17525275 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcata 17525216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 30029867 - 30029922
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  30029867 gactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagc 30029922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 42325964 - 42326172
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  42325964 gactcatgcaacttagttaaaaaacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 42326063  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    || | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | | ||| || ||| ||| | |||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  42326064 tcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaagttaacagttcttaacaacttcacaagtctcagttaacatcttaaatag 42326163  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    || ||||||    
T  42326164 gtttcatta 42326172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 15051531 - 15051584
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  15051531 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagttcacaacaaca 15051584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 15060307 - 15060360
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  15060307 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagttcacaacaaca 15060360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 16369423 - 16369476
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||||| |||||    
T  16369423 gactcatgcaacttggttaagtaacaatagcagcataggcagttcacaacaaca 16369476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 16909765 - 16909818
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  16909765 gactcatgcaacttggttaaataacaatagtagcataagcagttcacaacaaca 16909818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 222 - 286
Target Start/End: Original strand, 16909885 - 16909950
Alignment:
Q  222 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  16909885 tcaagtaataaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacaattcataaaagcttcacag 16909950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856216
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaaca 856216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1598560 - 1598477
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctt-aatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||| |||| ||| |||| |||||||| ||||||||||    
T  1598560 catgcaacttagttaaataacatt-gcagcataatcaaatcacatca--agcttaaataacaaatcattttcaacaa-ttcttgatca 1598477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 222 - 285
Target Start/End: Original strand, 16369543 - 16369607
Alignment:
Q  222 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcaca 285  Q
    |||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||    
T  16369543 tcaagtaatgaaattaatgattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagcttcaca 16369607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 266 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 26190947 - 26190895
Alignment:
Q  266 catttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    ||||||| ||||| |||||| || |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  26190947 catttcaaaataggttcacaattttcagttaacatcttaaataggtctcatta 26190895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 26196548 - 26196500
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaaca 144  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||    
T  26196548 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataaca 26196500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 93 - 320
Target Start/End: Original strand, 24735397 - 24735624
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735397 catcatcactttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 24735496  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735497 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcgatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 24735596  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24735597 gttaatatcttaaataggtctcattagt 24735624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10101730 - 10101530
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10101730 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 10101631  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  10101630 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 10101531  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  10101530 t 10101530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 24649378 - 24649570
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24649378 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 24649477  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  24649478 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 24649570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 12901597 - 12901405
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12901597 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcggatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 12901498  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  12901497 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 12901405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27379518 - 27379326
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27379518 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27379419  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  27379418 attaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 27379326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 27383564 - 27383372
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27383564 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27383465  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  27383464 attaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 27383372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 27601817 - 27602009
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27601817 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 27601916  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  27601917 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 27602009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 182 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19688779 - 19688641
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctt 281  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19688779 caattcatcttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctt 19688680  T
Q  282 cacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19688679 cacagttctcagttaatatcttaaataggtctcattagt 19688641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 24628564 - 24628372
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24628564 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatattaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 24628465  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  24628464 attcaagcaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 24628372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 41531089 - 41530903
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  41531089 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 41530996  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  41530995 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 41530903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 31344890 - 31345052
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  31344890 cttattcatactcatgcaacttagttaaataataattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 31344986  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | |||||  ||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  31344987 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcatgaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 31345052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 207 - 312
Target Start/End: Original strand, 15477711 - 15477816
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaa 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||    
T  15477711 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaa 15477810  T
Q  307 taggtc 312  Q
    ||||||    
T  15477811 taggtc 15477816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22812028 - 22811797
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||   |||        |||||||||    
T  22812028 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcaaatcacaacaacattataacttcatcatatcaattc 22811929  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaa-tcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcaca 285  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||  |||||||||    
T  22811928 at-ttcaacaacatcttgatcattcaataatacttcaggtaatgcaatttaatcattaaatcacattataatcaacttaatagttcatagcagcttcaca 22811830  T
Q  286 gttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    | | ||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  22811829 gatttcacttaacatcttaaataggtcacatta 22811797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 25963809 - 25963603
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  25963809 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 25963711  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || |||||||||| | ||| |||  |||||||||||    
T  25963710 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcaattaacatcttaaatag 25963612  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  25963611 gtcacatta 25963603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 22461277 - 22461079
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  22461277 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaa 22461181  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  22461180 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctccaataggtct 22461081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19928583 - 19928387
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19928583 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 19928486  T
Q  223 caagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||| ||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| | || || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  19928485 caaataaagacaatcaatccatatttcatttcataatctcctaacaattcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 19928387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25961628 - 25961464
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||         | ||| | |||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  25961628 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataacaacaattcattttcaacaacatctagatcat 25961529  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataa 275  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||  ||||| || |||||||    
T  25961528 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaacaacttaacagttcataa 25961464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 23187088 - 23187296
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | ||||  || ||||  |||| |  |||||||||||    
T  23187088 cttattcatactcatggaacttggtttaataacaattgcagcataatcaaatcatatcag--gttaaataaaaaatcattctcaatagtttcttgatcat 23187185  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||| | || |||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  23187186 tcaacaataattcaagtaaatacaattaatccacaattcacttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttcacagtcattatctttaatag 23187285  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||||||||    
T  23187286 gtctcattagt 23187296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 23598351 - 23598559
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||| |||||||||||| |||| ||||   | | ||||  || ||||  |||| |  |||||||||||    
T  23598351 cttattcatactcatggaacttggtttaataacaattgcagcataatcaaatcatatcag--gttaaataaaaaatcattctcaatagtttcttgatcat 23598448  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||| | |||| |||| | || |||| | ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  23598449 tcaacaataattcaagtaaatacaattaatccacaattcacttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttcacagtcattatctttaatag 23598548  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||||||||    
T  23598549 gtctcattagt 23598559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18855541 - 18855351
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  18855541 catgcaacttagttaaacaacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataatt 18855445  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||||| || ||||||| |  |||  |||  | ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  18855444 caagtaaaggcaatcacttcatatttcatttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttctcagtcattatctctaataggtctca 18855351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 118 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 21327662 - 21327485
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||         ||||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  21327662 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacagcagcagcataacttcataattatcaattcat-ttctacaacatcttgatt 21327564  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||  | ||||||| ||||||||||    
T  21327563 attcaacaatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataaacagcttaatagttcataacagcttcacag 21327485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21916215 - 21916069
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||| ||| |||        |||||||||    
T  21916215 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaaaaacaacataatcagatcacaacaaaagcataaattcataatatcaattc 21916116  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaat 235  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21916115 at-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaat 21916069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 21318731 - 21318584
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||         ||||||||||| ||| ||||| |||||||     
T  21318731 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataattatcaattcat-ttctacaacatcttgatt 21318633  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataa 257  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  21318632 attcaacaatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataa 21318584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 40428486 - 40428694
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |         | ||||| |||||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  40428486 gactcatgcaacttagttcaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaatattataacttcataataacaattcattttcaacaacatcaaggttat 40428585  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    | || ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  40428586 ttaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaatag 40428685  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  40428686 gtcacatta 40428694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Original strand, 37524697 - 37524821
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||         | ||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  37524697 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacatcaacattgtaacttcataacaacaattcat-ttcaataacatcttgatca 37524795  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaat 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||||    
T  37524796 ttcaataatatttcaagtaatgcaat 37524821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30345076 - 30344946
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  30345076 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 30344983  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  30344982 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 30344946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24716622 - 24716420
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca-------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||        | ||| | |||||||| ||||||||| || | ||||||    
T  24716622 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcataatcatt 24716524  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    ||||||||  || ||||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  24716523 caataatatgtctagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacaggtttcagttaacatcttaaatagg 24716425  T
Q  311 tctca 315  Q
    |||||    
T  24716424 tctca 24716420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 24673697 - 24673777
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  24673697 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacagtataatcagcttaacatttcataatagcttcacag 24673777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 1283410 - 1283540
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  1283410 actcatgcaacttagattaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 1283503  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  1283504 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 1283540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Original strand, 24174822 - 24174965
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||        | |||||||| ||||||||| ||| | | |    
T  24174822 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagttta 24174920  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  24174921 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 24174965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 41666962 - 41667078
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  41666962 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 41667059  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa 229  Q
    |||| || |||||||||||    
T  41667060 tcaacaacaattcaagtaa 41667078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Original strand, 24869902 - 24869950
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24869902 agactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcaca 24869950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24655433 - 24655290
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||        | |||||||| ||||||||| ||| | | |    
T  24655433 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagttta 24655335  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  24655334 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 24655290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22799220 - 22799167
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  22799220 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 22799167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 25616212 - 25616267
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  25616212 gactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 25616267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21918284 - 21918202
Alignment:
Q  237 aatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||| | |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21918284 aatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacagatttcagttaacatcttaaataggtcacatta 21918202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Original strand, 24673569 - 24673639
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  24673569 catcatcttaatcatcttgtacagactcatgcaacatggttaaataacaatagcagcacaagcagatcaca 24673639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Original strand, 27263285 - 27263343
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 169  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  27263285 cttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 27263343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Original strand, 60829 - 60941
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  60829 cttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatca-atcacatca--ggttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 60925  T
Q  211 tcaataataattcaag 226  Q
    |||| |||||||||||    
T  60926 tcaacaataattcaag 60941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019747
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 23019747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 22740973 - 22740914
Alignment:
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacat 252  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22740973 caacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacat 22740914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 22758715 - 22758601
Alignment:
Q  206 atcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatctt 303  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||   ||| ||| |||||| ||||||| || |  |||||| | ||||    
T  22758715 atcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacattaacatctcataacagcttcatagattgcagttaatttctt 22758616  T
Q  304 aaataggtctcatta 318  Q
    | |||||||||||||    
T  22758615 atataggtctcatta 22758601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622251
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 40622251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 58)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 93 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 36134074 - 36133849
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36134074 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatccattcatctt 36133975  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36133974 caacaacttcctgatcattcaataataactcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttccca 36133875  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  36133874 gttaatatcttaaataggtctcatta 36133849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 9556551 - 9556743
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  9556551 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaatacta 9556650  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  9556651 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 9556743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 17810293 - 17810493
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17810293 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 17810392  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  17810393 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttaacatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 17810492  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  17810493 t 17810493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 4561419 - 4561227
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4561419 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaatttattttcaacaacttcctaatcattcaataata 4561320  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  4561319 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 4561227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 14757507 - 14757307
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  14757507 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacaacttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 14757408  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  14757407 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 14757308  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  14757307 t 14757307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5757023 - 5756831
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5757023 actcatgtaacttagttaaataacaataacagcataatcagattatatcaacaacttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 5756924  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  5756923 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 5756831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 1951851 - 1951646
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1951851 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattca 1951754  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| | || ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||    
T  1951753 ataataattcaagtaaatgcaatcaatccataatttactttatattcacttaaaatttcataaaagcttcacagttctcagttaatatctttattaggtc 1951654  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  1951653 tcattagt 1951646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 27534047 - 27534247
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||     
T  27534047 actcatgcaacttagtttaataacaataacagcataatcggatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaataacttcttaatcattcaataatg 27534146  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  27534147 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataacaacttagcatttcaatatagcttcacaattaacagttaacatctcagataggtctcattag 27534246  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  27534247 t 27534247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 114 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18222468 - 18222264
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  18222468 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaattccttgatcattca 18222371  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18222370 ataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcattatctttaataggtc 18222271  T
Q  313 tcattag 319  Q
    |||||||    
T  18222270 tcattag 18222264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 111 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 22634516 - 22634369
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  22634516 cttattcagacgcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaatttcttgatcat 22634417  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  22634416 tcaataataattcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 22634369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 33742399 - 33742590
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  33742399 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttgataccaattcat-ttcaacaactccctgatcattcaataata 33742497  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  33742498 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacataataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 33742590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18228943 - 18228739
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||  |||| ||| |||||||| | |||||| | ||||||||||||    
T  18228943 attcagactcatgcaacttagttaaataaaaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttcataacaattcatttccaacaattccttgatcattca 18228846  T
Q  214 ataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18228845 ataataattcaagtaaagacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcgtaaaagcttcacagttctcagtcattatctttaataggtc 18228746  T
Q  313 tcattag 319  Q
    |||||||    
T  18228745 tcattag 18228739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17152576 - 17152374
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  17152576 attcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaacaattccttgatcattca 17152480  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  17152479 ataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaatcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtc 17152380  T
Q  313 tcatta 318  Q
    ||||||    
T  17152379 tcatta 17152374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 96 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16488194 - 16487972
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |||| |||        |||||||||    
T  16488194 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaattc 16488095  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  16488094 tt-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagtagcttcacag 16487996  T
Q  287 ttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
     ||||| |||  ||||||||||||    
T  16487995 atctcaattaacatcttaaatagg 16487972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 43256505 - 43256343
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  43256505 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgtagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 43256409  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  43256408 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 43256343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16357045 - 16356839
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  16357045 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcat-ttccacaacatcttgatcat 16356947  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta-taatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||  |||||||| |||| || |||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  16356946 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaaaaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaatag 16356848  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  16356847 gtcacatta 16356839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 3412811 - 3413017
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| || |||||||||||    
T  3412811 cttattcatactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaatcattctcaataatttcttgatcat 3412908  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| ||||||||||  |||  || |||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | | |||||| |||||    
T  3412909 tcaacaataattcaataaatataattcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataa-agcttcacagttctca-tcaatatctttaatag 3413006  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||||||||    
T  3413007 gtctcattagt 3413017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16243493 - 16243285
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  16243493 cttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcat 16243396  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | | |||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  16243395 tcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcacaatctcttaacaattcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaatag 16243296  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    ||| |||||||    
T  16243295 gtcacattagt 16243285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 20157579 - 20157407
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ctt---aatatcaa 184  Q
    ||||||| | ||||| | |||||  |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |     |||   ||||||||    
T  20157579 catcatcgtcttaatcaacttatatagactcatgcaaattagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacggtataactttataatatcaa 20157480  T
Q  185 ttcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  20157479 ttcat-ttcaacaacatctagatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 20157407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 18236904 - 18237067
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||| |||||    
T  18236904 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttaatcat 18237001  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataa 275  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || |||||||    
T  18237002 tcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataa 18237067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26243746 - 26243555
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  26243746 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 26243649  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||||| || ||||||| || |||  |||  | |||||| |||| || |||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  26243648 caagtaaaggcaatcattccatatttcatttcataatctcttaacaattcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctctaataggtctca 26243555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 13813135 - 13812966
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||         | ||||||||||||    
T  13813135 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattaccacaacattaaaacttcataatatcaattc 13813036  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  13813035 at-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 13812966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16348757 - 16348551
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||    
T  16348757 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcat-ttccacaacatcttgataat 16348659  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| || | || |||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  16348658 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttta-aaaagcttcacagatttcagttaacatcttaaatag 16348560  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  16348559 gtcacatta 16348551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 19757682 - 19757486
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19757682 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 19757585  T
Q  223 caagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  19757584 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 19757486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 19782124 - 19782320
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19782124 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 19782221  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  19782222 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 19782320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Original strand, 23139296 - 23139486
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| | || |||||||    
T  23139296 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataatt 23139392  T
Q  223 caagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||||||  | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||    
T  23139393 caagtatgggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctctaataggtctca 23139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Original strand, 2014791 - 2014991
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||   |||||| |||||||||||    
T  2014791 cttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcag--gtttaataacaaatcattcgcaacaatttcttgatcat 2014888  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    || | |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||  |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  2014889 tccacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatttcttaacaattcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaatag 2014988  T
Q  310 gtc 312  Q
    |||    
T  2014989 gtc 2014991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 43256120 - 43256046
Alignment:
Q  246 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  43256120 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttcccagttaacatcttaaataggtctcattagt 43256046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5339076 - 5338926
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||         ||||||||||| ||||||||  |||||||     
T  5339076 agactcatgcatcatagttaaataacaataacagcacaagcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattcat-ttcaacaaaatcttgatt 5338978  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 260  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  5338977 attcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataatca 5338926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Original strand, 9530460 - 9530654
Alignment:
Q  124 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattc 223  Q
    ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||  || ||||  ||||||| |||||||||| | || ||||||||    
T  9530460 atgcaacttagttaaatgacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataataaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataattc 9530556  T
Q  224 aagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
     ||||| | |||||| || |||  |||  |  |||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  9530557 gagtaaaggcaatcactccatatttcatttcctaatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttctcggtcattatctttaataggtctcattagt 9530654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 10712874 - 10713004
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  10712874 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 10712967  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10712968 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10713004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 10926644 - 10926774
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  10926644 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 10926737  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10926738 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10926774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 12570142 - 12570222
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12570142 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacag 12570222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14954252 - 14954122
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  14954252 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 14954159  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  14954158 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacaatata 14954122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 25689891 - 25690021
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  25689891 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 25689984  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  25689985 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 25690021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28569537 - 28569423
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||   | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  28569537 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaac--ttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 28569440  T
Q  211 tcaataataattcaagt 227  Q
    |||| || |||||||||    
T  28569439 tcaacaacaattcaagt 28569423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 12570014 - 12570090
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12570014 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 12570090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14708727 - 14708668
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14708727 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 14708668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15353402 - 15353193
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttc-ttgatc 208  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| ||||| | ||||        | |||||||| ||||||||| ||   |||     
T  15353402 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacagcaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcaaggatt 15353304  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaat 307  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||  |  ||||||  |||||| ||    
T  15353303 attcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacaaattccagttaacatcttagat 15353204  T
Q  308 aggtctcatta 318  Q
    |||| ||||||    
T  15353203 aggtttcatta 15353193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 318
Target Start/End: Original strand, 25555599 - 25555736
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagct 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||    
T  25555599 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaact 25555698  T
Q  281 tcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  25555699 tcacaggtctcagttaacatcttaaataagtttcatta 25555736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 123 - 238
Target Start/End: Original strand, 45938173 - 45938284
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| | || ||||| |    
T  45938173 catgcatcttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaattaacaataa-t 45938268  T
Q  223 caagtaatgcaatcaa 238  Q
    ||||||| ||||||||    
T  45938269 caagtaaggcaatcaa 45938284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 11250655 - 11250447
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  11250655 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 11250556  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| ||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | ||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  11250555 tcaagaataattcatgtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcataggtctcagttaacatcttaaatag 11250456  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    || ||||||    
T  11250455 gtttcatta 11250447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 12487732 - 12487862
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||  |||  ||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  12487732 actcatgcaacttagtttaacaacaattacagcataatcaattcatgtcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 12487825  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  12487826 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 12487862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 15224807 - 15224866
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15224807 cttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 15224866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Original strand, 25555503 - 25555550
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  25555503 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcaca 25555550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 18602824 - 18602766
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 169  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18602824 cttattcatactcatgaaacttagtttagtaacaattgcagcataatcaaatcacatca 18602766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42997543 - 42997337
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  42997543 cttattcataatcatgcaactcagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 42997446  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    | || || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    | |||||||| ||||    
T  42997445 ttaacaacaattcaagtaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttcatgatcattatctttaata 42997347  T
Q  309 ggtctcatta 318  Q
    |||| |||||    
T  42997346 ggtcacatta 42997337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18609396 - 18609340
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacat 167  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18609396 cttattcatactcatgaaacttagtttagtaacaattgcagcataatcaaatcacat 18609340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 23843608 - 23843711
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| |||| |||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||| |    
T  23843608 ataactcaagtaatacaattaatcattaaaacacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcac 23843707  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  23843708 atta 23843711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 44675762 - 44675865
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||||||||||| |    
T  44675762 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 44675861  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  44675862 atta 44675865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14954500 - 14954433
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  14954500 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 14954433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 15093798 - 15093853
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  15093798 gactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagc 15093853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 155
Target Start/End: Original strand, 23843478 - 23843537
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    ||||||||| || |||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23843478 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcata 23843537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 25689643 - 25689710
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  25689643 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 25689710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 256
Target Start/End: Original strand, 15224973 - 15225035
Alignment:
Q  194 aacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||| ||||||    
T  15224973 aacaacatcttggtcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcatattata 15225035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 235 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 18602715 - 18602630
Alignment:
Q  235 tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttatta-tcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| | || |||| ||||||||| ||||||    
T  18602715 tcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatattctttaataggtcttattagt 18602630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 15125130 - 15125071
Alignment:
Q  229 atgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  15125130 atgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacag 15125071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16351871 - 16351800
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  16351871 caattcat-ttcaacaacatctagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 16351800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 12916 - 13125
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12916 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaataggagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaatttcttgatcat 13015  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13016 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctccacagttctcagttaatatcttaaatagg 13115  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    ||||||||||    
T  13116 tctcattagt 13125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 19200 - 19409
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19200 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaataggagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaatttcttgatcat 19299  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||      
T  19300 tcaataataattaaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctccacagttctcagttaatatcttaaatata 19399  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    ||||||||||    
T  19400 tctcattagt 19409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 226
Target Start/End: Original strand, 62273 - 62386
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  62273 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaactcattctcaatagtttcttgatcat 62370  T
Q  211 tcaataataattcaag 226  Q
    |||| |||||||||||    
T  62371 tcaacaataattcaag 62386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 113 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16080536 - 16080329
Alignment:
Q  113 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  16080536 tattcagactcatgcaacttagttaattaaaaatagcagcataatcagatcacatcaataacttattatcaattcattttcaacaacttcttgatcatcc 16080437  T
Q  213 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16080436 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataaaagcttcacagttctcagttaatctcttaaataggtc 16080337  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  16080336 tcattagt 16080329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 8e-92
Query Start/End: Original strand, 93 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24782990
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatgaacagcttaatatcaattcatttt 24783113  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctca 292  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  24783112 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaattaattaataaatcacattataatcacttagcatttcataacagcttcacaattttca 24783013  T
Q  293 gttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||||  ||||||| |||||||||    
T  24783012 gttaacatcttaagtaggtctca 24782990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 36819403 - 36819193
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  36819403 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaccagcttaatatcaaattcattttcaacaacttcttgatca 36819304  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  36819303 ttcaataataattcaagaaatgcaatcaataaataaatcacaatataatcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcatttaatatcttaaatag 36819204  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||||||||    
T  36819203 gtctcattagt 36819193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 1010744 - 1010944
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1010744 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 1010843  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  1010844 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 1010943  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  1010944 t 1010944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20228894 - 20228702
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20228894 actcatgcaacttagtttaataacaatggcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 20228795  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  20228794 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 20228702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 16375543 - 16375351
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16375543 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 16375444  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  16375443 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 16375351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 21407376 - 21407568
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21407376 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 21407475  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  21407476 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 21407568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 52639562 - 52639754
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  52639562 actcatgtaacttagttaaataacaataacagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 52639661  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  52639662 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 52639754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 19211883 - 19212088
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  19211883 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattca 19211980  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||    
T  19211981 acaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatatcttttataggtc 19212080  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  19212081 tcattagt 19212088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 23819383 - 23819185
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23819383 actcatgcaacttcgtttaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcattttcagcaatttcttgatcattcaataata 23819286  T
Q  220 attcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  23819285 attcaagtaaagacaatcaatccataaatcactttatattcacttaacatctcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtctcatta 23819186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 96 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18182237 - 18182037
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||        ||||||||     
T  18182237 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaattt 18182138  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18182137 at-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattgaatcacattataaacaacttagcatctcataacagcttcacag 18182039  T
Q  287 tt 288  Q
    ||    
T  18182038 tt 18182037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 33797295 - 33797457
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  33797295 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 33797391  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  33797392 tcaataatatttcgattaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 33797457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 20138099 - 20138304
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  20138099 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgaacattca 20138196  T
Q  214 ataataattcaag-taatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    | |||||||||||  || |||| ||||| |||  |||  | | |||| |||| || ||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20138197 acaataattcaagcaaaggcaaccaatccatatttcatttcaaaatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagttattatctttaataggtc 20138296  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  20138297 tcattagt 20138304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22449382 - 22449184
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--at-tca---- 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||  || |||        
T  22449382 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataatagtagcagcataatcagatcacaacaagagcataatttcataatatcaatac 22449283  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  22449282 ttttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagcttcacag 22449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 3473017 - 3472843
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca------tcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||      | |||  | ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||    
T  3473017 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaagagtattaacttcataatatcaaatca-cttcaacaacatcttgatcatt 3472919  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||| |||| |||||||||| || | ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  3472918 caacaatatttcaagtaattcatttaatcattaaatcacatttcaaacaacttagcatttcataacagcttcacag 3472843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Original strand, 12646888 - 12647086
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  12646888 ttcagattcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaa 12646984  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  12646985 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctccaataggtct 12647084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 93 - 156
Target Start/End: Original strand, 21313122 - 21313185
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataa 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21313122 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataa 21313185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Original strand, 33797680 - 33797754
Alignment:
Q  246 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  33797680 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttctcagttaacatcttaaataggtctcattagt 33797754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 315
Target Start/End: Original strand, 18882393 - 18882583
Alignment:
Q  124 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattc 223  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  18882393 atgcaacttagttaaataacattttcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattatcaacaatttcttgatcattcaacaataattc 18882490  T
Q  224 aagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    |||| || ||||| | || |||  ||   | |||||| |||| || |||||||  |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||    
T  18882491 aagtaaaggcaattattccatatttcttttcataatctcttaacaattcataaaggcttcacaattctcagttaatatctctaataggtctca 18882583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 125 - 320
Target Start/End: Original strand, 46975494 - 46975688
Alignment:
Q  125 tgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattca 224  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  46975494 tgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataattca 46975591  T
Q  225 agtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| ||  |||||| | ||||| ||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  46975592 agtaaagacaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacaggtcataaaaacttcatagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 46975688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 118 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 8761728 - 8761526
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||| | |||         ||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  8761728 agactcatgcatcatagttaaataacaataacagcacaagcagatcacaacaacaacataacttcataattatcaattcat-ttcaacaacatcttgatt 8761630  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaat 307  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  | ||||||| |||||||||| | ||| |||  |||||| ||    
T  8761629 attcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataattagcttaatagttcataacagcttcacagatttcatttaacatcttatat 8761530  T
Q  308 aggt 311  Q
    ||||    
T  8761529 aggt 8761526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 17678679 - 17678538
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca-------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||        | ||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  17678679 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcttaatcatt 17678581  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  17678580 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaataacatta 17678538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18394059 - 18393850
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-----atatcaa----ttcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   ||     ||| |||    || || ||||||||||||  | | |    
T  18394059 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataattccataacaacaattttattttcaacaacttcaaggtta 18393960  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  18393959 ttcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaata 18393860  T
Q  309 ggtctcatta 318  Q
    |||| |||||    
T  18393859 ggtcacatta 18393850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 1925214 - 1925084
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  1925214 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 1925121  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  1925120 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 1925084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20924228 - 20924098
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  20924228 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 20924135  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  20924134 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 20924098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 215 - 318
Target Start/End: Original strand, 21022767 - 21022871
Alignment:
Q  215 taataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |  ||||||  |||||| |||||||     
T  21022767 taatatttcaagtaatgcaattaatcattaattcacattataatcagcttaacagttcataatagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtca 21022866  T
Q  314 catta 318  Q
    |||||    
T  21022867 catta 21022871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39244235 - 39244096
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||   |||||||  ||||||| |||||||   ||||||||||    
T  39244235 cttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatcaaa--cttaataagaattcat-ttcaaca---tcttgatcat 39244142  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  39244141 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 39244096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39247790 - 39247651
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||   |||||||  ||||||| |||||||   ||||||||||    
T  39247790 cttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcatatcaaa--cttaataagaattcat-ttcaaca---tcttgatcat 39247697  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  39247696 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 39247651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 41388335 - 41388196
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||  |||||  ||||||||  ||||||| |||||||   ||||||||||    
T  41388335 cttattcatattcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaattcgtatcaa--gcttaataaaaattcat-ttcaaca---tcttgatcat 41388242  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  41388241 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 41388196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45310462 - 45310261
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaatt-catcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| || ||   ||||        | ||||| ||| ||||||||||||  | | |    
T  45310462 gactcatgcaacttagttaaataacgacagcagcataatcagatcacaacagcattataattccataacaacaatttcattttcaacaacttcaaggtta 45310363  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  45310362 ttcaagaataaatcaagcaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaata 45310263  T
Q  309 gg 310  Q
    ||    
T  45310262 gg 45310261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 22831375 - 22831296
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||    
T  22831375 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagctaacatttcataacagcttcacag 22831296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20229168 - 20229075
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  20229168 caattcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 20229075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 6151976 - 6152056
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||    
T  6151976 tcattcactaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataaacagcttaacatttcataacagcttcacag 6152056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 3705159 - 3705016
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||         | ||| | |||||||| ||||||||| ||| | | |    
T  3705159 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcaaaatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagttta 3705061  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  3705060 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 3705016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 45489837 - 45489629
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  45489837 gactcatgcaacttagttaaataatagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 45489738  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    || | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || || |||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  45489737 tcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 45489638  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    || ||||||    
T  45489637 gtttcatta 45489629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 42865200 - 42865097
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||| |    
T  42865200 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacctttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcac 42865101  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  42865100 atta 42865097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21788136 - 21788081
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  21788136 gactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagc 21788081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 33050118 - 33050067
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 171  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  33050118 actcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaac 33050067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20229323 - 20229208
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  20229323 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattccagcataatcaaatcacatta--agttaaataacaaatcattctcaaaagtttcttgatcat 20229226  T
Q  211 tcaataataattcaagta 228  Q
    |||| || ||||||||||    
T  20229225 tcaacaacaattcaagta 20229208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 22468790 - 22468735
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||||    
T  22468790 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagc 22468735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 166
Target Start/End: Original strand, 21022631 - 21022701
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||    
T  21022631 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaggcagatcaca 21022701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Original strand, 6151848 - 6151905
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagca 153  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  6151848 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagca 6151905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 20135214 - 20135267
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  20135214 gactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaaca 20135267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 22831503 - 22831446
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagca 153  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  22831503 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagca 22831446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 57)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 93 - 260
Target Start/End: Original strand, 17410434 - 17410601
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatctt 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17410434 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacttaatatcaattcatctt 17410533  T
Q  193 caacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 260  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410534 cgacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 17410601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23535681 - 23535474
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  23535681 cttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcat-ttcaacaatttcttgatcat 23535583  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||    
T  23535582 tcaataataattaaagtaatgcaatctatcaataaatcac-gtataatcacttagcatttcatagaagcttcacagttctcatttaatatcttaaacagg 23535484  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    ||||||||||    
T  23535483 tctcattagt 23535474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 20295868 - 20296060
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20295868 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 20295967  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  20295968 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 20296060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 15236865 - 15236665
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  15236865 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaagaata 15236766  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  15236765 attcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 15236666  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  15236665 t 15236665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19472805 - 19472613
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19472805 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 19472706  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  19472705 atttaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 19472613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21366781 - 21366552
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattca 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||       |||||||||||    
T  21366781 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattca 21366682  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagt 287  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||     
T  21366681 t-ttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacaga 21366583  T
Q  288 tctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21366582 tctcagttaacatcttaaataggtcacatta 21366552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 114 - 315
Target Start/End: Original strand, 42805436 - 42805636
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||| |    
T  42805436 attcagactcatgcaacttggttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaattccttgatcattta 42805533  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  42805534 ataataattcaagtaaataaaatcaatccataattcactttatattcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtc 42805633  T
Q  313 tca 315  Q
    |||    
T  42805634 tca 42805636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 114 - 319
Target Start/End: Original strand, 18774219 - 18774424
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18774219 attcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattttcaacaatttcttgatcattca 18774316  T
Q  214 ataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataa-atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggt 311  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||| | ||||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||    
T  18774317 acaataattcaagtaaatacaatcaatccataatttcacttcataatcactgaacaattcataaaagcttcacagttctcaggtaatatctttaataggt 18774416  T
Q  312 ctcattag 319  Q
    ||||||||    
T  18774417 ctcattag 18774424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26742835 - 26742636
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   |||||||| ||| ||||  ||||||| | |||||||||||||    
T  26742835 ttcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcag--gcttaataacaactcattctcaacaattccttgatcattcaa 26742738  T
Q  215 taataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| | |||| |||| |||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  26742737 taataattcgagtaaatacaatcaaaccataattcactttataatcacttaatatatcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtct 26742638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20911263 - 20911101
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20911263 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 20911167  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  20911166 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 20911101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 319
Target Start/End: Original strand, 18784062 - 18784267
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  18784062 attcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattttcaacaatttctttatcattca 18784159  T
Q  214 ataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataa-atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggt 311  Q
    | |||||||||||| ||| ||||||||| ||||  |||| | ||||||||| | || ||||||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||| |||    
T  18784160 acaataattcaagtaaatacaatcaatccataatttcacttcataatcactgaacaattcataaaagcctcacagttctcagtcaatatctttaattggt 18784259  T
Q  312 ctcattag 319  Q
    ||||||||    
T  18784260 ctcattag 18784267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 115 - 320
Target Start/End: Original strand, 20232568 - 20232771
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||| ||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||  ||||||| || ||||||| ||||    
T  20232568 ttcagacttatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattctcaacaa-ttattgatcaatcaa 20232664  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20232665 caataattcaagtaaaggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatcttaaataggtct 20232764  T
Q  314 cattagt 320  Q
     ||||||    
T  20232765 tattagt 20232771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 24767665 - 24767493
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ctt---aatatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||   ||||||||    
T  24767665 catcatcatcttaatcatcttatatagatttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatcaa 24767566  T
Q  185 ttcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  24767565 ttcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 24767493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 18355970 - 18356132
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  || |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  18355970 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatca--agtttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 18356066  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  18356067 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 18356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 24533136 - 24532938
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  24533136 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcaacataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaa 24533040  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  24533039 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttagtatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctctaataggtct 24532940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26666219 - 26666021
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  26666219 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaa 26666123  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  26666122 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctctaataggtct 26666023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 26937816 - 26937618
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||| ||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||| ||||    
T  26937816 ttcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacgtcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaatcaa 26937720  T
Q  215 taataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | |||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  26937719 caataattcaagtaagggcaatcaatccataattcacttcataatcacttaatatatcataaaggcttcacagttctcagtcaatatctctaataggtct 26937620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 33409253 - 33409449
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  33409253 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 33409350  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  33409351 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 33409449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Original strand, 18356474 - 18356548
Alignment:
Q  246 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  18356474 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttctcagttaacatcttaaataggtctcattagt 18356548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20910813 - 20910685
Alignment:
Q  191 ttcaacaacttcttgatcattcaataataattc--aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagtt 288  Q
    ||||||||| |||||| |||||||  |||||||  |||||||||| | || || || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  20910813 ttcaacaacatcttgaacattcaa--ataattcttaagtaatgca-taaaacattatatcacattataatcacttagcatttcacaatagcttcacagtc 20910717  T
Q  289 ctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  20910716 ctcagataacatcttaaataggtctcattagt 20910685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 20805575 - 20805780
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  ||||         | ||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  20805575 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaagaacaaaataatttcataatatcaattcat--tcaacaacatctagatcat 20805672  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta-taatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||| |||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||  |||||||||||    
T  20805673 tcaataacatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattaccaataacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatag 20805771  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  20805772 gtcacatta 20805780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 16674177 - 16674373
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16674177 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 16674274  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | ||| || |||| || ||||||| | ||| ||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  16674275 caagtaaaggcaatcaatctatatttcatttcatagtctcttaacagttcataaaaactttacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 16674373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 115 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 21340855 - 21340657
Alignment:
Q  115 ttcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaa 214  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||  | ||||| |||||||||| | ||    
T  21340855 ttcagactcatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattctaaacaa-ttcttgatcaattaa 21340759  T
Q  215 taataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtct 313  Q
     |||||||| ||| || ||||||| || |||  |||  | |||||| |||| || |||| ||  |||||||||||| |||| |||||||  |||||||||    
T  21340758 caataattcgagtaaaggcaatcactccatatttcatttcataatcccttaacaattcaaaaaggcttcacagttcccagtcattatctctaataggtct 21340659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Original strand, 23451371 - 23451573
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca-------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||        | ||| |||||||| | ||||||||| || | ||||||    
T  23451371 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacatcaattc-ttttcaacaacatcataatcatt 23451469  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||| ||| || | |||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  23451470 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcactttacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatagg 23451568  T
Q  311 tctca 315  Q
    |||||    
T  23451569 tctca 23451573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 20766997 - 20767202
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| ||||| | |||        |||||||||||  |||||||| ||| ||||||    
T  20766997 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcaaatcacaacaacaacataagttcataatatcaattcat--tcaacaacatctagatcat 20767094  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta-taatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||| | ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  ||  |||||| | |||| || ||| |||||| | |||||||  |||||||||||    
T  20767095 tcaataacatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattaccaacaacttagtagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatag 20767193  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  20767194 gtcacatta 20767202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 10753385 - 10753515
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  10753385 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 10753478  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  10753479 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 10753515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 17718520 - 17718324
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | || ||||||||| |||||||||   | | |||| ||  ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17718520 catgcaacttagttaaataacatttgccgcataatcaaatcacatcat--gttcaataacagatcattctcaacaatttcttgatcattcaataataatt 17718423  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || | |||||||  |||  |||  | |||||| || | || ||||||| | ||||||||||| |||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  17718422 caagtaaaggaaatcaattcatatttcatttcataatctctaaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcaatatctttaataggtctcattagt 17718324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 182 - 311
Target Start/End: Original strand, 22757219 - 22757349
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagct 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||| ||| ||| | ||    
T  22757219 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaataataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttcttaacaact 22757318  T
Q  281 tcacagttctcagttattatcttaaataggt 311  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  22757319 tcacaggtctcagttaacatcttaaataggt 22757349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 120 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 40723672 - 40723607
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaat 185  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40723672 actcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataatcggatcatatcaacaacttaatatcaat 40723607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 1859070 - 1858929
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca-------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||        | ||| | |||||||| ||||||||| || | ||||||    
T  1859070 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcataatcatt 1858972  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  1858971 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 1858929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21885282 - 21885082
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  21885282 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 21885185  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||  | | |||||||| ||||    
T  21885184 tcaacaacaattcaagtaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttgacaattcataa-agcttcacagttcataataattatctttaata 21885086  T
Q  309 ggtc 312  Q
    ||||    
T  21885085 ggtc 21885082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 12028659 - 12028451
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  12028659 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 12028560  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    || | |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || || |||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  12028559 tcgagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 12028460  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    || ||||||    
T  12028459 gtttcatta 12028451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Original strand, 23458615 - 23458817
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||        | ||| | |||||| | ||||||| | || | ||||||    
T  23458615 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagaagcataatcagatcacaacaacactatacttcataacagcaattctt-ttcaacagcatcataatcatt 23458713  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  23458714 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatagg 23458812  T
Q  311 tctca 315  Q
    |||||    
T  23458813 tctca 23458817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Original strand, 23462876 - 23463078
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||        | ||| | |||||| | ||||||| | || | ||||||    
T  23462876 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagaagcataatcagatcacaacaacactatacttcataacagcaattctt-ttcaacagcatcataatcatt 23462974  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  23462975 caataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatagg 23463073  T
Q  311 tctca 315  Q
    |||||    
T  23463074 tctca 23463078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 123399 - 123214
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||   ||||        | |||||||| ||||||||| ||    | ||    
T  123399 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcatcacaacaattcattttcaacaacatcaaagttat 123300  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagtta 296  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| ||   |||| || ||||||| ||| |||||| |||||||||    
T  123299 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatctttaaatcacattacaacagcttaacaattcataacagcctcacagatctcagtta 123214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Original strand, 26680604 - 26680652
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26680604 agactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcaca 26680652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Original strand, 26952211 - 26952259
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26952211 agactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcaca 26952259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Original strand, 24221899 - 24222042
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||        | |||||||| ||||||||| ||| | | |    
T  24221899 agactcatgcaacctagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagttta 24221997  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  24221998 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 24222042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 275
Target Start/End: Original strand, 10753122 - 10753204
Alignment:
Q  194 aacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  10753122 aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 10753204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 312
Target Start/End: Original strand, 26172488 - 26172677
Alignment:
Q  122 tcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataat 221  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| ||| || |  |||| |  ||||||||||||||| || |||    
T  26172488 tcattcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcgttctcaatagtttcttgatcattcaacaacaat 26172585  T
Q  222 tcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||| || || |||||| |||| |||| | ||||||| ||  || ||||||| |||||||||||||  | | |||||||| ||||||||    
T  26172586 tcaagtaagtgtaattcaatccataattcacttcataatcatttgacaattcataa-agcttcacagttcataatcattatctttaataggtc 26172677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 166
Target Start/End: Original strand, 31342169 - 31342217
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  31342169 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcaca 31342217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 10752956 - 10753015
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  10752956 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataattaaatcacatcaa 10753015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17517295 - 17517240
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  17517295 gactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 17517240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17919245 - 17919198
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  17919245 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcaca 17919198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Original strand, 4036232 - 4036290
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 169  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4036232 cttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 4036290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25229499 - 25229441
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 169  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25229499 cttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 25229441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 25293655 - 25293597
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 169  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25293655 cttattcatattcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 25293597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 14079278 - 14079381
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||||||||||| |    
T  14079278 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataagagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 14079377  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  14079378 atta 14079381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 23572084 - 23572160
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  23572084 catcatcttaatcatcttatatggactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaaca 23572160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 11220521 - 11220588
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  11220521 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 11220588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 11228930 - 11228997
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  11228930 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 11228997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 11230919 - 11230986
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  11230919 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 11230986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 274
Target Start/End: Original strand, 11226940 - 11227006
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcata 274  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  11226940 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcata 11227006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 23201383 - 23201436
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  23201383 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 23201436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 23512121 - 23512174
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  23512121 gactcatgcactttagttaaataacaatagcagcataggcagatcgcatcaaca 23512174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873313
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcata 21873313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 254
Target Start/End: Original strand, 31342219 - 31342291
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | | ||||||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31342219 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaaggataattcaagtaatgcaattaatcgttaaatcacatta 31342291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 158; Significance: 5e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 2766 - 2558
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  2766 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaattgcagcataatcagatcacatcaacagcttaataacaattcat-ttcaacaatttcttgatcat 2668  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  2667 tcaataacaattcaagtaatccaatcaatcaatatatcacaatataatcacttagcagttcataaaagcttcacaattctcagttaatatcttaaatagg 2568  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    ||||||||||    
T  2567 tctcattagt 2558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 124 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 13568 - 13372
Alignment:
Q  124 atgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattc 223  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13568 atgcaactcagttaattaacaataacagaataatcagatcacatcaacaacttaatatcaatcgatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatta 13469  T
Q  224 aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13468 aagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagctacacagttatcagttaatatcttaaataggtctcattagt 13372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 111 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 18726 - 18522
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||    
T  18726 cttattcagactcatgcaacttaggtaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaataacaattcattttcaataatttcttgatcat 18627  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||| ||||||    
T  18626 tcaaaaataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataaaagcttcacagttctcattcaatatctttaatagg 18527  T
Q  311 tctca 315  Q
    |||||    
T  18526 tctca 18522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 6)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 65613 - 65421
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  65613 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcttgatcattcaataata 65514  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  65513 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 65421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 61697 - 61505
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  61697 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 61598  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  61597 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 61505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 80736 - 80933
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  80736 actcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaacatcttcctgatcattcaataata 80832  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  80833 attcaagtaatgcaatcaattaataaatcacattataaacacttagcatttcaatacagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 80932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 80307 - 80366
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  80307 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 80366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 12763 - 12839
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  12763 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttcaataacaataacagcataggcagatcacaacaaca 12839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 194 - 254
Target Start/End: Original strand, 80473 - 80533
Alignment:
Q  194 aacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  80473 aacaacatcttgatcattcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 80533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 173304 - 173511
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  173304 cttattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttctttatcat 173401  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||    
T  173402 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaatatatcacaatataatcacttagcatttcataatagcttcaaagttctcagttaatatctttaatagg 173501  T
Q  311 tctcattagt 320  Q
    |||| |||||    
T  173502 tctctttagt 173511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 422626 - 422483
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||| ||||| | ||||        | |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  422626 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataattagatcacaacaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagatca 422528  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | | ||  ||||||||||||    
T  422527 ttcaagaataattcaagtaatgcatttagtcgttaaatcacatta 422483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 228466 - 228258
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| | |||||||||||    
T  228466 cttattcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcagatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaactatttcttgatcat 228369  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  228368 tcaataataattcaagtaaatgcaatcaatcaataaatcactatataatcacttagcatttcataaaaacttcacagttctcagttaatatcttaagtag 228269  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||||||||    
T  228268 gtctcattagt 228258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3960 - 3760
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3960 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 3861  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  3860 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatctcagataggtctcattag 3761  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  3760 t 3760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 5186 - 4994
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5186 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagctcatatcaacaacttaatatcaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 5087  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  5086 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 4994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 54)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Original strand, 43251834 - 43252026
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  43251834 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcctaatcattcaataata 43251933  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  43251934 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 43252026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 19278368 - 19278176
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19278368 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 19278269  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  19278268 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 19278176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21972670 - 21972478
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21972670 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 21972571  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  21972570 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 21972478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 21976755 - 21976563
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21976755 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 21976656  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  21976655 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 21976563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 16231565 - 16231360
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16231565 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaaattcttgatcattca 16231468  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  16231467 ataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtc 16231368  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  16231367 tcattagt 16231360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 22044900 - 22045105
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    |||||||||||||||||||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  22044900 attcagactcatgcaacttagtttgataacaattgcagcacaatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattcc 22044997  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  22044998 ataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatctcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtc 22045097  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  22045098 tcattagt 22045105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 152 - 312
Target Start/End: Original strand, 22111904 - 22112064
Alignment:
Q  152 cataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 251  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22111904 cataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 22112003  T
Q  252 ttataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  22112004 ttataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 22112064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 20466133 - 20465957
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| ||||| | |||        ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20466133 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatca 20466035  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20466034 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttagcatttcataacagcttcacag 20465957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 30643386 - 30643177
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||        ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30643386 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatca 30643288  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagc-ttcacagttctcagttattatcttaaat 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||||| || ||| ||| ||| ||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  30643287 ttcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcatattataatcaacttaacagttcgtaacagctttcacagattgcagttaacatcttaaat 30643188  T
Q  308 aggtctcatta 318  Q
    ||||| |||||    
T  30643187 aggtcacatta 30643177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 177 - 319
Target Start/End: Original strand, 18619555 - 18619698
Alignment:
Q  177 aatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataa 275  Q
    ||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  18619555 aatntcaattcattttcagcaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaagacaatcaatccataaatcactttatattcacttaacatctcataa 18619654  T
Q  276 tagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
     |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  18619655 aagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtctcattag 18619698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 191 - 320
Target Start/End: Original strand, 22028648 - 22028778
Alignment:
Q  191 ttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttc 289  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22028648 ttcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacatttcataaaagcttcacagttc 22028747  T
Q  290 tcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    | ||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  22028748 ttagtcaatatcttcaataggtctcattagt 22028778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 23834188 - 23834394
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  23834188 attcagactcatgcaacatagtttaataacaattgcatcatagtcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaatttcttggtcattca 23834285  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaat-cacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggt 311  Q
    | |||||||||||||| | |||||| || |||||| ||| | ||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  23834286 acaataattcaagtaaatacaatcagtccataaattcacttcataatcacttaacaattcataaaagattcacagttctcagtcaatatctttaataggt 23834385  T
Q  312 ctcattagt 320  Q
    |||||||||    
T  23834386 ctcattagt 23834394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15603111 - 15602903
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagct--------taatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  15603111 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacatcaacagcaaaatttcataatatcgattcat-ttcaacaacatcttgatca 15603013  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata-atcacttagca-tttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaat 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |  |||||||| ||||| || |||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  15603012 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacagacaacttagcagtttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaat 15602914  T
Q  308 aggtctcatta 318  Q
    ||||| |||||    
T  15602913 aggtcacatta 15602903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 30308846 - 30308640
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| | ||||||| ||| |||||||| ||| |||||     |||||| ||| ||||   |||||| |||||||||||    
T  30308846 cttattcatactcatgcaaattagtttaataacaattgcaacataatcaaatcccatcagat--ttaataacaaatcattcacaacaatttcttgatcat 30308749  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||    
T  30308748 tcaacaataattcaagtaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcttaaaagcttcagagttctcagtcaatatctttaatagg 30308649  T
Q  311 tctcattag 319  Q
    |||||||||    
T  30308648 tctcattag 30308640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14398201 - 14398039
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||  | ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||    
T  14398201 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcgcat--aaagcttaataacaattcat-ttcaacaacaacttgatcat 14398105  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  14398104 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 14398039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15611563 - 15611355
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagct--------taatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  15611563 agactcatgcaacttggttaaataacaaaaccagcataatcagatcacatcaacagcaaaatttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatca 15611465  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata-atcacttagca-tttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaat 307  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| | |  |||||| | ||||| || |||||||||| | |||||||  |||||||||    
T  15611464 ttcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacagacaacttagtagtttca-aacagcttcacagatttcagttaacatcttaaat 15611366  T
Q  308 aggtctcatta 318  Q
    ||||| |||||    
T  15611365 aggtcacatta 15611355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 16410347 - 16410141
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| |||        |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  16410347 gactcatgcaacttagtgaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataataccaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 16410249  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || ||| |||||  | ||||||| ||||||||||||    
T  16410248 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcctcacatatttcagttaatatcttaaatag 16410150  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  16410149 gtcacatta 16410141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 17926799 - 17926593
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| | ||||||| ||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  17926799 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcaaaacaacagcataatttcacaatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 17926701  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || |||||||||| | ||| |||  |||||||||||    
T  17926700 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagcttcacagatttcaattaacatcttaaatag 17926602  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  17926601 gtcacatta 17926593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 256
Target Start/End: Original strand, 21387086 - 21387228
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21387086 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 21387182  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    || ||| || ||| |  |||||| | ||||| ||||||||| ||||    
T  21387183 tcgatactatttcgaacaatgcatttaatcattaaatcacagtata 21387228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 23847096 - 23846900
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctt-aatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataat 221  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||   |||| || |||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23847096 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcaca---acagatttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataat 23847000  T
Q  222 tcaagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||||||| | ||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  23846999 tcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 23846900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 111 - 249
Target Start/End: Original strand, 21383666 - 21383801
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||    
T  21383666 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttaatcat 21383762  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatca 249  Q
    |||||| || ||| || |||||| | ||||| |||||||    
T  21383763 tcaatactatttcgagcaatgcatttaatcattaaatca 21383801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 20856518 - 20856311
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |         | ||| | |||||||| ||||||||| ||| | | ||    
T  20856518 gactcatgcaacttagttaaataacaa-agcagcataatcagatcacaacaatattataacttcataacaacaattcattttcaacaacatctaggttat 20856420  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||  ||||| |||||    
T  20856419 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttagcaattcataacaggttcacagatctcagctaacatctttaatag 20856320  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  20856319 gtcacatta 20856311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 319
Target Start/End: Original strand, 15538473 - 15538668
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  15538473 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataact 15538570  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | || ||| |||| || ||||||| | |||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15538571 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcattatcccttaacagttcataaaatcttcactgttcacagtcattatctctaataggtctcattag 15538668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 319
Target Start/End: Original strand, 15531914 - 15532108
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  15531914 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 15532011  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | || ||| |||| || || |||| | ||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||    
T  15532012 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcattatcccttaacagtt-ataaaatcttcatagttcacagtcattatctctaataggtctcattag 15532108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18862730 - 18862600
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  18862730 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 18862637  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  18862636 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 18862600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21828099 - 21827969
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  21828099 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 21828006  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  21828005 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 21827969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 16861418 - 16861277
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||        | ||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  16861418 gactcatgcaactcggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacattatatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcttaatcatt 16861320  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||||| | | ||||| ||||||||||||    
T  16861319 caataatatttcaagtaatgtatttaatcattaaatcacatta 16861277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 24755842 - 24755922
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24755842 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacag 24755922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 251
Target Start/End: Original strand, 21410971 - 21411096
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  21410971 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 21411064  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 251  Q
     ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  21411065 tttcaaataatgcatttaatcattaattcaca 21411096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 251
Target Start/End: Original strand, 21805463 - 21805588
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  21805463 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 21805556  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcaca 251  Q
     ||||| ||||||| | ||||| ||| |||||    
T  21805557 tttcaaataatgcatttaatcattaattcaca 21805588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Original strand, 377414 - 377511
Alignment:
Q  222 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  377414 tcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattatgatcagcttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcacatta 377511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 32605223 - 32605400
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  32605223 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcacaatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 32605320  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttc 289  Q
    |||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  32605321 tcaacaacaattcaagtaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttc 32605400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 24755714 - 24755790
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24755714 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 24755790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17828663 - 17828580
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||    
T  17828663 catgcaacttagttaattaacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaaatcattctcaacaa-ttcttgatca 17828580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18678196 - 18678141
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  18678196 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 18678141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 174
Target Start/End: Original strand, 32121759 - 32121814
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagc 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  32121759 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagc 32121814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 39095018 - 39094875
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||         | ||||| |||||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  39095018 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacaattcattttcaacaacatcaaggttat 39094919  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| ||||| ||||||    
T  39094918 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaattacatta 39094875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 222 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 19259565 - 19259500
Alignment:
Q  222 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  19259565 tcaagtaatgaaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataatagcttcacag 19259500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 118 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22010769 - 22010716
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 171  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22010769 agactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaac 22010716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 111 - 289
Target Start/End: Original strand, 32598691 - 32598868
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||  ||   |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  32598691 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcacaatcaaatcacatca--agtcaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 32598788  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttc 289  Q
    |||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||    
T  32598789 tcaacaacaattcaagtaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttc 32598868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 111 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 17055472 - 17055412
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 171  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  17055472 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaataacatcaac 17055412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23776929 - 23776807
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaa-ttcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||| || |||        ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||    
T  23776929 gactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaatttcat-ttcaacaacatcttaatca 23776831  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgca 233  Q
    ||||||||||  | ||||||||||    
T  23776830 ttcaataatatcttaagtaatgca 23776807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Original strand, 23648580 - 23648633
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||| |||||    
T  23648580 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaaca 23648633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 172
Target Start/End: Original strand, 377295 - 377347
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  377295 actcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaagcagatcacaacaaca 377347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 19983223 - 19983326
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||||||||||| |    
T  19983223 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 19983322  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  19983323 atta 19983326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 18862978 - 18862911
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  18862978 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 18862911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21828347 - 21828280
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  21828347 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 21828280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17354037 - 17353984
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  17354037 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 17353984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19259685 - 19259632
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||    
T  19259685 gactcatgcaacttggttaaataacaatagtagcataagcagttcacaacaaca 19259632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21162152 - 21162099
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  21162152 gactcatgcaacttagttaaataataataacagcataggcagatcacaacaaca 21162099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21168825 - 21168772
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||| |||||    
T  21168825 gactcatgcaacttagttaaataataataacagcataggcagatcacaacaaca 21168772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22010678 - 22010629
Alignment:
Q  205 gatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  22010678 gatcattcaagaatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 22010629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 16184720 - 16184796
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||| |||||||| || |||||  |||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16184720 catcatcttaatcatcttatatagaatcatgcaagttggttaaacaacaatagcagcataagcatatcacaacaaca 16184796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 19899225 - 19899328
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcac--ttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||||||||||| |    
T  19899225 ataactcaagtaatgaaattaatcattaaatcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttaaataggtcac 19899324  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  19899325 atta 19899328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 20110 - 19902
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||    
T  20110 cttattcagattcatgcaacttagtttaataacaattgcaacataatcagatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcat 20013  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  20012 tcaataataattcaagtaaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttaacgtttcataaaagcttcacagttctcaattaatatctttaatag 19913  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    |||||||||||    
T  19912 gtctcattagt 19902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 36027 - 35836
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36027 actcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataattagatcatatcaacagcttaatatcaattaat-ttcaacaacttcctgatcattcaataata 35929  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  35928 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 35836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Original strand, 6957 - 7164
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||| ||| ||||   || |||||||||||||||    
T  6957 cttattcatgctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaataacaaatcattcacagcaacttcttgatcat 7054  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  7055 tcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacataacaattcataaaagcttcagagttctcagtcaatatctttaatag 7154  T
Q  310 gtctcattag 319  Q
    ||| ||||||    
T  7155 gtcacattag 7164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 120 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 58804 - 58612
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  58804 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagattatatcaacagcttaataccaattcattttcaacaacttcctgatcattcaataata 58705  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || | |||||||| ||||||||    
T  58704 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcattatctttaataggtc 58612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 9759 - 9550
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttc-aacaacttcttgatca 209  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||| |||||||| |   ||||| ||||||||||    
T  9759 cttatttagactcatgcaacatagttaattaacaattgcagcgtaatcagatcacatcaa--gcttaataacaattcatttaataacaatttcttgatca 9662  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9661 ttcaataataattcaagtaaatgcgatcaatcaataaatcacattataatcacttaaaatttcataaaagcttcacagttctcagttaatatcttaaata 9562  T
Q  309 ggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||    
T  9561 ggtctcattagt 9550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 129; Significance: 9e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 120 - 320
Target Start/End: Original strand, 12443 - 12643
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||| |||||||    
T  12443 actcatgtaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcatatcaacagcttaatatcaattcattttcaacaacttcccaatcatttaataata 12542  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattag 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |  ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  12543 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaaataacagttaacatcttagataggtctcattag 12642  T
Q  320 t 320  Q
    |    
T  12643 t 12643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 18450 - 18246
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||    
T  18450 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaattccttgatcattca 18353  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| ||||  ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  18352 ataataattcaagtaaatacaatcaatccataattcactttattttcacttaacatatcataaaagcttcacagttctcagtcattatctttaataggtc 18253  T
Q  313 tcattag 319  Q
    |||||||    
T  18252 tcattag 18246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3620 - 3415
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  3620 attcagactcatgcaacttagttaaataacaattgcagtataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaattcattttcaacaatttcttgatcattca 3523  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||    
T  3522 ataacaattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactctatattcacttaacatttcataaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaatgggtc 3423  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  3422 tcattagt 3415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 200 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 10589 - 10469
Alignment:
Q  200 ttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttatta 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10589 ttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagtatttcataatagcttcacagttctcagttaata 10490  T
Q  300 tcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  10489 tcttaaataggtctcattagt 10469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 96 - 173
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69871
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag 173  Q
    |||||| || || ||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacag 69871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 104; Significance: 8e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 8e-52
Query Start/End: Original strand, 96 - 315
Target Start/End: Original strand, 4430 - 4657
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||        ||||||||    
T  4430 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataatcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattc 4529  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  4530 at-ttcaacaacatcttgatcattcgataatatttcaagtaatgcaattaatcaataaatcacattataatcaacttagcatttcataatagtttcacag 4628  T
Q  287 ttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||  ||||||   ||||| ||||||||||    
T  4629 tttacagttaacttcttatataggtctca 4657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Original strand, 471 - 602
Alignment:
Q  120 actcatgcaactt-agttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataat 218  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||    
T  471 actcatgcaactttagttaaataacaatagcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataat 564  T
Q  219 aattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
    | ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  565 atttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 159 - 390
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||        |||||||||    
T  159 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaacataacttcataatatcaattc 258  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  259 attttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattagtcattaaatcacattataatcaacttaacagttcataacagcttcacag 358  T
Q  287 ttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
     | || ||||  ||||||| |||||| |||||    
T  359 atttccgttaacatcttaattaggtcacatta 390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 25059 - 24853
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttctt-gatcattc 212  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||  ||| ||||| || | ||| ||||||||    
T  25059 attcagactcatgcaactcagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaacacattttcaataattcctttgatcattc 24962  T
Q  213 aataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggt 311  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  24961 aataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttataatcacttaacatttcctaaaagcttcacagttctcagtcaatatctttaataggt 24862  T
Q  312 ctcattagt 320  Q
    |||||||||    
T  24861 ctcattagt 24853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 189462 - 189332
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  189462 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 189369  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  189368 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 189332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 189710 - 189643
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  189710 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 189643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 1494 - 1723
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattca 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    ||       |||||||||||    
T  1494 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaactttatacttcatcatatcaattca 1593  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagt 287  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||||     
T  1594 t-ttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagcagcttcacaga 1692  T
Q  288 tctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  1693 tctcagttaacatcttaaataggtcacatta 1723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 42627 - 42852
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag------cttaatatcaattcat 189  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||       | ||||||||||||||    
T  42627 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattaacttcataatatcaattcat 42726  T
Q  190 cttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagtt 288  Q
     |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||| |||| || ||||||| |||||||||| |    
T  42727 -ttcaaca---tcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattagaatcagcttaacagttcataacagcttcacagat 42822  T
Q  289 ctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    ||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  42823 ctcagttaacatcttaaataggtcacatta 42852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 318
Target Start/End: Original strand, 393 - 623
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||        |||||||||    
T  393 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacagcagcataacttcataatatcaattc 492  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||    
T  493 tt-ttcaacgacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcatagtagcttcacag 591  T
Q  287 ttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
     ||||| |||  |||||||||||||| |||||    
T  592 atctcaattaacatcttaaataggtcgcatta 623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 96 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 6425 - 6227
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||        |||||||||    
T  6425 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacatcataacttcataatatcaattc 6326  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6325 at-ttcaacaacttcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaataattaaatcacaatataaacaacttaacatttcataatagcttcacag 6227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Original strand, 5608 - 5815
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||       |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5608 agactcatgcaacttagttaaataacagtagcagcataatcagatcacaacaacagcatagttcataatatcaattcattttcaacaacatcttgatcat 5707  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| || |||||||||  ||||| |||||    
T  5708 tcaataatatctcaagtaatgcaattattcatttaatcacattataatcagcttaacaattcataacagcttcaaagatctcagttaacatctt-aatag 5806  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  5807 gtcacatta 5815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Original strand, 6803 - 7010
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctta-------atatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||       |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6803 agactcatgcaacttagttaaataacagtagcagcataatcagatcacaacaacagcatagttcataatatcaattcattttcaacaacatcttgatcat 6902  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||||||||  |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||| || |||||||||  ||||| |||||    
T  6903 tcaataatatctcaagtaatgcaattattcatttaatcacattataatcagcttaacaattcataacagcttcaaagatctcagttaacatctt-aatag 7001  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  7002 gtcacatta 7010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 84; Significance: 7e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 96 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 17228 - 17056
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattc 187  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||    
T  17228 catcatcttaatcatcttgtatagactcatggaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcataacttcataatatcaattc 17129  T
Q  188 atcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca 260  Q
    || | ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17128 atttccaacaacatcttgaacattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatca 17056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 172 - 320
Target Start/End: Original strand, 1 - 150
Alignment:
Q  172 agcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcattt 270  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||| |||||    
T  1 agcttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaataataattcaagtaaatgcaatcaatccataattcactttatattcacttaacattt 100  T
Q  271 cataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||| || |||| |||||||||||    
T  101 cataaaagcttcacagttctcagtcaatatttttaataagtctcattagt 150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 18750 - 18542
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||        | |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  18750 agactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaattcgt-ttcaacaacatcttgatca 18652  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||| |||    
T  18651 ttcaataatatttcaagtaatggaattaatcattaaatcacattataatcaacataccatttcataacagcttcacagattgcagttaacttcttatata 18552  T
Q  309 ggtctcatta 318  Q
    ||||||||||    
T  18551 ggtctcatta 18542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 320
Target Start/End: Original strand, 23232 - 23437
Alignment:
Q  114 attcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattca 213  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| | ||| ||| ||||| |||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||  ||||||| |||||| |||||||    
T  23232 attcagactcatgaaacatagtttaataataattgcagcttaatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattctcaacaatttcttggtcattca 23329  T
Q  214 ataataattcaagtaa-tgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtc 312  Q
    | |||||||||||||| | ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||    
T  23330 acaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataaaagcttcatagttctcagtcaatatcttgaataggtc 23429  T
Q  313 tcattagt 320  Q
    ||||||||    
T  23430 tcattagt 23437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 46820 - 46645
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||| ||| ||| |||        ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  46820 gactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaattcat-ttccacaacatcttgatcat 46722  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  46721 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttagcatttcataacagcttcacag 46645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 120 - 315
Target Start/End: Original strand, 15111 - 15313
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca-------acagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 212  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||       ||  | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  15111 actcatgcaacttagttaaataacaataacagcataatcagatcacaacacagcataacttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcattc 15209  T
Q  213 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggt 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||| |||| |||||||||| |  ||||||  |||||| | ||||    
T  15210 aataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaactttttataacagcttcacagattgcagttaacatcttataaaggt 15309  T
Q  312 ctca 315  Q
    ||||    
T  15310 ctca 15313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9741
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa-------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9536 gactcatgcaacttagttaaataacaataacaacataatcagatcacatcaacagcataactcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcatt 9634  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || || ||||||| | || ||||  ||||||||||||    
T  9635 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagtttcacagatttcggttaacatcttaaatagg 9733  T
Q  311 tctcatta 318  Q
    || |||||    
T  9734 tcacatta 9741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 1853 - 2059
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  1853 gactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 1951  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||| || || ||||||| | || ||||  |||||||||||    
T  1952 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttca-aacagtttcacagatttcggttaacatcttaaatag 2050  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  2051 gtcacatta 2059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 118 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 1584 - 1376
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||         | ||| | |||||||| ||||||||| |||||||||    
T  1584 agactcatgcaacttagttaaataaccaaagcagcataatcagatcacaacaacattataacttcataacaacaattcat-ttcaacaacatcttgatca 1486  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | ||  ||| |||||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||    
T  1485 ttcaataatatttcaagtaatgcaattattcgttaagtcacattataatcagcttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaata 1386  T
Q  309 ggtctcatta 318  Q
    |||| |||||    
T  1385 ggtcacatta 1376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 93 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10162 - 9990
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-----ctt---aatatcaa 184  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||     |||   ||||||||    
T  10162 catcatcatcttaatcatcttatatagatttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaatagtataactttataatatcaa 10063  T
Q  185 ttcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  10062 ttcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 9990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6350 - 6143
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||  || |||||| ||| ||||   || |||||||||||||||    
T  6350 cttattcatgctcatgcaacatagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agtttaataacaaatcattcacagcaacttcttgatcat 6253  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||| | |||||||| || || ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  6252 tcaacaataattcaagtaaatacaatcaatccataattcacttcataatcacataacaattcataaaagcttcagagttctcagtcaatatctttaatag 6153  T
Q  310 gtctcattag 319  Q
    ||| ||||||    
T  6152 gtcacattag 6143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 6693 - 6855
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||  ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6693 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatctcatca--agcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 6789  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    || |||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  6790 tctataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 6855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Original strand, 30897 - 31059
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30897 cttattcatactcatgcaacttagttaaataacaattacagcataatcaaatctcatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 30993  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  30994 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 31059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 199 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 1014 - 901
Alignment:
Q  199 cttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttatt 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||| || |  ||    
T  1014 cttcctgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataaacacttagcatttcaatatagcttcacaattcacaatcctt 915  T
Q  299 atcttaaataggtc 312  Q
    ||||| ||||||||    
T  914 atctttaataggtc 901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2178 - 1970
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa--------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||        ||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  2178 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatccat-ttcaacaacatcttgatcat 2080  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagca-tttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    ||||| | | ||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| || | |||||||| |||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  2079 tcaatgaaatttcaagtaatgcatttaatcattaaattacattacaaacaacttagcattttcataacagcttcacatatttcagttaatatcttaaata 1980  T
Q  309 ggtctcatta 318  Q
    |||| |||||    
T  1979 ggtcacatta 1970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 9916 - 10124
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  9916 cttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcat 10013  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  10014 tcaacaataattcaagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaatag 10113  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    ||| |||||||    
T  10114 gtcacattagt 10124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 104 - 258
Target Start/End: Original strand, 2913 - 3074
Alignment:
Q  104 taattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agct---taatatcaattcatcttcaa 195  Q
    |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||   ||||||||||| || |||||    
T  2913 taataatcttatatagacttatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacaatataactttataatatcaattaat-ttcaa 3011  T
Q  196 caacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataat 258  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||    
T  3012 caacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaattcacattataat 3074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 176 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 21597 - 21455
Alignment:
Q  176 taatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcata 274  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||| || ||||||    
T  21597 taatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatacaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacagttcata 21499  T
Q  275 atagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
      |||||||||  | |||||||  |||||||||||||| |||||    
T  21498 gcagcttcacaaatttcagttaacatcttaaataggtcacatta 21455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 182 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 80713 - 80642
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  80713 caattcat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcgagcaatgcatttaatcattaaatcacatta 80642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 80869 - 80810
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  80869 cttattcatactcttgcaacttagttaaataacaattgcagcataattaaatcacatcaa 80810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 20557 - 20395
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |||| |||| ||||||| ||    
T  20557 cttattcatattcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agcttaataacaattcat-ttcatcaacatcttgattat 20461  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||| |||  |||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  20460 tcaataatatttcgtgtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 20395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 96 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 73883 - 73725
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca-------gcttaatatcaattca 188  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||        | | |||||||||||    
T  73883 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacattatacttcatcatatcaattca 73784  T
Q  189 tcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatc 248  Q
    | |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  73783 t-ttcatcaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatc 73725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 920 - 1126
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  920 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 1018  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||||||  ||| || ||| |||||| | |||||||  |||||||||||    
T  1019 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttagcaggtca-aacagcctcacagatttcagttaacatcttaaatag 1117  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  1118 gtcacatta 1126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Original strand, 18367 - 18575
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||   | |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||    
T  18367 cttattcatacacatgcaacttagttaaataacatttgcagcataaacaaatcacatca--ggtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcat 18464  T
Q  211 tcaataataattcaagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||| || |||| |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||| |||||    
T  18465 tcaacaataattcaagtaaaggcaatcagtccataattcatttaataatctcttaacaattcataaaaacttcatagttcacagtcattatctttaatag 18564  T
Q  310 gtctcattagt 320  Q
    ||| |||||||    
T  18565 gtcacattagt 18575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 44104 - 44310
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||        |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||    
T  44104 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaattcat-ttccacaacatcttgataat 44202  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| || |||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| || | || |||||||||| | |||||||  |||||||||||    
T  44203 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttta-aaaagcttcacagatttcagttaacatcttaaatag 44301  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  44302 gtcacatta 44310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 63878 - 64074
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  63878 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaattcattctcaacaatttcttgatcattcaacaataatt 63975  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||||||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | |||||||||||  ||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  63976 caagtaaaggcaatcaatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcatagtcattatctttaataggtcacattagt 64074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 75762 - 75958
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||| ||   | |||||| ||||||||  ||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  75762 catgcaacttagttaaataacattttcagcataatcaaatcacaacag--gtttaataacaattcattctcaacaatttcttgaccattcaacaataatt 75859  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||| ||| |||  |||  | |||||| |||| || ||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  75860 caagtaaaggcaatctatccatatttcatttcataatctcttaacagttcataaaaacttcacagttcacagtcattatctttaatatgtcacattagt 75958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 34908 - 34796
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaa 305  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |  ||||||  ||||||     
T  34908 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacaattcataacagcttcacagattgcagttaacatcttat 34809  T
Q  306 ataggtctcatta 318  Q
    ||||||| |||||    
T  34808 ataggtcacatta 34796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 35036 - 34960
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| || ||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  35036 catcatcttaatcattttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 34960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 207942 - 207768
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaa-caactt 201  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||        | |||||||||||||| ||||| ||||      
T  207942 cttattcatattcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcatatcatatcaacagtataacttcataatatcaattcattttcaaacaacaa 207843  T
Q  202 cttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||||| |||||||    
T  207842 cttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagcagttcataa 207768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 320
Target Start/End: Original strand, 71460 - 71534
Alignment:
Q  246 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  71460 atcacattataatcacttaacatttcacaatagcttcacagttctcagttaacatcttaaataggtctcattagt 71534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 113 - 254
Target Start/End: Original strand, 71083 - 71215
Alignment:
Q  113 tattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||      |||||  |||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  71083 tattcatactcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatca------atcaa--gcttaataacaattcat-ttcaacaacatcttgatcattc 71173  T
Q  213 aataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||||| || || ||||||| | |||||  |||||||||||    
T  71174 aataatatttaaaataatgcatttaatcataaaatcacatta 71215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 414145 - 414002
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||         | ||| | |||||| | ||||||||| ||| |||||    
T  414145 agacgcatgcaacttagttaaataacaacagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcataacaacaattcgt-ttcaacaacatctagatca 414047  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  414046 ttcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 414002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Original strand, 139736 - 139926
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||  ||||||| | ||| ||||  ||||||| |||||||||| | |  |||||||    
T  139736 catgcaacttagttaaataacatttgcagcataatcaaatcacatca--agcttaacaacaaatcattctcaacaa-ttcttgatcaataatcaataatt 139832  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    | ||| || ||||||| || |||  |||  | |||||| |||| || |||||||   |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  139833 cgagtaaaggcaatcactccatatttcatttcataatctcttaacaattcataaagccttcacagttctcagtcattatctctaataggtctca 139926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 19317 - 19181
Alignment:
Q  179 tatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataata 277  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||  | ||||||| |    
T  19317 tatcaattcat-ttcaacaacatcttgattattcaataatatctcaagtaatgcaattaatcaataaatcacatcataatcagcttaatagttcataaca 19219  T
Q  278 gcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
    ||||||||| | ||| |||  |||||| ||||||||||    
T  19218 gcttcacagatttcatttaacatcttatataggtctca 19181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 6508 - 6302
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||| ||||        |||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  6508 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggaagatcacaacaatagcataatttcataatatcaattcat-ttcaacaacatcttgatcat 6410  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| | ||||| |||||||||||| || | | |||||| |||| || |||||||||  | |||||||  |||||||||||    
T  6409 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaagttagcagttca-aacagcttcacatatttcagttaacatcttaaatag 6311  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  6310 gtcacatta 6302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 96 - 235
Target Start/End: Original strand, 289 - 436
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac-----agcttaatatcaa----tt 186  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||     | ||| ||| |||    ||    
T  289 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataatcagatcacaacaacaatataacttcataacaacaattt 388  T
Q  187 catcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaat 235  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  389 cat-ttcaacaacatcttgatcattcaataatatttaaagtaatgcaat 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 318
Target Start/End: Original strand, 452 - 509
Alignment:
Q  261 cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||| || ||||||| |||||||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  452 cttaacaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaaataggtcacatta 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 35605 - 35397
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  35605 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaacattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaaggttat 35506  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||  | ||||||| |||||||||| |||||||||  |||| ||||||    
T  35505 tcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaataattcataacagcttcacaggtctcagttaacatctcaaatag 35406  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  35405 gtcacatta 35397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 315
Target Start/End: Original strand, 36331 - 36521
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    ||||||||||| |||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| ||||  | ||||| |||||||||| | || || ||||    
T  36331 catgcaacttaattaaataacatttgcagcataatcaaatcacatcaa--gcttaataacaaatcattcttaacaa-ttcttgatcaattaacaacaatt 36427  T
Q  223 caagtaatg-caatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctca 315  Q
       |||||| ||||||||| |||  |||| | ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  36428 tgggtaatggcaatcaatccatatttcacttcataatcacttaacaaatcataaaagcttcacagttctcagtcattatctctaataggtctca 36521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6093 - 5885
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||   | | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  6093 cttattcatactcatgcaacttagtttaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--ggttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 5996  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaa--tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| ||||||||||||||    |  |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| ||||||||| |||||||| | |||| | | ||    
T  5995 tcaacaataattcaagtaagtatatttcaatccataattcacttaataatcatttaacaattcataa-agcttcacaattctcagtcaatatcattatta 5897  T
Q  309 ggtctcattagt 320  Q
    ||||||||||||    
T  5896 ggtctcattagt 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 77264 - 77064
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  77264 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 77167  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa-tgcaa-tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaata 308  Q
    |||| || ||||||||||| |  || |||||| |||| |||| | ||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||  | | |||||||| ||||    
T  77166 tcaacaacaattcaagtaagtataattcaatccataattcacttcataatcatttaacaattcataa-agcttcacagttcataatcattatctttaata 77068  T
Q  309 ggtc 312  Q
    ||||    
T  77067 ggtc 77064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Original strand, 18259 - 18295
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18259 gactcatgcaacatagttaattaacaatagcagcata 18295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Original strand, 8583 - 8791
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatca--------attcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| || ||   |||| |||        |||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  8583 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacagcattataatttcataacaacaattcattttcaacaacatcaagtttat 8682  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||| || | ||||| || ||| ||| | |||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  8683 tcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacattacaaacaacttaacagttcttaacaacttcacaggtctcagttaacatcttaaatag 8782  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    || ||||||    
T  8783 gtttcatta 8791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 11586 - 11456
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  11586 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 11493  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  11492 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 11456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 320
Target Start/End: Original strand, 9445 - 9641
Alignment:
Q  123 catgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataatt 222  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| | |||| | ||   | |||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9445 catgcaacttagttaaataacatttgcagtataattaaatcataacag--gtttaataacaaatcattctcaacaatttcttgatcattcaataataatt 9542  T
Q  223 caagt-aatgcaatcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    ||||| || |||||||||  |||  |||  | |||||| |||| || ||||| | | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||    
T  9543 caagtaaaggcaatcaattcatatttcatttcataatctcttaacagttcatgaaaacttcacagttcacagtcattatctttaataggtcacattagt 9641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14172 - 14042
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  14172 actcatgcaacttagtttaacaacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 14079  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  14078 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 14042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 14420 - 14353
Alignment:
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataa 275  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | |||||||| |||||||    
T  14420 attcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacattataaacaacttagcagttcataa 14353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 19826 - 19618
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||         | ||||| || ||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  19826 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacacttcattttcaacaacatcaaggttat 19727  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  19726 tcaagaataaacccagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaactgcttagcaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaagtag 19627  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  19626 gtcacatta 19618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15304 - 15096
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag--------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| |||||         | ||||| || ||||| ||||||||| ||  | | ||    
T  15304 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcatcatattcagatcacaacaacattataacttcataataacacttcattttcaacaacatcaaggttat 15205  T
Q  211 tcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatag 309  Q
    |||| |||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||| || |  ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  15204 tcaagaataaacccagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaactgcttagcaattcataacagcttcacagatctcagttaacatcttaagtag 15105  T
Q  310 gtctcatta 318  Q
    ||| |||||    
T  15104 gtcacatta 15096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 193070 - 193034
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  193070 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcata 193034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 233
Target Start/End: Original strand, 7493 - 7615
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaat--------atcaattcatcttcaacaacttcttgatca 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| | ||||        | |||||||| ||||||||| ||| |||||    
T  7493 agactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacagcaacatcataatttcataacaacaattcat-ttcaacaacatctagatca 7591  T
Q  210 ttcaataataattcaagtaatgca 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  7592 ttcaagaataattcaagtaatgca 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 30836 - 30634
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacag-------cttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcatt 211  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||        | ||| | |||||||| |||||| || |||| ||||||    
T  30836 gactcatgcaacttggttaaataacaaaagcagcataatcggatcacaacaacattatacttcataacaacaattcat-ttcaactacatctttatcatt 30738  T
Q  212 caataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaatagg 310  Q
    |||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| || | |||||| | |||| || | ||| |||| | |||||||  ||||||||||||    
T  30737 caataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacaacttagaagttca-aacaactttacagatttcagttaacatcttaaatagg 30639  T
Q  311 tctca 315  Q
    |||||    
T  30638 tctca 30634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Original strand, 1889 - 2005
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||  || | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  1889 cttattcataatcatgcaacttagttaaatcacaattgcagcataatcaaatcacatca--agttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 1986  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa 229  Q
    |||| || |||||||||||    
T  1987 tcaacaacaattcaagtaa 2005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 4)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 2960 - 3040
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  2960 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcacag 3040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 207 - 286
Target Start/End: Original strand, 6626 - 6706
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  6626 tcattcattaacatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcagcttaacatttcataacagcttcacag 6706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 2832 - 2907
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 171  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  2832 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaagcagatcacaacaac 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 171
Target Start/End: Original strand, 6498 - 6573
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaac 171  Q
    |||||| ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  6498 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcacaagcagatcacaacaac 6573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 4245 - 4111
Alignment:
Q  185 ttcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttca 283  Q
    ||||| ||||||||||||  | | |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || |||| || ||||||| || ||||    
T  4245 ttcattttcaacaacttcaaggttattcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaacaattcataacagattca 4146  T
Q  284 cagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    ||  |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  4145 catatctcagttaacatcttaaataggtcacatta 4111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 4320 - 4273
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||    
T  4320 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcaca 4273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15376 - 15326
Alignment:
Q  246 atcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagtta 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15376 atcacattataatcacttatcatttcacaatagcttcacagttctcagtta 15326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14075 - 13985
Alignment:
Q  207 tcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatc-acttagcatttcataatagcttcacagttctcagtta 296  Q
    ||||||| ||| | |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||    
T  14075 tcattcattaacatttcaagtaattcaattaatcattaaatcacattataatcaacttaacatttcataacagcttcacagatttcagtta 13985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 14203 - 14127
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||  ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14203 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcatcatagttaaataacaatagcagcataagcagatcacaacaaca 14127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 222 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7061 - 6964
Alignment:
Q  222 tcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||  |||||| ||||||| |||||    
T  7061 tcaagtaatgcaattaatcattaaatctcattataatcagcttaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacatcttatataggtcacatta 6964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7204 - 7128
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| ||||| |  |||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||    
T  7204 catcatcttaatcatcttgtatagactcatgcgacatagttaaataacaatagcagcacaggcagatcacaacaaca 7128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 96 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38451
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca--------gcttaatatcaa-tt 186  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||         ||||||||||| ||    
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  187 catcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgca 233  Q
    ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||||||||    
T  38496 cat-ttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgca 38451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 182 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 192340 - 192203
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca-cttagcatttcataatagct 280  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | | |||||| ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||| || || ||||  | ||||||| | ||    
T  192340 caattcattttcaacaacatcaaggtaattcaagaataaatcaagtaatgcatttaatcattaaatcacattacaaacagcttaaaaattcataacaact 192241  T
Q  281 tcacagttctcagttattatcttaaataggtctcatta 318  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  192240 tcacagatctcagttaacatcttaaataggtcacatta 192203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 3872 - 3975
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||| |    
T  3872 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcaattaatatcttatataggtcac 3971  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  3972 atta 3975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 318
Target Start/End: Original strand, 8303 - 8406
Alignment:
Q  217 ataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctc 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| |||||||||| |  || ||| ||||||| ||||||| |    
T  8303 ataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcaattaatatcttatataggtcac 8402  T
Q  315 atta 318  Q
    ||||    
T  8403 atta 8406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4841
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagctt 176  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagctt 4841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 9347 - 9406
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9347 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 9406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 206 - 286
Target Start/End: Original strand, 32554 - 32636
Alignment:
Q  206 atcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacag 286  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||||    
T  32554 atcattcattcataactcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaacattaacatttcataacagcttcacag 32636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 8512 - 8571
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  8512 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatcaa 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 15656 - 15715
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  15656 cttattcataatcatgcaacttagttaaataacaattgcaacataatcaaatcacatcaa 15715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 152
Target Start/End: Original strand, 32459 - 32491
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagc 152  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32459 actcatgcaacatagttaattaacaatagcagc 32491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 439 - 548
Alignment:
Q  141 aacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatc 240  Q
    |||||| ||||||||||||  ||| |||||  |||||||| |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||    
T  439 aacaattgcagcataatcaattcatatcaa--gcttaataacaattcat-ttcaaca---tcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatc 532  T
Q  241 aataaatcacattata 256  Q
    | ||| ||||| ||||    
T  533 attaattcacagtata 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 235 - 320
Target Start/End: Original strand, 490 - 574
Alignment:
Q  235 tcaatcaataaatcacattataatcacttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatcttaaataggtctcattagt 320  Q
    |||||| |||| |||| | ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  490 tcaatccataattcacttcataatcacttaacaattcataa-agcttcacagttctcagtcaatatctttaataggtttcattagt 574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 169
Target Start/End: Original strand, 381 - 439
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatca 169  Q
    |||||||| | |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  381 cttattcataatcatgcaacttaattaaataacaattgcagcataatcaaatcacatca 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6171
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 6171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 170
Target Start/End: Original strand, 15350 - 15409
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaa 170  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15350 cttattcataattatgcaacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcacatcaa 15409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 32745 - 32615
Alignment:
Q  120 actcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataata 219  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||  |||  ||||  |||||||| ||||| || |||||||   |||||||||||||||||||    
T  32745 actcatgcaacttagtttaacaacaattacagcataatcaattcatgtcaa--gcttaataacaatttat-ttcaaca---tcttgatcattcaataata 32652  T
Q  220 attcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattata 256  Q
     ||||||||||||| | ||||| ||| ||||| ||||    
T  32651 tttcaagtaatgcatttaatcattaattcacagtata 32615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 111 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16756 - 16640
Alignment:
Q  111 cttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaatatcaattcatcttcaacaacttcttgatcat 210  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||   | |||| ||| ||||  |||| |  |||||||||||    
T  16756 cttattcataatcatgcgacttagttaaataacaattgcagcataatcaaatcatatcaac--ttaaataacaaatcattctcaatagtttcttgatcat 16659  T
Q  211 tcaataataattcaagtaa 229  Q
    |||| || |||||||||||    
T  16658 tcaacaacaattcaagtaa 16640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2531 - 2477
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  2531 agactcatgcaatttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaaca 2477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 10391 - 10337
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  10391 agactcatgcaatttagttaaataacagcagcagcataatcagatcacaacaaca 10337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Original strand, 33569 - 33694
Alignment:
Q  118 agactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcttaa---------tatcaattcatcttcaacaacttcttgatc 208  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| |||         ||||||||||| ||||||||| |||||||     
T  33569 agactcatccatcatagttaaataacaataacagcacaagcagatcacaacaacagcataacttcataattatcaattcat-ttcaacaacatcttgatt 33667  T
Q  209 attcaataataattcaagtaatgcaat 235  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||    
T  33668 attcaataatatctcaagtaatgcaat 33694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7311
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||||||||| |||||    
T  7364 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacataatcagatcacaacaaca 7311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16389
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcatatcacaacaaca 16389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 206 - 254
Target Start/End: Original strand, 1909 - 1957
Alignment:
Q  206 atcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  1909 atcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacatta 1957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 121 - 172
Target Start/End: Original strand, 1817 - 1868
Alignment:
Q  121 ctcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  1817 ctcatgcaacttagttaaataacaaaggcagcataatcagaccacaacaaca 1868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 26828 - 26904
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 26904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21844
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 21844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29736
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| |||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaaca 29736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 14664 - 14740
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  14664 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 14740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 23679 - 23755
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  23679 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 23755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 172
Target Start/End: Original strand, 39103 - 39179
Alignment:
Q  96 catcattttaattatcttattcagactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcacatcaaca 172  Q
    |||||| ||||| |||||||   ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||    
T  39103 catcatcttaatcatcttatattgactcatacaacttggttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaaca 39179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 119 - 166
Target Start/End: Original strand, 2191 - 2238
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcataatcagatcaca 166  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  2191 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcagcataatcaaatcaca 2238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 182 - 254
Target Start/End: Original strand, 11472 - 11544
Alignment:
Q  182 caattcatcttcaacaacttcttgatcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacatta 254  Q
    |||||||| ||||||||| ||  | | |||||| |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||    
T  11472 caattcattttcaacaacatcaagtttattcaagaataattcaagtaatgcatttaatcgttaaatcacatta 11544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 206 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 15669 - 15555
Alignment:
Q  206 atcattcaataataattcaagtaatgcaatcaatcaataaatcacattataatca--cttagcatttcataatagcttcacagttctcagttattatctt 303  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||| |||   ||| |||||||||| |||||||||| |  ||||||   ||||    
T  15669 atcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatctcacatcatattcaacattaacatttcataacagcttcacagattgcagttaacttctt 15570  T
Q  304 aaataggtctcatta 318  Q
    | |||||||||||||    
T  15569 atataggtctcatta 15555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 119 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15773 - 15737
Alignment:
Q  119 gactcatgcaacttagttaattaacaatagcagcata 155  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15773 gactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcata 15737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1873 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1873
Description:

Target: scaffold1873; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 93 - 123
Target Start/End: Original strand, 1250 - 1280
Alignment:
Q  93 catcatcattttaattatcttattcagactc 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1250 catcatcattttaattatcttattcagactc 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 709 times since January 2019
Visitors: 6719