View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0917_low_42 (Length: 311)

Name: NF0917_low_42
Description: NF0917
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0917_low_42
NF0917_low_42
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (12-254)||(13211-13453)
[»] chr8 (74 HSPs)
chr8 (12-256)||(18818286-18818530)
chr8 (12-247)||(20536208-20536443)
chr8 (12-247)||(21923814-21924049)
chr8 (12-242)||(23406379-23406611)
chr8 (12-243)||(7372778-7373001)
chr8 (12-243)||(22626736-22626966)
chr8 (13-243)||(28648934-28649164)
chr8 (12-243)||(16092231-16092463)
chr8 (12-247)||(21918886-21919121)
chr8 (12-254)||(18879116-18879352)
chr8 (9-243)||(6759255-6759487)
chr8 (12-238)||(22875065-22875291)
chr8 (13-247)||(23648554-23648788)
chr8 (12-247)||(31971257-31971490)
chr8 (12-247)||(45130884-45131117)
chr8 (12-247)||(16199532-16199765)
chr8 (15-178)||(14409444-14409606)
chr8 (15-178)||(1484402-1484564)
chr8 (15-178)||(5853292-5853454)
chr8 (19-178)||(16413316-16413474)
chr8 (15-178)||(20403227-20403389)
chr8 (15-178)||(22001753-22001915)
chr8 (15-178)||(41598188-41598350)
chr8 (15-178)||(4483281-4483442)
chr8 (15-178)||(4542373-4542535)
chr8 (15-178)||(15203231-15203393)
chr8 (15-178)||(20046195-20046357)
chr8 (15-178)||(19896265-19896430)
chr8 (14-166)||(18678069-18678221)
chr8 (12-233)||(21389353-21389571)
chr8 (15-178)||(14823774-14823935)
chr8 (12-228)||(21395888-21396101)
chr8 (12-228)||(21790381-21790594)
chr8 (13-178)||(26223917-26224081)
chr8 (14-166)||(32121734-32121886)
chr8 (15-158)||(26219717-26219858)
chr8 (12-203)||(21778709-21778897)
chr8 (15-178)||(25484275-25484430)
chr8 (19-178)||(45290694-45290853)
chr8 (15-158)||(26225268-26225409)
chr8 (9-123)||(19937061-19937174)
chr8 (19-194)||(13508024-13508199)
chr8 (28-123)||(15070571-15070665)
chr8 (31-178)||(19801382-19801527)
chr8 (12-138)||(38855246-38855372)
chr8 (12-135)||(6520368-6520491)
chr8 (19-194)||(13597556-13597731)
chr8 (12-179)||(17612064-17612231)
chr8 (31-194)||(20498581-20498744)
chr8 (12-110)||(17140916-17141014)
chr8 (12-109)||(21490995-21491092)
chr8 (150-247)||(25363026-25363123)
chr8 (12-127)||(5866280-5866395)
chr8 (16-131)||(21285601-21285716)
chr8 (39-194)||(23776774-23776929)
chr8 (27-130)||(983407-983512)
chr8 (16-83)||(23760893-23760961)
chr8 (16-88)||(26355742-26355815)
chr8 (31-179)||(37116366-37116515)
chr8 (24-138)||(21673716-21673830)
chr8 (12-62)||(21249384-21249434)
chr8 (12-62)||(21255222-21255272)
chr8 (31-179)||(17439460-17439609)
chr8 (31-131)||(24353039-24353140)
chr8 (39-189)||(20465982-20466132)
chr8 (31-135)||(19154883-19154989)
chr8 (39-179)||(16410207-16410347)
chr8 (31-131)||(17266994-17267096)
chr8 (39-161)||(30643264-30643385)
chr8 (16-101)||(17353975-17354060)
chr8 (31-80)||(20502154-20502203)
chr8 (33-82)||(22525579-22525628)
chr8 (39-75)||(20533467-20533503)
chr8 (31-79)||(28397569-28397617)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (12-247)||(51913-52148)
scaffold0011 (12-251)||(167861-168099)
scaffold0011 (31-80)||(38204-38253)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (12-251)||(25421532-25421771)
chr5 (12-251)||(25431395-25431633)
chr5 (12-254)||(23390375-23390617)
chr5 (12-247)||(24493569-24493803)
chr5 (12-247)||(8286728-8286964)
chr5 (12-247)||(13025311-13025545)
chr5 (12-247)||(13095495-13095729)
chr5 (12-243)||(9077952-9078183)
chr5 (15-241)||(24529223-24529449)
chr5 (12-251)||(22075018-22075258)
chr5 (12-243)||(1096467-1096698)
chr5 (12-179)||(21808343-21808510)
chr5 (12-179)||(21729018-21729185)
chr5 (12-247)||(21292856-21293090)
chr5 (15-178)||(264768-264930)
chr5 (15-178)||(39363384-39363546)
chr5 (15-177)||(10732941-10733102)
chr5 (15-178)||(20909012-20909174)
chr5 (15-178)||(29329934-29330096)
chr5 (15-178)||(42245365-42245527)
chr5 (15-227)||(11581151-11581361)
chr5 (12-120)||(21997547-21997655)
chr5 (15-227)||(22412187-22412388)
chr5 (15-178)||(29345980-29346142)
chr5 (15-178)||(36154783-36154942)
chr5 (15-178)||(29348453-29348615)
chr5 (15-178)||(29350926-29351088)
chr5 (15-178)||(39245136-39245298)
chr5 (15-178)||(20902008-20902172)
chr5 (15-178)||(2154613-2154776)
chr5 (26-227)||(18418594-18418793)
chr5 (15-178)||(32027393-32027555)
chr5 (18-178)||(18319033-18319193)
chr5 (31-233)||(22144068-22144271)
chr5 (15-178)||(10775675-10775838)
chr5 (15-178)||(31061068-31061231)
chr5 (15-178)||(20917952-20918110)
chr5 (14-166)||(17517168-17517320)
chr5 (15-123)||(38619434-38619541)
chr5 (16-123)||(23064512-23064618)
chr5 (18-178)||(24067110-24067270)
chr5 (16-195)||(21565546-21565724)
chr5 (61-179)||(18356364-18356480)
chr5 (116-243)||(21986037-21986164)
chr5 (19-190)||(37723910-37724080)
chr5 (12-88)||(19660879-19660956)
chr5 (12-88)||(21329541-21329618)
chr5 (12-135)||(21502154-21502277)
chr5 (31-130)||(20026942-20027043)
chr5 (149-247)||(22107259-22107357)
chr5 (16-88)||(22959576-22959649)
chr5 (61-179)||(20910753-20910869)
chr5 (12-193)||(26011976-26012154)
chr5 (12-110)||(36314577-36314675)
chr5 (39-191)||(21873277-21873426)
chr5 (12-227)||(40725853-40726069)
chr5 (16-101)||(26704075-26704160)
chr5 (16-101)||(26973808-26973893)
chr5 (78-158)||(20766095-20766174)
chr5 (12-88)||(19668898-19668975)
chr5 (15-69)||(20806850-20806904)
chr5 (28-81)||(26732884-26732937)
chr5 (31-179)||(22178174-22178323)
chr5 (16-190)||(22032323-22032492)
chr5 (31-81)||(26740697-26740747)
chr5 (16-190)||(18769947-18770118)
chr5 (31-80)||(23469822-23469871)
chr5 (61-131)||(29448052-29448123)
chr5 (16-86)||(23501402-23501472)
chr5 (39-80)||(20805575-20805616)
chr5 (31-80)||(21328268-21328317)
chr5 (35-80)||(21731514-21731559)
chr5 (35-80)||(21809634-21809679)
chr5 (16-101)||(23201360-23201445)
chr5 (39-79)||(20766997-20767037)
chr5 (39-75)||(26680605-26680641)
chr5 (39-75)||(26952212-26952248)
[»] chr3 (95 HSPs)
chr3 (12-254)||(17487856-17488098)
chr3 (12-254)||(17499338-17499580)
chr3 (12-248)||(13442274-13442510)
chr3 (12-247)||(23083247-23083482)
chr3 (12-242)||(26686887-26687117)
chr3 (16-247)||(14576719-14576949)
chr3 (12-254)||(20698315-20698556)
chr3 (12-242)||(43840932-43841162)
chr3 (12-243)||(14972854-14973085)
chr3 (12-243)||(18438534-18438765)
chr3 (25-247)||(14572602-14572823)
chr3 (15-227)||(24153115-24153326)
chr3 (12-251)||(12399209-12399448)
chr3 (12-243)||(25476275-25476506)
chr3 (30-233)||(42386428-42386632)
chr3 (15-243)||(40213611-40213838)
chr3 (12-243)||(11424653-11424880)
chr3 (15-194)||(29172567-29172745)
chr3 (27-251)||(30029855-30030078)
chr3 (15-178)||(9707607-9707769)
chr3 (15-178)||(17463178-17463340)
chr3 (15-178)||(34159326-34159488)
chr3 (15-178)||(45606907-45607069)
chr3 (15-178)||(55476491-55476653)
chr3 (15-178)||(7781347-7781509)
chr3 (15-178)||(8899094-8899256)
chr3 (15-178)||(16454281-16454443)
chr3 (15-178)||(17672626-17672788)
chr3 (15-178)||(28848611-28848773)
chr3 (15-178)||(38961891-38962053)
chr3 (15-178)||(13151790-13151953)
chr3 (15-178)||(13154255-13154418)
chr3 (14-178)||(13544024-13544187)
chr3 (15-178)||(6469134-6469296)
chr3 (15-178)||(10247723-10247885)
chr3 (19-178)||(12567564-12567722)
chr3 (17-178)||(16282811-16282971)
chr3 (15-178)||(17446655-17446816)
chr3 (15-178)||(50242822-50242984)
chr3 (12-178)||(43550478-43550644)
chr3 (17-178)||(41123892-41124049)
chr3 (15-158)||(36166598-36166739)
chr3 (31-178)||(53070653-53070799)
chr3 (15-129)||(55500942-55501055)
chr3 (15-141)||(15977515-15977640)
chr3 (15-123)||(12119780-12119887)
chr3 (15-123)||(15412429-15412536)
chr3 (26-158)||(21618460-21618590)
chr3 (14-166)||(46822267-46822419)
chr3 (12-227)||(24340628-24340844)
chr3 (15-123)||(8499518-8499625)
chr3 (31-227)||(52523633-52523831)
chr3 (14-166)||(12511059-12511211)
chr3 (15-131)||(10556985-10557101)
chr3 (15-112)||(44494809-44494905)
chr3 (15-178)||(27165250-27165413)
chr3 (150-251)||(16796685-16796786)
chr3 (12-127)||(13210333-13210448)
chr3 (16-195)||(16103784-16103961)
chr3 (15-112)||(17737236-17737335)
chr3 (30-194)||(23274705-23274869)
chr3 (12-227)||(37642170-37642386)
chr3 (15-178)||(53301505-53301669)
chr3 (12-135)||(14234487-14234610)
chr3 (16-131)||(15470928-15471043)
chr3 (16-195)||(16097332-16097510)
chr3 (150-228)||(14179570-14179648)
chr3 (16-88)||(12174303-12174376)
chr3 (19-131)||(32307684-32307795)
chr3 (16-88)||(49668120-49668193)
chr3 (15-76)||(28194693-28194755)
chr3 (16-88)||(9512924-9512997)
chr3 (16-88)||(9520899-9520972)
chr3 (15-68)||(45577947-45578000)
chr3 (94-195)||(2051137-2051238)
chr3 (12-227)||(22147431-22147646)
chr3 (31-131)||(37251168-37251270)
chr3 (31-131)||(43925977-43926079)
chr3 (16-173)||(856140-856294)
chr3 (19-88)||(1644718-1644787)
chr3 (39-179)||(11298481-11298621)
chr3 (31-131)||(22110352-22110454)
chr3 (31-135)||(12377940-12378046)
chr3 (33-82)||(13919350-13919399)
chr3 (13-162)||(14665398-14665546)
chr3 (13-162)||(14668554-14668702)
chr3 (16-101)||(15878083-15878168)
chr3 (16-80)||(23077530-23077594)
chr3 (39-159)||(19725886-19726004)
chr3 (31-80)||(606378-606428)
chr3 (33-79)||(9577646-9577691)
chr3 (39-80)||(14878569-14878610)
chr3 (31-80)||(15246037-15246086)
chr3 (16-101)||(17525190-17525275)
chr3 (39-75)||(3389994-3390030)
[»] chr2 (73 HSPs)
chr2 (12-242)||(23060513-23060742)
chr2 (12-236)||(23076442-23076666)
chr2 (12-247)||(22731120-22731355)
chr2 (12-247)||(22337115-22337350)
chr2 (12-247)||(22738066-22738300)
chr2 (12-247)||(23285865-23286096)
chr2 (12-251)||(23654268-23654507)
chr2 (12-243)||(23660023-23660253)
chr2 (15-251)||(298696-298933)
chr2 (12-247)||(38002-38235)
chr2 (15-178)||(22105412-22105575)
chr2 (18-178)||(21155060-21155219)
chr2 (15-178)||(18808943-18809105)
chr2 (15-178)||(23130862-23131024)
chr2 (15-178)||(23133329-23133491)
chr2 (15-178)||(23709532-23709694)
chr2 (15-178)||(23712013-23712175)
chr2 (15-178)||(26505379-26505541)
chr2 (15-178)||(26507857-26508019)
chr2 (15-178)||(34402522-34402684)
chr2 (15-178)||(39682313-39682475)
chr2 (12-247)||(20309108-20309340)
chr2 (13-178)||(32214921-32215085)
chr2 (15-178)||(571397-571559)
chr2 (15-178)||(6725995-6726157)
chr2 (15-178)||(23135590-23135752)
chr2 (15-178)||(24367774-24367936)
chr2 (15-178)||(24898195-24898358)
chr2 (15-178)||(24900678-24900841)
chr2 (15-178)||(24903155-24903318)
chr2 (15-178)||(24905632-24905795)
chr2 (15-178)||(24908107-24908270)
chr2 (15-178)||(32039498-32039660)
chr2 (12-233)||(23708518-23708738)
chr2 (15-178)||(28577099-28577261)
chr2 (17-178)||(43137301-43137461)
chr2 (15-178)||(45029854-45030016)
chr2 (15-178)||(24529528-24529691)
chr2 (12-183)||(23103346-23103516)
chr2 (15-178)||(38967374-38967537)
chr2 (19-166)||(25616192-25616339)
chr2 (12-227)||(19671830-19672043)
chr2 (17-138)||(28405981-28406103)
chr2 (12-89)||(8946657-8946734)
chr2 (31-251)||(32451811-32452031)
chr2 (167-254)||(27753730-27753817)
chr2 (12-75)||(23040247-23040310)
chr2 (31-179)||(7687-7835)
chr2 (39-191)||(22799068-22799220)
chr2 (16-138)||(25175854-25175976)
chr2 (16-180)||(7679589-7679751)
chr2 (18-94)||(24643034-24643109)
chr2 (31-233)||(20520092-20520295)
chr2 (13-88)||(22134251-22134326)
chr2 (16-191)||(23019648-23019823)
chr2 (12-110)||(23071972-23072070)
chr2 (31-131)||(23207296-23207398)
chr2 (27-88)||(18786947-18787009)
chr2 (33-82)||(23287384-23287433)
chr2 (101-178)||(24642856-24642933)
chr2 (39-179)||(25963669-25963809)
chr2 (33-81)||(26392403-26392451)
chr2 (33-101)||(23038048-23038116)
chr2 (31-179)||(23791292-23791441)
chr2 (31-131)||(23004767-23004869)
chr2 (31-89)||(22413181-22413240)
chr2 (16-191)||(22740902-22741081)
chr2 (31-80)||(9241945-9241994)
chr2 (16-190)||(40622151-40622327)
chr2 (39-75)||(24655396-24655432)
chr2 (39-75)||(24869903-24869939)
chr2 (31-82)||(25108906-25108958)
chr2 (39-75)||(25961592-25961628)
[»] chr7 (81 HSPs)
chr7 (12-254)||(9509189-9509431)
chr7 (12-247)||(12698831-12699067)
chr7 (12-247)||(38227481-38227715)
chr7 (15-243)||(3564254-3564482)
chr7 (15-227)||(18456319-18456530)
chr7 (12-251)||(26211995-26212235)
chr7 (12-247)||(10589039-10589273)
chr7 (12-248)||(16386132-16386369)
chr7 (14-247)||(40443393-40443624)
chr7 (12-178)||(13647325-13647491)
chr7 (15-178)||(456321-456483)
chr7 (15-178)||(11972496-11972658)
chr7 (15-178)||(14949122-14949284)
chr7 (15-178)||(15376713-15376875)
chr7 (15-178)||(16213684-16213846)
chr7 (15-178)||(16232520-16232682)
chr7 (15-178)||(18640272-18640434)
chr7 (15-178)||(20385123-20385285)
chr7 (15-178)||(21189595-21189757)
chr7 (15-178)||(32125491-32125653)
chr7 (15-178)||(41522917-41523079)
chr7 (15-178)||(41525379-41525541)
chr7 (16-178)||(11393287-11393448)
chr7 (12-178)||(18430709-18430874)
chr7 (15-178)||(24702238-24702400)
chr7 (15-178)||(27216860-27217022)
chr7 (19-165)||(24275175-24275320)
chr7 (15-176)||(16410059-16410219)
chr7 (15-131)||(48273392-48273508)
chr7 (27-245)||(15143925-15144143)
chr7 (15-178)||(44116509-44116671)
chr7 (15-178)||(3386333-3386495)
chr7 (12-218)||(2280033-2280238)
chr7 (15-178)||(24704688-24704847)
chr7 (12-247)||(27847719-27847951)
chr7 (16-191)||(14932675-14932851)
chr7 (16-191)||(15356110-15356286)
chr7 (16-191)||(15360224-15360400)
chr7 (15-178)||(20110556-20110708)
chr7 (15-123)||(13869346-13869453)
chr7 (15-178)||(17061915-17062077)
chr7 (19-178)||(38898376-38898535)
chr7 (15-141)||(13831373-13831498)
chr7 (12-131)||(67745-67864)
chr7 (12-131)||(22072913-22073033)
chr7 (31-178)||(12756671-12756817)
chr7 (12-127)||(34200786-34200901)
chr7 (12-110)||(28505321-28505419)
chr7 (15-178)||(26355983-26356156)
chr7 (15-178)||(26358435-26358608)
chr7 (16-138)||(18005650-18005772)
chr7 (12-227)||(19486649-19486865)
chr7 (16-135)||(811129-811248)
chr7 (16-135)||(16219715-16219834)
chr7 (12-127)||(16495402-16495517)
chr7 (12-135)||(47831807-47831930)
chr7 (27-233)||(1867895-1868101)
chr7 (39-188)||(15211484-15211633)
chr7 (16-125)||(44014182-44014291)
chr7 (34-227)||(12255697-12255892)
chr7 (18-101)||(18154873-18154956)
chr7 (12-109)||(11996051-11996148)
chr7 (12-127)||(15754893-15755008)
chr7 (35-233)||(15008398-15008597)
chr7 (61-142)||(2530129-2530208)
chr7 (27-131)||(16056343-16056446)
chr7 (12-141)||(10063810-10063939)
chr7 (16-190)||(17138006-17138177)
chr7 (27-89)||(12901338-12901401)
chr7 (27-82)||(14044761-14044817)
chr7 (27-82)||(14354791-14354847)
chr7 (16-173)||(12187019-12187173)
chr7 (16-101)||(19649521-19649606)
chr7 (39-189)||(12321685-12321835)
chr7 (31-82)||(18203831-18203882)
chr7 (13-75)||(2832499-2832561)
chr7 (31-125)||(20220194-20220290)
chr7 (39-75)||(9446216-9446252)
chr7 (39-75)||(20569654-20569690)
chr7 (172-227)||(48273538-48273594)
chr7 (38-89)||(48991206-48991258)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (12-254)||(1851-2093)
[»] chr4 (74 HSPs)
chr4 (12-254)||(44052829-44053071)
chr4 (12-251)||(7088877-7089116)
chr4 (12-247)||(12902757-12902992)
chr4 (12-247)||(7893703-7893935)
chr4 (12-247)||(16239856-16240090)
chr4 (14-247)||(22636437-22636669)
chr4 (12-229)||(16270140-16270356)
chr4 (12-194)||(7798774-7798956)
chr4 (15-243)||(16377413-16377639)
chr4 (17-243)||(14038653-14038879)
chr4 (19-251)||(23374241-23374473)
chr4 (12-181)||(6899891-6900059)
chr4 (12-137)||(52873363-52873488)
chr4 (15-178)||(18215274-18215436)
chr4 (15-178)||(44928879-44929042)
chr4 (15-178)||(12307-12469)
chr4 (15-178)||(15118352-15118514)
chr4 (15-178)||(52312510-52312672)
chr4 (9-178)||(19242693-19242861)
chr4 (13-178)||(19618172-19618336)
chr4 (15-179)||(1837508-1837671)
chr4 (15-178)||(3515007-3515169)
chr4 (15-178)||(23803265-23803427)
chr4 (15-178)||(44615288-44615450)
chr4 (15-178)||(44773087-44773249)
chr4 (15-178)||(50222339-50222501)
chr4 (15-158)||(54798729-54798872)
chr4 (15-178)||(18239419-18239581)
chr4 (15-178)||(51463868-51464030)
chr4 (12-247)||(14053188-14053422)
chr4 (15-138)||(14280316-14280438)
chr4 (15-178)||(44102214-44102376)
chr4 (19-178)||(15355324-15355483)
chr4 (12-247)||(17046487-17046719)
chr4 (13-178)||(14970707-14970871)
chr4 (15-178)||(12610950-12611105)
chr4 (12-98)||(3096293-3096379)
chr4 (12-178)||(15367690-15367856)
chr4 (12-178)||(15402703-15402869)
chr4 (15-178)||(7641192-7641344)
chr4 (31-176)||(21815587-21815731)
chr4 (27-227)||(52243099-52243302)
chr4 (31-194)||(13790-13953)
chr4 (12-178)||(15371202-15371368)
chr4 (12-178)||(15373483-15373649)
chr4 (14-178)||(22353835-22353999)
chr4 (15-158)||(8574844-8574985)
chr4 (12-123)||(15370018-15370128)
chr4 (12-178)||(16223532-16223698)
chr4 (27-195)||(43198491-43198661)
chr4 (18-178)||(20149832-20149992)
chr4 (31-251)||(6190481-6190701)
chr4 (12-83)||(15551817-15551889)
chr4 (12-135)||(39706286-39706409)
chr4 (127-241)||(3096759-3096872)
chr4 (16-88)||(12774011-12774084)
chr4 (61-179)||(43256114-43256230)
chr4 (27-130)||(12288211-12288316)
chr4 (150-247)||(17047958-17048055)
chr4 (16-88)||(8846360-8846433)
chr4 (39-191)||(15093798-15093950)
chr4 (39-179)||(16356905-16357045)
chr4 (87-176)||(15464888-15464977)
chr4 (39-179)||(16348617-16348757)
chr4 (39-179)||(16488031-16488171)
chr4 (31-131)||(46640456-46640558)
chr4 (16-189)||(15121747-15121917)
chr4 (206-243)||(15091090-15091127)
chr4 (33-82)||(17333298-17333347)
chr4 (31-82)||(53082202-53082254)
chr4 (39-75)||(11250619-11250655)
chr4 (172-227)||(14280462-14280518)
chr4 (39-75)||(15353365-15353401)
chr4 (176-227)||(54798669-54798721)
[»] scaffold0145 (3 HSPs)
scaffold0145 (12-247)||(38761-38995)
scaffold0145 (12-229)||(32942-33158)
scaffold0145 (10-178)||(9744-9912)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (12-247)||(3470-3705)
scaffold0292 (12-243)||(343-573)
[»] chr6 (78 HSPs)
chr6 (12-247)||(20360846-20361081)
chr6 (12-251)||(17287678-17287917)
chr6 (12-254)||(20638162-20638404)
chr6 (12-244)||(22780116-22780348)
chr6 (12-243)||(29060540-29060771)
chr6 (13-256)||(18409704-18409947)
chr6 (12-243)||(25629245-25629476)
chr6 (12-243)||(20593773-20594004)
chr6 (12-239)||(19303435-19303661)
chr6 (12-179)||(16496244-16496411)
chr6 (12-179)||(20076700-20076863)
chr6 (15-178)||(12742317-12742479)
chr6 (15-178)||(18334592-18334754)
chr6 (15-178)||(19005046-19005208)
chr6 (15-178)||(19858919-19859081)
chr6 (15-178)||(22782227-22782389)
chr6 (15-178)||(24422547-24422709)
chr6 (15-178)||(33861794-33861956)
chr6 (15-178)||(33864278-33864440)
chr6 (13-178)||(30676710-30676874)
chr6 (15-178)||(2291180-2291342)
chr6 (15-178)||(8055029-8055191)
chr6 (15-178)||(25754809-25754971)
chr6 (15-178)||(26924640-26924802)
chr6 (13-178)||(34963371-34963535)
chr6 (15-178)||(25656629-25656791)
chr6 (27-194)||(25644335-25644503)
chr6 (15-178)||(1540911-1541073)
chr6 (15-178)||(1595549-1595711)
chr6 (15-178)||(25688502-25688664)
chr6 (15-178)||(3852017-3852179)
chr6 (31-178)||(18456735-18456881)
chr6 (18-178)||(16448526-16448686)
chr6 (15-178)||(20556894-20557054)
chr6 (31-165)||(18461895-18462028)
chr6 (12-187)||(35245586-35245758)
chr6 (12-247)||(16920519-16920751)
chr6 (31-191)||(18821787-18821946)
chr6 (12-195)||(20109140-20109323)
chr6 (14-178)||(19847949-19848114)
chr6 (39-251)||(25603267-25603478)
chr6 (12-247)||(22831503-22831737)
chr6 (39-243)||(15041441-15041644)
chr6 (14-166)||(23992429-23992578)
chr6 (12-227)||(8227416-8227632)
chr6 (12-88)||(27333262-27333339)
chr6 (12-88)||(27394002-27394079)
chr6 (39-251)||(25611605-25611816)
chr6 (12-73)||(25714417-25714478)
chr6 (12-127)||(28496477-28496592)
chr6 (12-127)||(29808888-29809003)
chr6 (12-131)||(23019408-23019525)
chr6 (16-131)||(19652199-19652313)
chr6 (61-179)||(27415895-27416011)
chr6 (12-127)||(1561303-1561418)
chr6 (27-89)||(9098557-9098620)
chr6 (31-247)||(11185524-11185737)
chr6 (27-130)||(19668386-19668491)
chr6 (33-89)||(33443068-33443124)
chr6 (39-161)||(18907134-18907255)
chr6 (39-161)||(21766718-21766839)
chr6 (16-101)||(19873120-19873205)
chr6 (16-101)||(22432249-22432334)
chr6 (16-101)||(22438799-22438884)
chr6 (24-83)||(4185870-4185930)
chr6 (12-59)||(22080799-22080846)
chr6 (16-101)||(19862978-19863063)
chr6 (31-179)||(23076749-23076898)
chr6 (24-83)||(4186379-4186439)
chr6 (31-82)||(35008167-35008219)
chr6 (16-191)||(25642125-25642304)
chr6 (35-80)||(16493169-16493214)
chr6 (31-80)||(18453201-18453250)
chr6 (16-65)||(31155465-31155514)
chr6 (24-64)||(4738626-4738666)
chr6 (120-179)||(18180596-18180656)
chr6 (9-53)||(19008799-19008843)
chr6 (39-75)||(19790837-19790873)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (15-243)||(22886-23113)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (12-242)||(8424-8650)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (12-254)||(6000-6245)
[»] chr1 (59 HSPs)
chr1 (13-243)||(50210103-50210333)
chr1 (12-251)||(27250611-27250850)
chr1 (15-243)||(34509783-34510011)
chr1 (12-243)||(22532269-22532500)
chr1 (12-251)||(21026680-21026919)
chr1 (13-245)||(20135188-20135420)
chr1 (13-226)||(22468604-22468816)
chr1 (89-247)||(22354458-22354616)
chr1 (15-178)||(13988866-13989028)
chr1 (15-178)||(21923291-21923453)
chr1 (15-178)||(23593735-23593897)
chr1 (12-178)||(45574842-45575008)
chr1 (15-178)||(21475087-21475249)
chr1 (15-178)||(31612313-31612475)
chr1 (14-178)||(21840766-21840929)
chr1 (15-178)||(29298137-29298298)
chr1 (15-178)||(29776688-29776850)
chr1 (15-178)||(433012-433172)
chr1 (15-178)||(16275363-16275526)
chr1 (13-178)||(16361915-16362079)
chr1 (124-254)||(22356053-22356184)
chr1 (124-254)||(22357739-22357870)
chr1 (12-247)||(38801277-38801508)
chr1 (12-218)||(13212821-13213027)
chr1 (12-112)||(20847175-20847275)
chr1 (15-178)||(21346961-21347124)
chr1 (15-178)||(22123067-22123230)
chr1 (15-178)||(21707167-21707329)
chr1 (15-178)||(21711709-21711871)
chr1 (9-178)||(21342090-21342259)
chr1 (9-123)||(15860064-15860177)
chr1 (31-194)||(21896195-21896358)
chr1 (31-193)||(21861510-21861672)
chr1 (18-178)||(40389157-40389317)
chr1 (39-194)||(21787981-21788136)
chr1 (31-221)||(35260992-35261180)
chr1 (16-195)||(33681011-33681189)
chr1 (13-80)||(20454606-20454673)
chr1 (16-138)||(22921864-22921986)
chr1 (150-228)||(48603652-48603730)
chr1 (19-131)||(21754052-21754163)
chr1 (61-179)||(33797570-33797686)
chr1 (27-233)||(16758664-16758872)
chr1 (31-194)||(50614055-50614219)
chr1 (31-194)||(50621883-50622047)
chr1 (16-101)||(21714546-21714631)
chr1 (12-127)||(14295557-14295672)
chr1 (16-195)||(22237631-22237809)
chr1 (16-127)||(20248283-20248394)
chr1 (28-127)||(20918620-20918719)
chr1 (31-179)||(41049990-41050138)
chr1 (27-88)||(52928014-52928076)
chr1 (31-131)||(16368287-16368388)
chr1 (39-161)||(18182093-18182214)
chr1 (16-101)||(42865245-42865330)
chr1 (31-82)||(21533923-21533974)
chr1 (16-73)||(21161720-21161778)
chr1 (13-75)||(24783150-24783212)
chr1 (28-80)||(20958124-20958176)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (12-243)||(3041-3271)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (12-251)||(25896-26134)
scaffold0026 (12-251)||(39858-40096)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (12-247)||(8479-8710)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (14-243)||(39479-39707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (14-243)||(75105-75333)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (12-251)||(931-1169)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (12-243)||(4508-4738)
scaffold0228 (12-243)||(12090-12320)
scaffold0228 (12-243)||(22042-22272)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (12-243)||(16490-16721)
[»] scaffold0080 (3 HSPs)
scaffold0080 (12-243)||(39913-40143)
scaffold0080 (31-131)||(19885-19987)
scaffold0080 (39-191)||(18597-18749)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (30-254)||(24180-24406)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (13-243)||(17105-17337)
scaffold0056 (31-178)||(79284-79430)
[»] scaffold0122 (3 HSPs)
scaffold0122 (19-243)||(25955-26179)
scaffold0122 (15-158)||(44682-44825)
scaffold0122 (149-243)||(33385-33479)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (12-251)||(4849-5088)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (64-242)||(13144-13322)
scaffold0175 (12-87)||(34123-34199)
scaffold0175 (12-68)||(273-329)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (13-216)||(3103-3306)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (12-247)||(20910-21146)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (15-243)||(339840-340065)
scaffold0003 (15-178)||(158450-158612)
scaffold0003 (61-179)||(71350-71466)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (12-193)||(32898-33077)
scaffold0120 (12-193)||(45928-46107)
scaffold0120 (12-223)||(16113-16323)
scaffold0120 (12-73)||(17389-17450)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (12-247)||(4712-4946)
scaffold0358 (77-247)||(1-170)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (12-247)||(32067-32299)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (12-247)||(1952-2187)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (12-247)||(13497-13730)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (12-247)||(15351-15584)
scaffold0114 (16-173)||(7295-7449)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (12-247)||(10312-10544)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (12-142)||(28414-28544)
scaffold0046 (12-127)||(11292-11407)
scaffold0046 (12-127)||(1997-2112)
scaffold0046 (12-65)||(4552-4605)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (102-254)||(124675-124827)
scaffold0021 (13-190)||(174767-174943)
scaffold0021 (12-81)||(121766-121835)
scaffold0021 (31-130)||(136370-136471)
scaffold0021 (31-130)||(145078-145179)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (93-243)||(27911-28061)
scaffold0130 (13-48)||(27878-27913)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (75-238)||(3424-3588)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (15-178)||(20747-20909)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (15-178)||(37821-37983)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (15-178)||(94411-94573)
scaffold0023 (19-178)||(17440-17598)
scaffold0023 (15-175)||(44454-44614)
scaffold0023 (16-139)||(100378-100501)
scaffold0023 (12-83)||(119875-119947)
scaffold0023 (16-191)||(38421-38596)
scaffold0023 (16-138)||(40169-40291)
scaffold0023 (16-88)||(101503-101576)
scaffold0023 (104-191)||(23608-23695)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (15-178)||(4694-4856)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (15-178)||(13392-13554)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (15-178)||(13947-14109)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (15-178)||(136680-136842)
scaffold0028 (15-178)||(139149-139311)
scaffold0028 (15-178)||(144087-144249)
scaffold0028 (15-178)||(134211-134373)
scaffold0028 (15-178)||(141618-141780)
scaffold0028 (14-138)||(62200-62321)
scaffold0028 (16-98)||(132662-132745)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (12-247)||(16282-16514)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (14-178)||(10772-10935)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (33-243)||(4545-4754)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (15-178)||(16784-16946)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (15-178)||(82072-82234)
scaffold0037 (27-196)||(22608-22776)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (12-179)||(128751-128917)
scaffold0031 (31-178)||(20379-20524)
scaffold0031 (16-101)||(65830-65915)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (19-178)||(501088-501246)
scaffold0001 (15-178)||(85579-85742)
scaffold0001 (16-138)||(160688-160809)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (13-178)||(11286-11450)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (18-178)||(4300-4459)
scaffold0761 (39-161)||(6281-6402)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (15-178)||(40400-40562)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (12-247)||(938-1170)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (13-178)||(12249-12413)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (14-178)||(9241-9404)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (15-178)||(106-268)
[»] scaffold0106 (3 HSPs)
scaffold0106 (12-247)||(1289-1521)
scaffold0106 (12-247)||(7266-7498)
scaffold0106 (15-80)||(15291-15356)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (12-222)||(46995-47202)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (71-243)||(853-1021)
scaffold0395 (12-78)||(4888-4954)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (29-178)||(29946-30094)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (15-178)||(4214-4377)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (27-195)||(8481-8651)
scaffold0621 (12-138)||(6535-6661)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (15-178)||(12064-12220)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (71-247)||(6669-6845)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (15-158)||(116430-116571)
scaffold0022 (31-131)||(128971-129072)
scaffold0022 (19-131)||(78328-78442)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (12-134)||(11442-11564)
scaffold0235 (196-247)||(11399-11450)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (12-247)||(51582-51814)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (15-178)||(161089-161252)
scaffold0007 (95-178)||(164590-164674)
[»] scaffold0101 (2 HSPs)
scaffold0101 (18-178)||(1280-1440)
scaffold0101 (16-101)||(8995-9080)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (31-251)||(51766-51985)
scaffold0034 (12-131)||(32538-32654)
[»] scaffold0357 (3 HSPs)
scaffold0357 (31-218)||(13147-13336)
scaffold0357 (27-218)||(16014-16206)
scaffold0357 (31-82)||(2680-2732)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (12-227)||(17932-18148)
scaffold0247 (15-178)||(2128-2291)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (27-218)||(27663-27855)
scaffold0165 (171-247)||(3640-3716)
scaffold0165 (171-247)||(7704-7780)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (16-191)||(29558-29734)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (31-194)||(53488-53651)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (15-178)||(38657-38820)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (15-247)||(5017-5246)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (12-194)||(11464-11646)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (12-194)||(38195-38377)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (16-138)||(19268-19390)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (150-247)||(1052-1149)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (16-138)||(2801-2923)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (31-233)||(60614-60818)
scaffold0010 (24-179)||(129917-130071)
scaffold0010 (31-79)||(666-714)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (16-138)||(14692-14814)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (27-195)||(10480-10647)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (33-194)||(7998-8161)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (15-127)||(15664-15776)
scaffold0261 (16-101)||(1339-1424)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (31-194)||(12587-12749)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (12-135)||(6121-6244)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (61-179)||(15370-15486)
scaffold0107 (31-80)||(36199-36248)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (39-191)||(29117-29272)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (24-138)||(5655-5769)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (12-88)||(6611-6688)
scaffold0333 (12-88)||(13991-14068)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (12-88)||(15821-15898)
scaffold0020 (16-79)||(178898-178961)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (31-138)||(1051-1158)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (16-195)||(133-311)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (12-127)||(1075-1190)
scaffold0184 (39-75)||(4284-4320)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (16-101)||(23843-23928)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (39-191)||(16291-16442)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (12-83)||(1083-1155)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (12-135)||(12766-12889)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (16-83)||(2694-2762)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (16-135)||(12943-13062)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (16-131)||(45794-45909)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (16-88)||(28813-28887)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (16-191)||(4746-4921)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (172-243)||(10323-10394)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (16-88)||(1086-1159)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (16-88)||(23927-24000)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (69-194)||(225465-225588)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (31-194)||(6222-6386)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (27-130)||(8075-8180)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (39-188)||(192920-193070)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (24-88)||(6824-6889)
scaffold0556 (87-131)||(8090-8134)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (27-131)||(10542-10646)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (191-247)||(17873-17929)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (16-190)||(26828-26999)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (35-194)||(38339-38499)
scaffold0139 (16-101)||(19980-20065)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (27-131)||(25121-25226)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (16-173)||(1881-2035)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (16-110)||(32102-32197)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (16-79)||(36454-36517)
[»] scaffold0503 (1 HSPs)
scaffold0503 (31-73)||(11982-12024)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (39-179)||(1853-1993)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (16-101)||(69794-69879)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (204-252)||(20595-20643)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (16-190)||(21749-21920)
scaffold0210 (16-190)||(29641-29812)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (31-179)||(97024-97173)
scaffold0006 (31-179)||(106302-106451)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (31-130)||(569-669)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (39-162)||(920-1042)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (103-196)||(1164-1257)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (39-179)||(44104-44244)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (33-82)||(206575-206624)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (16-80)||(10575-10639)
scaffold0297 (16-76)||(15736-15796)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (27-130)||(103632-103737)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (39-189)||(46670-46820)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (100-165)||(13092-13157)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (31-131)||(267679-267781)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (31-89)||(2694-2753)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (39-77)||(4999-5037)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (69-138)||(2213-2281)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (39-179)||(6368-6508)
[»] scaffold0111 (2 HSPs)
scaffold0111 (31-80)||(7450-7499)
scaffold0111 (31-80)||(14569-14618)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (16-101)||(18236-18321)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (16-80)||(6095-6159)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (39-75)||(7328-7364)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (31-79)||(3276-3324)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (31-79)||(30350-30398)


Alignment Details
Target: scaffold0193 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 13211 - 13453
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13211 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 13310  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13311 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13410  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13411 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 13453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 74)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18818530 - 18818286
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818530 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 18818431  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  18818430 attgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 18818331  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 256  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  18818330 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactacccta 18818286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 20536208 - 20536443
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536208 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 20536307  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20536308 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatcttaaacaactt 20536407  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20536408 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 20536443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21924049 - 21923814
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21924049 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatca 21923950  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |  ||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  21923949 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataaccttattttgcatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 21923850  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923849 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 21923814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 23406379 - 23406611
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23406379 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23406478  T
Q  112 attgcaagtcaac--aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaac 209  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||    
T  23406479 attgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacatagtcaacatcaacacatcttaaacaac 23406578  T
Q  210 ttcacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  23406579 ttcacatattataattaacatcctcattaagtc 23406611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 7372778 - 7373001
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372778 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7372877  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  7372878 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc--------ttatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 7372969  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7372970 cacagattataattaacatcctcattaagtct 7373001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 22626736 - 22626966
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22626736 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22626834  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||    
T  22626835 aatacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 22626934  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22626935 cacagattataattaacatcctcattaagtct 22626966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 28649164 - 28648934
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28649164 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 28649065  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
     ||||||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  28649064 atgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 28648965  T
Q  213 acagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28648964 acatattataattaacatcatcattaagtct 28648934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16092463 - 16092231
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092463 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 16092364  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaact 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16092363 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacaact 16092264  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16092263 tcgcatattataattaacatcatccttaagtct 16092231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21919121 - 21918886
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919121 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 21919022  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||    
T  21919021 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcagcaacacatcttaaacagct 21918923  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21918922 tcacagatcgtaattaacctcatcgttaagtcttaat 21918886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 18879352 - 18879116
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||    
T  18879352 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatca 18879258  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| | || |||    
T  18879257 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatctt-atcagctt 18879159  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18879158 cacagattatagttaacatcatcattaagtcttgatgctatcc 18879116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 243
Target Start/End: Original strand, 6759255 - 6759487
Alignment:
Q  9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6759255 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataata 6759354  T
Q  109 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaaca 207  Q
    |||| |||||||   |||||||| || ||| || | ||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  6759355 tcaaatgcaagt---caacatctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaaca 6759451  T
Q  208 acttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759452 gcttcacagattataattaacatcatcattaagtct 6759487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 238
Target Start/End: Original strand, 22875065 - 22875291
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  22875065 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 22875163  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaact 210  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  22875164 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagct 22875263  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22875264 tcacagattataattaacatcaccatta 22875291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 23648554 - 23648788
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  23648554 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataataatatcat 23648653  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||     
T  23648654 ttgcaatacaacaacatcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctta 23648753  T
Q  213 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23648754 acagattataattaacatcatcattaggtcttaat 23648788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 31971257 - 31971490
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  31971257 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 31971355  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||| |||    
T  31971356 attccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacatctt 31971454  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  31971455 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 31971490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45131117 - 45130884
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45131117 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatca 45131020  T
Q  112 attgc-aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    ||| | || ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||| ||    
T  45131019 atttcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacaaatcttatacagct 45130921  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  45130920 tcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 45130884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16199765 - 16199532
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  16199765 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatc 16199668  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||| ||| ||| | ||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| | |||||| ||| ||    
T  16199667 aatttcaattcatctacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatattacatcataatcaacaacaacatatcttatacagct 16199569  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16199568 tcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 16199532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14409606 - 14409444
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14409606 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14409508  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14409507 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14409444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 1484402 - 1484564
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1484402 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 1484500  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1484501 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 1484564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 5853454 - 5853292
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5853454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 5853356  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  5853355 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 5853292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16413474 - 16413316
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16413474 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 16413376  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16413375 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16413316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20403227 - 20403389
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20403227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20403325  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20403326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20403389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 22001753 - 22001915
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22001753 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22001851  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22001852 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22001915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 41598188 - 41598350
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41598188 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41598286  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41598287 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41598350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 4483281 - 4483442
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4483281 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4483378  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4483379 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4483442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 4542535 - 4542373
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4542535 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaag-atacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 4542437  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4542436 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcaca 4542373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15203393 - 15203231
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15203393 tcatcatcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15203295  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15203294 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15203231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20046357 - 20046195
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20046357 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 20046259  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20046258 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20046195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 19896265 - 19896430
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgac---ataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  19896265 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acggtatacaaaaacagcatgacataataataatatca 19896363  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19896364 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19896430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 18678221 - 18678069
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  18678221 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 18678122  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  18678121 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 18678069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21389571 - 21389353
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  21389571 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21389475  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  21389474 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 21389376  T
Q  211 tcacagattataattaacatcat 233  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||    
T  21389375 tcacatattacaattaacttcat 21389353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 14823774 - 14823935
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14823774 tcatcatcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14823871  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14823872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14823935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21396101 - 21395888
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  21396101 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21396005  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| | ||| | ||||||  || ||    
T  21396004 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21395906  T
Q  211 tcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21395905 tcacagattacaattaac 21395888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21790594 - 21790381
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||| |||||    
T  21790594 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatc 21790498  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||| | ||| | ||||||  || ||    
T  21790497 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaataacaacatatcttattcagct 21790399  T
Q  211 tcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||| |||||||    
T  21790398 tcacagattacaattaac 21790381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 26223917 - 26224081
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | || || |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26223917 catcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaag-caatatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 26224015  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||||||| || ||||||  |||| || || |||||||||||  |||||||||||    
T  26224016 atgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcaca 26224081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 32121734 - 32121886
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  32121734 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 32121833  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  32121834 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 32121886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 26219717 - 26219858
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |    
T  26219717 tcatcatcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaat 26219814  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  26219815 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21778897 - 21778709
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  21778897 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatc 21778801  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta 203  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| | ||||||    
T  21778800 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatctta 21778709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25484430 - 25484275
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25484430 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta--------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25484339  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25484338 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 25484275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45290853 - 45290694
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  45290853 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 45290755  T
Q  119 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  |||||||||||    
T  45290754 gccaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcaca 45290694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26225409 - 26225268
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |    
T  26225409 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaat 26225312  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
     |||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  26225311 acaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 19937174 - 19937061
Alignment:
Q  9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19937174 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataaga 19937076  T
Q  109 tcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||| ||||||||||    
T  19937075 tcaaatgcaagtcaa 19937061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13508199 - 13508024
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| || || || ||||| ||||||||||| |  |||    
T  13508199 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13508101  T
Q  118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  13508100 agtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13508024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 123
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070665
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 15070665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801382
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtc 19801430  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19801429 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacaca 19801382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 38855372 - 38855246
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  38855372 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 38855274  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  38855273 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 38855246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 6520368 - 6520491
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6520368 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6520466  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  6520467 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 6520491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13597731 - 13597556
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||    
T  13597731 catcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgca 13597633  T
Q  118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||| |||||||||  |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  13597632 agtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13597556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17612231 - 17612064
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  17612231 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 17612133  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17612132 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacat 17612064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498744
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 20498744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 17140916 - 17141014
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  17140916 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatc 17141014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Original strand, 21490995 - 21491092
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 109  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  21490995 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 21491092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 25363123 - 25363026
Alignment:
Q  150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  25363123 tcaagtaatgcataaaacattataccacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 25363026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 5866395 - 5866280
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  5866395 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 5866297  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  5866296 gaatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 21285601 - 21285716
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| |    
T  21285601 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaat 21285699  T
Q  115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| ||||||||||||    
T  21285700 gcaaatcaacaacatct 21285716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23776929 - 23776774
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| | ||||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||    
T  23776929 gactcatgcaacttagttaaataactatagcagcataggcagatcacaacatcagcatgacttcttaatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 23776830  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  23776829 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcatattcaacatcaa 23776774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983407
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa-aacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||   ||||| |||| ||| |||| ||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  125 aacatc 130  Q
    ||||||    
T  983412 aacatc 983407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 23760961 - 23760893
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23760961 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 23760893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 26355815 - 26355742
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  26355815 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 26355742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116515
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  37116465 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacat 37116515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 21673716 - 21673830
Alignment:
Q  24 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  21673716 tcatcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 21673814  T
Q  123 acaacatcttaaatat 138  Q
    ||||||||| ||||||    
T  21673815 acaacatctcaaatat 21673830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 21249384 - 21249434
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 62  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249384 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 62
Target Start/End: Original strand, 21255222 - 21255272
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 62  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255222 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439460
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  17439510 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacat 17439460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 24353039 - 24353140
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  24353039 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 24353136  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  24353137 atct 24353140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20466132 - 20465982
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||   |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  20466132 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagtataggcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 20466034  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcaaaatcaac 189  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  20466033 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 20465982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 19154989 - 19154883
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||| | | |  || ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  19154989 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaacatatccagatataataatatcaagtgctaatcaacaaca 19154890  T
Q  129 tcttaaa 135  Q
     ||||||    
T  19154889 acttaaa 19154883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16410347 - 16410207
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||| ||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  16410347 gactcatgcaacttagtgaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataataccaatt-catttcaacaacatcttgatcat 16410249  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16410248 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16410207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266994
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17266998  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  17266997 atct 17266994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 30643385 - 30643264
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  30643385 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacaacataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 30643287  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  30643286 tcaataatatttcaagtaatgca 30643264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17354060 - 17353975
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  17354060 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 17353975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20502203 - 20502154
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  20502203 cttagaccgactcatgcagcttaattaacatacaacagcaacataggcag 20502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 22525579 - 22525628
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||    
T  22525579 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacttaggcagta 22525628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20533503 - 20533467
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20533503 gactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacata 20533467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 28397569 - 28397617
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||||||||||    
T  28397569 cttagaccgactcatgcagcttaattaatagacaacaacaacataggca 28397617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 51913 - 52148
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51913 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatca 52012  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||||| |||    
T  52013 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatctacatcaacacatcttaaacagctt 52112  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52113 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 52148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 168099 - 167861
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  168099 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 168000  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||| |||    
T  167999 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 167901  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  167900 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 167861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 38253 - 38204
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  38253 cttagaccgacacatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 38204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 25421532 - 25421771
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25421532 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25421631  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  25421632 attgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25421731  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25421732 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25421771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 25431395 - 25431633
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25431395 acatcatcatcttcataaa-ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 25431493  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  25431494 attgcaagtcaacaacatcttaaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 25431593  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25431594 cacagattataattaacatcatcattaagtctcaatgcta 25431633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 23390617 - 23390375
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23390617 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23390518  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  23390517 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 23390418  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  23390417 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 23390375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 24493569 - 24493803
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24493569 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 24493667  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||    
T  24493668 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaatagctt 24493767  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24493768 cacagattataattaacatcattattaagtcttaat 24493803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 8286964 - 8286728
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa-cagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8286964 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatc 8286865  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8286864 aattgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 8286765  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8286764 tcacataatataattaacatcttcattaagtcttaat 8286728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 13025311 - 13025545
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13025311 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13025409  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13025410 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13025509  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025510 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13025545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 13095495 - 13095729
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13095495 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacatattgatatca 13095593  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  13095594 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacatatcttaaacaactt 13095693  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095694 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 13095729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 9077952 - 9078183
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9077952 acatcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 9078051  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  9078052 agtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9078151  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9078152 cacagattataattaacatcatcattaagtct 9078183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 15 - 241
Target Start/End: Original strand, 24529223 - 24529449
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  24529223 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaat 24529322  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24529323 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24529422  T
Q  215 agattataattaacatcatcattaagt 241  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24529423 agattatagttaacatcatcattaagt 24529449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 22075018 - 22075258
Alignment:
Q  12 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  22075018 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatc 22075117  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  22075118 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 22075217  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22075218 tcacatattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 22075258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 1096467 - 1096698
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1096467 acatcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatca 1096566  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  1096567 aatgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 1096666  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || || |||||||||||||| |||||||||||    
T  1096667 cataggttataattaacatcctcattaagtct 1096698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21808510 - 21808343
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21808510 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21808411  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21808410 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacat 21808343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21729185 - 21729018
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21729185 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 21729086  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21729085 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 21729018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21293090 - 21292856
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||    
T  21293090 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatca 21292993  T
Q  112 --attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaac 209  Q
      |||  || ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| |||||    
T  21292992 atattcaaattcatcaacatcttaggtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacaac 21292894  T
Q  210 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  21292893 ttcacagattataattaacctcattattaagtcttaat 21292856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 264930 - 264768
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  264930 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 264832  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  264831 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 264768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 39363384 - 39363546
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39363384 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39363482  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39363483 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39363546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 15 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10733102 - 10732941
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10733102 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10733004  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcac 177  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  10733003 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcac 10732941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20909012 - 20909174
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20909012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20909110  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20909111 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29329934 - 29330096
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  29329934 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 29330032  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29330033 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29330096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 42245527 - 42245365
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42245527 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 42245429  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  42245428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 42245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11581361 - 11581151
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  11581361 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 11581263  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caacttca 213  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  | || |||||||||| |||| |||| ||||||||    
T  11581262 gcaagtcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataa-caacatcaat-catcataaatcaacttca 11581165  T
Q  214 cagattataattaa 227  Q
    |||||||| |||||    
T  11581164 cagattatcattaa 11581151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 12 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 21997655 - 21997547
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21997655 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 21997556  T
Q  112 attgcaagt 120  Q
    | |||||||    
T  21997555 aatgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Original strand, 22412187 - 22412388
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  22412187 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 22412285  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||      ||||     ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22412286 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagta------ataa----gtatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 22412375  T
Q  215 agattataattaa 227  Q
    |||||||||||||    
T  22412376 agattataattaa 22412388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29345980 - 29346142
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29345980 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29346078  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29346079 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29346142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36154942 - 36154783
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36154942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 36154847  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36154846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 36154783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29348453 - 29348615
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29348453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29348551  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29348552 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29348615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29350926 - 29351088
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29350926 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29351024  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29351025 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29351088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 39245136 - 39245298
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39245136 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39245234  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| ||  || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  39245235 gcaagtcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 39245298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20902172 - 20902008
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20902172 tcatcatcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaag 20902074  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  20902073 tgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 20902008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2154776 - 2154613
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  2154776 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 2154678  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  2154677 gcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 2154613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 227
Target Start/End: Original strand, 18418594 - 18418793
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa-taacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |    
T  18418594 atcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcatttgcaattca-c 18418690  T
Q  125 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataa 223  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  18418691 aacatcttaa-tattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttcacaggttataa 18418789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 32027393 - 32027555
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32027393 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32027491  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32027492 ccaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32027555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18319193 - 18319033
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18319193 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 18319095  T
Q  118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  18319094 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 18319033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144271
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataattaac 228  Q
    || ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||   || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || |||||     
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattgtaaacaacatcaattcatcttataacaacttcacaggtcatcattaat 22144266  T
Q  229 atcat 233  Q
    |||||    
T  22144267 atcat 22144271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10775838 - 10775675
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  10775838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaat 10775740  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  10775739 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 10775675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 31061068 - 31061231
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31061068 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31061166  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| | | || ||||||   ||| || || |||||||||||| |||||||||||    
T  31061167 gcaagtcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcaca 31061231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20918110 - 20917952
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||      
T  20918110 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaa-- 20918014  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
      ||||||||||| ||| || ||||||  | || ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  20918013 --aagtcaacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcaca 20917952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 17517320 - 17517168
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  17517320 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 17517221  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  17517220 cgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 17517168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 38619434 - 38619541
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38619434 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38619532  T
Q  115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
T  38619533 gcaagtcaa 38619541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 123
Target Start/End: Original strand, 23064512 - 23064618
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  23064512 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatg 23064610  T
Q  116 caagtcaa 123  Q
    ||||||||    
T  23064611 caagtcaa 23064618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 24067110 - 24067270
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  24067110 tcatcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgca 24067208  T
Q  118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24067209 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 24067270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 21565546 - 21565724
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  21565546 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaat 21565644  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  21565645 gcaagtcatcaacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat 21565724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Original strand, 18356364 - 18356480
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc 160  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| |||   | |||||||||    
T  18356364 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgc 18356461  T
Q  161 atataacattatatcacat 179  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  18356462 ataaaacattatatcacat 18356480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21986164 - 21986037
Alignment:
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcaca 215  Q
    ||||||||||||||||| | |||  | | |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21986164 caagtcaacaacatcttcattataaattcatatctcaagtaatgcatataacattttatcacctcatattcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 21986065  T
Q  216 gattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21986064 aattatagttaacatcatcatcaagtct 21986037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 190
Target Start/End: Original strand, 37723910 - 37724080
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||| |  |    
T  37723910 catcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaattaa 37724006  T
Q  118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-atataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
    | ||| |||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||    
T  37724007 attcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaaacattatatcacatcatattcaaca 37724080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19660956 - 19660879
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19660956 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 19660879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 21329618 - 21329541
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21329618 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 21329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21502277 - 21502154
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||   ||| |||||||| |||| ||||||    
T  21502277 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatc 21502179  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| || |||||||||    
T  21502178 gaatgcaagtcatcatcatcttaaa 21502154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026942
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T
Q  128 atc 130  Q
    |||    
T  20026944 atc 20026942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 149 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22107357 - 22107259
Alignment:
Q  149 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22107357 ttcaagtaatgcataatatattatatcacatcataatcaacaacaacacaccttaaacagcttcacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 22107259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22959649 - 22959576
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  22959649 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 22959576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20910869 - 20910753
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||| ||||||||    
T  20910869 aacaacagcaacatagacagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaacattcaaataattctt-aagtaatg 20910773  T
Q  160 catataacattatatcacat 179  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  20910772 cataaaacattatatcacat 20910753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 26012154 - 26011976
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  26012154 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatc 26012058  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatca 193  Q
    || ||  | |||||||||||| ||| | ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  26012057 aaatgtgaatcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacatcaacaacaacatca 26011976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Original strand, 36314577 - 36314675
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  36314577 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 36314675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873426
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| | ||||||||| | |||||||||||  ||  |   |||||||||||  ||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaatctcattt---caacatcttaaccat 21873373  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  21873374 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 21873426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 40725853 - 40726069
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||  || ||||| |||||||||||    
T  40725853 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaag-catcatgatataataatatc 40725951  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| || |    
T  40725952 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 40726051  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
T  40726052 ttcacagatcatcattaa 40726069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 26704075 - 26704160
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26704075 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26704160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 26973808 - 26973893
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  26973808 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 26973893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 78 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 20766174 - 20766095
Alignment:
Q  78 cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  20766174 cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 20766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Original strand, 19668898 - 19668975
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  19668898 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 19668975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 15 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 20806904 - 20806850
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc 69  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20806904 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagc 20806850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732884
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26732884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178174
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  22178224 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacat 22178174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 22032323 - 22032492
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| | | ||||  ||||| ||| |||||     
T  22032323 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaaaca-atcatg--ataattataccaatt- 22032418  T
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
    ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||    
T  22032419 caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 22032492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740697
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagt 26740697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 18770118 - 18769947
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  18770118 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggtcgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 18770021  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||    
T  18770020 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 18769947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 23469822 - 23469871
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  23469822 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 23469871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 61 - 131
Target Start/End: Original strand, 29448052 - 29448123
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29448052 aacaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatct 29448123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 23501472 - 23501402
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtataca 86  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  23501472 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcacaggcagaataca 23501402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Original strand, 20805575 - 20805616
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  20805575 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 20805616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21328317 - 21328268
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   ||| |||||||||||||||    
T  21328317 cttagaccgactcatgcagcttaattaatagacagcagcaacataggcag 21328268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21731559 - 21731514
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  21731559 gaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 21731514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21809679 - 21809634
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  21809679 gaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 21809634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 23201360 - 23201445
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    |||||||||  ||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  23201360 catcatcttgttcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 23201445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 79
Target Start/End: Original strand, 20766997 - 20767037
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  20766997 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca 20767037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Original strand, 26680605 - 26680641
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26680605 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26680641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Original strand, 26952212 - 26952248
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  26952212 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 26952248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 95)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 17487856 - 17488098
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487856 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17487955  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  17487956 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17488055  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17488056 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17488098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 17499338 - 17499580
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499338 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 17499437  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||    
T  17499438 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagatt 17499537  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499538 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 17499580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Original strand, 13442274 - 13442510
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13442274 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13442373  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  13442374 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 13442473  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442474 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 13442510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23083482 - 23083247
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23083482 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatca 23083383  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  23083382 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatatcaacacatcttaaacagctt 23083283  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23083282 cacagattgtaattaacatcatcactaagtcttaat 23083247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 26686887 - 26687117
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686887 acatcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 26686986  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  26686987 attgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 26687086  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26687087 cacagattataattaacatcctcattaagtc 26687117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 16 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14576949 - 14576719
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14576949 catcatcaacatcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattg 14576851  T
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcaca 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14576850 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcaca 14576751  T
Q  216 gattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14576750 gattataattaacatcatcattaaatcttaat 14576719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20698556 - 20698315
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20698556 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatca 20698457  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| |||| |||    
T  20698456 attgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacttcaacacatcttgaacagctt 20698358  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20698357 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaattctatcc 20698315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 43840932 - 43841162
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840932 acatcattatcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 43841031  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43841032 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 43841131  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  43841132 cacagattataattaacatcctcgttaagtc 43841162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 14972854 - 14973085
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972854 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 14972953  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||| |||||||||||| | |||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  14972954 aatgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 14973053  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14973054 catagattataattaacatcatcattaagtct 14973085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 18438534 - 18438765
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18438534 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatca 18438633  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||||   ||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||    
T  18438634 aatgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagctt 18438733  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438734 cacagattatagttaacatcatcattaagtct 18438765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 247
Target Start/End: Original strand, 14572602 - 14572823
Alignment:
Q  25 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  14572602 catcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaattgagagtcaac 14572700  T
Q  125 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||| || |||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14572701 aacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgaaaaaaacattatatcacatcataaacaacataaacaaatcttaaacaacttcacaaattataat 14572800  T
Q  225 taacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14572801 taacatcatcattaagtcttaat 14572823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24153326 - 24153115
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  24153326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaat 24153228  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24153227 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 24153128  T
Q  215 agattataattaa 227  Q
    |||||||||||||    
T  24153127 agattataattaa 24153115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 12399209 - 12399448
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12399209 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 12399308  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    ||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  12399309 aatgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataagacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaatagctt 12399408  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||    
T  12399409 cacagattatagttaacctcttcattatgtcttaatgcta 12399448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25476506 - 25476275
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476506 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 25476407  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||| |||    
T  25476406 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcacatcattatcatcatcaacacatcttaaacagctt 25476307  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  25476306 cacagattgtaattaacatcctcattaagtct 25476275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386632
Alignment:
Q  30 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataattaac 228  Q
    || ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaaacatcttaaaacagcttcacagattatcattaac 42386627  T
Q  229 atcat 233  Q
    |||||    
T  42386628 atcat 42386632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40213838 - 40213611
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  40213838 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacag-cagtatacataaacatcatgacataataatatcaaat 40213740  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||| ||    
T  40213739 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctttac 40213640  T
Q  215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213639 agattataattaacatcatcattaagtct 40213611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 11424880 - 11424653
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  11424880 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatca 11424782  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    || ||||   | |||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||| |||    
T  11424781 atagcaa---atcaacatctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataaacaacttcaacacatcttaaacagctt 11424685  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  11424684 cacagattaaaattaacatcaacattaagtct 11424653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29172745 - 29172567
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29172745 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 29172647  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||||||||    
T  29172646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaa 29172567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Original strand, 30029855 - 30030078
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||    
T  30029855 tcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataagaatatcatttgcaattca-caa 30029953  T
Q  127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataatta 226  Q
    | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||| | |    
T  30029954 cgtcttaaatattcaataaaacttcaagtaatgtacacaacattatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaacagcttcacatattatattaa 30030053  T
Q  227 acatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  30030054 acatcatcattaagtcttaaagcta 30030078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 9707769 - 9707607
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9707769 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 9707671  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  9707670 acaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 9707607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 17463178 - 17463340
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17463178 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17463276  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17463277 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17463340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 34159326 - 34159488
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34159326 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34159424  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34159425 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34159488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45607069 - 45606907
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45607069 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 45606971  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45606970 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45606907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 55476491 - 55476653
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55476491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55476589  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  55476590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 55476653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7781509 - 7781347
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7781509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 7781411  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7781410 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7781347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 8899094 - 8899256
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8899094 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8899192  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8899193 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8899256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16454443 - 16454281
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16454443 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16454345  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16454344 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16454281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 17672626 - 17672788
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17672626 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17672724  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  17672725 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 17672788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28848773 - 28848611
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28848773 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 28848675  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  28848674 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 28848611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38962053 - 38961891
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38962053 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 38961955  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38961954 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 38961891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13151953 - 13151790
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13151953 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13151855  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13151854 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13151790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13154418 - 13154255
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  13154418 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 13154320  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13154319 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13154255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 13544024 - 13544187
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  13544024 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 13544122  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13544123 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 13544187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 6469296 - 6469134
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6469296 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6469198  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || || |||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  6469197 gcaagtcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcaca 6469134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 10247885 - 10247723
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10247885 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 10247787  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  10247786 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 10247723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 12567564 - 12567722
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12567564 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacatcatgacataataatatcaaatgcaa 12567662  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12567663 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12567722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16282971 - 16282811
Alignment:
Q  17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||    
T  16282971 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgc 16282873  T
Q  117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16282872 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16282811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17446816 - 17446655
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17446816 tcatcatcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 17446719  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17446718 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17446655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 50242822 - 50242984
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  50242822 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 50242920  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50242921 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 50242984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 43550644 - 43550478
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  43550644 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatca 43550545  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  43550544 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 43550478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 41123892 - 41124049
Alignment:
Q  17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  41123892 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacacaa----cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 41123987  T
Q  117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41123988 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41124049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 36166598 - 36166739
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  36166598 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaat 36166695  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  36166696 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070653
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 53070701  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  53070700 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 53070653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 129
Target Start/End: Original strand, 55500942 - 55501055
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  55500942 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 55501040  T
Q  115 gcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||    
T  55501041 gcaagtcaacaacat 55501055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 15977515 - 15977640
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15977515 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-atagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 15977613  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 141  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  15977614 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 15977640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 12119887 - 12119780
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119887 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12119789  T
Q  115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
T  12119788 gcaagtcaa 12119780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 15412429 - 15412536
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15412429 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15412527  T
Q  115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
T  15412528 gcaagtcaa 15412536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Original strand, 21618460 - 21618590
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21618460 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    |||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 46822267 - 46822419
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  46822267 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 46822366  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  46822367 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 46822419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24340844 - 24340628
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| || || || ||||| |||||||||||    
T  24340844 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatc 24340746  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| || |    
T  24340745 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 24340646  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
T  24340645 ttcacagatcatcattaa 24340628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 8499518 - 8499625
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8499518 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 8499616  T
Q  115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
T  8499617 gcaagtcaa 8499625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523633
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||| | ||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataatta 226  Q
    |||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| |||| ||||| || ||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaat-catcttataacagcttctcagatcatcatta 52523634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 12511059 - 12511211
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||| || ||||||| |||||||||    
T  12511059 atcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaaatatcaat 12511158  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  12511159 tgcaattcaacaacatcttcaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 12511211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 10556985 - 10557101
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  10556985 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-tcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaat 10557083  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatct 131  Q
    ||||| ||| ||||||||    
T  10557084 gcaagccaatcaacatct 10557101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 112
Target Start/End: Original strand, 44494809 - 44494905
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44494809 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaa 44494905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 27165250 - 27165413
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| | |||||| ||||| |||  ||||||||     
T  27165250 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgc-aaaacaacatgatataccaatatcaaa 27165348  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| |||| |||||||||  |||| || ||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  27165349 tgcaagtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcaca 27165413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 251
Target Start/End: Original strand, 16796685 - 16796786
Alignment:
Q  150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgc 249  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||||||    
T  16796685 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaaaaacaacacatcttaaacaacttcacatattataattagcctcttcattaagtcttaatgc 16796784  T
Q  250 ta 251  Q
    ||    
T  16796785 ta 16796786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13210448 - 13210333
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  13210448 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 13210350  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | ||||| ||||||||    
T  13210349 gaatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 16103784 - 16103961
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16103784 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16103882  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| ||||  ||||| |||||| ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  16103883 gcaa-tcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaat 16103961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 112
Target Start/End: Original strand, 17737236 - 17737335
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta---tacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17737236 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcaatatactacaacaacagcatgacataataatatca 17737334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274869
Alignment:
Q  30 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |  |||||| |||||||    
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||| |||||||||  |||| ||||||||| | |||||  |||| ||||||| | || |||||||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaa 23274869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 37642386 - 37642170
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  37642386 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 37642288  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| || |    
T  37642287 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 37642188  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
T  37642187 ttcacagatcatcattaa 37642170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 53301669 - 53301505
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  53301669 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 53301571  T
Q  114 tgcaagtca-acaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||  ||| |||| |||||||||  |||| |||||||| | | ||||  |||||||||||    
T  53301570 tgcaagtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcaca 53301505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 14234487 - 14234610
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  14234487 acatcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 14234585  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  14234586 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 14234610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 15470928 - 15471043
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  15470928 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 15471026  T
Q  115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||| ||||||||    
T  15471027 gcaagtcatcaacatct 15471043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 16097332 - 16097510
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||| | |||| |||||| | |    
T  16097332 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaat 16097430  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  16097431 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat 16097510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 14179570 - 14179648
Alignment:
Q  150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14179570 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 14179648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 12174376 - 12174303
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12174376 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12174303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 32307684 - 32307795
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||    
T  32307684 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgca 32307782  T
Q  118 agtcaacaacatct 131  Q
    | ||||||||||||    
T  32307783 a-tcaacaacatct 32307795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 49668193 - 49668120
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  49668193 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 49668120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 76
Target Start/End: Original strand, 28194693 - 28194755
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacatag 76  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28194693 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatag 28194755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 9512924 - 9512997
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9512924 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9512997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 9520899 - 9520972
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9520899 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 9520972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 15 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 45578000 - 45577947
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 68  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578000 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 94 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051137
Alignment:
Q  94 catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatca 193  Q
    ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  194 at 195  Q
    ||    
T  2051138 at 2051137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22147646 - 22147431
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||  |||  | ||||||| ||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22147646 acatcaacatcttcaacgacttggaccgagtcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcggtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 22147548  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||| ||| |||| |||| || |    
T  22147547 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacataaat-catcataaatcagc 22147449  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
T  22147448 ttcacagatcatcattaa 22147431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251168
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  37251171 atct 37251168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926079
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  43926076 atct 43926079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 856140 - 856294
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  856140 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 856237  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattata 173  Q
     ||| ||||||||||||||  ||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||    
T  856238 -caattcaacaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatacata-aacattata 856294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 1644787 - 1644718
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644787 catcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatgcaaa 1644718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11298621 - 11298481
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| ||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  11298621 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 11298523  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  11298522 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 11298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 22110454 - 22110352
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |    
T  22110454 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacagc 22110356  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  22110355 atct 22110352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Original strand, 12377940 - 12378046
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  12377940 cttagaccgactcatacagcttagttaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaatagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 12378039  T
Q  129 tcttaaa 135  Q
     ||||||    
T  12378040 acttaaa 12378046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919399
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagggagta 13919399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 14665398 - 14665546
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||   |||  ||||| || || | | ||||||||    
T  14665398 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataatcagatcacatcaacagtataactttaaaatatcaa 14665497  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcat 162  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14665498 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcat 14665546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 14668554 - 14668702
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  ||||| || || | ||||||||||    
T  14668554 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagtataactttataatatcaa 14668653  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcat 162  Q
    || ||  ||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  14668654 tt-catttcaacaacatcttgatcattcaataatatttcaagtaatgcat 14668702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 15878168 - 15878083
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  15878168 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatatgacat 15878083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 23077594 - 23077530
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23077594 catcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacataggcag 23077530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 19726004 - 19725886
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||  ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  19726004 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacatcaacagcatgac-tcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 19725907  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatg 159  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  19725906 tcaataatatttcaagtaatg 19725886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 606428 - 606378
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcag 80  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  606428 cttataccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcag 606378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 79
Target Start/End: Original strand, 9577646 - 9577691
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||    
T  9577646 tagaccgactcatgcagcttatttatat-acaacagcaacataggca 9577691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14878610 - 14878569
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  14878610 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcag 14878569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 15246037 - 15246086
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  15246037 cttagaccgactcatgcagtttaattaatagacaacagcaacataggcag 15246086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17525275 - 17525190
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    |||||| || |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||  | ||| ||||| |||||||    
T  17525275 catcattttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggcagagtgcaacaacagtatgacat 17525190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 3390030 - 3389994
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390030 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 3389994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 73)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Original strand, 23060513 - 23060742
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23060513 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 23060612  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23060613 attgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23060712  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23060713 caca-attataattaacatcatcattaagtc 23060742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 236
Target Start/End: Original strand, 23076442 - 23076666
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076442 acatcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 23076541  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  23076542 attgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacagcttaaacagctt 23076641  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcat 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23076642 cacagattataattaacatcatcat 23076666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22731355 - 22731120
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731355 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22731256  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22731255 attgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22731156  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22731155 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22731120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 22337115 - 22337350
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22337115 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatca 22337214  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||| ||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  22337215 aatgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacatatcttaaacaactt 22337314  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337315 cacaaattataattaacatcatcattaagtcttaat 22337350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22738300 - 22738066
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738300 acatcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaa-ataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatca 22738202  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22738201 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22738102  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22738101 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22738066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 23285865 - 23286096
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||    
T  23285865 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag----acataataatatca 23285960  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  23285961 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 23286060  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286061 cacagattataattaacatcttcattaagtcttaat 23286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23654507 - 23654268
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23654507 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatca 23654408  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||| |||    
T  23654407 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaacaacaacacatcttaaacagctt 23654308  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23654307 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 23654268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 23660023 - 23660253
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  23660023 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatca 23660121  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  23660122 aatgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 23660221  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  23660222 tacaaattataattaacatcatcaataagtct 23660253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 298933 - 298696
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  298933 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaat 298834  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttca 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| || | ||| |||||||| ||| |||||    
T  298833 tgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattaataacaacacatcttatacagcttca 298734  T
Q  214 cagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    || |||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  298733 catattatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 298696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38235 - 38002
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38235 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 38137  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||| | | ||| || |||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |  ||||| ||| |||    
T  38136 atttcgattcatcatcatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatgtcttatacagctt 38038  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    || |||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  38037 cagagattataattaacctcattgttaagtcttaat 38002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 22105412 - 22105575
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22105412 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22105511  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22105512 gcaagtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22105575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21155219 - 21155060
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155219 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 21155121  T
Q  118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21155120 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21155060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 18808943 - 18809105
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18808943 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18809041  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18809042 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 23130862 - 23131024
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23130862 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23130960  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23130961 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23131024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 23133329 - 23133491
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23133329 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23133427  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23133428 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23133491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23709694 - 23709532
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23709694 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23709596  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23709595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23709532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23712175 - 23712013
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23712175 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23712077  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23712076 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 23712013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 26505379 - 26505541
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26505379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26505477  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26505478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26505541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 26507857 - 26508019
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  26507857 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaat 26507955  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26507956 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26508019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34402684 - 34402522
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34402684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 34402586  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34402585 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 34402522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 39682313 - 39682475
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39682313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 39682411  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39682412 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 39682475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 20309108 - 20309340
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  20309108 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatc 20309204  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  20309205 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 20309303  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20309304 tcacagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 20309340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32215085 - 32214921
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215085 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 32214987  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32214986 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 32214921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 571397 - 571559
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  571397 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 571495  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || | ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  571496 gcaagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 571559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 6725995 - 6726157
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6725995 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 6726093  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6726094 gtaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 6726157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 23135590 - 23135752
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23135590 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23135688  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  23135689 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 23135752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24367774 - 24367936
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24367774 tcatcattttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24367872  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24367873 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24367936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24898358 - 24898195
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24898358 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24898260  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24898259 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24898195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24900841 - 24900678
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24900841 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24900743  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24900742 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24900678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24903318 - 24903155
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24903318 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24903220  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24903219 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24903155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24905795 - 24905632
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24905795 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24905697  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24905696 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24905632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24908270 - 24908107
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24908270 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 24908172  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24908171 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24908107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 32039660 - 32039498
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32039660 tcatcatcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32039562  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32039561 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32039498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 23708738 - 23708518
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23708738 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23708642  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaac 209  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||| |    
T  23708641 aattgcaaatcatcgacatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaattcatcttataacagc 23708542  T
Q  210 ttcacagattataattaacatcat 233  Q
    ||||||||| || ||||| |||||    
T  23708541 ttcacagatcatcattaatatcat 23708518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 28577099 - 28577261
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  28577099 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaa-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaat 28577197  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| ||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  28577198 gcaagccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 28577261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 17 - 178
Target Start/End: Original strand, 43137301 - 43137461
Alignment:
Q  17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  43137301 atcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaa-tatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgc 43137399  T
Q  117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||| ||| || | ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43137400 aagtcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 43137461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45030016 - 45029854
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  45030016 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 45029918  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  45029917 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcaca 45029854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24529691 - 24529528
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24529691 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacaca-tcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagt 24529593  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| |||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  24529592 gcaagttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 24529528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 23103516 - 23103346
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  23103516 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatca 23103419  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgc-atataacattatatcacatcaaa 183  Q
    | | ||| ||| |||||||| ||  ||||| | ||| ||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||    
T  23103418 aattcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgcaattaaacattatatcacatcaaa 23103346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 38967374 - 38967537
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  || |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  38967374 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacaca-acaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaat 38967472  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  38967473 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38967537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 166
Target Start/End: Original strand, 25616192 - 25616339
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25616192 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaattgcaa 25616291  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  25616292 ttcaacaacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 25616339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Original strand, 19671830 - 19672043
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||    
T  19671830 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatc 19671928  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaac 209  Q
     |  |||||| ||||||||| | ||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||| |||| || | || |    
T  19671929 gaacgcaagtaaacaacatc-tcaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa-caacatcaat-catcatagatcagc 19672025  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||| |||||    
T  19672026 ttcacagattatcattaa 19672043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 17 - 138
Target Start/End: Original strand, 28405981 - 28406103
Alignment:
Q  17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| | ||    
T  28405981 atcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatg 28406080  T
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    ||| |||||||||||| ||||||    
T  28406081 caaatcaacaacatctcaaatat 28406103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 89
Target Start/End: Original strand, 8946657 - 8946734
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 89  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8946657 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451811
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 128  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||    
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca-aaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataatta 226  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||| |  |||||  | |||| ||||||| ||| ||||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acataatatcacatcataaatcaacatta--acatcccataacagcttcacaaattgtaatta 32451836  T
Q  227 acatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    | |||||  | ||||||||||||||    
T  32451835 atatcatattcaagtcttaatgcta 32451811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 254
Target Start/End: Original strand, 27753730 - 27753817
Alignment:
Q  167 cattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27753730 cattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacatattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 27753817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 23040310 - 23040247
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040310 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 23040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7687
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  7736 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacat 7687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22799220 - 22799068
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||    
T  22799220 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 22799121  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||||| |||  | |||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22799120 tcaataatatcttaagtaaggcacataacattatatcacatcatattcaacat 22799068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 25175854 - 25175976
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  25175854 catcatcatcatcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 25175952  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  25175953 gcaaatcaacaacatctcaaatat 25175976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 180
Target Start/End: Original strand, 7679589 - 7679751
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  7679589 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaa-t 7679686  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatc 180  Q
    | |||||| ||||||| |||| | ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||||    
T  7679687 gtaagtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatataacatc 7679751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 24643109 - 24643034
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagc 94  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  24643109 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-tcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520092
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataatta 226  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |  | | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  20520197 atctcaaaca-tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaatcatcttataacaacttcacagattatcatta 20520099  T
Q  227 acatcat 233  Q
    | |||||    
T  20520098 atatcat 20520092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 22134326 - 22134251
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22134326 catcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaacataggcagtatgcaaa 22134251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23019823 - 23019648
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||  | |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||| |||||| | ||||||||||||     
T  23019823 catcatcttaatcatcttatattgactcataaaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacaacatgacttcataatatcaattt 23019724  T
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23019723 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacat 23019648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 23072070 - 23071972
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  23072070 acatcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataacgaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 23071972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207398
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  23207395 atct 23207398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786947
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| ||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagtaacataggtagtatgcaaa 18786947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287433
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 23287433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 101 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642856
Alignment:
Q  101 taataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24642856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 25963809 - 25963669
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  25963809 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 25963711  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  25963710 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 25963669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 81
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392451
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagt 26392451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 33 - 101
Target Start/End: Original strand, 23038048 - 23038116
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23038048 tagacggactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 23038116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 23791292 - 23791441
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | | |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  23791292 cttagaccgactcatgtagcttagttaataagcaaacaacaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaac 23791390  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    |||| ||| ||| |  |||| |||| ||||||||||||   |||||||||||    
T  23791391 atctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacat 23791441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 23004767 - 23004869
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||| | |||| |   || || ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23004767 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggtagtacataaaatagttcaggatataataatatcaaatgcaaatcaacaaca 23004866  T
Q  129 tct 131  Q
    |||    
T  23004867 tct 23004869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 22413240 - 22413181
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 89  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  22413240 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa 22413181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22741081 - 22740902
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-----catgacataataatatc 110  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||     ||| ||||||  |||||    
T  22741081 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 22740982  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  22740981 aat--aaaaacaacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacat 22740902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 9241945 - 9241994
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || | |||||||||||||||||||    
T  9241945 cttagaccgacacatgcagcttaatcaatttacaacagcaacataggcag 9241994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 40622327 - 40622151
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  40622327 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattatatcaatt 40622230  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaata-----ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||     | ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  40622229 -caattcatcaacatcttatgtatacagtacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca 40622151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24655432 - 24655396
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655432 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 24655396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Original strand, 24869903 - 24869939
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  24869903 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 24869939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Original strand, 25108906 - 25108958
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 82  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  25108906 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 25108958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 25961628 - 25961592
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25961628 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 25961592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 81)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 9509189 - 9509431
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9509189 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatca 9509288  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  9509289 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 9509388  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9509389 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 9509431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 12698831 - 12699067
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12698831 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatc 12698930  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||    
T  12698931 aattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagct 12699030  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  12699031 tcacagattataattaacatcctcattaactcttaat 12699067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 38227481 - 38227715
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38227481 acatcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38227579  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||| | |||    
T  38227580 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcacatcttaatcaacatcaacatatcttaaatatctt 38227679  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227680 cacatattataattaacatcatcattaagtcttaat 38227715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3564482 - 3564254
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  3564482 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 3564383  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    | ||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  3564382 gtaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacaacttcat 3564283  T
Q  215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||    
T  3564282 aggttataattaacatcatcattaagtct 3564254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18456530 - 18456319
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  18456530 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 18456432  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  18456431 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 18456332  T
Q  215 agattataattaa 227  Q
    |||||||||||||    
T  18456331 agattataattaa 18456319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 26211995 - 26212235
Alignment:
Q  12 acatcatcat-cttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26211995 acatcatcattcttcaacaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatc 26212094  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  26212095 aattgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataatcaacaacaacacatcttaaacagct 26212194  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  26212195 tcacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 26212235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 10589039 - 10589273
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10589039 acatcatcatcttcgacaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatca 10589138  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||||||| | |||    
T  10589139 attgcaattcaacaacatcttcaatgttcaaatattcttcaagcaatgcata-aacattatatcacatcataatcagcaacaacacatcttaaatagctt 10589237  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10589238 cacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 10589273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16386369 - 16386132
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||    
T  16386369 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatc 16386270  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    ||||| |  ||| |||||||||||||||||||  |    |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16386269 aattgtatttcatcaacatcttaaatattcaaacaattctcaagtaatgcataaaacattatattacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagct 16386170  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatg 248  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16386169 tcacagattatagttaacctcttcattaagtcttaatg 16386132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443624
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaacaaa--cagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
    || ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||| ||| ||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagcttc 40443589  T
Q  213 acagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  40443590 acagattataattaacctcattgttaagtcttaat 40443624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 13647325 - 13647491
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13647325 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatca 13647424  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13647425 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13647491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 456321 - 456483
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  456321 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 456419  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  456420 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 456483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 11972496 - 11972658
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11972496 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 11972594  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11972595 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11972658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14949284 - 14949122
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14949284 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14949186  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14949185 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14949122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15376875 - 15376713
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15376875 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15376777  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15376776 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15376713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 16213684 - 16213846
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16213684 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16213782  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16213783 ccaagtcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16213846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 16232520 - 16232682
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16232520 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16232618  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16232619 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16232682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 18640272 - 18640434
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18640272 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18640370  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18640371 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18640434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20385285 - 20385123
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20385285 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20385187  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20385186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20385123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21189757 - 21189595
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21189757 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21189659  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21189658 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21189595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 32125491 - 32125653
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32125491 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 32125589  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  32125590 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 32125653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 41522917 - 41523079
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41522917 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41523015  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41523016 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41523079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 41525379 - 41525541
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41525379 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 41525477  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  41525478 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 41525541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 16 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11393448 - 11393287
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11393448 catcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 11393350  T
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11393349 caagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 11393287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 18430709 - 18430874
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18430709 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatca 18430807  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18430808 aatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18430874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24702238 - 24702400
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24702238 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 24702336  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24702337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24702400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 27216860 - 27217022
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27216860 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 27216958  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27216959 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 27217022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Original strand, 24275175 - 24275320
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24275175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24275273  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 165  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  24275274 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 176
Target Start/End: Original strand, 16410059 - 16410219
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16410059 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 16410157  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  16410158 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatca 16410219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 131
Target Start/End: Original strand, 48273392 - 48273508
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  48273392 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 48273491  T
Q  115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||||||||||||    
T  48273492 gcaagtcaacaacatct 48273508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143925
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| || || |||||||||| |||||| ||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatct-cagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaa 15144045  T
Q  127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataatt 225  Q
    ||||| || ||| || | ||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| |     
T  15144044 catctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcacatcataatcaatgtcaaaacatcttaaaacagcttgacagattatatta 15143945  T
Q  226 aacatcatcattaagtctta 245  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15143944 aacatcatcattaagtctta 15143925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 44116509 - 44116671
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  44116509 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 44116607  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  44116608 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcaca 44116671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 3386333 - 3386495
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  3386333 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaat 3386431  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  3386432 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcaca 3386495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 2280238 - 2280033
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  2280238 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatc 2280142  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaac 209  Q
    || ||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||| | || |||||||||  ||||||| |||| |    
T  2280141 aaatgcaaatcaacaacatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagc 2280042  T
Q  210 ttcacagat 218  Q
    |||||||||    
T  2280041 ttcacagat 2280033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24704688 - 24704847
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||   || |||||||||||||||| |    
T  24704688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaa---caagacataataatatcaaat 24704783  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24704784 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24704847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27847951 - 27847719
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||   ||||| |||||||||| |||||    
T  27847951 acatcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatc 27847855  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  27847854 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatcacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 27847756  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  27847755 tcacagattatagttaatctcattattaagtcttaat 27847719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 14932851 - 14932675
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  14932851 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 14932752  T
Q  116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  14932751 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcaacaacaacat 14932675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15356286 - 15356110
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15356286 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15356187  T
Q  116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  15356186 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcaacaacaacat 15356110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15360400 - 15360224
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15360400 catcatcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattg 15360301  T
Q  116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  15360300 caatttcaacaacactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacatcaacaacaacat 15360224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20110556 - 20110708
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20110556 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc-----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20110644  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20110645 gcaagtcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20110708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 13869346 - 13869453
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13869346 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13869444  T
Q  115 gcaagtcaa 123  Q
    |||||||||    
T  13869445 gcaagtcaa 13869453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17062077 - 17061915
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||     
T  17062077 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaac-tcagcagtatac-aaaatagcatgacataataatatcaaa 17061980  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17061979 tgcaagtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 17061915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898376
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacaca-gcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 38898437  T
Q  119 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  38898436 gtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 38898376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 141
Target Start/End: Original strand, 13831373 - 13831498
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |    
T  13831373 tcatcatcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca-cggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaat 13831471  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattca 141  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  13831472 gcaagtcaacaacgtctcaattattca 13831498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 67745 - 67864
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  67745 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 67843  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
     | ||||| ||||||||||||    
T  67844 gaatgcaaatcaacaacatct 67864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 22072913 - 22073033
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  22072913 acatcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatc 22073012  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    || || |||||||||||||||    
T  22073013 aaatgtaagtcaacaacatct 22073033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756671
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaa-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtc 12756719  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | || ||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12756718 tcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12756671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 34200786 - 34200901
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  34200786 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 34200884  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  34200885 gaatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28505419 - 28505321
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505419 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26356156 - 26355983
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaaacagcatgacataat 104  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26356156 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26356057  T
Q  105 aatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26356056 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26355983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26358608 - 26358435
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg----------cagtatacaaaaacagcatgacataat 104  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| |            ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26358608 tcatcatcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataat 26358509  T
Q  105 aatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26358508 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26358435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 18005650 - 18005772
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||   ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  18005650 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaat 18005748  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  18005749 gcaaatcaacaacatctcaaatat 18005772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19486865 - 19486649
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  19486865 acatcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 19486767  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| || |    
T  19486766 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 19486667  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
T  19486666 ttcacagatcatcattaa 19486649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 811248 - 811129
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  811248 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 811150  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
    ||||||||  |||||| ||||    
T  811149 gcaagtcattaacatcataaa 811129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 16219834 - 16219715
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  16219834 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 16219736  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
    |||||||| ||||||||||||    
T  16219735 gcaagtcatcaacatcttaaa 16219715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 16495402 - 16495517
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  16495402 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 16495500  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  16495501 gaatgtaaatcaacaac 16495517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 47831807 - 47831930
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| | | | || ||||| |||| ||||||    
T  47831807 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgc-atatcatcatgatataacaatatc 47831905  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  47831906 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 47831930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867895
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatcaa-tgcaaatgaa 1868004  T
Q  124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataa 223  Q
    |||||||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | |||||||||| |  | |||||||||  ||||||||| | |||||||||| || |    
T  1868003 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttaaaaagcttcacagatcatca 1867905  T
Q  224 ttaacatcat 233  Q
    |||| |||||    
T  1867904 ttaatatcat 1867895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Original strand, 15211484 - 15211633
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||| || ||    
T  15211484 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 15211582  T
Q  138 ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaa 188  Q
    |||||| | ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15211583 ttcaataaaacttcaagcgatgtatacaacattatatcacatcataatcaa 15211633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 125
Target Start/End: Original strand, 44014182 - 44014291
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  44014182 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 44014280  T
Q  115 gcaagtcaaca 125  Q
    |||| ||||||    
T  44014281 gcaaatcaaca 44014291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255697
Alignment:
Q  34 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||   |  ||||| |||| |||||||| || || || |||||||||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  132 taaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataattaa 227  Q
     ||| |||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||| || |||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaat-catcttataacaacttcatagatcatcattaa 12255697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 18 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 18154956 - 18154873
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  18154956 tcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagtatgacat 18154873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11996148 - 11996051
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 109  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||    
T  11996148 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatat 11996051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15755008 - 15754893
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  15755008 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 15754910  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | ||||| ||||||||    
T  15754909 gaatgcaaatcaacaac 15754893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008398
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  132 taaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataattaacat 230  Q
     ||| | |||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |  | |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||||| ||||| ||    
T  15008499 caaaca-tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagattatcattaatat 15008401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 2530208 - 2530129
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 142  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  2530208 aacaacagcaacataggcaacatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaa 2530129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056446
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  126 acatct 131  Q
    ||||||    
T  16056441 acatct 16056446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 10063939 - 10063810
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| || || || ||||| |||||||||||    
T  10063939 acatcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatc 10063841  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattca 141  Q
     |   ||||| |||||||||| |||||||||    
T  10063840 gaacacaagtaaacaacatctcaaatattca 10063810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 17138177 - 17138006
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  17138177 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 17138080  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||    
T  17138079 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcatattcaaca 17138006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901401
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 89  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaa 12901401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044817
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14044817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354847
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaaaagcaacataggcagta 14354847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 12187019 - 12187173
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  || | ||||  ||||| ||| |||||    
T  12187019 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaattacaatcatg--ataattataccaatt 12187116  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattata 173  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  12187117 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattata 12187173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 19649606 - 19649521
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| ||||  |||||||    
T  19649606 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacaatatgacat 19649521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 12321835 - 12321685
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  12321835 gactcatgcaacgtagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 12321737  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcaaaatcaac 189  Q
    || || ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  12321736 tccataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 12321685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Original strand, 18203831 - 18203882
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 82  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||    
T  18203831 cttagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacaacaacatagacagta 18203882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 2832561 - 2832499
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  2832561 catcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 2832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220194
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 20220194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 9446252 - 9446216
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446252 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 9446216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 20569690 - 20569654
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569690 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 20569654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 227
Target Start/End: Original strand, 48273538 - 48273594
Alignment:
Q  172 tatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataattaa 227  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  48273538 tatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagattatcattaa 48273594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 38 - 89
Target Start/End: Original strand, 48991206 - 48991258
Alignment:
Q  38 cgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 89  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||| ||||    
T  48991206 cgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa 48991258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 1851 - 2093
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1851 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 1950  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  1951 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaatagctt 2050  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  2051 cacagattataattaacatcctcattaagtcttaatactatcc 2093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 74)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Original strand, 44052829 - 44053071
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052829 acatcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 44052928  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| |||    
T  44052929 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcacatcataatcaacatcagcacatcttaaacagctt 44053028  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44053029 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 44053071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 7088877 - 7089116
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088877 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7088976  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || ||| ||||||||||||||||    
T  7088977 attgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataattagcaacaacacatcttaaacaactt 7089076  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  7089077 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 7089116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 12902757 - 12902992
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902757 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 12902856  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||| || ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  12902857 attgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 12902956  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  12902957 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaat 12902992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 7893703 - 7893935
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893703 acatcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7893802  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||   || ||| |||||||||||| |||    
T  7893803 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcacatcataat---cagcaacacatcttaaacagctt 7893899  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7893900 cacagattataattaacatcatcgttaagtcttaat 7893935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16240090 - 16239856
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16240090 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16239992  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16239991 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatcatatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16239892  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16239891 cgcagattataattaacatcatcattaagtcttaat 16239856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636669
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttca 213  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||| |||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcgacatcaacacatctt-aacagcttca 22636635  T
Q  214 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  22636636 cagattataattaacatcctcgttaagtcttaat 22636669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16270356 - 16270140
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16270356 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 16270258  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16270257 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16270158  T
Q  212 cacagattataattaaca 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  16270157 cacagattataatcaaca 16270140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 7798774 - 7798956
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798774 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 7798873  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  7798874 attgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16377639 - 16377413
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  16377639 tcattatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaat 16377542  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    ||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || |||    
T  16377541 gcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctccac 16377442  T
Q  215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377441 agattataattaacatcatcattaagtct 16377413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 17 - 243
Target Start/End: Original strand, 14038653 - 14038879
Alignment:
Q  17 atcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgc 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||    
T  14038653 atcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgc 14038752  T
Q  117 aagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacag 216  Q
    ||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  14038753 aagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatgttaaacagcttcacag 14038852  T
Q  217 attataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038853 attataattaatatcatcattaagtct 14038879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23374473 - 23374241
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||    
T  23374473 catcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgcaa 23374374  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagat 218  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||| | ||||| ||||    
T  23374373 ttcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacagatcttaaaaagcttcagagat 23374274  T
Q  219 tataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  23374273 tatagttaacctcttcattaagtcttaatgcta 23374241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 181
Target Start/End: Original strand, 6899891 - 6900059
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||||    
T  6899891 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatagcataataatatca 6899989  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca 181  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  6899990 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacatca 6900059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 52873488 - 52873363
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873488 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 52873389  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  52873388 attgcaagtcaacatcatcttaaata 52873363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18215436 - 18215274
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18215436 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18215338  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18215337 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18215274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44929042 - 44928879
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  44929042 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaat 44928943  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44928942 gcaagtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44928879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12469 - 12307
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12469 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12371  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12370 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15118514 - 15118352
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15118514 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 15118416  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15118415 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 15118352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 52312510 - 52312672
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52312510 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 52312608  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  52312609 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 52312672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Original strand, 19242693 - 19242861
Alignment:
Q  9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242693 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataata 19242791  T
Q  109 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19242792 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19242861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19618336 - 19618172
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19618336 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaa 19618238  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19618237 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 19618172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1837671 - 1837508
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1837671 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaat 1837573  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1837572 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacat 1837508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 3515007 - 3515169
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  3515007 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaat 3515105  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3515106 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 3515169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23803427 - 23803265
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23803427 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23803329  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23803328 gcaaatcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23803265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 44615288 - 44615450
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  44615288 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 44615386  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44615387 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44615450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 44773249 - 44773087
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44773249 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44773151  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44773150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44773087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 50222501 - 50222339
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  50222501 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 50222403  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  50222402 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 50222339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 54798872 - 54798729
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54798872 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 54798773  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  54798772 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 54798729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18239581 - 18239419
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18239581 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18239483  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18239482 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 18239419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 51464030 - 51463868
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  51464030 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 51463932  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  51463931 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcaca 51463868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14053422 - 14053188
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14053422 acatcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatacaaa--cagcatgacataataatatc 14053325  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacat-cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaac 209  Q
    |||| ||| ||| |||||| ||||   || ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| ||  |    
T  14053324 aatttcaattcatcaacattcttatgcatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacggc 14053226  T
Q  210 ttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14053225 ttcacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 14053188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 138
Target Start/End: Original strand, 14280316 - 14280438
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14280316 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-cggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 14280414  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  14280415 gcaagtcaacaacatctcaaatat 14280438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 44102214 - 44102376
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44102214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44102312  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| |||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  44102313 gcaagtaaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 44102376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 15355483 - 15355324
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15355483 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 15355385  T
Q  119 gtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  15355384 gtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 15355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 17046487 - 17046719
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   | |||| ||||||||||| |||||    
T  17046487 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtat---agaacaacatgacataattatatc 17046583  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  17046584 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatatcttattcagct 17046682  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  17046683 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 17046719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 14970871 - 14970707
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970871 catcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacag-caatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14970773  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  14970772 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcaca 14970707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12610950 - 12611105
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12610950 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca--------acaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12611041  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12611042 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12611105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Original strand, 3096293 - 3096379
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 98  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096293 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 15367690 - 15367856
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367690 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15367788  T
Q  112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  15367789 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcaca 15367856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 15402703 - 15402869
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402703 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15402801  T
Q  112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  15402802 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcaca 15402869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7641344 - 7641192
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  7641344 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaac-----------acaaaaacaacatgacataataatatcaaat 7641256  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7641255 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 7641192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 31 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815587
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-ctgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtc 21815633  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  21815632 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatca 21815587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243099
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| || || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattata 222  Q
    |||||||| ||| |||||  |||| | |||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  ||||||| |||| |||||||||| ||     
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcttataacagcttcacagatcatc 52243104  T
Q  223 attaa 227  Q
    |||||    
T  52243103 attaa 52243099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13790
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 13790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 15371202 - 15371368
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371202 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15371300  T
Q  112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||| |||  ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  15371301 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcaca 15371368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 15373483 - 15373649
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373483 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15373581  T
Q  112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||| |||  ||| || ||||||  |||| ||||| ||| |||||||  |||||||||||    
T  15373582 aatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcaca 15373649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 22353835 - 22353999
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  |  |  |||| |||||||||| |||||||||    
T  22353835 atcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaat 22353934  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | ||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22353935 tacaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22353999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 8574985 - 8574844
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |    
T  8574985 tcatcatcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat 8574888  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    | || |||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  8574887 gtaattcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 123
Target Start/End: Original strand, 15370018 - 15370128
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370018 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 15370116  T
Q  112 attgcaagtcaa 123  Q
    | ||||||||||    
T  15370117 aatgcaagtcaa 15370128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Original strand, 16223532 - 16223698
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16223532 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatct 16223630  T
Q  112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||  ||||||  |||||||||||    
T  16223631 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcaca 16223698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198491
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaac 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||| |   ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  125 aacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    || |||| |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| | || ||||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaat 43198491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 20149832 - 20149992
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20149832 tcatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 20149930  T
Q  118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  20149931 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 20149992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190701
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||| || |||  ||||| ||    
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatcaa-tgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca-aaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataatta 226  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| | |||||||| |  |||||| | |||| ||||||  ||| ||||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattagatcacatcatacatcaacatta--acatctcataacagcttcacgaattgtaatta 6190676  T
Q  227 acatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    | |||||  | ||||||||||||||    
T  6190677 atatcatattcaagtcttaatgcta 6190701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Original strand, 15551817 - 15551889
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15551817 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 15551889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 39706409 - 39706286
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  39706409 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 39706311  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
T  39706310 gaatgcaagtcatgaacatcataaa 39706286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 127 - 241
Target Start/End: Original strand, 3096759 - 3096872
Alignment:
Q  127 catcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataatta 226  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||| || ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  3096759 catcataaatattcaaatattcttcaagtaatgcata-aacattgtatctcatcataatcagcaacaacacatcttaaacagcttcacatattataatta 3096857  T
Q  227 acatcatcattaagt 241  Q
    || ||||||||||||    
T  3096858 acctcatcattaagt 3096872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 12774011 - 12774084
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12774011 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 12774084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 43256230 - 43256114
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  43256230 aacaacagcaacataggcagcataccaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 43256134  T
Q  160 catataacattatatcacat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  43256133 catataatattatatcacat 43256114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288211
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  124 caacatc 130  Q
    |||||||    
T  12288217 caacatc 12288211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17048055 - 17047958
Alignment:
Q  150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||   || |||||||||||||||    
T  17048055 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacaggttgtaattagtctcttcattaagtcttaat 17047958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 8846360 - 8846433
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  8846360 catcatcatcatcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 8846433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 15093798 - 15093950
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||  ||   |||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  || ||||||| ||||  ||    
T  15093798 gactcatgcaacttagttaaagaacaatagcagcatagaaagatcacaacaacagcatgacttcataatatcaatttcatttctacaacatattaatcat 15093897  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  15093898 tcaataatatattaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 15093950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16357045 - 16356905
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  16357045 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgatcat 16356947  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16356946 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16356905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 15464977 - 15464888
Alignment:
Q  87 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| ||||||||  |||||||||    
T  15464977 aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16348757 - 16348617
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  16348757 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgataat 16348659  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16348658 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16348617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 16488171 - 16488031
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||||| |||||| || | |||||||||||| |   ||||||||||||| |  ||    
T  16488171 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaaaagcagcataacttcataatatcaatt-cttttcaacaacatcttgatcat 16488073  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  16488072 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 16488031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640456
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| || || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  46640459 atct 46640456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15121917 - 15121747
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| | || |||||||||  ||||| || |  |||||  |||| |||||||||    
T  15121917 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatatcagcataggcagattacaacaataatcatga--taattatatcaatt 15121820  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaac 189  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||    
T  15121819 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaac 15121747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 243
Target Start/End: Original strand, 15091090 - 15091127
Alignment:
Q  206 caacttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15091090 caacttcacagattataattaacatcttcattaagtct 15091127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333347
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacatagacagta 17333347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082202
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagta 53082202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 11250655 - 11250619
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250655 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 11250619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 227
Target Start/End: Original strand, 14280462 - 14280518
Alignment:
Q  172 tatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataattaa 227  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  14280462 tatgacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagattatcattaa 14280518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 15353401 - 15353365
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353401 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 15353365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 176 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54798721 - 54798669
Alignment:
Q  176 acatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataattaa 227  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  54798721 acatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcacagattatcattaa 54798669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 3)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 38761 - 38995
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38761 acatcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 38859  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  38860 aatgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 38959  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38960 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 38995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 12 - 229
Target Start/End: Original strand, 32942 - 33158
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32942 acatcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatca 33040  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  33041 aatgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 33140  T
Q  212 cacagattataattaaca 229  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  33141 cacagattataatcaaca 33158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Original strand, 9744 - 9912
Alignment:
Q  10 ggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 109  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9744 ggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagaatgacataataatat 9842  T
Q  110 caattgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||| |||||||||||||| ||| || || ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  9843 caagtgcaagtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 3470 - 3705
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3470 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 3569  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  3570 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 3669  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3670 catagattataattaacatcctcattaagtcttaat 3705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 343 - 573
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  343 acatcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatacaaaat-agcatgacgtaataatatca 441  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  442 attggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 541  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  542 catatattataattaacatcctcattaagtct 573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 78)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20361081 - 20360846
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20361081 acatcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatca 20360982  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  20360981 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 20360882  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20360881 cacatattataattaacctcatcattaagtcttaat 20360846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17287917 - 17287678
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17287917 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatca 17287818  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | || ||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  17287817 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatgtcataacataatcaacctcaacacatcttaaacagctt 17287718  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17287717 cacaggttataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 17287678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 20638404 - 20638162
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20638404 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 20638305  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| | | ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20638304 attgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcataaaacgttatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20638205  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20638204 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgttatcc 20638162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 22780348 - 22780116
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22780348 acatcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatca 22780249  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22780248 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22780149  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtctt 244  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780148 cacagattatgattaacatcatcattaagtctt 22780116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 29060540 - 29060771
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  29060540 acatcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 29060639  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29060640 aatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatctcatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 29060739  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060740 cacagattataattaatatcatcattaagtct 29060771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18409947 - 18409704
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18409947 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatatcaa 18409848  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
     |||||||||||||||||| ||  || || | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18409847 atgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 18409748  T
Q  213 acagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatccta 256  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18409747 acatattataattaacatcatcattaagtctcaatactacccta 18409704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25629476 - 25629245
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  25629476 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatca 25629377  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  25629376 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 25629277  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25629276 cacagattataattaacaacatcattaagtct 25629245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 20593773 - 20594004
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20593773 acatcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 20593872  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| |||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  20593873 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 20593972  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  20593973 cacagattataattatcattatcattaagtct 20594004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 12 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 19303661 - 19303435
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  19303661 acatcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 19303563  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| || ||| || | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  19303562 aatgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttcaacagctt 19303463  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaa 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303462 cacagattataattaacatcatcattaa 19303435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 16496244 - 16496411
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16496244 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 16496343  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16496344 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcacat 16496411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 20076700 - 20076863
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20076700 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatca 20076798  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    | |||||   | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20076799 aatgcaa---atcaacatcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcacat 20076863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12742317 - 12742479
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12742317 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 12742415  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12742416 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12742479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 18334754 - 18334592
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18334754 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 18334656  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18334655 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18334592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 19005046 - 19005208
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19005046 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19005144  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19005145 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19005208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19859081 - 19858919
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19859081 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 19858983  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19858982 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 19858919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 22782227 - 22782389
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22782227 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22782325  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22782326 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22782389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 24422547 - 24422709
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24422547 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 24422645  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  24422646 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 24422709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 33861794 - 33861956
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33861794 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33861892  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33861893 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33861956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 33864278 - 33864440
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33864278 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 33864376  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  33864377 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 33864440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 30676874 - 30676710
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30676874 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 30676776  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30676775 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 30676710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2291342 - 2291180
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291342 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2291244  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2291243 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 2291180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 8055029 - 8055191
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8055029 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaa-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 8055127  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  8055128 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 8055191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 25754809 - 25754971
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25754809 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25754907  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25754908 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 25754971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26924802 - 26924640
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26924802 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 26924704  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  26924703 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 26924640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 34963371 - 34963535
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963371 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 34963469  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34963470 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 34963535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 25656629 - 25656791
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25656629 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 25656727  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || ||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  25656728 gcaagttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcaca 25656791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644503
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||| || |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    |||||| ||| |||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcacatcaaaaacaacatcaa 25644503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1541073 - 1540911
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1541073 tcatcatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaat 1540975  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  1540974 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 1540911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 1595549 - 1595711
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  1595549 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 1595647  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  1595648 gcaattcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcaca 1595711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 25688502 - 25688664
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  25688502 tcattatcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaact 25688600  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  25688601 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcaca 25688664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3852179 - 3852017
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||| || |    
T  3852179 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaat 3852081  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3852080 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 3852017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456881
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18456833  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18456834 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 18456881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16448686 - 16448526
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16448686 tcatcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16448588  T
Q  118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  16448587 agtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 16448526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20557054 - 20556894
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  20557054 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaat 20556956  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| ||   ||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20556955 gcaagtcaacaacgtctcaa--tttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20556894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 31 - 165
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 18461993  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 165  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  18461994 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 187
Target Start/End: Original strand, 35245586 - 35245758
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||    
T  35245586 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatatc 35245682  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatca 187  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  35245683 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatca 35245758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16920751 - 16920519
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||| ||||||||||  |||||    
T  16920751 acatcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatc 16920655  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | | | ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||   ||||||  || ||    
T  16920654 aaattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataccacatcataatcaacaacaacttatcttattcagct 16920556  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  16920555 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 16920519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821787
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-cat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| |||||| |||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatgccataacaatatcaa-cgcaagccaacaatcat 18821849  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca-aaatcaacat 191  Q
    || || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18821848 ctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacat 18821787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 20109140 - 20109323
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| | |||| ||||||    
T  20109140 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatc 20109236  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat--aacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    || ||||||||| |||||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  20109237 aaatgcaagtcatcaacatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaat 20109323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 19848114 - 19847949
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||  |||||||  |||||| |||||||||    
T  19848114 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaaatatcaat 19848015  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaata-ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  19848014 tgcaattcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcaca 19847949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25603478 - 25603267
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || || |||||| || |||    
T  25603478 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-actacatctcaattat 25603380  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||   | | |||||||||||| ||||||||||| || | |||||| ||||||    
T  25603379 tcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcacagattctattaaacatcgtcatta 25603280  T
Q  239 agtcttaatgcta 251  Q
    |||||||| ||||    
T  25603279 agtcttaaagcta 25603267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 22831503 - 22831737
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |   |||  ||||||||||| |||||    
T  22831503 acatcatcatcttcaacatagtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcactgttc---aacgacatgacataatcatatc 22831599  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa--tattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaa 208  Q
    || | ||| ||| |||||||||| |  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||  ||     
T  22831600 aaattcaattcatcaacatcttagatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcag 22831698  T
Q  209 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||||||    
T  22831699 cttcacagattatagttaacctcattctcaagtcttaat 22831737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041441
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    ||||| | |  |||||||||||| || |||||| | || |||  ||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||||||||||||    
T  15041544 tcaataaaatctcaagtaatgcacat-acattaaaccaaatcttaattatcatcaacacatcttaaacagctttacagattgtatctaacatcatcatta 15041446  T
Q  239 agtct 243  Q
     ||||    
T  15041445 ggtct 15041441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 166
Target Start/End: Original strand, 23992429 - 23992578
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||  ||||  ||||||| ||||||| |||||||||    
T  23992429 atcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaaatatcaat 23992528  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa 166  Q
    ||||| |   |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  23992529 tgcaatt---caacatcttaaatattcaataatatctcaagtaatgcacataa 23992578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8227632 - 8227416
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | ||||||| |||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  8227632 acatcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 8227534  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| || |    
T  8227533 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 8227434  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
T  8227433 ttcacagatcatcattaa 8227416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27333339 - 27333262
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27333339 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27333262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 27394079 - 27394002
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27394079 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 27394002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25611816 - 25611605
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || || |||||| || |||    
T  25611816 gactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-actacatctcaattat 25611718  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    ||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||   | | |||||||||||| ||||| ||||| |  | |||||| ||||||    
T  25611717 tcaataaaacttcaagtaatgtatacaacatcatatcacatcataatcaatgactaaacatcttaaacagcttcatagattctgttaaacatcgtcatta 25611618  T
Q  239 agtcttaatgcta 251  Q
    |||| ||| ||||    
T  25611617 agtcctaaagcta 25611605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 25714417 - 25714478
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714417 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 28496592 - 28496477
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28496592 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28496494  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  28496493 gaatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 29809003 - 29808888
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  29809003 acatcatcatcttcaaaaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 29808905  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  29808904 gaatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 23019408 - 23019525
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  23019408 acatcatcatctt--tcatcttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatc 23019504  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  23019505 aaatgcaagtcaacaacatct 23019525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Original strand, 19652199 - 19652313
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  19652199 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19652297  T
Q  115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| ||||||||||||    
T  19652298 gcaa-tcaacaacatct 19652313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 27416011 - 27415895
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaatta-tacttcaagtaatg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||| | ||||||    
T  27416011 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 27415915  T
Q  160 catataacattatatcacat 179  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  27415914 cataaaacattatatcacat 27415895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 1561303 - 1561418
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1561303 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaataacaatataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1561401  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | ||||| ||||||||    
T  1561402 gaatgcaaatcaacaac 1561418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098557
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaa 9098557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 247
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185737
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||| || |||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatgtgcagtgtac---aacaacatgacataattatatcaaattcaattcatcagcat 11185620  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaaca 229  Q
    |||   ||| |||  || |||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||| || ||| | ||||||  || ||||||||||||   |||||     
T  11185621 cttttgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aactttataacacttcataatcagcaacaacatatcttattcatcttcacagattacggttaacc 11185719  T
Q  230 tcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||  |||||||||||||    
T  11185720 tcactattaagtcttaat 11185737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668491
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  124 caacatc 130  Q
    |||||||    
T  19668485 caacatc 19668491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 33 - 89
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443124
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagtatataaaa 33443124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Original strand, 18907134 - 18907255
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  18907134 gactcatgcagcttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 18907232  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  18907233 tcaataatatttcaagtaatgca 18907255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Original strand, 21766718 - 21766839
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||| ||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  21766718 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagatcacaacaacaacataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 21766816  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  21766817 tcaataatatttcaagtaatgca 21766839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 19873120 - 19873205
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19873120 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 19873205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 22432249 - 22432334
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22432249 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22432334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 22438799 - 22438884
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  22438799 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaattaacaatagcagcataggcagtttacaacaacagtatgacat 22438884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 4185930 - 4185870
Alignment:
Q  24 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtat 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  4185930 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaacataggcagtat 4185870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22080846 - 22080799
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 59  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080846 acatcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 19862978 - 19863063
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| ||  ||||| ||||| |||||||    
T  19862978 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggaagattacaacaacagtatgacat 19863063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 23076749 - 23076898
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| | |||| | | |  || ||||||||||||| ||  | |||||||||    
T  23076749 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaacatatccagatataataatatcaagtgataatcaacaaca 23076848  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
     |||||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  23076849 acttaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacat 23076898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 24 - 83
Target Start/End: Original strand, 4186379 - 4186439
Alignment:
Q  24 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtat 83  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  4186379 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacaggcagcaacatagacagtat 4186439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Original strand, 35008167 - 35008219
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  35008167 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagta 35008219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25642304 - 25642125
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag-----catgacataataatatc 110  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||| |||  ||||| |||||     ||| ||||||  |||||    
T  25642304 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaactaggttaaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagtatgacatcacataacgatatc 25642205  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||   ||  ||||||||||||||  ||||| | ||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  25642204 aat--aaaaacaacaacatcttaatcattcattcataattcaagtaatgcaattaatcattatatcacatcatattcaacat 25642125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 80
Target Start/End: Original strand, 16493169 - 16493214
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  16493169 gaccgactcatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 16493214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 18453201 - 18453250
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  18453201 cttagaccgacttatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggcag 18453250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 31155514 - 31155465
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  31155514 catcatcatcatcaacttggattgactcatgcaacttagttaaataacaa 31155465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 4738666 - 4738626
Alignment:
Q  24 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 64  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4738666 tcatcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaaca 4738626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 120 - 179
Target Start/End: Original strand, 18180596 - 18180656
Alignment:
Q  120 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    |||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  18180596 tcaacaacatcttaatcattcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 18180656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 9 - 53
Target Start/End: Original strand, 19008799 - 19008843
Alignment:
Q  9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctta 53  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  19008799 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccaactcatgcagctta 19008843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 19790873 - 19790837
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  19790873 gactcatgcaacttagttaaataacaacagcagcata 19790837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 22886 - 23113
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22886 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacac-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 22984  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  22985 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcgtaatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 23084  T
Q  215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23085 agattataaataacatcatcattaagtct 23113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 181; Significance: 8e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 8e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8650 - 8424
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8650 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatca 8555  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  8554 attgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 8455  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8454 cacagattataattaacatcctcattaagtc 8424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 6245 - 6000
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca---taggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6245 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataata 6146  T
Q  109 tcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaa 208  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||     
T  6145 tcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacag 6046  T
Q  209 cttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6045 cttcacattttataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 6000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 59)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 50210333 - 50210103
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50210333 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 50210234  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
     |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  50210233 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 50210134  T
Q  213 acagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210133 acagattataattaacatcatcattaagtct 50210103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27250850 - 27250611
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250850 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 27250751  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  27250750 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 27250651  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||    
T  27250650 cacagattataattaacctcttcattaagtatcaatgcta 27250611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 5e-93
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 34509783 - 34510011
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  34509783 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaat 34509882  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||     
T  34509883 gcaagtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcacatcatattcaacatcaacacatcttaaacagcttcaa 34509982  T
Q  215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509983 agattataattaacatcatcattaagtct 34510011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 22532269 - 22532500
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22532269 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcc 22532368  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22532369 attgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22532468  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||||    
T  22532469 cacagttcataaataacatcatcattaagtct 22532500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21026680 - 21026919
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||    
T  21026680 acatcatcatcgtcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatca 21026779  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  21026780 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacagcaacacatcttaaacagctt 21026879  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21026880 cacagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 21026919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 20135188 - 20135420
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||     
T  20135188 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataataatatcat 20135287  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
     ||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20135288 gtgcaattcaacaacatcttaagtattcaataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatcatatcataatgaacatcaacacatcttaaacagcttc 20135387  T
Q  213 acagattataattaacatcatcattaagtctta 245  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20135388 acagattataattaacaacatcattaggtctta 20135420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22468816 - 22468604
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22468816 catcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcataatatcaa 22468717  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||  |||||||||||| ||||    
T  22468716 ttgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcacatcataat-tacatcagcacatcttaaacagcttc 22468618  T
Q  213 acagattataatta 226  Q
    ||||||||||||||    
T  22468617 acagattataatta 22468604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 89 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354458
Alignment:
Q  89 aacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaa 188  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcacatcataatcaa 22354517  T
Q  189 catcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22354516 catcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 22354458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 13988866 - 13989028
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13988866 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13988964  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13988965 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 13989028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21923453 - 21923291
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21923453 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21923355  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21923354 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21923291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 23593897 - 23593735
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23593897 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 23593799  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  23593798 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 23593735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 45575008 - 45574842
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  45575008 acatcatcatattcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatacca 45574909  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  45574908 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 45574842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 21475249 - 21475087
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21475249 tcatcatcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 21475151  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21475150 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 21475087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 31612313 - 31612475
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31612313 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 31612411  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31612412 gcaagtcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 31612475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840929
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 21840864  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21840865 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 21840929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29298137 - 29298298
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  29298137 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-acagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaat 29298234  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29298235 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29298298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 29776688 - 29776850
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |    
T  29776688 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaat 29776786  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  29776787 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 29776850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 433012 - 433172
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |    
T  433012 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaat 433108  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  433109 gcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 433172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 16275526 - 16275363
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275526 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 16275428  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  || | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  16275427 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcaca 16275363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 16361915 - 16362079
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  16361915 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaa-cagtatataaaaacaacatgacataataatatcaa 16362013  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||   ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16362014 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 16362079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22356184 - 22356053
Alignment:
Q  124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaa-catcaatacatcttaaacaacttcacagattata 222  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  22356184 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22356085  T
Q  223 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22356084 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22356053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 124 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 22357870 - 22357739
Alignment:
Q  124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaa-catcaatacatcttaaacaacttcacagattata 222  Q
    ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  22357870 caacatcataaatattcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaatcatcaacacatcttaaatagcttcacagattata 22357771  T
Q  223 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22357770 attaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 22357739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38801508 - 38801277
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||   ||||| |||||||| |||||    
T  38801508 acatcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtgcaa---cagcaagacataattatatc 38801413  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| |||||| ||| |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  38801412 aaattcaattcatcaacatattatatatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcgtaatcaacaacaacatatcttattcagct 38801314  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||| |||||| ||||  |||| |||||||||||||    
T  38801313 tcacaaattatagttaatctcattattaagtcttaat 38801277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 13213027 - 13212821
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13213027 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 13212929  T
Q  112 attgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
    | |||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||  | || |||||||||  |||| |||| ||||    
T  13212928 aatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataa-caacatcaaatcatcataaatcaac 13212830  T
Q  210 ttcacagat 218  Q
    |||||||||    
T  13212829 ttcacagat 13212821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 12 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20847275 - 20847175
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||    
T  20847275 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatca 20847176  T
Q  112 a 112  Q
    |    
T  20847175 a 20847175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 21346961 - 21347124
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21346961 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 21347059  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  21347060 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 21347124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 22123230 - 22123067
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  22123230 tcatcatcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaa-cagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaa 22123132  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||  ||| || ||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22123131 tgcaagtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22123067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 21707167 - 21707329
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21707167 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21707265  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  21707266 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21707329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 21711709 - 21711871
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  21711709 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaca-atagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaat 21711807  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  ||||  ||| ||||||| ||||  |||||||||||    
T  21711808 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcaca 21711871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 178
Target Start/End: Original strand, 21342090 - 21342259
Alignment:
Q  9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21342090 tggacttcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 21342188  T
Q  109 tcaattgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||| ||||||    
T  21342189 tcaaatgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcaca 21342259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 9 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 15860177 - 15860064
Alignment:
Q  9 tggacatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataata 108  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15860177 tggacttcatcatcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacaacatgacataataata 15860079  T
Q  109 tcaattgcaagtcaa 123  Q
    | || ||||||||||    
T  15860078 ttaaatgcaagtcaa 15860064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896195
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    || ||| |||||  |||| |||| |||||| |||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 21896195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatca 193  Q
    || ||| |||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| | || ||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 40389157 - 40389317
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40389157 tcatcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacat-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 40389255  T
Q  118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  40389256 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 40389317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21788136 - 21787981
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||   |||| ||||||||||| |  ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||    
T  21788136 gactcatgcaacttagttaaataaccatagcagcataggcagatcacaacaacagcatgacttcgtaatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcat 21788037  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  21788036 tcaataatatcttaagtaatgcacataacattatataacatcataatcaacatcaa 21787981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35260992
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| |||||   | ||||||    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaa---atcaacat 35261085  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattat 221  Q
    || ||| |||||   ||| |||||||||||||||||  |||| ||||||| |  | |||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaatcatcttataacaacttcacatattat 35260992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 33681011 - 33681189
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  33681011 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 33681109  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||||||  |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  33681110 gcaagtcgtcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat 33681189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 20454673 - 20454606
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454673 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 20454606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 22921986 - 22921864
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22921986 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22921888  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  22921887 gcaaatcaacaacatctcaaatat 22921864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 150 - 228
Target Start/End: Original strand, 48603652 - 48603730
Alignment:
Q  150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaac 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48603652 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattaac 48603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 21754052 - 21754163
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| ||||    
T  21754052 catcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgca 21754150  T
Q  118 agtcaacaacatct 131  Q
    | ||||||||||||    
T  21754151 a-tcaacaacatct 21754163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Original strand, 33797570 - 33797686
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||  || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  33797570 aacaacagcaacatatgcagcatacaaa--caacatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 33797666  T
Q  160 catataacattatatcacat 179  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  33797667 cataaaacattatatcacat 33797686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 27 - 233
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758872
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| |||  ||||| |||| |||||||| | |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  124 caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattata 222  Q
    |||||||   || |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || ||||| |||  ||| ||| |||| |||||||||| ||     
T  16758763 caacatc-acaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacaacaaatcatattataacagcttcacagatcatc 16758861  T
Q  223 attaacatcat 233  Q
    ||||| |||||    
T  16758862 attaatatcat 16758872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50614219 - 50614055
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  50614219 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50614121  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    |||| ||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||    
T  50614120 atctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaa 50614055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 50622047 - 50621883
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  50622047 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 50621949  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    |||| ||| | ||  ||||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || |||||||||||    
T  50621948 atctcaaaca-tcttttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaatatcaacatcaa 50621883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 21714546 - 21714631
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  21714546 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 21714631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 14295672 - 14295557
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  14295672 acatcatcatcttcaacattttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 14295574  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  14295573 gaatgtaaatcaacaac 14295557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 22237631 - 22237809
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  22237631 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 22237729  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| || | | || ||||||||||    
T  22237730 gcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataactttagaaacaacatcaat 22237809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 127
Target Start/End: Original strand, 20248283 - 20248394
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  20248283 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 20248381  T
Q  115 gcaagtcaacaac 127  Q
    |||| ||||||||    
T  20248382 gcaaatcaacaac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 127
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918719
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | || || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049990
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    ||| ||    |||  |||| |||||||||||||||||  | ||||||||||    
T  41050038 tctcaa--catcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacat 41049990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928014
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagacagtatgcaaa 52928014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368287
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| ||| |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  129 tct 131  Q
    |||    
T  16368289 tct 16368287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 18182214 - 18182093
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||||||| || | ||||||||||||  |  ||||||||||||| |  ||    
T  18182214 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacagcataacttcataatatcaatt-tatttcaacaacatcttgatcat 18182116  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  18182115 tcaataatatttcaagtaatgca 18182093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 42865330 - 42865245
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||| ||||| |||||||    
T  42865330 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaaataacaatagcaacatatgcagattgcaacaacagtatgacat 42865245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21533974 - 21533923
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||    
T  21533974 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacaacaacaacatacgcagta 21533923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 73
Target Start/End: Original strand, 21161720 - 21161778
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||    
T  21161720 catcatcatcatcaacttggatcgactcatgcaacttagttaaacaacaaacagcaaca 21161778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 24783212 - 24783150
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||||| |||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    
T  24783212 catcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcata 24783150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 28 - 80
Target Start/End: Original strand, 20958124 - 20958176
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  20958124 caacttagaccgactcatccagtttaattaatatacaacagcaacataggcag 20958176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 176; Significance: 8e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 3271 - 3041
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  3271 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 3173  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  3172 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 3073  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3072 cacaggttataattaacatcatcattaagtct 3041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 25896 - 26134
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  25896 acatcattatcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 25994  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  25995 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 26094  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  26095 cacagattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 26134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 5e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 39858 - 40096
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  39858 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatca 39956  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  39957 aatgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagctt 40056  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40057 cacaaattataattaacatcctcattaagtctcaatgcta 40096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 8479 - 8710
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8479 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatca 8578  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||    |||||| |||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  8579 attgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgcacataacatta----acatcataatcaacatcaacacatcctaaacagctt 8674  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8675 cacagattgtaattaacatcatcattaagtcttaat 8710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Original strand, 39479 - 39707
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  39479 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 39577  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttca 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  39578 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 39677  T
Q  214 cagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39678 tagattataattaacatcattattaagtct 39707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 14 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 75333 - 75105
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  75333 atcatcgtcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaa 75235  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttca 213  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  75234 tgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttca 75135  T
Q  214 cagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  75134 tagattataattaacatcattattaagtct 75105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 931
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1169 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatca 1070  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||| |||    
T  1069 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaaccaaaacacatcttaaacagctt 971  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    || |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  970 caaagattataattaacctcttcattaagtcttaatgcta 931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 4508 - 4738
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4508 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 4606  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  4607 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 4706  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4707 cacagattataattaacatcatcattaagtct 4738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 12090 - 12320
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12090 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 12188  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  12189 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 12288  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12289 cacagattataattaacatcatcattaagtct 12320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 22042 - 22272
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22042 acataatcattttcatcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatca 22140  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22141 aatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagctt 22240  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22241 cacagattataattaacatcatcattaagtct 22272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 16721 - 16490
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16721 acatcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatca 16622  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | || ||||||||| ||||| || ||| || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  16621 aatggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcacatcaaaatcaacatcaacacatcttaaacagctt 16522  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16521 cacagactataattaacatcatcattaagtct 16490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 12 - 243
Target Start/End: Original strand, 39913 - 40143
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  39913 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatca 40011  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| | |||    
T  40012 aatgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcataaagagctt 40111  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40112 cacagattataattaacatcatcattaagtct 40143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19885
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  19888 atct 19885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 18749 - 18597
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| ||||| || || | |||||||||||| |   ||||||||||||| |  ||    
T  18749 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagaataacttcataatatcaatt-cgtttcaacaacatcttgatcat 18651  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  18650 tcaataatatttcaagtaatggaattaatcattaaatcacattataatcaacat 18597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 30 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24180
Alignment:
Q  30 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca-aaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaa 227  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcacatcataattcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaa 24207  T
Q  228 catcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  24206 catcctcaataagtcttaatactatcc 24180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 17337 - 17105
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaa--cagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  17337 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataatatc 17238  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  17237 aaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacgtcttaaacagct 17138  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17137 ttacagattataattaacatcatgattaagtct 17105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79284
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac-gacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtc 79332  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||    
T  79331 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcaca 79284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 161; Significance: 7e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 7e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 25955
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagat 218  Q
     |||||||| ||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcatagat 25980  T
Q  219 tataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25979 tataattaacatcatcattaagtct 25955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 44825 - 44682
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44825 tcatcatcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 44726  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  44725 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 149 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 33479 - 33385
Alignment:
Q  149 ttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  33479 ttcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacgcatcttaaacagcttcataggttataattaacatcatcattaagtct 33385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 4849 - 5088
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4849 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatca 4948  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    | ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  4949 aatgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagctt 5048  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
    |||||||||||  ||||  | ||||||||||||| |||||    
T  5049 cacagattatagctaaccccttcattaagtcttattgcta 5088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 64 - 242
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13322
Alignment:
Q  64 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcata 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  164 taacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtc 242  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaacacatcttaaacagtttcacagattataattaacatcttcattaagtc 13322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 87
Target Start/End: Original strand, 34123 - 34199
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaa 87  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  34123 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatacaa 34199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 68
Target Start/End: Original strand, 273 - 329
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 68  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  273 acatcattatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 3103
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3306 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 3207  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttc 212  Q
     || || |||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  3206 atgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttc 3107  T
Q  213 acag 216  Q
    ||||    
T  3106 acag 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 20910 - 21146
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  20910 acatcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatc 21009  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| | | || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||    
T  21010 aattgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcagcatcaacacatcttaaacagct 21109  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21110 tcacaggttataattaacatcttcattaagtcttaat 21146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 141; Significance: 6e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 6e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 340065 - 339840
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |    
T  340065 tcatcatcttcgtcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-caacaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaat 339968  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcac 214  Q
     |||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  339967 -caagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcac 339869  T
Q  215 agattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  339868 agattataattaacgtcatcattaagtct 339840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 158612 - 158450
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  158612 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 158514  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  158513 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 158450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Original strand, 71350 - 71466
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaatta-tacttcaagtaatg 159  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||| || | ||| | ||||||    
T  71350 aacaacagcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataatattatcaatttcaattcaacaacatcttgagtattcaaataattctt-aggtaatg 71446  T
Q  160 catataacattatatcacat 179  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  71447 cataaaacattatatcacat 71466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 138; Significance: 4e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33077 - 32898
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33077 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 32979  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatca 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  32978 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatca 32898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 12 - 193
Target Start/End: Original strand, 45928 - 46107
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45928 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatca 46026  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatca 193  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  46027 attgcaattcaacaacatcttaaatattc-attatacttcgagtaatgcatataacattataacacatcatgatcaacatca 46107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16323
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||    
T  16113 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatca 16212  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaact 210  Q
    | |||||| ||||| ||||| || ||| || | |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  16213 aatgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcacgtcatgatcaacatca--acatcttaaaacagct 16310  T
Q  211 tcacagattataa 223  Q
    |||||||||||||    
T  16311 tcacagattataa 16323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17450 - 17389
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17450 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaaca 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 136; Significance: 6e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 4712 - 4946
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  4712 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatca 4811  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||    
T  4812 attgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatcacatcataatcaacaacaacatatcttatacaactt 4910  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  4911 cacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 4946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 77 - 247
Target Start/End: Original strand, 1 - 170
Alignment:
Q  77 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatca 176  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||| ||||||  ||| ||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1 gcagtatacaaaaacagcatgacataaatacatcaattgcaattcatcaaaatcttatgtatacaaatattcttcaagtaaggcata-aacattatatca 99  T
Q  177 catcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||| |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  100 catcataatcaacaacaacatatcttatacaacttcacagattatacttaacctcattgttaagtcttaat 170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 32067 - 32299
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  32067 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatca 32164  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||| ||| |||    
T  32165 atttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 32263  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  32264 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 32299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 1952 - 2187
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  1952 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatca 2051  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||| || ||| |||    
T  2052 attgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacattatatctcatcataatcaacaacaacatatcatatacagctt 2151  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
     ||| ||||| | |||| | ||||||||||||||||    
T  2152 tacatattattaataaccttatcattaagtcttaat 2187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 13497 - 13730
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  13497 acatcatcaacttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatca 13595  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||| | | ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | | | |||||| ||| |||    
T  13596 atttcgattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattatatcacatcataatcaacaacgacatatcttatacagctt 13694  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  13695 cacagattataattaacctcattgttaagtcttaat 13730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 124; Significance: 9e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15584 - 15351
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  15584 acatcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatca 15486  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaactt 211  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||  |||  || ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || ||| | |||||| ||| |||    
T  15485 atttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcata-aatattatatcacatcataatcatcaacaacatatcttatacagctt 15387  T
Q  212 cacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  15386 cacagattataattaaccttattattaagtcttaat 15351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 7295 - 7449
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| ||| |    
T  7295 catcatcttaatcatcttaaatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattata-caaat 7391  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattata 173  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  7392 tcaattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattata 7449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10544 - 10312
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10544 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatc 10448  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| || | | | |||||| ||| ||    
T  10447 aatttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcacatcataatcatcaacgacatatcttatacagct 10349  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||||||||||    
T  10348 tcacagattataattaaccttattattaagtcttaat 10312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 12 - 142
Target Start/End: Original strand, 28414 - 28544
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28414 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 28513  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaa 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28514 attgcaattcaacaacatcttatatattcaa 28544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 11292 - 11407
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  11292 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 11390  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  11391 gaatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Original strand, 1997 - 2112
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1997 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacacaaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 2095  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  2096 gaatgtaaatcaacaac 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 12 - 65
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4605
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124827
Alignment:
Q  102 aataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatct 201  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaacacatct 124774  T
Q  202 taaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctatcc 254  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  124775 taaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaatgctatcc 124827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 174767 - 174943
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| || ||||||    
T  174767 catcatcaacttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatca 174863  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat-aacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
    | | ||| |||||||||||| ||  ||||| | ||| |||||||||||||  | ||||||||||||| ||| | ||||||    
T  174864 aattcaattcaacaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgcaactaaacattatatcacgtcatattcaaca 174943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Original strand, 121766 - 121835
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagt 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  121766 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagt 121835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 136471 - 136370
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  136471 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 136373  T
Q  128 atc 130  Q
    |||    
T  136372 atc 136370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 145179 - 145078
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||| |||||||||||| || |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  145179 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcgacataggcagtacac-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 145081  T
Q  128 atc 130  Q
    |||    
T  145080 atc 145078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 93 - 243
Target Start/End: Original strand, 27911 - 28061
Alignment:
Q  93 gcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatc 192  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatc 28010  T
Q  193 aatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    || | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28011 aacaaatcttaaacaacttcacaggttataattaacatcatcattaagtct 28061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 48
Target Start/End: Original strand, 27878 - 27913
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgca 48  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27878 catcatcatcttcataaacttagaccgactcatgca 27913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 109; Significance: 8e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 75 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3588 - 3424
Alignment:
Q  75 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatat 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| || | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3588 aggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatat 3489  T
Q  175 cacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataattaacatcatcatta 238  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3488 cacatcataatcaacatcaacacatcttaaaacagcttcatagattataattaacatcatcatta 3424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 20747 - 20909
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20747 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 20845  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20846 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 37821 - 37983
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  37821 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 37919  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  37920 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 37983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 94411 - 94573
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  94411 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 94509  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  94510 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 94573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 17598 - 17440
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17598 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 17500  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17499 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 17440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 175
Target Start/End: Original strand, 44454 - 44614
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  44454 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 44552  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatc 175  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  44553 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 139
Target Start/End: Original strand, 100378 - 100501
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| | |    
T  100378 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaat 100476  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatatt 139  Q
    |||| |||||||||||| |||||||    
T  100477 gcaaatcaacaacatctcaaatatt 100501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Original strand, 119875 - 119947
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  119875 acatcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat 119947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38596 - 38421
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||   |||| |||| |||||| |  |||||||||||     
T  38596 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcatagacagatcacaacaacaacatgacttcttaatatcaattt 38497  T
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  38496 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacat 38421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 40291 - 40169
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  40291 catcatcatcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 40193  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  40192 gcaaatcaacaacatctcaaatat 40169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 101503 - 101576
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  101503 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 101576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 104 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 23695 - 23608
Alignment:
Q  104 taatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  23695 taatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatgcacataacgttatatcacatcatattcaacat 23608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 4694 - 4856
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  4694 tcatcatcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 4792  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4793 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 13392 - 13554
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13392 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 13490  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  13491 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcaca 13554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 13947 - 14109
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13947 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 14045  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14046 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 14109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 136680 - 136842
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  136680 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 136778  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  136779 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 136842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 139149 - 139311
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  139149 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 139247  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  139248 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 139311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 144087 - 144249
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  144087 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 144185  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  144186 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 144249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 134211 - 134373
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  134211 tcatcatcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 134309  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  134310 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 141618 - 141780
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  141618 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaat 141716  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  141717 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 141780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 138
Target Start/End: Original strand, 62200 - 62321
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| |    
T  62200 atcatcatcatcttcgacttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcga 62298  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
     ||||   ||||||||||| ||||||    
T  62299 atgca---caacaacatctcaaatat 62321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 98
Target Start/End: Original strand, 132662 - 132745
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 98  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||| ||||| || |||||    
T  132662 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatga 132745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 16282 - 16514
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||    
T  16282 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatc 16378  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| |||||| |||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  16379 aaattcaattcatcaacatattatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatatcttattcagct 16477  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  16478 tcacagattatagttaacctcattattaagtcttaat 16514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 10772 - 10935
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaa 10870  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  10871 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 10935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 33 - 243
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4754
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatctt 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| | ||||| || || |||||||||| |  || |||||||||||||    
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  133 aaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctt-aaacaacttcacagattataattaacatc 231  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcataatacattatatcacatcatgatcaacatca--acatcttaaaacagcctcacaaattataattaacatc 4742  T
Q  232 atcattaagtct 243  Q
     ||| |||||||    
T  4743 ttcaataagtct 4754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 16784 - 16946
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  16784 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 16882  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || |||| |  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16883 gcaagtcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 16946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 82072 - 82234
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  82072 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 82170  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  82171 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 82234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22608
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaata 196  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| | || |||||||||||    
T  22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaata 22608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 179
Target Start/End: Original strand, 128751 - 128917
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |   |  | | ||||||||||||||||||||||||||    
T  128751 acatcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaa-aaaaacagcatgacataataatatca 128849  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  128850 aatgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcacat 128917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 31 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20379
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatc 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacat-cagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 20427  T
Q  131 ttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20426 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 20379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 65915 - 65830
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||  ||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  65915 catcatcttgatcatcttttacctactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 65830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 178
Target Start/End: Original strand, 501088 - 501246
Alignment:
Q  19 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa 118  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  501088 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-caatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaa 501186  T
Q  119 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  501187 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 501246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 85742 - 85579
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  85742 tcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 85644  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  85643 gcaagtcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 85579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 160688 - 160809
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  160688 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 160786  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||| | ||||||    
T  160787 gcaa-tcaacaacatgtcaaatat 160809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 11286 - 11450
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11286 catcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 11384  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  11385 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcaca 11450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Original strand, 4300 - 4459
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4300 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagt-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgca 4398  T
Q  118 agtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    | |||||||| ||| || || |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4399 aatcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 4459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 6402 - 6281
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||| |||| ||| || | |||||||||||| ||  |||||||| |||| |  ||    
T  6402 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataatcagatcacaacaacatcataacttcataatatcaatt-catttcaacaacttcttgatcat 6304  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgca 161  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  6303 tcaataatatttcaagtaatgca 6281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 40400 - 40562
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  40400 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaat 40498  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  || | |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  40499 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 40562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1170 - 938
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1170 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatc 1074  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| ||| | || ||| ||| ||    
T  1073 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataacacatcataatcaacaacaacatattttatacagct 975  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||    
T  974 tcacagattatagttaacctcattcttaagacttaat 938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 12413 - 12249
Alignment:
Q  13 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12413 catcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagaatacaaaaacagcatgacaaaataatatcaa 12315  T
Q  113 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  | || |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12314 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcaca 12249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 178
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9404
Alignment:
Q  14 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 9339  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  9340 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcaca 9404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 106 - 268
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  106 tcatcatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaat-agtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 204  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  205 gcaaatcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 1289 - 1521
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||| ||||||||||| |||||    
T  1289 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatc 1385  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  1386 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 1484  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  1485 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 1521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 7266 - 7498
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||   |||| ||||| ||||| |||||    
T  7266 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatc 7362  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| | ||||||  || ||    
T  7363 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgcata-aacattataacacttcataatcaacaacaacatatcttattcagct 7461  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||| |||||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  7462 tcatagattatagttaacctcattcttaagtcttaat 7498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15356 - 15291
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15356 tcatcatcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcag 15291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 12 - 222
Target Start/End: Original strand, 46995 - 47202
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||   | ||||||||||||||||||||    
T  46995 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac---agcagcatgacataataatatc 47091  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || ||| | |||||| ||| ||    
T  47092 aatttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattctccaagtaatgcata-aacattatatcacatcataaacatcaacaacatatcttatacagct 47190  T
Q  211 tcacagattata 222  Q
    ||||||||||||    
T  47191 tcacagattata 47202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 1021 - 853
Alignment:
Q  71 acataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacatt 170  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1021 acataggcagtatacaa---cagcatggcataataatatcaat-gcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacatt 926  T
Q  171 atatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    ||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||| || |||| || ||||| ||||||||||    
T  925 atatcacatcgtaatcgacatcaacacatcttaaacagcttcacatatcataaatagcatcaccattaagtct 853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 4954 - 4888
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggc 78  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4954 acatcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacataggc 4888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 178
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30094
Alignment:
Q  29 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||     
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaa-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacg 30044  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||| || ||||||  |||| ||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  30045 tctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcaca 30094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 4214 - 4377
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  4214 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacaca-gcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaat 4312  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  4313 gcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 4377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8651
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatat--aacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||||| |||||||||  |||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||| | || ||||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaat 8651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 138
Target Start/End: Original strand, 6535 - 6661
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6535 acatcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6633  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
     | ||||| |||||||||||| ||||||    
T  6634 gaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 6661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Original strand, 12064 - 12220
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  12064 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacag-cagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaat 12156  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12157 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 12220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 247
Target Start/End: Original strand, 6669 - 6845
Alignment:
Q  71 acataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacatt 170  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||| ||    
T  6669 acataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcataaaacgtt 6768  T
Q  171 atatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | ||| || ||| ||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||||    
T  6769 atatcacatcataatcaacaacaacatatcatatacagctttacagattataaataaccttatcattaaatcttaat 6845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 116430 - 116571
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |    
T  116430 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaat 116527  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaat 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||    
T  116528 gcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128971
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaaca 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |||| |   ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  129 tct 131  Q
    |||    
T  128973 tct 128971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 78328 - 78442
Alignment:
Q  19 catcttcat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| |||||||| |    
T  78328 catcttcattcatcttggaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-t 78425  T
Q  115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||| ||||||||||||    
T  78426 gcaaatcaacaacatct 78442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 11564 - 11442
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 111  Q
    ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11564 acatcttcatcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatca 11465  T
Q  112 attgcaagtcaacaacatcttaa 134  Q
    ||| ||| ||| |||||| ||||    
T  11464 atttcaattcatcaacatgttaa 11442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11399
Alignment:
Q  196 acatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11450 acatgttaatcagcttcacagattataattaacctcatcattaagtcttaat 11399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 12 - 247
Target Start/End: Original strand, 51582 - 51814
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| ||| |    
T  51582 acatcatcattttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataac 51678  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaact 210  Q
    || | ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||| ||| | ||||||  || ||    
T  51679 aaattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatatccttcaagaaatgcata-aacattataacacttcatattcaacaacaacatatcttattcagct 51777  T
Q  211 tcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||| ||||| |||   ||||||||||||    
T  51778 tcacagattatagttaacctcactcttaagtcttaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 161252 - 161089
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  161252 tcatcatcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacaca-gcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaat 161154  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  161153 gcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 161089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164590
Alignment:
Q  95 atgacataataatatcaattgcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 164590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 18 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1280
Alignment:
Q  18 tcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgca 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1440 tcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatg-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 1342  T
Q  118 agtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||| || | ||| || ||||||  |||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  1341 agtcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 9080 - 8995
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||||||||| || |||| |||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  9080 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataataatagcagcataggcagattacaacaacattatgacat 8995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51766
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaa-ca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagc-acataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatcaa-tgcaagccaacaatca 51888  T
Q  129 tcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatca-aaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaa 227  Q
    ||| || |||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||  || | |||| ||||||| ||| |||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtat-acattatatcacatcataaatcaacattaatatctcat-aacagcttcacaaattgtaattaa 51790  T
Q  228 catcatcattaagtcttaatgcta 251  Q
     |||||  | ||||||||||||||    
T  51789 tatcatattcaagtcttaatgcta 51766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 131
Target Start/End: Original strand, 32538 - 32654
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||    
T  32538 acatcatcatctt--tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatc 32634  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    || ||||| ||||||||||||    
T  32635 aaatgcaa-tcaacaacatct 32654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 218
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13336
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  130 cttaaa-tattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagat 218  Q
    || |||  |||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 13336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16014
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagat 218  Q
    |||||| ||| ||||   |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 16014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Original strand, 2680 - 2732
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagta 82  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||    
T  2680 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaagcaacaacataggcagta 2732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 12 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17932
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||| ||| || || || ||||| |||||||||||    
T  18148 acatcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatc 18050  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaa-caac 209  Q
     |  |||||| |||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  |||| |||| || |    
T  18049 gaacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaatcatcataaatcagc 17950  T
Q  210 ttcacagattataattaa 227  Q
    ||||||||| || |||||    
T  17949 ttcacagatcatcattaa 17932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 2291 - 2128
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  2291 tcatcattttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacaca-acagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaat 2193  T
Q  115 gcaagtcaa-caacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    |||||||||  ||| ||| || ||||||   ||| ||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  2192 gcaagtcaattaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcaca 2128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27663
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| || || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagat 218  Q
    |||||| ||| |||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||  ||||||| |||| ||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaatcatcttataacagcttcacagat 27663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 247
Target Start/End: Original strand, 3640 - 3716
Alignment:
Q  171 atatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  3640 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 3716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 171 - 247
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7780
Alignment:
Q  171 atatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  7704 atatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacagcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 7780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Original strand, 29558 - 29734
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  29558 catcatcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattg 29657  T
Q  116 caa-gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||  ||||||| |  ||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| | ||||||    
T  29658 caatttcaacaagactttaaatattcaataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcacgtcaacaacaacat 29734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53488
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 53488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 15 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 38820 - 38657
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||     
T  38820 tcatcatcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaa 38722  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 178  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||| |  |||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  38721 tgcaagtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcaca 38657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5246 - 5017
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||   |||| ||||||||||| |||||||     
T  5246 tcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggtattatac---aacatcatgacataattatatcaaa 5150  T
Q  114 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttca 213  Q
    | ||| ||| ||||||||||  ||| |||  || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||  |||||||| ||| | || |||  ||  ||||    
T  5149 ttcaattcatcaacatcttatgtatacaaacattcttcaagtaatgtata-aacattataacacatcttaatcaacaacaacatattttattcagtttca 5051  T
Q  214 cagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    || |||||||||||| | || ||||| |||||||    
T  5050 catattataattaaccttattattaaatcttaat 5017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11646
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  11464 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 11562  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  11563 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 12 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38377 - 38195
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    |||||| |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  38377 acatcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatc 38279  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
        | |||| |||||||||| ||||| |||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  38278 gcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 38195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Original strand, 19268 - 19390
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  19268 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 19366  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  19367 gcaaatcaacaacatctcaaatat 19390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 150 - 247
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1149
Alignment:
Q  150 tcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||||||||||    
T  1052 tcaagtaatgcataaaacattatatcacatcataatcaacaacaacacatcttaaacatcttcacagattataattagcctcttcattaagtcttaat 1149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2923 - 2801
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||| |    
T  2923 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 2825  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  2824 gcaaatcaacaacatctcaaatat 2801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60614
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| |||| ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaat-gcaaatcaacaac 60721  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaatacatctta-aacaacttcacagattataatta 226  Q
    |||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |  | |||||||||  ||| ||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  60720 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaatcattttataacagcttcacagattatcatta 60621  T
Q  227 acatcat 233  Q
    | |||||    
T  60620 atatcat 60614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 24 - 179
Target Start/End: Original strand, 129917 - 130071
Alignment:
Q  24 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |||||||||    
T  129917 tcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 130015  T
Q  123 acaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
     |||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| ||||    
T  130016 tcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacat 130071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 666 - 714
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  666 cttagaccgacacatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggca 714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 16 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 14814 - 14692
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||| ||| ||||||| | |    
T  14814 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaat 14716  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  14715 gcaaatcaacaacatctcaaatat 14692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10480
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  126 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| |||| | || ||||||||||    
T  10548 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaat 10480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7998
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacataggcagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||  ||||  |||| ||||||||||||| || || ||||||||||    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaat-cagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    |||||| |||||  |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | || |||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaa 7998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 127
Target Start/End: Original strand, 15664 - 15776
Alignment:
Q  15 tcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaat 113  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |     
T  15664 tcatcatcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaa 15762  T
Q  114 tgcaagtcaacaac 127  Q
    || || ||||||||    
T  15763 tgtaaatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 1339 - 1424
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||  ||||| ||||  |||||||    
T  1339 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttgtttaagtaacaatagcaacataggcagattacaacaacattatgacat 1424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12749
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  130 cttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    || ||||| | |  |||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||| | || |||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6121
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  6244 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 6146  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | |||||||||  |||||| ||||    
T  6145 gaatgcaagtcattaacatcataaa 6121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 61 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 15486 - 15370
Alignment:
Q  61 aacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattc-aattatacttcaagtaatg 159  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||| || ||| ||||||||    
T  15486 aacaacatcaacataggcagcatacaaa--cagcatgacataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaataattctt-aagtaatg 15390  T
Q  160 catataacattatatcacat 179  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  15389 cataaaacattatatcacat 15370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 36199 - 36248
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||    
T  36199 cttagaccgactcatgcagcttaattaatatacaacaacaacataggcag 36248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Original strand, 29117 - 29272
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaa-gtcaacaacatcttaa--a 135  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | |||||| ||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||  |    
T  29117 gactcatgcatcttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaattttaacaacaccttaaata 29216  T
Q  136 tattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||||||| | |||||||||||| || | |||||||||||||||||| | ||||||    
T  29217 tattcaataaaacttcaagtaatacacacaacattatatcacatcaacaacaacat 29272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 24 - 138
Target Start/End: Original strand, 5655 - 5769
Alignment:
Q  24 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtca 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| |||| |||||| | ||||| |||    
T  5655 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatca 5753  T
Q  123 acaacatcttaaatat 138  Q
    ||||||||| ||||||    
T  5754 acaacatctcaaatat 5769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Original strand, 6611 - 6688
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  6611 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 6688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Original strand, 13991 - 14068
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  13991 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 14068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15821
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  15898 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 15821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 79
Target Start/End: Original strand, 178898 - 178961
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  178898 catcatcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcagcataggca 178961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 138
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1158
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||| | | | ||| ||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatacgaatcatcaacat 1149  T
Q  130 cttaaatat 138  Q
    || ||||||    
T  1150 ctcaaatat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 16 - 195
Target Start/End: Original strand, 133 - 311
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  133 catcatcatcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 231  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaat 195  Q
    |||| |||||||||||| ||||| ||||  ||| |||| |||||| |||||  ||||||| | || | || ||||||||||    
T  232 gcaaatcaacaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataatattataaacaacatcaat 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 12 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 1190 - 1075
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  1190 acatcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 1092  T
Q  111 aattgcaagtcaacaac 127  Q
     | || || ||||||||    
T  1091 gaatgtaaatcaacaac 1075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 4320 - 4284
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4320 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 4284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 23843 - 23928
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  23843 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaccataggcagattacaacaacagtatgacat 23928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 16442 - 16291
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||| |||| |||| |||||| | ||||||||||||  |  |||||||||||||||  |    
T  16442 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggca-tatcacaacaacatcatgacttcataatatcaatta-atttcaacaacatcttaatca 16345  T
Q  138 ttcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    |||||| |||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||    
T  16344 ttcaataatatcttaagtaatgcacataacattatatcacatcatattcaacat 16291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 1083
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  1155 acatcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtat 1083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 12 - 135
Target Start/End: Original strand, 12766 - 12889
Alignment:
Q  12 acatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||| || ||||| |||| ||||||    
T  12766 acatcatcataatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatgatataacaatatc 12864  T
Q  111 aattgcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
     | ||||||||| ||||||| ||||    
T  12865 gaatgcaagtcatcaacatcataaa 12889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 2762 - 2694
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtat 83  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2762 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacatcaacataggcagtat 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 135
Target Start/End: Original strand, 12943 - 13062
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| | |    
T  12943 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaat 13041  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaa 135  Q
    |||||||| ||||||| ||||    
T  13042 gcaagtcatcaacatcataaa 13062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 45909 - 45794
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | |    
T  45909 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 45811  T
Q  115 gcaagtcaacaacatct 131  Q
    | |||||| ||||||||    
T  45810 gtaagtcatcaacatct 45794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 28887 - 28813
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca--acagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  28887 catcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacattacagcaacataggcagtatgcaaa 28813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 4921 - 4746
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattg 115  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||||   |||| |||||| |||| | ||||||||||||     
T  4921 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttagttaaataataatagcagcataggcagatcacaacaacagcttgacttcataatatcaattt 4822  T
Q  116 caagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacat 191  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | |||||||  | ||||| ||||||||||||| | |||||||    
T  4821 catttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaagtaatatacataacgttatatcacatcatattcaacat 4746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 243
Target Start/End: Original strand, 10323 - 10394
Alignment:
Q  172 tatcacatcaaaatcaacatcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtct 243  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10323 tatcacatcataatcaacatcaacacatcttaaacagcttcacagattattattaacatcattattaagtct 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Original strand, 1086 - 1159
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  1086 catcttcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaa 1159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 16 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 24000 - 23927
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  24000 catcatcatcttcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 23927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 69 - 194
Target Start/End: Original strand, 225465 - 225588
Alignment:
Q  69 caacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataaca 168  Q
    |||||||| |||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||  |||| |||||||||||||||||  |    
T  225465 caacatagtcagtatgcaaaa-cagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaa 225562  T
Q  169 ttatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    ||||||||||| | || |||||||||    
T  225563 ttatatcacattataaacaacatcaa 225588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6222
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||    
T  6386 cttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 6288  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||| || | |||||||||    
T  6287 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaa 6222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8075
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||| |||||||| | ||| ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatacaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  124 caacatc 130  Q
    |||||||    
T  8081 caacatc 8075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 39 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 193070 - 192920
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaata 137  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| || |||| |||| |||||||||| ||||||| ||  || || ||||||||| || ||    
T  193070 gactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatcatttataattc-acaacatctcaatta 192972  T
Q  138 ttcaattatacttcaagtaatgca-tataacattatatcacatcaaaatcaa 188  Q
    |||||| | ||||||||| ||| | || |||||||||||||| || ||||||    
T  192971 ttcaataaaacttcaagtgatgtattacaacattatatcacaccataatcaa 192920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 24 - 88
Target Start/End: Original strand, 6824 - 6889
Alignment:
Q  24 tcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaa 88  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6824 tcatcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaa 6889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 87 - 131
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8134
Alignment:
Q  87 aaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatct 8134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10646
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| | ||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  126 acatct 131  Q
    ||||||    
T  10641 acatct 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17929 - 17873
Alignment:
Q  191 tcaatacatcttaaacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaat 247  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17929 tcaacacatcttaaacagcttcacagattataattaacatcctcattaagtcttaat 17873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Original strand, 26828 - 26999
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    |||||| || |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| |||||||||    
T  26828 catcattttaatcatcttatatcgactcatgcatcttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattatatcaatt 26925  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||    
T  26926 -caattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcataatcaaca 26999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38499
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  132 taaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacat-tatatcacatcaaaatcaacatcaa 194  Q
     ||| | |||  |||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||    
T  38438 caaaca-tcatatataattcatgtaatgcatat-acatatatatcacattaatctcaacatcaa 38499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 19980 - 20065
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| || | |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  19980 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcagcttgattaaataacaatagtagcataggcagattacaacaacagtatgacat 20065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 131
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25226
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||||| ||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatcaa-tgcaaatcaa 25218  T
Q  124 caacatct 131  Q
    ||||||||    
T  25219 caacatct 25226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 173
Target Start/End: Original strand, 1881 - 2035
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  1881 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttgaataacaatagcaacataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 1978  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattata 173  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1979 -caattcatcaacatcttatgtatacaattattcttcaagtaatgcata-aacattata 2035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 110
Target Start/End: Original strand, 32102 - 32197
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 110  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||| | ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||    
T  32102 catcatcatcatcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatc 32197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 16 - 79
Target Start/End: Original strand, 36454 - 36517
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||    
T  36454 catcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagtagcataggca 36517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12024
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 1853 - 1993
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  1853 gactcatgcaacttagttaaataacaatggcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 1951  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  1952 tcaataatatttcaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 1993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 69794 - 69879
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||    
T  69794 catcatcttgatcatcttataccgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacagtatgacat 69879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 252
Target Start/End: Original strand, 20595 - 20643
Alignment:
Q  204 aacaacttcacagattataattaacatcatcattaagtcttaatgctat 252  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20595 aacagcttcacagattatagttaacatcatcattaagtcttaatgctat 20643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21920 - 21749
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  21920 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 21823  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||    
T  21822 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca 21749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 16 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29812 - 29641
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaac-agcatgacataataatatcaatt 114  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||  ||||| ||| | ||||  ||||| ||| |||||    
T  29812 catcatcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcagattacaacaacaatcatg--ataattataccaatt 29715  T
Q  115 gcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaaca 190  Q
     ||| ||| ||||||||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||  |||||  ||||||||    
T  29714 -caattcatcaacatcttatgtatacaattaatcttcaagtaatgcata-aacattataatacatcttaatcaaca 29641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97173
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  97123 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacat 97173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 31 - 179
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106451
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||| |  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtaca-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  128 atcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacat 179  Q
    |||| ||| | |||  |||| |||| ||||||||||||  | ||||||||||    
T  106401 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacat 106451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Original strand, 569 - 669
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  569 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcata-taaaacagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 666  T
Q  128 atc 130  Q
    |||    
T  667 atc 669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 162
Target Start/End: Original strand, 920 - 1042
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  920 gactcatgcaacttagttcaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 1018  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcat 162  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1019 tcaataatatttcaagtaatgcat 1042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 103 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1257 - 1164
Alignment:
Q  103 ataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcacatcaaaatcaacatcaata 196  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||  | || ||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  1257 ataatatcaatttcatttcaacaacatcttaatcattcaataatatcttaaataatgcacataacattatatcacatcatattcaacattaata 1164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Original strand, 44104 - 44244
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||   |||| |||||||| |  | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  44104 gactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagatcacaacaacagcataatttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgataat 44202  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  44203 tcaataatattttaagtaatgcatttaatcattaaatcacat 44244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206575
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagta 82  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaacataggcagta 206575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 10639 - 10575
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10639 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcaacataggcag 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15796 - 15736
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatag 76  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||    
T  15796 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcatag 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 103737 - 103632
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca--gcatgacataataatatcaattgcaagtcaa 123  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||| |||| |||||||| |||||  |||    
T  103737 tcaacttagaccgactaatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggtagtata-aaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaaacaa 103639  T
Q  124 caacatc 130  Q
    |||||||    
T  103638 caacatc 103632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46820 - 46670
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||   |||| || ||||| || | |||||||||||| ||  || |||||||||| |  ||    
T  46820 gactcatgcaacttagttacataacaatagcagcataggcagatcacaacaatagcataacttcataatatcaatt-catttccacaacatcttgatcat 46722  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacatcaaaatcaac 189  Q
    ||||| ||| |||||||||||||  ||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  46721 tcaataatatttcaagtaatgcaattaatcattaaatcacattataatcaac 46670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 165
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13157
Alignment:
Q  100 ataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatata 165  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || ||||||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatata 13157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 131
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267781
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacataggcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaattgcaagtcaacaac 127  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| |||| ||||||| ||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  128 atct 131  Q
    ||||    
T  267778 atct 267781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 31 - 89
Target Start/End: Original strand, 2694 - 2753
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-ataacaacagcaacataggcagtatacaaaa 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2694 cttagaccgactcatgcagcttagtcaatagacaaacagcaacataggcagtatataaaa 2753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 5037 - 4999
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagg 77  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5037 gactcatgcaacttggttaaataacaacagcaacatagg 4999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 2281 - 2213
Alignment:
Q  69 caacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    ||||||||||||||| ||||  || ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  2281 caacataggcagtatgcaaat-catcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaatat 2213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 6508 - 6368
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatcttaaatat 138  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||   |||| || ||||| |  | |||||||||||| ||  ||||||||||||| |  ||    
T  6508 gactcatgcaacatagttaaataacaatagcagcataggaagatcacaacaatagcataatttcataatatcaatt-catttcaacaacatcttgatcat 6410  T
Q  139 tcaattatacttcaagtaatgcatataa-cattatatcacat 179  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||| ||| ||||| |||||||    
T  6409 tcaataatatttcgagtaatgcatttaatcattaaatcacat 6368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 7450 - 7499
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  7450 cttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaacataggcag 7499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 14569 - 14618
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  14569 cttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaacataggcag 14618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 101
Target Start/End: Original strand, 18236 - 18321
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacat 101  Q
    ||||||||| |||| |||| | ||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||||||  | ||| ||||| |||||||    
T  18236 catcatcttgatcatcttatatcgactcatgcaacatagttaattaacaatagcagcataggcagattgcaacaacagtatgacat 18321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 80
Target Start/End: Original strand, 6095 - 6159
Alignment:
Q  16 catcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcag 80  Q
    ||||||||| |||| |||| |  |||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  6095 catcatcttaatcatcttatattgactcatgcaacttggttaaataacaatagcagcataggcag 6159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 7364 - 7328
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacata 75  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7364 gactcatgcaacttagttaaataacagcagcaacata 7328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 3276 - 3324
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  3276 cttagaccgacacatgcagcttaattaatatacaacagcaacataggca 3324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 79
Target Start/End: Original strand, 30350 - 30398
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggca 79  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  30350 cttagaccgactcatgcagtttaattaatatacaacagcaacataggca 30398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 539 times since January 2019
Visitors: 6717