View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0920-INSERTION1 (Length: 732)

Name: NF0920-INSERTION1
Description: NF0920
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0920-INSERTION1
NF0920-INSERTION1
[»] chr8 (187 HSPs)
chr8 (98-392)||(5162310-5162604)
chr8 (100-392)||(5774054-5774347)
chr8 (469-732)||(27851432-27851697)
chr8 (100-352)||(11482859-11483111)
chr8 (100-352)||(16448492-16448744)
chr8 (99-392)||(44580615-44580910)
chr8 (99-392)||(18641115-18641411)
chr8 (100-392)||(32522584-32522874)
chr8 (98-392)||(23487070-23487362)
chr8 (103-382)||(24992531-24992810)
chr8 (146-392)||(8072914-8073160)
chr8 (98-392)||(18111714-18112006)
chr8 (100-392)||(23687905-23688196)
chr8 (99-352)||(38967189-38967442)
chr8 (155-392)||(44748257-44748494)
chr8 (146-349)||(44021055-44021258)
chr8 (146-392)||(50880-51126)
chr8 (104-392)||(40784897-40785184)
chr8 (146-392)||(32675542-32675788)
chr8 (147-348)||(44747098-44747298)
chr8 (99-392)||(2944012-2944303)
chr8 (146-391)||(8948136-8948381)
chr8 (99-392)||(26016575-26016866)
chr8 (146-391)||(26980762-26981006)
chr8 (146-392)||(18754150-18754397)
chr8 (97-347)||(257274-257524)
chr8 (97-347)||(658396-658646)
chr8 (97-347)||(844132-844382)
chr8 (146-392)||(8251718-8251964)
chr8 (146-392)||(18455726-18455972)
chr8 (146-392)||(28191960-28192206)
chr8 (99-392)||(5783885-5784179)
chr8 (99-392)||(39406565-39406858)
chr8 (100-392)||(13153934-13154225)
chr8 (146-392)||(8951213-8951459)
chr8 (146-392)||(28579645-28579890)
chr8 (146-392)||(34490523-34490769)
chr8 (146-392)||(38878727-38878973)
chr8 (147-394)||(33865329-33865574)
chr8 (99-392)||(44888686-44888979)
chr8 (146-392)||(29598230-29598476)
chr8 (146-392)||(36176888-36177134)
chr8 (146-392)||(38183351-38183596)
chr8 (147-392)||(34568496-34568741)
chr8 (99-392)||(39029184-39029474)
chr8 (146-392)||(1774348-1774594)
chr8 (146-392)||(14699458-14699704)
chr8 (176-392)||(29806038-29806253)
chr8 (146-389)||(4076181-4076424)
chr8 (100-392)||(38780881-38781172)
chr8 (100-346)||(7682777-7683022)
chr8 (99-391)||(8797027-8797327)
chr8 (146-392)||(33980471-33980714)
chr8 (146-347)||(35504365-35504566)
chr8 (99-352)||(7683302-7683554)
chr8 (99-346)||(8566255-8566499)
chr8 (146-349)||(36661711-36661914)
chr8 (146-392)||(9035326-9035570)
chr8 (150-392)||(33745686-33745926)
chr8 (97-392)||(40741271-40741564)
chr8 (146-392)||(41014510-41014756)
chr8 (100-388)||(11798615-11798902)
chr8 (100-392)||(17856517-17856807)
chr8 (149-392)||(29321083-29321325)
chr8 (100-388)||(32474972-32475254)
chr8 (146-389)||(42598501-42598743)
chr8 (146-392)||(12255102-12255346)
chr8 (146-392)||(12260645-12260889)
chr8 (146-352)||(25058088-25058292)
chr8 (145-392)||(2152025-2152271)
chr8 (100-392)||(4778597-4778887)
chr8 (100-378)||(28864247-28864524)
chr8 (146-388)||(42218132-42218371)
chr8 (146-392)||(16999002-16999249)
chr8 (100-392)||(43653943-43654234)
chr8 (146-327)||(16117236-16117417)
chr8 (146-327)||(16125495-16125676)
chr8 (147-347)||(42985302-42985501)
chr8 (99-392)||(44250858-44251152)
chr8 (146-391)||(4631339-4631585)
chr8 (100-328)||(12825017-12825244)
chr8 (100-352)||(41615952-41616208)
chr8 (108-392)||(44502626-44502912)
chr8 (99-385)||(45260236-45260521)
chr8 (98-392)||(29279201-29279495)
chr8 (146-387)||(35143307-35143545)
chr8 (100-327)||(31886742-31886967)
chr8 (146-392)||(45283575-45283823)
chr8 (146-313)||(21652267-21652438)
chr8 (147-384)||(45425049-45425283)
chr8 (162-347)||(5593470-5593654)
chr8 (146-352)||(36245698-36245904)
chr8 (146-269)||(30140211-30140334)
chr8 (146-298)||(35202938-35203087)
chr8 (231-352)||(5951164-5951285)
chr8 (167-347)||(39463036-39463215)
chr8 (146-252)||(14625673-14625779)
chr8 (146-351)||(5268016-5268220)
chr8 (146-392)||(13568695-13568936)
chr8 (167-391)||(17336426-17336647)
chr8 (146-296)||(110172-110324)
chr8 (99-348)||(26990566-26990815)
chr8 (146-392)||(7758714-7758940)
chr8 (147-392)||(14583919-14584162)
chr8 (251-392)||(40529313-40529453)
chr8 (146-352)||(14548474-14548679)
chr8 (261-392)||(42885060-42885191)
chr8 (167-392)||(11293659-11293883)
chr8 (167-392)||(35179606-35179830)
chr8 (147-302)||(35203098-35203243)
chr8 (167-392)||(12802617-12802838)
chr8 (106-216)||(28965648-28965758)
chr8 (167-380)||(5109899-5110111)
chr8 (167-392)||(36786473-36786697)
chr8 (146-350)||(21136903-21137107)
chr8 (167-327)||(25056707-25056865)
chr8 (231-384)||(44580923-44581076)
chr8 (167-383)||(36941284-36941498)
chr8 (147-245)||(42747361-42747459)
chr8 (266-392)||(28965510-28965636)
chr8 (168-388)||(43292806-43293023)
chr8 (167-392)||(23995583-23995806)
chr8 (171-348)||(30512817-30512991)
chr8 (167-385)||(44165276-44165493)
chr8 (252-352)||(17851339-17851439)
chr8 (183-392)||(26625799-26626007)
chr8 (248-392)||(19176142-19176286)
chr8 (170-351)||(23894718-23894896)
chr8 (184-392)||(5244451-5244656)
chr8 (161-308)||(11113869-11114018)
chr8 (171-345)||(39970021-39970195)
chr8 (147-347)||(40855846-40856047)
chr8 (252-349)||(9615975-9616071)
chr8 (171-348)||(24260764-24260941)
chr8 (189-327)||(31089750-31089887)
chr8 (190-327)||(39970555-39970693)
chr8 (167-348)||(23497778-23497960)
chr8 (168-391)||(26502488-26502709)
chr8 (100-287)||(44056809-44056993)
chr8 (232-327)||(25635979-25636074)
chr8 (146-242)||(42885325-42885422)
chr8 (99-199)||(5952482-5952582)
chr8 (258-392)||(37023180-37023315)
chr8 (100-194)||(17851249-17851343)
chr8 (165-310)||(23424897-23425041)
chr8 (469-719)||(9262344-9262598)
chr8 (183-392)||(41898317-41898527)
chr8 (146-291)||(28740961-28741106)
chr8 (100-280)||(29738099-29738276)
chr8 (231-289)||(13401791-13401848)
chr8 (252-348)||(24355214-24355310)
chr8 (298-392)||(36408421-36408515)
chr8 (235-392)||(31619123-31619279)
chr8 (177-216)||(16894062-16894101)
chr8 (203-282)||(28929339-28929418)
chr8 (246-333)||(42220522-42220608)
chr8 (184-352)||(13141506-13141670)
chr8 (177-295)||(19700825-19700942)
chr8 (160-327)||(2767705-2767868)
chr8 (97-207)||(40530336-40530446)
chr8 (146-210)||(39112547-39112611)
chr8 (160-216)||(41388545-41388601)
chr8 (146-218)||(44580539-44580611)
chr8 (171-214)||(42486245-42486288)
chr8 (231-286)||(45145356-45145411)
chr8 (232-387)||(4348382-4348536)
chr8 (231-284)||(29073738-29073791)
chr8 (248-347)||(13335775-13335882)
chr8 (360-392)||(17069843-17069875)
chr8 (360-392)||(17578398-17578430)
chr8 (96-132)||(23487060-23487096)
chr8 (688-732)||(25636226-25636270)
chr8 (147-187)||(34071018-34071058)
chr8 (97-132)||(12802608-12802643)
chr8 (172-271)||(15021169-15021268)
chr8 (361-392)||(28572052-28572083)
chr8 (98-132)||(2152245-2152279)
chr8 (361-391)||(5593428-5593458)
chr8 (98-132)||(18111980-18112014)
chr8 (167-213)||(19176874-19176920)
chr8 (96-125)||(5784160-5784189)
chr8 (363-392)||(6050557-6050586)
chr8 (177-210)||(19715659-19715692)
chr8 (99-132)||(23688170-23688203)
chr8 (99-132)||(34114558-34114591)
chr8 (99-132)||(36408414-36408447)
chr8 (99-132)||(40784890-40784923)
[»] chr3 (236 HSPs)
chr3 (100-392)||(10656697-10656989)
chr3 (99-389)||(1450251-1450541)
chr3 (100-392)||(46845231-46845523)
chr3 (100-392)||(50433128-50433420)
chr3 (100-392)||(4759088-4759382)
chr3 (98-392)||(6784469-6784762)
chr3 (99-388)||(53686735-53687024)
chr3 (98-392)||(12906149-12906444)
chr3 (100-391)||(46862105-46862396)
chr3 (103-392)||(33212403-33212691)
chr3 (99-392)||(43686507-43686800)
chr3 (146-392)||(53164169-53164415)
chr3 (99-392)||(20621424-20621715)
chr3 (100-392)||(10015530-10015820)
chr3 (100-392)||(19897577-19897867)
chr3 (99-393)||(42801520-42801814)
chr3 (146-392)||(24087123-24087366)
chr3 (100-392)||(28673035-28673325)
chr3 (146-392)||(7181356-7181602)
chr3 (99-393)||(31186763-31187055)
chr3 (146-392)||(49383350-49383595)
chr3 (98-392)||(47066940-47067234)
chr3 (99-392)||(45513375-45513668)
chr3 (97-332)||(40919020-40919255)
chr3 (146-392)||(7051505-7051751)
chr3 (146-392)||(9499282-9499528)
chr3 (146-392)||(43868109-43868355)
chr3 (107-392)||(53361601-53361886)
chr3 (146-392)||(22103714-22103960)
chr3 (151-352)||(46861666-46861867)
chr3 (146-392)||(51489373-51489619)
chr3 (99-392)||(15996513-15996804)
chr3 (100-392)||(46049727-46050017)
chr3 (146-392)||(8321931-8322175)
chr3 (146-392)||(21756492-21756738)
chr3 (146-392)||(23700570-23700816)
chr3 (146-392)||(23719025-23719271)
chr3 (146-392)||(23737481-23737727)
chr3 (146-392)||(45252779-45253025)
chr3 (146-392)||(46878224-46878470)
chr3 (146-392)||(48887731-48887977)
chr3 (146-392)||(49126983-49127229)
chr3 (146-392)||(50517307-50517553)
chr3 (146-392)||(54107359-54107605)
chr3 (99-392)||(8546910-8547203)
chr3 (146-389)||(54782702-54782945)
chr3 (146-392)||(7251067-7251313)
chr3 (146-392)||(26221294-26221540)
chr3 (146-392)||(30040802-30041048)
chr3 (146-392)||(32467431-32467677)
chr3 (146-392)||(45745784-45746030)
chr3 (107-392)||(50726532-50726814)
chr3 (107-392)||(50786034-50786316)
chr3 (103-392)||(21458988-21459277)
chr3 (146-392)||(17753320-17753566)
chr3 (146-392)||(19054640-19054886)
chr3 (99-352)||(23776235-23776486)
chr3 (146-392)||(25148907-25149153)
chr3 (146-388)||(43701188-43701430)
chr3 (146-392)||(46703033-46703279)
chr3 (146-384)||(52673201-52673439)
chr3 (99-392)||(14428616-14428907)
chr3 (146-392)||(27687992-27688235)
chr3 (92-392)||(33868454-33868753)
chr3 (146-392)||(43158523-43158767)
chr3 (148-392)||(52177806-52178050)
chr3 (147-392)||(12050181-12050423)
chr3 (146-392)||(31531196-31531442)
chr3 (146-392)||(35867868-35868114)
chr3 (146-392)||(44543788-44544033)
chr3 (147-392)||(45323875-45324118)
chr3 (100-352)||(1084693-1084945)
chr3 (146-391)||(25148466-25148707)
chr3 (99-392)||(50647683-50647975)
chr3 (148-391)||(32569004-32569247)
chr3 (146-392)||(32962890-32963136)
chr3 (146-389)||(35165748-35165990)
chr3 (146-392)||(13809594-13809840)
chr3 (146-392)||(20656095-20656341)
chr3 (146-392)||(26593550-26593796)
chr3 (146-392)||(37728719-37728964)
chr3 (147-392)||(43978166-43978409)
chr3 (146-388)||(45048807-45049049)
chr3 (147-352)||(50730371-50730576)
chr3 (147-352)||(50782278-50782483)
chr3 (148-392)||(10220939-10221180)
chr3 (97-394)||(17591282-17591578)
chr3 (99-392)||(17698772-17699062)
chr3 (100-392)||(16434977-16435267)
chr3 (146-392)||(35711282-35711525)
chr3 (146-388)||(48909882-48910122)
chr3 (146-392)||(43557238-43557484)
chr3 (188-392)||(12683009-12683213)
chr3 (99-391)||(20862203-20862495)
chr3 (100-392)||(4024058-4024348)
chr3 (100-388)||(52058985-52059272)
chr3 (146-392)||(1641885-1642130)
chr3 (147-389)||(38071204-38071446)
chr3 (100-348)||(36005553-36005801)
chr3 (100-392)||(10044848-10045137)
chr3 (99-391)||(36098973-36099262)
chr3 (100-392)||(9779979-9780272)
chr3 (146-392)||(54604373-54604619)
chr3 (104-347)||(52044540-52044781)
chr3 (146-392)||(14758844-14759086)
chr3 (146-392)||(26058552-26058790)
chr3 (100-352)||(42390643-42390895)
chr3 (100-392)||(48213758-48214048)
chr3 (168-392)||(49383640-49383864)
chr3 (150-392)||(2993265-2993505)
chr3 (146-347)||(26806166-26806366)
chr3 (146-349)||(52291214-52291415)
chr3 (147-283)||(54866388-54866524)
chr3 (100-345)||(41992279-41992509)
chr3 (146-392)||(51283848-51284093)
chr3 (99-392)||(32978487-32978778)
chr3 (146-352)||(35572243-35572446)
chr3 (146-384)||(39952286-39952522)
chr3 (160-352)||(33361500-33361684)
chr3 (146-352)||(36317442-36317646)
chr3 (159-392)||(26306406-26306638)
chr3 (147-351)||(41824155-41824358)
chr3 (188-392)||(44542301-44542504)
chr3 (162-391)||(22832411-22832637)
chr3 (100-327)||(33976554-33976777)
chr3 (103-286)||(37144228-37144413)
chr3 (146-352)||(54849409-54849615)
chr3 (146-348)||(53271642-53271842)
chr3 (147-391)||(20877640-20877881)
chr3 (224-345)||(46557746-46557867)
chr3 (225-391)||(49543684-49543850)
chr3 (146-286)||(19350162-19350302)
chr3 (169-392)||(27646115-27646337)
chr3 (146-392)||(41392665-41392911)
chr3 (167-392)||(47008309-47008533)
chr3 (146-393)||(22527408-22527653)
chr3 (169-392)||(1111457-1111679)
chr3 (146-277)||(23308059-23308190)
chr3 (146-281)||(25879256-25879391)
chr3 (171-392)||(16776696-16776918)
chr3 (147-393)||(1572336-1572580)
chr3 (247-392)||(9582249-9582394)
chr3 (196-392)||(30819884-30820079)
chr3 (167-350)||(44561503-44561685)
chr3 (98-348)||(29383064-29383314)
chr3 (167-392)||(15095204-15095428)
chr3 (167-392)||(17589683-17589907)
chr3 (97-216)||(18658165-18658284)
chr3 (158-352)||(36600189-36600382)
chr3 (146-271)||(41750972-41751097)
chr3 (167-347)||(28810928-28811107)
chr3 (167-384)||(42526432-42526648)
chr3 (175-352)||(43408542-43408720)
chr3 (167-392)||(48904070-48904294)
chr3 (146-348)||(25916450-25916654)
chr3 (188-352)||(7886890-7887053)
chr3 (167-392)||(29719518-29719741)
chr3 (167-392)||(54927897-54928122)
chr3 (149-328)||(46879088-46879267)
chr3 (168-352)||(38340996-38341177)
chr3 (167-348)||(34021802-34021982)
chr3 (147-216)||(39625243-39625312)
chr3 (167-392)||(12918645-12918869)
chr3 (248-347)||(20848612-20848711)
chr3 (146-245)||(20848985-20849084)
chr3 (188-351)||(31533414-31533576)
chr3 (167-391)||(45404382-45404604)
chr3 (225-344)||(18658323-18658442)
chr3 (248-352)||(39625681-39625785)
chr3 (167-390)||(32969033-32969254)
chr3 (147-351)||(33290393-33290594)
chr3 (146-327)||(25130721-25130897)
chr3 (146-222)||(12675208-12675284)
chr3 (183-392)||(42755347-42755555)
chr3 (231-392)||(48655110-48655270)
chr3 (167-352)||(8379723-8379907)
chr3 (166-345)||(38364219-38364400)
chr3 (183-384)||(40215052-40215252)
chr3 (167-392)||(48902516-48902739)
chr3 (276-352)||(54690581-54690657)
chr3 (168-392)||(4564243-4564466)
chr3 (285-392)||(7462921-7463028)
chr3 (167-392)||(28875059-28875282)
chr3 (171-274)||(13702666-13702769)
chr3 (165-290)||(35938469-35938594)
chr3 (167-392)||(42044061-42044283)
chr3 (231-324)||(55287335-55287428)
chr3 (167-404)||(31541023-31541252)
chr3 (167-327)||(24813657-24813814)
chr3 (248-350)||(40047979-40048081)
chr3 (275-349)||(41751383-41751457)
chr3 (146-211)||(9582396-9582461)
chr3 (146-327)||(34265510-34265696)
chr3 (167-392)||(34811321-34811543)
chr3 (167-388)||(36584720-36584935)
chr3 (231-390)||(52693558-52693718)
chr3 (176-383)||(2764219-2764424)
chr3 (168-290)||(23650639-23650761)
chr3 (183-286)||(4836516-4836616)
chr3 (275-352)||(7886455-7886532)
chr3 (291-347)||(20919133-20919189)
chr3 (291-347)||(20928095-20928151)
chr3 (171-343)||(49543990-49544161)
chr3 (167-286)||(21497618-21497734)
chr3 (236-382)||(48136964-48137106)
chr3 (168-219)||(40048141-40048192)
chr3 (220-277)||(54690380-54690435)
chr3 (99-132)||(17699036-17699069)
chr3 (171-216)||(20084697-20084742)
chr3 (167-216)||(31397957-31398006)
chr3 (146-191)||(46557700-46557745)
chr3 (204-284)||(27067501-27067581)
chr3 (96-132)||(28875256-28875292)
chr3 (171-242)||(16776557-16776628)
chr3 (361-392)||(20918225-20918256)
chr3 (361-392)||(20927187-20927218)
chr3 (231-286)||(51486231-51486286)
chr3 (171-213)||(8503312-8503354)
chr3 (96-126)||(17589887-17589917)
chr3 (183-245)||(22494483-22494544)
chr3 (98-132)||(33976501-33976535)
chr3 (92-126)||(42755333-42755367)
chr3 (97-127)||(50433399-50433429)
chr3 (267-352)||(1330913-1330998)
chr3 (99-132)||(2993258-2993291)
chr3 (99-132)||(4759356-4759389)
chr3 (99-132)||(10015794-10015827)
chr3 (99-132)||(12906418-12906451)
chr3 (99-132)||(19897841-19897874)
chr3 (275-347)||(23307705-23307778)
chr3 (99-132)||(24087340-24087373)
chr3 (171-216)||(36732179-36732224)
chr3 (99-132)||(41392885-41392918)
chr3 (99-132)||(46845497-46845530)
chr3 (99-132)||(48904268-48904301)
chr3 (99-132)||(53361860-53361893)
[»] chr6 (113 HSPs)
chr6 (100-392)||(7772182-7772474)
chr6 (100-392)||(25045382-25045674)
chr6 (100-392)||(9341844-9342136)
chr6 (100-392)||(17227267-17227558)
chr6 (99-392)||(2090664-2090958)
chr6 (98-392)||(13010857-13011151)
chr6 (149-347)||(15966950-15967148)
chr6 (100-352)||(19418863-19419115)
chr6 (100-392)||(34915282-34915574)
chr6 (99-350)||(16122302-16122552)
chr6 (98-392)||(31149985-31150277)
chr6 (100-389)||(31487110-31487399)
chr6 (146-392)||(34301617-34301863)
chr6 (99-392)||(13866599-13866892)
chr6 (100-392)||(11847577-11847869)
chr6 (99-392)||(20449919-20450212)
chr6 (146-392)||(6147389-6147635)
chr6 (99-392)||(8670141-8670432)
chr6 (100-392)||(402362-402652)
chr6 (97-392)||(13647865-13648160)
chr6 (99-392)||(15498635-15498926)
chr6 (98-392)||(925672-925964)
chr6 (146-392)||(13690517-13690762)
chr6 (146-392)||(33487839-33488083)
chr6 (97-392)||(31091451-31091744)
chr6 (146-391)||(1147054-1147297)
chr6 (146-392)||(25197158-25197404)
chr6 (146-392)||(30248653-30248899)
chr6 (99-392)||(12143785-12144076)
chr6 (146-392)||(23604466-23604714)
chr6 (105-392)||(19097547-19097832)
chr6 (146-392)||(5457418-5457664)
chr6 (146-392)||(12105849-12106095)
chr6 (146-392)||(25024291-25024537)
chr6 (146-392)||(1729889-1730132)
chr6 (146-392)||(287199-287445)
chr6 (147-392)||(16272754-16272999)
chr6 (99-392)||(23397878-23398170)
chr6 (146-392)||(10195779-10196024)
chr6 (100-392)||(9388529-9388822)
chr6 (108-392)||(8743194-8743476)
chr6 (146-392)||(230892-231136)
chr6 (99-392)||(15355294-15355585)
chr6 (146-352)||(34126187-34126391)
chr6 (97-392)||(34741472-34741766)
chr6 (146-349)||(23578211-23578414)
chr6 (100-387)||(1779784-1780070)
chr6 (169-318)||(17952167-17952316)
chr6 (146-349)||(17175250-17175453)
chr6 (100-310)||(20373123-20373331)
chr6 (190-392)||(9660506-9660707)
chr6 (140-348)||(31711629-31711835)
chr6 (146-347)||(33773628-33773831)
chr6 (146-385)||(390336-390573)
chr6 (107-347)||(15287190-15287428)
chr6 (107-351)||(344911-345158)
chr6 (146-347)||(3177232-3177430)
chr6 (190-388)||(11656174-11656373)
chr6 (160-352)||(345546-345737)
chr6 (146-352)||(15126510-15126714)
chr6 (146-347)||(8175712-8175907)
chr6 (100-392)||(6417882-6418168)
chr6 (161-352)||(5576180-5576367)
chr6 (148-392)||(22852119-22852362)
chr6 (168-392)||(32614995-32615216)
chr6 (146-348)||(18105957-18106158)
chr6 (184-390)||(6418476-6418681)
chr6 (184-391)||(4175249-4175455)
chr6 (177-343)||(9299246-9299411)
chr6 (167-392)||(11161857-11162083)
chr6 (234-395)||(8637148-8637309)
chr6 (167-392)||(22998852-22999076)
chr6 (167-392)||(23789328-23789552)
chr6 (183-392)||(22710272-22710478)
chr6 (183-392)||(9038648-9038854)
chr6 (187-392)||(13901647-13901850)
chr6 (161-327)||(235830-235993)
chr6 (167-386)||(8217528-8217744)
chr6 (147-388)||(11104580-11104805)
chr6 (183-392)||(11200600-11200808)
chr6 (167-392)||(13321135-13321357)
chr6 (183-392)||(14629909-14630115)
chr6 (265-392)||(29036132-29036258)
chr6 (168-327)||(4823043-4823198)
chr6 (167-347)||(27581437-27581616)
chr6 (146-222)||(29036250-29036326)
chr6 (171-346)||(8646015-8646190)
chr6 (167-352)||(28980662-28980847)
chr6 (167-392)||(28236010-28236232)
chr6 (231-352)||(29293669-29293790)
chr6 (168-352)||(33012473-33012656)
chr6 (160-265)||(2746343-2746448)
chr6 (231-352)||(11840417-11840537)
chr6 (103-188)||(9660136-9660221)
chr6 (171-274)||(6840082-6840183)
chr6 (190-352)||(23923538-23923698)
chr6 (167-352)||(27310480-27310662)
chr6 (171-392)||(23282615-23282836)
chr6 (266-389)||(2364998-2365121)
chr6 (146-263)||(26211032-26211151)
chr6 (248-332)||(32982509-32982593)
chr6 (231-286)||(8595644-8595699)
chr6 (100-132)||(22852336-22852368)
chr6 (97-132)||(402626-402661)
chr6 (361-392)||(4844406-4844437)
chr6 (167-209)||(17992177-17992219)
chr6 (98-132)||(23604458-23604492)
chr6 (146-191)||(11655854-11655899)
chr6 (99-132)||(13321331-13321364)
chr6 (99-132)||(13901640-13901673)
chr6 (99-132)||(15498628-15498661)
chr6 (99-132)||(25045648-25045681)
chr6 (99-132)||(34915548-34915581)
[»] chr1 (213 HSPs)
chr1 (100-392)||(27037275-27037567)
chr1 (98-391)||(24855288-24855581)
chr1 (146-392)||(42275945-42276192)
chr1 (97-392)||(48067631-48067926)
chr1 (147-392)||(38261346-38261591)
chr1 (100-352)||(23530591-23530843)
chr1 (100-392)||(28888162-28888455)
chr1 (98-392)||(28885840-28886135)
chr1 (100-352)||(9715406-9715658)
chr1 (100-392)||(36694860-36695152)
chr1 (100-392)||(36710961-36711253)
chr1 (147-351)||(27575423-27575627)
chr1 (100-392)||(6089741-6090031)
chr1 (101-392)||(9413067-9413356)
chr1 (146-392)||(13343779-13344025)
chr1 (146-392)||(15892349-15892594)
chr1 (154-392)||(50937785-50938022)
chr1 (146-391)||(45038148-45038392)
chr1 (100-392)||(34931085-34931375)
chr1 (100-352)||(38613521-38613773)
chr1 (100-392)||(5765730-5766021)
chr1 (146-392)||(11741403-11741649)
chr1 (146-392)||(52430959-52431205)
chr1 (146-392)||(31238725-31238969)
chr1 (146-392)||(45285595-45285841)
chr1 (100-352)||(28052235-28052487)
chr1 (146-391)||(41855260-41855503)
chr1 (100-309)||(25228285-25228494)
chr1 (100-392)||(4102455-4102745)
chr1 (147-346)||(14347174-14347373)
chr1 (100-392)||(52601997-52602287)
chr1 (146-392)||(16456642-16456888)
chr1 (146-392)||(30290271-30290517)
chr1 (146-392)||(42872119-42872365)
chr1 (146-392)||(49907027-49907273)
chr1 (99-392)||(21630844-21631138)
chr1 (146-352)||(11907013-11907219)
chr1 (146-392)||(943422-943668)
chr1 (146-392)||(3934612-3934857)
chr1 (147-392)||(25509215-25509457)
chr1 (146-392)||(45794350-45794596)
chr1 (146-392)||(46075653-46075898)
chr1 (97-392)||(41317599-41317893)
chr1 (99-383)||(27530342-27530624)
chr1 (146-392)||(16575877-16576123)
chr1 (98-392)||(15810970-15811263)
chr1 (99-392)||(30289601-30289893)
chr1 (146-392)||(2279959-2280205)
chr1 (100-385)||(15100369-15100660)
chr1 (146-351)||(19792649-19792852)
chr1 (100-392)||(23541985-23542276)
chr1 (146-352)||(36674083-36674289)
chr1 (146-332)||(37589007-37589192)
chr1 (100-392)||(37951689-37951980)
chr1 (147-404)||(8472042-8472297)
chr1 (161-383)||(15289951-15290171)
chr1 (142-392)||(32169736-32169985)
chr1 (146-347)||(50246715-50246916)
chr1 (99-392)||(12814525-12814818)
chr1 (100-352)||(40614646-40614896)
chr1 (100-392)||(7763491-7763780)
chr1 (100-392)||(1039121-1039412)
chr1 (100-392)||(1046027-1046318)
chr1 (147-352)||(8923456-8923659)
chr1 (146-389)||(47300678-47300920)
chr1 (146-327)||(14090037-14090218)
chr1 (97-388)||(39750118-39750408)
chr1 (100-391)||(44646278-44646568)
chr1 (146-387)||(51422212-51422454)
chr1 (99-391)||(9202244-9202535)
chr1 (100-392)||(44649635-44649926)
chr1 (100-392)||(45039418-45039709)
chr1 (140-389)||(37584963-37585209)
chr1 (97-392)||(39362931-39363225)
chr1 (146-392)||(50008268-50008514)
chr1 (146-383)||(15111596-15111837)
chr1 (146-343)||(229193-229388)
chr1 (146-389)||(1767649-1767888)
chr1 (146-352)||(15763361-15763567)
chr1 (157-347)||(39324576-39324766)
chr1 (100-392)||(39497439-39497730)
chr1 (99-352)||(48853864-48854115)
chr1 (147-348)||(9378887-9379090)
chr1 (140-392)||(26544510-26544760)
chr1 (99-380)||(38530890-38531169)
chr1 (97-392)||(14171548-14171830)
chr1 (141-352)||(34503282-34503493)
chr1 (100-389)||(2489141-2489427)
chr1 (147-343)||(43668188-43668384)
chr1 (149-348)||(31086711-31086910)
chr1 (146-332)||(51810942-51811128)
chr1 (146-327)||(8104075-8104256)
chr1 (98-351)||(1047990-1048242)
chr1 (146-388)||(26549801-26550040)
chr1 (147-313)||(896838-897004)
chr1 (146-392)||(3549038-3549281)
chr1 (107-391)||(47068796-47069078)
chr1 (146-392)||(45335891-45336137)
chr1 (150-388)||(50007985-50008221)
chr1 (161-388)||(35984463-35984689)
chr1 (99-392)||(7783997-7784292)
chr1 (146-392)||(18237100-18237343)
chr1 (164-348)||(39873488-39873672)
chr1 (146-347)||(25271242-25271440)
chr1 (147-335)||(43395459-43395645)
chr1 (147-321)||(36880409-36880580)
chr1 (147-352)||(10383828-10384034)
chr1 (156-346)||(46506209-46506398)
chr1 (100-286)||(25283918-25284104)
chr1 (99-349)||(27974894-27975144)
chr1 (97-387)||(31635867-31636156)
chr1 (142-392)||(10433327-10433577)
chr1 (147-352)||(7212345-7212550)
chr1 (151-352)||(38174922-38175118)
chr1 (93-349)||(9700483-9700738)
chr1 (188-392)||(43456449-43456652)
chr1 (146-348)||(32149096-32149298)
chr1 (146-351)||(4592625-4592830)
chr1 (97-392)||(22567072-22567369)
chr1 (99-281)||(44529413-44529593)
chr1 (146-352)||(47263501-47263709)
chr1 (146-349)||(31465714-31465917)
chr1 (146-270)||(44454612-44454736)
chr1 (205-392)||(11352908-11353093)
chr1 (146-350)||(47296352-47296556)
chr1 (248-352)||(39867543-39867647)
chr1 (156-352)||(47429183-47429378)
chr1 (179-392)||(48022912-48023124)
chr1 (184-392)||(29437678-29437885)
chr1 (146-292)||(47754431-47754577)
chr1 (167-392)||(2636993-2637217)
chr1 (146-352)||(15616179-15616387)
chr1 (104-288)||(1837316-1837506)
chr1 (167-388)||(39425637-39425858)
chr1 (167-392)||(17483739-17483962)
chr1 (167-392)||(27479605-27479828)
chr1 (147-392)||(32153580-32153825)
chr1 (276-392)||(5858261-5858377)
chr1 (261-394)||(32908286-32908416)
chr1 (152-349)||(18172377-18172561)
chr1 (168-391)||(21290129-21290350)
chr1 (167-392)||(51467280-51467503)
chr1 (248-352)||(51561765-51561869)
chr1 (147-306)||(31154351-31154509)
chr1 (167-387)||(52428899-52429117)
chr1 (168-387)||(30996755-30996973)
chr1 (167-390)||(49549009-49549231)
chr1 (171-389)||(26768395-26768611)
chr1 (146-223)||(32906752-32906829)
chr1 (167-392)||(15302551-15302775)
chr1 (147-223)||(26547680-26547756)
chr1 (99-216)||(51561069-51561186)
chr1 (99-348)||(35693112-35693363)
chr1 (161-327)||(31338946-31339112)
chr1 (251-352)||(27530805-27530905)
chr1 (183-352)||(39627059-39627227)
chr1 (146-273)||(13698736-13698862)
chr1 (168-392)||(23893505-23893727)
chr1 (183-392)||(38920245-38920448)
chr1 (183-392)||(4279951-4280157)
chr1 (167-348)||(4389659-4389839)
chr1 (103-216)||(26544395-26544508)
chr1 (167-351)||(48363821-48364004)
chr1 (177-348)||(9424817-9424988)
chr1 (167-346)||(27669894-27670071)
chr1 (248-387)||(43789665-43789804)
chr1 (177-274)||(18114288-18114385)
chr1 (167-327)||(35945279-35945438)
chr1 (167-388)||(37850244-37850466)
chr1 (146-320)||(1197952-1198128)
chr1 (168-347)||(4371574-4371750)
chr1 (267-352)||(44455529-44455614)
chr1 (171-392)||(1427205-1427425)
chr1 (248-351)||(19349254-19349357)
chr1 (177-288)||(30761007-30761118)
chr1 (248-392)||(38505805-38505948)
chr1 (205-347)||(8905463-8905604)
chr1 (252-349)||(33163290-33163387)
chr1 (231-388)||(5854462-5854619)
chr1 (248-348)||(39647679-39647779)
chr1 (187-313)||(41619995-41620118)
chr1 (183-271)||(45810116-45810204)
chr1 (167-286)||(1867262-1867380)
chr1 (177-348)||(50074460-50074631)
chr1 (171-285)||(46083979-46084093)
chr1 (171-327)||(15624703-15624862)
chr1 (167-389)||(46271159-46271378)
chr1 (267-385)||(37000665-37000783)
chr1 (168-216)||(2606722-2606770)
chr1 (160-216)||(8946442-8946498)
chr1 (195-352)||(10758451-10758609)
chr1 (315-391)||(897154-897230)
chr1 (253-352)||(15907109-15907208)
chr1 (168-222)||(10332361-10332415)
chr1 (220-286)||(13054800-13054866)
chr1 (98-132)||(28886109-28886143)
chr1 (298-392)||(47754023-47754118)
chr1 (168-217)||(23932941-23932990)
chr1 (300-349)||(25227356-25227405)
chr1 (99-132)||(50937778-50937811)
chr1 (96-132)||(25509205-25509241)
chr1 (92-132)||(27037261-27037301)
chr1 (267-327)||(35160218-35160278)
chr1 (97-132)||(9413330-9413365)
chr1 (167-210)||(52001530-52001573)
chr1 (146-199)||(11351487-11351541)
chr1 (171-213)||(33336983-33337025)
chr1 (167-213)||(38509096-38509142)
chr1 (99-132)||(5765995-5766028)
chr1 (99-132)||(7763754-7763787)
chr1 (99-132)||(17483732-17483765)
chr1 (171-216)||(27255467-27255512)
chr1 (99-132)||(42276166-42276199)
[»] chr4 (233 HSPs)
chr4 (98-392)||(55562863-55563158)
chr4 (100-392)||(20767955-20768247)
chr4 (100-392)||(31937082-31937374)
chr4 (99-392)||(29519903-29520195)
chr4 (146-392)||(25124030-25124277)
chr4 (146-392)||(375430-375676)
chr4 (100-351)||(29460444-29460695)
chr4 (100-393)||(38027137-38027430)
chr4 (146-343)||(1173616-1173813)
chr4 (102-392)||(28298111-28298402)
chr4 (182-392)||(41191449-41191659)
chr4 (100-392)||(37639627-37639918)
chr4 (99-392)||(625707-625997)
chr4 (100-321)||(20761564-20761785)
chr4 (99-392)||(30049822-30050115)
chr4 (100-351)||(39670771-39671023)
chr4 (146-392)||(54676553-54676800)
chr4 (140-389)||(37173842-37174091)
chr4 (99-392)||(17339084-17339377)
chr4 (96-392)||(43387728-43388024)
chr4 (146-408)||(18882343-18882605)
chr4 (150-392)||(34273008-34273250)
chr4 (146-392)||(35675705-35675951)
chr4 (146-392)||(36391860-36392106)
chr4 (146-392)||(53276971-53277216)
chr4 (103-352)||(39114631-39114880)
chr4 (146-352)||(51717883-51718089)
chr4 (146-392)||(9328025-9328271)
chr4 (146-392)||(33413524-33413770)
chr4 (146-392)||(36129875-36130121)
chr4 (98-393)||(50450962-50451257)
chr4 (99-392)||(13620594-13620885)
chr4 (146-383)||(47311305-47311541)
chr4 (100-392)||(26625743-26626033)
chr4 (100-392)||(56432524-56432817)
chr4 (100-392)||(36990920-36991212)
chr4 (99-306)||(45850462-45850669)
chr4 (92-392)||(47806866-47807166)
chr4 (146-392)||(1028524-1028770)
chr4 (146-392)||(20391223-20391468)
chr4 (146-392)||(44294795-44295041)
chr4 (146-392)||(45742591-45742837)
chr4 (147-392)||(5375344-5375588)
chr4 (146-392)||(32032776-32033024)
chr4 (146-383)||(51335808-51336045)
chr4 (98-392)||(51536176-51536467)
chr4 (140-392)||(48241429-48241681)
chr4 (146-392)||(20454969-20455212)
chr4 (146-392)||(48030319-48030563)
chr4 (146-392)||(6753531-6753777)
chr4 (146-392)||(24754084-24754330)
chr4 (146-392)||(50424639-50424885)
chr4 (146-392)||(52977988-52978234)
chr4 (147-392)||(15241486-15241730)
chr4 (146-325)||(18018731-18018910)
chr4 (99-391)||(45096905-45097195)
chr4 (146-392)||(37842181-37842425)
chr4 (146-392)||(37352550-37352795)
chr4 (146-392)||(37357449-37357694)
chr4 (94-392)||(49373428-49373724)
chr4 (147-392)||(47228514-47228759)
chr4 (147-347)||(49329541-49329741)
chr4 (146-345)||(30771575-30771774)
chr4 (98-392)||(32898976-32899249)
chr4 (100-392)||(4035831-4036122)
chr4 (100-392)||(5743399-5743690)
chr4 (146-392)||(14793810-14794053)
chr4 (146-392)||(10588081-10588326)
chr4 (146-392)||(20285806-20286052)
chr4 (146-347)||(29427540-29427741)
chr4 (146-392)||(49228503-49228749)
chr4 (146-392)||(50533890-50534135)
chr4 (146-392)||(37776521-37776768)
chr4 (100-392)||(4415971-4416262)
chr4 (100-392)||(6462430-6462721)
chr4 (100-392)||(47683095-47683386)
chr4 (103-391)||(50602840-50603127)
chr4 (146-344)||(52850239-52850437)
chr4 (100-392)||(55631999-55632290)
chr4 (146-392)||(422714-422959)
chr4 (147-392)||(46949998-46950241)
chr4 (162-392)||(50352070-50352300)
chr4 (101-352)||(36900852-36901100)
chr4 (100-388)||(45921441-45921726)
chr4 (146-352)||(55014751-55014957)
chr4 (147-391)||(4455067-4455313)
chr4 (146-392)||(17609807-17610051)
chr4 (146-392)||(47299023-47299269)
chr4 (146-391)||(55876387-55876630)
chr4 (100-392)||(2615683-2615976)
chr4 (100-272)||(41191275-41191447)
chr4 (100-392)||(4549629-4549920)
chr4 (103-352)||(13389654-13389900)
chr4 (146-327)||(37364588-37364769)
chr4 (146-392)||(52870650-52870895)
chr4 (100-392)||(23777543-23777833)
chr4 (96-297)||(54535917-54536118)
chr4 (99-392)||(20747176-20747468)
chr4 (100-347)||(40809607-40809854)
chr4 (146-392)||(41620520-41620764)
chr4 (96-392)||(53629798-53630093)
chr4 (147-352)||(20788977-20789182)
chr4 (146-392)||(25708465-25708709)
chr4 (98-307)||(30523762-30523969)
chr4 (106-392)||(49793097-49793381)
chr4 (147-391)||(8343915-8344156)
chr4 (161-352)||(9808398-9808589)
chr4 (99-392)||(39144410-39144702)
chr4 (99-352)||(54877754-54878003)
chr4 (146-392)||(1859150-1859394)
chr4 (146-392)||(16545769-16546014)
chr4 (100-383)||(29014064-29014346)
chr4 (146-393)||(39184278-39184522)
chr4 (147-352)||(33988582-33988783)
chr4 (97-348)||(37518055-37518304)
chr4 (97-348)||(37522271-37522520)
chr4 (147-352)||(18706430-18706633)
chr4 (146-392)||(26866647-26866894)
chr4 (146-352)||(30745585-30745790)
chr4 (147-392)||(54623807-54624051)
chr4 (146-392)||(6083290-6083535)
chr4 (146-391)||(34948438-34948681)
chr4 (140-392)||(18003949-18004199)
chr4 (146-389)||(19281876-19282109)
chr4 (146-391)||(38899830-38900072)
chr4 (147-349)||(4094759-4094960)
chr4 (146-389)||(34963393-34963634)
chr4 (146-347)||(15500397-15500598)
chr4 (179-313)||(38405643-38405777)
chr4 (192-387)||(48149017-48149212)
chr4 (110-284)||(46480769-46480943)
chr4 (146-352)||(25474862-25475066)
chr4 (147-352)||(39184037-39184240)
chr4 (231-352)||(49490037-49490158)
chr4 (167-392)||(13498293-13498517)
chr4 (147-391)||(17678305-17678549)
chr4 (239-392)||(42528469-42528624)
chr4 (99-274)||(33501667-33501842)
chr4 (100-281)||(23623753-23623933)
chr4 (269-392)||(468413-468536)
chr4 (169-392)||(28501196-28501417)
chr4 (167-391)||(30868605-30868831)
chr4 (97-216)||(5734384-5734503)
chr4 (150-327)||(52966166-52966342)
chr4 (167-352)||(28495430-28495615)
chr4 (167-392)||(13548986-13549209)
chr4 (100-216)||(49489880-49489996)
chr4 (167-392)||(18872723-18872947)
chr4 (167-392)||(26889708-26889930)
chr4 (146-327)||(20180703-20180883)
chr4 (167-350)||(6656552-6656733)
chr4 (171-392)||(8418156-8418377)
chr4 (249-352)||(36040849-36040953)
chr4 (183-392)||(53564179-53564387)
chr4 (146-245)||(6807499-6807598)
chr4 (167-391)||(23390155-23390378)
chr4 (100-216)||(39879919-39880035)
chr4 (146-216)||(55777075-55777145)
chr4 (146-216)||(55841255-55841325)
chr4 (168-392)||(6629284-6629503)
chr4 (146-308)||(3168221-3168380)
chr4 (225-344)||(5734542-5734661)
chr4 (167-347)||(13138777-13138956)
chr4 (167-327)||(47109627-47109786)
chr4 (168-352)||(48801427-48801610)
chr4 (183-352)||(17467937-17468102)
chr4 (161-347)||(31071749-31071932)
chr4 (198-352)||(20286096-20286249)
chr4 (146-352)||(36211304-36211509)
chr4 (231-313)||(53906102-53906184)
chr4 (231-388)||(18879511-18879664)
chr4 (167-352)||(29508851-29509035)
chr4 (469-571)||(53941022-53941126)
chr4 (248-392)||(39797440-39797584)
chr4 (167-350)||(41333857-41334039)
chr4 (183-352)||(52181009-52181175)
chr4 (146-216)||(4143569-4143639)
chr4 (278-385)||(23621472-23621578)
chr4 (167-347)||(32684648-32684825)
chr4 (167-391)||(35909648-35909872)
chr4 (167-352)||(20783234-20783416)
chr4 (267-352)||(11469142-11469227)
chr4 (267-352)||(11522234-11522319)
chr4 (168-392)||(21265226-21265448)
chr4 (231-332)||(51787598-51787699)
chr4 (146-216)||(27009626-27009698)
chr4 (276-392)||(46481303-46481420)
chr4 (171-313)||(10497451-10497593)
chr4 (183-352)||(6595556-6595724)
chr4 (100-352)||(51329521-51329757)
chr4 (177-349)||(26169770-26169941)
chr4 (274-391)||(38319612-38319729)
chr4 (248-392)||(24073013-24073157)
chr4 (167-392)||(37780022-37780244)
chr4 (167-271)||(42598519-42598621)
chr4 (147-200)||(48148710-48148763)
chr4 (177-284)||(706659-706766)
chr4 (177-284)||(729851-729958)
chr4 (167-392)||(3085451-3085672)
chr4 (167-387)||(30010659-30010876)
chr4 (231-388)||(25924502-25924659)
chr4 (248-384)||(38613420-38613557)
chr4 (167-286)||(19596248-19596366)
chr4 (167-214)||(54158710-54158757)
chr4 (187-310)||(49613987-49614108)
chr4 (183-227)||(50649096-50649140)
chr4 (260-351)||(7205194-7205284)
chr4 (177-288)||(26186516-26186627)
chr4 (167-213)||(7776751-7776797)
chr4 (233-326)||(7326036-7326133)
chr4 (305-352)||(2738832-2738879)
chr4 (97-132)||(4415962-4415997)
chr4 (361-392)||(30771534-30771565)
chr4 (97-132)||(46949989-46950024)
chr4 (168-256)||(5840103-5840188)
chr4 (98-132)||(18872715-18872749)
chr4 (98-132)||(20455186-20455220)
chr4 (98-132)||(21265218-21265252)
chr4 (177-283)||(22130324-22130429)
chr4 (167-213)||(24072289-24072335)
chr4 (98-132)||(32899223-32899257)
chr4 (168-210)||(38616016-38616058)
chr4 (98-132)||(39797432-39797466)
chr4 (183-245)||(50621563-50621624)
chr4 (273-327)||(55967944-55967998)
chr4 (167-213)||(55969007-55969053)
chr4 (267-352)||(15496177-15496262)
chr4 (99-132)||(28501391-28501424)
chr4 (99-132)||(41334058-41334091)
chr4 (99-132)||(49793090-49793123)
chr4 (248-313)||(50622480-50622545)
chr4 (99-132)||(52181191-52181224)
chr4 (99-132)||(56432517-56432550)
[»] chr2 (182 HSPs)
chr2 (469-732)||(8783692-8783950)
chr2 (100-392)||(11865026-11865320)
chr2 (98-392)||(45628618-45628910)
chr2 (103-392)||(26322035-26322324)
chr2 (100-392)||(1142997-1143289)
chr2 (100-392)||(24345423-24345715)
chr2 (98-392)||(19353197-19353491)
chr2 (97-389)||(7418503-7418795)
chr2 (146-392)||(24973804-24974052)
chr2 (100-392)||(12889949-12890239)
chr2 (149-392)||(38121299-38121542)
chr2 (100-392)||(40607708-40608000)
chr2 (147-349)||(5255583-5255784)
chr2 (146-392)||(10399247-10399493)
chr2 (153-392)||(18374495-18374735)
chr2 (100-392)||(31751075-31751370)
chr2 (146-392)||(34883633-34883879)
chr2 (99-392)||(40788828-40789119)
chr2 (146-392)||(32120950-32121196)
chr2 (100-392)||(8912615-8912905)
chr2 (146-392)||(3060406-3060652)
chr2 (146-392)||(36130813-36131059)
chr2 (100-392)||(2199984-2200277)
chr2 (96-392)||(23788975-23789270)
chr2 (146-392)||(8716677-8716923)
chr2 (146-392)||(13197430-13197676)
chr2 (146-392)||(15404493-15404738)
chr2 (146-392)||(20252216-20252462)
chr2 (146-392)||(34062450-34062696)
chr2 (146-392)||(41450522-41450768)
chr2 (145-386)||(1943586-1943827)
chr2 (146-391)||(20727643-20727888)
chr2 (146-391)||(37229447-37229692)
chr2 (146-391)||(40680734-40680979)
chr2 (100-392)||(23465142-23465431)
chr2 (97-392)||(15227887-15228180)
chr2 (100-391)||(28840646-28840935)
chr2 (183-347)||(43701021-43701185)
chr2 (100-392)||(2060322-2060614)
chr2 (146-392)||(25624739-25624981)
chr2 (146-352)||(19318840-19319046)
chr2 (146-392)||(5664644-5664890)
chr2 (100-391)||(34113538-34113823)
chr2 (146-392)||(25523506-25523751)
chr2 (100-392)||(2438231-2438522)
chr2 (146-392)||(8990210-8990456)
chr2 (146-392)||(16669632-16669878)
chr2 (146-392)||(41967989-41968233)
chr2 (98-344)||(45474369-45474615)
chr2 (146-384)||(7531617-7531853)
chr2 (100-392)||(16805531-16805822)
chr2 (146-352)||(18375238-18375444)
chr2 (100-392)||(22897397-22897688)
chr2 (96-388)||(39833735-39834026)
chr2 (97-392)||(1359797-1360091)
chr2 (97-392)||(16108212-16108506)
chr2 (99-352)||(22182663-22182914)
chr2 (105-397)||(16456617-16456908)
chr2 (100-392)||(16844813-16845103)
chr2 (146-392)||(4711734-4711978)
chr2 (147-385)||(7666291-7666529)
chr2 (98-392)||(41003949-41004241)
chr2 (99-352)||(1748380-1748633)
chr2 (164-392)||(8782472-8782700)
chr2 (99-392)||(8841396-8841688)
chr2 (107-392)||(17408041-17408325)
chr2 (100-346)||(19034465-19034708)
chr2 (146-352)||(38214526-38214730)
chr2 (100-392)||(7491850-7492141)
chr2 (146-392)||(11851973-11852216)
chr2 (146-392)||(17665529-17665774)
chr2 (147-389)||(5070318-5070557)
chr2 (151-352)||(15435667-15435867)
chr2 (146-392)||(42629377-42629616)
chr2 (160-392)||(7116099-7116330)
chr2 (146-313)||(7933505-7933672)
chr2 (100-392)||(27560212-27560503)
chr2 (146-391)||(1859554-1859799)
chr2 (140-392)||(20643488-20643738)
chr2 (100-313)||(30779740-30779953)
chr2 (100-351)||(40680404-40680652)
chr2 (146-389)||(9697927-9698169)
chr2 (146-350)||(13336542-13336744)
chr2 (146-347)||(36021035-36021235)
chr2 (160-392)||(11201689-11201920)
chr2 (147-383)||(29239380-29239615)
chr2 (147-392)||(44573675-44573913)
chr2 (100-352)||(11385909-11386159)
chr2 (100-392)||(34944158-34944443)
chr2 (146-320)||(6007650-6007824)
chr2 (146-352)||(32712571-32712775)
chr2 (146-351)||(19630976-19631179)
chr2 (146-351)||(19827877-19828080)
chr2 (146-348)||(41834456-41834659)
chr2 (180-319)||(3670309-3670448)
chr2 (146-352)||(15917865-15918070)
chr2 (146-392)||(30466111-30466377)
chr2 (98-389)||(8295330-8295608)
chr2 (147-383)||(12619822-12620060)
chr2 (234-392)||(26334717-26334876)
chr2 (147-352)||(15571232-15571436)
chr2 (146-392)||(12360463-12360706)
chr2 (100-290)||(40173142-40173332)
chr2 (146-347)||(8030804-8030992)
chr2 (146-350)||(23083541-23083749)
chr2 (146-328)||(15353249-15353426)
chr2 (183-403)||(31633670-31633891)
chr2 (230-392)||(32511027-32511187)
chr2 (98-287)||(44436222-44436411)
chr2 (142-352)||(45151794-45152006)
chr2 (99-313)||(1422162-1422374)
chr2 (161-392)||(29830556-29830785)
chr2 (231-352)||(10757848-10757969)
chr2 (146-347)||(16809002-16809201)
chr2 (146-347)||(16848283-16848482)
chr2 (146-383)||(9040892-9041128)
chr2 (167-388)||(18970536-18970756)
chr2 (167-392)||(28566157-28566381)
chr2 (167-390)||(30857946-30858168)
chr2 (220-352)||(12873035-12873167)
chr2 (183-392)||(41494445-41494653)
chr2 (167-391)||(36750691-36750914)
chr2 (184-392)||(41422518-41422725)
chr2 (166-392)||(3095305-3095530)
chr2 (171-389)||(12969520-12969738)
chr2 (167-392)||(9701076-9701300)
chr2 (190-350)||(13215649-13215808)
chr2 (231-318)||(7446945-7447032)
chr2 (185-352)||(43700663-43700833)
chr2 (162-321)||(7461290-7461446)
chr2 (8-76)||(8784076-8784144)
chr2 (171-346)||(11083496-11083671)
chr2 (167-352)||(2788145-2788328)
chr2 (167-385)||(6028355-6028572)
chr2 (161-348)||(29830817-29831002)
chr2 (234-347)||(44017791-44017904)
chr2 (167-392)||(34432008-34432231)
chr2 (146-216)||(16636408-16636478)
chr2 (180-349)||(6650975-6651144)
chr2 (147-327)||(18223686-18223867)
chr2 (150-271)||(8867712-8867829)
chr2 (168-352)||(40544370-40544555)
chr2 (289-392)||(44436749-44436852)
chr2 (167-320)||(3904524-3904677)
chr2 (168-352)||(44417445-44417631)
chr2 (177-345)||(26273372-26273540)
chr2 (167-392)||(30830150-30830373)
chr2 (171-286)||(11121096-11121211)
chr2 (171-381)||(12296238-12296448)
chr2 (292-384)||(24300282-24300374)
chr2 (146-198)||(26334670-26334722)
chr2 (167-325)||(21838690-21838846)
chr2 (183-348)||(12873559-12873719)
chr2 (140-347)||(22302566-22302774)
chr2 (167-351)||(11944445-11944628)
chr2 (8-67)||(8778950-8779009)
chr2 (168-326)||(18294065-18294220)
chr2 (258-348)||(4897640-4897730)
chr2 (258-348)||(4945034-4945124)
chr2 (247-321)||(7457310-7457384)
chr2 (166-216)||(16807067-16807117)
chr2 (166-216)||(16846348-16846398)
chr2 (147-213)||(32511185-32511251)
chr2 (180-313)||(40348225-40348355)
chr2 (167-392)||(4408584-4408809)
chr2 (168-352)||(36556204-36556391)
chr2 (179-285)||(8056070-8056175)
chr2 (172-327)||(14493626-14493779)
chr2 (248-348)||(15079298-15079397)
chr2 (179-336)||(25888339-25888497)
chr2 (96-132)||(25523496-25523532)
chr2 (96-132)||(31751065-31751101)
chr2 (190-286)||(40544651-40544746)
chr2 (98-132)||(2199976-2200010)
chr2 (98-132)||(23083513-23083547)
chr2 (98-132)||(41422510-41422544)
chr2 (171-216)||(4897464-4897509)
chr2 (171-216)||(4944858-4944903)
chr2 (99-132)||(12890213-12890246)
chr2 (99-132)||(26322298-26322331)
chr2 (99-132)||(29830759-29830792)
chr2 (99-132)||(41494627-41494660)
[»] chr5 (176 HSPs)
chr5 (100-351)||(9268032-9268283)
chr5 (100-392)||(40643100-40643392)
chr5 (147-392)||(22657774-22658019)
chr5 (100-352)||(9064953-9065205)
chr5 (146-352)||(7734880-7735086)
chr5 (146-389)||(14619258-14619501)
chr5 (98-391)||(39121427-39121720)
chr5 (100-392)||(35547267-35547559)
chr5 (100-392)||(43060150-43060442)
chr5 (151-392)||(8283898-8284138)
chr5 (99-392)||(7940458-7940749)
chr5 (146-383)||(32617561-32617797)
chr5 (146-392)||(22527698-22527944)
chr5 (146-392)||(27873130-27873376)
chr5 (149-392)||(19571726-19571970)
chr5 (146-392)||(1265955-1266201)
chr5 (100-391)||(20186508-20186799)
chr5 (102-351)||(21749977-21750226)
chr5 (146-392)||(39984776-39985023)
chr5 (99-394)||(4194686-4194977)
chr5 (146-352)||(9264019-9264225)
chr5 (100-352)||(10511211-10511462)
chr5 (146-392)||(6673013-6673259)
chr5 (146-348)||(14649235-14649437)
chr5 (100-389)||(23285044-23285335)
chr5 (99-313)||(8144458-8144672)
chr5 (146-392)||(25600845-25601091)
chr5 (146-392)||(28041136-28041382)
chr5 (146-392)||(31888899-31889145)
chr5 (146-392)||(32478144-32478390)
chr5 (150-392)||(34662210-34662452)
chr5 (146-391)||(3686539-3686784)
chr5 (146-391)||(16153040-16153285)
chr5 (190-392)||(20987754-20987955)
chr5 (100-392)||(20142000-20142290)
chr5 (100-388)||(34332227-34332516)
chr5 (146-352)||(12743870-12744076)
chr5 (147-345)||(31507407-31507605)
chr5 (146-392)||(15190600-15190846)
chr5 (146-392)||(21239105-21239351)
chr5 (100-352)||(41418356-41418606)
chr5 (98-392)||(4976026-4976321)
chr5 (146-352)||(17674443-17674649)
chr5 (98-392)||(16440937-16441229)
chr5 (98-381)||(40951780-40952063)
chr5 (147-392)||(4753004-4753249)
chr5 (100-392)||(14913654-14913945)
chr5 (99-392)||(20987953-20988244)
chr5 (147-392)||(42561135-42561380)
chr5 (99-392)||(23092378-23092671)
chr5 (146-348)||(28140705-28140907)
chr5 (100-392)||(9828399-9828690)
chr5 (146-352)||(10734306-10734512)
chr5 (146-332)||(15774848-15775034)
chr5 (146-352)||(34889063-34889269)
chr5 (146-392)||(4984901-4985147)
chr5 (146-392)||(5527980-5528226)
chr5 (146-392)||(13862780-13863026)
chr5 (146-392)||(15521727-15521973)
chr5 (146-392)||(23285862-23286107)
chr5 (100-392)||(9020700-9020991)
chr5 (146-392)||(11780770-11781006)
chr5 (146-392)||(41641101-41641351)
chr5 (107-392)||(3497547-3497831)
chr5 (146-392)||(32964139-32964382)
chr5 (100-392)||(3028019-3028313)
chr5 (146-392)||(7951568-7951812)
chr5 (146-392)||(24307926-24308171)
chr5 (146-392)||(24365152-24365397)
chr5 (98-392)||(16127265-16127558)
chr5 (147-392)||(40004196-40004440)
chr5 (147-392)||(13759235-13759478)
chr5 (146-383)||(18615847-18616088)
chr5 (100-351)||(20517892-20518139)
chr5 (100-307)||(37034238-37034443)
chr5 (99-392)||(41383911-41384203)
chr5 (98-392)||(13660867-13661158)
chr5 (99-391)||(39758899-39759186)
chr5 (147-391)||(38371760-38372005)
chr5 (98-313)||(14435887-14436102)
chr5 (146-352)||(35039043-35039249)
chr5 (99-392)||(23286220-23286505)
chr5 (98-347)||(186149-186397)
chr5 (146-391)||(3160312-3160557)
chr5 (98-281)||(30182958-30183140)
chr5 (190-352)||(12806692-12806854)
chr5 (146-392)||(40738416-40738661)
chr5 (146-352)||(17714610-17714820)
chr5 (146-352)||(31158213-31158415)
chr5 (161-392)||(32147300-32147529)
chr5 (146-351)||(13703595-13703797)
chr5 (146-389)||(33639300-33639542)
chr5 (146-347)||(14789604-14789804)
chr5 (146-327)||(17592587-17592767)
chr5 (560-732)||(18652510-18652682)
chr5 (100-352)||(22581475-22581726)
chr5 (146-389)||(38161566-38161808)
chr5 (146-383)||(26605401-26605644)
chr5 (167-387)||(25837019-25837238)
chr5 (237-352)||(26674480-26674595)
chr5 (237-352)||(26946086-26946201)
chr5 (146-392)||(14570676-14570921)
chr5 (147-255)||(42030385-42030493)
chr5 (226-392)||(26894739-26894904)
chr5 (167-392)||(41686922-41687143)
chr5 (156-392)||(14571293-14571526)
chr5 (167-392)||(39971020-39971244)
chr5 (469-590)||(42887139-42887262)
chr5 (142-325)||(12098634-12098816)
chr5 (98-218)||(26889591-26889711)
chr5 (231-391)||(39180468-39180628)
chr5 (146-352)||(8100179-8100384)
chr5 (167-392)||(16926458-16926682)
chr5 (183-352)||(24170179-24170348)
chr5 (167-392)||(23259945-23260169)
chr5 (167-392)||(24857562-24857785)
chr5 (183-392)||(31642193-31642401)
chr5 (167-391)||(31657692-31657914)
chr5 (167-392)||(8949818-8950045)
chr5 (179-348)||(37206169-37206338)
chr5 (168-385)||(16284998-16285214)
chr5 (147-319)||(9438877-9439051)
chr5 (167-352)||(11432356-11432546)
chr5 (167-352)||(5283094-5283277)
chr5 (183-392)||(15559539-15559751)
chr5 (147-348)||(26076175-26076375)
chr5 (168-388)||(21069647-21069866)
chr5 (183-349)||(6328626-6328791)
chr5 (167-387)||(13235953-13236169)
chr5 (258-347)||(13735701-13735789)
chr5 (183-349)||(1303400-1303563)
chr5 (168-392)||(18251020-18251249)
chr5 (277-388)||(30182093-30182204)
chr5 (183-352)||(28414507-28414675)
chr5 (171-348)||(37700143-37700320)
chr5 (231-327)||(20187151-20187247)
chr5 (167-320)||(3628980-3629132)
chr5 (248-392)||(4902813-4902949)
chr5 (168-352)||(35784728-35784908)
chr5 (146-262)||(15674913-15675027)
chr5 (98-190)||(20988250-20988342)
chr5 (167-313)||(27834029-27834174)
chr5 (171-348)||(13335338-13335514)
chr5 (146-213)||(13958637-13958704)
chr5 (168-349)||(39692462-39692640)
chr5 (179-347)||(16099279-16099448)
chr5 (146-397)||(8356325-8356580)
chr5 (146-191)||(12807129-12807174)
chr5 (179-348)||(30117163-30117333)
chr5 (146-213)||(4902966-4903033)
chr5 (171-348)||(10116630-10116809)
chr5 (171-290)||(26699424-26699543)
chr5 (171-290)||(26969157-26969276)
chr5 (142-216)||(2328404-2328478)
chr5 (147-216)||(11937204-11937273)
chr5 (187-392)||(16636825-16637032)
chr5 (150-215)||(39181902-39181967)
chr5 (168-216)||(7408878-7408926)
chr5 (140-216)||(35495050-35495126)
chr5 (147-218)||(10561245-10561316)
chr5 (167-213)||(7001486-7001532)
chr5 (98-132)||(32964131-32964165)
chr5 (147-209)||(37330994-37331056)
chr5 (248-313)||(21591812-21591877)
chr5 (248-313)||(21595929-21595994)
chr5 (171-224)||(33818837-33818890)
chr5 (191-223)||(32719092-32719124)
chr5 (97-132)||(3028010-3028045)
chr5 (97-132)||(23260143-23260178)
chr5 (98-132)||(7940450-7940484)
chr5 (248-313)||(7956568-7956633)
chr5 (99-132)||(8949811-8949844)
chr5 (99-132)||(14435829-14435862)
chr5 (99-132)||(20142264-20142297)
chr5 (97-126)||(39971011-39971040)
chr5 (613-654)||(42887264-42887305)
[»] scaffold0250 (1 HSPs)
scaffold0250 (98-392)||(9164-9457)
[»] chr7 (190 HSPs)
chr7 (97-392)||(9140269-9140564)
chr7 (100-391)||(28016285-28016575)
chr7 (99-389)||(43081261-43081550)
chr7 (147-391)||(37913084-37913326)
chr7 (146-392)||(39871398-39871644)
chr7 (100-392)||(27529235-27529524)
chr7 (100-392)||(35569393-35569682)
chr7 (100-392)||(12930324-12930616)
chr7 (161-352)||(43440910-43441101)
chr7 (146-392)||(32872160-32872406)
chr7 (146-392)||(41025881-41026127)
chr7 (100-392)||(2289755-2290047)
chr7 (100-347)||(27881827-27882074)
chr7 (146-392)||(8290909-8291155)
chr7 (146-392)||(25247476-25247721)
chr7 (146-392)||(31458003-31458249)
chr7 (146-392)||(34978862-34979108)
chr7 (146-392)||(36697916-36698162)
chr7 (146-392)||(40300236-40300482)
chr7 (99-390)||(41803208-41803500)
chr7 (146-382)||(9998303-9998539)
chr7 (99-391)||(43279712-43280001)
chr7 (146-392)||(1275518-1275764)
chr7 (146-392)||(6387331-6387577)
chr7 (146-392)||(36646422-36646668)
chr7 (146-392)||(39197724-39197970)
chr7 (146-383)||(8612360-8612597)
chr7 (140-352)||(30895606-30895818)
chr7 (100-392)||(4856812-4857107)
chr7 (100-334)||(26842828-26843069)
chr7 (94-349)||(30737745-30738001)
chr7 (146-392)||(29285822-29286068)
chr7 (146-384)||(29642929-29643166)
chr7 (146-392)||(33858652-33858897)
chr7 (99-392)||(21295157-21295449)
chr7 (146-381)||(29064242-29064477)
chr7 (100-384)||(47323268-47323552)
chr7 (146-392)||(7607419-7607663)
chr7 (110-348)||(10475751-10475989)
chr7 (146-391)||(11647621-11647864)
chr7 (146-392)||(32814439-32814685)
chr7 (99-392)||(1574725-1575016)
chr7 (146-391)||(31200149-31200394)
chr7 (146-352)||(787979-788185)
chr7 (146-392)||(7449276-7449520)
chr7 (98-392)||(19920569-19920860)
chr7 (146-392)||(26255102-26255347)
chr7 (146-392)||(44547432-44547678)
chr7 (149-392)||(18112955-18113197)
chr7 (146-392)||(42298213-42298457)
chr7 (146-351)||(7703606-7703810)
chr7 (146-384)||(17491529-17491767)
chr7 (146-384)||(17561447-17561685)
chr7 (146-392)||(41252147-41252392)
chr7 (146-392)||(48521035-48521278)
chr7 (146-383)||(21870121-21870358)
chr7 (140-351)||(38736499-38736707)
chr7 (100-352)||(26736526-26736784)
chr7 (146-392)||(45907251-45907495)
chr7 (146-351)||(2006522-2006727)
chr7 (146-392)||(38858304-38858549)
chr7 (147-392)||(36711085-36711329)
chr7 (99-392)||(32759562-32759855)
chr7 (100-389)||(41444211-41444500)
chr7 (140-313)||(12130133-12130304)
chr7 (97-392)||(29176989-29177283)
chr7 (146-392)||(41002940-41003185)
chr7 (147-392)||(43093194-43093440)
chr7 (100-352)||(6799285-6799535)
chr7 (192-392)||(46414835-46415036)
chr7 (100-392)||(23919738-23920028)
chr7 (146-312)||(24299989-24300155)
chr7 (98-348)||(23364064-23364314)
chr7 (146-383)||(47657451-47657686)
chr7 (147-392)||(25950837-25951083)
chr7 (146-392)||(9299103-9299352)
chr7 (98-325)||(23109140-23109367)
chr7 (147-352)||(19619080-19619284)
chr7 (100-313)||(17326956-17327169)
chr7 (98-350)||(28060766-28061016)
chr7 (146-328)||(44780178-44780358)
chr7 (146-392)||(7400135-7400383)
chr7 (100-384)||(9036669-9036952)
chr7 (146-392)||(9303652-9303901)
chr7 (146-349)||(23320700-23320907)
chr7 (146-392)||(34012304-34012548)
chr7 (146-352)||(48008980-48009188)
chr7 (146-399)||(3024583-3024833)
chr7 (147-392)||(21119563-21119809)
chr7 (146-388)||(46266161-46266401)
chr7 (151-347)||(41787302-41787495)
chr7 (146-392)||(44719133-44719374)
chr7 (146-392)||(31581683-31581930)
chr7 (146-388)||(38361161-38361400)
chr7 (100-320)||(38428225-38428444)
chr7 (231-392)||(17317447-17317608)
chr7 (219-391)||(26299323-26299494)
chr7 (249-392)||(31769220-31769363)
chr7 (146-302)||(20950824-20950978)
chr7 (146-304)||(16957729-16957886)
chr7 (148-352)||(7400508-7400712)
chr7 (146-341)||(17878162-17878346)
chr7 (146-352)||(5524783-5524989)
chr7 (147-392)||(18751774-18752013)
chr7 (167-392)||(19845474-19845700)
chr7 (167-392)||(30534711-30534933)
chr7 (161-352)||(34895903-34896094)
chr7 (167-392)||(42887887-42888111)
chr7 (147-342)||(10538917-10539116)
chr7 (146-269)||(27325953-27326076)
chr7 (146-352)||(47534689-47534894)
chr7 (251-392)||(12616273-12616414)
chr7 (146-282)||(21870877-21871013)
chr7 (148-392)||(27813502-27813749)
chr7 (97-392)||(29629722-29630015)
chr7 (247-352)||(10071260-10071365)
chr7 (146-265)||(32118010-32118127)
chr7 (225-352)||(9233440-9233567)
chr7 (100-236)||(33381358-33381494)
chr7 (147-392)||(45778005-45778253)
chr7 (167-392)||(31802929-31803151)
chr7 (167-392)||(9682608-9682831)
chr7 (167-392)||(49044927-49045151)
chr7 (155-326)||(2470870-2471041)
chr7 (184-392)||(44510168-44510374)
chr7 (183-352)||(32964218-32964386)
chr7 (190-392)||(19292845-19293045)
chr7 (188-327)||(3796058-3796197)
chr7 (146-352)||(22991531-22991735)
chr7 (189-390)||(24210979-24211177)
chr7 (167-352)||(32699513-32699695)
chr7 (167-392)||(35888318-35888540)
chr7 (100-392)||(40120994-40121289)
chr7 (167-351)||(24504731-24504914)
chr7 (167-351)||(45722054-45722237)
chr7 (167-391)||(2345350-2345573)
chr7 (147-271)||(21587534-21587658)
chr7 (281-392)||(33381494-33381604)
chr7 (140-213)||(12616190-12616263)
chr7 (167-392)||(12631620-12631847)
chr7 (147-327)||(49110813-49110993)
chr7 (167-351)||(3775870-3776059)
chr7 (190-349)||(3881371-3881529)
chr7 (171-290)||(28017051-28017170)
chr7 (183-385)||(8782033-8782237)
chr7 (231-348)||(3478821-3478938)
chr7 (167-352)||(23801990-23802173)
chr7 (183-385)||(37915156-37915356)
chr7 (167-275)||(21135371-21135478)
chr7 (170-392)||(33682720-33682938)
chr7 (97-213)||(20075031-20075147)
chr7 (183-352)||(43934637-43934803)
chr7 (167-347)||(19497292-19497475)
chr7 (225-308)||(32811295-32811378)
chr7 (183-313)||(33683007-33683136)
chr7 (178-312)||(32526001-32526134)
chr7 (264-392)||(32643658-32643788)
chr7 (156-213)||(34900775-34900832)
chr7 (179-286)||(20182099-20182204)
chr7 (300-392)||(20074895-20074987)
chr7 (168-311)||(46415103-46415244)
chr7 (171-245)||(31137214-31137288)
chr7 (177-286)||(33342249-33342356)
chr7 (146-211)||(10071852-10071917)
chr7 (167-327)||(34693471-34693631)
chr7 (251-348)||(43008144-43008240)
chr7 (231-327)||(40299187-40299282)
chr7 (146-206)||(43008300-43008360)
chr7 (167-271)||(47648985-47649088)
chr7 (167-213)||(6910622-6910668)
chr7 (98-132)||(46415010-46415044)
chr7 (171-388)||(2087096-2087316)
chr7 (307-380)||(12129695-12129768)
chr7 (308-392)||(21135282-21135367)
chr7 (259-384)||(30866416-30866541)
chr7 (97-132)||(2290021-2290056)
chr7 (96-127)||(6799556-6799587)
chr7 (167-222)||(21295638-21295692)
chr7 (266-309)||(23109101-23109144)
chr7 (98-132)||(27813494-27813528)
chr7 (171-213)||(30866184-30866226)
chr7 (183-213)||(32643627-32643657)
chr7 (164-206)||(34037502-34037544)
chr7 (98-132)||(35888310-35888344)
chr7 (99-132)||(1574718-1574751)
chr7 (140-177)||(2785163-2785200)
chr7 (99-132)||(33381578-33381611)
chr7 (99-132)||(34012522-34012555)
chr7 (91-132)||(38858289-38858330)
chr7 (99-132)||(42541864-42541897)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (98-352)||(19696-19951)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (99-388)||(93795-94084)
scaffold0039 (101-392)||(103804-104092)
[»] scaffold0237 (2 HSPs)
scaffold0237 (99-392)||(6350-6640)
scaffold0237 (99-132)||(6614-6647)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (100-392)||(3444-3735)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (100-392)||(164220-164510)
scaffold0020 (99-132)||(164213-164246)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (100-392)||(18503-18793)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (100-392)||(5157-5446)
[»] scaffold0649 (1 HSPs)
scaffold0649 (96-392)||(4033-4329)
[»] scaffold0549 (1 HSPs)
scaffold0549 (100-392)||(9924-10213)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (98-384)||(355040-355324)
scaffold0002 (160-216)||(92360-92416)
[»] scaffold0883 (1 HSPs)
scaffold0883 (147-392)||(1726-1971)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (146-391)||(31472-31717)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (147-392)||(45519-45764)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (146-392)||(51467-51713)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (147-392)||(258908-259153)
[»] scaffold0339 (1 HSPs)
scaffold0339 (147-392)||(6926-7171)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (99-392)||(12071-12362)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (146-392)||(45678-45921)
[»] scaffold0308 (2 HSPs)
scaffold0308 (146-392)||(14134-14379)
scaffold0308 (146-352)||(5071-5277)
[»] scaffold0457 (1 HSPs)
scaffold0457 (99-392)||(4403-4694)
[»] scaffold0907 (1 HSPs)
scaffold0907 (100-351)||(4316-4565)
[»] scaffold0604 (1 HSPs)
scaffold0604 (100-392)||(3525-3813)
[»] scaffold0368 (1 HSPs)
scaffold0368 (146-392)||(8224-8469)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (100-392)||(47646-47937)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (146-392)||(61638-61882)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (146-392)||(24417-24661)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (146-392)||(117852-118097)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (149-352)||(4808-5008)
scaffold0443 (286-352)||(4726-4792)
[»] scaffold0202 (1 HSPs)
scaffold0202 (146-321)||(9539-9714)
[»] scaffold0576 (1 HSPs)
scaffold0576 (99-392)||(284-575)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (99-392)||(48660-48952)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (100-392)||(65378-65668)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (146-391)||(24224-24460)
[»] scaffold0163 (2 HSPs)
scaffold0163 (220-392)||(1306-1477)
scaffold0163 (99-132)||(1451-1484)
[»] scaffold0280 (3 HSPs)
scaffold0280 (99-245)||(13302-13448)
scaffold0280 (190-352)||(8410-8571)
scaffold0280 (146-190)||(8092-8136)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (100-283)||(40606-40789)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (146-271)||(18481-18606)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (167-392)||(17470-17694)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (146-347)||(34156-34354)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (167-392)||(246462-246685)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (146-387)||(156187-156428)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (231-351)||(9536-9656)
scaffold0311 (146-213)||(9069-9136)
[»] scaffold0086 (2 HSPs)
scaffold0086 (147-346)||(32950-33148)
scaffold0086 (168-218)||(22069-22119)
[»] scaffold0294 (1 HSPs)
scaffold0294 (167-348)||(11469-11646)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (167-392)||(36172-36394)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (179-313)||(5494-5627)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (171-271)||(56051-56151)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (171-327)||(47226-47382)
[»] scaffold2116 (1 HSPs)
scaffold2116 (301-352)||(1-52)
[»] scaffold0472 (1 HSPs)
scaffold0472 (147-210)||(13112-13175)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (147-213)||(549-615)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (179-274)||(1953-2050)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (168-212)||(689-733)
scaffold0407 (168-212)||(7153-7197)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (160-216)||(13732-13788)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (167-213)||(25-71)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 187)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5162604 - 5162310
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5162604 tatactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 5162505  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5162504 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 5162405  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5162404 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 5162310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5774347 - 5774054
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5774347 tactacctccgtccctaattacaaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5774248  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat-aaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5774247 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatggaataggggcatgtatg 5774148  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5774147 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 5774054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 469 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 27851697 - 27851432
Alignment:
Q  469 caaacgggggatagaaatccctattacagcagttgtgagcatgtgactaaattgaatcggacaagactcaaaag--gtaatttgacccgttagagagcat 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  27851697 caaacgggggatagaaatccctattacatcagctgcgagcacgtgactaaattgagccggacaagactcaaaaattgtaatttcacccgttagagagcat 27851598  T
Q  567 ccaaaatttgctagagcatctgcacactggttagcttccctataagaatgcttcaccacaatctcccaatccagattaattaacctctcaatctcaaaaa 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27851597 ccaaaatttgctagagcatctgcacattggttagcttccctataagaatgcttcaccacaatctcccaatctagattaattaacctctgaatctcgaaaa 27851498  T
Q  667 ccaacgacctcccgctcgggctaccatgcccatttccattaatacaattagcaactactaaagaat 732  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27851497 ccaacgacctcccgctcgagctaccatgcccctttccattaatacaattcgcaactactaaagaat 27851432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 11482859 - 11483111
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11482859 tactacctccgtccctaattataagacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 11482958  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11482959 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 11483058  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11483059 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagtggtcttataaaaagggac 11483111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 16448492 - 16448744
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | |||||       |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448492 tactaccttcgtccctaattataaggctattttaaaaaaataacttgaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 16448591  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16448592 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 16448691  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448692 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 16448744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 44580615 - 44580910
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44580615 atactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 44580714  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag--aaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44580715 tacaattttatcctttaagagagatgaatggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaaaatgtataataaataggggcatgta 44580814  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44580815 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 44580910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 18641115 - 18641411
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||       ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18641115 atactatctccgtcactaattataagacctttttaaaaaaataataggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 18641214  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  18641215 tataattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttaaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggttatgtatg 18641314  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac---nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||           ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18641315 taaagaaataattaatttagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaaagggaccaaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 18641411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 32522584 - 32522874
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32522584 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32522683  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32522684 acaattttatcctttaagagagag--ttggcttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 32522781  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32522782 aaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagcgacggag 32522874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23487362 - 23487070
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487362 tatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 23487263  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23487262 ttacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtat 23487165  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23487164 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 23487070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 103 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 24992810 - 24992531
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||   |||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24992810 tacctccgtccctaattataaggttattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 24992711  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24992710 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagcatgaatgtaaa 24992611  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
     |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||    
T  24992610 aaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaacggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataatt 24992531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 8072914 - 8073160
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8072914 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacat 8073013  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  8073014 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacagatcttataaa 8073113  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       | ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8073114 aagggacaaatttttctctcaaaagggtcttataactagggacggag 8073160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 18111714 - 18112006
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111714 tatactacctctgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 18111813  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18111814 ttacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 18111911  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18111912 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggag 18112006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 23687905 - 23688196
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23687905 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 23688004  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23688005 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 23688102  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23688103 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 23688196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38967442 - 38967189
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38967442 atactacctccgttcctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttt 38967343  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  38967342 tacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatg 38967243  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38967242 taaagaaataattcatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggac 38967189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 155 - 392
Target Start/End: Original strand, 44748257 - 44748494
Alignment:
Q  155 tagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat 254  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44748257 tagtggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat 44748356  T
Q  255 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnn 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||      
T  44748357 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaa 44748456  T
Q  355 nnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  44748457 aaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggag 44748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 44021258 - 44021055
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44021258 gaattaagatagtggatatttatattaaatacgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacat 44021159  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44021158 tctatttattgctgattgaagaaaaatatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaa 44021059  T
Q  346 aagg 349  Q
    ||||    
T  44021058 aagg 44021055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 50880 - 51126
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  50880 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 50979  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  50980 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 51079  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51080 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 51126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 104 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40785184 - 40784897
Alignment:
Q  104 acctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40785184 acctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaa 40785085  T
Q  204 ttttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 303  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40785084 ttttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttacttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 40784985  T
Q  304 aaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40784984 aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 40784897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 32675542 - 32675788
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  32675542 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 32675641  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  32675642 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 32675741  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32675742 aagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 32675788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 44747298 - 44747098
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44747298 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttggcttatgttttcaacatt 44747199  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44747198 ctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaa 44747100  T
Q  347 ag 348  Q
    ||    
T  44747099 ag 44747098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 2944012 - 2944303
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2944012 atactccctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 2944111  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||    
T  2944112 tacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatatataataaataggggcatgcatg 2944209  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2944210 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 2944303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 8948136 - 8948381
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8948136 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8948235  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8948236 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 8948335  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8948336 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 8948381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26016866 - 26016575
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26016866 atactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26016767  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  26016766 tacaattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatg 26016669  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26016668 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagcggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 26016575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 26980762 - 26981006
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||| |||||||||||||||    
T  26980762 gaattaagatagtggatattt-tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattggtttatgttttcaacat 26980860  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  26980861 gttatttattggtgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaa 26980960  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26980961 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcatataattagggacgga 26981006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18754397 - 18754150
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18754397 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacat 18754298  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtag-ttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||  ||| |||||||||||    
T  18754297 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttggaaataacaaaagggtcttataa 18754198  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18754197 aaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 18754150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 97 - 347
Target Start/End: Original strand, 257274 - 257524
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257274 ttatactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 257373  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  257374 cttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgta 257473  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  257474 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 257524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 97 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 658646 - 658396
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  658646 ttatactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 658547  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  658546 cttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgta 658447  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  658446 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 658396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 97 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 844382 - 844132
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  844382 ttatactacctccgtccctaattatagcacttttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 844283  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
     ||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  844282 cttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgta 844183  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  844182 tgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 844132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 8251718 - 8251964
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8251718 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8251817  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  8251818 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 8251917  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8251918 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 8251964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18455972 - 18455726
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18455972 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 18455873  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  18455872 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 18455773  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18455772 aagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggag 18455726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 28191960 - 28192206
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  28191960 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttatacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 28192059  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  28192060 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 28192159  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28192160 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 28192206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 5783885 - 5784179
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5783885 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 5783984  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || | |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5783985 tacaattttatccttttaagagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtat 5784084  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  5784085 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggag 5784179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39406858 - 39406565
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||       ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39406858 atactacctccgtccctaattatagaacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 39406759  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39406758 tacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatattttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatg 39406659  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  39406658 taaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttatcaaaaaggtcttataattaaggacggag 39406565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13154225 - 13153934
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  13154225 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 13154126  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154125 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 13154027  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154026 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 13153934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 8951213 - 8951459
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8951213 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttccaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8951312  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | ||||||||||    
T  8951313 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaa 8951412  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8951413 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 8951459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28579890 - 28579645
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||    
T  28579890 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgttt-taatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacat 28579792  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  28579791 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaa 28579692  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28579691 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 28579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34490769 - 34490523
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34490769 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 34490670  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  34490669 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 34490570  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  34490569 aagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggag 34490523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38878973 - 38878727
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  38878973 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 38878874  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  38878873 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 38878774  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38878773 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggag 38878727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 394
Target Start/End: Original strand, 33865329 - 33865574
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||   ||  |||||||||||||||     
T  33865329 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagataga--tgttttatgttttcaacatg 33865426  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  33865427 ctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaa 33865526  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagta 394  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33865527 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagta 33865574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44888979 - 44888686
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  44888979 atactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattatttt 44888880  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||| |||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||||    
T  44888879 tacaattttatcctttaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtgtaataaatagggtcatgtatg 44888780  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44888779 aaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 44888686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29598476 - 29598230
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  29598476 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 29598377  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||   ||||||||||    
T  29598376 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaatgtcttataaa 29598277  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29598276 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggag 29598230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 36176888 - 36177134
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||    
T  36176888 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacat 36176987  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36176988 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatctatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 36177087  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36177088 aagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 36177134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 38183351 - 38183596
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  38183351 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 38183450  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||     
T  38183451 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataat 38183550  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38183551 aaaggacaaaaaaaattctcaaaa-ggtcttataattagggacggag 38183596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34568741 - 34568496
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||     
T  34568741 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttattttatgttttcaacatg 34568642  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||| |    
T  34568641 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaacaagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataata 34568542  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568541 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 34568496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39029474 - 39029184
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39029474 atactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 39029375  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||   || | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  39029374 tacaattttatcctttaagagagaa--ttagtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatg 39029277  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39029276 taaagaaat-attaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaattttctcaaaagggtcttataattagggacggag 39029184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1774594 - 1774348
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  1774594 gaattaagatagtggatatatgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 1774495  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||  ||| | ||||||||||    
T  1774494 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaatcattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaa 1774395  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1774394 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 1774348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14699704 - 14699458
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  14699704 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgtttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 14699605  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  14699604 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 14699505  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14699504 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 14699458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 176 - 392
Target Start/End: Original strand, 29806038 - 29806253
Alignment:
Q  176 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatg 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29806038 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatg 29806137  T
Q  276 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| |    
T  29806138 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggttt 29806236  T
Q  376 tataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||    
T  29806237 tataattagggacggag 29806253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 4076424 - 4076181
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  4076424 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 4076325  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |||||||    
T  4076324 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtattataaa 4076225  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||        ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4076224 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggattttataattagggacg 4076181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 38780881 - 38781172
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38780881 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 38780980  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    | ||||| ||||||||| | ||||| |||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38780981 ataattt-atcctttaagagagaggattgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 38781079  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||  || |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38781080 aaagaaataattattgtggttggaaataggaaaggggtcttataaagagggacagaaaaaattctcaaaagggtcttataattatggacggag 38781172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 346
Target Start/End: Original strand, 7682777 - 7683022
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7682777 tactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 7682876  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||| | ||   |||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7682877 acaattttatcctttaaaga-gataattggtttatgttttcaacatgttatttatcgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgt 7682975  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  7682976 aaagaaataattaatgtagtcgaaaatagcaaaggggtcttataaaa 7683022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Original strand, 8797027 - 8797327
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgta--------attact 190  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||        ||||||    
T  8797027 atactacctccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttatatgtttataattact 8797126  T
Q  191 attgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 290  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  8797127 attgtttttacaattatatcctttaagagagagggttggtttattttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatcgg 8797226  T
Q  291 catgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgg 390  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8797227 catgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacgg 8797326  T
Q  391 a 391  Q
    |    
T  8797327 a 8797327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33980714 - 33980471
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||    
T  33980714 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacat 33980617  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  33980616 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaa 33980517  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  33980516 aagggac-aaaaaatttctcaaaaaagtcttataattagggacggag 33980471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 35504365 - 35504566
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  35504365 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 35504464  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  35504465 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 35504564  T
Q  346 aa 347  Q
    ||    
T  35504565 aa 35504566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 7683302 - 7683554
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7683302 atactacctccgtccataattataggacctttttaaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 7683401  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7683402 tacaattttatcctttaaaga-gagaattggtttatgttttcaacatgttatatatcgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 7683500  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  7683501 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 7683554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 8566499 - 8566255
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | |||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8566499 atactacatccgtccctaattatagg-ccattttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttt 8566401  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8566400 tacaattttatcctttatgagagag--ttggtttatgttttcaacatgtcatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtata 8566303  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  8566302 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8566255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Original strand, 36661711 - 36661914
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  36661711 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacat 36661810  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36661811 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatataaagaattaattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 36661910  T
Q  346 aagg 349  Q
    ||||    
T  36661911 aagg 36661914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 9035326 - 9035570
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  9035326 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 9035423  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9035424 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 9035523  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||  |||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9035524 aaaagacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggag 9035570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 150 - 392
Target Start/End: Original strand, 33745686 - 33745926
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattcta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| || | |||||||||||||||  ||    
T  33745686 taagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttgagaaaaagg-ttagtttatgttttcaacatgtta 33745784  T
Q  250 tttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  33745785 tttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagg 33745884  T
Q  350 gacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||        ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33745885 gacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattaggaacggag 33745926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40741564 - 40741271
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       | ||  ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  40741564 ttatactccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacg-gaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 40741466  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40741465 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgta 40741367  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40741366 tgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattagggacggag 40741271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41014756 - 41014510
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||| ||||||||||    
T  41014756 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatattttcaacat 41014657  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  41014656 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 41014557  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||         |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41014556 aaggaacaaaaaaaaatctcaaaaagatcttataattagggacggag 41014510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11798902 - 11798615
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | |   ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  11798902 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcatgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 11798803  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11798802 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 11798704  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11798703 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 11798615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 17856517 - 17856807
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  17856517 tactccctccgtccttaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 17856616  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||  ||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17856617 acaattttatcctt-aagagagatagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17856715  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17856716 aaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttt-tcaaaagggtcttataattagggacggag 17856807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 149 - 392
Target Start/End: Original strand, 29321083 - 29321325
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||| ||||| | || ||    
T  29321083 ttaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgct 29321181  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  29321182 atttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaag 29321281  T
Q  349 ggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29321282 ggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggatggag 29321325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 388
Target Start/End: Original strand, 32474972 - 32475254
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||| || |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32474972 tactccctccgtccctaattctaggacctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 32475071  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    ||||    
T  32475072 acaattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggc----atgt 32475165  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||        ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32475166 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcccaaaagggtcttataattagggac 32475254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 42598501 - 42598743
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  42598501 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaacgttagtttatgttttcaacat 42598600  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||| |||||    
T  42598601 gttatttattgttgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtctaataaa 42598699  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||        ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  42598700 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacg 42598743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12255346 - 12255102
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| | |||||||||| | ||    
T  12255346 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatat 12255248  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  12255247 gctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 12255148  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12255147 aagggacaaaaaaaattctc-aaaggatcttataattagggacggag 12255102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12260889 - 12260645
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||| | |||||||||| | ||    
T  12260889 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatat 12260791  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  12260790 gctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 12260691  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  12260690 aagggacaaaaaaaattctc-aaaggatcttataattagggacggag 12260645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25058292 - 25058088
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||||||||    
T  25058292 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagatag--ttggtttatgttttcaacat 25058195  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  25058194 gttatttattgttgattaaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggttttataaa 25058095  T
Q  346 aagggac 352  Q
    || ||||    
T  25058094 aaaggac 25058088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 145 - 392
Target Start/End: Original strand, 2152025 - 2152271
Alignment:
Q  145 tgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || || | |||| ||| | |||||||||| | |    
T  2152025 tgaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcgtt-aagagagagagttagtttatgttttccata 2152123  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||    
T  2152124 tgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataggtcttataa 2152223  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2152224 aaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 2152271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4778887 - 4778597
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  |||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4778887 tactacctccgtccctaattatatgattattttaaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 4778788  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||| |||||||| |||| | |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4778787 acagttttatccattaagagagagggttggtttat-ttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatatatgt 4778690  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||| ||||| ||        ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  4778689 aaagaattaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttatagaaaggaacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacggag 4778597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 378
Target Start/End: Original strand, 28864247 - 28864524
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||       | | | ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  28864247 tactccctccatccctaattataagacccttttgttaaaatcagaggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 28864346  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28864347 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 28864445  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttat 378  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||    
T  28864446 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttat 28864524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Original strand, 42218132 - 42218371
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| |   ||| ||| | |||||| ||||||||    
T  42218132 gaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcttttaga---gagagttagtttatgtcttcaacat 42218228  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  42218229 tatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaa 42218328  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    || ||||        |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  42218329 aaaggacaaaaataattctaaaaagggtcttacaattagggac 42218371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16999249 - 16999002
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  16999249 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatcttttcaacat 16999150  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  ||| || |||||||||    
T  16999149 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaataacaaaaggatcttataaa 16999050  T
Q  346 aa-gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || |||||       ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16999049 aaggggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattatggacggag 16999002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 43653943 - 43654234
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  43653943 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 43654042  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43654043 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 43654141  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43654142 aaagaaataattaatgtagttggaaataataaagatgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 43654234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 16117236 - 16117417
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16117236 gaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 16117335  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16117336 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 16117417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 16125495 - 16125676
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16125495 gaattaagatagtcgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 16125594  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16125595 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 16125676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Original strand, 42985302 - 42985501
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||     
T  42985302 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatg 42985401  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  42985402 ttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataat-aatatagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagagtcttataaaa 42985500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 44250858 - 44251152
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||    
T  44250858 atactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattatttt 44250957  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||| | | | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44250958 tacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtat 44251057  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44251058 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggag 44251152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 4631339 - 4631585
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  4631339 gaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 4631437  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  4631438 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 4631537  T
Q  346 aagggacnnnnnnnt--ttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||       |  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4631538 aagggacaaattttttcttctcaaaatggtcttataattagggacgga 4631585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 12825244 - 12825017
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||   || ||||       ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12825244 tactacctccgtccctaattatagagcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttttaattactattgttttt 12825145  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12825144 acaattttatcctttaagagagatagttggtttatgttttcaacatgttgtttattgctgattgaagaaaaatatgtat-ataaataggggcatgtatgt 12825046  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatag 328  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12825045 aaagaaataattaatgtagttgaaaatag 12825017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41616208 - 41615952
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  41616208 tactacctccgtctctaattatagggccattttgaaaatataacatgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattagtattgttttt 41616109  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttat----gttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    ||||||||||||||||| | ||| | |||  ||||    |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41616108 acaattttatcctttaagagagatgtttgatttatttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgt 41616009  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||   | ||||||||||||||    
T  41616008 atgtaaagatataattaatgtagttgaaaataacaaagaaattttataaaaagggac 41615952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 108 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44502912 - 44502626
Alignment:
Q  108 ccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttt 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44502912 ccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatttt 44502813  T
Q  208 atcctttaaaaa---agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 304  Q
    |||||| | | |   |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  44502812 atccttaagagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaata 44502713  T
Q  305 aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44502712 aataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-atctcaaaaggatcttataattagggacggag 44502626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 99 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 45260521 - 45260236
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  45260521 atactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttt 45260423  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | | |  ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| || ||||||||    
T  45260422 tacaattttatcctttaagagataaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgccgattgaagaaagagctgtataataaataaggtcatgtatg 45260323  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagg 385  Q
     ||| |||||||||| |||||||||||||| |||  | | ||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||||    
T  45260322 gaaataaataattaatgtagttgaaaatagcaaatagattttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagg 45260236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29279495 - 29279201
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||    
T  29279495 tatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaaattttttgtaatcactattgttt 29279396  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29279395 ttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 29279297  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaa-gggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||        || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29279296 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaaggggtcttataattagggacggag 29279201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 387
Target Start/End: Original strand, 35143307 - 35143545
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  35143307 gaattaagatagtatatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttgtcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacat 35143404  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||   ||||||||||    
T  35143405 gttttttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaataagtcttataaa 35143504  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  35143505 aagggacaaaaata-ttctcaaaagggtcttataattaggga 35143545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31886967 - 31886742
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||| ||||||||  ||| ||||       ||||  ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31886967 tactacctccgtccttaattatagaacccttttaaaaaaataacgggaattaagataataaatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgttttt 31886868  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||  |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  31886867 acaattttatcctttaagagagag--ttgatttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggcatgtatgt 31886770  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||    
T  31886769 aaaaaaataattaatgtagttgaaaata 31886742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 45283575 - 45283823
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| | || |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||| ||||||||||    
T  45283575 gaattaagacaatgaatatttatatcaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatattttcaacat 45283674  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||  ||||  ||||||||||    
T  45283675 gttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaagataattaatgtagttggaaataacaaagatgtcttataaa 45283774  T
Q  346 aagggacnnnnnnnttt--ctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||       |||    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45283775 aaggaacaatttttttttatccaaaagggtcttataattagggacggag 45283823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 313
Target Start/End: Original strand, 21652267 - 21652438
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||    
T  21652267 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatttttattgtttttaccattttatcctttaaaagagagggttagtttatgttttcaacat 21652366  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat----aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21652367 aatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaa 21652438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 45425283 - 45425049
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||| | ||     
T  45425283 aattaagaaagttgatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttccatatg 45425187  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  45425186 ctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataaaa 45425087  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    ||||||       ||| |||||||||| ||||||||||    
T  45425086 agggacaacaaattttttcaaaagggttttataattag 45425049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 162 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 5593654 - 5593470
Alignment:
Q  162 tatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgat 261  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||| |||||    
T  5593654 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgat 5593556  T
Q  262 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5593555 tgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 5593470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 36245698 - 36245904
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  36245698 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttctaatcacaattgtttttacaattttctcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 36245796  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  36245797 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatcttataa 36245896  T
Q  345 aaagggac 352  Q
    ||||||||    
T  36245897 aaagggac 36245904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 30140334 - 30140211
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  30140334 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacat 30140235  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaa 269  Q
      ||||||||||| ||||||||||    
T  30140234 gttatttattgctaattgaagaaa 30140211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 35203087 - 35202938
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  35203087 gaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatccttt---agagagagttggtttatgttttcaacat 35202991  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  35202990 gttatttattgttgattgaagaaaaagatctataataaataggagcatgtatg 35202938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 231 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5951285 - 5951164
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5951285 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagca 5951186  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  5951185 aaggggtcttataaaaagggac 5951164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39463215 - 39463036
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||  | || |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  39463215 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctt-aagaaagagactaggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 39463117  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||    
T  39463116 aaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaggaaataattaacgtagttggaaatgacaaaggggtcttataaaaa 39463036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 14625779 - 14625673
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14625779 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagaaagaggattggcttatgttttcaacat 14625680  T
Q  246 tctattt 252  Q
    |||||||    
T  14625679 tctattt 14625673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 5268220 - 5268016
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  | |||| |||| |||| |||||||||||  | ||||  ||   |||||||||||||||    
T  5268220 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaaacattattatttt-acaaatttatcctttatgagagagaattaatttatgttttcaacat 5268122  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| | ||||||| ||    
T  5268121 attatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaagtagcaaaagagtcttatgaa 5268022  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  5268021 aaggga 5268016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 13568695 - 13568936
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-aaagagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    ||||||||| ||  ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||| | |   |||||||||| | |    
T  13568695 gaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagtgat---ttatgttttccata 13568791  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  13568792 tgctatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag----aattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataa 13568887  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntt-tctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||       || |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13568888 aaagggacaaattttttctctcaaaagggtcttataattaaggacggag 13568936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17336647 - 17336426
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  17336647 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttt-acaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 17336550  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||       ||| |||    
T  17336549 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatacaaaaaaggtcttataaaaagggacaattattttt-tca 17336451  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17336450 aaagggtcttataattagggacgga 17336426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 110324 - 110172
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaaaagagggttggcttatgttttcaac 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | | |||||||||| ||||||||| |||    
T  110324 gaattaagatcgtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatcttatcctttaagagagagagggttggtttatgtttttaac 110225  T
Q  244 attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||  ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  110224 atgttatttattggtgattgaaaaaaaatatgtataataaataagagcatgta 110172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 348
Target Start/End: Original strand, 26990566 - 26990815
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || | ||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||    
T  26990566 atactccctccgtccctaattataagacctttttactaaaattacgggaattaagaaagcgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattttttt 26990665  T
Q  199 tac-aattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |   |||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26990666 ttttaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 26990764  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||    
T  26990765 gtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaacgcgtcttataaaaag 26990815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 7758714 - 7758940
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||        
T  7758714 gaattaagataatggatagttgtattaaagttgtttgtaatcact-ttgtttttacgattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttca---- 7758808  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
                   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  7758809 ---------------ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 7758893  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7758894 aagggacaaaaaatattctcaaaagtgtcttataattagggacggag 7758940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 14583919 - 14584162
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||   || | |||||||||  | ||     
T  14583919 aattaagaaagtgaatatttgtattaaaattatttgtaatcacaattgtttttacaattttatcctt-aagagagaaaatttgtttatgtttttcatatg 14584017  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  14584018 ttatttattggtaattgaagaaaa-gatatataataaacaggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaa 14584116  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14584117 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggag 14584162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40529453 - 40529313
Alignment:
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||    
T  40529453 ttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaaagg 40529354  T
Q  351 acnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40529353 acaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagggacggag 40529313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 14548474 - 14548679
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||  |||   ||||| |||| | ||    
T  14548474 gaattaagaaagtgcatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtgtttacaattttatcctt-aaaagagatagtttatttatggtttccatat 14548572  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  14548573 gctatttattgctgattgaagaccaatatgtataataaatagaggcatgtatgtacataaataattaatatagttgaaaatagcaaagagatcttataaa 14548672  T
Q  346 aagggac 352  Q
    || ||||    
T  14548673 aaaggac 14548679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 261 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42885191 - 42885060
Alignment:
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |    
T  42885191 ttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttt 42885092  T
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42885091 ttttcaaaagggtcttataattagggacggag 42885060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11293883 - 11293659
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  11293883 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 11293785  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||||| ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||||||       |||||||    
T  11293784 aaaaagatgtaaaataagtaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccgaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttctca 11293685  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||  |||||||||||| |||||||    
T  11293684 aaagaatcttataattagagacggag 11293659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35179830 - 35179606
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||   |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  35179830 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaag 35179732  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||| || | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||       ||| |||    
T  35179731 aaaaaggtgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaaaggacaaattattttttca 35179632  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  35179631 aaagagtcttataattagggacggag 35179606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 35203243 - 35203098
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||           |||||||||  |||||||||||||||     
T  35203243 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttag----------agagggttgatttatgttttcaacatg 35203154  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  35203153 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatacggacatgtatgtaaa 35203098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12802838 - 12802617
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  12802838 gtattaaatttgtatttaattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 12802742  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| || |   ||||||||||||||| ||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||||        |||||||    
T  12802741 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatattaataaagaaataattaatgtacttggaaataccataggggtcttataaaaaggga-taaattttttctca 12802643  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  12802642 aaagggtcttataattagggacggag 12802617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 28965758 - 28965648
Alignment:
Q  106 ctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28965758 ctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 28965659  T
Q  206 ttatcctttaa 216  Q
    |||||||||||    
T  28965658 ttatcctttaa 28965648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5110111 - 5109899
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||   |||||||||||||||  ||||||| | ||||||||     
T  5110111 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttatagttgattgaaa 5110013  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||       ||| |||    
T  5110012 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgggtcttataaaaagggacaaattattttttca 5109913  T
Q  367 aaagggtcttataa 380  Q
    ||||||||||||||    
T  5109912 aaagggtcttataa 5109899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36786697 - 36786473
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  36786697 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 36786599  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctc 365  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || |||  ||||  ||| | |||||||||||||||||        ||||||    
T  36786598 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatctacttg-gaatatcaaatgagtcttataaaaagggacaaattttttttctc 36786500  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  36786499 aaaaaggtcttataattagggacggag 36786473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 146 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 21137107 - 21136903
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||| | | || |||   |||||||||||||||    
T  21137107 gaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttccaattttatcatttaagagatagagttaatttatgttttcaacat 21137008  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || | ||| ||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  21137007 gttatttattattcattgaagaaaaaaatgtataataaataggagtatgtaagtaaagaaatagttgatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaa 21136908  T
Q  346 aaggg 350  Q
    |||||    
T  21136907 aaggg 21136903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 327
Target Start/End: Original strand, 25056707 - 25056865
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||||||| ||| ||||   |||||||||    
T  25056707 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagtttgtttatgttttcaacatacta-ttat---tgattgaag 25056802  T
Q  267 -aaaaagatgtataataaata-ggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     ||||| |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  25056803 aaaaaaaatgtataataaatagggggtatataggtaaagaaataattaatgtagttggaaata 25056865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 231 - 384
Target Start/End: Original strand, 44580923 - 44581076
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |    
T  44580923 ttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataaca 44581022  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    ||| ||  ||||||||||||||       ||| |||||| ||||||||||||||    
T  44581023 aagaggcattataaaaagggacacaaaattttttcaaaatggtcttataattag 44581076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 36941498 - 36941284
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| || |  |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  36941498 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtagatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 36941400  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||  | ||||||||||||||||       ||| |||    
T  36941399 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatagatcttataaaaagggacagattattttttca 36941301  T
Q  367 aaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||||||||||||    
T  36941300 aaagggtcttataatta 36941284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 147 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 42747459 - 42747361
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||| ||||||||||    
T  42747459 aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattttttttacaattttattctttaagagagagggttggtttatattttcaacat 42747361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 266 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28965636 - 28965510
Alignment:
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||       ||| ||    
T  28965636 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaatttttttttc 28965537  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  28965536 aaaagggttttataattatggacggag 28965510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Original strand, 43292806 - 43293023
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  43292806 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 43292902  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||| ||| | |||||||| | | ||||  ||||||||||||| || ||| ||| |||||  |||| | ||||||||||||||||       ||| ||||    
T  43292903 aaaatatgcaaaataaataagagtatgttagtaaagaaataatgaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaagggacatatttttttttcaa 43293002  T
Q  368 aagggtcttataattagggac 388  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  43293003 aagagtcttataattagggac 43293023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23995806 - 23995583
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| | | | ||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  23995806 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatccttgagaga-gagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 23995708  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  23995707 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 23995609  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23995608 aaagggttttataattagggacggag 23995583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30512991 - 30512817
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | |||| | | | || ||||||||||||  |||||| || | |||||||||||    
T  30512991 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt----agagagagctagtttgtgttttcaacatagtatttaatgttcattgaagaaaa 30512896  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa-taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||| || |||||||||||| ||||  ||||| ||| ||||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30512895 agatataaaataaataggggtatgttggtaaaaaaattaattaatgtacttgaaaataccaaaggggtcttataaaaag 30512817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Original strand, 44165276 - 44165493
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |    
T  44165276 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-agagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagg 44165374  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||| ||||       |||||||    
T  44165375 aaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaatggacaattttttttctca 44165474  T
Q  367 aaagggtcttataattagg 385  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  44165475 aaatggtcttataattagg 44165493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 252 - 352
Target Start/End: Original strand, 17851339 - 17851439
Alignment:
Q  252 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||||||| |||    
T  17851339 tattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatatagttggaaatagtaaaagagtcttataaaaaagga 17851438  T
Q  352 c 352  Q
    |    
T  17851439 c 17851439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26626007 - 26625799
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  26626007 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-agagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaata 26625909  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| | | | ||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||||    
T  26625908 aataagagtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaaaggtcttataatt 26625809  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||| ||||    
T  26625808 agggatggag 26625799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 248 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19176286 - 19176142
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  19176286 tatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaa 19176187  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||       || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19176186 gggacaaaaaaattactcaaaagggtcttataattaaggacggag 19176142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 170 - 351
Target Start/End: Original strand, 23894718 - 23894896
Alignment:
Q  170 ttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaa 269  Q
    |||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
T  23894718 ttaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaa 23894814  T
Q  270 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||||| | |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| || |||||||||||||||    
T  23894815 aagatgcaaaataaataaggatatgttagtaaagaaataattaatgtatttggaaatactaaatggatcttataaaaaggga 23894896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 184 - 392
Target Start/End: Original strand, 5244451 - 5244656
Alignment:
Q  184 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||   ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  5244451 aattactattgtttttagaattttatcctt-aagagagagagttcatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataa 5244549  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| ||||||| ||||||||||||    
T  5244550 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggac--aattttttatcaaaagagtcttataatta 5244647  T
Q  384 gggacggag 392  Q
    |||||||||    
T  5244648 gggacggag 5244656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 11114018 - 11113869
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaa--gagggttggcttatgttttcaacattctatttattgct 258  Q
    |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |  ||| ||||  ||||||||| |||||  ||||||| |||    
T  11114018 atatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttactattttatcctttaagagatagagagttgttttatgtttttaacatgatatttatcgct 11113919  T
Q  259 gattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||||||||    
T  11113918 gattgaagaaaaagatgtataataaatagatgtatgtagataaagaaata 11113869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 39970195 - 39970021
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |  ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  39970195 taaatttgtttgtaattgtcattgtttttacaattgtatcctttaaaagagagggttagtgtatgttttcaatataatatttactgctgattgaagaaaa 39970096  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||| || |||||||| |||  |||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||||  |||| | |||||||||    
T  39970095 agatataaaataaataagggtgtgttggtaaagaattaattaatgtatttggaaatatgaaagagttcttataaa 39970021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40856047 - 40855846
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat- 245  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | | || ||| | |||||||||| | ||     
T  40856047 aattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaattattattgtttttacaattttat-ctttaagataaagagttagtttatgttttccatatg 40855949  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |   |||||||| ||| |||||||||| ||||||  |||||  |||| ||||||| ||    
T  40855948 tttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataagaatatgtatgtaaaaaaaataattaatgtagttagaaataacaaagaggtcttacaa 40855849  T
Q  345 aaa 347  Q
    |||    
T  40855848 aaa 40855846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 252 - 349
Target Start/End: Original strand, 9615975 - 9616071
Alignment:
Q  252 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| ||| | ||||||||||||||    
T  9615975 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtagttaaagaaataattaacgtagtttgaaatag-aaatgagtcttataaaaagg 9616071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Original strand, 24260764 - 24260941
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||  || |  ||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||||    
T  24260764 taaatttgtttgtaattactattgcttttacaattctatcctttaaaagagagaattagtgtatgttttcaagatagtatttaatactgattgaagaaaa 24260863  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||| || |||||||| ||| ||||  ||||| || ||||||| | | ||| |||||  |||||| ||||||||||||    
T  24260864 agatataaaataaataagggtatgttggtaaaaaattaattaatgcacttggaaatatcaaagggatcttataaaaag 24260941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 189 - 327
Target Start/End: Original strand, 31089750 - 31089887
Alignment:
Q  189 ctattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  31089750 ctattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttagtttatgttttcaacatgctatttattactgattgaagaaaaatatgtataataaataag 31089847  T
Q  289 ggcatgtatgtaaagaa-ataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     | ||||| ||||| ||  ||||||| |||||| ||||||    
T  31089848 agtatgtaggtaaaaaatttaattaatgtagttaaaaata 31089887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 190 - 327
Target Start/End: Original strand, 39970555 - 39970693
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 288  Q
    ||||||||||||||||| || ||| ||| | |||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||| |||||||| |    
T  39970555 tattgtttttacaatttaatacttaaaagagagagagtttgtttatgttttcaacatagtatttattgttgatggaagaaaaatatgtaaaataaataag 39970654  T
Q  289 ggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39970655 ggcatgttggtaaagaaataattaatgtaattgaaaata 39970693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23497960 - 23497778
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa- 265  Q
    ||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  23497960 gtattaaatttgtatgcaattattattgtttttccaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaa 23497862  T
Q  266 -gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
     |||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||  ||| |||||||||||||||    
T  23497861 agaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttataaataccaaaagggtcttataaaaag 23497778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26502709 - 26502488
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa---agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattga 264  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | | |   |||| |||   |||| |||||||| |  |||||||||   |||||    
T  26502709 tattaaatttgtatataatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagttaatttatattttcaacgtaatatttattg---attga 26502613  T
Q  265 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttct 364  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| |||  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||       ||| |    
T  26502612 agaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacatagaaatacaaaaggggtcttataaaaagggac--attttttttt 26502515  T
Q  365 caaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26502514 caaaagggttttataattagggacgga 26502488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 287
Target Start/End: Original strand, 44056809 - 44056993
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| | |||||||||||||  |||||||||       | ||| ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  44056809 tactacattcgtccctaattattggaccattttgttaaaatcacaagaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44056908  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    ||||||||||||||   || |||| ||| | |||||||||  | ||  ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  44056909 acaattttatcctt---aagagagagttagtttatgtttttcatatgatatttattgttgatttaaaaaaaagatgtataataaatag 44056993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 232 - 327
Target Start/End: Original strand, 25635979 - 25636074
Alignment:
Q  232 tatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  25635979 tatgttttccacatgctatttattgctgattgaaaataaacatgtataataaatagagacatgtatgtacagaaataattaatatagttgaaaata 25636074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 42885422 - 42885325
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct-ttaaaaaagagggttggcttatgttttcaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||  ||| | ||||||||||||    
T  42885422 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttcttaagaaagaacgttagtttatgttttcaa 42885325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5952582 - 5952482
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5952582 atactaccttcgtccctaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgattt 5952483  T
Q  199 t 199  Q
    |    
T  5952482 t 5952482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 258 - 392
Target Start/End: Original strand, 37023180 - 37023315
Alignment:
Q  258 tgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnn 357  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||  |||| ||| ||||||||||||||         
T  37023180 tgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaagaggttttataaaaagggacaattt 37023279  T
Q  358 nnt-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
      | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37023280 tttcttctcaaaagagtcttataattagggacggag 37023315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 17851249 - 17851343
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17851249 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg 17851343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23425041 - 23424897
Alignment:
Q  165 ttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattga 264  Q
    ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||   ||   |||||||||||| ||  ||||||| | |||||||    
T  23425041 ttgtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaaaagagataattaatttatgttttcaagataatatttatggttgattga 23424943  T
Q  265 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataat 310  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||    
T  23424942 agaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataat 23424897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 469 - 719
Target Start/End: Original strand, 9262344 - 9262598
Alignment:
Q  469 caaacgggggatagaaatccctattacagcagttgtgagcatgtgactaaattgaatcggacaagactc--aaaaggtaatttgacccgttagagagcat 566  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||| ||||  | ||| ||| || | |||||| ||||||     
T  9262344 caaacgagggatagaaatccctattacatcagttgtgagcaagtgattcaattgagccggacaaaactcatacaagataaattcatccgttaaagagcac 9262443  T
Q  567 ccaaaatttgctagagcatctgcacactggttagcttccctataagaatgcttcaccacaatctcc--caatccagattaattaacctctcaatctcaaa 664  Q
    | ||| || |||| ||||||| | ||| |||||| ||  || ||||||||||||  ||||| ||||  ||||||| |||||| |||| |  |||||| ||    
T  9262444 ctaaatttagctaaagcatcttcccaccggttagattttctgtaagaatgcttcgtcacaacctcccacaatccaaattaatcaaccgccgaatctcgaa 9262543  T
Q  665 aaccaacgacctcccgctcgggctaccatgcccatttccattaatacaattagca 719  Q
    ||||||  |||| ||||||  |||||||  | ||||||||  || ||||||||||    
T  9262544 aaccaaataccttccgctcatgctaccacactcatttccaccaagacaattagca 9262598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Original strand, 41898317 - 41898527
Alignment:
Q  183 taattactattgttttt-acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgt--tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtata 279  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |||   |||| |  |||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |    
T  41898317 taattactattgttttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaa 41898414  T
Q  280 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttata 379  Q
    ||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||| ||||       ||| |||||||| |||||||    
T  41898415 ataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaaaggacaaattattttttcaaaaggatcttata 41898514  T
Q  380 attagggacggag 392  Q
    |||||||||||||    
T  41898515 attagggacggag 41898527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 28741106 - 28740961
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |  ||| |||   |||| ||||| | ||    
T  28741106 gaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttacaattattattgtttttacaattttatcc-ttaagagcgagagttaatttatattttctatat 28741008  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat-aataaataggggc 291  Q
      ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28741007 attatttattgctcattgaaaaaaaagatgtataaataaataggggc 28740961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 280
Target Start/End: Original strand, 29738099 - 29738276
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||| ||||       | ||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || | ||||| |||||| |||||    
T  29738099 tactacctccgtccctatatgtaagacccttttgctaaaattacaggaattaagaaattggatatttgtattaaagttgatggtaatcactattattttt 29738198  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataa 280  Q
    |||||||| | |||   || |||| ||||  |||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29738199 acaattttgttctt---aagagagagttgatttatgttttccatatgttatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataa 29738276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 231 - 289
Target Start/End: Original strand, 13401791 - 13401848
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13401791 ttatattttcaacatgctatttattgct-attgaagaaaaagatgtataataaataggg 13401848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 252 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 24355310 - 24355214
Alignment:
Q  252 tattgctgattgaagaaaaa-gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||||||    
T  24355310 tattgttgatttaagaaaaacgatgtataataaatagggat-tgtaggtaaataaataattaacgtagttaaaaataacaaaggggtattataaaaag 24355214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 298 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36408515 - 36408421
Alignment:
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||        ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36408515 gtaaagaaataattaatgtactagaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggataaattattttttcaaaaaggtcttataattagggacggag 36408421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 235 - 392
Target Start/End: Original strand, 31619123 - 31619279
Alignment:
Q  235 gttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagg 334  Q
    |||||||||||  |||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||  |||  |||||||| || |||| ||| ||| |||||  |||      
T  31619123 gttttcaacatattatttaatgttgattgaagaaaaa-atataaaataaataggggtgtgttggtaaagaattagttaatgtacttggaaataccaaaaa 31619221  T
Q  335 ggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||       |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  31619222 ggtcttataaaaagagacaaatttttttctcaaaatggtcttatatttagggacggag 31619279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16894101 - 16894062
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16894101 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 16894062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 203 - 282
Target Start/End: Original strand, 28929339 - 28929418
Alignment:
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||||| ||||||| ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  28929339 attttatcttttaaaagagagactttgtttatgttttcaacatgctatttattgtttattggagaaaaagatgtataata 28929418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 42220608 - 42220522
Alignment:
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaag 333  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  42220608 tctatttattgttg-ttgaagaaaaatatgtataataaatagaagtatgtatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaag 42220522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 13141670 - 13141506
Alignment:
Q  184 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||   || |||| | |   |||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||    
T  13141670 aattactattgtttttacaattttatcttt---aagagagagataatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaa-aaaaagatgcaaaataa 13141575  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||| ||  ||||   ||||||||||||||| | | || ||||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  13141574 ataaggatatgttgataaagaaataattaatggacttaaaaatatcaaaaaggtcttataaaaagggac 13141506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 295
Target Start/End: Original strand, 19700825 - 19700942
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | | |||||| |  |||||||| |||||  |||||| || |||||||| ||||| || |    
T  19700825 tgtttgtaattattactgtttttacaattttatcctttaagagaaagggttagtgtatgttttgaacataatatttaatgttgattgaa-aaaaatatat 19700923  T
Q  277 ataataaataggggcatgt 295  Q
    | ||||||| |||| ||||    
T  19700924 aaaataaattggggtatgt 19700942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2767868 - 2767705
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctg 259  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||  |||  || |||   ||   |||||||||||||||  ||||||||  ||    
T  2767868 gatatttgtattaaagatctttgtaatcactattgtttttacaatattattattt--aagagataattattttatgttttcaacatgttatttatttttg 2767771  T
Q  260 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||||||||||| |   |||||||||| ||| |||||  | ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  2767770 attgaagaaaaaaa--cataataaatatgggtatgtagctcaagaaatgattaatttagttgaaaata 2767705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40530446 - 40530336
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||  |||||    
T  40530446 ttatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacggttgtt 40530347  T
Q  197 tttacaatttt 207  Q
    |||||||||||    
T  40530346 tttacaatttt 40530336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 210
Target Start/End: Original strand, 39112547 - 39112611
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 210  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39112547 gaatgaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatc 39112611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Original strand, 41388545 - 41388601
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||||||||||||||  ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41388545 gatatttgtattaaaattgtttgtgatgactattatttttacaattttatcctttaa 41388601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 218
Target Start/End: Original strand, 44580539 - 44580611
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa 218  Q
    ||||||||| |||  ||||||| ||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44580539 gaattaagaaagttaatatttgcattaaacttgtttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaaaa 44580611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #164
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 42486288 - 42486245
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 214  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42486288 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatacttt 42486245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #165
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 45145411 - 45145356
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  45145411 ttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgtacaataaata 45145356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 232 - 387
Target Start/End: Original strand, 4348382 - 4348536
Alignment:
Q  232 tatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaa 331  Q
    ||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| || |||||||| ||  ||||  |||||||| || | || ||| |||||||||  ||    
T  4348382 tatgttttcaacatagtatttaatactgattgaagaaaaagatataaaataaataaggatatgttggtaaagaattactgaatgtacttgaaaataccaa 4348481  T
Q  332 aggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |   ||||||||||||| |||       |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  4348482 atatgtcttataaaaagagac-aaaaaatttctcaaaaggatcttatatttaggga 4348536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 29073791 - 29073738
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 284  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||    
T  29073791 ttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaa 29073738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #168
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Original strand, 13335775 - 13335882
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagat---gtataataa--atagg---ggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  |||||    | ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||  ||| | ||||    
T  13335775 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtagtataataaacataggtactgtatgtaggtaaagaaataattaatgcagttgaaaataacaaaagagtct 13335874  T
Q  340 tataaaaa 347  Q
    ||||||||    
T  13335875 tataaaaa 13335882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #169
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 392
Target Start/End: Original strand, 17069843 - 17069875
Alignment:
Q  360 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17069843 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 17069875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #170
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17578430 - 17578398
Alignment:
Q  360 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17578430 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 17578398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 23487060 - 23487096
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23487060 attatactacctccgtccctaattataagaccctttt 23487096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 688 - 732
Target Start/End: Original strand, 25636226 - 25636270
Alignment:
Q  688 taccatgcccatttccattaatacaattagcaactactaaagaat 732  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  25636226 taccatgtccatttccattaatacaattcgcaactattaaagaat 25636270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 187
Target Start/End: Original strand, 34071018 - 34071058
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatt 187  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  34071018 aattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaatt 34071058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Original strand, 12802608 - 12802643
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12802608 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 12802643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 271
Target Start/End: Original strand, 15021169 - 15021268
Alignment:
Q  172 aaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa 271  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | || |  |||||||| |||||  | |||| || ||||||||||||||    
T  15021169 aaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagagatgattagtgtatgttttgaacataatctttaatgttgattgaagaaaaa 15021268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28572083 - 28572052
Alignment:
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28572083 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 28572052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #177
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2152279 - 2152245
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2152279 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 2152245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #178
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 361 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5593458 - 5593428
Alignment:
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593458 ttctcaaaagggtcttataattagggacgga 5593428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #179
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 18112014 - 18111980
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18112014 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 18111980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19176920 - 19176874
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  19176920 gtattaaatttgtatgtaattaatactgtttttacaattttatcctt 19176874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 5784189 - 5784160
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataaga 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5784189 attatactacctccgtccctaattataaga 5784160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 363 - 392
Target Start/End: Original strand, 6050557 - 6050586
Alignment:
Q  363 ctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6050557 ctcaaaagggtcttataattagggacggag 6050586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #183
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 210
Target Start/End: Original strand, 19715659 - 19715692
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19715659 tgtttgtaattattattgtttttacaattttatc 19715692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #184
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23688203 - 23688170
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23688203 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 23688170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34114591 - 34114558
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34114591 atactacttccgtccctaattataagaccatttt 34114558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 36408414 - 36408447
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36408414 atactacctccgtccctaattataagaccttttt 36408447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 40784890 - 40784923
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40784890 atactacctccgtccctaattataagaccttttt 40784923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 236)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10656989 - 10656697
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656989 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10656890  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656889 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 10656790  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10656789 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggggcggag 10656697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 99 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 1450541 - 1450251
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1450541 atactacatctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 1450442  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1450441 tacaattttagcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 1450342  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1450341 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacg 1450251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 46845231 - 46845523
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46845231 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46845330  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46845331 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 46845430  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46845431 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 46845523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 50433128 - 50433420
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50433128 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 50433227  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50433228 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 50433327  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||        |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50433328 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaataggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcacaagggtcttataattagggacggag 50433420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 4759088 - 4759382
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnn-taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759088 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaaataacgcgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 4759187  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggtt-ggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759188 tacaattttatcctttaagaaagagggtttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 4759287  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4759288 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 4759382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6784762 - 6784469
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6784762 tatactatctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgttt 6784663  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6784662 ttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtat 6784563  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6784562 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaa-gggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 6784469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 99 - 388
Target Start/End: Original strand, 53686735 - 53687024
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||        |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53686735 atactacctctgtccctaattataaaacccttttgaaaaaacaacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 53686834  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  53686835 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatg 53686934  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53686935 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattatggac 53687024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 12906149 - 12906444
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12906149 tatactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttt 12906248  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12906249 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 12906348  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc-aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||       ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  12906349 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatggaaaaggggtcttataagaagggacaaaaaaatttatcaaaaagggtcttataattagggacggag 12906444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Original strand, 46862105 - 46862396
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46862105 tactaccttcgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattactgttttt 46862204  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46862205 acaattttatcctttaagaaggagggttgacttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 46862304  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46862305 aaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 46862396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 103 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33212691 - 33212403
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||       |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33212691 tacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 33212592  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33212591 attttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 33212492  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||| |||| || |||||||||||   ||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33212491 gaaataattaatgtagatggaaatagaaaagaaatcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagggacggag 33212403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43686800 - 43686507
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43686800 atactacctccgtccctaattataaggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 43686701  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43686700 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatg 43686601  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||        |||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  43686600 taaataaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaggtcttataaaaagggaccaaaaaaattctaaaaagggtattataattaggaacggag 43686507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 5e-98
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53164415 - 53164169
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53164415 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacat 53164316  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  53164315 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaagtcttataaa 53164216  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53164215 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 53164169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 20621424 - 20621715
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20621424 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 20621523  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20621524 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 20621621  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20621622 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataattagggacggag 20621715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 10015530 - 10015820
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10015530 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10015629  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10015630 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 10015727  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10015728 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 10015820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 19897577 - 19897867
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897577 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19897676  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897677 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19897774  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19897775 aaagaaataattaaagtagttggaaatagtaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 19897867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 99 - 393
Target Start/End: Original strand, 42801520 - 42801814
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42801520 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 42801619  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42801620 tataattttatcctttaagaaagagggttagcttatattttcaatattctatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 42801719  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagt 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | || ||||||||||||||       ||||||||||| | |||||||||| ||| |||||    
T  42801720 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagtgccttataattaaggatggagt 42801814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 24087123 - 24087366
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  24087123 gaattaagatagtggatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggcctatgttttcaacat 24087222  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24087223 tttatttattgctgattgaagaaaaatatgt---ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagaaaacgggtcttataaa 24087319  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    | |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24087320 acgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 24087366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 28673035 - 28673325
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28673035 tactacctccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactgttgttttt 28673134  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28673135 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatattatttattgctggttgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 28673232  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28673233 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 28673325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7181602 - 7181356
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  7181602 gaattaagataggggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 7181503  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7181502 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 7181403  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7181402 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 7181356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 99 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 31187055 - 31186763
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31187055 atactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttt 31186956  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31186955 tacaattttatcctttaagagaaag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatg 31186858  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagt 393  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31186857 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattaaggacggagt 31186763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 49383595 - 49383350
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  49383595 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttgatttatgttttcaacat 49383496  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  49383495 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 49383396  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49383395 aagggacaatttttttt-tcaaaagagtcttataattagggacggag 49383350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47067234 - 47066940
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067234 tatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 47067135  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||| ||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  47067134 ttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaatgatgaataataaataagggcatgtat 47067035  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47067034 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggag 47066940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 45513375 - 45513668
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||       ||||   ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45513375 atactacctccgtccttaattataggacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactatcgtttt 45513474  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45513475 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 45513572  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc--tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45513573 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctttcaaaagggtcttataattagggacggag 45513668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 97 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 40919255 - 40919020
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40919255 ttatactacatccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 40919156  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40919155 tttacaattttatcctttaagaaagagggttatcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgta 40919056  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaa 332  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  40919055 tgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaa 40919020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 7051505 - 7051751
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  7051505 gaattaagatagtgggtatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 7051604  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7051605 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 7051704  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7051705 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 7051751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 9499282 - 9499528
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||    
T  9499282 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagagagaaggttagtttatgttttcaacat 9499381  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  9499382 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 9499481  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9499482 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 9499528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43868355 - 43868109
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  43868355 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 43868256  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  43868255 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 43868156  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43868155 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 43868109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 107 - 392
Target Start/End: Original strand, 53361601 - 53361886
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53361601 tccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 53361700  T
Q  207 tatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    |||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53361701 tatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 53361800  T
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||  |||||  ||| | |||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  53361801 taattaatgtagttagaaataacaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacggag 53361886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 22103714 - 22103960
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  22103714 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 22103813  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  22103814 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 22103913  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22103914 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 22103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 46861867 - 46861666
Alignment:
Q  151 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctat 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |||    
T  46861867 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttat 46861768  T
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  46861767 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggg 46861668  T
Q  351 ac 352  Q
    ||    
T  46861667 ac 46861666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 51489619 - 51489373
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | | |||||||||||||||    
T  51489619 gaattaagataggggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggatagtttatgttttcaacat 51489520  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||    
T  51489519 gttatttattgctgatggaagaaaaagatgtataataaataaatgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaacaagtcttataaa 51489420  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51489419 aagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 51489373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 15996513 - 15996804
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15996513 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 15996612  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  15996613 tacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatg 15996710  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15996711 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 15996804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 46049727 - 46050017
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46049727 tactccctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 46049826  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||    
T  46049827 acaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgt 46049924  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46049925 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaaaggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 46050017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8322175 - 8321931
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  8322175 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacat 8322078  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8322077 gctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 8321978  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8321977 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 8321931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21756738 - 21756492
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  21756738 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 21756639  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  21756638 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaagaggtcttataaa 21756539  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21756538 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 21756492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 23700570 - 23700816
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  23700570 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 23700669  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  23700670 gttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 23700769  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23700770 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 23700816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 23719025 - 23719271
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  23719025 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 23719124  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  23719125 gttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 23719224  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23719225 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 23719271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 23737481 - 23737727
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  23737481 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 23737580  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  23737581 gttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 23737680  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23737681 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 23737727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45253025 - 45252779
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  45253025 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 45252926  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  45252925 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 45252826  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45252825 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 45252779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 46878224 - 46878470
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  46878224 gaattaagataaaggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 46878323  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  46878324 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaa 46878423  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46878424 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaaggacggag 46878470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 48887731 - 48887977
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  48887731 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaagtattattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 48887830  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  48887831 gttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcagtcttataaa 48887930  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  48887931 aagggacaaaaaaatttctcaaaagaatcttataattatggacggag 48887977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 49126983 - 49127229
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||    
T  49126983 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaagattagtttatgttttcaacat 49127082  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  49127083 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 49127182  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  49127183 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 49127229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 50517307 - 50517553
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||||||||| ||    
T  50517307 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagggggagggttggtttatgttttcaatat 50517406  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  50517407 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtattataaa 50517506  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50517507 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 50517553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 54107605 - 54107359
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  54107605 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 54107506  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  54107505 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataataaaggggtcttataaa 54107406  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  54107405 aagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataatcagggacggag 54107359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8547203 - 8546910
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||       ||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8547203 atactacctccgtccctaagtataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgcgtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 8547104  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
     ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  8547103 gacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacctgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtatagtaaatagggacatgtatg 8547004  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8547003 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 8546910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 54782702 - 54782945
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||    
T  54782702 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacat 54782801  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  54782802 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 54782901  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54782902 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacg 54782945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 7251067 - 7251313
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  7251067 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 7251166  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | ||||||||||    
T  7251167 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaa 7251266  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7251267 aagggacaaaaaaaattcttaaaggggtcttataattagggacggag 7251313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26221540 - 26221294
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26221540 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 26221441  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  26221440 gttatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 26221341  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26221340 aagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 26221294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 30040802 - 30041048
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  30040802 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 30040901  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  30040902 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaa 30041001  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30041002 aagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaggaacggag 30041048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32467677 - 32467431
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  32467677 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttacgaaagaaggttagtttatattttcaacat 32467578  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  32467577 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 32467478  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32467477 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 32467431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45746030 - 45745784
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  45746030 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatat 45745931  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  45745930 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 45745831  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  45745830 aagggacaattttttttttcaaaagagtcttataatttgggacggag 45745784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 392
Target Start/End: Original strand, 50726532 - 50726814
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50726532 tccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 50726631  T
Q  207 tatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    |||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50726632 tatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 50726729  T
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50726730 taattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataatcagggacggag 50726814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 107 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 50786316 - 50786034
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50786316 tccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 50786217  T
Q  207 tatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    |||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50786216 tatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaa 50786119  T
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50786118 taattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataatcagggacggag 50786034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21459277 - 21458988
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21459277 tacctccttccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttgaca 21459178  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    |||||||||||||  | | || ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21459177 attttatcctttacgatatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 21459078  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||| |||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21459077 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggtgtcctataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 21458988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 17753320 - 17753566
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| |||| ||||||||||    
T  17753320 gaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacat 17753419  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  17753420 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaa 17753519  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17753520 aagggacaaaaaaaattctcagaaaggttttataattagggacggag 17753566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 19054640 - 19054886
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||||| |||| ||||||||||    
T  19054640 gaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatggttggtttatattttcaacat 19054739  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  19054740 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaagggtcttataaa 19054839  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  19054840 aagggacaaaaaaaattctcagaaaggttttataattagggacggag 19054886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 23776235 - 23776486
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | || ||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23776235 atactaccttcgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 23776334  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23776335 tacaattttattctttaatagagagggttggattatgttttcaacgt--tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatg 23776432  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  23776433 taaagaaacaattaatgtagttgtaaataacaaaggagtcttataacaagggac 23776486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 25148907 - 25149153
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  25148907 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 25149006  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  25149007 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaa 25149106  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25149107 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 25149153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 43701430 - 43701188
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  43701430 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 43701331  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  43701330 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 43701231  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43701230 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 43701188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 46703279 - 46703033
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  46703279 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaaagttagtttatgttttcaacat 46703180  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  46703179 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttagaaataacaaaggggtcttataaa 46703080  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46703079 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 46703033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 52673439 - 52673201
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  52673439 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 52673340  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||| ||||||||||||    
T  52673339 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaggtggaaataacaaatgggtcttataaa 52673240  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  52673239 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattag 52673201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14428907 - 14428616
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  14428907 atactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 14428808  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14428807 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg-catgtatg 14428710  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14428709 taaagaaataattaatgtagttggaaataagaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 14428616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27688235 - 27687992
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||    
T  27688235 gaattaagacagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt--aagagagggttggtttatgttttcaacat 27688138  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| || |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  27688137 gttatttattactaattgaagaaaaatatgtataat-aataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 27688039  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27688038 aagggacaaaaaaatttgtcaaaagggtcttataattaaggacggag 27687992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 92 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33868753 - 33868454
Alignment:
Q  92 aaacattatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  33868753 aaacatgatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcacta 33868654  T
Q  192 ttgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 291  Q
    |||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33868653 ttgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 33868555  T
Q  292 atgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33868554 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataactaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacgga 33868455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 43158523 - 43158767
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||| |||||||||||||||    
T  43158523 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaaa--tggtttatgttttcaacat 43158620  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  43158621 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaa 43158720  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  43158721 aagggacaattttttttctcaaaatgatcttataattagggacggag 43158767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52178050 - 52177806
Alignment:
Q  148 attaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat-- 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||      
T  52178050 attaagatagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattggtttatg-tttcaacattc 52177952  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| | | |||||||    
T  52177951 tctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaactag-aaagagatattataaa 52177853  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52177852 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcctataattagggacggag 52177806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 12050181 - 12050423
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||   |||| |||||||||||||||     
T  12050181 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttgagagagaa--ttggtttatgttttcaacatg 12050278  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  12050279 atatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaa 12050378  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12050379 aggtacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 12050423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 31531196 - 31531442
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  31531196 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 31531295  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||   ||||||||||    
T  31531296 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaatgtcttataaa 31531395  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31531396 aagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggag 31531442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 35867868 - 35868114
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  35867868 gaattaagatagggcatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 35867967  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35867968 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 35868067  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35868068 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 35868114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44544033 - 44543788
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  44544033 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttcgtttatgttttccatat 44543935  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  44543934 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 44543835  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44543834 aagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 44543788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 45323875 - 45324118
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||     
T  45323875 aattaagatagaagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacata 45323972  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  45323973 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaa 45324072  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||         ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45324073 agggataaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaaggacggag 45324118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 1084693 - 1084945
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||| |||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1084693 tactacctccgtccctaactatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttttattaaatatctttgtaattactattgttttt 1084792  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||| ||||||| | |||| | | | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1084793 acaattttaccctttaagagagagagatagtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 1084892  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  1084893 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaaaggatcttataaaaagggac 1084945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25148707 - 25148466
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||   || | |||||||||||||||    
T  25148707 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaaattagtttatgttttcaacat 25148608  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  25148607 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc----atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 25148512  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25148511 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 25148466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 50647683 - 50647975
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  50647683 atactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 50647782  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50647783 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 50647881  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50647882 taaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaattttttctcaaaagggtcttataattagagacggag 50647975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 148 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 32569247 - 32569004
Alignment:
Q  148 attaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattc 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||      
T  32569247 attaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattatttttacaattttatcatttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgt 32569148  T
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  32569147 tatttattgtcgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaaaa 32569048  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||        ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32569047 gggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataattagggacgga 32569004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 32962890 - 32963136
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  32962890 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt-acaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 32962988  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  32962989 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgcaaataacaaaggggtcttataaa 32963088  T
Q  346 aagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32963089 aagggacaaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 32963136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 35165748 - 35165990
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  35165748 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtagtcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 35165847  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  35165848 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaa 35165946  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35165947 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacg 35165990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 13809594 - 13809840
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||| |||| |||||||||||||||    
T  13809594 gaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttattcttcaagagagaggattggtttatgttttcaacat 13809693  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||  | |||||||||    
T  13809694 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatgatcttataaa 13809793  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  13809794 aagggacgaaaaaaattctcaaaagagttttataattagagacggag 13809840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 20656095 - 20656341
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20656095 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaataactattgcttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 20656194  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  20656195 gttatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 20656294  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||        ||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20656295 aagagacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattaggaacggag 20656341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 26593550 - 26593796
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  26593550 gaattaagataatagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 26593649  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  26593650 gttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaa 26593749  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26593750 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 26593796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37728964 - 37728719
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  37728964 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttatc-tttaagagagagagttagtttatgttttccatat 37728866  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37728865 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 37728766  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37728765 aagggacaacaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggag 37728719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 43978409 - 43978166
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||     
T  43978409 aattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatg 43978312  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||   |||||||||||    
T  43978311 ttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaa 43978212  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || |||        |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43978211 agagacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggag 43978166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Original strand, 45048807 - 45049049
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  45048807 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 45048906  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  45048907 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 45049006  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||       ||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  45049007 aagggacaaaattttttttcaaaaaggtcttataattaaggac 45049049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 50730576 - 50730371
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  | ||| |||||||||||||||     
T  50730576 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatg 50730477  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50730476 ttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaa 50730377  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  50730376 agggac 50730371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Original strand, 50782278 - 50782483
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||  | ||| |||||||||||||||     
T  50782278 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagagatagatggtttatgttttcaacatg 50782377  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  50782378 ttatttgttgctgatcgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaa 50782477  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  50782478 agggac 50782483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10221180 - 10220939
Alignment:
Q  148 attaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattc 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||      
T  10221180 attaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacatga 10221083  T
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  10221082 tatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaaa 10220983  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10220982 gggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 10220939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 394
Target Start/End: Original strand, 17591282 - 17591578
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  17591282 ttatactccctccatccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 17591381  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17591382 tttacaattttatc-tttaagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 17591480  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagta 394  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  17591481 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggagggagta 17591578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 17698772 - 17699062
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17698772 atactacctccatccttaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 17698871  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  17698872 tacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacacgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtttaattaataggggcgtgtatg 17698969  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17698970 taaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaaaggac-aaaaaatttctcaaaatggtcttataattagggacggag 17699062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 16434977 - 16435267
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16434977 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16435076  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16435077 acaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 16435175  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16435176 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagagacggag 16435267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35711525 - 35711282
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   ||   || ||||||||| ||    
T  35711525 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttcatttgtgttttcaatat 35711428  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  35711427 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaa 35711328  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35711327 aagggacaaaaaaaattctcaaaa-ggtcttataattagggacggag 35711282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 48910122 - 48909882
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  48910122 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttattatttaagagagag--ttggtttatgttttcaacat 48910025  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||   |||||||||||    
T  48910024 gttatttattattgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagtaggtcttataaa 48909925  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48909924 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggac 48909882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 43557238 - 43557484
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  43557238 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttattatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacat 43557337  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  43557338 gttatttattggtaattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaatgattaatgtagttgaaaatagcaaatggatcttataaa 43557437  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||        |||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  43557438 aaggaacaaaaaaaattctcaaaagagttttataattaaggacggag 43557484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 188 - 392
Target Start/End: Original strand, 12683009 - 12683213
Alignment:
Q  188 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12683009 actattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 12683108  T
Q  288 gggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||    
T  12683109 gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggactaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaggga 12683208  T
Q  388 cggag 392  Q
    |||||    
T  12683209 cggag 12683213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20862495 - 20862203
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||    
T  20862495 atactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttt 20862396  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||| | | | |||| ||| | |||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20862395 tacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatt-attgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtat 20862297  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20862296 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 20862203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4024348 - 4024058
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  |||| |||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  4024348 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaat-aagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 4024250  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4024249 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 4024151  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4024150 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggag 4024058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 388
Target Start/End: Original strand, 52058985 - 52059272
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  52058985 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 52059084  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52059085 acaattttatcctt-aagagagagagtttgtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 52059183  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  52059184 aaagaagtaattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggac 52059272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 1641885 - 1642130
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || | |||||||||||||||    
T  1641885 gaattaagatagtagatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatg-ttagtttatgttttcaacat 1641983  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||    
T  1641984 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaagtcttataaa 1642083  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  1642084 aagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttatagttagggatggag 1642130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 38071446 - 38071204
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||| |||||||||     
T  38071446 aattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagaggattggtttatgctttcaacatg 38071347  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||| | |||||||||||    
T  38071346 ttatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaaatgagtcttataaaa 38071247  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    | ||||       || ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  38071246 aaggacaaaaaaattcctcaaaaggatcttataattaaggacg 38071204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 36005801 - 36005553
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  36005801 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 36005702  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36005701 acaattttatcttttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 36005602  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||    
T  36005601 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaag 36005553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10045137 - 10044848
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  10045137 tactacatccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgcattaaagctgtttgtaatcactattgttttt 10045038  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||  || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10045037 acaattttatcctg-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 10044939  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||       ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10044938 aaagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaagggacaatttttttt-tcaaaaggatcttataattagggacggag 10044848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 36099262 - 36098973
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  36099262 atactccctctgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggataattgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 36099163  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36099162 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatcgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 36099064  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| ||||| | || |||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36099063 taaagaaataattaatgtaattggaaata-acaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacgga 36098973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 9779979 - 9780272
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  9779979 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattattattgttttt 9780078  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||| |||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9780079 acaatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 9780177  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac--nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||         ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9780178 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaatttttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 9780272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 54604373 - 54604619
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||||||||||||||    
T  54604373 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaatgaatgttagtttatgttttcaacat 54604472  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  54604473 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatggatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 54604572  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |  ||||        || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54604573 agaggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataattaaggacggag 54604619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 104 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 52044781 - 52044540
Alignment:
Q  104 acctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  52044781 acctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaa 52044682  T
Q  204 ttttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaag 303  Q
    ||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  52044681 ttttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatatatgtaaag 52044584  T
Q  304 aaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||    
T  52044583 aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaa 52044540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14759086 - 14758844
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  14759086 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 14758989  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  14758988 gttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcaa--atgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaa 14758891  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14758890 aagggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataattagggacggag 14758844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26058790 - 26058552
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  26058790 gaattaagatattggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 26058691  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
         |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  26058690 ----gttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggg----gtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 26058599  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26058598 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 26058552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 42390643 - 42390895
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||       ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42390643 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgagaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 42390742  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
     |||||||||| ||||| | |||| ||| | |||||||||||||||   |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42390743 gcaattttatcatttaagagagagagttagtttatgttttcaacatgtaatttattgcaaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgt 42390842  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||| |||||||||| | ||||| | |||  ||||  |||||||||||||||||    
T  42390843 aaataaataattaatgcagttggagataacaaagatgtcttataaaaagggac 42390895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48214048 - 48213758
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  48214048 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattattttt 48213949  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||| |||||||||||| | |||    ||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  48213948 acaagtttatcctttaagagagaaa--tggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatatatgt 48213851  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||| ||||        |||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  48213850 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcctataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaagaacggag 48213758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Original strand, 49383640 - 49383864
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  49383640 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaatagagagggttggtttatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaga 49383739  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||  ||||||||||||| | ||        |||||||    
T  49383740 aaaaaatatataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaacgaacaaaaaaaattctcaa 49383839  T
Q  368 aagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||    
T  49383840 aagagtcttataattagagacggag 49383864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2993505 - 2993265
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattcta 249  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||    
T  2993505 taaggtagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgtta 2993408  T
Q  250 tttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  2993407 tttattgttgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaatgagtcttataaaaagg 2993308  T
Q  350 gacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||         |||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  2993307 gacaaaaaaaaatctcaaaatgatcttataattagggacggag 2993265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 26806166 - 26806366
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || | ||| |||| | |||||||||| | ||    
T  26806166 gaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagaaggttagtttatgttttccatat 26806264  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26806265 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 26806364  T
Q  346 aa 347  Q
    ||    
T  26806365 aa 26806366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Original strand, 52291214 - 52291415
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | ||||   |   |||||||||||||||    
T  52291214 gaattaagatagtggatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttattctttaagagagaga--taatttatgttttcaacat 52291311  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  52291312 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 52291411  T
Q  346 aagg 349  Q
    ||||    
T  52291412 aagg 52291415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 147 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 54866524 - 54866388
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54866524 aattaagatagtgaatatttatattaattatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaataaagagggttggcttatgttttcaacatt 54866425  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54866424 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 54866388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 345
Target Start/End: Original strand, 41992279 - 41992509
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41992279 tactacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 41992378  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||               || |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41992379 acaattttatcct---------------ggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgt 41992463  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  41992464 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 41992509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 51283848 - 51284093
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||| | ||| |||||| | ||    
T  51283848 gaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttagtttacgttttccatat 51283946  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat-aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| || | ||||||    
T  51283947 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggattttataa 51284046  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51284047 aaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 51284093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32978778 - 32978487
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32978778 atactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 32978679  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| || ||||  || ||||||||||||||||||| |||    
T  32978678 tacaattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaatatgatatttattgttgattaaaaaaaattatatataataaataggggcatgcatg 32978581  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga-cnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||| |||         ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32978580 taaagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaaaggataaattttttttttcaaaaggatcttataattagggacggag 32978487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 35572243 - 35572446
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa--aaaagagggttggcttatgttttcaac 243  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||   | |||| ||||| |||||||||||||    
T  35572243 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttataattactattgattttacaattttatcctttaagggagagagagttggtttatgttttcaac 35572342  T
Q  244 attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  35572343 atgtcatttactgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg-----ttatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttata 35572437  T
Q  344 aaaagggac 352  Q
    |||||||||    
T  35572438 aaaagggac 35572446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 39952522 - 39952286
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| || | |||| ||| | |||||||||  | ||    
T  39952522 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatat 39952424  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  39952423 gctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaa 39952324  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  39952323 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattag 39952286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 160 - 352
Target Start/End: Original strand, 33361500 - 33361684
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||    
T  33361500 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctg 33361599  T
Q  260 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||||||||| ||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  33361600 attgaagaaaaagatgtataataagtaggg--------gtaaagaaataattaatgtagttggaaaaagcaaagaggtcttataaaaagggac 33361684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 36317442 - 36317646
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | ||||||||||   ||    
T  36317442 gaattaaga-agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccttat 36317539  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  36317540 gctatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtgaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 36317639  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  36317640 aagggac 36317646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 159 - 392
Target Start/End: Original strand, 26306406 - 26306638
Alignment:
Q  159 ggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgct 258  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||   |||||||||| | || ||| ||||||||    
T  26306406 ggatatttgtattaaagttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagcgagagagttaatttatgttttccatatgctacttattgct 26306504  T
Q  259 gattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnn 358  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||| ||||          
T  26306505 gattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaaaggacaaaaaa 26306604  T
Q  359 ntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26306605 aattctcaaaagggtcttataattaggaacggag 26306638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 41824358 - 41824155
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||     
T  41824358 aattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 41824260  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  41824259 ctatttattgttgattcaagaaaaaagtgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagatgtcttataaaa 41824160  T
Q  347 aggga 351  Q
    |||||    
T  41824159 aggga 41824155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 188 - 392
Target Start/End: Original strand, 44542301 - 44542504
Alignment:
Q  188 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  44542301 actattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataa 44542400  T
Q  288 gggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||   |||||||||||| | ||         ||||||||||||||||||||||||||    
T  44542401 gaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaaaatgtcttataaaaaagaacaaaaaaa-atctcaaaagggtcttataattaggga 44542499  T
Q  388 cggag 392  Q
    |||||    
T  44542500 cggag 44542504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 162 - 391
Target Start/End: Original strand, 22832411 - 22832637
Alignment:
Q  162 tatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgat 261  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||| |||||    
T  22832411 tatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattactgat 22832509  T
Q  262 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntt 361  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| |           |    
T  22832510 tgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaatga--taaaaaaat 22832607  T
Q  362 tctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22832608 tctcaaaagggtcttataattagggacgga 22832637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33976777 - 33976554
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||| ||||       |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33976777 tactacctccatcccgaattataggacccttttaaaaaaataacagaaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgctttt 33976678  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    | ||||||||||||| |    || || ||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33976677 ataattttatcctttga----gatggatgatttatgttttcaacatgttatttatggctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt 33976582  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  33976581 aaagaaataattaatgtagttggaaata 33976554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 286
Target Start/End: Original strand, 37144228 - 37144413
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataaga-ccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaa-tatgtttgtaattactattgttttta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37144228 tacctccgtccctaattataagaacccttttgaaaaattaacgggaattaagatagtggatatttttattaaaatatgtttgtaattactattgttttta 37144327  T
Q  201 caattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||||||||| ||||| | |||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37144328 caattttatcttttaagagagagagttgatttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 37144413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 54849615 - 54849409
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||   |||||||||||||||    
T  54849615 gaattaagaaagtggatatttacattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagatggttactttatgttttcaacat 54849516  T
Q  246 tctatttattgctgattgaaga-aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
      |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||| || ||||||||    
T  54849515 gttatttattgctgattgaagaaaaaatatgtataataaat-ggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtacttgaaaataacaaatggatcttataa 54849417  T
Q  345 aaagggac 352  Q
    ||||||||    
T  54849416 aaagggac 54849409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 53271842 - 53271642
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | || | ||| | |||||||||| | ||    
T  53271842 gaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcac-attgtttttacaattttatcctt-aagagagggagttagtttatgttttccatat 53271745  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||| |||||||||    
T  53271744 gttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaagggatcttataaa 53271645  T
Q  346 aag 348  Q
    |||    
T  53271644 aag 53271642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20877881 - 20877640
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||   || |||| ||| | ||| |||||| | ||     
T  20877881 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattacttttacaattttattctt---aagagagagttagtttacgttttccatatg 20877785  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | ||||||||||    
T  20877784 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaagatcttataaaa 20877685  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||       ||| ||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20877684 agggacaacaaattttttcaaaaaagtcttataattagagacgga 20877640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 224 - 345
Target Start/End: Original strand, 46557746 - 46557867
Alignment:
Q  224 ggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaa 323  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  46557746 ggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgga 46557845  T
Q  324 aatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  46557846 aatagaaaagggatcttataaa 46557867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 225 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 49543850 - 49543684
Alignment:
Q  225 gttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaa 324  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  49543850 gttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaaaaaaaagatgtatgataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaa 49543751  T
Q  325 atagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49543750 atagcaaaagagtcttataaaaagggacaacaaattttctcaaaagggtcttataattagggacgga 49543684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 286
Target Start/End: Original strand, 19350162 - 19350302
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  19350162 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttataaatttatccttcaaaagagagagttggtttatgttttcaacat 19350261  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19350262 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaata 19350302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 169 - 392
Target Start/End: Original strand, 27646115 - 27646337
Alignment:
Q  169 attaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaa 268  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  27646115 attaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 27646213  T
Q  269 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaa 368  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || |  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||||||| |||       |||||||||    
T  27646214 aaagatgcaaaataaataagggtatcttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaa 27646313  T
Q  369 agggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  27646314 aggatcttataattagggacggag 27646337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 41392665 - 41392911
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | || ||||| |||| ||||||||||    
T  41392665 gaattaagaaagttgattgtagtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatcctttaagagatagagttggtttatattttcaacat 41392764  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||   | |||||| ||| ||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||| |||    
T  41392765 agtatttattgttgattgaagaaaaatatgggaagtaaataagggtatgttgataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttacaaa 41392864  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41392865 aagggacgaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 41392911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 47008309 - 47008533
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  47008309 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattcttgattgaag 47008407  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||    
T  47008408 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctca 47008507  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  47008508 aaagtgtcttataattagggacggag 47008533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 146 - 393
Target Start/End: Original strand, 22527408 - 22527653
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||| | | || || ||| | |||||||| ||  ||    
T  22527408 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgttaggaatcactattgtttt-acaattttatccttaagagaa-agtgttagtttatgtttccat-at 22527504  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc-atgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||    
T  22527505 gctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggagccatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatcttataa 22527604  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagt 393  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22527605 aaagggataaaataatttctcaaaagggtcttataattaaggacggagt 22527653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 169 - 392
Target Start/End: Original strand, 1111457 - 1111679
Alignment:
Q  169 attaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaa 268  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  1111457 attaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 1111555  T
Q  269 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaa 368  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || |  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||| |||       |||||||||    
T  1111556 aaagatgcaaaataaataagggtatcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaa 1111655  T
Q  369 agggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  1111656 agggtcttataattagggacggag 1111679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23308190 - 23308059
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||    
T  23308190 gaattaagacagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggttagtttatgttttcaacat 23308091  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgta 277  Q
      ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23308090 gttatttattgctgattaaaaaaaaagatgta 23308059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25879391 - 25879256
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || ||||| |||||||||||||||    
T  25879391 gaattaagatagtggatatttgcattaaatatgtttgcaattactattgtttttacaattttatcttttaagagatagagttggtttatgttttcaacat 25879292  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 281  Q
      ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25879291 gttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataat 25879256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Original strand, 16776696 - 16776918
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaa 269  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | |||||||| |  |||||||||||  |  |||||| |||||||||||||||    
T  16776696 taaatttgtttgtaattactattgtttttacaaatttgtccttttaagagagagggttagtgtatgttttcaatgtagtatttaatgctgattgaagaaa 16776795  T
Q  270 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaa 369  Q
    ||||| || |||||||||||| || |  |||||||| ||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||    
T  16776796 aagatataaaataaataggggtatattggtaaagaattaattaatgtacttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaattttttttctcaaaa 16776895  T
Q  370 gggtcttataattagggacggag 392  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  16776896 ggatcctataattagggacggag 16776918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 147 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 1572580 - 1572336
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||| | ||     
T  1572580 aattaagaaaattgatatttatattaaagttgtttgtaatcgttattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttccatatg 1572484  T
Q  247 ctatttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||| |||||| || ||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  1572483 ttatttattgttgattggaaaaaaaaaatgtataatgaatatgggcatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 1572384  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagt 393  Q
    || ||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1572383 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggagt 1572336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 247 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9582394 - 9582249
Alignment:
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  9582394 ctatttatttttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatatagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 9582295  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||       |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9582294 agggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggatggag 9582249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 196 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30820079 - 30819884
Alignment:
Q  196 ttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||    
T  30820079 ttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgt 30819981  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
      |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30819980 tagtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctcaaaagggtcttatagttagggacggag 30819884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Original strand, 44561503 - 44561685
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  44561503 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 44561601  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  44561602 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 44561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 98 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29383314 - 29383064
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||       ||||  ||||||||| | | |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  29383314 tatactacctccgtccctaaatataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagaaaattgataatagtaataaatttgtttgtaattattattgttt 29383215  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||||| ||  |||||| |  ||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||      
T  29383214 ttacaattttatccttgaagagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttaatattgattgaagaaaaagatataaaataaataagggtatgttg 29383115  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  29383114 gtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 29383064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15095428 - 15095204
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  15095428 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaag 15095330  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |  |  ||||| |||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||       |||||||    
T  15095329 aaaaagatgcaaaataaataagggtagtttggtaaacaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaattttttttctca 15095230  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15095229 aaagggttttataattagggacggag 15095204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 17589683 - 17589907
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  17589683 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 17589781  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| |||    
T  17589782 aaaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaattattttttca 17589881  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  17589882 aaagtgtcttataattagggacggag 17589907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Original strand, 18658165 - 18658284
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18658165 ttatactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 18658264  T
Q  197 tttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18658265 tttacaattttatcctttaa 18658284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 158 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36600382 - 36600189
Alignment:
Q  158 tggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgc 257  Q
    ||||||||| |||||||   |||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| || | |||| ||| | ||||||||||   || |||||||||||    
T  36600382 tggatatttatattaaagtcgtttgtaagtaccattgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccttatgctatttattgc 36600284  T
Q  258 tgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||    
T  36600283 cgattcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatataaagaagtaattaatgtagttgaaaatagcaaataggtgttataaaaaaggac 36600189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Original strand, 41750972 - 41751097
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||  ||||| |||||||||||||||    
T  41750972 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttgagagagaaagttggtttatgttttcaacat 41751071  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaa 271  Q
      |||||| || |||||||| |||||    
T  41751072 gttatttaatgttgattgaaaaaaaa 41751097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Original strand, 28810928 - 28811107
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  28810928 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 28811026  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  28811027 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaa 28811107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 384
Target Start/End: Original strand, 42526432 - 42526648
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  42526432 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 42526530  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||| || || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||| |||||||||||       ||| |||    
T  42526531 aaagaggtgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatactaaagaggtcttgtaaaaagggacaaattattttttca 42526630  T
Q  367 aaagggtcttataattag 384  Q
    ||||||| ||||||||||    
T  42526631 aaagggttttataattag 42526648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 175 - 352
Target Start/End: Original strand, 43408542 - 43408720
Alignment:
Q  175 tatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-aaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga 273  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| || | | ||||| | ||    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||    
T  43408542 tatgtttataattagtattgtttttacaattttatctttaagagaaagacgatt----tatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaga 43408637  T
Q  274 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta----acgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    ||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  43408638 tgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtacgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggac 43408720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 48904070 - 48904294
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  48904070 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 48904168  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| | |    
T  48904169 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttta 48904268  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  48904269 aaagggtcttataattagggacggag 48904294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 25916654 - 25916450
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||  ||   |||| ||| | | ||    
T  25916654 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcagaga-gagaattaatttatatttcccatat 25916556  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg---tatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat 342  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||   ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||    
T  25916555 attatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaattgaggcatgcaatatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaatgggtcttat 25916456  T
Q  343 aaaaag 348  Q
    ||||||    
T  25916455 aaaaag 25916450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 188 - 352
Target Start/End: Original strand, 7886890 - 7887053
Alignment:
Q  188 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| | | || || |||| ||||||||||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7886890 actattatttttacaattttattcttaagagaa-agagttgacttatgtttttcatatgctatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatag 7886988  T
Q  288 gggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
     | |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  7886989 agacatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggac 7887053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 29719518 - 29719741
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  29719518 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttgaacatactatttattgttgattgaag 29719616  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||| | ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||| |||||||||| ||        |||||||    
T  29719617 aaaaaaatgcaaaataaagaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggttttataaaaagaga-taatttttttctca 29719715  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29719716 aaagggtcttataattatggacggag 29719741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 54927897 - 54928122
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  54927897 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcatttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 54927996  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | ||||||||   | ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||| | || |||||||||| |||       |||||||    
T  54927997 aaaaagatgcaaaataaataaaagtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatactaaaagagtattataaaaagagacaattttttttctca 54928096  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  54928097 aaagggttttataattaaggatggag 54928122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 149 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 46879267 - 46879088
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||  ||| |  ||||||||||| || ||    
T  46879267 ttaagaaagttgatatttgtattaaattcgtttgtaattactattgtttttacaatttatt--tttaaaaaagatagttagtgtatgttttcaatatgct 46879170  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaa--gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatag 328  Q
    |||||||||| |||||| |||||   |||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  46879169 atttattgcttattgaaaaaaaaataatgtatcataaacatgggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 46879088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 168 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38341177 - 38340996
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  38341177 tattaaatctgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 38341081  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||  || ||  |||||  |||| |||||| |||||||||||    
T  38341080 aaaagatgtaaaataaataagggtatgtttgtaaagaattaattaatatacttcgaaatactaaagaggtcttgtaaaaagggac 38340996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 34021802 - 34021982
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || | | || |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  34021802 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 34021900  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  34021901 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaag 34021982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Original strand, 39625243 - 39625312
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39625243 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 39625312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 12918645 - 12918869
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| | |||||||    
T  12918645 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagatagttaatttatattttcaatataatatttattgttaattgaag 12918743  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| || ||||||||||||||||       ||| |||    
T  12918744 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaaggatcttataaaaagggacaaattattttttca 12918843  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||    
T  12918844 agagggtcttataattagggatggag 12918869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 248 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20848711 - 20848612
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  20848711 tatttattgttgattgatgaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaa 20848612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 20849084 - 20848985
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20849084 gaattaggatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 20848985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 188 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 31533576 - 31533414
Alignment:
Q  188 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  | |||  ||| | |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31533576 actattatttttacaattttatcctt-aggagagaaagttagtttatgttttctatatgctatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaatag 31533478  T
Q  288 gggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
     | |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||  || |||||||||||||||    
T  31533477 agacatgtatgtaaagaaataattaatatagttagaaatagcaattggatcttataaaaaggga 31533414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45404604 - 45404382
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||    
T  45404604 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaag 45404506  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  ||| ||||||||||||||| |||       ||| |||    
T  45404505 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatgggtcttataaaaagagacaaattattttttca 45404407  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45404406 aaagggtcttataattagggacgga 45404382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 18658323 - 18658442
Alignment:
Q  225 gttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaa 323  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |    
T  18658323 gttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagttgga 18658422  T
Q  324 aatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  18658423 aatagcaaa-gggtcttataa 18658442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 248 - 352
Target Start/End: Original strand, 39625681 - 39625785
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||    
T  39625681 tatttattgctaattgaagaaaaatatgtataataaatagagacatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagttttataaaaa 39625780  T
Q  348 gggac 352  Q
    |||||    
T  39625781 gggac 39625785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Original strand, 32969033 - 32969254
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  32969033 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-agagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 32969131  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||  |||   ||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||| ||||||||||||||||       ||| |||    
T  32969132 aaaaa-atgcaaaataaataagggtctgttgttaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttca 32969230  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  32969231 aaagggtcttataattagggacgg 32969254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 33290594 - 33290393
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||| |||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| |||   || |||| |||   ||||||| |||||||     
T  33290594 aattaagaaagttgataatagtattaaatttgtttataattactattatttttacaattgtattctt---aagagagagttaatttatgttctcaacata 33290498  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |  |||||| |||    
T  33290497 atatttattattgattgaagaaaaagatgaaaaataaataggggtatggtggtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagtaaatgaatcttatgaaa 33290398  T
Q  347 aggga 351  Q
    |||||    
T  33290397 aggga 33290393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25130897 - 25130721
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||          ||| ||||  |||||||||  | ||    
T  25130897 gaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatctc--------gagagttgatttatgtttttcatat 25130806  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa---ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||| |||||    
T  25130805 gctatttattgctgattaaataaaaagatgtataataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattggaaata 25130721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Original strand, 12675208 - 12675284
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12675208 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaaga 12675284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42755555 - 42755347
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  42755555 taattactattgtttttataattttatcctt-aaaagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 42755457  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    ||||  || ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||  |||||||||||||| |||       ||| |||| || |||||||||||    
T  42755456 aataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaaaggtcttataaaaagagacaaattattttttcaatagagtcttataatt 42755357  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  42755356 agggacggag 42755347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 231 - 392
Target Start/End: Original strand, 48655110 - 48655270
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||||||||||| || ||| |  ||||||  |    
T  48655110 ttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataataaatgtactcaaaaatacca 48655209  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||||| |||||       |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  48655210 aagggatcttataaaacgggac-aatttttttctcaaaatggtcttataattagggatggag 48655270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 8379907 - 8379723
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||||||  |||| |||| |||||||||    
T  8379907 gtattaaatttgtatataattactactgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatattgattgttgattgaag 8379809  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||    
T  8379808 aaaaaaattcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgggtcttataaaaaaggac 8379723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 166 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 38364400 - 38364219
Alignment:
Q  166 tgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||| ||  |||| | || ||||||||    
T  38364400 tgtaataaatttatttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagagttgttatatgttttcaaaatagtattcactgttgattgaa 38364301  T
Q  266 gaaaaag-atgtataat-aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    ||||||  || || ||| ||||| ||||||||  ||||| || ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  38364300 gaaaaaacatataaaattaaataagggcatgttggtaaataattaattaatgtatttgaaaatattaaaggggtcttataaa 38364219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 183 - 384
Target Start/End: Original strand, 40215052 - 40215252
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  40215052 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaata 40215150  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||  ||| ||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||| |  |||||||||| |||||       ||| |||||||||| ||||||||    
T  40215151 aatcagggtatgttggtaaagaaacaattaatgtacttgaaaataccaaaagaatcttataaaatgggacaaattattttttcaaaagggttttataatt 40215250  T
Q  383 ag 384  Q
    ||    
T  40215251 ag 40215252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 48902516 - 48902739
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  48902516 gtattaaatttgtatataactactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 48902614  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | ||||||||  || ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||       | | | |    
T  48902615 aaaaa-atgcaaaataaataaaggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacagattattatttta 48902713  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  48902714 agagggtcttataattagggacggag 48902739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 352
Target Start/End: Original strand, 54690581 - 54690657
Alignment:
Q  276 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||    
T  54690581 tataataaatagaggcatgcatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaaaggac 54690657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4564466 - 4564243
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa-g 266  Q
    |||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||      
T  4564466 tattaaatttgtatattattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacacaatatttattgttgattgaata 4564368  T
Q  267 aaaaagatgtataataaatagggg--catgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttct 364  Q
    ||||||||| | |||||||| |||   ||||  ||||||||||||| || ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||       ||| |    
T  4564367 aaaaagatgcaaaataaataagggtatatgttagtaaagaaataatcaatgtacttggaaatactaaagaggtcttataaaaagggac---aattttttt 4564271  T
Q  365 caaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||    
T  4564270 caaaagagtcttataattagggacggag 4564243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 285 - 392
Target Start/End: Original strand, 7462921 - 7463028
Alignment:
Q  285 taggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||    
T  7462921 taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattag 7463020  T
Q  385 ggacggag 392  Q
     |||||||    
T  7463021 agacggag 7463028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 28875059 - 28875282
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||   |||| |||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  28875059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc--ttaagagagagagttaatttatatttttaatataatatttattgttgattgaag 28875156  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  |||      ||||||||||||||       ||| |||    
T  28875157 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaatatcaaaaaaaatttataaaaagggacaaattattttttca 28875256  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28875257 aaagggtcttataattagggacggag 28875282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 274
Target Start/End: Original strand, 13702666 - 13702769
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||||| |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13702666 taaatttgtttgtaattgctattcttttaacaattttatcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaacatagtatttaatgctgattgaagaaaa 13702765  T
Q  271 agat 274  Q
    ||||    
T  13702766 agat 13702769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 35938594 - 35938469
Alignment:
Q  165 ttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattga 264  Q
    ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |  ||||||||||||||  || ||| || |||| ||    
T  35938594 ttgtaataaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtgtatgttttcaacatgataattaatgttgatcga 35938495  T
Q  265 agaaaaagatgtataataaatagggg 290  Q
    |||||||||| || ||||||||||||    
T  35938494 agaaaaagatataaaataaatagggg 35938469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 42044061 - 42044283
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  42044061 gtattaaatttgtgtataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 42044159  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||  ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || ||| ||| |  |||  | |||||||||||| |||       ||| | |    
T  42044160 aaaa--atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaacaccaaaaagatcttataaaaagagacaaattattttttta 42044257  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42044258 aaaggatcttataattagggacggag 42044283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 55287428 - 55287335
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaa 324  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  55287428 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataattaatgtagttgaaa 55287335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 31541252 - 31541023
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | || ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  31541252 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagaaagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 31541154  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| |    ||||| ||| ||||  ||||||| |||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| | |    
T  31541153 aaaaa-atgca----aaataagggtatgttggtaaagatataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttta 31541059  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggagtaatagtatttt 404  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  31541058 aaatgatcttataattagggacggag--atagtatttt 31541023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24813814 - 24813657
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||  ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  24813814 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagaaagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 24813718  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||| |||| ||| ||| |||||    
T  24813717 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaatatttaatgtacttggaaata 24813657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40048081 - 40047979
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | | ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||| ||||||    
T  40048081 tatttattgctgattgaagaaaaatatgtaaaataaataagtgtatgttagtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttgtaaaaa 40047982  T
Q  348 ggg 350  Q
    |||    
T  40047981 ggg 40047979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 275 - 349
Target Start/End: Original strand, 41751383 - 41751457
Alignment:
Q  275 gtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||||||||    
T  41751383 gtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaacgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagg 41751457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 9582461 - 9582396
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9582461 gaattaagaaagtggatatttgtatcaaagttgtttggaattactattgtttttacaattttatcc 9582396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 34265510 - 34265696
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agaggg----ttggcttatgttttc 240  Q
    ||||||||| ||| | || | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | | ||| |     || | ||||||||||    
T  34265510 gaattaagaaagtcggtagtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagagagatgaataattagtttatgttttc 34265609  T
Q  241 aacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  34265610 aacatagtatttattgtcgattgaagaaaaagatgcaaaataaataaaggtatgttagtaaagaaataattaatgtaattgaaaata 34265696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34811543 - 34811321
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||| | | || || |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  34811543 gtattaaatttgtatataattactattgcttt-acaattttatccttaagagaa-agagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 34811446  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||  ||| | |||||||| | | ||||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||  ||| || ||||||||||||||||       ||| |||    
T  34811445 aaaagaatgcaaaataaataagagtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaaggatcttataaaaagggacaaattatttt-tca 34811347  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34811346 aaaggatcttataattagggacggag 34811321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 36584935 - 36584720
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||    |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  36584935 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt---aagagagagtaaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 36584839  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||   || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||   |||||||||||||||||       ||| |||    
T  36584838 aaaa---tgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaataagtcttataaaaagggacaaattattttttca 36584742  T
Q  367 aaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||| |||||||||||||||||    
T  36584741 aaagagtcttataattagggac 36584720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 231 - 390
Target Start/End: Original strand, 52693558 - 52693718
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||   ||||||||||||||| ||| ||| |||||  |    
T  52693558 ttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttgttaaagaaataattaatgtacttggaaatacca 52693657  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgg 390  Q
    ||  ||||||||||||||||||        ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  52693658 aaatggtcttataaaaagggacaaattatttttttcaaaaggatcttataattagggacgg 52693718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 176 - 383
Target Start/End: Original strand, 2764219 - 2764424
Alignment:
Q  176 atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatg 275  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||| || ||| ||||||||  |||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2764219 atgtatgtaattgctattgtttttaca-tttgatactt-aaaaaagaaagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatg 2764316  T
Q  276 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtct 375  Q
     | |||||||| ||| |||   ||||||||| |||||| | | |||||||||  |||||  || |||||||||| ||       || ||||||| |||||    
T  2764317 caaaataaataagggtatgctggtaaagaaacaattaatgcaattgaaaataccaaaggaatcatataaaaaggaacaaattttttactcaaaatggtct 2764416  T
Q  376 tataatta 383  Q
    ||||||||    
T  2764417 tataatta 2764424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 290
Target Start/End: Original strand, 23650639 - 23650761
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||| |  ||| | |||||||||||||||  || |||||  | |||| |||    
T  23650639 tattaaatttgtttgtaattagtaatgtttttacaattttatcctttatgaaaaaaagttagtttatgttttcaacataatacttattattaattggaga 23650738  T
Q  268 aaaagatgtataataaatagggg 290  Q
    |||| | ||| ||||||||||||    
T  23650739 aaaataagtaaaataaatagggg 23650761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 286
Target Start/End: Original strand, 4836516 - 4836616
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||    
T  4836516 taattactattgtttttacgattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttatttttgattgaagaaaaagatgcaaaata 4836612  T
Q  283 aata 286  Q
    ||||    
T  4836613 aata 4836616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7886532 - 7886455
Alignment:
Q  275 gtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  7886532 gtataataaatatgagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaaaatggac 7886455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20919189 - 20919133
Alignment:
Q  291 catgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20919189 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20919133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 20928151 - 20928095
Alignment:
Q  291 catgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  20928151 catgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagtaaaggggtcttataaaaa 20928095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 343
Target Start/End: Original strand, 49543990 - 49544161
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| |||   ||||||||| || ||  |||||| || |||||||||||||    
T  49543990 taaatttgttggtaattactattggttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgtttttaatatagtatttaatgttgattgaagaaaa 49544088  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    | ||  | |||||||||||| |||   || || || ||||||| | | |||||||||  ||||||||||||||    
T  49544089 atatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttgaaaataacaaaggggtcttata 49544161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 21497618 - 21497734
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||      
T  21497618 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattga-- 21497714  T
Q  267 aaaaagatgtataataaata 286  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  21497715 aaaaagatgcaaaataaata 21497734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 382
Target Start/End: Original strand, 48136964 - 48137106
Alignment:
Q  236 ttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggg 335  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| ||||| ||| |||    |||||| |||||| ||||       
T  48136964 ttttcaacatattatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaatagagctatgtaggtaaaaaaaaaat----gtagttaaaaatataaaaaat 48137059  T
Q  336 gtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||    
T  48137060 gtcttataaaaagggacacaaaatattctcaaaagagtcttataatt 48137106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 40048192 - 40048141
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa 219  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40048192 tattcaatttgtttgaaattactattgtttttacaattatatcctttaaaaa 40048141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 277
Target Start/End: Original strand, 54690380 - 54690435
Alignment:
Q  220 agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgta 277  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54690380 agagagttggtttatgttttcaacatt--atttattggtgattgaagaaaaagatgta 54690435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 17699069 - 17699036
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17699069 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 17699036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #209
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 20084697 - 20084742
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20084697 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttatcctttaa 20084742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #210
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 31398006 - 31397957
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31398006 gtattaaatttctttataattactattgtttttacaattatatcctttaa 31397957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #211
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 191
Target Start/End: Original strand, 46557700 - 46557745
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 191  Q
    ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46557700 gaattaaaataatggatatatgtattaaatatgtttgtaattacta 46557745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #212
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 204 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 27067581 - 27067501
Alignment:
Q  204 ttttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 284  Q
    |||||| |||||| | |||| ||| | ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  27067581 ttttattctttaagagagagagtttgtttatgttttcaacatgctatttatggtagattgaataaaaaaatgtataataaa 27067501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #213
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28875292 - 28875256
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28875292 attatactacctccgtccctaattataagaccctttt 28875256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 242
Target Start/End: Original strand, 16776557 - 16776628
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaa 242  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||| | || ||||| |  |||||||||||    
T  16776557 taaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttgtcctttaagagagggggttagtgtatgttttcaa 16776628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #215
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20918256 - 20918225
Alignment:
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918256 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 20918225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #216
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20927218 - 20927187
Alignment:
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20927218 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 20927187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #217
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 286
Target Start/End: Original strand, 51486231 - 51486286
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||| ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  51486231 ttatattttcaacatgatatttatcgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaata 51486286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Original strand, 8503312 - 8503354
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8503312 taaatttgttggtaattactattggttttacaattttatcctt 8503354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 96 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 17589917 - 17589887
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17589917 attatactacctccgtccctaattataagac 17589887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 22494483 - 22494544
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||| ||||  |||||||||||||||    
T  22494483 taattactattatttttacaattttatcc-ttaagagagagagttgatttatgttttcaacat 22494544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 33976501 - 33976535
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33976501 tatattacctccgtccctaattataagaccatttt 33976535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 126
Target Start/End: Original strand, 42755333 - 42755367
Alignment:
Q  92 aaacattatactacctccgtccctaattataagac 126  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42755333 aaacataatactacctccgtccctaattataagac 42755367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 97 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 50433429 - 50433399
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagacc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50433429 ttatactacctccgtccctaattataagacc 50433399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #224
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 352
Target Start/End: Original strand, 1330913 - 1330998
Alignment:
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||| | | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  1330913 aaaaatatgtagagtaaataggggtaattgtgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggac 1330998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #225
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 2993258 - 2993291
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2993258 atactacctccgtccctaattataagatcatttt 2993291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #226
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 4759389 - 4759356
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4759389 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 4759356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 10015827 - 10015794
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10015827 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 10015794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12906451 - 12906418
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12906451 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 12906418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19897874 - 19897841
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19897874 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 19897841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 23307778 - 23307705
Alignment:
Q  275 gtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || |||| | ||| |||||||    
T  23307778 gtataataaataaggacatgtatgtgaaaaaaataattaatgtagttgaaaagagcaaagagatctcataaaaa 23307705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 24087373 - 24087340
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24087373 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 24087340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 36732224 - 36732179
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  36732224 taaatttgtttgtaattcctattatttttacaattttattctttaa 36732179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41392918 - 41392885
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41392918 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 41392885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #234
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 46845530 - 46845497
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46845530 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 46845497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #235
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 48904301 - 48904268
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48904301 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 48904268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #236
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 53361893 - 53361860
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  53361893 atactccctccgtccctaattataagaccatttt 53361860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 113)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7772474 - 7772182
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7772474 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgtgaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 7772375  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7772374 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 7772275  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7772274 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 7772182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 25045382 - 25045674
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25045382 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25045481  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25045482 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattatatctattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25045581  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25045582 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 25045674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9342136 - 9341844
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9342136 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgttttt 9342037  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9342036 acaattttatcctttaagaaagaaggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9341937  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9341936 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 9341844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 17227267 - 17227558
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17227267 tactacctccgtctttaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattgaatatgtttgtaattactattgttttt 17227366  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17227367 acaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17227466  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17227467 aaagaaataattaatgtagttagaaatagaaaataggtcttataaaaagggac-aaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 17227558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2090958 - 2090664
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  | ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2090958 atactacctacgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 2090859  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  2090858 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatg 2090759  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2090758 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttgtaaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 2090664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 13010857 - 13011151
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||  || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13010857 tatactacctccgtccctaattacaaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatgactattgttt 13010956  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13010957 ttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 13011056  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||| |||       |||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  13011057 gtaaagaaataattaacgtagttggaaatagaaaatgagttttataaaaagcgacaaaaaattttctcaaaaggatcttataattaaggacggag 13011151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 149 - 347
Target Start/End: Original strand, 15966950 - 15967148
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15966950 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattct 15967049  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15967050 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 15967148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 19418863 - 19419115
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418863 tactacatctgtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 19418962  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  19418963 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaagagatgtacaataaatagggacatgtatgt 19419062  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19419063 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaaagggac 19419115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 34915282 - 34915574
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34915282 tactaccttcgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattgagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34915381  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34915382 acaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgt 34915481  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34915482 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggacttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 34915574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 99 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16122552 - 16122302
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16122552 atactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttt 16122454  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16122453 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatg 16122354  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  16122353 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaggg 16122302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 31149985 - 31150277
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31149985 tatactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtttatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 31150084  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31150085 ttacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 31150182  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31150183 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataaatagggacggag 31150277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 389
Target Start/End: Original strand, 31487110 - 31487399
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487110 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31487209  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487210 acaatttaatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 31487309  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31487310 aaagaaataattaatgtagttggaaattgcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaagaaattctcaaaagggttttataattagggacg 31487399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 34301617 - 34301863
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34301617 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacat 34301716  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  34301717 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 34301816  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34301817 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 34301863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13866892 - 13866599
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13866892 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 13866793  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13866792 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacttgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatg 13866695  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttct--caaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||       |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13866694 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttcttccaaaagggtcttataattagggacggag 13866599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11847869 - 11847577
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11847869 tactccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 11847770  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  11847769 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgt 11847670  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||        |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11847669 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaaggatcttataattagggacggag 11847577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 20449919 - 20450212
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20449919 atactacctccgtccctaattaaaggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 20450018  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
     ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20450019 gacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 20450118  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  20450119 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttttaattagggatggag 20450212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6147635 - 6147389
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  6147635 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 6147536  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6147535 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 6147436  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6147435 aagggaccaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggag 6147389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8670432 - 8670141
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8670432 atactacctccgtccctaattatagtacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 8670333  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8670332 tacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 8670235  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8670234 taaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtctgataattaggaacggag 8670141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 402362 - 402652
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  402362 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 402461  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  402462 acagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 402559  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  402560 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 402652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Original strand, 13647865 - 13648160
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||       ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647865 ttatactccctccgtcccttattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 13647964  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13647965 tttacaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatttataataaataggggcatgta 13648064  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13648065 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaaggacggag 13648160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15498926 - 15498635
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15498926 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 15498827  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15498826 tacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 15498729  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15498728 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 15498635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 925672 - 925964
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  925672 tatactccctccgttcctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 925771  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||    
T  925772 ttacaattttatcctttaagagagaa--ttgttttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcat 925869  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  925870 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggag 925964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 13690517 - 13690762
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13690517 gaattaagataatgaatatttatattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcatcat 13690616  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   ||||||||||    
T  13690617 tatatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaataagtcttataaa 13690716  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13690717 aagggacaaattttttt-tcaaaaggatcttataattaggaacggag 13690762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33488083 - 33487839
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  33488083 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 33487984  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33487983 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 33487884  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33487883 aagagacaaaaaa--ttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 33487839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31091744 - 31091451
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  31091744 ttatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 31091645  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  31091644 tttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgta 31091547  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31091546 tgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 31091451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 1147054 - 1147297
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||    
T  1147054 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacat 1147151  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  1147152 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 1147251  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1147252 aagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacgga 1147297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25197404 - 25197158
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  25197404 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 25197305  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  25197304 gttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 25197205  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25197204 aagggataaaaaaatttctcaaaaggatcttataattagggacggag 25197158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30248899 - 30248653
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  30248899 gaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 30248800  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  30248799 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaa 30248700  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30248699 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 30248653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12144076 - 12143785
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12144076 atactccctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttt 12143977  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| |||    
T  12143976 tacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattaaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatg 12143879  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||         ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12143878 taaagaaataattaatatagttgaaaatagcaaaggggttttataaaaagggacaaaaaaaactcttaaaagtgtcttataattagggacggag 12143785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23604714 - 23604466
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  23604714 gaattaagatagtgaatatttgtattagatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggattatgttttcaacat 23604615  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23604614 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtgtaataaataagggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaa 23604515  T
Q  346 aagggac--nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||         |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23604514 aagagacaaaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 23604466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 105 - 392
Target Start/End: Original strand, 19097547 - 19097832
Alignment:
Q  105 cctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 204  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19097547 cctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaat 19097646  T
Q  205 tttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 304  Q
    |||||||||||| | |||   |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  19097647 tttatcctttaagagagaa--ttggtttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatataaaga 19097744  T
Q  305 aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19097745 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggag 19097832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5457664 - 5457418
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  5457664 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 5457565  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5457564 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 5457465  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5457464 aaggaacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 5457418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 12105849 - 12106095
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  12105849 gaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttattctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 12105948  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  12105949 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaa 12106048  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12106049 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 12106095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 25024291 - 25024537
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  25024291 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 25024390  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| || |||||||||    
T  25024391 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggatcttataaa 25024490  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||       ||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  25024491 aaggaacaaatttttttttcaaaagaatcttataattagggacggag 25024537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 1729889 - 1730132
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||| ||    
T  1729889 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaatat 1729986  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  1729987 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaa 1730086  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1730087 aagggacaaaaaaaatt-tcaaaaggatcttataattagggacggag 1730132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 287199 - 287445
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  287199 gaattaatatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 287298  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  287299 gttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactgatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 287398  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  287399 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 287445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 16272754 - 16272999
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||  || ||||||||| ||     
T  16272754 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcctttaacaaagag--ttgatttttgttttcaatatg 16272851  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  16272852 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattgatgtagttggaaatagcaaaggggtcttttaaaa 16272951  T
Q  347 agggacnnnnnnnttt--ctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||       |||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16272952 agggacaaaaattttttcttcaaaagggtcttataattagggacggag 16272999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 23397878 - 23398170
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||       | ||  ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23397878 atactccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 23397977  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  23397978 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatg 23398076  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23398077 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggataaaaaaaatcctcaaaagggtcttataattagggacggag 23398170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 10195779 - 10196024
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10195779 gaattaacatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 10195878  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  10195879 attatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataatggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 10195978  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
     ||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10195979 gagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagagacggag 10196024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 9388529 - 9388822
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  9388529 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 9388628  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||| | | | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9388629 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatg 9388728  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9388729 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 9388822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 108 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8743476 - 8743194
Alignment:
Q  108 ccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttt 207  Q
    |||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8743476 ccgtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttt 8743377  T
Q  208 atcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 307  Q
    |||||| || | |||| ||| | |||||||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743376 atcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaat 8743278  T
Q  308 aattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8743277 aattaatgtacttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 8743194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 230892 - 231136
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| | |||||||||||||||    
T  230892 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaataaggttagtttatgttttcaacat 230991  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  230992 gttatttattgttgactgaagaaaaagatgtataataaatacgggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaata-acaaatggtcttataaa 231090  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  231091 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 231136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 15355294 - 15355585
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15355294 atactacctccgtccctaattatagggcc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttt 15355392  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  ||   |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15355393 tacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatg 15355492  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||        ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  15355493 taaag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaattcacaaaagagtcttataattaaggacggag 15355585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34126391 - 34126187
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||   |||| |||||||||||||||    
T  34126391 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacat 34126294  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | | ||||||||    
T  34126293 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggtatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagccttataaa 34126194  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  34126193 aagggac 34126187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34741766 - 34741472
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||  ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  34741766 ttatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtcaatatttgtattaaagttgtttttaatcactattgtt 34741667  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34741666 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgta 34741568  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
     |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||        || ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  34741567 ggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaatgggtcttataattagggatggag 34741472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Original strand, 23578211 - 23578414
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  23578211 gaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 23578310  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  ||| |  |||||||||    
T  23578311 gttatttatttttgattaaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttgaaaataacaaatgaatcttataaa 23578410  T
Q  346 aagg 349  Q
    ||||    
T  23578411 aagg 23578414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 387
Target Start/End: Original strand, 1779784 - 1780070
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||       | ||  ||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  1779784 tactccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaattacgggaattaagaaaatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttttt 1779883  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||| |||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1779884 acaatattatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 1779982  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1779983 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggga 1780070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 169 - 318
Target Start/End: Original strand, 17952167 - 17952316
Alignment:
Q  169 attaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaa 268  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17952167 attaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacaatctatttattgctgattgaagaa 17952266  T
Q  269 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtag 318  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  17952267 aaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaatatttaatgtag 17952316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Original strand, 17175250 - 17175453
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| ||||||||| |||||    
T  17175250 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaagttggtttatgttttgaacat 17175349  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||||  ||| || |||||||||    
T  17175350 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgttgttggaaataacaaatggatcttataaa 17175449  T
Q  346 aagg 349  Q
    ||||    
T  17175450 aagg 17175453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 20373331 - 20373123
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20373331 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20373232  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |    
T  20373231 acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgcatat 20373134  T
Q  300 aaagaaataat 310  Q
    |||||||||||    
T  20373133 aaagaaataat 20373123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 190 - 392
Target Start/End: Original strand, 9660506 - 9660707
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  9660506 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgatcgaagaaaaaaatgtataataaataggg 9660605  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||        ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  9660606 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaa-ggtcttataattaggaacg 9660704  T
Q  390 gag 392  Q
    |||    
T  9660705 gag 9660707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 140 - 348
Target Start/End: Original strand, 31711629 - 31711835
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| | ||||   ||  |||| ||||    
T  31711629 taacaggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattagtattgtatttacaattttattctttaagagagaga--tgatttatatttt 31711726  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||    
T  31711727 caacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagggatct 31711826  T
Q  340 tataaaaag 348  Q
    |||||||||    
T  31711827 tataaaaag 31711835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 33773831 - 33773628
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaggg--ttggcttatgttttcaac 243  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||  |||||||||||||    
T  33773831 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagagagagttgatttatgttttcaac 33773732  T
Q  244 attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    ||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||| |||||    
T  33773731 atgttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtattata 33773632  T
Q  344 aaaa 347  Q
    ||||    
T  33773631 aaaa 33773628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 390573 - 390336
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||   || |||| | ||  |||||||||||||||    
T  390573 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttattttt---aagagagagatgatttatgttttcaacat 390477  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
      ||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||  |||||||||    
T  390476 gttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtataattaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagatgtcttataa 390377  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagg 385  Q
    ||||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  390376 aaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagg 390336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 15287428 - 15287190
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15287428 tccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatctctattgtttttacaattt 15287329  T
Q  207 tatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    ||||| |||| | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15287328 tatcc-ttaatatagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatatataataaata-ggacatgtatgtaaagaaa 15287231  T
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||| || |||||||||||    
T  15287230 taattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaaaa 15287190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 107 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 345158 - 344911
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta----ttgtttttaca 202  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||       | ||| ||||||||| ||  ||||||| |||||||  |||||||||| ||||    |||||||||||    
T  345158 tccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagcagatatttatattaaagttgtttgtaatcactacgtattgtttttaca 345059  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    ||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  345058 attttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa 344960  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  344959 gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggga 344911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 3177430 - 3177232
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| | | || ||||| | ||    
T  3177430 gaattaagaaagtggatatttgcattaaagttgtttgtaaccactattttttttacaattttatcctt---aagagagagttagttcatattttccatat 3177334  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  3177333 gatatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagggatcttataaa 3177234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 190 - 388
Target Start/End: Original strand, 11656174 - 11656373
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctt-taaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||| |||||||||| | || |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||      
T  11656174 tattgtttttacaattttatccttatgagagagagagttggtttatgttttccatatgctatttattgtttattgaagaaaaagatgtataataaataaa 11656273  T
Q  289 ggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  11656274 agcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctccaaaggttcttataattagggac 11656373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 160 - 352
Target Start/End: Original strand, 345546 - 345737
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctg 259  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||    
T  345546 gatatttatattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctg 345644  T
Q  260 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||| |||||||    
T  345645 gttgaagaaagagatgtataataaataggcgcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataagaagggac 345737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15126714 - 15126510
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |   |||  |||| |||||||||||||||    
T  15126714 gaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttcatcctttaga---gagaattggtttatgttttcaacat 15126619  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaaga--tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
     ||||||||||||||||| ||||||| |  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||  |||||||     
T  15126618 gctatttattgctgattgtagaaaaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagcaaagaagtcttatc 15126519  T
Q  344 aaaagggac 352  Q
    |||||||||    
T  15126518 aaaagggac 15126510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8175907 - 8175712
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  8175907 gaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttcaagagagagagttagtttatgttttccatat 8175808  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||      ||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8175807 actatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaag------ttaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaa 8175714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6418168 - 6417882
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||    
T  6418168 tactccctccgtccctaattataagacctttttgttaaaatcacgggaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattggtttt 6418069  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||| |||| | |||| ||| | |||||||||  | || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    ||||    
T  6418068 acaattttatcc-ttaagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagaggc----atgt 6417974  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||        ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  6417973 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaa-ttctcaaaaaggtcttatgattagggacggag 6417882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 161 - 352
Target Start/End: Original strand, 5576180 - 5576367
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||   ||||  || | |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  5576180 atatttgtattgaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagtgagag--ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 5576277  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||  | |||||||||||| ||||    
T  5576278 ttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaatagcaa--gagtcttataaaaatggac 5576367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Original strand, 22852119 - 22852362
Alignment:
Q  148 attaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattc 247  Q
    ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||| ||||  | || |    
T  22852119 attaagaaagtggatatttgtttaaaat-tgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatatttttcatatac 22852216  T
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||    
T  22852217 tatttattgctgattgaaaaaaaaaaatgtataacaaatagggacatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaa 22852316  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||         ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22852317 agggacaaaaaaaaatcttaaaatggtcttataattagggacggag 22852362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32615216 - 32614995
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  32615216 tattaaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 32615118  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||| ||| | |||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||| ||||||||||||||         |||||||    
T  32615117 aaaa-atgcaaaataaataggggtatggttgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgggacttataaaaaggga-taaaaaaattctcaa 32615020  T
Q  368 aagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  32615019 aaggttcttataattagggacggag 32614995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Original strand, 18105957 - 18106158
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || | |||  ||| | | || ||||| | ||    
T  18105957 gaattaagaaagtgaatatttatattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagaaagttagttcatattttccatat 18106055  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  18106056 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacgtgcatgtaaagaaataattaatgtacttggaaataacaaaagggtcttataaa 18106155  T
Q  346 aag 348  Q
    |||    
T  18106156 aag 18106158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 184 - 390
Target Start/End: Original strand, 6418476 - 6418681
Alignment:
Q  184 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  6418476 aattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 6418574  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||       ||| |||||||| |||||||||||    
T  6418575 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaaggatcttataatta 6418674  T
Q  384 gggacgg 390  Q
    | |||||    
T  6418675 gagacgg 6418681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 184 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4175455 - 4175249
Alignment:
Q  184 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  4175455 aattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaacttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 4175357  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||    
T  4175356 ataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtatttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 4175257  T
Q  384 gggacgga 391  Q
    | ||||||    
T  4175256 gagacgga 4175249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 177 - 343
Target Start/End: Original strand, 9299246 - 9299411
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||| | ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9299246 tgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaacagagatagtttgtttatgttttaaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgt 9299345  T
Q  277 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    |||||||||| ||| |||  || |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||    
T  9299346 ataataaataagggtatg-ctggaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttata 9299411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11162083 - 11161857
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  11162083 gtattaaatttctatgtaattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 11161984  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||| | ||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||       ||||||    
T  11161983 gaaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaaaagggtcttataaaaaaggacaaatttttttctc 11161884  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11161883 aaaaggctcttataattaaggacggag 11161857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 234 - 395
Target Start/End: Original strand, 8637148 - 8637309
Alignment:
Q  234 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaag 333  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||  || |||||||||| ||||    
T  8637148 tgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaatgattaatatacttgaaaatagcaaag 8637247  T
Q  334 gggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagtaa 395  Q
    ||||||||||||||  |||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8637248 gggtcttataaaaaaagacaattatttttctcaaaagggtcttataattagggacggagtaa 8637309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 22998852 - 22999076
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  22998852 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 22998950  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| |||    
T  22998951 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttca 22999050  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  22999051 aaagggtcttataactagggacggag 22999076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23789552 - 23789328
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  23789552 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 23789454  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| |||    
T  23789453 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttca 23789354  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  23789353 aaagggtcttataactagggacggag 23789328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22710478 - 22710272
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  22710478 taattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 22710382  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| || |  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||||||||    
T  22710381 aataagggtattttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagtgtcttataatt 22710282  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    || |||||||    
T  22710281 agagacggag 22710272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9038854 - 9038648
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||  || | ||||    
T  9038854 taattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa--tgcaaaata 9038758  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||    
T  9038757 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaatgattttttcaaaagggtcttataatt 9038658  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  9038657 agggacggag 9038648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 187 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13901850 - 13901647
Alignment:
Q  187 tactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | | || ||| | |||||||||| | ||  ||||| ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  13901850 tactattgtttttacatttttatcctttaagagaaagagttagtttatgttttcgaaatgatatttcttgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaata 13901751  T
Q  287 ggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggg 386  Q
     ||| ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||  ||||||||||| ||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  13901750 tgggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaaggggtcttgtaaaaagagacacaaaa--ttctcaaaagggtcttataattaggg 13901653  T
Q  387 acggag 392  Q
    ||||||    
T  13901652 acggag 13901647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 235993 - 235830
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||| || ||||| | | |   || | |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  235993 atatttgtattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttgtcatttaagagaaata-ttagtttatgttttcaacatgttatttattgttga 235895  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||  |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  235894 ttg--gaaaaaaatgtataataaataggggtatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 235830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 386
Target Start/End: Original strand, 8217528 - 8217744
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  8217528 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 8217624  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||       ||| |||    
T  8217625 aaaaaaatgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagtcttataaaaatggacaaattattttttca 8217724  T
Q  367 aaagggtcttataattaggg 386  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  8217725 aaaggatcttataattaggg 8217744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 11104805 - 11104580
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgt---attaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaac 243  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||| ||||||||| |||    
T  11104805 aattaagatagtagatatttgttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagagaattggtttatgttttaaac 11104706  T
Q  244 attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    ||  |||                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | || |||||    
T  11104705 atgttat---------------------gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtattata 11104627  T
Q  344 aaaagggacnnnnnnntttct--caaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||||       |||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  11104626 aaaagggacaaaaatttttcttccaaaaggatcttataattagggac 11104580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11200808 - 11200600
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  11200808 taattactattgattttacaattgtatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 11200710  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||  |||| ||||||||| ||||       |||||||||||| ||||||||||    
T  11200709 aataagggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgtaaataccaacagggttttataaaaaaggacaaatttttttctcaaaaggctcttataatt 11200610  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  11200609 agggacggag 11200600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 13321135 - 13321357
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||  ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |  ||||||    
T  13321135 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagatagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttt-ttgaag 13321232  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  13321233 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacacgaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 13321331  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13321332 aaagggtcttataattagggacggag 13321357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14630115 - 14629909
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||   || ||||  ||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||    
T  14630115 taattattattatttttacaattttatcctt---aagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaagatgcaaaata 14630019  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || |||||||||  |||| ||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| ||||    
T  14630018 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatctacttgaaaataccaaagaggtattataaaaagggataattttttttctcaaaagggtcttaaaatt 14629919  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  14629918 agggacggag 14629909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 265 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29036258 - 29036132
Alignment:
Q  265 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttct 364  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||  |||||||||||||||||        ||||    
T  29036258 agaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttct 29036160  T
Q  365 caaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29036159 caaaaggatcttataattaggaacggag 29036132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 168 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4823198 - 4823043
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  4823198 tattaaatttgtatgtaattactattgtttttataattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 4823102  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  4823101 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaata 4823043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 27581616 - 27581437
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||| |||   ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  27581616 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 27581518  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| | |||||||||||    
T  27581517 aaaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagagatcttataaaaa 27581437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 146 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 29036326 - 29036250
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  29036326 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttagaaaaaga 29036250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 346
Target Start/End: Original strand, 8646015 - 8646190
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||| ||| |  ||||||||||| ||  | |||| || |||||||||||||    
T  8646015 taaatttgtttgcaattactattgtttttacaaatttgttctttaagaaagagagttagtgtatgttttcaatataatgtttaatgttgattgaagaaaa 8646114  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||| || |||||||||||| |||   ||||| || ||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  8646115 agatataaaataaataggggtatggtggtaaaaaattaattaatgtacttggaaatagcaaatgagtcttataaaa 8646190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Original strand, 28980662 - 28980847
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  28980662 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttgagagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 28980761  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||| ||| | |||||||| | | ||||  ||||||||||||||||  || ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  28980762 gaaaaa-atgcaaaataaataagagtatgttggtaaagaaataattaatttacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggac 28980847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 28236010 - 28236232
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||     
T  28236010 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaac 28236108  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||  || | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  ||||  |||||||||||||||||       ||| |||    
T  28236109 aaaaa--tgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaaattattttttca 28236206  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  28236207 aaagtgtcttataattagagacggag 28236232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 352
Target Start/End: Original strand, 29293669 - 29293790
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  |    
T  29293669 ttatgttttcaacataatatttattgttgattgatgaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttggaaatacca 29293768  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    || |||||||||||||| ||||    
T  29293769 aaagggtcttataaaaatggac 29293790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 352
Target Start/End: Original strand, 33012473 - 33012656
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  33012473 tattaaatttgtttataattaatattgtttttacaattttgtc-tttaaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 33012571  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| | ||||||||  |  ||||   ||||||||| ||||| | | |||||||||  ||| | |||||||||||| ||||    
T  33012572 aaaaaatgcaaaataaataaagttatgttgataaagaaatgattaaggcacttgaaaatatcaaatgagtcttataaaaaaggac 33012656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Original strand, 2746343 - 2746448
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctg 259  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| | ||||  || |||||||||||||||||  |||||| || ||    
T  2746343 gatagttgtaataaatttgtttgtaattattattgtttttacaaatttatcctttaagagagagaattagcttatgttttcaacatagtatttaatgttg 2746442  T
Q  260 attgaa 265  Q
    ||||||    
T  2746443 attgaa 2746448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 231 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11840537 - 11840417
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||| |||||| ||| ||||||| ||||||      
T  11840537 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagtaaaagatgtattataaacaggggtatgttcgtaaaaaaataactaatgtagttg-aaatagct 11840439  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    || | |||||||||||||||||    
T  11840438 aaagtgtcttataaaaagggac 11840417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 188
Target Start/End: Original strand, 9660136 - 9660221
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 188  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9660136 tacctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatta 9660221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 274
Target Start/End: Original strand, 6840082 - 6840183
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || |||| |||    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  6840082 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcc--tataagagagtgttaatgtatgttttcaacatattatttaatgctgattgaagaaaa 6840179  T
Q  271 agat 274  Q
    ||||    
T  6840180 agat 6840183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23923698 - 23923538
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   ||||  || |  |||||||| || ||  ||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  23923698 tattgtttttacaattttatccttaaaggtagag--ttagtatatgtttttaatataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataggg 23923601  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    | |||   ||||||||||| |||| ||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23923600 gtatggtggtaaagaaatatttaatgtaattgaaaataccaaaagagtcttataaaaagggac 23923538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27310662 - 27310480
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||   || ||||  ||   ||||||||||||||   ||||||||| |||||||||    
T  27310662 gtattaaatttgtatataattactgttgtttttataattttatcctt---aagagagatttaatttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaag 27310566  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||| | ||||||||  || ||||    |||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||  ||||||||||| ||||    
T  27310565 aaaaagatgcaaaataaataaaggtatgttgacaaagaaataattaatgtatttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggac 27310480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Original strand, 23282615 - 23282836
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta-aaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaa 269  Q
    ||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| | | |||||| |||   |||||||||||| ||  |||||| || ||||||||||||    
T  23282615 taaatttgttggtaattaccattggttttacaattttatccttaagagaaagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaa 23282714  T
Q  270 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaa 369  Q
    || |   | |||||||||||| |||   || || || ||||||| | | ||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||        |||||||||    
T  23282715 aataaacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataataagagacaaaaaaa-ttctcaaaa 23282813  T
Q  370 gggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  23282814 gggtcttatatttagggacggag 23282836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 266 - 389
Target Start/End: Original strand, 2364998 - 2365121
Alignment:
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||  ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||| |||       ||||||    
T  2364998 gaaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagtgacaaatttttttctc 2365097  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||| ||||||||||||| |||||    
T  2365098 aaaaaggtcttataattaaggacg 2365121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 26211151 - 26211032
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaaaagagggttggcttatgttttcaac 243  Q
    ||||||||| ||| | |||||||| ||||  ||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||  | ||||||  || | |||||||||||||    
T  26211151 gaattaagagagttggtatttgtactaaagttgtttataatcactaatatttttacaattttatcctttaagagaaagagatttagtttatgttttcaac 26211052  T
Q  244 attctatttattgctgattg 263  Q
    ||  |||||||| |||||||    
T  26211051 atgttatttattactgattg 26211032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 332
Target Start/End: Original strand, 32982509 - 32982593
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaa 332  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  32982509 tatttatcggtgattgaagaaaaatatgtataataaataaggatatgtaggtaattaaataattaatatagtcgaaaatagaaaa 32982593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 8595699 - 8595644
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8595699 ttatgttttcaacataatattgattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaata 8595644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 22852368 - 22852336
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22852368 tactacctccgtccctaattataagaccatttt 22852336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 402661 - 402626
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  402661 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 402626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4844437 - 4844406
Alignment:
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4844437 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 4844406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17992219 - 17992177
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 209  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  17992219 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttat 17992177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 23604458 - 23604492
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23604458 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 23604492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 191
Target Start/End: Original strand, 11655854 - 11655899
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 191  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11655854 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattacta 11655899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 13321364 - 13321331
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13321364 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 13321331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 13901640 - 13901673
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13901640 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 13901673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 15498628 - 15498661
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15498628 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 15498661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 25045681 - 25045648
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25045681 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 25045648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34915581 - 34915548
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34915581 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 34915548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 213)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27037567 - 27037275
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27037567 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 27037468  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037467 acaattttatcctttaagaaagagagctggcttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 27037368  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27037367 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 27037275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24855581 - 24855288
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24855581 tatattacctccgtccctaattataaggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 24855482  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24855481 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaatattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatat 24855382  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24855381 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattagggacgga 24855288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 42275945 - 42276192
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42275945 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacat 42276044  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42276045 tttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaa 42276144  T
Q  346 aagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42276145 aagggacaaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 42276192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Original strand, 48067631 - 48067926
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| ||||       ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48067631 ttatactacctccgtccctaattacaaaacccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatt 48067730  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48067731 tttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 48067830  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48067831 tgtaaagaaataattaatttagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagagacggag 48067926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38261591 - 38261346
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38261591 aattaagatagtgaatatttctattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacatt 38261492  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38261491 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggagtcttataaaa 38261392  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38261391 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 38261346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 23530843 - 23530591
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23530843 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23530744  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23530743 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatcttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 23530644  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23530643 aaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggac 23530591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 28888162 - 28888455
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888162 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28888261  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28888262 acaattttttcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 28888361  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||       |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28888362 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttacaaaaaaggacaattttttttcttcaaaaggatcttataattagggatggag 28888455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 28885840 - 28886135
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885840 tatactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 28885939  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  28885940 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtttcataaataggggcatgtat 28886039  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||       | || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28886040 gtaaataaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttacaaaaagggacaattttttctcttcaaaatggtcttataattagggacggag 28886135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9715658 - 9715406
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9715658 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9715559  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  9715558 acaattttatcctttaagaaagagggttgccttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaattggggcatgcatgt 9715459  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  9715458 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggcgcttataaaaagggac 9715406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36695152 - 36694860
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36695152 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36695053  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36695052 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36694953  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36694952 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 36694860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36711253 - 36710961
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711253 tactccctctgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 36711154  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711153 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 36711054  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36711053 aaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 36710961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 147 - 351
Target Start/End: Original strand, 27575423 - 27575627
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27575423 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgaaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacatt 27575522  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  27575523 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaggatcttataaaa 27575622  T
Q  347 aggga 351  Q
    |||||    
T  27575623 aggga 27575627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6090031 - 6089741
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6090031 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 6089932  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6089931 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 6089834  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6089833 aaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagagacggag 6089741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Original strand, 9413067 - 9413356
Alignment:
Q  101 actacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9413067 actaccttcgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 9413166  T
Q  201 caattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 300  Q
    |||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9413167 caattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgta 9413264  T
Q  301 aagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9413265 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 9413356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13344025 - 13343779
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  13344025 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttggcttatgttttcaacat 13343926  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||   ||||||||||    
T  13343925 tctatttattgctgatagaagaaaaagatgtacaataaataggggcatgtacgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagaaaataagtcttataaa 13343826  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13343825 aaggaacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggag 13343779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 15892349 - 15892594
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15892349 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagtgttggtttatgttttcaacat 15892448  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15892449 tctatttattactgattgaaaaaaaagatgtataataaataggagcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaa 15892548  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15892549 aagggacaaaaaaattt-tcaaaagggtcttataattaggaacggag 15892594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 154 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 50938022 - 50937785
Alignment:
Q  154 atagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctattta 253  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50938022 atagtggatatttgtattaaatatctttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaattta 50937923  T
Q  254 ttgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacn 353  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  50937922 ttgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaaaggaca 50937823  T
Q  354 nnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
           ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50937822 aaaaaa-ttctcaaaatggtcttataattagggacggag 50937785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 45038148 - 45038392
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  45038148 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagaaagagagttggctaatgttttcaacat 45038247  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  45038248 tctatttattgctgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagaataggggtcttataga 45038346  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45038347 aagggacaaaaaattttctcaaaagggtcttataattagcgacgga 45038392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34931375 - 34931085
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34931375 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34931276  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| | |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34931275 acaattttatcctttaagagagag--ttggttcatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 34931178  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34931177 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattaggaacggag 34931085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38613773 - 38613521
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38613773 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaactaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattattttt 38613674  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38613673 acaattttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 38613574  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38613573 aaagaaataattaatgtagttagaaatataaaaggggtcttataaaaagggac 38613521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 5765730 - 5766021
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765730 tactacctccgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 5765829  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||| ||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765830 acaattttctcctt-aagagagagtgttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 5765928  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||| ||         ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5765929 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataacaagagataaaaaaaattcacaaaagggtcttataattagggacggag 5766021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11741649 - 11741403
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  11741649 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 11741550  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  11741549 cttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 11741450  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11741449 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 11741403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 52430959 - 52431205
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  52430959 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 52431058  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  52431059 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 52431158  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52431159 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 52431205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31238969 - 31238725
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  31238969 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacat 31238872  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31238871 gttatttattactgattgaagaaaaagatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaaataattaaagtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 31238772  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31238771 aagggacaaaaaaaattctcaaacgggtcttataattagggacggag 31238725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 45285595 - 45285841
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  45285595 gaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacat 45285694  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||   || |||||||    
T  45285695 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaataagttttataaa 45285794  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45285795 aagggacaaaaaaatttctcaaaagagtcttataattagggacggag 45285841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28052487 - 28052235
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28052487 tactacctccgtccctaattacaggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28052388  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    | ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28052387 ataattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattggagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 28052288  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  28052287 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaaaagggac 28052235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 41855260 - 41855503
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||    
T  41855260 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacat 41855357  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  41855358 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 41855457  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41855458 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 41855503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 25228494 - 25228285
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| |||||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25228494 tactacctccgtccttaattaaaaggccattttgaaaatataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 25228395  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25228394 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 25228295  T
Q  300 aaagaaataa 309  Q
    ||||||||||    
T  25228294 aaagaaataa 25228285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 4102455 - 4102745
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4102455 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 4102554  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4102555 acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataagggcatgtatgt 4102652  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4102653 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 4102745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 14347373 - 14347174
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||     
T  14347373 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagggagggttggtttatgttttcaacatg 14347274  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  14347273 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggttttataaaa 14347174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52602287 - 52601997
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52602287 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 52602188  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52602187 acaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 52602090  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52602089 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggag 52601997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16456888 - 16456642
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16456888 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 16456789  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  16456788 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaa 16456689  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16456688 aagggacagaaaaatttctcagaagggtcttataattagggacggag 16456642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30290517 - 30290271
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||| | |||| ||||||||||    
T  30290517 gaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttttagaaagaatgttagtttatattttcaacat 30290418  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  30290417 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 30290318  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30290317 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 30290271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 42872119 - 42872365
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  42872119 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatat 42872218  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||    
T  42872219 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaa 42872318  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42872319 aagggacaaatttttttttcaaaagggtcttacaattagggacggag 42872365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 49907273 - 49907027
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  49907273 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttaacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttattttttcaacat 49907174  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  49907173 gatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 49907074  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49907073 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 49907027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 21630844 - 21631138
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||||       ||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21630844 atactacctccgtccctaattatatagcctttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 21630943  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||| |||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21630944 tacaaatttatccttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 21631043  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21631044 gtagagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttgtttcttcaaaagggtcttataattagggacggag 21631138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 11907013 - 11907219
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  11907013 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 11907112  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11907113 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 11907212  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  11907213 aagggac 11907219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 943422 - 943668
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  943422 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 943521  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||||| ||||||||||    
T  943522 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaggagtcttataaa 943621  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  943622 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 943668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3934857 - 3934612
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3934857 gaattaagatagtgagtatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacat 3934758  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3934757 tttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggaacatgtatctaaacaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataaa 3934658  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |        || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3934657 aaggggcaaaaaaa-ttatcaaaaggatcttataattagggacggag 3934612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25509457 - 25509215
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||     
T  25509457 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacatg 25509360  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  25509359 ctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaa 25509260  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25509259 agggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 25509215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45794596 - 45794350
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  45794596 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacat 45794497  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  45794496 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 45794397  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  45794396 aagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttctaattagggacggag 45794350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 46075653 - 46075898
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  46075653 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 46075752  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  46075753 gttatttattgttgatt-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 46075851  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46075852 aagggacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggag 46075898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41317893 - 41317599
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | || ||||       ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41317893 ttatactacctccgtctctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtt 41317794  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||    
T  41317793 tttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgta 41317696  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41317695 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattagggacggag 41317599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 383
Target Start/End: Original strand, 27530342 - 27530624
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  27530342 atactacctccgtccctaattatagggcc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgcttt 27530440  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27530441 tacaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 27530539  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||    
T  27530540 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaaaaatatttttcaaaagggtcttataatta 27530624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 16575877 - 16576123
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16575877 gaattaagatagtggatatttgtattcaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 16575976  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  16575977 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 16576076  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16576077 aagggacaaaaaaaattatcaaaagagtcttataattagggacggag 16576123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 15810970 - 15811263
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  15810970 tatactccatccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 15811069  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15811070 ttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 15811168  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15811169 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 15811263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 30289601 - 30289893
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  30289601 atactccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 30289700  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30289701 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 30289799  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30289800 taaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 30289893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2280205 - 2279959
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  2280205 gaattaagatagtggatatttctattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 2280106  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||| ||||||    
T  2280105 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtc-tataaa 2280007  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctc-aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2280006 aagggacaaaaaaatttctcaaaaagggtcttataattagggacggag 2279959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 15100660 - 15100369
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15100660 tactacctctgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 15100561  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagaggg------ttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 293  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |      |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15100560 acaattttatcctttaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcat 15100461  T
Q  294 gtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagg 385  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||    
T  15100460 gtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagg 15100369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Original strand, 19792649 - 19792852
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||   ||| |||||||||||||||    
T  19792649 gaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagataaaga--tggtttatgttttcaacat 19792746  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19792747 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaatagaaaaggagtcttataaa 19792846  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  19792847 aaggga 19792852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23542276 - 23541985
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23542276 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgttttt 23542177  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||| ||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23542176 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 23542078  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23542077 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 23541985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 36674083 - 36674289
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  36674083 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacat 36674182  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| || |||||||||    
T  36674183 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttaaaaatagcaaaaggatcttataaa 36674282  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  36674283 aagggac 36674289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 37589192 - 37589007
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37589192 gaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttggtttatgttttcaacat 37589093  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaa 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  37589092 tccatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaa 37589007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 37951689 - 37951980
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||    
T  37951689 tactccctccgtccctaattatatgacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgttttt 37951788  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||| | |||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37951789 acaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttatttctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 37951887  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37951888 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 37951980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 147 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8472297 - 8472042
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||    ||||||||||||||     
T  8472297 aattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagatgatt----tatgttttcaacatg 8472202  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8472201 ttatttattgctgattgaagaaaaaaaatgtatagttaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 8472102  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgg-agtaatagtatttt 404  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  8472101 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggaagtagtagtatttt 8472042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 161 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15290171 - 15289951
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15290171 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatattatcctttaagagagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctga 15290072  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||||| |||            
T  15290071 ttgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagtgacaaaaaa-- 15289974  T
Q  361 ttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15289973 ttctcaaaagggtcttataatta 15289951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Original strand, 32169736 - 32169985
Alignment:
Q  142 acatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttca 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||   |||| ||||||    
T  32169736 acatgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaagaaggttat-ttatattttca 32169834  T
Q  242 acattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
    ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  32169835 acatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtctta 32169934  T
Q  342 taaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32169935 taaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattaaggacggag 32169985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 50246715 - 50246916
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  50246715 gaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 50246814  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  50246815 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 50246914  T
Q  346 aa 347  Q
    ||    
T  50246915 aa 50246916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 12814525 - 12814818
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnn-taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||        ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12814525 atactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaaataacgggaattaagatactggatattagtattaaatatgtttgcaattactattgttt 12814624  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12814625 ttacaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttactgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtat 12814723  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12814724 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagtgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtcttataattatggacggag 12814818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 40614646 - 40614896
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40614646 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40614745  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  40614746 acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggagcatgtatgt 40614843  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40614844 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaatggac 40614896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 7763491 - 7763780
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7763491 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 7763590  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  7763591 acagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacatgctatttattgttaattgaagaaaaagat-tataattaataggggcatgtatgt 7763687  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7763688 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 7763780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 1039121 - 1039412
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||       | ||   |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1039121 tactccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 1039220  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1039221 acaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 1039319  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1039320 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 1039412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 1046027 - 1046318
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||       | ||   |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  1046027 tactccctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 1046126  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||| | || ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1046127 acaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattactgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 1046225  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1046226 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 1046318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Original strand, 8923456 - 8923659
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||     
T  8923456 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacatg 8923553  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  8923554 ctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaa 8923653  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  8923654 agggac 8923659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 47300678 - 47300920
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  47300678 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 47300777  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  47300778 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtctcataaa 47300877  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    || ||||        ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47300878 aa-ggacaaaaaaaattctcaaaagggtgttataattagggacg 47300920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 14090037 - 14090218
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |   |||||||||||||||    
T  14090037 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaggtaatttatgttttcaacat 14090136  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  14090137 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 14090218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 388
Target Start/End: Original strand, 39750118 - 39750408
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  39750118 ttatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 39750217  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39750218 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 39750316  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39750317 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 39750408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44646568 - 44646278
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  44646568 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44646469  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44646468 acaattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 44646370  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||         | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44646369 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatttcaaaagggtcttataattagggacgga 44646278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 387
Target Start/End: Original strand, 51422212 - 51422454
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  51422212 gaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatgctttaagagagagggttggtttatgttttcaacat 51422311  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--atgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
      |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||     
T  51422312 gttatttattgccgattgaaggaaaagatgtataataaataggggcatatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttat- 51422410  T
Q  344 aaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  51422411 aaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattaggga 51422454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Original strand, 9202244 - 9202535
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  9202244 atactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 9202343  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9202344 tacaattttatcctt-aagagagagaggtggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 9202442  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||         |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9202443 taaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaatggataaaaacaattctcaaaagagtcttataattagggacgga 9202535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44649926 - 44649635
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| ||  |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  44649926 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 44649827  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44649826 acaattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 44649728  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44649727 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 44649635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45039709 - 45039418
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  45039709 tacttcctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatattagtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 45039610  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  45039609 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgtatgt 45039511  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45039510 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 45039418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 140 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 37585209 - 37584963
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||    
T  37585209 taacaggaattaagataatagatatttgtattaaacatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag--ttggtttatgtttt 37585112  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |   ||||||||||    
T  37585111 caacatgttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaatttacaaaggggtct 37585012  T
Q  340 tataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||| ||||        |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37585011 tataaaaacggacaaaaaaa-ttctcaaaagagtcttataattagggacg 37584963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Original strand, 39362931 - 39363225
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  39362931 ttatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 39363030  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||  | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39363031 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgta 39363129  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363130 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 39363225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 50008268 - 50008514
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  50008268 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttgcaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 50008367  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  50008368 gttaattattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 50008467  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50008468 aagagacaaaaaaaattctcaaaatgatcttataattagggacggag 50008514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 15111837 - 15111596
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagg----gttggcttatgttttca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||     ||||| |||||||||||    
T  15111837 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttca 15111738  T
Q  242 acattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  15111737 acatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtctta 15111638  T
Q  342 taaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||||||        ||||||||||||| |||||||||    
T  15111637 taaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataatta 15111596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 343
Target Start/End: Original strand, 229193 - 229388
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  229193 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 229290  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  229291 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttata 229388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 1767649 - 1767888
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| | |||    ||| |||||||||||| ||    
T  1767649 gaattaagatagtgaatatttgcattatatatgtttgtaattagcattgtttttacaattttatcatttaagagagaaa--tggtttatgttttcaatat 1767746  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1767747 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaa 1767846  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1767847 aagggac--aattttttttcaaaagggtcttataattagggacg 1767888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15763567 - 15763361
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15763567 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaaaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 15763468  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  15763467 attatttattactgactgaagaaaaaaatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaa 15763368  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  15763367 aagggac 15763361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 157 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 39324766 - 39324576
Alignment:
Q  157 gtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  39324766 gtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattg 39324667  T
Q  257 ctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
     |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | ||||||||||||    
T  39324666 ttgattgaagaaaaagatgaataatagataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaa 39324576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39497730 - 39497439
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  39497730 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 39497631  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||  ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  39497630 acaattttatcctt-aagagagatagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgt 39497532  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39497531 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 39497439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 48854115 - 48853864
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48854115 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacaggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttt 48854016  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||    ||| ||| |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48854015 tacaattttatcctttaagagagaaa--tggtttacgttttcaacatattatttattattgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 48853918  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  48853917 taaagaaagaattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 48853864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 9378887 - 9379090
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaggg--ttggcttatgttttcaaca 244  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |  | || ||||||||| ||||    
T  9378887 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagagtcggtttatgtttttaaca 9378986  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||    
T  9378987 tgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataagtagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataa 9379086  T
Q  345 aaag 348  Q
    ||||    
T  9379087 aaag 9379090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26544760 - 26544510
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||    ||  |||||||||    
T  26544760 taacaagaattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttatgagagaaa--tgatttatgtttt 26544663  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  26544662 caacatgttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataatttataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaattgaaaatagaaaagaggtct 26544563  T
Q  340 tataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||       ||| | ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26544562 tataaaaagggacaatttttttttttaaaagggtcatataattagggacggag 26544510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 380
Target Start/End: Original strand, 38530890 - 38531169
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38530890 atactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattaatattgtttt 38530989  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    || ||||||||||||||| |  |||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  38530990 tataattttatcctttaagagggaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggtatgcatg 38531087  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataa 380  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||    
T  38531088 taaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagcgatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataa 38531169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14171830 - 14171548
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||       | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14171830 ttatactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaattacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtt 14171731  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  14171730 tttacaattttatccttt--aaaagagaattggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgca 14171633  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| |||||||||| |||||          |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14171632 tgtaaaaaaataattaatgtagt----------aaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagagacggag 14171548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 141 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34503493 - 34503282
Alignment:
Q  141 aacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttc 240  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  34503493 aacatgaattaagatggtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgcttttataattttatcttttaagagagagggttggtttatgttttc 34503394  T
Q  241 aacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctt 340  Q
    |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |  ||||    
T  34503393 aacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttgaaaatagcaaatgaatctt 34503294  T
Q  341 ataaaaagggac 352  Q
    ||||||| ||||    
T  34503293 ataaaaaaggac 34503282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 100 - 389
Target Start/End: Original strand, 2489141 - 2489427
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||||||       ||||  ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2489141 tactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgggaattaagataatgaacatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2489240  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  2489241 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtaaaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgt 2489338  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||  | ||||||||||||||||       ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  2489339 aaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaaagttcttataaaaagggacaaaaaaattt-tcaaaagggttttataattagggacg 2489427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 343
Target Start/End: Original strand, 43668188 - 43668384
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | | | | |||  |||||||||||||||     
T  43668188 aattaagatagtggatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagaaaagattgatttatgttttcaacatg 43668287  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||  ||||||||    
T  43668288 ttatttattgctgattgatgaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagaagtcttata 43668384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 149 - 348
Target Start/End: Original strand, 31086711 - 31086910
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||  ||||||||| |||||  |    
T  31086711 ttaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattgatttatgtttttaacatgtt 31086810  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || | ||||||||||    
T  31086811 atttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaagaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggattttataaaaag 31086910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51811128 - 51810942
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||  |||||||||||||||    
T  51811128 gaattaagatggtggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaggaatgatttatgttttcaacat 51811029  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaa 332  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  51811028 gttattgattgctgattgaagaaaaagatgtatagtaaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctgaaaatggaaaa 51810942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 8104075 - 8104256
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8104075 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8104174  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8104175 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaata 8104256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 351
Target Start/End: Original strand, 1047990 - 1048242
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  1047990 tatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 1048089  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||  | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1048090 ttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtat 1048188  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  1048189 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttttaaaaaggga 1048242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 26550040 - 26549801
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||   |  | |||||||||||||||    
T  26550040 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgta-ttagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaaatt--gtttatgttttcaacat 26549944  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||| |||    
T  26549943 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgggtctta-aaa 26549845  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||       |||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26549844 aagggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattaaggac 26549801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 313
Target Start/End: Original strand, 896838 - 897004
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||     
T  896838 aattaagataattgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatg 896937  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  896938 ttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgcatgtaaacaaataattaa 897004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3549281 - 3549038
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | | |    ||  |||||||||||||||    
T  3549281 gaattaagatagtgtatatttatattaaatatgtttgtaattagtatt-tttttacaattttatcctttaagagataaa--tgatttatgttttcaacat 3549185  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  3549184 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaa 3549085  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  3549084 aagggacaatttattttttcaaaaggatcttataattagagacggag 3549038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 107 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 47069078 - 47068796
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  47069078 tccgtccctaattataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattt 47068979  T
Q  207 tatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    ||||||| |||| |||| ||| | |||| ||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47068978 tatcctt-aaaagagagagttagtttatattttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 47068880  T
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||| | ||||  |||||  |||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47068879 taattaatgcagttagaaataacaaagaggtcttataaaaagggataaaaaaatttctcaaaagggtcttat-attagggacgga 47068796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45336137 - 45335891
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||| ||||||||||    
T  45336137 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttcttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatattttcaacat 45336038  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  ||||||||||||||||    
T  45336037 gttatttattgttaattgaaaaaaaaaatgtataataaatggaagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtaggaaataacaaaggggtcttataaa 45335938  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45335937 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggagggag 45335891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 150 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 50008221 - 50007985
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattcta 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||||| ||| | |||| | |||||||||||||||  ||    
T  50008221 taagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttcataattttatcatttaagaaaaaaggttagtttatgttttcaacatgtta 50008122  T
Q  250 tttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||     
T  50008121 tttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaaga 50008023  T
Q  350 gacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||        |||||||||| |||||||||||||||||    
T  50008022 gacaaaaaaa-ttctcaaaagagtcttataattagggac 50007985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 161 - 388
Target Start/End: Original strand, 35984463 - 35984689
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||    
T  35984463 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttga 35984561  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| | ||||||||||||||            
T  35984562 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttaaaaataacaaagggattttataaaaagggacaaaaaaaa 35984661  T
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35984662 ttctcaaaaggatcttataattagggac 35984689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7784292 - 7783997
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagata-gtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||       | ||  ||||||||| | |||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  7784292 atactccctccgtccctaattataagactcttttgttaaaattacgggaattaagaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgttt 7784193  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||| | | | |||| ||| | |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  7784192 ttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagaggcatgta 7784093  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||| |||||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7784092 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataataagggacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattagggacggag 7783997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18237343 - 18237100
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | |||| ||| | |||| ||||| | ||    
T  18237343 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattctatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatat 18237245  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  18237244 gctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaagcatgtatgtaaagaaataagtaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 18237145  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18237144 aagggacaaaaaa--ttctcaaaagagtcttataattagggacggag 18237100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 164 - 348
Target Start/End: Original strand, 39873488 - 39873672
Alignment:
Q  164 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg 263  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39873488 tttgtattaaatatgtatgtaattattattgtttttccaattttatcctttaagagagagggttggtttatgtttttaacatattatttattgctgattg 39873587  T
Q  264 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||   |||||||||||||    
T  39873588 aagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatatgtcttataaaaag 39873672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 25271440 - 25271242
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||  ||| ||||||| |||||||    
T  25271440 gaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttat--tttaagagagaggaatggtttatgttatcaacat 25271343  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||| | ||||| |||    
T  25271342 gttatt-attgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttaaaaa 25271244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 335
Target Start/End: Original strand, 43395459 - 43395645
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||     
T  43395459 aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatg 43395556  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggg 335  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  43395557 ttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggg 43395645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 321
Target Start/End: Original strand, 36880409 - 36880580
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||    ||| | |||||||||||||||     
T  36880409 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtatttacaattttatcctttaagaaat---gttagtttatgttttcaacatg 36880505  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttg 321  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  36880506 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttg 36880580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Original strand, 10383828 - 10384034
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  10383828 aattaagaaagtggatatttatattaaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatat 10383927  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  10383928 gttatttattactaattgaagaaaaagatatataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 10384027  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  10384028 aagggac 10384034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 156 - 346
Target Start/End: Original strand, 46506209 - 46506398
Alignment:
Q  156 agtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttatt 255  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||  |||||||||| | ||  | ||||||    
T  46506209 agtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagaaagagagttgatttatgttttccatatgatgtttatt 46506307  T
Q  256 gctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  46506308 gctcattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaagtaattaatatagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaa 46506398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 25284104 - 25283918
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25284104 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 25284005  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25284004 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaata 25283918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 99 - 349
Target Start/End: Original strand, 27974894 - 27975144
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||       |  || |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  27974894 atactacctccgtccctatatataagacccttttgtcaaaattgcaggaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttt 27974993  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||  ||||| | |||| ||    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  27974994 tacaattttattttttaagagagagagtatatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatgtgcatgtatg 27975093  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||  ||| | || |||||||||||    
T  27975094 taaataaataattaatgcagttgaaaataacaaaagagttttataaaaagg 27975144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 97 - 387
Target Start/End: Original strand, 31635867 - 31636156
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  31635867 ttatactacctcggtccctaattataagacttttttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtt 31635966  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt--ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatg 294  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| |||   |||||||||| | ||   |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31635967 tttacaattttatcctt---aaaagagagttaatttatgttttccatatatgctatttatggctaattgaagaaaaagatgtagaataaataggggcatg 31636063  T
Q  295 tatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | ||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31636064 tatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagagacaaatttttttctcaaaagagtcttataattaggga 31636156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 142 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10433577 - 10433327
Alignment:
Q  142 acatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttc 240  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| | | | ||||  || |  ||| |||||    
T  10433577 acatgaattaagaaagtagatatttgtattaaatttgtttctaatcactattgtttttacaattttattcttaagagagagagaattagtatatattttc 10433478  T
Q  241 aacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctt 340  Q
    |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||  ||| | |||||    
T  10433477 aacatgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataaataatgtagttggcaataacaaatgagtctt 10433378  T
Q  341 ataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10433377 ataaaaa-ggacaaaaaaaattctcaaaagggtcctataattagggacggag 10433327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Original strand, 7212345 - 7212550
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||| |||||| |||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  7212345 aattaatatagtgaatatttgtataaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctttatgaaagatggttagtttatgttttcaacatg 7212444  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| ||    
T  7212445 atatttattgttcattcaagaaaaatatgtataataaataaaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggttttatagaa 7212544  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  7212545 agggac 7212550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38175118 - 38174922
Alignment:
Q  151 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctat 250  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||     |||| ||||| |||||||||||||||  |||    
T  38175118 aagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgttattgtttttacaattttattcttt----gagagtgttggtttatgttttcaacatgttat 38175023  T
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||   |||||||||||||||    
T  38175022 ttattgttgattgaatgaaaagatgtataataaataagggcgtgtatgtaaa-aaataattaatgtagttaaaaatagcaaaatagtcttataaaaaggg 38174924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 93 - 349
Target Start/End: Original strand, 9700483 - 9700738
Alignment:
Q  93 aacattatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactat 192  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||||       | ||| ||||||||| ||||  |||||||||||||  | |||||||| |||||    
T  9700483 aacataatactacctccgtccctatatacaagacctttttgccaaaatcacaggaattaagaaagtgagtatttgtattaaagttatttgtaatcactat 9700582  T
Q  193 tgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 292  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||| | | | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  9700583 tgattttacaattttatcctttagaaa-gagagatagtttatattttcaacatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggaca 9700681  T
Q  293 tgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    | |||||||||||||||||||  || ||| |||||  || | |||||||||||||||    
T  9700682 tatatgtaaagaaataattaatttaattggaaataacaaggaggtcttataaaaagg 9700738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 188 - 392
Target Start/End: Original strand, 43456449 - 43456652
Alignment:
Q  188 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||| | || | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43456449 actattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgcaattttttgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 43456547  T
Q  288 gggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||| |||||        |||||||||||||||||||||||||||    
T  43456548 gggcaggtatgtaaataaataactaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaacgggaccaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggga 43456647  T
Q  388 cggag 392  Q
    |||||    
T  43456648 cggag 43456652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Original strand, 32149096 - 32149298
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| | ||||||||| |||||    
T  32149096 gaattaagaaagtagatattttcattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaatagagagttagtttatgttttgaacat 32149195  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||  ||  |||||  ||| ||||||||||||    
T  32149196 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtgaaataaatagaggcatgtatgtaaataaataataaatgtgcttagaaataacaaaagggtcttataaa 32149295  T
Q  346 aag 348  Q
    |||    
T  32149296 aag 32149298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 4592830 - 4592625
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| | | || ||| | |||||||||||||||    
T  4592830 gaattaagaaagtagatatttgcattaatattgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctataagagatagagttagtttatgttttcaacat 4592731  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  4592730 attatttattgctagttgaagaaaaagatgtataataaatatggacatgtatgtaaagtaatagttaatgtacttgaaaatatcaaaggtgtcttataaa 4592631  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  4592630 aaggga 4592625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22567369 - 22567072
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||   |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  22567369 ttatactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacggaaattaagaaagtggatatttgtattatttttgtttgtaatcactattgtt 22567270  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||  || || | |||| |||   |||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||    
T  22567269 tttacaattttattatt-aagagagagagttaatttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtattataaatatggacatgta 22567171  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt---ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||||||  |||||| |||||| ||| | ||||| |||||||||||       |   ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22567170 tgtaaggaaataattaatatagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaaaagggacaactttttttcttctcaaaaggatcttataattagggacggag 22567072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 281
Target Start/End: Original strand, 44529413 - 44529593
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44529413 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 44529512  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 281  Q
    ||||||||||||||||  || |||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  44529513 tacaattttatccttt--aagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaaaaaaaagatgtataat 44529593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 47263709 - 47263501
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||| | |||||||||  | ||    
T  47263709 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagattgagagttagtttatgtttttcatat 47263611  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat----aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||    
T  47263610 gttatt-attgctgattgaagaaaaagatgtatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgaatctta 47263512  T
Q  342 taaaaagggac 352  Q
    |||||| ||||    
T  47263511 taaaaaaggac 47263501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 31465917 - 31465714
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||  | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| | |||  ||| | |||||||||||||||    
T  31465917 gaattaagaaagtgaatatttgcattaaacttatttgttatcactaatgtttttacaattttatcctttaagagagatagttagtttatgttttcaacat 31465818  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||| ||| |||||  |||||| |||| ||||    
T  31465817 gttatttattgctaattaaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaggaatagttaatgtacttggaaataacaaagggatcttgtaaa 31465718  T
Q  346 aagg 349  Q
    ||||    
T  31465717 aagg 31465714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 270
Target Start/End: Original strand, 44454612 - 44454736
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || ||  |||||||||||||||    
T  44454612 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgattttacaattttatcctttaagagagatggatgatttatgttttcaacat 44454711  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
      |||||||||||||| ||||||||    
T  44454712 gttatttattgctgatagaagaaaa 44454736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 205 - 392
Target Start/End: Original strand, 11352908 - 11353093
Alignment:
Q  205 tttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 304  Q
    |||||||||||| | || | ||| | |||| ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||      
T  11352908 tttatcctttaagagagggagttagtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaat 11353007  T
Q  305 aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       ||  |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11353008 aataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatt--tcaaaagggtcttataattaggaacggag 11353093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 350
Target Start/End: Original strand, 47296352 - 47296556
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |   ||| | | | |||||||||||||||    
T  47296352 gaattaagataatcgatattggtattaaagatgtttgtaatcactattgttttcacaattttgtcctttaga---gagaggtagtttatgttttcaacat 47296448  T
Q  246 tctatttattgctgatt---gaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat 342  Q
      ||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||   || |||    
T  47296449 gatatttattgttgattattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaacaaataattaatgtagttggaaatagcaaagatatcctat 47296548  T
Q  343 aaaaaggg 350  Q
    ||||||||    
T  47296549 aaaaaggg 47296556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 248 - 352
Target Start/End: Original strand, 39867543 - 39867647
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  39867543 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaa 39867642  T
Q  348 gggac 352  Q
    |||||    
T  39867643 gggac 39867647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 156 - 352
Target Start/End: Original strand, 47429183 - 47429378
Alignment:
Q  156 agtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttatt 255  Q
    ||||||||||| |||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||| | |||| || |||| ||  ||||||||    
T  47429183 agtggatatttatattaaagttgtttgtagtcactattatttttacaattttattctttagaga-gagagttagtttatattctcaatatattatttatt 47429281  T
Q  256 gctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||||||||||||||||    
T  47429282 gttgattaaagaaaaagatgtataataaatggggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaaagggac 47429378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48023124 - 48022912
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat 278  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || |||| | ||| | |||||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||| || |||    
T  48023124 tttgtaattacaattgtttttataattttattctt-aagaaagtgagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgatttaagaaaaatatatat 48023026  T
Q  279 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttat 378  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||  | ||||||||||||||||       |||||||||| |||  |||    
T  48023025 aataaataggggcatgtatgcaaagaaataattaatgtagttggaaataccaaaatgatcttataaaaagggacatatttttttctcaaaaaggttctat 48022926  T
Q  379 aattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||    
T  48022925 aattagggacggag 48022912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 184 - 392
Target Start/End: Original strand, 29437678 - 29437885
Alignment:
Q  184 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||  ||||||||| || ||  ||||||||| ||| |||||||||| ||| | |||||    
T  29437678 aattactattgtttttacaattttatcctt-aatagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgaatgaagaaaaaaatgcaaaataa 29437776  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| ||||||||||||    
T  29437777 ataagggtatgttggtaaagaaataattgatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagagtcttataatta 29437876  T
Q  384 gggacggag 392  Q
    |||||||||    
T  29437877 gggacggag 29437885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 47754577 - 47754431
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||  ||||| |||||| |||||||  ||||||||| |||  | |||||||||| |||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  47754577 gaattaatttagtgaatatttatattaaagttgtttgtaaataccgtcgtttttacaaatttatcctttaagatagagagtttgtttatgttttcaacat 47754478  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 292  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47754477 actatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 47754431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 2636993 - 2637217
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  2636993 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 2637091  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||       |||  ||    
T  2637092 aaaaaaatgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaataccaaaggggtcttataaaaagggacattttttttttcca 2637191  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  2637192 aaagagtcttataattagggacggag 2637217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15616387 - 15616179
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||||| || | | | |||| ||| | |||||||||| | |    
T  15616387 gaattaagaaagtggataattatattaaagttgtttgtaatcatcattgtttttacaattttatctttaagagagagagagttagtttatgttttccata 15616288  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    | |||||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||  | |||||||    
T  15616287 tgctatttattgttgattaaaggaaaaatatgtataaaaaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaattgatcttata 15616188  T
Q  344 aaaagggac 352  Q
    |||| ||||    
T  15616187 aaaatggac 15616179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 104 - 288
Target Start/End: Original strand, 1837316 - 1837506
Alignment:
Q  104 acctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaa 203  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1837316 acctccgtccctaattatatgactcttttataaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtcttaaatatgtttgtaattactattgcttttacaa 1837415  T
Q  204 ttttatccttta------aaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 288  Q
    | |||||||| |      | | |||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1837416 tattatccttcaagagagagagagagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagg 1837506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Original strand, 39425637 - 39425858
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  39425637 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 39425735  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctc 365  Q
    |||| |||| | |||||||| ||| ||||  |||| ||||||||| | ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||| ||        ||||||    
T  39425736 aaaatgatgcaaaataaataagggtatgttggtaatgaaataatttatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggaacaatttttttttctc 39425835  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||| ||||||||||||||||||    
T  39425836 aaaatggtcttataattagggac 39425858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17483962 - 17483739
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  17483962 gtattaaatttgtatataattactattgattttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 17483864  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||       ||| |||    
T  17483863 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagagacaaattattttttca 17483765  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  17483764 aaagggtcttataattagggacggag 17483739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27479828 - 27479605
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||| ||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27479828 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagggaggattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27479730  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  |||||| ||||||||||| ||||       ||| |||    
T  27479729 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaa-ggacaaattattttttca 27479631  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  27479630 aaagggtattataattaaggacggag 27479605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 32153580 - 32153825
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |  ||| ||| | ||||||||| |||||     
T  32153580 aattaagaaagtaggtatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagatggagagttagtttatgttttgaacatg 32153679  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||  ||||  |||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||  || ||  |||||  ||| |||||||||||||    
T  32153680 ttatttattgttgattgaagaaaataatgtgaaataaataagggtatgtatgtaaataaataataaatctatttagaaataacaaaagggtcttataaaa 32153779  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||       ||| | |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  32153780 agggacaacatatttttttaaaaaggtcttataattaaggacggag 32153825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 276 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5858377 - 5858261
Alignment:
Q  276 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtct 375  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||| ||||    
T  5858377 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtct 5858278  T
Q  376 tataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||    
T  5858277 tataattagggacggag 5858261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #139
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 261 - 394
Target Start/End: Original strand, 32908286 - 32908416
Alignment:
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||       |    
T  32908286 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaataagtcttataaaaagggac---aattt 32908382  T
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggagta 394  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32908383 ttttcaaaagggtcttataattagggatggagta 32908416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #140
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 18172561 - 18172377
Alignment:
Q  152 agatagtggatatttgtattaaat-atgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctat 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||  || ||  ||||||||| |||||  |||    
T  18172561 agatagtggatatttatattaaattatgtttgtaattactgttgtttttacaattttatccttt--aagagttggatgatttatgtttttaacatgttat 18172464  T
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  18172463 ttatagttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg------------gaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 18172377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #141
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 168 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21290350 - 21290129
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| | | || ||  ||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| ||    
T  21290350 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatccttaagacaa-agaattaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagga 21290252  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||       ||||||||    
T  21290251 aaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac-aatttttttctcaa 21290153  T
Q  368 aagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21290152 aagggtcttataattagggacgga 21290129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #142
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 51467280 - 51467503
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  51467280 gtattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcc-ttaagagagagggttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 51467378  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||  ||| |||| ||||||||||||||       ||| |||    
T  51467379 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaataccaaaagggtgttataaaaagggacaaattattttttca 51467477  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  51467478 aaaggatcttataattagggacggag 51467503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #143
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 248 - 352
Target Start/End: Original strand, 51561765 - 51561869
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  51561765 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaatgtgtcttataaaaa 51561864  T
Q  348 gggac 352  Q
     ||||    
T  51561865 tggac 51561869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #144
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31154509 - 31154351
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||   |||| |||||||||  | ||     
T  31154509 aattaagaaaatggatatttatattaaagttgtttttaatcactattgtttttacaattttatcctt-aaaagagataattggtttatgtttttcatatg 31154411  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  31154410 ctatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgcaaagaaa 31154351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #145
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 52429117 - 52428899
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  52429117 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 52429019  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | | |||||||||||||||       ||| |||    
T  52429018 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagccttataaaaagggacaaattattttttca 52428920  T
Q  367 aaagggtcttataattaggga 387  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  52428919 aaaaggtcttataattaggga 52428899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #146
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30996973 - 30996755
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||| ||   ||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  30996973 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aagagagaggattaatttacgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 30996875  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||||||| | |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| || ||||||||||||||||       ||| ||||    
T  30996874 aaaagatgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatggatcttataaaaagggacaaattattttttcaa 30996775  T
Q  368 aagggtcttataattaggga 387  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
T  30996774 aagagtcttataattcggga 30996755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #147
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 49549231 - 49549009
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||     
T  49549231 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaa 49549133  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||       ||| |||    
T  49549132 aaaaaaatgcaaaataaataagggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttca 49549033  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgg 390  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  49549032 aaagagtcttataattaaggacgg 49549009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #148
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 171 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 26768611 - 26768395
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| | |||  ||| |  |||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||    
T  26768611 taaatttgtttgtaattgttattgtttttacaattttaacctttaagagagaaagttagtgtatg-tttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26768513  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaag 370  Q
    |||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||        ||||||||||    
T  26768512 agatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttagaaatacaaaagggatcttataaaaagagacaaaaaaa-ttctcaaaag 26768414  T
Q  371 ggtcttataattagggacg 389  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  26768413 ggtcttatatttagggacg 26768395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #149
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 223
Target Start/End: Original strand, 32906752 - 32906829
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagag 223  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32906752 gaattaagatagtagatatttgtattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagag 32906829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #150
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 15302551 - 15302775
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  15302551 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 15302649  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||  ||||||||||||||||||       ||| |||    
T  15302650 aaaaaaatacaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattattttttca 15302749  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15302750 aaaggatcttataattagggatggag 15302775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #151
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 147 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 26547756 - 26547680
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagag 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26547756 aattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagaaagag 26547680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #152
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 216
Target Start/End: Original strand, 51561069 - 51561186
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51561069 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 51561168  T
Q  199 tacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||    
T  51561169 tacaattttatcctttaa 51561186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #153
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 35693363 - 35693112
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||| | | |||| | ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  35693363 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagaaatttgataatggtaataaatttgtttgtaaatactattgtttt 35693264  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagaggg--ttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||| || | |||| |  ||   |||||||||||| ||  |||||| || |||||||| ||||||||||  ||||| |||||| ||||     
T  35693263 tacaattttatccttgaagagagagagagttattttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaaaaaaaagatgttgaataactaggggtatgtt 35693164  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
     ||||| || ||||||| ||  |||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  35693163 ggtaaaaaattaattaatgtgcttgaaaatatcaaagggatcttataaaaag 35693112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #154
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 327
Target Start/End: Original strand, 31338946 - 31339112
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaatt--actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgct 258  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| | || |||||||||||| |||||| ||| |    
T  31338946 atatttgtattaaatttgtttgtaattgtattattgtttttacaatttcatcctttaaaagagagagtttgtttctgttttcaacatgctatttcttgtt 31339045  T
Q  259 gattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||| |||||||| || |||||||||||  ||  |  | |||||||||||||||| | |||||||||||    
T  31339046 gattaaagaaaaaaatttataataaataaagg--ttgaggtaaagaaataattaatgaagttgaaaata 31339112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #155
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 251 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 27530905 - 27530805
Alignment:
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || | |||||||||||||||    
T  27530905 ttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagtgacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag-caatgagtcttataaaaaggg 27530807  T
Q  351 ac 352  Q
    ||    
T  27530806 ac 27530805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #156
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Original strand, 39627059 - 39627227
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || |  |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  39627059 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-atagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaata 39627157  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| |  | |||||||||||||||| |||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  39627158 aataagggtagatttgtaaagaaataattagcgtacttgaaaatatcaaagaggtcttataaaaagggac 39627227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #157
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 146 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 13698862 - 13698736
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| | |||| ||||| ||||||||||   ||    
T  13698862 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagagttggtttatgttttccttat 13698764  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaaga 273  Q
     || |||||||||||||||| |||||||    
T  13698763 actttttattgctgattgaaaaaaaaga 13698736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #158
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Original strand, 23893505 - 23893727
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  23893505 tattaaatttgtatataattaccattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 23893603  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | | ||| |||||    |||| ||||||||||||||||       ||||||||    
T  23893604 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgcacttggaaata-cctagggatcttataaaaagggacaattttttttctcaa 23893702  T
Q  368 aagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||  | ||||||||| ||||||||    
T  23893703 aagaattttataattaaggacggag 23893727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #159
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38920448 - 38920245
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||||||  || | ||||    
T  38920448 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaagaaaaa--tgcaaaata 38920352  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||||||   ||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||    
T  38920351 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacaccaaaggggt---ataaaaagggacaaatgattttttcaaaagggtcttataatt 38920255  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  38920254 agggacggag 38920245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #160
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Original strand, 4279951 - 4280157
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||    
T  4279951 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagcgagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa--tgtaaaata 4280047  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||  | ||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  ||| || ||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||    
T  4280048 aataaggttaagttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaatggatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatt 4280147  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  4280148 agggacggag 4280157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #161
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 4389839 - 4389659
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |    
T  4389839 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagg 4389741  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||| | |||||||| | | | ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| | ||||||||||||    
T  4389740 aaaaagatgcaaaataaataagagtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagagatcttataaaaag 4389659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #162
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 103 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 26544508 - 26544395
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  26544508 tacctccgtctctaattataggacccttttgaaaacataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatatttgtaattattattgtttttaca 26544409  T
Q  203 attttatcctttaa 216  Q
    ||||||| ||||||    
T  26544408 attttattctttaa 26544395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #163
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 351
Target Start/End: Original strand, 48363821 - 48364004
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  |    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  48363821 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 48363919  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| || |||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  48363920 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaataaataattaatgtacttaaaaacaccaaaggggtcttttaaaaaggga 48364004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #164
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 9424988 - 9424817
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  ||   |||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |    
T  9424988 tgtttataattaatattgtttttacaattttatcttttaagagagagaattattttatgttttcaacataatatttaatgttgattgaagaaaaagatat 9424889  T
Q  277 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    | ||||||||| || ||||  ||||| ||| |||||| ||| |||||||||  |||| | |||||| |||||    
T  9424888 aaaataaatagaggtatgttggtaaaaaaagaattaatgtatttgaaaataccaaagagatcttatgaaaag 9424817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #165
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 167 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 27670071 - 27669894
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgttttt-acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  27670071 gtattaaatttgtatataattactattgttttttacaattttatcctt---aaaagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 27669975  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| | | ||||||  || ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  27669974 gaaaaagatgcaaagtaaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatatacttggaaatatcaaagggatcttataaaa 27669894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #166
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 43789804 - 43789665
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||| ||||||||||| ||| ||| || ||  ||||||||||| ||||||    
T  43789804 tatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaatgaaataattaatgtaattggaactaccaaaggggtcttttaaaaa 43789705  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||       ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43789704 gggacaattttttttctcaaaagggtcttataattaggga 43789665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #167
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 274
Target Start/End: Original strand, 18114288 - 18114385
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagat 274  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18114288 tgtttgtaatttctattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttaatatatgttttcaatataatatttaatgctgattgaagaaaaagat 18114385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #168
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 35945438 - 35945279
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||   ||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  35945438 gtattaaatttgtatgtaattattattgtttttataattttatcctt-aagaaagaaaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 35945340  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||||||||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  35945339 aaaaagatgcaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaata 35945279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #169
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Original strand, 37850244 - 37850466
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||  ||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||    
T  37850244 gtattaaatttgtgtataattactattgtttttgcaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaag 37850342  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac--nnnnnnntttct 364  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||  || ||| |||||  ||| ||||||||| |||| ||||         |||||    
T  37850343 aaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatctatttggaaataccaaaagggtcttatgaaaaaggacaattttttttttct 37850442  T
Q  365 caaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  37850443 caaaaggatcttataattagggac 37850466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #170
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 320
Target Start/End: Original strand, 1197952 - 1198128
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa--agagggttggcttatgttttcaac 243  Q
    ||||||| | ||| ||| |||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |   |||| |||   ||||||||| |||    
T  1197952 gaattaaaaaagttgatgtttgtattaaagctgtttataattgctattgtttttaaaattttatcttttaagagggagagagttaatttatgtttttaac 1198051  T
Q  244 attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagtt 320  Q
    || |||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||   | | ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1198052 atgctatttattgttgattgaaaaaaaaaatgtatattaaataatagtacgtaggtaaagaaataattaatgtagtt 1198128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #171
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 168 - 347
Target Start/End: Original strand, 4371574 - 4371750
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||| ||||||||||  || |||||| ||||||| ||    
T  4371574 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatattttcaacataatacttattgttgattgagga 4371670  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||| | |||||||| ||  | ||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||||||||||    
T  4371671 aaaagatgcaaaataaataaggataggttggtaaataaataattaatgtacttgaaaatatcaaagaagtcttataaaaa 4371750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #172
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 267 - 352
Target Start/End: Original strand, 44455529 - 44455614
Alignment:
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||| | ||||||||||| ||||    
T  44455529 aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaagagatcttataaaaaaggac 44455614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #173
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1427425 - 1427205
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| | |||| |||   |||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||    
T  1427425 taaatttgttggtaattactattggttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaatatagtatttaatgttgattgaagaaaa 1427327  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaag 370  Q
    | ||  | |||||||||||| |||   || || || ||||||| | | ||| |||||  ||||||||||||||| ||| |||        ||||||||||    
T  1427326 atatacaaaataaataggggtatgatggtgaaaaattaattaatgcacttggaaataacaaaggggtcttataataagagacaaaaaaaattctcaaaag 1427227  T
Q  371 ggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||| ||| ||||||||    
T  1427226 ggtcttatatttaaggacggag 1427205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #174
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 19349357 - 19349254
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  19349357 tatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaataccaaatgggtcttataaaaa 19349258  T
Q  348 ggga 351  Q
    ||||    
T  19349257 ggga 19349254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #175
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 30761118 - 30761007
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | | || ||| |  ||||||||||||||  |||||| | ||||||||||||||| || |    
T  30761118 tgtttgtaattgctattgtttttacaattttattctttaagagaaagagttagtgtatgttttcaacatggtatttaatactgattgaagaaaaaaatat 30761019  T
Q  277 ataataaatagg 288  Q
    | ||||||||||    
T  30761018 aaaataaatagg 30761007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #176
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38505948 - 38505805
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| ||||||||||||    
T  38505948 tatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatatcaaaggagtcttataaaaa 38505850  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||       ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  38505849 ggaacaaattattttttcaaaagggtctaataattaaggacggag 38505805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #177
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 205 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 8905604 - 8905463
Alignment:
Q  205 tttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 304  Q
    |||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||  ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |   ||||||    
T  8905604 tttatcatttaagaaagagagttagtttatgtttttgacatgttatttattgctgat-gaagaaaaagatgtataataaatagggaaatatggataaaga 8905506  T
Q  305 aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||  ||||| ||||||| ||||   |||||||||||    
T  8905505 aataattaatatagtttaaaatagcaaagatatcttataaaaa 8905463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #178
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 252 - 349
Target Start/End: Original strand, 33163290 - 33163387
Alignment:
Q  252 tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||  || ||||| |||| |||||| || ||| ||||||    
T  33163290 tattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaataagggtatgtaggtaaagaaataattaatctaattgaacatagcaaagggatcatatgaaaagg 33163387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #179
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 388
Target Start/End: Original strand, 5854462 - 5854619
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||   |||| |||||||| ||  || ||| |||||  |    
T  5854462 ttatgttttcaacataatatttatggttgattgaagaaaaatatgcaaaataaataggggtatggtggtaacgaaataatcaatctaattggaaatacca 5854561  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    || |||||||||| ||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5854562 aaagggtcttatataaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggac 5854619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #180
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Original strand, 39647679 - 39647779
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||||    
T  39647679 tattcattgccgattgaagaaaaatatatgtaataaataggagtatgtatgtaaagaaatggttaatgtagttggaaatagtaaatggatcttataaaaa 39647778  T
Q  348 g 348  Q
    |    
T  39647779 g 39647779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #181
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 313
Target Start/End: Original strand, 41619995 - 41620118
Alignment:
Q  187 tactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  41619995 tactattgtttttacaattttatcttt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaagaaaaagatgcaaaataaata 41620091  T
Q  287 ggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
     ||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  41620092 agggtatgttggtaaaaaaataattaa 41620118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #182
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 183 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 45810204 - 45810116
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||    
T  45810204 taattactattatttttacaattttatcctttaaaggagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaaaaaaa 45810116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #183
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 1867262 - 1867380
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| || ||| || |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||    
T  1867262 gtattaaatttgtatataagtactattggttttacaattttatcctt-aagaaatagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcgaag 1867360  T
Q  267 aaaaagatgtataataaata 286  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  1867361 aaaaaaatgtaaaataaata 1867380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #184
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 50074631 - 50074460
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||   |||| ||||||| ||  |||||| || |||| ||||||||  ||||    
T  50074631 tgtttgtagttgctattgtttttataattttatcctttgagagagagtgttattttatattttcaatatagtatttaatgttgatcgaagaaaacaatgt 50074532  T
Q  277 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    | |||||||||| | ||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||||  |||||||||||||    
T  50074531 aaaataaataggagtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaataccaaagaagtcttataaaaag 50074460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #185
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 46084093 - 46083979
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| ||    ||||||||||||||  |||||| | || |||||||||||    
T  46084093 taaatttgtttgtaattaatattgcttttacaattttatcttttaagcaagaggattcttgtatgttttcaacatagtatttaattcttattgaagaaaa 46083994  T
Q  271 agatgtataataaat 285  Q
    |||| || |||||||    
T  46083993 agatataaaataaat 46083979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #186
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 327
Target Start/End: Original strand, 15624703 - 15624862
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg---aaga 267  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||||| ||| |  |||||| |||  ||  |||||| || ||||||   || |    
T  15624703 taaatttgtttgtaattactattattttgataattttatcctttaagaaagagagttagtgtatgttgtcattatagtatttaatgttgattgaaaaaaa 15624802  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  15624803 aaaagatataaaataaatagaggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaata 15624862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #187
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 389
Target Start/End: Original strand, 46271159 - 46271378
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||  |||| ||||    
T  46271159 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattattgatagaag 46271257  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||    ||||||||||||||||       ||| |||    
T  46271258 aaaaa-atgcaaaataaata-agatatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatcatcttataaaaagggacaaattattttttca 46271355  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  46271356 aaagggtcttataattagggacg 46271378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #188
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37000783 - 37000665
Alignment:
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||  | | ||||| |||||||||||||        |||||||    
T  37000783 aaaaagatgtaaaataattaggggtatgtttgtaaagaaataattaatgcacttgaaaatttagagggggttttataaaaagggataaagaattttctca 37000684  T
Q  367 aaagggtcttataattagg 385  Q
    | ||||||||||| |||||    
T  37000683 agagggtcttatatttagg 37000665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #189
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Original strand, 2606722 - 2606770
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2606722 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttacgattttatcctttaa 2606770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #190
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Original strand, 8946442 - 8946498
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  8946442 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacatttttattctttaa 8946498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #191
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 352
Target Start/End: Original strand, 10758451 - 10758609
Alignment:
Q  195 tttttacaattttatcctttaaaaaagaggg--ttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 292  Q
    |||||||||||||||| ||||| | ||||||  ||  ||||||||||||||||  |||||| ||  ||| |||||||||||| || ||||||||| |  |    
T  10758451 tttttacaattttatcttttaagagagagggcgttaacttatgttttcaacataatatttaatgtcgatcgaagaaaaagatataaaataaatagagtta 10758550  T
Q  293 tgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    | |  ||||| ||| |||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  10758551 tcttagtaaa-aaaaaattaaagttgttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaatggac 10758609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #192
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 315 - 391
Target Start/End: Original strand, 897154 - 897230
Alignment:
Q  315 gtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||       ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  897154 gtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagagtcttataattaggaacgga 897230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #193
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 253 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15907208 - 15907109
Alignment:
Q  253 attgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||||||| |||||||||| | |||||||| ||  | ||  |||||||||||||||  ||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15907208 attgttgattgaggaaaaagatgcaaaataaataaggataagttggtaaagaaataattagtgtatttaaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 15907109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #194
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 10332415 - 10332361
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaaga 222  Q
    |||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10332415 tattaaatttatttgtaattattattatttttacaattttatcctttaaataaga 10332361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #195
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 220 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 13054866 - 13054800
Alignment:
Q  220 agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  13054866 agagagttggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgtagaaaaagatgcaaaataaata 13054800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #196
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28886143 - 28886109
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28886143 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 28886109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #197
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 298 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47754118 - 47754023
Alignment:
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg-acnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |        ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  47754118 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggaaattttttttttctcaaaagagttttataattagggacggag 47754023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #198
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 217
Target Start/End: Original strand, 23932941 - 23932990
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa 217  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23932941 tattaaatttgtttgtaattagtattgtttttataattttattctttaaa 23932990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #199
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 25227405 - 25227356
Alignment:
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25227405 aaagaaataattaatatagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagg 25227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #200
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 50937778 - 50937811
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50937778 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 50937811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #201
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 25509205 - 25509241
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25509205 attatactacctccgtccctaattataagaccctttt 25509241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #202
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 92 - 132
Target Start/End: Original strand, 27037261 - 27037301
Alignment:
Q  92 aaacattatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27037261 aaacatcatactacctccgtccctaattataagaccctttt 27037301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #203
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 267 - 327
Target Start/End: Original strand, 35160218 - 35160278
Alignment:
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35160218 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaata 35160278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #204
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9413365 - 9413330
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9413365 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 9413330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #205
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 52001573 - 52001530
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  52001573 gtattaaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatc 52001530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #206
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 199
Target Start/End: Original strand, 11351487 - 11351541
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttg-tattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11351487 gaattaagatagtgaatattttatattaaatatgtttgtaattattattattttt 11351541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #207
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 33337025 - 33336983
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33337025 taaatttgttggtaattactattggttttacaattttatcctt 33336983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #208
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 38509142 - 38509096
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38509142 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatttcatcctt 38509096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #209
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 5766028 - 5765995
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5766028 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 5765995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #210
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 7763787 - 7763754
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7763787 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 7763754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #211
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 17483732 - 17483765
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17483732 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 17483765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #212
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 27255512 - 27255467
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27255512 taaatttgtttgcaatcactattgtttttacaattttatcatttaa 27255467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #213
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42276199 - 42276166
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42276199 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 42276166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 233)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 55562863 - 55563158
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55562863 tatactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 55562962  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55562963 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 55563062  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55563063 gtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggag 55563158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 20767955 - 20768247
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20767955 tactacctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20768054  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20768055 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 20768154  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||        |||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
T  20768155 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagagatcttataaaaagggacaaaaaaaattcttaaaagggttttataattaaggacggag 20768247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31937374 - 31937082
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31937374 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31937275  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  31937274 acaattttatcatttaagaaagagtgttagattatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgt 31937175  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31937174 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 31937082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 29519903 - 29520195
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29519903 atactacatccgtccctaattataaaacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggataaa-gtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 29520001  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29520002 tacaattttatcctttaagaaagaaagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatg 29520101  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29520102 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 29520195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 25124030 - 25124277
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25124030 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaataaagagggttgacttatgttttcaacat 25124129  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25124130 tttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgaagttggaaatagaaaaggggtcttataaa 25124229  T
Q  346 aagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25124230 aagggtcaaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 25124277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 375676 - 375430
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  375676 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcagcat 375577  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  375576 tctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaa 375477  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||         |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  375476 aagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaaggacggag 375430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 351
Target Start/End: Original strand, 29460444 - 29460695
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  29460444 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattagatatgtttgtaattattattgttttt 29460543  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29460544 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 29460643  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  29460644 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaaggga 29460695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 100 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 38027430 - 38027137
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38027430 tactacctccatccctaattatatgacccttttggaaaaataactggaattaagatagtggatatttatattaaatatttttgtaattactattgttttt 38027331  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38027330 acaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 38027231  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagt 393  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38027230 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggagggagt 38027137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1173813 - 1173616
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1173813 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 1173714  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1173713 tctatttattgctgattgaagaaaaggatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 1173616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 102 - 392
Target Start/End: Original strand, 28298111 - 28298402
Alignment:
Q  102 ctacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttac 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28298111 ctacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttac 28298210  T
Q  202 aattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 300  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28298211 aattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgtcgattgaaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgta 28298310  T
Q  301 aagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28298311 aagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 28298402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 182 - 392
Target Start/End: Original strand, 41191449 - 41191659
Alignment:
Q  182 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191449 gtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 41191548  T
Q  282 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||    
T  41191549 aaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataat 41191648  T
Q  382 tagggacggag 392  Q
    ||| |||||||    
T  41191649 tagagacggag 41191659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 37639627 - 37639918
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37639627 tactacatccgtctctaattataagtcctttttgaaaaaataacgagaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 37639726  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||||    
T  37639727 acaattttatcttttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgccgattgaacaaaaatatgtataataaata-ggacatgtatgt 37639825  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||         ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37639826 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaagaatctcaaaagagtcttataattagggacggag 37639918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 625707 - 625997
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  625707 atactacctccgtccctaattataggatctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttt 625806  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  625807 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 625904  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  625905 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttc-caaaaaggtcttataattagggacggag 625997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 100 - 321
Target Start/End: Original strand, 20761564 - 20761785
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20761564 tactacctccgtccctaattataagtcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20761663  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20761664 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 20761763  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttg 321  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  20761764 aaagaaataattaatgtagttg 20761785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 30049822 - 30050115
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049822 atactaccttcgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 30049921  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049922 tacaattttatcctttaagagagagagttgctttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 30050021  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30050022 taaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggaccaaattttttttcaaaagagtcttataattagggacggag 30050115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 39671023 - 39670771
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39671023 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgttttt 39670924  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||      
T  39670923 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtaga 39670824  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39670823 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaaggga 39670771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 54676800 - 54676553
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  54676800 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacat 54676701  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat-agaaaaggggtcttataa 344  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  54676700 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataa 54676601  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54676600 aaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 54676553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 140 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 37174091 - 37173842
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||    
T  37174091 taacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacagttttatcctttaagagagaggattggtttatgtttt 37173992  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  37173991 caacatgttatttattggtgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtct 37173892  T
Q  340 tataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37173891 tataaaaagggacaaaaaaaactctcaaaagggtcttataattagggacg 37173842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17339377 - 17339084
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17339377 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttt 17339278  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17339277 tacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatg 17339178  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17339177 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggag 17339084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 96 - 392
Target Start/End: Original strand, 43387728 - 43388024
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 195  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  43387728 attatactccctccgtccctatatataagacccttttatcaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgt 43387827  T
Q  196 ttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43387828 ttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 43387927  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43387928 atgtaaagaaataattaatgtagttggaagtaacaaaggggtcttataaaaagggacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 43388024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 18882605 - 18882343
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18882605 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacat 18882506  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--atgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |    
T  18882505 tatatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggttttaga 18882406  T
Q  344 aaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagtaatagtattttatat 408  Q
    |||| |||        |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  18882405 aaaaaggataaaaaattttctcaaaaaggtcttataattagggacggag--atagtatttaatat 18882343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 150 - 392
Target Start/End: Original strand, 34273008 - 34273250
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattcta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||    
T  34273008 taagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgtta 34273107  T
Q  250 tttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  34273108 tttattgttgattgaagaaaaagatgtatgataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagg 34273207  T
Q  350 gacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34273208 gacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 34273250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 35675705 - 35675951
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  35675705 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 35675804  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  35675805 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 35675904  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  35675905 aagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 35675951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36392106 - 36391860
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  36392106 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 36392007  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36392006 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 36391907  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36391906 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 36391860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 53276971 - 53277216
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  53276971 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 53277070  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  53277071 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 53277170  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53277171 aagggacaaaaaaa-ttcttaaaagggtcttataattagggacggag 53277216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 103 - 352
Target Start/End: Original strand, 39114631 - 39114880
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||       |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39114631 tacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttaca 39114730  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||    
T  39114731 attttatcctttaagaaagatggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagagcatgtatgtaaa 39114830  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39114831 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 39114880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 51717883 - 51718089
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |    
T  51717883 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagagttggtttatgttttcaacct 51717982  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  51717983 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatatggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtattataaa 51718082  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  51718083 aagggac 51718089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 9328025 - 9328271
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  9328025 gaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 9328124  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  9328125 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 9328224  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9328225 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 9328271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33413770 - 33413524
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  33413770 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 33413671  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  33413670 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 33413571  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33413570 aaaggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 33413524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 36129875 - 36130121
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||||    
T  36129875 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtctgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgtttccaacat 36129974  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  36129975 gttatctattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 36130074  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||         |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36130075 aagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaggaacggag 36130121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 98 - 393
Target Start/End: Original strand, 50450962 - 50451257
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50450962 tatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatctgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 50451061  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  50451062 ttacaattttatcctttaagagtgaggaatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatatat 50451161  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagt 393  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50451162 gtaaagaaataattaatgtagttttaaatagtaaaggggtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggagt 50451257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 13620594 - 13620885
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13620594 atactatctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 13620693  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13620694 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 13620791  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13620792 taaaaaaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaaggatcttataattagggacggag 13620885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 47311541 - 47311305
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47311541 gaattaagata-tggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaggaaagagggttggcttatgttttcaacat 47311443  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||   || |||||||    
T  47311442 tttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaaaagtgttataaa 47311343  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||        ||||||||| |||||||||||||    
T  47311342 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataatta 47311305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 26625743 - 26626033
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26625743 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacaggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26625842  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    | ||||||||||||||| | |||   |||  ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26625843 ataattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgtttttaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgt 26625940  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26625941 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggag 26626033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 56432817 - 56432524
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56432817 tactatctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 56432718  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga-aaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  56432717 acaattttatcctttaagagagagagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaatgtattataaataagggcatgtatg 56432618  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56432617 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 56432524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 36991212 - 36990920
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || |       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36991212 tactacctccgtccctaattataggacccttctgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 36991113  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36991112 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttgaacatgttatttattgctaattgaagaaaaaaatgtatgataaataggggcatgtatgt 36991013  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36991012 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagagacggag 36990920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 306
Target Start/End: Original strand, 45850462 - 45850669
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||       ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45850462 atactaccaccgttcctaattataagacccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtttt 45850561  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45850562 tacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 45850661  T
Q  299 taaagaaa 306  Q
    ||||||||    
T  45850662 taaagaaa 45850669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 92 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47807166 - 47806866
Alignment:
Q  92 aaacattatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 191  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||  |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||    
T  47807166 aaacataatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcacta 47807067  T
Q  192 ttgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 291  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47807066 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagaagattagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 47806967  T
Q  292 atgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47806966 atgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 47806867  T
Q  392 g 392  Q
    |    
T  47806866 g 47806866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1028770 - 1028524
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  1028770 gaattaagatagtggatatttgtattaaatttatttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 1028671  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  1028670 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaa 1028571  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1028570 aagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattaggaacggag 1028524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 20391223 - 20391468
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  20391223 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatat 20391322  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  20391323 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaa 20391422  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20391423 aagggacaaattttttt-tcaaaagggtcttataattagggacggag 20391468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44295041 - 44294795
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  44295041 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 44294942  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  44294941 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaa 44294842  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44294841 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 44294795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 45742591 - 45742837
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  45742591 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 45742690  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  45742691 gttatttattgttgatggaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaa 45742790  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45742791 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 45742837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 5375344 - 5375588
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  5375344 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccgttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 5375443  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  5375444 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca-gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 5375542  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5375543 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 5375588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 32032776 - 32033024
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  32032776 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 32032875  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  32032876 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctggaaataacaaaggggtcttataaa 32032975  T
Q  346 aagggac--nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32032976 aagggacaaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 32033024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 51336045 - 51335808
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | || | ||||| |||||||||||||||    
T  51336045 gaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagggagttggtttatgttttcaacat 51335946  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51335945 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaa 51335846  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  51335845 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 51335808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 51536467 - 51536176
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  51536467 tatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacaggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 51536368  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51536367 ttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 51536268  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51536267 gtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataataaagaggtcttataaaaagggacaaaaa---ttctcaaaaaggtcttataattagggagggag 51536176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Original strand, 48241429 - 48241681
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||    
T  48241429 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttatgagagagggttggtttatgtttt 48241528  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||  | |||    
T  48241529 caacatgttatttactggtgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaaagatct 48241628  T
Q  340 tataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||        |||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  48241629 tataagaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtgttataattagggacggag 48241681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 20454969 - 20455212
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  20454969 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 20455066  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  20455067 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatggcaaaggggtcttataaa 20455166  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20455167 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 20455212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48030563 - 48030319
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| ||||||||| |||||    
T  48030563 gaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgtttttaacat 48030466  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  48030465 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 48030366  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48030365 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggag 48030319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6753777 - 6753531
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||||| |||||    
T  6753777 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgtttttaacat 6753678  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  6753677 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 6753578  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6753577 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 6753531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24754330 - 24754084
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  24754330 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttattacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 24754231  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  24754230 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 24754131  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24754130 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 24754084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 50424639 - 50424885
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  50424639 gaattaagatagtggatatgtgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacat 50424738  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  50424739 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaa 50424838  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  50424839 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggag 50424885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52978234 - 52977988
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||    
T  52978234 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttggtttatgttttcaacat 52978135  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  52978134 gttatttattgttgattgaagaaaaggatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 52978035  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52978034 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 52977988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15241730 - 15241486
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  15241730 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 15241631  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  15241630 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaa 15241531  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15241530 agggacaaaaaaa-ttctcaaaagagtcttataattagggacggag 15241486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18018910 - 18018731
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18018910 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 18018811  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaa 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18018810 tctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 18018731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Original strand, 45096905 - 45097195
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45096905 atactccctccgttcctaattataggacccttttataaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 45097004  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||    
T  45097005 tacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaatcatgtataataaataagggtatgcatg 45097102  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45097103 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 45097195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37842425 - 37842181
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||| ||||||||| |||||    
T  37842425 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgtttttaacat 37842328  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  37842327 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 37842228  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        || ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37842227 aagggacaaaaaaaattatcaaaagagtcttataattagggacggag 37842181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37352795 - 37352550
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  37352795 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37352696  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||  |||||||||||    
T  37352695 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaa 37352596  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37352595 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattaaggacggag 37352550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 37357694 - 37357449
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  37357694 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37357595  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||  |||||||||||    
T  37357594 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaa 37357495  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37357494 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattaaggacggag 37357449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 94 - 392
Target Start/End: Original strand, 49373428 - 49373724
Alignment:
Q  94 acattatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt 193  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49373428 acattgtactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatctgtattaaatatgtttgcaattactatt 49373527  T
Q  194 gtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 293  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | |||||| ||||||| |||| ||  ||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  49373528 gtttttacaattttatcctttaagagatatggttggtttatgttatcaagatgttatttatagctgattgaagaaaa--atgtacaataaataggggcat 49373625  T
Q  294 gtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49373626 gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggccaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 49373724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 47228514 - 47228759
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  47228514 aattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 47228613  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||    
T  47228614 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaa 47228713  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47228714 atggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 47228759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 49329741 - 49329541
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||    
T  49329741 aattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttgtttttacaattttatcatttaagaaagtgggttgacttatgttttcaacatt 49329642  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||    
T  49329641 ctatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataaaggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataaaaaatgagtcttataaaa 49329542  T
Q  347 a 347  Q
    |    
T  49329541 a 49329541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 30771774 - 30771575
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  30771774 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 30771675  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30771674 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 30771575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 32898976 - 32899249
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32898976 tatactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 32899075  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    |||    
T  32899076 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagat--------------------tat 32899155  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32899156 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaa-atctcaaaagggtcttataattagggacggag 32899249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4036122 - 4035831
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  4036122 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 4036023  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4036022 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 4035924  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4035923 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 4035831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 5743399 - 5743690
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||       | ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  5743399 tactccctccgtccctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtctgtaatcactattgttttt 5743498  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||  | ||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5743499 acaattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 5743597  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5743598 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 5743690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 14793810 - 14794053
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||    
T  14793810 gaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacat 14793907  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14793908 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 14794007  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  14794008 aatggacaaaaaaa-ttcttaaaagggtcttataattagagacggag 14794053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 10588326 - 10588081
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10588326 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 10588227  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  10588226 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 10588127  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10588126 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatgttataattagggacggag 10588081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 20285806 - 20286052
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  20285806 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacat 20285905  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||  ||||||||||||    
T  20285906 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaagagggtcttataaa 20286005  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20286006 aagggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataattagggacggag 20286052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 29427741 - 29427540
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  29427741 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 29427642  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29427641 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 29427542  T
Q  346 aa 347  Q
    ||    
T  29427541 aa 29427540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 49228503 - 49228749
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||||||||||||||    
T  49228503 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttatgttttcaacat 49228602  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  49228603 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagtttgaaataacaaaggggtcttataaa 49228702  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||  ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49228703 aagggacaaattttttcttcaaaagggtcttataattagagacggag 49228749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 50534135 - 50533890
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || | |||||||||||||||    
T  50534135 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaagtttagtttatgttttcaacat 50534036  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  50534035 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 50533936  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  50533935 aa-ggaccaaaaaaattctcaaaatgatcttataattagggacggag 50533890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 37776521 - 37776768
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||    
T  37776521 gaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacat 37776618  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  37776619 gttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaa 37776718  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttc---tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37776719 aagggacaattttttttcttttcaaaagggtcttataattaaggacggag 37776768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4416262 - 4415971
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  4416262 tactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtattattgttttt 4416163  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||| |||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416162 acagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 4416064  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4416063 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaacattctcaaaagggtcttataattagggacggag 4415971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 6462430 - 6462721
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6462430 tactacctccgtccataattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 6462529  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6462530 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataat-aataggggcatgtatgt 6462628  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||         |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6462629 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaaaggtcttataataagggacagaaaaaaatctcaaaagaatcttataattagggacggag 6462721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47683386 - 47683095
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  47683386 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatattagtattaaatatgtttgcaattactattattttt 47683287  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  47683286 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaggtgtataat-aataggggcatgtatgt 47683188  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||        || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47683187 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaatggacaaaaaaaattatcaaaaggatcttataattagggacggag 47683095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 391
Target Start/End: Original strand, 50602840 - 50603127
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50602840 tacctccgtccctaattatataacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 50602939  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    ||||||| |||||| | |||  ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50602940 attttattctttaagagagatagttggattatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataagggcatgtatgtaaa 50603038  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||||| |||        ||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  50603039 gaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaagtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtattataattagagacgga 50603127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 344
Target Start/End: Original strand, 52850239 - 52850437
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||||| |||| ||||||||||    
T  52850239 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagatagttggtttatattttcaacat 52850338  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  |||||||||||||||    
T  52850339 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataa 52850437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 55631999 - 55632290
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||| | || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  55631999 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaaaaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 55632098  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55632099 acaattttatcctt-aagagagagagttggtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 55632197  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  55632198 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacggag 55632290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 422714 - 422959
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || | |||||||||||||||    
T  422714 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaatg-ttagtttatgttttcaacat 422812  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  422813 gttatttattgttgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 422912  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||         |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  422913 aagggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacggag 422959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 46950241 - 46949998
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||     
T  46950241 aattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttctaattagtattgttttcacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatg 46950144  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  46950143 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 46950044  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46950043 aggaacaaaaaatattctcaaaagggtcttataattagggacggag 46949998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 162 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 50352300 - 50352070
Alignment:
Q  162 tatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgat 261  Q
    |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  50352300 tatttgtaataaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgat 50352201  T
Q  262 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |    
T  50352200 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaat 50352101  T
Q  362 tctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  50352100 tctcaaaaggatcttataattagagacggag 50352070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 101 - 352
Target Start/End: Original strand, 36900852 - 36901100
Alignment:
Q  101 actacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36900852 actacctccgtccctaattatagggccattttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttta 36900951  T
Q  201 caattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 300  Q
    |||||||||||||   || |||| | ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36900952 caattttatcctt---aagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgta 36901048  T
Q  301 aagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||| ||||||||||    
T  36901049 aagaaataattaatgtagttggaaatagcaagggagtcttacaaaaagggac 36901100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 100 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 45921726 - 45921441
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45921726 tactacctctgtccctaattataaggcttttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgctttt 45921627  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||   |||||||||||   |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45921626 acaattttatcctttaagagagagggttaatttatgttttca---tgttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataagggcatgtatgt 45921530  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45921529 aaataaataattaatgtagttgcaaataggaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggac 45921441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 55014751 - 55014957
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  55014751 gaattaaaataatgcatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcttttaagagagatggttggtttatgttttcaacat 55014850  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || |||||||||    
T  55014851 gttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaa 55014950  T
Q  346 aagggac 352  Q
    || ||||    
T  55014951 aatggac 55014957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 4455313 - 4455067
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||     
T  4455313 aattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 4455214  T
Q  247 ctatttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  4455213 ttatttattgttgattgaaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 4455114  T
Q  346 aaggg-acnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||| ||        |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4455113 aagggaacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacgga 4455067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 17609807 - 17610051
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| | | || | |||||||||||||||    
T  17609807 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgcttgtaatcactattgtttttacaattttattctttaagaaaaatg-ttagtttatgttttcaacat 17609905  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  17609906 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaa 17610005  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17610006 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagggacggag 17610051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 47299023 - 47299269
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  47299023 gaattaagatagtaaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 47299122  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  47299123 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 47299222  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  47299223 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtattataattaggaacggag 47299269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 55876630 - 55876387
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||| ||||||||||| |||    
T  55876630 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt--aaaagagaattggtttatgttttcatcat 55876533  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||  |||||||||    
T  55876532 gatatttattgttgattgaagaaaattatgtataataaataagggcatgcatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggaatcttataaa 55876433  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    || | ||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55876432 aatgaacaacaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 55876387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 2615683 - 2615976
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||||       | ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  2615683 tactccctccgtccctaattataaggcccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 2615782  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||| | | | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2615783 acaattttatccttaagagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatg 2615882  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2615883 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttatgattagggacggag 2615976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 272
Target Start/End: Original strand, 41191275 - 41191447
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191275 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 41191374  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaag 272  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191375 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaag 41191447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 4549629 - 4549920
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  4549629 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttt 4549728  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4549729 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 4549827  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4549828 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 4549920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 352
Target Start/End: Original strand, 13389654 - 13389900
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13389654 tacctccgtccttaattatatggccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtagttagtattgtttttaca 13389753  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    |||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13389754 attttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaa 13389850  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13389851 gaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggagtcttataaaaaaggac 13389900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37364769 - 37364588
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  37364769 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctctaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37364670  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  37364669 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 37364588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 52870895 - 52870650
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||  || | |||||||||| | ||    
T  52870895 gaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattagtttatgttttccatat 52870797  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  52870796 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 52870697  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52870696 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagagacggag 52870650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 23777543 - 23777833
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23777543 tactacctctgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgttataaatatgtttgtaattagtatt-ttttt 23777641  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||    ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  23777642 acaattttatcctttaagagagata--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatat 23777739  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||       |||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23777740 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaaaagggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattaggaacggag 23777833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 96 - 297
Target Start/End: Original strand, 54535917 - 54536118
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||       |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54535917 attatactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 54536016  T
Q  196 ttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54536017 ttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgt 54536116  T
Q  296 at 297  Q
    ||    
T  54536117 at 54536118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20747468 - 20747176
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | |   ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  20747468 atactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaattatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 20747369  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20747368 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 20747270  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||        |||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  20747269 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagggatcttataaaaagggacaataaaaattctcaaaggaatcttataattagggacggag 20747176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 100 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 40809854 - 40809607
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||  ||||       ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40809854 tactacctccgtccataattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40809755  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  40809754 acaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtattataaatagggacatgtatgt 40809655  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||| |  |||||||||||    
T  40809654 aaataaataattaatgtagttaaaaatagcaaaagaatcttataaaaa 40809607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41620764 - 41620520
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||  |||| |||||||||||||||    
T  41620764 gaattaagataatggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagatag--ttggtttatgttttcaacat 41620667  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||   ||||||||||    
T  41620666 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatgaagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaatgtcttataaa 41620567  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41620566 aagagataaaaataattctcaaaagggtcttataattagggacggag 41620520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 96 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 53630093 - 53629798
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 195  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  53630093 attagactccctccgtccctaaatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgt 53629994  T
Q  196 ttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53629993 ttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 53629895  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||||| |||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53629894 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggag 53629798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20789182 - 20788977
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||     
T  20789182 aattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattgctattgtttttacaactttatcctttaagagagataattggtttatgttttcaacatg 20789083  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  20789082 ttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaa 20788983  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  20788982 agggac 20788977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 25708465 - 25708709
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  25708465 gaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 25708563  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25708564 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaacaaaaaatcaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 25708663  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25708664 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 25708709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 307
Target Start/End: Original strand, 30523762 - 30523969
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30523762 tatactacctccgtccctaattataagacccttttaaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 30523861  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||||  || |||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  30523862 ttacaattttatccttt--aagagagagatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaatatgggcatgtat 30523959  T
Q  298 gtaaagaaat 307  Q
    ||||||||||    
T  30523960 gtaaagaaat 30523969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 49793381 - 49793097
Alignment:
Q  106 ctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatt 205  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |    
T  49793381 ctccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgagaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttctaattacaattgtttttacaaat 49793282  T
Q  206 ttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa 305  Q
    |||||||| || | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  49793281 ttatccttcaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattcaagaaaaagatgaataataaataaggaaatgtatgtaaagaa 49793184  T
Q  306 ataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49793183 ataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 49793097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8344156 - 8343915
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  8344156 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 8344057  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | || ||||||||    
T  8344056 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggca--tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagttttataaaa 8343959  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||        ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8343958 agggacaaaaaaa-ttctcaaaaaggtcttataattaggaacgga 8343915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 161 - 352
Target Start/End: Original strand, 9808398 - 9808589
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  9808398 atatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctga 9808497  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9808498 ttgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttagaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 9808589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39144702 - 39144410
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  39144702 atactccctccgtctctaattataagacctttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 39144603  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | ||||||||||   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39144602 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccgtatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 39144504  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||| ||        |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39144503 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaaggaacaaaaaaaattcttaaaaggatcttataattagggacggag 39144410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 54877754 - 54878003
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54877754 atactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagagagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactattatttt 54877853  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||| ||||| |  ||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  54877854 tacaattttatcttttaaga--gagtgttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaaaaaaaa--tgtataataaataagggcatgtatg 54877949  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  54877950 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggac 54878003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1859394 - 1859150
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  1859394 gaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 1859296  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  1859295 gatacttattgctg-ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 1859197  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1859196 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 1859150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 16545769 - 16546014
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||| ||||||||||    
T  16545769 gaattaaaatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcttttaagagagaaggttggtttatcttttcaacat 16545868  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |  |||||||||    
T  16545869 gttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatatcaaatgattcttataaa 16545967  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16545968 aaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaaggacggag 16546014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 100 - 383
Target Start/End: Original strand, 29014064 - 29014346
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || | ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  29014064 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 29014163  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29014164 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 29014262  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||    
T  29014263 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataatta 29014346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 39184522 - 39184278
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||| | ||    
T  39184522 gaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcctt---aaaagagagttagtttatgttttccatat 39184426  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  39184425 attatttattgctagttgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtaggtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaa 39184326  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagt 393  Q
    |||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39184325 aagggacaaaaaaatttctcaaaatggtcttataattagggacggagt 39184278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Original strand, 33988582 - 33988783
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||| ||     
T  33988582 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaatatg 33988679  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  33988680 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaa--aaataattaatatagttggaaatagcaaagaggtcttataaaa 33988777  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  33988778 agggac 33988783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37518304 - 37518055
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37518304 ttatattacctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtt 37518205  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||| ||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37518204 tttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaa 37518107  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37518106 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 37518055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37522520 - 37522271
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37522520 ttatattacctctgtctctaattataagacctttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgaaattaatattgtt 37522421  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||| ||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  37522420 tttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgtcttcaacatattatttattattgatcgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgaa 37522323  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37522322 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 37522271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Original strand, 18706430 - 18706633
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||| | ||||   | | |||||||||||||||     
T  18706430 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttataattattattatatttacaattttatcctttaagagagaga--tcgtttatgttttcaacatg 18706527  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  18706528 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaaa 18706627  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  18706628 agggac 18706633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 26866647 - 26866894
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | | |||  ||| | |||||||||| | |    
T  26866647 gaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagatagttagtttatgttttccata 26866746  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    | |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26866747 tgctatttattgctgatacaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataa 26866846  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26866847 aaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 26866894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 30745585 - 30745790
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||||||||| |    
T  30745585 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcatt-ttgtttttacaattttatcctttaagaaataatgttagtttatgttttcaacct 30745683  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  30745684 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaa 30745783  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  30745784 aagggac 30745790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 54624051 - 54623807
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||   ||| ||||||||||||||||    
T  54624051 aattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagaaaga--tggtttatgttttcaacatt 54623954  T
Q  247 ct-atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     | |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || |||||| ||  | ||||||||||    
T  54623953 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtaggtggaaatagcaagtgagtcttataaa 54623854  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54623853 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 54623807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6083535 - 6083290
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  6083535 gaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatc-tttaagagagagagttagtttatgttttccatat 6083437  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6083436 gctatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagagctatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaa 6083337  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6083336 aaggaacaaaaaatattctcaaaaaggtcttataattaaggacggag 6083290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 34948438 - 34948681
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |||  ||||||||||   ||    
T  34948438 gaattaagaaaatgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaattttatcttttaagagagag--ttgatttatgttttccgtat 34948535  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  34948536 gctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaagtgatcttataaa 34948635  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  34948636 aagggacaaaaaatattctcaaaatggtcttataattaggaacgga 34948681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18004199 - 18003949
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||   ||  |||||||||    
T  18004199 taacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatcttttaagagagaga--tgttttatgtttt 18004102  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||    
T  18004101 caacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaaggtagttgaaaataacaaaaggatct 18004002  T
Q  340 tataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||        |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  18004001 tataaaaagggacaacaaaaattctcaaaaaagtgttataattagggacggag 18003949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 19281876 - 19282109
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  19281876 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 19281975  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||         ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  19281976 gttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaat---------tatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 19282065  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19282066 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacg 19282109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 38899830 - 38900072
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  38899830 gaattaagatattggatatttgtattaaatatatttgtaattaatgttgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 38899927  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||    
T  38899928 gttatttattgttgattgaagaaaaagatatataattaataggggcatgtatataaaggaataattaatgtagttggaaatagcaaagtgatcttataaa 38900027  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  38900028 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagagacgga 38900072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 147 - 349
Target Start/End: Original strand, 4094759 - 4094960
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||||| | ||     
T  4094759 aattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagggttagtttatgttttccatatg 4094857  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  ||||||||||||    
T  4094858 ctatttattgttgattgaagagaaagatgtataataaatagagatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaatggtcttataaaa 4094957  T
Q  347 agg 349  Q
    |||    
T  4094958 agg 4094960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 34963634 - 34963393
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| | |||||||||||| ||    
T  34963634 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgcaattattattggttttacaattttatcctttaagagagagagtt-gtttatgttttcaatat 34963536  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||  | |||||||||    
T  34963535 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatgatcttataaa 34963437  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    ||  |||       |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  34963436 aaacgacaaatttttttctcaaaatgttcttataattagggacg 34963393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 15500397 - 15500598
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||||||    
T  15500397 gaattaagatactagatattcatattaaatatgtttataattactattatttttacaattttatcctttatgagagaggggtggtttatgttttcaacat 15500496  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  15500497 gttatttattactaattgaagaaaaagatgtataataaatcggagcatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttataaa 15500596  T
Q  346 aa 347  Q
    ||    
T  15500597 aa 15500598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 179 - 313
Target Start/End: Original strand, 38405643 - 38405777
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat 278  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38405643 tttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttcaacatgttatttattactgattgaagaaaaagatgtat 38405742  T
Q  279 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38405743 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 38405777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 192 - 387
Target Start/End: Original strand, 48149017 - 48149212
Alignment:
Q  192 ttgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc 291  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  48149017 ttgtttttataattttatcctctaaaatagagagttgatttatgctctcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataatatatagaggc 48149116  T
Q  292 atgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||       ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48149117 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaagggtcttataaaaagagacaaaaaaatttctcaaaagagtcttataattaggga 48149212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 110 - 284
Target Start/End: Original strand, 46480769 - 46480943
Alignment:
Q  110 gtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||       ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46480769 gtccctaattataaaaccattttaaaaaaataacatgaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 46480868  T
Q  210 cctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaa 284  Q
    ||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||    
T  46480869 cctttaagagagatggttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattggagaaaaaaatatataataaa 46480943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25475066 - 25474862
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | |   || | |||||||||||||||    
T  25475066 gaattaagatagtggatatttactttaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagagataa--ttagtttatgttttcaacat 25474969  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | ||||||||||    
T  25474968 gttatttattgttgattgaagaaaaagacgtataataaataggattatgtatgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataacaaaagagtcttataaa 25474869  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  25474868 aagggac 25474862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Original strand, 39184037 - 39184240
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||||||||||||||     
T  39184037 aattaaaaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagatagagaattagtttatgttttcaacata 39184136  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     |||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||  |||||||||| ||    
T  39184137 atatttactgtcgattgaagaaaaatatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaatagttaatgtagttggaaatagcaa--gggtcttatacaa 39184234  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  39184235 agggac 39184240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 231 - 352
Target Start/End: Original strand, 49490037 - 49490158
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  49490037 ttatgttttcaacatgttatttattgctgattgtagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagga 49490136  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  49490137 aaggggtcttataaaaagggac 49490158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 13498293 - 13498517
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  13498293 gtattaaatttgtatataattactattgtatttacaattttatcctt-aaaaaagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 13498391  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | |||||||||||||||||       |||||||    
T  13498392 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaagggacaaacttttttctca 13498491  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||   ||||||||||||||||||||    
T  13498492 aaaacatcttataattagggacggag 13498517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 147 - 391
Target Start/End: Original strand, 17678305 - 17678549
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||   |||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | |||    
T  17678305 aattaagaaagtggatatttatattaatgttgtttgaaatcactattatttttacaattttatcctt-aagagagagtgttagtttatgttttccatatt 17678403  T
Q  247 ctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||   ||||||||||    
T  17678404 atatttattgctgattgaaggaaaaagatgtataataaatagggacatatatataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaataagtcttataaa 17678503  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||       |||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  17678504 aagggacaaaaaaatttctcaataggatcttataattatggacgga 17678549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 239 - 392
Target Start/End: Original strand, 42528469 - 42528624
Alignment:
Q  239 tcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtc 338  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||    
T  42528469 tcaacatactatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataattaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtc 42528568  T
Q  339 ttataaaaagggacnnnnnnnttt--ctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||       |||  |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42528569 ttataaaaagggacaatttttttttcctcaaaagggtcttataactagggacggag 42528624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Original strand, 33501667 - 33501842
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||||||||       | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  33501667 atactccctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcacaggaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 33501766  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagat 274  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33501767 tacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagat 33501842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 100 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 23623933 - 23623753
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23623933 tactacctccgtccctaattatatgactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattg-tttt 23623835  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 281  Q
    ||||||||||||||||| |||||   |||| |||| |||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  23623834 acaattttatcctttaagaaagataattggtttatatttttaacatgttatttattgctgattgaataaaaatatgtataat 23623753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 392
Target Start/End: Original strand, 468413 - 468536
Alignment:
Q  269 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaa 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||    
T  468413 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttttaaaaagggacaaaaaaatttctcaaa 468512  T
Q  369 agggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  468513 agggtcttataattaggaacggag 468536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 169 - 392
Target Start/End: Original strand, 28501196 - 28501417
Alignment:
Q  169 attaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaa 268  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  28501196 attaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagcgagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaa 28501294  T
Q  269 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaa 368  Q
    ||||||| | |||||||| ||  || |  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||       |||||||||    
T  28501295 aaagatgcaaaataaataaggt-atcttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaa 28501393  T
Q  369 agggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28501394 agggtcttataattagggacggag 28501417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Original strand, 30868605 - 30868831
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||    
T  30868605 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa 30868704  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttct 364  Q
     ||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||        |||||    
T  30868705 aaaaaagatgcaaaataaataagggtacgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttttct 30868804  T
Q  365 caaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  30868805 caaaagggtcttataattagggacgga 30868831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 97 - 216
Target Start/End: Original strand, 5734384 - 5734503
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5734384 ttatactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 5734483  T
Q  197 tttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5734484 tttacaattttatcctttaa 5734503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 52966342 - 52966166
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagg--gttggcttatgttttcaacattc 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||  ||| | |||||||||  | ||      
T  52966342 taagaaagtggatatttgtattaaagttatttgtaatccctattatttttacaattttatcctt---aaaagaggaagttagtttatgttttacatatga 52966246  T
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  52966245 tatttattgctaattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 52966166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28495615 - 28495430
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||  || | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  28495615 gtattaaatttgtttgtaattactattgcttttacaattttatcctttaagagagagatttagtttatattttcaacataatatttattgttgattgaat 28495516  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| | | ||| |||||  | | || ||||||||||||||||    
T  28495515 aaaaagatgtaaaataaataggggtatgttggtaaataaataattaatgaacttggaaataccagatggatcttataaaaagggac 28495430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13549209 - 13548986
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||    
T  13549209 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaag 13549111  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  13549110 aaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 13549012  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  13549011 aaagagtcttataattagggacggag 13548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Original strand, 49489880 - 49489996
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49489880 tactacctccgtccctaattataggacacttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 49489979  T
Q  200 acaattttatcctttaa 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  49489980 acaattttatcctttaa 49489996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18872947 - 18872723
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   ||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  18872947 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 18872849  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||  | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||  || |||||  |||||| ||||||||||||||||       ||| |||    
T  18872848 aaaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacctggaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttca 18872749  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  18872748 aaagggtcttataattagggacggag 18872723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 26889708 - 26889930
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||   || || | |||   ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||    
T  26889708 gtattaaatttatatgtaattactattgtttttacaattttatcctt---aagagggagttaatttatgtttttaacataatatttattgttgattgaag 26889804  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | |||||||||||    ||       ||| |||    
T  26889805 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgtttgtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgtgtcttataaaactaaacaattttttttttca 26889904  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  26889905 aaaggatcttataattagggacggag 26889930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 20180703 - 20180883
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| | |||| |||||| |||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | ||||| |||  ||||    
T  20180703 gaattaaaaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagattatgcttttcacat 20180801  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     ||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||    
T  20180802 actatttattgctgatcgaagaaaaaaaattataataaatagtggtatgtatgaaaagaaataattaatgtaattaaaaata 20180883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Original strand, 6656552 - 6656733
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||| | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6656552 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatc--ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 6656649  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    ||||||||| | |||||||| || ||| |   ||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  6656650 aaaaagatgcaaaataaataaggacatattgataaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaggg 6656733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 171 - 392
Target Start/End: Original strand, 8418156 - 8418377
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||   ||| | |||| |||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  8418156 taaatctgttagtaattagtattgtttttacaattctatcctttaagagagtaagttagtttatattttcaacatactatttaatgttgattgaagaaaa 8418255  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaag 370  Q
    | || || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||| || |||||||||||| ||        ||||||||||     
T  8418256 aaatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttgaaaataccaaatggatcttataaaaagagatataaatttttctcaaaaa 8418355  T
Q  371 ggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||||||||||||| ||||    
T  8418356 ggttttataattagggagggag 8418377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 249 - 352
Target Start/End: Original strand, 36040849 - 36040953
Alignment:
Q  249 atttattgctgattgaagaaaa-agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  36040849 atttattgctgattcaagaaaaaagatgtataataaataggggtatatatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggaatcttataaaaa 36040948  T
Q  348 gggac 352  Q
    |||||    
T  36040949 gggac 36040953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Original strand, 53564179 - 53564387
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||||||| ||| | ||||    
T  53564179 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaagaaaaatatgcaaaata 53564277  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||  ||| ||||| |||||||||| ||       |||||||||||||||||||||||    
T  53564278 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatctacttggaaatatcaaatgggtcatataaaaaggaacaatcttttttctcaaaagggtcttataatt 53564377  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  53564378 agggacggag 53564387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 6807598 - 6807499
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  6807598 gaattaaaatagtggatatttgtattaaaaatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 6807499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Original strand, 23390155 - 23390378
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||  ||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  23390155 gtattaaatttgtataaaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 23390253  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| |  ||||||||||||||       ||| |||    
T  23390254 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagatttataaaaagggacaaattattttttca 23390353  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||    
T  23390354 aaaaggtcttataattagagacgga 23390378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 39880035 - 39879919
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39880035 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatacttgtattaaatatgtttataattactattgttttt 39879936  T
Q  200 acaattttatcctttaa 216  Q
    |||||||||||||||||    
T  39879935 acaattttatcctttaa 39879919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55777145 - 55777075
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55777145 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaa 55777075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 55841325 - 55841255
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  55841325 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaa 55841255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Original strand, 6629284 - 6629503
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  6629284 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaaga 6629380  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| ||||    
T  6629381 aaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagcgtcttataaaaagggacaaattattttttcaa 6629479  T
Q  368 aagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||||||||||||||||||||    
T  6629480 aa-ggtcttataattagggacggag 6629503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 146 - 308
Target Start/End: Original strand, 3168221 - 3168380
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| ||||||| |||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||   |   |||||||||||||||    
T  3168221 gaattaagaaagttgatatttatattaaaattgttcgtaatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagagttat---ttatgttttcaacat 3168317  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 308  Q
     |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||| |||||    
T  3168318 actatttatcgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtacgtaggtaaataaata 3168380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 225 - 344
Target Start/End: Original strand, 5734542 - 5734661
Alignment:
Q  225 gttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaa 323  Q
    ||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| |    
T  5734542 gttggtttatattttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaaaaaaataattaatgtagttgga 5734641  T
Q  324 aatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    ||||| ||| |||||||||||    
T  5734642 aatagcaaa-gggtcttataa 5734661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13138956 - 13138777
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||  | | || ||||| |||| |||| |||||  ||||||| | | |||||||    
T  13138956 gtattaaatatgtttgtaattattattgttttttcaattatatcttttacgagatagagttggtttatatttt-aacataatatttatcgttaattgaag 13138858  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  13138857 aaaaatatgtaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaa 13138777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 327
Target Start/End: Original strand, 47109627 - 47109786
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  47109627 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 47109725  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  47109726 aaaaagatgcaaaataaataagggtaagttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaata 47109786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 352
Target Start/End: Original strand, 48801427 - 48801610
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||| | | || || ||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  48801427 tattaaatttgtatataattattatagtttttacaattttatccttaagagaa-agagttagtttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaga 48801525  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||| ||| ||| |||||||||  ||  |  ||||||||||||||||    
T  48801526 aaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataactaatgtaattgaaaatatcaattgtatcttataaaaagggac 48801610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #166
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17468102 - 17467937
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||  | ||||    
T  17468102 taattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttaattgaa-aaaaagattcaaaata 17468007  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  17468006 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagggatcttataaaaagggac 17467937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #167
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 161 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 31071932 - 31071749
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||| | | | |   || | || |||||||| |||  ||||||||| |||    
T  31071932 atatttgtattaaat-tgtttgtaatcactgttacttttataattttatcctttgagagataa--ttagtttttgttttcagcatgttatttattgttga 31071836  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| || |||||||||| ||||    
T  31071835 ttgaagaaaaagatgtataataaataaggatatgtatgtaaaaaaataattaatgtagctgaaaatagcaatggggtcttatgaaaa 31071749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #168
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20286249 - 20286096
Alignment:
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||  ||||| | |||| ||||  |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||    
T  20286249 ttacaattttatt-tttaagagagagagttgatttatgttttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatatat 20286151  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||   |||||||||||| ||||    
T  20286150 gtaatgaaataattaatgtagttggaaatagtaaataagtcttataaaaaaggac 20286096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #169
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 36211509 - 36211304
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||| | |||||||||||||||    
T  36211509 gaattaagaaagttgatatttgtattaaaattatttgaaatcactgttgtttttacaattttatcttttaagatcgagagttagtttatgttttcaacat 36211410  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||| |||| ||||| | |||||||||| |||| ||||| | | || || |||||||||||||||  ||||||| |||||| | | | ||||||||||    
T  36211409 attattcattgttgattaatgaaaaagatgaataaaaaatatgagtatttaggtaaagaaataattattgtagttggaaatagcata-gagtcttataaa 36211311  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  36211310 aagggac 36211304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #170
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 231 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 53906184 - 53906102
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  53906184 ttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaatagttaa 53906102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #171
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 231 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18879664 - 18879511
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| |    
T  18879664 ttatgttttcaacatgttatttattgatgatagaagaaagaaatgtataataaataagagtatgtaggtaaagaaataattaa--tagttggaaatagca 18879567  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||| |||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18879566 aaggggacttataaaaagggacaaaaaa--ttctcaaaaggatcttataattagggac 18879511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #172
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 29509035 - 29508851
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||  |||||||||    
T  29509035 gtattaaatttgtatatagttactattgtttttacaattttatcctt-aaaagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattattgattgaag 29508937  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||| | |||||||| |||  |||  ||||| |||||||||| ||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||    
T  29508936 aaaaagatgcaaaataaataagggtttgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaatatcaaaatggtcttataaaaagggac 29508851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #173
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 469 - 571
Target Start/End: Original strand, 53941022 - 53941126
Alignment:
Q  469 caaacgggggatagaaatccctattacagcagttgtgagcatgtgactaaattgaatcggacaagactcaaaa--ggtaatttgacccgttagagagcat 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||    
T  53941022 caaacgggggatagaaatccctattacatcagctgcgagcacgtgactaaattgagccggacaagactcaaaaattgtaatttcacccgttagagagcat 53941121  T
Q  567 ccaaa 571  Q
    |||||    
T  53941122 ccaaa 53941126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #174
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39797584 - 39797440
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| ||||||||||||||    
T  39797584 tatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaa 39797485  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||       ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39797484 gggacaaatgattttttcaaaaaggtcttataattagggacggag 39797440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #175
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 350
Target Start/End: Original strand, 41333857 - 41334039
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  41333857 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatc-tttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41333955  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||  || ||| ||||   |||||| || |||||||||||    
T  41333956 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatatacttggaaatgccaaagggatcctataaaaaggg 41334039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #176
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Original strand, 52181009 - 52181175
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |   ||| |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  52181009 taattactattgtttttacaattttatccttgaga---gagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaata 52181105  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  52181106 aataagggtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggac 52181175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #177
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 4143639 - 4143569
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4143639 gaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcctttaa 4143569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #178
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 23621578 - 23621472
Alignment:
Q  278 taataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtctta 377  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||    
T  23621578 taataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtctta 23621480  T
Q  378 taattagg 385  Q
    ||||||||    
T  23621479 taattagg 23621472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #179
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 32684825 - 32684648
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||  ||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  32684825 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagaaagag--ttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 32684729  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||  |||||||||||||    
T  32684728 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaccggtcttataaaaa 32684648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #180
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35909872 - 35909648
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| || ||||||    
T  35909872 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttggttgaag 35909774  T
Q  267 aaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    ||||| | |  | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| | | ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| ||    
T  35909773 aaaaaaaatacaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatggacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttc 35909674  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  35909673 aaaagggtcttataattggggacgga 35909648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #181
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 20783416 - 20783234
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |  ||||||    
T  20783416 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttttttgaag 20783320  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||| | ||||||||  || |||| ||||| |||||||||||  || |||||||||  ||| |  ||||||||||||||||    
T  20783319 aaaaagatgcaaaataaataatggtatgtttgtaatgaaataattaatatacttgaaaatacgaaatgaatcttataaaaagggac 20783234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #182
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 352
Target Start/End: Original strand, 11469142 - 11469227
Alignment:
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11469142 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 11469227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #183
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 267 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11522319 - 11522234
Alignment:
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  11522319 aaaaatatgtataataaataggggtatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaaaagggac 11522234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #184
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21265448 - 21265226
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-aaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || ||    |||||||||||  ||  ||||||||| |||||||||    
T  21265448 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaaaagagaaagagtaaatttatgttttcagtataatatttattgttgattgaag 21265349  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||| |||||  |||||||||||       ||| | |    
T  21265348 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaggtct--taaaaagggacaaattattttttta 21265252  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21265251 aaagggtcttataattagggacggag 21265226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #185
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 51787699 - 51787598
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||  |||||  ||||||||    
T  51787699 ttatgttttcaacatactatttatcgctgattgaagaaaaagatgcataataaatagaggaatgtaaataaaaaaataattaatatagttagaaatagaa 51787600  T
Q  331 aa 332  Q
    ||    
T  51787599 aa 51787598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #186
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Original strand, 27009626 - 27009698
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaa-tatgtttgtaatt-actattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009626 gaattaagatagtggatatttatattaaaatatgtttgtaatttactattgtttttacaattttatcctttaa 27009698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #187
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 392
Target Start/End: Original strand, 46481303 - 46481420
Alignment:
Q  276 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat-agaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtc 374  Q
    |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||    
T  46481303 tataataaataggggctttcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaggggtcttataaaaagggacaagaaaaattctcaaaaaggtc 46481402  T
Q  375 ttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  46481403 ttataattagggatggag 46481420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #188
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 10497593 - 10497451
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||| |  | |  |||||||| |||||  |||||| || |||||||||||||    
T  10497593 taaatttgtttataattactattatttttacaattttatcctttaagagagaagactagtgtatgtttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 10497494  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
     ||| || |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  10497493 ggatataaaataaataggggtatgttggtaaagaactaattaa 10497451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #189
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Original strand, 6595556 - 6595724
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||||||| | | |||     
T  6595556 taattattattgtttttataaatttatc-tttaagaaagagagttagtttatgttttcaacaatttatttatggttgatcgaagaaaaagaagcaaaatt 6595654  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| ||||   |||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||| |||| |||||||||||    
T  6595655 aataagggtatgttgataaagaaaaaattaatgtaattgaaaataacaaagggatcttctaaaaagggac 6595724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #190
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 51329521 - 51329757
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||       | |   ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  51329521 tactacctccgtccctatatataagaccattttgctaaaattatgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 51329620  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||| |||| | |||   || | |||| ||||  | ||  |||||||||||||||||||||||               ||| ||||||||||    
T  51329621 acaattttatcc-ttaagagagataattagtttatatttttcatatgttatttattgctgattgaagaaaa---------------aggcgcatgtatgt 51329704  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||| |||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  51329705 aaaaaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggac 51329757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #191
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 349
Target Start/End: Original strand, 26169770 - 26169941
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    ||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||| | |||||||||||||||  || |||||| || |||||||||| ||| |    
T  26169770 tgtttgttatcacaattatttttacagttttatcctttaaaaaaaagagttagtttatgttttcaacatgata-ttattgttgtttgaagaaaatgatat 26169868  T
Q  277 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |||||||||| ||  ||| | ||||| ||||||||||    |||| ||||||||||| |||  ||||||||||    
T  26169869 ataataaatatggttatgaaggtaaataaataattaattgtgttggaaatagaaaagaggttctataaaaagg 26169941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #192
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 274 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 38319729 - 38319612
Alignment:
Q  274 tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggt 373  Q
    |||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||       |||  |||||||||    
T  38319729 tgtacaataaataggactatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagctcttataaaaaaagacattttttttttccaaaagggt 38319630  T
Q  374 cttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||||||    
T  38319629 cttataattagggacgga 38319612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #193
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 248 - 392
Target Start/End: Original strand, 24073013 - 24073157
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||  |||||| |||||||||||    
T  24073013 tatttattattgattgaagaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatataattggaaataccaaagggatcttataaaaa 24073112  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||       | |||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24073113 gggacaattttttatctcaaaaaggtcttataattaaggacggag 24073157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #194
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 37780022 - 37780244
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  37780022 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 37780118  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    ||||| ||| | |||||||| | | ||||  || ||| |||||||||| ||| ||| ||| |  ||||  |||||||||||||| ||       ||| ||    
T  37780119 aaaaa-atgcaaaataaataagagtatgttggtaaaaaaaataattaatgtatttggaaacaccaaagaagtcttataaaaaggaacaaattattttttc 37780217  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37780218 aaaagggtcttataactagggacggag 37780244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #195
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 271
Target Start/End: Original strand, 42598519 - 42598621
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||| |||||| || ||| |||||| ||||||||     
T  42598519 gtattaaatttgtttgtagttactattgtttttacaattttatccttt--aagagagagttagtttatggtttcaatatgctacttattgttgattgaaa 42598616  T
Q  267 aaaaa 271  Q
    |||||    
T  42598617 aaaaa 42598621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #196
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 200
Target Start/End: Original strand, 48148710 - 48148763
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48148710 aattaatatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttta 48148763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #197
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 706766 - 706659
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||   || | ||||||||| ||||| |||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  706766 tgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaaaatatgt 706667  T
Q  277 ataataaa 284  Q
    ||||||||    
T  706666 ataataaa 706659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #198
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 284
Target Start/End: Original strand, 729851 - 729958
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||   || | ||||||||| ||||| |||||||||  | ||| |||||||| ||||    
T  729851 tgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagatagataattagtttatgtttttaacatgctatttattatttattaaagaaaaatatgt 729950  T
Q  277 ataataaa 284  Q
    ||||||||    
T  729951 ataataaa 729958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #199
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3085672 - 3085451
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    | |||| ||    ||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  3085672 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---gagagagagtaaatttatgtttttaatataatatttattgttgattgaag 3085576  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctc 365  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  ||| | |||||||||||| ||||        ||| ||    
T  3085575 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacactaaa-gagtcttataaaaatggacaaattatttttttc 3085478  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3085477 aaaaggatcttataattagggacggag 3085451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #200
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 167 - 387
Target Start/End: Original strand, 30010659 - 30010876
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| || | | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  30010659 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttgagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 30010757  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||  ||||  ||||||||||||||||  || ||  |||||  |||  ||||||||||||||| ||       ||| ||     
T  30010758 aaaaa-atgcaaaataaataaggatatgttggtaaagaaataattaatatacttagaaataccaaa-aggtcttataaaaaggaacaaattattttttcg 30010855  T
Q  367 aaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  30010856 aaagggtcttataattaggga 30010876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #201
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 231 - 388
Target Start/End: Original strand, 25924502 - 25924659
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||| ||| || |  ||| || ||||||||| ||||| ||||||  ||    
T  25924502 ttatgttctcaacatcatatttattgttgattgtagaaaaaggcgtaaaataaatatgggtatattggtataggaataattaatgtagtggaaaattcaa 25924601  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    | ||| ||||||||||||||||       |||||||| | ||||||||| ||||||||    
T  25924602 aggggatcttataaaaagggacaaagaattttctcaagaaggtcttatatttagggac 25924659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #202
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 248 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 38613557 - 38613420
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | ||||||||||||    
T  38613557 tatttactgatgattgaagaaaaatatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaatgagtcttataaaaa 38613458  T
Q  348 gggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
     | ||        |||||||||||||||||||||||||    
T  38613457 tgaacaatttttttttctcaaaagggtcttataattag 38613420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #203
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 286
Target Start/End: Original strand, 19596248 - 19596366
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||||||| |||||||||||||||||| || | |||  |||   | |||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19596248 gtattaaatttgtatataactactattgcttttacaattttatcctt-aagagagatagttaattcatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 19596346  T
Q  267 aaaaagatgtataataaata 286  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  19596347 aaaaagatgcaaaataaata 19596366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #204
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 214
Target Start/End: Original strand, 54158710 - 54158757
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  54158710 gtattaaatttgtttgtaattactattatttttacaattttatccttt 54158757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #205
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 310
Target Start/End: Original strand, 49613987 - 49614108
Alignment:
Q  187 tactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||| |||||||  |  |||||| || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  49613987 tactattgtttttacaattttatccttgaagagagag--ttattttatattttcaatgtagtatttaatgttgagtgaagaaaaagatgtagaataaata 49614084  T
Q  287 ggggcatgtatgtaaagaaataat 310  Q
    |||| ||||  |||||||| ||||    
T  49614085 ggggtatgttggtaaagaattaat 49614108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #206
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 50649140 - 50649096
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggtt 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50649140 taattgctattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggtt 50649096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #207
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 260 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 7205284 - 7205194
Alignment:
Q  260 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||| ||||||| |||||  ||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||| |||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  7205284 attgtagaaaaatatgtaatataaataggggtatattggtaaagaaataattaatgtacttgaaatttg-aaaggggtcttataaaaaggga 7205194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #208
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 288
Target Start/End: Original strand, 26186516 - 26186627
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    |||||||||| || ||| |||||||| ||||||| ||||| ||| || ||  | ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||  || |    
T  26186516 tgtttgtaatcacaattatttttacagttttatcatttaagaaaaagagtaagtttatgttttcaacaagatatttattgttgatcgaagaaaataatat 26186615  T
Q  277 ataataaatagg 288  Q
    ||||||||||||    
T  26186616 ataataaatagg 26186627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #209
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Original strand, 7776751 - 7776797
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7776751 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt 7776797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #210
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 233 - 326
Target Start/End: Original strand, 7326036 - 7326133
Alignment:
Q  233 atgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaga----tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat 326  Q
    ||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| |    ||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  7326036 atgttatcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaaaatatgtataataaataaggatatgtaggtaaagaaatcattaatgtagttggaaat 7326133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #211
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 2738879 - 2738832
Alignment:
Q  305 aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  2738879 aataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtattataaaaagggac 2738832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #212
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Original strand, 4415962 - 4415997
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4415962 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 4415997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #213
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30771565 - 30771534
Alignment:
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30771565 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 30771534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #214
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Original strand, 46949989 - 46950024
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46949989 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 46950024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #215
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 256
Target Start/End: Original strand, 5840103 - 5840188
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattg 256  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| | ||||||||| |||||  |||||||||    
T  5840103 tattaaatttgtttataattattattatttttacaattttatcctt---aagagagagttagtttatgtttttaacatgatatttattg 5840188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #216
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 18872715 - 18872749
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18872715 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 18872749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #217
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20455220 - 20455186
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20455220 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 20455186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #218
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 21265218 - 21265252
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21265218 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 21265252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #219
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 177 - 283
Target Start/End: Original strand, 22130324 - 22130429
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| || || | ||||| ||    ||||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |    
T  22130324 tgtttgtaattataattgtttt-acaattttatctttgaagagagaggattattgtatgttttcaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagatat 22130422  T
Q  277 ataataa 283  Q
    | |||||    
T  22130423 aaaataa 22130429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #220
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Original strand, 24072289 - 24072335
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24072289 gtattaaatttgtatataattactatggtttttacaattttatcctt 24072335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #221
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 32899257 - 32899223
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32899257 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 32899223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #222
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 38616058 - 38616016
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 210  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38616058 tattaaatttgtttataattactattatttttacaattttatc 38616016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #223
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 39797432 - 39797466
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39797432 tatactacctccgtccctaattataagaccttttt 39797466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #224
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 245
Target Start/End: Original strand, 50621563 - 50621624
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||   ||||||||| |||||    
T  50621563 taattattattgtttttacaattttatcc-ttaaaaaagagagttaatttatgttttgaacat 50621624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #225
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 55967998 - 55967944
Alignment:
Q  273 atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55967998 atgtataataaatagatacgtgtatataaagaaataattaatgtagttgaaaata 55967944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #226
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55969053 - 55969007
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  55969053 gtattaaagttgtttgtaatcactattggttttacaattttatcctt 55969007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #227
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 267 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15496262 - 15496177
Alignment:
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| |  | |||||||||| |||||| | | |||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  15496262 aaaaacatgtagagtaaataggggtaattttgtaaagaaaaaattaatgcacttgaaaatatcaaaagggtcttataaaaagggac 15496177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #228
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 28501424 - 28501391
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28501424 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 28501391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #229
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41334091 - 41334058
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41334091 atactacctccgttcctaattataagaccatttt 41334058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #230
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 49793090 - 49793123
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49793090 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 49793123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #231
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Original strand, 50622480 - 50622545
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||  || || |  ||||||||||||||||    
T  50622480 tatttattgttgattgaagaaaaggatgtaaaataaataatggtatcttggtaaagaaataattaa 50622545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #232
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 52181224 - 52181191
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52181224 atactacctccgtccataattataagaccatttt 52181191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #233
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 56432517 - 56432550
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56432517 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 56432550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 182)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 469 - 732
Target Start/End: Complemental strand, 8783950 - 8783692
Alignment:
Q  469 caaacgggggatagaaatccctattacagcagttgtgagcatgtgactaaattgaatcggacaagactcaaaa--ggtaatttgacccgttagagagcat 566  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  8783950 caaacgggggatataaatccctattacatcagctgtgagtacgtgactaaattgaaccggacaagactcaaaaaaggtaatttgacccgttagagagcat 8783851  T
Q  567 ccaaaatttgctagagcatctgcacactggttagcttccctataagaatgcttcaccacaatctcccaatccagattaattaacctctcaatctcaaaaa 666  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8783850 ccaaaatttgctagagcatctgcacactggttagcttccctataagaatgcttcaccacaatctcccaatccagattaattaacctctgaatctcaaaaa 8783751  T
Q  667 ccaacgacctcccgctcgggctaccatgcccatttccattaatacaattagcaactactaaagaat 732  Q
    ||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8783750 ccaa-------ccgctcgggctaccatgcccatttccattaatacaattagcaactactaaagaat 8783692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 11865026 - 11865320
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11865026 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 11865125  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11865126 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggagcatgtatg 11865225  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||         |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11865226 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 11865320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 45628618 - 45628910
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45628618 tatactacctccgtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 45628717  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45628718 ttacaattttaccctttaaaaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 45628817  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  45628818 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgaatcttataaaaagggacaaaaaa--ttctcaaaagggtcttataattaaggatggag 45628910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 103 - 392
Target Start/End: Original strand, 26322035 - 26322324
Alignment:
Q  103 tacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 202  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26322035 tacctccgtccttaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttaca 26322134  T
Q  203 attttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26322135 attttatcctttaagaaagagggctggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggtgcatgtatgtaaa 26322234  T
Q  303 gaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26322235 gaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 26322324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 1142997 - 1143289
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1142997 tactacctccgtccctaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 1143096  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1143097 acaattttatcctttaagaaagatggttggtttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 1143196  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  1143197 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaaagagtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaaggatcttataactagagacggag 1143289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24345715 - 24345423
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24345715 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaataactattgttttt 24345616  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | || |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24345615 acaattttatcctttaagaaagagagctgacttatgctttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 24345516  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24345515 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcgaaagggtcttataattagggacggag 24345423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19353491 - 19353197
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||       |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19353491 tatactacctccgtccctaattataaggcctctttaaaaaaataaagggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttt 19353392  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19353391 ttacaattttatcctttaagaatgagtgttgacttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 19353292  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19353291 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagcgacggag 19353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 97 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 7418795 - 7418503
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  || ||||       |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7418795 ttatactacctcagtccctaattataaagcccttttgaaaaaataacagaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 7418696  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7418695 tttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaatgatgtataataaataggggcatgta 7418596  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata-aaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| || |||||||||        ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7418595 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggtcttttataaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtctcataattagggacg 7418503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24974052 - 24973804
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24974052 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacat 24973953  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24973952 tctatttattgctgatagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaa 24973853  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtct--tataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||||| |||||| |||  |||||||||||||||||    
T  24973852 aagggacaaaaaaatttcttaaaaggatcttatataattagggacggag 24973804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 12889949 - 12890239
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12889949 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 12890048  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890049 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 12890146  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12890147 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 12890239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 149 - 392
Target Start/End: Original strand, 38121299 - 38121542
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38121299 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattct 38121398  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  38121399 atttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggtaatagaaaatgagtcttataaaaag 38121498  T
Q  349 ggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||        |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  38121499 ggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttattattagggacggag 38121542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40608000 - 40607708
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||| ||| |||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40608000 tacttcctctgtctctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40607901  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| | ||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40607900 acaattttatcctttaagagagagaggtggtttatgttttaaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 40607801  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40607800 aaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 40607708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 147 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 5255784 - 5255583
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5255784 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacatt 5255685  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5255684 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataa-taatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaa 5255586  T
Q  347 agg 349  Q
    |||    
T  5255585 agg 5255583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 10399247 - 10399493
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10399247 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacttttatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacat 10399346  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  10399347 tctatttattactcattgaagaaaaagatgtatagtaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaa 10399446  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    | |||||        ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10399447 acgggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggatggag 10399493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 174; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 153 - 392
Target Start/End: Original strand, 18374495 - 18374735
Alignment:
Q  153 gatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctattt 252  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18374495 gatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt-atcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattt 18374593  T
Q  253 attgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18374594 attgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggagtcttataaaaagggac 18374693  T
Q  353 --nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
             ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18374694 aaaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 18374735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31751370 - 31751075
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31751370 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 31751271  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg---aagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31751270 acaattttatcctttaagaaagaggattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgca 31751171  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31751170 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttcacaaaagggtcttataattagggacggag 31751075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 34883633 - 34883879
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34883633 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 34883732  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  34883733 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 34883832  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34883833 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 34883879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 40788828 - 40789119
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40788828 atactacttccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttatattaaatatgtttataattactattgtttt 40788927  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40788928 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 40789025  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40789026 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagagtcttataattagggacggag 40789119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32121196 - 32120950
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  32121196 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacat 32121097  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32121096 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 32120997  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32120996 aagggacaaatttttttttcaaaaggatcttataattagggacggag 32120950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 7e-85
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 8912615 - 8912905
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8912615 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 8912714  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8912715 acagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 8912812  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8912813 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 8912905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 3060406 - 3060652
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3060406 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 3060505  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    |||||||||    
T  3060506 tctatttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaacagaaaaaaaatcttataaa 3060605  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  3060606 aagggacaaaaaaaattctctaaagggtcttataattaagaacggag 3060652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 36130813 - 36131059
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  36130813 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 36130912  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  36130913 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaaaggtcttataaa 36131012  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36131013 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 36131059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2200277 - 2199984
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2200277 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattttt 2200178  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  2200177 acaattttatcatttaagagagagtgttggtttctgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtacagtaaatagggtcatgtatgt 2200078  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc-aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||        ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2200077 aaataaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagagacaaaaaaaattcacaaaaagggtcttataattagggacggag 2199984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 96 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23789270 - 23788975
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 195  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  23789270 attatactccctccgtccctaattataagactattttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgt 23789171  T
Q  196 ttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23789170 ttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 23789072  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23789071 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaaggacggag 23788975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 8716677 - 8716923
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  8716677 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaacat 8716776  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  8716777 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 8716876  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8716877 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 8716923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 13197430 - 13197676
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  13197430 gaattaagatagtggatatttgtattaaacttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 13197529  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  13197530 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 13197629  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  13197630 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggag 13197676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 15404493 - 15404738
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  15404493 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 15404592  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15404593 t-tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 15404691  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15404692 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttacaattaaggacggag 15404738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20252462 - 20252216
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20252462 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 20252363  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  20252362 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaa 20252263  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20252262 aagtgacaaaagaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 20252216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 34062450 - 34062696
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34062450 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 34062549  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  34062550 gttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 34062649  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34062650 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 34062696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41450768 - 41450522
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  41450768 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 41450669  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  41450668 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 41450569  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41450568 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 41450522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 145 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1943827 - 1943586
Alignment:
Q  145 tgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  1943827 tgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagatggttagtttatgttttcaaca 1943728  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  1943727 tgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataa 1943628  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggg 386  Q
    |||| |||        ||||||||||||||||||||||||||    
T  1943627 aaagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggg 1943586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 20727643 - 20727888
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  20727643 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 20727742  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  20727743 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 20727842  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20727843 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacgga 20727888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37229692 - 37229447
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  37229692 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 37229593  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  37229592 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 37229493  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37229492 aagggacaaaagaaattctcaaaatggtcttataattagggacgga 37229447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 40680979 - 40680734
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  40680979 gaattaagatggtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 40680880  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40680879 gttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatatagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 40680780  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40680779 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 40680734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23465431 - 23465142
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23465431 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23465332  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||   |||| | || ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23465331 acaattttatcctttaagagagaa--ttggttaatattttcaacatgatatttattgatgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 23465234  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||       ||| |||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23465233 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaatttttttt-tcaaaagggttttataatttgggacggag 23465142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Original strand, 15227887 - 15228180
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227887 ttatactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 15227986  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||  | | |||   |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |    
T  15227987 tttacaattttatccttcgagagagaa--ttggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgca 15228084  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15228085 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 15228180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28840935 - 28840646
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||||||||       ||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840935 tactacatccgtctcttattataggaccattttaaaaaaataacgggaattaagat-gtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28840837  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28840836 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgt 28840737  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28840736 aaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacgga 28840646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 183 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 43701185 - 43701021
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43701185 taattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 43701086  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43701085 aataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaa 43701021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2060614 - 2060322
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2060614 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 2060515  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||    
T  2060514 acaattttatcctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagat-tataataaatatgggaatgtatgt 2060416  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | || ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2060415 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtattataaaaagggacaaattttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 2060322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25624981 - 25624739
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||| | |||||||||||||||    
T  25624981 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaag---gttagtttatgttttcaacat 25624885  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  25624884 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 25624785  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25624784 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 25624739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 19318840 - 19319046
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||| ||||||||||    
T  19318840 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatattttcaacat 19318939  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  19318940 gttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacgtgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaa 19319039  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  19319040 aagggac 19319046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5664890 - 5664644
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| | ||||||||| |||||    
T  5664890 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgtttttaacat 5664791  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  5664790 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaatgaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 5664691  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5664690 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 5664644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 34113823 - 34113538
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34113823 tactccctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaatt----tagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34113728  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | | |   |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  34113727 acaattttatcctttaagagataa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgt 34113630  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34113629 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 34113538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25523751 - 25523506
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  25523751 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatttaatcctttaaga--gagggttggtttatgttttcaacat 25523654  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  25523653 gttatttattggtgattgaagaaaaaaatgtataataaattggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaatgggtcttataaa 25523554  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||       |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  25523553 aagagacaattttttttcttcaaaatggtcttataattaggaacggag 25523506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 2438522 - 2438231
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  2438522 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgttttt 2438423  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2438422 acaattttatcctt-aagatagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 2438324  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2438323 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 2438231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8990456 - 8990210
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8990456 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8990357  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||| |||||||    
T  8990356 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggttttataaa 8990257  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  8990256 aagggacaaaaaaaattctcaaaaagatcttataattagggacggag 8990210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16669878 - 16669632
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  16669878 gaattaagatagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 16669779  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  16669778 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatgggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggtcttataaa 16669679  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  16669678 aagggacaaaaataattctcaaaagggtcttataattaagaacggag 16669632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 41967989 - 41968233
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  41967989 gaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 41968088  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| | ||||  | |||||||    
T  41968089 gttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaata-acaaggaattttataaa 41968187  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41968188 aaaggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagggacggag 41968233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 45474615 - 45474369
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||       | || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  45474615 tatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 45474516  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45474515 ttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 45474416  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||    
T  45474415 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataa 45474369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 7531853 - 7531617
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||  ||||||||| |||||    
T  7531853 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagat--ttgttttatgtttttaacat 7531756  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  7531755 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaatgaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaggtcttataaa 7531656  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    ||||||        ||||| |||||||||||||||||||    
T  7531655 aagggataaaaaaatttcttaaaagggtcttataattag 7531617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 16805531 - 16805822
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16805531 tacttcctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16805630  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805631 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 16805729  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16805730 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 16805822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 18375444 - 18375238
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |  ||  |||||||||||||||    
T  18375444 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgagtgatttatgttttcaacat 18375345  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  18375344 gttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttgtaaatagcaaatgagtcttataaa 18375245  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  18375244 aagggac 18375238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22897688 - 22897397
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  22897688 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 22897589  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||| |||||||| || |||||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22897588 acaatattatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgt 22897490  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22897489 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggttttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 22897397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 96 - 388
Target Start/End: Original strand, 39833735 - 39834026
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 195  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  39833735 attatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgt 39833834  T
Q  196 ttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    |||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39833835 ttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgt 39833933  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39833934 atgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggac 39834026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1360091 - 1359797
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1360091 ttatactccctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 1359992  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1359991 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 1359893  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  1359892 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctccaaaggatcttataattagggacggag 1359797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Original strand, 16108212 - 16108506
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  16108212 ttatactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 16108311  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||| ||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16108312 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgta 16108410  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16108411 tgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggag 16108506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 22182663 - 22182914
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22182663 atacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 22182762  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||  |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22182763 tacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatgttatttagtgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 22182860  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22182861 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 22182914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 105 - 397
Target Start/End: Original strand, 16456617 - 16456908
Alignment:
Q  105 cctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16456617 cctccgtccctaattataagacccttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaat 16456716  T
Q  205 tttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 304  Q
    ||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16456717 tttatcctt-aagacagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 16456815  T
Q  305 aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagtaata 397  Q
    ||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16456816 aataattaatgtagttggaaatgacaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggaataata 16456908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 16844813 - 16845103
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||  ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  16844813 tacttcctccgtccctaattataagactcttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 16844912  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16844913 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 16845011  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16845012 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagggacggag 16845103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4711978 - 4711734
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4711978 gaattaagatactggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-tttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 4711880  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  4711879 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggccttataaa 4711780  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4711779 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttttaattagggacggag 4711734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7666529 - 7666291
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||  ||||||||||||||     
T  7666529 aattaagataatgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagtgaaggttggtatatgttttcaacatg 7666430  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||    
T  7666429 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgcgtcttataaaa 7666330  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagg 385  Q
    ||||||        |||||||||| ||||||||||||||    
T  7666329 agggacacaaaaaattctcaaaagagtcttataattagg 7666291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41004241 - 41003949
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  41004241 tatactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgttt 41004142  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||| ||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||    
T  41004141 ttataattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattaatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatccat 41004044  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  41004043 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggaacggag 41003949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 352
Target Start/End: Original strand, 1748380 - 1748633
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  | ||||       ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  1748380 atactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagattatggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattatttt 1748479  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||| ||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  1748480 tacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggtatgtatg 1748579  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  1748580 taaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagaggtcttataaaaagggac 1748633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 164 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8782700 - 8782472
Alignment:
Q  164 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg 263  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  8782700 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattg 8782601  T
Q  264 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc 363  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||   |||||||||||||| ||        |||    
T  8782600 aagaaaaagatgtataataaatatgttcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaatagtcttataaaaaggaacaaaaaaaattc 8782501  T
Q  364 tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8782500 tcaaaaggttcttataattagagacggag 8782472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 8841396 - 8841688
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  8841396 atactccctccgtccctaattataagactcttttactaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 8841495  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8841496 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgtatg 8841594  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8841595 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 8841688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 107 - 392
Target Start/End: Original strand, 17408041 - 17408325
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17408041 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattt 17408140  T
Q  207 tatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    ||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17408141 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatactacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaa 17408239  T
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17408240 taattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 17408325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 19034708 - 19034465
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  19034708 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt---ttt 19034612  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||| |||||||| | |||| ||||  |||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19034611 acaattttgtcctttaagagagagtgttgatttatcttttcaacatgttatttattgttgaatgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 19034512  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  19034511 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaa 19034465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 38214730 - 38214526
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||    ||  |||||||||||||||    
T  38214730 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacat 38214633  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  38214632 gttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaa 38214533  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  38214532 aagggac 38214526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7492141 - 7491850
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  7492141 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacaggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 7492042  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| | | || || ||| | |||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7492041 acaattttatccttaagagaa-agagttagtttatgttttccatatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 7491943  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7491942 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 7491850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 11851973 - 11852216
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  11851973 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 11852070  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  11852071 gttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataattaataggggcatgcatgtaaataaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaa 11852170  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11852171 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaaggatcttataattagggacggag 11852216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17665774 - 17665529
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||   ||   ||||||||||||||    
T  17665774 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgtttttacaattttatcttttaagagagaga--tgatatatgttttcaacat 17665677  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  17665676 gttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaa 17665577  T
Q  346 aaggga-cnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||          ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17665576 aagggataaaagaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 17665529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 147 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 5070557 - 5070318
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| | ||| |||||| |||||||||||||||     
T  5070557 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttttataattttattctttaagagagatggttggtttatgttttcaacat- 5070459  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||  ||| |||| ||||||||    
T  5070458 -tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatataggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttg-gaataacaaaagggttttataaaa 5070361  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    ||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5070360 agggacaaaaaaaattcccaaaagggtcttataattagggacg 5070318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 151 - 352
Target Start/End: Original strand, 15435667 - 15435867
Alignment:
Q  151 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctat 250  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  | |    
T  15435667 aagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattatatcatttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgtttt 15435766  T
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  15435767 ttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaaaaggg 15435865  T
Q  351 ac 352  Q
    ||    
T  15435866 ac 15435867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 42629616 - 42629377
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        ||| | |||||||||||||||    
T  42629616 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaa--------gttagtttatgttttcaacat 42629525  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  42629524 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataatatataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 42629425  T
Q  346 aagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42629424 aagggacaaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 42629377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Original strand, 7116099 - 7116330
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctg 259  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||||    
T  7116099 gatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctg 7116197  T
Q  260 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnn 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||           
T  7116198 attcaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaaagggacaattttt 7116297  T
Q  360 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7116298 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 7116330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 7933672 - 7933505
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  7933672 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 7933573  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  7933572 attatttattgctgattgaagaaaaacatgtataataaatagaggcatgtatgtaaaacaataattaa 7933505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27560503 - 27560212
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||       | |   ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||    
T  27560503 tactccctccgttcctaattataagaccattttgttaaaatcatgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatgtaatcactattgttttt 27560404  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||   |||||||||  | ||  || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27560403 acaattttatcctt-aagaaagagagttaatttatgtttttcatatgttacttattgatgattgaagaaaaatatgtataataaataggagcatgtatgt 27560305  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560304 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaatttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 27560212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1859799 - 1859554
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||  |||| |||| ||||||||||    
T  1859799 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagaattggtttatattttcaacat 1859700  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  1859699 cttatttattgttgattgaagaaaaaaatgaataataaata-aggcatgtaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 1859601  T
Q  346 aagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||         ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1859600 aagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacgga 1859554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 140 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20643738 - 20643488
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| | ||||   ||  |||||||||    
T  20643738 taacaggaattaagatagcgaatatttgtattatatatgtttgtaattagtattctttttacaattttatcttttaagagagaga--tgttttatgtttt 20643641  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||    
T  20643640 caacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtct 20643541  T
Q  340 tataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||        |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  20643540 tataaaaagggacaacaaaaattctcaaaaaagtgttataattagggacggag 20643488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 313
Target Start/End: Original strand, 30779740 - 30779953
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||       ||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30779740 tactacctccgtccctaattataggatcattttgaaaaaataacgggaattaaaatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 30779839  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||| |||||| || || | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  30779840 acaaatttatctttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 30779939  T
Q  300 aaagaaataattaa 313  Q
    ||||||||||||||    
T  30779940 aaagaaataattaa 30779953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 351
Target Start/End: Original strand, 40680404 - 40680652
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       |||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40680404 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataatgggaattaaaatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 40680503  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  40680504 acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagaggcatgtatgt 40680601  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||||||||  || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  40680602 aaagaaataattaatataattggaaatagcaaa-gggtcttataaaaaggga 40680652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 9697927 - 9698169
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||| ||||  | ||    
T  9697927 gaattaagaaatcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatatttttcatat 9698025  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  9698026 actacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 9698125  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||        ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9698126 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttgtaattagggacg 9698169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 350
Target Start/End: Original strand, 13336542 - 13336744
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  |||| ||||||||| |||||    
T  13336542 gaattaatatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaaaagagag--ttggtttatgtttttaacat 13336639  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||  |||||||||    
T  13336640 gttatttattgttgattgaataaaatgatgtataataaataggggcatatatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggaatcttataaa 13336739  T
Q  346 aaggg 350  Q
    |||||    
T  13336740 aaggg 13336744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 36021035 - 36021235
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||||||| ||||    
T  36021035 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcgacat 36021134  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  36021135 gttatttattgttgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataataaaggagtcttataaa 36021233  T
Q  346 aa 347  Q
    ||    
T  36021234 aa 36021235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 160 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11201920 - 11201689
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctg 259  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||    
T  11201920 gatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagtgagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctg 11201822  T
Q  260 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnn 359  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||||| |            
T  11201821 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagtgtcttataaaaaggaaaaaaataa 11201722  T
Q  360 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11201721 attctcaaaagggtcttataattagggacggag 11201689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 147 - 383
Target Start/End: Original strand, 29239380 - 29239615
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| || ||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||     
T  29239380 aattaagaaagcggatatttgttataaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 29239478  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29239479 ctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaa 29239578  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||||||        || ||||||||||||||||||||    
T  29239579 agggacaaaaaaaattgtcaaaagggtcttataatta 29239615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 44573675 - 44573913
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  || || ||| ||||||||| |||||     
T  44573675 aattaagatactgaatatttgta---aatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga--gatggatggtttatgtttt-aacatg 44573768  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  44573769 ttatttattgttaattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaa 44573868  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44573869 agggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattaaggacggag 44573913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 11385909 - 11386159
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11385909 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 11386008  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||||||   ||||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| |||||    
T  11386009 acaattttatcctttaagtgagaga--tggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattaaagaaaaaaatatataattaatagggacatatatgt 11386106  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||   |||||||||||||||||    
T  11386107 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaattagtcttataaaaagggac 11386159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 34944158 - 34944443
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||||       ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34944158 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattaatattgttttt 34944257  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  ||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  34944258 acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcgt-----tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaatagggacatgtatgt 34944350  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| || |||  | ||||||||||||||||       ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  34944351 aaagaaataattaatgtagttggaaacagcaaaatgttcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaagggatcttataattagggacggag 34944443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 6007824 - 6007650
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||   ||| |||||||||||||||    
T  6007824 gaattaagataatatatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttcaagagagagaaatggtttatgttttcaacat 6007725  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagtt 320  Q
      |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6007724 gttatttattgctgattgaaaaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagtt 6007650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 32712571 - 32712775
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| | | |    ||  |||||||||||||||    
T  32712571 gaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtagttagtattgattttacaattttatcctttaagagataaa--tgatttatgttttcaacat 32712668  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  32712669 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaa 32712768  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  32712769 aagggac 32712775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Original strand, 19630976 - 19631179
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  19630976 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 19631074  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |    
T  19631075 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata-acaaggggtcttatata 19631173  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  19631174 aaggga 19631179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Original strand, 19827877 - 19828080
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  19827877 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttctaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 19827975  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||| |    
T  19827976 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata-acaaggggtcttatata 19828074  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  19828075 aaggga 19828080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 41834659 - 41834456
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||| ||||    
T  41834659 gaattaagatactggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattatttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttctacat 41834562  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta---aagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat 342  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||   || |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  41834561 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgattaataggggcatgcatgtatgtaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttat 41834462  T
Q  343 aaaaag 348  Q
    ||||||    
T  41834461 aaaaag 41834456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 180 - 319
Target Start/End: Original strand, 3670309 - 3670448
Alignment:
Q  180 ttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtata 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3670309 ttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtata 3670408  T
Q  280 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  3670409 ataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagt 3670448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 15917865 - 15918070
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||| | |||| ||||  ||| ||||| |||||    
T  15917865 gaattaagatagtgaatattagtattaaatatgtttgtaattactattatttt-acagttttaccctttaagagagagagttgatttacgttttgaacat 15917963  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  15917964 gttatttattactgattgaagaaaaaaatgtataataaataaggacaagtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 15918063  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  15918064 aagggac 15918070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30466377 - 30466111
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  30466377 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacat 30466278  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgt---------------------ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaa 324  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||                     |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  30466277 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgttgtacccaaaaaaaaaaatgaataataaataagggcatgtatgaaaagaaataattaatgtagttggaa 30466178  T
Q  325 atagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30466177 atagcaaaggggtcttataaaaa-ggaaaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 30466111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 98 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 8295608 - 8295330
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||       ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  8295608 tatactacctccgtccctaattataggacgtttttgaaaaaataacgggaattatgatagtggatatttgtatgaaatatgtatgtaattactattgttt 8295509  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||             ||||  |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  8295508 ttacaattttatcctttaagagagatggttggtttatgttttcaaca-------------tgatcaaagaaaaatatgtataataaatatgggtatgtat 8295422  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||| |||| ||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8295421 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagagtcttgtaaagagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacg 8295330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 12620060 - 12619822
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggt--tggcttatgttttcaaca 244  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | |||| |   ||| ||||||||||||||    
T  12620060 aattaagatagtgactatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttcacaattttgtcctttaagagagagagagatggtttatgttttcaaca 12619961  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | || ||||||    
T  12619960 tgttatttattgctaattgaagaaaaatatatataataaatatgagcatttatataaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagttttataa 12619861  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||||||||       ||| ||||||||||||||||||||    
T  12619860 aaagggacaattgtttttttcaaaagggtcttataatta 12619822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 234 - 392
Target Start/End: Original strand, 26334717 - 26334876
Alignment:
Q  234 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaag 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  26334717 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaacgaagttagaaataaaaaag 26334816  T
Q  334 gggtctt-ataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26334817 gggtcttaataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 26334876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 15571436 - 15571232
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||     
T  15571436 aattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttatagttttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 15571338  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||    
T  15571337 ctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggaacatgtatctaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggatcttataaaa 15571238  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  15571237 agggac 15571232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12360706 - 12360463
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || | | |  ||| | || | ||||| | ||    
T  12360706 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcattattgtttttacaattttatcctt-aagagacaaagttagtttctattttccatat 12360608  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  |||||||||||    
T  12360607 attatttattgttgatttaagaaaaagatgtataataa-taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaa 12360509  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12360508 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattaaagacggag 12360463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 290
Target Start/End: Original strand, 40173142 - 40173332
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||| || | ||||       ||||  |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  40173142 tactacctccgtcccttattatatgatccttttgaaaaaataacgggaattaagatcgtgaatatttatattaaatatgtttataattactattgttttt 40173241  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggg 290  Q
    ||||||||||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  40173242 acaattttatcctttaagagatagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataagtagggg 40173332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 8030804 - 8030992
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||  |||| |||||||            
T  8030804 gaattaagataatgaatatttgtattgaatatgtttgtaatttctattatttttacaattttatcgtttaagagagag--ttggtttatgtt-------- 8030893  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||| | |||||||||    
T  8030894 ---atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtgatcttataaa 8030990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23083749 - 23083541
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat---cctttaaaaa-agagggttggcttatgttttca 241  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||   |||| | | | |||| ||||| ||||||||||     
T  23083749 gaattaagaaagtggatatttgtattagagttgtttgtaatcactattgtttttacaatttaatattccttaagagagagagagttggtttatgttttcc 23083650  T
Q  242 acattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
    | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||| ||| ||||||||    
T  23083649 atatcttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaattattaatgtagttcgaaatagcaaatgggtctta 23083550  T
Q  342 taaaaaggg 350  Q
    |||||||||    
T  23083549 taaaaaggg 23083541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 328
Target Start/End: Original strand, 15353249 - 15353426
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    ||| |||   |||| ||||||||||    
T  15353249 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcgtttaa----gagagttaatttattttttcaacat 15353344  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatag 328  Q
     |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15353345 actatttattgttgattgaagaaaa-gatatataataaataggggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 15353426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 183 - 403
Target Start/End: Original strand, 31633670 - 31633891
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  31633670 taattactattgtttttacaattttgtcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 31633768  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataat 381  Q
    |||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||     
T  31633769 aataagggtatgttagtaaataaataattaatgtacttggaaatacaaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttctcaaaagggtcttataac 31633868  T
Q  382 tagggacgga-gtaatagtattt 403  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  31633869 tagggacggaggtaatagtattt 31633891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 230 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32511187 - 32511027
Alignment:
Q  230 cttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaataga 329  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  32511187 cttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatacgaacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagc 32511088  T
Q  330 aaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||  ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32511087 aaataggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataa-tagggacggag 32511027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 98 - 287
Target Start/End: Original strand, 44436222 - 44436411
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  44436222 tatactacctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgttt 44436321  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||| ||| | |||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44436322 ttacaaatttatcttttaagaaagagagttagtttatgttttcaagatactatatattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatag 44436411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 142 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 45152006 - 45151794
Alignment:
Q  142 acatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt----acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtt 237  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| ||||||    ||||||||||||||   || |||| ||| | |||||||    
T  45152006 acatgaattaaaaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactatagtttttttttacaattttatcctt---aagagagagttagtttatgtt 45151910  T
Q  238 ttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa-gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagggg 336  Q
    ||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||| |||||| ||| | |    
T  45151909 ttccatatgttatttattgctgattgaagaaaaaagatatataataaataagggcatgtatgtaaaaatataattaatgtagttggaaatagcaaatgag 45151810  T
Q  337 tcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||||    
T  45151809 tcttataaaaagggac 45151794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 313
Target Start/End: Original strand, 1422162 - 1422374
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||    
T  1422162 atactacctccgtccctatatataagacccttttgttaaaattacgggaattaagaaagtagatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttt 1422261  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||| | |||| | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||    
T  1422262 tacaattttatgc-ttaagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaata-gggcatgcatg 1422359  T
Q  299 taaagaaataattaa 313  Q
    |||||||||||||||    
T  1422360 taaagaaataattaa 1422374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Original strand, 29830556 - 29830785
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctg 259  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||  ||| | ||||||||||||  | ||||||  ||||     
T  29830556 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcatttagagagagatagttagtttatgttttcaatttgctatttgatgctt 29830655  T
Q  260 attgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnn 359  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||           
T  29830656 atcgaagaaaaagatgtatagtaaataggggtatgtgtgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag-caatgagtcttataaaaagggacaacaaat 29830754  T
Q  360 tttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29830755 tt--tcaaaaaggtcttataattagggacggag 29830785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 231 - 352
Target Start/End: Original strand, 10757848 - 10757969
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |    
T  10757848 ttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataagagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaca 10757947  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  10757948 aaggggtcttataaaaagggac 10757969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 16809002 - 16809201
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | |||| ||||||| ||    
T  16809002 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat-cttttaaagagagagttagtttatattttcaaaat 16809100  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
       ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16809101 gtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaa 16809199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 16848283 - 16848482
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| | |||| ||||||| ||    
T  16848283 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttat-cttttaaagagagagttagtttatattttcaaaat 16848381  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
       ||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  16848382 gtaatttaatgccgattgaa-aaaaagatgtatattaaatagagacatgtatgtaaataaataattaatatagttgaaaataggaaaatgatcttataaa 16848480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 9040892 - 9041128
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||| || |||||||  |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | | |  ||| | |||||||||  | ||    
T  9040892 gaattaagaaagtagatacttatattaaagttaattgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagatatagttagtttatgtttttcatat 9040990  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  9040991 gttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaatcattaatatagttgaaaataacaaacgagtcttataaa 9041090  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    || ||||       ||| ||||||||||||||||||||    
T  9041091 aaaggacgcaattttttttcaaaagggtcttataatta 9041128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 388
Target Start/End: Original strand, 18970536 - 18970756
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |    
T  18970536 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagg 18970634  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||| |||||| |||||||||       |||||||    
T  18970635 aaaaaaatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagggatcttatgaaaagggacaattttttttctca 18970734  T
Q  367 aaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18970735 aaagggtcttataattagggac 18970756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 28566381 - 28566157
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   ||||||||||| |||  ||||||||| |||||||||    
T  28566381 gtattaaatttgtatataattagtattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcagcataatatttattgttgattgaag 28566283  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||  | |||||||| | | ||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| ||       |||||||    
T  28566282 aaaaagattcaaaataaataagagtatgttagtaaataaataattaatgtatttgaaaataccaaatgagtcttataaaaaggaacaattttttttctca 28566183  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  28566182 aaagggtcttataattagggacggag 28566157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 30858168 - 30857946
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  30858168 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 30858070  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| |||  || |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| |||    
T  30858069 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacatggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattattttttca 30857970  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30857969 aaagggtcttataattagggacgg 30857946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 220 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12873167 - 12873035
Alignment:
Q  220 agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagt 319  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  12873167 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagacgtataatagatagtgatatgtatgtaaagaaataattaatgtagt 12873068  T
Q  320 tgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    || |||||  || ||||||||||||||| ||||    
T  12873067 tggaaataacaagggggtcttataaaaaaggac 12873035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Original strand, 41494445 - 41494653
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  41494445 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaata 41494543  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | || ||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||    
T  41494544 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatt 41494643  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  41494644 agggacggag 41494653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Original strand, 36750691 - 36750914
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  36750691 gtattaaatttgtataaaattacaattttttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 36750789  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||       ||| |||    
T  36750790 aaaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttca 36750889  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  36750890 aaagggtcttataattagggacgga 36750914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 184 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41422725 - 41422518
Alignment:
Q  184 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  41422725 aattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaatttatttatattttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaaaatgcaaaataa 41422627  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| | || ||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||    
T  41422626 ataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaagagttttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttataatta 41422527  T
Q  384 gggacggag 392  Q
    |||||||||    
T  41422526 gggacggag 41422518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 166 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3095530 - 3095305
Alignment:
Q  166 tgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    |||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  3095530 tgtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-agagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa 3095432  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    |||||||||| | ||||| || ||  ||||  ||||||||||||||||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||||||||       ||| ||    
T  3095431 gaaaaagatgcaaaataattaaggatatgttggtaaagaaataattaatttacttagaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttc 3095332  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  3095331 aaaagggtcttataattagggacggag 3095305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 171 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 12969738 - 12969520
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||| |||||||| | |||| |||||  ||| |||||||     |||||| ||||||||||||||||    
T  12969738 taaatttgtgtgtaattactattgtttttataaatttgtcctttaagagagagagttggtgtatattttcaatgcagtatttaatgctgattgaagaaaa 12969639  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaag 370  Q
    | || || |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||| |||       |||||||||||    
T  12969638 aaatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatatatttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagagacaaaataatttctcaaaag 12969539  T
Q  371 ggtcttataattagggacg 389  Q
    | || ||||||||||||||    
T  12969538 gatcctataattagggacg 12969520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9701300 - 9701076
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||  ||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  9701300 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagatagaattaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 9701202  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||  || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||       ||| |||    
T  9701201 aaaaaattgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttca 9701102  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9701101 aaagggtcttataattaaggacggag 9701076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 190 - 350
Target Start/End: Original strand, 13215649 - 13215808
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    |||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13215649 tattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagg 13215747  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||    
T  13215748 gtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaagggtcttataaaaaggg 13215808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 231 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 7447032 - 7446945
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtag 318  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  7447032 ttatgttttcaacatattatttattgcagattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataagtaatgtag 7446945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 185 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43700833 - 43700663
Alignment:
Q  185 attactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agag-ggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43700833 attactattgtttttacaattttatccttaagagagagagaggttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaata 43700734  T
Q  283 aataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| ||||  || ||| ||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  43700733 aataagggtatgttggtaaaaaaaaaaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 43700663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 162 - 321
Target Start/End: Original strand, 7461290 - 7461446
Alignment:
Q  162 tatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgat 261  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |   ||| |||   |||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  7461290 tatttgtattaaagttgtttgaaatcactatcgtttttacaattttatcttttaga---gagagttaatttatgttttcaatatactatttattgttgat 7461386  T
Q  262 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttg 321  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7461387 tgaagaaaaatatatataataaatatgagcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttg 7461446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 8784144 - 8784076
Alignment:
Q  8 taaaacacaaatttaatgatatttggagtaactcttagtattaagtgcattcttatctctttgaattga 76  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8784144 taaaacacaaatttaaagatatttggagtaactcttagtattaagtgcattcttatctctttgaattga 8784076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 171 - 346
Target Start/End: Original strand, 11083496 - 11083671
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    ||| |||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11083496 taaatttgtttgtaattgctattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttaatgtatattttcagcatagtatttaatgctgattgaagaaaa 11083595  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||| || |||||| || ||  ||   |||||||| ||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||    
T  11083596 agatataaaataaacagtggtgtgctggtaaagaattaattaatgtacttgaaaatattaaagaggtcttataaaa 11083671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Original strand, 2788145 - 2788328
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||| |    
T  2788145 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgagg 2788243  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  | |||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  2788244 aaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggcaaagaaataagtaatgtacttggaaataccaaagtggtcttataaaaagggac 2788328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 6028572 - 6028355
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  6028572 gtattaaatttgtatataactactattgtttttataattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 6028474  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||||| || |||||||| ||| ||||  |||||| |||| | || ||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||       |||||||    
T  6028473 aaaaagatataaaataaataagggtatgttggtaaaggaatattaaatgtacttggaaataccaaataggtcttataaaaagggacaattttttttctca 6028374  T
Q  367 aaagggtcttataattagg 385  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  6028373 aaaggatcttataattagg 6028355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 29831002 - 29830817
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||| | | || ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||    
T  29831002 atatttgtattaaatttgtttgtaattattatt--ttttacaattttatcatttaagagaaagagtttgtttatgttttcaacatgttatttattgttga 29830905  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat-agaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
      | ||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||| | ||  ||||||||||||||||    
T  29830904 cggtagaaaaa-atgtataataaataaaggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagtttaaaataacaaggggggtcttataaaaag 29830817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 44017904 - 44017791
Alignment:
Q  234 tgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaag 333  Q
    ||||||||| || ||||||||| || ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| || |||||| ||||    
T  44017904 tgttttcaagatgctatttattactaattgaagaagaatatgtataataaataggggtatgtaagtaaataaataattaatgtagctggaaatagcaaag 44017805  T
Q  334 gggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||||||||    
T  44017804 gggtcttataaaaa 44017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 34432008 - 34432231
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | || | ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  34432008 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagggagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 34432106  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||  || |  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| | |    
T  34432107 aaaaa-atgcaaaataaataaggatatattggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttaa 34432205  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34432206 aaagggtcttataattagggatggag 34432231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #138
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 146 - 216
Target Start/End: Original strand, 16636408 - 16636478
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16636408 gaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaa 16636478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #139
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 180 - 349
Target Start/End: Original strand, 6650975 - 6651144
Alignment:
Q  180 ttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtata 279  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||| ||||  || |  |||||||||||| |  ||||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  6650975 ttgtaatttttattgtttttacaattttatcattcaaaagagagaattagagtatgttttcaacgtgttatttattgttgattgaggaaaaaaatgtata 6651074  T
Q  280 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |||||||| |  || || ||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  6651075 ataaatagagatatatacgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcaaagagaccttataaaaagg 6651144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #140
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 327
Target Start/End: Original strand, 18223686 - 18223867
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||   ||| | ||||||||||||  |     
T  18223686 aattaagaaagttaatatttgtattaaagttgtttgtgatcactattgtttttacaattttatcatttaagagagttagttagtttatgttttcaaagtg 18223785  T
Q  247 ctatttattgctgattg-aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | ||| || || ||||| ||||||||||  |||||| |||||    
T  18223786 atatttattgttgattgaaagaaaaagatgtataataaaaatgggtatataagtaaataaataattaatatagttggaaata 18223867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #141
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8867829 - 8867712
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattcta 249  Q
    ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||    ||||||||||||||| |||    
T  8867829 taagaaagttgatatttctattaaatttgtttgtaattactattatttttacgattttatcctttaagagagagagt----ttatgttttcaacatgcta 8867734  T
Q  250 tttattgctgattgaagaaaaa 271  Q
    ||||||| | ||||||||||||    
T  8867733 tttattgttaattgaagaaaaa 8867712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #142
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 168 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 40544555 - 40544370
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg--aa 265  Q
    |||||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||| |  ||    
T  40544555 tattaaatttgtatataattactattgtttttataattttatcctt-aaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgatcggaaa 40544457  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
     ||||||||| | |||||||| ||| |||   |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  40544456 aaaaaagatgcaaaataaataagggtatgccggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaatgagtcttataaaaagggac 40544370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #143
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 289 - 392
Target Start/End: Original strand, 44436749 - 44436852
Alignment:
Q  289 ggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | |||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44436749 ggcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaattttctcaaaagggtcttatcattagggac 44436848  T
Q  389 ggag 392  Q
    ||||    
T  44436849 ggag 44436852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #144
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3904677 - 3904524
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||  |||| |||| ||||   |||||||||||||||||||    
T  3904677 gtattaaatttgtttgcaattactattgtttttataattatatcatttaagagagagagttgatttatatttttaacaaagtatttattgctgattgaag 3904578  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagtt 320  Q
    ||||| ||||| ||||||||  || ||||  ||| | |||||||||| ||||||    
T  3904577 aaaaatatgtaaaataaataatggtatgtcagtacataaataattaatgtagtt 3904524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #145
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 44417631 - 44417445
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactatt---gtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattga 264  Q
    |||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||||| |||  | | || |||    ||||||||||||||  |||||| || ||| |||    
T  44417631 tattaaatttgtttgtaattactattattgtttttacaattttatcccttatgagaaagagttacactatgttttcaacatagtatttactgttgactga 44417532  T
Q  265 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||| || ||||||||||   ||||  |||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||||| |||||||||    
T  44417531 agaaaaagatata-aataaataggaatatgttggtaaagaaataattaatgtagttgaaaataccaaagagatcttatgaaaagggac 44417445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #146
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 177 - 345
Target Start/End: Original strand, 26273372 - 26273540
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | || |  |||||||  |||||  |||||| || |||||||||||||| || |    
T  26273372 tgtttgtaattgctattgttattacaattttatcctttaagagagatgattagtgtatgtttctaacatcatatttaatgttgattgaagaaaaaaatat 26273471  T
Q  277 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | ||||||||| |   |||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  26273472 aaaataaatagagatgtgttagtaaagaattaattaatgtacttgaaaatatcaaaggggtcttataaa 26273540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #147
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 30830150 - 30830373
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  30830150 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 30830248  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  ||||  |||||||||||||||||       ||| |||    
T  30830249 aaaaa-atgcagaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaaattattttttca 30830347  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||||    
T  30830348 aaaaggtcttataattaagaacggag 30830373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #148
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 11121211 - 11121096
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| |||||  ||||||||||||||   ||||| || |||||||| ||||    
T  11121211 taaatttgtttgtaattactactgtttttacaattttatcatttaagagggagagttggtgtatgttttcaacataacatttaatgttgattgaataaaa 11121112  T
Q  271 agatgtataataaata 286  Q
    ||||||| ||||||||    
T  11121111 agatgtaaaataaata 11121096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #149
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 171 - 381
Target Start/End: Original strand, 12296238 - 12296448
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaggg--ttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaa 268  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |  || |  ||||||||||| ||  |||| || | |||||||| ||    
T  12296238 taaatttgtttgtaatcactattgtttttacaattttaccctttaagagagagagagttagtatatgttttcaatatagtattaat-gttgattgaaaaa 12296336  T
Q  269 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaa 368  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||||  ||||||||||||| |||       |||||||||    
T  12296337 aaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttggaaatatcaaagatgtcttataaaaagagac-aatttttttctcaaa 12296435  T
Q  369 agggtcttataat 381  Q
    |||||||||||||    
T  12296436 agggtcttataat 12296448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #150
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 384
Target Start/End: Original strand, 24300282 - 24300374
Alignment:
Q  292 atgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  24300282 atgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattag 24300374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #151
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 146 - 198
Target Start/End: Original strand, 26334670 - 26334722
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26334670 gaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 26334722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #152
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21838846 - 21838690
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  |    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  21838846 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 21838748  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaa 325  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||   ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  21838747 aaaaa-atgcaaaataaataagggtatgttgataaagaaataattaatgtacttgaaaa 21838690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #153
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 12873719 - 12873559
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||     ||||| ||| | ||||||||| |||||  ||||||||  |||||||||||||||||| | ||||    
T  12873719 taattactattgtttttacaaatttatcctt-----aagagagttagtttatgtttttaacataatatttattattgattgaagaaaaagatgcaaaata 12873625  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||| ||  || |   |||||||||||| || ||| ||||||||   |||| ||||||||||||||    
T  12873624 aataaggttatattgataaagaaataataaatgtaattgaaaatttcaaagaggtcttataaaaag 12873559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #154
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 140 - 347
Target Start/End: Original strand, 22302566 - 22302774
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||   ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | || |  || | |||||||||    
T  22302566 taacaagaattaagaaagttgataagagtattaaatttgtttgtaattattattatttttacaattttatcctttaagatagtg--ttagtttatgtttt 22302663  T
Q  240 caacattctatt---tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagggg 336  Q
      | ||  ||||   ||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||| | | | |||||||||  | | ||     
T  22302664 tgatatattattatttattgttaattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataatttatgaatttgaaaatatcacaagga 22302763  T
Q  337 tcttataaaaa 347  Q
    |||||||||||    
T  22302764 tcttataaaaa 22302774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #155
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 167 - 351
Target Start/End: Original strand, 11944445 - 11944628
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||  ||   | |||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  11944445 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatc-tttaagagaaagaattaattcatgttttcaacataatatttatcgttgattgaag 11944543  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||||| ||||||||  |  ||||  ||||||||||||| ||  || ||  |||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  11944544 aaaaagatgtaaaataaataaagatatgttggtaaagaaataataaatatacttagaaataccaaagggatcttataaaatggga 11944628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #156
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 8 - 67
Target Start/End: Original strand, 8778950 - 8779009
Alignment:
Q  8 taaaacacaaatttaatgatatttggagtaactcttagtattaagtgcattcttatctct 67  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8778950 taaagcacaaatttaatgaaatttgtagtcactcttagtattaagtgcattcttatctct 8779009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #157
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18294220 - 18294065
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | || || ||||  ||||||||| || | |  |||||||| ||||||||||    
T  18294220 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattcttaagagaa-agagttgatttatgtttttaataat--atttattgttgattgaaga 18294124  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat 326  Q
    |||||||| | ||||||||  || || |  |||||||||||||||| ||| ||| ||||    
T  18294123 aaaagatgcaaaataaataaaggtatattcgtaaagaaataattaatgtaattggaaat 18294065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #158
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 348
Target Start/End: Original strand, 4897640 - 4897730
Alignment:
Q  258 tgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  4897640 tgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaag 4897730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #159
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 258 - 348
Target Start/End: Original strand, 4945034 - 4945124
Alignment:
Q  258 tgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| ||  |||||  |||| ||||||||||||||    
T  4945034 tgattgaagaaaaagatataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtacttcgaaatatcaaagaggtcttataaaaag 4945124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #160
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 321
Target Start/End: Original strand, 7457310 - 7457384
Alignment:
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttg 321  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  7457310 ctatttattgttgaatgaagaaaaatacgtataataaatatgaacatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttg 7457384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #161
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Original strand, 16807067 - 16807117
Alignment:
Q  166 tgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16807067 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaa 16807117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 216
Target Start/End: Original strand, 16846348 - 16846398
Alignment:
Q  166 tgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16846348 tgtaataaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaa 16846398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 32511251 - 32511185
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  32511251 aattaagaaagtgaaaatttgtattaaaattgtttgtaattactgttgtttttacgattttatcctt 32511185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #164
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 180 - 313
Target Start/End: Original strand, 40348225 - 40348355
Alignment:
Q  180 ttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtata 279  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||   || | |||||||||  | ||  ||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  40348225 ttgtaatcactattgtttttacaattttatcc-ttaagaaaga--attagtttatgtttttcatatgttatttattattgattgaaaaaaaagatgtata 40348321  T
Q  280 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    |||||||   | |||||| |||||||| ||||||    
T  40348322 ataaataaatgaatgtatataaagaaaaaattaa 40348355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 4408584 - 4408809
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||| | ||||  ||   |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  4408584 gtattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagaattaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaag 4408682  T
Q  267 -aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
     ||||| ||| | ||||||||   | ||||   |||||||||||||||  || ||| |||||  ||||   |||||||||||| |||       ||||||    
T  4408683 aaaaaatatgcaaaataaataaaagtatgttgataaagaaataattaatctacttggaaataccaaagatatcttataaaaagagacaaaaatatttctc 4408782  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||||    
T  4408783 aaaaaggtcttataattaagaacggag 4408809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 352
Target Start/End: Original strand, 36556204 - 36556391
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---aaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattga 264  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||   |  ||| ||||  |||| || |||||||  ||||||||| |||||||    
T  36556204 tattaaatttgtttgtaattactattgtttttacaattatatctttttaagagagggagagttgatttatattgtcaacataatatttattgttgattga 36556303  T
Q  265 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||| | | ||||| ||||||||  || | ||  ||||| | ||||||||  ||||||||||||  ||| | | |||||||||| ||||    
T  36556304 agacagatatgtaaaataaataaaggtaagttagtaaatatataattaatatagttgaaaataacaaacgagccttataaaaaaggac 36556391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8056175 - 8056070
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgttttt-acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgta 277  Q
    |||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |  ||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  8056175 tttgtaattgttattgtttttcacaattttatcttttaaga--gagggttagtgtatattttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaagatata 8056078  T
Q  278 taataaat 285  Q
     |||||||    
T  8056077 aaataaat 8056070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 327
Target Start/End: Original strand, 14493626 - 14493779
Alignment:
Q  172 aaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa 271  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||  || |  ||| ||||||| ||  |||||| |  |||||||||||||     
T  14493626 aaatttgtttgtaattactattgttttcataattttatcttttaagagggag--ttagtgtatattttcaatataatatttaattttgattgaagaaaag 14493723  T
Q  272 gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    | | || |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  14493724 gttataaaataaataggggtatgttggtaaagaattaattaatgtatttgaaaata 14493779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 248 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 15079397 - 15079298
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| || | |||||||||| ||| || ||||||| ||||   ||| | ||||||||||||    
T  15079397 tatttattgttgattgaagaaaaa-atgtaaaataaataggggtatatttgtaaagaaaaaataaatgtagttggaaatgtcaaatgagtcttataaaaa 15079299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25888497 - 25888339
Alignment:
Q  179 tttgtaattacta-ttgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgta 277  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||| |||||||||| |  |||  ||||  ||| ||| ||||||  ||||||||  ||||||||||||||  ||||    
T  25888497 tttgtaattactgcttgtttttataattatatcctttaagagcgagacttggtatatatttccaacatagtatttatttttgattgaagaaaaatgtgta 25888398  T
Q  278 taataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagggg 336  Q
     |||||||| | | ||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||  |||||||    
T  25888397 aaataaataagtgtatgttggtaaaaaaataattaatgtagttaaaaataacaaagggg 25888339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #171
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 25523496 - 25523532
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25523496 attatactacctccgttcctaattataagaccatttt 25523532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 96 - 132
Target Start/End: Original strand, 31751065 - 31751101
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31751065 attatactacctccgtccctaattataagaccctttt 31751101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 190 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 40544746 - 40544651
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata 286  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || | ||| || |   |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  40544746 tattgtttttccaattttatcctt-aatagagatggctaatttatcttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgaaaaataaata 40544651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #174
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 2199976 - 2200010
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2199976 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 2200010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #175
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 23083513 - 23083547
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23083513 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 23083547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #176
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 41422510 - 41422544
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41422510 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 41422544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #177
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 4897464 - 4897509
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4897464 taaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaa 4897509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #178
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Original strand, 4944858 - 4944903
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4944858 taaatttgtttgtaatcactattgtttttataattttgtcctttaa 4944903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #179
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 12890246 - 12890213
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12890246 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 12890213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #180
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 26322331 - 26322298
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26322331 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 26322298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #181
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 29830792 - 29830759
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29830792 atactacctccgtccctaattataagaccttttt 29830759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #182
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 41494660 - 41494627
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41494660 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 41494627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 176)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 100 - 351
Target Start/End: Original strand, 9268032 - 9268283
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9268032 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9268131  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9268132 acaattttatcctttaaaaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgatcgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 9268231  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9268232 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 9268283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40643392 - 40643100
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  | ||||       ||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643392 tactacctccgtccctaattatcagggccttttgaaaaaataacgggaattaatatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 40643293  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40643292 acaattttatcctttaagaaagagagttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 40643193  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40643192 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 40643100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22658019 - 22657774
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22658019 aattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacatt 22657920  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22657919 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagggatcttataaaa 22657820  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22657819 agggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 22657774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9065205 - 9064953
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9065205 tactatctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 9065106  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9065105 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgt 9065006  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9065005 aaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 9064953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 7735086 - 7734880
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||    
T  7735086 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaatagggttgggttatattttcaacat 7734987  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7734986 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggggtcttataaa 7734887  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  7734886 aagggac 7734880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 14619501 - 14619258
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14619501 gaattaatatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagaaagagggttggcttatgttttcaacat 14619402  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14619401 tctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaa 14619302  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    ||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14619301 aagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacg 14619258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 98 - 391
Target Start/End: Original strand, 39121427 - 39121720
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||       || |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39121427 tatactacctccgtccctaattataaggctcttttaaaaaaatagcgggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttataattactattgttt 39121526  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39121527 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattatatttattgctgatttaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 39121626  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||        || |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39121627 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattatcaaaatggtcttataattagggacgga 39121720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35547559 - 35547267
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  35547559 tactacctccgtccctaattataaggcccttttgaaaaagtaacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtaattactattattttt 35547460  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35547459 acaattttatcctttaagaatgagggttggcttatgttttcaacattttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgt 35547360  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  35547359 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaaaatcttataattagggacggag 35547267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 43060150 - 43060442
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43060150 tactaccttcgtccctaattatatgacccttttgaaaaaataacgggaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 43060249  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43060250 acaattttatcctttaaaagagagggatggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 43060349  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43060350 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 43060442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 151 - 392
Target Start/End: Original strand, 8283898 - 8284138
Alignment:
Q  151 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctat 250  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8283898 aagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttagcttatgttttcaacattctat 8283997  T
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283998 ttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 8284097  T
Q  351 acnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||         |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8284098 acaaaaaaa-atctcaaaagggttttataattagggacggag 8284138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7940749 - 7940458
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940749 atactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 7940650  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7940649 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatg 7940552  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7940551 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 7940458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 32617561 - 32617797
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32617561 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttgtcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 32617660  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  32617661 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtatattaaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaa 32617760  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||       ||| ||||||||||||||||||||    
T  32617761 aagggacaaattttttt-tcaaaagggtcttataatta 32617797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 22527944 - 22527698
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  22527944 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatgttttcaacat 22527845  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  22527844 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 22527745  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22527744 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 22527698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 27873130 - 27873376
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  27873130 gaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacat 27873229  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  27873230 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaaagggtcttataaa 27873329  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27873330 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 27873376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 149 - 392
Target Start/End: Original strand, 19571726 - 19571970
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19571726 ttaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattat 19571825  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||| |||||||||||||||    
T  19571826 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtgtgtaaagaaataattaatatagttggaaatagtaaatgggtcttataaaaag 19571925  T
Q  349 ggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||          |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19571926 ggacaaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggag 19571970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1266201 - 1265955
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  1266201 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 1266102  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  1266101 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 1266002  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1266001 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 1265955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20186799 - 20186508
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20186799 tacttcctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20186700  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  20186699 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgctaattgaagaaaaagatgtatgataaataggggtatgtatgt 20186600  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20186599 aaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagggtcttataaaaagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattagggacgga 20186508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 21750226 - 21749977
Alignment:
Q  102 ctacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttac 201  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | ||||       ||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21750226 ctacctccgtccttaattataagatccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtaaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttat 21750127  T
Q  202 aattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaa 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21750126 aattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaa 21750027  T
Q  302 agaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  21750026 agaaataatcaatgtagttgaaaatagaaaatgaatctcataaaaaggga 21749977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 7e-88
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39985023 - 39984776
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39985023 gaattaagatagcggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacat 39984924  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaat--aggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  39984923 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagagaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttata 39984824  T
Q  344 aaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| |||        |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  39984823 aaaagagacaaaaaaa-ttcttaaaagggtcttataattaaggacggag 39984776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 99 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4194977 - 4194686
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  4194977 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaat--gtttgtaattactattatttt 4194880  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4194879 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacattttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 4194782  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagta 394  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||| ||||||||||       |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4194781 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttacaaaaagggacaaaattttttctcaaaaaggtcttataattagggacggagta 4194686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 9264225 - 9264019
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9264225 gaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacat 9264126  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||    
T  9264125 tctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaa 9264026  T
Q  346 aagggac 352  Q
    | |||||    
T  9264025 acgggac 9264019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 10511211 - 10511462
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10511211 tactacctccgtccctaattatagggccattttaaaaaa-taacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 10511309  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  10511310 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagagcatgtatgt 10511409  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  10511410 aaagaaataattaatgtagttgaaaataggaaatgagtcttataaaaagggac 10511462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 6673013 - 6673259
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  6673013 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 6673112  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  6673113 attatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaa 6673212  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6673213 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 6673259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 14649437 - 14649235
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  14649437 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgttggtttatgttttcaacat 14649338  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14649337 gttatttattgctgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 14649238  T
Q  346 aag 348  Q
    |||    
T  14649237 aag 14649235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 23285335 - 23285044
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23285335 tactacatccgtcccttattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 23285236  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagaggg--ttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23285235 acaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtat 23285136  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23285135 gtaaagaaataattattgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggacttataattagggacg 23285044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 313
Target Start/End: Original strand, 8144458 - 8144672
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8144458 atactacctccgtccctaattataaggctcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 8144557  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8144558 tacaattttatcctttaagaaagatggttggcttatgtttttaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataattaggggcatgtatg 8144657  T
Q  299 taaagaaataattaa 313  Q
    |||||||||||||||    
T  8144658 taaagaaataattaa 8144672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 25600845 - 25601091
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  25600845 gaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 25600944  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25600945 attatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaa 25601044  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25601045 aaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggag 25601091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 28041136 - 28041382
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  28041136 gaattaagatagtggatatttgtattacagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 28041235  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  28041236 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 28041335  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28041336 aagggacaaaaaaaattctcaaaggggtcttataattagggatggag 28041382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31889145 - 31888899
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  31889145 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 31889046  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  31889045 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 31888946  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  31888945 aagggaccaaaaaaattctcaaaaggatcttttaattagggatggag 31888899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32478390 - 32478144
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||    
T  32478390 gaattaatataatggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagaaggttagtttatattttcaacat 32478291  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  32478290 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 32478191  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32478190 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 32478144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 150 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 34662452 - 34662210
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattcta 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||    
T  34662452 taagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgtta 34662353  T
Q  250 tttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  34662352 tttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagg 34662253  T
Q  350 gacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34662252 gacaaaaaaaactctcaaaagggtcttataattagggacggag 34662210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 3686539 - 3686784
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||| | |||| ||||||||||    
T  3686539 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaataaggttagtttatattttcaacat 3686638  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3686639 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 3686738  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    || ||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3686739 aatggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacgga 3686784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 16153040 - 16153285
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  16153040 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatat 16153139  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  16153140 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaa 16153239  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16153240 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 16153285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 190 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20987955 - 20987754
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20987955 tattgtttttacaattttatcctttaagaaatagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 20987856  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  20987855 gcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-aaaaaatttctcaagagggtcttataattagagacg 20987757  T
Q  390 gag 392  Q
    |||    
T  20987756 gag 20987754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 20142000 - 20142290
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20142000 tactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 20142099  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  20142100 acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtatatttaataggggcatgtatgt 20142197  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20142198 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttttccaaaagggtcttataattagggacggag 20142290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 34332516 - 34332227
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34332516 tactacctccgtccctaattataagaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 34332417  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||| ||| ||| || | |||| ||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  34332416 acaattatattcttgaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggtatgtatgt 34332317  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa-gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||| |||||        ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34332316 aaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaaaggggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggac 34332227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12744076 - 12743870
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  12744076 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacat 12743977  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  12743976 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaa 12743877  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  12743876 aagggac 12743870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 147 - 345
Target Start/End: Original strand, 31507407 - 31507605
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||     
T  31507407 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaatagagagagttggtttatgttttcaacata 31507506  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  31507507 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaa 31507605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 15190600 - 15190846
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  15190600 gaattaagatagtggatatttgtattaaaattgtttataatcactattgtttttacaattttatcatttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 15190699  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  15190700 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 15190799  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15190800 aagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 15190846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21239351 - 21239105
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  21239351 gaattaagatagtggatatttgcattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 21239252  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21239251 gttgtttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgtaaagaagtaattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 21239152  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||        |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21239151 aagagacaaaaaaaattctcaaaagggtcttctaattagggacggag 21239105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 41418606 - 41418356
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41418606 tactacctccgtccctaattatgaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttttt 41418507  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||   | ||||||||    
T  41418506 acaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaatattctatttattgttgattgaagaaaatgatgtataataaata--tgtatgtatgt 41418409  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41418408 aaagaaataattaatgtatttagaaatagaaaaagggtcttataaaaagggac 41418356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 4976026 - 4976321
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4976026 tatactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgctt 4976125  T
Q  198 ttacaattttatccttta--aaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    ||||||||||||||||||  | | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4976126 ttacaattttatcctttaagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaa-aaaaagatgtataataaatagaggcatgt 4976224  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||| | |||||||||| |||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976225 atgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaagagatcttataaaaggggacaaaaatatttttcaaaagggtcttataattagggacggag 4976321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 17674443 - 17674649
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  17674443 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 17674542  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  17674543 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 17674642  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  17674643 aagggac 17674649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16441229 - 16440937
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16441229 tatactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttt 16441130  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||    
T  16441129 ttacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatgttatttagtgctgattgaagaaaaaaatgtataattaatagaggcatgtat 16441032  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16441031 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggag 16440937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 98 - 381
Target Start/End: Original strand, 40951780 - 40952063
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || | ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40951780 tatactacctccgttcctaattatacgatccttttgaaaaaataacgagaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttt 40951879  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||| ||||||||| || | |||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  40951880 ttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtat 40951979  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataat 381  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||    
T  40951980 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaaaggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataat 40952063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 4753004 - 4753249
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  4753004 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 4753103  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||   |||||||||||    
T  4753104 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaattaacaaaaatgtcttataaaa 4753203  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4753204 agggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataattagggacggag 4753249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14913945 - 14913654
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14913945 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 14913846  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | | ||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14913845 acaattttatcctttaagagataga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgatgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 14913748  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14913747 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 14913654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 20987953 - 20988244
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       || |  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20987953 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaatagcgggaattaagaaagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 20988052  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20988053 tacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 20988150  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  20988151 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaaggtcttataaaaagggacacaaaaaattctcaaaagggtcttataattggagacggag 20988244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 42561135 - 42561380
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||     
T  42561135 aattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacatg 42561234  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  42561235 ttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaa 42561334  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  42561335 agggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaaggacggag 42561380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 23092378 - 23092671
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||       ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  23092378 atactacctccgtccctaatcatatgacctttttgaaaaaataacgaaaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgttgt 23092477  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | | |   |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  23092478 tacaattttatcctttaagagacataattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagttgtataaaaaataggggcatgcatg 23092577  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  23092578 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtattataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttatagttagagacggag 23092671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 146 - 348
Target Start/End: Original strand, 28140705 - 28140907
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  28140705 gaattaagataatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagtgttggtttatgttttcaacat 28140803  T
Q  246 tctatttatt-gctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
      |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  28140804 gttatttatccgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataa 28140903  T
Q  345 aaag 348  Q
    ||||    
T  28140904 aaag 28140907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9828690 - 9828399
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  9828690 tactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 9828591  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9828590 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 9828492  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9828491 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 9828399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 10734306 - 10734512
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  10734306 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaaacactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 10734405  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  10734406 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 10734505  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  10734506 aagggac 10734512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 332
Target Start/End: Original strand, 15774848 - 15775034
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15774848 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacat 15774947  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaa 332  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||| | ||||| ||||    
T  15774948 tctatttattgttgattaaagaaaaagatgtacaataaataggggcatatatgtaaaaaaataattaatgtagtcggaaataaaaaa 15775034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 34889063 - 34889269
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||||    
T  34889063 gaattaagatagtggatatttttattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaagagagagttgatttatgtattcaacat 34889162  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  34889163 gttatttattgctggttgaaaaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataggaaagatgtcttataaa 34889262  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  34889263 aagggac 34889269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 4984901 - 4985147
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4984901 gaattaagatagtggatatttgtattatagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 4985000  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  4985001 gttatttattattgattgaagaaaaagatctataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 4985100  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  4985101 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggttttataattagggacggag 4985147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5528226 - 5527980
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||    
T  5528226 gaattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactactgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacat 5528127  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  5528126 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 5528027  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  5528026 aaaggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattaaggacggag 5527980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 13862780 - 13863026
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  13862780 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 13862879  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||| || |||||||    
T  13862880 gttatttattgttgacagaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaaggagttttataaa 13862979  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13862980 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcatataattagggacggag 13863026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 15521727 - 15521973
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  15521727 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 15521826  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  15521827 gttatttattgttgattgaaggaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 15521926  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15521927 aaaggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataattagggacggag 15521973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 23285862 - 23286107
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | |||  |||||||||||||||    
T  23285862 gaattaagatagtagatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattgt-ttatgttttcaacat 23285960  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||    
T  23285961 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagatgtcttataaa 23286060  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
     ||||||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23286061 tagggacaaacaaaattctcaaaatgatcttataattagggacggag 23286107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9020991 - 9020700
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9020991 tactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 9020892  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9020891 acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 9020794  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| |||| || |||||| ||||| |||||||||||||||||        ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9020793 aaagaaataattaatgtagatggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 9020700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 11781006 - 11780770
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11781006 gaattaagatagtggatatttgtattaaatgtgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaagagagttggcttatattttcaacat 11780907  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||        | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11780906 tctatttattgttgattgaagaaaaagatgtacaataaacaggg--------gaaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaa-gggtcttataaa 11780816  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11780815 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataactagggacggag 11780770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 41641351 - 41641101
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  41641351 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 41641252  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaac----gtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  41641251 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttggaaataacaaaggggtctta 41641152  T
Q  342 taaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  41641151 taaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatgatcttataattagggacggag 41641101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 107 - 392
Target Start/End: Original strand, 3497547 - 3497831
Alignment:
Q  107 tccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3497547 tccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatat 3497646  T
Q  207 tatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 306  Q
    ||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3497647 tatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaa 3497745  T
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3497746 taattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattaggaacggag 3497831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32964382 - 32964139
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |  ||| | ||| |||||||||||||||    
T  32964382 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaaga--gagtgatggtttatgttttcaacat 32964285  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  32964284 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgcataattaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaa 32964185  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||         |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32964184 aagggacaaaaaaa-atctcaaaatggtcttataattagggacggag 32964139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3028313 - 3028019
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||| |||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3028313 tactacctccgtcccttattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatttttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 3028214  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggt--tggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||| |||||| | |||| |   ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  3028213 acaattttattctttaagagagagagagatgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataattaataggggcatgtat 3028114  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3028113 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaagggtcttataattagggacggag 3028019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7951812 - 7951568
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  7951812 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 7951714  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7951713 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 7951614  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7951613 aagggacaaaaaaa-atctcaaaagggtcttataattagggacggag 7951568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 24307926 - 24308171
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||  |||||||||||||||    
T  24307926 gaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaacat 24308025  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  24308026 gttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaa 24308125  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24308126 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagagtcttataattaaggacggag 24308171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24365397 - 24365152
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  ||||  |||||||||||||||    
T  24365397 gaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttttaattactattgtttttacaattttatcctttaagagaaatagttgatttatgttttcaacat 24365298  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  24365297 gttatttattacttattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaacaattaatgtagttggaaatagcaaatgggtcttataaa 24365198  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24365197 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagagtcttataattaaggacggag 24365152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16127558 - 16127265
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16127558 tatactccatccgtccctaattataagacccttttgctaaaattacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 16127459  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16127458 ttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtat 16127360  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16127359 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 16127265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 40004196 - 40004440
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||     
T  40004196 aattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatg 40004294  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  40004295 ctacttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaa 40004394  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40004395 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 40004440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 13759235 - 13759478
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||     
T  13759235 aattaagatggtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacatg 13759332  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  13759333 ctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaagtcttataaaa 13759432  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13759433 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaggaacggag 13759478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 18615847 - 18616088
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagg----gttggcttatgttttca 241  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | ||||     ||||| |||||||||||    
T  18615847 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattaattttacaattttatcctttaagagagagatagagttggtttatgttttca 18615946  T
Q  242 acattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||| ||||||||||||    
T  18615947 acatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatgataaatatggacatgtatgtaaagaaataattattgtagtttgaaatagcaaaggggtctta 18616046  T
Q  342 taaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||||||        ||||||||||||| |||||||||    
T  18616047 taaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggttttataatta 18616088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 20518139 - 20517892
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20518139 tactacctccgtccctaattatagggcctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 20518040  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    | |||||||||||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  20518039 ataattttatcctttaga---gagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctaattgaagaaaagaatgtataataaatgggggcatatatgt 20517943  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||| || || ||||||||||||    
T  20517942 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatggatc-tataaaaaggga 20517892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 37034443 - 37034238
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||       ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  37034443 tactacctccgtccctaattataaggaccttttgaaaaaataaccgaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtgtgtaa--actattgttttt 37034346  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  37034345 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtattt 37034246  T
Q  300 aaagaaat 307  Q
    ||||||||    
T  37034245 aaagaaat 37034238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 41383911 - 41384203
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  41383911 atactccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 41384010  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||| ||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41384011 tacaattttgtcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 41384109  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||| | |||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41384110 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaggagacaacaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 41384203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 13661158 - 13660867
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||   |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  13661158 tatactccctccgtccctaattataagacctttttattaaaatcacggaaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 13661059  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||   || |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  13661058 ttacaattttatcctt---aagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatatat 13660962  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  13660961 gtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagagacggag 13660867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39759186 - 39758899
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39759186 atactacctccgtccctaattatagggcccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatgtttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttt 39759087  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||| ||||||||| || | |||  ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  39759086 tacaaatttatccttcaagagagaaagttggtttatattttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatg 39758987  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |     |||||| |||||||||||       ||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  39758986 taaagaaataattaatgtagttggaaataaa-----ggtcttgtaaaaagggacaaatttttttttcaaaaaggtctgataattagggacgga 39758899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 147 - 391
Target Start/End: Original strand, 38371760 - 38372005
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | ||||   ||| |||||||||||||||     
T  38371760 aattaagattgtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattaatattatttttacaattttattctttaatagagaga--tggtttatgttttcaacatg 38371857  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat-agaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||| || |||||||||    
T  38371858 ttatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaaaggatcttataaa 38371957  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttc--tcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||       ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38371958 aagggacaattttttttctttcaaaagggtcttataattagagacgga 38372005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 14436102 - 14435887
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14436102 tatactacctccgtccctaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 14436003  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| ||    
T  14436002 ttacaattttatcttttaagagagagaattggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtattataaataatgacatgcat 14435903  T
Q  298 gtaaagaaataattaa 313  Q
    ||||| ||||||||||    
T  14435902 gtaaaaaaataattaa 14435887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 35039249 - 35039043
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||| ||||| |||||||||||| ||    
T  35039249 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaaatttatcattcaagagagagagttggtttatgttttcaatat 35039150  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||    |||||||||    
T  35039149 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaatatcttataaa 35039050  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  35039049 aagggac 35039043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 23286220 - 23286505
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  23286220 atacttcctccgttcctaattataagaccattttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 23286319  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||| ||||| | || |||       ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23286320 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatattttccatatgcta-------ctgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatg 23286411  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23286412 taaagaaataattaatgtagttggaaataaaaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 23286505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 186397 - 186149
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  186397 tatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaatttgtttgtaatcactattgttt 186298  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  186297 ttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 186199  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||   |||  |||||||||||||    
T  186198 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatgacaaaatggtcttataaaaa 186149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 3160312 - 3160557
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||  | |||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||| | |||||||||||||||    
T  3160312 gaatcaagatagtgaatatttgtgttaaagttttttgtaaacactattgtttttacaaatttatcctttaagagagatggttagtttatgttttcaacat 3160411  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||||  |||||||||    
T  3160412 actatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaaaaattaatgtaattgaaaatagcaaaggaatcttataaa 3160511  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||       |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3160512 aagggacaaaaaattttctcaaaatgatcttataattagggacgga 3160557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 98 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 30183140 - 30182958
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  || |       ||||  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30183140 tatactacctccgtctctaattataagactcttctgaaaaaataacgggaattaagatagatgatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 30183041  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataat 281  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30183040 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaa-atgtataat 30182958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 12806854 - 12806692
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12806854 tattgtttttacaattttatcctttaaaagagagggttgttttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataacaaataggg 12806755  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  12806754 gcatgtatgtaaagaaataattaatgcagttggaaatagcaaacgagtcttataaaaagggac 12806692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40738661 - 40738416
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  40738661 gaattaaaaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-atgagagagagttagtttatgttttccatat 40738563  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40738562 gttatttattgctcattgaagaaaaagatgtataataaatagaggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaa 40738463  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || | ||       ||| | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40738462 aaagaacaaattttttttttaaaaggatcttataattagggacggag 40738416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17714820 - 17714610
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagg-gttggcttatgttttcaaca 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  | ||| ||||||||||||||    
T  17714820 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttctgattactattgttttgacaattttattttttaagagagagatgatggtttatgttttcaaca 17714721  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaa---gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
    |  ||||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||    
T  17714720 tgttatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtctta 17714621  T
Q  342 taaaaagggac 352  Q
    ||| |||||||    
T  17714620 taagaagggac 17714610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 31158213 - 31158415
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||   || |||| ||||| |||||||||| | ||    
T  31158213 gaattaagaaagtg-atatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttataattttatcctt---aagagagagttggtttatgttttccatat 31158308  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  31158309 gctatttattgcttattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaatagaaaagtggtcttataaa 31158408  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  31158409 aagggac 31158415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 161 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32147529 - 32147300
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || |  ||| ||| | |||||||||  | || ||| ||||||||||    
T  32147529 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatcctt-aagagtgagagttagtttatgtttttcatatgctacttattgctga 32147431  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||            
T  32147430 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaa- 32147332  T
Q  361 ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32147331 ttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 32147300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Original strand, 13703595 - 13703797
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||    
T  13703595 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtatttacaattttattttttaaaagagag--ttggtttat-ttttcaacat 13703691  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |  ||||||||     
T  13703692 gttatttattgttgtttgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttaaaaatagcaaaagaatcttataac 13703791  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  13703792 aaggga 13703797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 33639542 - 33639300
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | | |  ||| | |||||||||| | ||    
T  33639542 gaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagataaagttagtttatgttttccatat 33639444  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  33639443 gctatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatatatgtagaaaaataattaatgtagttgaaaatagtaaatgagtcttataaa 33639344  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    | |||||        |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  33639343 acgggacaaaaaaaattctcaaaaaagtcttataattagggacg 33639300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 14789804 - 14789604
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||  || |||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||   |||||||||| | ||    
T  14789804 gaattaagaaagtggatcattatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagggttaatttatgttttctatat 14789706  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| | || |||||||||||    
T  14789705 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtaattgaaaatagcagagaggtcttataaa 14789606  T
Q  346 aa 347  Q
    ||    
T  14789605 aa 14789604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 327
Target Start/End: Original strand, 17592587 - 17592767
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||  || | |||||||||| | ||    
T  17592587 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatc-tttaagagagagaattagtttatgttttccatat 17592685  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  17592686 gctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaata 17592767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 560 - 732
Target Start/End: Original strand, 18652510 - 18652682
Alignment:
Q  560 agagcatccaaaatttgctagagcatctgcacactggttagcttccctataagaatgcttcaccacaatctcccaatccagattaattaacctctcaatc 659  Q
    |||||||  |||||| |||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || |  | ||||    
T  18652510 agagcatttaaaattagctagagcatttgcacactagttagcttccatataagaatgcttcaccacaatctcccaatcctaattaatcaatcattaaatc 18652609  T
Q  660 tcaaaaaccaacgacctcccgctcgggctaccatgcccatttccattaatacaattagcaactactaaagaat 732  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  18652610 tcgaaaaccaaagacctcccgctcgggctaccatgtccatttccactaatacaattagcaattactaaagaat 18652682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 22581475 - 22581726
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||  ||||||| | ||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  22581475 tactacctccgtccctatatataagacccttttgctaaaatcacgggaattaataaagtggatatttatattacagttgtttgtaagtactattgttttt 22581574  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||| |||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22581575 acagttttatcctt-aagagagagagttcgtttatgttttccatatgttatttattgctgattcaaaaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgt 22581673  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||    
T  22581674 aaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagaaatcttataaaaagggac 22581726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 389
Target Start/End: Original strand, 38161566 - 38161808
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||||| | |  || ||| | |||||||||||||||    
T  38161566 gaatcaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgcaatcaccgttgattttacaattttatcctttagagat-agagttagtttatgttttcaacat 38161664  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||||    
T  38161665 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtatagtaagtaggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaatgagtcttataaa 38161764  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    || ||||        ||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  38161765 aaaggacaaaaaaaattcacaaaaaggtcttataattagggacg 38161808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 26605401 - 26605644
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-------agagggttggcttatgttt 238  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | | |       |||| ||| | ||||||||    
T  26605401 gaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagagagagagagagagttagtttatgttt 26605500  T
Q  239 tcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtc 338  Q
    || | ||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||    
T  26605501 tccatatgttatttattgctgattcaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatatcaaaggggtc 26605600  T
Q  339 ttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||    
T  26605601 ttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataatta 26605644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 167 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 25837238 - 25837019
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  25837238 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aaaagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaa 25837140  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||| ||       |||||||    
T  25837139 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaaggaacaaatttttttctca 25837040  T
Q  367 aaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  25837039 aaagggtcttataattaggga 25837019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 352
Target Start/End: Original strand, 26674480 - 26674595
Alignment:
Q  237 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagggg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |    
T  26674480 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26674579  T
Q  337 tcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||||    
T  26674580 tcttataaaaagggac 26674595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 237 - 352
Target Start/End: Original strand, 26946086 - 26946201
Alignment:
Q  237 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagggg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |    
T  26946086 tttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtctgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgag 26946185  T
Q  337 tcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||||||    
T  26946186 tcttataaaaagggac 26946201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 14570676 - 14570921
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||| |||| ||||||||||||||   || |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  14570676 gaattaagaaggtggatatttgtattaaagttgtttataatcacaattattttaacaattttatcctt---aagagagagttagtttatgttttccatat 14570772  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| ||||||||||    
T  14570773 gctattcattgttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggcatatatgtaaagaaataattaatgtaattgaaaataacaaaggagtcttataaa 14570872  T
Q  346 aagggacnnnnnnnttt--ctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||   |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14570873 aagggacaatttttttttcttcaaaaaggtcttataattagggacggag 14570921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 255
Target Start/End: Original strand, 42030385 - 42030493
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  42030385 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaaggagagttagcttatgttttcaacatt 42030484  T
Q  247 ctatttatt 255  Q
    |||||||||    
T  42030485 ctatttatt 42030493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 226 - 392
Target Start/End: Original strand, 26894739 - 26894904
Alignment:
Q  226 ttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaa 325  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  26894739 ttggtttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaat-attaatgtagttggaaa 26894837  T
Q  326 tagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26894838 tagcaaatgggtcttataaaaagggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 26894904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 41686922 - 41687143
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  41686922 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 41687018  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||       ||| |||    
T  41687019 aaaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggagtcttataaaaagggacaatttttttt-tca 41687117  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41687118 aaagggtcttataattatggacggag 41687143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 156 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 14571526 - 14571293
Alignment:
Q  156 agtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttatt 255  Q
    |||| ||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   || |||| ||| | |||||||||  | ||  |||| |||    
T  14571526 agtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttagtttatgttttgcatatgttattcatt 14571430  T
Q  256 gctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnn 355  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||  ||||||| |||||||||       
T  14571429 gttgattgaagaaaaatatgtataataagtaggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaagtcttatgaaaagggacaaa 14571330  T
Q  356 nnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
         |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  14571329 aaaaattctcaaaaatatcttataattagggacggag 14571293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39971244 - 39971020
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||| |||    
T  39971244 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattaaag 39971146  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | ||||| || ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||       ||| |||    
T  39971145 aaaaagatgcaaaataattaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaagggatcttataaaaagggacaaattattttttca 39971046  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  39971045 aaagagtcttataattagggacggag 39971020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 469 - 590
Target Start/End: Original strand, 42887139 - 42887262
Alignment:
Q  469 caaacgggggatagaaatccctattacagcagttgtgagcatgtgactaaattgaatcggacaagactc--aaaaggtaatttgacccgttagagagcat 566  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42887139 caaacgggggatagaaatccctattacatcagctgcgagcacgtgactaaattgagccggacaagactcgaaaaaggtaattttatccgttagagagcat 42887238  T
Q  567 ccaaaatttgctagagcatctgca 590  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  42887239 ccaaaatttgctagagcatctgca 42887262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 142 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12098816 - 12098634
Alignment:
Q  142 acatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttca 241  Q
    |||| |||||||| | | |||||||||||||||  |||||||| | || |||||||||||||||||||||||||| | |||  | | | |||| |||| |    
T  12098816 acataaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgta-tcacaattgtttttacaattttatcctttaagagagatagctagtttatattttta 12098718  T
Q  242 acattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaa 325  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  12098717 acattctatttattgctcattgaagaaaaagatgtttaataaagaggggtatgtaagtaaaaaaataattaatgtagttgaaaa 12098634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 98 - 218
Target Start/End: Original strand, 26889591 - 26889711
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26889591 tatactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 26889690  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaa 218  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  26889691 ttacaattttatcctttaaaa 26889711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 231 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39180628 - 39180468
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |    
T  39180628 ttatgttttcaacatgttatttattgatgatttaagaaaaagatgtataataattagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaca 39180529  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||   || ||||||||||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39180528 aaaatgttttataaaaagggacaaataaaattctcaaaatggtcttataattagggacgga 39180468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 8100179 - 8100384
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  | | ||  || | |||||||||||||||    
T  8100179 gaattaagaaagttgatatttgtattaaatttgtttgtaatccctattggttttacaattttatcatttaggataaagaattag-ttatgttttcaacat 8100277  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| || |||| ||||||||||  | |||||||||    
T  8100278 gttatttattgatgattgaaaaaaaaaatgtatgataaataagagtatgtaagtaaagaagtaattaatgttgttggaaatagaaaattgatcttataaa 8100377  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  8100378 aagggac 8100384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 16926682 - 16926458
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||  ||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |    
T  16926682 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaagag--ttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgagg 16926585  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctc 365  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||||        ||||||    
T  16926584 aaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaagagggacaatttttttttctc 16926485  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||    
T  16926484 aaaagggtcttataattagggatggag 16926458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 24170348 - 24170179
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||| || || | ||||  || | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24170348 taatcactactgtttttacaattttatc-ttaaagagagagaattagtttatgttttctatatgctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 24170250  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat-agaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| | | ||||||||||||||||    
T  24170249 aataggagcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagatcttataaaaagggac 24170179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 23259945 - 23260169
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | | || || |||   |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||    
T  23259945 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatccttaagagaa-agtgttaatttatgttttcaacataatatttattgttggttgaag 23260043  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| | | || |  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||  ||||||||||| ||||       |||||||    
T  23260044 aaaaagatgcaaaataaataagagtatattagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggaatcttataaaaaaggacaaatttttttctca 23260143  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  23260144 aaagggtcttataattagggacggag 23260169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 24857785 - 24857562
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  24857785 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 24857687  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||| || | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  24857686 aaaaag-tgcaaaataaataagggtacgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 24857588  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  24857587 aaagagtcttataattagggacggag 24857562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31642401 - 31642193
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |||||||||| | ||||    
T  31642401 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-agagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgaggaaaaagatgcaaaata 31642303  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||  ||||||||||||    
T  31642302 aataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttctcaaagaggtcttataatt 31642203  T
Q  383 agggacggag 392  Q
    ||||||||||    
T  31642202 agggacggag 31642193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31657914 - 31657692
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  31657914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 31657816  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||  || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||||||||||||       ||| |||    
T  31657815 aaaaaagtgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaagggacaaattatttt-tca 31657717  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  31657716 aaagggtcttataattagggacgga 31657692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8950045 - 8949818
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||   |||||||||||||||  || |||||| ||||||| |    
T  8950045 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-agagttaatttatgttttcaacataatacttattgttgattgagg 8949947  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt---ttc 363  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| | ||  |||||||||||||||  ||| ||| |||||  ||||| |||||||||||||||||       |   |||    
T  8949946 aaaaagatgcaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattagtgtacttggaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaattttttttcttc 8949847  T
Q  364 tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8949846 tcaaaagggtcttataattagggacggag 8949818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37206338 - 37206169
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat 278  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||| || ||     
T  37206338 tttgtaattactattatttttacaattttatcctttaaaaaagcaggttagtgtatgttttcaacataatatttaatgctgattgaagaaaaatatataa 37206239  T
Q  279 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||  |||||| |||  ||||||||  |||  | ||||||||||||    
T  37206238 aataaacaggggtatgtttgtaaagaatcaattaatgtacatgaaaatatcaaaaagttcttataaaaag 37206169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 168 - 385
Target Start/End: Original strand, 16284998 - 16285214
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |  |  ||   |||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  16284998 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt-aagagattgaattaatttatgttttcaacataatatttattgtttattgaaga 16285096  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||       ||| | ||    
T  16285097 aaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttaaa 16285196  T
Q  368 aagggtcttataattagg 385  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16285197 aagggtcttataattagg 16285214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 319
Target Start/End: Original strand, 9438877 - 9439051
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| || | ||||  || | || ||||||||||||    
T  9438877 aattaagaaagttgatatttttattaaatttgtttgtaattattattgtttttacaatttttttcttttaagagagagaattagtttgtgttttcaacat 9438976  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagt 319  Q
     |||||||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| |||||    
T  9438977 gctatttattgctgatcaaagaaaaaaagtgtataataaatagggatatgtaggtaaaaaaataattaatgtagt 9439051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 11432546 - 11432356
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-----agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgat 261  Q
    ||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||||||||||| | | |     |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  11432546 gtattaaatttgtatatatttactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgat 11432447  T
Q  262 tgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11432446 tgaagaaaaagatgcagaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaagggatcttataaaaagggac 11432356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5283277 - 5283094
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  5283277 gtattaaatttgtatgtaattactattgtttttacaattttatcctt-aagaaagatagttaatctatgttttcaacatagtatttattgttgattgaag 5283179  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||| | |||||| | ||| | ||  |||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||   |||||||||||||||||    
T  5283178 aaaaagatgcaaaataaaaaagggta-gttggtaaagaaataattaatgtatttggaaatacaaaaaaagtcttataaaaagggac 5283094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 183 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 15559751 - 15559539
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa---agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |   |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |    
T  15559751 taattactattgtttttacaattttattcttaagagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaa 15559652  T
Q  280 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttata 379  Q
    |||| || ||| ||||   ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||| ||||       ||| |||||||| |||||||    
T  15559651 ataactaagggtatgttgataaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaaaggacaaatttttttttcaaaaggatcttata 15559552  T
Q  380 attagggacggag 392  Q
    ||||| |||||||    
T  15559551 attagagacggag 15559539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 147 - 348
Target Start/End: Original strand, 26076175 - 26076375
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| | | ||||| |||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||| ||| | || ||||||||||||     
T  26076175 aattaagaaaattgatatctgtattaaatttgtttctaattattattatttttacaattttattctttaagaaagagagttagtttgtgttttcaacata 26076274  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga--aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
     ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | ||| |||| | |||| |  |||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  26076275 ttatttattgctgattgaggaaaaag--gtataataaacaagggtatgtctctaaaaaataataattaatttagttggaaatagcaaagggg-cttataa 26076371  T
Q  345 aaag 348  Q
    ||||    
T  26076372 aaag 26076375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 168 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21069866 - 21069647
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagg--gttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||  |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||    
T  21069866 tattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt---aagagaggtagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaa 21069770  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    |||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||  ||||||||||||||||||       ||| ||    
T  21069769 gaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaatggtcttataaaaagggacaaattattttttc 21069670  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  21069669 aaaagggtcttataattagggac 21069647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 183 - 349
Target Start/End: Original strand, 6328626 - 6328791
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  6328626 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 6328724  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||  || ||| |||||  |||| | |||||||||||||    
T  6328725 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatatatttggaaatatcaaagagatcttataaaaagg 6328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 167 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 13236169 - 13235953
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  13236169 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt---aagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 13236073  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||| ||| ||  ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  13236072 aaaaa-atgcaaaataaataatggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttagaaacatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 13235974  T
Q  367 aaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13235973 aaagggtcttataattaggga 13235953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 258 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 13735789 - 13735701
Alignment:
Q  258 tgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||    
T  13735789 tgattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaa 13735701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 183 - 349
Target Start/End: Original strand, 1303400 - 1303563
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||| ||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||    
T  1303400 taattactattatttttacaattttatcctt---aagagagagttagtttatgttttcaacaaaatatttattgttgattgaagaaaacgatgcaaaata 1303496  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||  || |||||||||||    
T  1303497 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaatactaaagaagttttataaaaagg 1303563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 168 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18251249 - 18251020
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattga 264  Q
    |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||| |||| ||| | |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18251249 tattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagaaagagagagttagtttatgttttcaatatagtatttattgttgattga 18251150  T
Q  265 agaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt--tt 362  Q
    ||||||||||| | || ||||| ||| || |  ||||| ||||||||||  || ||| |||||  ||||||||||| ||||||| |||       |  ||    
T  18251149 agaaaaagatgcaaaagaaataagggtatcttggtaaaaaaataattaatttaattggaaataccaaaggggtcttttaaaaagagacaatttttttctt 18251050  T
Q  363 ctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  18251049 cttaaaagggtcttataattaaggacggag 18251020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 30182204 - 30182093
Alignment:
Q  277 ataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtctt 376  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||        ||||||||| ||| ||    
T  30182204 ataataaatagggccatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaatggtttt 30182105  T
Q  377 ataattagggac 388  Q
    ||||||||||||    
T  30182104 ataattagggac 30182093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Original strand, 28414507 - 28414675
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  28414507 taattattattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 28414605  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||| |||||  || ||  |||||  |||| ||||||||||||| ||||    
T  28414606 aataagggtatgttggtaaagaaatgattaatttacttcgaaataccaaagtggtcttataaaaatggac 28414675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 37700320 - 37700143
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||   || |  ||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||    
T  37700320 taaatttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagagagaaaattagtatatgttttcaatatagtatttaatgctgattgaagaaaa 37700221  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
     ||| || |||||||||||  ||||  |||||||| ||||||| ||| | | |||||  ||||| |||||||||||||    
T  37700220 tgatataaaataaatagggatatgttggtaaagaattaattaatgtactcggaaatatcaaaggagtcttataaaaag 37700143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 20187247 - 20187151
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  20187247 ttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcataataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaata 20187151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 3629132 - 3628980
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   ||||  || | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3629132 gtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaatgttatcctttaagctagag--ttagtttatgttttcaacatgatatttattgttgattgaag 3629035  T
Q  267 aaaaaga-tgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagtt 320  Q
    ||||| | | ||||||||||| |||  || | |||||||||||||||| ||||||    
T  3629034 aaaaaaattatataataaataagggtgtgcaagtaaagaaataattaatgtagtt 3628980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4902949 - 4902813
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||        |||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  4902949 tatttattgttgattcaagaaaaagatgtataataaatagggg--------taaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaa 4902858  T
Q  348 gggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||         |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4902857 gggacaaaaataaatctcaaaatggtcttataattagagacggag 4902813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 168 - 352
Target Start/End: Original strand, 35784728 - 35784908
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |    
T  35784728 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaaa 35784824  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||  || | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||||  |||||||||||||||||    
T  35784825 aaaac-tgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaagaagtcttataaaaagggac 35784908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 146 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 15675027 - 15674913
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  || |||| ||| | |||| ||||||||||    
T  15675027 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgcttttacaattttatctttt--aagagagagttagtttatattttcaacat 15674930  T
Q  246 tctatttattgctgatt 262  Q
      |||||||||||||||    
T  15674929 gttatttattgctgatt 15674913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 98 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 20988342 - 20988250
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 190  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| || ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20988342 tatactacattcgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 20988250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 167 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 27834174 - 27834029
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||  |||||||||||||||||||| || || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  27834174 gtattaaatttgtatataattatcattgtttttacaattttatcatt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 27834076  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    ||||||||| | |||||||  | | ||||  ||||||||||||||||    
T  27834075 aaaaagatgaaaaataaatgagagtatgttggtaaagaaataattaa 27834029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 13335514 - 13335338
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||| | ||    |||| ||| |||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  13335514 taaatttgtttgtaattaatattgcttttacaattttatcctttacgagagatgattattgtatgctttgaacatagtatttaatgctgattgaagaaaa 13335415  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||| || ||||||||| || ||||  ||||| || |||||||  || ||| |||||  ||| |||||||||||||||    
T  13335414 agatataaaataaatagcggtatgttggtaaa-aattaattaatatacttggaaataccaaatgggtcttataaaaag 13335338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 213
Target Start/End: Original strand, 13958637 - 13958704
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13958637 gaattaaaaaagtgaatatttgtattaaaattgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt 13958704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 349
Target Start/End: Original strand, 39692462 - 39692640
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||| | |||||||||||||||||| |||   || |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||    
T  39692462 tattaaatttgtatataattattgttgtttttacaattttattctt---aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaaga 39692558  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||| | ||| || ||||||  ||| | ||| ||||||||||    
T  39692559 aaaatatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattgatgtacttaaaaatatcaaatgagtcatataaaaagg 39692640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 179 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 16099448 - 16099279
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat---tgctgattgaagaaaaagatg 275  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||||||||  |||||||   |||| |||||||||||  ||     
T  16099448 tttgtaattgttattgtttttacaattttatccttt--aagagagggttagtgtatgttttcaacatagtatttatcaatgctaattgaagaaaataata 16099351  T
Q  276 tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    || ||||||||||||  |||  |||||||| |||||||  || ||| | |||  |||||| |||||||||||    
T  16099350 taaaataaataggggtgtgttggtaaagaattaattaatctacttggagatatcaaagggatcttataaaaa 16099279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 397
Target Start/End: Original strand, 8356325 - 8356580
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||| |  |||||||| | | | |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| | || |||   |||||||||||||||    
T  8356325 gaattaagaaagttgatagtaatattaaatttatatataattactgttgtttttacaattttatactt-aaaagatagagttaatttatgttttcaacat 8356423  T
Q  246 tctatttattgctgattg---aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt-aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagg-ggtctt 340  Q
      ||||||||| ||||||   || ||||||||| | |||||||| ||| ||||  || ||| |||||||||| ||| ||||||||   ||||| | | ||    
T  8356424 aatatttattgttgattgaaaaaaaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaaataattaatgtacttgaaaatgtcaaaggtgttttt 8356523  T
Q  341 ataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagtaata 397  Q
    |||| |||||||       |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8356524 ataataagggacaaaaaaatttctcaaaaaggtcttgtaattagggacggggtaata 8356580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12807174 - 12807129
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12807174 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacta 12807129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 30117333 - 30117163
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat 278  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| || |  ||||||||||||||  |||||| || |||| |||||||||||| |||    
T  30117333 tttgtaattgctattgtttt-acaattttatattttaaaagataggattagtgtatgttttcaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagatatat 30117235  T
Q  279 --aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
      ||||||||| ||  |||  |||||||| ||||||| ||| ||  |||||  ||||| |||||||||||||    
T  30117234 aaaataaatagaggtttgttggtaaagaattaattaatgtacttacaaatatcaaaggagtcttataaaaag 30117163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 4903033 - 4902966
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||  ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  4903033 gaattaaggaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt 4902966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10116809 - 10116630
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatg-ttttcaacattctatttattgctgattgaag-aa 268  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||  ||| |||||| |||  ||||||  | ||||||||| ||    
T  10116809 taaatttgtttgtaataactattgtttttacaattttatcatttaagagggagggttggcgcatgtttttcagcatagtatttaaagttgattgaagaaa 10116710  T
Q  269 aaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||| || ||||||||  || |||   |||||||| ||||||| ||| ||| |||||  ||| |  ||||||||||||    
T  10116709 aaagatataaaataaataatggtatgatggtaaagaattaattaatgtatttggaaataccaaaagaatcttataaaaag 10116630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26699543 - 26699424
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | ||    |||||||| |||||  |||||| || |||||||||||||    
T  26699543 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26699444  T
Q  271 agatgtataataaatagggg 290  Q
    ||||  | ||||||||||||    
T  26699443 agatagaaaataaatagggg 26699424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 26969276 - 26969157
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||| | ||| | ||    |||||||| |||||  |||||| || |||||||||||||    
T  26969276 taaatttgtttgtaattaatattgtttttataattttatgctttaagagagatgattattgtatgttttgaacatagtatttaatgttgattgaagaaaa 26969177  T
Q  271 agatgtataataaatagggg 290  Q
    ||||  | ||||||||||||    
T  26969176 agatagaaaataaatagggg 26969157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 216
Target Start/End: Original strand, 2328404 - 2328478
Alignment:
Q  142 acatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2328404 acatgaatttagaaaatggatatttgcattaaagttgttagtaatcactattgattttacaattttatcctttaa 2328478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 147 - 216
Target Start/End: Original strand, 11937204 - 11937273
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| | ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  11937204 aattaagaaagttgatatttgtattaaatttatttataatcacaattgtttttacaattttatcatttaa 11937273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 392
Target Start/End: Original strand, 16636825 - 16637032
Alignment:
Q  187 tactattgtttttacaatt---ttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| || | |||| |||   |||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||| | |||||    
T  16636825 tactattgtttttacaattattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatgtattgttgattgaagaaaaatatgcaaaataa 16636923  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    ||| | | ||||  |||| ||||||||||| |||  || |||||  |||  | ||||||||||||||||       ||| |||||||| |||||||||||    
T  16636924 ataagagtatgttggtaatgaaataattaatgtacgtggaaatactaaaatgatcttataaaaagggacaaattattttttcaaaaggatcttataatta 16637023  T
Q  384 gggacggag 392  Q
    | |||||||    
T  16637024 gagacggag 16637032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 150 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 39181967 - 39181902
Alignment:
Q  150 taagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta 215  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39181967 taagaaagtcgatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcattta 39181902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 7408926 - 7408878
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7408926 tattaaatttgtttgtaattactattgtttatacaattttatcttttaa 7408878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 216
Target Start/End: Original strand, 35495050 - 35495126
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    ||||| ||||||||| | | |||| | ||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35495050 taacaggaattaagaaaattgataatggtaataaatttatttgtaattactattgattttacaattttatcctttaa 35495126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10561316 - 10561245
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa 218  Q
    |||||||| | | ||||||| || ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10561316 aattaagaaaattgatatttctaataaatttgtttgtaattattattgtttttataattttatccttaaaaa 10561245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 7001532 - 7001486
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7001532 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt 7001486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 32964131 - 32964165
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32964131 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 32964165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Original strand, 37330994 - 37331056
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 209  Q
    |||||||| | | ||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37330994 aattaagaaaattgatatttgtcttaaatttgtttgtaattactgatgtttttacaattttat 37331056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Original strand, 21591812 - 21591877
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  21591812 tatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaa 21591877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Original strand, 21595929 - 21595994
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||||    
T  21595929 tatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaatatgggtatgttggtaaaaaaataattaa 21595994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 224
Target Start/End: Original strand, 33818837 - 33818890
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagg 224  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||||||    
T  33818837 taaatttgtttgtaattactattgcttttacaattctattctttaagaaagagg 33818890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 32719124 - 32719092
Alignment:
Q  191 attgtttttacaattttatcctttaaaaaagag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32719124 attgtttttacaattttatcctttaaaaaagag 32719092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Original strand, 3028010 - 3028045
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3028010 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 3028045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 23260178 - 23260143
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23260178 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 23260143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 7940450 - 7940484
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7940450 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 7940484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 248 - 313
Target Start/End: Original strand, 7956568 - 7956633
Alignment:
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||   |||||||| |||||||    
T  7956568 tatttaatgatgattgaagaaaaagatatacaataaataggggtatggtggtaaagaattaattaa 7956633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 8949811 - 8949844
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8949811 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 8949844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 14435829 - 14435862
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14435829 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 14435862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 20142297 - 20142264
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20142297 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 20142264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 126
Target Start/End: Original strand, 39971011 - 39971040
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39971011 ttatactacctccgtccctaattataagac 39971040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 613 - 654
Target Start/End: Original strand, 42887264 - 42887305
Alignment:
Q  613 aatgcttcaccacaatctcccaatccagattaattaacctct 654  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  42887264 aatgcttcaccacaatctcccaatttagattaattaatctct 42887305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0250 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0250
Description:

Target: scaffold0250; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Original strand, 9164 - 9457
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9164 tatactacctctgtccctaattataacacccttttgaaaaa-taacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 9262  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9263 ttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatattttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 9362  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9363 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagagacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 9457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 190)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Original strand, 9140269 - 9140564
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||       |||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9140269 ttatactacctctgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtt 9140368  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9140369 tttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaagaggggcatgta 9140468  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9140469 tgtaaaaaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 9140564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 100 - 391
Target Start/End: Original strand, 28016285 - 28016575
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28016285 tactacttccgtccctaattataaggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 28016384  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  28016385 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctaattgaagaaaaaggtgtataataaataggggcatgtatgt 28016484  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28016485 aaagaaataattaatgtagttggaaatataaaaggaatcttataaaaagggactaaataa-ttctcaaaagggtcttataattagggacgga 28016575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 99 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 43081550 - 43081261
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  ||||       ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081550 atactacctccgtccctaattataaggct-ttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 43081452  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081451 tacaattttatcctttaagaaaaagggttggcttatgttttcaacattctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 43081352  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43081351 taaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacg 43081261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 147 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37913326 - 37913084
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37913326 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagaaagagggttgacttatgttttcaacatt 37913227  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37913226 ctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaa 37913127  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||        ||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37913126 agggacaaaaaa--ttctcaaaatgatcttataattagggacgga 37913084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 7e-91
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 39871398 - 39871644
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  39871398 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 39871497  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  39871498 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 39871597  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39871598 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggacggag 39871644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27529524 - 27529235
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27529524 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 27529425  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27529424 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 27529327  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||       ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27529326 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagaggtcttataaaaagggacaatttttttt-tcaaaaggatcttataattagggacggag 27529235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 35569393 - 35569682
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569393 tactacatccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 35569492  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35569493 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 35569590  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||       ||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35569591 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaaggacaatttttttt-tcaaaagggtcttataattaaggacggag 35569682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12930616 - 12930324
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930616 tactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 12930517  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12930516 acaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 12930419  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata-aaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||        ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12930418 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaagggacaatttttttttctcaaaagagtcttataattagggacggag 12930324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 161 - 352
Target Start/End: Original strand, 43440910 - 43441101
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43440910 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 43441009  T
Q  261 ttgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||||||||||||||    
T  43441010 ttgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtttgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagataatgagtcttataaaaagggac 43441101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 32872160 - 32872406
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  32872160 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 32872259  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  32872260 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 32872359  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32872360 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 32872406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 41025881 - 41026127
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  41025881 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 41025980  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  41025981 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaa 41026080  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41026081 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 41026127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 2289755 - 2290047
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  2289755 tactacctccgtccgtaattataggacccttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatattt 2289854  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||| | |||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2289855 acaattttatcttttaagagagagagttcgtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaataaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 2289954  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2289955 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttagaaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 2290047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 100 - 347
Target Start/End: Original strand, 27881827 - 27882074
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | ||||       |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27881827 tactacctccgtccctaattataaggtccttttgaaaaaataacgtgaattaagatagttgatatttgtattaaatatgtttgtagttactattgttttt 27881926  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | |||||||||    
T  27881927 acaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaaaatatataataaatagagacatgtatgt 27882026  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||| |||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||||||||||    
T  27882027 aaaaaaataattaatgtagttagaaatataaaaggtgtcttataaaaa 27882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8291155 - 8290909
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8291155 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8291056  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  8291055 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgggtcttataaa 8290956  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  8290955 aagggacaaaaaaaattctcaaagggatcttataattagggacggag 8290909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 25247476 - 25247721
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  25247476 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 25247575  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  25247576 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 25247675  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25247676 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagagtcttataattagggacggag 25247721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31458249 - 31458003
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  31458249 gaattaagatagtggatgtctgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 31458150  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  31458149 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 31458050  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31458049 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 31458003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 34978862 - 34979108
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  34978862 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 34978961  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  34978962 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatttagttggaaataacaaaggggtcttataaa 34979061  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34979062 aagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagggacggag 34979108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 36697916 - 36698162
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  36697916 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 36698015  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  36698016 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagtggtcttataaa 36698115  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698116 aagggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 36698162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 40300482 - 40300236
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  40300482 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 40300383  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  40300382 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 40300283  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||         |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40300282 aagggacaaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattagggacggag 40300236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 157; E-Value: 4e-83
Query Start/End: Original strand, 99 - 390
Target Start/End: Original strand, 41803208 - 41803500
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||| |||| | |||||| |||||||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41803208 atactacctctgtcctttattataggaccattttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 41803307  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatg--tataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41803308 tacaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtatataataaataggggcatgta 41803407  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgg 390  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41803408 tgtaaagaaataattattatagttgaaaataataaaggggtcttataaaaa-ggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgg 41803500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 146 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 9998539 - 9998303
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||  | |||||||||||||    
T  9998539 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattatttttacaattttatcctttaagagagagggatgaataatgttttcaacat 9998440  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| ||||||| ||||    
T  9998439 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaagggtcttgtaaa 9998340  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||    
T  9998339 aagggacaaataaaattctcaaaagggtcttataatt 9998303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 99 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 43280001 - 43279712
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43280001 atactacatccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 43279902  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43279901 tacaattttatccttt--aagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaata-gggcatgtatg 43279805  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43279804 taaagaaataattaatgtagtaggaaatagtaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttacaattagggacgga 43279712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 1275518 - 1275764
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  1275518 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 1275617  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  1275618 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatatagttggaaataacaaaggggtcttataaa 1275717  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1275718 aagggacaaaaaaaattatcaaaagggtcttataattagggatggag 1275764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 6387577 - 6387331
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  6387577 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 6387478  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  6387477 tttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaagaggtcttataaa 6387378  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  6387377 aagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattagagacggag 6387331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 36646422 - 36646668
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||| |||||    
T  36646422 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgtttttaacat 36646521  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  36646522 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 36646621  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36646622 aagggacaaaaagaattctcaaaagggtcttctaattagggacggag 36646668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 39197970 - 39197724
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  39197970 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 39197871  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||||||    
T  39197870 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagagtcttataaa 39197771  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39197770 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 39197724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 8612360 - 8612597
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  8612360 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 8612459  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  8612460 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 8612559  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||       ||||||||||||||||||||||||    
T  8612560 aagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataatta 8612597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 140 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30895818 - 30895606
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||    
T  30895818 taacaggaattaagataatggatatttgtattaaatatgttcgtaattactattgtttttacaaatttatccttcaaaagagagagttggtttatgtttt 30895719  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  30895718 caacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtct 30895619  T
Q  340 tataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||    
T  30895618 tataaaaagggac 30895606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 152; E-Value: 4e-80
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 4857107 - 4856812
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnnta---acatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||       ||   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4857107 tactacctccgtccctaattataggaccattttggaaaaatattaacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatatttgtaattactattgtt 4857008  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4857007 tttacaattttatcctttaagagagatggttggtttaggttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataggggaatgta 4856908  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||        ||||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  4856907 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaagatattataattagggacggag 4856812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 100 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26843069 - 26842828
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||  ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26843069 tactacctccgtccctaattataggactcttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26842970  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttt-------tcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 292  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26842969 acaattttatcctttaagaaagagggttggtttatgttttcaagtttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggca 26842870  T
Q  293 tgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaagg 334  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26842869 tgtatggaaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaagg 26842828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 349
Target Start/End: Original strand, 30737745 - 30738001
Alignment:
Q  94 acattatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactatt 193  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||       ||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30737745 acattatactatctccgtccttaattataaggtcattttaaaaaaataacgggaactaagatagtagatatttgtattaaatacgtttgtaattactatt 30737844  T
Q  194 gtttttacaattttatcctttaa-----aaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30737845 gtttttacaattttatcctttaagaaaaaaaagagggttggtttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 30737944  T
Q  289 ggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    |    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  30737945 g----gtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgggtcttataaaaagg 30738001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 29285822 - 29286068
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  29285822 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttagaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 29285921  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  29285922 gttatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagggtcttataaa 29286021  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29286022 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 29286068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 384
Target Start/End: Original strand, 29642929 - 29643166
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  29642929 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatat 29643028  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  29643029 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaata-acaaggggtcttataaa 29643127  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  29643128 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattag 29643166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 33858652 - 33858897
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  33858652 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 33858751  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| | || ||||||||||||    
T  33858752 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatcaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaa 33858850  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33858851 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 33858897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21295449 - 21295157
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| | ||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  21295449 atactccctccgtccctaattataagaactttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 21295350  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295349 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 21295251  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295250 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 21295157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 381
Target Start/End: Original strand, 29064242 - 29064477
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  29064242 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgaaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 29064341  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29064342 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 29064441  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataat 381  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||    
T  29064442 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataat 29064477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 147; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 100 - 384
Target Start/End: Original strand, 47323268 - 47323552
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47323268 tactacctccgtccctaattatagggtctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgttttt 47323367  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  47323368 acaattttatcctttaagagagagggttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgt 47323467  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||| | | ||||||||||||||        |||||||||| |||||||||||||    
T  47323468 aaagaaataattaatgtagttgaaaataagaaagagattttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattag 47323552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 7607419 - 7607663
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  7607419 gaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagagtgttggtttatgttttcaacat 7607518  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||| ||||| |||||    
T  7607519 attatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattcatgcagttggaaatagcaaagaggtctcataaa 7607618  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        || |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7607619 aagggacgaaaaa--ttatcaaaagggtcttatatttagggacggag 7607663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 110 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 10475989 - 10475751
Alignment:
Q  110 gtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10475989 gtccctaattataagacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat 10475890  T
Q  210 cctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 309  Q
    ||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  10475889 cctttaagagagagtattggtttatgttttcaacatgtcatttattgctaattgaagaaaaagatgtataatatatagggtcatgtatgtaaataaataa 10475790  T
Q  310 ttaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  10475789 ttaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaag 10475751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 11647621 - 11647864
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||| ||    
T  11647621 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaatat 11647718  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11647719 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 11647818  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11647819 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacgga 11647864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32814685 - 32814439
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||||||||||||    
T  32814685 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaaaaatgttagtttatgttttcaacat 32814586  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  32814585 attatttattattgattgaagaaaaagatgtataataaatagggtcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgggtcttataaa 32814486  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32814485 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 32814439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1575016 - 1574725
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1575016 atactacctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 1574917  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| || ||||||| | ||||||||||||||||    
T  1574916 tacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaataatatgtatatttaataggggcatgtatg 1574819  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||       ||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  1574818 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttataaaaagggacacattttttttttaaaagggtcttataattagggacggag 1574725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 31200149 - 31200394
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  31200149 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 31200248  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  31200249 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 31200348  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  31200349 aagggacaaaaaaaattctcaaaagaggcttataattaggaacgga 31200394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 788185 - 787979
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||||||    
T  788185 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaggagagagggttgatttatgttttcaacat 788086  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  788085 attatttattgctgattgaagaaaaagaagtataataaataagggcatgtatgtaaaaaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaa 787986  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  787985 aagggac 787979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7449520 - 7449276
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | || | |||||||||||||||    
T  7449520 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcctttaagaaaaatg-ttagtttatgttttcaacat 7449422  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7449421 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 7449322  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7449321 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaatggtcttataattagggacggag 7449276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 98 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19920860 - 19920569
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19920860 tatactccttccgtccctaattataggacctttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattattt 19920761  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||   |||  |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19920760 ttaca-ttttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaacatgatatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgcat 19920664  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19920663 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggaacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 19920569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 26255347 - 26255102
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  26255347 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactaatgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 26255248  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||  |||||||||||    
T  26255247 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaatggtcttataaa 26255148  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26255147 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 26255102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44547678 - 44547432
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  44547678 gaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaagttagtttatgttttcaacat 44547579  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| | |||||||||    
T  44547578 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaa 44547479  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44547478 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataattagggacggag 44547432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 149 - 392
Target Start/End: Original strand, 18112955 - 18113197
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||  |    
T  18112955 ttaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatgtt 18113054  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||||||    
T  18113055 atttaatgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaagggttttataaaaag 18113154  T
Q  349 ggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||       ||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18113155 ggacaatttttttt-tcaaaagggtcttataattagagacggag 18113197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 42298213 - 42298457
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||    
T  42298213 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttataattactattatttttacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacat 42298310  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||    
T  42298311 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaaggggtcttatgaa 42298410  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42298411 aagggacaaaaaaaattcacaaaagggtcttaaaattagggacggag 42298457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Original strand, 7703606 - 7703810
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  7703606 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaggaaagaaggttag-ttatgttttcaacat 7703704  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  7703705 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 7703804  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  7703805 aaggga 7703810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 17491767 - 17491529
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  17491767 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 17491668  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  17491667 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 17491568  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||    
T  17491567 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattag 17491529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 384
Target Start/End: Original strand, 17561447 - 17561685
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  17561447 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttataatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 17561546  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  17561547 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 17561646  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||    
T  17561647 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattag 17561685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 41252147 - 41252392
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| || | |||||||||||| ||    
T  41252147 gaattaagatagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaataagg-ttagtttatgttttcaagat 41252245  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||    
T  41252246 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaaggggtcttataaa 41252345  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41252346 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 41252392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48521278 - 48521035
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  48521278 gaattaagatagtggatatttgcattaaagttatttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 48521179  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||||||||||    
T  48521178 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaa 48521079  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||  |         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48521078 aagtaa---aaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 48521035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 21870121 - 21870358
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  21870121 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaacat 21870220  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |    
T  21870221 gttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataga 21870320  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    | |||||        |||| ||||||||||||||||||    
T  21870321 aggggacaaaaaaaattcttaaaagggtcttataatta 21870358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 140 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 38736707 - 38736499
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |  || |||||  |||||||||    
T  38736707 taacaggaattaagatagtggacatttgtattaaatatgtttgtaattatcattgtttttacaattttattctttaaga--gaaggttgatttatgtttt 38736610  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtct 339  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  38736609 caacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaa-gagtct 38736511  T
Q  340 tataaaaaggga 351  Q
    ||||||||||||    
T  38736510 tataaaaaggga 38736499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 26736784 - 26736526
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||       |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26736784 tactacctccatccctaattataagacccttttgaaaaaataatgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 26736685  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagaggg------ttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 293  Q
    |||||| ||||||| || | |||| |      |||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26736684 acaattatatccttgaagagagagagagagagttggtttatgttttcaacatgttttttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcat 26736585  T
Q  294 gtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  26736584 gtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaatgagtcttataaaaagggac 26736526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45907495 - 45907251
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||| ||| ||    
T  45907495 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgtttccaatat 45907398  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  45907397 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatacatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaataataaaggggtcttataaa 45907298  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45907297 aagggacaattttttttttcaaaagggtattataattagggacggag 45907251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 2006727 - 2006522
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  2006727 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 2006628  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | | ||||||||    
T  2006627 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatgagccttataaa 2006528  T
Q  346 aaggga 351  Q
    ||||||    
T  2006527 aaggga 2006522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 38858549 - 38858304
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||  | ||    
T  38858549 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttcgtttatgtttttcatat 38858451  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  38858450 gttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 38858351  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858350 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 38858304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 133; E-Value: 9e-69
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 36711085 - 36711329
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||||||||||||     
T  36711085 aattaaaatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggtcagtttatgttttcaacatg 36711184  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  36711185 ttatttattgttgattgaa-aaaaaaatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaa 36711283  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||         ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36711284 agggaaaaaaataattctcaaaagggtcttataattaggaacggag 36711329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 32759855 - 32759562
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32759855 atactccctccgtccctaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatggtggatatttatattaaatatgtttgtaattagtattgtttt 32759756  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | |||    ||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32759755 tacaattttatcctttaagagagaaa--tgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 32759658  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt--ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||       |  || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32759657 taaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaatttttttcttttcaaaaaggtcttataattagggacggag 32759562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 100 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 41444500 - 41444211
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||       ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41444500 tactacctccgtccctaattataagatccttttgaaaaaataacgggaattgagatattggatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgttttt 41444401  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||| |||||  || || | |||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||||| |  || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41444400 acaaatttattattcaagagagagtgttagtttatgttttcaacatgttatttattgctggtataataaaaagatgaataataaataagggcatgtatgt 41444301  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41444300 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagtgacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagagacg 41444211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 140 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 12130304 - 12130133
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgtttt 239  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||| ||||| |||||||||    
T  12130304 taacgtgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaatg--atcctttaagagagagagttggtttatgtttt 12130207  T
Q  240 caacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12130206 caacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 12130133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Original strand, 29176989 - 29177283
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  29176989 ttatactccctccgtctctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtt 29177088  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgta 296  Q
    ||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29177089 tttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgttacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcgtgta 29177187  T
Q  297 tgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29177188 tgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaatattctcaaaaggatcttataattagggacggag 29177283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 41002940 - 41003185
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| | | | |||||||||| | ||    
T  41002940 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagatagtttatgttttccatat 41003038  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||| || |||||||||    
T  41003039 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaatggatcttataaa 41003138  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41003139 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 41003185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 43093194 - 43093440
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| |||| ||||||||||     
T  43093194 aattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattataattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatattttcaacatg 43093293  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| | || ||||||||    
T  43093294 ttatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataactaatgtagttggaaatagcaaatgagttttataaaa 43093393  T
Q  347 agggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43093394 agggacaaaaaatttttctcaaaagggtcttataattaggggcggag 43093440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 352
Target Start/End: Original strand, 6799285 - 6799535
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6799285 tactacctccgtcccaaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 6799384  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   | | ||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6799385 acaattttatcctttaagagagaga--tagtttatgctttcaacatattatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatatatgt 6799482  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  6799483 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 6799535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 192 - 392
Target Start/End: Original strand, 46414835 - 46415036
Alignment:
Q  192 ttgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-aaaaagatgtataataaatagggg 290  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  46414835 ttgtttttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattctattttttgctgattgaagaaaaaagatgtataataaataggag 46414934  T
Q  291 catgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgg 390  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||| |||         ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46414935 catgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaatgagtcttataaaaaaggataaaaataattctcaaaatggtcttataattagggacgg 46415034  T
Q  391 ag 392  Q
    ||    
T  46415035 ag 46415036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 23920028 - 23919738
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  ||||       ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23920028 tactacctccgtccctaattatagggctcttttgaaaaaataacgggaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 23919929  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||| ||||| | | ||   ||| |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23919928 acaattttatcttttaagagaaaga--tggtttatgttttcaacatattatttattgttgatggaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 23919831  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||||| ||       ||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23919830 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaagagtcttataaaaaggaacaaatatttttttcaaaagggttttataattagggacggag 23919738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 146 - 312
Target Start/End: Original strand, 24299989 - 24300155
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  24299989 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaaaagagagggttggtttatgttttcaacat 24300088  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 312  Q
      ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  24300089 gttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggtatgtatgtaaagaaataatta 24300155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 98 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 23364314 - 23364064
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23364314 tatactatctccgtccctaattatagggccctttttaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttatattaaatatatttgtagttactattgttt 23364215  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||| |||||||||||| | |||  ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  23364214 ttacaaatttatcctttaagagagaaagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgatcgaagaaaaagatgaataataaataagagcatgtat 23364115  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| || ||||||||||||    
T  23364114 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaatggatcttataaaaag 23364064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 146 - 383
Target Start/End: Original strand, 47657451 - 47657686
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||   |||  |||||||||||||||    
T  47657451 gaattaagatagtggatatttatattaaatatatttataattactattgtttttacaattttatcttttaagacagaa--ttgatttatgttttcaacat 47657548  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  47657549 gatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaa 47657648  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
    |||||||        ||||||||| |||||||||||||    
T  47657649 aagggacaaaaaaaattctcaaaaaggtcttataatta 47657686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 25951083 - 25950837
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | || | |||||||||||||||     
T  25951083 aattaagatagtggatatttgtattaacgttatttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagatgattagtttatgttttcaacatg 25950984  T
Q  247 ctatttattgctgattgaaga--aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
     ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  25950983 ttatttattgctaattgaagaaaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggatatagcaaaggggtcttataa 25950884  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25950883 aaagggacaaaaaaa-ttctcaaaaaggtcttataattaaggacggag 25950837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9299352 - 9299103
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaaaagagggttggcttatgttttcaa 242  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||| ||| | |||||||||| |    
T  9299352 gaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttcca 9299253  T
Q  243 cattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat 342  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  9299252 tatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggacttat 9299153  T
Q  343 aaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||        ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  9299152 aaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagtatcttataattagggacggag 9299103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 98 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23109367 - 23109140
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  23109367 tatactacctccgtccctaattataggaccctattgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaatttttt 23109268  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||| ||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  23109267 ttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataaggacatatat 23109168  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaa 325  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  23109167 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaa 23109140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 19619284 - 19619080
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||| ||||||     
T  19619284 aattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaaatactattgtttttacaattttatcctttaagagagagggttggtttatatttgcaacatg 19619185  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||  |||    
T  19619184 ttatttgttgctaattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaaaaaataattaatgtagttggaaattgcaaa-gggtcttaagaaa 19619086  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  19619085 agggac 19619080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 100 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 17327169 - 17326956
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||  ||||||||||||||       | ||  ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  17327169 tactccctccgtccctatatataagaccattttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaggttgtttgtaatcactattgttttt 17327070  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17327069 acaattttatcctttaagaaagaaggttaatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 17326970  T
Q  300 aaagaaataattaa 313  Q
    ||||||||||||||    
T  17326969 aaagaaataattaa 17326956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 98 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28061016 - 28060766
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | |   ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  28061016 tatactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcatgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttt 28060917  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| | |||||||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28060916 ttacaattttatcctt-aagaaagagagttagtttatgttttccatatgctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtag 28060818  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| | || |||||||||||||||||    
T  28060817 gtaaagaaataattaatgtagttggaaata-acaaagggtcttataaaaaggg 28060766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 146 - 328
Target Start/End: Original strand, 44780178 - 44780358
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||  |||||||||||||||    
T  44780178 gaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcttttaagagagagggttgatttatgttttcaacat 44780277  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatag 328  Q
      |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44780278 gttatttattgctgattga--aaaaaaatctataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatag 44780358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 7400383 - 7400135
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa---agagggttggcttatgttttcaa 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |   |||  ||||| |||| |||||||    
T  7400383 gaattaagatagtggatatttgcattaaagttgtttgtaatccttattgtttttacaattttatcctttaattagagagaaagttggtttatattttcaa 7400284  T
Q  243 cattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat 342  Q
    |||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  7400283 catgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggagtcttat 7400184  T
Q  343 aaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||       |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7400183 aaaaagggacaattttttttc-caaaaggatcttataattagggacggag 7400135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 100 - 384
Target Start/End: Original strand, 9036669 - 9036952
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  9036669 tacttcctccgttcctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgtatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 9036768  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9036769 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaattgtagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 9036867  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||| |||||||||    
T  9036868 aaacaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcctataattag 9036952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9303901 - 9303652
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatccttta---aaaaagagggttggcttatgttttcaa 242  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |   ||| |||| ||| | |||||||||| |    
T  9303901 gaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatccttaagagaaatagagagttagtttatgttttcca 9303802  T
Q  243 cattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat 342  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  9303801 tatgctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatgtaaagaaataattaatgtagttgtaaatagcaaaggggacttat 9303702  T
Q  343 aaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||        ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  9303701 aaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagtattttataattagggacggag 9303652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 23320907 - 23320700
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  23320907 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 23320808  T
Q  246 tctatttattgctgattg----aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
      ||||||||| ||||||    || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||  ||||||||||||    
T  23320807 gttatttattgttgattgaaaaaaaaaaaagatgtataataaataaggacatgtatgtaaagaaataattgatgtagttggaaataacaaaggggtctta 23320708  T
Q  342 taaaaagg 349  Q
    ||||||||    
T  23320707 taaaaagg 23320700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 34012304 - 34012548
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  34012304 gaattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtttgtaatcaatattgtttttacaattttatcctt-aaaagagagagttagtttatgttttccatat 34012402  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| | ||||||||||    
T  34012403 gttatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataacaaataggggcttgtatgtaaagaaataattaatgtacttggaaatagcaaaagagtcttataaa 34012502  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34012503 aagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 34012548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 118; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 48009188 - 48008980
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaaga--gggttggcttatgttttcaac 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||  ||||| ||||||     
T  48009188 gaattaagatagtggatatttgtatttaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagtgagttgatttatgctttcaat 48009089  T
Q  244 attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||| |||||||    
T  48009088 atgttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtatttggaaataacaaagggttcttata 48008989  T
Q  344 aaaagggac 352  Q
    |||| ||||    
T  48008988 aaaaaggac 48008980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 3024833 - 3024583
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||    
T  3024833 gaattaagatagtgaatgtttgtattaaatatatttgtaattagtattgtttt-acaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacat 3024737  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  3024736 gttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataattaataggggcatatatgtaaagaaataattaatatagttggaaatagcaaagaagtcttataaa 3024637  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggagtaatagt 399  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  3024636 aagggacaaatttttttttcaaaagggtcttataattaaggacggggtagtagt 3024583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21119809 - 21119563
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||   || | |||||||||||||||     
T  21119809 aattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcatttaagagagataattagtttatgttttcaacatg 21119710  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata-aa 345  Q
     ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | |||||||| ||    
T  21119709 ttatttattgctaattgaagaaaacaatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtaattggaaataacaaacgagtcttataaaa 21119610  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || | ||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21119609 aaagaacataaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 21119563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Original strand, 46266161 - 46266401
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| | | |||| ||| | ||||||||||||||    
T  46266161 gaattaagatagtgaatatttgtattaaagatgtttgcaatcactattgtttttacaatttaatcctttatatatagagagttagtttatgttttcaaca 46266260  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    |  ||||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||    
T  46266261 tgatatttatagctgattgaagaagaag---tataataaataggggcttgtatgtaaaaaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataa 46266357  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    | ||||||        |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46266358 agagggacaaaaataattctgaaaagggtcttataattagggac 46266401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 151 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 41787495 - 41787302
Alignment:
Q  151 aagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctat 250  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | |||||| ||||||||| |||||  |||    
T  41787495 aagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagaa--aaggttggtttatgttttaaacatgttat 41787398  T
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||| |  |||||||||||    
T  41787397 ttattgccgattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttggaaatagcaaatgaatcttataaaaa 41787302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 110; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 44719374 - 44719133
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     ||||| ||||| |||||||||| | ||    
T  44719374 gaatgaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttataattttatcctt-----aagagagttggtttatgttttccatat 44719280  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  44719279 gctatttattgttgattgaagaaaaagatttacaataaatatgggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagacgtcttataaa 44719180  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44719179 aagggacacaaaatattctcaaaatggtcttataattaaggacggag 44719133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 31581930 - 31581683
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||| ||| | |||| ||||| | |     
T  31581930 gaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttatttgtaatcactattgtttttataattttatc-tttaagagagagagttagtttatattttccatac 31581832  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatag-aaaaggggtcttataa 344  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31581831 gttatttattgctaattgaagaaaaagatgtataataaatagggatatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaaggggtcttataa 31581732  T
Q  345 aaagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||||       |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31581731 aaaaggacaattttttttcttcaaaagggtcttataattagggacggag 31581683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 146 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 38361400 - 38361161
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |   ||| ||||| |||||||||||||||    
T  38361400 gaattaagacagtgaatatttgtgttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcattgaga---gagagttggtttatgttttcaacat 38361304  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||| ||||  ||||||||||    
T  38361303 gttatttatagctgattgaagaaaaagatatataataaatattagcatgtatgtaaagaaataattaatgtagctcgaaatagcaaagaagtcttataaa 38361204  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    |||||||        |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  38361203 aagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataattaaggac 38361161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 100 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 38428444 - 38428225
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  38428444 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 38428345  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38428344 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaacaggggcatgtatgt 38428246  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagtt 320  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  38428245 aaagaaataattaatgtagtt 38428225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 231 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17317608 - 17317447
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |    
T  17317608 ttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataaca 17317509  T
Q  331 aaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17317508 aaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 17317447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 219 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26299494 - 26299323
Alignment:
Q  219 aagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtag 318  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26299494 aagagagttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatatatgtaaagaaataattaatgtag 26299395  T
Q  319 ttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    ||  |||||| |||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26299394 ttagaaatagtaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacgga 26299323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 249 - 392
Target Start/End: Original strand, 31769220 - 31769363
Alignment:
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  31769220 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaagaggtcttataaaaag 31769319  T
Q  349 ggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31769320 ggataaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 31769363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 302
Target Start/End: Original strand, 20950824 - 20950978
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||||||||||    
T  20950824 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaacat 20950921  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaa 302  Q
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  20950922 gttatttattgcttattgaagaaaaagatgtataataaataggagcatgcatgtaaa 20950978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 146 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 16957886 - 16957729
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||  |||||||||||| ||    
T  16957886 gaattaagataatgaatatttgtattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcgttt-aaagagatggttgatttatgttttcaatat 16957788  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga 304  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16957787 gttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatatgagcatgtatgtaaaga 16957729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 148 - 352
Target Start/End: Original strand, 7400508 - 7400712
Alignment:
Q  148 attaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattc 247  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||   ||||||||||||||| |    
T  7400508 attaagaaagttgaaatttgtattgaagatgtttgtaatcactattgtttttacaagtttatcctttaaaagaaagaattaatttatgttttcaacatgc 7400607  T
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  ||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  7400608 tatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataagggtatgcaaataaagaaataattaatgcagttgaaaataacaaagaggtcttataaaaa 7400707  T
Q  348 gggac 352  Q
     ||||    
T  7400708 aggac 7400712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 146 - 341
Target Start/End: Original strand, 17878162 - 17878346
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||        
T  17878162 gaattaagatggtgggtatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttataattttatcctttaagagagagggttggtttatgttttca---- 17878257  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||  |||||  |||| |||||||    
T  17878258 ------tattgctgattgaagaaaaagatgtataataaata-gggcatgtatgtaaaaatataattaatgtagttagaaataacaaagaggtctta 17878346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 5524783 - 5524989
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||| ||||  |||||||||| | |    
T  5524783 gaattaagaaagtgaatatttgcattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttgatttatgttttccata 5524882  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    | | |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5524883 tgc-atttattgctgattaaagaaaaagatatataataaatgagggcatatatataaagaaataattaatgtagttgaaaatagaaaatgagtcttataa 5524981  T
Q  345 aaagggac 352  Q
    ||||||||    
T  5524982 aaagggac 5524989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 18751774 - 18752013
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  ||| | |||| |||||| ||||||||||||||| |||   || |||  ||||| |||||||||| | ||     
T  18751774 aattaagaaagtagatatttgtattaaagttgtatttaatcactattatttttacaattttattctt---aagagatagttggtttatgttttccatatg 18751870  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  18751871 ctatttattgttaattgaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgtaaa-aaataattaatgtagttgaaaatagcagagtggtcttataaaa 18751969  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    | ||||        |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18751970 atggacaaaaaa--ttctcaaaagagtcttataattagggacggag 18752013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 19845474 - 19845700
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa-agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa 265  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  19845474 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaa 19845573  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctc 365  Q
    |||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||| ||||       ||||||    
T  19845574 gaaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaggggtcttataaaaaaggacaaatttttttctc 19845673  T
Q  366 aaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19845674 aaaaggatcttataattagggacggag 19845700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 30534933 - 30534711
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  30534933 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 30534837  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||||       ||| |||    
T  30534836 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagggacaaattattttttca 30534737  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  30534736 aaagtgtcttataattagggacggag 30534711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 161 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 34896094 - 34895903
Alignment:
Q  161 atatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctga 260  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||||| |    
T  34896094 atatttgtattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctaa 34895996  T
Q  261 ttgaagaaaaa-gatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||    
T  34895995 ttgaagaaaattgatgtataataaataaggatatgtatgtacagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaagagatcttataaaaagggac 34895903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 42887887 - 42888111
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  42887887 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 42887985  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||  ||||  ||||||||||||||||||| |||       ||| |||    
T  42887986 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggtaataccaaaggggtcttataaaaagtgacaattttttttttca 42888085  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42888086 aaaggatcttataattagggacggag 42888111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 147 - 342
Target Start/End: Original strand, 10538917 - 10539116
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||||||||     
T  10538917 aattaagaaagttgatatttgtattaaagttgtttgtaatgactattgtttttacaattttatccttt--aatagagagttagtttatgttttcaacatg 10539014  T
Q  247 ctatttattgctgattgaa------gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtctt 340  Q
    |||||||||||||||||||       ||||| ||||| |||||||| ||| || || |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  10539015 ctatttattgctgattgaaaaaaagaaaaaaaatgtaaaataaataagggtatttaggtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtctt 10539114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 269
Target Start/End: Original strand, 27325953 - 27326076
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  27325953 gaattaaaatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaatttctattgtttttataattttatcctttaagatagagagttggtttatgttttcaacat 27326052  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaa 269  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  27326053 gttatttattgctgattgaagaaa 27326076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 88; E-Value: 6e-42
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 47534689 - 47534894
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||||||||| | ||    
T  47534689 gaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcattgttgtttttacaattttatcctt---aagagagagttattttatgttttccatat 47534785  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaac----gtagttgaaaatagaaaaggggtctta 341  Q
      ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||| ||| |||| |||    
T  47534786 gttatttattgctaattgaagaaaaa-atgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaattaatgtagttgaaaatagcaaa-gggtttta 47534883  T
Q  342 taaaaagggac 352  Q
    |||||||||||    
T  47534884 taaaaagggac 47534894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 251 - 392
Target Start/End: Original strand, 12616273 - 12616414
Alignment:
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggg 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12616273 ttattgctgattgaagaaaaagatgaataataaataagggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaagggatcttataaaaaggg 12616372  T
Q  351 acnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |         ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12616373 atcaaaaaaattctcaaaagggtcttataataagggacggag 12616414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 146 - 282
Target Start/End: Original strand, 21870877 - 21871013
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  21870877 gaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattacaattgtttttacaaatttatccttcaagagagagagttggtttatgttttcaacat 21870976  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
      ||||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  21870977 gttatttatcgttgattgaagaaaaagatgaataata 21871013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 148 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 27813749 - 27813502
Alignment:
Q  148 attaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattc 247  Q
    ||||||| |||||||  | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||      
T  27813749 attaagaaagtggattgtagtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataa 27813651  T
Q  248 tatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| | ||  ||||||||||||||||  || |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27813650 tacttattgttgattgaggaaaaagatgtaaaataaataagggtaggttggtaaagaaataattaatatacttgaaaatatcaaaggggtcttataaaaa 27813551  T
Q  348 gggacnnnnnnnt----ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||       |    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27813550 gggacaatttttttttcttttcaaaagggtcttataattagggacggag 27813502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 29630015 - 29629722
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||       | ||  ||||||||| |||| || |||||||||||  |||||||||| || ||||||    
T  29630015 ttatactacctccgttcctatatataagaccattttgctaaaattacgggaattaagaaagtgaatgtttgtattaaagttgtttgtaatcacaattgtt 29629916  T
Q  197 tttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaac----attctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggca 292  Q
    ||| |||||||||||||   ||||||| ||||  |||||||||| |     || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |     
T  29629915 tttgcaattttatcctt---aaaagagagttgatttatgttttccatccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggac- 29629820  T
Q  293 tgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc-tcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
       |||||||||||||||||  |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||       |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  29629819 ---atgtaaagaaataattattgtagttgaaaataacagagggatcttataaaaagggacaattttttttcttcaaaaggttcttataattagggacgga 29629723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 247 - 352
Target Start/End: Original strand, 10071260 - 10071365
Alignment:
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  10071260 ctatttattgctgattcaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaatagcaaataggtcttataaaa 10071359  T
Q  347 agggac 352  Q
    ||||||    
T  10071360 agggac 10071365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 265
Target Start/End: Original strand, 32118010 - 32118127
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || |||| ||||| |||||||||||||||    
T  32118010 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttattacaattttatccttt--aagagagagttggtttatgttttcaacat 32118107  T
Q  246 tctatttattgctgattgaa 265  Q
      ||||||||| ||||||||    
T  32118108 gttatttattgttgattgaa 32118127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 225 - 352
Target Start/End: Original strand, 9233440 - 9233567
Alignment:
Q  225 gttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaa 324  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||| ||    
T  9233440 gttggtttatgttttcaacatgttatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagggacatatacgtaaataaataattaatgtagttggaa 9233539  T
Q  325 atagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| | |||||||||||||||||    
T  9233540 atagcaaatgagtcttataaaaagggac 9233567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 100 - 236
Target Start/End: Original strand, 33381358 - 33381494
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33381358 tactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgcatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 33381457  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgt 236  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||    
T  33381458 acaattttatcctttaagagagatggttggtttatgt 33381494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 45778005 - 45778253
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||| | | ||  || | |||||||||||||||     
T  45778005 aattaagaaagttgaaatttgtattaaagatgtttgtaatcactattatttttataattttatcttttaagagaaagaattagtttatgttttcaacatg 45778104  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag----gggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttat 342  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||     ||| ||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  45778105 ctatttattgttgattgaagaaaat-atgtataataaataaataagggtatgcaagtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttat 45778203  T
Q  343 aaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||        |||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  45778204 aaaaagggactaaaaacattctcaaaattgtcttataattaggaacggag 45778253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 31802929 - 31803151
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||| | |||||||||||||||  ||||||||| | ||| |||    
T  31802929 gtattaaatttgtttataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttagtttatgttttcaacataatatttattgtttattaaag 31803025  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||  || ||| |||||| ||||  |||||||||||  ||||        ||||||    
T  31803026 aaaaagatgcaaaataaataggggtatggaggtaaagaaataattaatataattggaaatagcaaagcagtcttataaaagtggacaaaaaaaattctca 31803125  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||    
T  31803126 aaaagatcttataattagggacggag 31803151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 9682831 - 9682608
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||    
T  9682831 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttatcgttgattgaag 9682733  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  9682732 aaaaa-atgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 9682634  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  9682633 aaagagtcttataattagggacggag 9682608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 49044927 - 49045151
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  49044927 gtattaaatttgtatacaattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 49045025  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||||||| | ||||| || ||| || |  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||       ||| |||    
T  49045026 aaaaagatgcaaaataattaagggtatattggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaagaggtcttataaaaagggacaaattattttttca 49045125  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||| |||||||    
T  49045126 aaagggtcttataattagagacggag 49045151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 155 - 326
Target Start/End: Original strand, 2470870 - 2471041
Alignment:
Q  155 tagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttat 254  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |  ||| ||||  || ||||||||||||  || ||||    
T  2470870 tagtggatatttgtattaaatatatttataattactattgtttttataatattatcctttaagagtgagagttgatttctgttttcaacatgttacttat 2470969  T
Q  255 tgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat 326  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||  || || |||| |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  2470970 tgctaattaaagaaaaagatgtataataaataaaggtatatatgaaaagaattaattaatgtagttggaaat 2471041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 76; E-Value: 9e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 392
Target Start/End: Original strand, 44510168 - 44510374
Alignment:
Q  184 aattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||    
T  44510168 aattactattgtttt-acaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataa 44510265  T
Q  284 ataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatta 383  Q
     || ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||       ||| |||||| |||||||||||||    
T  44510266 gtaagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaatggtcttataatta 44510365  T
Q  384 gggacggag 392  Q
    |||||||||    
T  44510366 gggacggag 44510374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Original strand, 32964218 - 32964386
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||  ||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  32964218 taattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagaattaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaata 32964316  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  32964317 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaaggactcttataaaaagggac 32964386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 190 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 19293045 - 19292845
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | |||  |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| ||    
T  19293045 tattgtttttacaattttattctt-aagagagatagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaagatgcaaaataaataagg 19292947  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacg 389  Q
    | ||||  |||||||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||||||||||||||||||       |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19292946 gtatgttagtaaagaaataattaatgtacttagaaatactaaaggggtcttataaaaagggac-aatttttttctcaaaaggatcttataattagggacg 19292848  T
Q  390 gag 392  Q
    |||    
T  19292847 gag 19292845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 188 - 327
Target Start/End: Original strand, 3796058 - 3796197
Alignment:
Q  188 actattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatag 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||   ||||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  3796058 actattgtttttacaattttatcttttaaaagagagaattaatttatgtttttaacatattatttattgctgatggaagaaaaagatgtaaaataaatag 3796157  T
Q  288 gggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     || |||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||    
T  3796158 aggtatgtatgtaaagaaataattaatgtaattggaaata 3796197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 22991531 - 22991735
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| ||| |  ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  22991531 gaattaagaaagttggaattagtattaaatttgtttataattactattgtttttaca-ttttatccta-aagagagagagttagtttatgttttcaacat 22991628  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| || |||||||||    
T  22991629 aatatttattgttgatcgaagaaaaagatgcaaaataaataggggtatggtgataaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaatggatcttataaa 22991728  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  22991729 aagggac 22991735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 189 - 390
Target Start/End: Original strand, 24210979 - 24211177
Alignment:
Q  189 ctattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaatagg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| | |||| |||||||| || ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  24210979 ctattgtttttacaattttatc--ttaaaaaagagagttagtttatattttcaac-ttgtatttattgttgattaaaaaaaaagatgtataataaatcgg 24211075  T
Q  289 ggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    || |||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||  |||| | |||||||||||| ||          |||||||||||||||||||||| ||||    
T  24211076 ggtatgtagataaagaaataattaatgtagtttaaaataacaaagagatcttataaaaagagataaaaaaaaatctcaaaagggtcttataattaaggac 24211175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Original strand, 32699513 - 32699695
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||   || |||| ||||  ||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||    
T  32699513 gtattaaatttgtataaaattattattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaag 32699609  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  32699610 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaatatcaaaggggtcttataaaaagggac 32699695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 35888540 - 35888318
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  35888540 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 35888444  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||  ||| |||||  |||  | ||||||||||||||||       ||| |||    
T  35888443 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgttcttggaaataccaaaatgctcttataaaaagggacaaattattttttca 35888344  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||    
T  35888343 aaaaggtcttataattagggacggag 35888318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 40120994 - 40121289
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||       ||||  ||||||||| | | |||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40120994 tactacctccgtctctaattatagggcccttttggaaaaataacgggaattaagaaaattgatagtggtaataaatttgtttgtaattactattgtattt 40121093  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat--aataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||| | ||||   | | |||||||||||||||  |||||| |   |||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||      
T  40121094 acaattttatcctttaagagagagaaatagtttatgttttcaacatagtatttaatatcgattgaagaaaaagatatataaaataaataggggaatgtcg 40121193  T
Q  298 gtaaaga-aataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| | ||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||||||||||| ||        | ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40121194 gtaaaaataataattaatgtacttggaaatactaaaggggtcttataaaaagagaattttttttctctcaaaagggttctataattagggacggag 40121289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 24504914 - 24504731
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||   |||| |||   || | ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  24504914 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagcgagagagttaatttctattttcaacataatatttattgttgattgaag 24504816  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  24504815 aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagagtcttataaaaaggga 24504731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 45722237 - 45722054
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||     
T  45722237 gtattaaatttgtatataattaccattatttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaaa 45722139  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||    
T  45722138 aaaaagatgcaaaataaataagggtgtgttagtaaagaaataattaatgtacttgaaaataccaaagagatcttataaaaaggga 45722054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 167 - 391
Target Start/End: Original strand, 2345350 - 2345573
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| ||  ||   |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||    
T  2345350 gtattaaatttgtatataattaatattgtttttacaattttatccttaagaaaa-agaattaatttatgttttcaacataatatttattattgattgaag 2345448  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||| || | |||||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||| ||| |||||  ||| | ||||| |||||||| ||       ||| |||    
T  2345449 aaaaaggtgcaaaataaataagggtatgtttgtaaataaataattaatgtatttggaaatatcaaatgagtcttttaaaaaggaacaaattattttttca 2345548  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  2345549 aaagagtcttataattagggacgga 2345573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 61; E-Value: 8e-26
Query Start/End: Original strand, 147 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21587658 - 21587534
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| | | ||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||  || | |||||||||||||||     
T  21587658 aattaagaaaattgatatttatattaaatttgtttgcaattactattgtttttacaattttattttttaaaagagagaatttgtttatgttttcaacatg 21587559  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaa 271  Q
     ||||||||| ||||||||||||||    
T  21587558 ttatttattgttgattgaagaaaaa 21587534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 281 - 392
Target Start/End: Original strand, 33381494 - 33381604
Alignment:
Q  281 taaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataa 380  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||    
T  33381494 taaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-atctcaaaagggtcttataa 33381592  T
Q  381 ttagggacggag 392  Q
    ||||||||||||    
T  33381593 ttagggacggag 33381604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 140 - 213
Target Start/End: Original strand, 12616190 - 12616263
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12616190 taacaggaattaagatagtggatatttatattaaatatgtttgtaattactaatgtttttacaaatttatcctt 12616263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 12631620 - 12631847
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa---aaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg 263  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||| |||||||| | |   |||||  ||| | |||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  12631620 gtattaaatttgtttatgattactattgttcttgcaatgttatccttaagagagaaagatagttagtttatattttcaacataatatttattgttgattg 12631719  T
Q  264 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttc 363  Q
    |||||||||||| | |||||||||| | |||   |||||||||| ||||| ||| |||||||||  |||  |||||||||||||||||        ||||    
T  12631720 aagaaaaagatgcaaaataaataggagtatggtggtaaagaaatgattaatgtaattgaaaataccaaattggtcttataaaaaggga-taatttttttc 12631818  T
Q  364 tcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  12631819 tcaaaatggtcttataattaaggacggag 12631847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 147 - 327
Target Start/End: Original strand, 49110813 - 49110993
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| | || | | |   ||||||||| |||||     
T  49110813 aattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgattttacaattttatcacttaagagagtgagctattttatgtttttaacatg 49110912  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaaga-aataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     ||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  49110913 ttatttattgccaattgaagaaaa-gatgtataataaatagggatatgtaagtaaaaataataattaatgtagttgaaaata 49110993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 167 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 3776059 - 3775870
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3776059 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaatattatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 3775961  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata------attaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    ||||||||  | |||||||| ||| || |  |||||||||||      ||||| ||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||    
T  3775960 aaaaagatacaaaataaataagggtatattggtaaagaaataaattatattaatgtacttgaaaataccaaagaggtcttataaaaaggga 3775870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 190 - 349
Target Start/End: Original strand, 3881371 - 3881529
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    ||||||||||| |||||||||||| || | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||    
T  3881371 tattgtttttaaaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaataaaaagatgtaaaataaataagg 3881469  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagg 349  Q
    | ||||  ||||| |||||||  | ||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  3881470 gtatgttggtaaaaaaataatctatgtacttgaaaatatcaaaggagtcttataaaaagg 3881529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28017170 - 28017051
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    ||||||||||| ||  |||||| || |||||||||||||    
T  28017170 taaatttgtttgtaattgctattgtttttataattttatccgttaagaaagagggttaatgtatgttttcaatataatatttaatgttgattgaagaaaa 28017071  T
Q  271 agatgtataataaatagggg 290  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  28017070 agatataaaataaatagggg 28017051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 385
Target Start/End: Original strand, 8782033 - 8782237
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa---agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtata 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |   |||| ||    ||| |||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | |    
T  8782033 taattactattgtttttacaattttatccttaagagagagagagagtaaatttaagttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaa 8782131  T
Q  280 ataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttata 379  Q
    |||||||  || ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||||||||    
T  8782132 ataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgtatttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttcaaaagggtcttata 8782231  T
Q  380 attagg 385  Q
    ||||||    
T  8782232 attagg 8782237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 231 - 348
Target Start/End: Original strand, 3478821 - 3478938
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    ||||||||| |||||  ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  3478821 ttatgtttttaacatagtatttattgttgattgaataaaaagatataaaataaataggggtatgttagtaaagaaataattaatgtagtttaaaatacaa 3478920  T
Q  331 aaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||| | || |||||||||    
T  3478921 aagagatcatataaaaag 3478938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 352
Target Start/End: Original strand, 23801990 - 23802173
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  23801990 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 23802088  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| ||| | |||||||| |||  |||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  ||| || ||||||||||||||||    
T  23802089 aaaaa-atgcaaaataaatatgggtgtgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaaggatcttataaaaagggac 23802173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 183 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 37915356 - 37915156
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||    
T  37915356 taattactattgtttttacaattttatccttaagagaa-agagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaaa-atgcaaaata 37915259  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataatt 382  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| |  ||| | ||||||||||| |||||       ||| | |||||||||||||||||    
T  37915258 aataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaacatcaaatgagtcttataaaaggggacaaattattttattaaaagggtcttataatt 37915159  T
Q  383 agg 385  Q
    |||    
T  37915158 agg 37915156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21135478 - 21135371
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||| |||   |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  21135478 gtattaaatttgtatgtaattaccattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagagttaatttatgttttcaacataatatttattgttgattgaag 21135380  T
Q  267 aaaaagatg 275  Q
    |||||||||    
T  21135379 aaaaagatg 21135371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 170 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 33682938 - 33682720
Alignment:
Q  170 ttaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaa 269  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||   || |||| ||    |||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||    
T  33682938 ttaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt---aagagagagtaaatttatgttttcaatataat-tttattgttgattgaagaaa 33682843  T
Q  270 aagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaat-agaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaa 368  Q
    || ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| |||||||  |  |||||||||||||||||||||||       ||| | |||    
T  33682842 aa-atgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttgaaaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattatttttttaaa 33682744  T
Q  369 agggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||  |||||||    
T  33682743 agggtcttataattatagacggag 33682720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20075147 - 20075031
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| |||| |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  20075147 ttatactccctccgtccctaattataagacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtgaatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtt 20075048  T
Q  197 tttacaattttatcctt 213  Q
    |||||||||||||||||    
T  20075047 tttacaattttatcctt 20075031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 183 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 43934803 - 43934637
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||    
T  43934803 taattacaattgtttttacaattttatcc-ttaagagagagggtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaagaaaa--atgcaaaata 43934707  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  ||||  |||||||||||||||||    
T  43934706 aataagggtatgttagtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaagatgtcttataaaaagggac 43934637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 167 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 19497475 - 19497292
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaa---agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattg 263  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |   |||  ||  | |||||||||||| ||  || |||||| |||||     
T  19497475 gtattaaatttgtttataattcctattgtttttacaattttatccttaagagagagagaaagtcagtttatgttttcaatatagtacttattgttgattt 19497376  T
Q  264 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaa 347  Q
    ||| |||||||| | || ||||||||| || |  |||||||||||||||| ||| |||||||||  |||||| |||||||||||    
T  19497375 aagtaaaagatgcaaaacaaataggggtatcttagtaaagaaataattaatgtaattgaaaatatcaaagggatcttataaaaa 19497292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 225 - 308
Target Start/End: Original strand, 32811295 - 32811378
Alignment:
Q  225 gttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaata 308  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||    
T  32811295 gttggtttatgttttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaata 32811378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 313
Target Start/End: Original strand, 33683007 - 33683136
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataata 282  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| || | |||| |||   ||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||    
T  33683007 taattaatattgcttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatgttttcaacctaatatttattgttgattgaagaaaatgatgcaaaata 33683105  T
Q  283 aataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    |||| ||| ||||  ||||||||||||||||    
T  33683106 aataagggtatgttggtaaagaaataattaa 33683136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 178 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 32526134 - 32526001
Alignment:
Q  178 gtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgta 277  Q
    ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||  |||||| || |||  ||||||||| |||||    
T  32526134 gtttgaaattactcttatttttacaattttgtcctttaaaaaaaagggttagtttatattttcaacatagtatttagtgttgacggaagaaaaa-atgta 32526036  T
Q  278 taataaataggggcatgtatgtaaagaaataatta 312  Q
     ||||||||  |  ||||  |||||||||||||||    
T  32526035 aaataaataaagatatgttggtaaagaaataatta 32526001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 264 - 392
Target Start/End: Original strand, 32643658 - 32643788
Alignment:
Q  264 aagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnnt--t 361  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  |||   |||||||||||||||||       |  |    
T  32643658 aagaaaaagatgtaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaatatgtcttataaaaagggacaatttttttct 32643757  T
Q  362 tctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32643758 tctcaaaagggtcttataattaggaacggag 32643788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 213
Target Start/End: Original strand, 34900775 - 34900832
Alignment:
Q  156 agtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34900775 agtggatatttgtattaaaattgtttgtaatcactgttgtttttacaattttatcctt 34900832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 179 - 286
Target Start/End: Original strand, 20182099 - 20182204
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | ||||  || |  ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| || ||     
T  20182099 tttgtaattactattgtttttacaatcttatcctt--acagagagatttagtgtatgttttcaacataatatttattgttgattgaagaaaaatatatag 20182196  T
Q  279 aataaata 286  Q
    ||||||||    
T  20182197 aataaata 20182204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 20074987 - 20074895
Alignment:
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  20074987 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaacaaatattctcaaaagaatattataattagggacggag 20074895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 311
Target Start/End: Original strand, 46415103 - 46415244
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaaga 267  Q
    |||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||   |||| ||| | |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||| |    
T  46415103 tattaaatttgtatataattattattgtttttacaattttattc-ttaagggagagagttagtttatgttttcaatataatatttattgttgattgaa-a 46415200  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataatt 311  Q
    |||||||| | |||||||| ||| |||   ||||||||||||||    
T  46415201 aaaagatgcaaaataaataagggtatgatggtaaagaaataatt 46415244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 245
Target Start/End: Original strand, 31137214 - 31137288
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  31137214 taaatttgtttgtaattgttatttcttttacaattttatcctttaagagagagggttggtgtatgttttcaacat 31137288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 33342356 - 33342249
Alignment:
Q  177 tgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgt 276  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||  || | |||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  33342356 tgtttataattactattgtttttacaattaaatcatttaagagagag--ttagtttatattttcaacatagtatttattgttgattgaagaaaaatatgt 33342259  T
Q  277 ataataaata 286  Q
      ||||||||    
T  33342258 gaaataaata 33342249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 146 - 211
Target Start/End: Original strand, 10071852 - 10071917
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcc 211  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10071852 gaattaagaaaattgatatttgtattaaagttgtttgtaattattatggtttttacaattttatcc 10071917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 167 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 34693631 - 34693471
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaa- 265  Q
    ||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | || ||||  ||||||||| || ||  ||||||||| ||||||||     
T  34693631 gtattaaatttgtatacaattactattatttttacaattttatcc-ttaagagatagagttgatttatgttttaaatataatatttattgttgattgaac 34693533  T
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
     ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  34693532 aaaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaaaaattaatgtacttgaaaata 34693471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 43008240 - 43008144
Alignment:
Q  251 ttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||| || || |||||||| |||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  43008240 ttattgcttattaaagaaaaatttgtataataattaggggtatttaggtaaagaagtaattaatatagttgaaa-taacaaaggggtcttataaaaag 43008144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 327
Target Start/End: Original strand, 40299187 - 40299282
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    |||||||||||||||  ||||||||  |||||||| ||||||||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  40299187 ttatgttttcaacataatatttattcttgattgaa-aaaaagatgcaaaataaataagggtatgttagtaaaaaaataattaatgtacttgaaaata 40299282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 43008360 - 43008300
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43008360 gaattaagaaagttgatatttgtattaaagatatttgtaatcactactgtttttacaattt 43008300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 271
Target Start/End: Original strand, 47648985 - 47649088
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  47648985 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttattc-ttaagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 47649083  T
Q  267 aaaaa 271  Q
    |||||    
T  47649084 aaaaa 47649088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Original strand, 6910622 - 6910668
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6910622 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt 6910668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 46415044 - 46415010
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46415044 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 46415010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #172
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 388
Target Start/End: Original strand, 2087096 - 2087316
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttat--cctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag-a 267  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||| || |||  ||||||| ||||||| || |  ||||||||||||||  |||||| || ||| ||||| |    
T  2087096 taaatttgtctgtaattagtattgcttttacatttatatatcctttaagaaagaggattagtgtatgttttcaacatagtatttactgatgaatgaagaa 2087195  T
Q  268 aaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaa 367  Q
    |||| || || |||||||| |||  |||  ||||| || ||||||| ||| |||||||||  ||||  ||||| ||||||| |||       | ||||||    
T  2087196 aaaaaatataaaataaataagggtgtgttggtaaaaaattaattaatgtacttgaaaatactaaagatgtcttgtaaaaagagacaacgctttctctcaa 2087295  T
Q  368 aagggtcttataattagggac 388  Q
    ||| ||| |||||||||||||    
T  2087296 aagagtcctataattagggac 2087316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #173
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 307 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 12129768 - 12129695
Alignment:
Q  307 taattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataa 380  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||        ||||||||||||||||||||    
T  12129768 taattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaagagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataa 12129695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #174
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 308 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 21135367 - 21135282
Alignment:
Q  308 aattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaa-gggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||       |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21135367 aattaatgtacttggaaatactaaaagggtcttataaaaagggacaaatttttttctcaaaaagggtcttataattagggacggag 21135282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 384
Target Start/End: Original strand, 30866416 - 30866541
Alignment:
Q  259 gattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnn 358  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||  || ||||  |||||||||||||||| ||  |||||||||  |||  |||||||||||||| |||          
T  30866416 gattgaagaaaatgatgcaaaataaataaaggtatgttggtaaagaaataattaatgttattgaaaatactaaaaaggtcttataaaaagagacaaaaaa 30866515  T
Q  359 ntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
      ||||||||| ||||||||||||||    
T  30866516 aattctcaaaaaggtcttataattag 30866541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 2290056 - 2290021
Alignment:
Q  97 ttatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2290056 ttatactacctccgtccctaattataagaccctttt 2290021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 6799587 - 6799556
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagacc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6799587 attatactacctccgtccctaattataagacc 6799556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 222
Target Start/End: Original strand, 21295638 - 21295692
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaaga 222  Q
    |||||| || |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21295638 gtattatatttgtttgcaattagtat-gtttttacaattttatcctttaaaaaaga 21295692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 266 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 23109144 - 23109101
Alignment:
Q  266 gaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataa 309  Q
    |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  23109144 gaaaaagatgaataataaataaggacatgtatgtaaagaaataa 23109101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 27813494 - 27813528
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27813494 tatactacctccgtccctaattataagaccctttt 27813528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 213
Target Start/End: Original strand, 30866184 - 30866226
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30866184 taaatatgtatataatcactattgtttttacaattttatcctt 30866226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 213
Target Start/End: Original strand, 32643627 - 32643657
Alignment:
Q  183 taattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32643627 taattactattgtttttacaattttatcctt 32643657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 34037544 - 34037502
Alignment:
Q  164 tttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattt 206  Q
    |||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34037544 tttgtattaaagttgtttgtaattactcttgtttttacaattt 34037502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 98 - 132
Target Start/End: Original strand, 35888310 - 35888344
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35888310 tatactacctccgtccctaattataagaccttttt 35888344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #185
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 1574718 - 1574751
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1574718 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 1574751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #186
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 177
Target Start/End: Original strand, 2785163 - 2785200
Alignment:
Q  140 taacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatat 177  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2785163 taacaagaattaagatagtgcatatttgtattaaatat 2785200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #187
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 33381611 - 33381578
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33381611 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 33381578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 34012555 - 34012522
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34012555 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 34012522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 132
Target Start/End: Original strand, 38858289 - 38858330
Alignment:
Q  91 caaacattatactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38858289 caaatattatactccctccgtccctaattataagaccctttt 38858330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 42541897 - 42541864
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42541897 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 42541864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 183; Significance: 1e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 98 - 352
Target Start/End: Original strand, 19696 - 19951
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19696 tatactacatccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagaggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 19795  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19796 ttacaattttatcctttaagaaagagggttggcttatgttttcaacattcaatttattgctgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtat 19895  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatag-aaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19896 gtaaagaaataattaatgtagttggaaatagaaaaagggatcttataaaaagggac 19951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 180; Significance: 8e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 8e-97
Query Start/End: Original strand, 99 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 94084 - 93795
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||       ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  94084 atactacctccatccctaattataaggcccttttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaactactattgtttt 93985  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  93984 tacaattttaacctttaagaaagagggttggtttatgttttcaacattatatttattgctgattgaagaaaaagatatataataaataggggcatgtatg 93885  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggac 388  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  93884 taaagaaataattaatgtagttgaaaataaaaaaggagttctataaaaagggacaaaaaaatttctcaaaagggtcttataattagggac 93795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 392
Target Start/End: Original strand, 103804 - 104092
Alignment:
Q  101 actacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttta 200  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||||       | ||  ||||||| | | | |||| | ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  103804 actacctccatccctaattataggaccattttgccaaaattacgggaattaaaaaaattgataatagtattaaatttgtttataattgctattgttttta 103903  T
Q  201 caattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgta 300  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| ||| |  | || ||| |||||  ||| ||||| ||||| | |||||||||| | | |||||||||| |||   |||    
T  103904 caattttatcc-ttaaaagggagagttagtgtttggttt-aacataatatatattgttgattaaggaaaaagatgcaaattaaataggggtatggtggta 104001  T
Q  301 aagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||  |||||  |||||||||||| |||        ||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  104002 aagaaatatttaatgtaattgaaaatatcaaaggtttcttataaaaagagacaaaaaaa-ttctcaaaaagatcttataattagggacggag 104092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 177; Significance: 5e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 5e-95
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 6350 - 6640
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6350 atactacctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 6449  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6450 tacaattttatcctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataaataggggcatgtatg 6547  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||       |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6548 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaattttttttc-caaaagggtcttataattagggacggag 6640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 6647 - 6614
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6647 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 6614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 175; Significance: 8e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 3735 - 3444
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3735 tactacctccgtccctaattatagggtccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 3636  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  3635 acaattttatcctttaagaaagagggttggattatgtttttaacatgttatttattgctgattgaaaaaaaagatgtataataaatcggggcatgcatgt 3536  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3535 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 3444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 168; Significance: 1e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 164510 - 164220
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164510 tactacctccgtccctaattataggatcgttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 164411  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||| |||||| | ||||  |||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  164410 acaattttattctttaagagagag--ttggtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 164313  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||       ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  164312 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagtggtcttataaaaagggacaattttttttttcaaaagggtcttataattagggacggag 164220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Original strand, 164213 - 164246
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  164213 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 164246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 18793 - 18503
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18793 tactacctccgtccctaattataagacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 18694  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18693 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgt 18595  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18594 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 18503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 5446 - 5157
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5446 tactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 5348  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5347 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgt 5249  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5248 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 5157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0649 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0649
Description:

Target: scaffold0649; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 96 - 392
Target Start/End: Original strand, 4033 - 4329
Alignment:
Q  96 attatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgt 195  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||| ||||       | ||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  4033 attatactccctccgtccctatatataagacccttttgccaaaatcacgggaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgt 4132  T
Q  196 ttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4133 ttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgt 4232  T
Q  296 atgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  4233 atgtcaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagagtcttataatcagggacggag 4329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0549 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0549
Description:

Target: scaffold0549; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 9924 - 10213
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9924 tactacctccgtccctaat-ataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattactattgttttt 10022  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10023 acaattttatcctttaagagagagagttggtttatgttttcaatatgttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataat-aataggggcatgtatgt 10121  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10122 aaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaatggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 10213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 98 - 384
Target Start/End: Original strand, 355040 - 355324
Alignment:
Q  98 tatactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttt 197  Q
    |||||| |||||||| ||||||||| |||||||||       ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  355040 tatactccctccgtctctaattataggaccattttgaaaaaataacggaaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgttattactattgttt 355139  T
Q  198 ttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtat 297  Q
    ||||||||||||||||||| | |||   |||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  355140 ttacaattttatcctttaagagagaa--ttggtttatgttttcaacatgatatttattgctgattgaggaaaattatgtataataaataggggcaagtat 355237  T
Q  298 gtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattag 384  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||    
T  355238 gtaaagaaataattaatgtagttgaaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattag 355324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 92416 - 92360
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  92416 gatattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaa 92360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0883 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0883
Description:

Target: scaffold0883; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 1971 - 1726
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||     
T  1971 aattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacata 1872  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  1871 ttttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaa 1772  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||       ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1771 agggacaaatttttttatcaaaaaggtcttataattaaggacggag 1726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Original strand, 31472 - 31717
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  31472 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 31571  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  31572 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaatagaggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaa 31671  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    |||||||        |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31672 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagagacgga 31717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 153; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45764 - 45519
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  |||| |||||||||||||||     
T  45764 aattaagatagtgtatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaagagagagaattggtttatgttttcaacata 45665  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  45664 ttttttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaataggggcatgcatgtaaagaaataattaatgtagctggaaatagcaaaggggtcttataaaa 45565  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||       ||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  45564 agggacaaatttttttatcaaaaaggtcttataattaaggacggag 45519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 150; Significance: 6e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 6e-79
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 51467 - 51713
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  51467 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcaccattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 51566  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||||||    
T  51567 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggtatgtatataaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagggatcttataaa 51666  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51667 aagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 51713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 149; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 258908 - 259153
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||     
T  258908 aattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacatg 259007  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| | ||||||||||    
T  259008 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagagatcttataaaa 259107  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  259108 agggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 259153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0339 (Bit Score: 145; Significance: 6e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0339
Description:

Target: scaffold0339; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 6e-76
Query Start/End: Original strand, 147 - 392
Target Start/End: Original strand, 6926 - 7171
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||     
T  6926 aattaagatagtgaatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacatg 7025  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||  ||| | |||||||||||    
T  7026 ttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaattaattaatgtagttggaaataacaaatgagtcttataaaa 7125  T
Q  347 agggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    | ||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7126 atggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 7171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 12362 - 12071
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  12362 atactccctccgtccctaattataaaacccttttgttaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttt 12263  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12262 tacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgctgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatg 12164  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12163 taaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 12071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 45921 - 45678
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||    
T  45921 gaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgtttttacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacat 45824  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  45823 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaa 45724  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || ||||        |||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  45723 aatggacaaaaaaa-ttcttaaaagggtcttataattagagacggag 45678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308 (Bit Score: 142; Significance: 4e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0308
Description:

Target: scaffold0308; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 14134 - 14379
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  14134 gaattaagatagtggatatttgtattaaagatgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 14233  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||  ||||||||||||||||    
T  14234 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgta-taggaaataacaaaggggtcttataaa 14332  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14333 aagggacagaaaaaattctcaaaagggtcttataattaaggacggag 14379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0308; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 352
Target Start/End: Original strand, 5071 - 5277
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  5071 gaattaagatagtggatatttgtattaaagctgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcttttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 5170  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| ||||||||||    
T  5171 gttatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaa 5270  T
Q  346 aagggac 352  Q
    |||||||    
T  5271 aagggac 5277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0457 (Bit Score: 141; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0457
Description:

Target: scaffold0457; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 4403 - 4694
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  4403 atactacctccgtccttaattatagggcccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgcaattaatattgtttt 4502  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4503 tacaattttatcctttaagagagaga--tggtttatgttttcaacatattatttattgctgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatg 4600  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| ||| | |||||||||||| ||||        ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4601 taaagaaataattaatatagttggaaatagcaaatgagtcttataaaaatggacaaaaaaaattctcaaaagaatcttataattagggacggag 4694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0907 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0907
Description:

Target: scaffold0907; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 351
Target Start/End: Original strand, 4316 - 4565
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  | ||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4316 tactacctccgtccctaattatagggtctttttaaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattagtattgttttt 4415  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||| ||||||||||||| | ||||   ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4416 acagttttatcctttaagagagaga--tgttttatgttttcaacatgctatttattgttgattgaagaaaaagatgtataattaataggggcatgtatgt 4513  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4514 aaagaaataattaatgtaattggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggga 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0604 (Bit Score: 140; Significance: 6e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0604
Description:

Target: scaffold0604; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 3525 - 3813
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3525 tactccctccgtccctaattataggacccttttgaaaaaataacgggaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactactgttttt 3624  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    ||||||||||||||||| | |||   |||  |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3625 acaattttatcctttaagagagaa--ttgatttatgttttcaatatgatatttattgctgattgaagaaaattatgtataataaataggggcatgcatgt 3722  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||| |||||  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3723 aaagaaat-attaatatagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaagggtcttataattagggacggag 3813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0368 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0368
Description:

Target: scaffold0368; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 8469 - 8224
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||| ||    
T  8469 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtntttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaatat 8370  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||||||||||||    
T  8369 gttatttattgttgattgaagaaaaatat-tataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacaatggggtcttataaa 8271  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8270 aagggacaaatttttttttcaaaagggtcttacaattagggacggag 8224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 47937 - 47646
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||||       | ||  ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  47937 tactccctccgtccctaattataagatccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 47838  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  47837 acaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatatgctatttattgttgattgaagaaaaatatgtataataaataggggcatgtatgt 47739  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47738 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggagtcttataaaaagggacaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 47646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 138; Significance: 9e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 9e-72
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 61638 - 61882
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||| ||    
T  61638 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatattttcaatat 61737  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  | ||||||||||||||    
T  61738 gttatttattgttgattgaaaaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaataacataggggtcttataaa 61837  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||       ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61838 aagggacaaattttttt-tcaaaa-ggtcttataattagggacggag 61882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 135; Significance: 6e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Original strand, 24417 - 24661
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||    
T  24417 gaattaagatagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaatgttagtttatgttttcaacat 24516  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  24517 gttatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggc--gtatgtaaagaaataattaatgtagttgaaaataacaaaggagtcttataaa 24614  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||| |||        ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24615 aagcgacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattaggaacggag 24661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 146 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 118097 - 117852
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||| | |||||||||| | ||    
T  118097 gaattaagaaaacggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttagtttatgttttccatat 117999  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  117998 gctacttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaataaataattaatgtagttgaaaataacaaaggggtcttataaa 117899  T
Q  346 aagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||        ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  117898 aagggacaaaaaaaattctcaaaaggatcttataattagggacggag 117852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 149 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 5008 - 4808
Alignment:
Q  149 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||  |    
T  5008 ttaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgcttttacaattt-atcctttaagagagagggttggtttttgttt-caacatgtt 4911  T
Q  249 atttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  4910 atttattgctaattgaagaaaaagatgtataataa-taggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaagggatcttataaaaag 4812  T
Q  349 ggac 352  Q
    ||||    
T  4811 ggac 4808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 286 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 4792 - 4726
Alignment:
Q  286 aggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4792 aggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaagggac 4726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0202 (Bit Score: 132; Significance: 4e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0202
Description:

Target: scaffold0202; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 146 - 321
Target Start/End: Original strand, 9539 - 9714
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||    
T  9539 gaattaagatagtggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgtttttacaattttatcctttaagaaagaaggttagtttatgttttcaacat 9638  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttg 321  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9639 attatttattgttgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaatgtagttg 9714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0576 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0576
Description:

Target: scaffold0576; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Original strand, 284 - 575
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  284 atactacctccgtccctaattatagggcc-ttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttgtattaaatatgtttgtaattaccattgtttt 382  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  ||   |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  383 tacaattttatcctttaagagagagaattaaattatgttttcaacatgttatttattgttcattgaagaaaaaaatgtataataaataagggcatgtatg 482  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||        ||| |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  483 taaag-aataattaatgtagttgaaaatagcaatggggtcttataaaaagtgacaaaaaaaattcacaaaagagtcttataattaaggacggag 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 99 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48952 - 48660
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| || | ||||       ||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  48952 atactacctccgtccctaattataggatccttttgaaaaaataacgggaattaagataatagatatttgtattaaatatgtttgtgattaatattgtttt 48853  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatg 298  Q
    |||||||||||||||||| | ||||   ||  |||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  48852 tacaattttatcctttaagagagaga--tgatttatgttttcaacatgttatttattaatgtttgaagaaaaagatgtataattaataggagcatctatg 48755  T
Q  299 taaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac-nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48754 taaagaaataattaatgtagttggaaatagcaaaggggtcttataaaaaggtacaaaaaaaaattctcaaaagggtcttataattagggacggag 48660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 123; Significance: 8e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 8e-63
Query Start/End: Original strand, 100 - 392
Target Start/End: Original strand, 65378 - 65668
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||       | ||  ||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  65378 tactccctccgtccctaattataagacccttttgctaaaatcacgggaattaagaaagcggatatttgtattaaagttgtttgtaatcactattgttttt 65477  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgt 299  Q
    |||||||||||||| || | ||||  || | |||||||||| | || ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  65478 acaattttatcctt-aagagagagaattagtttatgttttccatatgctacttattgctgattaaagaaaaagatgtataataaatatgggcatgtatgt 65576  T
Q  300 aaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||  |||| ||||||||||||||||||        ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65577 aaagaaataattaatgtagttggaaataacaaagaggtcttataaaaagggacaaaaaaa-ttctcaaaaaggtcttataattagggacggag 65668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 105; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 146 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24460 - 24224
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||| |||||||||||||||    
T  24460 gaattaagttaatggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa-------ggttggtttatgttttcaacat 24368  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaa 345  Q
      ||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  24367 gttatatattggcgattgaagaaaaaaatgtataataaatagaggcatgtatgtaaataaataat----gtagttggaaatagcaaatgggtcttataaa 24272  T
Q  346 aagggac--nnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacgga 391  Q
    || ||||         | |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24271 aaaggacaaaaaaaattctctcaaaagggtcttataattaaggacgga 24224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 220 - 392
Target Start/End: Original strand, 1306 - 1477
Alignment:
Q  220 agagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagt 319  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1306 agagagttggtttatgttttcaacatgttatttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaatcggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagt 1405  T
Q  320 tgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    || |||||| ||||| |||| ||||||||||||        || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1406 tggaaatagcaaaggagtctcataaaaagggacaaaaaaaatt-tcaaaagggtcttataattagggacggag 1477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 99 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1484 - 1451
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccatttt 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1484 atactacctccgtccctaattataagaccctttt 1451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 86; Significance: 1e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 13302 - 13448
Alignment:
Q  99 atactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||       |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13302 atactacctccgtccctaattatagagccattttgaaaaaataacgtgaattaagatagtagatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttt 13401  T
Q  199 tacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||||||    
T  13402 tacaattttatcatttaagagagaaggttggtttatgttttcaacat 13448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 190 - 352
Target Start/End: Original strand, 8410 - 8571
Alignment:
Q  190 tattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggg 289  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||| ||||||| |||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8410 tattgtttttacaattttatccttttaaga-gagagttggtttatgttatcaacatgttacttattggtgattgaagaaaaagatgtataataaataagg 8508  T
Q  290 gcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | ||| | ||||| |||||| ||||    
T  8509 gcatgcatgtaaagaaataattaatgtagttggaaattgtaaatgagtcttctaaaaaaggac 8571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 146 - 190
Target Start/End: Original strand, 8092 - 8136
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8092 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattact 8136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 83; Significance: 6e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 100 - 283
Target Start/End: Original strand, 40606 - 40789
Alignment:
Q  100 tactacctccgtccctaattataagaccattttnnnnnnntaacatgaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgttttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |  ||||       ||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  40606 tactacctccgtccctaattatagggcatttttgaaaaaataacgggaattaagatagtgaatatttttattaaatatgtttgtaattactcttattttt 40705  T
Q  200 acaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataa 283  Q
    |||||||||| |||||| | |||| ||||  |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  40706 acaattttattctttaagagagagagttgatttatgttttcaacatgttatttattgttgattgaagaaaaaaatgtataataa 40789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18606 - 18481
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| | |||||||||||||||    
T  18606 gaattaagatagtgaatatttatattaaatatgtttgtaattattattgtttttacaattttatcctttaagagagggggtttgtttatgttttcaacat 18507  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaa 271  Q
      | ||||||||||||||||||||||    
T  18506 gttttttattgctgattgaagaaaaa 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 17694 - 17470
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||   |||| ||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  17694 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagagagagagttaatttatattttcaatataatatttattgttgattgaag 17596  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| |||||  ||| |||||||||||||||||||       ||| |||    
T  17595 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaataccaaaagggtcttataaaaagggacaaattattttttca 17496  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17495 aaaggatcttataattagggacggag 17470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 34354 - 34156
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaa-aaagagggttggcttatgttttcaaca 244  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |   |||||| |||    ||||||||  | |    
T  34354 gaattaagaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaatcactattatttttacaattttatccttaagggaaagagagtt----tatgtttttcata 34259  T
Q  245 ttctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataa 344  Q
    | | |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |  ||||||||    
T  34258 tcccatttattaatgattgaagaaaaatatgtataataaatagggacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagtaaaagaatcttataa 34159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 246685 - 246462
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||    |||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||    
T  246685 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcc-ttaaaagagagagtaaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaag 246587  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    ||||| | | | |||||||| ||| ||||  |||||||||||||||| ||| ||| ||| |  |||||||||||||||||||||||       ||| |||    
T  246586 aaaaa-aagcaaaataaataagggtatgttggtaaagaaataattaatgtacttggaaacaccaaaggggtcttataaaaagggacaaattattttttca 246488  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||    
T  246487 aaagggtcttataattaggaacggag 246462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 146 - 387
Target Start/End: Original strand, 156187 - 156428
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacat 245  Q
    ||||||| | ||| |||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||  || | ||||  || | |||| ||||  | ||    
T  156187 gaattaaaaaagtagatatttgtactaaagttttttgtaatcactattgtttttacaattttatcctg-aagagagagaattagtttatatttttcatat 156285  T
Q  246 tctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaa--ataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttata 343  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||| || ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  156286 gctatttattactgattgaagaaaaatatgtataatgaatagggtcatctatgtaaagaaatataattaatgtggttgaaaataacaaacgggtcttata 156385  T
Q  344 aaaagggacnnnnnnntttctcaaaagggtcttataattaggga 387  Q
    |||| ||||       ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  156386 aaaa-ggacaaaaaaatttctcaaaatagtcttataattaggga 156428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 231 - 351
Target Start/End: Original strand, 9536 - 9656
Alignment:
Q  231 ttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaa 330  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  9536 ttatgttttccatatgctatttattgctgatataagaaaaatgtgtataataaatagagacatgtatgtaaagaaataattaatgtagttggaaatagca 9635  T
Q  331 aaggggtcttataaaaaggga 351  Q
    |||  ||||||||||||||||    
T  9636 aagaagtcttataaaaaggga 9656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 213
Target Start/End: Original strand, 9069 - 9136
Alignment:
Q  146 gaattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9069 gaattaaaaaagtggatatttatattaaagttgtttgtaagtactattgtttttacagttttatcctt 9136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0086
Description:

Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 147 - 346
Target Start/End: Original strand, 32950 - 33148
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacatt 246  Q
    |||||||| ||| | ||||| |||||||  | |||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||| |||  ||| | |||||||||||||| |    
T  32950 aattaagaaagttggtatttctattaaagttctttgtaatcagtattgtttttacaattttatcctc-aaaagagatagttagtttatgttttcaacaat 33048  T
Q  247 ctatttattgctgattgaagaaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaa 346  Q
     ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||   |||||||||||||||| | ||||  |||||  |||  ||||||||||||    
T  33049 atatttattgttgattgaagaaaaatatgtaaaataaataggggtatggcagtaaagaaataattaatgcagttagaaataccaaaatggtcttataaaa 33148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0086; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 168 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 22119 - 22069
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaa 218  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22119 tattaaatttgtttgtaattattattatgtttacaattttatcctttaaaa 22069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0294 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 167 - 348
Target Start/End: Original strand, 11469 - 11646
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||   || ||||| ||   |||||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  11469 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatactt---aagagaggattaatttatgttttcaacataatatttattgtt-attgaag 11564  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaag 348  Q
    ||||| ||| | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||||||    
T  11565 aaaaaaatgcaaaataaataagggtatgttagtaaataaataattaatgtacttaaaaataccaaaggggtcttataaaaag 11646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 54; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 167 - 392
Target Start/End: Original strand, 36172 - 36394
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaag 266  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |    |||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||     
T  36172 gtattaaatttgtatataattactattgtttttacaattttatcctt-aagaaagagaataaatttatgttttcaatataatatttattgttgattgaac 36270  T
Q  267 aaaaagatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggacnnnnnnntttctca 366  Q
    |||||  || | |||||||| ||| ||||  ||||| |||||||||| ||| ||| ||| |  ||||  |||||||||||||||||       ||| |||    
T  36271 aaaaa--tgcaaaataaataagggtatgttggtaaaaaaataattaatgtacttggaaacaccaaagaagtcttataaaaagggacaaattattttttca 36368  T
Q  367 aaagggtcttataattagggacggag 392  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||    
T  36369 aaagtgtcttataattagagacggag 36394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 313
Target Start/End: Original strand, 5494 - 5627
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagatgtat 278  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| | |||| ||| |  ||| |||| |||||  |||||| || |||| ||||||||||||  |     
T  5494 tttgtaattactattgcttttacaatttcattctttaagagagagagttagtgtatatttttaacatagtatttaatgttgatcgaagaaaaagat-aaa 5592  T
Q  279 aataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaa 313  Q
    |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  5593 aataaataggggtatgttggtaaagaattaattaa 5627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 56151 - 56051
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||| | || ||||| |  ||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  56151 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacacttttattctttaagagagtgggttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaagaaaa 56052  T
Q  271 a 271  Q
    |    
T  56051 a 56051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 47382 - 47226
Alignment:
Q  171 taaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaaaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaa 270  Q
    ||||| ||||||||||  |||||||||||||  |||||| |||||| | || | ||| |  ||||||||||| ||  |||||| ||||| ||||||||||    
T  47382 taaatttgtttgtaatcgctattgtttttacccttttattctttaagagagtgagttagtgtatgttttcaatatagtatttaatgctggttgaagaaaa 47283  T
Q  271 agatgtataataaataggggcatgtatgtaaagaaataattaacgtagttgaaaata 327  Q
    | ||  | |||||||||| | ||||  |||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  47282 aaataaaaaataaataggagtatgttggtaaagaattaataaatgtacttgaaaata 47226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2116 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold2116
Description:

Target: scaffold2116; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 301 - 352
Target Start/End: Original strand, 1 - 52
Alignment:
Q  301 aagaaataattaacgtagttgaaaatagaaaaggggtcttataaaaagggac 352  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1 aagaaataattaatgtagttggaaataacaaaggggtcttataaaaagggac 52  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0472 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0472
Description:

Target: scaffold0472; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 147 - 210
Target Start/End: Original strand, 13112 - 13175
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatc 210  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13112 aattaagaaagtaaatatttgtattaaagttgtttgtaatcattattgtttttacaattttatc 13175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 147 - 213
Target Start/End: Original strand, 549 - 615
Alignment:
Q  147 aattaagatagtggatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||| | | | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  549 aattaagatagttgatagtagtattaaatttatatataattactattgtttttacaattttgtcctt 615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 274
Target Start/End: Original strand, 1953 - 2050
Alignment:
Q  179 tttgtaattactattgtttttacaattttatccttta--aaaaagagggttggcttatgttttcaacattctatttattgctgattgaagaaaaagat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||| ||| |  ||| |||| |||||  |||||| || |||||||||||||||||    
T  1953 tttgtaattactattgtttttacaattttattctttaagagagagagagttagtgtatatttttaacatagtatttaatgttgattgaagaaaaagat 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 733 - 689
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  733 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcct 689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 168 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 7197 - 7153
Alignment:
Q  168 tattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcct 212  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  7197 tattaaatttgtttgtagttactattgattttacaattttatcct 7153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0263 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 160 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13788 - 13732
Alignment:
Q  160 gatatttgtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctttaa 216  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13788 gatattagtattaaatttatttgtaattcatattctttttacaattttatcctttaa 13732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 167 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 71 - 25
Alignment:
Q  167 gtattaaatatgtttgtaattactattgtttttacaattttatcctt 213  Q
    ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  71 gtattaaatttgtatataattactattatttttacaattttatcctt 25  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 93 times since January 2019
Visitors: 6695