View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0921_high_15 (Length: 271)

Name: NF0921_high_15
Description: NF0921
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0921_high_15
NF0921_high_15
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (24-250)||(6984-7210)
[»] chr7 (66 HSPs)
chr7 (21-271)||(13867830-13868080)
chr7 (21-249)||(7286294-7286522)
chr7 (21-256)||(7290908-7291142)
chr7 (21-222)||(12545600-12545802)
chr7 (21-258)||(369143-369379)
chr7 (21-271)||(18305585-18305831)
chr7 (21-215)||(44863443-44863637)
chr7 (21-249)||(2192572-2192799)
chr7 (21-215)||(26071937-26072131)
chr7 (21-215)||(26095724-26095918)
chr7 (21-215)||(47287976-47288170)
chr7 (21-249)||(16480802-16481029)
chr7 (21-249)||(15952825-15953050)
chr7 (21-207)||(12753172-12753358)
chr7 (21-215)||(15824178-15824371)
chr7 (21-240)||(14253046-14253263)
chr7 (21-215)||(141869-142062)
chr7 (21-195)||(49049549-49049723)
chr7 (21-209)||(15629004-15629192)
chr7 (141-259)||(12545509-12545627)
chr7 (21-209)||(13272976-13273164)
chr7 (21-207)||(3893381-3893573)
chr7 (21-265)||(11582609-11582840)
chr7 (126-249)||(2024765-2024892)
chr7 (21-224)||(15762251-15762445)
chr7 (115-208)||(45453932-45454026)
chr7 (21-265)||(13038883-13039114)
chr7 (21-265)||(16416509-16416743)
chr7 (120-209)||(16571833-16571923)
chr7 (21-91)||(16571983-16572053)
chr7 (21-91)||(16593609-16593679)
chr7 (120-209)||(16593739-16593829)
chr7 (21-265)||(32496220-32496451)
chr7 (21-207)||(112986-113168)
chr7 (21-103)||(45455499-45455581)
chr7 (126-265)||(122869-123001)
chr7 (21-265)||(3054982-3055215)
chr7 (161-265)||(16210102-16210205)
chr7 (197-271)||(11285473-11285547)
chr7 (21-86)||(2024692-2024757)
chr7 (214-271)||(2192526-2192583)
chr7 (195-271)||(7286198-7286274)
chr7 (155-209)||(12249853-12249907)
chr7 (193-259)||(13867792-13867858)
chr7 (193-259)||(7286160-7286226)
chr7 (141-256)||(16416723-16416838)
chr7 (126-207)||(1938448-1938529)
chr7 (193-271)||(16480756-16480832)
chr7 (21-74)||(11285348-11285402)
chr7 (193-259)||(11285519-11285585)
chr7 (21-93)||(16209975-16210045)
chr7 (193-271)||(7286248-7286324)
chr7 (159-265)||(13867762-13867864)
chr7 (193-259)||(15762191-15762256)
chr7 (214-271)||(11285564-11285621)
chr7 (141-213)||(16480710-16480782)
chr7 (21-91)||(122770-122838)
chr7 (21-56)||(12249908-12249943)
chr7 (21-67)||(13376002-13376049)
chr7 (159-209)||(2024904-2024954)
chr7 (207-265)||(12545479-12545537)
chr7 (159-209)||(15952763-15952813)
chr7 (193-247)||(16416825-16416879)
chr7 (138-256)||(15762064-15762182)
chr7 (141-213)||(2192480-2192552)
chr7 (198-259)||(10862598-10862661)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (21-271)||(17735-17985)
scaffold0292 (193-259)||(17957-18023)
scaffold0292 (159-259)||(17951-18047)
scaffold0292 (213-265)||(18025-18077)
[»] chr4 (72 HSPs)
chr4 (21-271)||(34393385-34393636)
chr4 (21-271)||(18166874-18167123)
chr4 (21-265)||(53909505-53909750)
chr4 (21-258)||(15274427-15274663)
chr4 (21-203)||(45460709-45460894)
chr4 (21-215)||(12837998-12838192)
chr4 (21-249)||(7134276-7134503)
chr4 (21-207)||(21961253-21961440)
chr4 (21-259)||(19699369-19699606)
chr4 (21-259)||(19709954-19710191)
chr4 (21-249)||(8372607-8372834)
chr4 (21-249)||(26678179-26678404)
chr4 (21-207)||(20813704-20813890)
chr4 (21-249)||(22356390-22356616)
chr4 (21-207)||(12901455-12901631)
chr4 (21-208)||(30236232-30236411)
chr4 (21-209)||(44054168-44054347)
chr4 (21-247)||(53706604-53706828)
chr4 (21-199)||(13811380-13811558)
chr4 (21-203)||(44345057-44345247)
chr4 (21-265)||(18246178-18246411)
chr4 (21-176)||(18294592-18294746)
chr4 (21-215)||(33738477-33738657)
chr4 (21-265)||(16520801-16521035)
chr4 (21-265)||(19998517-19998750)
chr4 (21-235)||(47355509-47355719)
chr4 (21-215)||(16366435-16366624)
chr4 (21-265)||(109748-109979)
chr4 (21-249)||(15211515-15211732)
chr4 (21-259)||(9293712-9293940)
chr4 (21-215)||(13244606-13244787)
chr4 (141-257)||(16521015-16521133)
chr4 (21-265)||(10642374-10642608)
chr4 (100-207)||(55378542-55378650)
chr4 (214-271)||(8372823-8372880)
chr4 (126-265)||(54119964-54120096)
chr4 (214-269)||(7134184-7134239)
chr4 (21-95)||(8874272-8874346)
chr4 (21-187)||(18496169-18496334)
chr4 (214-271)||(26678393-26678450)
chr4 (21-176)||(43283131-43283293)
chr4 (141-197)||(34393610-34393666)
chr4 (130-208)||(13751910-13751989)
chr4 (141-256)||(18246391-18246508)
chr4 (195-245)||(18294577-18294627)
chr4 (229-271)||(19998891-19998933)
chr4 (21-86)||(27959370-27959436)
chr4 (193-259)||(55378466-55378532)
chr4 (141-249)||(19998780-19998888)
chr4 (26-113)||(5684715-5684802)
chr4 (141-208)||(18167097-18167164)
chr4 (193-271)||(19998728-19998806)
chr4 (21-73)||(14867696-14867749)
chr4 (28-108)||(55378678-55378757)
chr4 (212-271)||(15211729-15211788)
chr4 (141-216)||(19998907-19998982)
chr4 (214-256)||(7134245-7134287)
chr4 (141-208)||(8372854-8372921)
chr4 (21-100)||(13752082-13752159)
chr4 (141-215)||(15211762-15211836)
chr4 (159-209)||(16521168-16521218)
chr4 (193-256)||(18246495-18246560)
chr4 (213-259)||(19699321-19699367)
chr4 (213-259)||(19709906-19709952)
chr4 (193-239)||(43283122-43283168)
chr4 (237-271)||(47355697-47355731)
chr4 (195-224)||(21961290-21961319)
chr4 (207-256)||(22356335-22356384)
chr4 (214-259)||(22356356-22356401)
chr4 (21-57)||(34197988-34198025)
chr4 (21-64)||(19824284-19824328)
chr4 (219-271)||(55378504-55378556)
[»] chr1 (56 HSPs)
chr1 (21-259)||(41217544-41217783)
chr1 (21-215)||(22407968-22408162)
chr1 (21-259)||(20252342-20252579)
chr1 (21-208)||(35524165-35524350)
chr1 (21-265)||(9786073-9786315)
chr1 (21-207)||(5676350-5676535)
chr1 (21-271)||(15863269-15863508)
chr1 (21-271)||(22352285-22352524)
chr1 (133-265)||(20895464-20895596)
chr1 (21-209)||(2422813-2422997)
chr1 (141-259)||(41217793-41217911)
chr1 (21-203)||(35053141-35053312)
chr1 (21-265)||(17146820-17147053)
chr1 (21-208)||(21716430-21716624)
chr1 (21-209)||(51658069-51658255)
chr1 (85-224)||(22250767-22250905)
chr1 (54-259)||(20589876-20590078)
chr1 (21-195)||(18505646-18505817)
chr1 (141-256)||(15863178-15863295)
chr1 (161-265)||(20444132-20444236)
chr1 (21-239)||(21857753-21857958)
chr1 (141-265)||(22352498-22352623)
chr1 (183-265)||(37846140-37846222)
chr1 (21-250)||(44036576-44036791)
chr1 (161-259)||(20529872-20529970)
chr1 (21-265)||(22364943-22365177)
chr1 (195-271)||(20589914-20589990)
chr1 (141-256)||(17147033-17147150)
chr1 (193-271)||(20589790-20589868)
chr1 (21-86)||(20956820-20956886)
chr1 (21-176)||(27673107-27673268)
chr1 (207-271)||(41217755-41217819)
chr1 (155-215)||(49966017-49966077)
chr1 (21-112)||(20895596-20895687)
chr1 (21-94)||(22837186-22837260)
chr1 (193-259)||(20589752-20589818)
chr1 (194-265)||(22836987-22837060)
chr1 (161-250)||(20929872-20929961)
chr1 (213-265)||(20529948-20530000)
chr1 (194-259)||(20956710-20956777)
chr1 (207-259)||(41217883-41217935)
chr1 (193-259)||(20252587-20252651)
chr1 (21-63)||(22080190-22080232)
chr1 (214-259)||(20589852-20589897)
chr1 (213-265)||(9785973-9786025)
chr1 (141-204)||(5676293-5676355)
chr1 (213-256)||(20252581-20252624)
chr1 (21-63)||(22837420-22837463)
chr1 (159-209)||(15863099-15863149)
chr1 (141-215)||(22836987-22837059)
chr1 (160-253)||(9786009-9786100)
chr1 (214-259)||(20252558-20252603)
chr1 (21-57)||(36358137-36358174)
chr1 (21-57)||(38035421-38035458)
chr1 (21-68)||(19601511-19601559)
chr1 (21-92)||(37846297-37846366)
[»] chr6 (62 HSPs)
chr6 (21-259)||(35017407-35017645)
chr6 (21-271)||(18004801-18005050)
chr6 (21-252)||(18843671-18843900)
chr6 (21-259)||(35011079-35011316)
chr6 (21-259)||(18128340-18128576)
chr6 (21-249)||(33316379-33316606)
chr6 (21-259)||(13622888-13623121)
chr6 (21-215)||(25646592-25646786)
chr6 (21-215)||(31626739-31626933)
chr6 (21-249)||(18578834-18579061)
chr6 (21-259)||(19627498-19627735)
chr6 (21-207)||(16104850-16105037)
chr6 (29-222)||(14628361-14628553)
chr6 (88-256)||(18825606-18825774)
chr6 (21-209)||(22428473-22428664)
chr6 (21-207)||(18775506-18775691)
chr6 (21-221)||(23975708-23975908)
chr6 (21-209)||(32896282-32896461)
chr6 (21-265)||(16827767-16828003)
chr6 (21-153)||(23151706-23151837)
chr6 (21-208)||(18397163-18397351)
chr6 (21-265)||(4988988-4989221)
chr6 (21-224)||(1553930-1554124)
chr6 (21-201)||(13016526-13016702)
chr6 (21-265)||(19984865-19985096)
chr6 (21-265)||(25173518-25173751)
chr6 (21-265)||(18740645-18740877)
chr6 (21-209)||(25369097-25369295)
chr6 (21-207)||(25745987-25746160)
chr6 (141-259)||(4989201-4989319)
chr6 (151-259)||(16238707-16238814)
chr6 (145-259)||(16827619-16827733)
chr6 (141-256)||(25173731-25173848)
chr6 (214-271)||(23975925-23975982)
chr6 (193-255)||(18128584-18128646)
chr6 (21-91)||(18422115-18422185)
chr6 (193-271)||(16827711-16827789)
chr6 (21-87)||(33323040-33323106)
chr6 (214-271)||(18128555-18128612)
chr6 (21-93)||(18835474-18835544)
chr6 (21-176)||(22866408-22866564)
chr6 (35-94)||(15738496-15738556)
chr6 (21-96)||(17787746-17787821)
chr6 (193-259)||(18128706-18128770)
chr6 (214-259)||(18579050-18579095)
chr6 (141-213)||(14628316-14628388)
chr6 (171-215)||(18422185-18422229)
chr6 (21-67)||(7829717-7829764)
chr6 (195-265)||(13622858-13622926)
chr6 (193-259)||(18128682-18128746)
chr6 (193-259)||(1554119-1554184)
chr6 (141-259)||(18128586-18128698)
chr6 (214-271)||(33316331-33316390)
chr6 (27-93)||(940904-940971)
chr6 (213-256)||(18128676-18128719)
chr6 (141-208)||(23975956-23976023)
chr6 (213-259)||(19627737-19627783)
chr6 (213-259)||(35011031-35011077)
chr6 (138-256)||(1554193-1554311)
chr6 (243-271)||(14628362-14628390)
chr6 (213-265)||(16238816-16238868)
chr6 (21-56)||(16889621-16889657)
[»] chr5 (73 HSPs)
chr5 (21-271)||(10780056-10780305)
chr5 (21-259)||(34937571-34937808)
chr5 (21-264)||(28257781-28258019)
chr5 (21-249)||(10307-10534)
chr5 (21-271)||(9732536-9732782)
chr5 (21-249)||(43445674-43445901)
chr5 (21-259)||(23986120-23986359)
chr5 (21-259)||(25211748-25211982)
chr5 (21-259)||(25275900-25276134)
chr5 (21-234)||(11579922-11580132)
chr5 (21-249)||(19497936-19498163)
chr5 (21-224)||(22885032-22885234)
chr5 (21-207)||(21661407-21661593)
chr5 (21-249)||(17473665-17473892)
chr5 (21-215)||(21392432-21392624)
chr5 (21-208)||(24184952-24185137)
chr5 (21-249)||(1221604-1221826)
chr5 (21-265)||(29192621-29192857)
chr5 (21-239)||(1171250-1171464)
chr5 (21-207)||(4863551-4863744)
chr5 (21-271)||(18779996-18780235)
chr5 (21-265)||(11340599-11340832)
chr5 (28-259)||(17907853-17908076)
chr5 (21-271)||(25944510-25944750)
chr5 (21-271)||(110935-111173)
chr5 (21-265)||(25424664-25424897)
chr5 (21-207)||(27185517-27185699)
chr5 (21-264)||(22368442-22368674)
chr5 (21-209)||(11338602-11338802)
chr5 (21-265)||(35793112-35793345)
chr5 (141-256)||(10554-10671)
chr5 (141-258)||(10779965-10780082)
chr5 (21-209)||(23453184-23453371)
chr5 (21-209)||(23460428-23460615)
chr5 (21-209)||(23464689-23464876)
chr5 (141-259)||(25944417-25944536)
chr5 (145-259)||(110844-110957)
chr5 (21-271)||(16534391-16534630)
chr5 (141-256)||(16534604-16534721)
chr5 (126-265)||(21653126-21653257)
chr5 (141-215)||(11582266-11582340)
chr5 (141-256)||(29192524-29192641)
chr5 (214-271)||(1221558-1221615)
chr5 (141-256)||(11340862-11340981)
chr5 (143-215)||(1170395-1170467)
chr5 (21-94)||(7726919-7726993)
chr5 (214-271)||(10523-10580)
chr5 (214-271)||(11340987-11341044)
chr5 (214-271)||(43445628-43445685)
chr5 (141-221)||(22368331-22368411)
chr5 (229-271)||(19498166-19498208)
chr5 (141-256)||(25424877-25424994)
chr5 (21-93)||(24470555-24470626)
chr5 (193-264)||(22368392-22368463)
chr5 (21-197)||(19403813-19403991)
chr5 (214-259)||(22368269-22368314)
chr5 (141-209)||(1221516-1221584)
chr5 (201-264)||(1171275-1171338)
chr5 (214-261)||(11582235-11582282)
chr5 (159-210)||(16534750-16534801)
chr5 (141-216)||(19498182-19498257)
chr5 (21-215)||(23510233-23510414)
chr5 (206-271)||(35793056-35793121)
chr5 (193-265)||(11340810-11340882)
chr5 (229-265)||(17473626-17473662)
chr5 (141-213)||(43445582-43445654)
chr5 (141-208)||(9732495-9732562)
chr5 (193-259)||(34937840-34937904)
chr5 (193-256)||(10658-10723)
chr5 (159-209)||(22884967-22885017)
chr5 (21-57)||(23492236-23492273)
chr5 (215-256)||(34937836-34937877)
chr5 (30-90)||(21647196-21647255)
[»] scaffold0269 (6 HSPs)
scaffold0269 (21-271)||(3055-3305)
scaffold0269 (21-256)||(281-520)
scaffold0269 (213-259)||(3345-3391)
scaffold0269 (202-259)||(3286-3343)
scaffold0269 (214-259)||(3322-3367)
scaffold0269 (215-259)||(527-571)
[»] scaffold0049 (4 HSPs)
scaffold0049 (21-271)||(30650-30900)
scaffold0049 (193-265)||(30946-31016)
scaffold0049 (202-259)||(30881-30938)
scaffold0049 (214-259)||(30917-30962)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (21-259)||(41508883-41509122)
chr8 (21-207)||(20655756-20655943)
chr8 (21-271)||(22008299-22008548)
chr8 (21-256)||(24108424-24108657)
chr8 (21-248)||(22909309-22909535)
chr8 (21-249)||(13664516-13664743)
chr8 (21-249)||(13723791-13724018)
chr8 (21-259)||(18610428-18610665)
chr8 (21-206)||(37605283-37605467)
chr8 (21-259)||(24719279-24719513)
chr8 (21-265)||(22323175-22323414)
chr8 (21-259)||(16043009-16043245)
chr8 (21-259)||(16041333-16041569)
chr8 (21-259)||(269950-270183)
chr8 (21-259)||(645737-645970)
chr8 (21-259)||(831472-831705)
chr8 (21-215)||(25120745-25120938)
chr8 (21-181)||(41243948-41244107)
chr8 (21-265)||(3433485-3433718)
chr8 (21-249)||(23509068-23509295)
chr8 (21-265)||(43375260-43375493)
chr8 (21-215)||(19994876-19995078)
chr8 (21-179)||(17343480-17343635)
chr8 (21-176)||(18768536-18768691)
chr8 (21-265)||(28835980-28836213)
chr8 (21-209)||(38531882-38532069)
chr8 (21-209)||(17731200-17731387)
chr8 (141-269)||(3433328-3433455)
chr8 (21-215)||(20479893-20480092)
chr8 (126-265)||(29758658-29758790)
chr8 (21-94)||(39448573-39448646)
chr8 (21-141)||(6776303-6776422)
chr8 (141-265)||(13664371-13664496)
chr8 (141-265)||(13723646-13723771)
chr8 (21-249)||(24387378-24387593)
chr8 (120-206)||(28543268-28543355)
chr8 (21-87)||(21695899-21695965)
chr8 (214-271)||(23509284-23509341)
chr8 (21-93)||(23631101-23631173)
chr8 (21-213)||(16416537-16416734)
chr8 (21-84)||(28543151-28543213)
chr8 (214-271)||(13664470-13664527)
chr8 (214-271)||(13723745-13723802)
chr8 (161-250)||(24930792-24930881)
chr8 (171-256)||(28836223-28836310)
chr8 (160-215)||(16203997-16204052)
chr8 (21-94)||(22737759-22737834)
chr8 (192-265)||(22008214-22008288)
chr8 (193-265)||(24719151-24719221)
chr8 (21-73)||(31196395-31196448)
chr8 (193-265)||(3433435-3433507)
chr8 (26-65)||(17283559-17283599)
chr8 (194-259)||(18768505-18768572)
chr8 (213-256)||(22909277-22909320)
chr8 (193-259)||(24108397-24108461)
chr8 (213-259)||(18610667-18610713)
chr8 (117-197)||(21679532-21679612)
chr8 (214-259)||(24719205-24719250)
chr8 (21-88)||(29758559-29758624)
[»] scaffold0434 (1 HSPs)
scaffold0434 (21-265)||(2907-3151)
[»] scaffold0622 (5 HSPs)
scaffold0622 (37-259)||(7452-7675)
scaffold0622 (138-271)||(7682-7815)
scaffold0622 (141-207)||(7842-7908)
scaffold0622 (159-224)||(7807-7871)
scaffold0622 (207-271)||(7647-7711)
[»] chr3 (92 HSPs)
chr3 (21-224)||(38166213-38166416)
chr3 (21-222)||(7851683-7851884)
chr3 (21-234)||(11812801-11813013)
chr3 (21-224)||(30140984-30141186)
chr3 (21-215)||(17098913-17099107)
chr3 (21-256)||(19944805-19945041)
chr3 (21-258)||(17936455-17936692)
chr3 (21-209)||(47786548-47786735)
chr3 (21-215)||(51160142-51160335)
chr3 (21-209)||(11199226-11199415)
chr3 (21-249)||(16819043-16819268)
chr3 (21-209)||(14287323-14287514)
chr3 (21-215)||(50113797-50113991)
chr3 (21-211)||(6148533-6148723)
chr3 (21-207)||(35121921-35122105)
chr3 (21-209)||(30204696-30204883)
chr3 (21-207)||(319297-319486)
chr3 (21-219)||(18737974-18738171)
chr3 (21-209)||(12351520-12351709)
chr3 (26-206)||(12796728-12796908)
chr3 (21-208)||(14296730-14296917)
chr3 (21-208)||(14302357-14302544)
chr3 (21-271)||(18908679-18908918)
chr3 (38-265)||(17958071-17958288)
chr3 (21-215)||(22145956-22146145)
chr3 (21-265)||(22273034-22273267)
chr3 (21-215)||(19572504-19572693)
chr3 (115-209)||(11062773-11062868)
chr3 (21-100)||(11062941-11063020)
chr3 (159-271)||(7851875-7851987)
chr3 (126-221)||(13815981-13816076)
chr3 (79-249)||(8630101-8630270)
chr3 (26-265)||(49230251-49230479)
chr3 (21-265)||(19230318-19230549)
chr3 (21-265)||(2451209-2451442)
chr3 (21-265)||(19262676-19262907)
chr3 (28-239)||(9304638-9304841)
chr3 (21-209)||(14523088-14523278)
chr3 (141-256)||(18908892-18909009)
chr3 (148-249)||(7851968-7852069)
chr3 (21-265)||(10736824-10737055)
chr3 (141-237)||(11813179-11813275)
chr3 (21-108)||(17536836-17536923)
chr3 (141-256)||(49230509-49230626)
chr3 (21-215)||(16183739-16183945)
chr3 (21-265)||(25057035-25057269)
chr3 (21-265)||(45581101-45581332)
chr3 (28-224)||(54686529-54686718)
chr3 (21-265)||(2048323-2048557)
chr3 (21-112)||(54045612-54045703)
chr3 (21-94)||(39654163-39654237)
chr3 (160-265)||(15860882-15860987)
chr3 (21-265)||(23490768-23491002)
chr3 (184-265)||(33340258-33340339)
chr3 (141-209)||(7852223-7852291)
chr3 (21-92)||(14061039-14061110)
chr3 (21-108)||(13815856-13815943)
chr3 (141-256)||(2451112-2451229)
chr3 (141-207)||(7852089-7852155)
chr3 (21-209)||(15515925-15516118)
chr3 (141-256)||(22273247-22273364)
chr3 (21-87)||(55443682-55443748)
chr3 (26-79)||(11884026-11884079)
chr3 (214-271)||(16819257-16819314)
chr3 (21-80)||(12563338-12563397)
chr3 (21-100)||(53900385-53900463)
chr3 (184-259)||(54049630-54049705)
chr3 (21-94)||(17137699-17137773)
chr3 (194-259)||(15516051-15516118)
chr3 (163-207)||(7852177-7852221)
chr3 (141-213)||(11813048-11813120)
chr3 (202-260)||(11813136-11813194)
chr3 (195-265)||(11813259-11813329)
chr3 (21-62)||(15548828-15548870)
chr3 (214-271)||(7852058-7852115)
chr3 (214-271)||(11813017-11813074)
chr3 (193-265)||(49230457-49230529)
chr3 (193-256)||(19945002-19945065)
chr3 (213-256)||(30141227-30141270)
chr3 (184-235)||(33340186-33340237)
chr3 (193-239)||(15516076-15516122)
chr3 (193-256)||(18908996-18909061)
chr3 (193-256)||(22273351-22273416)
chr3 (21-94)||(25769532-25769606)
chr3 (120-197)||(40938063-40938140)
chr3 (159-209)||(49230655-49230705)
chr3 (21-57)||(11330803-11330840)
chr3 (21-57)||(15874506-15874543)
chr3 (193-259)||(19945052-19945120)
chr3 (21-93)||(33340038-33340107)
chr3 (194-242)||(38166467-38166515)
chr3 (193-265)||(54686713-54686784)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (21-222)||(27950-28152)
scaffold0116 (141-222)||(28125-28206)
scaffold0116 (171-215)||(28209-28253)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (53-271)||(94335-94553)
scaffold0044 (193-259)||(94525-94591)
scaffold0044 (213-259)||(94665-94711)
scaffold0044 (214-259)||(94570-94615)
scaffold0044 (213-259)||(94593-94639)
scaffold0044 (195-259)||(94625-94687)
[»] scaffold0483 (4 HSPs)
scaffold0483 (21-249)||(4604-4831)
scaffold0483 (160-265)||(4413-4518)
scaffold0483 (214-256)||(4573-4615)
scaffold0483 (228-256)||(4524-4552)
[»] scaffold0109 (4 HSPs)
scaffold0109 (21-249)||(49444-49671)
scaffold0109 (160-265)||(49253-49358)
scaffold0109 (214-256)||(49413-49455)
scaffold0109 (228-256)||(49364-49392)
[»] scaffold0034 (6 HSPs)
scaffold0034 (23-256)||(77600-77836)
scaffold0034 (195-271)||(36020-36096)
scaffold0034 (126-259)||(36004-36134)
scaffold0034 (193-265)||(36142-36214)
scaffold0034 (214-271)||(36113-36170)
scaffold0034 (215-259)||(77869-77913)
[»] scaffold0023 (6 HSPs)
scaffold0023 (21-249)||(156149-156376)
scaffold0023 (171-259)||(58294-58382)
scaffold0023 (21-258)||(85923-86149)
scaffold0023 (214-271)||(156103-156160)
scaffold0023 (141-208)||(156062-156129)
scaffold0023 (21-69)||(92252-92300)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (21-215)||(256634-256827)
scaffold0011 (21-265)||(125067-125298)
scaffold0011 (21-265)||(72086-72317)
scaffold0011 (21-265)||(76467-76698)
scaffold0011 (21-265)||(192768-192999)
[»] scaffold0031 (3 HSPs)
scaffold0031 (24-203)||(68597-68777)
scaffold0031 (21-206)||(30314-30497)
scaffold0031 (165-208)||(68767-68810)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (21-259)||(26451-26687)
scaffold0138 (21-215)||(15080-15271)
scaffold0138 (207-259)||(26707-26759)
scaffold0138 (213-256)||(26689-26732)
scaffold0138 (21-57)||(24243-24280)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (21-207)||(59865-60051)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (21-222)||(21626-21827)
scaffold0077 (214-265)||(21559-21610)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (28-256)||(29644-29873)
scaffold0125 (214-256)||(29879-29921)
[»] scaffold0184 (4 HSPs)
scaffold0184 (21-248)||(33395-33613)
scaffold0184 (161-250)||(32863-32952)
scaffold0184 (213-256)||(33602-33645)
scaffold0184 (213-256)||(33626-33669)
[»] scaffold0078 (4 HSPs)
scaffold0078 (21-248)||(39231-39449)
scaffold0078 (161-250)||(39892-39981)
scaffold0078 (213-256)||(39175-39218)
scaffold0078 (213-256)||(39199-39242)
[»] chr2 (63 HSPs)
chr2 (21-215)||(36892434-36892628)
chr2 (126-265)||(25600312-25600451)
chr2 (21-259)||(42180165-42180402)
chr2 (21-224)||(21276333-21276535)
chr2 (21-259)||(24966425-24966658)
chr2 (21-209)||(28972272-28972461)
chr2 (21-215)||(25877692-25877882)
chr2 (21-209)||(7319718-7319906)
chr2 (21-221)||(12637988-12638187)
chr2 (21-265)||(3801073-3801306)
chr2 (21-249)||(12643778-12644000)
chr2 (21-265)||(34822315-34822548)
chr2 (21-209)||(31915-32102)
chr2 (21-265)||(19888687-19888920)
chr2 (21-208)||(21140139-21140325)
chr2 (21-208)||(269422-269608)
chr2 (21-265)||(8941712-8941945)
chr2 (21-265)||(38706760-38706993)
chr2 (21-271)||(25210893-25211132)
chr2 (21-265)||(9654565-9654792)
chr2 (21-265)||(20629092-20629323)
chr2 (21-209)||(24573133-24573320)
chr2 (143-256)||(25211108-25211223)
chr2 (21-108)||(4450084-4450171)
chr2 (21-94)||(22654339-22654412)
chr2 (21-239)||(24089050-24089275)
chr2 (21-100)||(25600173-25600252)
chr2 (141-256)||(3800926-3801043)
chr2 (126-236)||(15631723-15631833)
chr2 (21-209)||(22581671-22581858)
chr2 (21-102)||(22691829-22691910)
chr2 (21-102)||(22696476-22696557)
chr2 (141-209)||(6877859-6877927)
chr2 (214-271)||(12637914-12637971)
chr2 (214-271)||(12643732-12643789)
chr2 (161-265)||(461007-461111)
chr2 (126-247)||(43644681-43644795)
chr2 (131-208)||(22691690-22691768)
chr2 (131-208)||(22696337-22696415)
chr2 (214-269)||(3800865-3800920)
chr2 (195-265)||(461091-461161)
chr2 (171-249)||(8941955-8942033)
chr2 (21-215)||(8886450-8886631)
chr2 (141-224)||(19888624-19888707)
chr2 (229-271)||(21276263-21276305)
chr2 (21-91)||(22273164-22273233)
chr2 (141-209)||(12643690-12643758)
chr2 (21-91)||(6877721-6877791)
chr2 (21-91)||(22282397-22282466)
chr2 (194-265)||(24089074-24089147)
chr2 (21-208)||(22861795-22861971)
chr2 (193-259)||(24089054-24089122)
chr2 (162-215)||(43644635-43644688)
chr2 (193-265)||(3801023-3801095)
chr2 (213-265)||(24966660-24966712)
chr2 (193-258)||(25211210-25211277)
chr2 (141-208)||(12637873-12637940)
chr2 (213-259)||(7513770-7513816)
chr2 (21-57)||(19670970-19671007)
chr2 (21-57)||(24296382-24296419)
chr2 (195-259)||(24966620-24966682)
chr2 (21-56)||(23823315-23823351)
chr2 (21-56)||(23825259-23825295)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (21-216)||(13547-13740)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (21-215)||(31038-31230)
[»] scaffold0253 (2 HSPs)
scaffold0253 (21-206)||(14849-15032)
scaffold0253 (21-93)||(4067-4141)
[»] scaffold0191 (3 HSPs)
scaffold0191 (21-259)||(450-683)
scaffold0191 (213-265)||(396-448)
scaffold0191 (195-259)||(426-488)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (21-208)||(113965-114150)
scaffold0022 (21-176)||(107909-108069)
scaffold0022 (21-67)||(106708-106755)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (21-215)||(20860-21054)
scaffold0008 (21-215)||(28450-28644)
scaffold0008 (161-250)||(129871-129960)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (100-265)||(13864-14029)
scaffold0396 (21-100)||(14075-14154)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (139-259)||(15891-16011)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (21-249)||(2431-2658)
scaffold0342 (21-208)||(4078-4263)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (21-215)||(535-728)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-207)||(13964-14153)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (21-215)||(5845-6038)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (21-215)||(37760-37954)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (21-215)||(138480-138673)
scaffold0021 (21-215)||(76589-76779)
scaffold0021 (127-209)||(10003-10086)
scaffold0021 (21-85)||(9876-9940)
[»] scaffold0009 (4 HSPs)
scaffold0009 (21-265)||(270329-270565)
scaffold0009 (21-207)||(236412-236597)
scaffold0009 (159-207)||(236610-236658)
scaffold0009 (141-215)||(270545-270618)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (21-259)||(21114-21344)
scaffold0039 (141-265)||(20980-21104)
scaffold0039 (207-271)||(21078-21142)
[»] scaffold0195 (7 HSPs)
scaffold0195 (21-256)||(17526-17757)
scaffold0195 (21-234)||(19556-19765)
scaffold0195 (21-94)||(8466-8539)
scaffold0195 (21-94)||(13855-13928)
scaffold0195 (214-257)||(17739-17782)
scaffold0195 (214-271)||(19769-19826)
scaffold0195 (140-207)||(19799-19866)
[»] scaffold0315 (1 HSPs)
scaffold0315 (21-256)||(16770-17004)
[»] scaffold0447 (8 HSPs)
scaffold0447 (141-259)||(2737-2855)
scaffold0447 (141-259)||(2865-2983)
scaffold0447 (141-265)||(2993-3117)
scaffold0447 (148-259)||(2616-2727)
scaffold0447 (207-271)||(2699-2763)
scaffold0447 (207-271)||(2827-2891)
scaffold0447 (207-271)||(2955-3019)
scaffold0447 (21-108)||(2475-2561)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (21-207)||(4425-4605)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (21-207)||(66405-66592)
scaffold0037 (133-215)||(26490-26572)
scaffold0037 (21-91)||(26590-26660)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (21-199)||(3217-3395)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (21-249)||(9896-10122)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-207)||(75550-75727)
scaffold0001 (171-259)||(166144-166232)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (21-265)||(2849-3083)
scaffold0597 (141-215)||(2796-2869)
[»] scaffold0383 (9 HSPs)
scaffold0383 (141-265)||(5601-5725)
scaffold0383 (148-259)||(5480-5591)
scaffold0383 (21-254)||(328-550)
scaffold0383 (141-256)||(641-758)
scaffold0383 (195-271)||(591-667)
scaffold0383 (207-271)||(5563-5627)
scaffold0383 (21-108)||(5339-5425)
scaffold0383 (193-256)||(719-784)
scaffold0383 (193-265)||(539-611)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (21-195)||(56206-56370)
scaffold0051 (160-199)||(56369-56408)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (21-209)||(1652-1839)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (21-215)||(7087-7287)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (21-215)||(1120-1307)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (21-265)||(31120-31353)
scaffold0130 (141-256)||(31333-31450)
scaffold0130 (49-145)||(12989-13085)
[»] scaffold0158 (3 HSPs)
scaffold0158 (21-168)||(23040-23186)
scaffold0158 (21-90)||(16376-16445)
scaffold0158 (218-256)||(23256-23294)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (21-209)||(12488-12684)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (161-271)||(109945-110055)
scaffold0032 (141-256)||(109854-109971)
scaffold0032 (21-224)||(53931-54121)
[»] scaffold0066 (3 HSPs)
scaffold0066 (28-265)||(44266-44495)
scaffold0066 (49-265)||(52457-52665)
scaffold0066 (193-258)||(52643-52710)
[»] scaffold0028 (6 HSPs)
scaffold0028 (105-234)||(90783-90912)
scaffold0028 (21-108)||(90931-91018)
scaffold0028 (141-224)||(128730-128813)
scaffold0028 (141-215)||(90674-90748)
scaffold0028 (193-271)||(128678-128756)
scaffold0028 (214-271)||(90722-90779)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (21-235)||(25538-25749)
scaffold0134 (237-271)||(25727-25761)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (28-209)||(6123-6303)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (21-224)||(6401-6583)
scaffold0407 (21-112)||(28-119)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (21-108)||(26873-26960)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (21-265)||(6884-7115)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (86-209)||(145231-145351)
scaffold0014 (21-94)||(144987-145060)
[»] scaffold0003 (4 HSPs)
scaffold0003 (21-265)||(5221-5455)
scaffold0003 (141-256)||(5435-5550)
scaffold0003 (161-250)||(217420-217509)
scaffold0003 (193-247)||(5537-5591)
[»] scaffold1486 (1 HSPs)
scaffold1486 (171-259)||(1246-1334)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (161-265)||(144926-145030)
scaffold0025 (161-265)||(147185-147289)
[»] scaffold0450 (1 HSPs)
scaffold0450 (21-208)||(4528-4725)
[»] scaffold0384 (1 HSPs)
scaffold0384 (21-256)||(221-448)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (21-224)||(804-996)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (21-224)||(27169-27361)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (21-215)||(19306-19489)
[»] scaffold1140 (1 HSPs)
scaffold1140 (21-265)||(1298-1529)
[»] scaffold0095 (1 HSPs)
scaffold0095 (21-94)||(7416-7489)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (21-108)||(3927-4014)
scaffold0673 (100-215)||(3781-3897)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (21-93)||(15167-15239)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (21-94)||(2438-2511)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (21-94)||(72093-72166)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (21-68)||(7299-7346)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (93-205)||(8445-8558)
scaffold0190 (21-61)||(8387-8427)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (21-93)||(37627-37697)
scaffold0106 (174-265)||(39933-40024)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (130-208)||(31931-32010)
scaffold0103 (21-100)||(31776-31853)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (161-250)||(197772-197861)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (160-259)||(11700-11799)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (21-67)||(6891-6937)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (140-209)||(2920-2989)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (161-250)||(41107-41196)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (140-209)||(26623-26692)
[»] scaffold0243 (2 HSPs)
scaffold0243 (141-209)||(3978-4044)
scaffold0243 (194-259)||(3978-4045)
[»] scaffold0498 (2 HSPs)
scaffold0498 (21-206)||(12557-12728)
scaffold0498 (161-209)||(7408-7456)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-209)||(249218-249394)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (21-57)||(4327-4364)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (21-57)||(118403-118440)
[»] scaffold1610 (1 HSPs)
scaffold1610 (21-92)||(45-114)
[»] scaffold1605 (1 HSPs)
scaffold1605 (21-92)||(1465-1534)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (161-209)||(5283-5331)


Alignment Details
Target: scaffold0338 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 24 - 250
Target Start/End: Original strand, 6984 - 7210
Alignment:
Q  24 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  6984 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcatacatgtatacttatctcataatcc 7083  T
Q  124 cgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaat 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7084 cgatatctcacatcaataatcaccaatcacacgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaat 7183  T
Q  224 cctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7184 cctcaatcatatttcatgaacaatcac 7210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 66)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13868080 - 13867830
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  13868080 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcataa 13867981  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    || | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13867980 tctcaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 13867881  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  13867880 aaatatcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacatttatcatgaaca 13867830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7286522 - 7286294
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  7286522 acatcatcataatcaacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 7286423  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7286422 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 7286323  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  7286322 aatcaccaatcataagtcatgaacaatca 7286294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 7290908 - 7291142
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  7290908 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 7291006  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  7291007 tcccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcaagaac 7291106  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7291107 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 7291142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 12545802 - 12545600
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||  ||| ||    
T  12545802 acatcatcatagtccacattacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcttatacatatacttacatcaaaa 12545703  T
Q  121 tcccga-tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||| | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545702 accccaatatctcacatcaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 12545603  T
Q  220 caa 222  Q
    |||    
T  12545602 caa 12545600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 369143 - 369379
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||  | ||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  369143 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatacatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 369241  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||     
T  369242 ccccaatatctcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatcatgaat 369341  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369342 aatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 369379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18305831 - 18305585
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||   || ||    
T  18305831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacacca-aa 18305736  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  18305735 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcgtcaatcacatatatcgtgaac 18305636  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  18305635 aaatatcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacatttatcatgaaca 18305585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 44863443 - 44863637
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  44863443 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacttatacttacatcaaaa 44863542  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44863543 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 44863637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2192799 - 2192572
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  2192799 acattatcataatccaaataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 2192701  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  2192700 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 2192601  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  2192600 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 2192572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26072131 - 26071937
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||  |    
T  26072131 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26072032  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26072031 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 26071937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26095918 - 26095724
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||  |    
T  26095918 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 26095819  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26095818 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 26095724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 47287976 - 47288170
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||  ||| ||    
T  47287976 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcgtacatatacttacatcaaaa 47288075  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47288076 acccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaattacatacatca 47288170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 16481029 - 16480802
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  16481029 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacatgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 16480931  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16480930 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 16480831  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||  |||| ||||||||    
T  16480830 aatcaccaatcataagtcataaacaatca 16480802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 15953050 - 15952825
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  15953050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 15952954  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  15952953 ccccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 15952854  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  15952853 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 15952825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 12753172 - 12753358
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||| |     
T  12753172 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacaaat-aatacttatatcacat 12753270  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    || | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12753271 tctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaatttgcagttattcatacacagtcaccaatcac 12753358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15824371 - 15824178
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  15824371 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 15824273  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  15824272 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacataatcaccaaacacatacatca 15824178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14253263 - 14253046
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  14253263 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcaaatcaatacttacatca-aa 14253165  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  14253164 ccccaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatgacaaat-atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 14253066  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||  |||||| |||||||    
T  14253065 aatcaccaatcacatttcat 14253046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 141869 - 142062
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  141869 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaatcatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 141967  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  141968 ccccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaattattcatacacaataaccaatcacatacatca 142062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49049723 - 49049549
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||  ||||    
T  49049723 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacata--tatattcataccata 49049626  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacaca 195  Q
    ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  49049625 atcccaatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcaca 49049549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 15629004 - 15629192
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaa-taataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| || |||| ||| | || |  |||    
T  15629004 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaatcataatatccatatatatattcatacc--ata 15629101  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||    
T  15629102 atcccaatatcttacatcaattaatcaccaatcagatgtgttatgaacaatcatcaactcacatttattcatgcacaatcatcattcacat 15629192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 12545627 - 12545509
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12545627 aatcaccaatcacatatatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcccatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 12545528  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||| |||  ||||||||    
T  12545527 gaacagtcattaatcacat 12545509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 13272976 - 13273164
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  || | | ||  ||||    
T  13272976 acatcatcataattcacataacagttgacaagaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacata--tacattcataccata 13273073  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| || ||||||    
T  13273074 atcccgatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtctggaacaatcatcaaatcacatttatccatgcacaatcatcattcacat 13273164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 3893381 - 3893573
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacata------tgtatacttatc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||      | ||||||||      
T  3893381 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaata-ttcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcataaatatatatatacttaca 3893479  T
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    ||| || ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3893480 tcaaaaccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcac 3893573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 11582840 - 11582609
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  11582840 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatagttcaatt--aacatcatgcatttgattaataataat---cacacattaatacttacatcacac 11582746  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | | |||||||||||||||||||| |||||||       ||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  11582745 -ctcaatatctcacatcaataatcatcaatcac-------atggacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaaccacatttatcatgaac 11582654  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11582653 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 11582609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 126 - 249
Target Start/End: Original strand, 2024765 - 2024892
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaat----cacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaaca 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||    
T  2024765 atatctcacatcaataatcaccaatcaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcatcaatcatatacatcatgaaca 2024864  T
Q  222 atcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    |||  ||||||||   ||||||||||||    
T  2024865 atcaccaatcataagccatgaacaatca 2024892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15762445 - 15762251
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||    
T  15762445 acatcaacataatcaaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaa 15762346  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | | |||||||||||||||||||| | ||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  15762345 cctcaatatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcac--atatcatgaac 15762255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45454026 - 45453932
Alignment:
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45454026 tcataatcctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcaca 45453932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13039114 - 13038883
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  13039114 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatccataataat---cacacattaatacttacatcacac 13039020  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | | |||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  13039019 -ctcaatatctcacatcaataatcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaaatgttcattcacaatcaccgatcacatttgtcatgaac 13038928  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13038927 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 13038883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 16416509 - 16416743
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  16416509 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 16416605  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaa 219  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  16416606 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttattcatgaa 16416697  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16416698 taatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 16416743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16571923 - 16571833
Alignment:
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16571923 atcccaatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 16571833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 16572053 - 16571983
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16572053 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16571983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 16593609 - 16593679
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16593609 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataata 16593679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 120 - 209
Target Start/End: Original strand, 16593739 - 16593829
Alignment:
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16593739 atcccaatacctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcgtgaacaatcatcaactcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 16593829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 32496451 - 32496220
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||  |||| |||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  32496451 acattatcataatccaaacagcagttaacatgaatatttcaatt--aacaacatgcatttgatcaataataat---cacacataaatacttacatcacac 32496357  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcac-caatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
    ||| |||||||||||||||||||||  ||||||        ||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  32496356 tcc-gatatctcacatcaataatcaatcaatcat-------atgaacaattatcaattcataattattcat-cacaaacaccaatcacatttatcatgaa 32496266  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32496265 taatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 32496220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 113168 - 112986
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||   |||||| ||| |||||||||||| || |   |||||||  |||||||  ||| ||    
T  113168 acatcatcataatccaaataacatttagcatgaatatttcaaaataaacattatgcacttgatcaatagtagt---cacatatcaatacttacatcaaaa 113072  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     | | |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||| | |||||||    
T  113071 -ctcaatatctcacatcaataataaccaatcacatgtgtcatgaacaaacaacaattcacatttattcatacgcaattatcaatcac 112986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 45455581 - 45455499
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatat 103  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  45455581 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatttaattcaaaaatcatatacttgatcaataatgatattcatatat 45455499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 122869 - 123001
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  122869 atatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacaattatcaattcacaactattaattcacaatcaccaattacatttatcatgaataatca 122961  T
Q  226 tcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    | | ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  122962 ttactcacatttcatgaacaatccccaatcacatatatca 123001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 3054982 - 3055215
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||| |   | |||| ||  ||| |||| ||| |     
T  3054982 acattatcataattcaaatagcagttaacatgaatatttcaatt-aatcatcatgcatttgatcaataaaa---tccacacattaataattatatcacac 3055077  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaa 219  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  3055078 cccc-atatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatattcatgaa 3055169  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     | || | | ||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  3055170 tagtcattagtcacattttatgaacaatcaccaatcacatatatca 3055215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 16210102 - 16210205
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatg 260  Q
    ||||||||| | ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||     
T  16210102 atgaacaattaccaattcacaat-attcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcacaaatcacata 16210200  T
Q  261 tatca 265  Q
    |||||    
T  16210201 tatca 16210205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 197 - 271
Target Start/End: Original strand, 11285473 - 11285547
Alignment:
Q  197 tcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  11285473 tcaccaatcgcatgtatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacatttatcatgaaca 11285547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Original strand, 2024692 - 2024757
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaa 86  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  2024692 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaa 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2192583 - 2192526
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2192583 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 2192526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7286274 - 7286198
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7286274 aatcaccaaccacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaaca 7286198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12249907 - 12249853
Alignment:
Q  155 tgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  12249907 tgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacattcactaatcacat 12249853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13867858 - 13867792
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13867858 acaatcattaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcatatttcatgaacaatcagcaatcacat 13867792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7286226 - 7286160
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  7286226 acaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacat 7286160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 16416723 - 16416838
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||   ||    
T  16416723 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagtt-ttcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcct-gatcatatacatc 16416820  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16416821 atgaacaatcaccaatca 16416838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 1938529 - 1938448
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||  |||||| |||| |||| |||||  |||||||||||||    
T  1938529 atatctcacatcaataaccaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaatacacaattatgcatacgtaatcaccaatcac 1938448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16480832 - 16480756
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||||||  ||  |||| ||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16480832 acaatcaccaatca--taagtcataaacaatcattaatcatacttcaagaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 16480756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 74
Target Start/End: Original strand, 11285348 - 11285402
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatcat 74  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  11285348 acatcatgataatccacataacagttaaacatgaataattcaattcaaaaatcat 11285402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 11285519 - 11285585
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  11285519 acaatcattaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatcattaatcacat 11285585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 16209975 - 16210045
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  16209975 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattctatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 16210045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7286324 - 7286248
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||||||  ||  |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7286324 acaatcaccaatca--taagtcatgaacaatcattaatcatatttcatgaataatcaccaaccacatttatcatgaaca 7286248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13867864 - 13867762
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||||||||||||| ||| |||| |||| |||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  13867864 tcatgaacaatcattaat-cacatttat-catgaacaatcatcaatca--tatttcatgaacaatcagcaatcacatttcatgaacaatcaccaaccaca 13867769  T
Q  259 tgtatca 265  Q
    | |||||    
T  13867768 tatatca 13867762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15762256 - 15762191
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  15762256 acaatcaccaa-cacatttatcatgaacaatcattaatcatatcccatgaacaatcaccaaccacat 15762191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 11285564 - 11285621
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  11285564 catgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaaca 11285621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16480782 - 16480710
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat 213  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  16480782 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattccttcacaatcaccaatcacaaatat 16480710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 122770 - 122838
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||    
T  122770 acattatcataatccaaatagcagttaacacgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataata 122838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 12249943 - 12249908
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaata 56  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12249943 acatcatcataatccacataacaattaacatgaata 12249908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 13376002 - 13376049
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataattcaattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  13376002 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataaaacaattcaa 13376049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 2024904 - 2024954
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  2024904 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacat 2024954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12545537 - 12545479
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  12545537 catatttcatgaacagtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatca 12545479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15952813 - 15952763
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15952813 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacat 15952763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Original strand, 16416825 - 16416879
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  16416825 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcataattcatgaacaat 16416879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15762182 - 15762064
Alignment:
Q  138 aataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatattt 237  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||  |||| |||  | ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  15762182 aataatcatcaatcacatttatcatgaataatcatcaat-cacgtttat-catgaataatcaccaaccacatttatcatgaataatcatcaatcacattt 15762085  T
Q  238 --catgaacaatcaccaatca 256  Q
      |||||| ||||||||||||    
T  15762084 atcatgaataatcaccaatca 15762064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 2192552 - 2192480
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat 213  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||| | ||||||||||||| ||| ||||    
T  2192552 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattccttcacaatcaccaataacaaatat 2192480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 198 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 10862661 - 10862598
Alignment:
Q  198 caccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  10862661 caccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaccacatttatcatgaacaatcatcaatcacat 10862598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 17735 - 17985
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  17735 acatcatcaaaatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacaccatgtacttgatcaataataatattctcatatatatacttatatcatta 17834  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17835 tcccaatacctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattaacagttattaatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 17934  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  17935 aaatatcaatcatatttcatgaacaatcatcaatcacatttatcatgaaca 17985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 17957 - 18023
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  17957 acaatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatcattaatcacat 18023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 259
Target Start/End: Original strand, 17951 - 18047
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||  ||||||| ||||||  |||  ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17951 tcatgaacaatcatcaat-cacatttat-catgaacaatcatcaatca--tattccatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcaca 18046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Original strand, 18025 - 18077
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18025 tcatgaacaatcaccaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatca 18077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 72)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 34393385 - 34393636
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  34393385 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 34393484  T
Q  121 tcccga-tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34393485 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatctgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcgccaatcacatatatcatgaa 34393584  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  34393585 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 34393636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 18166874 - 18167123
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  18166874 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 18166972  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18166973 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 18167072  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18167073 aatcaccaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcatgaaca 18167123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 53909750 - 53909505
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata- 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| |     
T  53909750 acatcatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 53909651  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53909650 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatttatcatgaa 53909551  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  53909550 caatcattaatcacatttcatgaacattcaccaatcacatatatca 53909505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 15274663 - 15274427
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  15274663 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataaaattcccacatcaatacttacatca-aa 15274565  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||     
T  15274564 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaattatcaatcatatacatcatgaat 15274465  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15274464 aatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 15274427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45460894 - 45460709
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatg--tatacttatctcat 118  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  45460894 acatcataataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatgataatattcacatatgtatatacttatatcat 45460795  T
Q  119 aatcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaa 203  Q
    || ||| |||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45460794 aaccccaatatttcacatcaataattcatcaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaa 45460709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 12838192 - 12837998
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||| ||    
T  12838192 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttatatcaaaa 12838093  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12838092 ccccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 12837998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 7134503 - 7134276
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||| |||  ||| ||    
T  7134503 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaataattacatca-aa 7134405  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7134404 ccccaatatcccacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 7134305  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  7134304 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 7134276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21961440 - 21961253
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||  |||||     
T  21961440 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatcaatacttaaatcatac 21961341  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21961340 tcccaatagctcacatcaattaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 21961253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19699606 - 19699369
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  19699606 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 19699508  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19699507 ccccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 19699408  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  19699407 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 19699369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19710191 - 19709954
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  19710191 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 19710093  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19710092 ccccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 19709993  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  19709992 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 19709954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 8372607 - 8372834
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  8372607 acattatcataatccaaataacagttaacaagaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 8372705  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  8372706 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 8372805  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    | ||  ||||||||   ||||||||||||    
T  8372806 agtcaccaatcataagccatgaacaatca 8372834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 26678179 - 26678404
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  26678179 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccatatcaatacttacatca-aa 26678275  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26678276 ccccaatatgtcacatcaatattcacctatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 26678375  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  26678376 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 26678404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20813890 - 20813704
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatg--tatacttatctcat 118  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||  ||||||||| ||||    
T  20813890 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacacatgtatatacttatatcat 20813794  T
Q  119 aatcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||||| |||| |||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20813793 aatcccaatatttcacatcaataattcattaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaaacaccattcac 20813704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 22356616 - 22356390
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||   ||||||   |||  |    
T  22356616 acattatcataatccaaataacagttaacaataatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacataacaatacttgcatcaaga 22356519  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||    
T  22356518 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaac 22356419  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  22356418 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 22356390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 12901631 - 12901455
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||          |||||||  ||||||    
T  12901631 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataatt-aattcaaacatcatgtacttgatcaatataaatat----------atacttacatcataa 12901543  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||  ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12901542 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaataatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcac 12901455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 30236411 - 30236232
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||         |||| ||||||||| ||||||    
T  30236411 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacctgatcaataat---------atatatatacttatatcataa 30236321  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
       | ||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30236320 ctgcaatatctcacatcaataaatcaccaattacatgtgtcatgaacaatcaataattcacagttattcatacacagtcaccaatcaca 30236232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 44054168 - 44054347
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||||          |||||||  ||||||    
T  44054168 acatcatcataatccaaataacagttaacataattaatttaattcaaacatcatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 44054257  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44054258 tcccaatatctcatatcaataaatcaccagtcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 44054347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53706828 - 53706604
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| | |||||||||| |||    || | ||   ||||||  ||| |     
T  53706828 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcagtataaacatcatgcatttgatcaatagtaaa---cataaattagtacttacatcacac 53706732  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcacc-aatcacatatatc-atga 218  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  53706731 -cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaaatcacatatatcaatga 53706633  T
Q  219 acaatcctcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  53706632 acaatcattaatcacatttcatgaacaat 53706604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 13811558 - 13811380
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| || |||  || | | ||  ||||    
T  13811558 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccaaata--taaattcataccata 13811461  T
Q  120 atcccgatatctcacat-caataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatca 199  Q
    ||||| |||||| |||| || ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13811460 atcccaatatcttacatccattaatcaccaatcacacgtgtaatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatca 13811380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 44345057 - 44345247
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatct----- 115  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| |         
T  44345057 acatcatcataatcaaaacaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatacatatatactta 44345156  T
Q  116 ---cataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaa 203  Q
       || || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||| |||||||||||||    
T  44345157 catcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaa 44345247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 18246178 - 18246411
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  18246178 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 18246274  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  18246275 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacgattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 18246366  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  18246367 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 18246411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18294746 - 18294592
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  | | ||    
T  18294746 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaatatcatctacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatta-aa 18294648  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaat 176  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |   |||||||||||| |||||    
T  18294647 tcccaatatctcacatcaataatcaccgatcacataaatcatgaacaatcctcaat 18294592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 33738477 - 33738657
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||          |||||    |||||  ||| ||    
T  33738477 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaata----------catat----acttacatcaaaa 33738562  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||| ||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33738563 ccccaatatctcacatcaataatcaacaatcgcatgtgccatgagcaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 33738657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 16520801 - 16521035
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaa-catcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |    
T  16520801 acatcatcataatctaaataatagttaacatggatatttcaatttaaaacatcatgcacttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca 16520897  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
      |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  16520898 c-cccgatatcttacatctatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaa 16520989  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16520990 taatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatca 16521035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 19998517 - 19998750
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  ||||| |  ||| |     
T  19998517 acattatcataatccaaataacagtcaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatactcacatcacac 19998613  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  19998614 -cccaatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 19998705  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19998706 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 19998750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 47355509 - 47355719
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||   |||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||| ||    
T  47355509 acattatcataatcca-ataacagttatcacgaacatttcaatt---acatgatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaa 47355604  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||    
T  47355605 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcatcaattatatacatcatgaac 47355704  T
Q  221 aatcctcaatcatat 235  Q
    ||||  |||||||||    
T  47355705 aatcaccaatcatat 47355719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16366624 - 16366435
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| ||||||| || |||||||   |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  16366624 acatcatcataatccaaataatagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgcgtttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacac 16366529  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||  |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16366528 -cctaatatctcacatcaataatcatcaatcaaatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcactaatcacatatatca 16366435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 109748 - 109979
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |  |||||||||||||    |||| ||  |||||||  ||| |     
T  109748 acattatcataatacaaatagcagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatctgatcaataataac---cacacattaatacttacatcacac 109842  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||     
T  109843 cccc-atatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcgccaatcacaattatcatgaat 109934  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  109935 agtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 109979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 15211515 - 15211732
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||| | ||  |||||||  |||  |    
T  15211515 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa---tcatacattcatacttacatca-ca 15211610  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | | |||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| |||||||| ||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||     
T  15211611 cctcaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcgcaaatattcattaacaatcaccaatcacatttatcatgaat 15211703  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  15211704 aatcattaatcacatttcatgaacaatca 15211732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 9293712 - 9293940
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||   |||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  9293712 acattatcataatccaaataacagataacatggatatttcaacataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 9293807  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat-catgaa 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||| | |||| ||||||  | ||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  9293808 tcccaatatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacagttatcatttcacaaattttcattcacaatctccaatcacaaatattcatgaa 9293900  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
     |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  9293901 taatcattaatcacatttcacgaacaatcaccaatcacat 9293940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 13244606 - 13244787
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  13244606 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacac 13244700  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     | | |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13244701 -ctcaatatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatca 13244787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 141 - 257
Target Start/End: Original strand, 16521015 - 16521133
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  16521015 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcatcaattaacaattattcatacacaatcaccaatcatatgcatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 16521114  T
Q  239 atgaacaatcaccaatcac 257  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16521115 atgaacaatcaccaatcac 16521133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 10642374 - 10642608
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  10642374 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 10642469  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat-catgaa 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||| | |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  10642470 tcccaatatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacagttatcacttcacaaatattcattcacaatctccaatcacaaatattcatgaa 10642562  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     | || | ||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10642563 tagtcattaattacatttcacgaacaatcaccaatcacatttatca 10642608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 55378650 - 55378542
Alignment:
Q  100 atatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatc 198  Q
    |||| ||||||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  55378650 atatatatacttacatcataattccaatatctcacatcaattaatcaccaatcttatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaaatattcatacacaatc 55378551  T
Q  199 accaatcac 207  Q
    | |||||||    
T  55378550 atcaatcac 55378542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 8372823 - 8372880
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8372823 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 8372880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 54120096 - 54119964
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||| || || ||||||||||||||     
T  54120096 atatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacaattatcaattcacaaatattcaatcacaatcaccaaccatatttatcatgaacaatca 54120004  T
Q  226 tcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    | ||| | |||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  54120003 ttaattacatttcatgaataatcaccgatcacatatatca 54119964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7134239 - 7134184
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaa 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7134239 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaa 7134184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 8874346 - 8874272
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatat 95  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  8874346 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatat 8874272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 18496334 - 18496169
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca-ataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||| | || |||  |||||||||| |||| || ||| | || |  |||    
T  18496334 acatcatcataatccatataacaaataacatgaatagttcaatttaaatatcatgcatttaatccgataataatat-cacaaatatattcatacc--ata 18496238  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttatt 187  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  18496237 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtttcatgaataatcatcaaatcacatttatt 18496169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 26678393 - 26678450
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26678393 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaattaccaatcacatgtatcaggaaca 26678450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 43283293 - 43283131
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattca----catatgtatacttatc 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||| |||||||||| | |    ||||| || ||| ||     
T  43283293 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataattcaattcaaatagcatgtatataatcaaataataataataatatccatatatacactcata 43283194  T
Q  115 tcataatcccgatatctcaca-tcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaat 176  Q
     |||||| || |||||| ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  43283193 ccataattccaatatcttacattcaacaatcaccaatcacatatgtcatgaacattcatcaat 43283131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 197
Target Start/End: Original strand, 34393610 - 34393666
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaat 197  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34393610 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaat 34393666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 13751989 - 13751910
Alignment:
Q  130 ctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  13751989 ctcacatcaattaatcaccaatcacatatgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 13751910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 18246391 - 18246508
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||   ||    
T  18246391 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaatccacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcacggatcatatacatc 18246490  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18246491 atgaacaatcaccaatca 18246508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 18294627 - 18294577
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaaca 245  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18294627 aatcaccgatcacataaatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaaca 18294577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 19998891 - 19998933
Alignment:
Q  229 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19998891 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 19998933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Original strand, 27959370 - 27959436
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaa 86  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  27959370 acatcaccataatccacataacagttaagcatgaataatttaattcaaatatcatgtacttaatcaa 27959436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 55378532 - 55378466
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  55378532 acaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacat 55378466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 141 - 249
Target Start/End: Original strand, 19998780 - 19998888
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    |||||||||| || ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||   |||||||   |||    
T  19998780 aatcaccaattacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcatacacaatcaccaatcatatacttcatgaacaatcgcaaatcataagccat 19998879  T
Q  241 gaacaatca 249  Q
    |||||||||    
T  19998880 gaacaatca 19998888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 5684802 - 5684715
Alignment:
Q  26 atcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttat 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||  ||||||||    
T  5684802 atcataatccaaataacagttaacatgaatattacaaattaaacatcatgcacttgatcaacactaatactcccatattaatacttat 5684715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 18167097 - 18167164
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  18167097 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 18167164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Original strand, 19998728 - 19998806
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19998728 acaatcaccaattacttgtatcatgaataatcactaatcacatttcatgaaaaatcaccaattacatgtatcaggaaca 19998806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Original strand, 14867696 - 14867749
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatca 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14867696 acatcatcataatccacataacagttaaacataaataattcaattcaaatatca 14867749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 55378757 - 55378678
Alignment:
Q  28 cataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| ||||    
T  55378757 cataatcca-ataactgttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttaatcaataataatatccatatatatata 55378678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 271
Target Start/End: Original strand, 15211729 - 15211788
Alignment:
Q  212 atcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15211729 atcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcatgaaca 15211788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 19998907 - 19998982
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcat 216  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  19998907 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaccaatatcat 19998982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7134287 - 7134245
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7134287 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 7134245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 8372854 - 8372921
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  8372854 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 8372921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13752159 - 13752082
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 100  Q
    |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  13752159 acatcagcataattcacataaca-ttaacatgaataattcaac-cgaacttcatgcatttgatcaataataagattcaca 13752082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Original strand, 15211762 - 15211836
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||  ||||||||| |  || |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15211762 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcaaaaatactcattcacaatcaccaatcacaaatatca 15211836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 16521168 - 16521218
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16521168 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacat 16521218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 18246495 - 18246560
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18246495 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 18246560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19699367 - 19699321
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19699367 tcatgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 19699321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19709952 - 19709906
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19709952 tcatgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 19709906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 43283168 - 43283122
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  43283168 acaatcaccaatcacatatgtcatgaacattcatcaatcacatttca 43283122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Original strand, 47355697 - 47355731
Alignment:
Q  237 tcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47355697 tcatgaacaatcaccaatcatatgtatcaggaaca 47355731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21961319 - 21961290
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21961319 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 21961290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22356384 - 22356335
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  22356384 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccgatca 22356335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22356401 - 22356356
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  22356401 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcattaatcacat 22356356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 34198025 - 34197988
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34198025 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataa 34197988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 19824328 - 19824284
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaatt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||    
T  19824328 acatcatcataatccacataacagttaagcgtgaataaatcaatt 19824284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 55378556 - 55378504
Alignment:
Q  219 acaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  55378556 acaatcatcaatcacctttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaaca 55378504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 164; Significance: 1e-87; HSPs: 56)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 41217544 - 41217783
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  41217544 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 41217643  T
Q  121 tcccga-tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217644 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 41217743  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  41217744 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacat 41217783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22408162 - 22407968
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  22408162 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 22408063  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22408062 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgagcaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatca 22407968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 20252342 - 20252579
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||||  ||| ||    
T  20252342 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattatcatatcaatacttacatca-aa 20252440  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20252441 ccccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtatcatgaacgaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 20252540  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||| ||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  20252541 aaatatcaattatattccatgaacattcattaatcacat 20252579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 35524350 - 35524165
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  35524350 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttacatcataa 35524254  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35524253 tcccaatttctcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 35524165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9786315 - 9786073
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||  | ||||||  |||  |    
T  9786315 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacatttcatcataaacatcatacacttgatcaataataatatcctcatacatgtacttacatca--a 9786218  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| || |||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  9786217 ccccaatgtctcacatcaataatctccaatcacatttgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattacccatcacatatatcatgaac 9786118  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9786117 aatcccaaatcatattccatgaacaatcatcaatcacatttatca 9786073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5676535 - 5676350
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |  |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||   ||||||||  ||| ||    
T  5676535 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcattataaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatgcatatacttacatca-aa 5676437  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5676436 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatcac 5676350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15863508 - 15863269
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || ||||||| |||||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  15863508 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaccatcatgcacttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacac 15863412  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  15863411 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 15863320  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15863319 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcatgaaca 15863269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 22352285 - 22352524
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||  ||  |||||||  ||| |     
T  22352285 acattatcataatccaaataatagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat---cacgcattaatacttacatcacac 22352381  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||        |||||||||  ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  22352382 -cccaatatctcatatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattttcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 22352473  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22352474 aatcatcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 22352524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 133 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20895596 - 20895464
Alignment:
Q  133 acatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatca 232  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | |||||    
T  20895596 acatcaataatcaccaatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattaatca 20895497  T
Q  233 tatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20895496 catttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 20895464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2422997 - 2422813
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||  |||||||||||||||   ||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  2422997 acatcaacataatccaaataacaattaacatggatatttcaatataaacatcatacacttgatcaataata---ttctcatacatatacttacatca-aa 2422902  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2422901 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacat 2422813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 41217793 - 41217911
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217793 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 41217892  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  41217893 gaacaatcattaatcacat 41217911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 203
Target Start/End: Original strand, 35053141 - 35053312
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||  |          || ||    
T  35053141 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacaccatgtacttgatcaataataacattctcatacat----------ca-aa 35053229  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaa 203  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35053230 ccacaatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatcaccaa 35053312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 17146820 - 17147053
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  17146820 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 17146916  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||| ||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||     
T  17146917 -cccgatatttcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtatatcatgaat 17147008  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  17147009 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 17147053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 21716430 - 21716624
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtat------acttatc 114  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||      ||  ||     
T  21716430 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcattataaacatcatgtacttgatcaataataatattcatatatatatacacacacacata 21716529  T
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
     ||||||| | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  21716530 ccataatctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaattaccaatcaca 21716624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51658255 - 51658069
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||  |||||  || | | ||  |||||    
T  51658255 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatatacttaatc-acaataatatctacata--tacattcataccataa 51658159  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    | || |||||| ||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  51658158 ttccaatatcttacatcaattaatcaccaatcgcatgtggcatgaacaattatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacat 51658069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22250905 - 22250767
Alignment:
Q  85 aataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagtt 184  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||  ||| || ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22250905 aataataatattctcatatcaatacttacatca-aaccccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtt 22250807  T
Q  185 attcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 224  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22250806 attcatacacaaccaccaatcatatacatcatgaacaatc 22250767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 54 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20590078 - 20589876
Alignment:
Q  54 ataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatca 152  Q
    ||||||||||| |||  |||| || || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||     
T  20590078 ataattcaatttaaatctcatatatttaatcaataataatatccacatgtatatacttatatcataatcacaatatctcacatcaataaatcaccaatcg 20589979  T
Q  153 cgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcacca 252  Q
    | ||| |||||||||||| ||||  || | |||   ||  |||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20589978 catgtatcatgaacaatcctcaa-ccatattta---atgaacaatcattaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatcatca 20589883  T
Q  253 atcacat 259  Q
    |||||||    
T  20589882 atcacat 20589876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 18505646 - 18505817
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||||||||||   |||||||  |||||||  ||| |     
T  18505646 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgcatttgatcaataataatca-cacatattaatacttacatcacac 18505743  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacaca 195  Q
     ||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||    
T  18505744 -ccaaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacaaatattcattcaca 18505817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 15863295 - 15863178
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  15863295 aatcaccaattacatgtatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 15863196  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  15863195 atgaacaatcaccaatca 15863178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 20444132 - 20444236
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20444132 atgaacaattatcaattcacaattattcattcatagtcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacata 20444231  T
Q  261 tatca 265  Q
    |||||    
T  20444232 tatca 20444236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Original strand, 21857753 - 21857958
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||   ||||| ||  |||||||  |||  |    
T  21857753 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgtatttgatcaataataa---tcacacattaatacttacatca-ca 21857846  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||| |       |||||||| |||||| ||||  ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||     
T  21857847 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcatg-------tgaacaattatcaatgcacaaatattcattcataatcaccaatcacatttatcatgaat 21857939  T
Q  221 aatcctcaatcatatttca 239  Q
    |||| | ||||| ||||||    
T  21857940 aatcattaatcacatttca 21857958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Original strand, 22352498 - 22352623
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | || | ||||| ||||||    
T  22352498 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatattcatgaatagtcattaatcacatttca 22352597  T
Q  240 tgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  22352598 tgaacaatcaccaatcacatatatca 22352623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 183 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 37846222 - 37846140
Alignment:
Q  183 ttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  37846222 ttattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 37846140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 44036791 - 44036576
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||  |||| | || | |||||||||||||||   |||||||  |||||||  ||| |     
T  44036791 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataat-caatt--aacaacctgcatttgatcaataataat---cacatataaatacttacatcacac 44036698  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||     
T  44036697 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaattacattcatcatgaat 44036606  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  44036605 aatcattaatcacatttcatgaacaatcac 44036576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 161 - 259
Target Start/End: Original strand, 20529872 - 20529970
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  20529872 atgaacaattatcaattcacaattattcattcatagtcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcattaatcacat 20529970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 22364943 - 22365177
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   |||| ||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  22364943 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaacataaacctcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 22365038  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat-catgaa 219  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| | |||||       ||||||| | |||||||||||  ||||||| ||||||| | ||||||| |||| ||||||    
T  22365039 tcccaatatctcacgtcaataatcatccatcac-------atgaacagttatcaattcacaaatattcattcacaatctcaaatcacaaatattcatgaa 22365131  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     | || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22365132 tagtcattaatcacatttcacgaacaatcaccaatcacatttatca 22365177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20589990 - 20589914
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  20589990 aatcaccaatcgcatgtatcatgaacaatcctcaaccatatttaatgaacaatcattaatcacatttatcatgaaca 20589914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 17147033 - 17147150
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||   ||    
T  17147033 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagtcattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcactgatcatatacatc 17147132  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  17147133 atgaacaatcaccaatca 17147150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20589868 - 20589790
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  20589868 acaatcaccaaccacatttaccatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaaca 20589790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 20956886 - 20956820
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaa 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  20956886 acatcatcataatccacataacagttaaacatgaataaatcaatccaaatatcatgtacttaatcaa 20956820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 27673107 - 27673268
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc---aataataatattcacatatgt--atacttatc 114  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||||||| | |   ||||||||||| ||||||| |  ||||| ||     
T  27673107 acatcatcataatccacatgacagttaaacatgaataaat-aatccaaatatcatgtacttaaccaataataataatatccacatatatacatactcata 27673205  T
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaat 176  Q
     |||||| |  |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27673206 ccataatactaatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat 27673268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 41217755 - 41217819
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  41217755 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 41217819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 155 - 215
Target Start/End: Original strand, 49966017 - 49966077
Alignment:
Q  155 tgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    ||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49966017 tgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 49966077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 20895687 - 20895596
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatactta 112  Q
    |||||| |||||| ||  |||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  20895687 acatcaacataattcaattaactgtttacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatactta 20895596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22837260 - 22837186
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22837260 acatcatcataatccacataacagttaaacatgaataaatcaattc-aatatcatgtacttaatcaaataataata 22837186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20589818 - 20589752
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20589818 acaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattagtcacatttcatgaacaatcaccaaccacat 20589752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22837060 - 22836987
Alignment:
Q  194 caatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22837060 caatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcacatttatca 22836987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 20929872 - 20929961
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||||||| ||||||| |||  ||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||| | ||||| |||||||| ||||||||    
T  20929872 atgaacaattatcaattaacaaatattcattcaaaatcaccaatcacatttttcatgaataatcattaatcacatttcatggacaatcac 20929961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Original strand, 20529948 - 20530000
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20529948 tcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 20530000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20956777 - 20956710
Alignment:
Q  194 caatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | |  ||||||||||||| |||||||||    
T  20956777 caatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaatcacaataatcatgaacaatcatcaatcacat 20956710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 41217883 - 41217935
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41217883 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 41217935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 20252587 - 20252651
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  20252587 acaatcaccaatcacattt--catgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 20252651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 63
Target Start/End: Original strand, 22080190 - 22080232
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaat 63  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22080190 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaat 22080232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20589897 - 20589852
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  20589897 catgaacaatcatcaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacat 20589852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9786025 - 9785973
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9786025 tcatgaacaatcgccaaccatatttcatgaacaatcaccaaccacatttatca 9785973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5676355 - 5676293
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaat 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  5676355 aatcaccaatcacatgtgtcatgacaaat-atcaatacataattattcatacacaatcaccaat 5676293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Original strand, 20252581 - 20252624
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20252581 tcatgaacaatcaccaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 20252624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22837463 - 22837420
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaat 63  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22837463 acatcatcataatccacataacagttaaacatgaataaatcaat 22837420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15863149 - 15863099
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15863149 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacat 15863099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22837059 - 22836987
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  22837059 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaa-tcacattta-tcatgaacaatcatcaatcacatttatca 22836987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 160 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 9786100 - 9786009
Alignment:
Q  160 catgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaa 253  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||| |||  | |||||  |||||||| |||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||    
T  9786100 catgaacaatcatcaat-cacatttat-catgaaaaatcattaatcacatttatcatgaacaatcattaatcacaattcatgaacaatcgccaa 9786009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Original strand, 20252558 - 20252603
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20252558 catgaacattcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 20252603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 36358174 - 36358137
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36358174 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataa 36358137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 38035458 - 38035421
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38035458 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataa 38035421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 68
Target Start/End: Original strand, 19601511 - 19601559
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataattcaattcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||||    
T  19601511 acatcatcataatccacataacagttagacatgaatgaaacaattcaaa 19601559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 37846366 - 37846297
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataa 92  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||   ||||||||||||||    
T  37846366 acattatcataatccaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgattttgatcaataataa 37846297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 62)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35017645 - 35017407
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  35017645 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatatcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatagatatacttacatcaaaa 35017546  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35017545 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 35017446  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  35017445 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacat 35017407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18005050 - 18004801
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  18005050 acattatcataatccaaataatagttaacatgaacatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 18004952  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18004951 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 18004852  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18004851 aatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 18004801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 21 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18843900 - 18843671
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  18843900 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatattttaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 18843803  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  18843802 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 18843703  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcacca 252  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  18843702 aatcaccaatcacatttcatgaacaatcacca 18843671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35011316 - 35011079
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  35011316 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 35011218  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35011217 ccccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 35011118  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  35011117 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 35011079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 18128340 - 18128576
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  18128340 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcatct-aaacatcatgcacttgatcaataattacattcccatacatatacttacatca-aa 18128437  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18128438 ccccaatatctcacatcaataatctccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcacatatatcatgaac 18128537  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18128538 aatccccaatcatattccatgaacaatcatcaatcacat 18128576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33316606 - 33316379
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  33316606 acattatcataaaccaaatagcagttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 33316508  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  33316507 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatttacatcatgaac 33316408  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  33316407 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 33316379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13623121 - 13622888
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||  ||| ||    
T  13623121 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatca-aa 13623026  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  13623025 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcac--atttcatgaac 13622928  T
Q  221 -aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
     ||||  |||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  13622927 aaatcaccaatcacatttcatgaacaatcattaatcacat 13622888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25646786 - 25646592
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  ||| ||    
T  25646786 acatcatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatacatatacttacatcaaaa 25646687  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  25646686 ccccaatatttcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaactattcacacacaatcaccaatcaaatatatca 25646592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 31626739 - 31626933
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||  |    
T  31626739 acatcatcttaatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacattatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 31626838  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31626839 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatattaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 31626933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 18578834 - 18579061
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  18578834 acatgatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatatgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 18578932  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  18578933 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaag 18579032  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  18579033 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 18579061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 19627498 - 19627735
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  19627498 acatcaacataatccaaataacagttaacattattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 19627596  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  19627597 ccccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcatatatatcgtgaac 19627696  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  19627697 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 19627735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 16104850 - 16105037
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||     
T  16104850 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcgttataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacataacaatacttacatcatac 16104949  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| |||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16104950 ccccaatatctcacatcaattaatcacctatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 16105037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 29 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 14628553 - 14628361
Alignment:
Q  29 ataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgata 128  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| || ||  |||||||  ||| || ||| |||    
T  14628553 ataatccaaataacatataacatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcattaataatattcccacatcaatacttacatca-aaccccaata 14628455  T
Q  129 tctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14628454 tctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatgtatcaggaacaa 14628361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18825774 - 18825606
Alignment:
Q  88 aataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttatt 187  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||  ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18825774 aataatattctcatatatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatt 18825675  T
Q  188 catacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18825674 catgaacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 18825606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 22428473 - 22428664
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgt--atacttatctcat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |  |||||||  ||||    
T  22428473 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgtacttgatcaacaataatactcaaatatatcaatacttacatcat 22428572  T
Q  119 aatcccgatatctcacatc-aataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |  ||| | |||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22428573 atccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacat 22428664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 18775506 - 18775691
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |   |||||||  ||| ||    
T  18775506 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataaaattcaaaaaaaaatacttacatca-aa 18775604  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18775605 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcataaacaaaaatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcac 18775691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Original strand, 23975708 - 23975908
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatatt-cacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||| | || ||  |||||||  ||| |    
T  23975708 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatttcccacatcaatacttacatca-a 23975806  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23975807 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaa 23975906  T
Q  220 ca 221  Q
    ||    
T  23975907 ca 23975908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 32896282 - 32896461
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||  |||||          |||||||  ||||||    
T  32896282 acatcatcataatccaaataacagttaccatgaataatttaattcaaacattatgtacttgatcgatataaatat----------atacttacatcataa 32896371  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
     ||| ||| |||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32896372 ccccaataactcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 32896461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16828003 - 16827767
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||  |  |||||||  ||| ||    
T  16828003 acattatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacgtcaatacttacatca-aa 16827905  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||  ||||||||||||||||||| ||||||        ||||||| | ||||||| |||  ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||     
T  16827904 ccccattatctcacatcaataatcatcaatcat-------atgaacagttatcaatttacaaatattcattcacaatcaccagtcacatttatcatgaat 16827812  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16827811 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatca 16827767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 153
Target Start/End: Original strand, 23151706 - 23151837
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  23151706 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 23151804  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcac 153  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23151805 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcac 23151837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 18397163 - 18397351
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |    
T  18397163 acatcatcataatccacataacgtttaacatgaatatttcaatttaaacttcgtgtacttggtcaataataatattcacatatatatacatatatcacga 18397262  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    || | | | |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||  ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  18397263 tctcaacaactcacatcaattaatcaccaatcgcatgtgtcatgaacaagtatccaatcacatttattcatgcaaaatcatcaatcaca 18397351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 4988988 - 4989221
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||| || ||||||  |||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||   ||| ||  |||||||  ||| |     
T  4988988 acattatcataatacaaataacaaataacataaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataata---acacattaatacttacatcacac 4989084  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  4989085 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 4989176  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4989177 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatca 4989221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 1553930 - 1554124
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| ||    
T  1553930 acatcaacataatcaaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaa 1554029  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | | |||||||||||||||||||| | ||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  1554030 cctcaatatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcac--atatcatgaac 1554120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 13016702 - 13016526
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||| | | |||||||||||||||||||  | |  ||||||||  |||  |    
T  13016702 acatcatcataatccaaata-cagttaacatgaatatttcaatttaa-catcaagcatttgatcaataataatattctaaaaaatatacttacatca--a 13016607  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcacc 201  Q
     ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13016606 ccccaatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcacc 13016526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19985096 - 19984865
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||| ||| |     
T  19985096 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttatatcacac 19985002  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | | |||||||||||||||  ||| |||||| |||       |||||| ||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  19985001 -ctcaatatctcacatcaatcgtcatcaatcatgtg-------aacaattatcgattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 19984910  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19984909 aatcattaatctcatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 19984865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 25173518 - 25173751
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   | ||| ||  |||||||  |||  |    
T  25173518 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa---ttacacattaatacttacatca-ca 25173613  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| |   ||||||        ||||| ||| |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  25173614 ccccgatatctcacatcaatatttgtcaatca-------tatgaataattatcagtttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 25173706  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25173707 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 25173751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 18740645 - 18740877
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||  |||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  18740645 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttgaatataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 18740740  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| ||||||||| |  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||     
T  18740741 tccagatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcaaaaatattcattcacaattaccaatcacatttatcatgaat 18740833  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| |  |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  18740834 aatcat-tatcacatttcatgaacagttaccaatcacatatatca 18740877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25369295 - 25369097
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaa-taataatattcacatatgtatacttatct--- 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||| ||||| || |||| ||||  ||| |       
T  25369295 acatcatcataatcgacataacagttaaacatgaataattcaattcaattatcatgtacttaatcaaataagaatatccatatatatatatatatatact 25369196  T
Q  116 -----cataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
         ||||||||| |||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  25369195 cataccataatcccaatatcttacattaagtaatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaa-tcacatttattcatgcacaatcatcaatcacat 25369097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 25746160 - 25745987
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| | |||              || ||    
T  25746160 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcat--------------caaaa 25746075  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25746074 ccccaatatctcacattaataaatccccaatcacgtgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcac 25745987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 4989201 - 4989319
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||   |||    
T  4989201 aatcaccaattacatgtatcatgaataaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatcataagccat 4989300  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||| |||||||| ||||    
T  4989301 gaacattcaccaattacat 4989319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 259
Target Start/End: Original strand, 16238707 - 16238814
Alignment:
Q  151 cacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac-aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  16238707 cacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac--atttcatgaacaaatcaccaatcacatttcatgaataatca 16238804  T
Q  250 ccaatcacat 259  Q
     |||| ||||    
T  16238805 tcaataacat 16238814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16827733 - 16827619
Alignment:
Q  145 accaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaac 244  Q
    |||||| || ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||   |||||||    
T  16827733 accaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacataatcaccaatcatataaatcatgaacaatcaccaatcataagccatgaac 16827634  T
Q  245 aatcaccaatcacat 259  Q
    | |||||||| ||||    
T  16827633 attcaccaattacat 16827619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 25173731 - 25173848
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||   ||    
T  25173731 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatcatatacatc 25173830  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  25173831 atgaacaatcaccgatca 25173848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 23975925 - 23975982
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23975925 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 23975982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 18128584 - 18128646
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatc 255  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18128584 acaatcaccaatcacatttatcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatc 18128646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 18422115 - 18422185
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  18422115 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataata 18422185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16827789 - 16827711
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  16827789 acaatcaccaattacatgtatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaattaccaattacatgtatcatgaaca 16827711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 33323040 - 33323106
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaat 87  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  33323040 acatcatcataatccacacaacagttaacatgaataatttaattcaaatttcatatacttaatcaat 33323106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 18128555 - 18128612
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18128555 catgaacaatcatcaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatttatcatgaaca 18128612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 18835544 - 18835474
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  18835544 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 18835474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 22866408 - 22866564
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgat-caataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    ||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||| | || || | ||||||||| ||||| || |||| | ||   |||    
T  22866408 acatcatcataattcaaataataattaacatgaataattccattcaaatatcatgcatttaatccgataataata-tcacacatatatattcatactata 22866506  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaat 176  Q
    ||| |||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || |||||    
T  22866507 atctcgatgtctcacatcaatcaatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaat 22866564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 94
Target Start/End: Original strand, 15738496 - 15738556
Alignment:
Q  35 cacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  15738496 cacataacagttaaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaattataata 15738556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 96
Target Start/End: Original strand, 17787746 - 17787821
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatatt 96  Q
    |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  17787746 acatcatcataatcaaaataataattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatatt 17787821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 18128706 - 18128770
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18128706 acaatcaccaatca--tattccatgaacaatcatcaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 18128770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Original strand, 18579050 - 18579095
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18579050 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 18579095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 14628388 - 14628316
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat 213  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  14628388 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 14628316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 18422185 - 18422229
Alignment:
Q  171 atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18422185 atcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 18422229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 7829764 - 7829717
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataattcaattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  7829764 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataaatcaattcaa 7829717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13622926 - 13622858
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  13622926 aatcaccaatcacattt--catgaacaatcattaatcacatttcatgaataatcaccaatcacatatatca 13622858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 18128682 - 18128746
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  18128682 acaatcaccaatcacattt--catgaacaatcaccaatcatattccatgaacaatcatcaatcacat 18128746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 1554119 - 1554184
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  1554119 acaatcaccaa-cacatttatcatgaacaatcattaatcatatcccatgaacaatcaccaaccacat 1554184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 18128586 - 18128698
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| ||| |||| ||   |||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||| | ||||| | |||||    
T  18128586 aatcaccaatcacatttatcatgaacaatcattaat-cacattt---catgaacaatcaccaatctcattt--catgaacaatcattaatcacaattcat 18128679  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18128680 gaacaatcaccaatcacat 18128698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33316390 - 33316331
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcat--gaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  33316390 catgaacaatcattaatcatatttcatatgaacaattaccaatcacatgtatcagaaaca 33316331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 940971 - 940904
Alignment:
Q  27 tcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||    
T  940971 tcataatccacatagcagttaggcatgaataattcaattcaaatatcatatacttaatccatagtaat 940904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Original strand, 18128676 - 18128719
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18128676 tcatgaacaatcaccaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 18128719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Original strand, 23975956 - 23976023
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  23975956 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 23976023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 19627737 - 19627783
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19627737 tcatgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 19627783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35011077 - 35011031
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35011077 tcatgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 35011031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 138 - 256
Target Start/End: Original strand, 1554193 - 1554311
Alignment:
Q  138 aataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatattt 237  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| |||  |||| |||  | ||||||||| ||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  1554193 aataatcatcaatcacatttatcatgaataatcatcaat-cacgtttat-catgaataatcaccaaccacatttatcatgaataatcatcaatcacattt 1554290  T
Q  238 --catgaacaatcaccaatca 256  Q
      |||||| ||||||||||||    
T  1554291 atcatgaataatcaccaatca 1554311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 243 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14628390 - 14628362
Alignment:
Q  243 acaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14628390 acaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 14628362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Original strand, 16238816 - 16238868
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| | | |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  16238816 tcatgaacaatcattagtcatatttcaggaataatcaccaatcacatatatca 16238868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 16889657 - 16889621
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaata 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16889657 acatcatcataatccacataacagttatacatgaata 16889621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 73)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10780305 - 10780056
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  10780305 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcacatcaatacttacatca-aa 10780207  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10780206 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 10780107  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10780106 aatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 10780056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 34937571 - 34937808
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  34937571 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 34937669  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||| |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34937670 ccccaatatctaacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 34937769  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  34937770 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 34937808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Original strand, 28257781 - 28258019
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||  ||| |     
T  28257781 acatcatcataatcaaaataacagttaaaatgaa-aattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatcacac 28257876  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28257877 -cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcatgaac 28257975  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatc 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  28257976 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaaccacatttatc 28258019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 10307 - 10534
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  10307 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 10405  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10406 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 10505  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  10506 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 10534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 9732782 - 9732536
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||   |||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  9732782 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcaagataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 9732687  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  9732686 tcccaatatctcgcatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaagatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 9732587  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    | || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732586 agtcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 9732536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 43445901 - 43445674
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  43445901 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 43445803  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43445802 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 43445703  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    | ||  ||||||||   ||||||||||||    
T  43445702 agtcaccaatcataagccatgaacaatca 43445674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23986359 - 23986120
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||  |||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||  |||||||  |||||     
T  23986359 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttctatataaacatcatgcacttgataaataataatactctcatatcaatacttacatcatac 23986260  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||| || | ||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  23986259 ccccaatgtttcacatcaagtaatcaccaatcatatgtgtcaggaacaaatattaattcacagttattcatacacaatcatcattcacatatatcgtgaa 23986160  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  23986159 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacat 23986120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25211982 - 25211748
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  25211982 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25211885  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
      || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||     
T  25211884 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcac--atttcatgaaa 25211787  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  25211786 aatcaccaatcatattccatgaacattcattaatcacat 25211748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25276134 - 25275900
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  25276134 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 25276037  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
      || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||     
T  25276036 ctccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacagaatcaccaatcac--atttcatgaaa 25275939  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||  |||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  25275938 aatcaccaatcatattccatgaacattcattaatcacat 25275900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 11579922 - 11580132
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  11579922 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattctcatat--atacttacatcaaaa 11580018  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
      || ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |||||||||    
T  11580019 ctccaatatctcacatcagtaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacgcagtcaccaatcatatacatcatgaac 11580118  T
Q  221 aatcctcaatcata 234  Q
    |||| |||||||||    
T  11580119 aatcatcaatcata 11580132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 19497936 - 19498163
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||| || ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||| ||  |||||||  ||| ||    
T  19497936 acattatcataatgcaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacattacgtacatgatcattaataatattcacacatcaatacttacatca-aa 19498034  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  19498035 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacttcatgaac 19498134  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||   |||||||   ||||||||||||    
T  19498135 aatcacaaatcataagccatgaacaatca 19498163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22885234 - 22885032
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  22885234 acattatcataatccaaataacagtcatcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 22885136  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  22885135 ccccaatatctcacatcaatgatcgccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcatatacatcatgaac 22885036  T
Q  221 aatc 224  Q
    ||||    
T  22885035 aatc 22885032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 21661593 - 21661407
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||  |||  |    
T  21661593 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcatacatatgcttacatcaaga 21661494  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21661493 ccccaatatctcacaacaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcac 21661407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 17473892 - 17473665
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||    |||||||  ||| ||    
T  17473892 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataaaaatactcacatca--atacttacatca-aa 17473796  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata--tcatga 218  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  17473795 ccccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatatgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatatacttcatga 17473696  T
Q  219 acaatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||||   |||||||   ||||||||||||    
T  17473695 acaatcacaaatcataagccatgaacaatca 17473665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 21392432 - 21392624
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||  ||  ||    
T  21392432 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataaaaatattctcatacatatacttacatc--aa 21392529  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| ||  || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21392530 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcagtttccaattattcatacacaatcaccaaacacatatatca 21392624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24185137 - 24184952
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||  ||||  || ||||||    
T  24185137 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtaattgatcaat---aatattcacatataaatacaaatatcataa 24185041  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    || | || ||||||||||| |||||||||||  | ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185040 tctcaatttctcacatcaattaatcaccaattccatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 24184952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 1221826 - 1221604
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||    |||||||  ||| ||    
T  1221826 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacatca--atacttacatca-aa 1221733  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  1221732 ccccaatagctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 1221633  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  1221632 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 1221604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29192857 - 29192621
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  29192857 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcattcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 29192759  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||||||||||| |||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||     
T  29192758 ccccgatatctcgcatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcaatcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 29192666  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| |  |||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  29192665 aatcattgatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 29192621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1171464 - 1171250
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| |     
T  1171464 acatcatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaag 1171365  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| ||||| || ||||||| | | ||||||| ||||||||| |||||    |||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||     
T  1171364 ccccaatatctcacattaataaacatcaatcacatttatcatgaataatcatcaa-tcaca---tttcataaacaatcaccaaccacatttatcctgaat 1171269  T
Q  221 aatcctcaatcatatttca 239  Q
    |||| ||||||| ||||||    
T  1171268 aatcatcaatcacatttca 1171250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 4863551 - 4863744
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgta------tacttat 113  Q
    |||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||      ||||||     
T  4863551 acatcatcataatcaaaacaacagttaatcatgaataatttaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttac 4863650  T
Q  114 ctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4863651 atcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaaagcacaattattcatacacaatcaccaatcac 4863744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18780235 - 18779996
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  18780235 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgattaataataatt---acacattaatacttacatcacac 18780139  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | |||||||||||||||||  ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  18780138 -ctcgatatctcacatcaatcttcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 18780047  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  18780046 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatcatgaaca 18779996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 11340599 - 11340832
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  11340599 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 11340695  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||||||||||||||| |||| ||| ||||||        |||||| || ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  11340696 -cccgatatctcacataaatattcatcaatcat-------atgaacgattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 11340787  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  11340788 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 11340832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Original strand, 17907853 - 17908076
Alignment:
Q  28 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccga 126  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||   || || ||| |    
T  17907853 cataatccaaataacagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaa 17907952  T
Q  127 tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcct 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |    
T  17907953 tatctcacatcaataatcatcgatcat-------atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcac--atatcatgaacaatcat 17908043  T
Q  227 caatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
     ||||||| | |||||||||||||||| |||||    
T  17908044 taatcatactccatgaacaatcaccaaccacat 17908076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25944750 - 25944510
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  25944750 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacac 25944654  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcac-caatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||  ||||||||||| ||||||||  ||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  25944653 -cctaatatctcacattaataatcaatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatcatgaa 25944562  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
     |||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  25944561 taataattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcatgaaca 25944510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 111173 - 110935
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  111173 acattatcataattcaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacac 111077  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  111076 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 110985  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  110984 aatcattaatcacatttcatgaacaat-accaattacatgtatcatgaaca 110935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 25424664 - 25424897
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  25424664 acattatcataattcaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 25424760  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||| ||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  25424761 -cccgatatttcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 25424852  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  25424853 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 25424897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 27185699 - 27185517
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||  ||| ||    
T  27185699 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatataaacattatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatca-aa 27185604  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||    
T  27185603 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgtacaaacaacaattcacatttattcagacacaattatcaatcac 27185517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22368674 - 22368442
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||   ||||  |  |||||||  ||| |     
T  22368674 acattatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat---cacacgttaatacttacatcacac 22368578  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||| |||  || ||||||        ||||||||| ||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  22368577 -cccgatatctcacatcgatatccatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 22368486  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatc 264  Q
    |||| | ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22368485 aatcattaatgacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatc 22368442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11338802 - 11338602
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattc------------acatatgtata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||            | |||| ||||    
T  11338802 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatatttcaattaaaagatcatgtacttgatcaataacaacattcatatatatatatatatatatata 11338703  T
Q  109 cttatctcataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
      ||| |||| ||||| ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  11338702 tatatatcatgatcccaataactcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaa-tcacatttattcatgcacaatcaccaatcac 11338604  T
Q  208 at 209  Q
    ||    
T  11338603 at 11338602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35793345 - 35793112
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  35793345 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 35793249  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     | |||||||||||||||||  ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  35793248 -ctcgatatctcacatcaatcttcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 35793157  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||| |||||| | | ||||||||||    
T  35793156 aatcattaatcacatttcatgaaaaatcacaatttacatgtatca 35793112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 10554 - 10671
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  10554 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 10653  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  10654 atgaacaatcaccaatca 10671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 10780082 - 10779965
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat-catgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||    
T  10780082 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaat-atcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatattcatgaataatcattaatcatatttca 10779984  T
Q  240 tgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10779983 tgaacaatcaccaatcaca 10779965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 23453184 - 23453371
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||| ||||||||||| |||| || |||  |||     ||    
T  23453184 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat-cacaaatatat--ttacaatcta 23453280  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  23453281 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacat 23453371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 23460428 - 23460615
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||| ||||||||||| |||| || |||  |||     ||    
T  23460428 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat-cacaaatatat--ttacaatcta 23460524  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  23460525 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacat 23460615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 23464689 - 23464876
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||| | || ||| ||||||||||| |||| || |||  |||     ||    
T  23464689 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgcatttaatccaataataatat-cacaaatatat--ttacaatcta 23464785  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  23464786 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaataatatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacaattatttatgcacaatcatcaatcacat 23464876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25944536 - 25944417
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat-catgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||||| | ||||| ||||||    
T  25944536 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcgcaaatattcatgaacaatcattaatcacatttca 25944437  T
Q  240 tgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  25944436 tgaacaatcaccaatcacat 25944417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 110957 - 110844
Alignment:
Q  145 accaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaac 244  Q
    |||||| || ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||   |||||||    
T  110957 accaattacatgtatcatgaacaat-atcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatcataagccatgaac 110859  T
Q  245 aatcaccaatcacat 259  Q
    | |||||||| ||||    
T  110858 attcaccaattacat 110844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 16534391 - 16534630
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| | |||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  16534391 acattatcataatccagataataattaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaacaataatt---acacattaatacttacatcacac 16534487  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||  ||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  16534488 -cccgaagtctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 16534579  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | |||||  ||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||    
T  16534580 aatcattaatcacgtttcatggaaaatcaccaattaaatgtatcatgaaca 16534630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 16534604 - 16534721
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| |  ||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  16534604 aatcaccaattaaatgtatcatgaacaattatctattcacagttattcatacgcaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 16534703  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  16534704 atgaacaatcaccaatca 16534721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21653257 - 21653126
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||| ||| |||| ||   |||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||     
T  21653257 atatctcacatcaataatcaccaatcacattt--catgaacaatcattaat-cacattt---catgaacaatcaccaatca--tatttcatgaacaatca 21653166  T
Q  226 tcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21653165 ccaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatttatca 21653126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Original strand, 11582266 - 11582340
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11582266 aatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatctccaatcacatacatca 11582340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29192641 - 29192524
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  29192641 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 29192542  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  29192541 atgaacaatcaccaatca 29192524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1221615 - 1221558
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1221615 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 1221558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 11340862 - 11340981
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat--atatcatgaacaatcctcaatcatat--t 236  Q
    |||||||||| || ||| ||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  | |||||||       
T  11340862 aatcaccaattacatgtatcatgactaataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatatcatgaacaatcaccgatcatataca 11340961  T
Q  237 tcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11340962 tcatgaacaatcaccaatca 11340981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 143 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1170467 - 1170395
Alignment:
Q  143 tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1170467 tcacaaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatca 1170395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 7726919 - 7726993
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  7726919 acatcatcataatccagataacagctaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 7726993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 10523 - 10580
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10523 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcatgaaca 10580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 11340987 - 11341044
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11340987 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccattcacatgtatcaggaaca 11341044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 43445685 - 43445628
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  43445685 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcgccaatcacatgtatcaggaaca 43445628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 141 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22368411 - 22368331
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaaca 221  Q
    |||||||||| || ||| || |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  22368411 aatcaccaattacatgtatcctgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaaca 22368331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Original strand, 19498166 - 19498208
Alignment:
Q  229 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498166 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 19498208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 25424877 - 25424994
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||   ||    
T  25424877 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagtcattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcactgatcatatacatc 25424976  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  25424977 atgaacaatcaccaatca 25424994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 24470555 - 24470626
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  24470555 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatagttcaatt-taacatcatgcatttgatcaataataat 24470626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22368463 - 22368392
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatc 264  Q
    |||||||||||| |||| |||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22368463 acaatcaccaattacatgtatcctgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatc 22368392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 197
Target Start/End: Original strand, 19403813 - 19403991
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgat-caataataatattcac--atatgtatacttatctca 117  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||| | |  || | ||||||||| ||||  |||| | || | ||   |    
T  19403813 acatcatcataatccatataataattaacatgaatagttcaattcaaatatcatgcattgaatccgataataata-tcacttatatatttattcatacta 19403911  T
Q  118 taatcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaat 197  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || | || ||||| ||||||| |||||||    
T  19403912 taatccccatatctcacatcaatcaatcaccagtcacatgtgtcatgaacattctttaa-tcacatttattcacacacaat 19403991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22368314 - 22368269
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22368314 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 22368269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1221584 - 1221516
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  1221584 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacat 1221516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 201 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 1171338 - 1171275
Alignment:
Q  201 caatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatc 264  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  1171338 caatcacatttatcatgaataatcatcaatcacatttcataaacaatcaccaaccacatttatc 1171275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 261
Target Start/End: Original strand, 11582235 - 11582282
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgt 261  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11582235 catgaacaatcattaataatatttcatgaacaatcaccaatcacatgt 11582282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 210
Target Start/End: Original strand, 16534750 - 16534801
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacata 210  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  16534750 tcatgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatctccaatcacata 16534801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 216
Target Start/End: Original strand, 19498182 - 19498257
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcat 216  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  19498182 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaccaatatcat 19498257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 23510233 - 23510414
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||    |||| ||  ||||||   |||||     
T  23510233 acattatcataatccaaatgacagttaacataaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataacaac---cacacattaatacttgcatcatac 23510327  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||       |||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  23510328 -cccaatatctcacatcaatagtcatcaatcatgtg-------aacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 23510414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 206 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 35793121 - 35793056
Alignment:
Q  206 acatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| ||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  35793121 acatgtatcatgaataataattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcatgaaca 35793056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 11340810 - 11340882
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11340810 acaatcaccaattacttgtatcatgaataatcactaatcacatttcatgaaaaatcaccaattacatgtatca 11340882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 229 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17473662 - 17473626
Alignment:
Q  229 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17473662 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 17473626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 43445654 - 43445582
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat 213  Q
    |||| |||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  43445654 aatcgccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 43445582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 9732562 - 9732495
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  9732562 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 9732495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 34937840 - 34937904
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  34937840 acaatcaccaatcacattt--catgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaattacat 34937904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 10658 - 10723
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10658 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 10723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22885017 - 22884967
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22885017 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacat 22884967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 23492236 - 23492273
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23492236 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataa 23492273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 215 - 256
Target Start/End: Original strand, 34937836 - 34937877
Alignment:
Q  215 atgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34937836 atgaacaatcaccaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 34937877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 30 - 90
Target Start/End: Original strand, 21647196 - 21647255
Alignment:
Q  30 taatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataat 90  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||    
T  21647196 taatccaaatagcagttaacatgaatatttcaatt-aatcatcatgcatttgatcaataat 21647255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 6)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 3055 - 3305
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  3055 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaaaatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 3154  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3155 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 3254  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||    
T  3255 aaatatcaatcatatttcatgaataatcattaatcacatttatcatgaaca 3305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 281 - 520
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata--cttatctcat 118  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||  |||     
T  281 acattatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 380  T
Q  119 aatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatga 218  Q
    || ||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  381 aaccccaatatcttacctcaacaatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatga 480  T
Q  219 acaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  481 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 3345 - 3391
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3345 tcatgaacaatcaccaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 202 - 259
Target Start/End: Original strand, 3286 - 3343
Alignment:
Q  202 aatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  3286 aatcacatttatcatgaacaaccatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 3343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Original strand, 3322 - 3367
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  3322 catgaacattcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 3367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 259
Target Start/End: Original strand, 527 - 571
Alignment:
Q  215 atgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  527 atgaacaatcattaatcatatttcatgaatgatcaccaatcacat 571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 30650 - 30900
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  30650 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 30749  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30750 ccccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 30849  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| |||||    
T  30850 aaatatcaatcatatttcatgaataatcattaatcacatttatcatgaaca 30900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 30946 - 31016
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  30946 acaatcaccaatcacattt--catgaacaatcattaatcacatttcatgaacattcaccaatcacatatatca 31016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 202 - 259
Target Start/End: Original strand, 30881 - 30938
Alignment:
Q  202 aatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  30881 aatcacatttatcatgaacaaccatcaatcatattccatgaacattcatcaatcacat 30938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Original strand, 30917 - 30962
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30917 catgaacattcatcaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 30962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 41509122 - 41508883
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  41509122 acatcatcataatccaaataacagttaatatggatatttcaattcaaacatcaggcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 41509023  T
Q  121 tcccga-tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41509022 accccaatatctcacatcaataatcaccactcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 41508923  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||| | ||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  41508922 caatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaagcacat 41508883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 9e-76
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20655943 - 20655756
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |    
T  20655943 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatatccacatatgtatacttatatcatga 20655844  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20655843 tcccaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 20655756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22008548 - 22008299
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  22008548 acattatcataatccaaataacagttaacataaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 22008450  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||    
T  22008449 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcatttcatagttattcatacacaatcatcaattatatacatcatgaac 22008350  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22008349 aatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcaggaaca 22008299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24108657 - 24108424
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  24108657 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 24108560  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
      || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  24108559 ctccaatatgtcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 24108460  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24108459 aatcaccaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 24108424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22909535 - 22909309
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  22909535 acattatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 22909437  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| |||||||| || |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22909436 tcccaatatctcaaattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 22909337  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatc 248  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  22909336 aatcattaatcacatttcatgaacaatc 22909309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13664743 - 13664516
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  13664743 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 13664645  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13664644 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 13664545  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  || |||||   ||||||||||||    
T  13664544 aatcaccactcataagccatgaacaatca 13664516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 13724018 - 13723791
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  13724018 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 13723920  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  13723919 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 13723820  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  || |||||   ||||||||||||    
T  13723819 aatcaccactcataagccatgaacaatca 13723791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 18610428 - 18610665
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  18610428 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 18610526  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18610527 ccccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 18610626  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  18610627 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 18610665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 37605283 - 37605467
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  37605283 acatcatcataatctaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatca-aa 37605381  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 206  Q
     ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37605382 ccccaatatttcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcaccaatca 37605467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24719513 - 24719279
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  ||||||   ||| ||    
T  24719513 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttgcatca-aa 24719418  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24719417 ccccaatatctcacattaataatcaccattcacatgtgtcatgaacaaatatcacttcacaattattcatacacaatcaccaatcacataaatcgtgaac 24719318  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   |||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  24719317 aaatatcaatcatatttcatgaataatcattaatcacat 24719279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22323414 - 22323175
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||   || ||||  ||| |     
T  22323414 acatcatcataaacaaaataacagttaacatgaa-aattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatgcttacatcacac 22323319  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22323318 -cccaatatctcacatcaatattcatcaatcacatgtatcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatcatgaac 22323220  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  22323219 aatcctcaatcatatttcaagaacaatcaccaaacacatttatca 22323175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16043245 - 16043009
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||| ||    
T  16043245 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16043148  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  16043147 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatcgtgaac 16043048  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  16043047 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 16043009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16041569 - 16041333
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||| ||    
T  16041569 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcaaaa 16041472  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  16041471 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacacgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattacccatcacatatatcgtgaac 16041372  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  16041371 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 16041333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 269950 - 270183
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||   |||||| ||  |||||||  ||| ||    
T  269950 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatca-aa 270044  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  270045 cccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatcgtgaac 270144  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  270145 aaatatcaatcatatttcatgaacattcattaatcacat 270183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 645970 - 645737
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||   |||||| ||  |||||||  ||| ||    
T  645970 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatca-aa 645876  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  645875 cccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatcgtgaac 645776  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  645775 aaatatcaatcatatttcatgaacattcattaatcacat 645737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 831705 - 831472
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||||||   |||||| ||  |||||||  ||| ||    
T  831705 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataa-catcatgcacttgatcaataata---ttcacacatcaatacttacatca-aa 831611  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  831610 cccaaatatctcacatcaataatcattaatcacgtgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacagtcaccaattacatatatcgtgaac 831511  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   |||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  831510 aaatatcaatcatatttcatgaacattcattaatcacat 831472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 25120745 - 25120938
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  25120745 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 25120843  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  25120844 ccccaatatctcacataaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcatacacaattatcaaacacatatatca 25120938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 181
Target Start/End: Original strand, 41243948 - 41244107
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  41243948 acatcatcataatccaaataacagttaacatgtatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 41244046  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcaca 181  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  41244047 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacaca 41244107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3433718 - 3433485
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  3433718 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatacacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 3433622  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  3433621 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 3433530  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3433529 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 3433485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 23509068 - 23509295
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  ||||||| |  | ||| ||||||||||||||| |  ||  |||||||  ||| ||    
T  23509068 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcctacatttggtcaataataatattcccgcatcaatacttacatca-aa 23509166  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||     
T  23509167 ccccaatatcgcacatcaatcatcaccaatcacatgtgtcttgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaat 23509266  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    | ||  ||||||||   ||||||||||||    
T  23509267 attcaccaatcataagccatgaacaatca 23509295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 43375493 - 43375260
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  43375493 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacac 43375397  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| ||||||        ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  43375396 -cccaatatcccacatcaataatcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 43375305  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  43375304 aatcattaatcacatttcatgaacagtcaccaatcacatatatca 43375260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19995078 - 19994876
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatct----- 115  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||  ||| |         
T  19995078 acatcatcataatcaaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 19994979  T
Q  116 ---cataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata 212  Q
       || || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  19994978 catcaaaaccccaataactcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccaaacacatata 19994879  T
Q  213 tca 215  Q
    |||    
T  19994878 tca 19994876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 17343480 - 17343635
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  ||||| |||    ||    
T  17343480 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatactcatc---aaa 17343576  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattca 179  Q
     ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  17343577 ccccaatatcccacatcaataatcgccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattca 17343635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 18768691 - 18768536
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||  ||||| ||  ||||    
T  18768691 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataaatcaattcaaatatcatgtacttactcaataataatatccaaatat--atactcataccata 18768594  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaat 176  Q
    || || |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18768593 attccaatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaat 18768536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 28835980 - 28836213
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  28835980 acattatcataatccaaataacagttaacctgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 28836076  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  28836077 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 28836168  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||    
T  28836169 aatcattaatcacatttcatgaacaatcgccaattacttgtatca 28836213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 38531882 - 38532069
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaa-taataatattcacatatgtatacttatctcat 118  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||| ||||| || ||||  ||||| ||  |||    
T  38531882 acatcatcataattcatataacagttaaacatgaataattcaattcaaatatcatgcacttaatcaaataagaatatccatatat--atactcataccat 38531979  T
Q  119 aatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||    
T  38531980 aatcccaatatcttacattaagtaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaa-tcacaattatt-atgcacaatcatcaatcacat 38532069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17731387 - 17731200
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca-ataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |||  ||||||| || |||| |||||| |  | || |||    
T  17731387 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatgattcaatttaaatatcatgtatttaatccgataataaaat-cacaaatgtattcaca-ct-ata 17731291  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||  | ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17731290 atttcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacaagtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatacacaatcatcaatcacat 17731200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3433455 - 3433328
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaa-tcctcaatcatatttca 239  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||   ||||||||| || | ||||||||||||    
T  3433455 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatca--taagccatgaacaaatcattaatcatatttca 3433358  T
Q  240 tgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaa 269  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3433357 tgaacaatcaccattcacatgtatcaggaa 3433328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 20479893 - 20480092
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgta------tacttatc 114  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||| ||| ||||||  |||||||||| | |||||||| ||| |||||| ||||| ||      ||||||      
T  20479893 acatcatcataatcaaaataacacttaacatggatagttcaatataaacatcatgcatttgatcaa-aatgatattctcatatatacatatatacttaca 20479991  T
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 214  Q
    ||| || ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  20479992 tcaaaacccaaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacataatcaccgagcacatatatc 20480091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 29758658 - 29758790
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||       || |||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  29758658 atatctcacatcaataatcatcaatcac-------attaacaattatcaattcacaactattcattcacaatcaccaattacatttatcatgaataatca 29758750  T
Q  226 tcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    | | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29758751 ttactcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 29758790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 39448646 - 39448573
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  39448646 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 39448573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 6776422 - 6776303
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  6776422 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 6776324  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaata 141  Q
     ||| ||||||||||||||||    
T  6776323 ccccaatatctcacatcaata 6776303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13664496 - 13664371
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | || | ||||| ||||||    
T  13664496 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatattcatgaatagtcattaatcacatttca 13664397  T
Q  240 tgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    
T  13664396 cgaacaatcaccaatcacatttatca 13664371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13723771 - 13723646
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| | || | ||||| ||||||    
T  13723771 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatattcatgaatagtcattaatcacatttca 13723672  T
Q  240 tgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     ||||||||||||||||||| |||||    
T  13723671 cgaacaatcaccaatcacatttatca 13723646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 24387593 - 24387378
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||  |||| |||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  |||||     
T  24387593 acattatcataatccaaatagcagataacatgaatatttcaatt--aacaacatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcatac 24387499  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||| ||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||     
T  24387498 -cccgatatttcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccactcacatgtatcatgaat 24387407  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  24387406 aatcattaatcacatttcatgaacaatca 24387378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 206
Target Start/End: Original strand, 28543268 - 28543355
Alignment:
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 206  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28543268 atcccaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaattatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatca 28543355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Original strand, 21695899 - 21695965
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaat 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  21695899 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaat 21695965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 23509284 - 23509341
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509284 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 23509341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23631173 - 23631101
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23631173 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 23631101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 16416537 - 16416734
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgta------tacttatc 114  Q
    |||||||||||||| | |||| | |||||||| ||| ||||||  |||||||||  | |||||||||||| ||||||| |||| ||      |||| |      
T  16416537 acatcatcataatcaaaataataattaacatggatagttcaatataaacatcataca-ttgatcaataatgatattcaaatatatacatatatactcaca 16416635  T
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat 213  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16416636 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaataatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaattattcacacacaatcaccgaacacatatat 16416734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 84
Target Start/End: Original strand, 28543151 - 28543213
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc 84  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28543151 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattcaatt-aaacatcatgtacttgatc 28543213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13664527 - 13664470
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13664527 catgaacaatcattaatcatatttcacgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 13664470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13723802 - 13723745
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13723802 catgaacaatcattaatcatatttcacgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 13723745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24930881 - 24930792
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| ||| |||||||||||||    
T  24930881 atgaataattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacattccatgaacaatcac 24930792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 256
Target Start/End: Original strand, 28836223 - 28836310
Alignment:
Q  171 atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| |  |||||||   ||||||||||||||| ||||    
T  28836223 atcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacgtcatgaacaatcatttatcatatacatcatgaacaatcaccgatca 28836310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16204052 - 16203997
Alignment:
Q  160 catgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16204052 catgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatca 16203997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 22737834 - 22737759
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataata 94  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||    
T  22737834 acatcatcataatctacataacagttaaacatgaatagttcaattcaaatatcatgcacttaatcaaataataata 22737759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22008288 - 22008214
Alignment:
Q  192 cacaatcaccaatcacatatat-catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22008288 cacaatcaccaatcacaaatattcatgaatagtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 22008214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24719221 - 24719151
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  24719221 acaatcaccaatcacattt--catgaacaatcattaatcacatttcatgaacattcaccaatcatatatatca 24719151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 31196448 - 31196395
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatca 73  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31196448 acatcatcataatccacataaacgttaaacatgaataattcaattcaaatatca 31196395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3433507 - 3433435
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3433507 acaatcaccaattacttgtatcatgaataatcactaatcacatttcatgaaaaatcaccaattacatgtatca 3433435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Original strand, 17283559 - 17283599
Alignment:
Q  26 atcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattc 65  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17283559 atcataatccacataacagttaatcatgaataattcaattc 17283599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18768572 - 18768505
Alignment:
Q  194 caatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||    
T  18768572 caatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaatcatatttatcatgcataatcatcaatcacat 18768505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22909320 - 22909277
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22909320 tcatgaacaatcgttaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 22909277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24108461 - 24108397
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||||||||    
T  24108461 acaatcaccaatcacattt--catgaacaatcaccaatcatattccatgaacattcatcaatcacat 24108397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 18610667 - 18610713
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18610667 tcatgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 18610713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Original strand, 21679532 - 21679612
Alignment:
Q  117 ataatcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaat 197  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||| || | || ||||| ||||||| |||||||    
T  21679532 ataatccccatatctcacatcaatcaattaccagtcacatgtgtcatgaacattctttaa-tcacatttattcacacacaat 21679612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24719250 - 24719205
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24719250 catgaacattcataaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 24719205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 88
Target Start/End: Original strand, 29758559 - 29758624
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaata 88  Q
    |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  29758559 acattatcataattcaaatagcagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaata 29758624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 2907 - 3151
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||| ||  ||    
T  2907 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgaacaataatagtattcacataaatatacctatatcccaa 3006  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    | || |||||||||| ||||| |||| |||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3007 ttccaatatctcacagcaatagtcactaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacggttattcatacacaattaccaatcacatatatcatgaac 3106  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  3107 aatcatcaatcatatttcatgaacaatcaccaaccacatttatca 3151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 5)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 37 - 259
Target Start/End: Original strand, 7452 - 7675
Alignment:
Q  37 cataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccga-tatctcaca 135  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||  ||| || ||| | |||||| ||    
T  7452 cataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaagaataatattctcatacatatacttacatcaaaaaccccaatatctccca 7551  T
Q  136 tcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat 235  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7552 tcaataatcaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat 7651  T
Q  236 ttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||  ||||||||    
T  7652 ttcatgaacaatcattaatcacat 7675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 271
Target Start/End: Original strand, 7682 - 7815
Alignment:
Q  138 aataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatattt 237  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||||| ||||    
T  7682 aataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatcataaacaatcattaatcacattt 7781  T
Q  238 catgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  7782 catgaacattcaccaaccacatatatcatgaaca 7815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 7842 - 7908
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7842 aatcaccaatcacatttgtcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 7908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 224
Target Start/End: Original strand, 7807 - 7871
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 224  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7807 tcatgaacaatcattaat-catagttattcatacacaatcaccaatcacatttgtcatgaacaatc 7871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 7647 - 7711
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||    
T  7647 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaataatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 7711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 92)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 38166213 - 38166416
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  38166213 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 38166312  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
      || |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  38166313 ctccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 38166412  T
Q  221 aatc 224  Q
    ||||    
T  38166413 aatc 38166416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 7851683 - 7851884
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | ||    
T  7851683 acatcatcataatccaaataacagttagtatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttatatgacaa 7851782  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  7851783 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatcatgaac 7851882  T
Q  221 aa 222  Q
    ||    
T  7851883 aa 7851884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 11812801 - 11813013
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  11812801 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatttatacttacatca-aa 11812899  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  11812900 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 11812999  T
Q  221 aatcctcaatcata 234  Q
    ||||  ||||||||    
T  11813000 aatcaccaatcata 11813013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 30140984 - 30141186
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  30140984 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 30141082  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30141083 tcccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 30141182  T
Q  221 aatc 224  Q
    ||||    
T  30141183 aatc 30141186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 17098913 - 17099107
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  17098913 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattctcataaatatacttacatcaaaa 17099012  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17099013 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcacacacaatcaccaatcacatatatca 17099107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 19944805 - 19945041
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  19944805 acatcatcataatccaaataacagttagcatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 19944903  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19944904 ccccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 19945003  T
Q  221 aatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||  | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  19945004 aatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 19945041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Original strand, 17936455 - 17936692
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattc-aaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||| ||| |    
T  17936455 acatcatcataatccacataacagttaacatgaacattttcatcataaacatcatgcacttgatcaattataatattcccatacatatacttatatca-a 17936553  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17936554 accccaatatctcacatcaataatctcaaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaatcatatatatcatgaa 17936653  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||| | | |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  17936654 caataccccatcatattccatgaacaatcatcaatcaca 17936692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47786735 - 47786548
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| ||| ||    
T  47786735 acatcatcataatccaaataactgttatcatgaatatatcaatt--aacatcatgtacttgatcaataatagttttcacatatatatacttatatcacaa 47786638  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47786637 tcccaatatctcacatcaattaatcactaatctcatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 47786548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 51160335 - 51160142
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  51160335 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatctcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatca-aa 51160237  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51160236 cctcaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 51160142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11199415 - 11199226
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||| |    
T  11199415 acatcatcataatccacataacaattaacatgaacaattcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatatatacatataccatca 11199316  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    | || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  11199315 ttccaatatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacagtcatcaaatcacattcattcatgcacaatcaccaatcacat 11199226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Original strand, 16819043 - 16819268
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  16819043 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 16819139  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16819140 ccccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 16819239  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  16819240 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 16819268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 14287323 - 14287514
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcac--atatgtatacttatctcat 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||  |||    
T  14287323 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaatttaaacatcatgtacttgatcaataataacgttcacatatatatatacttataccat 14287422  T
Q  119 aatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
     || || ||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14287423 gattccaatacctcacatcaattaatcaacaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacaaaatcaccaatcacat 14287514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 50113991 - 50113797
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  | | ||    
T  50113991 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcacat-tcaatacttacattagaa 50113893  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||| |||||| ||||||| | | ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50113892 ccccaatatctcacatcaattaatcatcaatcacatatatcatgaataatcatcaatccacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 50113797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 6148723 - 6148533
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  ||| ||    
T  6148723 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacacatacttacatcaaaa 6148624  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 211  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  6148623 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaattcacaagtattcacacacaatcaccaatcacatat 6148533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 35121921 - 35122105
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||||  |||||||| ||| ||    
T  35121921 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcgtgtacttgatc---aataatatttacatataaatacttatatcaaaa 35122017  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||| |  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35122018 tcccaaattctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcaggaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcac 35122105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 30204696 - 30204883
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  30204696 acatcatcataatccaaataaaagttaatatggatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatgttctcatacatatacttacatca-aa 30204794  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30204795 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacat 30204883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 319486 - 319297
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatat--tcacatatgtatacttatctcat 118  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||  |||     
T  319486 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatatacttacatcaa 319387  T
Q  119 aatcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    || ||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  319386 aaccccaatatctcatattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaatgcacaattattcatacacaatcaccaatcac 319297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 219
Target Start/End: Original strand, 18737974 - 18738171
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  18737974 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatattccaatataaacatcatgcacttgatcaatagtactattctcatacatatacttacatca-aa 18738072  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  18738073 ccccaatatctcacatcaataatcttcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaattaccaattacatatatcatgaa 18738171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12351709 - 12351520
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||     
T  12351709 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcagttgatcaacaataatactcacatatcaatacttatgtcatat 12351610  T
Q  121 tcccgatatctcacatc-aataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
     ||| | |||||||||| |||||||||||| ||| | || |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12351609 ccccaacatctcacatcaaataatcaccaaacacatatgacatgaacaatcatcaattcataattattcatacacaatcaccagtcacat 12351520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 26 - 206
Target Start/End: Original strand, 12796728 - 12796908
Alignment:
Q  26 atcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatatt-cacatatgtatacttatctcataatccc 124  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||| ||| | || ||  |||||||  ||| || |||    
T  12796728 atcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataaaatttcccacatcaatacttacatca-aacccc 12796826  T
Q  125 gatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 206  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12796827 aatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 12796908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 14296730 - 14296917
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  14296730 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14296828  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  14296829 tcccaaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcaca 14296917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 14302357 - 14302544
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| |    
T  14302357 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaa-catcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatacttataccatga 14302455  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||| | | |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  14302456 tcccaaaaactcacatcaattaatcaccaatcacatgtatcatgaacaagtatcaaatcacattcatttatgcacaatcaccaatcaca 14302544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 18908679 - 18908918
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  18908679 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 18908775  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  18908776 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 18908867  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  18908868 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcatgaaca 18908918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 17958288 - 17958071
Alignment:
Q  38 ataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata-atcccgatatctcacat 136  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||  |||||   ||| |||||||||||    
T  17958288 ataacagttaacatggatatttcaaagtaaacatcatgtacttgatcaataataatactcccatattaatacttacatcatatcccccaatatctcacat 17958189  T
Q  137 caataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt 236  Q
    ||||||||||||||||       ||||||| ||||||||||||||||| |||||    ||| | |||||||||||||| | ||||||| | |||||||||    
T  17958188 caataatcaccaatca-------catgaaccatcatcaattcacagttgttcat----aattatcaatcacatatatcttaaacaatcattaatcatatt 17958100  T
Q  237 tcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17958099 tcatgaacaatcatcaatcacatatatca 17958071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22146145 - 22145956
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||| ||  ||   |    
T  22146145 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacatacatcc--a 22146051  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22146050 ccccaatatctaacatcaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatatgcaatcaccaatcacatatatca 22145956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 22273034 - 22273267
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  22273034 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 22273130  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  22273131 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 22273222  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  22273223 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 22273267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19572693 - 19572504
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||||  |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  19572693 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaa-catcatgtgtttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcacac 19572598  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19572597 -cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaatacacaaatattcattcacaatcaccactcacatatatca 19572504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11062868 - 11062773
Alignment:
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11062868 tcatgatcccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 11062773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 11063020 - 11062941
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11063020 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 11062941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 159 - 271
Target Start/End: Original strand, 7851875 - 7851987
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  7851875 tcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaccatcaaccacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcattaatcaca 7851974  T
Q  259 tgtatcaggaaca 271  Q
    ||| ||| |||||    
T  7851975 tgtgtcatgaaca 7851987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 126 - 221
Target Start/End: Original strand, 13815981 - 13816076
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaaca 221  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13815981 atatctcacgtcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaaccacatttatcatgaaca 13816076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 79 - 249
Target Start/End: Original strand, 8630101 - 8630270
Alignment:
Q  79 ttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattc 178  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||  ||| || ||| |||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||     
T  8630101 ttgatcaataacaatatccacatacatatacttacatca-aaccccaatatctcacattcataatctccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattt 8630199  T
Q  179 acagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||    
T  8630200 acagttattcatgcacaattaccaatcacatatgtcatgaacactcaccaatcatattccatgaataatca 8630270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 265
Target Start/End: Original strand, 49230251 - 49230479
Alignment:
Q  26 atcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccg 125  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||  ||| |  |||     
T  49230251 atcacaatccaaataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatggacttgatcaataataat-tacacattagta--cttacatcacac-ccca 49230346  T
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  49230347 atatctcacatcaatcttcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 49230439  T
Q  226 tcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  49230440 ataatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 49230479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 19230318 - 19230549
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    |||| ||  |||||||  ||| |     
T  19230318 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac---cacacattaatacttacatcacac 19230412  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  19230413 -cccaatatctcacatcaataatcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatcatgaat 19230504  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||    
T  19230505 aatcattaatcacatttcatgaatattcaccaatcacatttatca 19230549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2451442 - 2451209
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  2451442 acattatcttaatccagataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatacacttgatcattaataatt---acacattaatacttacatcacac 2451346  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  2451345 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacacttattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 2451254  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  2451253 aatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 2451209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19262907 - 19262676
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    |||| ||  |||||||  ||| |     
T  19262907 acattatcataatccaattagcagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac---cacacattaatacttacatcacac 19262813  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||     
T  19262812 cccc-atatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcgccaatcacaattatcatgaat 19262721  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19262720 agtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 19262676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 9304841 - 9304638
Alignment:
Q  28 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccga 126  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| ||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| || | | |    
T  9304841 cataatccaaataatagttaatcatggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaacctcaa 9304742  T
Q  127 tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcct 226  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |    
T  9304741 tatctcacatcaataatcatcgatcat-------atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcac--atatcatgaacaatcat 9304651  T
Q  227 caatcatatttca 239  Q
     ||||||||||||    
T  9304650 taatcatatttca 9304638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14523278 - 14523088
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcat-a 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||  ||| |    
T  14523278 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatattccaatttaaccatcatgtacttgatcaataataatattcacgtataaatacatataccatca 14523179  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
     || | |    |||  |||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| |||||||| |||| ||||    
T  14523178 ttctcaaagattcagctcaattattcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacacttatgcatgcacaatcatcaattacat 14523088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 18908892 - 18909009
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  18908892 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 18908991  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18908992 atgaacaatcaccaatca 18909009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 148 - 249
Target Start/End: Original strand, 7851968 - 7852069
Alignment:
Q  148 aatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||   ||||||||||    
T  7851968 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatcataagccatgaacaat 7852067  T
Q  248 ca 249  Q
    ||    
T  7852068 ca 7852069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 10736824 - 10737055
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | |||| |||||| ||    ||||| |  |||||||  ||| |     
T  10736824 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgaccaataaaaac---cacatgtcaatacttacgtcacac 10736918  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||||  ||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||||     
T  10736919 tcca-atatctcacattaataatcaccaatcac-------atgaacaacaatcaattcacaattatccattcactatcacaaatcacatttatcatgaat 10737010  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10737011 aatcaataatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 10737055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 141 - 237
Target Start/End: Original strand, 11813179 - 11813275
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatattt 237  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||| ||||    
T  11813179 aatcaccaatcacatgggtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaataatcatcaatcacattt 11813275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 17536923 - 17536836
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  17536923 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttcatgcacttgatcaataataatattcatatatatata 17536836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 49230509 - 49230626
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  49230509 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 49230608  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  49230609 atgaacaatcaccaatca 49230626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 16183945 - 16183739
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattc------------acatatgtata 108  Q
    |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||||| ||||||            | |||| ||||    
T  16183945 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatatatatatatatata 16183846  T
Q  109 cttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
      ||| ||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || | ||||| | ||||||||||| ||||    
T  16183845 tatatatcaaaaccccaatatcttacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttccaatcattcacagacaatcaccaaacaca 16183746  T
Q  209 tatatca 215  Q
    |||||||    
T  16183745 tatatca 16183739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 25057035 - 25057269
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  25057035 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 25057130  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaa 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||       ||||| || | |||| ||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  25057131 tcccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------catgagcagttatcagttcacaaatattcattcacaatctccaatcacaaatattcatgaa 25057223  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     | || | | ||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25057224 tagtcattagtcacatttcacgaacaatcaccaatcacatttatca 25057269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 45581101 - 45581332
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    |||| ||  |||||||  ||| |     
T  45581101 acattatcataatccaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataac---cacacattaatacttacatcacac 45581195  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||       ||||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||  |||||||||  |||||||||     
T  45581196 cccc-atatctcacatcaataatcatcaatc-------tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcataattgccaatcacaattatcatgaat 45581287  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45581288 agtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 45581332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 224
Target Start/End: Original strand, 54686529 - 54686718
Alignment:
Q  28 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctc-ataatcccg 125  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  || | || |||     
T  54686529 cataatccaaataacagttactcatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaacccca 54686628  T
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 224  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||    
T  54686629 atatctcacatcaataatcatcgatca-------tatgaacaattatcaactcacaattattcatacacaattaccgatcac--atatcatgaacaatc 54686718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 2048323 - 2048557
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||  |  ||||| || |||| ||  | |||||| ||| |     
T  2048323 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaatt-aatcatcatgcatttga--atcaataaaatccacacattaacacttatatcacac 2048419  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaa 219  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  2048420 cccc-atatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcgccaatcacaaatattcatgaa 2048511  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2048512 tagtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 2048557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54045703 - 54045612
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatactta 112  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  54045703 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatactta 54045612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 39654163 - 39654237
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||    
T  39654163 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataata 39654237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15860987 - 15860882
Alignment:
Q  160 catgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||| | |||||||||| |||||||||||||||    
T  15860987 catgaacaattatcaattcacaaatattcaatcacaatcaccaaccacatttatcatgaacactcattaattacatttcatgaataatcaccaatcacat 15860888  T
Q  260 gtatca 265  Q
     |||||    
T  15860887 atatca 15860882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 23490768 - 23491002
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||  |||||||||| | |||||||||| ||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  23490768 acattatcataatccaaataacagataacatgagtatttcaatataaacatcatgcatttgatcaatagtaat---cacacattaatacttacatcaca- 23490863  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat-catgaa 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||       || |||| | | |||||||||  ||||||| ||||||| |||| |||| |||| ||||||    
T  23490864 tcccaatatctcacatcaataatcatcaatcac-------ataaacagttaacaattcacaaatattcattcacaatctccaaacacaaatattcatgaa 23490956  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     | || | ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23490957 tagtcattaatcacatttcacgaacaatcaccaatcacatttatca 23491002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 184 - 265
Target Start/End: Original strand, 33340258 - 33340339
Alignment:
Q  184 tattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33340258 tattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaaccacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 33340339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Original strand, 7852223 - 7852291
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852223 aatcaccaatcacatttatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacat 7852291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 14061110 - 14061039
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  14061110 acatcatcataatccacataacagttaagcatgaataattcaattc-aacatcatgtacttaatcaatgataa 14061039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 13815856 - 13815943
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  13815856 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcgatataaacatcatgcatttgatcaataatgatattctcatatatata 13815943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 2451229 - 2451112
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||   ||    
T  2451229 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcactgatcatatacatc 2451130  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2451129 atgaacaatcaccaatca 2451112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Original strand, 7852089 - 7852155
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7852089 aatcaccaaccacgtatatcatgaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 7852155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 15515925 - 15516118
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattca----catatgtatacttatc 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||| | |    ||||| |||||| ||     
T  15515925 acatcatcataatccacatagcagttaaacatgaataaatcaattcaaatatcatttacttaatcaaataataataataatatccatatatatactcata 15516024  T
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
     |||||| |  |||||| |||| ||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  15516025 ccataattctaatatcttacattaagcaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaa-tcacattta-tcatgaacaatcatcaatcacat 15516118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 22273247 - 22273364
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||   ||    
T  22273247 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcactgatcatatacatc 22273346  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22273347 atgaacaatcaccaatca 22273364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 55443748 - 55443682
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaat 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||| ||||||    
T  55443748 acatcatcataatccacataacagttaacatgaatgattcaattcaaatttcatatacttaatcaat 55443682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 11884079 - 11884026
Alignment:
Q  26 atcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtact 79  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11884079 atcataatccacataacagttaacatgaataaatcaattcaaatatcatgtact 11884026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 16819257 - 16819314
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16819257 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaattaccaatcacatgtatcaggaaca 16819314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12563397 - 12563338
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtactt 80  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12563397 acatcatcataattcacataacacttaacatgaataattcaatttaaatatcatgtactt 12563338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 53900463 - 53900385
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  53900463 acatcatcataatccaaacaacagtta-cataaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattcaca 53900385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 184 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 54049705 - 54049630
Alignment:
Q  184 tattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  54049705 tattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaacaaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 54049630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 17137699 - 17137773
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||  ||||| ||||||    
T  17137699 acatcatcataatccacataacagttaaccatgaataattcaattcaaatatcacatacttagtcaatgataata 17137773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Original strand, 15516051 - 15516118
Alignment:
Q  194 caatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||    
T  15516051 caatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcacat 15516118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 207
Target Start/End: Original strand, 7852177 - 7852221
Alignment:
Q  163 gaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7852177 gaacaatcattaattcatagttattcatacacaatcaccaatcac 7852221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 213
Target Start/End: Original strand, 11813048 - 11813120
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatat 213  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  11813048 aatcaccaattacatgtttcatgaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatat 11813120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 202 - 260
Target Start/End: Original strand, 11813136 - 11813194
Alignment:
Q  202 aatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatg 260  Q
    |||||||| ||||||||| | || | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11813136 aatcacatttatcatgaatagtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatg 11813194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 11813259 - 11813329
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11813259 aatcatcaatcacatttatcatgaataattattaatcaaatttcatgaacaatcagcaatcacatttatca 11813329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 62
Target Start/End: Original strand, 15548828 - 15548870
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataattcaa 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15548828 acatcatcataatccacataacagttatacatgaataattcaa 15548870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 7852058 - 7852115
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||    
T  7852058 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaaccacgtatatcatgaaca 7852115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 11813017 - 11813074
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||    
T  11813017 catgaataatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaattacatgtttcatgaaca 11813074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 49230457 - 49230529
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  49230457 acaatcaccaattacttgtatcatgaataatcactaatcacatttcatgaaaaatcaccaattacatgtatca 49230529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 19945002 - 19945065
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||||    
T  19945002 acaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatcataagccatgaacaatcaccaatca 19945065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Original strand, 30141227 - 30141270
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30141227 tcatgaacaatcaccaatcatattccatgaacaatcaccaatca 30141270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 184 - 235
Target Start/End: Original strand, 33340186 - 33340237
Alignment:
Q  184 tattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat 235  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||    
T  33340186 tattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcatat 33340237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 239
Target Start/End: Original strand, 15516076 - 15516122
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15516076 acaatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcacatttca 15516122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 18908996 - 18909061
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  18908996 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 18909061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 22273351 - 22273416
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  22273351 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 22273416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 25769532 - 25769606
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| ||||  ||||| ||| || ||||||    
T  25769532 acatcatcataatccacataacggttaagcatgaatgattaaattcaaatatcacatacttaatcgatgataata 25769606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 120 - 197
Target Start/End: Original strand, 40938063 - 40938140
Alignment:
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaat 197  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  40938063 atccccatatctcacattaatcaatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaa-tcacatttattcacacacaat 40938140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 209
Target Start/End: Original strand, 49230655 - 49230705
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  49230655 tcatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatctccaatcacat 49230705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11330840 - 11330803
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11330840 acatcatcataatccacataacagttatacatgaataa 11330803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 15874506 - 15874543
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15874506 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataa 15874543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 19945052 - 19945120
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  19945052 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatcataaacaatcaccaatcacat 19945120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 33340038 - 33340107
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||| | ||||||| |||||||    
T  33340038 acattatcataatcca-ataacagttatcatgaataattcaatt--aacaacatgcatttgatcactaataat 33340107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 194 - 242
Target Start/End: Original strand, 38166467 - 38166515
Alignment:
Q  194 caatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatga 242  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||    
T  38166467 caatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatttcatga 38166515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 54686713 - 54686784
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||| ||||| |||| ||||||||| | | ||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  54686713 acaatcaccaa-cacatttatcttgaacaatcatgagtcatactccatgaacaatcaccaaccacatatatca 54686784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Original strand, 27950 - 28152
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata- 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| |     
T  27950 acatcatcataatccaaataacagttagcatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaac 28049  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28050 accccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 28149  T
Q  220 caa 222  Q
    |||    
T  28150 caa 28152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 141 - 222
Target Start/End: Original strand, 28125 - 28206
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaa 222  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||    
T  28125 aatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacagttattcatactcaatcatcaaccacatatatcattaacaa 28206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 215
Target Start/End: Original strand, 28209 - 28253
Alignment:
Q  171 atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||    
T  28209 atcaattcacagttattcatactcaatcatcaaacacaaatatca 28253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 53 - 271
Target Start/End: Original strand, 94335 - 94553
Alignment:
Q  53 aataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatca 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  94335 aataattcaattcaaacatcatgtactggatcaataataatattctcatatatataattatatcataatcccaatatctcatattaataatcaccaatca 94434  T
Q  153 cgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcacca 252  Q
    | ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||   ||||||||||||||||||||||||  |    
T  94435 catgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaccaccaatcacatatattgtgaacaaatatcaatcatatttcatgaacaatcatta 94534  T
Q  253 atcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||| || ||||| |||||    
T  94535 atcatatttatcatgaaca 94553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Original strand, 94525 - 94591
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||  ||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  94525 acaatcattaatcatatttatcatgaacaatcatcaatcatattccatgaacaatcattaatcacat 94591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 94665 - 94711
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  94665 tcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 94711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 259
Target Start/End: Original strand, 94570 - 94615
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  94570 catgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 94615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Original strand, 94593 - 94639
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  94593 tcatgaacaatcaccaatcacatttcatgaataatcaccaatcacat 94639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 94625 - 94687
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||| |  ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  94625 aatcaccaatcacattt--catgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcattaatcacat 94687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 4831 - 4604
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  4831 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 4733  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  4732 ccccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 4633  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  4632 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 4604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 4518 - 4413
Alignment:
Q  160 catgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4518 catgaacaattataaattcacaattatgcattcacaatcaccaatcacatttattatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 4419  T
Q  260 gtatca 265  Q
     |||||    
T  4418 atatca 4413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4615 - 4573
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4615 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 4552 - 4524
Alignment:
Q  228 aatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4552 aatcatatttcatgaacaatcaccaatca 4524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 49671 - 49444
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  49671 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 49573  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  49572 ccccaatatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 49473  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  49472 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 49444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 160 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 49358 - 49253
Alignment:
Q  160 catgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  49358 catgaacaattataaattcacaattatgcattcacaatcaccaatcacatttattatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacat 49259  T
Q  260 gtatca 265  Q
     |||||    
T  49258 atatca 49253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49455 - 49413
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49455 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 49413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 49392 - 49364
Alignment:
Q  228 aatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49392 aatcatatttcatgaacaatcaccaatca 49364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 6)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 23 - 256
Target Start/End: Original strand, 77600 - 77836
Alignment:
Q  23 atcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatc 122  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| || |    
T  77600 atcatcataatccaaataacatttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaaac 77699  T
Q  123 ccga-tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaaca 221  Q
    || | ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77700 cctaatatctcacatccataaccaccaatcaaatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatgcacaatcaccaatcacatatatcatgaaca 77799  T
Q  222 atcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  77800 atcctcaatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 77836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Original strand, 36020 - 36096
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||    
T  36020 aatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacatttatcatgaaca 36096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 126 - 259
Target Start/End: Original strand, 36004 - 36134
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 224  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| |||||   ||  | |||||  |||||||  |||||||| ||||||||||||||    
T  36004 atatctcacatcaataaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcctcaat---catat-ttcatgaacaatcattaatcacatttatcatgaacaatc 36099  T
Q  225 ctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36100 atcaatcatattccatgaacaatcatcaatcacat 36134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 36142 - 36214
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  36142 acaatcaccaaccacatttatcatgaacagtcattaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatca 36214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 36113 - 36170
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  36113 catgaacaatcatcaatcacatttcatgaacaatcaccaaccacatttatcatgaaca 36170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 215 - 259
Target Start/End: Original strand, 77869 - 77913
Alignment:
Q  215 atgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  77869 atgaacaatcattaatcatatttcatgaaagatcaccaatcacat 77913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 6)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 156376 - 156149
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| |     
T  156376 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatcaaac 156277  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  156276 tcca-atatctcacatcaataatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 156178  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  156177 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 156149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 58382 - 58294
Alignment:
Q  171 atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  58382 atcaattcacaaagattcatacacaatcaccgatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatacttcatgaacaatcaccaaccacat 58294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 86149 - 85923
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |  |||||||||| | ||||||||||| |||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  86149 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcactataaacatcatgcatttgatcaataacaat---cacacattaatacttacatcacac 86053  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||| |||||||||||||| ||||||        ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  86052 -cccaatatcccacatcaataatcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaacaatcacatttatcatgaat 85961  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  85960 aatcattaatcacatttcatgaacagtcaccaatcaca 85923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 156160 - 156103
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  156160 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 156103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 156129 - 156062
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  156129 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 156062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 69
Target Start/End: Original strand, 92252 - 92300
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaac 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||    
T  92252 acatcatcataatccacataacagttaacataaatatttaaatttaaac 92300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 256827 - 256634
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  256827 acatcatcataatccaaataacagttaatatgaatatttcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 256729  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256728 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 256634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 125298 - 125067
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  125298 acatcatcataatctaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 125205  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||| |||       |||||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  125204 tcccaatatctcacatcaataatcatcaatcaagtg-------aacaattatcaattcataaatattcattcacaatcaccaaccacatttatcatgaac 125112  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  125111 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 125067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 72317 - 72086
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  | | |     
T  72317 acatcatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacattacac 72223  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||       |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  72222 -cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacttg-------aacaattatcaaatcacaaatattcattcacaatcacctatcacatttgtcatgaac 72131  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  72130 aatcattaatcacatttcatgaataatcaccaatcacatatatca 72086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 76698 - 76467
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  | | |     
T  76698 acatcatcataatccaaataacagttatcaagaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacattacac 76604  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||       |||||| ||||| |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  76603 -cccaatatctcacatcaataatcatcaatcacttg-------aacaattatcaaatcacaaatattcattcacaatcacctatcacatttgtcatgaac 76512  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  76511 aatcattaatcacatttcatgaataatcaccaatcacatatatca 76467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 192768 - 192999
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  | | |     
T  192768 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacattacac 192862  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||| ||       ||||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  192863 -cccaatatctcacatcaataatcatcaattac-------atgaacaattatcaattcacaaatgttcattcacaatcacctatcacatttgtcatgaac 192954  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  192955 aatcattaatcacatttcatgaataataaccaatcacatatatca 192999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 24 - 203
Target Start/End: Original strand, 68597 - 68777
Alignment:
Q  24 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcc 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||    
T  68597 tcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaataataatattcgcatataaatacttatatcataatcc 68696  T
Q  124 cgatatctcacatca-ataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaa 203  Q
    | || ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  68697 caatttctcacatcagttaatcaccaatcacatgtatcatgaacaatcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaa 68777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 30314 - 30497
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca-ataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||  |||||||||| ||||||| ||| | || || |||    
T  30314 acatcatcataatctatataataattaacatgaataattcaattcaaatatcatgcatttaatccgataataatat-cacatatatattcata-ct-ata 30410  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||||| ||||||| ||||||| | ||||||    
T  30411 atccccatatctcacatcaatcaatcaccagtcacatgtgtcatgaacattcttcaa-tcacatttattcacacacaattatcaatca 30497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 165 - 208
Target Start/End: Original strand, 68767 - 68810
Alignment:
Q  165 acaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  68767 acaatcaccaaatcatagttattcatacacaatcaccaatcaca 68810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 26451 - 26687
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  |||  |    
T  26451 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca--a 26548  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26549 ccccaatatctcacattcataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 26648  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| ||||| || |||  ||||||||    
T  26649 aaatatcaatcatattccatgatcattcattaatcacat 26687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15271 - 15080
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||   ||| | ||  |||||||  |||  |    
T  15271 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataa---tcatacattaatacttacatca-ca 15176  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacac-aatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||   ||||||| ||| |||||||| |||||| |||||    
T  15175 ccccaatatctcacatcaataataatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcactaatattcattcacaaatcaccagtcacatgtatca 15080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 259
Target Start/End: Original strand, 26707 - 26759
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26707 catatttcatgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 26759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Original strand, 26689 - 26732
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26689 tcatgaacgatcaccaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 26732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24280 - 24243
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24280 acatcatcataatccacataacagttatacatgaataa 24243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 59865 - 60051
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| |||||     
T  59865 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatccacaaat-aatacttatatcatat 59963  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaata-atcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59964 tcccaatatctcacatcaatacatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 60051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 118; Significance: 3e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 21 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 21827 - 21626
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  21827 acatcatcataatccaaataacagttagcataaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 21728  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21727 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaaaaaatgtcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 21628  T
Q  221 aa 222  Q
    ||    
T  21627 aa 21626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21610 - 21559
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21610 catgaacaatcgttaatcatatttcatgaacaatcgccaatcacatgtatca 21559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 256
Target Start/End: Original strand, 29644 - 29873
Alignment:
Q  28 cataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgat 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  ||| || ||| ||    
T  29644 cataatcaaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattcacaaatcaatacttacatca-aaccccaat 29742  T
Q  128 atctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctc 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |    
T  29743 atctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtaatgaacaaatatcaattcaccgttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcacc 29842  T
Q  228 aatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
     |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  29843 gatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 29873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 256
Target Start/End: Original strand, 29879 - 29921
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29879 catgaacaatcattaatcatatttcatgaaaaatcaccaatca 29921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Original strand, 33395 - 33613
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| ||    
T  33395 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattca--------tacttacatca-aa 33485  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  33486 tcccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 33585  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatc 248  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  33586 aatcattaatcacatttcatgaacaatc 33613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32952 - 32863
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |  |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  32952 atgaacaattatcaattcacaaatatttattcacaatcaccaatcactttcatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcac 32863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Original strand, 33602 - 33645
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33602 tcatgaacaatcgttaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 33645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Original strand, 33626 - 33669
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33626 tcatgaacaatcaccaatcatattccatgaacaatcaccaatca 33669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 4)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39449 - 39231
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||        ||||||  ||| ||    
T  39449 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattca--------tacttacatca-aa 39359  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39358 tcccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacatttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 39259  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatc 248  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||    
T  39258 aatcattaatcacatttcatgaacaatc 39231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 39892 - 39981
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||||||||||| |  |||||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  39892 atgaacaattatcaattcacaaatatttattcacaatcaccaatcactttcatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcac 39981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39218 - 39175
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39218 tcatgaacaatcaccaatcatattccatgaacaatcaccaatca 39175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 213 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39242 - 39199
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  39242 tcatgaacaatcgttaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 39199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 63)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 36892628 - 36892434
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  36892628 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 36892529  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| ||| || ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892528 ccccaatagcttacatcaataatcaccaatcacatgtgttatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 36892434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 25600312 - 25600451
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25600312 atatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatct 25600411  T
Q  226 tcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  25600412 tcaatcatatttcatgaataatcaccaaccacatttatca 25600451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 42180402 - 42180165
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  42180402 acatcaacataatccaaataacagttaacatgattatttcaatataaacatcatgcacttgattaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 42180304  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42180303 ccccaatatctcccattaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagctattcatacacaatcaccaatcacatatatcgtgaac 42180204  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||   ||||||||||| |||||||| |||  ||||||||    
T  42180203 aaatatcaatcatattccatgaacattcattaatcacat 42180165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21276535 - 21276333
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||| | |||||||||||| |||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  21276535 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataagcatcatgcatttgatcaataatcatattcccacatcaatacttacatca-aa 21276437  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  21276436 ccccaatatctcacatcgataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 21276337  T
Q  221 aatc 224  Q
    ||||    
T  21276336 aatc 21276333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Original strand, 24966425 - 24966658
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||  ||| ||    
T  24966425 acatcatcataatccaaataaaagttaacatgaataactcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatca-aa 24966520  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  24966521 ccccaatatctcacattaataatcaccaatcatatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcaccaatcac--atttcatgaac 24966618  T
Q  221 -aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
     ||||  |||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  24966619 aaatcaccaatcacatttcatgaataatcatcaatcacat 24966658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 28972272 - 28972461
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||    
T  28972272 acatcatcataatccacataacaattaacatgaatagttcaatt-aaacatcatgtacttgatcaataataatattcacacatatatacatataccataa 28972370  T
Q  121 t-cccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    | ||| | || |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  28972371 ttcccaaaatttcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcctgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacat 28972461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 25877882 - 25877692
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||   ||||||||   |||||||  ||| |     
T  25877882 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacataacaatacttacatca-at 25877787  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25877786 ccccaatatctcgcatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 25877692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 7319718 - 7319906
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||| ||  |||| | ||  ||||    
T  7319718 acatcatcataatccacataacaattaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacgta--tatattcataccata 7319815  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || ||||||    
T  7319816 atcccaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacattcattcatacacaatcatcattcacat 7319906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 12638187 - 12637988
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  12638187 acattatcataaaccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcaattgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 12638089  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  12638088 ccccaatgtctcacatcaataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatgcatcatgaac 12637989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3801306 - 3801073
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  3801306 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 3801210  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  3801209 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 3801118  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  3801117 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 3801073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12644000 - 12643778
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| | |||||||  ||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||    |||||||  ||| ||    
T  12644000 acattatcataatccaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataa-aatactcacatca--atacttacatca-aa 12643907  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  12643906 ccccaatgtctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 12643807  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||   ||||||||||||    
T  12643806 aatcaccaatcataagccatgaacaatca 12643778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 34822315 - 34822548
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  34822315 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 34822411  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  34822412 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 34822503  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  34822504 aatcattaatcacatttcatgaacaatcacaaattacttgtatca 34822548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32102 - 31915
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgat-caataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||| | || || |||    
T  32102 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaattcgataataatat-cacatatatattcata-ct-ata 32006  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||  | |||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  32005 atttcaatatctcacatcaaataatcaccagtcacatatgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacat 31915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19888920 - 19888687
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  19888920 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 19888824  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| | |||||||||     
T  19888823 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcataatcaccaatcacgtttatcatgaat 19888732  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  19888731 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 19888687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 21140139 - 21140325
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  21140139 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcatttgatcaataataatattcccacatcaatacttacatca-aa 21140237  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||    
T  21140238 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtataaggaacaaatatcaattcacaagtattcatttacaatcatcaatcaca 21140325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 269422 - 269608
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||  ||| |    
T  269422 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattaaatataaacatcatgaatttgatcaataacaatattcacata--tatacatataccatga 269519  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    || | ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||  |||| || |||||| ||||||||||    
T  269520 tctcaataactcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatatatttatgcacaattaccaatcaca 269608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 8941712 - 8941945
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  8941712 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 8941808  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||| | ||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  8941809 -cccgatgtttcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 8941900  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8941901 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 8941945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 38706993 - 38706760
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | |||||  |||  ||||  ||| |     
T  38706993 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattaaaacatcatgcacttgatcaataataat-tacacattagta--cttacatcacac 38706897  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||  |||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  38706896 acca-atatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcatcaatcacatttatcatgaat 38706805  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  38706804 aatcattaatcacatttcaggaacaatcaccaattacttgtatca 38706760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 25210893 - 25211132
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| |||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  25210893 acattatcataattcaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 25210989  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||||||||||||||||| || ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  25210990 -cccgatatctcacatcagtattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 25211081  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||  | ||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    
T  25211082 aattattaatcacatttcatgaacagtcaccaattacttgtatcatgaaca 25211132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9654792 - 9654565
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||      |||||| | |||||||||||||||   |||||||  |||||||  ||| |     
T  9654792 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaat------atcatgcatttgatcaataataat---cacatattaatacttacatcaca- 9654703  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||     
T  9654702 tcccaatatctcacatcaataatcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaattaccaatcacatttatcatgaat 9654610  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  9654609 aatcattaataacatttcatgaacagtcaccaatcacatatatca 9654565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20629323 - 20629092
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||    |||| ||  |||||||  |||  |    
T  20629323 acattatcataatccaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataacaa---ccacacattaatacttacatca-ca 20629230  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||  ||||||||||||||||| | ||||||       |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  20629229 ccccattatctcacatcaataattatcaatca-------catgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 20629137  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20629136 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatatatca 20629092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 24573320 - 24573133
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca-ataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||  ||||||| || |||| || ||| |  | || |||    
T  24573320 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatgtatttaatccgataataaaat-cacaaatatattcaca-ct-ata 24573224  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||  |||||||||    
T  24573223 atctcaatatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttatttatgcacaatcttcaatcacat 24573133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 256
Target Start/End: Original strand, 25211108 - 25211223
Alignment:
Q  143 tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcat 240  Q
    |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||||    
T  25211108 tcaccaattacttgtatcatgaacaattatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatcat 25211207  T
Q  241 gaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||    
T  25211208 gaacaatcaccaatca 25211223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4450171 - 4450084
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  4450171 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgaacttgatcaataacaatattctcatatatata 4450084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 22654339 - 22654412
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  22654339 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaataataata 22654412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 24089275 - 24089050
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaat---aataatattcacat----atgtatactta 112  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||   ||||||| | | ||    ||||||||| |    
T  24089275 acatcatcataatccgtataacagttaaacatgaataaatcaattcaaatatcatgtacttaatcaatgataataataataatatctagatgtatactca 24089176  T
Q  113 tctcataatcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatat 211  Q
    |  |||||| || | |||| |||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||| |    
T  24089175 taccataattccaacatcttacattaagcaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaa-tcacattta-tcatgaacaatcatcaatcacattt 24089078  T
Q  212 atcatgaacaatcctcaatcatatttca 239  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  24089077 atcatgcacaatcatcaatcacatttca 24089050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 25600173 - 25600252
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  25600173 acatcatcataatccacataacagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattcaca 25600252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3801043 - 3800926
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||   ||    
T  3801043 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcactgatcatatacatc 3800944  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3800943 atgaacaatcaccaatca 3800926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 126 - 236
Target Start/End: Original strand, 15631723 - 15631833
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |  ||||| | ||| |||||||||||| || | |||||| |||||||||||||||||     
T  15631723 atatctcacatcaataatctccaatcacatgtgtcatgaacgaatatcaacttacaattattcatacaccattatcaatcatatatatcatgaacaatca 15631822  T
Q  226 tcaatcatatt 236  Q
     ||||||||||    
T  15631823 ccaatcatatt 15631833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22581858 - 22581671
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca-ataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||| || || |||  |||||||||| |||| || ||| |  | || |||    
T  22581858 acatcatcataatccacataacaaataacatgaataattcaatttaaatatcatttatttaatccgataataatat-cacaaatatattcaca-ct-ata 22581762  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | | ||| || |||||||| |||||||||    
T  22581761 atctcaatatctcacgtcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcatattcatttatgcacaatcatcaatcacat 22581671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22691910 - 22691829
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22691910 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacata 22691829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22696557 - 22696476
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacata 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22696557 acatcatcatagtccacataacatttaacatgaatatttcaatttaaacttaatgcacttgatcaataataatattcacata 22696476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Original strand, 6877859 - 6877927
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6877859 aatcaccattcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacat 6877927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12637971 - 12637914
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12637971 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 12637914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12643789 - 12643732
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643789 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 12643732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 461007 - 461111
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatg 260  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| | || |||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||     
T  461007 atgaacaattatcaagtcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcgtaaataatcattaatcacatctcatgaagaatcaccaatcacatt 461106  T
Q  261 tatca 265  Q
    |||||    
T  461107 tatca 461111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43644795 - 43644681
Alignment:
Q  126 atatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcc 225  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  43644795 atatctcacatcaataatcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcgcaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatca 43644703  T
Q  226 tcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    | ||||| ||||| ||||||||    
T  43644702 ttaatcacatttcgtgaacaat 43644681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22691768 - 22691690
Alignment:
Q  131 tcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22691768 tcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 22691690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 131 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 22696415 - 22696337
Alignment:
Q  131 tcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22696415 tcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 22696337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 214 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3800920 - 3800865
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaa 269  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3800920 catgaacaatcattaatcatatttcatgaacaatcaccattcacatgtatcaggaa 3800865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 265
Target Start/End: Original strand, 461091 - 461161
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  461091 aatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatctcatgaacaatcaccaatcacatatatca 461161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 249
Target Start/End: Original strand, 8941955 - 8942033
Alignment:
Q  171 atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |  |||||||||||||    
T  8941955 atcaattcacagtcattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatcaaaagtcatgaacaatca 8942033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 8886450 - 8886631
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||   ||||| ||  |||| ||  ||| |     
T  8886450 acattatcataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa---tcacacatcaatacctacatcacac 8886544  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    | || ||||||| ||||||||||||  |||||       |||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  8886545 t-ccaatatctcgcatcaataatcattaatca-------catgaacaattatcaattcacaaatattcactcacaatcaccaatcacacatatca 8886631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19888707 - 19888624
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 224  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19888707 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcatagttattcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatc 19888624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 229 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21276305 - 21276263
Alignment:
Q  229 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21276305 atcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtattaggaaca 21276263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 22273164 - 22273233
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  22273164 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaatt-aatcatcatgtatttgatcaataata 22273233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12643758 - 12643690
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  12643758 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcagaaatattcatacacaatcaccaatcacat 12643690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 6877721 - 6877791
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||  |||||| ||||||||    
T  6877721 acattatcataatccaaataacaattaacatgaatatttcaatataaacatcatacacttgaacaataata 6877791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Original strand, 22282397 - 22282466
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  22282397 acattatcataatccaaatagcagttaacatgaatatttcaatt-aatcatcatgcatttgatcaataata 22282466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24089147 - 24089074
Alignment:
Q  194 caatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24089147 caatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcacatttatca 24089074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 22861795 - 22861971
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataatt-caattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||| ||||||||| | |||||| ||| |||||||| || |||||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |    
T  22861795 acattatcataatcaaaataacaattatcatgaatattttcaatt--aacatcaggcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca 22861889  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
      ||||||||||||||||||||||||  ||||||       |||||| || |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  22861890 cccccgatatctcacatcaataatcattaatcac-------atgaacgattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcaca 22861971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24089122 - 24089054
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  24089122 acaatcatcaatcacatttatcatgaacaatcatcaatcacatttatcatgcacaatcatcaatcacat 24089054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 43644688 - 43644635
Alignment:
Q  162 tgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  43644688 tgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacatttatca 43644635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3801095 - 3801023
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| || | ||||||||| ||||   ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  3801095 acaatcaccaattacttgtatcatgaataatcactaatcacatttcatgaaaaatcaccaattacatgtatca 3801023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Original strand, 24966660 - 24966712
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  24966660 tcatgaacaatcattaatcacatttcatgaataatcaccaatcacatatatca 24966712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Original strand, 25211210 - 25211277
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  25211210 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatcaca 25211277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 12637940 - 12637873
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||    
T  12637940 aatcaccaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcaca 12637873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 213 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7513816 - 7513770
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  7513816 tcatgaacaatcaccaatcataagtcatgaacaatcaccaatcacat 7513770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 19671007 - 19670970
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataa 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19671007 acatcatcataatccacataacagttaaacatgaataa 19670970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 24296419 - 24296382
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24296419 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataa 24296382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Original strand, 24966620 - 24966682
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||| |  |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  24966620 aatcaccaatcacattt--catgaataatcatcaatcacatttcatgaacaatcattaatcacat 24966682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 23823351 - 23823315
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaata 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23823351 acatcatcataatccacataacagttagacatgaata 23823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 56
Target Start/End: Complemental strand, 23825295 - 23825259
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaata 56  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23825295 acatcatcataatccacataacagttagacatgaata 23825259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13740 - 13547
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  13740 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatca-aa 13642  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcat 216  Q
     ||| |||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13641 ccccaatatctcacatcaatattcactaatcacatgtgtcatgaacaat-atcaattcacaattatttatacacaatcaccaatcacaaatatcat 13547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 31038 - 31230
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||   |||||||  |||  |    
T  31038 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcataaaaatacttacatca--a 31135  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31136 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 31230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 14849 - 15032
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||    
T  14849 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataatattctcatatatatacttacatcaaaa 14946  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 206  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14947 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcgtacacaatcaccaatca 15032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 4067 - 4141
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca-ataataat 93  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  4067 acatcatcataatccacataacagttaaacatgaataaatcaattcaaatatcatgtacttaatcagataataat 4141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 683 - 450
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||   |||||||||  |||||||  ||| ||    
T  683 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata---ttcacatatcaatacttacatca-aa 588  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||||||    
T  587 ccccaatatctcatattaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacaccatcaccaatcac--atttcatgaac 490  T
Q  221 -aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
     ||||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  489 aaatcaccaatcatatttcatgaataatcatcaatcacat 450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 213 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 396
Alignment:
Q  213 tcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  448 tcatgaacaatcattaatcacatttcatgaataatcaccaatcacatatatca 396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 195 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 488 - 426
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||  ||||||||    
T  488 aatcaccaatca--tatttcatgaataatcatcaatcacatttcatgaacaatcattaatcacat 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 114150 - 113965
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  114150 acatcatcataattcaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtacttgatcaat---aatattcacatataaatacttatatcataa 114054  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||| || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  114053 tcccaatttctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcaccaaatcatagttatttatacacaatcaccaatcaca 113965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 176
Target Start/End: Original strand, 107909 - 108069
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtt-aacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattc--acatatgtatacttatctc 116  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||  ||||||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||| |  | |||| |||||| ||  |    
T  107909 acatcatcataatccgcatatcagttaaacatgaatagatcaattcgaatatcatatacttaatcaaataataatatccatatatatatatactcatacc 108008  T
Q  117 ataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaat 176  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  ||||| ||||||| ||  |||||||||| |||||||    
T  108009 ataatcccaatatcttacattaagcaatcatcaatcacatggatcatgaacaaccatcaat 108069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 106755 - 106708
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataattcaattcaa 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||    
T  106755 acatcatcataatccacataacagttatacatgaataaagcaattcaa 106708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 20860 - 21054
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||| || |||||||||| ||||  ||||||||  ||||||    
T  20860 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaagcatcatgcatttgattaacaataatattctcatacatatacttacatcataa 20959  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  20960 tcccaatatctcacatcaataatcaccaatcataagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaaacaccaatcacatacatca 21054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 28450 - 28644
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||  || |||||  |||| |    
T  28450 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattgaaacatcatgcatttgatcaacaataatattctcatacatagacttacatcatga 28549  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28550 tctgaatatctcacatcaataatcaccaatcacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatactcaaacaccaatcacatacatca 28644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 129960 - 129871
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||||||| || |||||| || ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| || | | ||||| |||||||  ||||||||    
T  129960 atgaacaattattaattcatagatattcattcacaaccaccaatcacatttatcatgaataaccattaatcacatttcatagacaatcac 129871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 100 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14029 - 13864
Alignment:
Q  100 atatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatca 199  Q
    |||| |||||||||  || |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14029 atatatatacttataccacaatcccaacatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatgtcaattcacagttattcatacacaatca 13930  T
Q  200 ccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  13929 ccaatcacatatatcatgaacaatcttcaatcatatttcatgaaaaatcaccaaccacatttatca 13864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 14154 - 14075
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  14154 acatcatcataatccacataatagttaacatgaatatttcaaactaaacatcatgcacttgatcaataatagtattcaca 14075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15891
Alignment:
Q  139 ataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttc 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16011 ataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttgttcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttc 15912  T
Q  239 atgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  15911 atgaacaatcaccaaccacat 15891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 109; Significance: 7e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 2658 - 2431
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||  |||||||  ||| ||    
T  2658 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcaaatcaatacttacatca-aa 2560  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| | |||||||    
T  2559 ccccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaattaccaatcatatacaccatgaac 2460  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||   |||||||   ||||||||||||    
T  2459 aatcactaatcataagccatgaacaatca 2431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Original strand, 4078 - 4263
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||   |||||||||  |||||||| ||||||    
T  4078 acatcatcataatcaaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgtgcttgatcaatagta---ttcacatatacatacttatatcataa 4174  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||| || |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4175 tcccaatttctcacatcaattaataaccaatcacatgtgtcatgaacactcaccaaatcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 4263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 535 - 728
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  535 acatcatcataatacaaataacagttagcatgaatatttcaatttaagcatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 633  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  634 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaattatcaattcacagttattcatacgtaattaccaatcacatatatca 728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 13964 - 14153
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatg--tatacttatctcat 118  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  13964 acatcaacataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatatacttatatcat 14063  T
Q  119 aatcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    || ||| ||||||||||| ||||| ||| |||||   ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  |||||||    
T  14064 aaccccaatatctcacattaataagtcatcaatcgtatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacagacattcatacacaatcgtcaatcac 14153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 5845 - 6038
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||  |||| |||  | | ||    
T  5845 acatcattataatccaaataacagttaacatgaatatttcaattcaaacatcatgtatttgatcaataataacattctcatacatatagttacatta-aa 5943  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  5944 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacacaattattcatacacaatcatcaatcacatatatca 6038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 37760 - 37954
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  |||  |    
T  37760 acatcatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaga 37859  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37860 ccccaatatctcacatcaataatcaccaataacaagtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatacatca 37954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 138673 - 138480
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||| ||    
T  138673 acatcatcataatccaaataacagttaacattaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattttcatacttatacttacatca-aa 138575  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  138574 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtttcatgaacaaatatcaattcaaaattatttatacacaatcaccaatcacatatatca 138480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Original strand, 76589 - 76779
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||   |||||||||||| ||||  |||||||  ||| ||    
T  76589 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgat---taataatattcatatatcaatacttacatca-aa 76684  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  76685 ccccaatatctcacatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatgcacaatcaccaatcacatatatca 76779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 209
Target Start/End: Original strand, 10003 - 10086
Alignment:
Q  127 tatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  10003 tatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgccatgaacaatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacat 10086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 21 - 85
Target Start/End: Original strand, 9876 - 9940
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca 85  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||    
T  9876 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcaattcaaaactcatatacttaatca 9940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 270329 - 270565
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  270329 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 270427  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||     
T  270428 ccccaatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaataaccaatcacatttatcatgaat 270520  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  270521 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatca 270565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 236412 - 236597
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    ||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||  ||    
T  236412 acatcatcataattcaaataacaattaacatgaatatttcaattcaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatacatatacttacatc-gaa 236510  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  236511 ccccaatatctgacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatacaccattattcatacacaatcaccaatcac 236597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 159 - 207
Target Start/End: Original strand, 236610 - 236658
Alignment:
Q  159 tcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  236610 tcatgaataatcatcaatccacagttattcatagacaatcaccaatcac 236658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Original strand, 270545 - 270618
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  270545 aatcaccaattacatgtatcatgaataat-atcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatca 270618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21344 - 21114
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||  ||| ||    
T  21344 acattatcataatccaaatagtagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatacatttgatcaataataatattctcatacatatacttacatcaaaa 21247  T
Q  121 tcccga-tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||| | ||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21246 accccaatatctcacatcaataatcatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatatatcatgaa 21154  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21153 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcattaatcacat 21114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21104 - 20980
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  21104 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcattaatcacatttcat 21005  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  21004 gaacaatcaccaatcacatatatca 20980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21142 - 21078
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21142 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 21078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 7)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 17526 - 17757
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||   |||||||||  |||||||  ||| ||    
T  17526 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatca-aa 17621  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17622 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 17721  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||  ||||||||   |||||||||||| ||||||    
T  17722 aatcaccaatcataagccatgaacaatcatcaatca 17757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 19556 - 19765
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| | ||||  |||||| ||| |||| ||||||||||   |||||||||  |||||||  ||| ||    
T  19556 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatattccaatataaacattatgcacttcatcaataata---ttcacatatcaatacttacatca-aa 19651  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  19652 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatggacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 19751  T
Q  221 aatcctcaatcata 234  Q
    ||||  ||||||||    
T  19752 aatcaccaatcata 19765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 8539 - 8466
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  8539 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 8466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 13928 - 13855
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  13928 acatcatcataatcaaaataacaattaacatgaataattcaattcaaatttcatatacttaatcaatgataata 13855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 257
Target Start/End: Original strand, 17739 - 17782
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcac 257  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17739 catgaacaatcatcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcac 17782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Original strand, 19769 - 19826
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19769 catgaagaatcattaatcatatttcatgactaatcagcaatcacatgtatcaggaaca 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 140 - 207
Target Start/End: Original strand, 19799 - 19866
Alignment:
Q  140 taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||||| ||||||| ||| ||| ||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  19799 taatcagcaatcacatgtatcaggaacaaatatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcac 19866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Original strand, 16770 - 17004
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||| |||||| | |||||||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  16770 acattatcataatctaaataacagttatcatgaacatttcaatt--aacgtcatgcatttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 16866  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16867 ccccaatatctcacatcaatgatcaccaattacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcacacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 16966  T
Q  221 aatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||  | |||||||   ||||||||||||||||||||    
T  16967 aatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 17004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 8)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 2737 - 2855
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2737 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 2836  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  2837 gaacaatcattaatcacat 2855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 141 - 259
Target Start/End: Original strand, 2865 - 2983
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2865 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 2964  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  2965 gaacaatcattaatcacat 2983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Original strand, 2993 - 3117
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  2993 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattaatcacatttcat 3092  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  3093 gaacaatcaccaatcacatttatca 3117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 259
Target Start/End: Original strand, 2616 - 2727
Alignment:
Q  148 aatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2616 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 2715  T
Q  248 caccaatcacat 259  Q
    ||  ||||||||    
T  2716 cattaatcacat 2727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 2699 - 2763
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2699 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 2827 - 2891
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2827 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 2891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 2955 - 3019
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  2955 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 3019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #8
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 2475 - 2561
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  2475 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaat-attcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 2561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4605
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||     
T  4425 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataagtcaatataaacatcatgtatttgatcaataataatattcacatatcaatacttacatcatac 4524  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||       ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4525 tcccaatatctcacatcaattaatcaccaatca-------catgaacaatcattaattcatagttattcatacacattcaccaatcac 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 92; Significance: 9e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 66592 - 66405
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||    
T  66592 acatcatcataatccaaatgacatttaacatgaataattcaatataatcatcatgtacttgctcaataataatattcacatatcaatacttacatcataa 66493  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
    || | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||  ||||||||    
T  66492 tctcaatatctcatatcaattaatcaccaatcacatgaatcatgaacaatcatcaatccatagttactcatacacaattcccaatcac 66405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 26572 - 26490
Alignment:
Q  133 acatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26572 acatcaataatcatcaatcacatgtgtcatgaacaaatctcaattcacaattattcatacacaatcaccaatcacatatatca 26490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 26660 - 26590
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataata 91  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  26660 acatcatcataatccaaagaacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataata 26590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 3395 - 3217
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatc-aataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| | ||  ||||    
T  3395 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaatcaaataataatatccacata--tatattcataccata 3298  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatca 199  Q
    ||| | |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||    
T  3297 atctcaatatcttacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcgcaatca 3217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 10122 - 9896
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||| || ||||||| |||| ||| |||||| ||||| || ||  | |||||  ||| ||    
T  10122 acattatcataatccaaatgacagttaacatgtatttttcaatttaa-catcatgcactttatcgataatattattctcaaatcaacacttacatca-aa 10025  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  10024 ccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaataaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaac 9925  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatca 249  Q
    ||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  9924 aatcaccaatcataagtcatgaacaatca 9896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 75727 - 75550
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||           ||| | || ||||||||  ||||||    
T  75727 acatcatcataatccaaataatagttaacatgaataatttaattcaaacatcatgtacttgatcg----------tcataaatatatacttacatcataa 75638  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataa-tcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 207  Q
     ||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75637 ccccaatatctcatatcaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcac 75550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 166232 - 166144
Alignment:
Q  171 atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||    
T  166232 atcaattcacaaagatttatacacaatcgccgatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatacttcatgaacaatcattaatcacat 166144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 3083 - 2849
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||| |||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  3083 acatcatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacataatgcacttgatcattaataat---cacacattaatacttacatcacac 2987  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcac-caatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaa 219  Q
     ||||||||||||||||||||||||  ||||||        ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||    
T  2986 -cccgatatctcacatcaataatcaatcaatcat-------atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaaacaccaatcacatttatcatgaa 2895  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2894 taatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatca 2849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 2869 - 2796
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||||||||| || ||| ||||||| |||||| ||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  2869 aatcaccaattacatgtatcatgaataatcattaat-cacaaatattcattcacaatcaccaatcacaaatatca 2796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 9)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 141 - 265
Target Start/End: Original strand, 5601 - 5725
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcat 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  5601 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcatagttattcatacacaatcaccaaccacatttatcatgaacaatcattaatcacatttcat 5700  T
Q  241 gaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  5701 gaacaatcaccaatcacatttatca 5725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 148 - 259
Target Start/End: Original strand, 5480 - 5591
Alignment:
Q  148 aatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    |||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5480 aatcacatgtgtcatgaacaaatatcaatttacagttattcatacacaatcatcaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 5579  T
Q  248 caccaatcacat 259  Q
    ||  ||||||||    
T  5580 cattaatcacat 5591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 21 - 254
Target Start/End: Original strand, 328 - 550
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  328 acattatcataatccaaataacagttaccatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 424  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  425 -cccgatatctcacatcaatattcatcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 516  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaat 254  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  517 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaat 550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 641 - 758
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  641 aatcaccaattacatgtatcatgaacaattatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 740  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  741 atgaacaatcaccaatca 758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 195 - 271
Target Start/End: Original strand, 591 - 667
Alignment:
Q  195 aatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  591 aatcaccaattacatgtatcatgaataataattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcatgaaca 667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 271
Target Start/End: Original strand, 5563 - 5627
Alignment:
Q  207 catatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  5563 catatttcatgaacaatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 5627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 5339 - 5425
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| | |||||||||||| |||| | ||||| ||||    
T  5339 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaat-attcaacataaacatcatgcatttgatcaataatgatatcctcatatatata 5425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 256
Target Start/End: Original strand, 719 - 784
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||  |||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  719 acaatcaccgatcatatacatcatgaacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccaatca 784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #9
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 265
Target Start/End: Original strand, 539 - 611
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||| ||||   ||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  539 acaatcaccaattatatacatcatgaataatcactaatcacatttaatgaaaaatcaccaattacatgtatca 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 195
Target Start/End: Original strand, 56206 - 56370
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||          ||||||||  ||||||    
T  56206 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaatataaata----------tatacttacatcataa 56295  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacaca 195  Q
     ||  ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  56296 ccctaatatctcacatcaataaatcaccaatcacatg-gtcatgaacaaacatcaattcacagttattcatacaca 56370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 160 - 199
Target Start/End: Original strand, 56369 - 56408
Alignment:
Q  160 catgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatca 199  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  56369 catgaacaaacatcaattcacagttactcatacacaatca 56408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 1652 - 1839
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttga-tcaataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||| ||| | || || |||    
T  1652 acatcatcataatccacataacaattaacatgagtaatttaatttaaacatcatgtacttaattcgataataata-tcacatatatattcata-ct-ata 1748  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  1749 atcccaatatctcacatcaattaatcatcaatcacatgtgtcatgaacaatcttcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacat 1839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 7287 - 7087
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgta------tacttatc 114  Q
    |||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||||||||||| |||||| ||||| ||      ||||||      
T  7287 acatcatcataatcaaaataaaagttaacatgaataattcaatataaacatcatacatttgatcaataatgatattctcatatatacatatatacttaca 7188  T
Q  115 tcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatc 214  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||  || ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  7187 tcaaaaccccaatatctcacatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattttcaattattcacacacaatcaccaaacacatatatc 7088  T
Q  215 a 215  Q
    |    
T  7087 a 7087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 1307 - 1120
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||      ||||| |||  |||||||  ||| |     
T  1307 acatcatcataatcaaaataatagttatcatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaata------ttcacgtatcaatacttacatcacac 1214  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1213 -cccaatatctcacatcaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacaattattcatacccaatcaccaatcacatatatca 1120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 31120 - 31353
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  31120 acattatcataatccaaataacagataacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 31216  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||| ||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||||||     
T  31217 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaaacat-------atgaacaataatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttatcatgaat 31308  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  31309 aatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 31353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 31333 - 31450
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  31333 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagttattcatacacaatcactgatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 31432  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  31433 atgaacaatcaccaatca 31450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 13085 - 12989
Alignment:
Q  49 catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatca 145  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  13085 catggatatttcaatttaaacatctcgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacatcaaaaccccaatatctcacatcaataatca 12989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 168
Target Start/End: Original strand, 23040 - 23186
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||  ||| ||    
T  23040 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatcaatacttacatca-aa 23138  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaa 168  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||  |||||||    
T  23139 ccccaatatctcacattaataatcatcaatcacatgtgttctgaacaa 23186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 90
Target Start/End: Original strand, 16376 - 16445
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataat 90  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  16376 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcacttgatcaataat 16445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 256
Target Start/End: Original strand, 23256 - 23294
Alignment:
Q  218 aacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23256 aacaatcatcaatcacatttcatgaacaatcaccaatca 23294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 12488 - 12684
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattc------acatatgtatacttatc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||| ||||||| |||||||||||||      | |||| ||||||||      
T  12488 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatatagacatcatgcacttgatgaataataatattctcatatatatatatatacttaca 12587  T
Q  115 tcataa--tcccgatatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||| ||   ||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  12588 tcaaaaccccccaatatctcacattaataaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaa-cattaattcaaaattattcatacacaatcaccaatcacat 12684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 161 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 110055 - 109945
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  110055 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcactaatcacatatatcttgaataatcatcaatcacatttcatgaacaatcaccaatcacatg 109956  T
Q  261 tatcaggaaca 271  Q
    | ||| |||||    
T  109955 tgtcatgaaca 109945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 109971 - 109854
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||||   ||    
T  109971 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcatatacatc 109872  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  109871 atgaacaatcaccgatca 109854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 53931 - 54121
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||| ||    ||||| |  |||||||  ||| |     
T  53931 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataaaaa---ccacatgtcaatacttacgtcacac 54025  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||       |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||| |||||||||||||| |||||||||     
T  54026 t-ccaatatctcacatcaataatcaccaatca-------catgaacaattatcaattcacaattattaattcactatcaccaatcacatttatcatgaag 54117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 44266 - 44495
Alignment:
Q  28 cataatccacataacagttaa-catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccga 126  Q
    ||||||||  |||||||| || |||||||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||   || || ||| |    
T  44266 cataatccgaataacagtcaatcatgaatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttacaccaaaaccccaa 44365  T
Q  127 tatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcct 226  Q
    |||||||||||||||| || | ||||        ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| |    
T  44366 tatctcacatcaataaacatcgatcat-------atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaatcaccgatcac--atatcatgaacaatcat 44456  T
Q  227 caatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     ||||||| |  ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  44457 taatcatactcgatgaacaatcaccaaccacatatatca 44495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 265
Target Start/End: Original strand, 52457 - 52665
Alignment:
Q  49 catgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcacca 148  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||   ||||||||  ||| || ||| |||||||| ||||||| ||| ||    
T  52457 catggatatttcaatttaaacatcacgtacatgatcaataataatattcacatgcatatacttaaatcaaaaccccaatatctcagatcaatagtcatca 52556  T
Q  149 atcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaa-tcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    ||||        ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||||||||| | ||||||| | ||||||||||    
T  52557 atcat-------atgaacaattatcaactcacaattattcatacacaaatcaccgatcacatat--catgaacaatcattaatcatactccatgaacaat 52647  T
Q  248 caccaatcacatgtatca 265  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  52648 caccaaccacatatatca 52665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 258
Target Start/End: Original strand, 52643 - 52710
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcaca 258  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  52643 acaatcaccaaccacatatatcatgaataatcatcaatcacatttatcatgaataatcatcaatcaca 52710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 6)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 90912 - 90783
Alignment:
Q  105 tatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaat 204  Q
    ||||||||  ||| || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  90912 tatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaatattcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagtcattcatacacaatcaccaat 90813  T
Q  205 cacatatatcatgaacaatcctcaatcata 234  Q
    || ||| |||||||||||||  ||||||||    
T  90812 catatacatcatgaacaatcaccaatcata 90783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 91018 - 90931
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  91018 acatcatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatataaacatcatgcacttgatcaataataatattcatatatatata 90931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 224
Target Start/End: Original strand, 128730 - 128813
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatc 224  Q
    |||||||||| || ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  128730 aatcaccaattacatgtatcatgaacaaatatcaattaacagttattcatacacaatcaccaatcatatacatcatgaacaatc 128813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 141 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 90748 - 90674
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  90748 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttattcttacacaatctccaatcacatacatca 90674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 193 - 271
Target Start/End: Original strand, 128678 - 128756
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  128678 acaatcaccaattacatgtatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacatgtatcatgaaca 128756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 90779 - 90722
Alignment:
Q  214 catgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  90779 catgaataatcattaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtgtcatgaaca 90722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 25538 - 25749
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| | |||||||   ||||| || |  |||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||| ||    
T  25538 acattatcataatccaaataacagttatcaagaacatttcaatt---acatcgtgcatctgatcaataaaaatattcacataacaatacttacatcagaa 25634  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||| |||||||||    
T  25635 ccccaatatctcacattaataatcatctatcacatgtgtcataaacaaatatcaattcacagttattcatacataatcatcaattatatacatcatgaac 25734  T
Q  221 aatcctcaatcatat 235  Q
    ||||  |||||||||    
T  25735 aatcaccaatcatat 25749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 237 - 271
Target Start/End: Original strand, 25727 - 25761
Alignment:
Q  237 tcatgaacaatcaccaatcacatgtatcaggaaca 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25727 tcatgaacaatcaccaatcatatgtatcaggaaca 25761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 209
Target Start/End: Original strand, 6123 - 6303
Alignment:
Q  28 cataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatca-ataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccga 126  Q
    |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||  |||||||||| |||| || ||| | || || |||||| | |    
T  6123 cataatccacataaaaattaacatgagtaattcaatttaaatatcatgtacttaatccgataataatat-cacacatatattcata-ct-ataatctcaa 6219  T
Q  127 tatctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||    
T  6220 tatctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgttatgaacaatcatcaaatcacatttattcatgcacaatcatcaatcacat 6303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 6583 - 6401
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  |||||||             
T  6583 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatactt--------- 6493  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
                ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  6492 ------------acatcaataatcaccaatcacatgtgtcatgaacaaatatcaattcacagttatttatacacaatcaccaaccacatttatcatgaac 6405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 119 - 28
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatactta 112  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||  ||||||||    
T  119 acatcaacataatccaattaacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatatactcatacatatactta 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Original strand, 26873 - 26960
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26873 acatcaacatagtccaaataacagttaacatgaataattcaattcagacatcatgtacttgatcaaaaataatattcacatatgtata 26960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 7115 - 6884
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||| ||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  7115 acattatcataatccaaataacagttatcatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaatagtaat---cacacattaatacttacttcaca- 7022  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||||||        |||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||     
T  7021 tcccaatatctcacatcaatagtcatcaatcat-------atgaccaattatcaattcacaaatattcattcacaatcatcaatcacatttatcatgaat 6929  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||    
T  6928 aatcattaatcacatttcatgaacagtcaccaatcatatatatca 6884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 86 - 209
Target Start/End: Original strand, 145231 - 145351
Alignment:
Q  86 ataataatattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagtta 185  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||| | ||| |||||||||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  145231 ataataatattcacatatatatacttataccatgatctcaatacctcacatcaat---caccaatcacatgtgtcatgaaaaatcatcaattcacagtta 145327  T
Q  186 ttcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||||||| | ||||||    
T  145328 ttcatacacaatcactactcacat 145351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Original strand, 144987 - 145060
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144987 acattatcataatccacataacaattaacatgattaattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 145060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 5221 - 5455
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||||    ||| ||  |||||||  ||| |     
T  5221 acattatcataatccaaataacaggtaacatgaatatttcattttaaacatcatgcacttgatcaataataatt---acacattaatacttacatcacac 5317  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatata-tcatgaa 219  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||| | || |||||||    
T  5318 -cccgatatctcacatcaatattcgtcaatcat-------atgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacgtttattcatgaa 5409  T
Q  220 caatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
     |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  5410 taatcattaatcacatttcatgaacaatcaccaattacttgtatca 5455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 256
Target Start/End: Original strand, 5435 - 5550
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatat--ttc 238  Q
    |||||||||| || ||| |||| || ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||   ||    
T  5435 aatcaccaattacttgtatcataaataaatatcaattcacagtt-ttcatacacgatcaccaatcatatacatcatgaacaatcct-gatcatatacatc 5532  T
Q  239 atgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  5533 atgaacaatcaccaatca 5550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 217509 - 217420
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  217509 atgaataattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaattacatttcatgaacaatcac 217420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 247
Target Start/End: Original strand, 5537 - 5591
Alignment:
Q  193 acaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaat 247  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||  | |||||| ||||||||||||    
T  5537 acaatcaccaatcatatacatcatgaacaatcaccgatcataattcatgaacaat 5591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1486 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1486
Description:

Target: scaffold1486; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 171 - 259
Target Start/End: Original strand, 1246 - 1334
Alignment:
Q  171 atcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  1246 atcaattcacaaagattcatacacaatcaccgatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatacttcatgaacaatcaccaaccacat 1334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 144926 - 145030
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  144926 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacagtcaccaatcacata 145025  T
Q  261 tatca 265  Q
    |||||    
T  145026 tatca 145030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 161 - 265
Target Start/End: Original strand, 147185 - 147289
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatg 260  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  147185 atgaacaattatcaattcacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaataatcattaatcacatttcatgaacagtcaccaatcacata 147284  T
Q  261 tatca 265  Q
    |||||    
T  147285 tatca 147289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 4725 - 4528
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcac----------atatgtatact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||          |||| |||||     
T  4725 acatcatcataatccacataacatttaacatgaatatttcaatt-taacttcatgcacttgatcaataataatattcacatatatatatatatatataca 4627  T
Q  111 tatctcataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    |||  ||| ||| | ||  |||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  4626 tataccatgatctcaatgactcacatcaattaatcaccaatcacatatatcatgaacaagtatcaattcacatttattcatgcacaatcaccaatcaca 4528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 448 - 221
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   | ||| ||  |||||||  ||| |     
T  448 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa---ttacacattaatacttacatcacac 352  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        |||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  351 ccccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaccaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 259  T
Q  221 aatcctcaatcatat--ttcatgaacaatcaccaatca 256  Q
    ||||  | |||||||   ||||||| ||||||||||||    
T  258 aatcaccgatcatatacatcatgaataatcaccaatca 221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 804 - 996
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   | ||| ||  |||||||  |||  |    
T  804 acattatcataatccaaataacagttaacatagatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa---ttacacattaatacttacatca-ca 899  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| ||||||        ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  900 ccccgatatctcacatcaatattcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 224
Target Start/End: Original strand, 27169 - 27361
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||| ||  |||||||  |||  |    
T  27169 acattatcataatccaaataacagttaacatggatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataa---tcacacattaatacttacatca-ca 27264  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     |||||||||||||||||||| ||| | ||||        |||| |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||     
T  27265 ccccgatatctcacatcaatattcatcgatca-------tatgagcaattatcaatttacaattattcattcacaatcaccaatcacatttatcatgaat 27357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 19489 - 19306
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  19489 acattatcataatccaaataacatttaacatgaatatttcaatataaacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca- 19394  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatca 215  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19393 tcccaatatctcacatcaataatcatcaatca-------tatgaacaattatcaatttacaaatattcattcacaatcaccaatcacatatatca 19306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 265
Target Start/End: Original strand, 1298 - 1529
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  | | |     
T  1298 acatcaacataatccaaataacagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat---cacacattaatacttacattacac 1392  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaac 220  Q
     ||| |||||||||||||||||||| |||||||       ||||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||| ||||||| | | ||||||    
T  1393 -cccaatatctcacatcaataatcatcaatcac-------atgaacagttatcaattcacaaatattcattcacaatcacctatcacatttgttatgaac 1484  T
Q  221 aatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    |||| | ||||| ||||| | || ||||||||||||||| |||||    
T  1485 aatcattaatcacatttcgtaaataatcaccaatcacatatatca 1529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 7489 - 7416
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||||||    
T  7489 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaatatcatgtacttaaccaatgataata 7416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 108
Target Start/End: Complemental strand, 4014 - 3927
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtata 108  Q
    ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4014 acatcattataatccaaataatagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataatattctcatatatata 3927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 3897 - 3781
Alignment:
Q  100 atatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaac-aatcatcaattcacagttattcatacacaatc 198  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  3897 atatatatacttacatcaaaaccccaatatctcacattaataatcactaatcacatgtgtcatgaacaaaatatcaattcacaattattcacacaccatc 3798  T
Q  199 accaatcacatatatca 215  Q
    | |||||||||||||||    
T  3797 atcaatcacatatatca 3781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 15239 - 15167
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  15239 acattatcataatccaaataacagttaacatgaatatttcaatttaaacatcatgcacttgatcaataataat 15167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 2511 - 2438
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||| |||||| ||||||    
T  2511 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaatccaaatttcatatacttaatcaatgataata 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 72166 - 72093
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataata 94  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||| ||||||    
T  72166 acatcatcataatccacataatagttaacatgaataattcatttcaaatatcatatacttaatcaatgataata 72093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 68
Target Start/End: Original strand, 7299 - 7346
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaa 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7299 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaa 7346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 205
Target Start/End: Original strand, 8445 - 8558
Alignment:
Q  93 tattcacatatgtatacttatctcataatcccgatatctcacatcaa-taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcata 191  Q
    ||||| |||||| | ||||||  |||| |||| || |||||||| || ||||||||| ||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8445 tattctcatatgaacacttatagcatagtcccaatttctcacattaagtaatcaccactcacacgtatcatgaacaatcaccaaatcacagttattcata 8544  T
Q  192 cacaatcaccaatc 205  Q
    ||||||||||||||    
T  8545 cacaatcaccaatc 8558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 61
Target Start/End: Original strand, 8387 - 8427
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattca 61  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  8387 acatcatcataatccaaataacaattaacatgaataattca 8427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 93
Target Start/End: Original strand, 37627 - 37697
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataat 93  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  37627 acattatcataatccaaataacagttaacatgaataattcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataat 37697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 265
Target Start/End: Original strand, 39933 - 40024
Alignment:
Q  174 aattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacatgtatca 265  Q
    ||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||| | ||| | | |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39933 aattcacaaatattcattcacaaccaccaatcacatttatcatgaataatcattaataacagttcatgaacagtcaccaatcacatatatca 40024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 130 - 208
Target Start/End: Original strand, 31931 - 32010
Alignment:
Q  130 ctcacatcaat-aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcaca 208  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  31931 ctcacatcaattaatcaccaatcacatgtgtcatgaacaagtatcaaatcacatttattcatacacaattatcaatcaca 32010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Original strand, 31776 - 31853
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcaca 100  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31776 acatcatcataacccacataacattta-catgaatatttcaatttaa-cttcatgcacttgatcaataataatattcaca 31853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 197861 - 197772
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||||||| ||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  197861 atgaacaattatcgattcacaaatattcgttcacaatcaccaatcacatttatcatggataatcattaatcacatttcatgaacaatcac 197772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11799 - 11700
Alignment:
Q  160 catgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    ||||| |||| |||||| ||||  ||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| || | | |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  11799 catgagcaattatcaatgcacaactattcattcgcaatcaccaattacatttatcatgaataaccattaatcacctttcatgaacaatcaccaatcacat 11700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 67
Target Start/End: Original strand, 6891 - 6937
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaa 67  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6891 acatcatcataatccatataacagttaacatgaataagtcaattcaa 6937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2989 - 2920
Alignment:
Q  140 taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  2989 taatcgccagtcacgtgtatcatgaataatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacat 2920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 41107 - 41196
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatttcatgaacaatcac 250  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||| |  ||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||    
T  41107 atgaacaattatcaattcacaaatattcgttcacaatcaccaatcaaaattatcatgaataatcattaatgacatttcatgaacaatcac 41196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26692 - 26623
Alignment:
Q  140 taatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  26692 taatcgccagtcacgtgtatcatgaataatcatcaaatcacatttattcatacacaatcatcattcacat 26623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 141 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 4044 - 3978
Alignment:
Q  141 aatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||||| |||||||||    
T  4044 aatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaa-tcacattta-tcatgcacaatcatcaatcacat 3978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 194 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4045 - 3978
Alignment:
Q  194 caatcaccaatcacatatatcatgaacaatcctcaatcatatt--tcatgaacaatcaccaatcacat 259  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||    
T  4045 caatcaccaatcacatgtgtcatgaacaatcatcaatcacatttatcatgcacaatcatcaatcacat 3978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 206
Target Start/End: Original strand, 12557 - 12728
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcataa 120  Q
    |||| ||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||  |||| |||| | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |     
T  12557 acattatcataatccaaatagcatttaacatgaataat-caatt--aacaacatgcatttgatcaataataat---cacacataaatacttacatcaca- 12649  T
Q  121 tcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatca 206  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| ||||||        ||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  12650 tcccgatatctcacatcaacattcatcaatcat-------atgaacaattattaattcacagatattcattcacaatcaccaatca 12728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Original strand, 7408 - 7456
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7408 atgaacaattattaattcacagatattcattcacaatcaccaatcacat 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 249394 - 249218
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataatt-caattcaaacatcatgtacttgatcaataataatattcacatatgtatacttatctcata 119  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| || |||||  ||||||| | | |||||||||||||||   |||| ||  |||||||  ||| |    
T  249394 acattatcataatccaaataacaattatcatgaatattttcaatt--aacatcaggaatttgatcaataataat---cacacattaatacttacatcaca 249300  T
Q  120 atcccgatatctcacatcaataatcaccaatcacgtgtgtcatgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
      ||| ||||||||||||||||||||  ||||||       ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||    
T  249299 c-cccaatatctcacatcaataatcattaatcac-------atgaacaattatcaattcacaaatattcattcacaatcaccaatcacat 249218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Original strand, 4327 - 4364
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4327 acatcatcataatccacataacagttatacatgaataa 4364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 118440 - 118403
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagtta-acatgaataa 57  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  118440 acatcatcataatccacataacagttagacatgaataa 118403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1610 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1610
Description:

Target: scaffold1610; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 114 - 45
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataa 92  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  114 acattatcataattcaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa 45  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1605 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1605
Description:

Target: scaffold1605; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 21 - 92
Target Start/End: Original strand, 1465 - 1534
Alignment:
Q  21 acatcatcataatccacataacagttaacatgaataattcaattcaaacatcatgtacttgatcaataataa 92  Q
    |||| |||||||| || ||| |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  1465 acattatcataattcaaatagcagttatcatgaatatttcaatt--aacatcatgcatttgatcaataataa 1534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5331 - 5283
Alignment:
Q  161 atgaacaatcatcaattcacagttattcatacacaatcaccaatcacat 209  Q
    ||||||||| || ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  5331 atgaacaattattaattcacagattttcattcacaatcaccaatcacat 5283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University

This website was viewed 497 times since January 2019
Visitors: 6717