View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0949_high_3 (Length: 377)

Name: NF0949_high_3
Description: NF0949
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0949_high_3
NF0949_high_3
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (1-364)||(14737406-14737769)
chr6 (1-370)||(22010520-22010889)
chr6 (9-364)||(14742266-14742620)
chr6 (1-370)||(11856864-11857236)
chr6 (1-358)||(28184397-28184757)
chr6 (2-352)||(28155412-28155762)
chr6 (1-352)||(6438393-6438743)
chr6 (1-339)||(6005310-6005650)
chr6 (2-339)||(16838638-16838977)
chr6 (1-339)||(33330297-33330639)
chr6 (8-339)||(33335794-33336129)
chr6 (7-288)||(5674685-5674966)
chr6 (288-364)||(5674557-5674633)
chr6 (110-204)||(5757479-5757575)
chr6 (110-204)||(21356036-21356132)
chr6 (110-194)||(10077176-10077262)
chr6 (110-204)||(5572241-5572338)
chr6 (110-193)||(31086485-31086570)
chr6 (1-155)||(5343373-5343527)
chr6 (110-194)||(4629954-4630040)
chr6 (110-204)||(31979513-31979610)
chr6 (88-192)||(22708996-22709102)
chr6 (122-204)||(21801344-21801429)
chr6 (110-204)||(22963700-22963796)
chr6 (110-204)||(23824597-23824693)
chr6 (1-61)||(30125937-30125998)
chr6 (131-204)||(18232867-18232942)
chr6 (110-192)||(5017482-5017566)
chr6 (110-173)||(31936587-31936651)
chr6 (259-339)||(5343628-5343710)
chr6 (114-173)||(12195515-12195575)
chr6 (288-350)||(5017304-5017364)
chr6 (101-173)||(5273203-5273276)
chr6 (290-350)||(22709241-22709299)
chr6 (114-173)||(4816231-4816291)
chr6 (114-173)||(19704567-19704627)
chr6 (114-173)||(20915356-20915416)
chr6 (114-173)||(26932562-26932622)
chr6 (114-173)||(29754709-29754769)
chr6 (114-173)||(33309110-33309170)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (1-370)||(15044579-15044948)
chr5 (1-370)||(43592171-43592541)
chr5 (1-370)||(27449706-27450076)
chr5 (1-370)||(43598616-43598986)
chr5 (1-370)||(43604108-43604478)
chr5 (1-370)||(43609600-43609970)
chr5 (1-370)||(1456985-1457354)
chr5 (1-370)||(27444862-27445232)
chr5 (1-339)||(28807429-28807767)
chr5 (7-287)||(30631305-30631586)
chr5 (1-339)||(37556478-37556816)
chr5 (1-339)||(37561300-37561638)
chr5 (32-288)||(31180138-31180394)
chr5 (1-339)||(2785268-2785608)
chr5 (1-339)||(33791209-33791549)
chr5 (1-339)||(31396843-31397185)
chr5 (1-339)||(31401700-31402042)
chr5 (1-339)||(33768072-33768417)
chr5 (1-288)||(24135744-24136028)
chr5 (7-288)||(38192073-38192353)
chr5 (7-288)||(38219298-38219578)
chr5 (88-288)||(35387640-35387842)
chr5 (288-364)||(30631640-30631716)
chr5 (288-364)||(31180447-31180523)
chr5 (288-364)||(24136080-24136156)
chr5 (110-204)||(9353333-9353429)
chr5 (110-204)||(36932351-36932447)
chr5 (110-204)||(10281751-10281848)
chr5 (110-204)||(15464532-15464628)
chr5 (111-204)||(11916972-11917068)
chr5 (288-350)||(35387893-35387955)
chr5 (110-204)||(14520230-14520326)
chr5 (110-195)||(17003970-17004057)
chr5 (110-204)||(3880299-3880396)
chr5 (113-204)||(12084176-12084269)
chr5 (110-204)||(19588746-19588843)
chr5 (110-192)||(28832259-28832343)
chr5 (288-350)||(38219629-38219691)
chr5 (110-192)||(42127423-42127507)
chr5 (114-173)||(4410241-4410301)
chr5 (110-189)||(31300612-31300693)
chr5 (114-173)||(15552464-15552524)
chr5 (114-173)||(31179371-31179431)
chr5 (114-173)||(31542953-31543013)
chr5 (114-173)||(31545299-31545359)
chr5 (288-350)||(24553335-24553395)
chr5 (288-349)||(11181641-11181700)
chr5 (114-167)||(27910675-27910729)
chr5 (290-350)||(7160712-7160770)
chr5 (290-350)||(14520461-14520519)
chr5 (288-348)||(28832486-28832544)
chr5 (114-173)||(3373137-3373197)
chr5 (114-173)||(10749919-10749979)
chr5 (114-173)||(15354575-15354635)
chr5 (110-192)||(24553520-24553603)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (8-370)||(7289749-7290112)
chr8 (1-364)||(25328108-25328470)
chr8 (1-352)||(39784665-39785016)
chr8 (1-288)||(6311190-6311477)
chr8 (7-288)||(36979276-36979558)
chr8 (7-287)||(33037724-33038005)
chr8 (1-339)||(35745284-35745624)
chr8 (7-288)||(30655542-30655827)
chr8 (7-288)||(4759991-4760274)
chr8 (1-288)||(18853083-18853372)
chr8 (1-288)||(18870477-18870763)
chr8 (7-288)||(10689058-10689341)
chr8 (10-339)||(10684116-10684447)
chr8 (7-288)||(1261871-1262148)
chr8 (88-192)||(26287879-26287985)
chr8 (88-192)||(26301136-26301242)
chr8 (88-192)||(26313130-26313236)
chr8 (88-288)||(31071146-31071349)
chr8 (288-370)||(6311532-6311614)
chr8 (288-364)||(18870348-18870424)
chr8 (276-364)||(25327982-25328070)
chr8 (288-364)||(30655880-30655956)
chr8 (288-364)||(10688927-10689003)
chr8 (288-364)||(18852954-18853030)
chr8 (288-364)||(33037595-33037671)
chr8 (110-195)||(26403240-26403327)
chr8 (110-204)||(4456028-4456124)
chr8 (75-204)||(7412305-7412437)
chr8 (288-350)||(1261758-1261820)
chr8 (288-364)||(4759861-4759938)
chr8 (288-361)||(36979611-36979683)
chr8 (110-204)||(19175755-19175851)
chr8 (110-204)||(23799577-23799674)
chr8 (110-192)||(4696609-4696693)
chr8 (113-204)||(6127224-6127318)
chr8 (112-173)||(9765852-9765914)
chr8 (110-204)||(5702483-5702580)
chr8 (110-192)||(19752407-19752491)
chr8 (288-348)||(31071035-31071095)
chr8 (288-350)||(26288121-26288183)
chr8 (288-350)||(26301378-26301440)
chr8 (288-350)||(26313372-26313434)
chr8 (288-350)||(7412569-7412629)
chr8 (114-173)||(43079877-43079937)
chr8 (114-173)||(43082248-43082308)
chr8 (288-350)||(4696416-4696476)
chr8 (110-176)||(6813683-6813750)
chr8 (140-173)||(18810982-18811015)
chr8 (291-350)||(23799384-23799441)
chr8 (114-173)||(44721118-44721178)
[»] chr4 (50 HSPs)
chr4 (1-370)||(9224230-9224599)
chr4 (1-370)||(9229017-9229386)
chr4 (1-364)||(51520349-51520713)
chr4 (2-352)||(45347658-45348009)
chr4 (2-352)||(45357138-45357488)
chr4 (1-364)||(3813916-3814278)
chr4 (1-352)||(5732554-5732907)
chr4 (1-339)||(18855619-18855956)
chr4 (1-237)||(56146667-56146904)
chr4 (7-288)||(24741839-24742121)
chr4 (7-286)||(29760541-29760821)
chr4 (282-370)||(18712589-18712677)
chr4 (288-364)||(24742174-24742250)
chr4 (88-192)||(28468542-28468647)
chr4 (288-364)||(29760874-29760951)
chr4 (88-204)||(31985635-31985752)
chr4 (110-204)||(10047379-10047476)
chr4 (110-204)||(39245994-39246091)
chr4 (110-204)||(36315230-36315326)
chr4 (110-204)||(36329439-36329535)
chr4 (110-204)||(16623293-16623390)
chr4 (110-204)||(5396672-5396768)
chr4 (110-195)||(38152449-38152536)
chr4 (110-204)||(3796519-3796616)
chr4 (111-194)||(5143260-5143345)
chr4 (110-192)||(5269204-5269288)
chr4 (111-194)||(5147678-5147763)
chr4 (111-204)||(3777550-3777645)
chr4 (110-195)||(24333809-24333896)
chr4 (115-195)||(6743425-6743507)
chr4 (114-204)||(16630680-16630773)
chr4 (288-350)||(28468342-28468404)
chr4 (288-347)||(5112466-5112523)
chr4 (114-173)||(16931789-16931849)
chr4 (114-173)||(16934143-16934203)
chr4 (114-173)||(22780373-22780433)
chr4 (114-173)||(44599838-44599898)
chr4 (288-350)||(3777778-3777838)
chr4 (288-350)||(5396479-5396539)
chr4 (288-350)||(16623101-16623161)
chr4 (288-350)||(16628680-16628740)
chr4 (131-204)||(39774305-39774380)
chr4 (110-194)||(54867184-54867269)
chr4 (290-350)||(5269008-5269066)
chr4 (288-347)||(6743226-6743283)
chr4 (114-173)||(6765117-6765177)
chr4 (114-173)||(7941596-7941656)
chr4 (114-173)||(18709164-18709224)
chr4 (114-173)||(22782738-22782798)
chr4 (291-350)||(25861841-25861898)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (1-370)||(34885-35254)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (1-370)||(22173018-22173387)
chr3 (1-352)||(18656324-18656677)
chr3 (7-288)||(7167143-7167425)
chr3 (7-288)||(28503780-28504053)
chr3 (1-339)||(2676939-2677280)
chr3 (1-339)||(2672783-2673124)
chr3 (1-339)||(24968000-24968340)
chr3 (43-285)||(8738982-8739224)
chr3 (43-285)||(9091220-9091462)
chr3 (1-288)||(2671502-2671790)
chr3 (1-339)||(8512108-8512450)
chr3 (1-339)||(8516988-8517330)
chr3 (50-288)||(40372712-40372949)
chr3 (7-288)||(8477263-8477545)
chr3 (10-339)||(32475387-32475717)
chr3 (10-339)||(32480245-32480575)
chr3 (153-288)||(28501613-28501750)
chr3 (110-288)||(26928507-26928687)
chr3 (88-288)||(32143299-32143501)
chr3 (88-288)||(1305927-1306128)
chr3 (288-364)||(2671373-2671449)
chr3 (288-364)||(8477598-8477674)
chr3 (288-364)||(8738850-8738926)
chr3 (288-364)||(40372583-40372659)
chr3 (288-364)||(7167478-7167555)
chr3 (288-364)||(9091088-9091164)
chr3 (1-158)||(10207826-10207983)
chr3 (288-364)||(28501483-28501560)
chr3 (288-364)||(28503650-28503727)
chr3 (110-204)||(8370477-8370573)
chr3 (110-204)||(27974943-27975039)
chr3 (110-204)||(18552873-18552970)
chr3 (110-288)||(27452958-27453138)
chr3 (110-204)||(16264350-16264446)
chr3 (110-204)||(21711223-21711319)
chr3 (110-192)||(27986449-27986533)
chr3 (111-204)||(36029094-36029190)
chr3 (113-204)||(1736295-1736389)
chr3 (110-204)||(30709780-30709877)
chr3 (110-192)||(33386669-33386753)
chr3 (110-204)||(3715992-3716089)
chr3 (110-204)||(40592772-40592869)
chr3 (110-204)||(48438214-48438311)
chr3 (110-204)||(6794704-6794800)
chr3 (110-204)||(25795781-25795878)
chr3 (110-204)||(26298988-26299085)
chr3 (110-192)||(1417493-1417577)
chr3 (110-204)||(47923896-47923993)
chr3 (288-348)||(1306179-1306239)
chr3 (110-192)||(37466291-37466375)
chr3 (110-192)||(39039995-39040079)
chr3 (110-204)||(40844652-40844748)
chr3 (110-192)||(3328359-3328443)
chr3 (110-176)||(4386947-4387014)
chr3 (110-204)||(24695154-24695251)
chr3 (291-350)||(4386774-4386831)
chr3 (114-173)||(38210569-38210629)
chr3 (114-173)||(50494198-50494258)
chr3 (114-177)||(53894055-53894119)
chr3 (288-350)||(23392106-23392166)
chr3 (288-350)||(24694963-24695023)
chr3 (288-350)||(26928396-26928456)
chr3 (288-350)||(27986253-27986313)
chr3 (288-350)||(36029322-36029382)
chr3 (288-350)||(40592579-40592639)
chr3 (131-192)||(3323693-3323755)
chr3 (114-173)||(458483-458543)
chr3 (114-173)||(6063444-6063504)
chr3 (114-173)||(10621528-10621588)
chr3 (291-350)||(21711454-21711511)
chr3 (291-350)||(23410529-23410586)
chr3 (110-157)||(39153357-39153405)
chr3 (288-347)||(47923704-47923761)
[»] chr2 (58 HSPs)
chr2 (1-370)||(39811811-39812180)
chr2 (1-352)||(32246677-32247031)
chr2 (1-254)||(44312563-44312816)
chr2 (7-288)||(11098843-11099125)
chr2 (1-339)||(19344313-19344655)
chr2 (1-339)||(19349171-19349513)
chr2 (1-288)||(14291381-14291669)
chr2 (1-288)||(9296317-9296605)
chr2 (7-288)||(25398395-25398675)
chr2 (7-288)||(25403533-25403813)
chr2 (88-288)||(3491729-3491930)
chr2 (288-364)||(11098714-11098790)
chr2 (110-195)||(8040060-8040147)
chr2 (88-192)||(40738822-40738926)
chr2 (288-364)||(9296189-9296265)
chr2 (288-364)||(14291722-14291798)
chr2 (113-204)||(13569331-13569425)
chr2 (110-204)||(21629944-21630040)
chr2 (110-204)||(28259178-28259274)
chr2 (140-288)||(25407653-25407802)
chr2 (110-204)||(10445444-10445541)
chr2 (110-204)||(17865203-17865300)
chr2 (110-204)||(20522220-20522317)
chr2 (110-204)||(34682334-34682431)
chr2 (111-204)||(34388859-34388955)
chr2 (110-204)||(14699008-14699104)
chr2 (111-204)||(10707252-10707348)
chr2 (113-204)||(8390150-8390244)
chr2 (288-350)||(25409860-25409922)
chr2 (110-195)||(31056044-31056131)
chr2 (110-204)||(33528621-33528718)
chr2 (110-204)||(39482931-39483028)
chr2 (110-204)||(23078471-23078567)
chr2 (110-204)||(42039670-42039766)
chr2 (110-195)||(16940219-16940306)
chr2 (110-195)||(17010884-17010971)
chr2 (288-350)||(3491981-3492043)
chr2 (110-194)||(33118136-33118222)
chr2 (110-193)||(36757774-36757859)
chr2 (100-173)||(2838063-2838136)
chr2 (113-173)||(1345574-1345635)
chr2 (114-173)||(35215586-35215646)
chr2 (114-173)||(35217963-35218023)
chr2 (131-193)||(27149306-27149369)
chr2 (288-350)||(36757570-36757630)
chr2 (288-350)||(39483162-39483222)
chr2 (288-350)||(40739063-40739123)
chr2 (113-193)||(2869705-2869787)
chr2 (288-348)||(21630174-21630232)
chr2 (215-288)||(40738940-40739012)
chr2 (114-170)||(45332181-45332238)
chr2 (310-350)||(20522471-20522511)
chr2 (288-351)||(23078278-23078339)
chr2 (114-173)||(23452237-23452297)
chr2 (288-351)||(29867780-29867840)
chr2 (114-173)||(36558864-36558924)
chr2 (114-173)||(36561141-36561201)
chr2 (288-350)||(41586358-41586419)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (7-370)||(41398139-41398498)
chr1 (8-370)||(41390485-41390843)
chr1 (1-352)||(25444931-25445282)
chr1 (1-352)||(39445392-39445742)
chr1 (1-352)||(44023716-44024065)
chr1 (9-352)||(1054854-1055196)
chr1 (7-288)||(24787280-24787560)
chr1 (1-339)||(43988314-43988658)
chr1 (1-288)||(24202686-24202969)
chr1 (214-352)||(25439738-25439875)
chr1 (74-288)||(19358760-19358975)
chr1 (74-288)||(19361349-19361564)
chr1 (74-288)||(19379989-19380204)
chr1 (289-364)||(24787151-24787226)
chr1 (110-204)||(26644898-26644994)
chr1 (110-195)||(47703946-47704033)
chr1 (288-350)||(24202573-24202635)
chr1 (110-204)||(19072928-19073025)
chr1 (110-204)||(19120818-19120915)
chr1 (110-204)||(16124516-16124613)
chr1 (110-204)||(27104372-27104469)
chr1 (110-204)||(3281708-3281804)
chr1 (110-195)||(9476261-9476348)
chr1 (110-195)||(13598398-13598485)
chr1 (110-195)||(29651811-29651898)
chr1 (110-202)||(37069770-37069864)
chr1 (110-195)||(775672-775759)
chr1 (75-204)||(21536570-21536702)
chr1 (110-204)||(13604624-13604720)
chr1 (110-192)||(47098837-47098921)
chr1 (288-350)||(19366112-19366174)
chr1 (110-192)||(32889439-32889523)
chr1 (288-350)||(19361237-19361298)
chr1 (113-173)||(47102874-47102935)
chr1 (114-173)||(9459419-9459479)
chr1 (114-173)||(9463246-9463306)
chr1 (114-173)||(16226386-16226446)
chr1 (288-350)||(47098633-47098693)
chr1 (288-350)||(47102647-47102707)
chr1 (288-349)||(3281936-3281995)
chr1 (288-350)||(19358648-19358709)
chr1 (114-173)||(23786058-23786118)
chr1 (290-349)||(37069998-37070055)
chr1 (114-173)||(51752582-51752642)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (1-370)||(12396804-12397173)
chr7 (1-362)||(12406224-12406585)
chr7 (1-370)||(31109406-31109775)
chr7 (1-370)||(24024150-24024520)
chr7 (9-339)||(19992213-19992544)
chr7 (1-339)||(21812092-21812431)
chr7 (1-288)||(20357463-20357751)
chr7 (1-199)||(4866622-4866820)
chr7 (1-288)||(2057852-2058147)
chr7 (10-339)||(24266054-24266385)
chr7 (10-339)||(24261175-24261506)
chr7 (10-339)||(16884831-16885162)
chr7 (10-339)||(16879975-16880306)
chr7 (7-288)||(1533359-1533640)
chr7 (7-288)||(21639710-21639988)
chr7 (7-288)||(21645908-21646186)
chr7 (7-288)||(18408666-18408943)
chr7 (110-288)||(18413641-18413819)
chr7 (290-364)||(4873310-4873384)
chr7 (288-364)||(20357334-20357410)
chr7 (288-364)||(1533231-1533307)
chr7 (288-364)||(2058202-2058278)
chr7 (111-194)||(21983285-21983370)
chr7 (110-204)||(29159803-29159900)
chr7 (110-204)||(46516310-46516407)
chr7 (110-204)||(49091661-49091758)
chr7 (110-204)||(44848685-44848781)
chr7 (110-204)||(2647696-2647793)
chr7 (110-204)||(33332450-33332547)
chr7 (110-192)||(9190021-9190105)
chr7 (110-192)||(20284089-20284173)
chr7 (288-350)||(21640039-21640101)
chr7 (288-350)||(21646237-21646299)
chr7 (110-204)||(55948-56044)
chr7 (110-192)||(2580390-2580474)
chr7 (288-350)||(18408993-18409055)
chr7 (110-193)||(35960816-35960901)
chr7 (110-192)||(9185178-9185262)
chr7 (288-350)||(18413869-18413931)
chr7 (110-189)||(47263678-47263757)
chr7 (110-193)||(2479337-2479421)
chr7 (110-204)||(4796667-4796764)
chr7 (113-173)||(28617258-28617319)
chr7 (111-194)||(21988909-21988992)
chr7 (114-173)||(31155911-31155971)
chr7 (288-350)||(20284318-20284378)
chr7 (288-350)||(23402821-23402881)
chr7 (288-349)||(4796477-4796536)
chr7 (290-350)||(44847933-44847991)
chr7 (114-173)||(1049296-1049356)
chr7 (114-173)||(2935497-2935557)
chr7 (114-173)||(3035953-3036013)
chr7 (110-173)||(5817303-5817366)
chr7 (114-173)||(7351652-7351712)
chr7 (110-157)||(8153466-8153514)
chr7 (114-173)||(9027194-9027254)
chr7 (288-347)||(21989137-21989194)
chr7 (114-173)||(22108295-22108355)
chr7 (114-173)||(22137306-22137366)
chr7 (114-173)||(40550055-40550115)
chr7 (114-173)||(40552333-40552393)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (8-323)||(9514-9825)
scaffold0355 (196-370)||(3671-3845)
scaffold0355 (8-83)||(1-72)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (1-352)||(255-605)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (1-339)||(2103-2443)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (1-339)||(148808-149148)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (1-339)||(19017-19357)
scaffold0197 (10-339)||(14161-14492)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (7-288)||(17869-18148)
scaffold0188 (7-288)||(23962-24241)
scaffold0188 (288-350)||(17756-17818)
scaffold0188 (288-350)||(23849-23911)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (10-178)||(181980-182147)
scaffold0009 (245-339)||(176829-176925)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (7-142)||(300-432)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (110-204)||(8420-8516)
scaffold0140 (288-350)||(8225-8285)
scaffold0140 (114-173)||(22343-22403)
scaffold0140 (114-173)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (111-204)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (110-204)||(43962-44058)
scaffold0087 (75-204)||(36833-36965)
scaffold0087 (288-350)||(36640-36700)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (110-195)||(5683-5770)
scaffold0006 (110-195)||(2492-2579)
scaffold0006 (110-204)||(133281-133377)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (110-204)||(10729-10826)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (110-192)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (113-204)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (114-173)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (140-173)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (114-173)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 325; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14737769 - 14737406
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaa-gagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14737769 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaaca 14737671  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737670 aaacaccgagaagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 14737571  T
Q  200 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737570 caagactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 14737471  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737470 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 14737406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22010889 - 22010520
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010889 ccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 22010791  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010790 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 22010691  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22010690 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 22010591  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22010590 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 22010520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 312; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 9 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14742620 - 14742266
Alignment:
Q  9 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccga 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14742620 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccga 14742522  T
Q  109 gaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactct 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742521 gaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactct 14742422  T
Q  209 agccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtt 308  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14742421 agccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaagtgattacaatgtt 14742322  T
Q  309 tttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14742321 tttcccaacccaagagacactctcaacaaagacacttaacccattggttccctcct 14742266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 308; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 11856864 - 11857236
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11856864 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaa 11856962  T
Q  101 aa---caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 197  Q
    ||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856963 aaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 11857062  T
Q  198 tacaaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11857063 tacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggt 11857162  T
Q  297 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11857163 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 11857236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 1 - 358
Target Start/End: Original strand, 28184397 - 28184757
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  28184397 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaaca 28184495  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28184496 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28184595  T
Q  200 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28184596 caacactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 28184695  T
Q  300 tacaatgttttt---cccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttc 358  Q
    ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28184696 tactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagaccctcaacccatttgttc 28184757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 2 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 28155762 - 28155412
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaa 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| ||||||    
T  28155762 caagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaa 28155664  T
Q  101 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155663 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28155564  T
Q  200 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28155563 caagaatttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgat 28155465  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  28155464 tacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 28155412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 6438393 - 6438743
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  6438393 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 6438490  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  6438491 aaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggtt 6438589  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  6438590 acaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 6438688  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  6438689 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 6438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 6005310 - 6005650
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  6005310 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 6005406  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  6005407 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 6005505  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  6005506 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 6005604  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  6005605 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 6005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 2 - 339
Target Start/End: Original strand, 16838638 - 16838977
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaaca 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  |||||    
T  16838638 caagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaaca 16838734  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gt 197  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  16838735 aa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 16838833  T
Q  198 tacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 296  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16838834 tacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggt 16838932  T
Q  297 gattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  16838933 gattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 16838977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33330639 - 33330297
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  |||    
T  33330639 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaa 33330542  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    |||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  33330541 caaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 33330443  T
Q  196 gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 294  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||    
T  33330442 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaag 33330344  T
Q  295 gtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33330343 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33330297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 8 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 33336129 - 33335794
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaaca 104  Q
    ||||||||||||||||||  || ||| ||||||| |||| |||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||||| ||    
T  33336129 aacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-ca 33336033  T
Q  105 ccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaa 202  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  33336032 ccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaa 33335933  T
Q  203 gactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 301  Q
    || |||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33335932 gaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgatta 33335834  T
Q  302 caatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33335833 caatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33335794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 5674966 - 5674685
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaac-agccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||  ||||||   |||||||  ||||| |||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  5674966 caacaacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 5674872  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  5674871 ccaaagagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 5674772  T
Q  204 --actctagccttcaagctttacacatg-aacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
      ||  |||| | ||||| ||||||| | |||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  5674771 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 5674685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 5674633 - 5674557
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5674633 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 5674557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757479
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 5757479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356132
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaaga 21356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10077262 - 10077176
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077262 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5572338 - 5572241
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5572338 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31086570 - 31086485
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086570 aagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 5343373 - 5343527
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  |||    
T  5343373 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaa 5343469  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 155  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343470 caaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 31979513 - 31979610
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  31979513 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaaga 31979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 22708996 - 22709102
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22708996 aaaggaagaacaaacacaccaaaaa-attgttgacctagttcggttcaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 22709094  T
Q  185 tgttacaa 192  Q
    ||||||||    
T  22709095 tgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801344
Alignment:
Q  122 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaaga 21801344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 22963700 - 22963796
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22963700 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 22963796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23824693 - 23824597
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23824693 aagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 30125998 - 30125937
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagata 61  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30125998 ccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagata 30125937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232942
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5017566 - 5017482
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017566 aagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Original strand, 31936587 - 31936651
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936587 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 339
Target Start/End: Original strand, 5343628 - 5343710
Alignment:
Q  259 tttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  5343628 tttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 5343710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5017364 - 5017304
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5017364 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5017304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 5273203 - 5273276
Alignment:
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273203 aacactgagaaatttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Original strand, 22709241 - 22709299
Alignment:
Q  290 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  22709241 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 22709299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 319; Significance: 1e-180; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 15044579 - 15044948
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  15044579 ccaaaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaa 15044677  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044678 aacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 15044777  T
Q  201 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044778 aagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 15044877  T
Q  301 acaatgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15044878 acaatgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 15044948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 43592171 - 43592541
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43592171 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43592270  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592271 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43592370  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  43592371 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 43592470  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43592471 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43592541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 27449706 - 27450076
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27449706 ccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 27449805  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449806 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 27449905  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  27449906 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 27450005  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27450006 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 27450076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 43598616 - 43598986
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43598616 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43598715  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598716 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43598815  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  43598816 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 43598915  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43598916 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43598986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 43604108 - 43604478
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43604108 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43604207  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604208 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43604307  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  43604308 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 43604407  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43604408 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43604478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 43609600 - 43609970
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  43609600 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 43609699  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609700 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 43609799  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  43609800 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 43609899  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43609900 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 43609970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1457354 - 1456985
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||    
T  1457354 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-ggaagaacaa 1457256  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457255 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 1457156  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1457155 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 1457056  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1457055 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 1456985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 27444862 - 27445232
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27444862 ccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 27444961  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444962 aacaccgagaagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 27445061  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  27445062 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 27445161  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27445162 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 27445232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 28807767 - 28807429
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaa 97  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||| ||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||    
T  28807767 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaa 28807670  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 196  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  28807669 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaagg 28807571  T
Q  197 ttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 296  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  28807570 ttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 28807472  T
Q  297 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28807471 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 28807429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Original strand, 30631305 - 30631586
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||    
T  30631305 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaa-ggaagaacaaaacacc 30631403  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--a 204  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  30631404 aagaagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaa 30631503  T
Q  205 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30631504 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 30631586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37556816 - 37556478
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  37556816 ccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaaca 37556718  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37556717 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtt 37556618  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    |||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37556617 acaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 37556519  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  37556518 attacaatg-ttttcccaacctaagaaacactcacatcaaag 37556478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 37561638 - 37561300
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||| || |||| |||| |||||    
T  37561638 ccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaatggaaagaaca 37561540  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37561539 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtt 37561440  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    |||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37561439 acaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 37561341  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||| || |||||    
T  37561340 attacaatg-ttttcccaacctaagaaacactcacatcaaag 37561300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 32 - 288
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180394
Alignment:
Q  32 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagc 131  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagc 31180236  T
Q  132 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatg 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |    
T  31180237 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaag 31180336  T
Q  230 aacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  31180337 -acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaa 31180394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 2785268 - 2785608
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  2785268 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 2785364  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2785365 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2785463  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  2785464 ttacaagaatctagcttttcaagctttactcatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 2785562  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2785563 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2785608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 33791209 - 33791549
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  33791209 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 33791305  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  33791306 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 33791404  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  33791405 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 33791503  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33791504 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33791549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31397185 - 31396843
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca- 99  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  || ||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  | |     
T  31397185 ccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacaaac 31397089  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gt 197  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  31397088 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 31396989  T
Q  198 tacaagactctagcct-tcaagctttacacatg--aacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 294  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||||||| |  || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||||    
T  31396988 tacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaag 31396890  T
Q  295 gtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31396889 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 31396843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 31402042 - 31401700
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  31402042 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac 31401946  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  31401945 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 31401847  T
Q  197 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatg--aacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaa 293  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| |  || ||||  |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  || |||||    
T  31401846 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaactctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaa 31401748  T
Q  294 ggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31401747 ggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 31401700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 33768072 - 33768417
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| | |||| || ||| |||||  || ||||| ||||||||||||  ||||    
T  33768072 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaa-gcata--caggataaacgataaaaggaaaagaac 33768168  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  33768169 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 33768267  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctacccttt--ggtattttccc-actc--tcacactatgaaccctaaaacc 290  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||  | ||||||||| || |   |||||||||||||   || ||    
T  33768268 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttcggttattttccctacccctccacactatgaaccaataatcc 33768366  T
Q  291 caaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33768367 caaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 33768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 24135744 - 24136028
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   ||| |   |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24135744 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaacaa 24135838  T
Q  101 a-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||    
T  24135839 acacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggtt 24135938  T
Q  199 acaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||||    
T  24135939 acaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaa 24136028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 38192073 - 38192353
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  38192073 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 38192168  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38192169 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 38192268  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38192269 aaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 38219298 - 38219578
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  38219298 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 38219393  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38219394 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 38219493  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  38219494 aaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38219578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Original strand, 35387640 - 35387842
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  35387640 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagt 35387739  T
Q  186 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 284  Q
    |||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||| ||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35387740 gttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 35387838  T
Q  285 aaaa 288  Q
    ||||    
T  35387839 aaaa 35387842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 30631640 - 30631716
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631640 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 30631716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 31180447 - 31180523
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31180447 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcct 31180523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 24136080 - 24136156
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24136080 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactttctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 24136156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353333
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 9353333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932351
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281848
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10281848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464628
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 15464628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916972
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 11916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 35387893 - 35387955
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35387893 acccaaggtgattacaatgttttttccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 35387955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520326
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 14520326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17004057 - 17003970
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004057 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 3880299 - 3880396
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3880299 aagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3880396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084176
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 12084176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588843
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19588843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 28832259 - 28832343
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832259 aagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 38219629 - 38219691
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  38219629 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 38219691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42127507 - 42127423
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127507 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31300693 - 31300612
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  31300693 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgtta 31300612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24553395 - 24553335
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24553395 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 24553335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 11181700 - 11181641
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 349  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  11181700 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacc 11181641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 114 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 167  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7160770 - 7160712
Alignment:
Q  290 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  7160770 ccaaggtgattacaatgttt--cccaatccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 7160712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Original strand, 14520461 - 14520519
Alignment:
Q  290 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  14520461 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 14520519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 28832486 - 28832544
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 348  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  28832486 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaac 28832544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 24553603 - 24553520
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  24553603 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaa 24553520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 8 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7290112 - 7289749
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg 107  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7290112 aacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaacaccg 7290013  T
Q  108 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag-act 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7290012 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaact 7289913  T
Q  207 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289912 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatg 7289813  T
Q  307 tttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7289812 tttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 7289749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25328470 - 25328108
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| || |||| | || |||||    
T  25328470 ccaagccaacaacaacaaaacaacccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaaca 25328373  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328372 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 25328273  T
Q  200 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25328272 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgat 25328173  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25328172 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcct 25328108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 39785016 - 39784665
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  39785016 ccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaaca 39784918  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39784917 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggtt 39784819  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39784818 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 39784720  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39784719 attacaatgtttttcccaacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccat 39784665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 6311190 - 6311477
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  6311190 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaa 6311288  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6311289 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 6311388  T
Q  201 aag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  6311389 aagaaactctagccttcaagctttacacaag-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 6311477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 36979276 - 36979558
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  36979276 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacac 36979373  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag- 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  36979374 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 36979473  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  36979474 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 36979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 33038005 - 33037724
Alignment:
Q  7 caacaacaacaa--aacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaaca 104  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  33038005 caacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaag-aagaacaaaaca 33037908  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag- 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  33037907 ccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaaga 33037808  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaa 287  Q
     ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33037807 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 33037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 35745284 - 35745624
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  35745284 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 35745380  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  35745381 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 35745479  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  35745480 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 35745578  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  35745579 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 35745624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 30655542 - 30655827
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaa---- 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||        
T  30655542 caacaacaa-aaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacatagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaaaaaa 30655639  T
Q  103 caccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttaca 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  30655640 caccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttaca 30655739  T
Q  202 ag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30655740 agaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 30655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 4760274 - 4759991
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||     
T  4760274 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacat 4760176  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag- 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  4760175 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 4760076  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     ||  |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4760075 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 4759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18853372 - 18853083
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaaca-gccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||| |||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  18853372 ccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 18853275  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggt 197  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||    
T  18853274 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggt 18853175  T
Q  198 tacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18853174 tacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattttaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18853083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18870763 - 18870477
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  18870763 ccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaa 18870668  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggtt 198  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||    
T  18870667 aacaccaagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggtt 18870568  T
Q  199 acaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||||  ||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18870567 acaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18870477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 10689341 - 10689058
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| |||||||||||||||    
T  10689341 caacaacaacaaaaacaaccctagtgtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagtaagaaa-ggaagaacaaaacac 10689244  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag- 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||     
T  10689243 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaaga 10689144  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     ||  |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  10689143 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 10689058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 10684447 - 10684116
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  10684447 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 10684352  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagac 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  10684351 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 10684252  T
Q  206 tctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  10684251 tctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaa 10684153  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  10684152 tgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 10684116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1262148 - 1261871
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgata-aaaggaagaacaaa-ac 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||| ||||  |||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||| ||    
T  1262148 caacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca-agaga-atac--aagca--aacaagataag--atagaaaggaagaacaaacac 1262057  T
Q  104 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  1262056 accaaaaagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 1261957  T
Q  203 g-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    | |   |||| | ||||| ||||||| | ||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1261956 gaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1261871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 26287879 - 26287985
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26287879 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26287978  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  26287979 gttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 26301136 - 26301242
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26301136 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26301235  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  26301236 gttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 26313130 - 26313236
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26313130 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 26313229  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  26313230 gttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 31071349 - 31071146
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31071349 aaaggaagaacaaacacaccaaaaagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 31071250  T
Q  185 tgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 283  Q
    ||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||||    
T  31071249 tgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 31071151  T
Q  284 taaaa 288  Q
    |||||    
T  31071150 taaaa 31071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 6311532 - 6311614
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  6311532 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgcta 6311614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18870424 - 18870348
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18870424 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcct 18870348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 276 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327982
Alignment:
Q  276 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcct 25327982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 30655880 - 30655956
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30655880 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcct 30655956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10689003 - 10688927
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10689003 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 10688927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 18853030 - 18852954
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18853030 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcct 18852954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 33037671 - 33037595
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33037671 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagacactcaaccctttggttccctcct 33037595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 26403327 - 26403240
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403327 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456124
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 4456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Original strand, 7412305 - 7412437
Alignment:
Q  75 aagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||| |||||  ||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7412305 aagataagcaatgaaagaaggaacaaacacaccatgaaaattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 7412404  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    | ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  7412405 actatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 7412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 1261820 - 1261758
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1261820 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccc 1261758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 4759938 - 4759861
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgttttt-cccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  4759938 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccctttggttacctcct 4759861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 288 - 361
Target Start/End: Original strand, 36979611 - 36979683
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccct 361  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36979611 acccaaggtgattacaatgtttt-cccaacctaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccct 36979683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175755
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 19175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23799674 - 23799577
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23799674 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 4696693 - 4696609
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696693 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127318
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 6127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  112 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5702580 - 5702483
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5702580 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19752491 - 19752407
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752491 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 31071095 - 31071035
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  31071095 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 26288121 - 26288183
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26288121 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26288183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 26301378 - 26301440
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26301378 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26301440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 26313372 - 26313434
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26313372 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 7412569 - 7412629
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  7412569 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 7412629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4696476 - 4696416
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4696476 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 4696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 110 - 176
Target Start/End: Original strand, 6813683 - 6813750
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 176  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813683 aagattgttaacccagttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaata 6813750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  140 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23799441 - 23799384
Alignment:
Q  291 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23799441 caaggtgtttacaatgttc--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23799384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 315; Significance: 1e-177; HSPs: 50)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9224599 - 9224230
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9224599 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaa 9224501  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9224500 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttag 9224401  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224400 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 9224301  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9224300 tacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 9224230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9229386 - 9229017
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9229386 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaa 9229288  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9229287 aacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttag 9229188  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229187 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 9229088  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9229087 tacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 9229017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 51520349 - 51520713
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51520349 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 51520448  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520449 aacaccgagaagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 51520548  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  51520549 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 51520648  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520649 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 51520713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 2 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 45348009 - 45347658
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45348009 caagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 45347911  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347910 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 45347811  T
Q  201 aagac-tctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45347810 aagacctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtgat 45347711  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  45347710 tacaatgtttttcccaacctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccat 45347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 2 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 45357488 - 45357138
Alignment:
Q  2 caagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaa 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  45357488 caagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 45357390  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357389 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 45357290  T
Q  201 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45357289 aagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccccaaggtgatt 45357190  T
Q  301 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  45357189 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 45357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 3813916 - 3814278
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  3813916 ccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 3814013  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3814014 aaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggtt 3814113  T
Q  199 acaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 298  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3814114 acaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 3814212  T
Q  299 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  3814213 ttacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccataggatccctcct 3814278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 5732554 - 5732907
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| || |||| | ||||||||    
T  5732554 ccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaa 5732651  T
Q  101 aa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732652 aaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 5732751  T
Q  196 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  5732752 gttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaagg 5732850  T
Q  296 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  5732851 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 5732907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 18855619 - 18855956
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  18855619 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 18855716  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18855717 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 18855815  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  18855816 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccacaatcccaaggtg 18855914  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  18855915 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 18855956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 56146904 - 56146667
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  56146904 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 56146805  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146804 aacaccgagaagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 56146705  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaacc 237  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146704 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaacc 56146667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 24741839 - 24742121
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24741839 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacac 24741936  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag- 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  24741937 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 24742036  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24742037 aacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 7 - 286
Target Start/End: Original strand, 29760541 - 29760821
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  29760541 caacaacaacaaaacaaccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacacc 29760638  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-- 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  29760639 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 29760738  T
Q  204 actctagccttcaagctttacacatg-aacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaa 286  Q
    ||  |||||| ||||| ||||||| | |||||  | |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29760739 acaatagcctgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaa 29760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 282 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18712677 - 18712589
Alignment:
Q  282 cctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18712677 cctaaaacccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 18712589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 24742174 - 24742250
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24742174 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 24742250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28468647 - 28468542
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  28468647 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 28468549  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  28468548 gttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 29760874 - 29760951
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29760874 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 29760951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 31985752 - 31985635
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  31985752 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaag 31985655  T
Q  185 tgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  31985654 tgttacaaagggttacaaga 31985635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 10047379 - 10047476
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10047379 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 39245994 - 39246091
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39245994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 39246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36315326 - 36315230
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36315326 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36315230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36329535 - 36329439
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36329535 aagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36329439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16623390 - 16623293
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16623390 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16623293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396672
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaaga 5396672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 38152536 - 38152449
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152536 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796519
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3796519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 5269288 - 5269204
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269288 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777645
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 24333809 - 24333896
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333809 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  115 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16630773 - 16630680
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16630773 ttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16630680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 28468404 - 28468342
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||    
T  28468404 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccc 28468342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 5112466 - 5112523
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 347  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  5112466 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcacaacaaagacactcaa 5112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 3777778 - 3777838
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3777778 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3777838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5396539 - 5396479
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5396539 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5396479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16623161 - 16623101
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  16623161 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 16623101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 16628740 - 16628680
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  16628740 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 16628680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774305
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa-aggttacaaga 204  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaaga 39774305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 54867184 - 54867269
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867184 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5269066 - 5269008
Alignment:
Q  290 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5269066 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5269008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 6743283 - 6743226
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 347  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  6743283 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcgctacaaagacactcaa 6743226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 25861898 - 25861841
Alignment:
Q  291 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  25861898 caaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 25861841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35254 - 34885
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35254 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaa 35156  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  35155 aacaccgagaagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttag 35056  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35055 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 34956  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  34955 tacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 34885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22173387 - 22173018
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  22173387 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaa 22173289  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173288 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 22173189  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  22173188 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 22173089  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22173088 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctactttgcta 22173018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 18656324 - 18656677
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||  |||||||||| || |||| | ||||||||    
T  18656324 ccaagctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaa 18656421  T
Q  101 aa----caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||    ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656422 aaaaaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 18656521  T
Q  196 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  18656522 gttacaagactctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaagg 18656620  T
Q  296 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  18656621 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 18656677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 7167143 - 7167425
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  7167143 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacacc 7167241  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-- 203  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  7167242 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaa 7167341  T
Q  204 actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  7167342 acaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7167425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28504053 - 28503780
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||          ||||||||||||||||||    
T  28504053 caacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaaga----------aaggaagaacaaaacacc 28503964  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--a 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  28503963 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaa 28503864  T
Q  205 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28503863 ctctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28503780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2677280 - 2676939
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||    
T  2677280 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaac 2677183  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2677182 aaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2677084  T
Q  197 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2677083 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaagg 2676985  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2676984 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2676939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2673124 - 2672783
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||    
T  2673124 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaac 2673027  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2673026 aaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2672928  T
Q  197 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2672927 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaatcccaagg 2672829  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2672828 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 2672783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 24968000 - 24968340
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  24968000 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac 24968096  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  24968097 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 24968195  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    
T  24968196 ttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgaga-tctaccctttggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaagg 24968294  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24968295 tgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24968340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 8739224 - 8738982
Alignment:
Q  43 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739224 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 8739127  T
Q  143 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaacctt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  8739126 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 8739028  T
Q  240 agattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 285  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  8739027 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 8738982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 43 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 9091462 - 9091220
Alignment:
Q  43 aaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091462 aaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 9091365  T
Q  143 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaacctt 239  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| || |    
T  9091364 aatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccct 9091266  T
Q  240 agattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccta 285  Q
    ||||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  9091265 agattctacccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 9091220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 2671790 - 2671502
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  2671790 ccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 2671693  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2671692 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 2671593  T
Q  199 acaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||||  ||  |||  | ||||| ||||||| || ||| || |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2671592 acaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2671502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 8512108 - 8512450
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-cgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||  ||||||| | ||  |||    
T  8512108 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaa 8512204  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  8512205 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 8512304  T
Q  196 gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 294  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||    
T  8512305 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 8512403  T
Q  295 gtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8512404 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8512450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 8516988 - 8517330
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-cgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||| ||||| |||||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||  ||||||| | ||  |||    
T  8516988 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaa-gcata--caagataaaacgataaacgaaaacgaa 8517084  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  8517085 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 8517184  T
Q  196 gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaag 294  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||    
T  8517185 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaag 8517283  T
Q  295 gtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8517284 gtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 8517330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 50 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 40372949 - 40372712
Alignment:
Q  50 cacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 149  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40372949 cacatagagataacaaagca-aaacaagataagcaagata-ggaagaacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 40372852  T
Q  150 gggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattcta 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| |||||| || |||||||||    
T  40372851 gggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattcta 40372753  T
Q  248 ccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||| |  || ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  40372752 cccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaa 40372712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 8477263 - 8477545
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaac-agccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||  |||| |   |||||||  |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  8477263 caacaacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccaca--aagataatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 8477357  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  8477358 ccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 8477457  T
Q  204 --actctagccttcaagctttacac-atgaacaaaccttagattctaccctttggtattt-tcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
      ||  |||| | ||||| |||||| || |||||  | |||||||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8477458 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattctaccctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaa 8477545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 32475387 - 32475717
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  32475387 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 32475482  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |    
T  32475483 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaat 32475581  T
Q  207 ctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  32475582 ctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaa 32475680  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  32475681 tgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 32480245 - 32480575
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  32480245 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 32480340  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 206  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |    
T  32480341 accaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaat 32480439  T
Q  207 ctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  32480440 ctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaa 32480538  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  32480539 tgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 32480575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 153 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501613
Alignment:
Q  153 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccc 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  251 tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 26928687 - 26928507
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--act 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||  |      
T  26928687 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 26928588  T
Q  207 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  26928587 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 26928507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Original strand, 32143299 - 32143501
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 184  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  32143299 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 32143397  T
Q  185 tgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccc 283  Q
    ||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| ||||||||| || |||||||||    
T  32143398 tgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccc 32143496  T
Q  284 taaaa 288  Q
    |||||    
T  32143497 taaaa 32143501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Original strand, 1305927 - 1306128
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||    
T  1305927 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagt 1306025  T
Q  186 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 284  Q
    |||||||| ||||||||| |   |||  | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  1306026 gttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccct 1306124  T
Q  285 aaaa 288  Q
    ||||    
T  1306125 aaaa 1306128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2671449 - 2671373
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2671449 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 2671373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 8477598 - 8477674
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8477598 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 8477674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8738926 - 8738850
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738926 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaacccattggttccctcct 8738850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 40372659 - 40372583
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40372659 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 40372583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 7167478 - 7167555
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7167478 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcct 7167555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9091164 - 9091088
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9091164 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 9091088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 158
Target Start/End: Original strand, 10207826 - 10207983
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| |||||||| | || ||| |||  ||||    
T  10207826 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaac 10207923  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 158  Q
    ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207924 aaa-caccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28501560 - 28501483
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-attggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  28501560 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttccctcct 28501483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 28503727 - 28503650
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-attggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  28503727 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttggttccctcct 28503650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370477
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8370477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974943
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 27974943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18552970 - 18552873
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18552970 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18552873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 288
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453138
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 206  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 27453057  T
Q  207 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||  |||||||| || || ||| ||||||||| || ||||||||||||||    
T  27453058 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 27453138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264446
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 16264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 21711223 - 21711319
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  21711223 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029190
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 36029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736295
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 1736295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709780
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 30709780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3716089 - 3715992
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3716089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3715992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40592869 - 40592772
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40592869 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40592772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 48438214 - 48438311
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48438214 aagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 48438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6794800 - 6794704
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6794800 aagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 6794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795878
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaaga 25795878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 26298988 - 26299085
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26298988 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 26299085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1417577 - 1417493
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417577 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47923993 - 47923896
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  47923993 aagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaaga 47923896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 1306179 - 1306239
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 348  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  1306179 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 37466291 - 37466375
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466291 aagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 40844652 - 40844748
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40844652 aagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40844748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3328443 - 3328359
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328443 aagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 110 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386947
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 176  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24695251 - 24695154
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24695251 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 24695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 4386831 - 4386774
Alignment:
Q  291 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4386831 caaggtgattacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 4386774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 177  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 23392106 - 23392166
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23392106 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23392166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24695023 - 24694963
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24695023 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 24694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 26928456 - 26928396
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  26928456 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 26928396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 27986313 - 27986253
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  27986313 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 27986253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 36029322 - 36029382
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36029322 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36029382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 40592639 - 40592579
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  40592639 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 40592579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 131 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323693
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 3323693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Original strand, 21711454 - 21711511
Alignment:
Q  291 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  21711454 caaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 21711511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 350
Target Start/End: Original strand, 23410529 - 23410586
Alignment:
Q  291 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23410529 caaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23410586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 47923761 - 47923704
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 347  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  47923761 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagattctcactacaaagacactcaa 47923704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 58)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39812180 - 39811811
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  39812180 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaa 39812082  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812081 aacaccgagaagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 39811982  T
Q  201 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39811981 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 39811882  T
Q  301 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  39811881 acaatgtttttctcaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 39811811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 32246677 - 32247031
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagc---gataaaaggaagaa 97  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    | |||||||||||    
T  32246677 ccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacac-aagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaagaa 32246775  T
Q  98 caaaacaccg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 196  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246776 caaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 32246875  T
Q  197 ttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32246876 ttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggt 32246975  T
Q  297 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  32246976 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 32247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 44312816 - 44312563
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312816 ccaagcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 44312718  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312717 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 44312618  T
Q  201 aag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttg 254  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44312617 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 11099125 - 11098843
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  11099125 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag-gaagaaaggaagaacaaaacac 11099028  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag- 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  11099027 caagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaaga 11098928  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     ||  |||| | ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11098927 aacaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 19344313 - 19344655
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  19344313 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 19344409  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  19344410 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 19344509  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  19344510 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 19344608  T
Q  296 tgattacaa---tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19344609 tgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19344655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Original strand, 19349171 - 19349513
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||||||  ||||    
T  19349171 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaaggaaaagaac 19349267  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  19349268 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 19349367  T
Q  197 ttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||    
T  19349368 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaagg 19349466  T
Q  296 tgattacaa---tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19349467 tgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19349513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 14291381 - 14291669
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||    
T  14291381 ccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagataagcaagaaa-ggaagaaca 14291478  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  14291479 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 14291578  T
Q  199 acaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  14291579 acaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 14291669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 9296605 - 9296317
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||| | ||| |||||||||    
T  9296605 ccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca-aaacaagaaaagcaagaaa-ggaagaaca 9296508  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9296507 aaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggtt 9296408  T
Q  199 acaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||||  ||  |||||||||||| ||| ||| |||||| || |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  9296407 acaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 9296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 25398395 - 25398675
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  25398395 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 25398490  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25398491 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 25398590  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25398591 aaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25398675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 25403533 - 25403813
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  25403533 caacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaa-gagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 25403628  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25403629 ccaaaaagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 25403728  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25403729 aaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 288
Target Start/End: Original strand, 3491729 - 3491930
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  3491729 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 3491827  T
Q  186 gttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccct 284  Q
    |||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  3491828 gttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccct 3491926  T
Q  285 aaaa 288  Q
    ||||    
T  3491927 aaaa 3491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 11098790 - 11098714
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11098790 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 11098714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 8040060 - 8040147
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040060 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 192
Target Start/End: Original strand, 40738822 - 40738926
Alignment:
Q  88 aaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagt 185  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  40738822 aaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagt 40738919  T
Q  186 gttacaa 192  Q
    |||||||    
T  40738920 gttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9296265 - 9296189
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9296265 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 9296189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 14291722 - 14291798
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  14291722 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactatctacaaagacgctcaaccctttggttccctcct 14291798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569425
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 13569425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 21629944 - 21630040
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21629944 aagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 21630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259178
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 28259178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 288
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407802
Alignment:
Q  140 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaacc 237  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  238 ttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     ||| |||||||| || || |||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10445541 - 10445444
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  10445541 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10445444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 17865203 - 17865300
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17865203 aagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17865300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 20522220 - 20522317
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20522220 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaaga 20522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34682431 - 34682334
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  34682431 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34682334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388955
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34388955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 14699104 - 14699008
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14699104 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaaga 14699008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707252
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10707252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390150
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaaga 8390150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 25409860 - 25409922
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25409860 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 25409922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33528718 - 33528621
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33528718 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 39482931 - 39483028
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  39482931 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaaga 39483028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078471
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaaga 23078471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039670
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaaga 42039670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16940306 - 16940219
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940306 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17010971 - 17010884
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010971 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 3491981 - 3492043
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3491981 acccaaggtgtttacaatgttttttccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3492043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 194
Target Start/End: Original strand, 33118136 - 33118222
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  33118136 aagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaa 33118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757774
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaa 36757774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2838136 - 2838063
Alignment:
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2838136 aaacaccaagaa-attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatcca 2838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345574
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 131 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149306
Alignment:
Q  131 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaa 27149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36757630 - 36757570
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36757630 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36757570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 39483162 - 39483222
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  39483162 acccaaggtgtttacaatattt--cccaacccaagagatcctcacaacaaagacactcaaccc 39483222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 40739063 - 40739123
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  40739063 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 40739123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869705
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 2869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 348
Target Start/End: Original strand, 21630174 - 21630232
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 348  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  21630174 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 21630232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 288
Target Start/End: Original strand, 40738940 - 40739012
Alignment:
Q  215 caagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  40738940 caagctt-acacaagaacaagtcttagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 40739012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 170
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 310 - 350
Target Start/End: Original strand, 20522471 - 20522511
Alignment:
Q  310 ttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  20522471 ttcccaacccaagagatactcactacaaagacactcaaccc 20522511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23078339 - 23078278
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 351  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||    
T  23078339 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagattctcatcacaaagacactcaaccca 23078278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29867840 - 29867780
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 351  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  29867840 acccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaccctcaaccca 29867780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 41586419 - 41586358
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaa-tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41586419 acccaaggtgtttacaactgtttt--ccaacccaagagaagctctcaccaaagacactcaaccc 41586358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 7 - 370
Target Start/End: Original strand, 41398139 - 41398498
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaaca 104  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||    
T  41398139 caacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaaca 41398231  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398232 ccgagaagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 41398331  T
Q  205 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398332 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 41398431  T
Q  305 tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  41398432 tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 41398498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 8 - 370
Target Start/End: Original strand, 41390485 - 41390843
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa--ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacac 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||     
T  41390485 aacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaacat 41390577  T
Q  106 cgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagac 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390578 cgagaagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagac 41390677  T
Q  206 tctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaat 305  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390678 tctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaat 41390777  T
Q  306 gtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  41390778 gtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaatccatttggttccctcctttgcta 41390843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25445282 - 25444931
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  25445282 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 25445185  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445184 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 25445085  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25445084 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtg 25444986  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25444985 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 39445392 - 39445742
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  39445392 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 39445489  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  39445490 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggtt 39445588  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  39445589 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 39445687  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39445688 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 39445742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 44024065 - 44023716
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||  | |||| | ||||||||    
T  44024065 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaa 44023968  T
Q  101 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  44023967 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggtta 44023869  T
Q  200 caagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 298  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  44023868 caagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 44023770  T
Q  299 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  44023769 ttacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 44023716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 9 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 1055196 - 1054854
Alignment:
Q  9 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  1055196 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 1055099  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1055098 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggttacaagact 1055000  T
Q  207 ctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaat 305  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1054999 ctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaat 1054901  T
Q  306 gtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  1054900 gtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 1054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24787560 - 24787280
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  24787560 caacaacaa-aaaacagccctagacttatgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc 24787464  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--a 204  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |    
T  24787463 aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaa 24787364  T
Q  205 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |  |||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  24787363 caatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattctaccctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaa 24787280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 43988658 - 43988314
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag-cgataaaaggaa--gaa 97  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||| ||||| || ||| |||||  ||||||||  | || ||| |||  |||    
T  43988658 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaa 43988562  T
Q  98 caaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag- 195  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||     
T  43988561 caaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 43988462  T
Q  196 gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatg--aacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaaccca 292  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||| |  || ||||| |||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||  || ||||    
T  43988461 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatccca 43988363  T
Q  293 aggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  43988362 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 43988314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24202969 - 24202686
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||   |||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  24202969 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaa 24202876  T
Q  101 a-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  24202875 acacaccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggtt 24202776  T
Q  199 acaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24202775 acaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24202686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 214 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 25439875 - 25439738
Alignment:
Q  214 tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25439875 tcaagctttacacatgaacaaaccctagag-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcc 25439777  T
Q  314 caacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25439776 caacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25439738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19358975 - 19358760
Alignment:
Q  74 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19358975 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacatcaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19358877  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctc 270  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  19358876 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19358778  T
Q  271 acactatgaaccctaaaa 288  Q
     || ||||||||||||||    
T  19358777 tcaatatgaaccctaaaa 19358760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19361564 - 19361349
Alignment:
Q  74 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19361564 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19361466  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctc 270  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||  | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  19361465 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19361367  T
Q  271 acactatgaaccctaaaa 288  Q
     || ||||||||||||||    
T  19361366 tcaatatgaaccctaaaa 19361349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 74 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 19380204 - 19379989
Alignment:
Q  74 caagataagcgataaaaggaagaacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcc 172  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19380204 caagataagcaagaaaaggaagaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatcc 19380106  T
Q  173 aatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctc 270  Q
    | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||  | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||    
T  19380105 actatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctc 19380007  T
Q  271 acactatgaaccctaaaa 288  Q
     || ||||||||||||||    
T  19380006 tcaatatgaaccctaaaa 19379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 289 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787151
Alignment:
Q  289 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcct 24787151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644898
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 26644898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47704033 - 47703946
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704033 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 24202635 - 24202573
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24202635 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccc 24202573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073025
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19073025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120915
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19120915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16124613 - 16124516
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16124613 aagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 27104469 - 27104372
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27104469 aagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 27104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281804
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 9476261 - 9476348
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476261 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 13598398 - 13598485
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598398 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 29651811 - 29651898
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651811 aagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 202
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 202  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 775672 - 775759
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775672 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21536702 - 21536570
Alignment:
Q  75 aagataagcgataaaaggaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 171  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |  || | || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21536702 aagataagcgatgaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatc 21536604  T
Q  172 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    || ||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  21536603 cactataatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21536570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604624
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 13604624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 47098921 - 47098837
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098921 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19366174 - 19366112
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19366174 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19366112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 32889439 - 32889523
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32889439 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19361298 - 19361237
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19361298 acccaaggtgtttacaatgtttt-cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 19361237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102874
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47098693 - 47098633
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47098693 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcgctacaaagacactcaaccc 47098633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 47102707 - 47102647
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47102707 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 47102647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Original strand, 3281936 - 3281995
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 349  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  3281936 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 3281995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 19358709 - 19358648
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    
T  19358709 acccaaggtgtttacaatgtttt-cccaacccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccc 19358648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 349
Target Start/End: Original strand, 37069998 - 37070055
Alignment:
Q  290 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 349  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  37069998 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 37070055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Original strand, 12396804 - 12397173
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  12396804 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaa 12396902  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396903 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 12397002  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12397003 aagaactctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgat 12397102  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12397103 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 12397173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 1 - 362
Target Start/End: Original strand, 12406224 - 12406585
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  12406224 ccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaa 12406322  T
Q  101 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406323 aacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 12406422  T
Q  201 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  12406423 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagccaaggtgat 12406522  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctc 362  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406523 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctc 12406585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 300; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31109775 - 31109406
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  31109775 ccaagccaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaa 31109678  T
Q  101 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109677 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 31109578  T
Q  200 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 299  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109577 caagactctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 31109478  T
Q  300 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat-tggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  31109477 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgcta 31109406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 1 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24024520 - 24024150
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  24024520 ccaagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaa 24024422  T
Q  101 aa-caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24024421 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgtt 24024322  T
Q  199 acaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtga 298  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  24024321 acaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaacccacggtga 24024222  T
Q  299 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctatgcta 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24024221 ttacaatgtttttccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgcta 24024150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 9 - 339
Target Start/End: Original strand, 19992213 - 19992544
Alignment:
Q  9 acaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  19992213 acaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaaaacaccg 19992310  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 206  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19992311 agcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagact 19992410  T
Q  207 ctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaat 305  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19992411 ctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaat 19992509  T
Q  306 gttttt-cccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||| || |||||    
T  19992510 gtttttccccaacctaagaaacactcacatcaaag 19992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 21812431 - 21812092
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || |||||| || |||||    
T  21812431 ccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaaca 21812334  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  21812333 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aagtcttacaaaaggtt 21812235  T
Q  199 acaagactctagcct-tc-aagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 296  Q
     |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  21812234 ccaagactctagcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccataatcccaaggt 21812136  T
Q  297 gattacaatgttttt-cccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21812135 gattacaatgtttttccccaacctaagaaacactctcatcaaag 21812092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 20357751 - 20357463
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| | |||||||||||||    
T  20357751 ccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaaca 20357654  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20357653 aaataccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggtta 20357554  T
Q  200 caag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    ||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||| |  || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20357553 caagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 20357463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 4866622 - 4866820
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaa-ccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4866622 ccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaaca 4866720  T
Q  100 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866721 aaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 2057852 - 2058147
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaa----caagataagcgataaaaggaag 95  Q
    |||||| ||||||||||||| | |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||| |||||||||||    
T  2057852 ccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctagacttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaag 2057951  T
Q  96 aacaaaacaccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  2057952 aacaaaacaccaagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaag 2058051  T
Q  195 ggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccc-tttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||| | || | ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  2058052 ggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2058147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24266385 - 24266054
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||||||||||     
T  24266385 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacacca 24266290  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagac 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  24266289 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24266190  T
Q  206 tctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  24266189 tctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaa 24266091  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24266090 tgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24266054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 24261506 - 24261175
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  24261506 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 24261411  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagac 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  24261410 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 24261311  T
Q  206 tctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  24261310 tctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaa 24261212  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  24261211 tgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 24261175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 16884831 - 16885162
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  16884831 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 16884926  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |    
T  16884927 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaat 16885026  T
Q  207 ctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  16885027 ctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaa 16885125  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  16885126 tgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 16885162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Original strand, 16879975 - 16880306
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  16879975 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 16880070  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagact 206  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |    
T  16880071 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaat 16880170  T
Q  207 ctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggt-attttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    ||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  16880171 ctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaa 16880269  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  |||| |||||| ||||  |||||||| |||||    
T  16880270 tgttgtttttccaacctaagattcactctcatcaaag 16880306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 1533640 - 1533359
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaac-agccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||  ||||||   |||||||  ||||| |||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  1533640 caacaacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccaca--aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 1533546  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  1533545 ccaataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 1533446  T
Q  204 --actctagccttcaagctttacacatg-aacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
      ||  |||| | ||||| ||||||| | |||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1533445 aaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattctaccctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccctaaaa 1533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 21639710 - 21639988
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  21639710 caacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 21639803  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  21639804 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagggttacaag 21639903  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21639904 aaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21639988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 21645908 - 21646186
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||   |||||   |||| ||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |||    
T  21645908 caacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaaaca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacaca 21646001  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||    
T  21646002 ccaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaagggttacaag 21646101  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | |||||||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21646102 aaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21646186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Original strand, 18408666 - 18408943
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa-cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-aca 104  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||||  || | |||| ||||||  |||||||||||| | ||| | ||||||||| |||    
T  18408666 caacaacaacaaaaacagccgtagtctagtgtagagcaacaccaca--aacaaatac-aaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacaca 18408759  T
Q  105 ccgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag 203  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18408760 ccaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgttacaaagggttacaag 18408858  T
Q  204 -actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
     |   || | | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18408859 aaaaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18408943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 288
Target Start/End: Original strand, 18413641 - 18413819
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  18413641 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 18413739  T
Q  208 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    |||  | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18413740 tagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18413819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 290 - 364
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873384
Alignment:
Q  290 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 4873384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20357410 - 20357334
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20357410 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcct 20357334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1533307 - 1533231
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1533307 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 1533231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 288 - 364
Target Start/End: Original strand, 2058202 - 2058278
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2058202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 2058278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 29159803 - 29159900
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29159803 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 29159900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 46516407 - 46516310
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46516407 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 46516310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 49091661 - 49091758
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49091661 aagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 49091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848685
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 44848685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2647793 - 2647696
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2647793 aagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 2647696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33332547 - 33332450
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  33332547 aagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9190105 - 9190021
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190105 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 20284089 - 20284173
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284089 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 21640039 - 21640101
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21640039 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21640101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 21646237 - 21646299
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21646237 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 55948 - 56044
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  55948 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 56044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 2580390 - 2580474
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  2580390 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 2580474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 18408993 - 18409055
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18408993 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18409055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 35960816 - 35960901
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960816 aagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9185262 - 9185178
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185262 aagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 18413869 - 18413931
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  18413869 acccaaggtgtttacattgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 18413931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 110 - 189
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 189  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 193
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4796764 - 4796667
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4796764 aagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 4796667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 113 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 194
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Original strand, 20284318 - 20284378
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  20284318 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 20284378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23402881 - 23402821
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23402881 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23402821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 288 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4796536 - 4796477
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 349  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  4796536 acccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 4796477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 44847991 - 44847933
Alignment:
Q  290 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  44847991 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 44847933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 5817366 - 5817303
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817366 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatcca 5817303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 110 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 157  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 347
Target Start/End: Original strand, 21989137 - 21989194
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 347  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  21989137 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaa 21989194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 8 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 9825 - 9514
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacaccg 107  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  9825 aacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaa-gagctaacaa-gcataaacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaaacaccg 9729  T
Q  108 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9728 agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactc 9629  T
Q  208 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9628 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt 9530  T
Q  308 ttttcccaacccaaga 323  Q
    ||||||||||| ||||    
T  9529 ttttcccaacctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3671
Alignment:
Q  196 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 3747  T
Q  296 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctatgcta 370  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3746 tgattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgcta 3671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 72 - 1
Alignment:
Q  8 aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagc 83  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||   ||| || | |||||||||||||||||||    
T  72 aacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaac-aagcataaacaagataagc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 352
Target Start/End: Original strand, 255 - 605
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa-gaaca 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  255 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 352  T
Q  100 aaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 198  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  353 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaaggtt 451  T
Q  199 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 297  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  452 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaa-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 550  T
Q  298 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 352  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  551 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 2443 - 2103
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||    
T  2443 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaac 2347  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  2346 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2248  T
Q  197 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||    
T  2247 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagg 2149  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2148 tgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 149148 - 148808
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||| | ||  ||||    
T  149148 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaggaaaacgaac 149052  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |    
T  149051 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 148953  T
Q  197 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||    
T  148952 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagg 148854  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  148853 tgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 148808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 19357 - 19017
Alignment:
Q  1 ccaagccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaac 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||    
T  19357 ccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaac 19261  T
Q  99 aaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-g 196  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| |    
T  19260 aaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagag 19162  T
Q  197 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 295  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  ||  ||||||    
T  19161 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-tctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataattccaagg 19063  T
Q  296 tgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19062 tgattacaatgttgttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 7e-71
Query Start/End: Original strand, 10 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 14492 - 14161
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  14492 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 14397  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagac 205  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||     
T  14396 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 14297  T
Q  206 tctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 304  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  ||||| ||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  14296 tctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaa 14198  T
Q  305 tgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    |||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14197 tgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 18148 - 17869
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa--cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-ac 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||   |||||||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| ||    
T  18148 caacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-ggaagaacaaacac 18055  T
Q  104 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18054 accaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 17955  T
Q  203 g-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    | |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  17954 gaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 7 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 24241 - 23962
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaa--cagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaa-ac 103  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||   ||||| |  |||||||||||  | ||| ||||||||||| ||    
T  24241 caacaacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca---agagaatacaaagaa--aacaagataagaaagaaa-ggaagaacaaacac 24148  T
Q  104 accgagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 202  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  24147 accaaaaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaa 24048  T
Q  203 g-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccttagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaa 288  Q
    | |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  24047 gaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17756
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  17818 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 17756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 23911 - 23849
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23911 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 10 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 182147 - 181980
Alignment:
Q  10 caacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaa--gaacaaaacaccg 107  Q
    ||||||||||||||||  || ||| |||| |||||| |||||| ||||| || ||| |||||  |||||||| ||||||||| ||  ||||||||||||     
T  182147 caacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaa-gcata--caagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacacca 182052  T
Q  108 ag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 178  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182051 agcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 245 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 176925 - 176829
Alignment:
Q  245 ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 339  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  176925 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 176829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 7 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 432 - 300
Alignment:
Q  7 caacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaacacc 106  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  432 caacaacaa-aaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccacacaaagagataataaagca-aaacaagataagctagaaa-gaaagaacaaaacacc 336  T
Q  107 gagaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 142  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  335 aagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8420
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 8285 - 8225
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  8285 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 111 - 204
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85779
Alignment:
Q  111 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 85779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43962
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36965 - 36833
Alignment:
Q  75 aagataagcgataaaaggaag-aacaaa-acaccgagaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatc 171  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| |    
T  36965 aagataagcaataaaagaaaggaacaaacacaccaa-aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacc 36867  T
Q  172 caatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    || ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36866 cactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 36700 - 36640
Alignment:
Q  288 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 350  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36700 acccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 5683 - 5770
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5683 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 195
Target Start/End: Original strand, 2492 - 2579
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 195  Q
    |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2492 aagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133281
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 204  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 133281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 10729 - 10826
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  10729 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 110 - 192
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  110 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 192  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17360
Alignment:
Q  113 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 204  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 173
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  140 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 114 - 173
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  114 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 173  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University