View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0953_high_50 (Length: 332)

Name: NF0953_high_50
Description: NF0953
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0953_high_50
NF0953_high_50
[»] scaffold0349 (3 HSPs)
scaffold0349 (56-322)||(14513-14777)
scaffold0349 (56-321)||(3580-3844)
scaffold0349 (159-322)||(8062-8225)
[»] chr6 (65 HSPs)
chr6 (56-322)||(27698652-27698916)
chr6 (56-322)||(27718537-27718803)
chr6 (56-322)||(28786041-28786307)
chr6 (56-321)||(27725003-27725267)
chr6 (56-300)||(28792184-28792428)
chr6 (56-302)||(27611160-27611406)
chr6 (56-322)||(28780902-28781168)
chr6 (56-315)||(27229004-27229261)
chr6 (56-322)||(26802201-26802471)
chr6 (56-322)||(26655752-26656018)
chr6 (56-322)||(26761723-26761989)
chr6 (59-322)||(27604866-27605135)
chr6 (56-203)||(27531355-27531502)
chr6 (56-322)||(27338223-27338482)
chr6 (56-322)||(27398963-27399222)
chr6 (56-287)||(27678744-27678975)
chr6 (56-295)||(31284078-31284317)
chr6 (56-253)||(27593178-27593375)
chr6 (56-219)||(26884029-26884192)
chr6 (65-305)||(26823626-26823860)
chr6 (56-256)||(26622805-26623005)
chr6 (56-256)||(26728783-26728983)
chr6 (56-287)||(27706560-27706791)
chr6 (56-253)||(27677772-27677969)
chr6 (64-255)||(26861446-26861637)
chr6 (56-230)||(26646334-26646508)
chr6 (56-230)||(26752302-26752476)
chr6 (87-303)||(27427792-27428006)
chr6 (56-191)||(25481636-25481771)
chr6 (56-191)||(25579613-25579748)
chr6 (56-191)||(26055820-26055955)
chr6 (56-191)||(26075790-26075925)
chr6 (56-191)||(26142759-26142894)
chr6 (60-191)||(26048739-26048870)
chr6 (60-191)||(26069908-26070039)
chr6 (56-191)||(25538434-25538569)
chr6 (56-211)||(28234438-28234593)
chr6 (226-306)||(26055738-26055818)
chr6 (227-306)||(25481554-25481633)
chr6 (227-302)||(25538356-25538431)
chr6 (227-306)||(26048657-26048736)
chr6 (227-306)||(26069826-26069905)
chr6 (227-306)||(26075708-26075787)
chr6 (227-306)||(26142677-26142756)
chr6 (62-190)||(27214312-27214440)
chr6 (62-190)||(27234788-27234916)
chr6 (60-154)||(29825958-29826052)
chr6 (60-219)||(28325347-28325506)
chr6 (60-190)||(25071554-25071684)
chr6 (227-306)||(25579529-25579610)
chr6 (60-190)||(26635585-26635715)
chr6 (60-190)||(26741551-26741681)
chr6 (60-142)||(26848603-26848685)
chr6 (60-181)||(26959069-26959190)
chr6 (60-139)||(27665279-27665358)
chr6 (60-142)||(26617269-26617351)
chr6 (60-142)||(26723197-26723279)
chr6 (60-141)||(26811453-26811534)
chr6 (125-238)||(28098596-28098709)
chr6 (56-229)||(28185222-28185395)
chr6 (181-248)||(26018770-26018837)
chr6 (181-248)||(26139474-26139541)
chr6 (60-155)||(26949591-26949686)
chr6 (56-229)||(28180970-28181143)
chr6 (147-219)||(26342183-26342255)
[»] scaffold0277 (2 HSPs)
scaffold0277 (57-300)||(4830-5073)
scaffold0277 (56-322)||(13790-14056)
[»] scaffold1254 (1 HSPs)
scaffold1254 (56-322)||(75-334)
[»] scaffold0419 (1 HSPs)
scaffold0419 (56-322)||(7295-7554)
[»] chr4 (8 HSPs)
chr4 (56-298)||(18699545-18699787)
chr4 (56-298)||(18655622-18655864)
chr4 (56-298)||(18679712-18679954)
chr4 (56-298)||(18731649-18731891)
chr4 (56-258)||(18724230-18724432)
chr4 (87-303)||(17989226-17989440)
chr4 (87-303)||(18073549-18073763)
chr4 (91-181)||(5091147-5091237)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (60-282)||(28164511-28164733)
chr1 (93-279)||(28127862-28128042)
chr1 (56-258)||(268502-268704)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (87-303)||(59357-59571)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (64-247)||(29273936-29274119)
chr8 (56-208)||(31903728-31903880)
[»] scaffold0038 (2 HSPs)
scaffold0038 (56-211)||(34599-34754)
scaffold0038 (60-219)||(116662-116821)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (56-211)||(58440-58595)
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (60-252)||(17993846-17994038)
chr2 (9-61)||(35967227-35967279)
chr2 (135-181)||(3279592-3279638)
[»] scaffold0713 (1 HSPs)
scaffold0713 (181-248)||(5915-5982)
[»] chr5 (1 HSPs)
chr5 (56-122)||(16688974-16689040)


Alignment Details
Target: scaffold0349 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 14513 - 14777
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14513 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 14612  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14613 tgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattg 14712  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14713 agagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaa-ttttgtgttctgtg 14777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #2
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 321
Target Start/End: Original strand, 3580 - 3844
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3580 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 3679  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  3680 tgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattg 3779  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgt 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  3780 agagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 3844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 159 - 322
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8225
Alignment:
Q  159 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgaga 258  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8062 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattgaga 8161  T
Q  259 gaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8162 gaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 8225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 65)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 27698652 - 27698916
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27698652 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 27698751  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27698752 tgccgagtgtcagtgcccctaaaactgatgaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattg 27698851  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27698852 agagaaataggatg-aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaa-ttttgtgttctgtg 27698916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 27718537 - 27718803
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  27718537 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaactg 27718636  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  27718637 tgccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatgggagaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattg 27718736  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27718737 agagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtgaatttttgtgttctgtg 27718803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28786307 - 28786041
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28786307 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 28786208  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28786207 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 28786108  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  28786107 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28786041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 321
Target Start/End: Original strand, 27725003 - 27725267
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27725003 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 27725102  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||    
T  27725103 tgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgacaattg 27725202  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgt 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  27725203 agagaaataggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatg-gtaaatttttgtggtctgt 27725267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 56 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28792428 - 28792184
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28792428 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 28792329  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28792328 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 28792229  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28792228 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 28792184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 56 - 302
Target Start/End: Original strand, 27611160 - 27611406
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27611160 tgatggtgtgatttcatctcctcttggaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 27611259  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||| | |||| |||||||| | |||||    
T  27611260 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaagaagaggaagctaattgcatagccatgaaaattg 27611359  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27611360 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 27611406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 28781168 - 28780902
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  28781168 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 28781069  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  28781068 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattg 28780969  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  28780968 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 28780902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 56 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 27229261 - 27229004
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27229261 tgatggtgtgatttcgtctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 27229162  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  27229161 tgccgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatccaaaggaaaatgaagaggaagaggaaggtgattgtatagccatgagacttg 27229062  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtg 315  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  27229061 agagaaattggatg--aaaagagttttagaatgcagaatatgaatgagtatgtttttgtg 27229004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26802471 - 26802201
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  26802471 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcaataagagccttgtagagattgcccgtaaaaccg 26802372  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || || |||||||| | |||||    
T  26802371 taccgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataagaaaatgaagaggatgaggaaggagactgcatagccatgaaaattg 26802272  T
Q  256 agagaaattggatgaa----aaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
     |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26802271 tgagaaattggatgaaaaaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26802201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26656018 - 26655752
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26656018 tgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 26655919  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26655918 tgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattg 26655819  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26655818 agagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26655752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 26761989 - 26761723
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26761989 tgatggtgtgatttcatctcctctgagaagatcattgtcatcaatgaaagtatggattcccttatcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 26761890  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26761889 tgccgggtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtatttaaacccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccatgagaattg 26761790  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26761789 agagaaaatggatgaaaaaagagtttgggaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 26761723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 59 - 322
Target Start/End: Original strand, 27604866 - 27605135
Alignment:
Q  59 tggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtgg 158  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||      
T  27604866 tggtgtgatttcatctcctcttcgaagatcattttcatcaatgaaggtatgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccgtat 27604965  T
Q  159 cgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaa------gtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaa 252  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||    
T  27604966 cgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcataggaaaatgaagaggatgaggatgaggaaggtaattgcatagccatgagaa 27605065  T
Q  253 ttgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27605066 ttgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27605135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 56 - 203
Target Start/End: Original strand, 27531355 - 27531502
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27531355 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatagattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccg 27531454  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 203  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27531455 tggcgagtgtccgcgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaat 27531502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 27338223 - 27338482
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27338223 tgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 27338322  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  27338323 taaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattg 27338422  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27338423 agagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27338482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 27398963 - 27399222
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  27398963 tgatggtgtgctttcatctcctctttcaagatcgttgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcaataagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 27399062  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |   |||||||| || ||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  27399063 taaagagtgtcaatgtccctaaaactgaggaacacatggtatttgaacccagaggaaattgaagaggaagaggaaagtgattgcatagccatgagaattg 27399162  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    ||||||||  |||||||||| ||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27399163 agagaaataagatgaaaaaaaagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 27399222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 56 - 287
Target Start/End: Complemental strand, 27678975 - 27678744
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  27678975 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagaccattcttatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattcccggtgaaaccg 27678876  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| ||     
T  27678875 taccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagatttt 27678776  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaat 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27678775 agagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27678744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 56 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 31284317 - 31284078
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||     
T  31284317 tgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcactatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaacca 31284218  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||| |||||||| ||| |||    
T  31284217 taccgagtgtcacttcccctgaaactaaggaatacttggtatttgaatacataggaaattgaagaggaagaggaagatgattgcatagccatgagatttg 31284118  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaata 295  Q
    ||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31284117 agagaatatggatgaagaaagaatttgagaatgcagaata 31284078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 56 - 253
Target Start/End: Original strand, 27593178 - 27593375
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  27593178 tgatggtgtgatttcatttcctctttgaagaccattgtcatcaatgaaggtgttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtgaaaccg 27593277  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaat 253  Q
    |  ||||||||| | || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27593278 taccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtaatcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27593375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 56 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 26884192 - 26884029
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  || |||||     
T  26884192 tgatggtgtgatttcgcttcctcttggaagatgattatcatcaatgaaggtgtggattcccttgttagtaagagccttgtagagatttccagtgaaacca 26884093  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 219  Q
    |  ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26884092 taccgagtgtcacttcctctgaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 26884029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 65 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 26823860 - 26823626
Alignment:
Q  65 gatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtg 164  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||   |||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||  | |  ||||||    
T  26823860 gattttatcccctctttgaagttcacgatcatcaaaaaaggtgtggattcccttgtctgtaagagccttgtagagattgccggtaaattcataccgagtg 26823761  T
Q  165 tcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaatt 264  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||| |||| |||||      |||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  26823760 tcagcgcctctaaaactgagaaacacttggtatttgaaatcatatgaaactgaag------aggaagttgactgcatagccatgagaattgagagaaatt 26823667  T
Q  265 ggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagta 305  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26823666 ggacgaagaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagta 26823626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26623005 - 26622805
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  26623005 tgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccg 26622906  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  26622905 taccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattg 26622806  T
Q  256 a 256  Q
    |    
T  26622805 a 26622805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 56 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 26728983 - 26728783
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| ||||||| || ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||    
T  26728983 tgatggtttgatttcgtcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccagtgaaaccg 26728884  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||  |||||  |||||||| ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||    
T  26728883 taccgagtgtcactgcctctgaaacttaggaacacttggtatttgaattgataggaaattgaagaggaagaggatggtgattgcatagccatgataattg 26728784  T
Q  256 a 256  Q
    |    
T  26728783 a 26728783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 56 - 287
Target Start/End: Original strand, 27706560 - 27706791
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |  || ||||||    
T  27706560 tgatggtgtgatttcatcccttctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaaaagccttgtagagattgcctgtgaaaccg 27706659  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  |||||||||   || || ||||||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||| ||| ||     
T  27706660 taccgagtgtcacctcctctgaaactgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagagaaaggtgattgcatagccatgagatttt 27706759  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaat 287  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27706760 agagaaattagatgaaaaaagagtttgagaat 27706791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 56 - 253
Target Start/End: Original strand, 27677772 - 27677969
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||    
T  27677772 tgatggtgtgatttcatcccctctttgaagttcatgattgtcaatgaaggtgtggattcccttgtcatcaagagccttgtagagattgccggtgaaaccg 27677871  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaat 253  Q
    |  ||||||||| | || || ||| ||||||| ||||||||  || |  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  27677872 taccgagtgtcacttcctctgaaattgaggaatacttggtatttgtactcataggaaattgaagtggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaat 27677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 64 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 26861637 - 26861446
Alignment:
Q  64 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagt 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |  |||||    
T  26861637 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatccatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagattaccggtaaaaccataccgagt 26861538  T
Q  164 gtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |||| | || || ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||    
T  26861537 gtcacttcctctgaaactgaggaatacctggtatttgaatccataggaaatggaagaggaagagcaaggtgattgcatagccatcagaattg 26861446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26646508 - 26646334
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  26646508 tgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccg 26646409  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaa 230  Q
    |  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||    
T  26646408 tcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaa 26646334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 56 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 26752476 - 26752302
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||   |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  26752476 tgatggtgtgatttcatctcctctcttaagatcacaatcatcaatgaaggtgtgaattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgtccagtaaaaccg 26752377  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaa 230  Q
    |  ||||||||| ||||||| ||  ||||||| || ||||| |||||||| ||||||| | ||| ||| ||||||    
T  26752376 tcacgagtgtcactgcccctgaagttgaggaagacctggtaggtgaatccgtaggaaattaaagaggaagaggaa 26752302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Original strand, 27427792 - 27428006
Alignment:
Q  87 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 186  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  27427792 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 27427891  T
Q  187 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 286  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  27427892 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 27427989  T
Q  287 tgcagaatatgaatgag 303  Q
    |||||||||||||||||    
T  27427990 tgcagaatatgaatgag 27428006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25481771 - 25481636
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  |    
T  25481771 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattg 25481672  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  25481671 ttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 25481636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25579748 - 25579613
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  |    
T  25579748 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattatcatcaaagaaggtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaagtg 25579649  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    | |||||||||| |||| || |||||||||||||||    
T  25579648 ttgcgagtgtcactgcctctgaaactgaggaacact 25579613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26055955 - 26055820
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  |    
T  26055955 tgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattg 26055856  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26055855 ttgcgagtgtcactgcccctgaaaatgaggaacact 26055820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26075925 - 26075790
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | |||||||  |    
T  26075925 tgatgatgtgatttcatctcctctttgaagatcattttcatcaatgaaagtattaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaaattg 26075826  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    | |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||    
T  26075825 ttgcgagtgtcactgcccctgaaattgaggaacact 26075790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26142894 - 26142759
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||   |    
T  26142894 tgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacgaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttg 26142795  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26142794 ttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26142759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26048870 - 26048739
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||||  || ||    
T  26048870 ggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgc 26048771  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26048770 gagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26048739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 60 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 26070039 - 26069908
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||| | |||||||| |||||||| | |||||||  || ||    
T  26070039 ggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatcaatgaaagtacaaattcccttgtcaatgagagccttatagagattaccggtaaaattgttgc 26069940  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  26069939 gagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 26069908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 25538569 - 25538434
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||   ||||||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||   |    
T  25538569 tgatggtgtgatttcatctcctctttcaagatcattatcatctatgaaagtactaattcccttgtcaacaagagccttatagagattaccggtaaatttg 25538470  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacact 191  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25538469 ttgcgagtgtcactgcccctgaaactgaggaacact 25538434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 28234593 - 28234438
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||  |||||||||     
T  28234593 tgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaacca 28234494  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 211  Q
    | |||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  28234493 tagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 28234438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 226 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26055818 - 26055738
Alignment:
Q  226 aggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 306  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26055818 aggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26055738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25481633 - 25481554
Alignment:
Q  227 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25481633 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 25481554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 25538431 - 25538356
Alignment:
Q  227 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatga 302  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||    
T  25538431 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatga 25538356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26048736 - 26048657
Alignment:
Q  227 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26048736 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26048657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26069905 - 26069826
Alignment:
Q  227 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26069905 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26069826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26075787 - 26075708
Alignment:
Q  227 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26075787 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26075708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26142756 - 26142677
Alignment:
Q  227 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  26142756 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatatggatgaaaaaagactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 26142677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 27214440 - 27214312
Alignment:
Q  62 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcga 161  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| | ||| |||||||| |||    
T  27214440 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27214341  T
Q  162 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 190  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27214340 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27214312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 62 - 190
Target Start/End: Original strand, 27234788 - 27234916
Alignment:
Q  62 tgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcga 161  Q
    ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||| | ||| |||||||| |||    
T  27234788 tgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagattaccggtgaaaccgtgtcga 27234887  T
Q  162 gtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 190  Q
    ||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  27234888 gtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 27234916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 29826052 - 29825958
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaacc 154  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||  | |||  ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  29826052 ggtgtgatttcgtcccctctttgaagctctttgtcatcaatgaaggtgcgaattttcttgtcagttagagctttgtagagattgccggtaaaacc 29825958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 28325506 - 28325347
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | |||||||||||||  |||||||| |  |    
T  28325506 ggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataac 28325407  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 219  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  28325406 gagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaag 28325347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 25071684 - 25071554
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    ||||||||||| || ||||| | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||| || || ||||| | ||||||||||   |    
T  25071684 ggtgtgatttcgtcacctctcttaagctctttgtcatcaataaaggtgtggattcctttgtcagaaagagctttataaagattaccggtaaaaccgaatc 25071585  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 190  Q
    ||||||| || ||||| ||||| | ||||||    
T  25071584 gagtgtcggtacccctgaaactaatgaacac 25071554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 227 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25579610 - 25579529
Alignment:
Q  227 ggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatga--aaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaa 306  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||  ||||| | ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  25579610 ggaaggtgattgcatagccatgagaattgaaagaatttggatgaataaaaaaactttgaaaatggagaatatgaatgagtaa 25579529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26635715 - 26635585
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || | ||| ||||||        
T  26635715 ggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaaccgaatt 26635616  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 190  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26635615 gagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26635585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26741681 - 26741551
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || | ||| ||||||        
T  26741681 ggtgtgatttcatccccttttttaagctccttgtcatcaatgaaggtgttgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaaccgaatt 26741582  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacac 190  Q
    ||||||| |||||||| ||||| | ||||||    
T  26741581 gagtgtcggtgcccctgaaactaatgaacac 26741551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26848685 - 26848603
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 142  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||    
T  26848685 ggtgtgatctcatcaccactctgaagatccttgtcatcaatgaaggttcggattccattgtcagaaagagctttatagagatt 26848603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 60 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 26959190 - 26959069
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||| || ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || ||||| || | ||| |||| |   |    
T  26959190 ggtgtgatttcatccccttttttaagctctttgtcatcaatgaaggtgtcgattcctttgtcagaaagagctttatagaggttaccggtgaaactgaatc 26959091  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaact 181  Q
    ||||||| |||||||| |||||    
T  26959090 gagtgtcggtgcccctgaaact 26959069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 139
Target Start/End: Original strand, 27665279 - 27665358
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagag 139  Q
    ||||||||||| || ||  || |||| || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  27665279 ggtgtgatttcgtcaccagttggaagctccttgtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagaaagagccttatagag 27665358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26617351 - 26617269
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26617351 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26617269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 26723279 - 26723197
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatt 142  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||| ||| ||||||  |||||| || ||||||||    
T  26723279 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggactcctttgtcacaaagagctttatagagatt 26723197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 26811534 - 26811453
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagat 141  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| || |||||||    
T  26811534 ggtgtgatttcgtcacctctctgaagctccttgtcatcaatgaaggttcggattcctttgtcacaaagagctttatagagat 26811453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 125 - 238
Target Start/End: Original strand, 28098596 - 28098709
Alignment:
Q  125 aagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggat 224  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||| |  |||||||| |||||||||||| | || ||||| |  || ||||||||||| || ||||||| | |     
T  28098596 aagagctttgtagagatttccagtaaaaccataccgagtgtcggtgcccctaaaattaagaaacacgtcataggtgaatccataagagaatgaagagaaa 28098695  T
Q  225 gaggaaggtgattg 238  Q
    ||||||| ||||||    
T  28098696 gaggaagatgattg 28098709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28185395 - 28185222
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||  |||||||      
T  28185395 tgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacga 28185296  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgagga 229  Q
    |  ||||||||| | || ||||| || |||||||| |  || |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  28185295 taacgagtgtcactacctctaaagctaaggaacacgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28185222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 248
Target Start/End: Original strand, 26018770 - 26018837
Alignment:
Q  181 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 248  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  || ||||||||||| |||||||||    
T  26018770 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagacgaaggtgattgaatagccata 26018837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 248
Target Start/End: Original strand, 26139474 - 26139541
Alignment:
Q  181 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 248  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  26139474 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccata 26139541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 60 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26949686 - 26949591
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||| || ||| | ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| || |||||||| | ||| ||||||    
T  26949686 ggtgtgatttcgtcacctttctgaagctccttatcatcaatgaaggttcggattcccttgtcagagagagctttatagagattaccggtgaaaccg 26949591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 56 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 28181143 - 28180970
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  | | ||||||||  ||||||||     
T  28181143 tgatgatgttatttcttcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctattgagatttccagtaaaacca 28181044  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgagga 229  Q
    |  |||||||||   || ||||| || |||||| | |  || |||||||||||||| || |||| |||||||||    
T  28181043 taacgagtgtcaccacctctaaagctaaggaacgcgtcataggtgaatccataggagaaggaagaggatgagga 28180970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 219
Target Start/End: Original strand, 26342183 - 26342255
Alignment:
Q  147 gtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 219  Q
    |||||||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |  || ||||||||||| || |||||||    
T  26342183 gtaaaaccatagcgagtgccaatgcccctaaaattgaggaacacatcatatgtgaatccatatgagaatgaag 26342255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0277
Description:

Target: scaffold0277; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 57 - 300
Target Start/End: Original strand, 4830 - 5073
Alignment:
Q  57 gatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgt 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4830 gatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttccggtaaaaccgt 4929  T
Q  157 ggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattga 256  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4930 ggcgagtgtcaatgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattga 5029  T
Q  257 gagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5030 gagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaat 5073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0277; HSP #2
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 13790 - 14056
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  13790 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 13889  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||| |||| |||||||| | |||||    
T  13890 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatgcagaggaaaatgaagaggaagaggaaggtaattgcatagccatgataattg 13989  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||| ||||||    
T  13990 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaattcagaatatgaatgagtttgtttttgtggtctgtg 14056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1254 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold1254
Description:

Target: scaffold1254; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Original strand, 75 - 334
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  75 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 174  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  175 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattg 274  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||       ||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  275 agagaaattagatgaaaaaagagtttg-------agaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0419 (Bit Score: 181; Significance: 9e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0419
Description:

Target: scaffold0419; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 56 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 7554 - 7295
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  7554 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggttttgattcccttgtcagtaagagccttgtagagattgccggtaaaaccg 7455  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||    
T  7454 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactaaggaacacttggtaagtgaatgcatatgaaaatgaagaggaagagggaggtgattgcatagccatgagaattg 7355  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatgaatgagtaaatttttgtgttctgtg 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||       |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7354 agagaaattagatgaaaaaagagtttga-------gaatatgaatgagtaagtttttgtggtctgtg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 8)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 18699545 - 18699787
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||    
T  18699545 tgatggtttgatttcatccccactttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatggccagtaaaaccg 18699644  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18699645 tcacgagtgtcagtgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattg 18699744  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 298  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18699745 agagaaactagatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18699787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 18655622 - 18655864
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||    
T  18655622 tgatggtttgatttcatccccactttgcagctcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctttgtagagatgcccagtaaaaccg 18655721  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| | |||||    
T  18655722 ttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcctagccatgaaaattg 18655821  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18655822 agagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18655864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 18679712 - 18679954
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  18679712 tgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcctttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccg 18679811  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  18679812 ttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagagaatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatag 18679911  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18679912 agagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18679954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 56 - 298
Target Start/End: Original strand, 18731649 - 18731891
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||  |  |||||||||    
T  18731649 tgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagctctgtagagatggccagtaaaaccg 18731748  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| |    
T  18731749 tcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgaaaatcg 18731848  T
Q  256 agagaaattggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 298  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18731849 agagaaactggatgaaaaaagagtttgagaatgcagaatatga 18731891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Original strand, 18724230 - 18724432
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||| || |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||||||    
T  18724230 tgatggtttgatttcatcccctctttgcaggtcacggtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatgaccagtaaaaccg 18724329  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18724330 ttacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacacttggtaagtgaatcgataggaaaatgaagaggatgaggaaggtgattgcatagccatgagaattg 18724429  T
Q  256 aga 258  Q
    |||    
T  18724430 aga 18724432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Original strand, 17989226 - 17989440
Alignment:
Q  87 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 186  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  17989226 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 17989325  T
Q  187 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 286  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  17989326 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 17989423  T
Q  287 tgcagaatatgaatgag 303  Q
    |||||||||||||||||    
T  17989424 tgcagaatatgaatgag 17989440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18073763 - 18073549
Alignment:
Q  87 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 186  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  18073763 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 18073664  T
Q  187 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 286  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  18073663 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 18073566  T
Q  287 tgcagaatatgaatgag 303  Q
    |||||||||||||||||    
T  18073565 tgcagaatatgaatgag 18073549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 91 - 181
Target Start/End: Original strand, 5091147 - 5091237
Alignment:
Q  91 tgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaact 181  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||| ||   ||||| |  ||||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  5091147 tgtcatcaatgaaggtgtgaattcccttgacacgtagagcttcatagagatttccagtaaaaccgtaacgagtgtcggtgcctctaaaact 5091237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 60 - 282
Target Start/End: Original strand, 28164511 - 28164733
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||   ||||||||||| || || |||||||||||   ||| ||||| |||||||  |  || |||||||  |    
T  28164511 ggtgtgatttcttctcctctctcaagatcacaatcatcaatgaatgtgtgaattcccttgtcgtcaagggccttatagagatggccagtgaaaccgtcac 28164610  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagag 259  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||| | ||| |||||||||| |||||||| ||    
T  28164611 gagtgtcactgcccctaaaactgaggaacacttggtatgtgaatccataggaaattgaagaggaagaggaatgcgatcgtatagccatgagaattgacag 28164710  T
Q  260 aaattggatgaaaaaagagtttg 282  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  28164711 aaattggatgagaaaagagtttg 28164733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 93 - 279
Target Start/End: Original strand, 28127862 - 28128042
Alignment:
Q  93 tcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacactt 192  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||  |  || |||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  28127862 tcatcaatgaatgtgtggattcccttgtcataaagggccttgtagagatggccagtgaaaccgtcacgagtgtcactgcccctgaagctgaggaacactt 28127961  T
Q  193 ggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagt 279  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||      |||||| ||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  28127962 ggtatgtgaatccataggaaattgaa------gaggaatgtgattgcatagccatgagaattgacaaaaattggatgagaaaagagt 28128042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 258
Target Start/End: Original strand, 268502 - 268704
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   |||||||     
T  268502 tgatggtttgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatggccaataaaaccc 268601  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattg 255  Q
    |  |||||||||  ||| || ||  ||||||| || ||||| |  |||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||    
T  268602 tcacgagtgtcaccgcctctgaagttgaggaagacctggtaggcaaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccatgagaactg 268701  T
Q  256 aga 258  Q
    |||    
T  268702 aga 268704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 87 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 59571 - 59357
Alignment:
Q  87 tcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaactgagga 186  Q
    |||| |||||||  ||||||| | |||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| |||||||  |||||||| |||||| || || ||||||    
T  59571 tcatcgtcatcatggaaggtacgaattcccttgtcaataagagccttcaagagattgccggtgaaaccgtaccgagtgtcggtgcccttacaaatgagga 59472  T
Q  187 acacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaattgagagaaattggatgaaaaaagagtttgagaa 286  Q
    |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| |||  || ||||| |||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  | |||||||||||||    
T  59471 acacatcgtaactgaatgcataggaaaatgaagaggaatagaaaggtaattgcatggccatgagaattgagagaaataagatg--agaagagtttgagaa 59374  T
Q  287 tgcagaatatgaatgag 303  Q
    |||||||||||||||||    
T  59373 tgcagaatatgaatgag 59357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 64 - 247
Target Start/End: Original strand, 29273936 - 29274119
Alignment:
Q  64 tgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggcgagt 163  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |   |||||||||  |||||    
T  29273936 tgatttcatcccctctttgaagttcacgatcatcaatgaaggtgtggattcccttgtcagtaagagtcttgtagagatggccaataaaaccgtcacgagt 29274035  T
Q  164 gtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccat 247  Q
    ||||  ||| |||||  ||||||| || ||||||||||||||||| || | ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||    
T  29274036 gtcaccgcctctaaagttgaggaagacctggtaagtgaatccatatgagattgaagaggaagaggaaggtgattgcatagccat 29274119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 56 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 31903880 - 31903728
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| || |  || ||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||  ||||||||     
T  31903880 tgatggtgtgatttcatgtcctctttgaagttcttcatcgtcaataaaggtgtggattcccttatcataaagagctttgtagagatttccagtaaaacca 31903781  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccata 208  Q
    | |||||||||   ||| ||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||    
T  31903780 tagcgagtgtctaagcctctaaagctgaggaacacatcgtaggtgaatccata 31903728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 34754 - 34599
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||  | |||||||||  |||||||||     
T  34754 tgatggtgttatttcatctcctccttgaagctccctgtcatcaatgaaggtgtggattcccttgtgacaaagagctctatagagattttcggtaaaacca 34655  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 211  Q
    | |||||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||    
T  34654 tagcgagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccatagga 34599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 60 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 116821 - 116662
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    ||||| ||||| || |||| |||||| || |||||||||||||||||| | |||| |||   |  |||| | |||||||||||||  |||||||| |  |    
T  116821 ggtgttatttcgtcacctcgttgaaggtctttgtcatcaatgaaggtacgaattctcttcctacaaagatctttgtagagatttccagtaaaaccataac 116722  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaag 219  Q
    |||||||| | || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||||||||| ||||    
T  116721 gagtgtcactacctctaaaactaaggaacacgtcataggtgaatccataggaaaaggaag 116662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 211
Target Start/End: Original strand, 58440 - 58595
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccg 155  Q
    ||||||||| ||||| || |||| |||||| ||  ||||||| ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||  ||||||||     
T  58440 tgatggtgttatttcgtcacctccttgaagctctctgtcatccatgaaggttcggattcccttgtcacaaagagctctgtagagatttccagtaaaacca 58539  T
Q  156 tggcgagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccatagga 211  Q
    | ||||||||||   || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||    
T  58540 tagcgagtgtcacaacctctaaagctaaggaacacgtgataggtgaatccatagga 58595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 60 - 252
Target Start/End: Original strand, 17993846 - 17994038
Alignment:
Q  60 ggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtcagtaagagccttgtagagatttctggtaaaaccgtggc 159  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | ||||||||||||| |||||| || |||||||| | ||| ||||| |  |    
T  17993846 ggtgtgatttcatcacctctctgaagctctttgtcatcgatgaaggttcgaattcccttgtcagaaagagctttatagagattaccggtgaaaccatatc 17993945  T
Q  160 gagtgtcagtgcccctaaaactgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccataagaa 252  Q
    |||| || || ||||| ||||| | |||||| | | |  |||| ||||| || || || |  || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  17993946 gagtatcggtacccctgaaactaatgaacacatcgaagctgaaaccataagataaggaggaagaggaggaaggtgattgcatagccataagaa 17994038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 35967279 - 35967227
Alignment:
Q  9 agtttgtgatgtattttgtgtcgctatgttgttttcttgaacttggttgatgg 61  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35967279 agtttgtgatgtattttgtgtcactatcttgttttcttgaacttggttgatgg 35967227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 3279638 - 3279592
Alignment:
Q  135 tagagatttctggtaaaaccgtggcgagtgtcagtgcccctaaaact 181  Q
    ||||||||||  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3279638 tagagatttccagtaaaaccatagcgagtgtcagtgcccctaaaact 3279592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0713 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0713
Description:

Target: scaffold0713; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 181 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5915
Alignment:
Q  181 tgaggaacacttggtaagtgaatccataggaaaatgaagtggatgaggaaggtgattgtatagccata 248  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||| || | ||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  5982 tgaggaacacttggtatgtgagtccataggaaaaggatgaggtagaggaaggtgattgaataaccata 5915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 56 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 16689040 - 16688974
Alignment:
Q  56 tgatggtgtgatttcatctcctctttgaagatcattgtcatcaatgaaggtatggattcccttgtca 122  Q
    ||||||||||||||  || ||||| ||||| || |||||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  16689040 tgatggtgtgattttgtcacctctctgaagttccttgtcatcaatgaagacacggattcccttgtca 16688974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University