View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0962_low_1 (Length: 854)

Name: NF0962_low_1
Description: NF0962
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0962_low_1
NF0962_low_1
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (29-849)||(1204565-1205389)
chr8 (399-804)||(37970296-37970701)
chr8 (388-804)||(43643372-43643788)
chr8 (390-791)||(12876108-12876510)
chr8 (389-791)||(16446665-16447067)
chr8 (402-804)||(23854209-23854610)
chr8 (451-787)||(1149426-1149762)
chr8 (388-798)||(16222860-16223273)
chr8 (389-783)||(27082636-27083030)
chr8 (388-791)||(36694756-36695159)
chr8 (390-797)||(10554988-10555393)
chr8 (390-804)||(5299723-5300137)
chr8 (390-774)||(6098320-6098709)
chr8 (380-791)||(30654373-30654784)
chr8 (388-791)||(38643975-38644378)
chr8 (387-787)||(34894963-34895358)
chr8 (392-791)||(7890747-7891137)
chr8 (380-752)||(9864137-9864509)
chr8 (404-783)||(11727037-11727416)
chr8 (388-787)||(40862416-40862816)
chr8 (390-798)||(33906223-33906617)
chr8 (392-791)||(465843-466232)
chr8 (389-787)||(8803610-8803998)
chr8 (403-791)||(31933676-31934064)
chr8 (391-792)||(35459500-35459888)
chr8 (390-791)||(44869495-44869897)
chr8 (490-791)||(1953778-1954081)
chr8 (390-705)||(13307622-13307936)
chr8 (516-804)||(4132463-4132750)
chr8 (387-791)||(39098909-39099303)
chr8 (621-790)||(12587812-12587981)
chr8 (380-596)||(1150090-1150306)
chr8 (585-745)||(1149756-1149912)
chr8 (617-791)||(35859160-35859334)
chr8 (541-804)||(18259233-18259492)
chr8 (618-791)||(34951847-34952020)
chr8 (572-781)||(24823194-24823395)
chr8 (490-675)||(41910895-41911079)
chr8 (422-661)||(43025733-43025972)
chr8 (652-787)||(33198063-33198198)
chr8 (390-583)||(41362517-41362707)
chr8 (389-584)||(34952028-34952223)
chr8 (692-804)||(41362723-41362835)
chr8 (390-514)||(4133077-4133199)
chr8 (621-712)||(34463704-34463792)
chr8 (691-783)||(43025974-43026066)
chr8 (591-668)||(7998478-7998555)
chr8 (498-584)||(7998401-7998488)
chr8 (390-455)||(15009241-15009306)
chr8 (572-628)||(12585297-12585353)
chr8 (388-454)||(24823399-24823465)
chr8 (387-438)||(4108912-4108963)
chr8 (390-445)||(33197891-33197946)
chr8 (490-545)||(33197948-33198003)
chr8 (744-787)||(41910852-41910895)
chr8 (389-430)||(7998361-7998402)
chr8 (389-438)||(38110352-38110401)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (388-798)||(18797302-18797710)
chr7 (388-783)||(32820846-32821241)
chr7 (386-787)||(30055497-30055899)
chr7 (389-804)||(31578836-31579256)
chr7 (390-803)||(37109847-37110262)
chr7 (388-791)||(9355611-9356014)
chr7 (388-803)||(17842357-17842774)
chr7 (385-791)||(24211711-24212118)
chr7 (392-798)||(23111167-23111575)
chr7 (389-791)||(21991610-21992003)
chr7 (390-787)||(27283719-27284118)
chr7 (390-804)||(7334769-7335182)
chr7 (389-791)||(32432431-32432828)
chr7 (390-791)||(15612544-15612944)
chr7 (390-791)||(37346997-37347397)
chr7 (430-804)||(10481619-10481994)
chr7 (390-792)||(4582894-4583296)
chr7 (390-791)||(8861260-8861661)
chr7 (392-783)||(25691337-25691729)
chr7 (390-791)||(5657265-5657667)
chr7 (388-787)||(41764867-41765266)
chr7 (390-791)||(10358999-10359400)
chr7 (390-791)||(6546494-6546895)
chr7 (392-770)||(11071182-11071558)
chr7 (420-798)||(29173545-29173905)
chr7 (406-792)||(48928081-48928466)
chr7 (390-791)||(31520526-31520909)
chr7 (404-783)||(22687228-22687599)
chr7 (476-804)||(37703270-37703590)
chr7 (391-686)||(38258521-38258816)
chr7 (389-705)||(43686015-43686330)
chr7 (390-746)||(12165727-12166074)
chr7 (508-791)||(15672544-15672830)
chr7 (479-791)||(46480914-46481218)
chr7 (427-820)||(35353120-35353517)
chr7 (429-776)||(43925120-43925456)
chr7 (385-787)||(12390438-12390821)
chr7 (420-791)||(26980328-26980682)
chr7 (391-721)||(33688117-33688446)
chr7 (534-791)||(26587877-26588126)
chr7 (391-667)||(48928473-48928748)
chr7 (490-791)||(44598741-44599042)
chr7 (392-643)||(27421313-27421563)
chr7 (607-804)||(44411312-44411509)
chr7 (591-787)||(32592996-32593191)
chr7 (499-645)||(37704241-37704387)
chr7 (620-804)||(37704387-37704571)
chr7 (422-705)||(38053493-38053751)
chr7 (430-604)||(44413351-44413525)
chr7 (631-785)||(34361967-34362123)
chr7 (388-540)||(26524363-26524515)
chr7 (703-803)||(38258867-38258967)
chr7 (390-520)||(34362205-34362334)
chr7 (437-576)||(32593189-32593327)
chr7 (741-791)||(12166215-12166265)
chr7 (392-456)||(8299192-8299256)
chr7 (658-722)||(27421219-27421283)
chr7 (768-804)||(23402047-23402083)
chr7 (390-438)||(23402371-23402419)
chr7 (392-438)||(3953733-3953779)
chr7 (384-438)||(4902334-4902388)
chr7 (388-438)||(40381938-40381988)
chr7 (424-470)||(44598373-44598419)
chr7 (750-791)||(33688077-33688118)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (392-803)||(46297534-46297945)
chr3 (389-791)||(40552043-40552445)
chr3 (389-803)||(26941032-26941446)
chr3 (388-787)||(48354930-48355329)
chr3 (436-787)||(42505863-42506214)
chr3 (390-791)||(37203058-37203460)
chr3 (389-790)||(52040707-52041109)
chr3 (384-783)||(47481507-47481907)
chr3 (385-790)||(53228937-53229343)
chr3 (390-791)||(37157699-37158100)
chr3 (390-791)||(4015451-4015851)
chr3 (380-752)||(34132916-34133288)
chr3 (388-791)||(39282642-39283044)
chr3 (388-785)||(4761438-4761838)
chr3 (389-792)||(3654982-3655388)
chr3 (388-791)||(21009585-21009992)
chr3 (388-781)||(22450957-22451350)
chr3 (400-791)||(29099356-29099739)
chr3 (389-783)||(7327274-7327669)
chr3 (384-791)||(33378569-33378973)
chr3 (388-791)||(21193595-21193999)
chr3 (405-790)||(11357166-11357535)
chr3 (390-791)||(44891498-44891889)
chr3 (422-804)||(3362276-3362660)
chr3 (390-783)||(54505799-54506192)
chr3 (391-787)||(25579731-25580127)
chr3 (459-798)||(24707892-24708231)
chr3 (429-776)||(24488761-24489108)
chr3 (430-791)||(2007964-2008331)
chr3 (513-791)||(22622502-22622780)
chr3 (387-791)||(32373460-32373861)
chr3 (392-803)||(43975664-43976068)
chr3 (389-791)||(11466814-11467202)
chr3 (511-791)||(33698265-33698545)
chr3 (388-746)||(46994490-46994837)
chr3 (392-730)||(54828546-54828883)
chr3 (393-791)||(22445849-22446247)
chr3 (548-803)||(1089842-1090097)
chr3 (390-714)||(45174494-45174821)
chr3 (389-776)||(44186316-44186687)
chr3 (451-791)||(14586464-14586794)
chr3 (493-791)||(29163912-29164194)
chr3 (403-787)||(40935995-40936361)
chr3 (387-648)||(35844314-35844575)
chr3 (506-791)||(36012244-36012532)
chr3 (432-752)||(38591727-38592051)
chr3 (390-601)||(51212955-51213166)
chr3 (460-705)||(43348319-43348563)
chr3 (390-783)||(27480150-27480564)
chr3 (603-804)||(51212548-51212743)
chr3 (556-804)||(20373034-20373263)
chr3 (420-629)||(53176076-53176284)
chr3 (585-803)||(11356930-11357140)
chr3 (384-568)||(20373303-20373487)
chr3 (501-714)||(11835494-11835702)
chr3 (609-776)||(50475021-50475195)
chr3 (604-712)||(53811597-53811701)
chr3 (387-456)||(55343403-55343472)
chr3 (390-470)||(33698183-33698259)
chr3 (391-485)||(11835701-11835790)
chr3 (729-787)||(35844577-35844635)
chr3 (388-438)||(40640634-40640684)
chr3 (391-446)||(29163839-29163894)
chr3 (760-802)||(13498678-13498720)
chr3 (392-438)||(53818509-53818555)
chr3 (388-438)||(38392628-38392678)
chr3 (385-427)||(53175709-53175751)
chr3 (389-438)||(45879498-45879547)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (389-804)||(879345-879760)
chr4 (387-803)||(35020829-35021249)
chr4 (390-787)||(19089267-19089664)
chr4 (389-787)||(37663555-37663951)
chr4 (389-804)||(25184112-25184527)
chr4 (390-791)||(19440458-19440860)
chr4 (390-791)||(28002796-28003197)
chr4 (388-791)||(34361301-34361704)
chr4 (388-777)||(55477715-55478108)
chr4 (393-803)||(6864038-6864448)
chr4 (388-791)||(32912389-32912793)
chr4 (385-803)||(3042606-3043032)
chr4 (387-787)||(25700870-25701271)
chr4 (392-804)||(36493486-36493897)
chr4 (385-791)||(55240915-55241320)
chr4 (390-791)||(7703517-7703910)
chr4 (392-803)||(17173292-17173703)
chr4 (385-787)||(29584014-29584414)
chr4 (392-791)||(47253751-47254141)
chr4 (407-803)||(23761089-23761484)
chr4 (392-789)||(33341397-33341797)
chr4 (392-773)||(34947923-34948306)
chr4 (392-791)||(17167715-17168114)
chr4 (387-791)||(50697239-50697643)
chr4 (390-791)||(49375966-49376368)
chr4 (392-791)||(27396618-27397015)
chr4 (404-791)||(46887968-46888354)
chr4 (498-782)||(1815409-1815693)
chr4 (387-785)||(50764732-50765115)
chr4 (391-787)||(37775670-37776055)
chr4 (387-792)||(32579441-32579848)
chr4 (387-787)||(30002455-30002838)
chr4 (393-803)||(32592096-32592497)
chr4 (392-791)||(33816326-33816742)
chr4 (389-787)||(42199728-42200127)
chr4 (389-787)||(37287732-37288126)
chr4 (404-817)||(5047746-5048162)
chr4 (391-791)||(4597994-4598383)
chr4 (427-801)||(4934012-4934375)
chr4 (489-787)||(17272067-17272361)
chr4 (384-705)||(38011848-38012169)
chr4 (388-791)||(9139245-9139628)
chr4 (587-792)||(7152013-7152218)
chr4 (532-803)||(46883911-46884177)
chr4 (588-787)||(26896285-26896485)
chr4 (389-667)||(35025530-35025800)
chr4 (618-791)||(39400236-39400409)
chr4 (622-803)||(4205216-4205397)
chr4 (652-789)||(35025379-35025515)
chr4 (420-645)||(54499193-54499420)
chr4 (661-791)||(23431826-23431956)
chr4 (390-596)||(39397918-39398115)
chr4 (380-495)||(4205106-4205221)
chr4 (696-783)||(38012568-38012655)
chr4 (629-694)||(56050169-56050234)
chr4 (388-470)||(4396324-4396406)
chr4 (392-446)||(52516599-52516653)
chr4 (388-438)||(2704510-2704560)
chr4 (388-470)||(7152237-7152319)
chr4 (388-446)||(17272009-17272067)
chr4 (388-438)||(38812260-38812310)
chr4 (392-444)||(20097485-20097537)
chr4 (390-438)||(38811813-38811861)
chr4 (390-470)||(53124287-53124367)
chr4 (387-417)||(1012306-1012336)
chr4 (385-439)||(47073656-47073710)
chr4 (431-504)||(23518400-23518473)
chr4 (391-444)||(51204580-51204633)
[»] chr6 (21 HSPs)
chr6 (393-803)||(6090953-6091363)
chr6 (389-791)||(3879722-3880124)
chr6 (388-791)||(5627389-5627793)
chr6 (388-791)||(1945831-1946237)
chr6 (381-770)||(4318626-4319016)
chr6 (390-803)||(7234803-7235218)
chr6 (392-779)||(21016913-21017294)
chr6 (391-783)||(20768087-20768475)
chr6 (389-791)||(8513232-8513622)
chr6 (392-791)||(29182165-29182562)
chr6 (390-791)||(33892795-33893186)
chr6 (392-776)||(6088910-6089282)
chr6 (390-787)||(33618834-33619230)
chr6 (389-648)||(7055141-7055400)
chr6 (392-676)||(30353256-30353540)
chr6 (406-659)||(15491631-15491884)
chr6 (643-803)||(7054543-7054704)
chr6 (384-520)||(18498427-18498564)
chr6 (716-771)||(33724062-33724117)
chr6 (386-438)||(11084152-11084204)
chr6 (388-438)||(19631747-19631797)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (392-791)||(699152-699551)
chr5 (402-804)||(27318249-27318650)
chr5 (391-804)||(22980794-22981207)
chr5 (388-792)||(35826259-35826660)
chr5 (388-791)||(38528011-38528413)
chr5 (386-804)||(22973843-22974261)
chr5 (388-791)||(22255179-22255583)
chr5 (388-803)||(36860421-36860837)
chr5 (390-803)||(36866762-36867175)
chr5 (391-803)||(31705374-31705785)
chr5 (385-791)||(19119854-19120260)
chr5 (390-791)||(31786420-31786821)
chr5 (387-804)||(24886099-24886501)
chr5 (389-791)||(39572818-39573212)
chr5 (390-803)||(40133385-40133798)
chr5 (387-805)||(8741645-8742065)
chr5 (388-804)||(12910348-12910769)
chr5 (429-798)||(17157798-17158166)
chr5 (404-791)||(30969097-30969485)
chr5 (402-792)||(33908245-33908634)
chr5 (388-787)||(27330304-27330701)
chr5 (452-798)||(35504427-35504773)
chr5 (422-791)||(7208638-7209006)
chr5 (390-791)||(35511256-35511652)
chr5 (392-804)||(5837557-5837969)
chr5 (392-791)||(25500700-25501099)
chr5 (422-775)||(5829929-5830278)
chr5 (390-791)||(7693230-7693622)
chr5 (390-787)||(23116008-23116397)
chr5 (389-791)||(9200232-9200625)
chr5 (473-791)||(15992314-15992632)
chr5 (389-791)||(35933901-35934297)
chr5 (390-783)||(15724490-15724881)
chr5 (390-791)||(22019632-22020024)
chr5 (387-791)||(14919313-14919707)
chr5 (391-791)||(32563150-32563541)
chr5 (398-791)||(43308434-43308819)
chr5 (403-791)||(8436979-8437366)
chr5 (422-792)||(21088541-21088908)
chr5 (541-803)||(2888207-2888469)
chr5 (390-791)||(14409115-14409501)
chr5 (432-791)||(42342775-42343122)
chr5 (388-803)||(13956126-13956522)
chr5 (389-741)||(1428983-1429321)
chr5 (448-804)||(23954563-23954907)
chr5 (388-629)||(5112250-5112490)
chr5 (541-791)||(25669737-25669977)
chr5 (403-648)||(26268087-26268332)
chr5 (388-791)||(8466743-8467127)
chr5 (451-717)||(6824329-6824595)
chr5 (604-791)||(25889584-25889771)
chr5 (652-788)||(28416328-28416464)
chr5 (429-602)||(28416490-28416663)
chr5 (655-791)||(26269074-26269210)
chr5 (689-804)||(43254154-43254269)
chr5 (427-545)||(25668687-25668804)
chr5 (392-526)||(11898004-11898138)
chr5 (390-467)||(16004474-16004552)
chr5 (390-470)||(26317779-26317859)
chr5 (584-635)||(11898148-11898199)
chr5 (393-444)||(13380498-13380549)
chr5 (387-438)||(22616491-22616542)
chr5 (389-438)||(36055874-36055923)
chr5 (389-438)||(27579038-27579087)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (391-804)||(10922724-10923137)
chr1 (427-803)||(32216088-32216464)
chr1 (387-787)||(32267027-32267427)
chr1 (392-803)||(15752027-15752438)
chr1 (389-791)||(2959743-2960145)
chr1 (388-798)||(16415639-16416050)
chr1 (390-804)||(23999343-23999758)
chr1 (389-791)||(30254419-30254820)
chr1 (389-804)||(10181773-10182189)
chr1 (400-787)||(28564566-28564951)
chr1 (389-791)||(19899547-19899950)
chr1 (390-791)||(38823210-38823611)
chr1 (388-783)||(15382927-15383323)
chr1 (390-775)||(27227280-27227657)
chr1 (420-801)||(51128885-51129264)
chr1 (388-798)||(8222125-8222532)
chr1 (380-783)||(238300-238702)
chr1 (400-787)||(37451292-37451678)
chr1 (391-791)||(14758038-14758429)
chr1 (392-783)||(28769651-28770042)
chr1 (420-787)||(9902837-9903204)
chr1 (387-791)||(34012161-34012560)
chr1 (396-803)||(47279191-47279599)
chr1 (390-791)||(7078842-7079254)
chr1 (429-791)||(46931446-46931807)
chr1 (390-804)||(47682260-47682673)
chr1 (390-775)||(27266995-27267376)
chr1 (390-783)||(42721035-42721425)
chr1 (386-791)||(1547279-1547668)
chr1 (389-754)||(18422646-18423004)
chr1 (477-777)||(25160715-25161016)
chr1 (403-803)||(4330288-4330690)
chr1 (385-791)||(11742147-11742535)
chr1 (387-791)||(15168082-15168493)
chr1 (390-770)||(30326751-30327132)
chr1 (429-787)||(27763093-27763451)
chr1 (406-791)||(27532761-27533144)
chr1 (387-803)||(3534925-3535332)
chr1 (429-804)||(27563671-27564046)
chr1 (387-787)||(39393376-39393777)
chr1 (385-776)||(3309139-3309536)
chr1 (489-792)||(22170806-22171109)
chr1 (390-791)||(31621327-31621733)
chr1 (385-742)||(37618729-37619081)
chr1 (422-792)||(40884841-40885212)
chr1 (392-792)||(41926161-41926554)
chr1 (392-791)||(33725390-33725778)
chr1 (586-791)||(48353735-48353939)
chr1 (586-803)||(1359703-1359919)
chr1 (384-672)||(48620627-48620906)
chr1 (608-804)||(21289817-21290010)
chr1 (450-707)||(38759583-38759846)
chr1 (631-791)||(31962853-31963014)
chr1 (390-538)||(21289661-21289816)
chr1 (721-791)||(48620916-48620986)
chr1 (430-521)||(1359932-1360022)
chr1 (389-489)||(30254853-30254952)
chr1 (750-804)||(38759846-38759900)
chr1 (390-438)||(43579242-43579290)
chr1 (388-435)||(4150490-4150537)
chr1 (387-446)||(22170747-22170806)
chr1 (389-439)||(26970260-26970310)
[»] scaffold0291 (1 HSPs)
scaffold0291 (387-787)||(7884-8284)
[»] chr2 (56 HSPs)
chr2 (386-803)||(2325168-2325577)
chr2 (427-787)||(43648051-43648411)
chr2 (388-803)||(4166920-4167335)
chr2 (389-803)||(11366170-11366585)
chr2 (390-797)||(33550778-33551189)
chr2 (382-791)||(3176931-3177340)
chr2 (390-792)||(26357577-26357979)
chr2 (390-791)||(4763628-4764033)
chr2 (389-791)||(19424444-19424832)
chr2 (388-791)||(31570536-31570939)
chr2 (422-792)||(37905740-37906113)
chr2 (388-792)||(39167170-39167568)
chr2 (386-791)||(19289125-19289525)
chr2 (392-791)||(33660179-33660569)
chr2 (489-791)||(41960939-41961241)
chr2 (422-789)||(33709036-33709403)
chr2 (388-804)||(29241934-29242343)
chr2 (390-783)||(44913662-44914060)
chr2 (390-796)||(35958909-35959298)
chr2 (386-803)||(18494071-18494475)
chr2 (389-684)||(17071646-17071941)
chr2 (389-752)||(27349789-27350143)
chr2 (390-792)||(41465509-41465903)
chr2 (389-684)||(17054005-17054300)
chr2 (389-743)||(4263926-4264281)
chr2 (392-791)||(43770650-43771039)
chr2 (486-791)||(31861948-31862253)
chr2 (386-784)||(13711460-13711853)
chr2 (389-791)||(5881533-5881930)
chr2 (427-742)||(4478406-4478717)
chr2 (392-724)||(44285951-44286283)
chr2 (392-695)||(36641988-36642293)
chr2 (390-729)||(19313852-19314186)
chr2 (460-787)||(7006744-7007054)
chr2 (487-695)||(45327817-45328025)
chr2 (585-804)||(19500706-19500923)
chr2 (390-643)||(33902068-33902319)
chr2 (392-664)||(41463779-41464051)
chr2 (531-682)||(18258198-18258349)
chr2 (655-781)||(41051112-41051238)
chr2 (663-783)||(41463400-41463520)
chr2 (693-783)||(33902317-33902407)
chr2 (678-791)||(18257340-18257453)
chr2 (728-791)||(45328028-45328091)
chr2 (420-535)||(41051263-41051379)
chr2 (387-438)||(19093410-19093461)
chr2 (719-793)||(17071571-17071646)
chr2 (719-793)||(17053931-17054005)
chr2 (385-438)||(22963395-22963448)
chr2 (385-438)||(22998029-22998082)
chr2 (394-438)||(18947598-18947642)
chr2 (764-803)||(19093787-19093826)
chr2 (493-560)||(19501773-19501839)
chr2 (388-438)||(6177773-6177823)
chr2 (389-435)||(39788580-39788626)
chr2 (746-791)||(4263711-4263756)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (389-776)||(133-514)
scaffold0002 (451-781)||(408223-408552)
scaffold0002 (619-791)||(93885-94056)
scaffold0002 (420-627)||(94331-94538)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (392-798)||(43959-44364)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (392-798)||(154423-154828)
[»] scaffold0318 (1 HSPs)
scaffold0318 (392-791)||(11908-12309)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (392-787)||(145803-146199)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (389-804)||(267281-267690)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (389-470)||(42347-42428)
scaffold0009 (611-735)||(100948-101058)
scaffold0009 (386-463)||(100817-100894)
[»] scaffold0262 (1 HSPs)
scaffold0262 (390-439)||(12137-12186)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 695; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 695; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 849
Target Start/End: Original strand, 1204565 - 1205389
Alignment:
Q  29 aagtgttacacaagtaaaactatcacgttagaacacttatgaccaacaacgaaaaagatgagatagaaagaatatgagagagcgatgaattagaaacgga 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204565 aagtgttacacaagtaaaactatcacgttagaacacttatgaccaacaacgaaaaagatgagatagaaagaatatgagagagcgatgaattagaaacgga 1204664  T
Q  129 tttattgacataagttaattannnnnnnattagagacggaagttagagacgcaatcacaacagtatttcgtgtccaaattcgtctctattgggtcaaatt 228  Q
    |||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1204665 tttattgacataagttaattatttttttattagagacggaagcaagagacgcagtcacaacagtatttcgtgtccacattcgtctctattgggtcaaatt 1204764  T
Q  229 tctgtttttataaagtcaacaattattcggagacgacatttagagacataattgttccgtgtcaaatgagcttcatctctagttccatctccaactaaaa 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1204765 tctgtttttataaagtcaacaattatacggagacgacatttacagacataattgttccgtgtcaaatgagcttcatctctagttccatctccaactaaaa 1204864  T
Q  329 aactaaactataaggcaagtttttccactattttggctccaaacacctgatttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctg 428  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  1204865 aaataaactataaggcaattttttccactattttggctccaaacacctgatttaataaaaaggaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctg 1204964  T
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1204965 gtgaagttaacactataacataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatca 1205064  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1205065 tattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaac 1205164  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 728  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1205165 tctgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 1205264  T
Q  729 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc----aagctcccaaaataaaaacac 824  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||    
T  1205265 tcagcaatttaaaaatgaatcaaacaacaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactacaccgtagaagctcccaaaataaaaacac 1205364  T
Q  825 aaaattccctccaatattcttcgac 849  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  1205365 aaaattccctccaatatttttcgac 1205389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 399 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 37970701 - 37970296
Alignment:
Q  399 tatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaag 498  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  37970701 tatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatgccatcaaaag 37970602  T
Q  499 ttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaa 598  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  37970601 ttcagccctcatagtatcatcaattcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37970502  T
Q  599 cacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37970501 cacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatccttacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattacta 37970402  T
Q  699 gatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgact 798  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||    
T  37970401 gatgaattactgttgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcactttcctgact 37970302  T
Q  799 acacca 804  Q
     |||||    
T  37970301 gcacca 37970296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 388 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 43643788 - 43643372
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||    
T  43643788 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaat 43643689  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |    
T  43643688 gacatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctc 43643589  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||   || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43643588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 43643489  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643488 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 43643389  T
Q  788 gttttttgactacacca 804  Q
    ||||| ||||| |||||    
T  43643388 gttttctgactgcacca 43643372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 12876108 - 12876510
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||| |||||| || ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12876108 ggaaaattctatggttaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatataaaaaatgttgtgagtaacacccaactgtttgtacaatga 12876207  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12876208 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaagaaggatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccac 12876307  T
Q  590 aaagtgtaacactt-aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  12876308 aaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttaca 12876407  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||| ||| ||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||    
T  12876408 ggcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacagtttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaacttttttaaaaaagtcag 12876507  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  12876508 ttt 12876510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 16447067 - 16446665
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  16447067 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgataaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtataatg 16446968  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16446967 gcatcaaaagtttagtccccatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 16446868  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446867 caaagcgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 16446768  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16446767 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatctaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 16446668  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  16446667 ttt 16446665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 402 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 23854610 - 23854209
Alignment:
Q  402 ggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 501  Q
    ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23854610 ggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacacccaactgtttgtgcaatgacatcaaaagttc 23854511  T
Q  502 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 601  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| || ||||||||||||    
T  23854510 agtcctcatagtatcatcaactcattagattaacaatactacaattaatctaattttatcttacctagttataagtgtaacaccgcataaagtgtaacac 23854411  T
Q  602 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 701  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23854410 ttaagacaatcacataatatcatcaactctgcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 23854311  T
Q  702 gaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactaca 801  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||    
T  23854310 gaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa-tcaatttcctgactaca 23854212  T
Q  802 cca 804  Q
    |||    
T  23854211 cca 23854209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 451 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 1149762 - 1149426
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 550  Q
    ||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1149762 aaaaatgtaatgagtaacaacccactgtttgtacaatgacatcaaaagttctgtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaat 1149663  T
Q  551 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattt 650  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  1149662 ctaattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactttgtttgcatgttaaagattc 1149563  T
Q  651 taacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatca 750  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1149562 caacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatca 1149463  T
Q  751 aacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  1149462 aacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtca 1149426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 388 - 798
Target Start/End: Original strand, 16222860 - 16223273
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||   |  ||| |||||||||||    
T  16222860 aaggaaaattctacggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaatttaacactataacataaaaaatatagtgagtagttccccacagtttgtacaat 16222959  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||    
T  16222960 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatccttccttgttttaaacgtaacacccc 16223059  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16223060 aaaaagtgtaacacttaagagtatcacataatatcatcaactttgtttgcattttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgc 16223159  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa---cttttttaaaaaag 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    |||||| ||||||    
T  16223160 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttttttcaaaaag 16223259  T
Q  785 tcagttttttgact 798  Q
    |||||||| |||||    
T  16223260 tcagttttctgact 16223273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 389 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 27083030 - 27082636
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  |||||||||| || ||    
T  27083030 aggaaaattctatggtgaagtcatcagactgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccccactgtttgtgcagtg 27082931  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||     
T  27082930 gcattaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttaccatgttttaagtctaacaccccg 27082831  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27082830 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 27082731  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27082730 agcattactagatgaattactacttatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 27082636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 36695159 - 36694756
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36695159 aaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 36695060  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  36695059 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccc 36694960  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  36694959 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaaatccaagatgttgc 36694860  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||| |||    
T  36694859 aagcatcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaaatca 36694760  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  36694759 gttt 36694756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 390 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 10555393 - 10554988
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  10555393 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccactgtttgtacaatga 10555294  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| |||    
T  10555293 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgcaacacctcac 10555194  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10555193 aaaacgtaacactt--gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgcaa 10555096  T
Q  690 gcattactagatgaatt--actattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||   | |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10555095 gcattactagatgaattacactattgatcatta---agtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttttcaaaaaagtc 10554999  T
Q  787 agttttttgac 797  Q
    | |||| ||||    
T  10554998 aattttctgac 10554988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 390 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 5300137 - 5299723
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||  || |||| ||| || |||| |||   |||||||||||| ||     
T  5300137 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtaagtagcactctactgtttgtacagtgg 5300038  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  5300037 catcaaaagttcagtccttatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacaccccac 5299938  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5299937 aaagtgtaacacttaagattatcaaatgatatcagcaattttgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 5299838  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  5299837 gcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 5299738  T
Q  790 tttttgactacacca 804  Q
    ||  ||||| |||||    
T  5299737 ttcatgactgcacca 5299723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 390 - 774
Target Start/End: Complemental strand, 6098709 - 6098320
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||    
T  6098709 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtga 6098610  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||||    
T  6098609 catcaaaagttcagtccccatagtatcgtcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccccac 6098510  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacg-----ataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||     ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6098509 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgatacaatacaatagtacttgtaagtccaagatgt 6098410  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 774  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  6098409 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcatgattaacttt 6098320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 380 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 30654784 - 30654373
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||   | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  30654784 ttaaaaaataggaaaattttatggtgaagtcataagagtgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtt 30654685  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| || ||||||||||    
T  30654684 tgttgaatgacatcaaaagttcagccttcatagtatcatcacttcatcaggttaacaagactacacttaatttaattttaccatacattgttttaagcgt 30654585  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 679  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30654584 aacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaaaatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 30654485  T
Q  680 gatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta 778  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |    
T  30654484 gatgttgcaagcattactaaatgaatatattattgatcattaatcagtaattaacaattt-aaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttca 30654386  T
Q  779 aaaaagtcagttt 791  Q
    ||||| |||||||    
T  30654385 aaaaaatcagttt 30654373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 38643975 - 38644378
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||  | |    
T  38643975 aaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttttggtcaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtctagt 38644074  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  38644075 ggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactcc 38644174  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    | ||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38644175 ataaagtgtaacactcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 38644274  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38644275 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaaaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 38644374  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  38644375 gttt 38644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 387 - 787
Target Start/End: Original strand, 34894963 - 34895358
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  34894963 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaag 34895062  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||    
T  34895063 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34895162  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  34895163 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgaaaaaatagtacatgtaagttcaagatgttg 34895257  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34895258 caagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 34895357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 7891137 - 7890747
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||         |||||  ||| |||||||||||| ||    
T  7891137 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgactttttttgtgaagttaacactataacatcaaaaat---------aacactccaccgtttgtacaatggca 7891047  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  7891046 tcaaaagttcggtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacactcaatctagttttatcttactttgttataagcgtaacaccccacaa 7890947  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  7890946 cgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactctggttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagc 7890847  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7890846 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 7890747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 380 - 752
Target Start/End: Original strand, 9864137 - 9864509
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  9864137 ttaataaaaaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtt 9864236  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  9864237 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgt 9864336  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9864337 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagttcaa 9864436  T
Q  680 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9864437 gatgttgcaagcattactagatgaataactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 9864509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 404 - 783
Target Start/End: Original strand, 11727037 - 11727416
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  |||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  11727037 tgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttgtatagtggcatcaaaagttcag 11727136  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    |||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11727137 tcctcataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacactt 11727236  T
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11727237 aagactatcacatgatatcaacaactttgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatga 11727336  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  11727337 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaa 11727416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 388 - 787
Target Start/End: Original strand, 40862416 - 40862816
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatat-aaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  40862416 aaggaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaa 40862515  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||  | | | |||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || || |||| ||||||| |    
T  40862516 tggcatcaaaagttcagtc-tcatggtatcatcaatttttcatactaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttctaagtgtaacactc 40862614  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40862615 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 40862714  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaattt-aaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  40862715 caagcattactagatgaattactatttgtcataaatcagtaatcgacaatttaaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaactttttcaaaaaagt 40862814  T
Q  786 ca 787  Q
    ||    
T  40862815 ca 40862816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 390 - 798
Target Start/End: Original strand, 33906223 - 33906617
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||          
T  33906223 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagtattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttata------ 33906316  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
          |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||     
T  33906317 ------aagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaagggtaacattccaa 33906410  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33906411 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 33906510  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33906511 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatca--aatttaaaaatgaatcgaatagtaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 33906608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Original strand, 465843 - 466232
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  465843 aaaattttatggtgaagtcattaaaatgacttttgtggtgaagttaacacgataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggca 465942  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  465943 tcaaaaattcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacaccccacaa 466042  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||         |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  466043 agtgtaacac---------tcacat-atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaataatacctgtaagtctaagatgttgcaagc 466132  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||| |||||||    
T  466133 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttattcaaaaaaatcagttt 466232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 389 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 8803998 - 8803610
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  ||    ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  8803998 aggaaaattctatggtgaagtcatatga----cttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccactatttgtagaatg 8803903  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||| |       |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||| |    
T  8803902 acatcaaaagttcagcc-------tatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacacccta 8803810  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8803809 aaaagtgtaacacttaatactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 8803710  T
Q  689 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8803709 agcattaccagatgaatatactattgatcattaatcagtaatgaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 8803610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 403 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31934064 - 31933676
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    ||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31934064 gtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatgatatcaaaaatataatgagtaacaccccactctttatacaatgacatcaaaagttca 31933965  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  31933964 gtcattatagtatcatcaattcatccgattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcataataccgcacaaagtgtaacact 31933865  T
Q  603 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 702  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||    
T  31933864 taaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccaacaataaaatagtacttgtaagtctaagatattgcagacattactagatg 31933765  T
Q  703 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31933764 aattattattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 31933676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 391 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 35459888 - 35459500
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||| |             |||||| ||||||||||||    
T  35459888 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttcgtaaagttaatactataatataaaaaatct-------------tcactgattgtacaatgac 35459802  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| ||||||    
T  35459801 attaaaagttcagtcctcataatatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctactttgttataaatgtaacatcccaca 35459702  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
     | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  35459701 gattataacacttaagactattacataatatcatcaattctgtttgtatgttaaagatttcgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaaa 35459602  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35459601 cattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 35459502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 44869495 - 44869897
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaa--atgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||| || |||||| | || |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||  || | |||||| |  |  ||||||||| |||||    
T  44869495 ggaaaattctacggtgaaattataagaataacttttttggtgaagttaacactataacattaaaagtattttgtgagtgatccc-cactgtttgcacaat 44869593  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    |||    
T  44869594 gacatcaaaagttcaatcgtcatagtatcatcaatttatcagattaacaataatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgttgt-ccc 44869692  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  44869693 cacaaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacgataaaatagtaccgataagtccaagatattg 44869792  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  44869793 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaaccaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtc 44869892  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  44869893 agttt 44869897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 490 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 1954081 - 1953778
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatc-atcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-cccc 587  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| | || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  1954081 catcaaaagttcagccctcatagtatctatcaattcatcagattaatatgactacactaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacatcccc 1953982  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1953981 acaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaagttgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagattttgc 1953882  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  1953881 aagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaaatca 1953782  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  1953781 gttt 1953778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 390 - 705
Target Start/End: Original strand, 13307622 - 13307936
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||    
T  13307622 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactatttgtacagtga 13307721  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||    
T  13307722 catcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattagcaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaaatgtaacaccccac 13307821  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  13307822 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaa-atgtcaacgataaaatagtacccgtaagttcaagatgttgcaa 13307920  T
Q  690 gcattactagatgaat 705  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13307921 gcattacaagatgaat 13307936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 516 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 4132750 - 4132463
Alignment:
Q  516 catcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcaca 615  Q
    ||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4132750 catcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttt-aagtgtaacaccccacaaagtgtaacacataagactatcaca 4132652  T
Q  616 taatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 715  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4132651 taatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgat 4132552  T
Q  716 cattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    |||||||   ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  4132551 cattaatttgtaatcaacaatttaaaaatgaattacacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtttgctgactgcacca 4132463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 387 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 39099303 - 39098909
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||        ||||||| || ||||  || |  ||||||||  |||| ||||||||     
T  39099303 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatg--------actataacatcaaaa--gttgcaagtaacaccccactctttgtacac 39099214  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||| ||    
T  39099213 tagcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcttaccctgttttaagtgtaacatcc 39099114  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  39099113 cacaaagtatcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtatatgtaagtccaaaatgttg 39099014  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| |||||||||||| ||    
T  39099013 caagcattactagatgaattactattgatcattaattaataatcaataatttaaaaatgcatcaaacattaaaattaaaattaatttttttaaaaaaatc 39098914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 621 - 790
Target Start/End: Original strand, 12587812 - 12587981
Alignment:
Q  621 tcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 720  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12587812 tcatcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtcaaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcatta 12587911  T
Q  721 atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  12587912 atcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagtt 12587981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 380 - 596
Target Start/End: Complemental strand, 1150306 - 1150090
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||   |||||||    
T  1150306 ttaataattaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccactgtt 1150207  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||    
T  1150206 tgtacaacgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgt 1150107  T
Q  580 aacaccccacaaagtgt 596  Q
    |||||||||||||||||    
T  1150106 aacaccccacaaagtgt 1150090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 585 - 745
Target Start/End: Complemental strand, 1149912 - 1149756
Alignment:
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  1149912 cccacaaagtgtaacacttaagac----acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgt 1149817  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg 745  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1149816 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatg 1149756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 617 - 791
Target Start/End: Original strand, 35859160 - 35859334
Alignment:
Q  617 aatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatc 716  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35859160 aatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagttcgagatgttgcaagcattactagatgaattaatattgatc 35859259  T
Q  717 attaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35859260 attaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 35859334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 541 - 804
Target Start/End: Original strand, 18259233 - 18259492
Alignment:
Q  541 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatg 640  Q
    |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||  |||||| ||| ||  ||||||||    
T  18259233 tacatttaatttaattttatcataccttattttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacctaag----tcacaagatatcagcaatttaatttgcatg 18259328  T
Q  641 ttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaa 740  Q
    ||||| || | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  18259329 ttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattattgttgatcagtaatgagtaatcaacaatttaa 18259428  T
Q  741 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||||||||||| || ||| || ||||||||| |||| |||||||||| |||  ||||| |||||    
T  18259429 aaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcaatttcatgactgcacca 18259492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 618 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 34952020 - 34951847
Alignment:
Q  618 atatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 717  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  34952020 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagtcttactacatgaattactattgatca 34951921  T
Q  718 ttaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  34951920 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 34951847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 572 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 24823395 - 24823194
Alignment:
Q  572 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgt 671  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||| |||||| ||||| ||||        ||||||   |||||||||||||||| |||    
T  24823395 ttaagtgtaacaccccacaaagtataatactcaagattatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagatgccaacgataaaatagtacatgt 24823304  T
Q  672 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac 771  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  24823303 aagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaac 24823204  T
Q  772 ttttttaaaa 781  Q
    ||||||||||    
T  24823203 ttttttaaaa 24823194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 490 - 675
Target Start/End: Complemental strand, 41911079 - 41910895
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41911079 catcaaaaattcagtcaacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 41910980  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagt 675  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  41910979 aaagtgtaacacttaatactatcacatgatatcaccaactctgtttgcatgttaaaga-tgcaacgataaaatattacctgtaagt 41910895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 422 - 661
Target Start/End: Original strand, 43025733 - 43025972
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||  |||| ||| |||| ||| |||| ||| ||  |||| |||||||||||  || ||||||||||| |  ||| ||||||||     
T  43025733 ttttatggtgaagttaacgatatagtatcaaaagtgttgtgattaataccccactctttgtacaatggtattaaaagttcagttcatataatatcatcaa 43025832  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 621  Q
    ||||| ||| ||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43025833 ttcatcagactaagaagaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaactgtaacaccccacaaaatgtaacacttaaaactatcacataatat 43025932  T
Q  622 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaa 661  Q
    |||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  43025933 catcaactctgattgcatgttaaagatgtcaacgataaaa 43025972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 652 - 787
Target Start/End: Original strand, 33198063 - 33198198
Alignment:
Q  652 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33198063 aacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcatcactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaa 33198162  T
Q  752 acaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
     || |||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  33198163 tcattaagattaagattaactttttcaaaaaagtca 33198198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 583
Target Start/End: Original strand, 41362517 - 41362707
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||| |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||  |||| |||||| | |||    
T  41362517 ggaaaattctatggtgaagttatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactagcata---aaaatgtagtgagtaacaccccactatttgtatagtga 41362613  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || |||| || |||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  41362614 catcaaaagttcagacctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactaaacttgatataattttatcataccttgttttaagtgtaaca 41362707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 389 - 584
Target Start/End: Complemental strand, 34952223 - 34952028
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||| || ||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  34952223 aggaaaattctatagtaaagtcattaaaatgacttttctggtcaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacagcccactgtttgtacagtg 34952124  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||    
T  34952123 acatcaaaagttcagtccctttagtatcatcaattcatcaaattaataagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacac 34952028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 692 - 804
Target Start/End: Original strand, 41362723 - 41362835
Alignment:
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  41362723 attactagatgaattactattgatcattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 41362822  T
Q  792 tttgactacacca 804  Q
      ||||| |||||    
T  41362823 cctgactgcacca 41362835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 4133199 - 4133077
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||  ||| |||| ||  ||||||||| || | |||||||||||| ||     
T  4133199 ggaaaattttatggtcaagtcatcagaatgacttttttggtgaagttaacactagcataaaaaagat--agtgagtaatacctgactgtttgtacagtgg 4133102  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagta 514  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4133101 catcaaaagttcagtcctcatagta 4133077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 621 - 712
Target Start/End: Original strand, 34463704 - 34463792
Alignment:
Q  621 tcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 712  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34463704 tcatcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacctataagtcc---atgttgcaagcattactaaatgaattactatt 34463792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 691 - 783
Target Start/End: Original strand, 43025974 - 43026066
Alignment:
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| |||||    
T  43025974 cattattagataaattactattgatcatgaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttcaaaaa 43026066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 591 - 668
Target Start/End: Original strand, 7998478 - 7998555
Alignment:
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacc 668  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||  || ||||||||   |||||||||||||||||    
T  7998478 aagtgtaacacttaatactatcacataatatcaacaactctgtttctatattaaagatgccaacgataaaatagtacc 7998555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 584
Target Start/End: Original strand, 7998401 - 7998488
Alignment:
Q  498 gttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||| |||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  7998401 gttcggtccccataatatcatcaatacatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac 7998488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 455
Target Start/End: Original strand, 15009241 - 15009306
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaa 455  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15009241 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaa 15009306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 572 - 628
Target Start/End: Original strand, 12585297 - 12585353
Alignment:
Q  572 ttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  12585297 ttaagtgtaacaccccacaaaatctaacacttaatactatcacataacatcatcaac 12585353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24823465 - 24823399
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaa 454  Q
    |||||||||  |||||| |||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24823465 aaggaaaatactatggtaaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaa 24823399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4108963 - 4108912
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||||    
T  4108963 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtaaagttaa 4108912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 445
Target Start/End: Original strand, 33197891 - 33197946
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactata 445  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| ||||||    
T  33197891 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataatttttctgattaagttaatactata 33197946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 490 - 545
Target Start/End: Original strand, 33197948 - 33198003
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacac 545  Q
    ||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  33197948 catcaaaagttcagtctccataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacac 33198003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 744 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 41910895 - 41910852
Alignment:
Q  744 tgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41910895 tgaatcaaacattcagattaaaattaacttttttaaaaaagtca 41910852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 430
Target Start/End: Original strand, 7998361 - 7998402
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggt 430  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7998361 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggt 7998402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 38110352 - 38110401
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||||||    
T  38110352 aggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgatgaagttaa 38110401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 388 - 798
Target Start/End: Original strand, 18797302 - 18797710
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  18797302 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaat 18797399  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |    
T  18797400 gacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacacctc 18797499  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797500 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 18797599  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797600 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 18797699  T
Q  788 gttttttgact 798  Q
    ||||| |||||    
T  18797700 gttttctgact 18797710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 388 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 32821241 - 32820846
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32821241 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaat 32821142  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  32821141 ggcatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacagttaatttagttttatcctaccttgttttaagcgtaacacccc 32821042  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  32821041 ataaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgc 32820942  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32820941 aagcattactagatgaattactattaatcattcatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaa 32820846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 386 - 787
Target Start/End: Original strand, 30055497 - 30055899
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctgg-tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| | | |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  30055497 aaaaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgactttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 30055596  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||    
T  30055597 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacac 30055696  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30055697 cctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 30055796  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| | |||||||    
T  30055797 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaag 30055896  T
Q  785 tca 787  Q
    |||    
T  30055897 tca 30055899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 389 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 31579256 - 31578836
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttg-----ta 483  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||      ||    
T  31579256 aggaaaattctatggtgaagtcataagaataatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttaatttata 31579157  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||    
T  31579156 caatgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataaca 31579057  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31579056 ccctataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatg 31578957  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31578956 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaataatttaaaaatgaatcaaacaataaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 31578857  T
Q  784 gtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||||||||  ||||| |||||    
T  31578856 gtcagtttcctgactgcacca 31578836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 390 - 803
Target Start/End: Original strand, 37109847 - 37110262
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  37109847 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 37109946  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatctta--ccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||    
T  37109947 catcaaaagttcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacacccc 37110046  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37110047 acaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 37110146  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||| |||    
T  37110147 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaaatca 37110246  T
Q  788 gttttttgactacacc 803  Q
     ||| |||||| ||||    
T  37110247 atttcttgactgcacc 37110262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 9356014 - 9355611
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  ||  || ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |    
T  9356014 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgaccattttggtgaatttaacactatagcataaaaaatgtagtgagcaataccccactgtttgtacagt 9355915  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||| | | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  9355914 gacatcaaaagtttagttctcatattatcgttaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttcatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 9355815  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9355814 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgc 9355715  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9355714 aagcattactagatgaattgctattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 9355615  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  9355614 gttt 9355611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 388 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 17842774 - 17842357
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||    
T  17842774 aaggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaat 17842675  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatctta--ccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    ||||||||||| |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  |||| || ||||||||||| |    
T  17842674 gacatcaaaagctcagtcattataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctataccttgttataagcgtaacatc 17842575  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17842574 ccacaaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 17842475  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||    
T  17842474 gcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttccaaaaaagt 17842375  T
Q  786 cagttttttgactacacc 803  Q
    || ||| |||||| ||||    
T  17842374 caatttcttgactgcacc 17842357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 385 - 791
Target Start/End: Original strand, 24211711 - 24212118
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   ||||||| ||     
T  24211711 aaaaaagaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctactgtttatag 24211810  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||     
T  24211811 aatggcatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacat 24211910  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24211911 cctacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgt 24212010  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24212011 tgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 24212110  T
Q  784 gtcagttt 791  Q
    ||||||||    
T  24212111 gtcagttt 24212118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 392 - 798
Target Start/End: Original strand, 23111167 - 23111575
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  23111167 aaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatattgtgagtaacacaccactatttgtacaatggca 23111266  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatct--taccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||  | || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||| || ||||||||||||||||||||    
T  23111267 tcaaaagttcaaccatcgtagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatatcatactttgttttaagcgtaacaccccac 23111366  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||    
T  23111367 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataacaacgataaaatagtacatgtaaatcaaagatgttgaaa 23111466  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23111467 gcattactagaagaattactattgatcataaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaagttaacttttttaaaaaagtcagt 23111566  T
Q  790 tttttgact 798  Q
    ||| |||||    
T  23111567 tttctgact 23111575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 21991610 - 21992003
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21991610 aggaaaattctagggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtacagtg 21991709  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  21991710 tcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 21991809  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21991810 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 21991909  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||||     |||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||    
T  21991910 agca-----agatgaattactattgatc----atcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaccttttcaaaaaagtcag 21992000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 390 - 787
Target Start/End: Original strand, 27283719 - 27284118
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  27283719 ggaaaattctatggtgaagttataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatga 27283818  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  27283819 aatcaaaagttcagtcctcatagtattatcaatttatcagattaacaagactatacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 27283918  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27283919 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatattatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 27284018  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacaataagatcaaaattaa-cttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||||||||    
T  27284019 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaatcttttcaaaaaaagtca 27284118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 390 - 804
Target Start/End: Original strand, 7334769 - 7335182
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||| ||||||  |||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7334769 ggaaaattctacggtgaagtcgtgagaatgacttttttgatgaagttaacactataacataaaatatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatga 7334868  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  7334869 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 7334968  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7334969 agagtgtaacacttaagattatcagataatatcatcaac-tagtttgaatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaa 7335067  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |    
T  7335068 gcattactagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaat 7335167  T
Q  790 tttttgactacacca 804  Q
    ||  ||||| |||||    
T  7335168 ttcctgactgcacca 7335182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 32432431 - 32432828
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |     ||||||| |||||||||||  || |||||||||||||    
T  32432431 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatca-----aaaatgttgtgagtaacaccccattgtttgtacaatg 32432525  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  32432526 acatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacagttaatataattttatcctaccttattttaagtgtaacacccca 32432625  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  32432626 caaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacactgtttgcatattaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgca 32432725  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32432726 agcattactagatgaattattattaatcatgaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaagtaacttttttaaaaaagtcag 32432825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15612944 - 15612544
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||  |||  ||||||||||  || |||||||| | ||     
T  15612944 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaataacgtttcttgtgaagttaacactataacatcaaag-tgttatgagtaacaccccagtgtttgtagagtgg 15612846  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15612845 catcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 15612746  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15612745 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaa 15612646  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  15612645 gcattactagatgaattattgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttaaaaaaagtcagt 15612546  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  15612545 tt 15612544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 37346997 - 37347397
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  | |||| |||||||||||| ||||||  || |||||| || ||||||||||  || |||||||||| |||    
T  37346997 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtacagtga 37347096  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || ||||    
T  37347097 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaatttattaaattaacaggactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccac 37347195  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37347196 aaagtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaa 37347295  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37347296 gcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagt 37347395  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  37347396 tt 37347397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 430 - 804
Target Start/End: Original strand, 10481619 - 10481994
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |    
T  10481619 tgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacacccccactgtttgtacaatgacatcaaaaattcagtctttatagtatcatcaattcatca 10481718  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10481719 gattaacaagactacgcttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 10481818  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 728  Q
    | | ||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  10481819 tctctttgcatgtcaaagattccaacaataaaatagtatccgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgatcgttaatcagtaa 10481918  T
Q  729 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    | |||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  10481919 ttaacaatttaaaaataaattaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgactgcacca 10481994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 390 - 792
Target Start/End: Original strand, 4582894 - 4583296
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4582894 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaatactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 4582993  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  4582994 catcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacaccccac 4583093  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  4583094 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgatcaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaa 4583193  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  4583194 gcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtcatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaat 4583293  T
Q  790 ttt 792  Q
    |||    
T  4583294 ttt 4583296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 8861260 - 8861661
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||  || |||| |||  ||| ||||||  ||||||||||||| ||     
T  8861260 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgcgaagttaacactatagcatcaaaagtgttatgaataacaccccactgtttgtacagtgg 8861359  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  8861360 catcaaaagttaagtccccatagtatcatcaattaatcagattaacaacaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccgc 8861459  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||     
T  8861460 aaagtgtaacactcaagaccatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcat 8861559  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  8861560 gcattactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacactaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 8861659  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  8861660 tt 8861661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 392 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 25691729 - 25691337
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaac-acatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||  || |||||||||||||| || |    
T  25691729 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctcgtgaagttaacactataacatcaaaagtattgtgagtaattacctcactgtttgtacagtggc 25691630  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||| | |||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  25691629 atcaacagttcagttcttatagtattatcaattcatcatattaacaaaaatacatttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccaca 25691530  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||  || ||||||| ||| |||||||||     
T  25691529 aagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgttaacgataaaataacacatgtaagttcaaaatgttgcaaa 25691430  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25691429 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaattttttaaaaaa 25691337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 5657667 - 5657265
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  5657667 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 5657568  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||||    
T  5657567 catcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcatattaacaaaaatacacttaatttaattttatcctactttgttttaagtgtaacagcccac 5657468  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  5657467 aaagtgtaatacttaagactatcgcatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaa 5657368  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaat-aagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||| ||||| |||||    
T  5657367 gcattactagatgaattactattgatcattaatgagtaatcaaaaatttaaaaatgaataaatcattaaagattaaaattaactttttcaaaaatgtcag 5657268  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  5657267 ttt 5657265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 388 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 41765266 - 41764867
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| | |||| || ||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  |    
T  41765266 aaggaaaattccatggtgaagtcatgagaatgacttttctgataaagtcaatactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggt 41765167  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||   |||||| ||||||| ||||||||||    
T  41765166 ggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttactctaccttgttttaagtgtaacacccc 41765067  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  41765066 agaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagattttgc 41764967  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  41764966 aagcattactggatgaattattattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaccgaacattaagatcaaaattaaccttttcaaaaaagtca 41764867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 10359400 - 10358999
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||   ||||  || |||| ||||||||||||||    ||| ||| |||| |||    
T  10359400 ggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtaaaattaatcttatagcatcaaaagtgtagtgagtaacatcctactatttatacagtga 10359301  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaa-tctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  10359300 catcaaaagttcagtc-tgatagtatcatcaattcatcagatcaacaagactacacttaaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacacccca 10359202  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  10359201 caaagtgtaacacttaagactatcacataacaacatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaattagtacttgtaagtccaagattttgca 10359102  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  10359101 agcattactaaatgatttactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatgatcaaaattaactttttcaaaaaagttag 10359002  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  10359001 ttt 10358999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 6546494 - 6546895
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| | |    
T  6546494 ggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttctagtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtaa 6546593  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| | |   ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6546594 catcaaaagtttactatccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 6546693  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||| |||||||||| | |||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  6546694 aaagtataacacttaatattatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgaggcaa 6546793  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  6546794 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 6546893  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  6546894 tt 6546895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 392 - 770
Target Start/End: Original strand, 11071182 - 11071558
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||   | |||| |||| ||||||  ||||||  || |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  11071182 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgtatttttttggtaaagttagtactatatcatcaaaaatatagcgagtaacactccactgtttgtacagtgac 11071281  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  11071282 atcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaacactacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccaca 11071381  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  11071382 aagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgttcgcatgttaaaga---caacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgcaaa 11071478  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa 770  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  11071479 cattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaa 11071558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 420 - 798
Target Start/End: Original strand, 29173545 - 29173905
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29173545 acttttctggtgaagttaacactgtagtatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 29173644  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    | ||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||                 ||| ||||||||||||||||||||||    
T  29173645 aattcatcaaactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaag-----------------tgttacacttaagactatcacataat 29173727  T
Q  620 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 719  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29173728 atcatcaactctgtttgcatgttaaa-atgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatg 29173826  T
Q  720 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgact 798  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  29173827 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttttctgact 29173905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 406 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 48928466 - 48928081
Alignment:
Q  406 aagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 505  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||  || ||||||||||||||||    
T  48928466 aagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgccatcaaaagttcagtc 48928367  T
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| || |||||||||  |||||    
T  48928366 c-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacctcagaaagtgtaatgcttaa 48928268  T
Q  606 gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 705  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48928267 gactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgatgaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaat 48928168  T
Q  706 tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttt 792  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  48928167 tactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacatttagatcaaaattaatttttttaaaaaagtcaatttt 48928081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31520909 - 31520526
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||    
T  31520909 ggaaaattttatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacactccattgtttgtacagtga 31520810  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||                 
T  31520809 catcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttttaag------------- 31520724  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31520723 ----tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 31520628  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  31520627 gcattactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagt 31520528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 404 - 783
Target Start/End: Original strand, 22687228 - 22687599
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||  |||||||||||||    
T  22687228 tgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtggtatcaaaagttcag 22687327  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  22687328 tccccatagtatcatcaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactc 22687427  T
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    ||||||||| ||| |||||| |||||         |||||| |||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22687428 aagactatctcatgatatcaacaact--------ctgttaaggatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattaatagatga 22687519  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22687520 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcatacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 22687599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 476 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 37703590 - 37703270
Alignment:
Q  476 tgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaa 575  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||||        ||||| |||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  37703590 tgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtctccatagtatcatcag--------attaataagactacacttaatctaattttatcatatcttattttaa 37703499  T
Q  576 gcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagt 675  Q
    | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  37703498 gtgtaacatcccacaaagtgtaccacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagt 37703399  T
Q  676 ccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 775  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37703398 ccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 37703299  T
Q  776 ttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    | |||||||||| |||  ||||| |||||    
T  37703298 tcaaaaaagtcaatttactgactgcacca 37703270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 391 - 686
Target Start/End: Original strand, 38258521 - 38258816
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  38258521 gaaaattctacggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtttgtacaatgac 38258620  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  38258621 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccaca 38258720  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38258721 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 38258816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 389 - 705
Target Start/End: Original strand, 43686015 - 43686330
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  43686015 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgactttttgggtgaagttaacactataatatcaaaaatgttgtgagtaacacc-cactgtttgtacaatg 43686113  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  43686114 gcatcaaaagttcagtccctatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 43686213  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  43686214 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgca 43686313  T
Q  689 agcattactagatgaat 705  Q
    ||||||||| |||||||    
T  43686314 agcattactggatgaat 43686330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 390 - 746
Target Start/End: Original strand, 12165727 - 12166074
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||| | | ||  ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  12165727 ggaaaattctacggtgaagtcgttaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatccaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 12165826  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| |||||    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12165827 catcaaaagttaagtcccttaagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 12165926  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||         |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  12165927 aaagtgtaacact---------cacataatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaa 12166017  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatga 746  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12166018 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatga 12166074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 508 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15672830 - 15672544
Alignment:
Q  508 catagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaga 607  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15672830 catagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccacaaagtgtaacacttaaga 15672731  T
Q  608 ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa---aatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaa 704  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||   ||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15672730 ctatcacataatatcatcaactctatttgaatgttaaagatgccaacgataaaataatagtacctgtaagtccaaaatgttgcaagcattactagatgaa 15672631  T
Q  705 ttactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15672630 ttactattgatcatgcatcaataatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaggttaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 15672544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 479 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 46481218 - 46480914
Alignment:
Q  479 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcg 578  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||        |||||||||| || |||| || |||||||||  ||| || ||||||| |    
T  46481218 ttgtacaatgacatcaaaaattcaatccccatagtatcatcag--------attaacaagactatacttgatgtaattttattctacattgttttaagtg 46481127  T
Q  579 taacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcca 678  Q
    ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |    
T  46481126 taacatctcataaagtgtaacacttaagactatcacataatatcattaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtcta 46481027  T
Q  679 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta 778  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| |    
T  46481026 agatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaataaaacattaagatcataattaactttttca 46480927  T
Q  779 aaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||    
T  46480926 aaaaagtcagttt 46480914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 427 - 820
Target Start/End: Original strand, 35353120 - 35353517
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagtt-cagtcctcatagtatcatcagttca 525  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  || ||||||||| |||  |||||||||| | |||| |||||||||| || ||||    
T  35353120 tggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccattgtttgtacgatggaatcaaaagtttctgtccccatagtatcaccaattca 35353219  T
Q  526 ttagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 625  Q
    | |||||||||||| | || ||| |  |  |    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35353220 tcagattaacaagactgca-ttactagatgtaacacttaccttgttttaagtgtaacaccccagaaaatgtaacacttaagactatctcataatatcatc 35353318  T
Q  626 aactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcac 725  Q
    |||| | |||||||||||||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  35353319 aactatatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatcactattgatcattaatcag 35353418  T
Q  726 taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc----aagctcccaaaataaaa 820  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||    |||||||||||||||||    
T  35353419 caatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcaccttagaagctcccaaaataaaa 35353517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 429 - 776
Target Start/End: Original strand, 43925120 - 43925456
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||| ||||||||||| |||||||    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  | || |    
T  43925120 gtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacacctcactgt----acaatgacatcaaaagttcagtctacatagtatcatcaact-atca 43925214  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    || |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||| || ||| |||||| || |||||||||||||||||||    
T  43925215 gactaacaataatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgcaacacctcacaacgtttaatacttaatacaatcacataatatcatcaac 43925314  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 728  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  43925315 tctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatac------gtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcactaa 43925408  T
Q  729 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 776  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  43925409 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 43925456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 168; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 385 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 12390821 - 12390438
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||   |||||||||| |    
T  12390821 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcatcagatcgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgtaatgagtaacatcccactgtttgtgc 12390722  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | ||||||||||||||  |||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||            
T  12390721 agtgacatcaaaagttatgtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttcttttaag-------- 12390630  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
             ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  | |||||||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12390629 ---------tgtaacacttaagact--cacataatatcatcaactcagcttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 12390541  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12390540 tgcaaccattactagatgaattactatttatcattaatcagtaattgacaatttaaaaatgaaataaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaag 12390441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 420 - 791
Target Start/End: Original strand, 26980328 - 26980682
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  26980328 acttttatggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacggtttgtacagtggcatcaaaagttcagtccccataatatcatc 26980427  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||                 ||||||||||||||||||||||| ||    
T  26980428 aattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagactatcacatgat 26980510  T
Q  620 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 719  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||    
T  26980511 atcagcaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagtattactagatgaattattgttgatcatt 26980610  T
Q  720 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26980611 aatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 26980682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 391 - 721
Target Start/End: Complemental strand, 33688446 - 33688117
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||    ||||||||| || || |    
T  33688446 gaaaattatatggtgaagttatgagaatgacttttctggt-aagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacatcctactgtttgtccagtggc 33688348  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||| |    
T  33688347 atcaaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcatactttgttttaagtgtaacactccata 33688248  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    |||||||||| | |||||||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33688247 aagtgtaacattcaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcaagttaaagatgtcaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 33688148  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaa 721  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33688147 cattactagatgaattgctattgatcattaa 33688117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 534 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 26588126 - 26587877
Alignment:
Q  534 acaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgt 633  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  26588126 acaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactcaagactatcacatgatatcaacaactctgt 26588027  T
Q  634 ttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaac 733  Q
    |        ||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26588026 t--------aaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaggcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaac 26587935  T
Q  734 aatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26587934 aatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 26587877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 391 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 48928748 - 48928473
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  |||| |||||||  || |    
T  48928748 gaaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactatttgtacggtgcc 48928649  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| || |    
T  48928648 atcaaaagttcagtcc-catagtattatcaattcatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctacattattttaagtgtaacacctcaga 48928550  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtac 667  Q
    ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||    
T  48928549 aagtgtaatgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtac 48928473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 490 - 791
Target Start/End: Original strand, 44598741 - 44599042
Alignment:
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| |||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44598741 catcaaaaattcaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccac 44598840  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  44598841 aaagtgtaacacctaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaataatacatgtaagtctaagatgttacaa 44598940  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatc---actaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||   | ||||||||||||| |||||||||||| |  |||||| |||||||| ||||| |||||| ||    
T  44598941 gcattactagatgaa--actattgatcattaatcaataataatcaacaattt-aaaatgaatcaatcgttaagattaaaattaattttttcaaaaaaatc 44599037  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  44599038 agttt 44599042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 392 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 27421563 - 27421313
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| ||| ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27421563 aaaattctatggtgaagtcgtgataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatgaca 27421464  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||| | || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27421463 tcaaaagttcagtcct-ataatatcataaatttatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacatcccacaa 27421365  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgtta 643  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||| ||||| |||||||||||||    
T  27421364 agtgtaacacttaagactatcgtatgatatcagcaactctgtttgcatgtta 27421313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 607 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 44411509 - 44411312
Alignment:
Q  607 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 706  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44411509 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatattatctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 44411410  T
Q  707 actattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||  |||||||| |||||  ||||| |||||    
T  44411409 aatattgaccattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatgaaacattaagatcataattaacctttccaaaaaagttagtttcctgactgcacca 44411312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 591 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 32593191 - 32592996
Alignment:
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||     
T  32593191 aagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgttaaaatagtacatgtaagtccaagatgttacaaa 32593092  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
     |||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32593091 tattactagataaattactatggatcattaatcagcaatcaacaattt-aaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 32592996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 499 - 645
Target Start/End: Original strand, 37704241 - 37704387
Alignment:
Q  499 ttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaa 598  Q
    |||||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37704241 ttcagtccccatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaa 37704340  T
Q  599 cacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaa 645  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37704341 cacttaagactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa 37704387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 620 - 804
Target Start/End: Original strand, 37704387 - 37704571
Alignment:
Q  620 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 719  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37704387 atcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagcattaccagatgaattactattgatcatt 37704486  T
Q  720 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| ||||  ||||  |||||||||| |||  ||||| |||||    
T  37704487 aattagtaatcaacaatttacaaatgaatcaaacattaaaatcaagattagtttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacca 37704571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 422 - 705
Target Start/End: Original strand, 38053493 - 38053751
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||     
T  38053493 ttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatgtaatgagtaaaaccctactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagttctcatagtgtcatcaa 38053592  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 621  Q
            |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || ||||                 ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38053593 --------attaacaagactacacttaatctaattttatcatactttgttataag-----------------tgtaacacttaagactatcacataatat 38053667  T
Q  622 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 705  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  38053668 catcaactctatttggatgttaaagattccaacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaacattatttgatgaat 38053751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 430 - 604
Target Start/End: Complemental strand, 44413525 - 44413351
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattag 529  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| ||| ||||||||||| |||  ||||||||| ||| ||||| |     
T  44413525 tgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacaccccaatgtttgtacactgaaatcaaaagttcggtctccatagtatcttcaattcatcaa 44413426  T
Q  530 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactta 604  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44413425 attaacaaggctacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacactta 44413351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 631 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 34362123 - 34361967
Alignment:
Q  631 tgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatc 730  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||     
T  34362123 tgtttgcatgttaaaaatatcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattgcaaacattactagatgaattacttttgatcattaatcagtcatt 34362024  T
Q  731 aacaatttaaaaatgaatcaaacaat-aaga-tcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  34362023 aacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagatttaaaattaactttttcaaaaaagt 34361967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 388 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 26524515 - 26524363
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||  || ||||||| || |    
T  26524515 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgatgttaacactataacatcaaaaatgttgtgactaacactccattgtttgtgcagt 26524416  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagat 540  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||| || || | |||||||||||    
T  26524415 ggcatcaaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcatattaacaagat 26524363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 703 - 803
Target Start/End: Original strand, 38258867 - 38258967
Alignment:
Q  703 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacac 802  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||    
T  38258867 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttttctgactgcac 38258966  T
Q  803 c 803  Q
    |    
T  38258967 c 38258967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 390 - 520
Target Start/End: Complemental strand, 34362334 - 34362205
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||| | |||||||  |||||||| |  ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  34362334 ggaaaattctatggtgaaattatgagaatgacttttctaggaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 34362235  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 520  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  34362234 catc-aaagttcagttctcatagtatcatca 34362205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 437 - 576
Target Start/End: Complemental strand, 32593327 - 32593189
Alignment:
Q  437 aacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaaca 536  Q
    |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| ||    
T  32593327 aacactatagcattaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatatggtggtatcaaaagttcagtc-tcacagtatcatcaattcatcagattatca 32593229  T
Q  537 agattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 576  Q
    | | | || |||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  32593228 aaactgcatttaatctaattttatcataccttgttttaag 32593189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 741 - 791
Target Start/End: Original strand, 12166215 - 12166265
Alignment:
Q  741 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12166215 aaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagttt 12166265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 456
Target Start/End: Original strand, 8299192 - 8299256
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaat 456  Q
    |||||| ||||||||||||| || ||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  8299192 aaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaat 8299256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 658 - 722
Target Start/End: Complemental strand, 27421283 - 27421219
Alignment:
Q  658 aaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaat 722  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  27421283 aaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaatgttacaagatgaaataatattgatcattaat 27421219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 768 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 23402083 - 23402047
Alignment:
Q  768 taacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23402083 taacttttttaaaaaagtcagttttttgactgcacca 23402047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23402419 - 23402371
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  23402419 ggaaaattctatggcgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 23402371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 392 - 438
Target Start/End: Original strand, 3953733 - 3953779
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3953733 aaaattctatgatgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 3953779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 384 - 438
Target Start/End: Original strand, 4902334 - 4902388
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||| ||||||| ||||    
T  4902334 taaaagggaaaattttatggtgaagtcatgaaaataatttttttggtgaatttaa 4902388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 40381938 - 40381988
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  40381938 aaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaa 40381988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 424 - 470
Target Start/End: Original strand, 44598373 - 44598419
Alignment:
Q  424 ttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  44598373 ttctcgtgaagttaatactataatatcaaaaatgttgtgagtaacac 44598419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 750 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33688118 - 33688077
Alignment:
Q  750 aaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33688118 aaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 33688077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 392 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 46297945 - 46297534
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |     
T  46297945 aaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatatagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcg 46297846  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46297845 tcaaaagttcagtccccgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatcaaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 46297746  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46297745 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaagc 46297646  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46297645 attactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 46297546  T
Q  792 tttgactacacc 803  Q
    ||||||| ||||    
T  46297545 tttgactgcacc 46297534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 40552445 - 40552043
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  40552445 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggagaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatg 40552346  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||    
T  40552345 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaacactacacttaatttaattttatcttagcttgttataagcgtaacatccca 40552246  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  40552245 caacgtgtaacacttaggattgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccatgatgttgca 40552146  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40552145 agcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 40552046  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  40552045 ttt 40552043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 389 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 26941446 - 26941032
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| | || ||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  26941446 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataaaatcaaaattataatgagtaacaccccactgtttgtataatg 26941347  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| ||    
T  26941346 acatcaaaagttcagtcctcatggtatcattaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaatacctca 26941247  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
     |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26941246 taaagtgtaacacttaaaactatcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 26941147  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26941146 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcgttaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 26941047  T
Q  789 ttttttgactacacc 803  Q
    |||| ||||| ||||    
T  26941046 ttttctgactgcacc 26941032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 388 - 787
Target Start/End: Original strand, 48354930 - 48355329
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||    
T  48354930 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttatggtgaagttaacactataatattaaaaatgtaatgagtaacaccccattgtttgtacaat 48355029  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||| || |||  ||||||  ||    
T  48355030 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttagtctaattttatcctaccttgttataaatgtaacatacc 48355129  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  48355130 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgc 48355229  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48355230 aagtattactagatgaattattattgatcattaatcagtaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 48355329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 436 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 42506214 - 42505863
Alignment:
Q  436 taacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaac 535  Q
    ||||||||||| || |||| |||| ||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  42506214 taacactataacatcaaaattgtaatgagtaataccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaac 42506115  T
Q  536 aagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgttt 635  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  42506114 aagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttc 42506015  T
Q  636 gcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaa 735  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42506014 gcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaa 42505915  T
Q  736 tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42505914 tttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtca 42505863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 37203058 - 37203460
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  | |||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||     
T  37203058 ggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgg 37203157  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||| ||||||||    
T  37203158 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttttagtgtatcaccccac 37203257  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact-ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  37203258 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacctgtaagtccaatatatcgca 37203357  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37203358 agcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 37203457  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  37203458 ttt 37203460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 389 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 52041109 - 52040707
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcac-tgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| || |||| ||||||||||||| |  ||  |||||||| | |    
T  52041109 aggaaaattctgaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaatactataacatcaaaagtgtagtgagtaactccccaaatgtttgtatagt 52041010  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||    
T  52041009 ggcatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccc 52040910  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52040909 acatagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 52040810  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    || ||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  52040809 aaacattactagatgaatgattattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 52040710  T
Q  788 gtt 790  Q
    |||    
T  52040709 gtt 52040707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 384 - 783
Target Start/End: Original strand, 47481507 - 47481907
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||||||||||    
T  47481507 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcataggaatgatgtttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgta 47481606  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
     |||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||| |||||    
T  47481607 gaatgacatcaaaagtttagccctcatagtatcatcaattcatcatgttaacaagactacacttaatataattttattataccttattctaagcataaca 47481706  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  47481707 ccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatattaaagatttcaacgataaaatagtacttgtaagttcaagatg 47481806  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 782  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||    
T  47481807 ttgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaa 47481906  T
Q  783 a 783  Q
    |    
T  47481907 a 47481907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 385 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 53229343 - 53228937
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-tcactgtttgta 483  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||  | |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||||||||| |||||  ||| ||||||||    
T  53229343 aaaaagaaaaattttaaggtgaagtcatgaaaattatttttctggtgaaattaacactatagcatcaaaagtgtagtgagcaacaccctcaatgtttgta 53229244  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    || |  |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||     
T  53229243 cagttgcatcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacagttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaact 53229144  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  53229143 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacatagtatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagttcaagatg 53229044  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||    
T  53229043 ttgcaagcattactagatgaattagtattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaa 53228944  T
Q  784 gtcagtt 790  Q
     ||||||    
T  53228943 atcagtt 53228937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 37157699 - 37158100
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||   ||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||| ||||| ||     
T  37157699 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggcttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtt-gtacagtgg 37157797  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37157798 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaatttataagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttatttcaagtgtaacaccccac 37157897  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact-ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  37157898 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatattgtttgtatgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaatatgtcgca 37157997  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37157998 agcattactagatgaattaccattgatcattaatgagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 37158097  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  37158098 ttt 37158100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 4015451 - 4015851
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||   |||||||||| | |||    
T  4015451 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtagagtga 4015550  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| || | ||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||    
T  4015551 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatataattagtctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccac 4015650  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4015651 aaagtgtcacacttaagactatcgcattgtatcaacaactt-gtttgcatgttaaagatgccaacggtaaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 4015749  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4015750 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 4015849  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  4015850 tt 4015851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 380 - 752
Target Start/End: Original strand, 34132916 - 34133288
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||||||||||||| |||  |||||||| || ||  |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||  |||||||    
T  34132916 ttaataaaaaggaaaattctataatgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaaattaacactatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtt 34133015  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  34133016 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcagactaataagaatacacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgt 34133115  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34133116 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 34133215  T
Q  680 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34133216 gatgttgcaagcattactagatgaattactagtaatcatgaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 34133288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 39282642 - 39283044
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||| | || |||||||||||| || |||| ||| |||||||| ||  |||||||| |||| |    
T  39282642 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttctgataaaattaacactataacatcaaaactgt-gtgagtaataccccactgtttatacagt 39282740  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||    
T  39282741 ggcatcaaaagttcagttctcatattatcatccattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccc 39282840  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||    
T  39282841 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcctgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctgtaaatccaaaatgttgc 39282940  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39282941 aagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 39283040  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  39283041 gttt 39283044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 388 - 785
Target Start/End: Complemental strand, 4761838 - 4761438
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct--ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||   |||||| |  ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  4761838 aaggaaaattctatggtgaattcatgagattgacttttttttggtgaagttaatactataatatcaaaaatgtaatgagtaacacttcactgtttgtaca 4761739  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||  |||||||    
T  4761738 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatctgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtataacacc 4761639  T
Q  586 cc-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||   || |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4761638 cccacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatcaactatatttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctataagtccaaaatgt 4761539  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  4761538 tgcaaacattaccagatgaattactattaatcattaatcagaaatcaacaatttgaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaag 4761439  T
Q  785 t 785  Q
    |    
T  4761438 t 4761438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 389 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 3655388 - 3654982
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||  |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  3655388 aggaaaattttatggtgaagtcataaaaatgacttttttgataaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 3655289  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||    
T  3655288 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttagaagcgtaacacacca 3655189  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||  | ||||||||||  || | ||||||||||||||||||    
T  3655188 caaaatgtaacacttaaaactatcacatgatatcatcagctctgtttgcatgttaaagattccatcgataaaataacacatataagtccaagatgttgca 3655089  T
Q  689 agcattactag--atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaat-gaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |    
T  3655088 agcattactagatatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaaatcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaat 3654989  T
Q  786 cagtttt 792  Q
    |||||||    
T  3654988 cagtttt 3654982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 21009992 - 21009585
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctg---gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  | |||| |    ||||| || ||||||||| || ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||     
T  21009992 aaggaaaattttatggtgaagttataagaatgatttttttttttgtgaatttgacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactatttgtag 21009893  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| || ||| || ||||| ||||||    
T  21009892 aatgacatcaaaagttcagccctcatattatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataacttgttctaagcataacac 21009793  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21009792 tctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacaatatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgt 21009693  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21009692 tgcaagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaa 21009593  T
Q  784 gtcagttt 791  Q
    ||||||||    
T  21009592 gtcagttt 21009585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 388 - 781
Target Start/End: Original strand, 22450957 - 22451350
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||||   |    
T  22450957 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactgtttgtatggt 22451056  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22451057 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccttaccttgttttaagtgtaacacccc 22451156  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22451157 agtaagtgtaacatttaacactatcgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 22451256  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa 781  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22451257 aagcattactagatgaattattattgatcattaatcagcaatcaaaaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaa 22451350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 400 - 791
Target Start/End: Original strand, 29099356 - 29099739
Alignment:
Q  400 atggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt 499  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  29099356 atggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgtcgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgacatctaaagt 29099455  T
Q  500 tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  29099456 tcagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcgtgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgta-- 29099553  T
Q  600 acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 699  Q
           ||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29099554 -------actttcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttgcaagcattactag 29099646  T
Q  700 atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29099647 atgaattaccattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaactttttcaaaaaaagtcagttt 29099739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 389 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 7327669 - 7327274
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa-cactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||  || | |||||||| |    
T  7327669 aggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttagtgaagttaaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattatttgtacagt 7327570  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||| |||  || ||||||||||    
T  7327569 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatttatttttatcctaccttctttctagtgtaacacccc 7327470  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  7327469 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgc 7327370  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  7327369 aagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaattattaagattaaaattaacttttttaaaaaa 7327274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 384 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33378973 - 33378569
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| |||||||  ||||||   ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||  || | ||||||    
T  33378973 taaaaaggaaaattctatggcaaagttatgagaatgactttt---gtgaagtcaacactatagtatcaaaagtgtagtgagtagtaccccaatatttgta 33378877  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |  |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  33378876 cggtgacatcaaaagttcagtccccatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaca 33378777  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
    |||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  33378776 ccccaagaagtgtaatacttaagactatcgcataatctcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatg 33378677  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  33378676 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaa 33378577  T
Q  784 gtcagttt 791  Q
    ||||||||    
T  33378576 gtcagttt 33378569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 21193595 - 21193999
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |   || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | |    
T  21193595 aaggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgttgaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtagagt 21193694  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||    
T  21193695 gacatcaaaagttcagtccccatggtatcattaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactcc 21193794  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    | ||||  |||||||||| |||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  21193795 ataaaggataacacttaaagactatcatatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagattctcacgataaaatagtagccgtaagttcaagatgttg 21193894  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21193895 caaccattactaaatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtc 21193994  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  21193995 agttt 21193999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 405 - 790
Target Start/End: Complemental strand, 11357535 - 11357166
Alignment:
Q  405 gaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| | |||||||||||||  | |||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  11357535 gaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtatagtgagtaacacccccactgtttgtacagttgcatcaaaagttcag 11357436  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||                 ||||||||||    
T  11357435 tcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttattttaag-----------------tgtaacactt 11357353  T
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11357352 aagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 11357253  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11357252 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagtt 11357166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 44891498 - 44891889
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||   ||||||         |     
T  44891498 ggaaaattatacggtgaagtcatgaaaatgactttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgt---------gg 44891587  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  44891588 catcaaaagtttagtccacatagtatcatcaattaatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacactccac 44891687  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  44891688 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctacaagtctaagatgttgcaa 44891787  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44891788 gcattactagatgaattactgttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 44891887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 422 - 804
Target Start/End: Original strand, 3362276 - 3362660
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || | |||| ||||||||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||     
T  3362276 ttttttggtgaagttaacactatagcatcagaaatatagtgagtaacatcccactatttgtacagtggcatcaaaagttcactcctcatggtatcatcaa 3362375  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacact--taatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    ||||| |  ||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3362376 ttcatcatgttaacaagactacactattaatctaattttatcctaccttattttaagtgaaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataac 3362475  T
Q  620 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 719  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3362476 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaattgtacttagaagtccaatatgttgcaagcattactggatgaattactattgatcatt 3362575  T
Q  720 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||| |||  ||||| |||||    
T  3362576 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcaatttcctgactgcacca 3362660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 390 - 783
Target Start/End: Original strand, 54505799 - 54506192
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||| |||||||   ||||  |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  || | ||| || |||||    
T  54505799 ggaaaattttatgatgaagtcgcaagaatgacttttttgttgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttatagaatga 54505898  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| | | |||  | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||| | ||    
T  54505899 catcaaaaattcag-cctcatagtatcataaatacatcgggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacactctac 54505997  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||  | ||||||||| |||||||||    
T  54505998 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatctactttatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatttataagtccaaaatgttgcaa 54506097  T
Q  690 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  54506098 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 54506192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 391 - 787
Target Start/End: Original strand, 25579731 - 25580127
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||  | ||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||| |||| |||||    ||| ||| |||| ||||    
T  25579731 gaaaattttatggttaagttatgagaatgatttttctggtgaagttaatactatagcatcaaaagtgttgtgaataacattctactatttatacagtgac 25579830  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||    
T  25579831 atcaaaagttcagtccccatattatcatcagtttattagattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgtttttagtgtaacaccccaca 25579930  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||  |||||| ||| || ||||| |||||||    
T  25579931 aagtgtaacacttaagactattacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaactgtacctataaatctaagatattgcaag 25580030  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  25580031 cattactagatgaattactattgatcattaatccgcaatcaacaatttaaaaatgaaccaatcattaagattaagattaacttttttaaaaaagtca 25580127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 459 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 24708231 - 24707892
Alignment:
Q  459 agtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacactta--atctaatt 556  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||   ||||||||    
T  24708231 agtgagtaacacctcactgt--gtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttttgatctaatt 24708134  T
Q  557 ttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacga 656  Q
    ||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||    
T  24708133 ttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaacaatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacga 24708034  T
Q  657 taaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaat 756  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  24708033 taaaatagtacatgtaagtccaagaagttgcaagcattattagataaattactattaatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatt 24707934  T
Q  757 aagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgact 798  Q
    || || |||||||||||||| |||||| ||| |||| |||||    
T  24707933 aaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcaattttctgact 24707892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 429 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 24489108 - 24488761
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |    
T  24489108 gtgaagttaagactatagtattaaaaatgttgtgagtaacattccactgtttgcacaatgacatcaaaagttcagtccccatattatcatcaattcatca 24489009  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24489008 gactaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacctcacaaggtgtaacacttaagactatcacacaatatcatcaac 24488909  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 728  Q
    | | ||||||||||||||||   ||| ||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||    
T  24488908 tctatttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtgtcagtaagttcaagatgttgcaagcattactagatgcattactattaatcatgaatcaataa 24488809  T
Q  729 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 776  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  24488808 tcaataatttaaaaatgaatcaaacattaatattaaaattaacttttt 24488761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 430 - 791
Target Start/End: Original strand, 2007964 - 2008331
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattag 529  Q
    ||||||||||||||||   | |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||    
T  2007964 tgaagttaacactatagcgttaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagttcaatccccatagcatcatcaattcatcag 2008063  T
Q  530 attaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 629  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  2008064 attaacaagaatatacttaatctaattttatcctacctcgttttaagtgta-cactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaact 2008162  T
Q  630 ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat-------taat 722  Q
     ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||       ||||    
T  2008163 ctgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaaataatattgatcattaatcagtaat 2008262  T
Q  723 cactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2008263 cattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 2008331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 513 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 22622780 - 22622502
Alignment:
Q  513 tatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatc 612  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22622780 tatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgtttcaagtgtaacaccccacaaagcgtaacacttaagactatc 22622681  T
Q  613 acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 712  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22622680 acataatatcatcaaatctgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactatt 22622581  T
Q  713 gatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  22622580 gatcattaatcagtaatcaactatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcagttt 22622502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 387 - 791
Target Start/End: Original strand, 32373460 - 32373861
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||||   | ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||| |  |||||||||||||     
T  32373460 aaagggaaattctatgatgaagtcatgagaatgacttttccaataaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaactc--cactgtttgtacag 32373557  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || ||||||||||||   ||  || ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  32373558 tggcatcaaaagttccaccccaatggtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 32373657  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  32373658 cacaaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatattaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttg 32373757  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||    
T  32373758 caagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaattt-aaaatgaattcatcaataagattaaaattaactttttcaaaaaattc 32373856  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  32373857 agttt 32373861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 392 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 43976068 - 43975664
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   |||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||| ||||||| ||||||    
T  43976068 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttttg---aagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactatttgtacgatgaca 43975972  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||| | |||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  43975971 tcaaaagtttaatcctcataatatcatcaattcatcagattaacaaaattgcacttaatctaattttatcttatcttgttttaagtgtaacaccccagaa 43975872  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact---ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||       ||| ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  43975871 agtgtaacact-------atcgcataatatcatcaactatgttgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtccaagattttgca 43975779  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||    
T  43975778 agcattactagatgaattaatattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaagattaattttttcaaaagagtcag 43975679  T
Q  789 ttttttgactacacc 803  Q
    |||| ||||| ||||    
T  43975678 ttttctgactgcacc 43975664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 11466814 - 11467202
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||| ||   || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  11466814 aggaaaattctatggtgaagtcttgagaatgacttttctgatgaagttaagactataacatcgcaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 11466913  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||    
T  11466914 gcatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccca 11467013  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||   ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11467014 caaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgtttaagataccaacgacaaaatagtacctgcaagtctaagatgttgca 11467113  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |       ||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  11467114 a-------tagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagaataaaattaactttttcaaaaaagtcag 11467199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 511 - 791
Target Start/End: Original strand, 33698265 - 33698545
Alignment:
Q  511 agtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 610  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33698265 agtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagacta 33698364  T
Q  611 tcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 710  Q
    || ||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  33698365 tcgcatgatatcggcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatattgcaagcattactagatgaattaata 33698464  T
Q  711 ttgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33698465 ttgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcagtcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 33698545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 388 - 746
Target Start/End: Complemental strand, 46994837 - 46994490
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||| | ||||  | |||| |||||||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||||||          |||||    
T  46994837 aaggaaaattctacggtgaagtcgtaagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaa-tgtaatgagtaacacat----------acaat 46994749  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| ||||| ||||    
T  46994748 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatatgattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagtgtaacgcccc 46994649  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46994648 acaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattatgtttgcatgctaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatattgc 46994549  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatga 746  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  46994548 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatga 46994490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 392 - 730
Target Start/End: Complemental strand, 54828883 - 54828546
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||| | || || |||| |||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||  ||| ||||  |||| ||||    
T  54828883 aaaattttatggtgaagtcataaaaataatttttttggtaaagttaacactataacataaaaa-tgtaatgagtaacaccccaccgtttaaacaacgaca 54828785  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||| |||| || |||||| ||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  54828784 tcaaaaattcattcttcatagcatcatcaattcatcatatgaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacatcccacaa 54828685  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54828684 agtgtaacacttaaaactatcaaataatatcatcaactatgtttgtatgttaaaaattccaactataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagc 54828585  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatc 730  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  54828584 attactagataaattactattgatcattaatcagtaatc 54828546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 393 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 22446247 - 22445849
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||||||  |||| |||||||| || ||    
T  22446247 aaattctacggtgaagtcatgaaaatgactttttttggtgaagttaacattatatcatcaaaaatatagtgagtaacaccccact-tttgtacagtggca 22446149  T
Q  492 tcaaaagttcagtcc-tcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||| ||||| | || || |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| | |||    
T  22446148 tcaaaagttcaaaccctcatagtatcatcaattcatcatataaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacactc-aca 22446050  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    | || ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  22446049 atgtataacactcaagactatcatataatatcatcaactatttttgcatattaaagataccaacgataaaatagtacctttaagtccaaaatgttgcaag 22445950  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  22445949 tattactggatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaatatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtcagtt 22445850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 548 - 803
Target Start/End: Original strand, 1089842 - 1090097
Alignment:
Q  548 aatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaag 646  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||||||||    
T  1089842 aatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataacatcaacaactctatttgcatgttaaag 1089941  T
Q  647 attttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatga 746  Q
    ||   |||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1089942 atgccaacgataaaatagtacat-taaatccaagattttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatga 1090040  T
Q  747 atcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  1090041 atcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttcctgactacacc 1090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 390 - 714
Target Start/End: Original strand, 45174494 - 45174821
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtg--agtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||| |||||||||||||| |    
T  45174494 ggaaaattttatggtgaagttgtgagaataacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgtgagtaacacttcactgtttgtacagt 45174593  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
      ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||| |    
T  45174594 agcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacactc 45174693  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
     |||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  45174694 tacaaagtgtaacacttaagactataatatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaacggtaagtccaagatgttg 45174793  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattga 714  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45174794 caagcattactagatgaattactattga 45174821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 389 - 776
Target Start/End: Complemental strand, 44186687 - 44186316
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||| |||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  | |||||| |||| ||    
T  44186687 aggaaaattctatgatgaagtcgagagaatgatttttttggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccgctgtttatacagtg 44186588  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  44186587 acatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaaaaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacacccca 44186488  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||                ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44186487 caa----------------ctatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaatgataaaatagtacctctaagtctaagatgttgca 44186404  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 776  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  44186403 agcattactagataaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacatttt 44186316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 451 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 14586794 - 14586464
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 550  Q
    |||| ||| ||||||||||| ||||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14586794 aaaagtgttgtgagtaacacctcactatttatacagtgatatcaaaagttttgtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaat 14586695  T
Q  551 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattt 650  Q
    |||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||         |  || |||||| ||||| ||||||||||||||||||      
T  14586694 ctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact---------cgtatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgc 14586604  T
Q  651 taacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatca 750  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14586603 caacgataaaatagtacg-gtaagtccaagatgttgcaagcattactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatca 14586505  T
Q  751 aacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14586504 aacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagtcagttt 14586464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 493 - 791
Target Start/End: Original strand, 29163912 - 29164194
Alignment:
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  29163912 caaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 29164011  T
Q  593 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca 692  Q
    ||||||||||         ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  29164012 gtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttacaagca 29164102  T
Q  693 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29164103 ttactagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaacttttttagaaaagtcagttt 29164194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 403 - 787
Target Start/End: Original strand, 40935995 - 40936361
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| | ||||||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  40935995 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcattgtttatacagtgacatcaaaagttca 40936094  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||  || || |||                  ||||||||||||    
T  40936095 gtcctcatagtatcatctattcatcagattaacaagaatacacttaatataattttatccaacttttttt------------------aagtgtaacact 40936176  T
Q  603 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 702  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  40936177 taagactatcacatgatattagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagcattactagata 40936276  T
Q  703 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| || ||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  40936277 aattactattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaataaatcaatcattaagattgaaattaactttttcaaaaaagtca 40936361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 387 - 648
Target Start/End: Original strand, 35844314 - 35844575
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  35844314 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagttaacactataacaacaaaaatgttgtgagtaacacctcactgtttgtacag 35844413  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  35844414 tgacatcaaaagtttagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctacctagttttaagtgtaacacc 35844513  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 648  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||||||    
T  35844514 ctacaaagtgtaacacttaaga-tatcacatgatatcagtaactttgtttccatgttaaagat 35844575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 506 - 791
Target Start/End: Original strand, 36012244 - 36012532
Alignment:
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactta 604  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||| |||| || |||||| |||||||| |||||||||||    
T  36012244 ctcataatatcatcaattcatcagatgaacaagaatacacctaatctaatttttatcctaccttgttttcagtgtaacatcccacaaaatgtaacactta 36012343  T
Q  605 agactatcacataatatcatcaact-ttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| |||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  36012344 agactatcaaatgatatcagcaactcttgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccgataagtccaaaatgctgcaagcattactagatga 36012443  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaa-ttaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36012444 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaatttaactttttcaaaaaagtcagttt 36012532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 432 - 752
Target Start/End: Original strand, 38591727 - 38592051
Alignment:
Q  432 aagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgt----ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatt 527  Q
    ||||||||||||||| || |||| | ||| ||||||||  ||| |||    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||  ||||     
T  38591727 aagttaacactataacatcaaaattatagggagtaacatctcattgtattgttgtacaatggcatcaaaagttaagtccacatattattatcaactcatc 38591826  T
Q  528 agattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaa 627  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| |||| ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38591827 agattaacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgtttcaagtgtaataccccacaaaacgtgacacttaagactatcacataatatcatcaa 38591926  T
Q  628 ctttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcacta 727  Q
     | | ||||||||| ||||||   |||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||| ||    
T  38591927 atctatttgcatgtcaaagatgacaacgataaaaaagtatttgtaaatccaagatgttgcaagcattattaaacaaattactattgatcattaatcagta 38592026  T
Q  728 atcaacaatttaaaaatgaatcaaa 752  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38592027 atcaacaatttaaaaatgaatcaaa 38592051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 390 - 601
Target Start/End: Complemental strand, 51213166 - 51212955
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||     
T  51213166 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactgtaacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatgg 51213067  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||    
T  51213066 catcaaaagttgagtcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagtgtaacaccccac 51212967  T
Q  590 aaagtgtaacac 601  Q
    ||||||||||||    
T  51212966 aaagtgtaacac 51212955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 460 - 705
Target Start/End: Original strand, 43348319 - 43348563
Alignment:
Q  460 gtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttta 559  Q
    ||||| |||||  ||||||||||  | || |||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43348319 gtgagcaacaccccactgtttgtttagtggcatcaaaagttcagtcttt-tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttta 43348417  T
Q  560 tcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa 659  Q
    || |||||| ||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||| | ||||||||    
T  43348418 tcctaccttgttttaagtgtaacatcccataaagtgtgacacttaagactatcacatgatatcaacaactctatttgcatgttaaagatgtcaacgataa 43348517  T
Q  660 aatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 705  Q
    |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43348518 aatagtacttgtaagtttaagatgttgcaagcattactaaatgaat 43348563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 390 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 27480564 - 27480150
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  |  ||| |||| |||| |||||||||| || |||| | || |||||| ||    | |||||||||  |||    
T  27480564 ggaaaattctatgatgaagtcatgagaatgatatttttggtaaagtcaacactataacatcaaaagtataatgagtagcatccaattgtttgtacggtga 27480465  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc-- 587  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||       
T  27480464 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacacccaga 27480365  T
Q  588 ------aca-----aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacttt----gtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgta 672  Q
          |||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    |||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||    
T  27480364 agtgtaacacccagaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgta 27480265  T
Q  673 agtccaagatgttg----caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaatt 768  Q
    ||||||| |||||     ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  27480264 agtccaaaatgttaattacaaacattactagatgaattactattgattattaatcagcgatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagaacaaaatt 27480165  T
Q  769 aacttttttaaaaaa 783  Q
    |  ||||| ||||||    
T  27480164 atatttttaaaaaaa 27480150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 603 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 51212743 - 51212548
Alignment:
Q  603 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 702  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51212743 taaggctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 51212644  T
Q  703 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacac 802  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||      | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||    
T  51212643 aattactattgatcattaattaaaaatcaacaatttaaaaatgaa------attaagatcaaaattaactttttcaaaaatgtcagttttctgactgcac 51212550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 556 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 20373263 - 20373034
Alignment:
Q  556 tttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacg 655  Q
    |||||| |||||| || ||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  20373263 tttatcctaccttgttataagcgtaatatcccataaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacg 20373164  T
Q  656 ataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaa 755  Q
    |||||||||||| | |||||||||                   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||     
T  20373163 ataaaatagtacatataagtccaa-------------------gatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacat 20373083  T
Q  756 taagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  20373082 taaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcacca 20373034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 420 - 629
Target Start/End: Original strand, 53176076 - 53176284
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || |||||     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53176076 acttttctgatgaagttaacatcataacatcaaaaatgttgtaagtaatgtc-cactgtttgtacaataacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 53176174  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53176175 aattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaacctcattttaaatataacactccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgat 53176274  T
Q  620 atcatcaact 629  Q
    |||| |||||    
T  53176275 atcagcaact 53176284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 585 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 11357140 - 11356930
Alignment:
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||| ||   || ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  11357140 cccacaaagtgtaacactcaagactatcatataatatcatcaactctggttgtatgttaaatatgccaatgataaaatagtatttgtaagtccaagatgt 11357041  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||||        ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11357040 tgcaagcatta--------attactattcatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatccaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 11356949  T
Q  785 tcagttttttgactacacc 803  Q
    |||||| | ||||| ||||    
T  11356948 tcagttgtctgactgcacc 11356930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 384 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 20373487 - 20373303
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  | |||| |||||||||||| ||||||| || |||||||||  |||||||||  |||||||||||    
T  20373487 taaaatggaaaattttatagtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccccactgtttgta 20373388  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttacctt 568  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20373387 caatgacatcaaaagttcagttctcatggtatcatcaattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcctacctt 20373303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 501 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 11835702 - 11835494
Alignment:
Q  501 cagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaat-tttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    |||||| ||||||||||||| || || | |||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||    
T  11835702 cagtccccatagtatcatcaatttatcatattaacaaaaatacacttaatctaatatttatcctaccttgttttaagtgtaacaacctacaaagtgtaac 11835603  T
Q  600 acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 699  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||      ||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  11835602 aattaagactatcacatgatatcatcaactctatttgcat------gatgttaacgataaaatagtatttgtaagtccaagatgttgcaaacattactaa 11835509  T
Q  700 atgaattactattga 714  Q
    |||||||||||||||    
T  11835508 atgaattactattga 11835494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 609 - 776
Target Start/End: Original strand, 50475021 - 50475195
Alignment:
Q  609 tatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattac 708  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||| | || ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  50475021 tatcatataatatcatcaaatctgtttgcatattaaagatgtcaaggataaaataatacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattag 50475120  T
Q  709 tattg-------atcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 776  Q
    |||||       ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  50475121 tattgatcattaatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaaattttt 50475195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 604 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 53811701 - 53811597
Alignment:
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||   |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  53811701 aagactatcacataatatcatcaactttg----catgttaaagataccaacgataaaataatactcgtaagtccaagatgttgcaggcattcctagatga 53811606  T
Q  704 attactatt 712  Q
    |||||||||    
T  53811605 attactatt 53811597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 55343472 - 55343403
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaat 456  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  55343472 aaaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaat 55343403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Original strand, 33698183 - 33698259
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    || ||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  33698183 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaa----ttctctagtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaacac 33698259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 391 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 11835790 - 11835701
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||| |     ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  11835790 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactatca-----aaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtaca 11835701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 729 - 787
Target Start/End: Original strand, 35844577 - 35844635
Alignment:
Q  729 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  35844577 tcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtca 35844635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40640684 - 40640634
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40640684 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 40640634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 391 - 446
Target Start/End: Original strand, 29163839 - 29163894
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  29163839 gaaaattttatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactataa 29163894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 760 - 802
Target Start/End: Original strand, 13498678 - 13498720
Alignment:
Q  760 atcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacac 802  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  13498678 atcaaaattaacttttttaaaaaagtcaattttctgactacac 13498720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 53818555 - 53818509
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  53818555 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 53818509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38392678 - 38392628
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  38392678 aagggaaattatatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaa 38392628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 427
Target Start/End: Original strand, 53175709 - 53175751
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  53175709 aaaaaggaaaattttatggtgaagttatgagaatgacttttct 53175751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45879547 - 45879498
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  45879547 aggaaaattctatgctgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaa 45879498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 389 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 879760 - 879345
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  879760 aggaaaattttaaggtgaagtcatgagaataatttttttggtgaagtaaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcattgtttgtacaatg 879661  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  879660 acatcaaaagtttaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacataatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctca 879561  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  879560 caaagtgtaacatttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 879461  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  879460 agcattactagatgaattattattgatcattaataagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcag 879361  T
Q  789 ttttttgactacacca 804  Q
    |||| |||||||||||    
T  879360 ttttctgactacacca 879345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 387 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 35021249 - 35020829
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  35021249 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacat 35021150  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || | |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  35021149 tggcgtcaaaagtttcgtcctcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccc 35021050  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  35021049 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatattg 35020950  T
Q  687 caagcattactagatgaattac----tattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 782  Q
    ||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  35020949 caaacattactagatgaattactatatattgatcattaatcggtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaag 35020850  T
Q  783 agtcagttttttgactacacc 803  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  35020849 agtcagttttctgactacacc 35020829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 390 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 19089664 - 19089267
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  19089664 ggaaaattctatggtgaagtcataagaataacttttttgatgaagttaacactataatatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtataatga 19089565  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||||||||||| ||    
T  19089564 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctatatgcgtaacaccctac 19089465  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19089464 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 19089365  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  19089364 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtca 19089267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 389 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 37663951 - 37663555
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| || ||||||||||||||  | || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  37663951 aggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttgatgaagttaacacta--acattaaaactgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaatg 37663854  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  37663853 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgctataagcgtaacacccca 37663754  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37663753 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 37663654  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37663653 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttattaaaaaagtca 37663555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 389 - 804
Target Start/End: Original strand, 25184112 - 25184527
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||    
T  25184112 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgactattttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacactctactgtttgtacaatg 25184211  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||    
T  25184212 acatccaaagttcaatcttcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttgatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctca 25184311  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||   || |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25184312 caaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctgtttgcatgttaaaaattccgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 25184411  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25184412 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcgacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 25184511  T
Q  789 ttttttgactacacca 804  Q
    |||| ||||| |||||    
T  25184512 ttttctgactgcacca 25184527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 19440860 - 19440458
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaa-gtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||| ||||||||||||    
T  19440860 ggaaaattctatggtgaaagtcatgagaatgacttttttggtgatgttaacactataacatcaaaaatgtaatgattaacactccaccgtttgtacaatg 19440761  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  19440760 gcatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcttagcttgttataagcgtaacacccca 19440661  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||| ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19440660 caacgtgtaacccttaagtttataacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 19440561  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19440560 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 19440461  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  19440460 ttt 19440458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 28003197 - 28002796
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  || |||| |||||| ||||  ||  ||||||||||||| |||    
T  28003197 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtcagtagtactccactgtttgtacagtga 28003098  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  28003097 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcggattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 28002998  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  28002997 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcta 28002898  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28002897 acattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 28002798  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  28002797 tt 28002796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 34361704 - 34361301
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||    
T  34361704 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaat 34361605  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||||  | ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  34361604 gacattaaaagttcag-cctcataatatcatcaattcatccggttaacaaaattacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 34361506  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34361505 acaaagtgtaacacttaaagctatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctataagtccaagatgttgc 34361406  T
Q  688 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  34361405 aagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtc 34361306  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  34361305 agttt 34361301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 388 - 777
Target Start/End: Complemental strand, 55478108 - 55477715
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcac----tgtttgta 483  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||  |||    ||||||||    
T  55478108 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacactccactgtttgtttgta 55478009  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||| ||||||    
T  55478008 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgttataagtgtaaca 55477909  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  55477908 ccccacaacgtgtaacactgaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatttaagtccaagatg 55477809  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt 777  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  55477808 ttgcaagcattactagatgaattactattaatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttt 55477715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 393 - 803
Target Start/End: Original strand, 6864038 - 6864448
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 492  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| || ||| |||||    ||| ||||||||||  |||    
T  6864038 aaattgtatggtgatgtcatgagaatgacttttttggtgaagttatcactataacatcaaaaatttaatgaataacatccaactttttgtacaatagcat 6864137  T
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6864138 caaaagtccagtcctcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactacatttaatttaattttatcataccttgttataagcgtaacaccccacaaa 6864237  T
Q  593 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca 692  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  6864238 gtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaataatatttgtaagttcaagatgttgcaagca 6864337  T
Q  693 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttt 792  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6864338 ttactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttt 6864437  T
Q  793 ttgactacacc 803  Q
     ||||| ||||    
T  6864438 ctgactgcacc 6864448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 32912793 - 32912389
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||   | | |||||| |||    
T  32912793 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccctagtatttgtagaat 32912694  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    || |||||||||||||  |||||| |||||||| || || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||     
T  32912693 gatatcaaaagttcagcactcataatatcatcaatttatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccct 32912594  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32912593 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgtatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 32912494  T
Q  688 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||    
T  32912493 aagcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaatgaattttttcaaaaaagtc 32912394  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  32912393 agttt 32912389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 385 - 803
Target Start/End: Original strand, 3042606 - 3043032
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  ||| |||| |||    
T  3042606 aaaaaggaaaattctatggtgaaatcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatacaaaatgtaatgagtaataccccaccgtttatac 3042705  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatca--------tcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 576  Q
    ||||||||||||| ||||||| | | |||||||        ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  3042706 aatgacatcaaaaattcagtcattagagtatcaatgtatcatcaattcatcatattaacaagattacacttaatataattttatcataccttattataag 3042805  T
Q  577 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  3042806 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcttgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtc 3042905  T
Q  677 caagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 776  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  3042906 caacatgttgcaagcattactagatgaattagtattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttt 3043005  T
Q  777 taaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
     |||||||||| ||| |||||| ||||    
T  3043006 caaaaaagtcaatttcttgactgcacc 3043032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 387 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 25701271 - 25700870
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||| ||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||   ||||||||||||     
T  25701271 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgataatgacttttttggtaaagttaacattataacatcaaaagtgtagtgagtaacaccctactgtttgtacag 25701172  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-cc 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||    
T  25701171 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaggactacactaaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatcc 25701072  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| | |||| || ||||| ||    
T  25701071 ccacaaagtgtaacacttaagattatcacataacatcatcaactttgtttgcatgttaaagaagtcaacgataaaatagtatccgtaaatctaagatttt 25700972  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25700971 gcaagcattgttagatgaattactattgatcattaatcaataatgtacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagt 25700872  T
Q  786 ca 787  Q
    ||    
T  25700871 ca 25700870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 392 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 36493897 - 36493486
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||| |||||||||||||  || |||||||||| |||||    
T  36493897 aaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttttggtgaagttaatactataccatcaaaaatatagtgagtaacaccccattgtttgtacagtgaca 36493798  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||| || ||||||    
T  36493797 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaa-actccacaa 36493699  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    
T  36493698 agtgtaacacttaagactaccacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatattgcaagc 36493599  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||    
T  36493598 attactcgatgaattactattgatcattaatccgtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcaattt 36493499  T
Q  792 tttgactacacca 804  Q
      ||||| |||||    
T  36493498 cctgactgcacca 36493486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 385 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 55241320 - 55240915
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||| ||| |||| ||| | |||||||||  ||||||||||||    
T  55241320 aaaatggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaatactatattatcaaaattgttgcgagtaacaccccactgtttgtac 55241221  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||||||||||| || || |||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  55241220 agtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaatttatcagat-aagaagaatacacttaatctaattttatcataccttgttttaagtgtaacac 55241122  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  55241121 ctcacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatgtcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 55241022  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  55241021 tgcaaacattactagataaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaaatttttcaaaaaag 55240922  T
Q  785 tcagttt 791  Q
    |||||||    
T  55240921 tcagttt 55240915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 7703517 - 7703910
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||  |||    
T  7703517 ggaaaattctatgttaaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtcagtaacaccccactgtttgtacggtga 7703616  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  7703617 catcaaaagttcagtccccatagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacactccac 7703708  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7703709 aaagtgtcacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaa 7703808  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  7703809 gcattactagatgaattactatttatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 7703908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 392 - 803
Target Start/End: Original strand, 17173292 - 17173703
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17173292 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 17173391  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  17173392 tcaaaagttcaatctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaa 17173491  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17173492 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagc 17173591  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    || |||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17173592 atcactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagttt 17173691  T
Q  792 tttgactacacc 803  Q
     |||||| ||||    
T  17173692 cttgactgcacc 17173703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 385 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 29584414 - 29584014
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||| |||||||||||||    
T  29584414 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacacctcactgtttgtac 29584317  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| || ||||    
T  29584316 aatggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgttacac 29584217  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29584216 cccatgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgt 29584117  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  29584116 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaag 29584017  T
Q  785 tca 787  Q
    |||    
T  29584016 tca 29584014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Original strand, 47253751 - 47254141
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  || ||||| |||| |||||    
T  47253751 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactatatcatcaaaagtgttgtgagtaacacc-cattgtttatacagtgaca 47253849  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  47253850 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 47253941  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  47253942 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgcaagtctaagatgttgcaagc 47254041  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47254042 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 47254141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 407 - 803
Target Start/End: Original strand, 23761089 - 23761484
Alignment:
Q  407 agtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcc 506  Q
    |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  23761089 agtcatgagaatgactattcttgtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagtcc 23761188  T
Q  507 tcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaag 606  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||| || ||||||| ||| |||||    
T  23761189 ccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatct-accttgttttaagtgtaacacctcataaagtgtcacatttaag 23761287  T
Q  607 actatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 706  Q
    |||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761288 actatcgcatgatatcagcaactctgtttgcacgttaaagataccaacgataaaattgtacctataagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatt 23761387  T
Q  707 actattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23761388 attattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcatgactacacc 23761484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 392 - 789
Target Start/End: Original strand, 33341397 - 33341797
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatg----tagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||  || |||| ||    | | ||| |||||  ||||||||||||| |    
T  33341397 aaaattctatagtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaaattaacactatatcatcaaaattgattgttgcgaggaacaccccactgtttgtacagt 33341496  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |    
T  33341497 ggcatcaaaagttcagtcc-catagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatataattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctc 33341595  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  33341596 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgt 33341695  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  33341696 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaatttttttaaaaaagtca 33341795  T
Q  788 gt 789  Q
    ||    
T  33341796 gt 33341797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 392 - 773
Target Start/End: Complemental strand, 34948306 - 34947923
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||| | || ||    
T  34948306 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctggcgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtaaagtggca 34948207  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||| | ||||||||||||    
T  34948206 tcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgtttaaagtgcaacaccccacaa 34948107  T
Q  592 agtgtaac--acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  34948106 agtgtaacgtacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaa 34948007  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactt 773  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  34948006 gcattactagatgaaatactattgatcgttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactt 34947923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Original strand, 17167715 - 17168114
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| ||||||||||| | || ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17167715 aaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaacattataatatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgaca 17167814  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||||| | ||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  17167815 tcaaaagttcattctccatagtatcattaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcctacattgttttaagtgtaacaccccacaa 17167914  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  17167915 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaagc 17168014  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  17168015 atcactagatgaattactatttatcattaattagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaattttttcaaaaaagtcagttt 17168114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 387 - 791
Target Start/End: Original strand, 50697239 - 50697643
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| | ||  | |||| | ||||||| |||||||||| ||||||||| ||  |||||||||   || ||||||||||    
T  50697239 aaaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgatttttttagtgaagtaaacactataacataaaaaatataacgagtaacaccctaccgtttgtacaa 50697338  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||     
T  50697339 tgacatcaaaagttcaattctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcctaccttgttataagcgtaacacca 50697437  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgca-tgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  50697438 cacaaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcaatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaattccaagatgtt 50697537  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||||||    
T  50697538 gtaagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaagt 50697637  T
Q  786 cagttt 791  Q
    ||||||    
T  50697638 cagttt 50697643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 49375966 - 49376368
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaactttt-ctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||| ||||||| ||    
T  49375966 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgactttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtcgtgagtaacaccccactgcttgtacagtg 49376065  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||  | ||||  ||||||    ||||||||    
T  49376066 gcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacgcttgatctaattttattctgccttgatttaagttatacacccca 49376165  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  49376166 caatgtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaactttgtttggatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagaagttgaa 49376265  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  49376266 agcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaagaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcag 49376365  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  49376366 ttt 49376368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Original strand, 27396618 - 27397015
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| |||  ||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27396618 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcattaaaagtgttatgagtaacaccctactgtttgtacaatgaca 27396717  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||| ||    
T  27396718 tcaaaagtttcgtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaagtgtaacatcccataa 27396817  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| ||||  |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27396818 agtgtcacacttaagaccatcgcatgatatcagcaacgctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaagtggtacctataagtccaaaatgttgcaagc 27396917  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  27396918 attactagatgaattactattgatcattaat--gtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttttaaaaaatcagttt 27397015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 404 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 46888354 - 46887968
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||  | ||||||||||||||    
T  46888354 tgaagtcaagaaaataacttttctgatgaagttaatactataacatcaaaattgtagtgagtaataccccactatttgtacagcggcatcaaaagttcag 46888255  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    ||| |||| |||| | | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||    
T  46888254 tccccatactatcgttaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccacaaaacgtaacactt 46888155  T
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46888154 a-gactatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttacaagcattactagatga 46888056  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46888055 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 46887968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 498 - 782
Target Start/End: Original strand, 1815409 - 1815693
Alignment:
Q  498 gttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgta 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1815409 gttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacatttactctaattttatcctaccttgttttaagggtaacaccccacaaagtgta 1815508  T
Q  598 acacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattact 697  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  1815509 acacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaaacattact 1815608  T
Q  698 agatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 782  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1815609 agatgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaa 1815693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 387 - 785
Target Start/End: Original strand, 50764732 - 50765115
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||  | || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||      
T  50764732 aaaggaaaattttatg---aagtcatgagaataacttttttgatgaagttaacacta--acatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacgg 50764826  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |          |||||||||    
T  50764827 tgacatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctacgt----------gtaacaccc 50764916  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||| |||||| || | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  50764917 cacaaagtgaaacactcaatattatcacatgatatcagcaactatgtttgcaagttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttg 50765016  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  50765017 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagt 50765115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 391 - 787
Target Start/End: Original strand, 37775670 - 37776055
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| || ||||||||||| | ||  | |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  37775670 gaaaattctacggtgaagtcattaaaatgatttttttggtgaagttagcactataatattaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggc 37775769  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||   |||  ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  37775770 atcaaaagttcccccct--tagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccaca 37775867  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    ||||||||||||         ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  37775868 aagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 37775958  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  37775959 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattgaaattaacttttttaaaaaagtca 37776055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 387 - 792
Target Start/End: Original strand, 32579441 - 32579848
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgt---a 483  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| |||| ||||| || |||| || |||||||| |||  || |||||||   |    
T  32579441 aaaggaaaattttatggtgaagttctgagaatgacttttctggtgaagtcaacattataacatcaaaagtgcagtgagtagcaccccagtgtttgttgta 32579540  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |  || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |    
T  32579541 cggtgccatcaaaagtttagtc-tcatagtattatcagttcatcagattaacatgactgtacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaaga 32579639  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
    || || |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32579640 cctcagaaagtgtaactcttaagactatcttataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatg 32579739  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  32579740 ttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaa 32579839  T
Q  784 gtcagtttt 792  Q
    |||||||||    
T  32579840 gtcagtttt 32579848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 387 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 30002838 - 30002455
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||| ||  || |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||     
T  30002838 aaaggaaaactctatggtgaagtcattaaaatgatttttctggtgaagttaacactgtagcatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacag 30002739  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||        |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  30002738 tgacatcaaaagttcagtcttcttagtatcatcag--------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccc 30002647  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||         ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||| |||||||||    
T  30002646 cacaaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatttaagtctaagatgttg 30002556  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  30002555 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaataaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtc 30002456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 393 - 803
Target Start/End: Original strand, 32592096 - 32592497
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 492  Q
    ||||||||| |||||||||| | ||  |||||| || |||||||||||||| | ||| |||| ||| | |||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  32592096 aaattttattgtgaagtcattataatgacttttttgatgaagttaacactacagtatcaaaagtgttgagagtaacactccactgtttgtatagtgacat 32592195  T
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  32592196 caaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaa 32592295  T
Q  593 gtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagca 692  Q
    ||||||||||         || || || ||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32592296 gtgtaacact---------catatgatttcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtctacgataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgaaagca 32592386  T
Q  693 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttt 792  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  32592387 ttactaaatgaattactattgatcgttaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaatttt 32592486  T
Q  793 ttgactacacc 803  Q
     ||||| ||||    
T  32592487 atgactgcacc 32592497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33816742 - 33816326
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||  | |||||||||||||| |||| | ||  || |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||  || ||    
T  33816742 aaaattatatgcttaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacattgtagcatcaaaagtgtagtgagtagcacctcactatttatacggtggca 33816643  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca--- 588  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||       
T  33816642 tcaaaagttcagtctccatagtatcatcaatttatcagattaacaagattgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccagaa 33816543  T
Q  589 --------------caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaag 674  Q
                  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||| | ||||||    
T  33816542 agtgtaataccccacaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagttcatgtaag 33816443  T
Q  675 tccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttt 774  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  33816442 tccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaacttt 33816343  T
Q  775 tttaaaaaagtcagttt 791  Q
    || ||||||||||||||    
T  33816342 ttcaaaaaagtcagttt 33816326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 389 - 787
Target Start/End: Original strand, 42199728 - 42200127
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||| | ||||||||| |||| ||||  | |||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||| ||  || | |||||| ||||    
T  42199728 aggaaaaatctatggtgaaatcataagaatgatttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccattatttgtagaatg 42199827  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  42199828 acataaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacacccta 42199927  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacc-tgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42199928 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaataataccttgtaagtccaagatgttgc 42200027  T
Q  688 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||  || ||| ||||||||||||| ||||| |||    
T  42200028 aagcattactagatgaatatactactgttcattaatcagtaatcaataatttaaaaattaatcaaacatcaaaatc-aaattaactttttcaaaaaggtc 42200126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 389 - 787
Target Start/End: Original strand, 37287732 - 37288126
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  37287732 aggaaaattctatggtgaagtaatgagaatgactttttttggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagt 37287831  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    | ||||||||||||| |||||||| |||||| ||        |||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||||| ||||| |||    
T  37287832 ggcatcaaaagttcaatcctcataatatcataag--------attaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaagtgtaacgccc 37287923  T
Q  587 c-acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37287924 ccacaaaatgtaacacttaagactagcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttgaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 37288023  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataaga-tcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||    
T  37288024 gcaagcattattagatgaattactattgagcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaagatttaaaattaactttttcaaaaaag 37288123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 404 - 817
Target Start/End: Complemental strand, 5048162 - 5047746
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    |||||| |||||||  | |||||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||||||||  ||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5048162 tgaagttatgagaatgatttttctggtgaagtcaactctataacatcaaaagtgtagtgagtaggaccacactgtttgtacgatgatatcaaaagttcag 5048063  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||  |||| ||||||||||    
T  5048062 ttcccatagtatcatcaattcatgagattaacaagactgcatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaatacccg-caaaatgtaacactt 5047964  T
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |    
T  5047963 aagactatcacatgatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagttttactagataa 5047864  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||| ||||    
T  5047863 attattattgatcagtaatcaacaataaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtctgtttcctgactgcacc 5047764  T
Q  804 ----aagctcccaaaata 817  Q
        ||||||||||||||    
T  5047763 gtaaaagctcccaaaata 5047746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 391 - 791
Target Start/End: Original strand, 4597994 - 4598383
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |    
T  4597994 gaaaattttatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaag-tgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggc 4598092  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| | | || ||||||| |||||||||||||    
T  4598093 atcaaaagttcagtccccttagactcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatttaattttatcctgc-ttgttttaagtgtaacaccccaca 4598191  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    ||||||||||||         ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||    
T  4598192 aagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatttaaatccaagatgttgcaag 4598282  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  4598283 cattattagattaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacattttacaaaaagtcagtt 4598382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 427 - 801
Target Start/End: Complemental strand, 4934375 - 4934012
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttca 525  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4934375 tggtgaagttaacactag--tataaaaaatgtagtgagtaacacccccattgtttgtacactggcatcaaaagttcaatcctcatagtatcatcatttca 4934278  T
Q  526 ttagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 625  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4934277 tcagattaacaagactacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtccaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatc 4934178  T
Q  626 aactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcac 725  Q
    |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||           |||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||     
T  4934177 aactatgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtacct-----------atgttgcacgcattaatagatgaatttctattaatcattaatcag 4934089  T
Q  726 taatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactaca 801  Q
    ||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  4934088 taatcaaaaattttaaaaataaattaaacattaagatcaaaattaacttgttcaaaaaagtcagtttattgactaca 4934012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 489 - 787
Target Start/End: Original strand, 17272067 - 17272361
Alignment:
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  17272067 acatcaaaagttcagtc----tagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacccca 17272162  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17272163 tgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatattaaagatttcaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 17272262  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  17272263 agcattactagatgaattactattgatcattaatcggtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaataagtca 17272361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 384 - 705
Target Start/End: Original strand, 38011848 - 38012169
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| || |||  |||||||||||    
T  38011848 taaaaaggaaaattctatggtgaaatcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgaatagcaccccactgtttgta 38011947  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||| ||||||    
T  38011948 cggtgccatcaaaagttcagtccccataatattatcaattcatcagattaacaagactacacttaatttaattttattataccttgttttaagtgtaaca 38012047  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
     |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  38012048 tcccagaaagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcacgttaaaaatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatg 38012147  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaat 705  Q
    ||||||  ||||||||||||||    
T  38012148 ttgcaaatattactagatgaat 38012169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 165; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 9139245 - 9139628
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||| |    
T  9139245 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaattgacttttttggtgaagttaacgttatagcataaaaaat--agtgagtaacaccccaccgtttgtacagt 9139342  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||     
T  9139343 gacataaaaagttcaatccccatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaactgtaacaccct 9139442  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||                || |||| ||||||||||||||||||   ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  9139443 acaaagtgtaacacttaag----------------ataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataacgtagtacatgtaagtccaagatgttgc 9139526  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  9139527 aagcattactagacgaattactattgatcattaatcaataatc--taatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtca 9139624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 587 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 7152218 - 7152013
Alignment:
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7152218 cacaaagtataacacttaatactatcacataacatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagattttg 7152119  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||    
T  7152118 caagcattattagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatgaaaaataactttttcaaaaaagtc 7152019  T
Q  787 agtttt 792  Q
    ||||||    
T  7152018 agtttt 7152013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 532 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 46884177 - 46883911
Alignment:
Q  532 taacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacttt 631  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| || ||| || ||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||    
T  46884177 taacgagactacacttaatctaattttatcatatcttgttataagc-taacatctcacaaaatgtaacacttaa-actatcacataatatcataaatttt 46884080  T
Q  632 gtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatca 731  Q
    |||||||||||||| |||  || ||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46884079 gtttgcatgttaaaaattccaaagataaaatagta--tgtaagtcc--gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatca 46883984  T
Q  732 acaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  46883983 acaatttaaaaataaatcaaacattaaaataaaaattaattttttcaaaaaaaatcaattttttgactgcacc 46883911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 588 - 787
Target Start/End: Original strand, 26896285 - 26896485
Alignment:
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcc-aagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| || ||||||    
T  26896285 acaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatgatcaagtctatttgcatgttaaa-atttcaacgataaaatagtacttgtaagtccgaaaatgttg 26896383  T
Q  687 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26896384 caaacattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagt 26896483  T
Q  786 ca 787  Q
    ||    
T  26896484 ca 26896485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 389 - 667
Target Start/End: Complemental strand, 35025800 - 35025530
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||  | |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  |||||||| |||  ||    
T  35025800 aggaaaattctatgctgaagtcatgaaaatgatttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttatacgttg 35025701  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||| | || ||||| |||||||||| || ||| ||||||| || ||||||||    
T  35025700 acatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcag--------attaacaagactgcatttaatataattttatcctatcttgttttaagtgtcacacccca 35025609  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtac 667  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||    
T  35025608 gaaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac 35025530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 618 - 791
Target Start/End: Original strand, 39400236 - 39400409
Alignment:
Q  618 atatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 717  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39400236 atatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatggtacctttaagttcaagatgttgcaagcattactagatgaatgactattgatca 39400335  T
Q  718 ttaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39400336 ttaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 39400409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 622 - 803
Target Start/End: Original strand, 4205216 - 4205397
Alignment:
Q  622 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 721  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4205216 catcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcatcactagatgaattactatttatcatgaa 4205315  T
Q  722 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    | | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  4205316 taagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcacc 4205397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 652 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 35025515 - 35025379
Alignment:
Q  652 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 751  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35025515 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35025416  T
Q  752 acaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  35025415 acattaa-atcaaaattaactttttcataaaagtcagt 35025379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 420 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 54499420 - 54499193
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac-aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  54499420 acttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccaccgtttgtactaatgacatcaaaagttcagtctctatagtatcat 54499321  T
Q  519 cagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacata 617  Q
    || ||||| | |||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||     
T  54499320 caattcatcatattaacaagaatatacttaatctaatttttatcataccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtaacttttaagactatcacatg 54499221  T
Q  618 atatcatcaactttgtttgcatgttaaa 645  Q
    |||| |  |||| ||||| |||||||||    
T  54499220 atattagtaactctgtttccatgttaaa 54499193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 661 - 791
Target Start/End: Original strand, 23431826 - 23431956
Alignment:
Q  661 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataaga 760  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |    
T  23431826 atagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattagtagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgcatcaaacattaaaa 23431925  T
Q  761 tcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23431926 ttaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 23431956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 390 - 596
Target Start/End: Original strand, 39397918 - 39398115
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || |||||||||| |||    
T  39397918 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttatggtgaagttaacactataacattaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtacagtga 39398017  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||    
T  39398018 catcaaaagttcagtcttctcagtatcatca---------attaacaagaatacacttaatctaattttatcctgccttattttaagtgtaacaccccac 39398108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 380 - 495
Target Start/End: Original strand, 4205106 - 4205221
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||  |||||||    
T  4205106 ttaataaaaaggaaaattctatggtgaagtcaggaaaatgacttttctgatgaagttaacactataatatcaaaaatgttctgaataacaccccactgtt 4205205  T
Q  480 tgtacaatgacatcaa 495  Q
    ||||||||||||||||    
T  4205206 tgtacaatgacatcaa 4205221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 696 - 783
Target Start/End: Original strand, 38012568 - 38012655
Alignment:
Q  696 ctagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38012568 ctagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 38012655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 629 - 694
Target Start/End: Original strand, 56050169 - 56050234
Alignment:
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 694  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56050169 tttgtttgcatgttaaagacttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatt 56050234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 388 - 470
Target Start/End: Original strand, 4396324 - 4396406
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4396324 aaggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgacttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacac 4396406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 446
Target Start/End: Original strand, 52516599 - 52516653
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52516599 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttatggtgaagttaacactataa 52516653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 2704510 - 2704560
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  2704510 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 2704560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 7152319 - 7152237
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||  ||||||||||| ||||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||    
T  7152319 aaggaaaattctatggtgaagtcatgctaatgacttttctggtaaagttaacattataacatcaaaagtatagtgagtaacac 7152237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 446
Target Start/End: Original strand, 17272009 - 17272067
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17272009 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataa 17272067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38812310 - 38812260
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  38812310 aaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 38812260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 392 - 444
Target Start/End: Complemental strand, 20097537 - 20097485
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactat 444  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  20097537 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaaccctat 20097485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 38811813 - 38811861
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  38811813 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 38811861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Original strand, 53124287 - 53124367
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||    
T  53124287 ggaaaattatatgatgaagtcattaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacac 53124367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 417
Target Start/End: Original strand, 1012306 - 1012336
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaa 417  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1012306 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaa 1012336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 385 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 47073710 - 47073656
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaac 439  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  47073710 aaaaaggaaaattctatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaac 47073656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 431 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 23518473 - 23518400
Alignment:
Q  431 gaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagt 504  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||| ||||||  |||||||  |||| || |||||||| ||||||    
T  23518473 gaagttaacactataacattaaaactgtagtgactaacaccccactgttaatacagtggcatcaaaaattcagt 23518400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 391 - 444
Target Start/End: Original strand, 51204580 - 51204633
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactat 444  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  51204580 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttctggtgaagttaaccctat 51204633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 21)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 6091363 - 6090953
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacat 492  Q
    ||||| ||| |||||||||||| || || |||| |||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  6091363 aaattctattgtgaagtcatgaaaataatttttttggtaaagttaaca-tgtaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccattgtttgtacaatgccat 6091265  T
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaa 592  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  6091264 caaaagttcagtactcgtagtatcatcaattcattagattaacaaaactacacttaatctaattttatcataccttgttttaagcgtaacacccaacaaa 6091165  T
Q  593 gtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6091164 gtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatattaaagattcaaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 6091065  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6091064 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtaagttt 6090965  T
Q  792 tttgactacacc 803  Q
    | ||||| ||||    
T  6090964 tctgactgcacc 6090953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 3880124 - 3879722
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||   |||||||||||||||    
T  3880124 aggaaaattctatggtgaagtcacgagaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaagtgttgtgagtaacaccctactgtttgtacaatg 3880025  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||    
T  3880024 acatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatatacttattctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacacccca 3879925  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3879924 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgca 3879825  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3879824 agcattactagatgaattactattgatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcag 3879725  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  3879724 ttt 3879722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 5627389 - 5627793
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  |||| |||||| |||    
T  5627389 aaggaaaattctaaggtgaagtcataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataatgagtaacaccccactatttgtagaat 5627488  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| ||||||||     
T  5627489 gacatcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccct 5627588  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5627589 acaaagtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 5627688  T
Q  688 aagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  5627689 aagcattactaggtgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaatttttttaaaaaaatc 5627788  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  5627789 agttt 5627793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 1945831 - 1946237
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||  |||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||    
T  1945831 aaggaaaattctacggtgaagtcataagaatgactttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtagaa 1945930  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| |  ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  1945931 tgacatcaaaagttcagccctcatagtatcatgaattcatcaagttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcgtaacaccc 1946030  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  1946031 tacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtta 1946130  T
Q  687 caagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt-aaaaaag 784  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  1946131 caagcattattagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttcaaaaaag 1946230  T
Q  785 tcagttt 791  Q
    |||||||    
T  1946231 tcagttt 1946237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 381 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 4319016 - 4318626
Alignment:
Q  381 taataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgttt 480  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||  ||||||||||  ||||||||    
T  4319016 taataaaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttatgagtaacaccccactgttt 4318917  T
Q  481 gtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  4318916 gtacagtgacatcaaaagttcaacccccatagtatcatcaattcattagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgt 4318817  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 679  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||  | ||||||||    
T  4318816 aacaccctataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgttttcatgttaaagatgtcaacgatgaaatagtacgggaaagtccaa 4318717  T
Q  680 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||    
T  4318716 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaattaaaattaa 4318626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 390 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 7235218 - 7234803
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  ||     
T  7235218 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttccggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtgc 7235119  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||     
T  7235118 catcaaaagttcagtc-tcatagtattatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccag 7235020  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7235019 aaagtgtaacgcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaaaatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 7234920  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaat---cactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  7234919 acattactagatgaattactattgatcattaatcaacaacaatcaacaatttaaaaataaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaaatc 7234820  T
Q  787 agttttttgactacacc 803  Q
    | |||  ||||||||||    
T  7234819 attttcctgactacacc 7234803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 392 - 779
Target Start/End: Complemental strand, 21017294 - 21016913
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || |||||||||| || ||  |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||  || | ||||||||||| ||    
T  21017294 aaaattatacggtgaagtcacgaaaatgacttttttggtgaagttaacattgtagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccattatttgtacaatggca 21017195  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  21017194 tcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaataaacttaatctaattttatcctacgttattttaagtgtaacaccccacaa 21017095  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||    
T  21017094 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaatatgtcaacgataaaatagtac------gtctaagatgttgcaagc 21017001  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  21017000 attactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttataaatgaatcaaatattaagattaaaattaacttttttaa 21016913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 391 - 783
Target Start/End: Original strand, 20768087 - 20768475
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| ||   || |||||||  | || |    
T  20768087 gaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcatc-cattgtttgtt-agtggc 20768184  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||| |||| |    
T  20768185 atcaaaagttcagtcctcatagtatcattaattcatcagattaacaagattac--ttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacatcccata 20768282  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  20768283 aagtgtaacacttaagatcatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaggtgttgcaag 20768382  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20768383 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 20768475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 8513232 - 8513622
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  8513232 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtg 8513331  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa-ttttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||      ||||||||     
T  8513332 acatcaaaagttcagtccccataatatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttgatctaatttttatcctaccttgttt------taacaccct 8513425  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||||| || ||||    
T  8513426 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaagtccaaaatcttgc 8513525  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  8513526 aagcattactagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtca 8513618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Original strand, 29182165 - 29182562
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | |||  || ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  29182165 aaaattttatggtgaagtcatgagaatgattttattgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtgtca 29182264  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca-ccccaca 590  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||| |    
T  29182265 tcaaaagttcagtctccatattatcatcaattcatcagattaataagaatacacttaatctaattttatcctaccatattttaagtgtaacacccccata 29182364  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  29182365 aagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctatttgcaggttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtctaagatgttgcaag 29182464  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
     |||||||||||||||||   |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29182465 tattactagatgaattac---tgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagactaaaattaactttttcaaaaaagttagtt 29182561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33893186 - 33892795
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||| ||||||| |||| || |||| | |||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  33893186 ggaaaattctatggtaaagtcattagaataatttttttagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatga 33893087  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||    
T  33893086 tattaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttatgtataacaccccac 33892988  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||         ||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33892987 aaagtgtaacact---------cacatgatatcagcaactcagtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 33892897  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  33892896 acattactaaatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaggttaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 33892797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 392 - 776
Target Start/End: Original strand, 6088910 - 6089282
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||||||||| |  ||||||||||| | || ||    
T  6088910 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaagtgttgtgagtaacgccccactgtttgtaaagtggca 6089009  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||| |||||| ||||||      ||| | |||    
T  6089010 tcaaaagttcagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatatccttgatctaatttttatcctaccttgttttaa------cactctaca 6089103  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    | || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  6089104 aggtataacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccagtaagtccaaaatgttgcaag 6089203  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 776  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||    
T  6089204 cattactatatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaatttttt 6089282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 390 - 787
Target Start/End: Original strand, 33618834 - 33619230
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||||||   || |||| ||||||||||| ||   || | |||||||  ||     
T  33618834 ggaaaattctacggtgaagtcatgggaaatacttttctggtgaagtcaacactatcgcatcaaaagtgtagtgagtagcaacccattatttgtacggtgg 33618933  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||        || ||||||||| |     
T  33618934 catcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctacc--------agtgtaacaccctag 33619025  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa-----agattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    || |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||     ||||   |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33619026 aa-gtgtgacacttaagagtatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaatatgt 33619124  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcatta---atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa 781  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  33619125 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatgatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagattaaaattaactttttaaaaa 33619224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 389 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 7055400 - 7055141
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  7055400 aggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatataattagtaacacctcactatttgtagaatg 7055301  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||| | |    
T  7055300 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagtgtaacacgcta 7055201  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 648  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  7055200 caaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctatttggatgttaaagat 7055141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 392 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 30353540 - 30353256
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||| | |||||| |  |||||||||||||| || ||    
T  30353540 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacattataacatcaaaagtgttgcgagtaatatctcactgtttgtacagtggca 30353441  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||| ||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||||    
T  30353440 tcgatagttcagtctccatagtatcatcaattcatcatataaacaagaatacacttaatctaattttatcatgccttgttttaagtgtaacatcccacaa 30353341  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtc 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||| ||||||||    
T  30353340 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaaaatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtc 30353256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 406 - 659
Target Start/End: Original strand, 15491631 - 15491884
Alignment:
Q  406 aagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 505  Q
    |||| |||||||  |||||||| |||||||||||| | ||| || |||| ||| |||||||||||  |||| |||||||| || |||||||||||||| |    
T  15491631 aagttatgagaatgacttttctcgtgaagttaacattgtaacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttgtacagtggcatcaaaagttcagcc 15491730  T
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15491731 ctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatgcacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaa 15491830  T
Q  606 gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa 659  Q
     | |||||||| |||||| ||| | |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  15491831 aaatatcacatgatatcagcaattctgtttggatgttaaagatgctaacgataa 15491884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 643 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 7054704 - 7054543
Alignment:
Q  643 aaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaa 741  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7054704 aaagattccaacgataaaatagtaactgtaagtccaagatgttgcaaacattactaaatgaatatactattgatcattaatcattaatcaacaatttaaa 7054605  T
Q  742 aatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  7054604 gatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttcttgactgcacc 7054543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 384 - 520
Target Start/End: Original strand, 18498427 - 18498564
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaaca-catcactgtttgt 482  Q
    |||||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||  || |||| ||||||||| |||| |  ||| ||||||    
T  18498427 taaaaaggaaaaatctatagtgaagtcatgagaatgactttcctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgtagtgagcaacacccccacagtttgt 18498526  T
Q  483 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 520  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18498527 acagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatca 18498564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 716 - 771
Target Start/End: Complemental strand, 33724117 - 33724062
Alignment:
Q  716 cattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac 771  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33724117 cattaatcattaagcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaac 33724062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11084204 - 11084152
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  11084204 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaataacttttctggtaaagttaa 11084152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 19631747 - 19631797
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  19631747 aaggaaaattctatggtgaagtcataagaatgacttttctggtgaagttaa 19631797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Original strand, 699152 - 699551
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  699152 aaaattttatggtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagttaacactatagcataaaaaatctagtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 699251  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  699252 tcaaaagttcagtcatcataatatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttattttaagtgtaacactccacaa 699351  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  699352 agtgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaagc 699451  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  699452 attactagatgaattactattgattattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcagttt 699551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 402 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27318650 - 27318249
Alignment:
Q  402 ggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 501  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  27318650 ggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactaaaacataaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatgacatcaaaagttt 27318551  T
Q  502 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 601  Q
    ||| |||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27318550 agttctcacagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 27318451  T
Q  602 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 701  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||  |||||||||||| |||||||| ||    
T  27318450 ttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtac--ataagtttaagatgttgcaaacattactatat 27318353  T
Q  702 gaattactattgatcattaatcactaatcaacaa-tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactac 800  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  27318352 gaattactattgatcattaatcaaaaatcaacaattttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgc 27318253  T
Q  801 acca 804  Q
    ||||    
T  27318252 acca 27318249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 391 - 804
Target Start/End: Original strand, 22980794 - 22981207
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||| ||  |||||||||  |||||||    
T  22980794 gaaaattttatgatgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagtatcaaaaatacagtgagtaataccccactgtttgagcaatgac 22980893  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  22980894 atcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcaca 22980993  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||     
T  22980994 aaatgtaacacttaagactatcacataatatcataaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaat 22981093  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22981094 cattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttttaaaaagtcagtt 22981193  T
Q  791 ttttgactacacca 804  Q
    |  ||||| |||||    
T  22981194 tcctgactgcacca 22981207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 388 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 35826660 - 35826259
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| | |||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |    
T  35826660 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgactttttttgtgaagttaatactataacatcaaaaatgtactgagtaacacttcattgtttgtacagt 35826561  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||| ||    
T  35826560 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat-agattaacaataccacatttaatctaattttattctacattgttttaagcgtaacactcc 35826462  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35826461 acaaagtgtaacccttaagattatca--taatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 35826364  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  35826363 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaaacca 35826264  T
Q  788 gtttt 792  Q
    |||||    
T  35826263 gtttt 35826259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 38528413 - 38528011
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||  || ||||| |||| |    
T  38528413 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttctgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccattgtttatacagt 38528314  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38528313 gacatcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcttaccttgtttcaagtgtaacacccc 38528215  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38528214 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctatttacatgttaaagatatcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgc 38528115  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  38528114 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatca 38528015  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  38528014 gttt 38528011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 386 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 22974261 - 22973843
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||||   |||||||||||||    
T  22974261 aaaaggaaaattctatggtgaagttatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaaagtaatgagtaacatcccactgtttgtaca 22974162  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    || |||||||||||||| | |||||| ||||||||  |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||    
T  22974161 ataacatcaaaagttcaattctcatattatcatcaactcatcagaataacaagactacacttaatctaattttatcctatcttgttataagcgtaacacc 22974062  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
     |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22974061 tcacaaaatgtaacacttaagactattacataatattatcaactctgtttgcatgttaaagatttcgacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 22973962  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  22973961 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaaat 22973862  T
Q  786 cagttttttgactacacca 804  Q
    ||||||| ||||| |||||    
T  22973861 cagttttctgactgcacca 22973843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 22255179 - 22255583
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatat-aaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||| | || ||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22255179 aaggaaaactctacggtgaagtcataaaaataacttttttggtgaagttaacattataacatcaaaaaatgtaatgagtaacaccccaccgtttgtacaa 22255278  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || ||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||  || || |||||||||||||     
T  22255279 tggcatcaaaagttcagttctcatattatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttagcctattttgttataagcgtaacacca 22255378  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22255379 cacaaagtgtaacacttaaaactattacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaatattccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 22255478  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  22255479 caagccttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttaaaaaaagtc 22255578  T
Q  787 agttt 791  Q
    |||||    
T  22255579 agttt 22255583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 388 - 803
Target Start/End: Original strand, 36860421 - 36860837
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  36860421 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactatagtataaaaaatgttgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 36860520  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttatttt-aagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| | | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||    
T  36860521 gacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcatactaacaagagtacatttaatctaattttatcctaccttttttttaagtgtaacaccc 36860620  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  36860621 cacaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttg 36860720  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36860721 caagcattactaaatgaattactattaatcatgaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagcattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtc 36860820  T
Q  787 agttttttgactacacc 803  Q
    | |||| ||||| ||||    
T  36860821 aattttctgactgcacc 36860837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 390 - 803
Target Start/End: Original strand, 36866762 - 36867175
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  36866762 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgatttttctggtgaagttaacactataatatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaatgg 36866861  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36866862 catcaaaagttcagtcccgatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 36866961  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  36866962 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 36867061  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  36867062 acattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcaat 36867161  T
Q  790 tttttgactacacc 803  Q
    ||| ||||| ||||    
T  36867162 tttctgactgcacc 36867175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 391 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 31705785 - 31705374
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||   || ||||||||||||||    
T  31705785 gaaaattctatggtgaagtcataaaaatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacaccctaccgtttgtacaatgac 31705686  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||||    
T  31705685 atcaaaagtccagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagcgtaacatctcaca 31705587  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  31705586 aaatgtaacacttaagaccatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaaagataaaatagtacatataagtccaagatgttgcaag 31705487  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| ||    
T  31705486 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtcaatt 31705387  T
Q  791 ttttgactacacc 803  Q
    | |||||| ||||    
T  31705386 tcttgactgcacc 31705374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 385 - 791
Target Start/End: Original strand, 19119854 - 19120260
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| |  ||||||||  ||||||||||||    
T  19119854 aaaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttgtggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgctagtaacaccccactgtttgtac 19119953  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||| |||||||  ||||||    
T  19119954 agtgacatcaaaagttcagtccccatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaataaacttactctaattttatcctaccttgttttaagtataacac 19120053  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  19120054 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactccgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctcaaagtctaagatgt 19120153  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  19120154 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtgatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaag 19120253  T
Q  785 tcagttt 791  Q
    |||||||    
T  19120254 tcagttt 19120260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31786821 - 31786420
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||| |||||||  ||||||  |||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| |   |  ||||||||||||| ||     
T  31786821 ggaaaattctatagtgaagtagtgagaatgacttttttggtgaagttaacactatagcatgaaaaatgtagtgagcactgccccactgtttgtacagtgg 31786722  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  31786721 catcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacaccctac 31786622  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31786621 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgattgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgcaa 31786522  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31786521 gcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaatatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 31786422  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  31786421 tt 31786420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 387 - 804
Target Start/End: Original strand, 24886099 - 24886501
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct--ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |  ||||||||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  24886099 aaaggaaaattttatggtgaaatcatgagaatgacttttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtac 24886198  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||            
T  24886199 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattataag-------- 24886290  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24886291 ---------tgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 24886381  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24886382 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaag 24886481  T
Q  785 tcagttttttgactacacca 804  Q
    ||||||| |||||| |||||    
T  24886482 tcagtttcttgactgcacca 24886501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 39572818 - 39573212
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| || ||    
T  39572818 aggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagttaagttaatactataatataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgcagtg 39572917  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  39572918 acatcaaaagttcagttctcatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacatccca 39573017  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||||         ||||||||||   || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39573018 caaagtgtaacactcgagactatcacatgatatcaacaact--------ctgttaaagatgccaatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 39573109  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39573110 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcag 39573209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 390 - 803
Target Start/End: Original strand, 40133385 - 40133798
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  |||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||     
T  40133385 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttgtggtgaagttaacattatagtatcaaaaatgttgtgagtaacaccccactatttgtacaatgg 40133484  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  40133485 catcaaaagttcagtccccataatatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 40133584  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  40133585 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaa 40133684  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |    
T  40133685 gcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcaat 40133784  T
Q  790 tttttgactacacc 803  Q
    ||| ||||| ||||    
T  40133785 tttctgactgcacc 40133798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 387 - 805
Target Start/End: Complemental strand, 8742065 - 8741645
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtaca 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  | | ||||||||||    
T  8742065 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtaca 8741966  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||    
T  8741965 atggcatcaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacaattaatctaattttgtcataccttgttttaagtgtaacacc 8741866  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat-atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  8741865 ctacaaagtgtaacacttaagactatcacatgattatgagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaaatgt 8741766  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  8741765 tgcaagcatcactagatgaaatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaag 8741666  T
Q  785 tcagttttttgactacaccaa 805  Q
    || ||||  ||||| ||||||    
T  8741665 tctgtttcatgactgcaccaa 8741645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 388 - 804
Target Start/End: Original strand, 12910348 - 12910769
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| || |||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  12910348 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactataacatcaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 12910447  T
Q  488 -----gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaac 582  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||    
T  12910448 acagtgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacatgactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaac 12910547  T
Q  583 accccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 682  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||   ||| ||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  12910548 accccacaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgccaacaatacaataatacatgtaagtccaagat 12910647  T
Q  683 gttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaa 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||    
T  12910648 gttgcaagcattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaa 12910747  T
Q  783 agtcagttttttgactacacca 804  Q
    |||||||||  ||||| |||||    
T  12910748 agtcagtttcctgactgcacca 12910769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 429 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 17158166 - 17157798
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||| | ||||| |    
T  17158166 gtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttc-gtcattatagtatcattaattcatca 17158068  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    ||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17158067 gattaacaagactacacttagtataattgtatcttaccttattataagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagaccatcacataatattatcaac 17157968  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 728  Q
    | |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  17157967 tctgtttgcatgataaagatttcaacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaa 17157868  T
Q  729 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgact 798  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || ||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  17157867 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaacttgactttttcaaaaaagtcaatttcttgact 17157798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 404 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 30969485 - 30969097
Alignment:
Q  404 tgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcag 503  Q
    ||||||||||||||  | || |||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  30969485 tgaagtcatgagaatgatttatctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactatttatacaatgacatcaaaagttcag 30969386  T
Q  504 tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacactt 603  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  30969385 tcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactt 30969286  T
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| || ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  30969285 aagactatcacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtatctataagttcaagatgctgcaagtattactagatga 30969186  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaa-aaaagtcagttt 791  Q
     |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30969185 gttactattaatcattaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaaagtcagttt 30969097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 402 - 792
Target Start/End: Original strand, 33908245 - 33908634
Alignment:
Q  402 ggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttc 501  Q
    ||||||||||||||||  |  ||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  || ||||||||||||    
T  33908245 ggtgaagtcatgagaatgaactttctggtgaagtcaacactatatcatcaaaagtgtagtgagtagcactccactgtttgtacggtggcatcaaaagttc 33908344  T
Q  502 agtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacac 601  Q
    ||||||||||||||||||| ||  | |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  33908345 agtcctcatagtatcatcaattattcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccagaaagtgtaacac 33908444  T
Q  602 ttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 701  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33908445 ttaagactatcgcataatatcgtcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagat 33908544  T
Q  702 gaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttt 792  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33908545 -aattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtttt 33908634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 388 - 787
Target Start/End: Original strand, 27330304 - 27330701
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  27330304 aaggaaaattctatggtgaagtcgtgggaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgt--tgagtaacaccttactgtttgtacaat 27330401  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||    
T  27330402 ggcatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaatgagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacccc 27330501  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  27330502 atgaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatttcaacaataaaatggtacatgtaagtccaagatgttgc 27330601  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||    
T  27330602 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatgaacgatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaacaagtca 27330701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 452 - 798
Target Start/End: Original strand, 35504427 - 35504773
Alignment:
Q  452 aaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatc 551  Q
    |||||||| |||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||     
T  35504427 aaaatgtaatgagtaacacctcaccgtttgtatgatgacatcaaaagttcaatcattatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaata 35504526  T
Q  552 taattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttt 651  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||     
T  35504527 taattttatcctaccatattataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatattatcaaatctgtttgcatgttaaagatttc 35504626  T
Q  652 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 751  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  35504627 aacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 35504726  T
Q  752 acaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgact 798  Q
    ||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  35504727 acattaaaatcaaaattgactttttcaaaaaagtcaatttcttgact 35504773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 422 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 7209006 - 7208638
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||| |  |||||||||   || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  7209006 ttttttggtgaagttaacattgtaacataaaaaatgcaacgagtaacaccctaccgtttgtacattgacatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaa 7208908  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 621  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7208907 ttcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataaacgtaacacctcacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 7208808  T
Q  622 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 721  Q
      |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7208807 tttcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaagtattactagatgaattattattgatcattaa 7208708  T
Q  722 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7208707 tcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttaaaaaaagtcagttt 7208638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 35511652 - 35511256
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| | |||    
T  35511652 ggaaaatcctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttctgatgaagttaacattataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaagtga 35511553  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  35511552 catcaaaagttcagtcatcatactatcaccaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccccac 35511453  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||| ||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  35511452 aaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaagatgttgcaa 35511358  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35511357 gcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 35511258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 392 - 804
Target Start/End: Original strand, 5837557 - 5837969
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || |||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  5837557 aaaattctacggtgaattcatgagaatgacttttctggtgaaggtaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtgaca 5837656  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||| |||| |||||||||    
T  5837657 tcaaaatttcagtctccatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacacttaatctaatttaatcctacattgttttaagtgtaataccccacaa 5837756  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5837757 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctctttgcatgttaaagatgacaacgacaaaatagtacctgcaagtccaagatgttgcaagc 5837856  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  5837857 attactagatgaattactgttgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaaaattaaaattaaccttttcaaaaaagtcagttt 5837956  T
Q  792 tttgactacacca 804  Q
      ||||| |||||    
T  5837957 gatgactgcacca 5837969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 25501099 - 25500700
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||| |||||| |||||||||||||| || ||    
T  25501099 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgaataacacctcactgtttgtacactgcca 25501000  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  25500999 tcaaaagttaagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagaataaacttaatttaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 25500900  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||  |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25500899 agtgtaacacttaagatcatcacatgatatcagcaactttctttagatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtctaagatgttgcaagc 25500800  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25500799 attactagatgaaatactgttgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaatactaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagttt 25500700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 422 - 775
Target Start/End: Original strand, 5829929 - 5830278
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataat----ataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatca 517  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||    |||||||||||| ||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5829929 ttttttggtgaagttaacattataattaacataaaaaatgtaatgagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagtttagtcctcatagtatca 5830028  T
Q  518 tcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacata 617  Q
    |||         |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5830029 tca---------attaacaagactacacttaatctcattttatcttaccttgttataagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaaaactatcacata 5830119  T
Q  618 atatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 717  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5830120 atatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 5830219  T
Q  718 ttaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaactttt 775  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  5830220 ttaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttt 5830278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 7693230 - 7693622
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||     
T  7693230 ggaaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtgg 7693329  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  7693330 catcaaaagttcaatcctcttagtatcatcaattcattagattaacatgaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacaccccac 7693429  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||         |||||| |||| | ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  7693430 aaagtgtaacac---------tcacatgatattagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgcaa 7693520  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7693521 gcattactagatgaattactattgttcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaacttttttagaaaagtcagt 7693620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 390 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 23116397 - 23116008
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||| |  ||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||| ||     
T  23116397 ggaaaattctatggtgacgtcatgaaaatgactttttttatgaagttaacattataacatcaaaactgtagtgagtagcaccccactgtttgtacagtgg 23116298  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
     ||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  23116297 aatcaaaagttcagtttacatagtatcatcaattcatcagattaacaatattacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacaccccac 23116198  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23116197 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 23116098  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||        | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23116097 gcattac--------tgactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 23116008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 9200232 - 9200625
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||| ||||||||| ||    
T  9200232 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtacagtg 9200331  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||  |||    
T  9200332 acatcaaaagtttagtcctcttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacattcca 9200431  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||         |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  9200432 caaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctataagtctaagatgttgca 9200522  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||||||| ||||| |||||| ||||    
T  9200523 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaatttaaaattaaaattaattttttcaaaaaaatcag 9200622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 473 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 15992632 - 15992314
Alignment:
Q  473 cactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattt 572  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||  ||    
T  15992632 cactgtttgtacagtgacatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttgatctaattttattctaccttgatt 15992533  T
Q  573 taagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgta 672  Q
    | || | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||    
T  15992532 tgagtgcaacaccccacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcaggaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggta 15992433  T
Q  673 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaact 772  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15992432 agtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaact 15992333  T
Q  773 tttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||| ||||||||||||||    
T  15992332 ttttcaaaaaagtcagttt 15992314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 35933901 - 35934297
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| || ||||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||| |||||        | ||    
T  35933901 aggaaaattgtatggtgaagtcatgagaatgatttttttgatgaagttaacactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactt-------agtg 35933993  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
     |||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  35933994 gcatcaaaagtccagtcaccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctagtttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccct 35934093  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35934094 acaaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactttgtttccatgttaaagatgtcaacaataaaatagtaccggtaagtccaagatgttgc 35934193  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||    
T  35934194 aagcattactagttgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgattcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatca 35934293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 390 - 783
Target Start/End: Original strand, 15724490 - 15724881
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||| | | |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  15724490 ggaaaattctatggtgaagttatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaagttttgtgagtaacaccccactgtttatacaatga 15724589  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||| || |    
T  15724590 catcaaa-gttcagtcc-cataatatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttattttaagtataacacgcccc 15724687  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||| || |||||||||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  15724688 aaagtgtatcaattaagactatcatatgatatcaacaactttgtttacatgttaaagatgtcaactataaaatagtacttgtaagtccaaaatattgtaa 15724787  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||| ||||||    
T  15724788 gcattactagatgaattactattaatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaagttaaaattaactttttcaaaaaa 15724881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 22019632 - 22020024
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||||  || |||| ||| |||||||||||  || |||||||| | |||    
T  22019632 ggaaatttctatggtgaagttattagaatgacttttctggtgaagttaaaactatagaatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttgtatagtga 22019731  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22019732 catcaaaagttaagtccccttagtatcatcacttcatcatattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttattttaagtgtaacaccccac 22019831  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||| |||||||         ||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||   |||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||    
T  22019832 aaagtataacact---------cacatgatatcagcaactctatttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacttgtaagtctaagatgttgtaa 22019922  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  22019923 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 22020022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 387 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 14919707 - 14919313
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctgg-tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| | | ||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |    
T  14919707 aaaggaaaattatatggtgaagtcatgagaattattttttttgatgaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttatata 14919608  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||    
T  14919607 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaactcatcatattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttattataagtgtaacacc 14919508  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
     |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||    |||||||||||| ||    
T  14919507 tcacaaattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacaataaaattgta----taagtccaagatatt 14919412  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||| |      ||||||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  14919411 gcaatc------agatgaattac-attgatcattaatcagaaatctaaaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagt 14919319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 391 - 791
Target Start/End: Original strand, 32563150 - 32563541
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||  | ||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  32563150 gaaaattctatggtgaagtcattaaaatgatttttctgatgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccactgtctgtacagtgac 32563249  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  32563250 atcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacagcccaca 32563349  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    |||||||||||         |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  32563350 aagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttatagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgcaag 32563440  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
     |||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32563441 aattactagataaattattattgatcattaatcagcaattaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 32563540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 398 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 43308819 - 43308434
Alignment:
Q  398 ttatggtgaagtcatgagaacaacttttctg-gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaa 496  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |  || ||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  43308819 ttatggtgaagtcatgagaatgactttttttagtaaagttaacattataacatcaaaaatgtaatgaataacacc-cactgttcgtacaatggcatcaaa 43308721  T
Q  497 agttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgt 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||   |||||||    
T  43308720 agttcagtcctcatagtatcatcaactcatcagcttaacaaaactatacttaatctaattttatcttaccttgttataagtgtaacaccctgaaaagtgt 43308621  T
Q  597 aacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattac 696  Q
    |||||||||||||||        |||||||||| |  ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  43308620 aacacttaagactat--------atcatcaactcttcttgcatgttaaagattccgacaataaaatagtacctgtaagtcgaagatgttgcaagcattac 43308529  T
Q  697 tagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43308528 tagatgaattactattgatcattaatcagaaatcaacaatttaaaaacgaatcaaatactaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 43308434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 403 - 791
Target Start/End: Original strand, 8436979 - 8437366
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    |||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||   |  ||| ||||||||||||||   || |||||||||| ||||||||||||||||    
T  8436979 gtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaaattaacactatagcttccaaagtgtagtgagtaacatcccattgtttgtacagtgacatcaaaagttca 8437078  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||  ||||||||   ||| ||||| |||| | ||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||    ||||||||||| ||||||||||    
T  8437079 gtcctcattatatcatcaac-catcagatttacaaaactatgcttaatctaattttatcctgccttgttttaagttatacaccccacaatgtgtaacact 8437177  T
Q  603 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatg 702  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  8437178 taagattatcacataatatgatcaactctgtttgaatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgaaaacattactagatg 8437277  T
Q  703 aattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8437278 aattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 8437366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 422 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 21088908 - 21088541
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||     
T  21088908 ttttttggtgaagttaa-actgtagtataaaaaatgttgtgagtgacaccccactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaa 21088810  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 621  Q
    ||||| | | |||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21088809 ttcatcatactaacaagaatacatttaatctaactttatcctaccttgttttaagtgtaacatcccacaaagtgtaacacttaagattatcacataatat 21088710  T
Q  622 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 721  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||  | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21088709 catcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataacatctgtaaatccaagatgttgtaagcattactagatgaattactattaatcatgaa 21088610  T
Q  722 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaa-cttttttaaaaaagtcagtttt 792  Q
    | | ||||   |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||  |||||| ||||||||||||||    
T  21088609 taaataat---caatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaagttaatttttttttaaaaagtcagtttt 21088541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 541 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 2888469 - 2888207
Alignment:
Q  541 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatg 640  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||  |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||    
T  2888469 tacacttaatctaattttattttaccttgtttcaagtttaacattccataaagtgtaacacttaagactatcagataatatcatcaaatatgtttgcatg 2888370  T
Q  641 ttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaa 740  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2888369 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttacaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 2888270  T
Q  741 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||    
T  2888269 aaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaagtcaattttctgactgcacc 2888207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 14409501 - 14409115
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||| |||  |||| ||  |||  ||     
T  14409501 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaaatgtagtgagtagcaccccactcttaatacggtgg 14409402  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||           
T  14409401 catcaaaagttcagtc-tcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaact------ 14409309  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
            || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14409308 --------actcttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaa 14409217  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||| |||||| |||||    
T  14409216 acattactaaatgaattactattgatcattattcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaaaattaaaattaaatttttcaaaaaaatcagt 14409117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 432 - 791
Target Start/End: Original strand, 42342775 - 42343122
Alignment:
Q  432 aagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagat 531  Q
    ||||||| ||||||| || |||||||| |||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||  |   ||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  42342775 aagttaatactataacatcaaaaatgttgtgagtaataccccactgtttatacagtgacatcaaaaaatt--tccccttagtatcatcaattcatcagat 42342872  T
Q  532 taacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacttt 631  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| || |||||||||||||||||         ||||| |||||||||||| |    
T  42342873 taacaagaatacacttaatctaattttatcttac-ttgttttaagtgtaatacaccacaaagtgtaacact---------cacatgatatcatcaactct 42342962  T
Q  632 gtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatca 731  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  42342963 gtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataggacatgtaagtctaagatgttgcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatca 42343062  T
Q  732 acaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  42343063 acaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 42343122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 164; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 388 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 13956522 - 13956126
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  13956522 aaggaaaattctacggtgaagtcatgaaaatgacttttctcatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacacctcactgtttgtacact 13956423  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
      |||                || ||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||| |||||||||     
T  13956422 tgcat----------------at-gtatcatcaattcatcagattaacaaaacttcacttaatctaattttattttatcttgtttcaagtgtaacaccct 13956340  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13956339 acaaagcgtaacacttaagactatcatataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgttagtccaagatgttgc 13956240  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |   ||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||| |||    
T  13956239 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaattt--aactttttcaaacattaaaatcaaaattaacattttcaaaaaaatca 13956142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 162; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 389 - 741
Target Start/End: Complemental strand, 1429321 - 1428983
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||| | |||||||||||||||| ||  ||| || |||||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  1429321 aggaaaaatctatggtgaagtcatgaaaatgactcttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacactg 1429222  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||||                
T  1429221 gcatcaaaaattcagtctccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagactacatttaatctaattttatcctaccttgttttaag------------ 1429134  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1429133 -----tgtaacacttaagactatcacataatatcataaactttatttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 1429039  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa---tcaacaatttaaa 741  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||    
T  1429038 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatattcaacaatttaaa 1428983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 448 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 23954907 - 23954563
Alignment:
Q  448 ataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa-tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacact 546  Q
    ||||||||| |||||||||||||  |||||||| ||| | || |||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||    
T  23954907 ataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttttactagtggcatcaaaagttcagtttccatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacact 23954808  T
Q  547 taatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaag 646  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  23954807 taatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaaatgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaa- 23954709  T
Q  647 attttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatga 746  Q
    ||   |||||||||||| ||  ||||||| |||||||     | ||||||| ||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  23954708 atgccaacgataaaataatatttgtaagtgcaagatg-----aacattacttgatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatga 23954621  T
Q  747 atcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    || ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||| |||||    
T  23954620 attaaacattaagatcataattaactttttcaaaaaagtcagtttcctgactgcacca 23954563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 388 - 629
Target Start/End: Complemental strand, 5112490 - 5112250
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  5112490 aaggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaatactataacataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagt 5112391  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||    
T  5112390 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcattaaattaacaagactatacttaatctaattttatcataccatgttttaagtgtaa-acccc 5112292  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaact 629  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5112291 acaaagtacaacacttaagactttcacataatatcatcaact 5112250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 541 - 791
Target Start/End: Original strand, 25669737 - 25669977
Alignment:
Q  541 tacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatg 640  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||         ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25669737 tacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa-gtgtaacact---------cacatgatatcatcaactctgtttgcatg 25669826  T
Q  641 ttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaa 740  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25669827 ttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtctaaaatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaa 25669926  T
Q  741 aaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  25669927 aaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatcagttt 25669977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 403 - 648
Target Start/End: Original strand, 26268087 - 26268332
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttca 502  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||  || |||| |||  ||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||||| |    
T  26268087 gtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttttgagtaacaccccactgtttgtacggtgacatcaaaagttta 26268186  T
Q  503 gtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26268187 gtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacaattaatcaaattttatcataccttgttttaagtgtaacaccgcacaaagtgtaacact 26268286  T
Q  603 taagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 648  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  26268287 taagactatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagat 26268332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Original strand, 8466743 - 8467127
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||| ||||||  | || |||||||| |    
T  8466743 aaggaaaattctatgatgaggtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactgtaacatcaaaagtgttgtgaataacacccc-ctctttgtacagt 8466841  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |  |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||                
T  8466842 ggtatcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatttaattttattctaccttgttttaaa----------- 8466930  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
          |||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||| ||| |||||| | | |||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||    
T  8466931 ------tgtaacacttaagactatcatatgatatcaccaactctgtttacatattaaaggtgt-aacgataaaatattatttgtaagtccaaaatgttgc 8467023  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||| |||    
T  8467024 aagcattactagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacagtttaaaaatgaatcaaacattaaaaataaaattaactttttaaaaaaaatca 8467123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 451 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 6824595 - 6824329
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt--tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacactta 548  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  6824595 aaaagtgttgtgagtaacactccactgtttgtacagtgacatcaaaagtgttcagtcttcatagtatcatcaatttatcagattaacaagaatacactta 6824496  T
Q  549 atctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagat 648  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  6824495 atctaattttatcataccttgttttaaatgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacaagatat-agcaactctgtttgcatgttaaagat 6824397  T
Q  649 tttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatca 717  Q
     | || ||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  6824396 gtcaa-gataaaacaatacatgtaagtctaagatgttgcaagcatcactagatgagatactattgatca 6824329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 604 - 791
Target Start/End: Original strand, 25889584 - 25889771
Alignment:
Q  604 aagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatga 703  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25889584 aagattatgacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagataccaacaataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgaaagcattactagatga 25889683  T
Q  704 attactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||    
T  25889684 attactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaacttttccagaaaagtcagttt 25889771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 652 - 788
Target Start/End: Complemental strand, 28416464 - 28416328
Alignment:
Q  652 aacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaa 751  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  28416464 aacgataaaatagtacttttaagtccaagatgttgcaagcattacttgatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaaagaatcaa 28416365  T
Q  752 acaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28416364 acattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcag 28416328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 429 - 602
Target Start/End: Complemental strand, 28416663 - 28416490
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||||   ||||||||||||| ||  |||||||||||| ||  | || |||||||| ||||| |    
T  28416663 gtgaagttaacactataatatcaaaagtattgtgagtaacatcccactgtttgtacagtggaatcaaaagttcaatctccttaatatcatcaattcatca 28416564  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacact 602  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28416563 gattaacaagaatacacttaatctaattttattctgccttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacact 28416490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 655 - 791
Target Start/End: Original strand, 26269074 - 26269210
Alignment:
Q  655 gataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 754  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  26269074 gataaaatagtacctgtaagtttaagatgttgtaagcaatactagataaattactactgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaccaatca 26269173  T
Q  755 ataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
     |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  26269174 ttaagattaaaattaactttttcataaaagtcagttt 26269210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 689 - 804
Target Start/End: Original strand, 43254154 - 43254269
Alignment:
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  43254154 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttccaaaaaagtcaa 43254253  T
Q  789 ttttttgactacacca 804  Q
    |||  ||||| |||||    
T  43254254 tttcctgactgcacca 43254269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 427 - 545
Target Start/End: Original strand, 25668687 - 25668804
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||| ||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||| || ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  25668687 tggtgaagttaacact-taacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgaacagtggcatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcat 25668785  T
Q  527 tagattaacaagattacac 545  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  25668786 tagattaacaagaatacac 25668804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 392 - 526
Target Start/End: Original strand, 11898004 - 11898138
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| | ||||  || |||| || | ||||||||||   |||  ||||||| |||||    
T  11898004 aaaattttagggtgaagtcatgataataacttttctggtaaagttaatattatagcatcaaaagtgcactgagtaacaccctactagttgtacagtgaca 11898103  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11898104 tcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 11898138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 16004552 - 16004474
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaa 467  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  16004552 ggaaaattctatggtaaagtcatgagaattgacttttctggtgaagttaacactataacatcaaaaatgttgtgagtaa 16004474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26317859 - 26317779
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||    
T  26317859 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacac 26317779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 584 - 635
Target Start/End: Original strand, 11898148 - 11898199
Alignment:
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgttt 635  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  11898148 ccccacaaagtgtaacccttaagaatatcacataacatcatcaactctgttt 11898199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 444
Target Start/End: Original strand, 13380498 - 13380549
Alignment:
Q  393 aaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactat 444  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||    
T  13380498 aaattttatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaaccctat 13380549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Original strand, 22616491 - 22616542
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  22616491 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaa 22616542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36055923 - 36055874
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  36055923 aggaaaattttatggtgatgtcatgagaatgacttttcttgtgaagttaa 36055874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 389 - 438
Target Start/End: Original strand, 27579038 - 27579087
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  27579038 aggaaaattttatggtgaaatcgtgaaaacgacttttttggtgaagttaa 27579087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 391 - 804
Target Start/End: Original strand, 10922724 - 10923137
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||  | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  10922724 gaaaattttatggtgaaatcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaagaccccactgtttgtacaatgac 10922823  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||| |||||||| ||||    
T  10922824 atcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaactcatcagattaacaagactacacttaatcttattttatcataccttgttataagggtaacacctcaca 10922923  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10922924 aagtgtaacacttaagactgtcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattctgacaataaaatagtatctgtaagtccaaaatgttgcaag 10923023  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  10923024 cattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaagagtcagtt 10923123  T
Q  791 ttttgactacacca 804  Q
    || ||||| |||||    
T  10923124 ttctgactgcacca 10923137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 427 - 803
Target Start/End: Original strand, 32216088 - 32216464
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32216088 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacacaccactgtttgtacaatggcgtcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcaattcat 32216187  T
Q  527 tagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 626  Q
    ||||||||||| | || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32216188 tagattaacaaaactaaacttaatcaaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcataa 32216287  T
Q  627 actttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcact 726  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32216288 actctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagt 32216387  T
Q  727 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32216388 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttctgactgcacc 32216464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 387 - 787
Target Start/End: Original strand, 32267027 - 32267427
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| | |||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  32267027 aaaggaaaattttatggtgaagtcataagaatgactttttttgtgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 32267126  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |    
T  32267127 tgacatcaaaagttcactcctcatattatcatcaacccatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacactc 32267226  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32267227 cacaaagtgtaacactcaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaatattccaactataaaatagtacctgtaggtccaagatgttg 32267326  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  32267327 caagcattactagatgaattactattgaacattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtc 32267426  T
Q  787 a 787  Q
    |    
T  32267427 a 32267427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 392 - 803
Target Start/End: Original strand, 15752027 - 15752438
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15752027 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatatagtgagtaacacctcactgtttgtacaatggca 15752126  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  15752127 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagcgtaacaccccataa 15752226  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||      
T  15752227 agtgtaacacttaagagtatcacataatatcattaactctgtttgcatgttaaaaattccaacgacaaaataatacatgtaagtccaagaagttgcaatt 15752326  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||    
T  15752327 tttactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaattttttttaaaaaatcaattt 15752426  T
Q  792 tttgactacacc 803  Q
    | ||||| ||||    
T  15752427 tctgactgcacc 15752438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 2959743 - 2960145
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||   ||||||||||||| ||    
T  2959743 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtaagtaacatcccactgtttgtacagtg 2959842  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| ||||    
T  2959843 acatcaaaagttcagtcctcatagtgtcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatccca 2959942  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2959943 caaattgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgca 2960042  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2960043 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcag 2960142  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  2960143 ttt 2960145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 388 - 798
Target Start/End: Original strand, 16415639 - 16416050
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-tcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||||||||||  | | ||||||||||     
T  16415639 aaggaaaattctaaggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacaccctaaatgtttgtacag 16415738  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||    
T  16415739 tggcatcaaaagttcagccatcatagtatcatcaattcattagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccc 16415838  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16415839 cacatattgtaatacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 16415938  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||     
T  16415939 caagcattattagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagtt 16416038  T
Q  787 agttttttgact 798  Q
    |||| |||||||    
T  16416039 agttatttgact 16416050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 390 - 804
Target Start/End: Original strand, 23999343 - 23999758
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | |||| ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  |||||||||  |||| |||||| |||||    
T  23999343 ggaaaattttatggtgaagtcataagaatgatttttttggtgaagttaacactacaacataaaaaatataacgagtaacaccccactatttgtagaatga 23999442  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||    
T  23999443 catcaaaagttcagccctcatagtattatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctac 23999542  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23999543 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 23999642  T
Q  690 gcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  23999643 gcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtcaa 23999742  T
Q  789 ttttttgactacacca 804  Q
    |||  ||||| |||||    
T  23999743 tttcctgactgcacca 23999758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 30254419 - 30254820
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  30254419 aggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgttgaagttaacaatataacatcaaaaatgtaatgagtaataca-cactgtttgtacaatg 30254517  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |    
T  30254518 acatcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcaattcatcagattaacaagactagacttaatctaattttatcctaccttgttataagcataacacccta 30254617  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
     |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30254618 taaagtgtaacacttaagactgtcacataataacatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgca 30254717  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30254718 agcattactagatgaattactattgattattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 30254817  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  30254818 ttt 30254820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 389 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 10182189 - 10181773
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| ||    
T  10182189 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacttttttggtgaagttaaaactgtaacataaaaaatatagtgcgtaacacgccactgtttgtacagtg 10182090  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||    
T  10182089 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcgtcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccca 10181990  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacc-tgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||   ||| ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10181989 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgacaacaatacaatagtaccttgtaagtccaaaatgttgc 10181890  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||||| |    
T  10181889 aagcattactagatgaattactattgaacattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaagtta 10181790  T
Q  788 gttttttgactacacca 804  Q
    ||||  ||||| |||||    
T  10181789 gtttcctgactgcacca 10181773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 400 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 28564951 - 28564566
Alignment:
Q  400 atggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt 499  Q
    |||||||||| |||| ||  | |||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  28564951 atggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccttactgtttgtacaatgacatcaaaagt 28564852  T
Q  500 tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| || ||||| |||||||||  ||||||||||    
T  28564851 tcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcatgccttgttataagcataacaccccgtaaagtgtaac 28564752  T
Q  600 acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 699  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28564751 acttaa--ctatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactag 28564654  T
Q  700 atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28564653 atgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 28564566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 19899950 - 19899547
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19899950 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgatttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaacgagtaacacctcactgtttgtagaatg 19899851  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| || || |||||||||||||| |    
T  19899850 gcatcaaaagttcaaccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcatacattgttctaagcgtaacacccta 19899751  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19899750 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcaccaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgca 19899651  T
Q  689 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  19899650 agcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttccaaaaaagtca 19899551  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  19899550 gttt 19899547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 38823210 - 38823611
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| | |||||||||  |||| |||||||| ||     
T  38823210 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggttaagttaacactatagcatcaaaattgttgcgagtaacaccccactatttgtacagtgt 38823309  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||    
T  38823310 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttattttaagtgtaacacccaac 38823409  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||   |||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  38823410 aaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttagagatgccaacgataaaataatacctgtaagtctaaaatgttgcaa 38823509  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38823510 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaacaaatattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 38823609  T
Q  790 tt 791  Q
    ||    
T  38823610 tt 38823611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 388 - 783
Target Start/End: Original strand, 15382927 - 15383323
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||| || | ||  |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||    
T  15382927 aaggaaaattctatggtgaagttataaaaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatcccaccgtttgtacaat 15383026  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  15383027 gtcatcaaaagttcagtcatcgtagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacccc 15383126  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15383127 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtatgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgc 15383226  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15383227 aagcattactagatgaattactattgattattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaa 15383323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 390 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27227657 - 27227280
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||| |      ||| |||||||||||||| ||     
T  27227657 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtact------cacctcactgtttgtacagtgg 27227566  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27227565 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccac 27227466  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27227465 aaagtgcaacacttaagactatcacatgatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaa 27227366  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 775  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27227365 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaccatttaaaaatgaattaaacattaatatcaaaattaactttt 27227280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 420 - 801
Target Start/End: Original strand, 51128885 - 51129264
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  51128885 acttttttagtgaagttaacactataacataaaaaatgtaatgagtaacactccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcattatagtatcatc 51128984  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    | ||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  51128985 aattcatcatattaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttataagtgtaacaccccacaaagtgtaacaattaaaactatcacataat 51129084  T
Q  620 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 719  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129085 atcatcaactctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 51129184  T
Q  720 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactaca 801  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||  ||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||||    
T  51129185 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaagtattaaaat--aaattaactttttcaaaaaagtcaatttcttaactaca 51129264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 388 - 798
Target Start/End: Original strand, 8222125 - 8222532
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| || ||||||||||| | ||  || ||| | |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||| |||   |||||    
T  8222125 aaggaaaattctacggtgaagtcataaaaatgacctttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacaccacaccgtt---acaat 8222221  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  8222222 ggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacacccc 8222321  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8222322 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgc 8222421  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8222422 aagcattactagatgaatta-tattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtc 8222520  T
Q  787 agttttttgact 798  Q
    |||||| |||||    
T  8222521 agttttctgact 8222532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 380 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 238702 - 238300
Alignment:
Q  380 ttaataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtt 479  Q
    |||||| |||| |||||| ||| ||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||   |||||||    
T  238702 ttaatataaagaaaaattctatagtgaagtcacgaaaataacttttttggtgaagttaacactatagtattaaaaatgttgtgagtaacatc-cactgtt 238604  T
Q  480 tgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||    
T  238603 tgtacaatgacatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattaatcagactaacaagaatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgt 238504  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 679  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||| || ||||||||||||    
T  238503 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaataatatctgtaagtccaa 238404  T
Q  680 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaa 779  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||| ||    
T  238403 gatgttgcaagcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatccacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaatcaactttttcaa 238304  T
Q  780 aaaa 783  Q
    ||||    
T  238303 aaaa 238300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 400 - 787
Target Start/End: Original strand, 37451292 - 37451678
Alignment:
Q  400 atggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagt 499  Q
    ||||||||||||| | ||  |||||| |||| ||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||   || |||||||||||||||||||||||    
T  37451292 atggtgaagtcataaaaatgacttttttggtaaagttaacactataacatcaaaaatgtaataagtaacaccctaccgtttgtacaatgacatcaaaagt 37451391  T
Q  500 tcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaac 599  Q
    ||||||||| ||||||||||| || || | |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| || ||||||||||    
T  37451392 tcagtcctc-tagtatcatcaatttatcatattaacaagactacacttaatctaattttatctgaccttgttataagtgtaacacctcaaaaagtgtaac 37451490  T
Q  600 acttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactag 699  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37451491 acttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacattactag 37451590  T
Q  700 atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  37451591 atgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaataaaaattaactttttcaaaaaagtca 37451678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 391 - 791
Target Start/End: Original strand, 14758038 - 14758429
Alignment:
Q  391 gaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgac 490  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||  || |    
T  14758038 gaaaattttacggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagtcaacactataacatcaaaagtgtagtgagtagcacacaactgtttgtacggtggc 14758137  T
Q  491 atcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccaca 590  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |    
T  14758138 atcaaaagttcagtccccatagtttcatcaattcattagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccaga 14758237  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    ||         ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14758238 aa---------ttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaag 14758328  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14758329 cattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagtt 14758428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 392 - 783
Target Start/End: Original strand, 28769651 - 28770042
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||| | || ||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||  ||| |||||||||||| ||    
T  28769651 aaaattctatggtgaagtcataaaaataactttttttgtgaagttaacactatgacatcaaaaatgtaatgagtaacacc-caccgtttgtacaatggca 28769749  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc-aca 590  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||||||||||| |||    
T  28769750 tcaaaggttcggtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataaacgtaacacccccaca 28769849  T
Q  591 aagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaag 690  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  28769850 aagtgtaacgcttaagactatcacataatatcatcacctctgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaaa 28769949  T
Q  691 cattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  28769950 cattgctagatgaattactattgatcattaattaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaa 28770042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 420 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 9903204 - 9902837
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||    
T  9903204 acttttttgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacaccccgctgtttgtacagtgacatcaaaagttcaatccacatactatcatc 9903105  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    | ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9903104 aattcatcaaattaacaagactacacttaatctaattttatcttacattgtttcaagtgtaacaccccacaaaatgtaacacttaagactatcacataat 9903005  T
Q  620 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 719  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9903004 atcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgacaacgataaaatagtaccagtaagtccaagatgctgcaagcactactagatgaattactattgatcatt 9902905  T
Q  720 aatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9902904 aatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 9902837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 387 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 34012560 - 34012161
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||  || ||| || ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||  ||||||||||| |     
T  34012560 aaaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgacgtttatgatgaagttaacactataacatcaacactgtagtgagtaacactccactgtttgtaaag 34012461  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||    
T  34012460 tggcatcaaaagttcagtcatcatactatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatccaaccttgtttcaagtgtaacaccc 34012361  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  34012360 cacaaaatgtaacac-----actatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagttcaagatgttg 34012266  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34012265 caagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 34012166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 396 - 803
Target Start/End: Original strand, 47279191 - 47279599
Alignment:
Q  396 ttttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaa 495  Q
    |||| |||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||| |||| ||| |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||| || |||| |    
T  47279191 ttttttggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacattatactatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcga 47279290  T
Q  496 aagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtg 595  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| |||| ||||||    
T  47279291 aagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaattgtaacatcccataaagtg 47279390  T
Q  596 taacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcatta 695  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  47279391 taacacttaagactatcacatgatatcaacaactatgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctgtaagtccaagatgttgcaaacatta 47279490  T
Q  696 ctagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt-taaaaaagtcagtttttt 794  Q
     |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||| |    
T  47279491 ttagatgaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaaatcagttttat 47279590  T
Q  795 gactacacc 803  Q
    |||| ||||    
T  47279591 gactgcacc 47279599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 7079254 - 7078842
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacaca-----------tcactgt 478  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||            |||||||    
T  7079254 ggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaacactataatatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactaacacctcactgt 7079155  T
Q  479 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcg 578  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  7079154 ttgtacaatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtg 7079055  T
Q  579 taacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcca 678  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||| |    
T  7079054 taacaccccacaaagtataagacttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatatgtaagtcta 7078955  T
Q  679 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttta 778  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |    
T  7078954 agatattgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttca 7078855  T
Q  779 aaaaagtcagttt 791  Q
    ||||| |||||||    
T  7078854 aaaaaatcagttt 7078842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 429 - 791
Target Start/End: Original strand, 46931446 - 46931807
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| || | |||||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| |    
T  46931446 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaataccccactgtttgtagaacggcatcaaaaattcagccctcataatatcatcaattcatca 46931545  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46931546 ggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttc--agcgtaacaccctacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 46931643  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcacta 727  Q
    | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||    
T  46931644 tctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatatattattgatcattaatcagta 46931743  T
Q  728 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  46931744 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 46931807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 390 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 47682673 - 47682260
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||  | |||| ||||||| ||    
T  47682673 ggaaaattttatggtgaagtcatgagagtgacttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgttgtgagtaacactcccactgcttgtacagtg 47682576  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||  | |||| ||||||| |||||||| ||    
T  47682575 gtatcaaaagttcattcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacatttaaactaattttattctgccttgttttaagtgtaacacctca 47682476  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47682475 caaagtgtaacacttaagactatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgttgca 47682376  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  47682375 agcattactaaatgaattactattgatcattaatcagtaattaacaatttaaaaaagaattaaacattaagattaaaattaacttgttcaaaaaagtcag 47682276  T
Q  789 ttttttgactacacca 804  Q
    |||  ||||| |||||    
T  47682275 tttactgactgcacca 47682260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 390 - 775
Target Start/End: Complemental strand, 27267376 - 27266995
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||     
T  27267376 ggaaaattatatg-tgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacactagcata--aaaaatgtagtgagtgacaccccactgtttgtacagtgg 27267280  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||    
T  27267279 cattaaaagttcagtctccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaatttaatct-accttgttttgagtgtaacaccccac 27267181  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  27267180 aaagtgcaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaa 27267081  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttt 775  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  27267080 gcattactagatgaattactattgataattaatcaataatcaataatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttt 27266995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 390 - 783
Target Start/End: Original strand, 42721035 - 42721425
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||  | |||| ||||||||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| | |    
T  42721035 ggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatgatttttttggtgaagttagccctatatcataaaaaatatagtgagtaacaccccactgtttgtacagtaa 42721134  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||    
T  42721135 catcaaaagttcaatccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaataccccac 42721234  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  42721235 aaagtataacacttaagattatcacgtaatatcatcaactttgtttgcatgttaaaga---caacgataaaatattacatgtaagtccaagatgttgcaa 42721331  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
      |||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  42721332 ttattactagattaattactattgatcattaatgagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcataattaacttttttaaaaaa 42721425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 386 - 791
Target Start/End: Original strand, 1547279 - 1547668
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||    
T  1547279 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactataacataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtgca 1547378  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
     || ||||||||||||||| ||||||||||||||||        |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||    
T  1547379 gtggcatcaaaagttcagttctcatagtatcatcag--------attaacaaaaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacacc 1547470  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||        ||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1547471 ccacaaagtgtaacactcaaaactatcacatgatatcaacaactctgtt--------aaagataccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 1547562  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  1547563 gcaagcattactagatgaattaccattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaattttttcaaaaaagt 1547662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 389 - 754
Target Start/End: Original strand, 18422646 - 18423004
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  18422646 aggaaaattctatggtgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatataacgagtaacaccccaccgtttgtacaatg 18422745  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  18422746 acatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctaccttgttatatgcgtaacacccca 18422845  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||  |||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18422846 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcacctccgtttgcatgttaaagattccaacgataaaaaagcacatgtaagtccaagatgttgca 18422945  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 754  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18422946 agcattgctagatgaattactattgatcat-------taatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 18423004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 477 - 777
Target Start/End: Original strand, 25160715 - 25161016
Alignment:
Q  477 gtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaag 576  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| || ||||    
T  25160715 gtttgtacaatggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagattaataagactacacttaatctcattttatcctaccttgttataag 25160814  T
Q  577 cgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtc 676  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||    
T  25160815 tgtaacaccccacaaagtataacacttaaaactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtc 25160914  T
Q  677 caagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaactttt 775  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  25160915 caagatgttgcaagcattactatatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaaccttt 25161014  T
Q  776 tt 777  Q
    ||    
T  25161015 tt 25161016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 403 - 803
Target Start/End: Original strand, 4330288 - 4330690
Alignment:
Q  403 gtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa-cactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgtacaatgacatcaaaagtt 500  Q
    ||||||| |||||||  ||||||||| ||||| ||| |||||||  || |||| |||||||||||||||  | | |||||||||| ||  ||||||||||    
T  4330288 gtgaagttatgagaatgacttttctgatgaagataaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtaacacccccaatgtttgtacagtgggatcaaaagtt 4330387  T
Q  501 cagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaaca 600  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  4330388 cagtcatcatagtatcatcaatttatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaaaatgtaaca 4330487  T
Q  601 cttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactaga 700  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4330488 cttaagactatcacataatatcatcaactctttttgcatgttaaagatgtcaaagataaaatagtacttgtaagtccaatatgttgcaagcattactaga 4330587  T
Q  701 tgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactac 800  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||| |||||| | ||||| |    
T  4330588 tgaattacaattgatcattaatcagtaatcaacaatataaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttccaaaaaaatcagttgtctgactgc 4330687  T
Q  801 acc 803  Q
    |||    
T  4330688 acc 4330690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 385 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 11742535 - 11742147
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  11742535 aaaaaggaaaattttatcgtgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatattatcaaaagtgttgtaagtaacaccccactgtttgtac 11742436  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacac 584  Q
    | |||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||            
T  11742435 agtgacatcaaaagttcagtcc-cataatatcatcaattcatcggattaacaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaag-------- 11742345  T
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
             ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| | |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11742344 ---------tgtaacaattaagactatcacatgatatcagcaactctctttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgt 11742254  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||     
T  11742253 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaa 11742154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 387 - 791
Target Start/End: Original strand, 15168082 - 15168493
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| ||| ||||||| |||||||    |||||||||||||| |||||||||  || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||      
T  15168082 aaaggaaaattctatcgtgaagtgatgagaatgctttttctggtgaagtcaacactatagcatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacgt 15168181  T
Q  487 tga-------catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgt 579  Q
    ||        ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||    
T  15168182 tgtacggtggcatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcagttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgt 15168281  T
Q  580 aacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaa 679  Q
    |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15168282 aacacctcagaaagtgtaacacttaaggctatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtacaa 15168381  T
Q  680 gatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaa 779  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15168382 gatgttgcaagcattattagatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaa 15168481  T
Q  780 aaaagtcagttt 791  Q
    |||| |||||||    
T  15168482 aaaaatcagttt 15168493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 390 - 770
Target Start/End: Complemental strand, 30327132 - 30326751
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| ||| |||||||||| | ||  |||||| | ||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||   || |||||||||||      
T  30327132 ggaaaattctatagtgaagtcataaaaatgactttttttgtgaatttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaatacccaaccgtttgtacaatag 30327033  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  30327032 catcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctcattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccac 30326933  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  30326932 aaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatttaagtccaagatgttgcaa 30326833  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaa 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||    
T  30326832 gcattactagatgaattactattgatcatcaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaaatcaaatattaaaatcaaaattaa 30326751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 429 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 27763451 - 27763093
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||  ||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || |    
T  27763451 gtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacc-catagtttgtagaatgacatcaaaagtccagccctcatagtatcatcaatttatca 27763353  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27763352 ggttaacaagactacacttaatctaattttatcatacctagttctaagcgtaacaccctacaaagtgtaatacttaagactatcacataatataatcaac 27763253  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat-tactattgatcattaatcacta 727  Q
    | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||    
T  27763252 tctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagttcaagatgttgcaagcattactagataaatatactattgatcattaatcagta 27763153  T
Q  728 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  27763152 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaatgtca 27763093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 210; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 406 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 27533144 - 27532761
Alignment:
Q  406 aagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtc 505  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| | | ||| ||||||   |||| |||||||| || ||||||||||||| ||    
T  27533144 aagttatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtattgtgggtaacaacccactctttgtacagtggcatcaaaagttcaatc 27533045  T
Q  506 ctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaa 605  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||    
T  27533044 cccatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatc-aattttatcctaccttgttttaagtgtaacacctcacaaagtgtaacactcaa 27532946  T
Q  606 gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 705  Q
    ||||||||||| |||||| ||| | |||||||| |||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27532945 gactatcacatgatatcagcaattctgtttgcaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaat 27532846  T
Q  706 tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27532845 tactattgatcattaatcagtaatcaacaa-ttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaatcagttt 27532761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 387 - 803
Target Start/End: Original strand, 3534925 - 3535332
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| |||  ||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||| ||||||||||| | ||||||||| ||     
T  3534925 aaaggaaaattctattatgaagtcattagaattaattttctagtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactgtttgtgcag 3535024  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||||||| | || ||| |||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||    
T  3535025 tgacatcaaaagttcagtccccttaatattatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcctgccttgttttaagtgtaacaccc 3535124  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||         ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3535125 cacaaagtgtaacactta---------catgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacctttaagtccaagatgttg 3535215  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| ||    
T  3535216 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcaacaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaactaactttttaaaaaaaatc 3535315  T
Q  787 agttttttgactacacc 803  Q
    |||||  ||||||||||    
T  3535316 agtttcatgactacacc 3535332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 429 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 27564046 - 27563671
Alignment:
Q  429 gtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcatta 528  Q
    ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |  ||| ||| |||| ||||| |    
T  27564046 gtgaagttaacactataactttaaaaatatagtgagtaacactccactgtttgtatagtgacatcaaaagttcagttccgataatattatcaattcatca 27563947  T
Q  529 gattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaac 628  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27563946 gattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtataataccccacaaagaggaacacttaagactatcatataatttcatcaac 27563847  T
Q  629 tttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaa 728  Q
    | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  27563846 tctgtttgcatgttaaagatgcaaacgataaaatagtatatgtaagtccaagatgttgcaagtattactagatgaattaatattgatcattaatcagtaa 27563747  T
Q  729 tcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||||||  ||||| |||||    
T  27563746 tcaacaatttaaaaaagaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaaaatcagtttcctgactgcacca 27563671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 387 - 787
Target Start/End: Original strand, 39393376 - 39393777
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||  ||||||||  ||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||| || ||| ||||||||||     
T  39393376 aaaggaaaattctacggtgaagttatgagaatgacttttctaatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaatacttcattgtttgtacag 39393475  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |    
T  39393476 tggcatcaaaagtttaatccccatagtatcataaattcatcagattaacaagaatacacttcatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacatc 39393575  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  39393576 ctacaaagtgtaacacttaagactatcatatgatattagcaactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtaccggtaaatccaagatgtt 39393675  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  39393676 gcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaaaattaaaattaacttttttaaaaaagt 39393775  T
Q  786 ca 787  Q
    ||    
T  39393776 ca 39393777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 385 - 776
Target Start/End: Original strand, 3309139 - 3309536
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtac 484  Q
    |||| |||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  ||||||||||||    
T  3309139 aaaatggaaaattctatggtaaagtcatgagaatgacttttctggtaaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacc-cactgtttgtac 3309237  T
Q  485 aatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    | ||  |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| || ||||||  ||||||    
T  3309238 agtggtatcaaaagttcaatcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaatttttaacctactttgttttaaatgtaaca 3309337  T
Q  584 ccccacaa-----agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtcca 678  Q
    || ||| |     |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3309338 cctcactacactaagtgtaacacttaagactatcaaatgatatcagcaactctgtttgtatgttaaagatgccaacgataaaatagtacccgtaagtcca 3309437  T
Q  679 agatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataaga-tcaaaattaacttttt 776  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||    
T  3309438 agatattgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacatttagatttaaaattaacttttt 3309536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 489 - 792
Target Start/End: Original strand, 22170806 - 22171109
Alignment:
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||  |||||||||||    
T  22170806 acatcaaaagttcagtctacataatatcatcaattcattagattaataacactacacttaatctaatttcatcctaccttgtttcaaatgtaacacccca 22170905  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  22170906 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaataattcttgtaagtctaagatgttgca 22171005  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    | ||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22171006 aacattattagataaattactattgatcattaattagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaaatcag 22171105  T
Q  789 tttt 792  Q
    ||||    
T  22171106 tttt 22171109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 180; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31621733 - 31621327
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||| || |||  |||| |||||| |||  | || |||||||  ||     
T  31621733 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagtcaacactataacatcaaaggtgtattgagtagcaccccgctatttgtacggtgg 31621634  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | || ||||||     
T  31621633 catcaaaaattcagtccccatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgcaataccccag 31621534  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaa-----agattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||     ||||   |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  31621533 aa-gtgtgacacttaagactatcgcataatatcaacaactatgtttgcatgttaagttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagttcaatatgt 31621435  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaattta-aaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31621434 tgcaagcattagtagatgaactactattgatcattaatcatcaatcaacaatttaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaa 31621335  T
Q  784 gtcagttt 791  Q
    ||||||||    
T  31621334 gtcagttt 31621327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 385 - 742
Target Start/End: Complemental strand, 37619081 - 37618729
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc--actgtttgt 482  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||  |||||| |||||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||| |  |||||||||    
T  37619081 aaaaaggaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttggtgaagttaacactataacatcaaaaatttaatgagtaaaacaccccactgtttgt 37618982  T
Q  483 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtat--catcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgta 580  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| ||    
T  37618981 aaaatgacatcaaaagttcagttctcatagtatatcatcaattcatcagattaacaatactacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcata 37618882  T
Q  581 acaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaag 680  Q
    ||| |||| ||||||||||||         ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37618881 acatcccataaagtgtaacac---------tcatataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgataaaataatacatgtaagtccaag 37618791  T
Q  681 atgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaa 742  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  37618790 atgttgcaagcattactagatgaattagtattgaccattaatcaataatcaacaatttaaaa 37618729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 422 - 792
Target Start/End: Original strand, 40884841 - 40885212
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||||| |||  ||||||||||||  || |||||||||||||||||  |||||||| |||     
T  40884841 ttttctggtgaagtcaacaccataacatcaaaagtgtagtgagtagcaccccactgtttgtacggtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcttcaa 40884940  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 621  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||| ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40884941 ttcatcagattaacaagattgcacttaatctagttttatcctatcttgttttaagtgtaacattccgaaaagtgtaacacttaagactatcgcataatat 40885040  T
Q  622 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 721  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40885041 catcaactatgtttgcatgttaaagatgccgatgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaaacattactagatgaattactattgatcattaa 40885140  T
Q  722 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaa-ttaacttttttaaaaaagtcagtttt 792  Q
    | |  |||||| |||| ||||||||||| || | |||| | |||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  40885141 ttagcaatcaataattcaaaaatgaatcgaatattaaggttaaaagttaacatttttaaaaaagtcaatttt 40885212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 174; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 392 - 792
Target Start/End: Original strand, 41926161 - 41926554
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||  | |||| || ||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| |   ||||||||||||| || ||    
T  41926161 aaaattctatggtgaagttatgaaaatgatttttttgatgaagttaatactataacatcaaaaatatagtgagtaatatcccactgtttgtacagtggca 41926260  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||| ||||||    
T  41926261 tcacaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaagattacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaacactccacaa 41926360  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||      ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  41926361 agtgtaacact------tattaaataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt-caagc 41926453  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| ||||  |||||| |||||||    
T  41926454 attactagatgaattactattgatcattaattaataatcaatgatttaaaattgaatcaaacattaaaatcataattaatttttaaaaaaaaatcagttt 41926553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33725778 - 33725390
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||  |||||||| ||||||| ||| |||||  || |||| |||| |||||| ||   |||| ||| |    || ||    
T  33725778 aaaattctatggtaaagtcaagagaatgacttttctagtgaagtcaacgctatatcatcaaaagtgtattgagtagcagcccactatttctttggtggca 33725679  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||| ||    
T  33725678 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagactgcacttaatctaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccagaa 33725579  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |    
T  33725578 agtgtaacatttaagactatcgcataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagaccaaaatgttgcaaac 33725479  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatt-taaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtt 790  Q
                |||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||    
T  33725478 ------------attactattgatcattaatcagcaatcaacaattaaaaaaatgaatcgaacattaagatcaaaataaactttttcaaaaaaatcagtt 33725391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 586 - 791
Target Start/End: Original strand, 48353735 - 48353939
Alignment:
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  48353735 ccacaaagtgtaacact-aagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtccaagatatt 48353833  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  48353834 gcaagcattactagatgaattattattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaaat 48353933  T
Q  786 cagttt 791  Q
    ||||||    
T  48353934 cagttt 48353939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 586 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 1359919 - 1359703
Alignment:
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  1359919 ccacaaagtgtaacacttaagattatcatataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaagttcaaaatgtt 1359820  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||   |||||| || ||||    
T  1359819 gcaagcattactggatgaattactatcgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatc-aaattttttttttttaacaagt 1359721  T
Q  786 cagttttttgactacacc 803  Q
    ||||||| ||||| ||||    
T  1359720 cagttttctgactgcacc 1359703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 384 - 672
Target Start/End: Original strand, 48620627 - 48620906
Alignment:
Q  384 taaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| || | ||  |||||||| |||||||||||| ||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  48620627 taaaaaggaaaattctatgttgaagttattaaaatgacttttcttgtgaagttaacaatataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 48620726  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||    
T  48620727 cagtgacatcaaaagttcagtccccttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctactttgttttaagtgtaaca 48620826  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgta 672  Q
    ||||||||||||||||||         |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||    
T  48620827 ccccacaaagtgtaacac---------tcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgaataaatagtacctgta 48620906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 608 - 804
Target Start/End: Original strand, 21289817 - 21290010
Alignment:
Q  608 ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 707  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||| ||||||||   ||||||||||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21289817 ctatcacataatatca---actctgtttgcatattaaagatgccaacgataaaataacacttataagtccaagatgttgcaaacattactagatgaatta 21289913  T
Q  708 ctattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||    
T  21289914 ttattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaatttttctaaaaaagtcagttttttaactgcacca 21290010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 450 - 707
Target Start/End: Original strand, 38759583 - 38759846
Alignment:
Q  450 aaaaaatgtagtgagtaacacatcact--gtttgtacaatgacatcaaaagttcag----tcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattac 543  Q
    ||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||    || || || |||||||| ||||| | ||||| || | |||    
T  38759583 aaaaaatatagtgagtaacacctcgctctgtttgtacagtgacatcaaaagttcagccagtcttcgtaatatcatcaattcatcatattaataaaactac 38759682  T
Q  544 acttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgtta 643  Q
    | ||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  38759683 atttaatttaattttatcatatcttattttaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttgagactatcagataatatcaccaactatgtttgcatgtta 38759782  T
Q  644 aagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatta 707  Q
    ||| | | ||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38759783 aaggtgtcaactataaaataatatatgtaactccaagatgttgcaagcattactagattaatta 38759846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 631 - 791
Target Start/End: Original strand, 31962853 - 31963014
Alignment:
Q  631 tgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatc 730  Q
    |||||||||||||||||  | |||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  31962853 tgtttgcatgttaaagaaatcaacgataaaataatatatgtaagtttaagatgttgcaagcattattagatgaactactattgatcattaatcggtaatc 31962952  T
Q  731 aacaa-tttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31962953 aacaattttaaaaataaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 31963014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 390 - 538
Target Start/End: Original strand, 21289661 - 21289816
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactata------ata-taaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgt 482  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  21289661 ggaaaaatctattgtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatatcataaataataaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgt 21289760  T
Q  483 acaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaag 538  Q
    ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21289761 acagtggcatcaaaagttcagtccctatagtatcatcaattcatcagattaacaag 21289816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 721 - 791
Target Start/End: Original strand, 48620916 - 48620986
Alignment:
Q  721 atcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  48620916 atcattaatcaacaattttaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 48620986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 430 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 1360022 - 1359932
Alignment:
Q  430 tgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    ||||||||| ||||||| || |||||| |||||| ||| |  ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1360022 tgaagttaatactataacattaaaaatatagtga-taatatttcagtgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcctcgtagtatcatcag 1359932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 389 - 489
Target Start/End: Original strand, 30254853 - 30254952
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  |||||| || ||||||||||||||||| || ||||||||| ||  ||||||  ||||||||||||||||    
T  30254853 aggaaaattctatggtgaagtcataataatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatggataacac-ccactgtttgtacaatg 30254951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 750 - 804
Target Start/End: Original strand, 38759846 - 38759900
Alignment:
Q  750 aaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacca 804  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||    
T  38759846 aaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttaattgactgcacca 38759900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 43579242 - 43579290
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  43579242 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctagtgaagttaa 43579290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 388 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 4150537 - 4150490
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagt 435  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  4150537 aaggaaaattctatggtgaagtcatgataatgacttttctggtgaagt 4150490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 387 - 446
Target Start/End: Original strand, 22170747 - 22170806
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataa 446  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||  ||||||||  |||||||||||||||||    
T  22170747 aaaggaaaattctatggtgaaatcatgaaaatgacttttctaatgaagttaacactataa 22170806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 389 - 439
Target Start/End: Original strand, 26970260 - 26970310
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaac 439  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||| |||||||||||||    
T  26970260 aggaaaattttatggtaaagtcatgataatgacttttttggtgaagttaac 26970310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0291 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0291
Description:

Target: scaffold0291; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 387 - 787
Target Start/End: Original strand, 7884 - 8284
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||| |||||| ||||||||||| || ||||  |||||| || ||||||||||||||||| || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||    
T  7884 aaagaaaaattctatggtgaagttataagaatgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaattgtaatgagtaacaccccactgtttgtacaa 7983  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||    
T  7984 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaacttgctataagcgtaacaccc 8083  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8084 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaacgttgttcgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 8183  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtc 786  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||||| | |||||||||    
T  8184 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcgttaaaatcaaaattaactttatcaaaaaagtc 8283  T
Q  787 a 787  Q
    |    
T  8284 a 8284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 56)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 386 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 2325577 - 2325168
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| |||  |||||||| |||||||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||  || ||||||||||    
T  2325577 aaaaggaaaattctatggtgaagttatgtgaatgacttttctcgtgaagttaacaatataacatcataaatgtattgagtaacaccccattgtttgtaca 2325478  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||||         |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2325477 ctggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa--------attaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacc 2325386  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2325385 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattacaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgtt 2325286  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  2325285 gcaagcattactagatgaattactattgattattaatcagtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaactttttaaaaaaaat 2325186  T
Q  786 cagttttttgactacacc 803  Q
    || |||| ||||| ||||    
T  2325185 caattttctgactgcacc 2325168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 427 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 43648411 - 43648051
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  43648411 tggtgaagttaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacacctcactgtttgtataatgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaactcat 43648312  T
Q  527 tagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatca 626  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43648311 cagattaacaagactacacttaatctaattttatcataccttgttataagtgtaacaccacacaaagtataacacttaagactatcacataatatcatca 43648212  T
Q  627 actttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcact 726  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  43648211 actttgtttccatgttaaagatttcaacgataaaatagcacttgtaagtccaagatgtcgcaaacattactagatgaattactattgatcattaatcagt 43648112  T
Q  727 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43648111 aatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 43648051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 388 - 803
Target Start/End: Original strand, 4166920 - 4167335
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||||  |||||||||||||||    
T  4166920 aaggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacattatagtatcaaaaatattgtgagtaacaccccactgtttgtacaat 4167019  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  4167020 ggcatcaaaagttcagtccccatagtatcaacaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 4167119  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  4167120 acaaagtgtaacacttaaaactatcacataatatcatcaactatgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaataatatttgtaagtccaagatgttgc 4167219  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4167220 aagcattactggatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 4167319  T
Q  788 gttttttgactacacc 803  Q
     |||| ||||| ||||    
T  4167320 attttctgactgcacc 4167335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 389 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 11366585 - 11366170
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||| |||||||||  ||||| |||||| ||||    
T  11366585 aggaaaattctatggtgaaatcataagaatgacttttttggtgaaattaacactataacatcaaaaatgtaatgagtaacatctcactatttgtataatg 11366486  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||| | |||||||| |    
T  11366485 acatcaaaagttcagccctcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacatttaatataattttatcatatcttgttctaaacataacacccta 11366386  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11366385 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 11366286  T
Q  689 agcattactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||    
T  11366285 agcattactagatgaatatactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaaatca 11366186  T
Q  788 gttttttgactacacc 803  Q
     |||| ||||| ||||    
T  11366185 attttctgactgcacc 11366170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 390 - 797
Target Start/End: Complemental strand, 33551189 - 33550778
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  33551189 ggaaaattctacggtgaagtcatgagaatgacttttttagtgaagttaacactataacatcaaaaatgtagtgagtaacaccccactgtttgtacaatga 33551090  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  33551089 catcaaaagttcggtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctacgttgttttaagcgtaacaccccac 33550990  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  33550989 aaagtgtaacacttaagacta-cgtataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacttgaaagtccaatatgttgcaa 33550891  T
Q  690 gcattactagatgaattactattga----tcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac-ttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||     
T  33550890 gcattactagatgaataactattgattatttattaaccagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttttaaaaat 33550791  T
Q  785 tcagttttttgac 797  Q
    |||||||| ||||    
T  33550790 tcagttttctgac 33550778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 382 - 791
Target Start/End: Original strand, 3176931 - 3177340
Alignment:
Q  382 aataaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttg 481  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||| | || ||  ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||   ||||||||    
T  3176931 aataaagagaaaaattctatggtgaagttacgaaaatgacttttctgatgaagttaatactataatatcaaaaatgttttgagtaacacgcaactgtttg 3177030  T
Q  482 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaa 581  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  3177031 tacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaagaagaatacacttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaa 3177130  T
Q  582 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaaga 681  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  3177131 caccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatgtcaactataaaatagtacatgtaagtccaaga 3177230  T
Q  682 tgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaa 781  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || |||| ||||||||| ||||    
T  3177231 tattacaagcattactagatgaattactatttatcatgaataagtaatcaacaatttgaaaataaatcaaacattaaaattaaaagtaactttttcaaaa 3177330  T
Q  782 aagtcagttt 791  Q
    ||||||||||    
T  3177331 aagtcagttt 3177340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 390 - 792
Target Start/End: Original strand, 26357577 - 26357979
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||   ||||||||||||| |||    
T  26357577 ggaaaattttatggtgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacactataacatcaaaactgtagtgagtaacatcccactgtttgtacagtga 26357676  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||| || ||||  | |||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||| |||||    
T  26357677 catcaaaagttcagttcttatagagttatcaattcatcatattaacaagatcacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacatcccac 26357776  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  26357777 aaattgtaacacttaaaactatcacataatattatcaaatgtgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtatttttaagtccaagatgttgcaa 26357876  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26357877 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaagtcaat 26357976  T
Q  790 ttt 792  Q
    |||    
T  26357977 ttt 26357979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 390 - 791
Target Start/End: Original strand, 4763628 - 4764033
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaaca---ctataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa 486  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||   |||||  |  |||| |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  4763628 ggaaaattctatgatgaagtcatgaaaatgacttttctgatgaagttaacaacactatatcaacaaaactgtagtgagtaacaccccactgtttgtacag 4763727  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||| ||| |||||    
T  4763728 tgacatcaaaagttcagttcccatagtataatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttattctaccttgtttcaagtgtagcaccc 4763827  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4763828 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaattctttttgcatgttaaagatgctaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatattg 4763927  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaac-ttttttaaaaaagt 785  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||| |||||||    
T  4763928 caagcattactagttgaattactattgatcattaatcagtaatcaataatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttttaaaaagt 4764027  T
Q  786 cagttt 791  Q
    ||||||    
T  4764028 cagttt 4764033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 19424832 - 19424444
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || ||||| || | ||    
T  19424832 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaatggcttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccattgtttatatagtg 19424733  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19424732 gcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcttaccttgttttaagtgtaacacccca 19424633  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||              |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  19424632 caaagtgtaacatttaagactatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaag--------------atagtacctgcaagtctaagatgttgca 19424547  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19424546 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaatcattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcag 19424447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 388 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 31570939 - 31570536
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || |||| ||| || ||||||||  |||| ||| || | |    
T  31570939 aaggaaaattctatggtgaagttatgagaataacttttctggtgaaattaacactataacattaaaagtgttgtaagtaacaccccactatttttatagt 31570840  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  31570839 gacatcaaaagttcagtccacatagtatcatgaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcttacattgttttaagtgtaacacccc 31570740  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  31570739 acaaaatgtaacacttaagactgtcacatgatatcaacaactctgtttacatgttaaagatgccaacgataaaatagtacttgtaagtttaagatgttgc 31570640  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  31570639 aagcattgctagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaaatatttaaaaatgaatcaatcattaaaatgaaaattaactttttaaaaaaagtca 31570540  T
Q  788 gttt 791  Q
    ||||    
T  31570539 gttt 31570536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 422 - 792
Target Start/End: Original strand, 37905740 - 37906113
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  37905740 ttttttggtgaagttaacactataacataaaaaatgtaacgagtaacaccccaccgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaa 37905839  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca--ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37905840 ttcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttataagcgtaacaccccccacaaagtgtaacacttaaaactatcgcataat 37905939  T
Q  620 atcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcatt 719  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||  || |||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  37905940 atcattaactctgtttgcatgttaaagattccaatgataaaataacacatgtaagtccaagatgttgcaagaattactggatgaattactattgatcatt 37906039  T
Q  720 aatcactaatcaacaatttaaaaatg-aatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagtttt 792  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  37906040 aatcagtaattaacaatttaaaaatgaaatcaaacattaaaatcaaaattaattttttcaaaaaagtcaatttt 37906113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 388 - 792
Target Start/End: Complemental strand, 39167568 - 39167170
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  | |||| || |||||||||||  ||| ||| |||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39167568 aaggaaaattttatggtgaagtcacgagaatgatttttttgatgaagttaacagaatagtatcaaaagtattgtgagtaacacctcactgtttgtacaat 39167469  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||  |||||| ||||||| |||||| |||    
T  39167468 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcattagagtaacaagaatacacttattctaattttattataccttgttttaagtgtaacatccc 39167369  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||      ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  39167368 acaaagtgtaaca------actatcacataatatcatcaactctgtttgtatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaaattgttgc 39167275  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
     |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39167274 tagcattactagatgaattactattaattatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaataaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtca 39167175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 386 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 19289525 - 19289125
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| |||||||||||||     |  |||||| || ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||  || ||||||||||    
T  19289525 aaaaggaaaattctatggtgaagtca-----atgacttttttgatgaagttaacactataacatcaaaaatataatgagtaacaccccattgtttgtaca 19289431  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| || || |||  |||||| |    
T  19289430 atgacatcaaaagttaagttctcacagtatcatcaactcatcagattaataagactacacttaatctaattttatcctacattgttataaatgtaacatc 19289331  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  19289330 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtgtgcatgttaaagattccgacaataaaataatacctgtaagtccaagatatt 19289231  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19289230 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagaaattaacaatttaaaaatgaattaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagt 19289131  T
Q  786 cagttt 791  Q
    ||||||    
T  19289130 cagttt 19289125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 220; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 33660569 - 33660179
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||  |||||||| || ||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||   |||||||||||| || ||    
T  33660569 aaaattctatggtgaagtcattaaaatgacttttctagttaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacacccaactgtttgtacagtggca 33660470  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  33660469 tcaaaagttcagtcctcttagtatcatcaattcattagattaacaggaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 33660370  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||          ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  33660369 agtgtaacacc---------cacatgatatcagcaactttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtatctgtaagtctgagatgttgcaagc 33660279  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  33660278 attactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcagaaaagtcagttt 33660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 489 - 791
Target Start/End: Original strand, 41960939 - 41961241
Alignment:
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||    
T  41960939 acatcaaaagttcagtccacatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttgtttcaagtgtaacacccca 41961038  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41961039 caaagtgtaacacttaagattatcacataatatcatcaaatcggtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacctgtaagtccaagatgttgca 41961138  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41961139 agcattactagatgaattactattgatcattaatcaataatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaattcag 41961238  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  41961239 ttt 41961241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 422 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 33709403 - 33709036
Alignment:
Q  422 ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcag 521  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| | |||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  33709403 ttttatggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgcgagtaacactccactgttagtacagtgacatcaaaagttcagtccccatagtatcatcaa 33709304  T
Q  522 ttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatat 621  Q
     |  | |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||    
T  33709303 atattcagattaacaagaatacgcttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctacaaagtgtcacacttaagactatcgcatgatat 33709204  T
Q  622 catcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 721  Q
    || ||||| |||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33709203 cagcaactctgtttgcatgttaaagatgtcaatgataaaatagtacttgtaaatccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaa 33709104  T
Q  722 tcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||| |||||    
T  33709103 tcattaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaattaaaattaactttttcaaaaaattcagt 33709036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 388 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 29242343 - 29241934
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||    |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| |    
T  29242343 aaggaaaattctatggtgaagtcatgaaaatggtttttttggtgaagttaaaactataacataaaaaatatagtgcgtaacaccccactgtttgtacagt 29242244  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |  ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||    
T  29242243 ggtatcaaaagttcagtcttcatagtatcatcaattcatcagattaacaaaactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacccc 29242144  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||         
T  29242143 acaaagtgtaacacctaagactatcacataatatcatcaactctggttgtatgttaaagatgtcaacgatacaatagtacctgtaagtccaagat----- 29242049  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
      | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||||  |||    
T  29242048 --gaattactagatgaattactattgaacattaatcagcaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcataattaacttttccaaaaagttca 29241951  T
Q  788 gttttttgactacacca 804  Q
    ||||  ||||| |||||    
T  29241950 gtttcctgactgcacca 29241934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 390 - 783
Target Start/End: Original strand, 44913662 - 44914060
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcact-gtttgtacaatg 488  Q
    |||||||| ||||||||||||| || ||  |||||| || ||||||||||||| || ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  44913662 ggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttatg-tgaagttaacactgtagtatcaaaaatgttgtgagtaacacctcacttgtttgtaaaatg 44913760  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctc-atagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||    
T  44913761 acataaaaagttcaatcccccatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacacttaatctaattttatcatacattgttttaagtgtaacacccc 44913860  T
Q  588 -acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44913861 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 44913960  T
Q  687 caagcattactag---atgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||| |||   ||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  44913961 caagcattattagaaaatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaa 44914060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 390 - 796
Target Start/End: Original strand, 35958909 - 35959298
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||||| | ||  |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||    
T  35958909 ggaaaattctatgatgaagtcataaaaatgacttttttggtgaagttgccactataacataaaaaatgtaatgagcaacaccccactgtttgtacaatga 35959008  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||| ||||||||||            ||||| ||||| | |||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  35959009 cattaaaagttcag------------catcaattcatcatattaacaagactgcacttaatataattt-atcctaccttgttataagcgtaacaccccac 35959095  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||||    
T  35959096 aaagtgtaacagttaagactatcacataatatcatcaactatgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgt----ccaagatgttgcaa 35959191  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  35959192 gcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtcaat 35959291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 386 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 18494475 - 18494071
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||  |||              
T  18494475 aaaaggaaaattctgtggtgaagtcatgaaaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccac---------- 18494386  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||| ||||||| ||||||||||||| |||||| | ||||| |||| |||    
T  18494385 --gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattcactagaatacacttgatctaattttatcctaccttgtattaagtgtaa-acc 18494289  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18494288 tcacaaagagtcacacttaagactatcacatgatatcaacgactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgtt 18494189  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  18494188 gtaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagt 18494089  T
Q  786 cagttttttgactacacc 803  Q
    ||||||  ||||||||||    
T  18494088 cagtttcatgactacacc 18494071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 389 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17071941 - 17071646
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||  ||| | |||||||||||    
T  17071941 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaacactataacaacaaaaatgtagtaagtaacatctcattatttgtacaatg 17071842  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17071841 acatcaaaagttcggtattcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccca 17071742  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17071741 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17071646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 389 - 752
Target Start/End: Complemental strand, 27350143 - 27349789
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaac-ttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaat 487  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||  |||| |||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |    
T  27350143 aggaaaattttatggtgaagtcattaaaataatattttttggtgaagttaacactatagcatcaaaaatgttgtgagtaacaccacactgtttgtacagt 27350044  T
Q  488 gacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccc 587  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||    
T  27350043 gacatcaaaagttcagtcc-cttagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatccaaccttgttttaagtgtaacacccc 27349945  T
Q  588 acaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    ||||||||||||||         |||||| ||||||  |||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  27349944 acaaagtgtaacac---------tcacatgatatcaggaactctgtttgcaagttaaagattccaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgc 27349854  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 752  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27349853 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaa 27349789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 390 - 792
Target Start/End: Original strand, 41465509 - 41465903
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||||| |||   |  | | |||          
T  41465509 ggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaacactatagcatcaaaggtgtagtgagtagcaccctaacgctggta------ 41465602  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
      |||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||| ||     
T  41465603 --tcaaaagttcagtccctataatatcatcaattcattagattcacaagactgaacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacacctcag 41465700  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41465701 aaagtgtaacacttaagactatcgcataatatcatcaattatgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaa 41465800  T
Q  690 gcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagt 789  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41465801 acattactatatgaattactattgatcattaatcagcaatcaacaatttaaaattgaatcgaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagt 41465900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 389 - 684
Target Start/End: Complemental strand, 17054300 - 17054005
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||    
T  17054300 aggaaaattctatggtgaagtcatgcgaatgacttttttggtgaagttaatactataacatcaaaaatgtagtaagtaacatctcattgtttgtacaatg 17054201  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    ||||||||||| | ||  ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17054200 acatcaaaagtncggtattcataatatcatcaattcatcagattaacaagaccacacttaatctaattttatcctaccttattttaagcgtaacacccca 17054101  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17054100 caaagtgtaacacttaanactatcacataatatcatcaaatttgtttgcatgttaaaggttccaacgataaaatagtacctgtaaatccaagatgt 17054005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 389 - 743
Target Start/End: Complemental strand, 4264281 - 4263926
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| ||||||||||   ||||||||||||| ||    
T  4264281 aggaaaattctatggtgaagtcatcataatgacttttctggtaaagttaacactatagcatcaaaagtgttgtgagtaacatcccactgtttgtacagtg 4264182  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||    
T  4264181 acatcaaaagttcagtctccatagtattatcaattcatcatattaagaagaatacacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtttaacacccca 4264082  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatc-acataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgc 687  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  4264081 caaagtgtaacacttaagactatcaacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtacatataagttcaagatgttgc 4263982  T
Q  688 aagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaa 743  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  4263981 aagcattactagatgaaataatattgatcattgatcagtaatcaacaatttaaaaa 4263926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 43771039 - 43770650
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  |||||||| |||| || ||    
T  43771039 aaaattctatggtgaagtcattagaatgattttt-tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttatacagtggca 43770941  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||| | |||| ||||||| |||||||| |||||    
T  43770940 tcaaaagttcagtccccttaatatcatcaattcatcagattaacaagaatatacttaatttaattttatcctgccttgttttaagtgtaacacctcacaa 43770841  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||         ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||    
T  43770840 agtgtaacact---------cacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacaataaaatagtatctttaagttcaagatgttgcaagc 43770750  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  43770749 attactagatgaatttctattgatcattaattagaaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 43770650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 486 - 791
Target Start/End: Original strand, 31861948 - 31862253
Alignment:
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  31861948 atgatatcaaaatttcagtcattatagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaatctaattttaacatacattgttataagcgtaacacc 31862047  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||   || |||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  31862048 ccacaaagtgtaacacttaaaattatcacataatatcatcaagtctgtttgcatgttaaggattccgacaataaaatagtacttgtaagtccaagatatt 31862147  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    | |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31862148 gtagacattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagt 31862247  T
Q  786 cagttt 791  Q
    ||||||    
T  31862248 cagttt 31862253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 386 - 784
Target Start/End: Original strand, 13711460 - 13711853
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtaca 485  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| |||||||||||  ||| |||||||||    
T  13711460 aaaatgaaaattctatggtgaagtcatcagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccccacagtttgtaca 13711559  T
Q  486 atgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacc 585  Q
     |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |      ||||||| ||||||||    
T  13711560 gtgacatcaaaagtttagtccacatggtatcatcaattcatcagattaacaagaatacatttaatctaattttatcatg-----ttttaagtgtaacacc 13711654  T
Q  586 ccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    ||| ||||| ||| | |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13711655 ccataaagtataatagttaagactatgacatgatatcagcaactctgtatgcatgttaaagatgccagcgataaaatagtacctgtaagtctaagatgtt 13711754  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || | | || |||||||| ||||| |||||||    
T  13711755 gcaaacaatactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacgatttaaaaatgaatcaatcatttaaattaaaattaattttttcaaaaaag 13711853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 389 - 791
Target Start/End: Original strand, 5881533 - 5881930
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaa-----tgtagtgagtaacacatcactgtttgta 483  Q
    ||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||| | | ||||| || ||||      ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  5881533 aggaaaattttattgtgaagtcattaaaatgacttttctggtgaagttgatattataacatcaaaacaaaagtgttgtgagtaacaccccactgtttgta 5881632  T
Q  484 caatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaaca 583  Q
    || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||| ||||| | |||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||| |    
T  5881633 cagtgacatcaaaagttgagtccccttagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacatttaatctaattt-atcataccttgttttaagtgtaata 5881731  T
Q  584 ccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatg 683  Q
    || ||||||||||||||||         ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5881732 cctcacaaagtgtaacact---------cacatgatatcaacaattttgtttgcatgttaaagatgtcaacaataaaatagtacatgtaagtctaagatg 5881822  T
Q  684 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | ||||    
T  5881823 ttgcaagcattactagatgaattactattgatcattattcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaactttttcataaaa 5881922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 427 - 742
Target Start/End: Original strand, 4478406 - 4478717
Alignment:
Q  427 tggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcat 526  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||  || |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4478406 tggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacactccattgtttgtacagtggcatcaaaagtttagtcctcatagtatcatcaattcat 4478505  T
Q  527 tagattaacaagattacacttaatctaatttt-atcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatc 625  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||     ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |    
T  4478506 cagattaacaagaatacacttaatctaatttttatcctaccttgttttaagtgtaacac-----aaagtgtaacacttaagtctatcacatgatatcacc 4478600  T
Q  626 aactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcac 725  Q
    |||| ||||| ||||||||||||   || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  4478601 aactctgtttccatgttaaagatgccaatgataaaatagtatcggtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcattaatcag 4478700  T
Q  726 taatcaacaatttaaaa 742  Q
    |||||||||||||||||    
T  4478701 taatcaacaatttaaaa 4478717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 173; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 392 - 724
Target Start/End: Original strand, 44285951 - 44286283
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || |||||||||||| |||  | ||||||| ||||||||||||||||  || |||| ||| | ||| || |  |||||||||||| | || ||    
T  44285951 aaaattatacggtgaagtcatgcgaatgatttttctgatgaagttaacactatagcatcaaaagtgttgcgagcaatatctcactgtttgtatagtggca 44286050  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  44286051 tcaaaagtttagtccacatagtatcataaattcatcagattaacaataatacacttaatctaattttattctaccttgttttaagtgtaacaccccacaa 44286150  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  44286151 agtgtaacacttaagactatcacatgatatcaacaactttgtttgcatgttaaatatgctaacgataaaatagtatctgtaagtctaagatgttgcaagc 44286250  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatca 724  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44286251 attgttagatgaattactattgatcattaatca 44286283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 392 - 695
Target Start/End: Original strand, 36641988 - 36642293
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||  || |||| ||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  36641988 aaaattctatggtgaagtcatgagaatgacttttctggtgaaattaatactatagcatcaaaagtgttgcgagtaacacctcactgtttgtacagtgaca 36642087  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaa--ttttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  36642088 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcaaattaacaagaatacacttaatctaattttttatcctaccttgttttaagtgtaacaccctac 36642187  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaa 689  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  36642188 aaagtgtaacacttaagactatcacatgataccagcaactctgtttccatgttaaagatgccaacgataaaatagtaccggtaagttcaagatgttgcaa 36642287  T
Q  690 gcatta 695  Q
    ||||||    
T  36642288 gcatta 36642293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 390 - 729
Target Start/End: Original strand, 19313852 - 19314186
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||  || |||| ||| ||||||||||| | ||| ||| |||| |||    
T  19313852 ggaaaattctatggtgaagtcattagaatgacttttctggtgaagttaacattatagcatcaaaagtgttgtgagtaacaccttactatttatacagtga 19313951  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19313952 catcaaaagttcagtcct-atagtatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatcgaattttaccctaccttgttttaagtgtaacaccccac 19314050  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctg---taagtccaagatgttg 686  Q
    ||||||||||       |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||   |||||| |||||||||    
T  19314051 aaagtgtaac-------actatcacatgatatcagcaactatgtttgcatgttaaagatgtcagcgataaaatagtacatgttataagtctaagatgttg 19314143  T
Q  687 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaat 729  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19314144 caagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaat 19314186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 460 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 7007054 - 7006744
Alignment:
Q  460 gtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaatttta 559  Q
    ||||||||||   ||||||||||||| |  ||||||||||| ||| | ||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7007054 gtgagtaacatcccactgtttgtacagtagcatcaaaagtttagttcccatagtatcatcaatttataagattaacaagaatacacttaatctaatttta 7006955  T
Q  560 tcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataa 659  Q
    || |||||| |||||||                 |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   ||||||||    
T  7006954 tcataccttgttttaag-----------------tgtaacacttaagaatatcacatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataa 7006872  T
Q  660 aatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataag 759  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  7006871 aatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaatttctattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattatg 7006772  T
Q  760 atcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||    
T  7006771 attaaaattaactttttcaaaaaagtca 7006744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 487 - 695
Target Start/End: Original strand, 45327817 - 45328025
Alignment:
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||     
T  45327817 tgacatcaaaagttcagtcatcatagtatcatcaattcatcagattaacaagactgcacttaatctaattttatcctaccttgttttaagtgtaacacct 45327916  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttg 686  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45327917 cagaaagtgtaacacataagactatcgcataatatcataaactatgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttg 45328016  T
Q  687 caagcatta 695  Q
    |||||||||    
T  45328017 caagcatta 45328025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 585 - 804
Target Start/End: Complemental strand, 19500923 - 19500706
Alignment:
Q  585 cccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgt 684  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  19500923 cccacaaaatgtaacacttaagactatcacataatattatcaactctatttacatgttaaagatgttaacgataaaatagtacatgtaatttcaagatgt 19500824  T
Q  685 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaag 784  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||| |||||||    
T  19500823 tgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaatt-attttttcaaaaaag 19500725  T
Q  785 tcagttttttgactacacca 804  Q
    | | |||||||||| |||||    
T  19500724 t-aattttttgactgcacca 19500706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 390 - 643
Target Start/End: Original strand, 33902068 - 33902319
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatga 489  Q
    |||||||| |||| ||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||    
T  33902068 ggaaaattctatgatgaagtcgttagaatgacttttctggtgaagttaacacta--acataaaaaatgtagtgagtaataccccactgtttgtaaaatga 33902165  T
Q  490 catcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccac 589  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || | |||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  33902166 catcaaaagttcagtcctcaaagtatcatcagttcatcagattaacaagactatatttaatcgaattttatcctaccttgttttaagggtagcaccccac 33902265  T
Q  590 aaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgtta 643  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||    
T  33902266 aaagtgtaacacttaatagtatcacataatatcattaactctgtttccatgtta 33902319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 392 - 664
Target Start/End: Complemental strand, 41464051 - 41463779
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||    
T  41464051 aaaattctatggtgaagtcgtgagaatgacatttttggtgaagttaatactataaaatcaaaagtgttgtgagtaacacctcactgtttgtacagtggca 41463952  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |||  ||||| |||||||||| ||| || ||||||  |||||||| |||||    
T  41463951 tcaaaagttcaatcctcatagtatcatcaattcatcatattaacaagaatacttttaatataattttatcatactttgttttaattgtaacacctcacaa 41463852  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatag 664  Q
    | ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  41463851 aatgtaacatttaagactatcacatgatatcaacaactctgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatag 41463779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 531 - 682
Target Start/End: Complemental strand, 18258349 - 18258198
Alignment:
Q  531 ttaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactt 630  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||     
T  18258349 ttaacaagaataaacttaatctaattttatcctacatttttttaagtgtaacaccccataaagtgtaacacttaagactatcacatgatatcagcaactc 18258250  T
Q  631 tgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagat 682  Q
    | ||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||    
T  18258249 tctttgcatgttaaagatcccaacgataaaatagtaactgcaagtctaagat 18258198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 655 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 41051238 - 41051112
Alignment:
Q  655 gataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaaca 754  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41051238 gataaaatagtacctgtaagttcaagatgttgtaagcattgctagatgaattgttattgatcattaatcaataatcaacaattcaaaaatgaatcaaaca 41051139  T
Q  755 ataagatcaaaattaacttttttaaaa 781  Q
     ||| || |||||||| ||||| ||||    
T  41051138 ttaaaattaaaattaattttttcaaaa 41051112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 663 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 41463520 - 41463400
Alignment:
Q  663 agtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatc 762  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| || ||||||     
T  41463520 agtacctctaagtctaagatgttgtaaacattaatagataaattactattgatcattaatcaataattaataatttaaaaatgaatcaatcattaagatt 41463421  T
Q  763 aaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  41463420 aaaattaactttttaaaaaaa 41463400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 693 - 783
Target Start/End: Original strand, 33902317 - 33902407
Alignment:
Q  693 ttactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaa 783  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33902317 ttactagatgaattattattgattattaatctgtaatcaacaatttaaaaataaatcaaacattaagatcaaaattaacttttttaaaaaa 33902407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 678 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 18257453 - 18257340
Alignment:
Q  678 aagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactttttt 777  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||  | ||| || ||||||||||||||     
T  18257453 aagatgttgcaagcattactagatgaattattatttatcattaatcagtaatcgacaattttaaaatgaataaattattaatattaaaattaactttttc 18257354  T
Q  778 aaaaaagtcagttt 791  Q
    | ||||||||||||    
T  18257353 acaaaagtcagttt 18257340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 728 - 791
Target Start/End: Original strand, 45328028 - 45328091
Alignment:
Q  728 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45328028 atcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagatcaaaattaactttttcaaaaaagtcagttt 45328091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 420 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 41051379 - 41051263
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaa-tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 518  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||  || |||| ||| |||  |||||| ||||| ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41051379 acttttctgatgaagctaatactatagcatcaaaagtgttgtgtataacacttcactatttgtaccagtggcatcaaaagttcagtcctcatagtatcat 41051280  T
Q  519 cagttcattagattaac 535  Q
    || ||||| ||||||||    
T  41051279 caattcatcagattaac 41051263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 387 - 438
Target Start/End: Original strand, 19093410 - 19093461
Alignment:
Q  387 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  19093410 aaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaatgatttttctggtgaagttaa 19093461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 719 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 17071646 - 17071571
Alignment:
Q  719 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaactt-ttttaaaaaagtcagttttt 793  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||   || ||||||||||||||||||||    
T  17071646 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaatttttttttattttaaaaaagtcagttttt 17071571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 719 - 793
Target Start/End: Complemental strand, 17054005 - 17053931
Alignment:
Q  719 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttttt 793  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||   || ||| |||||||||||||||    
T  17054005 taatcagtaatcaacaatgtaaaaatgaatcaaacattaagatcaatttttttttattttaaaaagtcagttttt 17053931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 438
Target Start/End: Original strand, 22963395 - 22963448
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  22963395 aaaatggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctggtaaagttaa 22963448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 385 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 22998082 - 22998029
Alignment:
Q  385 aaaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||    
T  22998082 aaaatggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctggtaaagttaa 22998029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18947642 - 18947598
Alignment:
Q  394 aattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  18947642 aattctatggtgaagtcatgaaaataacttttctggtgaagttaa 18947598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 764 - 803
Target Start/End: Original strand, 19093787 - 19093826
Alignment:
Q  764 aaattaacttttttaaaaaagtcagttttttgactacacc 803  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  19093787 aaattaacttttttaaaaaagtcaattttttgactgcacc 19093826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 493 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 19501839 - 19501773
Alignment:
Q  493 caaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttat 560  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  19501839 caaaagttcagtctctatagtatcatcaattcatcagattaacaa-actacatttaatctaattttat 19501773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 388 - 438
Target Start/End: Original strand, 6177773 - 6177823
Alignment:
Q  388 aaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaa 438  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  6177773 aaggaaaattctacggcgaagtcatgagaatgacttttctggtgaagttaa 6177823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 389 - 435
Target Start/End: Complemental strand, 39788626 - 39788580
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagt 435  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||||    
T  39788626 aggaaaattttatggtgaagtcataagaatgacttttctagtgaagt 39788580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 746 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 4263756 - 4263711
Alignment:
Q  746 aatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||    
T  4263756 aatcaaacattaagattaaaattaactttttaaaaaaaatcagttt 4263711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 389 - 776
Target Start/End: Original strand, 133 - 514
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatg 488  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  133 aggaaaattctatggtgaagtcacgaaaatgacttttctggtgaagttaacactgtagtataaaaaatgttgtgagtaacactccactgtttgtacaatg 232  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  233 gcatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagactaacaagaatacatttaatctaattttatcctatcttattttaagtgtaacacccca 332  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||      |||||||||||||||    
T  333 taaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtac------gtccaagatgttgca 426  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttt 776  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  427 agcattactagatgaattactattaatcatgaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacattaagattaaaattaacttttt 514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 451 - 781
Target Start/End: Complemental strand, 408552 - 408223
Alignment:
Q  451 aaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaat 550  Q
    ||||||||| |||||||||| | || ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  408552 aaaaatgtaatgagtaacaccttaccgtttgtaaaatgaaatcaaaagttcagtcctc-tagtatcatcaattcatcagattaacaagactacacttaat 408454  T
Q  551 ctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattt 650  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  408453 ctaattttatcctaccttgttataagcgtaacacctcacaaagtggaacacttaagactatcacacaatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattc 408354  T
Q  651 taacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatca 750  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  408353 caacgataaaatagtacatgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatca 408254  T
Q  751 aacaataagatcaaaattaacttttttaaaa 781  Q
    |||| ||| || |||||||| ||||| ||||    
T  408253 aacattaaaataaaaattaattttttcaaaa 408223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 619 - 791
Target Start/End: Complemental strand, 94056 - 93885
Alignment:
Q  619 tatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattactattgatcat 718  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  94056 tatcatcaaatttgtttgcatgttaaagatgtcaacgataaaatagtacttgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattgctattgatcat 93957  T
Q  719 taatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  93956 taatcactaatcaacaattt-aaaatgaatcaaacattaaaatcaaaattaacttttttaaaaaggtccgttt 93885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 420 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 94538 - 94331
Alignment:
Q  420 acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatc 519  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||||  |||| |||| |||||||    
T  94538 acttttctgatgaagttaacattataacatcaaaattgtagtgagtaacaccccactgtttgtacagtggcatcaaaagtttggtccccatactatcatc 94439  T
Q  520 agttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactatcacataat 619  Q
    | ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||  || ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  94438 aattcatgagattaacaagactacacttaatttaattttattctagcttgtttcaagtgtaacaccccacaaagtgtaacacttaagactattacataat 94339  T
Q  620 atcatcaa 627  Q
    ||||||||    
T  94338 atcatcaa 94331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 247; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 392 - 798
Target Start/End: Original strand, 43959 - 44364
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||    
T  43959 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 44058  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||    
T  44059 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 44158  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  44159 agtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagc 44257  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44258 attactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagttt 44357  T
Q  792 tttgact 798  Q
     ||||||    
T  44358 gttgact 44364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 247; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 392 - 798
Target Start/End: Complemental strand, 154828 - 154423
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||  |  ||||||||||||| ||    
T  154828 aaaattctatggtgaagtcgtaagaaagacttttttggtgaagttaacgctataatatcaaaaatgtaatgagtaacaccccgttgtttgtacaatggca 154729  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| || ||| || ||||| |||||||||||||    
T  154728 taaaaagttcagtcctcatagtatcatcaattcatcagattaataagactacatttaatataattttatcatatcttgttataagcttaacaccccacaa 154629  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  154628 agtgtaacacttaag-ctatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatttcaacgataaaatagtacatgtaagtccaagttgttgcaagc 154530  T
Q  692 attactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcagttt 791  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  154529 attactgaatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaatcaactttttcaaaaaagtcagttt 154430  T
Q  792 tttgact 798  Q
     ||||||    
T  154429 gttgact 154423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0318 (Bit Score: 223; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0318
Description:

Target: scaffold0318; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 392 - 791
Target Start/End: Original strand, 11908 - 12309
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaaca-acttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatc-actgtttgta-caatg 488  Q
    |||||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||| |||| || |||| ||| |||||||||||  | | |||||||| || ||    
T  11908 aaaattctatggtgaagtcatgagaaatgacttttctggtgaaattaacaccataacattaaaagtgttgtgagtaacacccccattgtttgtatcagtg 12007  T
Q  489 acatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacacccca 588  Q
      ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||| ||||||| |||||||||||    
T  12008 gtatcaaaagttcagtcctcataatatcatcaattcatcagattaacaagaatacacttaatctaattttatcctatcttgttttaagtgtaacacccca 12107  T
Q  589 caaagtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgca 688  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12108 caaagtgtcacacttaagactatcgcatgatatcagcaactctgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaatagtacatgtaagtctaagatgttgca 12207  T
Q  689 agcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtcag 788  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12208 agcattactagatgaattactattgatcattaatcagtaatcaacaatttaaaaat-aatcaaacattaagattaaaattaacttttttaaaaaagtaag 12306  T
Q  789 ttt 791  Q
    |||    
T  12307 ttt 12309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 392 - 787
Target Start/End: Complemental strand, 146199 - 145803
Alignment:
Q  392 aaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgtttgtacaatgaca 491  Q
    |||||| || ||||||||||| ||||  | |||| |||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||  || | |||||| |||||||    
T  146199 aaaattctacggtgaagtcataagaatgatttttttggttaagttaacattataacataaaaaatgtaatgagtaacaccccattatttgtagaatgaca 146100  T
Q  492 tcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccccacaa 591  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  146099 tcaaaagttcagccttcatagtatcatcaattcatcaggttaacaagactacacttaatataattttatcataccttgttctaagcataacaccctacaa 146000  T
Q  592 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagc 691  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  145999 agtgtaacacttaagactatcacataatatcatcaactctatttgcatgttaaagattccaacgataaaatagtgtctgtaagtccaagatgttgcaagc 145900  T
Q  692 attactagatgaat-tactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagtca 787  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  145899 attactaaatgaatatacaattgatcattaatcagtaataaaaaatttaaaaatgaattaaacattaaaatcaaaattaactttttcaaaaaagtca 145803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 171; Significance: 2e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 389 - 804
Target Start/End: Original strand, 267281 - 267690
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttct-ggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacacatcactgttt-gtacaa 486  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  | |||| | ||| |  || ||||||||  || |||||| ||||||||||||    ||||||| |||||     
T  267281 aggaaaattctatggtgaagtcatgaaaattattttttttggtaatatttacactatagcatcaaaaatatagtgagtaacatccaactgttttgtacag 267380  T
Q  487 tgacatcaaaagttcagtcctcatagtatcatcagttcattagattaacaagattacacttaatctaattttatcttaccttattttaagcgtaacaccc 586  Q
    || ||||||||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  |||||| ||    
T  267381 tgtcatcaaaagttcagtctctataatatcatcaattcattagattagcaagactacacttaatctaattttatcctaccttgttttaaatgtaacatcc 267480  T
Q  587 cacaaagtgtaacacttaa-gactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgtt 685  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    
T  267481 cacaaagtgtaacacttaaagactatcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagatgccaacgataaaataatacatgtaagtccaagatgct 267580  T
Q  686 gcaagcattactagatgaattactattgatcattaatcactaatcaacaatttaaaaatgaatcaaacaataagatcaaaattaacttttttaaaaaagt 785  Q
    ||||| ||||||||||||||||         |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  267581 gcaagaattactagatgaatta---------accaatcagtaatcaacaatttaaaaatgaatcaaatattaagatcaaaattaattttttcaaaaaagt 267671  T
Q  786 cagttttttgactacacca 804  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  267672 cagtttcttgactgcacca 267690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 58; Significance: 6e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 389 - 470
Target Start/End: Original strand, 42347 - 42428
Alignment:
Q  389 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtgagtaacac 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||||||||||    
T  42347 aggaaaattttatggtgaagtcatgagaataatttttctggtgaagttaacactataacatcaaaagtgttgtgagtaacac 42428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 611 - 735
Target Start/End: Original strand, 100948 - 101058
Alignment:
Q  611 tcacataatatcatcaactttgtttgcatgttaaagattttaacgataaaatagtacctgtaagtccaagatgttgcaagcattactagatgaattacta 710  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||            ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  100948 tcacataatatcatcaactctgtttgcatgttaaagattccaacgat------------gtaagtccaagatgttgcaagcattactaaatgcattacta 101035  T
Q  711 ttgatcattaatcactaatcaacaa 735  Q
      |||||||||||| ||||||||||    
T  101036 --gatcattaatcagtaatcaacaa 101058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 386 - 463
Target Start/End: Original strand, 100817 - 100894
Alignment:
Q  386 aaaaggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaacactataatataaaaaatgtagtga 463  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||    
T  100817 aaaaggaaaattctatggtgaagtcatgagaatgatttttttggtgaagttaacgctataacatcaaaaacgtagtga 100894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0262 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0262
Description:

Target: scaffold0262; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 12186 - 12137
Alignment:
Q  390 ggaaaattttatggtgaagtcatgagaacaacttttctggtgaagttaac 439  Q
    |||||||| |||| |||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12186 ggaaaattctatgatgaagttatgagaatgacttttctggtgaagttaac 12137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University