View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0964_low_41 (Length: 300)

Name: NF0964_low_41
Description: NF0964
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0964_low_41
NF0964_low_41
[»] chr3 (166 HSPs)
chr3 (170-300)||(19884508-19884638)
chr3 (116-235)||(35065549-35065668)
chr3 (116-235)||(2842421-2842540)
chr3 (116-235)||(44269494-44269612)
chr3 (116-233)||(11258405-11258522)
chr3 (118-233)||(35353537-35353652)
chr3 (134-237)||(35065647-35065750)
chr3 (116-235)||(37427537-37427655)
chr3 (116-300)||(19569279-19569460)
chr3 (116-300)||(45531576-45531760)
chr3 (116-232)||(20417055-20417170)
chr3 (116-235)||(14153424-14153543)
chr3 (217-300)||(2842560-2842643)
chr3 (119-300)||(43889979-43890161)
chr3 (120-300)||(18700671-18700851)
chr3 (137-233)||(2842522-2842618)
chr3 (116-300)||(14642510-14642688)
chr3 (116-235)||(46751882-46752001)
chr3 (217-300)||(35065688-35065771)
chr3 (116-232)||(37037794-37037910)
chr3 (134-233)||(11258325-11258424)
chr3 (133-235)||(12512834-12512936)
chr3 (116-296)||(17207051-17207232)
chr3 (134-232)||(35353458-35353556)
chr3 (116-300)||(16044281-16044465)
chr3 (132-232)||(42327333-42327433)
chr3 (116-235)||(50349057-50349176)
chr3 (217-300)||(35353432-35353515)
chr3 (217-300)||(44269471-44269553)
chr3 (133-235)||(6158333-6158434)
chr3 (207-300)||(14441171-14441263)
chr3 (116-300)||(16059140-16059324)
chr3 (175-300)||(22307654-22307778)
chr3 (116-300)||(11191865-11192048)
chr3 (120-300)||(42327282-42327458)
chr3 (116-300)||(6158311-6158489)
chr3 (207-300)||(15565436-15565525)
chr3 (137-300)||(36166351-36166517)
chr3 (221-300)||(11258301-11258379)
chr3 (116-295)||(12512779-12512953)
chr3 (137-296)||(16283053-16283214)
chr3 (133-211)||(17693041-17693118)
chr3 (214-300)||(50349113-50349198)
chr3 (116-300)||(16049757-16049941)
chr3 (135-235)||(14441194-14441292)
chr3 (217-300)||(15206704-15206788)
chr3 (217-300)||(15245786-15245870)
chr3 (116-300)||(16728201-16728381)
chr3 (116-233)||(19884492-19884613)
chr3 (217-300)||(21618245-21618329)
chr3 (172-296)||(24545558-24545679)
chr3 (171-296)||(8898853-8898980)
chr3 (217-300)||(14153483-14153565)
chr3 (170-300)||(17538006-17538136)
chr3 (217-275)||(2842480-2842538)
chr3 (137-296)||(17446896-17447057)
chr3 (137-300)||(29172826-29172991)
chr3 (214-300)||(46751860-46751945)
chr3 (116-233)||(15565461-15565571)
chr3 (116-196)||(17693093-17693173)
chr3 (217-300)||(10562550-10562634)
chr3 (116-275)||(11886633-11886790)
chr3 (137-300)||(11886774-11886934)
chr3 (217-300)||(13919135-13919219)
chr3 (217-300)||(15264907-15264991)
chr3 (217-300)||(5214794-5214876)
chr3 (261-300)||(10542957-10542996)
chr3 (116-233)||(13919160-13919278)
chr3 (172-235)||(17548606-17548669)
chr3 (217-300)||(20417030-20417112)
chr3 (217-300)||(37037769-37037851)
chr3 (217-300)||(40806872-40806954)
chr3 (172-235)||(40806894-40806957)
chr3 (172-235)||(41173410-41173473)
chr3 (217-300)||(41173413-41173495)
chr3 (163-297)||(6145940-6146072)
chr3 (172-234)||(14507803-14507865)
chr3 (135-235)||(15245809-15245910)
chr3 (116-196)||(17259195-17259277)
chr3 (217-275)||(35065608-35065666)
chr3 (217-275)||(35353537-35353595)
chr3 (255-300)||(12269198-12269243)
chr3 (259-300)||(42353620-42353661)
chr3 (172-232)||(15932545-15932605)
chr3 (217-296)||(24153445-24153525)
chr3 (217-300)||(32404419-32404503)
chr3 (222-298)||(54331444-54331519)
chr3 (137-188)||(10562698-10562749)
chr3 (229-300)||(12506747-12506817)
chr3 (221-300)||(13031823-13031901)
chr3 (217-300)||(14507780-14507862)
chr3 (217-300)||(15932548-15932630)
chr3 (172-235)||(17520061-17520124)
chr3 (217-300)||(17520064-17520146)
chr3 (172-235)||(17534858-17534921)
chr3 (217-300)||(17534861-17534943)
chr3 (172-235)||(30175605-30175668)
chr3 (217-300)||(30175608-30175690)
chr3 (217-300)||(40811687-40811769)
chr3 (172-235)||(40811709-40811772)
chr3 (254-300)||(9577474-9577520)
chr3 (135-235)||(15206727-15206828)
chr3 (250-300)||(17043972-17044021)
chr3 (118-235)||(17538028-17538150)
chr3 (135-235)||(23318942-23319043)
chr3 (116-300)||(315889-316069)
chr3 (247-296)||(1209082-1209130)
chr3 (116-157)||(5214922-5214963)
chr3 (154-235)||(12506714-12506795)
chr3 (172-233)||(13031816-13031877)
chr3 (116-157)||(14507908-14507949)
chr3 (116-161)||(14519407-14519452)
chr3 (116-157)||(17044100-17044141)
chr3 (116-157)||(17519912-17519953)
chr3 (116-157)||(17534774-17534815)
chr3 (116-157)||(40807000-40807041)
chr3 (116-157)||(40811815-40811856)
chr3 (135-235)||(42386211-42386311)
chr3 (250-298)||(1465868-1465915)
chr3 (264-300)||(12377728-12377764)
chr3 (175-235)||(13026707-13026767)
chr3 (137-235)||(24153407-24153506)
chr3 (116-235)||(54331376-54331499)
chr3 (172-235)||(5206694-5206757)
chr3 (217-300)||(5206697-5206779)
chr3 (172-235)||(5214816-5214879)
chr3 (116-194)||(9577496-9577574)
chr3 (184-235)||(15017592-15017643)
chr3 (172-235)||(17043994-17044057)
chr3 (172-235)||(17519996-17520059)
chr3 (217-296)||(17548609-17548687)
chr3 (261-296)||(18438314-18438349)
chr3 (122-157)||(31224917-31224952)
chr3 (145-296)||(41123651-41123802)
chr3 (217-300)||(43925729-43925811)
chr3 (116-158)||(6155693-6155735)
chr3 (217-275)||(11258405-11258463)
chr3 (134-196)||(14519331-14519393)
chr3 (246-300)||(15017570-15017623)
chr3 (254-300)||(23319020-23319066)
chr3 (116-146)||(41173326-41173356)
chr3 (142-233)||(323851-323943)
chr3 (116-153)||(5206610-5206647)
chr3 (137-240)||(9707849-9707953)
chr3 (171-235)||(10562573-10562638)
chr3 (259-296)||(10901479-10901516)
chr3 (249-298)||(11562455-11562503)
chr3 (116-194)||(11562474-11562554)
chr3 (259-296)||(12174561-12174598)
chr3 (259-296)||(14234251-14234288)
chr3 (172-237)||(15448038-15448102)
chr3 (116-157)||(15932461-15932502)
chr3 (255-300)||(17669154-17669198)
chr3 (116-157)||(22307590-22307631)
chr3 (116-157)||(30175521-30175562)
chr3 (124-235)||(32404368-32404480)
chr3 (259-296)||(37251437-37251474)
chr3 (259-296)||(38962214-38962251)
chr3 (247-296)||(50756447-50756495)
chr3 (259-296)||(52524040-52524077)
chr3 (259-300)||(53646974-53647014)
chr3 (116-235)||(12377751-12377870)
chr3 (250-298)||(17259287-17259334)
chr3 (264-296)||(25476692-25476724)
chr3 (137-235)||(38962134-38962232)
chr3 (264-296)||(40214029-40214061)
[»] chr4 (124 HSPs)
chr4 (116-231)||(11424922-11425037)
chr4 (116-235)||(25090617-25090736)
chr4 (116-235)||(42874763-42874882)
chr4 (116-230)||(16997496-16997610)
chr4 (116-235)||(37018558-37018681)
chr4 (132-300)||(13036776-13036942)
chr4 (133-300)||(33244200-33244369)
chr4 (116-237)||(19734269-19734391)
chr4 (116-235)||(9637791-9637910)
chr4 (155-300)||(14548573-14548714)
chr4 (135-235)||(40906703-40906803)
chr4 (116-232)||(40229420-40229537)
chr4 (217-300)||(16997388-16997471)
chr4 (116-300)||(21061436-21061618)
chr4 (133-235)||(27995698-27995799)
chr4 (134-235)||(25090538-25090638)
chr4 (133-237)||(15364854-15364957)
chr4 (135-235)||(16042807-16042906)
chr4 (116-300)||(27995676-27995853)
chr4 (116-300)||(53631551-53631727)
chr4 (132-300)||(20433-20597)
chr4 (116-196)||(20571-20651)
chr4 (125-300)||(15608204-15608374)
chr4 (116-300)||(15364834-15365011)
chr4 (116-300)||(16042784-16042963)
chr4 (132-235)||(51992457-51992560)
chr4 (134-232)||(11424841-11424939)
chr4 (134-235)||(16296435-16296535)
chr4 (134-211)||(42874707-42874784)
chr4 (135-300)||(13592332-13592499)
chr4 (172-300)||(19609157-19609285)
chr4 (120-300)||(40906680-40906857)
chr4 (116-196)||(50160022-50160102)
chr4 (212-300)||(26045557-26045646)
chr4 (212-300)||(26050738-26050827)
chr4 (116-196)||(19738110-19738189)
chr4 (116-300)||(51992435-51992615)
chr4 (132-211)||(14650528-14650607)
chr4 (217-300)||(42874660-42874743)
chr4 (136-211)||(50159970-50160044)
chr4 (116-235)||(26444799-26444919)
chr4 (134-194)||(14548595-14548655)
chr4 (217-300)||(15355606-15355690)
chr4 (217-300)||(15791453-15791537)
chr4 (217-300)||(9637769-9637851)
chr4 (116-190)||(9871528-9871602)
chr4 (116-275)||(13036722-13036876)
chr4 (217-300)||(15042222-15042305)
chr4 (217-300)||(15112119-15112202)
chr4 (133-196)||(19738073-19738135)
chr4 (217-296)||(25090519-25090597)
chr4 (171-300)||(26444778-26444903)
chr4 (217-300)||(32467274-32467356)
chr4 (116-275)||(33244145-33244299)
chr4 (217-300)||(35812531-35812614)
chr4 (135-235)||(26045521-26045623)
chr4 (135-235)||(26050702-26050804)
chr4 (137-296)||(52312269-52312430)
chr4 (138-235)||(16997411-16997508)
chr4 (142-235)||(19435786-19435878)
chr4 (116-235)||(46640627-46640747)
chr4 (135-237)||(14853101-14853204)
chr4 (116-300)||(16296413-16296592)
chr4 (172-235)||(10357488-10357551)
chr4 (173-296)||(14280111-14280237)
chr4 (217-300)||(19435818-19435900)
chr4 (217-300)||(19734249-19734331)
chr4 (134-235)||(37018477-37018579)
chr4 (217-280)||(37018555-37018618)
chr4 (250-300)||(19857196-19857245)
chr4 (251-300)||(361869-361917)
chr4 (116-194)||(12622402-12622482)
chr4 (116-300)||(14853045-14853225)
chr4 (255-300)||(46642511-46642556)
chr4 (217-296)||(12549-12629)
chr4 (217-273)||(11424922-11424978)
chr4 (217-296)||(44102053-44102133)
chr4 (217-300)||(11424816-11424898)
chr4 (173-296)||(20149627-20149753)
chr4 (217-272)||(25090622-25090677)
chr4 (172-235)||(35812528-35812591)
chr4 (217-300)||(53082422-53082505)
chr4 (250-300)||(15098963-15099012)
chr4 (116-169)||(19435731-19435785)
chr4 (171-297)||(26922744-26922869)
chr4 (173-235)||(32467272-32467334)
chr4 (116-157)||(10357447-10357488)
chr4 (259-296)||(12773862-12773899)
chr4 (178-235)||(13844239-13844296)
chr4 (116-161)||(16027043-16027088)
chr4 (171-296)||(18215551-18215678)
chr4 (171-296)||(54798987-54799115)
chr4 (175-235)||(10357575-10357635)
chr4 (135-233)||(15791478-15791577)
chr4 (217-300)||(37018454-37018538)
chr4 (217-300)||(10357575-10357657)
chr4 (217-296)||(12288480-12288559)
chr4 (261-296)||(14038482-14038517)
chr4 (249-300)||(14629674-14629724)
chr4 (116-190)||(15791648-15791722)
chr4 (118-157)||(35812446-35812485)
chr4 (217-296)||(43198821-43198900)
chr4 (217-300)||(46640687-46640770)
chr4 (250-300)||(13844217-13844266)
chr4 (254-300)||(14825238-14825284)
chr4 (137-237)||(15355568-15355669)
chr4 (254-300)||(17333046-17333092)
chr4 (246-300)||(19736406-19736459)
chr4 (214-296)||(39706560-39706642)
chr4 (258-296)||(52873565-52873603)
chr4 (135-232)||(53082382-53082479)
chr4 (255-300)||(3484898-3484942)
chr4 (116-194)||(14629695-14629775)
chr4 (116-153)||(15042135-15042172)
chr4 (116-153)||(15112252-15112289)
chr4 (116-157)||(19609328-19609369)
chr4 (190-235)||(19736428-19736473)
chr4 (259-300)||(32307223-32307264)
chr4 (116-160)||(32467252-32467297)
chr4 (116-194)||(46225561-46225640)
chr4 (259-296)||(52243507-52243544)
chr4 (247-296)||(55582203-55582251)
chr4 (217-293)||(14157624-14157700)
chr4 (217-257)||(16997511-16997551)
[»] chr1 (113 HSPs)
chr1 (116-235)||(4596814-4596933)
chr1 (116-231)||(20241797-20241912)
chr1 (116-231)||(16059283-16059398)
chr1 (116-235)||(42912015-42912133)
chr1 (116-235)||(19675717-19675834)
chr1 (116-233)||(51475951-51476068)
chr1 (134-237)||(42911933-42912036)
chr1 (116-300)||(42696631-42696812)
chr1 (134-233)||(19675639-19675738)
chr1 (134-235)||(16059381-16059482)
chr1 (116-231)||(8276951-8277067)
chr1 (217-300)||(19675614-19675697)
chr1 (134-235)||(20241713-20241814)
chr1 (116-300)||(22349509-22349689)
chr1 (143-296)||(431518-431672)
chr1 (134-235)||(4596912-4597013)
chr1 (135-300)||(20316183-20316349)
chr1 (217-300)||(42911912-42911995)
chr1 (116-300)||(45754368-45754548)
chr1 (116-300)||(21240193-21240376)
chr1 (217-300)||(16059422-16059505)
chr1 (116-300)||(17904020-17904196)
chr1 (217-300)||(20241690-20241773)
chr1 (135-300)||(48520061-48520227)
chr1 (212-300)||(21043545-21043634)
chr1 (172-300)||(35088351-35088478)
chr1 (217-300)||(4596953-4597036)
chr1 (116-235)||(23967547-23967665)
chr1 (133-235)||(38057666-38057767)
chr1 (133-235)||(38888126-38888227)
chr1 (116-300)||(38057611-38057789)
chr1 (116-300)||(38888071-38888249)
chr1 (122-300)||(14800296-14800472)
chr1 (122-300)||(14809170-14809346)
chr1 (171-296)||(27161739-27161866)
chr1 (137-296)||(22123310-22123470)
chr1 (207-300)||(23967524-23967617)
chr1 (170-300)||(51475927-51476052)
chr1 (217-300)||(21534138-21534222)
chr1 (116-235)||(44891554-44891674)
chr1 (132-235)||(24726259-24726362)
chr1 (171-296)||(29297896-29298023)
chr1 (217-275)||(4596873-4596931)
chr1 (134-232)||(7053065-7053162)
chr1 (133-194)||(1642416-1642477)
chr1 (116-196)||(24720765-24720848)
chr1 (116-300)||(24726237-24726417)
chr1 (116-196)||(13301798-13301880)
chr1 (172-235)||(13528849-13528912)
chr1 (172-235)||(20587628-20587691)
chr1 (172-235)||(20592166-20592229)
chr1 (217-296)||(41050305-41050384)
chr1 (217-300)||(50622214-50622297)
chr1 (118-300)||(7053010-7053187)
chr1 (214-300)||(8277008-8277093)
chr1 (135-235)||(21043509-21043611)
chr1 (135-235)||(21534098-21534199)
chr1 (250-300)||(35982137-35982186)
chr1 (250-300)||(41306045-41306094)
chr1 (158-235)||(19762201-19762278)
chr1 (217-273)||(16059342-16059398)
chr1 (217-273)||(20241797-20241853)
chr1 (220-300)||(43696988-43697067)
chr1 (252-300)||(46383015-46383062)
chr1 (217-300)||(47190406-47190490)
chr1 (249-300)||(20957958-20958009)
chr1 (173-296)||(21711504-21711630)
chr1 (217-300)||(26064707-26064790)
chr1 (173-296)||(40388952-40389078)
chr1 (135-233)||(41050265-41050363)
chr1 (217-300)||(50614386-50614469)
chr1 (249-300)||(51323260-51323310)
chr1 (171-297)||(18120463-18120588)
chr1 (214-300)||(19762215-19762300)
chr1 (254-296)||(21706962-21707004)
chr1 (116-300)||(41227701-41227869)
chr1 (250-300)||(43542732-43542781)
chr1 (250-300)||(48300739-48300788)
chr1 (254-300)||(52954624-52954670)
chr1 (259-296)||(33680779-33680816)
chr1 (135-235)||(50614346-50614446)
chr1 (135-235)||(50622174-50622274)
chr1 (217-297)||(13528852-13528931)
chr1 (256-300)||(16380974-16381018)
chr1 (116-196)||(16381054-16381133)
chr1 (246-300)||(20636519-20636572)
chr1 (167-235)||(21238650-21238718)
chr1 (137-296)||(31612075-31612232)
chr1 (221-300)||(20587606-20587684)
chr1 (221-300)||(20592144-20592222)
chr1 (172-235)||(20634665-20634728)
chr1 (217-300)||(20634668-20634750)
chr1 (246-300)||(22118581-22118636)
chr1 (261-296)||(34509560-34509595)
chr1 (172-235)||(48300761-48300824)
chr1 (116-189)||(1642459-1642532)
chr1 (116-235)||(50686440-50686561)
chr1 (259-296)||(20248054-20248091)
chr1 (116-153)||(20587738-20587775)
chr1 (116-153)||(20592276-20592313)
chr1 (178-231)||(20636545-20636598)
chr1 (126-159)||(21047031-21047064)
chr1 (116-169)||(22124182-22124234)
chr1 (247-296)||(22825912-22825960)
chr1 (259-296)||(22922180-22922217)
chr1 (135-235)||(26064730-26064830)
chr1 (116-157)||(35088521-35088562)
chr1 (259-300)||(50686417-50686458)
chr1 (256-300)||(1642395-1642438)
chr1 (264-296)||(16368601-16368633)
chr1 (250-300)||(28194907-28194956)
chr1 (207-275)||(42912017-42912084)
chr1 (116-156)||(48520243-48520283)
[»] chr8 (111 HSPs)
chr8 (116-300)||(20179490-20179670)
chr8 (116-232)||(42818867-42818983)
chr8 (116-296)||(22584695-22584870)
chr8 (116-300)||(19698977-19699157)
chr8 (116-300)||(22253336-22253516)
chr8 (133-237)||(22259378-22259482)
chr8 (116-300)||(25849399-25849579)
chr8 (116-300)||(18833204-18833388)
chr8 (116-300)||(23669331-23669516)
chr8 (116-300)||(23418257-23418437)
chr8 (116-300)||(23888634-23888817)
chr8 (116-300)||(39695574-39695754)
chr8 (116-300)||(19929781-19929960)
chr8 (116-300)||(45471428-45471609)
chr8 (116-235)||(5760391-5760507)
chr8 (116-300)||(13665426-13665604)
chr8 (116-300)||(13724701-13724879)
chr8 (134-229)||(17217523-17217620)
chr8 (207-300)||(5760290-5760382)
chr8 (132-232)||(42266608-42266708)
chr8 (171-296)||(41597947-41598074)
chr8 (229-300)||(42819018-42819089)
chr8 (116-235)||(17907929-17908050)
chr8 (116-300)||(22381903-22382085)
chr8 (116-196)||(42266553-42266634)
chr8 (116-300)||(36728284-36728467)
chr8 (134-233)||(42818965-42819064)
chr8 (116-300)||(17217495-17217679)
chr8 (116-300)||(20502273-20502453)
chr8 (116-300)||(22259323-22259502)
chr8 (217-300)||(37515295-37515379)
chr8 (137-296)||(45290938-45291099)
chr8 (116-300)||(22244313-22244495)
chr8 (116-236)||(18819847-18819971)
chr8 (116-300)||(19127867-19128055)
chr8 (135-235)||(5760313-5760411)
chr8 (217-300)||(22963680-22963764)
chr8 (217-300)||(6102735-6102817)
chr8 (171-296)||(15203507-15203634)
chr8 (217-300)||(17907990-17908072)
chr8 (137-296)||(19896024-19896185)
chr8 (116-235)||(5083325-5083445)
chr8 (217-300)||(16799253-16799337)
chr8 (116-196)||(22473553-22473636)
chr8 (217-300)||(22995611-22995695)
chr8 (217-300)||(26225572-26225656)
chr8 (217-300)||(28397318-28397402)
chr8 (217-300)||(9097-9179)
chr8 (217-300)||(20084610-20084692)
chr8 (250-300)||(1323535-1323584)
chr8 (134-232)||(18820032-18820133)
chr8 (173-235)||(20084608-20084670)
chr8 (135-235)||(22995634-22995735)
chr8 (246-300)||(31723834-31723887)
chr8 (212-300)||(5083379-5083467)
chr8 (120-298)||(2419046-2419220)
chr8 (171-235)||(18819989-18820053)
chr8 (217-300)||(22984053-22984137)
chr8 (116-167)||(39695489-39695541)
chr8 (142-235)||(16799276-16799370)
chr8 (261-296)||(22626517-22626552)
chr8 (217-300)||(24713097-24713179)
chr8 (172-235)||(24713119-24713182)
chr8 (172-235)||(39937101-39937164)
chr8 (250-300)||(20983083-20983132)
chr8 (254-300)||(22525327-22525373)
chr8 (173-235)||(23947210-23947272)
chr8 (218-300)||(29763869-29763950)
chr8 (250-300)||(38550449-38550498)
chr8 (174-235)||(9119-9180)
chr8 (217-274)||(42818926-42818983)
chr8 (217-300)||(17086419-17086503)
chr8 (264-300)||(19155203-19155239)
chr8 (171-235)||(22318947-22319010)
chr8 (254-298)||(24352792-24352836)
chr8 (137-235)||(28397341-28397440)
chr8 (264-300)||(35027132-35027168)
chr8 (116-235)||(36733583-36733703)
chr8 (257-300)||(2717865-2717907)
chr8 (122-161)||(6102720-6102759)
chr8 (261-296)||(16092602-16092637)
chr8 (246-297)||(21513208-21513258)
chr8 (175-300)||(23667693-23667819)
chr8 (217-300)||(23947188-23947270)
chr8 (217-300)||(39937104-39937186)
chr8 (250-300)||(13428500-13428549)
chr8 (254-300)||(17439812-17439858)
chr8 (254-296)||(22419718-22419760)
chr8 (262-296)||(22874849-22874883)
chr8 (254-300)||(26219514-26219560)
chr8 (116-296)||(36405977-36406156)
chr8 (135-235)||(37515318-37515419)
chr8 (254-300)||(40493280-40493326)
chr8 (116-196)||(4381737-4381821)
chr8 (170-235)||(6102730-6102794)
chr8 (259-296)||(6520136-6520173)
chr8 (259-296)||(20498335-20498372)
chr8 (259-300)||(20533720-20533761)
chr8 (259-296)||(21673478-21673515)
chr8 (259-300)||(22207091-22207131)
chr8 (116-157)||(22318885-22318926)
chr8 (134-235)||(22318989-22319089)
chr8 (247-296)||(22343995-22344043)
chr8 (247-296)||(22355655-22355703)
chr8 (116-160)||(23947247-23947292)
chr8 (259-296)||(26355973-26356010)
chr8 (251-300)||(27472747-27472795)
chr8 (144-297)||(38988224-38988374)
chr8 (144-297)||(39019321-39019471)
chr8 (264-296)||(21673421-21673453)
chr8 (260-300)||(33587128-33587167)
[»] chr7 (138 HSPs)
chr7 (116-300)||(44373849-44374029)
chr7 (116-300)||(44382714-44382894)
chr7 (116-235)||(12466229-12466348)
chr7 (116-235)||(19282056-19282175)
chr7 (116-235)||(20585320-20585439)
chr7 (116-233)||(14161839-14161956)
chr7 (134-300)||(14220064-14220229)
chr7 (116-300)||(33000870-33001052)
chr7 (134-235)||(19281976-19282077)
chr7 (120-235)||(17071252-17071368)
chr7 (116-235)||(43277779-43277898)
chr7 (116-232)||(13699714-13699831)
chr7 (134-235)||(14161937-14162038)
chr7 (116-300)||(19558268-19558452)
chr7 (116-300)||(10660215-10660395)
chr7 (172-300)||(20619119-20619246)
chr7 (173-300)||(12371178-12371304)
chr7 (217-300)||(20585297-20585380)
chr7 (134-237)||(12466327-12466434)
chr7 (116-300)||(32300876-32301059)
chr7 (116-300)||(36705630-36705810)
chr7 (217-300)||(14161978-14162061)
chr7 (217-300)||(19281953-19282036)
chr7 (116-300)||(17130702-17130884)
chr7 (116-300)||(38519140-38519321)
chr7 (116-235)||(3286901-3287020)
chr7 (172-300)||(11066302-11066429)
chr7 (116-300)||(15281170-15281354)
chr7 (217-300)||(14183718-14183801)
chr7 (116-300)||(130989-131169)
chr7 (116-233)||(12371202-12371323)
chr7 (172-300)||(13150627-13150754)
chr7 (116-275)||(14220007-14220163)
chr7 (132-235)||(37785374-37785477)
chr7 (116-300)||(4070634-4070818)
chr7 (212-300)||(42461717-42461806)
chr7 (217-300)||(11525833-11525917)
chr7 (217-300)||(11772522-11772606)
chr7 (214-300)||(3286879-3286964)
chr7 (170-300)||(12128187-12128315)
chr7 (137-296)||(20110313-20110475)
chr7 (172-300)||(32434680-32434807)
chr7 (217-300)||(14044516-14044599)
chr7 (217-300)||(14354546-14354629)
chr7 (221-300)||(17071312-17071390)
chr7 (137-235)||(8136113-8136210)
chr7 (171-300)||(15139002-15139126)
chr7 (247-300)||(12466402-12466455)
chr7 (116-235)||(17017627-17017747)
chr7 (116-300)||(37785319-37785499)
chr7 (135-237)||(42461738-42461842)
chr7 (217-296)||(44116310-44116390)
chr7 (116-196)||(47094096-47094175)
chr7 (116-196)||(48213887-48213970)
chr7 (217-300)||(61513-61595)
chr7 (172-235)||(8852256-8852319)
chr7 (217-300)||(8852259-8852341)
chr7 (142-235)||(11525800-11525894)
chr7 (116-235)||(13133498-13133617)
chr7 (172-235)||(14183715-14183778)
chr7 (217-300)||(18875943-18876026)
chr7 (172-235)||(36686291-36686354)
chr7 (217-296)||(43277838-43277916)
chr7 (217-295)||(48273150-48273229)
chr7 (172-235)||(48811735-48811798)
chr7 (250-300)||(8468107-8468156)
chr7 (250-300)||(9390154-9390203)
chr7 (212-286)||(38227273-38227347)
chr7 (116-235)||(9033520-9033640)
chr7 (116-235)||(9177838-9177958)
chr7 (116-231)||(11769086-11769202)
chr7 (217-298)||(15008768-15008849)
chr7 (116-235)||(16091588-16091708)
chr7 (259-300)||(16461441-16461482)
chr7 (172-237)||(18075576-18075640)
chr7 (133-194)||(47094061-47094121)
chr7 (205-297)||(8136139-8136229)
chr7 (217-300)||(9033579-9033663)
chr7 (116-196)||(11053640-11053723)
chr7 (137-229)||(15139030-15139122)
chr7 (217-296)||(17062157-17062237)
chr7 (217-296)||(29329201-29329281)
chr7 (217-300)||(1868226-1868309)
chr7 (217-296)||(12256090-12256169)
chr7 (217-276)||(14161898-14161957)
chr7 (261-300)||(16579350-16579389)
chr7 (217-300)||(36686294-36686377)
chr7 (172-235)||(38227282-38227345)
chr7 (170-300)||(46387085-46387215)
chr7 (116-196)||(48809491-48809573)
chr7 (116-235)||(12128171-12128293)
chr7 (217-275)||(12466288-12466346)
chr7 (250-300)||(14270492-14270541)
chr7 (254-300)||(17017724-17017770)
chr7 (250-300)||(17232243-17232292)
chr7 (217-275)||(19282058-19282116)
chr7 (116-157)||(8852172-8852213)
chr7 (116-157)||(13150543-13150584)
chr7 (137-233)||(14044541-14044637)
chr7 (116-161)||(14183633-14183678)
chr7 (259-300)||(14323178-14323219)
chr7 (137-233)||(14354571-14354667)
chr7 (135-235)||(15008728-15008828)
chr7 (116-157)||(46387069-46387110)
chr7 (172-232)||(61510-61570)
chr7 (217-300)||(16995990-16996074)
chr7 (217-296)||(18456649-18456729)
chr7 (264-300)||(20220467-20220503)
chr7 (137-235)||(44116329-44116428)
chr7 (116-237)||(1868166-1868288)
chr7 (217-296)||(2282519-2282598)
chr7 (116-194)||(9744094-9744176)
chr7 (134-190)||(11053606-11053664)
chr7 (249-300)||(13133589-13133639)
chr7 (217-296)||(13699774-13699852)
chr7 (261-296)||(15144338-15144373)
chr7 (217-296)||(16056101-16056180)
chr7 (261-300)||(16586274-16586312)
chr7 (116-155)||(18075535-18075574)
chr7 (217-300)||(45848048-45848130)
chr7 (217-300)||(48811713-48811795)
chr7 (165-235)||(20253690-20253760)
chr7 (250-300)||(37727995-37728044)
chr7 (250-300)||(48809583-48809632)
chr7 (116-157)||(59399-59440)
chr7 (171-235)||(11772518-11772583)
chr7 (116-161)||(15576927-15576972)
chr7 (116-169)||(16996119-16996171)
chr7 (116-153)||(18875879-18875916)
chr7 (116-157)||(20619289-20619330)
chr7 (259-296)||(47831574-47831611)
chr7 (264-296)||(67513-67545)
chr7 (220-300)||(6170530-6170609)
chr7 (248-300)||(11053558-11053609)
chr7 (221-300)||(11769149-11769229)
chr7 (245-297)||(15105203-15105254)
chr7 (175-235)||(18875943-18876003)
chr7 (268-300)||(48990986-48991018)
[»] scaffold0074 (5 HSPs)
scaffold0074 (116-235)||(536-655)
scaffold0074 (134-232)||(459-557)
scaffold0074 (217-275)||(538-596)
scaffold0074 (116-169)||(8057-8110)
scaffold0074 (217-298)||(436-516)
[»] scaffold0328 (1 HSPs)
scaffold0328 (116-300)||(19603-19786)
[»] scaffold0111 (10 HSPs)
scaffold0111 (116-235)||(19770-19889)
scaffold0111 (134-235)||(19868-19969)
scaffold0111 (217-296)||(19909-19988)
scaffold0111 (172-235)||(7212-7275)
scaffold0111 (172-235)||(14331-14394)
scaffold0111 (172-235)||(14396-14459)
scaffold0111 (217-300)||(7190-7272)
scaffold0111 (172-235)||(7277-7340)
scaffold0111 (217-300)||(14309-14391)
scaffold0111 (217-275)||(19829-19887)
[»] scaffold0040 (7 HSPs)
scaffold0040 (116-235)||(102065-102184)
scaffold0040 (134-235)||(102163-102264)
scaffold0040 (117-300)||(10907-11086)
scaffold0040 (119-300)||(22007-22184)
scaffold0040 (217-300)||(102204-102287)
scaffold0040 (217-296)||(103900-103979)
scaffold0040 (175-235)||(103900-103960)
[»] chr2 (107 HSPs)
chr2 (116-233)||(36839140-36839257)
chr2 (116-234)||(28653471-28653588)
chr2 (116-235)||(24515151-24515269)
chr2 (116-235)||(17306452-17306570)
chr2 (116-235)||(24835039-24835157)
chr2 (134-235)||(17306372-17306473)
chr2 (134-235)||(28653568-28653669)
chr2 (116-300)||(18391270-18391453)
chr2 (116-300)||(25044917-25045096)
chr2 (138-237)||(24515069-24515168)
chr2 (134-235)||(36839058-36839159)
chr2 (217-300)||(17306349-17306432)
chr2 (116-300)||(18389257-18389437)
chr2 (217-300)||(28653609-28653692)
chr2 (116-300)||(34136708-34136889)
chr2 (116-300)||(3538674-3538857)
chr2 (133-235)||(24815693-24815794)
chr2 (172-300)||(24781954-24782081)
chr2 (116-235)||(1384737-1384858)
chr2 (217-298)||(24515050-24515131)
chr2 (132-232)||(19357883-19357983)
chr2 (116-300)||(24815638-24815816)
chr2 (137-296)||(23712255-23712416)
chr2 (172-300)||(5032415-5032540)
chr2 (116-196)||(19357957-19358038)
chr2 (116-235)||(43947537-43947657)
chr2 (116-235)||(5985063-5985183)
chr2 (116-300)||(14693137-14693317)
chr2 (217-300)||(39828225-39828309)
chr2 (137-296)||(6725754-6725915)
chr2 (116-235)||(26392212-26392332)
chr2 (175-235)||(356936-356996)
chr2 (217-300)||(43947596-43947680)
chr2 (170-300)||(356914-357044)
chr2 (172-235)||(26896208-26896271)
chr2 (217-292)||(36839043-36839118)
chr2 (207-300)||(10743980-10744071)
chr2 (165-235)||(21316797-21316867)
chr2 (116-235)||(39828166-39828286)
chr2 (217-300)||(24529854-24529938)
chr2 (172-235)||(19202295-19202358)
chr2 (217-300)||(19202298-19202380)
chr2 (172-235)||(23969639-23969702)
chr2 (217-300)||(24435929-24436011)
chr2 (172-235)||(24435951-24436014)
chr2 (116-235)||(27851552-27851671)
chr2 (217-275)||(17306454-17306512)
chr2 (165-235)||(21336787-21336857)
chr2 (246-300)||(25140846-25140899)
chr2 (116-235)||(25140868-25140989)
chr2 (116-300)||(21115509-21115689)
chr2 (135-235)||(25108709-25108809)
chr2 (172-232)||(9974826-9974886)
chr2 (217-300)||(18547214-18547298)
chr2 (172-235)||(6478341-6478404)
chr2 (217-300)||(9974801-9974883)
chr2 (217-300)||(21316807-21316889)
chr2 (217-300)||(21336797-21336879)
chr2 (217-296)||(22413406-22413485)
chr2 (172-235)||(24883360-24883423)
chr2 (116-235)||(27860267-27860386)
chr2 (173-300)||(44071440-44071565)
chr2 (183-296)||(1384766-1384876)
chr2 (214-300)||(5985041-5985126)
chr2 (135-235)||(18547174-18547275)
chr2 (165-235)||(21367751-21367821)
chr2 (217-275)||(24515153-24515211)
chr2 (116-157)||(6576217-6576258)
chr2 (259-300)||(20520465-20520506)
chr2 (135-235)||(22413366-22413466)
chr2 (116-157)||(22689684-22689725)
chr2 (116-157)||(22694280-22694321)
chr2 (137-237)||(23791063-23791163)
chr2 (116-157)||(24436057-24436098)
chr2 (116-157)||(24781847-24781888)
chr2 (256-296)||(7679391-7679431)
chr2 (217-300)||(21237540-21237624)
chr2 (175-235)||(22689578-22689638)
chr2 (175-235)||(22694174-22694234)
chr2 (217-296)||(26392193-26392273)
chr2 (217-296)||(18787172-18787251)
chr2 (165-232)||(21336699-21336766)
chr2 (217-296)||(21367733-21367811)
chr2 (261-296)||(22336905-22336940)
chr2 (217-300)||(22689556-22689638)
chr2 (259-298)||(24697838-24697877)
chr2 (217-300)||(24835098-24835179)
chr2 (217-300)||(26896186-26896268)
chr2 (163-233)||(10743978-10744048)
chr2 (254-300)||(23791042-23791088)
chr2 (217-275)||(36839140-36839198)
chr2 (116-191)||(44071505-44071584)
chr2 (116-153)||(5032331-5032368)
chr2 (135-235)||(18787132-18787232)
chr2 (259-300)||(22258847-22258887)
chr2 (251-300)||(23969771-23969819)
chr2 (259-296)||(24367533-24367570)
chr2 (217-298)||(24688558-24688639)
chr2 (251-300)||(24883338-24883386)
chr2 (116-157)||(24883466-24883507)
chr2 (259-300)||(25085326-25085366)
chr2 (247-296)||(25587815-25587863)
chr2 (116-156)||(9974930-9974970)
chr2 (260-300)||(22500759-22500798)
chr2 (260-300)||(22508693-22508732)
chr2 (217-293)||(22694159-22694234)
chr2 (116-194)||(24697778-24697857)
[»] scaffold0203 (2 HSPs)
scaffold0203 (116-235)||(19110-19229)
scaffold0203 (170-300)||(19126-19252)
[»] chr6 (103 HSPs)
chr6 (133-300)||(23083296-23083461)
chr6 (116-300)||(17742964-17743149)
chr6 (116-235)||(27126446-27126565)
chr6 (134-235)||(7825530-7825631)
chr6 (116-231)||(7825614-7825729)
chr6 (116-235)||(17105525-17105642)
chr6 (116-300)||(17229827-17230006)
chr6 (116-300)||(20136440-20136618)
chr6 (116-300)||(22196251-22196429)
chr6 (217-300)||(7825507-7825590)
chr6 (116-235)||(18260176-18260292)
chr6 (120-300)||(23528278-23528453)
chr6 (116-235)||(23538499-23538616)
chr6 (207-300)||(19656511-19656603)
chr6 (207-300)||(23538320-23538412)
chr6 (116-231)||(19656307-19656420)
chr6 (133-235)||(20411796-20411897)
chr6 (116-300)||(20411741-20411919)
chr6 (116-300)||(22556097-22556282)
chr6 (116-290)||(27573271-27573445)
chr6 (116-300)||(22376857-22377034)
chr6 (221-300)||(27126509-27126588)
chr6 (116-235)||(31735874-31735993)
chr6 (207-300)||(15705824-15705918)
chr6 (116-299)||(15895700-15895877)
chr6 (116-275)||(23083242-23083395)
chr6 (120-235)||(23492265-23492382)
chr6 (120-235)||(23497863-23497980)
chr6 (207-300)||(17105425-17105516)
chr6 (134-231)||(22212526-22212622)
chr6 (135-235)||(23538421-23538519)
chr6 (120-300)||(18177847-18178022)
chr6 (212-300)||(18452988-18453077)
chr6 (173-300)||(25714212-25714341)
chr6 (135-235)||(17105447-17105545)
chr6 (135-235)||(19656482-19656580)
chr6 (135-235)||(23538343-23538441)
chr6 (171-296)||(20557169-20557296)
chr6 (137-296)||(1595308-1595469)
chr6 (116-300)||(16492917-16493097)
chr6 (116-235)||(18453011-18453131)
chr6 (217-300)||(20078439-20078522)
chr6 (116-236)||(23500619-23500739)
chr6 (116-300)||(16245107-16245284)
chr6 (135-232)||(18896537-18896635)
chr6 (217-298)||(19362197-19362279)
chr6 (133-211)||(19829966-19830043)
chr6 (135-235)||(15705795-15705895)
chr6 (136-196)||(18203910-18203970)
chr6 (217-300)||(25688337-25688421)
chr6 (172-300)||(18708332-18708461)
chr6 (207-280)||(17105522-17105594)
chr6 (207-280)||(23538496-23538568)
chr6 (116-164)||(18203980-18204028)
chr6 (135-231)||(19656404-19656498)
chr6 (116-235)||(19957919-19958039)
chr6 (173-300)||(23492280-23492404)
chr6 (173-300)||(23497878-23498002)
chr6 (217-300)||(35007918-35008002)
chr6 (172-235)||(16133727-16133790)
chr6 (261-296)||(19303802-19303837)
chr6 (172-235)||(19444337-19444400)
chr6 (214-300)||(18260230-18260314)
chr6 (135-235)||(19362218-19362319)
chr6 (254-300)||(25656548-25656594)
chr6 (250-300)||(25957079-25957128)
chr6 (116-157)||(18708504-18708545)
chr6 (263-300)||(22805525-22805562)
chr6 (207-280)||(23538418-23538490)
chr6 (132-194)||(31735930-31735994)
chr6 (205-297)||(6083809-6083899)
chr6 (220-300)||(18319509-18319588)
chr6 (217-300)||(18896577-18896661)
chr6 (135-237)||(19668161-19668263)
chr6 (261-296)||(20361224-20361259)
chr6 (172-235)||(23017181-23017244)
chr6 (172-231)||(23017246-23017305)
chr6 (261-296)||(25629659-25629694)
chr6 (217-296)||(25644111-25644190)
chr6 (261-296)||(29060320-29060355)
chr6 (207-273)||(19656355-19656420)
chr6 (254-300)||(22117697-22117743)
chr6 (116-298)||(22212469-22212646)
chr6 (250-300)||(31733624-31733673)
chr6 (116-194)||(33442919-33442996)
chr6 (259-296)||(9100883-9100920)
chr6 (259-296)||(16448854-16448891)
chr6 (247-296)||(19234283-19234331)
chr6 (259-296)||(19651967-19652004)
chr6 (116-196)||(19829911-19829991)
chr6 (259-296)||(20108908-20108945)
chr6 (259-300)||(20223713-20223754)
chr6 (116-153)||(23017097-23017134)
chr6 (217-300)||(23017249-23017331)
chr6 (247-296)||(25920507-25920555)
chr6 (178-235)||(25957049-25957106)
chr6 (116-157)||(27323625-27323666)
chr6 (247-296)||(30674485-30674533)
chr6 (260-300)||(27328998-27329037)
chr6 (260-300)||(27389738-27389777)
chr6 (220-296)||(27850795-27850870)
chr6 (172-232)||(31733649-31733709)
chr6 (264-300)||(33442816-33442852)
[»] scaffold1662 (3 HSPs)
scaffold1662 (116-235)||(390-509)
scaffold1662 (134-220)||(488-574)
scaffold1662 (217-300)||(529-611)
[»] scaffold0301 (2 HSPs)
scaffold0301 (116-235)||(10801-10920)
scaffold0301 (217-300)||(10778-10861)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (135-235)||(63309-63409)
scaffold0032 (217-300)||(63349-63432)
scaffold0032 (135-235)||(63192-63292)
scaffold0032 (116-280)||(63136-63295)
[»] scaffold0054 (3 HSPs)
scaffold0054 (116-300)||(76001-76179)
scaffold0054 (134-300)||(66044-66209)
scaffold0054 (116-278)||(65945-66106)
[»] scaffold0630 (2 HSPs)
scaffold0630 (132-232)||(8034-8134)
scaffold0630 (149-300)||(8009-8155)
[»] scaffold0010 (7 HSPs)
scaffold0010 (116-300)||(415-596)
scaffold0010 (212-300)||(6783-6872)
scaffold0010 (137-232)||(127439-127536)
scaffold0010 (136-235)||(6806-6907)
scaffold0010 (116-300)||(127377-127561)
scaffold0010 (207-235)||(117847-117875)
scaffold0010 (134-237)||(117854-117957)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (116-300)||(15228-15406)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (116-299)||(24080-24256)
[»] scaffold0529 (2 HSPs)
scaffold0529 (138-300)||(7221-7382)
scaffold0529 (116-196)||(7362-7443)
[»] scaffold0241 (4 HSPs)
scaffold0241 (134-300)||(1275-1440)
scaffold0241 (116-196)||(4583-4664)
scaffold0241 (116-275)||(1341-1497)
scaffold0241 (137-179)||(4562-4604)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (116-296)||(65934-66113)
scaffold0056 (261-296)||(17527-17562)
[»] scaffold0073 (2 HSPs)
scaffold0073 (116-235)||(56706-56824)
scaffold0073 (217-300)||(56684-56765)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (116-300)||(25775-25958)
[»] chr5 (79 HSPs)
chr5 (133-235)||(10952908-10953010)
chr5 (116-300)||(20470085-20470268)
chr5 (132-237)||(20565348-20565453)
chr5 (116-300)||(10952886-10953065)
chr5 (217-300)||(25578299-25578383)
chr5 (116-300)||(15796191-15796370)
chr5 (137-300)||(2154856-2155021)
chr5 (217-300)||(25574733-25574817)
chr5 (116-235)||(25742804-25742921)
chr5 (116-300)||(25250851-25251035)
chr5 (116-300)||(25314636-25314820)
chr5 (137-296)||(11581442-11581604)
chr5 (116-300)||(20565328-20565508)
chr5 (117-300)||(23469571-23469751)
chr5 (217-300)||(25575926-25576010)
chr5 (116-296)||(6551466-6551646)
chr5 (116-300)||(23202700-23202882)
chr5 (132-211)||(25742786-25742867)
chr5 (116-196)||(21406627-21406708)
chr5 (173-296)||(14047880-14048006)
chr5 (116-196)||(29914302-29914384)
chr5 (116-300)||(36509768-36509946)
chr5 (137-296)||(22411946-22412106)
chr5 (116-300)||(21809751-21809931)
chr5 (171-235)||(25574729-25574794)
chr5 (217-300)||(21732196-21732280)
chr5 (135-233)||(25578259-25578358)
chr5 (116-196)||(25743591-25743671)
chr5 (218-296)||(20918271-20918350)
chr5 (246-300)||(13536477-13536530)
chr5 (134-196)||(21406684-21406746)
chr5 (163-300)||(21619041-21619174)
chr5 (137-296)||(29329693-29329854)
chr5 (212-300)||(16227251-16227339)
chr5 (135-234)||(21732156-21732256)
chr5 (171-235)||(25575922-25575987)
chr5 (116-196)||(14026869-14026952)
chr5 (217-296)||(24066949-24067029)
chr5 (116-193)||(8504702-8504782)
chr5 (135-235)||(16227273-16227374)
chr5 (254-300)||(26740951-26740997)
chr5 (186-235)||(13536459-13536508)
chr5 (259-300)||(26733100-26733141)
chr5 (135-235)||(27989158-27989258)
chr5 (260-296)||(18319318-18319354)
chr5 (175-235)||(21309060-21309120)
chr5 (149-234)||(21619064-21619151)
chr5 (261-296)||(1096248-1096283)
chr5 (261-296)||(9077734-9077769)
chr5 (246-300)||(16227541-16227596)
chr5 (172-235)||(19920613-19920676)
chr5 (217-296)||(20027210-20027289)
chr5 (261-296)||(24529000-24529035)
chr5 (217-296)||(27989198-27989277)
chr5 (172-235)||(31455439-31455502)
chr5 (134-196)||(8504761-8504823)
chr5 (250-300)||(19920591-19920640)
chr5 (259-297)||(21330536-21330574)
chr5 (214-296)||(21565314-21565396)
chr5 (136-170)||(25743579-25743613)
chr5 (250-300)||(26761338-26761387)
chr5 (254-296)||(32027152-32027194)
chr5 (259-296)||(10775999-10776036)
chr5 (247-296)||(16605467-16605515)
chr5 (259-296)||(21329808-21329845)
chr5 (259-300)||(21555465-21555506)
chr5 (259-300)||(21558130-21558171)
chr5 (247-296)||(22110681-22110729)
chr5 (259-300)||(22178532-22178573)
chr5 (259-296)||(22959842-22959879)
chr5 (259-300)||(25743533-25743574)
chr5 (120-157)||(31454932-31454969)
chr5 (120-157)||(31455545-31455582)
chr5 (250-300)||(5889617-5889666)
chr5 (137-235)||(10775919-10776017)
chr5 (249-297)||(20198811-20198858)
chr5 (116-156)||(21330515-21330555)
chr5 (134-237)||(22143837-22143940)
chr5 (261-297)||(25431173-25431209)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (116-300)||(2893-3076)
[»] scaffold0077 (4 HSPs)
scaffold0077 (116-296)||(13993-14167)
scaffold0077 (135-300)||(55910-56077)
scaffold0077 (132-195)||(2880-2943)
scaffold0077 (116-196)||(2917-2998)
[»] scaffold0500 (1 HSPs)
scaffold0500 (116-300)||(7323-7501)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (116-300)||(28189-28371)
scaffold0042 (116-232)||(47522-47641)
[»] scaffold0107 (5 HSPs)
scaffold0107 (116-300)||(35948-36129)
scaffold0107 (212-300)||(10398-10487)
scaffold0107 (207-300)||(10646-10739)
scaffold0107 (172-235)||(10400-10464)
scaffold0107 (116-235)||(10598-10717)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (209-300)||(4516-4608)
scaffold0292 (135-235)||(4539-4639)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (116-300)||(397407-397587)
[»] scaffold0853 (2 HSPs)
scaffold0853 (201-300)||(2917-3016)
scaffold0853 (175-235)||(2933-2993)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (116-300)||(13078-13254)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (116-300)||(954-1136)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (133-235)||(9096-9197)
scaffold0218 (119-300)||(9044-9219)
[»] scaffold0098 (2 HSPs)
scaffold0098 (133-235)||(39051-39152)
scaffold0098 (116-300)||(39029-39207)
[»] scaffold0065 (3 HSPs)
scaffold0065 (133-235)||(54806-54907)
scaffold0065 (116-235)||(53595-53715)
scaffold0065 (116-295)||(54789-54962)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (133-235)||(7667-7768)
scaffold0018 (116-300)||(7612-7790)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (116-235)||(109143-109264)
scaffold0004 (170-300)||(109121-109248)
scaffold0004 (221-300)||(332087-332167)
[»] scaffold0379 (6 HSPs)
scaffold0379 (136-237)||(4806-4905)
scaffold0379 (116-300)||(4748-4925)
scaffold0379 (119-235)||(14797-14911)
scaffold0379 (217-300)||(14852-14933)
scaffold0379 (247-296)||(9490-9538)
scaffold0379 (247-296)||(16682-16730)
[»] scaffold0075 (3 HSPs)
scaffold0075 (132-300)||(60132-60296)
scaffold0075 (116-196)||(60270-60350)
scaffold0075 (218-296)||(52248-52327)
[»] scaffold1283 (2 HSPs)
scaffold1283 (135-235)||(1601-1699)
scaffold1283 (116-300)||(1545-1721)
[»] scaffold0375 (2 HSPs)
scaffold0375 (172-300)||(9393-9520)
scaffold0375 (116-153)||(9309-9346)
[»] scaffold0108 (5 HSPs)
scaffold0108 (116-300)||(7878-8060)
scaffold0108 (132-300)||(5287-5448)
scaffold0108 (173-236)||(5424-5487)
scaffold0108 (217-275)||(5427-5485)
scaffold0108 (116-169)||(3153-3206)
[»] scaffold1223 (2 HSPs)
scaffold1223 (116-235)||(142-263)
scaffold1223 (207-300)||(193-285)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (207-300)||(13801-13895)
scaffold0452 (135-235)||(13772-13872)
[»] scaffold0439 (3 HSPs)
scaffold0439 (134-232)||(1143-1240)
scaffold0439 (134-232)||(9003-9100)
scaffold0439 (116-161)||(11215-11260)
[»] scaffold0170 (4 HSPs)
scaffold0170 (133-235)||(2460-2561)
scaffold0170 (116-300)||(2438-2616)
scaffold0170 (212-300)||(2725-2814)
scaffold0170 (172-235)||(2748-2812)
[»] scaffold0737 (4 HSPs)
scaffold0737 (175-300)||(6740-6864)
scaffold0737 (175-235)||(6698-6758)
scaffold0737 (135-235)||(2027-2127)
scaffold0737 (120-157)||(6638-6675)
[»] scaffold0716 (2 HSPs)
scaffold0716 (134-235)||(832-933)
scaffold0716 (116-300)||(810-989)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (175-300)||(2976-3100)
scaffold0507 (116-157)||(2843-2884)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (212-300)||(1662-1751)
scaffold0396 (135-235)||(1685-1787)
[»] scaffold0220 (9 HSPs)
scaffold0220 (116-300)||(17321-17502)
scaffold0220 (133-235)||(15658-15759)
scaffold0220 (132-300)||(15636-15797)
scaffold0220 (138-196)||(12916-12973)
scaffold0220 (173-235)||(12956-13018)
scaffold0220 (173-235)||(15774-15836)
scaffold0220 (133-201)||(12874-12941)
scaffold0220 (246-300)||(3371-3424)
scaffold0220 (217-275)||(15776-15834)
[»] scaffold0061 (1 HSPs)
scaffold0061 (175-300)||(19471-19595)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (116-235)||(206696-206816)
scaffold0014 (217-300)||(206755-206839)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (217-300)||(17272-17356)
scaffold0293 (171-235)||(17295-17360)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (116-253)||(11768-11903)
scaffold0338 (256-300)||(15227-15270)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (218-300)||(708-790)
scaffold0058 (176-235)||(708-767)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (116-231)||(896-1010)
scaffold0083 (116-231)||(6200-6314)
scaffold0083 (116-300)||(11667-11848)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (116-235)||(142410-142530)
scaffold0020 (212-300)||(142388-142476)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (116-235)||(38324-38444)
scaffold0011 (205-300)||(38370-38467)
scaffold0011 (116-297)||(39805-39988)
scaffold0011 (116-191)||(125642-125716)
scaffold0011 (135-232)||(125525-125623)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (118-300)||(446257-446432)
scaffold0001 (172-300)||(76585-76712)
scaffold0001 (116-235)||(497254-497374)
scaffold0001 (217-300)||(497231-497315)
[»] scaffold1695 (2 HSPs)
scaffold1695 (116-237)||(348-471)
scaffold1695 (207-300)||(328-420)
[»] scaffold0914 (2 HSPs)
scaffold0914 (217-300)||(1469-1553)
scaffold0914 (135-233)||(1494-1593)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (133-233)||(20587-20686)
scaffold0149 (217-300)||(20563-20645)
[»] scaffold0036 (3 HSPs)
scaffold0036 (172-300)||(78401-78528)
scaffold0036 (137-235)||(78404-78506)
scaffold0036 (116-157)||(78317-78358)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (201-300)||(13559-13657)
scaffold0450 (175-235)||(13581-13641)
[»] scaffold0005 (4 HSPs)
scaffold0005 (132-211)||(166685-166764)
scaffold0005 (249-300)||(187659-187709)
scaffold0005 (254-300)||(14425-14471)
scaffold0005 (116-194)||(187608-187688)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (217-300)||(95207-95289)
scaffold0003 (165-235)||(95229-95299)
scaffold0003 (259-300)||(158775-158816)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (250-300)||(7969-8019)
[»] scaffold0039 (2 HSPs)
scaffold0039 (133-235)||(10914-11015)
scaffold0039 (116-300)||(10859-11037)
[»] scaffold1539 (3 HSPs)
scaffold1539 (116-196)||(518-598)
scaffold1539 (116-300)||(707-887)
scaffold1539 (133-188)||(489-543)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (116-234)||(3240-3360)
[»] scaffold0485 (2 HSPs)
scaffold0485 (224-300)||(9940-10017)
scaffold0485 (183-233)||(9965-10016)
[»] scaffold0282 (5 HSPs)
scaffold0282 (212-300)||(18432-18521)
scaffold0282 (212-300)||(11935-12024)
scaffold0282 (135-235)||(18396-18498)
scaffold0282 (135-237)||(11899-12003)
scaffold0282 (116-152)||(18339-18375)
[»] scaffold0790 (2 HSPs)
scaffold0790 (118-170)||(5930-5982)
scaffold0790 (136-193)||(5869-5926)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (172-300)||(9849-9976)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (143-296)||(11822-11977)
[»] scaffold0113 (2 HSPs)
scaffold0113 (116-300)||(34194-34377)
scaffold0113 (255-300)||(34095-34139)
[»] scaffold1815 (2 HSPs)
scaffold1815 (134-232)||(961-1058)
scaffold1815 (118-300)||(936-1113)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (250-300)||(8278-8328)
[»] scaffold0231 (3 HSPs)
scaffold0231 (116-235)||(18753-18874)
scaffold0231 (137-231)||(18856-18952)
scaffold0231 (165-300)||(18846-18978)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (116-192)||(20980-21059)
scaffold0251 (173-234)||(20999-21059)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (172-233)||(692-753)
scaffold0188 (217-296)||(695-773)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (207-300)||(38200-38293)
scaffold0139 (117-235)||(38223-38341)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (116-235)||(106112-106232)
scaffold0006 (254-300)||(106089-106135)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (217-300)||(8658-8742)
scaffold0347 (137-235)||(8681-8780)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (217-296)||(15475-15555)
scaffold0106 (134-235)||(19874-19976)
scaffold0106 (217-298)||(19915-19997)
scaffold0106 (171-235)||(15471-15536)
[»] scaffold1633 (2 HSPs)
scaffold1633 (172-235)||(152-215)
scaffold1633 (217-300)||(130-212)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (171-296)||(6361-6488)
[»] scaffold0371 (7 HSPs)
scaffold0371 (217-300)||(2759-2841)
scaffold0371 (172-235)||(2781-2844)
scaffold0371 (175-235)||(2846-2906)
scaffold0371 (249-300)||(14500-14550)
scaffold0371 (259-300)||(11400-11440)
scaffold0371 (116-157)||(16656-16697)
scaffold0371 (171-235)||(16572-16635)
[»] scaffold0064 (3 HSPs)
scaffold0064 (217-300)||(57676-57758)
scaffold0064 (172-235)||(57698-57761)
scaffold0064 (116-157)||(57804-57845)
[»] scaffold0047 (4 HSPs)
scaffold0047 (172-235)||(77984-78047)
scaffold0047 (217-300)||(77962-78044)
scaffold0047 (116-157)||(78090-78131)
scaffold0047 (254-300)||(22048-22094)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (254-300)||(7338-7384)
scaffold0278 (256-296)||(5417-5457)
scaffold0278 (259-300)||(10785-10826)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (250-300)||(44242-44291)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (217-298)||(17185-17267)
scaffold0046 (217-298)||(26334-26416)
scaffold0046 (135-235)||(17145-17246)
scaffold0046 (135-235)||(26294-26395)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (250-300)||(106179-106228)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (254-300)||(116215-116261)
scaffold0022 (135-235)||(44394-44494)
scaffold0022 (172-235)||(78115-78178)
scaffold0022 (254-298)||(129239-129283)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (137-297)||(3607-3767)
[»] scaffold0063 (2 HSPs)
scaffold0063 (116-296)||(61658-61838)
scaffold0063 (207-300)||(73027-73119)
[»] scaffold1792 (1 HSPs)
scaffold1792 (220-300)||(10-89)
[»] scaffold0230 (2 HSPs)
scaffold0230 (220-300)||(23811-23890)
scaffold0230 (220-300)||(20881-20960)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (116-235)||(19114-19233)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (137-296)||(30096-30258)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (173-296)||(16536-16661)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (261-296)||(33259-33294)
scaffold0120 (261-296)||(45711-45746)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (172-235)||(41280-41343)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (116-196)||(113615-113697)
scaffold0037 (259-296)||(22981-23018)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (250-300)||(2659-2708)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (116-194)||(18092-18173)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (254-300)||(2445-2491)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (254-300)||(5001-5047)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (259-300)||(6539-6580)
scaffold0420 (259-300)||(13993-14034)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (217-298)||(24879-24960)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (255-300)||(145686-145731)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (259-296)||(40405-40442)
scaffold0023 (171-296)||(44213-44340)
scaffold0023 (259-296)||(100123-100160)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (116-169)||(221378-221431)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (217-300)||(4865-4949)
[»] scaffold0505 (2 HSPs)
scaffold0505 (116-193)||(1680-1759)
scaffold0505 (116-161)||(3725-3770)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (217-300)||(2468-2552)
scaffold0357 (172-237)||(16329-16394)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (116-156)||(15461-15501)
scaffold0207 (259-298)||(15482-15521)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (217-296)||(1521-1601)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (264-296)||(15016-15048)
[»] scaffold1256 (2 HSPs)
scaffold1256 (176-235)||(369-428)
scaffold1256 (218-296)||(369-446)
[»] scaffold1186 (2 HSPs)
scaffold1186 (249-300)||(559-609)
scaffold1186 (116-194)||(580-660)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (217-296)||(1308-1387)
[»] scaffold0520 (1 HSPs)
scaffold0520 (245-296)||(510-560)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (261-296)||(3632-3667)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (261-296)||(21868-21903)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (217-296)||(27981-28060)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (261-296)||(37128-37163)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (261-296)||(27658-27693)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (257-296)||(20114-20153)
scaffold0080 (172-235)||(59644-59707)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (261-296)||(77649-77684)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (217-296)||(32306-32385)
scaffold0034 (261-300)||(116691-116730)
scaffold0034 (135-235)||(32325-32425)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (217-296)||(136653-136732)
scaffold0021 (135-235)||(136613-136713)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (266-296)||(1744-1774)
[»] scaffold0100 (3 HSPs)
scaffold0100 (214-296)||(24150-24232)
scaffold0100 (247-296)||(10304-10352)
scaffold0100 (247-296)||(27758-27806)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (116-194)||(57689-57766)
[»] scaffold0645 (2 HSPs)
scaffold0645 (116-194)||(141-221)
scaffold0645 (249-298)||(192-240)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (259-296)||(4661-4697)
scaffold0628 (259-296)||(9221-9257)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (259-296)||(1888-1925)
scaffold0621 (259-296)||(6305-6342)
[»] scaffold0556 (1 HSPs)
scaffold0556 (259-296)||(6591-6628)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (259-296)||(12711-12748)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (247-296)||(1696-1744)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (172-237)||(14087-14151)
[»] scaffold0017 (2 HSPs)
scaffold0017 (116-157)||(25655-25696)
scaffold0017 (171-235)||(25571-25634)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (264-296)||(12534-12566)
[»] scaffold0453 (1 HSPs)
scaffold0453 (264-300)||(2174-2210)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (264-296)||(12341-12373)
[»] scaffold0048 (1 HSPs)
scaffold0048 (137-196)||(56016-56078)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 111; Significance: 5e-56; HSPs: 166)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Original strand, 19884508 - 19884638
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggctt 269  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19884508 tttacgttgagggcttaatgccctgtcggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggctt 19884607  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19884608 gatgcctttgattggtaccacatgcatgatt 19884638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 35065549 - 35065668
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  35065549 agtccatgcatactcatttacgttgagggcctgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 35065648  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35065649 cgttgagggcttgatgccct 35065668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 2842421 - 2842540
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2842421 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 2842520  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||||||||||||||||||    
T  2842521 tgttgagggcttgatgccct 2842540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44269612 - 44269494
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44269612 agtccatgcatactcatttacgttgagggctttatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 44269513  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  44269512 tgttg-gggcttgatgccct 44269494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11258522 - 11258405
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  11258522 agtccatgcatactcatttacgttgaaggcttgatgctctgtgaacttttgctctttaagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaata 11258423  T
Q  216 cgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11258422 cgttgagggcttgatgcc 11258405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 118 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 35353652 - 35353537
Alignment:
Q  118 tccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  35353652 tccatgcatactcatttacgttgatgacttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaatacg 35353553  T
Q  218 ttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||||||    
T  35353552 ttgaggacttgatgcc 35353537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 35065647 - 35065750
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35065647 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 35065746  T
Q  234 ctag 237  Q
    ||||    
T  35065747 ctag 35065750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37427655 - 37427537
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  37427655 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagtttagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-tta 37427557  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||||||||||||||||||    
T  37427556 tgttgagggcttgatgccct 37427537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 19569279 - 19569460
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  ||||| |||    
T  19569279 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctata 19569376  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||| |  |||| | ||||| ||| ||| |||| |||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||    
T  19569377 agttgagggcttgatgccatgtgagtataattatactctataagttgagggcttgatgctctgg-ttggtgccacatgcatgatt 19569460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 45531576 - 45531760
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || | || ||| ||    
T  45531576 agtccatgcatactcattggaagttgagggcttgatgccctatgagcttctgctctttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataataatactctat 45531675  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45531676 atgttgagggcttgatgccttgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 45531760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20417170 - 20417055
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| |||    
T  20417170 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttg-tgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctata 20417072  T
Q  216 cgttgagggcttgatgc 232  Q
     ||||||||||||||||    
T  20417071 tgttgagggcttgatgc 20417055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 14153424 - 14153543
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  14153424 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 14153522  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  14153523 atgttgagggcttgatgccct 14153543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 2842560 - 2842643
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2842560 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgatt 2842643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Original strand, 43889979 - 43890161
Alignment:
Q  119 ccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tac 216  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| || | || |||| |||||||| ||     
T  43889979 ccatacatactcatttaagttgggggcttgatgccctga-agcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttgggagtatattaatgctcaaataa 43890077  T
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  43890078 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgatt 43890161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Original strand, 18700671 - 18700851
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgt 218  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   |  |||||| |||||||||||  | || |||| |||||||| || ||    
T  18700671 catgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacacattgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaataagt 18700769  T
Q  219 tgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18700770 tgaggtcttgatgccctgggagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 18700851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Original strand, 2842522 - 2842618
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  2842522 gttgagggcttgatgccctttgagtttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 2842618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 14642510 - 14642688
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  14642510 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctc-tt 14642603  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14642604 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 14642688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 46752001 - 46751882
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  46752001 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 46751903  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||| ||||||||||    
T  46751902 atgttgagggtttgatgccct 46751882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 35065688 - 35065771
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  35065688 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 35065771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37037910 - 37037794
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  37037910 agtccatgcataatcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 37037812  T
Q  215 acgttgagggcttgatgc 232  Q
    | ||||||||||||||||    
T  37037811 atgttgagggcttgatgc 37037794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11258424 - 11258325
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  11258424 tacgttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctttaagtttagggcttgatgccatgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggtttgatgcc 11258325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 12512834 - 12512936
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||  | || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  12512834 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagctttttctctttaagttgagggcttgatgccctgtgattataattatactctatatgttgagggcttgatgc 12512933  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  12512934 cct 12512936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 17207232 - 17207051
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||  ||||    
T  17207232 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgaggacttgatgccatgtgagcctattt--gctc 17207135  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
     ||| |||  ||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17207134 tataagtttggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 17207051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 35353556 - 35353458
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  35353556 tacgttgaggacttgatgccatgtgagcttttgctctttaagttgacggcttgatgccctgggagtgtatgtatgctcaatatgttgggggcttgatgc 35353458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16044465 - 16044281
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||  ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||  |||||     
T  16044465 agtccatgcgtacccatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctactaagttgaggggttgatgccctgtgagcctatt--tgctct 16044368  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||| |  ||||| || |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  16044367 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgttctatatgttgagggcttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgatt 16044281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Original strand, 42327333 - 42327433
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  42327333 tttacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatg 42327432  T
Q  232 c 232  Q
    |    
T  42327433 c 42327433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 50349057 - 50349176
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||| || ||||||||||||||  |    
T  50349057 agtccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggctagatgccctatgagtgtatttatgctcttt 50349155  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  50349156 atgttgagggcttgatgccct 50349176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35353515 - 35353432
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35353515 gttgacggcttgatgccctgggagtgtatgtatgctcaatatgttgggggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgatt 35353432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44269553 - 44269471
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44269553 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgtt-ggggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgatt 44269471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6158434 - 6158333
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  6158434 ttacgttgagggcttgatgttctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttaagggcttgatgc 6158336  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  6158335 cct 6158333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14441263 - 14441171
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14441263 tgctcaataagttgagggtttgatgccct-gaagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgtatgatt 14441171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16059324 - 16059140
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||  |||||||||| |||||||||||||| |  |||||  |||      
T  16059324 agtccatgtgtacccatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctactaagttgagggcttgatgccctgtgagcctattt--gctat 16059227  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||| |||| |||||||||||  |||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16059226 ttacgtcgaggacttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 16059140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Original strand, 22307654 - 22307778
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgc 274  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||   |  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22307654 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgaacatatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 22307753  T
Q  275 cttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||| ||| ||||||||||||||||    
T  22307754 cctgg-ttgataccacatgcatgatt 22307778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11192048 - 11191865
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| || |||||||||| ||| |  ||||  | ||  |    
T  11192048 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgcccggtgagcctatt--ttcttta 11191951  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||   |||||||||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  11191950 taagtttgaggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtactacatgcatgatt 11191865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Original strand, 42327282 - 42327458
Alignment:
Q  120 catgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgt 218  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |     || |||||  || ||    
T  42327282 catgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgctctgtgag----cttttgctctttaagt 42327377  T
Q  219 tgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||| ||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||    
T  42327378 tgagggcttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatg-ctctgattggtaccacatacatgatt 42327458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6158489 - 6158311
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||| |     || |||||  |    
T  6158489 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgtcgtgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgttctgtgagc----ttttgctct-t 6158396  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  6158395 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttaagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 6158311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15565525 - 15565436
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15565525 tgctcaacacgttaagggcttgatgccct----gtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccatggattggtgccacatgcatgatt 15565436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36166517 - 36166351
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| ||||||   | |||||||||||||||||    
T  36166517 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgcc 36166419  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36166418 ctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 36166351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11258379 - 11258301
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11258379 agggcttgatgccatgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggtttgatgccatgg-ttggtaccacatgcatgatt 11258301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 295
Target Start/End: Original strand, 12512779 - 12512953
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |     || | |||  |    
T  12512779 agtccatgcatactcattttaagttgagggattgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag----ctttttctcttt 12512873  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgca 295  Q
    | |||||||||||||||||||  || | | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  12512874 aagttgagggcttgatgccctgtgattataattatactctatatgttgagggcttgatgccct-gtttggtaccacatgca 12512953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 16283053 - 16283214
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || |||||||||||| |||||    
T  16283053 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgttgccc 16283151  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16283152 tgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 16283214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 17693118 - 17693041
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17693118 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttgtgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 17693041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Original strand, 50349113 - 50349198
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  50349113 tacgttgagggctagatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 50349198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16049941 - 16049757
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||| ||| ||| |  |||||||  |||||||||| |||||||||| ||| |  |||||   |||     
T  16049941 agtccatgcgtacccatttaagttgagggcttcatgccttgtaagcctatttgctctactaagttgagggcttgatgccccgtgagcctatttt--ctct 16049844  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||||||||  |||| |  |||| ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16049843 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttattctatatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 16049757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14441292 - 14441194
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14441292 acgttgagggcttgatgcgctg-gagcctttgctcaataagttgagggtttgatgccctgaag-tgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccc 14441195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15206788 - 15206704
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15206788 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 15206704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15245870 - 15245786
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15245870 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 15245786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16728381 - 16728201
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||| |     || |||||  |    
T  16728381 agtccatgcatactcattcaaagttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgcgttgtgag----cttttgctcttt 16728286  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |  ||||||| ||||||||||  |||| | ||||| |||  ||| ||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16728285 aatttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctttattttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 16728201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Original strand, 19884492 - 19884613
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccct----gtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||   || |||||  || ||||||| |||||||||||  | ||||  ||||||||    
T  19884492 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtcggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctc 19884591  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||| |||| ||||||||||||    
T  19884592 aatatgttgggggcttgatgcc 19884613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21618329 - 21618245
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618329 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 21618245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24545679 - 24545558
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| || |   ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  24545679 taagttaagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctatga-tcctatt-tgctctataagttgggggcttga 24545582  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  24545581 tgccct-gattggtaccacatgcat 24545558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 8898980 - 8898853
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||    
T  8898980 ttaagttgagggcttgatgctctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggct 8898881  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8898880 tgatgccctggattggtaccacatgcat 8898853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 14153483 - 14153565
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14153483 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 14153565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17538136 - 17538006
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgg-gtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggct 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| |  | || |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||    
T  17538136 tttaagttgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggct 17538037  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17538036 tgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17538006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Original strand, 2842480 - 2842538
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2842480 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgcc 2842538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 17446896 - 17447057
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||  | |  | |||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  17446896 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcccttggagcctttttacgctcaaataagttgagggattgatgccc 17446994  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17446995 tgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 17447057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Original strand, 29172826 - 29172991
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  29172826 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacactcaaataagttgagggcttgatgccc 29172924  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||  |  ||| | ||||  | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  29172925 tgggagcctatttacgttcaaacacgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 29172991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 46751945 - 46751860
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46751945 tacgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 46751860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15565571 - 15565461
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||   | ||| ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||    
T  15565571 agtccatgcatac--atttaagttaagggcttgatgccctg-gagcttttgctcaacacgttaagggcttgatgccctgtg----tatttatgctcaata 15565479  T
Q  216 cgttgagggcttgatgcc 233  Q
     |||||||||||||||||    
T  15565478 tgttgagggcttgatgcc 15565461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17693173 - 17693093
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  17693173 agtccatgcacactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtg 17693093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10562634 - 10562550
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10562634 gttgagggcttgatgccttgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 10562550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Original strand, 11886633 - 11886790
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| || |||||| |||| || |  ||||  | |||  ||    
T  11886633 agtccatgcatactcatatatgttgagggcttgatgccatgtgagcatttgctcttcacgttgtgggcttgataccctatgagcctatt--ttctcttta 11886730  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
     ||||||||||||||||  |  |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  11886731 agttgagggcttgatgctatgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgcc 11886790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Original strand, 11886774 - 11886934
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcccta 236  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| || |||||| |||| || |  |||||   |||  || ||||||||||||||||  |     
T  11886774 gttgagggcttgatgccatgtgagcatttgctcttcacgttgtgggcttgataccctatgagcctatttt--ctctttaagttgagggcttgatgctatg 11886871  T
Q  237 ggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11886872 tgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 11886934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13919219 - 13919135
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| ||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919219 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaatacattgagggcttaatgccttggattggtaccacatgcatgatt 13919135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15264991 - 15264907
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |  | |||||||| || |||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15264991 gttgagggcttgatgccctaagagtatattaatgctcaaataagttgagggattgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 15264907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5214876 - 5214794
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5214876 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgttcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 5214794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 10542957 - 10542996
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542957 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 10542996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13919278 - 13919160
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| ||    
T  13919278 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagccttttctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaa 13919180  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||| |||||||||| |||||    
T  13919179 tacattgagggcttaatgcc 13919160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 17548606 - 17548669
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17548606 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 17548669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20417112 - 20417030
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  20417112 gttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20417030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37037851 - 37037769
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  37037851 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 37037769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40806954 - 40806872
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40806954 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 40806872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40806957 - 40806894
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40806957 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 40806894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 41173410 - 41173473
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41173410 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 41173473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 41173413 - 41173495
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  41173413 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 41173495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6146072 - 6145940
Alignment:
Q  163 tttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttg 262  Q
    |||||||| ||  ||||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||  |||| |  |||||||| | | ||||    
T  6146072 tttgctctatatattgaggggttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgaggacttgatgccctttgagtatatttatgctcta-aagttg 6145974  T
Q  263 ggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    |||||||||| || |  ||||||||||||||||||    
T  6145973 ggggcttgatcccct-aattggtaccacatgcatg 6145940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 14507865 - 14507803
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14507865 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccc 14507803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15245910 - 15245809
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15245910 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 15245812  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  15245811 cct 15245809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 17259195 - 17259277
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgag-ct-tttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||||| || ||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  17259195 agtccatgcatactcatttaaattgagggcttgatgccatgtgagactattttctctataagttgagggcttgatgccctgtg 17259277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Original strand, 35065608 - 35065666
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  35065608 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 35065666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 35353595 - 35353537
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| || |||||||||    
T  35353595 gttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaatacgttgaggacttgatgcc 35353537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12269243 - 12269198
Alignment:
Q  255 atatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12269243 atatgttgggggcttcatgccctggattggtaccacatgcatgatt 12269198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 42353620 - 42353661
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42353620 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 42353661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Original strand, 15932545 - 15932605
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  15932545 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 15932605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 24153445 - 24153525
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  24153445 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctgcattggtaccacatgcat 24153525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 32404419 - 32404503
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |  | |||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32404419 gttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaaataagtttagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 32404503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 222 - 298
Target Start/End: Original strand, 54331444 - 54331519
Alignment:
Q  222 gggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  54331444 gggcttgatgccctgtgagtataattatgctctatatgttgggggattgatgccctgg-ttggtaccagatgcatga 54331519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 10562749 - 10562698
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgat 188  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10562749 gttgagggattgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgat 10562698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 229 - 300
Target Start/End: Original strand, 12506747 - 12506817
Alignment:
Q  229 atgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12506747 atgccctatgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 12506817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 13031823 - 13031901
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13031823 agggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccttgg-ttggttccacatgcatgatt 13031901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14507862 - 14507780
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  14507862 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccccgg-ttggtaccacatgcatgatt 14507780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 15932548 - 15932630
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  15932548 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 15932630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 17520061 - 17520124
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17520061 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 17520124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 17520064 - 17520146
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17520064 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17520146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 17534858 - 17534921
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17534858 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 17534921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 17534861 - 17534943
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17534861 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17534943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 30175605 - 30175668
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30175605 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 30175668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 30175608 - 30175690
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30175608 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 30175690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40811769 - 40811687
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40811769 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 40811687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40811772 - 40811709
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40811772 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 40811709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9577520 - 9577474
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9577520 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 9577474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15206828 - 15206727
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15206828 acgttgggggcttgatgctctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 15206730  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  15206729 cct 15206727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17044021 - 17043972
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17044021 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17043972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17538150 - 17538028
Alignment:
Q  118 tccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtga-----gcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |       || | |   ||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||    
T  17538150 tccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctca 17538051  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  17538050 atacgttgggggcttgatgccct 17538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 23318942 - 23319043
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgc-tcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || | | |||||||||||||||||||||    
T  23318942 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatacgttgagggcttgatgc 23319040  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  23319041 cct 23319043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 316069 - 315889
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat- 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||   | |||| || ||||||||||||   | |  |||  |||||||     
T  316069 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcttttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg---gagccttt--gctcaatt 315976  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||| | | ||| |  | || ||||| || |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  315975 aagttgagggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaataagttgagggcttgatgccctggattagtaccacatgcatgatt 315889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 1209082 - 1209130
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1209082 tatgctctataagttgggggcttgatgcctt-gattggtaccacatgcat 1209130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5214963 - 5214922
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5214963 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 5214922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 154 - 235
Target Start/End: Original strand, 12506714 - 12506795
Alignment:
Q  154 ctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||  ||| ||||||| || || || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  12506714 ctgtgagcttttgcattttaagttgagaccttcatgccctatgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccct 12506795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Original strand, 13031816 - 13031877
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  13031816 taagttaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgcc 13031877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14507949 - 14507908
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14507949 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 14507908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 14519452 - 14519407
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc 161  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  14519452 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagc 14519407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17044141 - 17044100
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17044141 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 17044100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 17519912 - 17519953
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17519912 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 17519953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 17534774 - 17534815
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17534774 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 17534815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40807041 - 40807000
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40807041 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 40807000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 40811856 - 40811815
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  40811856 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 40811815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42386311 - 42386211
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  42386311 acgttgagggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgcc 42386213  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  42386212 ct 42386211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Original strand, 1465868 - 1465915
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  1465868 gctcaataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatga 1465915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12377764 - 12377728
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12377764 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 12377728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 13026707 - 13026767
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13026707 gttgagggcttgatgccttgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 13026767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 24153407 - 24153506
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24153407 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccc 24153505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 54331376 - 54331499
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacg-ttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||| ||||||||||||| |  ||||| | |||||| | || |||||||||||||| || || ||||||||    
T  54331376 agtccatgcatactcatctaaacttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctatattaagtagggggcttgatgccctgtgagtataattatgctc 54331475  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
     ||| |||| ||| ||||||||||    
T  54331476 tatatgttgggggattgatgccct 54331499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 5206694 - 5206757
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  5206694 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgatgggggcttgatgccct 5206757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 5206697 - 5206779
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5206697 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgatgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 5206779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5214879 - 5214816
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| | |||||| |||| ||||||||||||||    
T  5214879 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgttcaatatgttgggggcttgatgccct 5214816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 9577574 - 9577496
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||  ||| |||||||   |||||||||| ||||||||||||    
T  9577574 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 9577496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15017643 - 15017592
Alignment:
Q  184 ttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  15017643 ttgatgccatgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 15017592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17044057 - 17043994
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17044057 taagttgagggtttgattccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 17043994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 17519996 - 17520059
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17519996 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgcttaatacgttgagagcttgatgccct 17520059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 17548609 - 17548687
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||    
T  17548609 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtgccacatgcat 17548687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 18438349 - 18438314
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18438349 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 18438314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 157
Target Start/End: Original strand, 31224917 - 31224952
Alignment:
Q  122 tgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31224917 tgcatactcatttaagttgagggcttaatgccctgt 31224952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 145 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41123802 - 41123651
Alignment:
Q  145 cttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtg 242  Q
    |||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||  | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||      
T  41123802 cttaatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctaggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagcc 41123704  T
Q  243 tgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |  ||| |||||| || ||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41123703 tatttacgctcaaatacgttggg--cttgatgccctggattggtaccacatgcat 41123651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43925811 - 43925729
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43925811 gttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcct-ggattggtaccacatgcatgatt 43925729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 6155735 - 6155693
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtg 158  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  6155735 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtg 6155693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11258463 - 11258405
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  11258463 gttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 11258405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14519393 - 14519331
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||| |||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  14519393 tacgttgggggctcgatgccctgagagcttatgctctataagttgggggcttgatgccctgtg 14519331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15017623 - 15017570
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15017623 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 15017570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 23319020 - 23319066
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23319020 aatacgttgagggcttgatgccctggattgataccacatgcatgatt 23319066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 146
Target Start/End: Original strand, 41173326 - 41173356
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggct 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41173326 agtccatgcatactcatttacgttgagggct 41173356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 323943 - 323851
Alignment:
Q  142 gggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| |||||||||| ||||||    
T  323943 gggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggctggatgcc 323851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 5206610 - 5206647
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5206610 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 5206647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 240
Target Start/End: Original strand, 9707849 - 9707953
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat-acgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9707849 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaataaagttgagggcttgatgccc 9707947  T
Q  235 taggag 240  Q
    | ||||    
T  9707948 tgggag 9707953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10562638 - 10562573
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | || |||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10562638 ttaagttgagggcttgatgccttgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 10562573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 10901479 - 10901516
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10901479 gttgtgggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 10901516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 11562503 - 11562455
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  11562503 tgctctataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatga 11562455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 11562554 - 11562474
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  11562554 agtccgtgcatactcattaaagtgtagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctg 11562474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 12174561 - 12174598
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12174561 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12174598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14234288 - 14234251
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14234288 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 14234251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 15448038 - 15448102
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15448038 taagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctta-tacgttgagggcttgatgccctag 15448102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 15932461 - 15932502
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15932461 agtcaatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 15932502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17669198 - 17669154
Alignment:
Q  255 atatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17669198 atatgttgggggcttgatgccctgg-ttggcaccacatgcatgatt 17669154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 22307590 - 22307631
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22307590 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgt 22307631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 30175521 - 30175562
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  30175521 agtccatgcttactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 30175562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Original strand, 32404368 - 32404480
Alignment:
Q  124 catactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttga 221  Q
    |||||||||| | |||| |||||| ||| |||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||| | || |||| |||||| |||| ||| |    
T  32404368 catactcattaaagttgggggcttgatgtcctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaaataagttta 32404466  T
Q  222 gggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||    
T  32404467 gggcttgatgccct 32404480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 37251437 - 37251474
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37251437 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 37251474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 38962214 - 38962251
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38962214 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 38962251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 50756447 - 50756495
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50756447 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 50756495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 52524040 - 52524077
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52524040 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 52524077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 53646974 - 53647014
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  53646974 gttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 53647014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12377870 - 12377751
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||| ||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |  || |||| || || ||     
T  12377870 agtctatgcatacttattcatgttgggggcttgatgcccta-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctataagtatattaatacttaaa 12377772  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  12377771 acgttcagggcttgatgccct 12377751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 298
Target Start/End: Original strand, 17259287 - 17259334
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  17259287 gctctataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatga 17259334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Original strand, 25476692 - 25476724
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25476692 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 25476724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 38962134 - 38962232
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat-acgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  38962134 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctatttacgctcaaacacgttgagggcttgatgccc 38962231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Original strand, 40214029 - 40214061
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40214029 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 40214061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 124)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11425037 - 11424922
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  11425037 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 11424938  T
Q  216 cgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  11424937 cgttgagggcttgatg 11424922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25090736 - 25090617
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25090736 agtccatgcatactcatttactttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctttttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 25090637  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  25090636 cgttgagggcttgattccct 25090617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42874882 - 42874763
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  42874882 agtccatggatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgacagtgtatttatgctcaata 42874783  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||| ||||    
T  42874782 cgttgagggcttgataccct 42874763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16997610 - 16997496
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  16997610 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctcaata 16997511  T
Q  216 cgttgagggcttgat 230  Q
    | |||| ||||||||    
T  16997510 cattgaaggcttgat 16997496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37018681 - 37018558
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggct----taatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |    | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||    
T  37018681 agtccatgcatactcatttacgttgagggatatattgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctc 37018582  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37018581 aatacgttgagggcttgatgccct 37018558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 132 - 300
Target Start/End: Original strand, 13036776 - 13036942
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  13036776 tttacgttgagggcttgatgttctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatg 13036874  T
Q  232 ccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13036875 ccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 13036942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 133 - 300
Target Start/End: Original strand, 33244200 - 33244369
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  33244200 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagagcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 33244298  T
Q  233 cctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttgg---attggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||||| |||   |||||||||||||||||||||    
T  33244299 cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggtttgatgccctggttaattggtaccacatgcatgatt 33244369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19734391 - 19734269
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  19734391 agtccatgcatactcattggaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 19734292  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  19734291 atgttgagggcttgatgccctag 19734269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9637910 - 9637791
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  9637910 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 9637812  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  9637811 atgttgagggcttgatgccct 9637791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 155 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14548714 - 14548573
Alignment:
Q  155 tgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctca 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    ||| | || ||||      
T  14548714 tgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatactcaatacgtggagggcttgatgccct----gtgagcttttgctgt 14548619  T
Q  255 atatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     || |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14548618 ttaagttgagggcttgatgccctggatgggtaccacatgcatgatt 14548573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 40906803 - 40906703
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  40906803 acgttgggggcttgatgccctgtgagctttttctctttaagttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaataagttgagggcttgacgccc 40906704  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  40906703 t 40906703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40229537 - 40229420
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||    
T  40229537 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttactctttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactctat 40229438  T
Q  215 acgttgagggcttgatgc 232  Q
    | ||||||||||||||||    
T  40229437 atgttgagggcttgatgc 40229420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16997471 - 16997388
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16997471 gttgagggcttgatgccctagaagtgtatttatgctcaatatgttaggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 16997388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21061618 - 21061436
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||  |    
T  21061618 agtccatgcatactcttttaaagttgaaggcttgatgtccggtgagcctttgctctttatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctcttt 21061521  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||| ||| | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21061520 aagttgagggtttgatgctctatgtgtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 21061436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27995799 - 27995698
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  27995799 ttacgttgagggcttgatcccctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 27995701  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  27995700 cct 27995698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25090638 - 25090538
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25090638 tacgttgagggcttgattccctgtgagcttttgctctttaagttgagg-gttgatcccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 25090540  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  25090539 ct 25090538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 15364957 - 15364854
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || | | ||||||||||||    
T  15364957 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgataagggcttgatgc 15364859  T
Q  233 cctag 237  Q
    |||||    
T  15364858 cctag 15364854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16042906 - 16042807
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||    
T  16042906 acgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-ttacattgagggtttgatgccc 16042808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 27995853 - 27995676
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| |     || |||||  ||    
T  27995853 agtccatgcatactcattgat-ttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgagggcttgatcccctgtgagc----ttttgctct-ta 27995760  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27995759 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 27995676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 53631551 - 53631727
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||   | ||||||| ||||||||||||   | |  |||  ||||||||    
T  53631551 agtccatgcatactcatttaagttgatggcttcatgcccta-gagcctttactcaacacgttgagggcttgatgccctg---gagccttt--gctcaata 53631644  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  53631645 agttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 53631727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20597 - 20433
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||  || |||||||||||||||    
T  20597 tttacgttgaggacttgatgccctgtgagccttttctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctc-ttaagttgagggcttgatg 20501  T
Q  232 ccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||    |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20500 ccacgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20651 - 20571
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20651 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccatgtgagcctttgctctttacgttgaggacttgatgccctgtg 20571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 125 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15608374 - 15608204
Alignment:
Q  125 atactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagg 223  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| |  |     | |||  || ||||| |    
T  15608374 atactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgctctgtgagcct-----ttctctttaagttgatg 15608280  T
Q  224 gcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15608279 gcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 15608204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15365011 - 15364834
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  15365011 agtccatgcatactcattga-gttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctc-tta 15364918  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||| |  |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  15364917 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgataagggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 15364834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16042963 - 16042784
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  16042963 agtccatgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctgtgagcgtttgctctacacgttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttta 16042868  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  |||| |  ||||||||  ||  ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16042867 tgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc-ttacattgagggtttgatgccctggattggtaccacatgcgtgatt 16042784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 51992560 - 51992457
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  51992560 tttacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatg 51992461  T
Q  232 ccct 235  Q
    ||||    
T  51992460 ccct 51992457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11424939 - 11424841
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| || || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11424939 tacgttgagggcttgatgtcatgtgagctttttctctttaagttgagggtttgataccttgggagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgc 11424841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16296535 - 16296435
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| |||    
T  16296535 tacgttgagggcttgatgatctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgcc 16296437  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  16296436 ct 16296435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 42874784 - 42874707
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  42874784 tacgttgagggcttgataccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctc 42874707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Original strand, 13592332 - 13592499
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat-acgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13592332 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttactcaattaagttgaggtcttgatgccctgggagtatattaatgctcaattaagttgagggcttgatgc 13592430  T
Q  233 cctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||| ||||| |  | || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13592431 cctgggagtatattaatactcaaatacgttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgcatgatt 13592499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19609285 - 19609157
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgc--tcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggctt 269  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |  ||| |||||||| ||||| |||||    
T  19609285 taagttgagggcttgatgccctgtgagtctatttacgcgctcaatacgttgagggcttgatgctctgtgagtttatttacgctcaatacgttggaggctt 19609186  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  19609185 gatgcct--ggttggtaccacatgcatgatt 19609157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 40906857 - 40906680
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaa-gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgt 218  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||    | |||| || |||||||||||||| |  | ||    |||  || ||    
T  40906857 catgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatgccctgtgagcttttt----ctctttaagt 40906762  T
Q  219 tgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40906761 tgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaataagttgagggcttgacgccctggattggtaccacatgcatgatt 40906680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50160102 - 50160022
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  50160102 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttgcgttgagggcttgatgccctgtg 50160022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 26045557 - 26045646
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26045557 aataagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 26045646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 26050738 - 26050827
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26050738 aataagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 26050827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19738189 - 19738110
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19738189 agtccatgcatactcattga-gttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgagggcttgatgccctgtg 19738110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51992615 - 51992435
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  51992615 agtccctgcatactcatttgaagttgagggattgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgctctgtgag----cttttgctcttt 51992520  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||| ||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| | | |||||| |||||||||||||    
T  51992519 aagttgagggtttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccct-gtttggtatcacatgcatgatt 51992435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 14650607 - 14650528
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14650607 tttacgttgggggcttgatgccctatgcgcttttgctctttaagttgaaggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 14650528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42874743 - 42874660
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  42874743 gttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcgatatattgggggattgatgtcatggattggtaccacatgcatgatt 42874660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 136 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 50160044 - 50159970
Alignment:
Q  136 cgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  50160044 cgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatcccctgtgagtgtatttatgctc 50159970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26444919 - 26444799
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgag-ct-tttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| || |||||||| || |||| || |||||||||||||| || |||||||| |  |    
T  26444919 agtccatgcatactcattaa-gttgagggcttgatgccctgtgagtctatttgctctatatgttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgtttta 26444821  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  26444820 tatgttgggggcttgatgccct 26444799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 134 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14548655 - 14548595
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14548655 tacgtggagggcttgatgccctgtgagcttttgctgtttaagttgagggcttgatgccctg 14548595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 15355606 - 15355690
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15355606 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 15355690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15791537 - 15791453
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15791537 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgatt 15791453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9637851 - 9637769
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9637851 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 9637769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Original strand, 9871528 - 9871602
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgc 190  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  9871528 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgc 9871602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Original strand, 13036722 - 13036876
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||  ||||| |     || |||||  |    
T  13036722 agtccatgcatactcgtttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgct-tttacgttgagggcttgatgttctgtgag----cttttgctc-tt 13036815  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  13036816 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgcc 13036876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 15042222 - 15042305
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15042222 gttgagggattgatgccctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttcatgccctggattggtaccacatgcatgatt 15042305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15112202 - 15112119
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15112202 gttgagggattgatgccctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggctttatgccctggattggtaccacatgcatgatt 15112119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 133 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19738135 - 19738073
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19738135 ttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgtg 19738073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25090597 - 25090519
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||    
T  25090597 gttgaggg-ttgatcccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcccttgattgataccacatgcat 25090519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26444903 - 26444778
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| |  ||||| |  ||||||||||||||||    
T  26444903 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagtctattt--gctctatatgttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgttttatatgttgggggcttg 26444806  T
Q  271 atgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  26444805 atgccctgg--ttgtaccacatgcatgatt 26444778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 32467274 - 32467356
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  32467274 gttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 32467356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Original strand, 33244145 - 33244299
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  33244145 agtccatgcatactcattcaaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctc-tt 33244238  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    | |||||| ||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  33244239 atgttgagagcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgcc 33244299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 35812531 - 35812614
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| |  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35812531 gttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 35812614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 26045521 - 26045623
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  26045521 acgttgggggcttgatgacctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgc 26045620  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  26045621 cct 26045623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 26050702 - 26050804
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  26050702 acgttgggggcttgatgtcctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgc 26050801  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  26050802 cct 26050804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 52312430 - 52312269
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || |||||||||||||||| |    
T  52312430 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgctc 52312332  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52312331 tgggagcctatttacgctcaaatacgttggggacttgatgccctggattggtaccacatgcat 52312269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 138 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16997508 - 16997411
Alignment:
Q  138 ttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||| ||||| || ||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||    
T  16997508 ttgaaggcttgattcccagtgaacttttgctatttaagttgagggcttgatgccctagaagtgtatttatgctcaatatgttaggggcttgatgccct 16997411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 19435786 - 19435878
Alignment:
Q  142 gggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| ||||  |||||||||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||    
T  19435786 gggcttgatgctatgtgagcttttgatctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttaatgccct 19435878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 46640627 - 46640747
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||  || |||| || || ||    
T  46640627 agtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatacttaa 46640725  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  46640726 tacgttgagggcttgatgccct 46640747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Original strand, 14853101 - 14853204
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  14853101 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 14853199  T
Q  233 cctag 237  Q
    |||||    
T  14853200 cctag 14853204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16296592 - 16296413
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||  |||||||||||||||| || ||||||| |||||||  ||||| |     || |||||  |    
T  16296592 agtccatgcatattcatttgaagttgagggcttggtgctttgtgagcttttgctctatacgttgagggcttgatgatctgtgagc----ttttgctct-t 16296498  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  16296497 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtacaacatgcatgatt 16296413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 10357488 - 10357551
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10357488 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 10357551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14280237 - 14280111
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggctt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||| | || |||||||||||    
T  14280237 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggctt 14280138  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14280137 gatgccctggattggtaccacatgcat 14280111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 19435818 - 19435900
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19435818 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttaatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19435900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19734331 - 19734249
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  19734331 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 19734249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37018579 - 37018477
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||| | |||||||||||| | || |||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  37018579 tacgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgaaggcttgatgccctgagagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatg 37018481  T
Q  232 ccct 235  Q
    ||||    
T  37018480 ccct 37018477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 37018618 - 37018555
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttgga 280  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||||    
T  37018618 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctgga 37018555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19857245 - 19857196
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19857245 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19857196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 361917 - 361869
Alignment:
Q  251 ctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  361917 ctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 361869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12622482 - 12622402
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  12622482 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctatacgttgggggcttgatgccctg 12622402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 14853045 - 14853225
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat- 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||   | |||| || ||||||||||||   | |  |||  |||||||     
T  14853045 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcttttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg---gagccttt--gctcaatt 14853138  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||    
T  14853139 aagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctagattggtacctcatacatgatt 14853225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 46642556 - 46642511
Alignment:
Q  255 atatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  46642556 atatgttgggggcttgatgtcatggattggtaccacatgcatgatt 46642511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 12549 - 12629
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12549 gttgggggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaatacgttgggggcttgattccttggattggtaccacatgcat 12629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 11424978 - 11424922
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11424978 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 11424922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44102133 - 44102053
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44102133 gttgagggcttgatgccctgagagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 44102053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11424898 - 11424816
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||| || | |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||    
T  11424898 gttgagggtttgataccttgggagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccgcatgcatgatt 11424816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20149753 - 20149627
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggctt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||   | ||||||| ||||||||||| ||||  |  ||| |||| | || |||||||||||    
T  20149753 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgaggacttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggctt 20149654  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20149653 gatgccctggattggtaccacatgcat 20149627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 272
Target Start/End: Complemental strand, 25090677 - 25090622
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgat 272  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  25090677 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgat 25090622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 35812528 - 35812591
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35812528 taagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 35812591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 53082422 - 53082505
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  53082422 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgatt 53082505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15099012 - 15098963
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15099012 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 15098963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Original strand, 19435731 - 19435785
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc 169  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19435731 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc 19435785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 297
Target Start/End: Original strand, 26922744 - 26922869
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttg 270  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||     || ||||| ||| ||||||||||||    
T  26922744 ttaagttgagggtttgatgccctgtgagcccttttatgctctataagttgggggcttgatgccctttgagcccttttgtgctctataagttgggggcttg 26922843  T
Q  271 atgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||    
T  26922844 atgccct-gattggtaccacatgcatg 26922869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 32467272 - 32467334
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  32467272 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccct 32467334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 10357447 - 10357488
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  10357447 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 10357488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12773899 - 12773862
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12773899 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12773862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13844296 - 13844239
Alignment:
Q  178 gaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13844296 gaggacttgatgctctgtgagcctatttaagctcaatacgttgggggcttgatgccct 13844239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Original strand, 16027043 - 16027088
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc 161  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  16027043 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagc 16027088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 18215551 - 18215678
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggc 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||  |||||   | ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || | |||||||    
T  18215551 ttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttaccctcaaataaagttgagggcttgatgccct-ggagcctatttacgctcaaatacgatgggggc 18215649  T
Q  268 ttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18215650 ttgatgccctggattggtaccacatgcat 18215678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 54798987 - 54799115
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggc 267  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| ||||||   | |||||||| |||||||||| ||||  |  ||| |||||| || |||||||||    
T  54798987 ttaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggc 54799086  T
Q  268 ttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||    
T  54799087 ttgatgccctgcattggtaccacatgcat 54799115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 10357575 - 10357635
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10357575 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 10357635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15791577 - 15791478
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15791577 acgttgggggcttgatgctctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 15791479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37018538 - 37018454
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| |||||||||||||  |||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  37018538 gttgaaggcttgatgccctgagagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaacacatgcatgatt 37018454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 10357575 - 10357657
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  10357575 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccatatgcatgatt 10357657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 12288480 - 12288559
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12288480 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12288559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14038517 - 14038482
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14038517 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 14038482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14629724 - 14629674
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14629724 tgctctataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 14629674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 15791722 - 15791648
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgc 190  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  15791722 agtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 15791648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 118 - 157
Target Start/End: Original strand, 35812446 - 35812485
Alignment:
Q  118 tccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  35812446 tccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 35812485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 43198821 - 43198900
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43198821 gttgaggacttgatgccctagaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 43198900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 46640687 - 46640770
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  46640687 gttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgatt 46640770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13844266 - 13844217
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||    
T  13844266 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-tttgtaccacatgcatgatt 13844217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14825284 - 14825238
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14825284 aataagttgagggcttgatgccctgcattggtaccacatgcatgatt 14825238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Original strand, 15355568 - 15355669
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||| |||| |||| |||||||||||||    
T  15355568 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggcttgatgccc 15355666  T
Q  235 tag 237  Q
    |||    
T  15355667 tag 15355669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17333092 - 17333046
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17333092 aatacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 17333046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19736459 - 19736406
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19736459 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19736406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Original strand, 39706560 - 39706642
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  39706560 tacgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 39706642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 296
Target Start/End: Original strand, 52873565 - 52873603
Alignment:
Q  258 tgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  52873565 tgttgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcat 52873603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Original strand, 53082382 - 53082479
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| ||||||||  |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || |||||||||||||||||||||    
T  53082382 acgttgggggcttgatgccctga-agctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgc 53082479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3484942 - 3484898
Alignment:
Q  255 atatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3484942 atatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 3484898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14629775 - 14629695
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  14629775 agtccatgcacactcattatagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctg 14629695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 15042135 - 15042172
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15042135 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 15042172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15112289 - 15112252
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  15112289 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 15112252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19609369 - 19609328
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||    
T  19609369 agtccatgcatactcatttaagttgaggacttgatgccctgt 19609328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19736473 - 19736428
Alignment:
Q  190 ccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  19736473 ccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 19736428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 32307223 - 32307264
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32307223 gttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatt 32307264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 160
Target Start/End: Original strand, 32467252 - 32467297
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgag 160  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  32467252 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgag 32467297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Original strand, 46225561 - 46225640
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||   |||||||| || |||| || ||||||||||||    
T  46225561 agtccatgcatactca-ttaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctatacgttgggggcttgatgccctg 46225640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 52243507 - 52243544
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52243507 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 52243544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 55582251 - 55582203
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  55582251 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 55582203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14157700 - 14157624
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | || || | || |||||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  14157700 gttgagggcttgatgccctagaagtatattaatacttattacgttgggggcttgatgccccggattgataccacatg 14157624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 16997551 - 16997511
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaata 257  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  16997551 gttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctcaata 16997511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 113)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 4596814 - 4596933
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  4596814 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaata 4596913  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4596914 cgttgagggcttgatgccct 4596933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20241912 - 20241797
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20241912 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttactctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 20241813  T
Q  216 cgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  20241812 cgttgagggcttgatg 20241797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 16059283 - 16059398
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16059283 agtccatgcatactcatttacgttgagggcatgatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 16059382  T
Q  216 cgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  16059383 cgttgagggcttgatg 16059398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 42912133 - 42912015
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||| ||||    
T  42912133 agtccatgcgtactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctcattaagttgagggcttgatgccctg-gagtttatttatgcttaata 42912035  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  42912034 cgttgagggcttgatgccct 42912015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19675834 - 19675717
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  || | ||||||||||||||||    
T  19675834 agtccatgcatactcatttacgttgagggtttgattccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccc--tgagagtatttatgctcaata 19675737  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19675736 cgttgagggcttgatgccct 19675717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51476068 - 51475951
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||  ||    
T  51476068 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactcttta 51475969  T
Q  216 cgttgagggcttgatgcc 233  Q
     |||||||||||||||||    
T  51475968 tgttgagggcttgatgcc 51475951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42912036 - 42911933
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||    
T  42912036 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggtttgatgcc 42911937  T
Q  234 ctag 237  Q
    ||||    
T  42911936 ctag 42911933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42696812 - 42696631
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||  ||    
T  42696812 agtccatgcatactcatatatgttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctcttta 42696715  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||| | |  |||| | ||||| ||| | |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42696714 agttgagggcttgatgtcgtgtgagtataattatactctacatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 42696631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19675738 - 19675639
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19675738 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 19675639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 16059381 - 16059482
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  16059381 tacgttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgagagtgtatttttgctcaatatgttgggggcttgatgcc 16059480  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  16059481 ct 16059482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 8276951 - 8277067
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  8276951 agtccacgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 8277050  T
Q  215 acgttgagggcttgatg 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  8277051 atgttgagggcttgatg 8277067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19675697 - 19675614
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19675697 gttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 19675614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20241814 - 20241713
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||  || |||||||||    
T  20241814 tacgttgagggcttgatgtcctgtgagctttttctctttaagttgaggacttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttagggacttgatgcc 20241715  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  20241714 ct 20241713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22349689 - 22349509
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |     || |||||  |    
T  22349689 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgaagccctgtgag----cttttgctcttt 22349594  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||  |  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  22349593 aagttgagggcttgatgctttgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccaaatgcatgatt 22349509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 431672 - 431518
Alignment:
Q  143 ggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggag 240  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||| || ||||||||||||||||||| ||||    
T  431672 ggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggag 431574  T
Q  241 tgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
      |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  431573 cctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 431518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 4596912 - 4597013
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || | ||||| ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  4596912 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgctttgggagtgtacttatgcttaatatgttgggggcttgatgcc 4597011  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  4597012 ct 4597013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20316349 - 20316183
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||| | || |||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  20316349 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 20316251  T
Q  233 cctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | | ||||  |  ||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20316250 cttgggagcctatttacgctcaatacgttgggggtttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 20316183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42911995 - 42911912
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42911995 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggtttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 42911912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 45754548 - 45754368
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||  ||    
T  45754548 agtccatgcatactcataaaagttgagggcttgatgtcctatgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctcttta 45754451  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||| |  |||| | ||||| ||| ||||||| | ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45754450 agttgagggcttgatgccatgtgagtataattatactctatatgtt-gaggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 45754368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 21240193 - 21240376
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||| ||||  |||| |  |||||  |||| |    
T  21240193 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgtcctatgagcctatttgctctataagttgaggactttatgctatgtgagcctattt--gctcta 21240290  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||  ||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  21240291 tacgttaggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttggggacttgatgtcgtgg-ttggtaccacatgcatgatt 21240376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 16059422 - 16059505
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16059422 gttgagggcttgatgccctgagagtgtatttttgctcaatatgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgatt 16059505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 17904020 - 17904196
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| |      ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||  |||| ||    
T  17904020 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctgtgagcttat------taagttgagggtttgatgccctgtgagcctattt--gctctat 17904111  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||| ||| ||||||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17904112 aagttgggggattgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17904196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20241773 - 20241690
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20241773 gttgaggacttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttagggacttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 20241690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48520227 - 48520061
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  48520227 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 48520129  T
Q  233 cctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     || ||||| |  ||| |||||||| ||||| || || ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  48520128 tctgggagtctatttacgctcaatacgttggaggtttaatgctctggattggtaccacatgcatgatt 48520061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 21043545 - 21043634
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21043545 aataagttgggggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 21043634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35088478 - 35088351
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  35088478 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaaaacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttga 35088379  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35088378 cgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 35088351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 4596953 - 4597036
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||  | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4596953 gttgagggcttgatgctttgggagtgtacttatgcttaatatgttgggggcttgatgccctggattgataccacatgcatgatt 4597036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23967665 - 23967547
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||   | ||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||||    
T  23967665 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg-gagcttttgctcaacacgttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaata 23967567  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | ||| | ||||||||||||    
T  23967566 ccttgggagcttgatgccct 23967547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 38057666 - 38057767
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||| | |||||||    
T  38057666 ttacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagagtttgatgc 38057764  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  38057765 cct 38057767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 38888126 - 38888227
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||| ||    
T  38888126 ttacgttgaggacttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccttgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgc 38888224  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  38888225 cct 38888227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 38057611 - 38057789
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  38057611 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggtttgatgctctgtgag----cttttgctc-tt 38057704  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| | | |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  38057705 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagagtttgatgccctgg-ttggtactacatgcatgatt 38057789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 38888071 - 38888249
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||  |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  38888071 agtccatgcatactcatttgaagttgagggtttgatgttctgtgagcttttgctc-ttacgttgaggacttgatgctctgtgag----cttttgctc-tt 38888164  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||| |  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  38888165 atgttgagggcttgatgccttgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 38888249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14800472 - 14800296
Alignment:
Q  122 tgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||  |||||||   | |||| || |||||||||||||| |     || ||||||| || ||||    
T  14800472 tgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctgggagtctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctgtgagc----ttttgctcaaataagttg 14800377  T
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||| ||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  14800376 agggtttgatgccctgggaatgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgtcctggattggtatcacatgcatgatt 14800296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 122 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14809346 - 14809170
Alignment:
Q  122 tgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||  |||||||   | |||| || |||||||||||||| |     || ||||||| || ||||    
T  14809346 tgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctgggagtctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctgtgagc----ttttgctcaaataagttg 14809251  T
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||| ||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||    
T  14809250 agggtttgatgccctgggaatgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgtcctggattggtatcacatgcatgatt 14809170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 27161739 - 27161866
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||||| || |||||||| |||||||||| ||||  |  ||| ||| || |||||||||||||    
T  27161739 ttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctgaaatatgttgggggct 27161838  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27161839 tgatgccctggattggtaccacatgcat 27161866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 22123310 - 22123470
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  22123310 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttgagggcttgatgccc 22123408  T
Q  235 taggagtgtgattatgctc-aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22123409 tgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttg-tgccctggattggtaccacatgcat 22123470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23967617 - 23967524
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||||||||  ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23967617 tgctcaacacgttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaataccttgggagcttgatgccctgtattggtaccacatgcatgatt 23967524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51476052 - 51475927
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggctt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |     || |||||  || |||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||  ||||||| ||||||    
T  51476052 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagc----ttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggctt 51475957  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  51475956 gatgccttgg-ttggtaccacatgcatgatt 51475927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 21534138 - 21534222
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  21534138 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaatatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacattcatgatt 21534222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44891674 - 44891554
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||   |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  ||||  |||||     
T  44891674 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatt--tgctct 44891577  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  44891576 atacgttgggggcttgatgccct 44891554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24726362 - 24726259
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||  |||||| || || |||| ||| ||| ||| |||||||||||    
T  24726362 tttacgttgagggtttgacgccctgtgagtttttgctctttaagttgagggtttgatctcctgtgagtataattatactctatatgttaagggcttgatg 24726263  T
Q  232 ccct 235  Q
    ||||    
T  24726262 ccct 24726259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29298023 - 29297896
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  | ||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||| ||  |||||||||    
T  29298023 ttaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaaatacattgggggct 29297924  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29297923 tgatgccctggattggtaccacatgcat 29297896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Original strand, 4596873 - 4596931
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4596873 gttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 4596931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 7053065 - 7053162
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7053065 tacgttgatggcttgatgctctgtgagtttttgctctt-atgttgagggcttgatgtcatgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 7053162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1642477 - 1642416
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1642477 ttacgttgagggcttgatgatctgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgccctg 1642416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 24720765 - 24720848
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  24720765 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtg 24720848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24726417 - 24726237
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||| |    ||| |||||  |    
T  24726417 agtccatgcatactcgtttaaagttgagggcttgatgccatgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgacgccctgtgag----tttttgctcttt 24726322  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| |||||  |||  |||| | ||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||    
T  24726321 aagttgagggtttgatctcctgtgagtataattatactctatatgttaagggcttgatgccctgg-ttggtatcacattcatgatt 24726237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 13301880 - 13301798
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  13301880 agtccatgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctatgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtg 13301798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 13528849 - 13528912
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13528849 taagttgagggcttgatgccctgtgattctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 13528912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20587691 - 20587628
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587691 taagttaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 20587628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20592229 - 20592166
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| ||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20592229 taagttaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 20592166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 41050305 - 41050384
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050305 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 41050384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 50622214 - 50622297
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50622214 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 50622297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 300
Target Start/End: Original strand, 7053010 - 7053187
Alignment:
Q  118 tccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatac 216  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| || ||||| | |||||||| ||||| ||    || |||||  ||     
T  7053010 tccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctttgagcttttcctctatacgttgatggcttgatgctctgtgagt----ttttgctct-tat 7053104  T
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  7053105 gttgagggcttgatgtcatgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 7053187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Original strand, 8277008 - 8277093
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  8277008 tacgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgatt 8277093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 21043509 - 21043611
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||     ||||||| || |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  21043509 acgttgggggcttgatgccctgtgagcttttgcaaaaataagttgggggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgc 21043608  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  21043609 cct 21043611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 21534098 - 21534199
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21534098 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaatatgttgagggcttgatgc 21534196  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  21534197 cct 21534199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 35982137 - 35982186
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  35982137 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 35982186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 41306045 - 41306094
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  41306045 gctcaatatgttgggggcttgatgccttgg-ttggtaccacaagcatgatt 41306094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 158 - 235
Target Start/End: Original strand, 19762201 - 19762278
Alignment:
Q  158 gagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  19762201 gagcttttgctctttacgttgggggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggctcgatgccct 19762278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 273
Target Start/End: Original strand, 16059342 - 16059398
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  16059342 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 16059398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 20241853 - 20241797
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatg 273  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  20241853 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 20241797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43697067 - 43696988
Alignment:
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |  ||| |||||||| |||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  43697067 gagggcttgatgctctatgagtctatttacgctcaatacgttgggggcttgataccttgg-ttagtaccacatgcatgatt 43696988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 252 - 300
Target Start/End: Original strand, 46383015 - 46383062
Alignment:
Q  252 tcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  46383015 tcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 46383062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 47190490 - 47190406
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  47190490 gttgagagattgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 47190406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20958009 - 20957958
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20958009 tgctcaacacgttggaggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 20957958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21711630 - 21711504
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggctt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| || |  |  ||| ||| || || |||||||||||    
T  21711630 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgggtgcctatttacgcttaaatacgttgggggctt 21711531  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21711530 gatgcgttggattggtaccacatgcat 21711504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26064790 - 26064707
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || || | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26064790 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 26064707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 40389078 - 40388952
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggctt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||| | || |||||||||||    
T  40389078 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggctt 40388979  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||    
T  40388978 gatgtcctggattggtaccacatgcat 40388952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Original strand, 41050265 - 41050363
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  41050265 acgttgagggcttgatgcccta-gagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 41050363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 50614386 - 50614469
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  50614386 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgatt 50614469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 51323310 - 51323260
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51323310 tgctctataagttgggggcttgatgccttg-attggtaccacatgcatgatt 51323260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 18120588 - 18120463
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  | ||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||     || ||||| ||| ||||||||||||    
T  18120588 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttttgtgctctataagttgtgggcttgatgccctgtgagcccttttgtgctctataagttgggggcttg 18120489  T
Q  271 atgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
     |||| | |||||||||||||||||||    
T  18120488 ttgccct-gattggtaccacatgcatg 18120463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Original strand, 19762215 - 19762300
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  19762215 tacgttgggggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggctcgatgccctgg-ttggtaccacatggatgatt 19762300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21707004 - 21706962
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21707004 aatacgttgggggcttgatgcgttggattggtaccacatgcat 21706962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 41227701 - 41227869
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||               ||||||||||  ||||| || |||| |  ||||||  |||||||    
T  41227701 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg---------------taagttgagggattgattccatgtgagcctatttacactcaata 41227785  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||| |  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  41227786 tgttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 41227869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 43542781 - 43542732
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43542781 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 43542732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48300788 - 48300739
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48300788 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 48300739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 52954624 - 52954670
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  52954624 aataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 52954670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 33680816 - 33680779
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33680816 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 33680779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 50614346 - 50614446
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  50614346 acgttgggggcttgatgccatg-gagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 50614444  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  50614445 ct 50614446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 50622174 - 50622274
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  50622174 acgttgggggcttgatgccatg-gagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 50622272  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  50622273 ct 50622274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 297
Target Start/End: Original strand, 13528852 - 13528931
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    |||||||||||||||||||  || | |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||    
T  13528852 gttgagggcttgatgccctgtgattctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtgccacatgcatg 13528931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16381018 - 16380974
Alignment:
Q  256 tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16381018 tatgttgagggattgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 16380974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16381133 - 16381054
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||| |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||    
T  16381133 agtccatgcatactcatttatgttgagggcttgatgccttttgagtttttactctacc-gttgagggcttgatgccctgtg 16381054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20636572 - 20636519
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatg-ccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  20636572 ttatgctcaatacgttgggggcttgatgtccttg--ttggtaccacatgcatgatt 20636519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 167 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21238718 - 21238650
Alignment:
Q  167 ctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  21238718 ctctataagttgggggtttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccct 21238650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 31612232 - 31612075
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||| | |  |||||| ||||||   | |||||||||||||||||    
T  31612232 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcacttaagttgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgcc 31612134  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctc-aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||  |  ||| |||| ||||||||||||||| ||     ||||||||||||||||||||    
T  31612133 ctaggagcctatttacgctcaaatatgttgggggctcga-----tggattggtaccacatgcat 31612075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20587684 - 20587606
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20587684 agggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20587606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20592222 - 20592144
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20592222 agggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20592144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 20634665 - 20634728
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  20634665 taagttgagggcttgatgtcctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggctttatgccct 20634728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 20634668 - 20634750
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| |||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20634668 gttgagggcttgatgtcctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggctttatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20634750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22118636 - 22118581
Alignment:
Q  246 ttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  22118636 ttatgctcaaataagttgagggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgatt 22118581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 34509595 - 34509560
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34509595 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 34509560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48300824 - 48300761
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48300824 taagttgagggtttgatgccatgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 48300761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 1642532 - 1642459
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatg 189  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||| |||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||    
T  1642532 agtccatggatactcatttgaagttgagagcttgattccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatg 1642459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 50686561 - 50686440
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgc-tca 212  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || | | |    
T  50686561 agtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccct-tgagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa 50686463  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  50686462 acacgttgagggcttgatgccct 50686440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20248091 - 20248054
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20248091 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 20248054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20587775 - 20587738
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20587775 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 20587738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 20592313 - 20592276
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20592313 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 20592276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20636598 - 20636545
Alignment:
Q  178 gaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20636598 gagggcttgatgctctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgatg 20636545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 159
Target Start/End: Original strand, 21047031 - 21047064
Alignment:
Q  126 tactcatttacgttgagggcttaatgccctgtga 159  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21047031 tactcatttacgttgagggcttgatgccctgtga 21047064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22124234 - 22124182
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  22124234 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctc 22124182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 22825912 - 22825960
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22825912 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22825960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 22922180 - 22922217
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22922180 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22922217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26064830 - 26064730
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || || |||||||||||||||||||    
T  26064830 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaacacgttgagggcttgatgcc 26064732  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  26064731 ct 26064730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 35088562 - 35088521
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  35088562 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgctctgt 35088521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 50686458 - 50686417
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  50686458 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatacatgatt 50686417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1642438 - 1642395
Alignment:
Q  256 tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1642438 tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 1642395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Original strand, 16368601 - 16368633
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16368601 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 16368633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 28194907 - 28194956
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatg-ccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  28194907 gctcaatacgttgggggcttgatgtccttg--ttggtaccacatgcatgatt 28194956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 42912084 - 42912017
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  42912084 tgctcattaagttgagggcttgatgccct-ggagtttatttatgcttaatacgttgagggcttgatgcc 42912017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48520283 - 48520243
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctg 156  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48520283 agtccatgcatgctcatttaagttgagggcttgatgccctg 48520243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 111)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 20179490 - 20179670
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccct-gtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     || |||||  |    
T  20179490 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttt 20179585  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20179586 aagttgagggcttgatgtccttggagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatgatt 20179670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Original strand, 42818867 - 42818983
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  42818867 agtccatgcatactcatttacgttgagggattgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgagagtgtatttatgctcaata 42818966  T
Q  216 cgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||||||||    
T  42818967 cgttgagggcttgatgc 42818983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Original strand, 22584695 - 22584870
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| |    ||| |||||  ||    
T  22584695 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctatgagctttagctctttacgttgagggtttgatgccctgtgag----tttttgctcttta 22584790  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
     |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  22584791 agttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcat 22584870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19699157 - 19698977
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |  ||||  |||||  ||    
T  19699157 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgatgccctgtgagcctatt--tgctc-tta 19699061  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19699060 agttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactttatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19698977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 22253336 - 22253516
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   | |||| || ||||||||||||   | |  ||||  |||||||    
T  22253336 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctgggagcctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg---gagccttta--ctcaata 22253430  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22253431 agttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 22253516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 133 - 237
Target Start/End: Original strand, 22259378 - 22259482
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||| ||||||||||    
T  22259378 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgaaggcttgatgc 22259477  T
Q  233 cctag 237  Q
    |||||    
T  22259478 cctag 22259482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 25849399 - 25849579
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |     || |||||  |    
T  25849399 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgccctgtgag----cttttgctcttt 25849494  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25849495 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 25849579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18833388 - 18833204
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa- 213  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| || |||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||   |  |||||| ||||||     
T  18833388 agtctatgcatactcatttaagttaagggcttgatgccatg-gagcctttgctcaattaagttgagggctggatgccctggtagcctatttacgctcaaa 18833290  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18833289 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgcc-tggattggtaccacatgcatgatt 18833204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23669516 - 23669331
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggac-ttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||      
T  23669516 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagctattgctc-ttatgttgagggctttgatgccctgtgagtgtacttatgctc-t 23669419  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgcccta--ggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||||||| |||||||||||   ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23669418 tatgttgagggtttgatgccctatgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 23669331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23418437 - 23418257
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |     || | |||  |    
T  23418437 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgacgccctgtgag----cttttactcttt 23418342  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||| |||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23418341 aagttgaggtcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgatggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatgatt 23418257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23888817 - 23888634
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||| |||| || |||||||||||||| |  ||||  |||||      
T  23888817 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttacgttgggggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctt 23888720  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     | |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23888719 aaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatattatgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 23888634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 39695574 - 39695754
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |     || |||||  |    
T  39695574 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttt 39695669  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||| ||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||| |||| || ||||||||||||    
T  39695670 aagttgagggctcgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgctctgg-ttggcactacatgcatgatt 39695754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 19929781 - 19929960
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||  |||||||||||   |     || ||||| |||    
T  19929781 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgggggattgatgccctggcag----cttttgctctata 19929876  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19929877 agttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgaggggttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 19929960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 45471428 - 45471609
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||   |||| |    
T  45471428 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--cgctcta 45471525  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||| ||||||||||||||  |||  | |||  |||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  45471526 taagttgggggcttgatgccctctgagcct-att-cgctctatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatgatt 45471609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5760507 - 5760391
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| ||||||| |||| | |||||| ||||||||| |    
T  5760507 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatg-cctg-gagtgtatatatgctcaaca 5760411  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5760410 cgttgagggcttgatgccct 5760391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 13665426 - 13665604
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |   |||| |||||  ||    
T  13665426 agtccatgcatactcattga-gttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgaagccttgatgccctgtgag---atttttgctc-tta 13665520  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  |||||   |||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  13665521 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgcatttatgctatttatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 13665604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 13724701 - 13724879
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||| | |||||||||||||| |   |||| |||||  ||    
T  13724701 agtccatgcatactcattga-gttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctccttacgttgaagccttgatgccctgtgag---atttttgctc-tta 13724795  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  |||||   |||||||   ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  13724796 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgcatttatgctatttatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 13724879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17217620 - 17217523
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttga 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17217620 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgagggcttga 17217523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5760382 - 5760290
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5760382 tgctcaataagttgagggcttgatgccctag-agtgtatttatgctcaatacgttggggggttaatgccctggattggtaccacatgcatgatt 5760290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Original strand, 42266608 - 42266708
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  42266608 tttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagtttagggctttatgctctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatg 42266707  T
Q  232 c 232  Q
    |    
T  42266708 c 42266708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 41598074 - 41597947
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||  |  |||||||||| || ||||||||||    
T  41598074 ttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccatgggagcctatttatgctcaaatacgttgggggct 41597975  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41597974 tgatgccctggattggtaccacatgcat 41597947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 229 - 300
Target Start/End: Original strand, 42819018 - 42819089
Alignment:
Q  229 atgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42819018 atgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgatt 42819089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 17907929 - 17908050
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||| |||| ||||||||||||| |  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |    
T  17907929 agtccatgcatgctcattaaagttgagagcttgatgccctgtgagcctatttgctttttaagttgagggcttgatgccctgtgaatatatttatgctcta 17908028  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  17908029 tatgttgggggcttgatgccct 17908050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 22381903 - 22382085
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-t 214  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| |||||||   | |||| || |||||||||||||| |     || ||||||| |    
T  22381903 agtccatccatactcatttaagttgagggcttgatgccctaggagcatttgctcaacacgttgggggcttgatgccctgtgagc----ttttgctcaaat 22381998  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||| |||||||||||| |  ||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22381999 aagttgggggcttgatgccatgcgagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaacacatgcatgatt 22382085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 42266553 - 42266634
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  42266553 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgcgcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtg 42266634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 36728284 - 36728467
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||   |||||||| ||||||| || |||||||||||||  || ||||  ||||| |    
T  36728284 agtcgatgcatactcattaaagttgagggattcatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtaagtctatt--tgctcta 36728381  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||  ||||||||||| |  |||| |  |||| ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  36728382 tacgttggaggcttgatgccatgtgagtatatttatactctatatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 36728467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 134 - 233
Target Start/End: Original strand, 42818965 - 42819064
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||| |||  || |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  42818965 tacgttgagggcttgatgctctgtgagctttttttctttaagtttagggttttatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 42819064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17217679 - 17217495
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||  || ||||||| |||||||||||||| |  |||||  ||||     
T  17217679 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttactctaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctattt--gctct 17217582  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     || |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| |||||||| ||||||||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  17217581 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgagggcttgacaccctgg-ttggtaccacatgcgtgatt 17217495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 20502273 - 20502453
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat- 214  Q
    |||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   | ||||||||||||||||||||   | |  |||  |||||||     
T  20502273 agtccatgcatactcatccatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacacgttgaggacttgatgccctg---gagccttt--gctcaatt 20502366  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20502367 aagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 20502453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 22259323 - 22259502
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  22259323 agtccatgcatactcattcaaagttgaaagcttgatgccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctcttt 22259417  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||  ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  22259418 aagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgaaggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 22259502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 37515379 - 37515295
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37515379 gttgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgatt 37515295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 45290938 - 45291099
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||||| ||||||   | |||||||||||||||||    
T  45290938 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctg-gagtctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgcc 45291035  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    || ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  45291036 ctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 45291099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22244495 - 22244313
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| || |||| |  ||||  |||||  |    
T  22244495 agtccatgcttactcatttaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgataccatgtgagcctatt--tgctcttt 22244398  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||  | ||||||||||  |||| |  |||||||| |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  22244397 aagttgaatgtttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggtttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 22244313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 236
Target Start/End: Original strand, 18819847 - 18819971
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||||| |  ||||||| |||||||| || ||||||||||||||  | ||||||| |||    
T  18819847 agtccatgcatactcatctaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgggggcttgatgccctgtgaatatatttatactc 18819946  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgcccta 236  Q
     ||| ||||||||||||||||||||    
T  18819947 tataagttgagggcttgatgcccta 18819971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19128055 - 19127867
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtga-----gcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgct 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |       || | |   ||| ||||||| ||||||||||||||    |||||| |||    
T  19128055 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgatgccctgtgatcctatttacgct 19127956  T
Q  211 caatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| || |  |||  |  ||| |||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19127955 caatacgttgagggcttgataccatgtgagcctatttacgctcaatacgtcgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19127867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5760411 - 5760313
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  5760411 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgcccta-gagtgtatttatgctcaatacgttggggggttaatgccc 5760314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 22963680 - 22963764
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | || ||||| || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22963680 gttgagggcttgatgccctaggagtatattaattctcaaataagttgagggtttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 22963764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 6102735 - 6102817
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6102735 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctta-tatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 6102817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 15203507 - 15203634
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||||||| ||||||||| || | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||    
T  15203507 ttaagttgagggcttgatgccttgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggct 15203606  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15203607 tgatgccctggattggtaccacatgcat 15203634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 17907990 - 17908072
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  || | |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17907990 gttgagggcttgatgccctgtgaatatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17908072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19896185 - 19896024
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || |||||| |||||||||||    
T  19896185 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagtgcttgatgccc 19896087  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19896086 tgggagcctatttacgctcaaatacggtgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 19896024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 5083325 - 5083445
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||| ||||||| |||  |||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||||||  ||||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  5083325 agtccatgcatattcatttaagttaggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaataagttgagggtttgatgccctgggagtatatttatgctcaaa 5083423  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  5083424 taagttgagggcttgatgccct 5083445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16799337 - 16799253
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |  | ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16799337 gttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 16799253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 22473636 - 22473553
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22473636 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtg 22473553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22995695 - 22995611
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22995695 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccaaatgcatgatt 22995611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 26225572 - 26225656
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26225572 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgatt 26225656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28397402 - 28397318
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28397402 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatcctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 28397318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9179 - 9097
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  9179 gttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccct-gattagtaccacatgcatgatt 9097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 20084610 - 20084692
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20084610 gttgagggcttgatgctctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20084692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 1323535 - 1323584
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1323535 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 1323584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Original strand, 18820032 - 18820133
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgat 230  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| |||||||  || ||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||| |||||||||    
T  18820032 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagtttggggctttatgccctgtgagtatatttatgcactatacgttgggggcttgat 18820131  T
Q  231 gc 232  Q
    ||    
T  18820132 gc 18820133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Original strand, 20084608 - 20084670
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  20084608 aagttgagggcttgatgctctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccct 20084670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22995735 - 22995634
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22995735 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 22995637  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  22995636 cct 22995634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Original strand, 31723834 - 31723887
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  31723834 ttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 31723887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 5083379 - 5083467
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5083379 aataagttgagggtttgatgccctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 5083467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 120 - 298
Target Start/End: Original strand, 2419046 - 2419220
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat-acgt 218  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||||||||   | |||| || ||||||||||||  | |     | |||||||| | ||    
T  2419046 catgcatactcattcaagttgagggcttgatgcccta-gagcttttgctcaacacgttgggggcttgatgccctggagct-----tctgctcaattaagt 2419139  T
Q  219 tgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||||| |||||||||| ||||| |  | ||||||||| | |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2419140 tgaggggttgatgccctgggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatga 2419220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Original strand, 18819989 - 18820053
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| || ||| ||||| |||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18819989 ttaagttgggggcttaatgccttgtgagtatatttatgctctatacgttgagggcttgatgccct 18820053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22984137 - 22984053
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |  | |||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  22984137 gttgaggccttgatgccctaggagtatattaatgctcaaataagttaagggcttgatgccctggattggtaccatatgcatgatt 22984053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 167
Target Start/End: Original strand, 39695489 - 39695541
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgc 167  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39695489 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgc 39695541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16799370 - 16799276
Alignment:
Q  142 gggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat-acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||| ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16799370 gggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgccct 16799276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22626552 - 22626517
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626552 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 22626517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24713179 - 24713097
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||| ||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24713179 gttgagggcttgataccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 24713097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24713182 - 24713119
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24713182 taagttgagggcttgataccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 24713119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 39937101 - 39937164
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39937101 taagttgagggcttgatgccctgcgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 39937164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 20983083 - 20983132
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20983083 gctcaatatgttgggggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20983132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22525373 - 22525327
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22525373 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 22525327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23947272 - 23947210
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||    
T  23947272 aagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatactttatatgttgagggcttgatgccct 23947210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 300
Target Start/End: Original strand, 29763869 - 29763950
Alignment:
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |  ||| ||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29763869 ttgagggcttgatgccctatgagcctatttacgctta-tacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 29763950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 38550449 - 38550498
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  38550449 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgatt 38550498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 174 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9180 - 9119
Alignment:
Q  174 agttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  9180 agttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccct 9119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 274
Target Start/End: Original strand, 42818926 - 42818983
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgc 274  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||    
T  42818926 gttgagggcttgatgccctgagagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 42818983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 17086419 - 17086503
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| || | |||||||||||||||||||    
T  17086419 gttgagggcttgatgctcttggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgaaatggtaccacatgcatgatt 17086503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Original strand, 19155203 - 19155239
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19155203 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 19155239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Original strand, 22318947 - 22319010
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22318947 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt-atgctctatacgttgggggcttgatgccct 22319010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24352836 - 24352792
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24352836 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga 24352792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 28397440 - 28397341
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| || ||||| || ||||||||||||||||||    
T  28397440 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatcctcaaataagttgagggcttgatgccc 28397342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Original strand, 35027132 - 35027168
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35027132 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 35027168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 36733583 - 36733703
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||  |||| |||   |||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  | ||||  |||     
T  36733583 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgttctgtaagcctatttgctctattaagttgagggattgatgccctgtgagccttttta--ctct 36733680  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  36733681 atacgttgggggcttgatgccct 36733703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 300
Target Start/End: Original strand, 2717865 - 2717907
Alignment:
Q  257 atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2717865 atgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 2717907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 161
Target Start/End: Original strand, 6102720 - 6102759
Alignment:
Q  122 tgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  6102720 tgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagc 6102759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 16092602 - 16092637
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16092602 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 16092637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 21513258 - 21513208
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  21513258 ttatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatg 21513208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23667819 - 23667693
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgat 272  Q
    |||||||  ||||||| ||| | || |||| |||||||| || |||||||| ||||||| || ||||| |  | |||||||| || |||| ||| |||||    
T  23667819 gttgagggtttgatgcactgggagtatattaatgctcaaataagttgagggtttgatgcactgggagtatattaatgctcaaataagttgagggtttgat 23667720  T
Q  273 gccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23667719 gcct-ggattggtaccacatgcatgatt 23667693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23947270 - 23947188
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |  |||| ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  23947270 gttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatactttatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgtatgatt 23947188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 39937104 - 39937186
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  39937104 gttgagggcttgatgccctgcgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttgataccatatgcatgatt 39937186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 13428500 - 13428549
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  13428500 gctcaatatgttgggggcttgatgcactgg-ttggtaccatatgcatgatt 13428549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 17439812 - 17439858
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17439812 aatacgttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatt 17439858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 296
Target Start/End: Original strand, 22419718 - 22419760
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22419718 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22419760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22874883 - 22874849
Alignment:
Q  262 gggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22874883 gggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22874849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26219560 - 26219514
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  26219560 aatacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgatt 26219514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Original strand, 36405977 - 36406156
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc- 211  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||  |||||     
T  36405977 agtccatgcatactaattaaagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctcttaagttgatggcttgatgccttgtgagcctatt--tgctct 36406074  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | || |||||||| ||||||||||  |||  | ||| ||||| ||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  36406075 attaagttgagggtttgatgccctgtgagcct-att-tgctctatacgttgggggtttgatgccct-gattggtaccacatgcat 36406156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 37515419 - 37515318
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||  | || |||| |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  37515419 acgttgggggcttgatgctctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaatacgttgggggcttgatgc 37515321  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  37515320 cct 37515318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 40493280 - 40493326
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  40493280 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgcatgatt 40493326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 4381737 - 4381821
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  4381737 agtccatccatactcatttaaagttaagggcttgatgccttgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtg 4381821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 235
Target Start/End: Original strand, 6102730 - 6102794
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||    
T  6102730 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgct-tatatgttgggggcttgatgccct 6102794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6520173 - 6520136
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6520173 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 6520136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20498372 - 20498335
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20498372 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 20498335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 20533720 - 20533761
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  20533720 gttgggggcttgatgtcctggattgataccacatgcatgatt 20533761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21673515 - 21673478
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21673515 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 21673478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22207131 - 22207091
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22207131 gttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 22207091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 22318885 - 22318926
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  22318885 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgt 22318926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 22318989 - 22319089
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| | |||||| ||| ||| || |||||||||||||| |  || |||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  22318989 tacgttgggggcttgatgccctgagagcctatgctctataaattgggggcttgatgccctgtgagccta-ttatgctctacaagttgggggcttgatgcc 22319087  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  22319088 ct 22319089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22344043 - 22343995
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22344043 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22343995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22355703 - 22355655
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22355703 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22355655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23947292 - 23947247
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgag 160  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23947292 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgccctgtgag 23947247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 26355973 - 26356010
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26355973 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 26356010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 300
Target Start/End: Original strand, 27472747 - 27472795
Alignment:
Q  251 ctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  27472747 ctcaatatgttgggggcttgatgctctag-ttggtaccacatgcatgatt 27472795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 38988374 - 38988224
Alignment:
Q  144 gcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgt 243  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |  | |||  |||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||  |    
T  38988374 gcttgatgccctgagagcttatgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagcct-ttttcgctctataagttgggggtttgatgccctgggagcct 38988276  T
Q  244 gattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
     |||  ||||   | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38988275 tatt-cgctcttaaagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatg 38988224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39019471 - 39019321
Alignment:
Q  144 gcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgt 243  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||| |  | |||  |||| ||| |||| ||| |||||||||| ||||  |    
T  39019471 gcttgatgccctgagagcttatgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagcct-ttttcgctctataagttgggggtttgatgccctgggagcct 39019373  T
Q  244 gattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
     |||  ||||   | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39019372 tatt-cgctcttaaagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatg 39019321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21673453 - 21673421
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21673453 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 21673421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Original strand, 33587128 - 33587167
Alignment:
Q  260 ttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  33587128 ttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 33587167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 138)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44374029 - 44373849
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccct-gtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     || |||||  |    
T  44374029 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttt 44373934  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44373933 aagttgagggcttgatgtccttggagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatgatt 44373849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44382894 - 44382714
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccct-gtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |     || |||||  |    
T  44382894 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgcccttgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttt 44382799  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44382798 aagttgagggcttgatgtccttggagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatgatt 44382714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 12466229 - 12466348
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12466229 agtccatgcatactcatttacgttgagggtttgatgccctgtgagtttttgttctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaata 12466328  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12466329 cgttgagggcttgatgccct 12466348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19282175 - 19282056
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | ||||||||||||||||||    
T  19282175 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgcctttggagtgtatttatgctcaata 19282076  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19282075 cgttgagggcttgatgccct 19282056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20585439 - 20585320
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  20585439 agtccatgcatactcatttacgttgatggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 20585340  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  20585339 tgttgggggcttgatgccct 20585320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Original strand, 14161839 - 14161956
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||    
T  14161839 agtccatgcataatcatttacattgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcagta 14161938  T
Q  216 cgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14161939 cgttgagggcttgatgcc 14161956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 14220064 - 14220229
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| || || |||| |||  || |||||||||||||||||    
T  14220064 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctataagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgcc 14220163  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14220164 atgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 14220229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33001052 - 33000870
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  ||||| ||    
T  33001052 agtccatgcatactcatataaagttgagggcttaatgccctgtgagcctttgcttcttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctctat 33000955  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||| |  |||| | ||| | ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  33000954 aagttgagggcttgatgccttgtgagtataattgtactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 33000870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19282077 - 19281976
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19282077 tacgttgagggcttgatgccctgtgagattttgctctttaagttgagggcttgatgccctggaagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 19281978  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  19281977 ct 19281976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 17071252 - 17071368
Alignment:
Q  120 catgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgt 218  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || ||    
T  17071252 catgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctatttaagttaagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgt 17071351  T
Q  219 tgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  17071352 tgagggcttgatgccct 17071368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 43277779 - 43277898
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  43277779 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 43277877  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  43277878 atgttgagggcttgatgccct 43277898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Original strand, 13699714 - 13699831
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||| ||| ||    
T  13699714 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagctttttctctttaagttgagggcttgatgtcctgtgagtataattatactctat 13699813  T
Q  215 acgttgagggcttgatgc 232  Q
    | ||||||||||||||||    
T  13699814 atgttgagggcttgatgc 13699831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 14161937 - 14162038
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14161937 tacgttgagggcttgatgcctcatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccccgggagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgcc 14162036  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  14162037 ct 14162038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 19558268 - 19558452
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||  ||||| |    
T  19558268 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctattagctctataagttgaggactttatgccctgtgagcctatt--tgctcta 19558365  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgtt-gggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||| |||||||||||| |  |||| |  |||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19558366 taagttgggggcttgatgccttgtgagtatatttatgctctatatgttggggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19558452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 10660215 - 10660395
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||| |     || |||||  |    
T  10660215 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgacgccctgtgag----cttttgctcttt 10660310  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||| ||||||||  |  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10660311 aagttgaggtcttgatgctttgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 10660395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20619246 - 20619119
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  20619246 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctatgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttga 20619147  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  20619146 tgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20619119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 12371304 - 12371178
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgat 272  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  12371304 aagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgat 12371205  T
Q  273 gccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  12371204 gccttgg-ttggtacgacatggatgatt 12371178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20585380 - 20585297
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  20585380 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcatgatt 20585297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 12466327 - 12466434
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatt----tatgctcaatacgttgagggcttga 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| | |||||||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  12466327 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagagcttgatgctctgggagtgtatttatgtatgctcaatatgttgagggcttga 12466426  T
Q  230 tgccctag 237  Q
    ||||||||    
T  12466427 tgccctag 12466434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32301059 - 32300876
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca-at 214  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||   | |||| || |||||||||||| | || |||| ||||||| ||    
T  32301059 agtctatgcatatttatttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacacgttgggg-cttgatgccctgggagtatattaatgctcagat 32300962  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  32300961 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgattccctggattggtaccacatgcatgatt 32300876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 36705630 - 36705810
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  36705630 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggtttgatgctctgtgag----cttttgctcttt 36705725  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||| ||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  36705726 aagttgagggtttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccct-gattggtaccacaagcatgatt 36705810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 14161978 - 14162061
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14161978 gttgagggcttgatgccccgggagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 14162061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19282036 - 19281953
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19282036 gttgagggcttgatgccctggaagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtactacatgcatgatt 19281953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 17130702 - 17130884
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||| ||||| ||||| || | || |||||||||||||| |  |||||  ||||       
T  17130702 agtccatgcatactcatttgaagttgagggtttgatgccatgtgagcctttgcactttacgtcgtgggcttgatgccctgtgagcctattt--gctcttc 17130799  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17130800 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17130884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38519321 - 38519140
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-t 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||   | |||| || ||||||||| |||| |     || ||||||| |    
T  38519321 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctga-agcctttgctcaacacgttgggggcttgatgccttgtgagc----ttttgctcaaat 38519227  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||| || ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38519226 aagttgagggcttgataccctgggagtgtatttatgctcaaataagttaggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 38519140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 3287020 - 3286901
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  3287020 agtcaatgtatactcatttgaagttgatggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 3286922  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  3286921 atgttgagggcttgatgccct 3286901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11066429 - 11066302
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  11066429 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacattaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttga 11066330  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11066329 tgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 11066302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15281354 - 15281170
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgag-ct-tttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||||| ||||||| | |||| |  ||||  |||||     
T  15281354 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttaatgccctgtgagtctatttgctctactacgttgagggcttgatgtcgtgtgagcctatt--tgctct 15281257  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     || ||||||||||| |||||||  |||| |  ||| |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15281256 ttaagttgagggcttaatgccctgtgagtatatttaagctctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 15281170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 14183718 - 14183801
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||| ||||  |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14183718 gttgagggcttgataccctgtgagtctatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 14183801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 130989 - 131169
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||| |||||||   | |||| || ||||||| ||||||     | || |||||||      
T  130989 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctga-agcctttgctcaacacgttgggggcttgatgtcctgtga----acttttgctcaaat 131083  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
      |||||||||||||  ||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  131084 aattgagggcttgatttcctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 131169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12371323 - 12371202
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc----ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    ||  ||||  || ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  12371323 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctc 12371224  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||| ||||||||||||    
T  12371223 aatacgttgggggcttgatgcc 12371202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Original strand, 13150627 - 13150754
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  13150627 taagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttggaggcttga 13150726  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  13150727 tgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 13150754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Original strand, 14220007 - 14220163
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||||||||||| |     || ||||| ||    
T  14220007 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctatacgttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctctat 14220102  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||| | ||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  14220103 aagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgcc 14220163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Original strand, 37785374 - 37785477
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| || || |||| |||  || |||||||||||||||    
T  37785374 tttacattgagggcttgatgcactgtgagcttttgctctttaagttgatgacttgatgtcccgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatg 37785473  T
Q  232 ccct 235  Q
    ||||    
T  37785474 ccct 37785477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4070818 - 4070634
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||   |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||| |  ||||  |||||     
T  4070818 agtccatgcatactcatatatgttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagagcttgatgccatgtgagcctatt--tgctct 4070721  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||  |||| |  |||||||| |||  ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4070720 ataagttgggggtttgatgccctgtgagtatatttatgctctatagattgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 4070634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 42461806 - 42461717
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  42461806 aataagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagatgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 42461717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 11525833 - 11525917
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11525833 gttgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 11525917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 11772522 - 11772606
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11772522 gttgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 11772606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3286964 - 3286879
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3286964 tacgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 3286879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Original strand, 12128187 - 12128315
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggctt 269  Q
    ||||||||||||  |||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||| | ||||||  ||||||||||    
T  12128187 tttaagttgagggtttgatgccctttgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacg-tcaatacattgggggctt 12128285  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  12128286 gatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 12128315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20110475 - 20110313
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||   | ||| |||||||||||||    
T  20110475 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagtttagggcttgatgcc 20110377  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    || ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20110376 ctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 20110313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Original strand, 32434680 - 32434807
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  32434680 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacattgagggtttgatgccatgtgagcatatttacgctcaatacgttgggggcttga 32434779  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  32434780 tgcactgg-ttggtaccacatgcatgatt 32434807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14044599 - 14044516
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044599 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 14044516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14354629 - 14354546
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354629 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 14354546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 17071312 - 17071390
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17071312 agggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17071390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 8136113 - 8136210
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| | |||||| ||||||| || |||||||||||||| |  || |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  8136113 gttgagggcttgatgccctgagagcctatgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagccta-ttatgctctatacgttgggggcttgatgccct 8136210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15139126 - 15139002
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttg 270  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |  |||||  |||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| | ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  15139126 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctattt--gctctataagttgggggcttgatgccctgtgagtct-att-tgctctatacgttgggggcttg 15139031  T
Q  271 atgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||    
T  15139030 acgccttg-attggtaccacatgcatgatt 15139002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 247 - 300
Target Start/End: Original strand, 12466402 - 12466455
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  12466402 tatgctcaatatgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 12466455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 17017627 - 17017747
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgc-tcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || | | ||    
T  17017627 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaa 17017725  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  17017726 tacgttgagggcttgatgccct 17017747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 37785319 - 37785499
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  37785319 agtccatgcatactcattcaaagttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttacattgagggcttgatgcactgtgag----cttttgctcttt 37785414  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||| | ||||||| ||   |||| | ||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  37785415 aagttgatgacttgatgtcccgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 37785499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 42461842 - 42461738
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||||||    
T  42461842 acgttgggggtttgatgctctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagatgggggcttgatgc 42461743  T
Q  233 cctag 237  Q
    |||||    
T  42461742 cctag 42461738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44116390 - 44116310
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44116390 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 44116310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47094175 - 47094096
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  47094175 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccatgcgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtg 47094096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 48213887 - 48213970
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||    
T  48213887 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaaattgagggcttgatgccctgtg 48213970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 61513 - 61595
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  61513 gttgagggcttgatgccctatgagcatatttacgctcaatacgttgggggcttgatgcactgg-ttggtaccacatgcatgatt 61595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 8852256 - 8852319
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8852256 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 8852319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 8852259 - 8852341
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8852259 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 8852341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 142 - 235
Target Start/End: Original strand, 11525800 - 11525894
Alignment:
Q  142 gggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  11525800 gggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 11525894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 13133498 - 13133617
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||   || |||||  | |||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |    
T  13133498 agtccatgcatactcatttaagctgagggcttgatgccctgtgagcctattcgctctaaatgttgggggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctcta 13133595  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  13133596 tacgttgggggcttgatgccct 13133617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 14183715 - 14183778
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  14183715 taagttgagggcttgataccctgtgagtctatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccct 14183778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 18875943 - 18876026
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| | |||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18875943 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacggtcaatacgttgggggtttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 18876026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 36686291 - 36686354
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36686291 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 36686354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 43277838 - 43277916
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43277838 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcat 43277916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 48273229 - 48273150
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgca 295  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48273229 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgca 48273150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 48811798 - 48811735
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  48811798 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 48811735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8468156 - 8468107
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8468156 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 8468107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 9390154 - 9390203
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9390154 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 9390203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 38227347 - 38227273
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggta 286  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38227347 aataagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggta 38227273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 9033520 - 9033640
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| ||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||| |||| |  | |||| |||||| ||    
T  9033520 agtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgctctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgtcctgggattatattaatgctcaaa 9033618  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  9033619 taagttgagggcttgatgccct 9033640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 9177838 - 9177958
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgc-tcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||   || ||||  | | | ||    
T  9177838 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattagtacttaaa 9177936  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  9177937 tacgttgagggcttgatgccct 9177958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 11769086 - 11769202
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||| ||| |||||||||||| | || |||| |||||| ||    
T  11769086 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttaagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaa 11769184  T
Q  214 tacgttgagggcttgatg 231  Q
    || ||||||| |||||||    
T  11769185 taagttgaggacttgatg 11769202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Original strand, 15008768 - 15008849
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15008768 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga 15008849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16091708 - 16091588
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgc-tcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || | | ||    
T  16091708 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaa 16091610  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||    
T  16091609 tacattgagggcttgatgccct 16091588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 16461441 - 16461482
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16461441 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 16461482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 18075576 - 18075640
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18075576 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttg-gggcttgatgccctag 18075640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 47094121 - 47094061
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  47094121 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgaggacttaatgccctg 47094061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 205 - 297
Target Start/End: Original strand, 8136139 - 8136229
Alignment:
Q  205 tatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  8136139 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagcct-attatgctctatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatg 8136229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 9033579 - 9033663
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||| ||| | |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9033579 gttgagggcttgatgtcctgggattatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 9033663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11053723 - 11053640
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||||  || ||||||| ||||||||||||||    
T  11053723 agtccatgaatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctactacgttgagggcttgatgccctgtg 11053640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15139122 - 15139030
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttga 229  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||  ||||| |||||||| ||||||||    
T  15139122 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagtctatt--tgctctatacgttgggggcttga 15139030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 17062157 - 17062237
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| | |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17062157 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgatcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 17062237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 29329201 - 29329281
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29329201 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacattgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 29329281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 1868226 - 1868309
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || ||||||||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1868226 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatatgttgagggcttaatgccctagattggtaccacatgcatgatt 1868309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 12256090 - 12256169
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12256090 gttgagggcttgatgccctagaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12256169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 276
Target Start/End: Original strand, 14161898 - 14161957
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcct 276  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| || |||| |||||||||||||    
T  14161898 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcagtacgttgagggcttgatgcct 14161957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16579389 - 16579350
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16579389 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 16579350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 36686294 - 36686377
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  36686294 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgcatgatt 36686377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38227345 - 38227282
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38227345 taagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 38227282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Original strand, 46387085 - 46387215
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgg-gtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggct 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| |  | || |||||||| ||||||||||  ||   |  ||| |||||||||||||||||||    
T  46387085 tttaagttgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggtttgatgccctgtgaacctatttacgctcaatatgttgggggct 46387184  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  46387185 tgatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 46387215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 48809491 - 48809573
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |   || ||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  48809491 agtccacgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgaacctattcgctctataagttgggggcttgatgccctgtg 48809573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 12128171 - 12128293
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc----ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| |||||    ||  ||||  || ||||||| |||||||||||||| |  |||||| | ||    
T  12128171 agtccatgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctttgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacg-tc 12128269  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||    
T  12128270 aatacattgggggcttgatgccct 12128293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Original strand, 12466288 - 12466346
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  12466288 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 12466346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 14270492 - 14270541
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  14270492 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcttgatt 14270541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 17017724 - 17017770
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17017724 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 17017770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17232292 - 17232243
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  17232292 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatggatgatt 17232243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 19282116 - 19282058
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19282116 gttgagggcttgatgcctttggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 19282058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 8852172 - 8852213
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  8852172 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 8852213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 13150543 - 13150584
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13150543 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 13150584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14044637 - 14044541
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  14044637 gttgagggcttgatgccatg-gagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 14044541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Original strand, 14183633 - 14183678
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc 161  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  14183633 agtccatgcatactcatttaacttgagggcttgatgccctgtgagc 14183678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14323219 - 14323178
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14323219 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 14323178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14354667 - 14354571
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  14354667 gttgagggcttgatgccatg-gagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 14354571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 15008728 - 15008828
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  15008728 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 15008826  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  15008827 ct 15008828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 46387069 - 46387110
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  46387069 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 46387110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Original strand, 61510 - 61570
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  61510 taagttgagggcttgatgccctatgagcatatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 61570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16996074 - 16995990
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| | |||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16996074 gttgagagtttgatgccctgggagtatatttatgctcaaataagtttagggtttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 16995990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 18456649 - 18456729
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18456649 gttgaggccttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggagcttgatgccctggattggtaccacatgcat 18456729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Original strand, 20220467 - 20220503
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20220467 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 20220503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44116428 - 44116329
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  44116428 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccc 44116330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 237
Target Start/End: Original strand, 1868166 - 1868288
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||    
T  1868166 agtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgcccta-gagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa 1868264  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    || ||||||||||| |||||||||    
T  1868265 tatgttgagggcttaatgccctag 1868288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 2282519 - 2282598
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2282519 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 2282598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Original strand, 9744094 - 9744176
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  9744094 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgggggcttgatgccctg 9744176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 134 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11053664 - 11053606
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgc 190  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  11053664 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttaatgc 11053606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 13133589 - 13133639
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13133589 tgctctatacgttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 13133639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 13699774 - 13699852
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| |||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  13699774 gttgagggcttgatgtcctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcat 13699852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 15144338 - 15144373
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15144338 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 15144373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16056180 - 16056101
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16056180 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 16056101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Original strand, 16586274 - 16586312
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16586274 tgggggcttgatgcct-ggattggtaccacatgcatgatt 16586312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 155
Target Start/End: Original strand, 18075535 - 18075574
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccct 155  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  18075535 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccct 18075574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 45848048 - 45848130
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||  |||  |  ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  45848048 gttgagggcttgatgctctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgtatgatt 45848130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48811795 - 48811713
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  48811795 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 48811713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Original strand, 20253690 - 20253760
Alignment:
Q  165 tgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |  ||||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  20253690 tgctctgtaagttgagggtttgatgcactgtgagcctatttatgctctatacgttggggacttgatgccct 20253760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 37727995 - 37728044
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  37727995 gctcaatacgttgggggcttgatgccatgg-ttgataccacatgcatgatt 37728044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 48809583 - 48809632
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  48809583 gctctatatgttgggggcttgatgctctg-attggtaccacatgcatgatt 48809632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 59399 - 59440
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  59399 agtccatgcatgctcatttaagttgagggcttgatgccctgt 59440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Original strand, 11772518 - 11772583
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||  | || |||| |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  11772518 ttaagttgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 11772583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Original strand, 15576927 - 15576972
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc 161  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15576927 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctatgagc 15576972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16996171 - 16996119
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc 169  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||    
T  16996171 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctc 16996119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 18875879 - 18875916
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18875879 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 18875916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20619330 - 20619289
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  20619330 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgt 20619289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 47831611 - 47831574
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47831611 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 47831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 67545 - 67513
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  67545 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 67513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 6170530 - 6170609
Alignment:
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |  ||| |||||||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  6170530 gagggcttgatgctctatgagcctatttacgctcaatacgttggggacttgatgtcctgg-ttggtaccacatgcatgatt 6170609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 248 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11053609 - 11053558
Alignment:
Q  248 atgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  11053609 atgctctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccgcatgcatgatt 11053558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 11769149 - 11769229
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| || ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  11769149 agggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgaggacttgatgtcgtggattgataccacatgcatgatt 11769229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 245 - 297
Target Start/End: Original strand, 15105203 - 15105254
Alignment:
Q  245 attatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  15105203 attatgctctacaagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatg 15105254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 18875943 - 18876003
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||    
T  18875943 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacggtcaatacgttgggggtttgatgccct 18876003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 48991018 - 48990986
Alignment:
Q  268 ttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48991018 ttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 48990986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 655 - 536
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  655 agtccatgcatactcatttacgttgaaggcttgatgccctatgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 556  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  555 cgttgagggcttgatgccct 536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 557 - 459
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| ||| ||| |||| |||||||||||    
T  557 tacgttgagggcttgatgccctgtgtgctttttctctttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgtgggcttgatgc 459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 596 - 538
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  596 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 8057
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc 169  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  8110 agtctatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgggagcctttgctc 8057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 516 - 436
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||||||||||||||| ||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||| ||  | ||||||||||||||||||    
T  516 gttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgtgggcttgatg-ctctgtttggtaccacatgcatga 436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0328 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0328
Description:

Target: scaffold0328; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 19603 - 19786
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  |    
T  19603 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcttt 19701  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19702 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 10)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 19770 - 19889
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  | ||||||||||||||||||    
T  19770 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgataccctaggagtgtatttatgctcaata 19869  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19870 cgttgagggcttgatgccct 19889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 19868 - 19969
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19868 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 19967  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  19968 ct 19969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 19909 - 19988
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19909 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 19988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7275 - 7212
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7275 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgtgggcttgatgccct 7212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14394 - 14331
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14394 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgtgggcttgatgccct 14331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14459 - 14396
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14459 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgcttaatacgttgagggcttgatgccct 14396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7272 - 7190
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7272 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgtgggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 7190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7340 - 7277
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7340 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatatacgcttaatacgttgagggcttgatgccct 7277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14391 - 14309
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14391 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgtgggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 14309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Original strand, 19829 - 19887
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19829 gttgagggtttgataccctaggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 19887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 7)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 102065 - 102184
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  102065 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatggtcaata 102164  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| || ||||||||||    
T  102165 cgttgaaggtttgatgccct 102184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 102163 - 102264
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  102163 tacgttgaaggtttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgggagtgtatttatactcaatatgttgggggcttgatgcc 102262  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  102263 ct 102264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 11086 - 10907
Alignment:
Q  117 gtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaa-gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||    | |||| ||||||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  11086 gtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctgtcagcctttgctcaaacacgttggggacttgatgccctgtgagc----ttttgctcttta 10991  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10990 tcttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctct-tatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 10907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22184 - 22007
Alignment:
Q  119 ccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaa-gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacg 217  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||    | |||| ||||||||||||||||| |     || ||||   ||      
T  22184 ccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctgtgagcctttgctcaaacacgttggggacttgatgccctgtgagc----ttttgctttttatc 22089  T
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22088 ttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctct-tatgttgggggcttgatgccctggattggtacaacatgcatgatt 22007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 102204 - 102287
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  102204 gttgaggacttgatgccctgggagtgtatttatactcaatatgttgggggcttgatgccctggcttggtaccacatgcatgatt 102287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 103900 - 103979
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  103900 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 103979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 103900 - 103960
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  103900 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccct 103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 107)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36839257 - 36839140
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  36839257 agtccatgcatactcatttatgttgagagcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccttgagagtgtatttatgctcaata 36839158  T
Q  216 cgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  36839157 cgttgagggcttgatgcc 36839140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Original strand, 28653471 - 28653588
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  28653471 agtccatgcatactcatttacgttgagg-cttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgatggtttgatgctctgggagtgtatttatgctcaata 28653569  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28653570 cgttgagggcttgatgccc 28653588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24515269 - 24515151
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  24515269 agtccatgcatactcattt-cgctgagggcttgatgccctctgagctttttctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaata 24515171  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  24515170 cattgagggcttgatgccct 24515151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17306570 - 17306452
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||    
T  17306570 agtccatgcatactcatttacgctgaaggcttgatgccttgtgagcttttgct-tttaagttgagggattgatgccctaggagtgtatttatgctcaata 17306472  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17306471 cgttgagggcttgatgccct 17306452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 24835039 - 24835157
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||  ||    
T  24835039 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgtgactgtatttatgctc-tta 24835137  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||||||||||||||||||    
T  24835138 tgttgagggcttgatgccct 24835157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17306473 - 17306372
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17306473 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 17306374  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  17306373 ct 17306372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 28653568 - 28653669
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28653568 tacgttgagggcttgatgccccgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 28653667  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  28653668 ct 28653669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 18391270 - 18391453
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||   |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |  ||||  || || |    
T  18391270 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctataagttgagggcttgatgtcctgtgagcatatt--tggtcta 18391367  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||| ||||||||||||||  |||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18391368 taagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgttgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 18391453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25045096 - 25044917
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||    ||| | || |||||  |    
T  25045096 agtccatgcatactcatttgatgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctct----gtgaaattttgctcttt 25045002  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25045001 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 25044917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 138 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 24515168 - 24515069
Alignment:
Q  138 ttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  24515168 ttgagggcttgatgccctgtgagatttttctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgtcctag 24515069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 36839159 - 36839058
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||    
T  36839159 tacgttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttcatgccctgagagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatacc 36839060  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  36839059 ct 36839058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17306432 - 17306349
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17306432 gttgagggtttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 17306349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 18389257 - 18389437
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||||||    | ||| |||||  |    
T  18389257 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttgcgttgagggctagatgccctgtg---atcttt-tgctcttt 18389352  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||| ||||||||||||||  |||| | ||||| |||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  18389353 aagttgggggcttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 18389437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 28653609 - 28653692
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28653609 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtacaacatgcatgatt 28653692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34136889 - 34136708
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-t 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| || ||||   | |||| || |||||||||||||| |     || ||||||| |    
T  34136889 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg-gagccttcgctcaacacgttgggggcttgatgccctgtgagc----ttttgctcaaat 34136795  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||| |||| |||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34136794 aagttaagggattgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgatt 34136708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3538857 - 3538674
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  ||||  ||||| |    
T  3538857 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgaggactttatgccctgtgagcctatt--tgctcta 3538760  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||| ||  ||||||| ||  |||| |  |||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  3538759 taagttggggatttgatgctctgtgagtatatttatgctatatatgttgggggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgatt 3538674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 24815693 - 24815794
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  24815693 ttacgttgacggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggctcgatgccctattggtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatac 24815791  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  24815792 cct 24815794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Original strand, 24781954 - 24782081
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||  |  ||| | |||||| |||||||||||||    
T  24781954 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgttcaatacgttgggggcttga 24782053  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24782054 tgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 24782081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 1384737 - 1384858
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| |  || ||||||| ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| || ||||||| |||||| || ||||||||||| |    
T  1384737 agtccatgcatactcattaaacttaagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgcgggcttgatgtcctgtgagtatatttatgctcca 1384836  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  1384837 tacgttgggggcttgatgccct 1384858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24515131 - 24515050
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  24515131 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgtcctagattggtaccacatgcatga 24515050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19357983 - 19357883
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| || || |||| ||  ||| |||||||| ||||||    
T  19357983 tttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgctctgtgagtataattatactttatatgttgagggtttgatg 19357884  T
Q  232 c 232  Q
    |    
T  19357883 c 19357883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 24815638 - 24815816
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  24815638 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgataccctgtgagctttggctccttacgttgacggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttta 24815733  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||| |||||||||   ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  24815734 agttgagggctcgatgccctattggtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgataccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 24815816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 23712255 - 23712416
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  23712255 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccc 23712353  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23712354 tgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 23712416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Original strand, 5032415 - 5032540
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5032415 taagttgagggcttgatgccctgagcct--atttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttga 5032512  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | || ||| ||||||||||||||||||||    
T  5032513 taccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 5032540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19358038 - 19357957
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  19358038 agtccatgcatactcattcaaagttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtg 19357957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 43947537 - 43947657
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| ||    
T  43947537 agtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaa 43947635  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  43947636 taagttgagggcttgatgccct 43947657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 5985183 - 5985063
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||| || || |||| ||  ||    
T  5985183 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgattccctgtgagcctttgctctttacgttgagggtttgatgcgctgtgagtataattatactatat 5985084  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  5985083 atgttgagggcttgatgccct 5985063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14693317 - 14693137
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |     || |||||  |    
T  14693317 agtccatgcatactcatttgaagtcgagggcttgatgccctgtgatcatttgctctttacgttgggggcttgatgccttgtgag----cttttgctcttt 14693222  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||  |||||||| ||| |||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  14693221 atgttgagggcttgatgccctgcgagtataattatactatatatgttgagggtttgatgccct-gtttggtaccacatgcatgatt 14693137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 39828225 - 39828309
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39828225 gttgagggcttgatgccctgagagtatatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 39828309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6725915 - 6725754
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||| ||    
T  6725915 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgtcc 6725817  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6725816 tgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 6725754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26392332 - 26392212
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa- 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||  ||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||     
T  26392332 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-aagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaat 26392234  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| ||||||||||    
T  26392233 tacgttgagggtttgatgccct 26392212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 356996 - 356936
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  356996 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 356936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 43947596 - 43947680
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43947596 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 43947680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 357044 - 356914
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgg-gtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggct 268  Q
    |||||||||||| |||||||||||||   || ||||||| |  | || |||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||| |||| |||||    
T  357044 tttaagttgagggcttgatgccctgtaatgtatatttatacatattatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctcaatacgttgagggct 356945  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  356944 tgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 356914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26896271 - 26896208
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26896271 taagttgaggacttgatgccctgtgagcctagttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 26896208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 36839118 - 36839043
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacat 292  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  36839118 gttgagggcttcatgccctgagagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgataccctggatttgtaccacat 36839043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 10743980 - 10744071
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  10743980 tgctctatacgttgggggcttgaagccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgcct--ggttggtaccacatgcatgatt 10744071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Original strand, 21316797 - 21316867
Alignment:
Q  165 tgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21316797 tgctctgtaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctctatacgttgggggcttgatgccct 21316867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 39828166 - 39828286
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||| ||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||| ||    
T  39828166 agtctatgcatactcattaaagtttggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagtatatttatgctcaaa 39828264  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  39828265 taagttgggggcttgatgccct 39828286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 24529854 - 24529938
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529854 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttggtggcttgatgccatggattggtaccacatgcatgatt 24529938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 19202295 - 19202358
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19202295 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 19202358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 19202298 - 19202380
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19202298 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19202380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 23969639 - 23969702
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23969639 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 23969702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24436011 - 24435929
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24436011 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 24435929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24436014 - 24435951
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24436014 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 24435951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27851671 - 27851552
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||   || |||||  | |||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |    
T  27851671 agtccatgcatactcatttaagctgagggcttgatgccctgtgagcctattcgctctaaatgttgggggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctcta 27851574  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  27851573 tacgttgggggcttgatgccct 27851552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 17306512 - 17306454
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  17306512 gttgagggattgatgccctaggagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 17306454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Original strand, 21336787 - 21336857
Alignment:
Q  165 tgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21336787 tgctctgtaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttatgctctatacgttgggggcttgatgccct 21336857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25140899 - 25140846
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25140899 ttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 25140846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25140989 - 25140868
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    ||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |  ||||||| |  |||| ||  |||||||| |||| || ||||||||||| |    
T  25140989 agtccatccatactcattaaagttgagggcttgatgcgctgtgagcctatttgctctatttgttgggggattgatgccttgtgagtatatttatgctcta 25140890  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  25140889 tatgttgggggcttgatgccct 25140868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21115689 - 21115509
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   | |||| || ||||||||||||   | |  |||  |||||||     
T  21115689 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg---gagccttt--gctcaatt 21115596  T
Q  216 c-gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||| || ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21115595 cagttgagggcttgatgcactgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgatt 21115509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25108809 - 25108709
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  25108809 acgttgggggcttgatgccct-tgagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 25108711  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  25108710 ct 25108709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9974886 - 9974826
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  9974886 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 9974826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 18547214 - 18547298
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18547214 gttgagtgcttgatgccccgagagtgttttaatgctcaaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 18547298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 6478341 - 6478404
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6478341 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 6478404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 9974883 - 9974801
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  9974883 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 9974801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 21316807 - 21316889
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  21316807 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctctatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccagatgcatgatt 21316889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 21336797 - 21336879
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21336797 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttatgctctatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 21336879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 22413406 - 22413485
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22413406 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22413485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24883423 - 24883360
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  24883423 taagttgagggcttgatgcactgtgagcctatttacactcaatacgttgagggcttgatgccct 24883360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 27860386 - 27860267
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   || |||||  | |||| || |||||||||||||| |  | ||  ||||| |    
T  27860386 agtccaagcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctattcgctctaaatgttgggggcttgatgccctgtgagcctctt--tgctcta 27860289  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||    
T  27860288 tacgttgggggcttgatgccct 27860267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 44071565 - 44071440
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgat 272  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||     || ||||| ||||||||||||||||||    
T  44071565 aagttgagggtttgatgccctgtgagcccttttgtgctctatacgttgagggcttgatgccttatgagccct-ttgtgctctatatgttgggggcttgat 44071467  T
Q  273 gccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  44071466 gctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 44071440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 183 - 296
Target Start/End: Original strand, 1384766 - 1384876
Alignment:
Q  183 cttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggatt 282  Q
    |||||||||||||| |  |||||  |||| ||| |||| |||||||||| |||  |||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  1384766 cttgatgccctgtgagcctattt--gctctataagttgcgggcttgatgtcctgtgagtatatttatgctccatacgttgggggcttgatgccct-gatt 1384862  T
Q  283 ggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||    
T  1384863 ggtaccacatgcat 1384876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5985126 - 5985041
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||| ||||||| ||  |||| | ||||| ||  |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5985126 tacgttgagggtttgatgcgctgtgagtataattatactatatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 5985041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 18547174 - 18547275
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||||| | | |||| || |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18547174 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagtgcttgatgccccgagagtgttttaatgctcaaatacgttgagggcttgatgc 18547272  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  18547273 cct 18547275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 21367821 - 21367751
Alignment:
Q  165 tgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || |  ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  21367821 tgctctgtaagttgagggcttgatgccctatgagcctatttatgctctatacgttgtggggttgatgccct 21367751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 24515211 - 24515153
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  24515211 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatacattgagggcttgatgcc 24515153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 6576258 - 6576217
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6576258 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 6576217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 20520465 - 20520506
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20520465 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 20520506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 22413366 - 22413466
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  22413366 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgcc 22413464  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  22413465 ct 22413466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22689725 - 22689684
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22689725 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 22689684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22694321 - 22694280
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22694321 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 22694280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 23791163 - 23791063
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||||   || |||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  23791163 gttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaattaagttgagggctttatgccctgcaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccct 23791065  T
Q  236 ag 237  Q
    ||    
T  23791064 ag 23791063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24436098 - 24436057
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  24436098 agtccatgcatactcatttaagttgaaggcttaatgccctgt 24436057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 24781847 - 24781888
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24781847 agtccatgcatactcatttatgttgagggcttgatgccctgt 24781888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 7679431 - 7679391
Alignment:
Q  256 tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7679431 tatgttgggggctttatgccctggattggtaccacatgcat 7679391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 21237624 - 21237540
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| |||||  |||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21237624 gttgagggcttgacgccctcagagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggaatggtaccacatgcatgatt 21237540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22689638 - 22689578
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22689638 gttgagggcttgattccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 22689578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22694234 - 22694174
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| |||||| ||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22694234 gttgagggcttgattccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 22694174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 26392273 - 26392193
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||| | |||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26392273 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaattacgttgagggtttgatgccctggattggtaccatatgcat 26392193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 18787172 - 18787251
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18787172 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 18787251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 232
Target Start/End: Original strand, 21336699 - 21336766
Alignment:
Q  165 tgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||| |||| |  ||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  21336699 tgctctgtaagttgagggtttgatgccttgtgagcctatttatgctctaaacgttgagggcttgatgc 21336766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21367811 - 21367733
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |  |||||||| ||| |||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  21367811 gttgagggcttgatgccctatgagcctatttatgctctatacgttgtggggttgatgccctgg-ttggtaccacatgcat 21367733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22336940 - 22336905
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22336940 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22336905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22689638 - 22689556
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||| ||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  22689638 gttgagggcttgattccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgtatgatt 22689556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 298
Target Start/End: Original strand, 24697838 - 24697877
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24697838 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga 24697877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 24835098 - 24835179
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  || |||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24835098 gttgagggtttgatgccctgtgactgtatttatgctct-tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 24835179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26896268 - 26896186
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| |||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26896268 gttgaggacttgatgccctgtgagcctagttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 26896186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 233
Target Start/End: Original strand, 10743978 - 10744048
Alignment:
Q  163 tttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||| || |||| || ||||| |||||||| || ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  10743978 tttgctctatacgttgggggcttgaagccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgcc 10744048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23791088 - 23791042
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  23791088 aatacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 23791042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 36839198 - 36839140
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36839198 gttgagggcttgatgccttgagagtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 36839140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 44071584 - 44071505
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc----ttttgctctttaagttgaggacttgatgcc 191  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||    || |||||| || ||||||| |||||||||    
T  44071584 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcccttttgtgctctatacgttgagggcttgatgcc 44071505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 5032331 - 5032368
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5032331 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 5032368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 18787132 - 18787232
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  18787132 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgcc 18787230  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  18787231 ct 18787232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22258887 - 22258847
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22258887 gttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 22258847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 300
Target Start/End: Original strand, 23969771 - 23969819
Alignment:
Q  251 ctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  23969771 ctcaatacgttggggacttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 23969819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24367570 - 24367533
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24367570 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 24367533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Original strand, 24688558 - 24688639
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24688558 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgaaggcttaatgccctggattggtaccacatgcatga 24688639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 24883386 - 24883338
Alignment:
Q  251 ctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  24883386 ctcaatacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 24883338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24883507 - 24883466
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  24883507 agtccatgcatactaatttaagttgagggcttgatgccctgt 24883466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25085366 - 25085326
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25085366 gttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 25085326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 25587815 - 25587863
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25587815 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 25587863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9974970 - 9974930
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctg 156  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9974970 agtccatgcatacccatttaagttgagggcttgatgccctg 9974930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22500798 - 22500759
Alignment:
Q  260 ttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22500798 ttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 22500759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22508732 - 22508693
Alignment:
Q  260 ttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22508732 ttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 22508693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22694234 - 22694159
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatg 293  Q
    |||||||||||||| ||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  22694234 gttgagggcttgattccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatg 22694159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Original strand, 24697778 - 24697857
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  24697778 agtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 24697857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 19110 - 19229
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |  |||||||||||||||||    
T  19110 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctaggattgtatttatgctcaata 19209  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||||||||||||||||||    
T  19210 tgttgagggcttgatgccct 19229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Original strand, 19126 - 19252
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggctt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |     || |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  19126 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagc----ttttgctctttaagttgagggcttgatgccctaggattgtatttatgctcaatatgttgagggctt 19221  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19222 gatgccctggattggtaccacatgcatgatt 19252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 103)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 133 - 300
Target Start/End: Original strand, 23083296 - 23083461
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  23083296 ttacgttgaggggttgatgccctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 23083394  T
Q  233 cctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23083395 cctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 23083461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17743149 - 17742964
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa- 213  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| | | || |||| ||||||||     
T  17743149 agtccatgcatacccatttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccccgggagtatattaatgctcaaa 17743051  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||||||||||||||| |||||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17743050 taagttgagggcttgatgctctaggagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 17742964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 27126446 - 27126565
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||    
T  27126446 agtccatgcatactcatttgagttgagggcttgatgccctgtgagctttttctctttaagttcagggcttgatgccctggaagtgtatttatgctcaata 27126545  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  27126546 tgttgggggcttgatgccct 27126565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 7825631 - 7825530
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  7825631 tacgttgagggcttgatgtcctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 7825532  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  7825531 ct 7825530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7825729 - 7825614
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||| | || | || |||||||||||||||    
T  7825729 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgttctatgagctgttgctctttaagttgagggcttgatgtcatgggagtatatttatgctcaata 7825630  T
Q  216 cgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  7825629 cgttgagggcttgatg 7825614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17105642 - 17105525
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  17105642 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaaca 17105545  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17105544 cgttgagggcttgatgccct 17105525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 17229827 - 17230006
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||| |    |||| ||||  ||    
T  17229827 agtccatccatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctatatacgttgagggcttgatgccctgtgag---cttta-gctcttta 17229922  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||| |||||| |||| |  ||||||||  ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17229923 tgttgagggcttgaagccctatgagtatatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatt 17230006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20136618 - 20136440
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |   |||| |||||  ||    
T  20136618 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgttagcttttgatctatacgttgagggcttgatgccctgtgag---attt-tgctcttta 20136523  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20136522 tgttgagggcttgatgccctgtgagggtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20136440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 22196251 - 22196429
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||| |   |||| |||||  ||    
T  22196251 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgttagcttttgatctatacgttgagggcttgatgccctgtgag---attt-tgctcttta 22196346  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||| ||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22196347 tgttgagggcttgatgccctgtgagggtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 22196429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7825590 - 7825507
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  7825590 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattgataccacatgcatgatt 7825507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 18260176 - 18260292
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | ||    
T  18260176 agtccatgcatactcattaa-gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgacgccctgtgagtgtatttatgct-atta 18260272  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||||||||||||||||||    
T  18260273 tgttgagggcttgatgccct 18260292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Original strand, 23528278 - 23528453
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgtt 219  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||||    ||||||| |||||||||||||| |     || |||||  || |||    
T  23528278 catgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagatttttctctactcgttgagggcttgatgccctgtgagc----ttttgctctttaggtt 23528373  T
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||| |  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23528374 gagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctct-tatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 23528453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23538616 - 23538499
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| ||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |    
T  23538616 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgcactg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaaca 23538519  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23538518 cgttgagggcttgatgccct 23538499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 19656511 - 19656603
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19656511 tgctcaataagttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctggattgataccacatgcatgatt 19656603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23538412 - 23538320
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23538412 tgctcaatattttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 23538320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 19656307 - 19656420
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||  |||||||  |||||||||| ||||||||| || | |||||||||||||||| |    
T  19656307 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg-gagactttgctcaataagttgagggcttgatgccttg-gagtgtatttatgctcaaca 19656404  T
Q  216 cgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||||||    
T  19656405 cgttgagggcttgatg 19656420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 20411796 - 20411897
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  20411796 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgtcctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 20411894  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  20411895 cct 20411897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 20411741 - 20411919
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  20411741 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctc-tt 20411834  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||| |||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  20411835 atgttgagggcttgatgtcctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 20411919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22556282 - 22556097
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||  || |    
T  22556282 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagaacttgatgccttgtgagcctatttactct-a 22556184  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     || |||||||||||||||||||  |||| |  ||||| || |||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22556183 ttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgttctatatattgggggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 22556097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 290
Target Start/End: Original strand, 27573271 - 27573445
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||   |||||||||| |||||||||||    || |||||| |||| ||    
T  27573271 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccctagaagtctatttacgctcaaa 27573369  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccac 290  Q
     | |||||||| |||||||||||||||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27573370 gaagttgagggtttgatgccctaggagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccac 27573445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 22376857 - 22377034
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  ||| |||||||  ||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  22376857 agtccatgcatactcattga-gttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctacttatgttgagggattgatgccctgtgag----cttttgctc-tta 22376950  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22376951 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggattgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 22377034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Original strand, 27126509 - 27126588
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  27126509 agggcttgatgccctggaagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccctggattcgtaccacatgcatgatt 27126588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 31735874 - 31735993
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||      
T  31735874 agtccatgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgcgcctatt--tgctctt 31735971  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  31735972 taagttgagggcttgatgccct 31735993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 15705824 - 15705918
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  15705824 tgctcaataagttgagggcttgttgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattgttaccacatgcatgatt 15705918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15895877 - 15895700
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  15895877 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccccgtgagcctttgctccttaatttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctc-tta 15895783  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgat 299  Q
     |||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||    
T  15895782 tgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgtatgat 15895700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Original strand, 23083242 - 23083395
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  23083242 agtccatgcatactcattga-gttgagggcttaatgccctgtgagcctttgctccttacgttgaggggttgatgccctgtgag----cttttgctc-tta 23083335  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  23083336 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgcc 23083395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 23492265 - 23492382
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacg 217  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  23492265 catgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgaacctatttactctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatacg 23492364  T
Q  218 ttgagggcttgatgccct 235  Q
    | | ||| ||||||||||    
T  23492365 tcgggggtttgatgccct 23492382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 120 - 235
Target Start/End: Original strand, 23497863 - 23497980
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacg 217  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| | |  || ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||    
T  23497863 catgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgaacctatttactctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatacg 23497962  T
Q  218 ttgagggcttgatgccct 235  Q
    | | ||| ||||||||||    
T  23497963 tcgggggtttgatgccct 23497980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17105516 - 17105425
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17105516 tgctcaatattttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 17105425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 22212526 - 22212622
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||    
T  22212526 tacgttgagggcttgatgccccgtgagcctttgctctttgagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc-ttaagttgagggcttgatg 22212622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23538519 - 23538421
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23538519 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataatttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaacacgttgagggcttgatgccc 23538422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 120 - 300
Target Start/End: Original strand, 18177847 - 18178022
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgtt 219  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||  ||||    ||| ||| |||||||||||||| |     || |||||  ||||||    
T  18177847 catgcatactcatttatgttgagggtttgatgccctgtgagctttcactctacccgttaagggcttgatgccctgtgagc----ttttgctctttacgtt 18177942  T
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||| |  |||| |  ||||||||  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  18177943 gagggcttgatgccttgtgagtatatttatgctct-tatgttgagggcttgattccctggattggtaccacatgcatgatt 18178022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18453077 - 18452988
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18453077 aataagttgaaggcttgatgccctgggagcgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 18452988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25714341 - 25714212
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttg 270  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||||| || |||||||| ||||||| || ||||  |  ||| |||||| |||||||||||||||    
T  25714341 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttgagggtttgatgctctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggcttg 25714242  T
Q  271 atgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25714241 atgccctggattggtaccacatgcatgatt 25714212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17105545 - 17105447
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17105545 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaatattttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccc 17105448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 19656482 - 19656580
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |||  ||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19656482 acgttgagggcttgatgttctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccc 19656579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23538441 - 23538343
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||  |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23538441 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaatattttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccc 23538344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Original strand, 20557169 - 20557296
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||||| || ||| ||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| |||||||||||||    
T  20557169 ttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttaagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggct 20557268  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20557269 tgatgccctggattggtaccatatgcat 20557296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1595469 - 1595308
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  1595469 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccc 1595371  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |  |||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1595370 tgagagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 1595308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16493097 - 16492917
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat- 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   | |||| || ||||||||||||   | |  |||  |||||||     
T  16493097 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg---gagccttt--gctcaatt 16493004  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16493003 aagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 16492917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18453131 - 18453011
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||| | |||||||||||| | | |||||||||||| ||    
T  18453131 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcttttgctcaaataagttgaaggcttgatgccctgggagcgtatttatgctcaaa 18453033  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  18453032 taagttgggggcttgatgccct 18453011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 20078439 - 20078522
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctc-aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  20078439 gttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagtt-ggggcttgatgtcctagattggtaccacatgcatgatt 20078522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23500739 - 23500619
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||   |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |  ||||   ||||      
T  23500739 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--cgctctt 23500642  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgcccta 236  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  23500641 taagttgagggcttgatgcccta 23500619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16245284 - 16245107
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||| ||||||| ||  ||||| | |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  16245284 agtccatgcatactcattcaagttgagggtttgatggcctgtgagcctttgctccttgcgttgaaggcttgatgccctgtgag----cttttgctc-tta 16245190  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||  | ||| ||  ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16245189 tgttgagggcttgatgccctatgagtgtattaatgatc-ttatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 16245107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Original strand, 18896537 - 18896635
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  18896537 acgttgggggcttgatgccctg-gagcttttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatgctcaaatacgttgagggcttgatgc 18896635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 19362279 - 19362197
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |  | ||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19362279 gttgagggattgatgccctaggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga 19362197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 211
Target Start/End: Original strand, 19829966 - 19830043
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||    
T  19829966 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgctctgtgaatgtatttatgctc 19830043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 15705795 - 15705895
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||| || |||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  15705795 acgttgagggattgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgttgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgcc 15705893  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  15705894 ct 15705895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18203970 - 18203910
Alignment:
Q  136 cgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  18203970 cgttaagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccttgtg 18203910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25688421 - 25688337
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25688421 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttaatgccctggattggtaccacatgcatgatt 25688337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18708461 - 18708332
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||  |  ||| |||||||| |||||||| ||||    
T  18708461 taagttgaggtcttgatgctctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccttgtgagcctatttacgctcaatacgttggggg-ttga 18708363  T
Q  272 tgccttggattg--gtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| |||  || ||||||||||||||    
T  18708362 tgccctggtttgtagtcccacatgcatgatt 18708332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 17105594 - 17105522
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttgga 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  17105594 tgctcaataagttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaacacgttgagggcttgatgccctgga 17105522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23538568 - 23538496
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttgga 280  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  23538568 tgctcaataagttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaacacgttgagggcttgatgccctgga 23538496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 18204028 - 18203980
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttt 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  18204028 agtccatgcatactcatttatgttgagggtttgatgccctgtgagcttt 18203980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 19656404 - 19656498
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||| ||| |||| |||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||  |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19656404 acgttgagggcttgatgtcctg-gagcctttgctcaataaattgagggcttgatgcccta-gattgtatttatgctcaacacgttgagggcttgatg 19656498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 19957919 - 19958039
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||| |  ||||||| || || ||||||||||   |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||     
T  19957919 agtccatgcatactcattaaatttgagggtttgataccctgtgagcctatttgttctattaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctct 19958016  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19958017 atacgttgggggcttgatgccct 19958039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 23492280 - 23492404
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgat 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||  |||  || |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||| || ||||| |||||    
T  23492280 aagttgagggcttgatgccctgtgaacctattta--ctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatacgtcgggggtttgat 23492377  T
Q  273 gccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23492378 gccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 23492404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 173 - 300
Target Start/End: Original strand, 23497878 - 23498002
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgat 272  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    ||||||  |||  || |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||| || ||||| |||||    
T  23497878 aagttgagggcttgatgccctgtgaacctattta--ctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatacgtcgggggtttgat 23497975  T
Q  273 gccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23497976 gccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 23498002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 35008002 - 35007918
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| || || |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35008002 gttgagggcttgatgccctagaagtatattaatgcttaaatacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgatt 35007918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 16133727 - 16133790
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16133727 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttactctcaatacgttgggggcttgatgccct 16133790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 19303802 - 19303837
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303802 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 19303837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 19444337 - 19444400
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19444337 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacactcaatacgttgggggcttgatgccct 19444400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 214 - 300
Target Start/End: Original strand, 18260230 - 18260314
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||  ||||||| | ||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  18260230 tacgttgagggcttgacgccctgtgagtgtatttatgct-attatgttgagggcttgatgccctcg-ttggtaccacatgcatgatt 18260314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19362319 - 19362218
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat-acgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||  | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19362319 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggattgatgccctaggagtatattaatgctcaattacgttgagggcttgatgc 19362221  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  19362220 cct 19362218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25656594 - 25656548
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25656594 aatacgttgggggcttgattccctggattggtaccacatgcatgatt 25656548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 25957079 - 25957128
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25957079 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 25957128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18708545 - 18708504
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18708545 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 18708504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 263 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22805562 - 22805525
Alignment:
Q  263 ggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22805562 ggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 22805525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 23538490 - 23538418
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttgga 280  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||| ||||    
T  23538490 tgctcaataatttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaacacgttgagggcttgatgccctgga 23538418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 132 - 194
Target Start/End: Original strand, 31735930 - 31735994
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||| || |  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31735930 tttaagttgagggcttgatgccctgtgcgcctatttgctctttaagttgagggcttgatgccctg 31735994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 297
Target Start/End: Original strand, 6083809 - 6083899
Alignment:
Q  205 tatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||  | ||||||||  ||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6083809 tatgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagcct-attatgctttatacgttaggggcttgatgcctt-gattggtaccacatgcatg 6083899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 18319588 - 18319509
Alignment:
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| || ||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  18319588 gagggcttgatgctcttggagcctatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacattcatgatt 18319509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 18896577 - 18896661
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||   ||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18896577 gttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatgctcaaatacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatgatt 18896661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19668263 - 19668161
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || ||  |||||||||||||||||||||    
T  19668263 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatactttatacgttgagggcttgatgcc 19668165  T
Q  234 ctag 237  Q
    ||||    
T  19668164 ctag 19668161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 20361224 - 20361259
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20361224 tgggggcttgatgccttgtattggtaccacatgcat 20361259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 23017181 - 23017244
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  23017181 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgcttaatacgttgagagcttgatgccct 23017244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 231
Target Start/End: Original strand, 23017246 - 23017305
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  23017246 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatg 23017305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 25629659 - 25629694
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25629659 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 25629694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25644190 - 25644111
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | || || | || |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25644190 gttgagggcttgatgccctagaagtatattaatacttattacgttgagggcatgatgccctggattggtaccacatgcat 25644111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29060355 - 29060320
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29060355 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 29060320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 273
Target Start/End: Original strand, 19656355 - 19656420
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatg 273  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||    
T  19656355 tgctcaataagttgagggcttgatg-ccttggagtgtatttatgctcaacacgttgagggcttgatg 19656420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22117743 - 22117697
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  22117743 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtacgacatgcatgatt 22117697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 298
Target Start/End: Original strand, 22212469 - 22212646
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||   || ||||||| |||||||||| ||| |      | |||||  |    
T  22212469 agtccacgcatactcatttaagttgagggcttgatgccatgtgagcctttactcaaatacgttgagggcttgatgccccgtgag----cctttgctcttt 22212564  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
      |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||| ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||    
T  22212565 gagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc-ttaagttgagggcttgatgttctgg-ttggtaccacatgcatga 22212646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 31733673 - 31733624
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  31733673 gctcaatacgttgggggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 31733624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 33442996 - 33442919
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   | |||| || ||||||||||||    
T  33442996 agtccatgcatactcatttatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg 33442919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 9100883 - 9100920
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9100883 gttgagggcttgataccttggattggtaccacatgcat 9100920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 16448854 - 16448891
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16448854 gttgggggcttgatgccctggattggtaccatatgcat 16448891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19234331 - 19234283
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19234331 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 19234283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 19652004 - 19651967
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19652004 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 19651967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 19829911 - 19829991
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||| ||||||||| |||| | ||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  19829911 agtctatgcatacttatttgaagttgagggcttgatgctctatgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtg 19829991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 20108945 - 20108908
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20108945 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 20108908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20223754 - 20223713
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20223754 gttgagggcttgatgccctggattggtacgacatgcatgatt 20223713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 23017097 - 23017134
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23017097 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 23017134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 23017249 - 23017331
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatg-ccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  23017249 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgtccttg--ttggtaccacatgcatgatt 23017331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 25920555 - 25920507
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25920555 tatgctctatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 25920507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 235
Target Start/End: Original strand, 25957049 - 25957106
Alignment:
Q  178 gaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||| |||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25957049 gagggcttgatgctctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 25957106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 27323625 - 27323666
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  27323625 agtccatgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctgt 27323666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 30674485 - 30674533
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30674485 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 30674533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Original strand, 27328998 - 27329037
Alignment:
Q  260 ttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27328998 ttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 27329037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 300
Target Start/End: Original strand, 27389738 - 27389777
Alignment:
Q  260 ttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27389738 ttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 27389777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 220 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27850870 - 27850795
Alignment:
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||| ||| |||  |  ||| |||||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  27850870 gagggcttgatgctctatgagcctatttacgctcaatatgttgggtacttgatgccctgg-ttggtaccacatgcat 27850795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31733709 - 31733649
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31733709 taagttgagggattgatgccatgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 31733649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 33442852 - 33442816
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  33442852 gggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatt 33442816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold1662
Description:

Target: scaffold1662; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 390 - 509
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |  |||||||||||||||    
T  390 agtccattcatactcatttacgttgagggcttggtgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgtcctgggagcttatttatgctcaata 489  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  490 cgttgagggcttgatgccct 509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 134 - 220
Target Start/End: Original strand, 488 - 574
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttg 220  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  488 tacgttgagggcttgatgccctgtgagattttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttg 574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1662; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 529 - 611
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  529 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgtt-ggggtttgattccctggattggtaccacatgcatgatt 611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10920 - 10801
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||    
T  10920 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgttcaata 10821  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||| ||| ||||| ||||    
T  10820 tgttggggggttgatcccct 10801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10861 - 10778
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  10861 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgttcaatatgttggggggttgatcccctggattggtaccacatgcatgatt 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 63309 - 63409
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  63309 acgttgagggcttgatgccctgtgaccttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccc 63408  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  63409 t 63409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 63349 - 63432
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  63349 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgagggcttgatgccctggattggtacgacatgtatgatt 63432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 63192 - 63292
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | | ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  63192 acgttgagagcttgatgtcatgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatttcctgggagcgtatttatgcttaatatgttgagggcttgatgccc 63291  T
Q  235 t 235  Q
    |    
T  63292 t 63292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 280
Target Start/End: Original strand, 63136 - 63295
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||| |||||||   | ||||||  ||||||| | |||| |     || |||||  ||    
T  63136 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccttg-gagcctttgctcaacacgttgagagcttgatgtcatgtgag----cttttgctcttta 63230  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttgga 280  Q
     ||||||||||||||  ||| |||| ||  ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  63231 agttgagggcttgatttcctgggagcgtatttatgcttaatatgttgagggcttgatgccctgga 63295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 3)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 76001 - 76179
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |||||||||| |     || |||||  ||    
T  76001 agtccatgcatactgatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctatacgttgagggcttaatgccctgtgag----cttttgctcttta 76096  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  76097 tgttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 76179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Original strand, 66044 - 66209
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  ||||||| || |||| || ||||||||| |||| |  |||||  |||| ||| |||| ||||||||||    
T  66044 tacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctatatgttgggggcttgatgccttgtgagcctattt--gctctataagttgggggcttgatg 66141  T
Q  232 ccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  66142 ccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 66209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 278
Target Start/End: Original strand, 65945 - 66106
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| ||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |  ||||  |||||     
T  65945 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgctctgtgagcctatttgctctattaagttgaggccttgatgccctctgagcttatt--tgctct 66042  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttg 278  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||  | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  66043 atacgttgagggcttgatgccctgtgagcct-att-tgctctatatgttgggggcttgatgccttg 66106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0630
Description:

Target: scaffold0630; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 132 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8134 - 8034
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  8134 tttacgttgagggcttaatgctctgtgagcttttgctctttaagttgatggcttgatgctctgtgagtgtatttatgctctatatgttgagggcttgatg 8035  T
Q  232 c 232  Q
    |    
T  8034 c 8034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0630; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 149 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8155 - 8009
Alignment:
Q  149 atgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgatta 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||| |     || |||||  || ||||| |||||||||| ||  ||||||  |||    
T  8155 atgccctgtgagcttttgctctttacgttgagggcttaatgctctgtgagc----ttttgctctttaagttgatggcttgatgctctgtgagtgtattta 8060  T
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  8059 tgctctatatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 8009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 7)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 596 - 415
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-t 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||    | | || || |||||||||||||| |   |||| ||||||| |    
T  596 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctttgcttaacacgctgggggcttgatgccctgtgag---attt-tgctcaaat 502  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  501 aagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 6872 - 6783
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6872 aataagttaagggcttgatgccctgggtgtgtatttatgctcaaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 6783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 232
Target Start/End: Original strand, 127439 - 127536
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || ||||||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| || ||| |||| ||| |||||||    
T  127439 gttgagggcttgatgccctgtgagcttattttctctttaagttgagggcttgatgccctgcgagtatatttatgatctatatgttgggggtttgatgc 127536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 136 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6907 - 6806
Alignment:
Q  136 cgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||   |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  6907 cgttgggggcttgatgccctgtgagattttgctcaaataagttaagggcttgatgccctgggtgtgtatttatgctcaaatatgttgggggcttgatgcc 6808  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  6807 ct 6806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 127377 - 127561
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||||| |  ||||| |  || ||||||| |||||||||||||| |  |||||   |||     
T  127377 agtccatgcatactcatttaagtagatggcttgattccctgtgagcctatttgctgtactatgttgagggcttgatgccctgtgagcttatttt--ctct 127474  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     || |||||||||||||||||||  |||| |  ||||| || |||||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||||||    
T  127475 ttaagttgagggcttgatgccctgcgagtatatttatgatctatatgttgggggtttgatgctctgg-ttggtatcacatgcatgatt 127561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 207 - 235
Target Start/End: Original strand, 117847 - 117875
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  117847 tgctcaatacgttgagggcttgatgccct 117875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Original strand, 117854 - 117957
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| |||||| ||||    || |||| || || || ||||||||||||||||||    
T  117854 tacgttgagggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgataccctagaagtatattaatacttaacacgttgagggcttgatgc 117952  T
Q  233 cctag 237  Q
    |||||    
T  117953 cctag 117957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15406 - 15228
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  15406 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttcatgccctgtgagcttttgctctttacgttggaggcttgatgccctgtgag----cttttgctctcta 15311  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  15310 agttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgggggcttgatgccctgga-tggtaccacatgcatgatt 15228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 116 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 24256 - 24080
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |      | |||||  ||    
T  24256 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgag----cctttgctcctta 24161  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgat 299  Q
     ||||||||| |||||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  24160 agttgagggcctgatgccct--gagtatatttatgctctatatgttgggggcttcatgccctgg-ttggtaccacatgcatgat 24080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 138 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7382 - 7221
Alignment:
Q  138 ttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| || || |||| |||  || |||| ||| ||||||||||      
T  7382 ttgagggcttgatgccctgtgagcttttactctttaagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgggggtttgatgccctct 7283  T
Q  238 gagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7282 gagtgtatttatgctcgttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 7221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7443 - 7362
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || | ||| |||||||| ||  |||||| ||||||||||||||    
T  7443 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctttcagcatttgctctatacattgagggcttgatgccctgtg 7362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 134 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1440 - 1275
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| |||  || |||||||||||||||||    
T  1440 tacgttgagggcttgatgctctgtgagatttttctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgcc 1341  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||  ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||    
T  1340 ctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatcccctgg-ttggtaccacatacatgatt 1275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4664 - 4583
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
T  4664 agtccatgcatactcatttcaagttgagggcttgatgctctgtgagcctttgctctatatgttgagggcttgatgccctgtg 4583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 1497 - 1341
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| | |||||| |||||||| || ||||||| |||||||| ||||| |   |||| | |||  |    
T  1497 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctcagtgagcctttgctctatacgttgagggcttgatgctctgtgag---attt-ttctcttt 1402  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||  ||||||| ||||||||||||    
T  1401 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctttatgttgagggcttgatgcc 1341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4604 - 4562
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttga 179  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4604 gttgagggcttgatgccctgtgagcgtttgctctttaagttga 4562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 66113 - 65934
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |  ||||||| ||||||| || | ||||||| |||| |  |||||  |||| |    
T  66113 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttgctctataagttgggggcatgatgccatgtgagcctattt--gctcta 66016  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  66015 tacgttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcat 65934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 17527 - 17562
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17527 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 17562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 56824 - 56706
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||| ||||||| | |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||    
T  56824 agtccatgcagactcattcatgttgggggcttgttgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-tta 56726  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||| ||||||||||||||    
T  56725 tgttgggggcttgatgccct 56706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 56765 - 56684
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  56765 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctct-tatgttgggggcttgatgccctgga-tggtaccacatgcatgatt 56684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 25775 - 25958
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc----ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||      || |||||  || |||||| ||||||||||||||| ||    || |||||    
T  25775 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttgatgctctgggattgtatttatgctcaatacgttgagaacttgatgccctgtgagt----ttttgctc 25870  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
      || ||||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  25871 tttaagttgaggtcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaatatgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatgatt 25958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 79)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10953010 - 10952908
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  10953010 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgc 10952911  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  10952910 cct 10952908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 20470085 - 20470268
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgag-ct-tttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| || |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |  ||||  ||||| |    
T  20470085 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctatgagtctatttgctctataagttgagggcttgataccctgtgagcctatt--tgctcta 20470182  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgc-cttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||| ||||||||||||||  |||| |   ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  20470183 taagttgggggcttgatgccctgtgagtatatctatgctctatatgttgagggcttgatgctcttg--ttggtaccacatgcatgatt 20470268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 132 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 20565453 - 20565348
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||| ||||||| |||    
T  20565453 tttacgttgatggcttgatgctctgtgagcttttgctctttaagttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttaagggcttcatg 20565354  T
Q  232 ccctag 237  Q
    ||||||    
T  20565353 ccctag 20565348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10953065 - 10952886
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  10953065 agtccatgcatactcattttaagttgagggtttgctgccctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctcttt 10952971  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10952970 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 10952886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 25578299 - 25578383
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25578299 gttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 25578383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15796370 - 15796191
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    |||||||  ||||||||||||| |      | ||||| |      
T  15796370 agtccatgcatactcatttatgtttagggcttgatgccctgtgagcttttgctctacccgttgagggtttgatgccctgtgag----cctttgctctact 15796275  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |  |||| |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15796274 cgttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatactc-ttatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 15796191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 137 - 300
Target Start/End: Original strand, 2154856 - 2155021
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  2154856 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccc 2154954  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||  |  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2154955 tgggagcctatttatgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 2155021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 25574733 - 25574817
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25574733 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 25574817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25742921 - 25742804
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||| || |  ||||  |||||  ||    
T  25742921 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagccattgctctttacgttgagggcttgatgccctatgagcctatt--tgctcttta 25742824  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
     |||||||||||||||||||    
T  25742823 agttgagggcttgatgccct 25742804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 25250851 - 25251035
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||  || ||||||| |||||||||||||| |  |||||  ||||     
T  25250851 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttactctaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctattt--gctct 25250948  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
      | |||||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  25250949 tcaagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgataccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 25251035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 25314636 - 25314820
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |  || ||||  || ||||||| |||||||||||||| |  |||||  ||||     
T  25314636 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttactctaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctattt--gctct 25314733  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
      | |||||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  25314734 tcaagttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgataccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 25314820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Original strand, 11581442 - 11581604
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||| |||||||| | |  |||||| ||||||   | |||||||||||||||||    
T  11581442 gttgggggcttgatgccct-tgagcctttgctcacttaagttgagggcttcatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgcc 11581540  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    || ||||  |  ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11581541 ctgggagcctatttacgctcaaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 11581604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20565508 - 20565328
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  20565508 agtccatgcatactcatttaaagttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctttacgttgatggcttgatgctctgtgag----cttttgctcttt 20565413  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||  |||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  20565412 aagttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttaagggcttcatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 20565328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 117 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 23469751 - 23469571
Alignment:
Q  117 gtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-ta 215  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||| |||||||  |||| |||||||   | |||| || |||||||||||||| |     || ||||||| ||    
T  23469751 gtccatgcatactcatataagttgggggcttgatgcccta-gagcctttgctcaacatgttgggggcttgatgccctgtgagc----ttttgctcaaata 23469657  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |  | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23469656 agttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagaagagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 23469571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 25575926 - 25576010
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25575926 gttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagtttagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 25576010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Original strand, 6551466 - 6551646
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||||| || ||  ||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||    
T  6551466 agtccatgcatacttatctaaagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctc 6551563  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
     ||| |||| ||||||||||| ||  |||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6551564 tataagttgggggcttgatgctctgtgagtatatttatgctctatacgtt-ggggcttgatgcctt-gattggtaccacatgcat 6551646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 23202700 - 23202882
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaa-gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa- 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||    | |||| || |||||||||||||| |     || |||||||     
T  23202700 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatgccctgtgagc----ttttgctcaaa 23202794  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctc-aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23202795 taagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgatggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatt 23202882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 25742867 - 25742786
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||    
T  25742867 tttacgttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctc 25742786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 21406627 - 21406708
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| |||||    
T  21406627 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctatacgttgagggcttgatgctctgtg 21406708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14048006 - 14047880
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggctt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||   | ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || |||||||||||    
T  14048006 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggctt 14047907  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14047906 gatgccctggattggtaccacatgcat 14047880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29914384 - 29914302
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  29914384 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtg 29914302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 36509768 - 36509946
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| ||||||||||||| | | || ||||||| |||||||| ||||| |   |||| |||||  |    
T  36509768 agtccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgcactgtgagcttttgttgtatatgttgagggcttgatgctctgtgag---attt-tgctct-t 36509862  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36509863 atgt-gaggggttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggtttgatgtcttgg-ttggtaccacatgcatgatt 36509946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22412106 - 22411946
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||| || || ||||||||||||||||||    
T  22412106 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctaaaataagttgagggcttgatgccc 22412008  T
Q  235 taggagtgtgattatgctc-aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22412007 tgggagcctatttacgctcaaatacgtt-ggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22411946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 21809751 - 21809931
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat- 214  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   | |||| || ||||||||||||   | |  |||  |||||||     
T  21809751 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg---gagccttt--gctcaatt 21809844  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21809845 aagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcccaggattggtaccacatgcatgatt 21809931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Original strand, 25574729 - 25574794
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  25574729 ttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 25574794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 21732196 - 21732280
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21732196 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgcccaggattggtaccacatgcatgatt 21732280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Original strand, 25578259 - 25578358
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  25578259 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgc 25578357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25743671 - 25743591
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| ||||    ||||||| ||||||||||||||    
T  25743671 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctatgagtttttactctacccgttgagggcttgatgccctgtg 25743591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 296
Target Start/End: Original strand, 20918271 - 20918350
Alignment:
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20918271 ttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 20918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Original strand, 13536477 - 13536530
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13536477 ttatgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 13536530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 196
Target Start/End: Original strand, 21406684 - 21406746
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21406684 tacgttgagggcttgatgctctgtgaccttttgttctttaagttgagggcttgatgctctgtg 21406746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 300
Target Start/End: Original strand, 21619041 - 21619174
Alignment:
Q  163 tttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttg 262  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |  |||||  |||| ||| |||| ||| ||||||||||  |||| |  |||| ||| ||||||||    
T  21619041 tttgctctataagttgaggactt-atgccctgtgagcctattt--gctctataagttgggggtttgatgccctgtgagtatatttatactctatatgttg 21619137  T
Q  263 ggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||    
T  21619138 ggggcttgatgcccagg-ttggtaccacacgcatgatt 21619174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29329854 - 29329693
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||  |||||||||||| | |  | |||| |||||| || |||||||| |||||||||    
T  29329854 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagagcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggtttgatgccc 29329756  T
Q  235 taggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  29329755 tgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtatcacatgcat 29329693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16227339 - 16227251
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||| ||| ||||| |  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  16227339 aataagttgagggcttgatgtcctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 16227251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 234
Target Start/End: Original strand, 21732156 - 21732256
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21732156 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 21732254  T
Q  233 cc 234  Q
    ||    
T  21732255 cc 21732256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Original strand, 25575922 - 25575987
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  25575922 ttaagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagtttagggcttgatgccct 25575987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 14026869 - 14026952
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||||| ||||    
T  14026869 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggtttgatgccttgtg 14026952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24067029 - 24066949
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24067029 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 24066949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 193
Target Start/End: Original strand, 8504702 - 8504782
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc---ttttgctctttaagttgaggacttgatgccct 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||| || |||| || |||||||||||    
T  8504702 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttttcgctctatacgttgggggcttgatgccct 8504782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16227374 - 16227273
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||   |||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16227374 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgtcctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgc 16227276  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  16227275 cct 16227273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 26740951 - 26740997
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26740951 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 26740997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 13536459 - 13536508
Alignment:
Q  186 gatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13536459 gatgccctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccct 13536508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 26733100 - 26733141
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26733100 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 26733141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 27989158 - 27989258
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || |||||||| |||||||||||||    
T  27989158 acgttgagggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttaagggcttgatgcc 27989256  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  27989257 ct 27989258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 260 - 296
Target Start/End: Original strand, 18319318 - 18319354
Alignment:
Q  260 ttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18319318 ttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 18319354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 21309060 - 21309120
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21309060 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggtttgatgccct 21309120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 234
Target Start/End: Original strand, 21619064 - 21619151
Alignment:
Q  149 atgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||  ||||||||||||| || ||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  21619064 atgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggtttgatgccctgtgagtatatttatactctatatgttgggggcttgatgccc 21619151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1096283 - 1096248
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1096283 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 1096248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9077769 - 9077734
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9077769 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 9077734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 16227596 - 16227541
Alignment:
Q  246 ttatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||| || |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  16227596 ttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgcatgatt 16227541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19920676 - 19920613
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19920676 taagttgagggtttgatgccatgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 19920613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 20027210 - 20027289
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20027210 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 20027289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 24529035 - 24529000
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529035 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 24529000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 27989198 - 27989277
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27989198 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttaagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 27989277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 31455502 - 31455439
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31455502 taagatgagggcttgatgtcctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggtttgatgccct 31455439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 196
Target Start/End: Original strand, 8504761 - 8504823
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  8504761 tacgttgggggcttgatgccctaagagcttatgctctataagttgggggcttgatgccctgtg 8504823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 19920640 - 19920591
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  19920640 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtactacatgcatgatt 19920591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 297
Target Start/End: Original strand, 21330536 - 21330574
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  21330536 gttgggggcttaatgccctggattggtaccacatgcatg 21330574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21565396 - 21565314
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  21565396 tacgttgggggcttgatgccctagaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacaagcat 21565314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 25743613 - 25743579
Alignment:
Q  136 cgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct 170  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25743613 cgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct 25743579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 26761387 - 26761338
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  26761387 gctctataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 26761338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32027194 - 32027152
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  32027194 aatacgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgcat 32027152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 10775999 - 10776036
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10775999 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 10776036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 16605467 - 16605515
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16605467 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 16605515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 21329808 - 21329845
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21329808 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 21329845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 21555465 - 21555506
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  21555465 gttgagggcttgatgccctcgattggtaccacatgcatgatt 21555506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 21558130 - 21558171
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  21558130 gttgggggcttgatgcactagattggtaccacatgcatgatt 21558171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 22110729 - 22110681
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  22110729 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 22110681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 22178532 - 22178573
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22178532 gttgagggcttgctgccctggattggtaccacatgcatgatt 22178573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 22959842 - 22959879
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22959842 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 22959879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 25743574 - 25743533
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25743574 gttgagggcttaatgccctggattggtaccacatgcatgatt 25743533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31454969 - 31454932
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31454969 catgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 31454932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31455582 - 31455545
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31455582 catgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 31455545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 5889617 - 5889666
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatg-ccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  5889617 gctcaatacgttgggggcttgatgtccttg--ttggtaccacatgcatgatt 5889666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 10775919 - 10776017
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat-acgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  10775919 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctg-gagcctatttacgctcaaacacgttgagggcttgatgccc 10776016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 249 - 297
Target Start/End: Original strand, 20198811 - 20198858
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  20198811 tgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatg 20198858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Original strand, 21330515 - 21330555
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctg 156  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||    
T  21330515 agtccatgcatactcattaaagttgggggcttaatgccctg 21330555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 134 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 22143940 - 22143837
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || | ||||||||||| |||||||    
T  22143940 tacgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggtttgatgc 22143842  T
Q  233 cctag 237  Q
    |||||    
T  22143841 cctag 22143837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 261 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 25431209 - 25431173
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25431209 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatg 25431173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 2893 - 3076
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |  |||||  ||||      
T  2893 agtccatgtatactcattaaagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttgctctttaagttgagggcttgatgccatgtgagcctattt--gctctt 2990  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  2991 taagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatacgttgggggcttgatgcactgg-ttggtaccacatgcatgatt 3076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 4)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 14167 - 13993
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  14167 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgctc-tt 14074  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14073 atgttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcat 13993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Original strand, 55910 - 56077
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||||| || ||||||||||||||||    
T  55910 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 56008  T
Q  233 cctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||  |||| |  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56009 cctgtgagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 56077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 132 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2943 - 2880
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgt 195  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2943 tttacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggcttgatgccctgt 2880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2998 - 2917
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  2998 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgtcctatgagcttttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtg 2917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0500 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0500
Description:

Target: scaffold0500; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7501 - 7323
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  7501 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctctttacattgggggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttta 7406  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||| ||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  7405 agttgggggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgggggcttgatgccctgga-tggtaccacatggatgatt 7323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 28371 - 28189
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||| |  ||||  | |||       
T  28371 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctctttacattgagggcttgatgccctgtgagcctatt--ttctcttc 28274  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| |||||||||||  ||| |  |||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  28273 aagttgagggtttgatgccctataagtatatttatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 28189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 232
Target Start/End: Original strand, 47522 - 47641
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagct--tttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||   ||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| |||     
T  47522 agtccatgcatactcatttgaagttgagggattgatgccctgtgagcacattttctctttaagttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactct 47621  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||| |||||||| |||||||    
T  47622 atatgttgagggtttgatgc 47641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 5)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 36129 - 35948
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-t 214  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||   | ||||||| |||||||||||||| |  | ||    ||||| |    
T  36129 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccct-tgagcctttgctcaacacgttgagggcttgatgccctgtgagcttttt----ctcaaat 36035  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36034 aagttgagggcttgattccctgggagtgtatttatgctcaaacaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 35948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 10398 - 10487
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||||||||||  |||| |  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10398 aataagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 10487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 10646 - 10739
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctc-aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  10646 tgctcaacacgttgggggctggatgccctaggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 10739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 10400 - 10464
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  10400 taagttgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccct 10464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 10598 - 10717
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aat 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| || |||| |||||||   | |||| || || ||||||||  | || ||||||||||| |||    
T  10598 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccttg-gagcctttgctcaacacgttgggggctggatgccctaggagtatatttatgctcaaat 10696  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  10697 aagttgagggcttgatgccct 10717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 209 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 4608 - 4516
Alignment:
Q  209 ctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4608 ctcaataagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 4516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4639 - 4539
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| ||| |||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  4639 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttactcaataagttgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgcc 4541  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  4540 ct 4539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 397587 - 397407
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||||||||||| |     || | |||  |    
T  397587 agtccatgcatactcatttgaagttgagggtttgatgccctgtgagcttttgctctatacgttgagggtttgatgccctgtgag----ctttttctcttt 397492  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  397491 aagttgagggcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 397407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0853 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0853
Description:

Target: scaffold0853; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 201 - 300
Target Start/End: Original strand, 2917 - 3016
Alignment:
Q  201 tatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  2917 tatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctatgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgcccttgattggtaccacatgcatgatt 3016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0853; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 2933 - 2993
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||| || |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2933 gttgagggcttgatgccctatgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 13078 - 13254
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||| |   |||| | |||  ||    
T  13078 agtccatgcatactcattga-gttgagagcttgatgccctgtgagcttttgctccttacgttgagggcttgacgccctgtgag---attt-ttctc-tta 13171  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  13172 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 13254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 954 - 1136
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||| ||||||||||| || |  |||||   |||  |    
T  954 agtccatgcatactcatttgaagttgaggacttgatgccccgtgagcttttgctatatacgttgagggcttgatgccctatgagcttatttt--ctcttt 1051  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1052 aagttgagggtttgatgccctgcgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 1136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 9096 - 9197
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  9096 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgctgagggcttgatgc 9194  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  9195 cct 9197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 300
Target Start/End: Original strand, 9044 - 9219
Alignment:
Q  119 ccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacg 217  Q
    |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||| ||||| |     || |||||  || |    
T  9044 ccatgcatactcatttgaagttgagtgcttgatgccctgtgagcctttgctctt-acgttgagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctct-tatg 9137  T
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9138 ttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgctgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 9219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 39152 - 39051
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  39152 ttacgttgagggcttgatgctctatgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 39054  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  39053 cct 39051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39207 - 39029
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || || |     || |||||  |    
T  39207 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgccatgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgctctatgagc----ttttgctct-t 39114  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39113 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 39029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 54907 - 54806
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  54907 ttacgttgagggcttgatgttctgtgagcttttgctctt-atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 54809  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  54808 cct 54806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 53595 - 53715
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || || |||| ||| ||    
T  53595 agtccatgcatactcatttgaagttgagggtttgatgccctgtgtgcttttgctctttatgttgagggtttgatgccctgtgagtataattatactctat 53694  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |  ||||| ||||||||||||    
T  53695 atattgagtgcttgatgccct 53715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 54962 - 54789
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||  ||||| |     || |||||  |    
T  54962 agtccatgcatactcatttaaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgagggcttgatgttctgtgagc----ttttgctct-t 54869  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgca 295  Q
    | |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  54868 atgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgca 54789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 7667 - 7768
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||  || |||||||||||||| |    
T  7667 ttacgttgacggcttgatgccctgtgagcttttgctctttaagttgagggctcgatgccctattggtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatac 7765  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  7766 cct 7768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 7612 - 7790
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||| | |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  7612 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgataccctgtgagctttggctccttacgttgacggcttgatgccctgtgag----cttttgctcttta 7707  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||| |||||||||   ||||  ||||||||  ||||||| ||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  7708 agttgagggctcgatgccctattggtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgataccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 7790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 109264 - 109143
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||| | || |||||||||||||| || |||||||| |  |    
T  109264 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagtagggggcttgatgccctgtgagtatatttatgattta 109165  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  109164 tatgttgagggcttgatgccct 109143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 109248 - 109121
Alignment:
Q  170 tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggctt 269  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |  |||||  |||| ||| || | ||||||||||||||  |||| |  ||||| |  |||||||| ||||||    
T  109248 tttaagttgagggcttgatgccctgtgagcctattt--gctctataagtagggggcttgatgccctgtgagtatatttatgatttatatgttgagggctt 109151  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  109150 gatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 109121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 221 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 332167 - 332087
Alignment:
Q  221 agggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatat-gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  | ||||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  332167 agggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaattagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 332087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 6)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 136 - 237
Target Start/End: Original strand, 4806 - 4905
Alignment:
Q  136 cgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||| ||    
T  4806 cgttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgcact 4903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 4748 - 4925
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| |     || |||||  ||    
T  4748 agtccatgcatactcattcaagttgagggcttgatgccctgtgagcctttgctcattgcgttgagggcttgatgccctgtgag----cttttgctc-tta 4842  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  4843 tgttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgcactag-ttggtaccacatgcatgatt 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 119 - 235
Target Start/End: Original strand, 14797 - 14911
Alignment:
Q  119 ccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgt 218  Q
    ||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  | ||||||||||||||  || ||    
T  14797 ccatgcatactcattcaagttgagtgcttgatgccctgtgagcgtttgctc-ttatgttgagggcttgaggccctaagagtgtatttatgctc-ttatgt 14894  T
Q  219 tgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||||||||||    
T  14895 tgagggcttgatgccct 14911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 14852 - 14933
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14852 gttgagggcttgaggccctaagagtgtatttatgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 14933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 9538 - 9490
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  9538 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 9490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16730 - 16682
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16730 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 16682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 132 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 60296 - 60132
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  |||||  || |||||||||||||||    
T  60296 tttacgttgaggacttgatgccctgtgagccttttctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctc-ttaagttgagggcttgatg 60200  T
Q  232 ccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||    |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  60199 ccacgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 60132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 60350 - 60270
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  60350 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccatgtgagcctttgctctttacgttgaggacttgatgccctgtg 60270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 296
Target Start/End: Original strand, 52248 - 52327
Alignment:
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  52248 ttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 52327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 1601 - 1699
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1601 acgttgagggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgccctg-gagtgtatttatgctcaataagttgagggcttgatgccc 1698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 1545 - 1721
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||| ||| |||   | ||||||| ||||||||||||   | |  |||  ||||||||    
T  1545 agtccatgcatactcatttaagttgatggcttcatgcccta-gagcctttactcaacacgttgagggcttgatgccctg---gagccttt--gctcaata 1638  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1639 agttgagggcttgatgccct-ggagtgtatttatgctcaataagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 1721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Original strand, 9393 - 9520
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9393 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtaagcctatttacgctcaatacgttgggggcttga 9492  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| | | ||||||||||||||||||||    
T  9493 tgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 9520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 153
Target Start/End: Original strand, 9309 - 9346
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgcc 153  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9309 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgcc 9346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 7878 - 8060
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||||||| || |||||||||||||| |  ||||  ||||| |    
T  7878 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgc-ctataagttgggggcttgatgccctgtgagcctatt--tgctcta 7974  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||  ||| ||||||||||  |||| |  |||||||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7975 taagtttggggtttgatgccctttgagtatatttatgctctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 8060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 5448 - 5287
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| |||||||| ||||| |     || |||||  || |||||||||||||||    
T  5448 tttatgttgagggcttgatgccctatgagcttttgctctt-acgtttagggcttgatgctctgtgagc----ttttgctct-tatgttgagggcttgatg 5355  T
Q  232 ccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||  |||||| |||| ||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  5354 ccctgtgagtgttattaagctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 5287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 5487 - 5424
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcccta 236  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  5487 aagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgcccta 5424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 5485 - 5427
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  5485 gttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgcc 5427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3206 - 3153
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc 169  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  3206 agtccaagcatactcatttaagttgacggcttgatgccctgggagcctttgctc 3153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold1223
Description:

Target: scaffold1223; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 142 - 263
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||| |||||||| |  ||||||| || |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  142 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgcactgtgagcctatttgctctatatgttgggggcttgatgccctgtgggtatatttatgctcta 241  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||| ||||||||||||||    
T  242 tatgttgggggcttgatgccct 263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1223; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 193 - 285
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  | || |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  193 tgctctatatgttgggggcttgatgccctgtgggtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-tcggtaccacatgcatgatt 285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Original strand, 13801 - 13895
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13801 tgctcaataagttaagggcctgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 13895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 13772 - 13872
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||| ||| | |||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13772 acgttgagggcttgatgcccta-gagcctttgctcaataagttaagggcctgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatgcc 13870  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  13871 ct 13872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 1143
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1240 tacgttgagggcttgatgccttgtgagctttagctctttatgttgagggattgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttaagttgagggcttgatgc 1143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9100 - 9003
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  9100 tacgttgagggcttgatgccttgtgagctttagctctttatgttgagggattgatgccctgtgagtgtatttatgctc-ttaagttgagggcttgatgc 9003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 11260 - 11215
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc 161  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||    
T  11260 agtccatgcatactcattcatgttgagggcttgatgccctgtgagc 11215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2460
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  2561 ttacgttgatggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 2463  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  2462 cct 2460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2616 - 2438
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  2616 agtccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctctt-acgttgatggcttgatgctctgtgagc----ttttgctct-t 2523  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2522 atgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 2438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2814 - 2725
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  2814 aataagttgagggcttgatgcccttggagtatatttatgctcaaataagttaagggcttgatgccctggattggtcccacatgcatgatt 2725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2812 - 2748
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || ||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  2812 taagttgagggcttgatgcccttggagtatatttatgctcaaataagttaagggcttgatgccct 2748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 4)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Original strand, 6740 - 6864
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgc 274  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  6740 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacattaagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 6839  T
Q  275 cttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||    
T  6840 cctgg-ttggtaccacatgcatgatt 6864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Original strand, 6698 - 6758
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| ||||||||||||||    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6698 gttgagggcttgatgccctgtgaacctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 6758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 2027 - 2127
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  2027 acgttaagggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgcc 2125  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  2126 ct 2127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 157
Target Start/End: Original strand, 6638 - 6675
Alignment:
Q  120 catgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  6638 catgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 6675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 933 - 832
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || || ||||||||  || |||||||||||||||||    
T  933 tacgttgagggcttgatgccttgtgagtctttgctctttaagttgagggcttgatgccctgtaagtatacttatgctctttatgttgagggcttgatgcc 834  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  833 ct 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 810
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||| ||||| |||||||| || ||||||| ||||||||| |||| |    | | |||||  ||    
T  989 agtccatgcatactcattcaagttgaggttttgatgccctatgagcctttgctctctacgttgagggcttgatgccttgtgag----tctttgctcttta 894  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||||||   ||| |  ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  893 agttgagggcttgatgccctgtaagtatacttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Original strand, 2976 - 3100
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgc 274  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  2976 gttgagggcttaatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagtgcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 3075  T
Q  275 cttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||    
T  3076 cctgg-ttggtaccacatgcatgatt 3100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 2843 - 2884
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  2843 agtccatgcatactcatttaagttgagggtttgatgccctgt 2884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1751 - 1662
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1751 aataagttgggggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgcgggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1787 - 1685
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||  | |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  1787 acgttgggggcttgataccctgtgagcttttgctcaaataagttgggggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataagttgcgggcttgatgc 1688  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  1687 cct 1685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 9)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17502 - 17321
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || | |||||||  ||||||||||||| |  ||||  | |||  ||    
T  17502 agtccatgcatactcctatatgttgagggcttgatgccctatgagcctttgcttttcacgttgagggtttgatgccctgtgagcctatt--ttctcttta 17405  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
     |||||||||||||||| ||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  17404 agttgagggcttgatgctctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttgataccacatgcatgatt 17321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15759 - 15658
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||| || || ||||||||||||||  || |||||| |||||||||    
T  15759 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgct-tttatgttgagatcttgatgcactatgagtgtatttatgctctttatgttgagtgcttgatgc 15661  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  15660 cct 15658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15797 - 15636
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| ||||| |     || ||||   || ||||||  |||||||    
T  15797 tttatgttgagggcttgttgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtgag----cttttgct-tttatgttgagatcttgatg 15704  T
Q  232 ccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||| ||||||  ||||||||  ||||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15703 cactatgagtgtatttatgctctttatgttgagtgcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 15636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 12973 - 12916
Alignment:
Q  138 ttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  12973 ttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgaggatttgatgctctgtg 12916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13018 - 12956
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  13018 aagttgagagcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatattgagggcttgatgccct 12956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15836 - 15774
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||    
T  15836 aagttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgttgccct 15774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 133 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12941 - 12874
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgt 201  Q
    |||||||||||  || |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12941 ttacgttgaggatttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgatgccctgtgagtgt 12874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 246 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 3424 - 3371
Alignment:
Q  246 ttatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3424 ttatgctctttatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 3371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #9
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 15834 - 15776
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgcc 275  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  ||||||| ||||||| ||||    
T  15834 gttgagggcttgatgccctatgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgttgcc 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0061 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:

Target: scaffold0061; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 175 - 300
Target Start/End: Original strand, 19471 - 19595
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgc 274  Q
    ||||||| ||||||| | |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19471 gttgagggcttgatgtcatgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatatgttgagggcttgatgc 19570  T
Q  275 cttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||    
T  19571 cctgg-ttggtaccacatgcatgatt 19595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 206696 - 206816
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa- 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||||     
T  206696 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgagagtatattaatgctcaac 206794  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  206795 tacgttgagggcttgatgccct 206816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 206755 - 206839
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||    
T  206755 gttgagggcttgatgccctgagagtatattaatgctcaactacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacgtgcatgatt 206839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 17356 - 17272
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17356 gttgagggcttgatgccctgggagtgaatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 17272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17360 - 17295
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||    
T  17360 ttaagttgagggcttgatgccctgggagtgaatttatgctcaaataagttgggggcttgatgccct 17295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 116 - 253
Target Start/End: Original strand, 11768 - 11903
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| |  ||||  || ||  ||    
T  11768 agtccatacatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagtctttgctccttacgttgagggcttgatgccctgtgagcctatt--tgttcttta 11865  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctc 253  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||    
T  11866 agttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 11903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 300
Target Start/End: Original strand, 15227 - 15270
Alignment:
Q  256 tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15227 tatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 15270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 218 - 300
Target Start/End: Original strand, 708 - 790
Alignment:
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  708 ttgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaatatgttgcgggcttgatgccctggattggtaccacttgcatgatt 790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 235
Target Start/End: Original strand, 708 - 767
Alignment:
Q  176 ttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| |||||||||||| | |  ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  708 ttgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaatatgttgcgggcttgatgccct 767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 896 - 1010
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  | ||| ||    
T  896 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcgtatt--ttctctat 993  T
Q  215 acgttgagggcttgatg 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  994 aagttgagggcttgatg 1010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 231
Target Start/End: Original strand, 6200 - 6314
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||||  | ||| ||    
T  6200 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccttgtgagcctttgctctttacgttgagggcttgatgccctgtgagcgtatt--ttctctat 6297  T
Q  215 acgttgagggcttgatg 231  Q
    | |||||||||||||||    
T  6298 aagttgagggcttgatg 6314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 11667 - 11848
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcat-ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |  ||||  | ||| ||    
T  11667 agtccatgcatactcatctaaagttgagggcttgatgccctatgagc-cttgctctttacgttgagggcttaatgccctgtgagcctatt--ttctctat 11763  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||| |  ||||||||||||  |||| | ||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  11764 aagttaaatgcttgatgccctgtgagtataattatactctatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcgtgatt 11848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 142530 - 142410
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   |||||||||| ||||||||| || | || ||||||||||| ||    
T  142530 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccttgggagtatatttatgctcaaa 142432  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  142431 taagttgagggcttgatgccct 142410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 142476 - 142388
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  142476 aataagttgagggcttgatgccttgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 142388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 38324 - 38444
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa- 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| | |||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||||||||     
T  38324 agtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccctg-gagcctatgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaat 38422  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  38423 taagttgagggcttgatgccct 38444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 300
Target Start/End: Original strand, 38370 - 38467
Alignment:
Q  205 tatgctcaat-acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38370 tatgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaattaagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 38467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 39988 - 39805
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    |||||||||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||| | |||||||||||||| |  |||||   ||     
T  39988 agtccatgcatattcatctaaagttgagggcttgatgccctatgagcctatttgctctattaagttgacggcttgatgccctgtgagcctattttctct- 39890  T
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    | || |||| ||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  39889 actaagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatacgttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcatg 39805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 125716 - 125642
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgcc 191  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||||| |||||||||    
T  125716 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaataagttgagggcttgatgcc 125642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 125623 - 125525
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  125623 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 125525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 118 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 446432 - 446257
Alignment:
Q  118 tccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacg 217  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||| |     || |||||  || |    
T  446432 tccatgcatactcattga-gttgagggcttgatgccctatgagcctttgctccttacgtttagggcttgatgccctgtgag----cttttgctc-ttatg 446339  T
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||  |||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  446338 ttgagggcttgatgccatatgagtgtacttatgctctttatgatgagggtttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 446257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 76712 - 76585
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||  |||  |  ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  76712 taagttgagggcttgatgccctgtgagcatatttacgctcaatatgttgtgggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaataaattgggggcttga 76613  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  76612 tgccgtgg-ttggtaccacattcatgatt 76585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 497374 - 497254
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgc-tctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa- 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||| || |||| ||||| |  |||||||| || ||||||||| || | || |||||||| ||||     
T  497374 agtccatgcatactcattaaagttgggggcttgatgccttg-gagcctttgcttaattaagttgggggcttgatgccgtgggagtatatttatgttcaat 497276  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||||||| ||||||||||    
T  497275 taagttgagggattgatgccct 497254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 497315 - 497231
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| |  ||||| ||||| | |||| ||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  497315 gttgggggcttgatgccgtgggagtatatttatgttcaattaagttgagggattgatgcccttgattggtaccacatgcatgatt 497231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold1695
Description:

Target: scaffold1695; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 116 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 471 - 348
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||| || ||||||||||||| |  ||||||| ||||||| || |||||||||||||| || ||||||| ||| |    
T  471 agtccatgcatactcattaaagttaggggtttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatactcta 372  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    || |||| ||||||||||||||||    
T  371 tatgttgggggcttgatgccctag 348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1695; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 420 - 328
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||||||||  |||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  420 tgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatactctatatgttgggggcttgatgccctag-ttggtaccacatgcatgatt 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1553 - 1469
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1553 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1593 - 1494
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1593 acgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgc 1495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 133 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20686 - 20587
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||  || ||||||||||||||||    
T  20686 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgttctt-atgttgagggctggatgccctgtgagtgtatttatactctttatgttgagggcttgatgc 20588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 20645 - 20563
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||  |||| |||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20645 gttgagggctggatgccctgtgagtgtatttatactctttatgttgagggcttgatgcctt-gattggtaccacatgcatgatt 20563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Original strand, 78401 - 78528
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| | ||  || |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  78401 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacggtctttatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttga 78500  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  78501 tgccct-gattggtaccacatgcatgatt 78528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Original strand, 78404 - 78506
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagctttt----gctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |    | |||||| ||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  78404 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacggtctttatgttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgc 78503  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  78504 cct 78506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 78317 - 78358
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  78317 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgt 78358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 201 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 13657 - 13559
Alignment:
Q  201 tatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  13657 tatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgtgagcctttttacgctcaatacgttgggggcttgattccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 13559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13641 - 13581
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||| |||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13641 gttgagggcttgatgccctgtgagcctttttacgctcaatacgttgggggcttgattccct 13581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 132 - 211
Target Start/End: Original strand, 166685 - 166764
Alignment:
Q  132 tttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc 211  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  166685 tttacgttgggggcttgatgccctatgcgcttttgctctttaagttgaaggtttgatgccctgtgagtgtatttatgctc 166764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Original strand, 187659 - 187709
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  187659 tgctctataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 187709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 14425 - 14471
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14425 aataagttgagggcttgatgccctgcattggtaccacatgcatgatt 14471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Original strand, 187608 - 187688
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  187608 agtccatgcacactcattatagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctg 187688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 95289 - 95207
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  95289 gttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 95207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 95299 - 95229
Alignment:
Q  165 tgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||||||||||||||    
T  95299 tgctctgtaagttgagggcttgatgccctgtgagtgtatttatgctctttatgttgggggcttgatgccct 95229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 158775 - 158816
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  158775 gttggggtcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 158816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 7969 - 8019
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7969 gctcaatatgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 8019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 133 - 235
Target Start/End: Original strand, 10914 - 11015
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||||||| || |||| |||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||| ||  || ||||||||||||| ||    
T  10914 ttacgttgagggtttgatgctctgtgagcttttgctctt-atgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgatctttatgttgagggcttgacgc 11012  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  11013 cct 11015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Original strand, 10859 - 11037
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat 214  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||| |     || |||||  |    
T  10859 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggtttgatgctctgtgag----cttttgctc-tt 10952  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||||||  ||||||  ||||| ||  ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  10953 atgttgagggtttgatgccctgtgagtgtatttatgatctttatgttgagggcttgacgccctgg-ttggtaccacatgtatgatt 11037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 3)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 598 - 518
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||    
T  598 agtccatgcatactcatttgaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctc-ttacgttgagggcttgatgctctgtg 518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 887 - 707
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aat 214  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||| |||||||   |  ||| || |||||||||||   || |  ||  ||||| |||    
T  887 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaacactttgggggcttgatgccct---ggagcctt--tgctcaaat 794  T
Q  215 acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctc-aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | |||||||| ||||||| || ||||| |  |||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  793 aagttgagggattgatgctctgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattgataccacatgcatgatt 707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 543 - 489
Alignment:
Q  133 ttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgat 188  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  543 ttacgttgagggcttgatgctctgtgagcttttgctc-ttatgttgagggcttgat 489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 3360 - 3240
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||   || |||||||||||||||| |||||||||||| | || || ||||  || |    
T  3360 agtctatgcatactcatatatgttgagggcttgatgccctgtgagcctattcgctctttaagttgagggcttgatgccctgcgagtataattatattcta 3261  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||  |||||||||||||||||    
T  3260 tatattgagggcttgatgccc 3240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 224 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 10017 - 9940
Alignment:
Q  224 gcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10017 gcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgcctttgattggtaccacatgcatgatt 9940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 183 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10016 - 9965
Alignment:
Q  183 cttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  10016 cttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgagggcttgatgcc 9965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 5)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 18432 - 18521
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  18432 aataagttaagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgataccctggattggtaccacgtgcatgatt 18521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 300
Target Start/End: Original strand, 11935 - 12024
Alignment:
Q  212 aatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||| |||||||| | |||||||  |||||||||| || |||||||||||||| || | |||||||||||| |||||||||    
T  11935 aataagttgaggggttgatgccttgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgataccctagattggtaccacgtgcatgatt 12024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 18396 - 18498
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |   |||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |    
T  18396 acgttgggggcttgatgccatgtgagcttttgcgcaaataagttaagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatac 18495  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  18496 cct 18498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 237
Target Start/End: Original strand, 11899 - 12003
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |   ||||||||||  |||||||| || | |||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |    
T  11899 acgttgggggcttgatgccatgtgagcttttgcgcaaataagttgaggggttgatgccttgggagtgtatttatgctcaaataagttgggggcttgatac 11998  T
Q  233 cctag 237  Q
    |||||    
T  11999 cctag 12003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 152
Target Start/End: Original strand, 18339 - 18375
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgc 152  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18339 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgc 18375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0790
Description:

Target: scaffold0790; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 118 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 5982 - 5930
Alignment:
Q  118 tccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct 170  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5982 tccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct 5930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0790; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 5926 - 5869
Alignment:
Q  136 cgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccct 193  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  5926 cgttgagggcttgatgtcatgtgagcttttgctctttatgttgagggcttgatgccct 5869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 300
Target Start/End: Original strand, 9849 - 9976
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttga 271  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||| |||||||| | |  |||  |  ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9849 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttatgctcaatatgttgagtgcttgatgtcttgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttga 9948  T
Q  272 tgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||| |||||||||| |||||||||    
T  9949 tgccctgg-ttggtaccacttgcatgatt 9976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 143 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 11977 - 11822
Alignment:
Q  143 ggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggag 240  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||| | || |||||| |||||| || |||||||||||| |||| | ||||    
T  11977 ggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgattccctgggagtctatttacgctcaaataagttgagggcttgttgccttgggag 11879  T
Q  241 tgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
      |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11878 cctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 11822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 116 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34377 - 34194
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||| |  ||||||| || |||| || ||||||||| ||||    |||||  |||| |    
T  34377 agtccatgcatagtcattaaagttgaaggcttgatgccctgtgagcctatttgctctatatgttgggggcttgatgccttgtgaccctattt--gctcta 34280  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    || |||| ||||||||| ||||  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||    
T  34279 tatgttgggggcttgataccctgtgagtatatttatgctctatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtactacattcatgatt 34194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 34139 - 34095
Alignment:
Q  255 atatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  34139 atatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatacatgatt 34095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1815
Description:

Target: scaffold1815; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 134 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 1058 - 961
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  1058 tacgttgatggcttgatgctctgtgagtttttgctctt-atgttgagggcttgatgtcatgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgc 961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1815; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 118 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 1113 - 936
Alignment:
Q  118 tccatgcatactcattt-acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatac 216  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||| || ||||||||| |||| || ||||| | |||||||| ||||| ||    || |||||  ||     
T  1113 tccatgcatattcatttgaagttgagggcttgatgctctttgagcttttcctctatacgttgatggcttgatgctctgtgagt----ttttgctct-tat 1019  T
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| | |  ||||||  ||||||||  ||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  1018 gttgagggcttgatgtcatgtgagtgtatttatgctctttatgttgagggcttgatgctctgg-ttggtaccacatgcatgatt 936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8328 - 8278
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8328 gctcaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 8278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Original strand, 18753 - 18874
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa 213  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||| |||||| |  ||||||| ||||||| || |||||||||||||| || |||  |||||| |    
T  18753 agtccatgcatagtcattgaagttgagggcttgatgccccgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctgtgagtatatccatgctcta 18852  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    || |||| |||||| |||||||    
T  18853 taagttgggggcttaatgccct 18874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 231
Target Start/End: Original strand, 18856 - 18952
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||| || |||||||||||||| || ||||||||||| ||| |||| || |||||||    
T  18856 gttgggggcttaatgccctgtgagcctatttgctttataagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttggggacttgatg 18952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 300
Target Start/End: Original strand, 18846 - 18978
Alignment:
Q  165 tgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttggg 264  Q
    |||||| ||||||| || ||| |||||||||| |  |||||  |||  ||| |||| ||||||||||||||  |||| |  |||||||| ||||||||||    
T  18846 tgctctataagttgggggcttaatgccctgtgagcctattt--gctttataagttgggggcttgatgccctgtgagtatatttatgctctatatgttggg 18943  T
Q  265 ggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    | ||||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  18944 gacttgatgtcccgg-ttggtaccacatgcatgatt 18978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 192
Target Start/End: Original strand, 20980 - 21059
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc---ttttgctctttaagttgaggacttgatgccc 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||   || |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20980 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttgatgccctgtgagccttttatgctctataagttgagggcttgatgccc 21059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 173 - 234
Target Start/End: Original strand, 20999 - 21059
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20999 aagttgagggcttgatgccctgtgagcct-tttatgctctataagttgagggcttgatgccc 21059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 233
Target Start/End: Original strand, 692 - 753
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  692 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgatgcc 753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 695 - 773
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  695 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttatgctcaatacgttgggggcttgatgccttgg-ttggtgccacatgcat 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 38293 - 38200
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  38293 tgctcaatacgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgcatgatt 38200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 38341 - 38223
Alignment:
Q  117 gtccatgcatactcatttac-gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaata 215  Q
    ||||||||||||||||| |  |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  || |||| || ||||||||||||   || |||| || || ||||    
T  38341 gtccatgcatactcattcattgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaatacgttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaata 38243  T
Q  216 cgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  38242 cgttgagggcttgatgccct 38223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 106232 - 106112
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aa 213  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| ||   || |||| || ||| ||    
T  106232 agtccatgcatactcattcatgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaa 106134  T
Q  214 tacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  106133 tacgttgagggcttgatgccct 106112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 106135 - 106089
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  106135 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 106089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 8742 - 8658
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| | ||||| |  |||||||||| || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8742 gttgtgggcttgatgccatgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 8658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 8780 - 8681
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccc 234  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  |||||||| || ||||||||| || | || ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8780 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgtgggcttgatgccatgggagtatatttatgctcaaataagttgagggcttgatgccc 8682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 15475 - 15555
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15475 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 15555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 134 - 235
Target Start/End: Original strand, 19874 - 19976
Alignment:
Q  134 tacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc-tttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatg 231  Q
    ||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||| | || |||| || ||| |||| |||||||||| ||||    
T  19874 tacgttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcatttaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatactcaaataagttgagggctagatg 19972  T
Q  232 ccct 235  Q
    ||||    
T  19973 ccct 19976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Original strand, 19915 - 19997
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | || ||||| || |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19915 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatactcaaataagttgagggctagatgccctggattggtaccacatgcatga 19997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Original strand, 15471 - 15536
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |  |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15471 ttaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccct 15536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold1633
Description:

Target: scaffold1633; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 152
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  215 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1633; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 212 - 130
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||  |||  |  ||| |||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  212 gttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6488 - 6361
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||||| | |||||||||||| | |  | |||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| ||| || || ||||||||||    
T  6488 ttaagttgaaggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctgaaatacgttgggggct 6389  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6388 tgatgccctggattggtaccacatgcat 6361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 7)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2841 - 2759
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  2841 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggttccacatgcatgatt 2759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2844 - 2781
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2844 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatatgttgggggcttgatgccct 2781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 175 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2906 - 2846
Alignment:
Q  175 gttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||  |||||||||| || |  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2906 gttgagggtttgatgccctatgagcctatttacgctcaatacgttgagggcttgatgccct 2846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 14550 - 14500
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  14550 tgctctataagttgggggcttgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 14500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 11400 - 11440
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  11400 gttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 11440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16697 - 16656
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||    
T  16697 agtccatgcatactcatataagttgagggcttgatgccctgt 16656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16635 - 16572
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| |  | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  16635 ttaagttgagagcttgatgccctgtgagcct-tttatgctctataagttgagggcttgatgccct 16572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 3)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 57758 - 57676
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  57758 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 57676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 57761 - 57698
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  57761 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 57698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 57845 - 57804
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  57845 agtccatgcatactcatttaagttaagggcttgatgccctgt 57804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 78047 - 77984
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  78047 taagttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 77984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 78044 - 77962
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||  |||  |  ||| |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  78044 gttgagggcttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct-gattggtactacatgcatgatt 77962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 78131 - 78090
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  78131 agtccatgcatcctcatttaagttgagggcttaatgccctgt 78090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 22094 - 22048
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  22094 aataagttgagggcttgatgccctgcattggtaccacatgcatgatt 22048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 7384 - 7338
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7384 aatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 7338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 5457 - 5417
Alignment:
Q  256 tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5457 tatgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 5417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 10785 - 10826
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  10785 gttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgcatgatt 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Original strand, 44242 - 44291
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  44242 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 44291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Original strand, 17185 - 17267
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | |||||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17185 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaatacgttgggggattgatgccctggattggaaccacatgcatga 17267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Original strand, 26334 - 26416
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |  | || ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  26334 gttgagggcttgatgccctgggagtatattaattctcaaatacgttgggggcttgatgccctggattggaaccacatgcatga 26416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 17145 - 17246
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| |||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  17145 acgttgggggcttgacgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaatacgttgggggattgatgc 17243  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  17244 cct 17246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 26294 - 26395
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctc-aatacgttgagggcttgatgc 232  Q
    |||||| |||||| | |||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | || |||| || ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26294 acgttgggggcttgacgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagtatattaattctcaaatacgttgggggcttgatgc 26392  T
Q  233 cct 235  Q
    |||    
T  26393 cct 26395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 106228 - 106179
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  106228 gctcaatatgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 106179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 116261 - 116215
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  116261 aatacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 116215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44494 - 44394
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| |||||||||||||  || |||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  44494 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagagcttgatgcc 44396  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  44395 ct 44394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 78178 - 78115
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| |||||||||||||  || |||| || || ||||||||||| ||||||||||||    
T  78178 taagttgagggcttgatgccctgtaagtatattaatacttaatacgttgagagcttgatgccct 78115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 254 - 298
Target Start/End: Original strand, 129239 - 129283
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  129239 aatacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgcatga 129283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 137 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 3767 - 3607
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagc---ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||||| || |||||||||||||   || |||||| ||||||| || ||||||||||||||    |||| |||||| |||  ||| ||||||||||||    
T  3767 gttgagggtttgatgccctgtgagcctattatgctctataagttgggggcttgatgccctgtgatcctatt-atgctctataaattgggggcttgatgcc 3669  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatg 297  Q
    ||  |||  | ||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  3668 ctgtgagcct-attatgctctatacgttgggggcttgatgccct-gattgataccacatgcatg 3607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 61838 - 61658
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||| | | |||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| |  ||||  |||||     
T  61838 agtccatgcatactcactaaagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgccatgtgagcttatt--tgctct 61741  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||| |||| |||||||||||| |  |||| |  |||||||  ||| | |||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  61740 ataagttgggggcttgatgccttgtgagtatatttatgctttatacgatgggggtttgatgccct-tattggtaccacatgcat 61658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 207 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 73119 - 73027
Alignment:
Q  207 tgctcaatacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||     || ||||| |||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  73119 tgctctatacgttgaaggcttgatgccctatgagcccttttgtgctctatatgttgggggattgatgccctg-attggtaccacatgcatgatt 73027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1792 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1792
Description:

Target: scaffold1792; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 89 - 10
Alignment:
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| || ||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  89 gagggcttgatgctcttggagcctatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 10  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 23811 - 23890
Alignment:
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| || ||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23811 gagggcttgatgctcttggagcctatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 23890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 220 - 300
Target Start/End: Original strand, 20881 - 20960
Alignment:
Q  220 gagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||| || ||||  |  ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  20881 gagggcttgatgctcttggagcctatttacgctcaatatgttgagggcttgatgccctgg-ttggtaccacattcatgatt 20960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 116 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 19233 - 19114
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagctt--ttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctca 212  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |  ||||||||||||| |  ||||||| |||||||||||  ||||||||||||| |  |||||  ||||     
T  19233 agtccatgcatactcattaa-gttgagggttcgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggtttgatgccctgtgagcctattt--gctct 19137  T
Q  213 atacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  19136 atacgttgggggcttgatgccct 19114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30258 - 30096
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||| |||||| |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |  | |||| ||||||   | |||||||||||||||||    
T  30258 gttgggggcttgatgccctg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgcc 30160  T
Q  234 ctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    || ||||  |  ||| ||||||  | |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30159 ctgggagcctatttacgctcaaacacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 30096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 173 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 16661 - 16536
Alignment:
Q  173 aagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaat--acgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggctt 269  Q
    ||||||||| |||||||||||| | |  |||||||||||||   | ||||||| ||||||||||| ||||  |  ||| |||||| || |||||||||||    
T  16661 aagttgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaaataaagttgagg-cttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatacgttgggggctt 16563  T
Q  270 gatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16562 gatgccctggataggtaccacatgcat 16536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 33259 - 33294
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 33294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 45746 - 45711
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45746 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 45711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 41280 - 41343
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41280 taagttgagggtttgatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggcttgatgccct 41343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 196
Target Start/End: Original strand, 113615 - 113697
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||   |||||||| | ||||||||  |||||||||||||    
T  113615 agtccatgcatactcatttaagttgggggcttgatgccctttgagcctatttgctctatgagttgagggtttgatgccctgtg 113697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 22981 - 23018
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22981 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 23018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2708 - 2659
Alignment:
Q  250 gctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2708 gctcaatacgttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 2659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18173 - 18092
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctct-ttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  18173 agtccatgcatactcattaaacttgagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggattgatgccctg 18092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2491 - 2445
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2491 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 2445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Original strand, 5001 - 5047
Alignment:
Q  254 aatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5001 aatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 5047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 6539 - 6580
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6539 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 6580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 300
Target Start/End: Original strand, 13993 - 14034
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13993 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 14034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 24960 - 24879
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | || || || | |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24960 gttgagggcttgatgccctagaagtatattaatacttaacacgttgagagcttgatgctttggattggtaccacatgcatga 24879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 145731 - 145686
Alignment:
Q  255 atatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  145731 atatgttaggggcttgatgccctggattggtaccacatacatgatt 145686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 40405 - 40442
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40405 gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 40442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44340 - 44213
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggct 268  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| | |  | |||| |||||| || ||||||| ||||||||||| ||||  |  |||  ||||| || ||||||||||    
T  44340 ttaagttaagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgaggccttgatgccctgggagcctatttacactcaaatacgttgggggct 44241  T
Q  269 tgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  44240 tgatgccctagattggtaccacatgcat 44213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 100160 - 100123
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  100160 gttgagggcctgatgccttggattggtaccacatgcat 100123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 116 - 169
Target Start/End: Original strand, 221378 - 221431
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctc 169  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  221378 agtccatgcatgctcatttaagttgagggcttgatgccctgggagcctttgctc 221431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Original strand, 4865 - 4949
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| |  | |||||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  4865 gttgagggtttgatgccctggaagtatattaatgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggttggtaccacatgcatgatt 4949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0505
Description:

Target: scaffold0505; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1759 - 1680
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccct 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| ||  ||||||||||    
T  1759 agtccatgcatactcattaaagttgaggacttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggtttgatgccct 1680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0505; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 3770 - 3725
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc 161  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  3770 agtccatgcatactcattaaagttgagggtttgatgccctgtgagc 3725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2552 - 2468
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaat-atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |  | || || ||  |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2552 gttgagggcttgatgccctagaagtatattaatacttaaacatgttgaggacttgatgccctggattggtaccacatgcatgatt 2468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Original strand, 16329 - 16394
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || | ||||||||||||||||||||||||    
T  16329 taagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctag 16394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 156
Target Start/End: Original strand, 15461 - 15501
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctg 156  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  15461 agtccatgcatactcatttaagttgagggcttgatgccctg 15501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 259 - 298
Target Start/End: Original strand, 15482 - 15521
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15482 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcatga 15521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 1521 - 1601
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaa-tatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  |  ||| |||| | || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  1521 gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctctactacgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgcat 1601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Original strand, 15016 - 15048
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15016 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 15048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold1256
Description:

Target: scaffold1256; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 235
Target Start/End: Original strand, 369 - 428
Alignment:
Q  176 ttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||| |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  369 ttgagggcttggtgccctgtgagtatatttatgctctatacgttaggggcttgatgccct 428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1256; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 218 - 296
Target Start/End: Original strand, 369 - 446
Alignment:
Q  218 ttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||| ||||||  |||| |  |||||||| ||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  369 ttgagggcttggtgccctgtgagtatatttatgctctatacgttaggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold1186
Description:

Target: scaffold1186; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 249 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 609 - 559
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  609 tgctctataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatgatt 559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1186; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 660 - 580
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||| |||||||   |||| |||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  660 agtccatgcacactcattatagttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctg 580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1387
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1308 gttgggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 1387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0520 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0520
Description:

Target: scaffold0520; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 245 - 296
Target Start/End: Original strand, 510 - 560
Alignment:
Q  245 attatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  510 attatgctatatacgttgggggcttgatgcctt-gattggtaccacatgcat 560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 3632 - 3667
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3632 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 3667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 21903 - 21868
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21903 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 21868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 27981 - 28060
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27981 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 28060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 37163 - 37128
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  37163 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 37128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 27693 - 27658
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  27693 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 27658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 296
Target Start/End: Original strand, 20114 - 20153
Alignment:
Q  257 atgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20114 atgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 20153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 172 - 235
Target Start/End: Original strand, 59644 - 59707
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| |  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  59644 taagttgagggctttatgccctgtgagcctatttacgctcaatacgttgggggtttgatgccct 59707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 296
Target Start/End: Original strand, 77649 - 77684
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  77649 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 77684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 32385 - 32306
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || | || |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32385 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 32306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 261 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 116730 - 116691
Alignment:
Q  261 tgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  116730 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgcatgatt 116691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32425 - 32325
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || | ||||||||||||||||||||    
T  32425 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttattacgttgagggcttgatgcc 32327  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  32326 ct 32325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 217 - 296
Target Start/End: Original strand, 136653 - 136732
Alignment:
Q  217 gttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |  | || || |||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  136653 gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcctgatgccctggattggtaccacatgcat 136732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 235
Target Start/End: Original strand, 136613 - 136713
Alignment:
Q  135 acgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctt-taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgcc 233  Q
    |||||| |||||| |||||||| ||||||| ||||   |||||||||| ||||||||||||   || |||| || || |||||||||||||| |||||||    
T  136613 acgttgggggcttgatgccctg-gagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatacgttgagggcctgatgcc 136711  T
Q  234 ct 235  Q
    ||    
T  136712 ct 136713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 266 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1774 - 1744
Alignment:
Q  266 gcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1774 gcttgatgccttggattggtaccacatgcat 1744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 296
Target Start/End: Original strand, 24150 - 24232
Alignment:
Q  214 tacgttgagggcttgatgccctaggagtgtgattatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |  | || |  ||||  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24150 tacgttgagggcttgatgccctggaagtatattaatacataatacattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 24232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 10304 - 10352
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10304 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 10352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Original strand, 27758 - 27806
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  27758 tatgctctataagttgggggcttgatgccat-gattggtaccacatgcat 27806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 57766 - 57689
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagcttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||| |||||||   | |||| || ||||||||||||    
T  57766 agtccatgcatactcattaaagttgggggcttaatgccctg-gagcctttgctcaacacgttgggggcttgatgccctg 57689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0645
Description:

Target: scaffold0645; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 194
Target Start/End: Original strand, 141 - 221
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgtgagc--ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctg 194  Q
    ||||| |||||||||||| | ||  ||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  141 agtccgtgcatactcattaaagtgtagggcttgatgccctgtgagcctatttgctctataagttgggggcttgatgccctg 221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0645; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 249 - 298
Target Start/End: Original strand, 192 - 240
Alignment:
Q  249 tgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcatga 298  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  192 tgctctataagttgggggcttgatgccctgg-ttggtaccacatgcatga 240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 4661 - 4697
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4661 gttgggggcttgatgcctt-gattggtaccacatgcat 4697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Original strand, 9221 - 9257
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9221 gttgggggcttgatgcctt-gattggtaccacatgcat 9257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1925 - 1888
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1925 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 1888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6342 - 6305
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6342 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 6305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 6628 - 6591
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6628 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 6591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 259 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12748 - 12711
Alignment:
Q  259 gttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12748 gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 1744 - 1696
Alignment:
Q  247 tatgctcaatatgttgggggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  1744 tatgctctataagttgggggcttgatgccct-gattggtaccacatgcat 1696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 172 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 14151 - 14087
Alignment:
Q  172 taagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccctag 237  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| |  |||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14151 taagttgagggcttgatgccatgtgagcctatttacgctta-tacgttgagggcttgatgccctag 14087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25696 - 25655
Alignment:
Q  116 agtccatgcatactcatttacgttgagggcttaatgccctgt 157  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||    
T  25696 agtccatgcatactcattaaagttgagggcttcatgccctgt 25655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 171 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25634 - 25571
Alignment:
Q  171 ttaagttgaggacttgatgccctgtgggtgtatttatgctcaatacgttgagggcttgatgccct 235  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |  || |||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  25634 ttaagttgatgacttgatgccctgtgagccta-ttatgctctatacgtttggggcttgatgccct 25571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12566 - 12534
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12566 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0453 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0453
Description:

Target: scaffold0453; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 2210 - 2174
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcatgatt 300  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  2210 gggcttgatgccctggattgctaccacatgcatgatt 2174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 12373 - 12341
Alignment:
Q  264 gggcttgatgccttggattggtaccacatgcat 296  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12373 gggcttgatgccctggattggtaccacatgcat 12341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0048 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0048
Description:

Target: scaffold0048; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 137 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 56078 - 56016
Alignment:
Q  137 gttgagggcttaatgccctgtgagc---ttttgctctttaagttgaggacttgatgccctgtg 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||   ||| ||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  56078 gttgagggcttgatgccctgtgagcctttttcgctctataagttgagggcttgatgctctgtg 56016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University