View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0979-INSERTION-16 (Length: 912)

Name: NF0979-INSERTION-16
Description: NF0979
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0979-INSERTION-16
NF0979-INSERTION-16
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (7-912)||(24156628-24157532)
chr1 (334-912)||(20190329-20190909)
chr1 (599-912)||(36233513-36233823)
chr1 (684-912)||(20189048-20189276)
chr1 (334-594)||(22062046-22062304)
chr1 (335-597)||(6473763-6474022)
chr1 (335-597)||(20127060-20127318)
chr1 (749-912)||(20759301-20759464)
chr1 (848-912)||(48463010-48463074)
chr1 (749-803)||(31390245-31390299)
chr1 (433-498)||(37260418-37260482)
chr1 (163-208)||(23085426-23085471)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (335-912)||(9595340-9595915)
chr7 (335-912)||(9646303-9646878)
chr7 (583-912)||(7842881-7843211)
chr7 (609-912)||(9647111-9647414)
chr7 (335-594)||(32706331-32706588)
chr7 (749-904)||(41000394-41000549)
chr7 (749-904)||(40998535-40998690)
chr7 (609-674)||(9596148-9596213)
chr7 (480-579)||(5247436-5247536)
chr7 (835-902)||(23446877-23446944)
chr7 (445-518)||(14575569-14575642)
chr7 (445-518)||(14578845-14578918)
chr7 (413-498)||(16157037-16157122)
chr7 (413-498)||(21368624-21368709)
chr7 (433-498)||(22707689-22707754)
[»] chr4 (20 HSPs)
chr4 (334-912)||(39488052-39488629)
chr4 (335-912)||(15017546-15018119)
chr4 (334-912)||(15019185-15019759)
chr4 (407-844)||(9166926-9167365)
chr4 (609-912)||(13518136-13518439)
chr4 (335-594)||(17266600-17266858)
chr4 (335-595)||(34098711-34098967)
chr4 (136-305)||(3241789-3241958)
chr4 (749-883)||(9398935-9399069)
chr4 (600-739)||(19458007-19458146)
chr4 (599-747)||(19459700-19459848)
chr4 (635-794)||(19460552-19460708)
chr4 (209-331)||(25376569-25376691)
chr4 (596-794)||(19456246-19456441)
chr4 (596-680)||(24663578-24663662)
chr4 (484-588)||(23090869-23090973)
chr4 (596-674)||(21484617-21484695)
chr4 (482-594)||(17780705-17780821)
chr4 (597-712)||(22474101-22474216)
chr4 (499-562)||(19460135-19460198)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (335-912)||(244345-244917)
chr5 (335-912)||(29951430-29952003)
chr5 (334-912)||(29949792-29950366)
chr5 (349-597)||(4568240-4568484)
chr5 (168-329)||(35874992-35875153)
chr5 (414-498)||(11126394-11126478)
chr5 (599-692)||(27401975-27402068)
chr5 (383-546)||(34597760-34597919)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (523-912)||(1491-1882)
[»] chr8 (6 HSPs)
chr8 (583-909)||(8366315-8366642)
chr8 (335-589)||(20730871-20731122)
chr8 (749-902)||(17277991-17278144)
chr8 (406-499)||(18446214-18446307)
chr8 (413-498)||(16417535-16417620)
chr8 (413-498)||(18774284-18774369)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (583-912)||(22300045-22300375)
chr2 (407-597)||(6050194-6050385)
chr2 (407-589)||(15409796-15409979)
chr2 (749-902)||(18535618-18535771)
chr2 (749-902)||(24806599-24806753)
chr2 (749-912)||(24808455-24808619)
chr2 (136-272)||(10281111-10281247)
chr2 (335-594)||(33809366-33809625)
chr2 (413-498)||(44794755-44794840)
chr2 (256-329)||(6372274-6372347)
chr2 (407-449)||(23732418-23732460)
[»] chr3 (21 HSPs)
chr3 (676-912)||(25531841-25532077)
chr3 (334-589)||(5553469-5553721)
chr3 (749-902)||(5554107-5554260)
chr3 (749-902)||(16346849-16347002)
chr3 (749-902)||(23460417-23460570)
chr3 (749-902)||(47418292-47418445)
chr3 (753-912)||(47566680-47566839)
chr3 (366-594)||(17236777-17236997)
chr3 (334-561)||(22271157-22271384)
chr3 (338-467)||(23433138-23433262)
chr3 (406-498)||(16019424-16019516)
chr3 (599-708)||(2693788-2693900)
chr3 (445-518)||(13956976-13957049)
chr3 (445-518)||(13962709-13962782)
chr3 (445-518)||(15381954-15382027)
chr3 (445-518)||(15387690-15387763)
chr3 (413-498)||(13179870-13179955)
chr3 (413-498)||(13184528-13184613)
chr3 (559-597)||(16345391-16345429)
chr3 (413-498)||(33757949-33758034)
chr3 (655-714)||(2683933-2683989)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (334-597)||(18781742-18782003)
chr6 (407-589)||(30518256-30518439)
chr6 (335-594)||(18553331-18553586)
chr6 (410-589)||(20419613-20419793)
chr6 (410-589)||(20414880-20415060)
chr6 (334-564)||(20417454-20417682)
chr6 (378-597)||(6230578-6230798)
chr6 (501-597)||(20417683-20417779)
chr6 (413-498)||(21299377-21299462)
chr6 (433-498)||(12639504-12639568)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (411-597)||(848-1035)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (407-594)||(33210-33397)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (407-597)||(136746-136937)
[»] scaffold0146 (4 HSPs)
scaffold0146 (334-594)||(6608-6864)
scaffold0146 (337-594)||(9503-9756)
scaffold0146 (337-594)||(17170-17423)
scaffold0146 (749-789)||(27480-27520)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (407-594)||(25732-25920)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (335-594)||(4497-4753)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (410-594)||(54763-54948)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (755-912)||(86784-86941)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (407-550)||(22586-22730)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (749-902)||(55072-55225)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (749-902)||(241261-241414)
scaffold0013 (481-540)||(241614-241675)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (749-912)||(399-563)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (413-498)||(8747-8832)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (413-498)||(288973-289058)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (433-498)||(2135-2199)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (433-498)||(33780-33844)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 846; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 846; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 7 - 912
Target Start/End: Original strand, 24156628 - 24157532
Alignment:
Q  7 attttatatacatctcttcatcaaatttatctagatattttttaaaacaatgtggtgaaatgatatactaaatttatgcaaacaagatatttatcatctg 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24156628 attttatatacatatcttcatcaaattttgctagatattttttaaaacaatgtggtgaaatgatatactaaatttatgcaaacaagatatttatcatctg 24156727  T
Q  107 aacacaatagaatatgttaactcacaaaaattgagtggcaaactatctttatggtaacatgttggcacttgtggacctggaggaataaaagcatttttga 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24156728 aacacaatagaatatgttaactcacaaaaattgagtggcaaactatctttatggtaacatgttggcacttgtggacctggaggaataagagcatttttga 24156827  T
Q  207 agaggagttccatcgaccttttaatccaattgatgtgattcttaagagggctatggggattgataacggcgaacaaacacacgtaactggatgacctcag 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  24156828 agaggagttccatcgaccttttaatccaattgatgtgattcttaagagggctatggggattgataacggcgaacaaacacacgtaactggatgacctcaa 24156927  T
Q  307 cttactgatactattttcattggatagatgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaatt 406  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24156928 cttactgacactattttcattggatggatgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaatt 24157027  T
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttc 506  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24157028 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtcaatggatgcgaggatcaccacaagaaaatgatttc 24157127  T
Q  507 ttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactttttacatatcat 606  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24157128 ttgataagatcaaggatggttcgatccataaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattctactttttacatatcat 24157227  T
Q  607 tttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttg 706  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24157228 tttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatgcagccactaattacaataatgttttg 24157327  T
Q  707 gtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgt 806  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24157328 gtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgca-attgatttgt 24157426  T
Q  807 gaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaa 906  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24157427 gaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaa 24157526  T
Q  907 accatt 912  Q
    ||||||    
T  24157527 accatt 24157532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 334 - 912
Target Start/End: Original strand, 20190329 - 20190909
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20190329 atgatgagtgtcacggagccgtcggaagcaacttatgaataatgttggtggaaatggtgaaaagactaaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 20190428  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||  ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  20190429 aaggacgccacactttctaatccaagaaactgataagtctatggaagcgaggattgccacaagaacataatgtcttgataagatcaaggatggttcaatc 20190528  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt-tttacatatcattttcgtgctctatttatatgagctt 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  20190529 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacataagtgtaaaattctacaaagttcaacttgtttacatatcattttcgtgatctatttatatgaggtt 20190628  T
Q  632 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  20190629 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgatttggtggctgattaatgcaaataaaaga 20190728  T
Q  732 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 831  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20190729 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttcaagacgtta 20190828  T
Q  832 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20190829 caattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttcatcacgttttcaacttacaactcattttaaaacatt 20190909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 599 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 36233823 - 36233513
Alignment:
Q  599 catatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaata 698  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||    
T  36233823 catatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttcactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaata 36233724  T
Q  699 atgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacat 798  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233723 atgttttggtggctgattaatgcaaataaaatgttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacat 36233624  T
Q  799 tgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaact 898  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36233623 tgatttgtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaa---cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaact 36233527  T
Q  899 cattttaaaccatt 912  Q
    ||||||| ||||||    
T  36233526 cattttacaccatt 36233513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 684 - 912
Target Start/End: Original strand, 20189048 - 20189276
Alignment:
Q  684 ccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttaca 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20189048 ccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttata 20189147  T
Q  784 tattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgt 883  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  20189148 tattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttaagcttacacactttaactacgt 20189247  T
Q  884 tttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  20189248 tttcaacttacaactcactttacaccatt 20189276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 166; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 334 - 594
Target Start/End: Original strand, 22062046 - 22062304
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  22062046 atgatgagtgtcactgagccgtcggaagcaaattatgaataatgttggtggaaatggtgaaaagactaaaaa----aatgaagaaatggaatggatagac 22062141  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgat 531  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  22062142 agggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaat 22062241  T
Q  532 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  22062242 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaactt 22062304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 335 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 6474022 - 6473763
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagc-aactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| ||||||| |||| |     |||||||||||||||||||||||||||    
T  6474022 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgattaatgttggtggaaatggtgaaaagactaa-----aaaatgaagaaatggaatggatagaca 6473928  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  6473927 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgtcacaagaaatgtgatttcttgataagatcaaggatgattcaatc 6473828  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  6473827 cagaaccacaagagacaaggctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaacttttt 6473763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 335 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 20127318 - 20127060
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| ||| |      ||||||||||||||||||||||    
T  20127318 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtgaaaatggtgaaaagactaaaact------gaagaaatggaatggatagaca 20127225  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20127224 gggacgccacactttctaatccaagaaagcgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggatggttcaatc 20127125  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  20127124 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacttttt 20127060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 749 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 20759464 - 20759301
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  20759464 aagttggtcgctgatcaatgcatgaggatgttacatattcatttgcacattgattaatcaaggcttgttatttatagatgttacaattccacaaacacca 20759365  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
     |||||||| ||| ||||| ||||||||| ||  | |||||||||||  |||||||| ||||||    
T  20759364 tctttaatttttcagcttatacactttaatcatatcttcaacttacagttcattttacaccatt 20759301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 848 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 48463074 - 48463010
Alignment:
Q  848 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48463074 acctttaattcttcagtttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 48463010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 749 - 803
Target Start/End: Complemental strand, 31390299 - 31390245
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatt 803  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31390299 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatt 31390245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 37260482 - 37260418
Alignment:
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  37260482 agggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 37260418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 163 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 23085471 - 23085426
Alignment:
Q  163 acatgttggcacttgtggacctggaggaataaaagcatttttgaag 208  Q
    ||||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  23085471 acatgttggtacttgtggaagtggaggaataaaagtatttttgaag 23085426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 425; Significance: 0; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 335 - 912
Target Start/End: Original strand, 9595340 - 9595915
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagc-aactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| |     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9595340 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtggaaatggtgaaaagactaa-----aaaatgaagaaatgaaatggatagaca 9595434  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9595435 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggatggttcaatc 9595534  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt-tttacatatcattttcgtgctctatttatatgagctt 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9595535 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaacttctttacatatcattttcgtgctctatttatatgagttt 9595634  T
Q  632 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9595635 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaattcaaataaaagt 9595734  T
Q  732 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 831  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9595735 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggtggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 9595834  T
Q  832 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9595835 caattccacaaacacctcctttaattctccagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaagccatt 9595915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 425; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 335 - 912
Target Start/End: Original strand, 9646303 - 9646878
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagc-aactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| |     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9646303 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtggaaatggtgaaaagactaa-----aaaatgaagaaatgaaatggatagaca 9646397  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9646398 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggatggttcaatc 9646497  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt-tttacatatcattttcgtgctctatttatatgagctt 631  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9646498 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaacttctttacatatcattttcgtgctctatttatatgagttt 9646597  T
Q  632 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaagg 731  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  9646598 attacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaattcaaataaaagt 9646697  T
Q  732 ttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 831  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9646698 ttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggtggttacatattcatttggacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtta 9646797  T
Q  832 caattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9646798 caattccacaaacacctcctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaagccatt 9646878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 583 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 7843211 - 7842881
Alignment:
Q  583 aaaattctactt-tttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatgg 681  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  7843211 aaaattctacttctttacataccattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactcaaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgc 7843112  T
Q  682 agccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggtta 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7843111 agccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaagaggtta 7843012  T
Q  782 catattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccac 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  7843011 catattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattctccagcttacacactttaaccac 7842912  T
Q  882 gttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7842911 gttttctacttacaactcattttaaaccatt 7842881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 609 - 912
Target Start/End: Original strand, 9647111 - 9647414
Alignment:
Q  609 tcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggt 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  9647111 tcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataattttttggt 9647210  T
Q  709 ggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtga 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9647211 ggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaataaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtaa 9647310  T
Q  809 aggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaac 908  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9647311 aggctgattatttctagacgttacaattccacaaacacctcctttaattcttcaggttacacaatttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaac 9647410  T
Q  909 catt 912  Q
    ||||    
T  9647411 catt 9647414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 335 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 32706588 - 32706331
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||  ||||||||| |||||||  |||  |||    |||||||||||| ||| |||||| |    
T  32706588 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattaagaataatgttggtggaaatggtgaaaaaactagaaa----aatgaagaaatgaaatagatagaga 32706493  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaa-tgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32706492 gggacaccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatagatgcgaggattgccacaagaaatgtgatttcttgataagatcaaggatggttcaatc 32706393  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  32706392 cagaaccacaagagacaaagctcttaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaactt 32706331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 749 - 904
Target Start/End: Original strand, 41000394 - 41000549
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41000394 aagttggtggctgatcaatgcatgaaaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacacca 41000493  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatttt 904  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  41000494 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacaactcatttt 41000549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 749 - 904
Target Start/End: Original strand, 40998535 - 40998690
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40998535 aagttggtggctgatcaatgcatgaaaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggattattatggctagacgttacaattccataaacacca 40998634  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatttt 904  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||    
T  40998635 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatttt 40998690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 609 - 674
Target Start/End: Original strand, 9596148 - 9596213
Alignment:
Q  609 tcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaag 674  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9596148 tcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaag 9596213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 480 - 579
Target Start/End: Original strand, 5247436 - 5247536
Alignment:
Q  480 tgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaatt 578  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  5247436 tgaggatctccacaaaaaatatgatttcttgataagatcaaggatgattcaatccagaaccataagagacaaagctctcaacactcatacgtgtaaaatt 5247535  T
Q  579 c 579  Q
    |    
T  5247536 c 5247536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 835 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 23446944 - 23446877
Alignment:
Q  835 ttccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  23446944 ttccacaaacaccacctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatt 23446877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Original strand, 14575569 - 14575642
Alignment:
Q  445 ctttctaattcaagaaag--tgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatca 518  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14575569 ctttctaatccaagagagaatgataagcctatggatg--aggatcaccacaagaaaaggatttcttgataagatca 14575642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Original strand, 14578845 - 14578918
Alignment:
Q  445 ctttctaattcaagaaag--tgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatca 518  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14578845 ctttctaatccaagagagaatgataagcctatggatg--aggatcaccacaagaaaaggatttcttgataagatca 14578918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 16157122 - 16157037
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16157122 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 16157037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 21368624 - 21368709
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||| ||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21368624 aagaaatggaatggagagtttagggatgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 21368709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 498
Target Start/End: Original strand, 22707689 - 22707754
Alignment:
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  | | |||||||||||||||    
T  22707689 agggacgcctcactttctaatcctagaaactgataagcctatggaaataaagatcaccacaagaaa 22707754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 20)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 334 - 912
Target Start/End: Original strand, 39488052 - 39488629
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||  |||||||  ||| ||||     |||||||||||||||||||||||    
T  39488052 atgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtggaattggtgaaaatactaaaaa-----atgaagaaatggaatggatagac 39488146  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgat 531  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  39488147 agggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggatgattcaat 39488246  T
Q  532 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttta--catatcattttcgtgctctatttatatgagc 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39488247 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattccacttttttttcataacattttcgtgctctatctatatgagc 39488346  T
Q  630 ttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaa 729  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39488347 atattacatgttgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaga 39488446  T
Q  730 ggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgt 829  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39488447 ggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaagacttattatttctagacgt 39488546  T
Q  830 tacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39488547 tacaatttcacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 39488629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 405; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 335 - 912
Target Start/End: Original strand, 15017546 - 15018119
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagc-aactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| |     ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15017546 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtggaaatggtgaaaagactaa-----aaaatgaaggaatggaatggatagaca 15017640  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15017641 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccataagaaatatgatttcttgataagatcaaggatggttcaatc 15017740  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctac--tttttacatatcattttcgtgctctatttatatgagct 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15017741 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacctctttttcatatcattttcgtgctctatttatatgagct 15017840  T
Q  631 tattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaag 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15017841 tattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagaaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaat 15017940  T
Q  731 gttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtt 830  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15017941 gttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtt 15018040  T
Q  831 acaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15018041 acaattccacaaa---cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccatt 15018119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 334 - 912
Target Start/End: Original strand, 15019185 - 15019759
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||| ||||| | |||| |||      |||||||||||||||||||||||    
T  15019185 atgatgagtgctacggagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtggaaatggtgagaagactaaaag-----atgaagaaatggaatggatagac 15019279  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgat 531  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15019280 agggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggatggttcaat 15019379  T
Q  532 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt--tttacatatcattttcgtgctctatttatatgagc 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15019380 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacctctttttcatatcattttcgtgctctatttatatgagc 15019479  T
Q  630 ttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaa 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15019480 ttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaatgaaa 15019579  T
Q  730 ggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgt 829  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15019580 tgttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgt 15019679  T
Q  830 tacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15019680 tacaattccacaaa---cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccatt 15019759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 407 - 844
Target Start/End: Complemental strand, 9167365 - 9166926
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgattt 505  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  9167365 aaaatgaagaaatgaaattgatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattt 9167266  T
Q  506 cttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt-tttacatatc 604  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||||    
T  9167265 cttgataagatcaaggttggttcaatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaacttcttttcatatc 9167166  T
Q  605 attttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttt 704  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  9167165 attttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatccaaccactaattacaataatgttt 9167066  T
Q  705 tggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgattt 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9167065 tggtggctgattaatgcaaataaaatgttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgattt 9166966  T
Q  805 gtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaac 844  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9166965 gtgaaggctaattatttctagacgttacaattccacaaac 9166926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 609 - 912
Target Start/End: Original strand, 13518136 - 13518439
Alignment:
Q  609 tcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggt 708  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13518136 tcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccactaattacaataattttttggt 13518235  T
Q  709 ggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtga 808  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13518236 ggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaataaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtaa 13518335  T
Q  809 aggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaac 908  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518336 aggctaattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagattacacaatttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaac 13518435  T
Q  909 catt 912  Q
    ||||    
T  13518436 catt 13518439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 335 - 594
Target Start/End: Original strand, 17266600 - 17266858
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  17266600 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaataatgttggtggaaatggtgaaaagactaaaaa----aatgaagaaatggaatggatagaca 17266695  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaa--tgatttcttgataagatcaaggatggttcgat 531  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17266696 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcaccacaagaaaatctgatttcttgataagatcaaggatggttcaat 17266795  T
Q  532 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  17266796 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctacaaaattcaactt 17266858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 335 - 595
Target Start/End: Complemental strand, 34098967 - 34098711
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  34098967 tgatgagtgtcactgagccgtcggaagcaaattatgaataatgttggtggaaatggtgaaatgactaa-----aaaatgaagaaatgaaatggatagaca 34098873  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttcgatcc 533  Q
    |||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34098872 gggacgccacactttctaatccaataaagtgataagtctatagatgcgaggatcgccacaagaaaataatttcttgataagatcaaggatggttcaatcc 34098773  T
Q  534 agaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttt 595  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  34098772 agaaccacaagagacaaagttctcaatacacataagtgtaaaattctataaaattcaacttt 34098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 136 - 305
Target Start/End: Original strand, 3241789 - 3241958
Alignment:
Q  136 attgagtggcaaactatctttatggtaacatgttggcacttgtggacctggaggaataaaagcatttttgaagaggagttccatcgaccttttaatccaa 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3241789 attgagtggcaaactatctttatggtaacatgttggcacttgtggtcgtggaggaataagagcatttttgaagagtagttccatcgaccttttaatccaa 3241888  T
Q  236 ttgatgtgattcttaagagggctatggggattgataacggcgaacaaacacacgtaactggatgacctca 305  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| | |||||||  ||| ||||| ||||||||||    
T  3241889 ttgatgtgattcttaatatggctatggagattgataactgtgaacaaatgcacataacttgatgacctca 3241958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 749 - 883
Target Start/End: Original strand, 9398935 - 9399069
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  9398935 aagttagtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacatttatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacaccg 9399034  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgt 883  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9399035 cctttaattcttcagctaacacactttaaccacgt 9399069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 600 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 19458146 - 19458007
Alignment:
Q  600 atatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataa 699  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||||    
T  19458146 atatcattttcatgctctatttatatgagcctattacatgatgattttgattctaacactcttagaaaatgaaaggaagtgtagccactaattccaataa 19458047  T
Q  700 tgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaa 739  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19458046 tgttttagtggctgattagtgcaaagaaaaggttacaaaa 19458007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 599 - 747
Target Start/End: Complemental strand, 19459848 - 19459700
Alignment:
Q  599 catatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaata 698  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||    
T  19459848 catatcattttcgtgcactatttatatgaacatattacatgattattttgattctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcatccattaattgcaata 19459749  T
Q  699 atgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctc 747  Q
    |||||||||||| | |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  19459748 atgttttggtggttaattagtgcaaagaaaaggttataaaacgactctc 19459700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 635 - 794
Target Start/End: Original strand, 19460552 - 19460708
Alignment:
Q  635 acatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggtta 734  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  |||    
T  19460552 acatgatgattttgattctaaaactctttgaaaatgaaatgaaatgcagccactaattacaataatgttttggtggttgattaatgcaaaaaaaa--tta 19460649  T
Q  735 caaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgc 794  Q
    ||||| ||||||| ||| | | |  | |||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  19460650 caaaatgactctccaaggtag-gcttcatcaatgcatgaagaggttacacattcatttgc 19460708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 209 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 25376691 - 25376569
Alignment:
Q  209 aggagttccatcgaccttttaatccaattgatgtgattcttaagagggctatggggattgataacggcgaacaaacacacgtaactggatgacctcagct 308  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| |||     
T  25376691 aggagttccatcgaacttttaatccaattgatgtgattcttaagatgactatgaagattgataattgcgaacaaacacacgtaattggatgaccttagcc 25376592  T
Q  309 tactgatactattttcattggat 331  Q
    ||| || ||||||||||||||||    
T  25376591 tacagacactattttcattggat 25376569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 596 - 794
Target Start/End: Complemental strand, 19456441 - 19456246
Alignment:
Q  596 ttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattaca 695  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    || ||||||  |||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| ||    
T  19456441 ttacatatcattgtcgtgctctatttatatgagcttatta---tataattttggttctaaaactcttag-aaatgaaaggaaatgcatctactaattgca 19456346  T
Q  696 ataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaa-gttggtggc-taatcaatgcatgaggaggttacatattcatttg 793  Q
    |||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||||| || ||||||| || || |||||| | |||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  19456345 ataatgttttgg-gactgattagtgcaaagaaaatgttacataatgactctccaaggtgggtggcttcatcaatgcatggagaggttacacattcatttg 19456247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 596 - 680
Target Start/End: Original strand, 24663578 - 24663662
Alignment:
Q  596 ttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatg 680  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24663578 ttacgtatcattttcgtgctctatttatatgattttattacatgatgattttgattctaaaactcttagaaaataaaaggaaatg 24663662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 484 - 588
Target Start/End: Original strand, 23090869 - 23090973
Alignment:
Q  484 gatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaata 583  Q
    |||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||| | |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||    
T  23090869 gatcgccacaagaaaagaatttattgataagatcaaggatgattcaatctaaaaccgcaagagacaaagctatcaatacacatatgtataaaattctata 23090968  T
Q  584 aaatt 588  Q
    |||||    
T  23090969 aaatt 23090973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 596 - 674
Target Start/End: Original strand, 21484617 - 21484695
Alignment:
Q  596 ttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaag 674  Q
    |||||||||||||| ||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  21484617 ttacatatcatttttgtattgtatttatatgcgtttattacatgatgattttgattctaaaactcttacaaaatgaaag 21484695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 482 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 17780821 - 17780705
Alignment:
Q  482 aggatcaccacaagaaaa-tgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc----cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaa 576  Q
    |||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||    || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  17780821 aggatcgccacaagaaatgtgatttcttgataaaatcaaagatagttcgatcaatccataaccacaagaga-agagctctcaatacacatatgtgtaaaa 17780723  T
Q  577 ttcaataaaattctactt 594  Q
    ||  ||||||||| ||||    
T  17780722 ttgtataaaattcaactt 17780705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 597 - 712
Target Start/End: Complemental strand, 22474216 - 22474101
Alignment:
Q  597 tacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaa 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||  || | | ||| ||||||| ||||||| |||| ||||| | ||| ||||||  |    
T  22474216 tacatatcattttcgtgctctatttatatgaactcattacaagatagttctaattctgaaactctaagaaaataaaaggaaatgcaaccattaattatca 22474117  T
Q  697 taatgttttggtggct 712  Q
     |||||||||||||||    
T  22474116 caatgttttggtggct 22474101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 499 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 19460198 - 19460135
Alignment:
Q  499 atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatac 562  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| || || ||||||||| |||||| |||| |||||    
T  19460198 atgatttcttgataagatcaagaatagttcaattcataaccacaagggacaaaactcttaatac 19460135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 410; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 410; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 335 - 912
Target Start/End: Original strand, 244345 - 244917
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | ||||||| |  ||||| ||| ||||||| |||| |||||      ||||||||||||||||||||||    
T  244345 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtgaaaatggtgaaaagactaaaaat------gaagaaatggaatggatagaca 244438  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  244439 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggatggttcaatc 244538  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctact--ttttacatatcattttcgtgctctatttatatgagct 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  244539 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaacccctttttcatatcattttcgtgctctatttatatgagct 244638  T
Q  631 tattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaag 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  244639 tattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaat 244738  T
Q  731 gttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtt 830  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  244739 gttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtt 244838  T
Q  831 acaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  244839 acaattccacaaa---cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccatt 244917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 335 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 29952003 - 29951430
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaag-caactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||| | ||||| |||| |     |||||||||||||| ||||||||||||    
T  29952003 tgatgaatgtcacggagccgtcggaagtgaattatgaatattgttggtggaaatgatgaaaagactaa-----aaaatgaagaaatgtaatggatagaca 29951909  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  29951908 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcaccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaatc 29951809  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctact--ttttacatatcattttcgtgctctatttatatgagct 630  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29951808 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacttctttttcatatcattttcgtgctctatttatatgagct 29951709  T
Q  631 tattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaag 730  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  29951708 tattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaat 29951609  T
Q  731 gttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgtt 830  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29951608 gttacaaaatgactctctaagctggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgtt 29951509  T
Q  831 acaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29951508 acaattccacaaa---cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccatt 29951430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 334 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 29950366 - 29949792
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaag-caactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||  || |||||||| |  ||||||||| | ||||| |||| |     |||||||||||||| |||||||||||    
T  29950366 atgatgaatgtcacggagccgtcggaagtgaattatgaatattgttggtggaaatgatgaaaagactaa-----aaaatgaagaaatgtaatggatagac 29950272  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgat 531  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  29950271 agggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaat 29950172  T
Q  532 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctact--ttttacatatcattttcgtgctctatttatatgagc 629  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29950171 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacttctttttcatatcattttcgtgctctatttatatgagc 29950072  T
Q  630 ttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaa 729  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29950071 ttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcaaccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaa 29949972  T
Q  730 ggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgt 829  Q
     ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29949971 tgttacaaaatgactctctaagctggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggctaattatttctagacgt 29949872  T
Q  830 tacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29949871 tacaattccacaaa---cacctttaattcttcagcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttacaccatt 29949792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 349 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 4568484 - 4568240
Alignment:
Q  349 gagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactt 447  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| ||||     ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  4568484 gagccgtcggaagcaaattatgaatattgttggtggaaatggtgaaaagactaaaaa-----atgaagaaatg-aatggatagacagggacgccacactt 4568391  T
Q  448 tctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagag 546  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  4568390 tctaatccaaaaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattttttgataagatcaagaatggttcaatccagaaccacaagag 4568291  T
Q  547 acaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||    
T  4568290 acaaagctctcaatacacataagtataaaattctataaaattcaacttttt 4568240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 329
Target Start/End: Original strand, 35874992 - 35875153
Alignment:
Q  168 ttggcacttgtggacctggaggaataaaagcatttttgaagaggagttccatcgaccttttaatccaattgatgtgattcttaagagggctatggggatt 267  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||    ||||    
T  35874992 ttggcacttgtggatgtggaggaataagagcatttttgaagaggagttccatcgtgttttcaatccaattggtgtgattctcaagatggctacatagatt 35875091  T
Q  268 gataacggcgaacaaacacacgtaactggatgacctcagcttactgatactattttcattgg 329  Q
    |||||| || ||| |||||   || ||||||| ||| | | |||||| | ||||||||||||    
T  35875092 gataactgcaaactaacacgaatatctggatggcctaaacatactgacaatattttcattgg 35875153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 414 - 498
Target Start/End: Original strand, 11126394 - 11126478
Alignment:
Q  414 agaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  11126394 agaaatggaatggaaatacagggatgccacactttctaatccaagaaagtggtaagtctatgggattgaggatcaccacaagaaa 11126478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 599 - 692
Target Start/End: Complemental strand, 27402068 - 27401975
Alignment:
Q  599 catatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaatt 692  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||| ||| |||||| ||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  27402068 catatcatttttgtgctctttttatatgggctaattacaagatggctttgattctaaaactctcagaaaatgaaaataaatgcagccactaatt 27401975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 383 - 546
Target Start/End: Complemental strand, 34597919 - 34597760
Alignment:
Q  383 gaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcact--ttctaattcaagaaagt--gataagtctatggat 478  Q
    |||||||||||| ||||||||     ||||||||||||||||||||||||| | || |  ||||  ||||||||||||||||   |||||||   |||||    
T  34597919 gaaaaggtgaaaagactcaaac----aatgaagaaatggaatggatagacaagaacactacactctttctaattcaagaaagaacgataagttggtggat 34597824  T
Q  479 gtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagag 546  Q
    |  |||||| | |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34597823 g--aggatctctacaa-aaaaggatttcttgataagat-aaggatggttcaatccagaaccacaagag 34597760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 317; Significance: 1e-178; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 523 - 912
Target Start/End: Original strand, 1491 - 1882
Alignment:
Q  523 tggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctact--ttttacatatcattttcgtgctctatt 620  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||  |||||||||  ||||||||||| ||||    
T  1491 tggttcaatccagaaccataagagacaaagctctcaatacacataagtgtaaaattctataaaattcaactctttttacatagaattttcgtgctatatt 1590  T
Q  621 tatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatg 720  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1591 tatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgcagccattaattacaataatgttttggtggctgattaatg 1690  T
Q  721 caaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatt 820  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1691 caaataagaggttacaaaatgactctctaagttagtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatt 1790  T
Q  821 tctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1791 tctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaaattacaactcattttaaaccatt 1882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 292; Significance: 1e-163; HSPs: 6)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 292; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 583 - 909
Target Start/End: Complemental strand, 8366642 - 8366315
Alignment:
Q  583 aaaattctactt-tttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatgg 681  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  8366642 aaaattctacttgtttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgaggactttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgc 8366543  T
Q  682 agccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggtta 781  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8366542 agccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggtta 8366443  T
Q  782 catattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccac 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8366442 catattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacactttaaccac 8366343  T
Q  882 gttttcaacttacaactcattttaaacc 909  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8366342 gttttcaacttacaactcattttaaacc 8366315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 335 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 20731122 - 20730871
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||| | | |||||||  || |||||| ||||||| |||| || |||     |||||||| |||||||||||||    
T  20731122 tgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattaagaataatgttgatggaaatggtgaaaagactaaagatt-----gaagaaattgaatggatagaca 20731028  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  20731027 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaatc 20730928  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20730927 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattc 20730871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Original strand, 17277991 - 17278144
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17277991 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcattttcacattgatttgtgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacacca 17278090  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  17278091 cctttaattcttcagctaacacactttaaccacgtcttctacttatagctcatt 17278144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 406 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 18446307 - 18446214
Alignment:
Q  406 taaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaa 499  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||    
T  18446307 taaaatggagaaatggaatggaaagaaagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatgggattgaggaccaccacaagaaaa 18446214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 16417535 - 16417620
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  16417535 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 16417620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 18774284 - 18774369
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  18774284 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 18774369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 583 - 912
Target Start/End: Original strand, 22300045 - 22300375
Alignment:
Q  583 aaaattctactt-tttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgattttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatgg 681  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  22300045 aaaattctacttgtttacatatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatgactttgactctaaaactcttagaaaatgaaaggaaatgc 22300144  T
Q  682 agccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggtta 781  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22300145 agccattaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgaggaggtta 22300244  T
Q  782 catattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacactttaaccac 881  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22300245 catattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttgcacactttaaccac 22300344  T
Q  882 gttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22300345 gttttcaacttacaactcattttaaaccatt 22300375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 407 - 597
Target Start/End: Original strand, 6050194 - 6050385
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgattt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  6050194 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattt 6050293  T
Q  506 cttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  6050294 cttgataagatcaaggatggttcaatccagaaccacaagagacaaagctcttaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacttttt 6050385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 407 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 15409979 - 15409796
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgattt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15409979 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattt 15409880  T
Q  506 cttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  15409879 cttgataagatcaaggatggttcaatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattc 15409796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Original strand, 18535618 - 18535771
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  18535618 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacacca 18535717  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18535718 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatt 18535771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Original strand, 24806599 - 24806753
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattat-ttctagacgttacaattccacaaacacc 847  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  24806599 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagacgttacaattccacaaacacc 24806698  T
Q  848 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  24806699 acctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatt 24806753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 749 - 912
Target Start/End: Original strand, 24808455 - 24808619
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattat-ttctagacgttacaattccacaaacacc 847  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  24808455 aagttggtggcggatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacacc 24808554  T
Q  848 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| | |||||||    
T  24808555 acctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctaattacagctcattctgaaccatt 24808619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 136 - 272
Target Start/End: Original strand, 10281111 - 10281247
Alignment:
Q  136 attgagtggcaaactatctttatggtaacatgttggcacttgtggacctggaggaataaaagcatttttgaagaggagttccatcgaccttttaatccaa 235  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  10281111 attgtgtggcaaactatatttatggtaacatgttggcacttgtggaagtggaggaataagagcatttttgaagaggagttccatcgtcctttcaatccaa 10281210  T
Q  236 ttgatgtgattcttaagagggctatggggattgataa 272  Q
    ||||| ||||||| || | |||||||  |||||||||    
T  10281211 ttgatatgattctcaaaatggctatgtagattgataa 10281247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 335 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33809625 - 33809366
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaactatgaataattat--ggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||| || |  |||||||| ||||||| || |||||| |||  |||||||||||||| |||||||    
T  33809625 tgatgagtgtcgtggagccgtcggaagcaaattagaatatttttttggtggaaatggtgaaaagattcaaaaataag-tgaagaaatggaatcgatagac 33809527  T
Q  433 agggacgccgcact--ttctaattcaagaaag--tgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttc 528  Q
    | || |||| ||||  ||| ||| ||||||||  ||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||  | ||     |||||| ||||||||||     
T  33809526 aagggcgccacactctttccaatccaagaaagaatgataagccgatggatgcgaggatcgccacaagaaaagaaatt-----taagattaaggatggttt 33809432  T
Q  529 gatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33809431 gatccaaaaccacaagagacaagactctcaacacacatatgtgtaaaattctataaaattcaactt 33809366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 44794840 - 44794755
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  44794840 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 44794755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 256 - 329
Target Start/End: Original strand, 6372274 - 6372347
Alignment:
Q  256 gctatggggattgataacggcgaacaaacacacgtaactggatgacctcagcttactgatactattttcattgg 329  Q
    ||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||| |||||    
T  6372274 gctatggagatcgataacggaaaacaaacacatgtaactggatggccttagcatactgacactatttttattgg 6372347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 407 - 449
Target Start/End: Original strand, 23732418 - 23732460
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttc 449  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  23732418 aaaatgaagaaatagaacggatagacagggacgccacactttc 23732460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 21)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 676 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 25532077 - 25531841
Alignment:
Q  676 aaatggagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataaaaggttacaaaaggactctctaagttggtggctaatcaatgcatgagg 775  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25532077 aaatgcagccactaattacaataatgttttggtggctgattaatgcaaataagaggttacaaaatgactctctaagttggtggctaatcaatgcatgagg 25531978  T
Q  776 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttccgcttacacacttt 875  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25531977 aggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctttaattcttcagcttacacacttt 25531878  T
Q  876 aaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25531877 aaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 25531841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 334 - 589
Target Start/End: Complemental strand, 5553721 - 5553469
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||  || |||||| | ||||| |||| ||||     |||||||||||||||||||||||    
T  5553721 atgatgagtgtcacggagccgtcggaagcaaattaagaataatgttgatggaaatgatgaaaagactaaaaa-----atgaagaaatggaatggatagac 5553627  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgat 531  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  5553626 agggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatgtatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaatgatggttcaat 5553527  T
Q  532 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattc 589  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5553526 ccagaaccacaagagataaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattc 5553469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Original strand, 5554107 - 5554260
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  5554107 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttacacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacacca 5554206  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  5554207 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatt 5554260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 16347002 - 16346849
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16347002 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacacca 16346903  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  16346902 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatt 16346849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 23460570 - 23460417
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  23460570 aagttggtggttgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacacca 23460471  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| || |||| ||||||    
T  23460470 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacctacagctcatt 23460417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Original strand, 47418292 - 47418445
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47418292 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaatgcttattatggctagacgttacatttccacaaacacca 47418391  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  47418392 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatt 47418445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 753 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 47566839 - 47566680
Alignment:
Q  753 tggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccacctt 852  Q
    |||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  47566839 tggtggttgatcaatgcttgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaagcttattatttctagaaattacaattccacaaacaccacttt 47566740  T
Q  853 taattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||  ||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| || ||||||    
T  47566739 taattcttcaacttgcacactttaatcacgtcttcaacttacagctcattctacaccatt 47566680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 366 - 594
Target Start/End: Original strand, 17236777 - 17236997
Alignment:
Q  366 tatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtga 465  Q
    ||||||||||  ||||||||| ||||||| |||| ||||   |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||    
T  17236777 tatgaataatgttggtggaaatggtgaaaagactaaaaa---aaatgaagaaatggaatggacagacagggatgccacactttttaatccaagaaagtga 17236873  T
Q  466 taagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacac 564  Q
    ||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||      ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  17236874 taagtttatcgatgcgaggatcgccacaagaaatgtgattttttgataaga------atggttcaaaccagaaccacaagagacaaaactctcgatacac 17236967  T
Q  565 atatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||| ||||    
T  17236968 ataagtgtaaaattctacaaaattcaactt 17236997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 334 - 561
Target Start/End: Complemental strand, 22271384 - 22271157
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaac--tatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggataga 431  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||   || ||||| || ||||| ||||||| ||| |||| ||||    |||| |||||| ||||||||| |    
T  22271384 atgatgagtgtcgcggagcc-tcggaagcaaaattaggaatatttttggtgtaaaaggtaaaaagactgaaaa----aatgtagaaatagaatggataaa 22271290  T
Q  432 cagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgag--gatcaccacaagaaaa-tgatttcttgataagatcaaggatggttc 528  Q
    |   |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22271289 ctcagacgccacactttctaatcccagaaagtgataagtctatggatgcgagatgatcgccacaagaaatgtgatttcttgataagatcaatgatggttc 22271190  T
Q  529 gatccagaaccacaagagacaaagctctcaata 561  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22271189 aatccagaaccacaagagacaaaactctcaata 22271157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 338 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 23433262 - 23433138
Alignment:
Q  338 tgagtgtcgcggagccgtcggaagcaacta-tgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagacaggg 436  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||  ||||| ||| ||||||| |||| |||||      |||||||||||||||||||||| ||    
T  23433262 tgagtgtcacggagccgtcggaagcaaattctgaataatgttggtgaaaatggtgaaaagactaaaaat------gaagaaatggaatggatagacatgg 23433169  T
Q  437 acgccgcactttctaattcaagaaagtgata 467  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23433168 acgccacactttctaatccaagaaagtgata 23433138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 406 - 498
Target Start/End: Original strand, 16019424 - 16019516
Alignment:
Q  406 taaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  16019424 taaaatggagaaatggaatggaaagaaagggacactacactttctaatccaagaaagtgataagtctctgggattgaggatcaccacaagaaa 16019516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 599 - 708
Target Start/End: Complemental strand, 2693900 - 2693788
Alignment:
Q  599 catatcattttcgtgctctatttatatgagcttattacatgatga---ttttgactctaaaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattaca 695  Q
    |||||||||||||||  || ||||| || ||||| |||||||||    |||||| ||| ||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||    
T  2693900 catatcattttcgtgtcctctttatgtgggcttagtacatgatgcaggttttgattctgaaactcttagaaaataaaagtaaatgcaaccactaattgca 2693801  T
Q  696 ataatgttttggt 708  Q
    || ||||||||||    
T  2693800 attatgttttggt 2693788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Original strand, 13956976 - 13957049
Alignment:
Q  445 ctttctaattcaagaaag--tgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatca 518  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13956976 ctttctaatccaagagagaatgataagcctatggatg--aggatcaccacaagaaaaggatttcttgataagatca 13957049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Original strand, 13962709 - 13962782
Alignment:
Q  445 ctttctaattcaagaaag--tgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatca 518  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13962709 ctttctaatccaagagagaatgataagcctatggatg--aggatcaccacaagaaaaggatttcttgataagatca 13962782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15382027 - 15381954
Alignment:
Q  445 ctttctaattcaagaaag--tgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatca 518  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15382027 ctttctaatccaagagagaatgataagcctatggatg--aggatcaccacaagaaaaggatttcttgataagatca 15381954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 445 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 15387763 - 15387690
Alignment:
Q  445 ctttctaattcaagaaag--tgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatca 518  Q
    ||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15387763 ctttctaatccaagagagaatgataagcctatggatg--aggatcaccacaagaaaaggatttcttgataagatca 15387690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 13179870 - 13179955
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13179870 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 13179955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 13184528 - 13184613
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  13184528 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 13184613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 559 - 597
Target Start/End: Original strand, 16345391 - 16345429
Alignment:
Q  559 atacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16345391 atacacatatgtgtaaaattctataaaattcaacttttt 16345429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 33757949 - 33758034
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  33757949 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctattga-atgaagatcaccacaagaaa 33758034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 655 - 714
Target Start/End: Complemental strand, 2683989 - 2683933
Alignment:
Q  655 aaactcttagaaaatgaaagcaaatggagccactaattacaataatgttttggtggctga 714  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2683989 aaactcttagaaaatgaacggaaatgcagc---taatttcaataatgttttggtggctga 2683933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 334 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 18782003 - 18781742
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact--atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggataga 431  Q
    |||||||||| | | |||||||||||||||| |  ||||||| |  ||||||||| ||||||| |||| |||      ||||||||||||||||||||||    
T  18782003 atgatgagtgccacagagccgtcggaagcaaattaatgaatattgttggtggaaatggtgaaaagactaaaag-----atgaagaaatggaatggataga 18781909  T
Q  432 cagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcga 530  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  18781908 cagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaa 18781809  T
Q  531 tccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  18781808 tccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacttttt 18781742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 407 - 589
Target Start/End: Original strand, 30518256 - 30518439
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgattt 505  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  30518256 aaaatgaagaaatgaaatggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattt 30518355  T
Q  506 cttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattc 589  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  30518356 cttgataagatcaaggatggttcaatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattc 30518439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 335 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 18553586 - 18553331
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||    |||||||||||||||| ||||||||    
T  18553586 tgatgagtgtcatggagccgtcggaagcaaattatgaataatgttggtggaaatggtgagaagactaaaaa----aatgaagaaatggaattgatagaca 18553491  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  18553490 gggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaatc 18553391  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18553390 cagaaccacaagagacaaggctctcaatacac--atgtgtaaaattctataaaattcaactt 18553331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 410 - 589
Target Start/End: Original strand, 20419613 - 20419793
Alignment:
Q  410 atgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttctt 508  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20419613 atgaagaaatggaatggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttctt 20419712  T
Q  509 gataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattc 589  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20419713 gataagatcaaggttggttcaatccagaaccacaagagacaagactctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattc 20419793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 410 - 589
Target Start/End: Original strand, 20414880 - 20415060
Alignment:
Q  410 atgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttctt 508  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  20414880 atgaagaaattgaatggatagacagggacgccacactttctaatctaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttctt 20414979  T
Q  509 gataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattc 589  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20414980 gataagatcaaggttggttcaatccagaaccacaagagacaaggctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattc 20415060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 334 - 564
Target Start/End: Original strand, 20417454 - 20417682
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||| ||||| | |||| ||||    |||||||||||||||| |||||||    
T  20417454 atgatgagtgccacggagccgtcggaagcaaattatgaataatgttggtggaaatggtgagaagactaaaaa----aatgaagaaatggaattgatagac 20417549  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgat 531  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20417550 agggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaat 20417649  T
Q  532 ccagaaccacaagagacaaagctctcaatacac 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20417650 ccagaaccacaagagacaaggctctcaatacac 20417682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 378 - 597
Target Start/End: Original strand, 6230578 - 6230798
Alignment:
Q  378 tggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaag--tgataagtctatg 475  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||  |  | | ||||  ||| ||| ||||  ||||||| | |||    
T  6230578 tggtggaaaatgtgaaaaaactcaaaaaataaatgaagaaatggaatggatagacaggcgccacactcttttcaatccaaaaaagaatgataagccgatg 6230677  T
Q  476 gatgtgaggatcaccacaagaaaa-tgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaa 574  Q
    ||||  | |||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6230678 gatg--aagatcgccataagaaatgtgatttcttgataagatcaaggatggttcaatccagaaccacaagagtcaaaactctcaatacacatatgtgtaa 6230775  T
Q  575 aattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||| | ||||||| |||||||    
T  6230776 aattctacaaaattcaacttttt 6230798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 501 - 597
Target Start/End: Original strand, 20417683 - 20417779
Alignment:
Q  501 gatttcttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  20417683 gatttcttgataagatcaaggttggttcaatccagaaccacaagagacaaggctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaacttttt 20417779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 21299377 - 21299462
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  21299377 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 21299462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 433 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 12639568 - 12639504
Alignment:
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||    
T  12639568 agggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctataga-atgaagatcaccacaagaaa 12639504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 411 - 597
Target Start/End: Original strand, 848 - 1035
Alignment:
Q  411 tgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttg 509  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  848 tgaagaaatggaatggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgagaggatcgccacaagaaatatgatttcttg 947  T
Q  510 ataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  948 ataagatcaaggatggttcaatccagaaccacaagagacaaagttctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattccacttttt 1035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 407 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 33397 - 33210
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttc 506  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  33397 aaaatgaagaaatggaattgatagacagggacgccacactttctaatccaagaaattgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaaataatttc 33298  T
Q  507 ttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||    
T  33297 ttgataagatcaaggatggttcaatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctacaaaattcaactt 33210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 144; Significance: 3e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 407 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 136937 - 136746
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgattt 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  136937 aaaatgaagaaatggattggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattt 136838  T
Q  506 cttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctacttttt 597  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||    
T  136837 cttgataagatcaaggatggtttaatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaacttttt 136746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 142; Significance: 5e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 334 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 6864 - 6608
Alignment:
Q  334 atgatgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagac 432  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||| |||  ||||||||| ||||||| ||||  |||     |||||||||||||||||||||||    
T  6864 atgatgagtgtcacggagccgtcggaagcaaattaagaagaatgttggtggaaatggtgaaaagactagaaa-----atgaagaaatggaatggatagac 6770  T
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6769 agggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaaaaaaattcttgataagatcaagaatggttcaatc 6670  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6669 caaaaccacaagagacaaagctctcaatacacataagtgtaaaattctataaaattcaactt 6608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 337 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 9756 - 9503
Alignment:
Q  337 atgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagacagg 435  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9756 atgagtgtcacggagtcgtcggaagcaaattaagaataatgttggtggaaatggtgaaaagactagaaa-----atgaagatatggaatggatagacagg 9662  T
Q  436 gacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccag 535  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  9661 gacaccacactttctaatccaagaaagtgataagtcggtggatgcgaggatccccacaagaaaagaaattcttgataagaacaagaatggttcaatccag 9562  T
Q  536 aaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  9561 aaccacaagagacaaagctctcaatacacataagtgtaaaattctatcaaattcaactt 9503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 337 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 17423 - 17170
Alignment:
Q  337 atgagtgtcgcggagccgtcggaagcaact-atgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagacagg 435  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | | |||||||  ||||||||| ||||||| ||||  |||     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  17423 atgagtgtcacggagtcgtcggaagcaaattaagaataatgttggtggaaatggtgaaaagactagaaa-----atgaagatatggaatggatagacagg 17329  T
Q  436 gacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaaatgatttcttgataagatcaaggatggttcgatccag 535  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  17328 gacaccacactttctaatccaagaaagtgataagtcggtggatgcgaggatccccacaagaaaagaaattcttgataagaacaagaatggttcaatccag 17229  T
Q  536 aaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||||    
T  17228 aaccacaagagacaaagctctcaatacacataagtgtaaaattctatcaaattcaactt 17170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 749 - 789
Target Start/End: Complemental strand, 27520 - 27480
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattca 789  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27520 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattca 27480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 407 - 594
Target Start/End: Original strand, 25732 - 25920
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgattt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  25732 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtatatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattt 25831  T
Q  506 cttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25832 cttgataagatcaaggttggttcaatccagaactacaagagacaaagctctcactacacatatgtgtaaaattctataaaattcaactt 25920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 134; Significance: 3e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 335 - 594
Target Start/End: Original strand, 4497 - 4753
Alignment:
Q  335 tgatgagtgtcgcggagccgtcggaagc-aactatgaataattatggtggaaaaggtgaaatgactcaaaattaaaatgaagaaatggaatggatagaca 433  Q
    |||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||| | ||||| |||| |     |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4497 tgatgagtatcacggagccgtcggaagcaaattatgaataatgttggtggaaatgatgaaaagactaa-----aaaatgtagaaatggaatggatagaca 4591  T
Q  434 gggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaaggatggttcgatc 532  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  4592 gggatgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcaaggatcgccgcaagaaatatgatttcttgataagatcaaggttggttcaatc 4691  T
Q  533 cagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  4692 cagaaccacaagagacaaggctctcaatacacatatgtgtaaaattctataatattcaactt 4753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 410 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 54948 - 54763
Alignment:
Q  410 atgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgatttctt 508  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  54948 atgaagaaatggaatggatatatagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgagtatcgccacaagaaatatgatttctt 54849  T
Q  509 gataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaaagctctcaatacacatatgtgtaaaattcaataaaattctactt 594  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  54848 gataagatcaaggttggttcaatccagaaccacaagagacaaggctctcaatacacatatgtgtaaaattctataaaattcaactt 54763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 755 - 912
Target Start/End: Complemental strand, 86941 - 86784
Alignment:
Q  755 gtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacaccaccttta 854  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86941 gtggctaatcaatggatgaggaggttacatattgattttcacattgatttgtgaaggcttattatttatagacgttacaattccacaaacaccaccttta 86842  T
Q  855 attcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  86841 attcttcagcttactcactttaaccacgttttcagcttacaactcattttacaccatt 86784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 407 - 550
Target Start/End: Original strand, 22586 - 22730
Alignment:
Q  407 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa-atgattt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  22586 aaaatgaagaaatggaatggatagacagggacgccacactttctaatccaagaaagtgataagtctatggatgcgaggatcgccacaagaaatatgattt 22685  T
Q  506 cttgataagatcaaggatggttcgatccagaaccacaagagacaa 550  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22686 cttgataagatcaaggatggttcaatccagaaccacaagagacaa 22730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 55225 - 55072
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  55225 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatggctagacgttacaattccacaaacacca 55126  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  55125 cctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctacttacagctcatt 55072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 110; Significance: 6e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 749 - 902
Target Start/End: Complemental strand, 241414 - 241261
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattatttctagacgttacaattccacaaacacca 848  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  241414 aagttggtggctgatcaatgcatgagaaggttatatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatgtctagacgttacaattccacaaacacca 241315  T
Q  849 cctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcatt 902  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||    
T  241314 cctttaattcttcagctaacacactttaaccacgtcttctacttatagctcatt 241261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 481 - 540
Target Start/End: Complemental strand, 241675 - 241614
Alignment:
Q  481 gaggatcaccacaagaaa-atgatttcttgataagatcaa-ggatggttcgatccagaacca 540  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  241675 gaggatcaccacaagaaacgtggtttcttgataagatcaacgcatggttcaatccagaacca 241614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 93; Significance: 8e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 749 - 912
Target Start/End: Original strand, 399 - 563
Alignment:
Q  749 aagttggtggctaatcaatgcatgaggaggttacatattcatttgcacattgatttgtgaaggcttattat-ttctagacgttacaattccacaaacacc 847  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||    
T  399 aagttggtggcggatcaatgcatgagaaggttacatattcatttgcacattgatttttgaaggcttattatggcctagccgttacaattccacaaacacc 498  T
Q  848 acctttaattcttccgcttacacactttaaccacgttttcaacttacaactcattttaaaccatt 912  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||| |||||| | |||||||    
T  499 acctttaattcttcagctaacatactttaaccacgtcttctaattacagctcattctgaaccatt 563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Original strand, 8747 - 8832
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  8747 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 8832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 413 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 289058 - 288973
Alignment:
Q  413 aagaaatggaatggatagac-agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  289058 aagaaatggaatggagagtttagggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 288973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 498
Target Start/End: Complemental strand, 2199 - 2135
Alignment:
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  2199 agggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 2135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 433 - 498
Target Start/End: Original strand, 33780 - 33844
Alignment:
Q  433 agggacgccgcactttctaattcaagaaagtgataagtctatggatgtgaggatcaccacaagaaa 498  Q
    ||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||    
T  33780 agggacgccacactttctaatcctagaaaatgataagtctatgga-atgaagatcaccacaagaaa 33844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University