View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF0982_low_1 (Length: 783)

Name: NF0982_low_1
Description: NF0982
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF0982_low_1
NF0982_low_1
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (92-783)||(18200715-18201407)
chr3 (159-783)||(26950486-26951113)
chr3 (159-782)||(36091934-36092560)
chr3 (95-528)||(36091495-36091931)
chr3 (95-528)||(26951116-26951552)
chr3 (95-266)||(18256107-18256278)
chr3 (101-265)||(49562482-49562646)
chr3 (95-265)||(35716184-35716354)
chr3 (95-251)||(31487113-31487269)
chr3 (95-251)||(36087657-36087813)
chr3 (95-247)||(36947224-36947375)
chr3 (101-247)||(38655996-38656142)
chr3 (95-251)||(18198592-18198748)
chr3 (95-251)||(52418862-52419017)
chr3 (95-169)||(12825171-12825245)
chr3 (92-169)||(13454947-13455024)
chr3 (92-169)||(16651391-16651468)
chr3 (92-203)||(16066870-16066981)
chr3 (95-168)||(4594084-4594157)
chr3 (95-161)||(854554-854620)
chr3 (95-169)||(12260798-12260872)
chr3 (95-169)||(26947819-26947893)
chr3 (104-240)||(16725940-16726076)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (92-783)||(3590567-3591259)
chr6 (95-266)||(25971107-25971278)
chr6 (95-249)||(25975547-25975701)
chr6 (95-251)||(2280821-2280977)
chr6 (92-226)||(34265224-34265358)
chr6 (95-169)||(33045848-33045922)
chr6 (179-248)||(17905868-17905937)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (95-783)||(41859940-41860631)
chr4 (159-783)||(52681699-52682326)
chr4 (95-528)||(52682329-52682765)
chr4 (92-266)||(36895718-36895891)
chr4 (95-251)||(30388097-30388253)
chr4 (95-249)||(21382528-21382682)
chr4 (95-251)||(16908941-16909097)
chr4 (95-251)||(28389279-28389435)
chr4 (92-178)||(41944072-41944158)
chr4 (136-251)||(29359311-29359426)
chr4 (95-169)||(19515295-19515369)
chr4 (95-169)||(21581685-21581759)
chr4 (299-395)||(23004567-23004660)
chr4 (92-142)||(37062400-37062452)
chr4 (104-240)||(4882107-4882243)
chr4 (641-776)||(30576448-30576582)
[»] chr1 (21 HSPs)
chr1 (95-783)||(2045316-2046007)
chr1 (370-780)||(35595295-35595705)
chr1 (92-378)||(35593930-35594216)
chr1 (92-266)||(23086259-23086433)
chr1 (95-249)||(37891602-37891756)
chr1 (95-251)||(39513323-39513479)
chr1 (95-251)||(29245330-29245486)
chr1 (95-250)||(45503600-45503755)
chr1 (95-251)||(38211061-38211217)
chr1 (95-251)||(50708751-50708907)
chr1 (95-251)||(48650894-48651050)
chr1 (95-250)||(13926369-13926520)
chr1 (95-169)||(49787424-49787498)
chr1 (95-169)||(2047567-2047641)
chr1 (95-169)||(36866978-36867052)
chr1 (95-169)||(7480470-7480544)
chr1 (95-169)||(9533846-9533920)
chr1 (95-169)||(42496554-42496628)
chr1 (92-151)||(26211630-26211689)
chr1 (92-243)||(23480959-23481110)
chr1 (146-248)||(5429244-5429346)
[»] chr5 (12 HSPs)
chr5 (95-783)||(32674238-32674929)
chr5 (92-266)||(16678829-16679002)
chr5 (92-249)||(38095575-38095732)
chr5 (295-479)||(8795897-8796082)
chr5 (95-169)||(20105161-20105235)
chr5 (92-169)||(3608003-3608080)
chr5 (92-169)||(30090418-30090495)
chr5 (95-169)||(12655177-12655251)
chr5 (95-169)||(23183962-23184036)
chr5 (95-169)||(23188229-23188303)
chr5 (95-169)||(34761223-34761297)
chr5 (95-169)||(39878057-39878131)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (95-783)||(40604710-40605401)
chr2 (159-783)||(13907228-13907855)
chr2 (159-783)||(26454873-26455500)
chr2 (95-528)||(26455503-26455939)
chr2 (95-528)||(13907858-13908293)
chr2 (95-251)||(35432242-35432398)
chr2 (95-251)||(207623-207779)
chr2 (95-251)||(5013634-5013791)
chr2 (101-247)||(1512653-1512799)
chr2 (95-169)||(13905287-13905361)
chr2 (95-169)||(2300779-2300853)
chr2 (95-169)||(6123670-6123744)
chr2 (95-169)||(184091-184165)
chr2 (95-169)||(976151-976225)
chr2 (95-169)||(2449325-2449399)
chr2 (92-130)||(23455759-23455797)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (95-783)||(14994547-14995238)
chr8 (92-266)||(37589444-37589618)
chr8 (95-251)||(22729954-22730110)
chr8 (95-251)||(23827644-23827800)
chr8 (95-251)||(19961504-19961660)
chr8 (95-169)||(406231-406305)
chr8 (95-169)||(18266066-18266140)
chr8 (95-168)||(41376488-41376561)
chr8 (295-347)||(36238570-36238622)
chr8 (95-169)||(18275079-18275153)
chr8 (107-240)||(9885678-9885811)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (159-783)||(22005946-22006573)
chr7 (159-783)||(7892722-7893349)
chr7 (95-528)||(7893352-7893788)
chr7 (95-528)||(22006576-22007011)
chr7 (361-630)||(3595667-3595936)
chr7 (92-296)||(3595461-3595666)
chr7 (624-783)||(3598843-3599008)
chr7 (95-251)||(45115705-45115861)
chr7 (95-251)||(32660102-32660258)
chr7 (101-266)||(26168704-26168869)
chr7 (92-241)||(35102862-35103010)
chr7 (95-169)||(17696872-17696946)
chr7 (95-169)||(27715901-27715975)
chr7 (95-169)||(16719857-16719931)
chr7 (95-169)||(31100097-31100171)
chr7 (95-169)||(7888824-7888898)
chr7 (95-168)||(29956435-29956508)
chr7 (95-153)||(32038416-32038474)
chr7 (295-334)||(16805970-16806009)
[»] scaffold0097 (2 HSPs)
scaffold0097 (101-249)||(51990-52138)
scaffold0097 (95-169)||(40512-40586)
[»] scaffold0642 (1 HSPs)
scaffold0642 (95-169)||(3356-3430)
[»] scaffold0345 (1 HSPs)
scaffold0345 (95-169)||(13268-13342)
[»] scaffold0105 (1 HSPs)
scaffold0105 (95-169)||(25639-25713)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (95-153)||(45550-45608)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (179-248)||(104606-104675)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 609; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 609; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 18201407 - 18200715
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18201407 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcctttgaagtaaccctttatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacac 18201308  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201307 caacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagataacagaaattgctttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 18201208  T
Q  292 ctaaccc-gtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 390  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201207 ttaaccccgtgctatcacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 18201108  T
Q  391 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 490  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201107 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 18201008  T
Q  491 tcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 590  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18201007 tcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 18200908  T
Q  591 aatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 690  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200907 aatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 18200808  T
Q  691 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18200807 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 18200715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 26951113 - 26950486
Alignment:
Q  159 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  26951113 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 26951014  T
Q  256 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951013 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 26950914  T
Q  356 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 455  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26950913 tcacataaaaaccataaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 26950814  T
Q  456 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 555  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  26950813 gttaatggtaagttaaacatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 26950714  T
Q  556 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26950713 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacatagtcacatcagtataatcaaccacca 26950614  T
Q  656 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26950613 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 26950514  T
Q  756 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26950513 gataacaatgcaattcaaaaagtcatcg 26950486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 782
Target Start/End: Original strand, 36091934 - 36092560
Alignment:
Q  159 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 255  Q
    |||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||       
T  36091934 catgtgaaaaaacaggagaagatagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataatgg 36092033  T
Q  256 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092034 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 36092133  T
Q  356 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36092134 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 36092233  T
Q  456 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  36092234 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 36092333  T
Q  556 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  36092334 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacagcttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacaatcacattagtataatcaaccacca 36092433  T
Q  656 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 755  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  36092434 ctgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 36092533  T
Q  756 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatc 782  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  36092534 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatc 36092560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 528
Target Start/End: Original strand, 36091495 - 36091931
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| |||||| || | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36091495 tcattaatcaatatttttaaaacacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 36091594  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36091595 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 36091694  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36091695 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 36091794  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  36091795 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 36091894  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36091895 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 36091931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 26951552 - 26951116
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26951552 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 26951453  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951452 catgtttcaacgactgaccctaactcttgttaatagtcactgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 26951353  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26951352 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 26951253  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26951252 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 26951153  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 528  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26951152 catatggttagatagatccttattcagccaatagaat 26951116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 18256278 - 18256107
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  18256278 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagacaccaa 18256179  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 266  Q
    ||| ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  18256178 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttc 18256107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 101 - 265
Target Start/End: Original strand, 49562482 - 49562646
Alignment:
Q  101 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 200  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  49562482 atcaatatttttaaaccaccccttgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 49562581  T
Q  201 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgcctt 265  Q
     || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  49562582 ctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcgaaaattgcctt 49562646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 35716354 - 35716184
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  35716354 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 35716255  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgcctt 265  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  35716254 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagatatcggaaattgcctt 35716184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 31487269 - 31487113
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  31487269 tcattaatcaatatttttaaaccagccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 31487170  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31487169 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 31487113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 36087657 - 36087813
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  36087657 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtaaaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 36087756  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36087757 catgttctagcgactgacccggactcttgttaatagtgattgcaaatgagacagata 36087813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 247
Target Start/End: Original strand, 36947224 - 36947375
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  36947224 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtg-aaaaacaggagacggtaggtagacaccaa 36947322  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 247  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36947323 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 36947375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 247
Target Start/End: Original strand, 38655996 - 38656142
Alignment:
Q  101 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  38655996 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 38656095  T
Q  201 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 247  Q
     || ||| | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38656096 ctagcgactaaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 38656142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18198748 - 18198592
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  18198748 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtagcccgtgatagtgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 18198649  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18198648 catgttctagcgactgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaaagata 18198592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 52418862 - 52419017
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| ||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| | || ||||||| || |||||||    
T  52418862 tcattaatcaatatctttaaaacacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtcaatgtg-aaaaataggaaacggtaggtagacaccaa 52418960  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    ||| || || ||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52418961 catattctagcgactgaccctgacccttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 52419017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12825245 - 12825171
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12825245 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 12825171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 169
Target Start/End: Original strand, 13454947 - 13455024
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13454947 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13455024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16651468 - 16651391
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16651468 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 16651391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 92 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 16066981 - 16066870
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||| ||| || |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||    
T  16066981 tcataatttatcaagatcttcaaaccatctcttaaaataacccttgatattacaacatacaattgtccatgtgaaaaaacaggagaaggtaaatagacac 16066882  T
Q  192 caacatgtttta 203  Q
    |||||| |||||    
T  16066881 caacatttttta 16066870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4594157 - 4594084
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaa 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  4594157 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtctatgtgaaaa 4594084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 854620 - 854554
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccat 161  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  854620 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccat 854554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12260872 - 12260798
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12260872 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 12260798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 26947893 - 26947819
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  26947893 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 26947819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 16725940 - 16726076
Alignment:
Q  104 aatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtttta 203  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| ||||| | | | || || | ||| || ||||||||||| |    
T  16725940 aatatcttcaaaccttctcttgaagtaacccttgacaaagccacatacaattgaccatgagaaaagataggcgatggcaaatatacgccaacatgtttca 16726039  T
Q  204 acgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaa 240  Q
    | ||||||||  |||| || || ||||||||||||||    
T  16726040 aagattgaccttgacttttctttatagtcattgcaaa 16726076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 605; Significance: 0; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 605; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 92 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 3591259 - 3590567
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3591259 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcctttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagatggtagataaacac 3591160  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    |||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3591159 caacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagttattgcaaatgagacagataacggaaattgctttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 3591060  T
Q  292 ctaaccc-gtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 390  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3591059 ctaaccccgtgctatcacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaat 3590960  T
Q  391 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 490  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590959 atatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatacttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaa 3590860  T
Q  491 tcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 590  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590859 tcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactt 3590760  T
Q  591 aatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 690  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590759 aatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaa 3590660  T
Q  691 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3590659 caaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 3590567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 95 - 266
Target Start/End: Original strand, 25971107 - 25971278
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||    
T  25971107 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgatgtacaattgttcatgtgaaaaaacaggagatggtagatagacaccaa 25971206  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 266  Q
    ||| ||| || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||    
T  25971207 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacagaaactgccttc 25971278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Original strand, 25975547 - 25975701
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||    
T  25975547 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgatgtacaattgttcatgtgaaaaaacagtagatggtagatagacaccaa 25975646  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 249  Q
    ||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25975647 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 25975701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 2280977 - 2280821
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  2280977 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 2280878  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2280877 catgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 2280821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 226
Target Start/End: Original strand, 34265224 - 34265358
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||    
T  34265224 tcatcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcaatattgcgacgtacaattgtccatgtcaaaaaacaggagacgttagatagacac 34265323  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgtta 226  Q
    |||||| ||  || || |||||| |||||||||||    
T  34265324 caacattttacaaagactgaccctgactcttgtta 34265358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 33045848 - 33045922
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  33045848 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 33045922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 248
Target Start/End: Original strand, 17905868 - 17905937
Alignment:
Q  179 ggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacag 248  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  17905868 ggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgatacag 17905937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 570; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 783
Target Start/End: Original strand, 41859940 - 41860631
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41859940 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattacgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 41860039  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860040 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 41860139  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860140 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 41860239  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41860240 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 41860339  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 591  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860340 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 41860439  T
Q  592 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 691  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860440 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 41860539  T
Q  692 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41860540 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 41860631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 52682326 - 52681699
Alignment:
Q  159 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  52682326 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 52682227  T
Q  256 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682226 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 52682127  T
Q  356 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682126 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 52682027  T
Q  456 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  52682026 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 52681927  T
Q  556 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 655  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52681926 attaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 52681827  T
Q  656 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  52681826 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaatctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 52681727  T
Q  756 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52681726 gatagcaatccaattcaaaaagtcatcg 52681699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 52682765 - 52682329
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  52682765 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacacgaa 52682666  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682665 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattacaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 52682566  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52682565 ctaactcgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 52682466  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  52682465 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 52682366  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  52682365 catatgcttagatagatccttattcatccaatagaat 52682329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 36895718 - 36895891
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  36895718 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagttaccctcgatattgcgacgtacaattggccatgtg-aaaaacaggagacggtagatagacac 36895816  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 266  Q
    |||||| ||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  36895817 caacatttttcaaagattgaccctgaatcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttc 36895891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 30388097 - 30388253
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  30388097 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 30388196  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30388197 catgttctagcgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 30388253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 21382682 - 21382528
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  21382682 tcattaatcaatatttttaaaccagccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 21382583  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 249  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21382582 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 21382528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16909097 - 16908941
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  16909097 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 16908998  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || |||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16908997 catgttctagcgaccgaccttgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 16908941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28389435 - 28389279
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  28389435 tcattaatcaatattttaaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 28389336  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28389335 catgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 28389279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 92 - 178
Target Start/End: Original strand, 41944072 - 41944158
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagac 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41944072 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagac 41944158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 251
Target Start/End: Original strand, 29359311 - 29359426
Alignment:
Q  136 tgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcatt 235  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||| || ||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  29359311 tgatattgcgacgtacaactgtccatatgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgttctagcgactgaccctcactcttgttaatagtcatt 29359410  T
Q  236 gcaaatgagacagata 251  Q
    ||||||||||||||||    
T  29359411 gcaaatgagacagata 29359426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 19515295 - 19515369
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19515295 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 19515369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 21581685 - 21581759
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21581685 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 21581759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 299 - 395
Target Start/End: Original strand, 23004567 - 23004660
Alignment:
Q  299 gtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatata 395  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||   |||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23004567 gtgctatcgcacgggtcaatattaagcacaatatattagcaatttaggactacaacatcacatgaaaa---taaactaaaacaacgtgaaatatata 23004660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 92 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 37062452 - 37062400
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccat--cccttgaagtaacccttgatatt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  37062452 tcatcattgatcaatatctttaaactatatcccttgaagtaacccttgatatt 37062400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 240
Target Start/End: Original strand, 4882107 - 4882243
Alignment:
Q  104 aatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtttta 203  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |  || || |||||||| ||||| || || | | | || || | ||| |||||||||||||| |    
T  4882107 aatatcttcaaaccttctcttgaagtaacccttgacaaagccacatacaattgaccatgagagaagataggcgatggcaaatatacaccaacatgtttca 4882206  T
Q  204 acgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaa 240  Q
    | ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||    
T  4882207 aagattgaccttgacttttgtttatagtcattgcaaa 4882243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 641 - 776
Target Start/End: Original strand, 30576448 - 30576582
Alignment:
Q  641 tttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac-------aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccg 733  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||| |||  ||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||            
T  30576448 tttattcaaccaccaccatataaatcatcagcgcaggggccttcttgcaagttacgaaaaccaccgccgcataaacctcgttctagaaaatat------- 30576540  T
Q  734 aaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaa 776  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30576541 -aaaagagatggtaataaattagataacaatgaaattcaaaaa 30576582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 570; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 570; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 783
Target Start/End: Original strand, 2045316 - 2046007
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2045316 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 2045415  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045416 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 2045515  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045516 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 2045615  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045616 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 2045715  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 591  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2045716 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaactta 2045815  T
Q  592 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 691  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2045816 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 2045915  T
Q  692 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2045916 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatccaattcaaaaagtcatcg 2046007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 367; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 370 - 780
Target Start/End: Original strand, 35595295 - 35595705
Alignment:
Q  370 taaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagtt 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595295 taaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagtt 35595394  T
Q  470 aagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgat 569  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35595395 aagcatattttgaagacaaaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgat 35595494  T
Q  570 atgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatc 669  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595495 ataaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatc 35595594  T
Q  670 accgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaat 769  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35595595 accgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaggagatgataataaattagatagcaatgcaat 35595694  T
Q  770 tcaaaaagtca 780  Q
    |||||||||||    
T  35595695 tcaaaaagtca 35595705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 92 - 378
Target Start/End: Original strand, 35593930 - 35594216
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35593930 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacac 35594029  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    |||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35594030 caacatgtttcaacgactgactctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 35594129  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaa 378  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35594130 ctaacctgtgctatcacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaatcgtaaattaaa 35594216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 23086259 - 23086433
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  23086259 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaaccatcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagacac 23086358  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 266  Q
    |||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||| |||||||    
T  23086359 caacatttttcaaagattgaccccaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagacaacggaaactgccttc 23086433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Original strand, 37891602 - 37891756
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  37891602 tcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacagaagacggtagatagacaccaa 37891701  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 249  Q
    ||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37891702 catttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 37891756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 39513323 - 39513479
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  39513323 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 39513422  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39513423 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 39513479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 29245486 - 29245330
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  29245486 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 29245387  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29245386 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgaggcagata 29245330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Original strand, 45503600 - 45503755
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  45503600 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 45503699  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 250  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45503700 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 45503755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 38211061 - 38211217
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||    
T  38211061 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaactcgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacagtaggtagacaccaa 38211160  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38211161 catgttctagcgattgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 38211217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 50708907 - 50708751
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  50708907 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgatgtaacacgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 50708808  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50708807 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 50708751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 48651050 - 48650894
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||| || |||||||    
T  48651050 tcattaatcaatatttttaaaccagccctcaaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacagtaggtagacaccaa 48650951  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48650950 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 48650894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Original strand, 13926369 - 13926520
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||||||||| ||||       
T  13926369 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtgcatgtg-aaaaataggagacggtagatagacac--- 13926464  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 250  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13926465 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagat 13926520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 49787424 - 49787498
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  49787424 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 49787498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 2047567 - 2047641
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2047567 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 2047641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 36866978 - 36867052
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  36866978 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgtgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 36867052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7480544 - 7480470
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  7480544 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 7480470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 9533920 - 9533846
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  9533920 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 9533846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42496628 - 42496554
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  42496628 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 42496554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 26211689 - 26211630
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtac 151  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  26211689 tcatcattaatcaatatcttttaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtac 26211630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 243
Target Start/End: Original strand, 23480959 - 23481110
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||| |||||||||||||||  || || || || ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | |  |||||||| ||||    
T  23480959 tcatcagtgatcaatatctttagtccttctctggatgtaactcttgaaatagcaacatacaactgtccttgagaaaatacaggtgttggtagatatacac 23481058  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatga 243  Q
    |||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  23481059 caacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatga 23481110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 146 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5429346 - 5429244
Alignment:
Q  146 acgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgaga 245  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| ||| | |  |||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  5429346 acgtacaactgtctatgagaaaatacaggtgttggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgata 5429247  T
Q  246 cag 248  Q
    |||    
T  5429246 cag 5429244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 562; Significance: 0; HSPs: 12)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 32674929 - 32674238
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32674929 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccttgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 32674830  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674829 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 32674730  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674729 ctaacccgtgctaccacacgagtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 32674630  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674629 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 32674530  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 591  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674529 catatgattagatagatctttattcaaccaatagaatatcacaagaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 32674430  T
Q  592 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 691  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674429 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 32674330  T
Q  692 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32674329 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 32674238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Original strand, 16678829 - 16679002
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  16678829 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacc-tcgatattgcaacgtacaattgtccatgtaaaaaaacaggagacggtagatagacac 16678927  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 266  Q
    |||||| ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  16678928 caacatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacgaaaactgccttc 16679002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 249
Target Start/End: Original strand, 38095575 - 38095732
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  38095575 tcatcattgatcaacatctttaaaccatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacatacaattgtccatgtgaaaaaacaagagacggtagatagacac 38095674  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 249  Q
    ||| || ||| || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38095675 caatatttttcaaagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 38095732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 8796082 - 8795897
Alignment:
Q  295 acccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccg-taaattaaaataacatgaaata-t 392  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||| |||  || |||||||||| ||  | ||||| |    
T  8796082 acccgtgctatcgcacgggtcaata-tgagctcaacaaattaaaaatttaggagtccaacatcacatgaaagacgataaattaaaacaatgtaaaatact 8795984  T
Q  393 atagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattt 479  Q
    ||||||||||||| ||||  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  ||| |||||||    
T  8795983 atagctatattatctaggataagtatggtttataatttatgttttgcaatgatcatgcttgtagataatgataaactaaccatattt 8795897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 20105161 - 20105235
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20105161 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 20105235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 92 - 169
Target Start/End: Original strand, 3608003 - 3608080
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3608003 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 3608080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 92 - 169
Target Start/End: Original strand, 30090418 - 30090495
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30090418 tcatcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgcgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 30090495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 12655251 - 12655177
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  12655251 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 12655177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23184036 - 23183962
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23184036 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 23183962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23188303 - 23188229
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  23188303 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 23188229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 34761297 - 34761223
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  34761297 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 34761223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 39878131 - 39878057
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  39878131 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 39878057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 558; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 558; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 40605401 - 40604710
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40605401 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 40605302  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605301 catgtttcaacgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 40605202  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605201 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 40605102  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40605101 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 40605002  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 591  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40605001 catatgcttagatagatccttattcaaccaatagaatatcaaatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatagtttacaactta 40604902  T
Q  592 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 691  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40604901 atttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 40604802  T
Q  692 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40604801 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatccaattcaaaaagtcatcg 40604710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 13907855 - 13907228
Alignment:
Q  159 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  13907855 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 13907756  T
Q  256 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907755 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 13907656  T
Q  356 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907655 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 13907556  T
Q  456 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  13907555 gttaatggtaagttaagcatattttgaaggcacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 13907456  T
Q  556 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  13907455 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacattcacatcagtataatcaaccacca 13907356  T
Q  656 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  13907355 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 13907256  T
Q  756 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907255 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 13907228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 526; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 26455500 - 26454873
Alignment:
Q  159 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  26455500 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 26455401  T
Q  256 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455400 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 26455301  T
Q  356 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455300 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 26455201  T
Q  456 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 555  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  26455200 gttaatggtaagttaagcatatcttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 26455101  T
Q  556 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 655  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26455100 attaaaacaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttttagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 26455001  T
Q  656 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  26455000 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 26454901  T
Q  756 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26454900 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 26454873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 26455939 - 26455503
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26455939 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 26455840  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455839 catgtttcaacgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 26455740  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26455739 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 26455640  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26455639 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 26455540  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 528  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26455539 aatatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 26455503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 13908293 - 13907858
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13908293 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 13908194  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13908193 catgtttcaacgat-gaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 13908095  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13908094 ctaacccgtgctaccacacgggttaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaatcgtaaattaaaataacatgaaata 13907995  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13907994 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaacggtaagttaagcatattttgaagacacaat 13907895  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13907894 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 13907858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 35432242 - 35432398
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  35432242 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 35432341  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35432342 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 35432398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 207779 - 207623
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  207779 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 207680  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  207679 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagacagata 207623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 5013634 - 5013791
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgt-gaaaaaacatgagacggtagataaacacca 193  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  5013634 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtagaaaaaataggagacggtaggtagacacca 5013733  T
Q  194 acatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    ||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5013734 acatgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgaaaatgagacagata 5013791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 101 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1512799 - 1512653
Alignment:
Q  101 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  1512799 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 1512700  T
Q  201 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 247  Q
     || ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1512699 ctagcgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagaca 1512653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13905361 - 13905287
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13905361 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13905287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2300853 - 2300779
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  2300853 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgccatgtacaactgtccatgtgaaaaa 2300779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 6123744 - 6123670
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6123744 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 6123670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 184165 - 184091
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  184165 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 184091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 976151 - 976225
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  976151 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 976225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2449399 - 2449325
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  2449399 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 2449325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 130
Target Start/End: Original strand, 23455759 - 23455797
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagta 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23455759 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagta 23455797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 538; Significance: 0; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 538; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 783
Target Start/End: Original strand, 14994547 - 14995238
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| || |||||| | || |||||||||| ||||||||  |||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14994547 tcattaatcaatattttaaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgtcacgtacgactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 14994646  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994647 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaataatcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 14994746  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14994747 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacaggaaata 14994846  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  14994847 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaaacatattttgaagacataat 14994946  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 591  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14994947 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatccttattaaaacaatgatatgaatcatggtttacaactta 14995046  T
Q  592 atttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaac 691  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14995047 atttgtagtttgcatagctcaggggatatcaaagacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccacgagggccttcttgcaac 14995146  T
Q  692 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14995147 aaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaacagtcatcg 14995238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 92 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 37589618 - 37589444
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||    
T  37589618 tcatcattgatcaatatctttaaatcatcccttgaagtaaccatcgatattgcaacatacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagatagatac 37589519  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 266  Q
    |||||| ||| |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  37589518 caacatttttcatagactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgtcttc 37589444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Original strand, 22729954 - 22730110
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  22729954 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatttgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 22730053  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22730054 catgttctagcgactgaccctgactcttgttagtagtcattgcaaatgagacagata 22730110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23827800 - 23827644
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  23827800 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 23827701  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23827700 catgttctagcgaccgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 23827644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19961660 - 19961504
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| || ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  19961660 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgatgtaactcgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 19961561  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19961560 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 19961504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 406231 - 406305
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  406231 tcattaatcaatatctttaaaccatccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 406305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 18266066 - 18266140
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  18266066 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgatgtacaactgtccatgtgaaaaa 18266140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 46; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Original strand, 41376488 - 41376561
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaa 168  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  41376488 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgcccatgtaaaaa 41376561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 295 - 347
Target Start/End: Original strand, 36238570 - 36238622
Alignment:
Q  295 acccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttagga 347  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36238570 acccgtgctatcgcacgggtcaatattgagcacaatatattagtaatttagga 36238622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 18275079 - 18275153
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||  | |||||| |||||||||||||||    
T  18275079 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgttatgtacaactgtccatgtgaaaaa 18275153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 240
Target Start/End: Original strand, 9885678 - 9885811
Alignment:
Q  107 atctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacg 206  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | ||| || |||||||| ||||| ||||||||| | || || | |||||| || |||||||| |  |    
T  9885678 atcttcaaaccttctcttgaagtaactcttgacaatgccacatacaattgaccatgagaaaaaacaggcgatggcaaataaactcccacatgtttaagag 9885777  T
Q  207 attgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaa 240  Q
    | || ||  |||| ||||||||||||| ||||||    
T  9885778 actggccttgacttttgttaatagtcactgcaaa 9885811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 534; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 534; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 22006573 - 22005946
Alignment:
Q  159 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  22006573 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 22006474  T
Q  256 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006473 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 22006374  T
Q  356 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006373 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 22006274  T
Q  456 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||    
T  22006273 gttaatggtaagttaagcatattttgaaggcacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatgctt 22006174  T
Q  556 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 655  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22006173 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 22006074  T
Q  656 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  22006073 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 22005974  T
Q  756 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22005973 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 22005946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 530; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 159 - 783
Target Start/End: Complemental strand, 7893349 - 7892722
Alignment:
Q  159 catgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacat 255  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||      
T  7893349 catgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacgg 7893250  T
Q  256 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893249 aaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttgctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaaca 7893150  T
Q  356 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 455  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893149 tcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttata 7893050  T
Q  456 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatcctt 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||    
T  7893049 gttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacatgaagcattgggccaatcctt 7892950  T
Q  556 attaaaacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacacagtcacatcagtttaatcaaccacca 655  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7892949 attaaatcaatgatatgaatcatagtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcaggggatatctaagacacagtcacatcagtataatcaaccacca 7892850  T
Q  656 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaatta 755  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7892849 ccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaatta 7892750  T
Q  756 gatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7892749 gatagcaatccaattcaaaaagtcatcg 7892722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 7893788 - 7893352
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7893788 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 7893689  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893688 catgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 7893589  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893588 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 7893489  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  7893488 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacagt 7893389  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7893388 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 7893352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 347; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 95 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 22007011 - 22006576
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22007011 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacggtagataaacaccaa 22006912  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagac---agataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 291  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006911 catgtttcaacgat-gaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacgacagataacggaaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataatttg 22006813  T
Q  292 ctaacccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacatcacataaaaaccgtaaattaaaataacatgaaata 391  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22006812 ctaacccgtgctaccacacgggtcaatgatgagcacaatatattagtaatttaggagttcaacgtcacataaaaatcgtaaattaaaataacatgaaata 22006713  T
Q  392 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaatggtaagttaagcatattttgaagacacaat 491  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22006712 tatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaacggtaagttaagcatattttgaagacacaat 22006613  T
Q  492 catatgcttagataaatccttattcagccaatagaat 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22006612 catatgcttagatagatccttattcagccaatagaat 22006576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 361 - 630
Target Start/End: Original strand, 3595667 - 3595936
Alignment:
Q  361 taaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaaggtatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaa 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3595667 taaaaaccgtaaattaaaataacatgaaatatatagctatattatgtaggtaagatatgatttacaattaatgttttgcaatgatcatgcttatagttaa 3595766  T
Q  461 tggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagataaatccttattcagccaatagaatctcacataaagcattgggacaatccttattaa 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||| ||||||||||| |    
T  3595767 tggtaagttaagcatattttgaagacacaatcatatgcttagatagatccttattcagccaatagaatatcacctgaagcattgggccaatccttattga 3595866  T
Q  561 aacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagttcatgggacatctaagacaca 630  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  3595867 aacaatgatatgaatcatggtttacaacttaatttgtagtttgcatagctcagaggacatctaagacaca 3595936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 92 - 296
Target Start/End: Original strand, 3595461 - 3595666
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatat-ctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaaca 190  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |    
T  3595461 tcatcattgatcaatatactttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgatgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggagacagtagatagata 3595560  T
Q  191 ccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttcatgtcaagcaaaacctcataattt 290  Q
    ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  3595561 ccaacatgtttcaacgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacggaaattgccttgatgtcaagaaaaacctcataattt 3595660  T
Q  291 gctaac 296  Q
    ||||||    
T  3595661 gctaac 3595666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 624 - 783
Target Start/End: Original strand, 3598843 - 3599008
Alignment:
Q  624 agacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcaccgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctcct------tct 717  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||    
T  3598843 agacacagtcacatcagtttaatcaaccaccaccgtataaattatcatcgcgagggccttcttgcaacaaccaccaccgcataaacctccttctagatct 3598942  T
Q  718 agaatataacaaaccgaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 783  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3598943 agaatataacaaacaaaaaaagagatgataataaattagatagcaatgcaattcaaaaagtcatcg 3599008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 45115861 - 45115705
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  45115861 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 45115762  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45115761 catgttctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 45115705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32660258 - 32660102
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaa 194  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||    
T  32660258 tcattaatcaatatttttaaactacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaa 32660159  T
Q  195 catgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 251  Q
    |||||| || ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32660158 catgttctagcgactgaccatgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagata 32660102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 26168869 - 26168704
Alignment:
Q  101 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  26168869 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 26168770  T
Q  201 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacagataacataaattgccttc 266  Q
     || ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||    
T  26168769 ctagcgactgaccctaactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaaatatcagaaactgccttc 26168704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 92 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 35103010 - 35102862
Alignment:
Q  92 tcatcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacac 191  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  35103010 tcatcattgatcaatatctttaaatcatcccttgaagtaaccctcgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacaggaga-agtagataaacac 35102912  T
Q  192 caacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaat 241  Q
    |||||| ||| ||  | | |||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35102911 caacatttttcaaaaactaaccttgactcttgttaatagtcattgcaaat 35102862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17696946 - 17696872
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17696946 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 17696872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27715975 - 27715901
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27715975 tcattaatcaatatatttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 27715901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16719931 - 16719857
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16719931 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcaacgtacaactgtccatgtgaaaaa 16719857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31100171 - 31100097
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  31100171 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccatgatattgcgacgtacaactctccatgtgaaaaa 31100097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7888898 - 7888824
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  7888898 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 7888824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 29956508 - 29956435
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaa 168  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  29956508 tcattaattaatatctttaaaccacccctcaaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactatccatgtgaaaa 29956435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 32038474 - 32038416
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaa 153  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32038474 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaa 32038416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 334
Target Start/End: Original strand, 16805970 - 16806009
Alignment:
Q  295 acccgtgctatcacacgggtcaataatgagcacaatatat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16805970 acccgtgctatcgcacgggtcaatattgagcacaatatat 16806009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 101 - 249
Target Start/End: Original strand, 51990 - 52138
Alignment:
Q  101 atcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaaacatgagacggtagataaacaccaacatgtt 200  Q
    |||||||| ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||||    
T  51990 atcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaaataggagacggtaggtagacaccaacatgtt 52089  T
Q  201 ttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 249  Q
     || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52090 ctagcgactgaccctgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacaga 52138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 40512 - 40586
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  40512 tcattaatcaatatctttaaaccacccctcgaagtaacctgtgatattgcaatgtacaactgtccatgtgaaaaa 40586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0642 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0642
Description:

Target: scaffold0642; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 3430 - 3356
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3430 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 3356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0345 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0345
Description:

Target: scaffold0345; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 13342 - 13268
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13342 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 13268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 51; Significance: 8e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 95 - 169
Target Start/End: Original strand, 25639 - 25713
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaattgtccatgtgaaaaa 169  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25639 tcattaatcaatatttttaaaccacccctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaactgtccatgtgaaaaa 25713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 45608 - 45550
Alignment:
Q  95 tcattgatcaatatctttaaaccatcccttgaagtaacccttgatattgcgacgtacaa 153  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  45608 tcattaatcaatatttttaaaccacctctcgaagtaacccgtgatattgcgacgtacaa 45550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 179 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 104675 - 104606
Alignment:
Q  179 ggtagataaacaccaacatgttttaacgattgaccccgactcttgttaatagtcattgcaaatgagacag 248  Q
    |||||||| |||||||||||||| | ||| || ||  |||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  104675 ggtagatatacaccaacatgtttaagcgactgcccttgacttttgttaattgtcattgcaaatgatacag 104606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University