View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1001-INSERTION9 (Length: 731)

Name: NF1001-INSERTION9
Description: NF1001
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1001-INSERTION9
NF1001-INSERTION9
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (8-731)||(11486184-11486908)
chr8 (94-731)||(44955959-44956597)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (98-731)||(10678587-10679221)
chr3 (92-727)||(10664679-10665315)
chr3 (94-731)||(10261847-10262485)
chr3 (34-731)||(10501735-10502433)
chr3 (110-731)||(10581759-10582381)
chr3 (98-677)||(10529851-10530430)
chr3 (94-731)||(10033149-10033787)
chr3 (110-731)||(10362099-10362718)
chr3 (94-731)||(9840010-9840648)
chr3 (94-731)||(9850888-9851526)
chr3 (94-731)||(10128074-10128712)
chr3 (94-731)||(10374127-10374765)
chr3 (94-731)||(10089939-10090577)
chr3 (94-731)||(10196822-10197460)
chr3 (94-731)||(10432326-10432964)
chr3 (94-731)||(10518634-10519272)
chr3 (94-731)||(11780264-11780902)
chr3 (94-731)||(11770383-11771021)
chr3 (94-380)||(10185881-10186167)
chr3 (587-727)||(13853458-13853599)
chr3 (94-380)||(10078911-10079197)
chr3 (547-725)||(10078565-10078744)
chr3 (574-727)||(10185392-10185546)
chr3 (547-725)||(10185535-10185714)
chr3 (94-297)||(13172615-13172818)
chr3 (574-727)||(10078422-10078576)
chr3 (40-229)||(11147082-11147271)
chr3 (40-229)||(11158245-11158434)
chr3 (94-297)||(13345670-13345873)
chr3 (619-731)||(11129836-11129949)
chr3 (619-731)||(11158824-11158937)
chr3 (94-229)||(11129311-11129446)
chr3 (94-294)||(10890893-10891093)
chr3 (95-251)||(13397116-13397272)
chr3 (619-731)||(10890455-10890568)
chr3 (619-731)||(11147661-11147774)
chr3 (106-294)||(8862873-8863061)
chr3 (94-222)||(13334566-13334694)
chr3 (619-731)||(11245430-11245543)
chr3 (94-222)||(13162642-13162770)
chr3 (619-717)||(8862449-8862548)
chr3 (94-235)||(11244908-11245049)
chr3 (162-219)||(3886874-3886931)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (94-731)||(26908037-26908675)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (98-731)||(17851212-17851846)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (94-731)||(55884-56522)
scaffold0083 (547-731)||(57146-57331)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (94-660)||(29837861-29838427)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (94-297)||(134170-134373)
scaffold0002 (94-222)||(144218-144346)
scaffold0002 (94-222)||(152523-152651)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (94-279)||(31678015-31678200)
chr6 (518-731)||(31678439-31678653)
[»] chr1 (1 HSPs)
chr1 (95-233)||(827541-827679)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (162-219)||(1217-1274)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 661; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 661; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 11486908 - 11486184
Alignment:
Q  8 gaagaattagaagcttttccttccttgacacaatagaactcttggccaattgtctccagcatgaacatattcgttatactcagtttcttgagagatggta 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11486908 gaagaattagaagcttttccttccttgacacaatagaactcttggccaattgtctccaacatcaacatattccttatactcagtttcttgagagatggta 11486809  T
Q  108 gttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaact 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11486808 gttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaact 11486709  T
Q  208 tgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtcttcacttaatttt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11486708 tgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcgagtttattggtggatgcaacatatcaagcacaactttcacttttagcgagtcttcacttaatttt 11486609  T
Q  308 ccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttcttgatggtaa 407  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11486608 ccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttcttgatggtta 11486509  T
Q  408 agcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtttggagactttctag 507  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11486508 agcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggtcctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtttggagactttctag 11486409  T
Q  508 cccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgaga 607  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11486408 cccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacgtaagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgaga 11486309  T
Q  608 caccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgca 706  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11486308 cactgacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatcaggcaagctaccgatattagtggaggagagatctagatatcgca 11486209  T
Q  707 attgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11486208 attgcaccaaattgccaattgaatc 11486184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Original strand, 44955959 - 44956597
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||| | || |||||||| |||||||||||||| |  |||||  | |||| | ||||| |||||||| |||| |||||||| ||| |||| ||||||    
T  44955959 cttgagaaaaggcagttgccccagcggtggaagtgttacacaataccctcaattactgatgcaaagggacgccatgttagaaaacgaaaaatctcccaac 44956058  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | || | ||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  44956059 caatttggaaagcttgtcccaccatagaagtcaatttttagactcttcaggttcattggtggttgcaacatatcaagcacgactttcacttttagcgagt 44956158  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    |||||||   ||||||||||  ||| |  ||    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||||||  ||||||| |||||||||||||     
T  44956159 cttcactatgttttccccatagcagctccaagtcttcaatttgctctttgcttttcaggttcgcatagtgtgcctccttggcatctatgacattatgcaa 44956258  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    |||||| ||| | |   ||||||||||||| |  |||||| |||| |||||||||| |  |||| ||||| |||||||||||| |||| | || | ||||    
T  44956259 gttcttcatgatgagttttccttgtaggtgtgaaaatttcttaagctctttgatacctaaccctgcttgtcgcttccccactacaaaaacagttagagtt 44956358  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| |||| |||||| || || |||||||||||||| ||   | |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||  ||||    
T  44956359 tgaaggttttctagtccaccaatttctatgggaaactcctttatatcagttccaattatatcaagatgacgtaaatttattaaatttcccatattcactg 44956458  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    ||||||||||||||   |||||      ||||| || ||||| || |||||||||||| ||| | |||||| |||||||||||||  | ||  |||||||    
T  44956459 gcaattcagtgagattgcaacaatcaactaaaatcagggtttccagattgtaaaggttacatgtggtatcaggcaagcttttgattcttgtaaaggagag 44956558  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    |||  |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  44956559 atccggataccgcaaatgcaccaaatttccaattgaatc 44956597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-117; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 98 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10679221 - 10678587
Alignment:
Q  98 agagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaat 197  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||  ||| |||||||| ||| | ||  |||| |  || | |||||    
T  10679221 agagaaggtagctgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcagaattatcgatgcgaagagacaccatgttatagaacaaagagtttcctacccaat 10679122  T
Q  198 tcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtcttc 297  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| |||| |  || | |||||   |||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10679121 ttggaaaacttgtcccgccatacaagccaatacgaagcctcttcagacttattggtggttgcaacatatctagaacaactttcacttttcgcgagtcttc 10679022  T
Q  298 acttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttc 397  Q
    ||||  |||||||||   ||| | |||   ||||||||||||||||  ||  ||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  10679021 actttgttttccccacaacagctctaactcctcaatttgctctttgtcttccaggttggcatcttttgcatccgtggcatcaacgacattatgaaggttc 10678922  T
Q  398 ttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtttgga 497  Q
    ||||| ||||   |||| |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  10678921 ttgatagtaagttttccctgtaagtgtgggaatttctcaagttctttgatacttaaccctacttgatgcttacccactgcaaaaactgtcaaagtttgga 10678822  T
Q  498 gactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaa 597  Q
    |  |||||||||||  ||||||||  || |||||||  ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10678821 ggttttctagcccatcaatttccaagggaaactcctgcatattttttgaacttatatcaaggtgacataaattgattaaatttcccatatgtactggtaa 10678722  T
Q  598 ttcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatct 696  Q
    ||||||||||  || ||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||  ||||||| ||||||||||||| | |||| | |||||||||    
T  10678721 ttcagtgagattcctacagcttgataaaatcaaagtctgcaaattataaaggttacatgatgtatcaggcaagcttttgatttcagtgaaagagagatct 10678622  T
Q  697 agatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10678621 agataccgcaactgcaccaaattgccaattgaatc 10678587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 92 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 10665315 - 10664679
Alignment:
Q  92 ttcttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcaccca 191  Q
    ||||||||||| ||||  | ||| || ||||||||| |||  ||||||||||||| | ||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||    
T  10665315 ttcttgagagaaggtaacttcccaaggggtggaagtatcacacaatattcacaattactgatacagagggataccatgttagaaaacgaagaatttccca 10665216  T
Q  192 accaattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcga 291  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||||||||||  |||  |||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||    
T  10665215 accaacttggaaagcttgttccaccatacaagaaaatattcaggctcttcaaatttattggtggttgcaacatatcgagtacaactttcactttttgcga 10665116  T
Q  292 gtcttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgc 391  Q
     |||||||||  |||||||||| |||| | |||  ||||||| | |||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| |    
T  10665115 atcttcactttgttttccccatatcagctctaacttctcaatcttctctttgcttttcaagttggcatcgtgtgcctctctggcatcaacaacattatcc 10665016  T
Q  392 aggttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctac-ttgtggcttccccactataaaatctgtcaaa 490  Q
    ||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||||| || |||||||| |||  |||||| |||| |||| ||||||| ||||   || | |    
T  10665015 aggttcttgatggtaagttttccctgtaggtttgggaatttccttagctctttgatgcttaaccctacattgt-gcttacccactaaaaaaagggtgaga 10664917  T
Q  491 gtttggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgta 590  Q
    ||||| ||  ||||||| || | ||||||||  |||||||| ||||| || ||   |||||||||||| |||| ||| |||| ||||||||| |||||||    
T  10664916 gtttgaaggttttctagtcccccaatttccacaggcaactcatttatgtcagtcccacttatatcaagctgacgtaaattgactaaatttccaatatgta 10664817  T
Q  591 ctggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggagga 689  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| | ||    
T  10664816 ctggcaattcagtgagactcccacaacttgataaattcaaggtctgcaaattgtaaaggttacatgttgtatcaggcaagctttcgattttagtgaaaga 10664717  T
Q  690 gagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattg 727  Q
    || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10664716 gatatctagataccgcaattgcactaaattgccaattg 10664679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10262485 - 10261847
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||   || || ||||| ||| |||| |||||||  ||||||    
T  10262485 cttgagagaaggtaactgccctatgggtggaagtgtcatacaatattcacaattagtgatgcgcagagataccatgttataaaacgaagaatttcccaac 10262386  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||   |||  |||| | ||| |  ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  10262385 caactcggaaagcttgtcccaccatacaaacaaattttcaggctctttagatttattggtggttgcaacatatcgagcacaactttcactttttgcgact 10262286  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  10262285 cttcactttgttttccccatatcagctctaactcctcaattttctctttgcttttcaggtttgcatcgtgtgcctctctggcatcaacaacattatccag 10262186  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||  |||  ||| ||||||| ||||   || | ||||    
T  10262185 gttcttgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacttaaccctatatgtctcttacccactaaaaaaagggtgagagtt 10262086  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| || | ||||||||  |||||||| ||||| |  ||   ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||| ||||||| ||    
T  10262085 tgaaggttttctagtcccccaatttccacaggcaactcatttatgttagtcccacttatatcaaggtgacgtaagccgactaaatttccaatatgtattg 10261986  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    |||||||||| ||||    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  10261985 gcaattcagtaagactgtcacaccttgataaattcaaggtctgcaaattgtaaaggctacatgttgtatcaggcaagcttttgattttagtgaaggagat 10261886  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||    
T  10261885 atctagataacgcagctgcaccaaatttccaattgaatc 10261847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 34 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10502433 - 10501735
Alignment:
Q  34 gacacaatagaactcttggccaattgtctccagcatgaacatattcgttatactcagtttcttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatg 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||  || ||||||| |  |||||| || |  |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  10502433 gacacaatagaactctgggccaattttctccaatattaacatataccctatacttaggtctttgagagaaggtagttgccctaacggtggaagtgtcaca 10502334  T
Q  134 caatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctca 233  Q
    ||||||||||| | | ||||||  | ||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||| ||| | |    
T  10502333 caatattcacagttagtgatgttgatggataccatgttagaaaacgaagaatttcccaaccaatttggaaagcttgtcccgctatacaagtctatgatta 10502234  T
Q  234 gtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtcttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaat 333  Q
    ||  ||||||||||| || |||||||||| | ||||| |||  |||| ||||| | ||||||||| ||  ||| ||||||  ||  | |||    |||||    
T  10502233 gtttcttcaagtttactgatggatgcaacatctcaagtacatttttctctttttgtgagtcttcaatttgtttgccccataacaactctaactcttcaat 10502134  T
Q  334 ttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttc 433  Q
    || |||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||  ||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||    
T  10502133 tttctctttgcttttcaggttggcatcgtgtgcctccgtggcatcaactacattatttaggttcttgatggtaagttttccttgtaggtgcgagaatttc 10502034  T
Q  434 ctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtttggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcct 533  Q
    | ||| ||||||||||||  |||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||| ||||| ||  ||||||| |    ||| ||||| |||||||| |    
T  10502033 cgaagctctttgatacttaaccctacctgtagcttccccacgatgaaaactgtcaatgtttgaaggttttctagtcgtacaatatccatgggcaactcat 10501934  T
Q  534 ttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggt 633  Q
    ||||  | ||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||   |||   ||||| |   ||||||  |||||    
T  10501933 ttatgccagtctcacttatatcaaggtgatgtaaattgattaaatttcccatattcgctggcaattcacaaagatcgcaacaaccaaataaaataaaggt 10501834  T
Q  634 ttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10501833 ttgcaaattaaaaaggttgcatatcgtatcaggcaagcttttgattctagttaaggagagatctagatacctcatttgcaccaaattgccaattgaatc 10501735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 3e-96
Query Start/End: Original strand, 110 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10582381 - 10581759
Alignment:
Q  110 tgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaacttg 209  Q
    |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | |||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  10582381 tgccctattggtggaagtgtcacacaatattcacaattagtgatgcggagggataccatgttagaaaacgaagaatttcccaaccaactaggaaaacttg 10582282  T
Q  210 tcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtcttcacttaattttcc 309  Q
    |||| ||||| |||  |||  |||| | |||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||||  ||||||    
T  10582281 tcccgccatataagcaaatattcaggctcttcaaatttattgctggttgcaacatatcaagcacaactttcactttatgcgactcttcactttgttttcc 10582182  T
Q  310 ccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttcttgatggtaaag 409  Q
    |||| |||| | |||   |||||||| |||||||||||| | | ||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| || ||||||||||||||      
T  10582181 ccatatcagctctaactcctcaattttctctttgcttttcaagctggcatcatgtgcctctttggcatcaacaacattatccacgttcttgatggtaagt 10582082  T
Q  410 cttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtttggagactttctagcc 509  Q
     ||||||||||||  | |||||| || || ||||||||||||  |||||| ||  |||| ||||||| ||||   || | |||||| ||  ||||||| |    
T  10582081 tttccttgtaggtttgagaatttactgagctctttgatacttaaccctacgtggtgcttacccactaaaaaacaggtgagagtttgaaggttttctagtc 10581982  T
Q  510 cacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgagaca 609  Q
    | | ||||||||  |||||||| ||||| |  ||   ||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  10581981 ccccaatttccacaggcaactcatttatgttagtcccacttatatcaaggtgacgtaaattgactaaatttccaatatgtattggcaattcagtgagact 10581882  T
Q  610 ccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaat 708  Q
    |||  |  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||     
T  10581881 ccagtagtttgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatattgtatcaggcaagctttcgatgttagtgaaggagatatctagataccgcaac 10581782  T
Q  709 tgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  10581781 tgcaccaaatttccaattgaatc 10581759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 98 - 677
Target Start/End: Complemental strand, 10530430 - 10529851
Alignment:
Q  98 agagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaat 197  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||| |||||||| ||| ||||  |||| |  || | |||||    
T  10530430 agagaaggtagctgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaattatcgatgcgaagagacaccatgttataaaacaaagagtttccgacccaat 10530331  T
Q  198 tcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtcttc 297  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||    || | |||||   |||||||||| |||||| |||| || ||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10530330 ttggaaaacttgtcccgccatacaagccaatatgaaggctcttcagagttattggtggttgcaacatatctagaacaactttcacttttcgcgagtcttc 10530231  T
Q  298 acttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttc 397  Q
    ||||  |||||||||   ||||  |||   ||||||||||||| |   ||  ||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||||||| |||    
T  10530230 actttcttttccccacaacagacctaactcctcaatttgctctgtc--ttccaggttggcatcttttgcatccatggcatcaacgacattatgcagtttc 10530133  T
Q  398 ttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggctt-ccccactataaaatctgtcaaagtttgg 496  Q
    ||||| ||||   |||| |||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |||| |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  10530132 ttgatagtaagttttccctgtaagtgtgggaatttctcaagttctttgatacttaaccctacttgatgctttccccactacaaaaactgtcaaagtttgg 10530033  T
Q  497 agactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggca 596  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||  |  |||||||  ||||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  10530032 aggttttctagcccaccaatttccaaggaaaactcctgcatattttttgaacttatatcaaggtgacataaattgattaaatttcccatatgtactggta 10529933  T
Q  597 attcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgat 677  Q
    |||||||||||  || ||| |||||||||| ||| || |||||||| |||||||| |||  ||||||| |||||||||||||    
T  10529932 attcagtgagattcctacagcttgataaaatcaaagtctgcaaattataaaggttacatgatgtatcaggcaagcttttgat 10529851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10033787 - 10033149
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||  ||| || ||||| ||||||||  ||||||  ||||||    
T  10033787 cttgagagaaggtaactgccctatgggtggaagtgtcatacaatattcacaattagtgatgcgaagagataccatgttagaaaacaaagaatttcccaac 10033688  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||   |||  |||| | ||| |  ||||||||||| |||||  |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  10033687 caactcggaaagcttgtcccaccatacaaacaaatattcaggctctttagatttattggtggttgcaaaatatcgagcacaactttcactttttgcgact 10033588  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  10033587 cttcactttgttttccccatatcagctctaactcctcaattttctctttgcttttcaggtttgcatcgtgtgcctctctggcatcaacaacattatccag 10033488  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||| |||  ||| ||||||| |||   ||| | ||||    
T  10033487 gttcttgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacttaaccctacatgtctcttgcccactaaaaatagtgtgagagtt 10033388  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| |  | || |||||  |||||||| ||||| |  ||    |||||||||||||||| |||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  10033387 tgaaggttttctagtctcccaagttccacaggcaactcatttatgttagtcccgcttatatcaaggtgacgtaaacttactaaatttccaatatgtactg 10033288  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    | ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||     
T  10033287 gtaattcagtgagactccaacaacgtgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatgttgtatcaggcaagcttttgattttactcgaggagat 10033188  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    || |||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  10033187 atgtagataccgtaactgcaccaaatttccaattgaatc 10033149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 110 - 731
Target Start/End: Original strand, 10362099 - 10362718
Alignment:
Q  110 tgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaacttg 209  Q
    |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||| | |||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||||| | ||||||||||    
T  10362099 tgccctaagggtggaagtatcacacaatattcacaattagtgatgcggagggataccatgttagaaaacgaagaatttcccaaccaactaggaaaacttg 10362198  T
Q  210 tcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtcttcacttaattttcc 309  Q
    |||||||||   |   |||  |||| | |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||    
T  10362199 tcccaccatggca---aatattcaggctcttcaaatttattggtggttgcaacatatcaagcacaactttcactttttgcgactcttcactttgttttcc 10362295  T
Q  310 ccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttcttgatggtaaag 409  Q
    |||| |||| | |||   || ||||| |||||||||||| | ||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||  ||||||||||||||||      
T  10362296 ccatatcagctctaactcctgaattttctctttgcttttcaagttggcatcatgtgcctctttggcatcaacaacattatctaggttcttgatggtaagt 10362395  T
Q  410 cttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtttggagactttctagcc 509  Q
     ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||   ||||| |||  ||| |||||||||||   ||| | |||||| ||  ||||||| |    
T  10362396 tttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacttaatcctacatgtctcttgcccactataaatagtgtgagagtttgaaggttttctagtc 10362495  T
Q  510 cacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgagaca 609  Q
    | | |||||| |  || ||||| ||||| |  ||    |||||||||||||||| |||  | | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||     
T  10362496 ccccaatttctacaggaaactcatttatgttagtcctgcttatatcaaggtgacgtaaacttactaaatttccaatatgtactggtaattcagtgagact 10362595  T
Q  610 ccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaat 708  Q
    |||||| |||||||||  |||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||| |||||     
T  10362596 ccaacaacttgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatgttgtatcaggcaagcttttgattttactgaaggagatatctagataccgcaac 10362695  T
Q  709 tgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  10362696 tgcaccaaatttccaattgaatc 10362718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 9840648 - 9840010
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| | ||||    || || || || ||| |||| ||||||   ||||||    
T  9840648 cttgagagaaggtaactgccctagggatggaagtgtcacacaattttcacaattactgatactgagagatacgatgttataaaacgaagaacttcccaac 9840549  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| | |||| |    
T  9840548 caactcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaattttaagcaccttcagatttattggtggttgcaacatatcgagcacaactttcacttcttgcgaat 9840449  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    |||||||   |||||||||| |||| | |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| |||  ||||||||  ||||||| |||    
T  9840448 cttcactatgttttccccatatcagctctaactcctcaatttgctctttgcttttcaggttggcatcgtgtgcgtctcgggcatcaacaacattatccag 9840349  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||  |||  ||| ||||||| ||||   || | ||||    
T  9840348 gttcttgatggtaagttttccctgtaggtttgggaatttcctgagctctttgatacttaaccctatatgtctcttacccactaaaaaaagggtgagagtt 9840249  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| || | ||||||||  |||||||| ||||| |  ||    |||||||||||||||| ||||  ||  |||||||| ||||||||||    
T  9840248 tgaaggttttctagtcccccaatttccacaggcaactcatttatgttagtcccgcttatatcaaggtgacgtaagccgaccaaatttccaatatgtactg 9840149  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    |||||||||| ||||    ||| |||||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||     
T  9840148 gcaattcagtaagactgttacaccttgataaattcaaggtctgcaaattgtaaaggttacatattgtatcaggcaagcttttgattctagtgaaggagat 9840049  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9840048 atctagataccgcaactgcaccaaatttccaattgaatc 9840010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 9851526 - 9850888
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| | ||||    || || ||||| ||| |||| ||||||   ||||||    
T  9851526 cttgagagaaggtaactgccctagggatggaagtgtcacacaattttcacaattactgatactgagagataccatgttataaaacgaagaacttcccaac 9851427  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||  ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||| | |||| |    
T  9851426 caactcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaattttaagcaccttcagatttattggtggttgcaacatatcgagcacaactttcacttcttgcgaat 9851327  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    |||||||   |||||||||| |||| | |||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||| |||    
T  9851326 cttcactatgttttccccatatcagctctaactcctcaatttgctctttgcttttcaggttggcatcgtgtgcctctcgggcatcaacaacattatccag 9851227  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||| ||   ||| || |||| |||    || | ||||    
T  9851226 gttcttgatggtaagttttccgtgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacttaaccctacgtggcacttacctactaaaaagagggtgagagtt 9851127  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| || |  |||||||  |||||||| ||||| |  ||   ||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  9851126 tgaaggttttctagtcccccgatttccacaggcaactcatttatgttagtcccacttatatcaaggtgatgtaaattgactaaatttccaatatgcactg 9851027  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||||||  |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||   |||| | ||||     
T  9851026 gcaattcagtgagactcctacaacctgataaattcaaggtctgcaaattgtaaaggttacatattgtatcaggcaagcttttgattccagtgaatgagat 9850927  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  9850926 atctagataccgcaactgcaccaaatttccaattgaatc 9850888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10128712 - 10128074
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||   || || ||||| ||||||||  ||||||  ||||||    
T  10128712 cttgagagaaggtaactgccctatgggtggaagtgtcatacaatattcacaattagtgatgcgcagagataccatgttagaaaacaaagaatttcccaac 10128613  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||   |||  |||| | ||| |  ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  10128612 caactcggaaagcttgtcccaccatacaaacaaatattcaggctctttagatttattggtggttgcaacatatcgagcacaactttcactttttgcgact 10128513  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  10128512 cttcactttgttttccccatatcagttctaactcctcaattttctctttgcctttcaggtttgcatcgtgtgcctctctggcatcaacaacattatccag 10128413  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||  |||  ||| ||||||| |||   ||| | ||||    
T  10128412 gttcttgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacttaaccctaaatgtctcttgcccactaaaaatagtgtgagagtt 10128313  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| |  | || ||| |  |||||||| ||||| |  ||  | |||||||||||||||| |||  | | ||||||||| ||||||||||    
T  10128312 tgaaggttttctagtctcccaaattctacaggcaactcatttatgttagtccagcttatatcaaggtgacgtaaacttactaaatttccaatatgtactg 10128213  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    | ||||||||||||| | |||| | |||||||  |||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  10128212 gtaattcagtgagactcgaacaacgtgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatgttgtatcaggcaagcttttgattttagtgcaggagat 10128113  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  10128112 atctagataccgtaactgcaccaaatttccaattgaatc 10128074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Original strand, 10374127 - 10374765
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| | ||||    || || ||||| ||| |||| ||||||   ||||||    
T  10374127 cttgagagaaggtaactgccctagggatggaagtgtcacacaattttcacaattactgatactgagagataccatgttataaaacgaagaacttcccaac 10374226  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||   ||| | |||||| ||||||| ||| |||||| |||| | |||| |||| |||||| || |||    
T  10374227 caactcggaaagcttgtcccaccatacaagcaaatatgcaggctcttcaaatttattgctggttgcaacatatccaacacaacttttactttttgcaagt 10374326  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||  |||||||  ||    
T  10374327 cttcactttgttttccccatatcagctctaactcctcaattttctctttgcctttcaggtttgcatcgtgtgcctctctggcatcaacaacattatctag 10374426  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||| |  |||||| || ||||| ||||||| |||    || | ||||    
T  10374427 gttcttgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacctaaccctacgtggggcttacccactaaaaagagggtgagagtt 10374526  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| |  | ||||||||  |||||||| |||||||  ||   ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||||||    
T  10374527 tgaaggttttctagtcgcccaatttccacaggcaactcatttatattagtcccacttatatcaaggtgacgtaaactgactaaatttccaatatgtactg 10374626  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    |||||||||| ||||    ||| |||||||||| |||||| || || ||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||     
T  10374627 gcaattcagtaagactgtcacaccttgataaaatcaaggtctgtaagttgtaaaggctacatgttgtatcaggcaagcttttgatgttagtgaaggagat 10374726  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10374727 atctagataccgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 10374765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10090577 - 10089939
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  10090577 cttgagagaaggtaattgacctatgggtggaagtgtcacacaatattcacaattactgatacagagggataccatgttagaaaacgaagaatttcccaac 10090478  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||  | |||||  |||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  10090477 caactcggaaagcttgtcccaccatacaagcaaatattcaagctcttcagatttattggaggttgcaacatatcgagcacaactttcactttttgcgagt 10090378  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||   ||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||||||| | |||||||||   ||||||   ||||||||  ||||||| |||    
T  10090377 cttcactttgctttccccatatcagctctaactcctcaattttctctttgcttttcaagttggcatcacgtgcctcccaggcatcaacaacattatacag 10090278  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||  |||||  ||   ||| || |||| ||||   || | ||||    
T  10090277 gttcttgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttaatacttaaccctatgtggttcttaccaactaaaaaaagggtgagagtt 10090178  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| || | ||||||||  || ||||| || || |  ||   ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  10090177 tgaaggttttctagtcccccaatttccaaaggtaactcattaatgttagtcccacttatatcaaggtgacgtaaactgactaaatttccaatatgtattg 10090078  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    | ||||||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||   |||| ||||||     
T  10090077 gtaattcagtgagactccagcagtttgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatattgtatcaggtaagctttcgattccagtgaaggagat 10089978  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  10089977 atctagataccgcaacagcaccaaattcccaattgaatc 10089939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10197460 - 10196822
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||  ||||||    
T  10197460 cttgagagaaggtaattgacctatgggtggaagtgtcacacaatattcacaattactgatacagagggataccatgttagaaaacgaagaatttcccaac 10197361  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||  | |||||  |||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  10197360 caactcggaaagcttgtcccaccatacaagcaaatattcaagctcttcagatttattggaggttgcaacatatcgagcacaactttcactttttgcgagt 10197261  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||   ||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||||||| | |||||||||   ||||||   ||||||||  ||||||| |||    
T  10197260 cttcactttgctttccccatatcagctctaactcctcaattttctctttgcttttcaagttggcatcacgtgcctcccaggcatcaacaacattatacag 10197161  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || ||||| ||||||  |||||  ||  |||| || |||| ||||   || | ||||    
T  10197160 gttcttgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttaatacttaaccctatgtggcgcttaccaactaaaaaaagggtgagagtt 10197061  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| || | ||||||||  || ||||| || || |  ||   ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  10197060 tgaaggttttctagtcccccaatttccaaaggtaactcattaatgttagtcccacttatatcaaggtgacgtaaactgactaaatttccaatatgtattg 10196961  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    | ||||||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |||   |||| ||||||     
T  10196960 gtaattcagtgagactccagcaatttgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatattgtatcaggtaagctttcgattccagtgaaggagat 10196861  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| |||||   ||||||||| |||||||||||    
T  10196860 atctagataccgcaacaacaccaaattcccaattgaatc 10196822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Original strand, 10432326 - 10432964
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | ||||  | ||||| ||||| |  ||||| |||||||  |||| |    
T  10432326 cttgagagaaggtaactgccctaagggtggaagtgtcacacaatattcacaattactgatacagagggataccatgtccgaaaacgaagaatttcccagc 10432425  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||  | || | |||||   | |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||  ||||||    
T  10432426 caactcggaaagcttgtaccatcatacaagcaaatatttaggctcttcatactcattggtggttgcaacatatccagcacaactttcactttgtgcgagt 10432525  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||  |||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  10432526 cttcactttgttttccccatatcagctctaactcctcaattttctctttgctttttaggttggcatcgtgtgcctctctggcatcaacaacattatccag 10432625  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   |||| |||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||| | |   |||| ||||||| ||||   || | ||||    
T  10432626 gttcttgatggtaagttttccctgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacttaaccctgcattgcgcttacccactaaaaaaagggtgagagtt 10432725  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
     | ||  ||||||| || | ||||||||  |||||||| ||||| |  ||   ||||||||||||||||| |||  |||  |||||||| ||| ||| ||    
T  10432726 agaaggttttctagtcccccaatttccacaggcaactcatttatgttggtcccacttatatcaaggtgacgtaaactgaccaaatttccaatacgtattg 10432825  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    |||||| |||||||  |   ||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| ||| | || | ||||||     
T  10432826 gcaatttagtgagagtcgtgcattttgacaaaatcaaggtctgcaaattgtaaaggttacatattgtatcaggtaagctttcgatgtaagagaaggagat 10432925  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10432926 atctagataccgcaactgcaccaaatttccaattgaatc 10432964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10519272 - 10518634
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| | ||||    || || ||||| ||| |||| ||||||   ||||||    
T  10519272 cttgagagaaggtaactgccctagggatggaagtgtcacacaattttcacaattactgatactgagagataccatgttataaaacgaagaacttcccaac 10519173  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  10519172 caactcggaaaacttgtcccaccatacaaacaaatattcaggctcttcaaatttattggtggttgcaacatatcgagcacaactttcactttttgcgagt 10519073  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    | ||||||  |||||||||| |||| | |||   ||| |||  |||| ||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  10519072 cgtcactttgttttccccatatcagctctaactcctcgattgtctctatgctttttaggttggcatcgtgtgcctctctggcatcaaccacattatccag 10518973  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  |||||| |||  ||| ||||||| |||   ||  | ||||    
T  10518972 gttcttgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttcctgagctctttgatacttaaccctacatgtctcttacccactaaaaatagtgcgagagtt 10518873  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    |  ||  ||||||| |  | ||||||||  ||||||||  |||| |  ||   | ||||||||||||||| |||  | | ||||||||| | ||||| ||    
T  10518872 taaaggttttctagtctcccaatttccacaggcaactcacttatgttagtcccagttatatcaaggtgacgtaaactaactaaatttccaacatgtattg 10518773  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    | ||||||||||||  |  |||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| ||| | |||| |||||      
T  10518772 gtaattcagtgagagccgtacagtttgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatgttgtatcaggcaagctttcgatgtaagtgaaggaggt 10518673  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10518672 atctaaataccgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 10518634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Original strand, 11780264 - 11780902
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | | ||    ||||| ||||| || |||||||||| ||  |||| |    
T  11780264 cttgagagaaggtagctgccctatgggtggaagtgtcacacaatattcacaattactaatacggagggataccatgtttgaaaatgaaggatttcccagc 11780363  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| | ||||| ||||||||||||||||||  |||  |||| | |||||  |||||||| || |||| | |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  11780364 caacttggaaagcttgtcccaccatacaagcaaatattcaggctcttcagatttattggcggctgcagcatatcgagcacaactttcactttttgcgact 11780463  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    | ||||||  |||||||||| | || | |||   ||||||||  ||||||||||| ||||||||||| | |||||||  ||||||||  ||||||| |||    
T  11780464 cgtcactttgttttccccatattagctctaaatcctcaattttttctttgcttttcaggttggcatcgtgtgcctctccggcatcaacaacattatccag 11780563  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   |||  |||||||  ||||||||    || ||||||||||||  |||||| |||  ||| ||||||||||||   || | ||||    
T  11780564 gttcttgatggtaagtgttctatgtaggtttgggaatttttcgagctctttgatacttaaccctacatgtctcttacccactataaaaagggtgagagtt 11780663  T
Q  494 tggagactttctag-cccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtact 592  Q
    || ||  ||||||| ||||||| ||||||  ||||||||  |||| |  ||   |||||||||||| |||| ||   ||| ||||||||| || ||||||    
T  11780664 tgaaggttttctagtcccacaa-tttccacaggcaactcacttatgttagttccacttatatcaagttgacgtagactgactaaatttccaatttgtact 11780762  T
Q  593 ggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggaga 691  Q
    ||||||||| |||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  || |||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11780763 ggcaattcaatgagactctcacaacttgataaaatcaaggtttgtaaattgtaaagcttatatgttgtatcaggcaatcttttgattttagtgaaggaga 11780862  T
Q  692 gatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11780863 tatctagataccgcaactgcaccaaatttccaattgaatc 11780902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 11771021 - 11770383
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||||||||  ||||||||||||| | | ||    ||||| ||||| ||||||||||||||||  |||| |    
T  11771021 cttgagagaaggtagctgccctatgggtggaagtgtcacacaatattcacaattactaatacggagggataccatgttagaaaatgaagaatttcccagc 11770922  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||  |||| | |||||  |||||||| || |||| | |||| |||||| ||||||||||| |||| |    
T  11770921 caactcggaaagcttgtcccaccatacaagcaaatattcaggctcttcagatttattggcggctgcagcatatcgagcacatctttcactttttgcgact 11770822  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    | ||||||  |||||||||| | || | |||   ||||||||  ||||||||||| | ||||||||| | |||||||  || |||||  ||||||| |||    
T  11770821 cgtcactttgttttccccatattagctctaaatcctcaattttttctttgcttttcaagttggcatcgtgtgcctctacggaatcaaaaacattatccag 11770722  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||||||||||||   |||  |||||||  |||| ||| |  || ||||||||||||  |||||| |||  ||| ||||||||||||   || | ||||    
T  11770721 gttcttgatggtaagtgttctatgtaggtttgggagttttccgagctctttgatacttaaccctacatgtctcttacccactataaaaagggtgagagtt 11770622  T
Q  494 tggagactttctag-cccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtact 592  Q
    || ||  ||||||| ||||| ||||||||  ||||||||  |||| |  ||   ||||||||||||||||| ||   ||| ||||||||| || ||||||    
T  11770621 tgaaggttttctagtcccac-aatttccacaggcaactcacttatgttagttccacttatatcaaggtgacgtagactgactaaatttccaatttgtact 11770523  T
Q  593 ggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggaga 691  Q
    |||||||||  ||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||  ||  || |||| |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  11770522 ggcaattcaacgagactctcacaacttgataaaatcaaggtttgtaaattgtaaagcttatatgatgaatcaggcaaacttttgattttagtgaaggaga 11770423  T
Q  692 gatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
     ||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11770422 tatctagataccgcaactgcaccaaatttccaattgaatc 11770383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10186167 - 10185881
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||   ||||||||||||||| ||||    ||||||||||  ||| |||| |||||||  || |||    
T  10186167 cttgagagaaggtagttgcccaagtggtggaagtatcgcacaatattcacaatcagtgattacgagggacaccaagttacaaaacgaagaatttcctaac 10186068  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||  |||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||| | || |    
T  10186067 caactcgaaaagcttgtcccaccatacaagcaaatattcagactcttcaaatttattggtggttgcaacatatctagcaatactttcactttttgtgaat 10185968  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaa 380  Q
    ||||||||  |||||||||| |||  | |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10185967 cttcactttgttttccccatatcatctctaactcctcaatttggtctttgcttttaaggttggcatcacatgcctctgtggcatcaa 10185881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 587 - 727
Target Start/End: Original strand, 13853458 - 13853599
Alignment:
Q  587 tgtactggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtgg 685  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| | |||      
T  13853458 tgtactggcaattcagtgagaccctcacaacttgataaaatcaaggtttgcaaattgtaaaggttacatattgtatcatgcaagcttttgatttcagtat 13853557  T
Q  686 aggagagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattg 727  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  13853558 aggagagatctagataccgcagttgcactaaattgccaattg 13853599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10079197 - 10078911
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||    ||||| ||||  ||| |||| |||||||  || |||    
T  10079197 cttgagagaaggtagttgcccaagtggtggaagtatcacacaatattcacaatcagtgattacgagggataccaagttacaaaacgaagaatttcctaac 10079098  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||||||||  |||  |||| | |||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||   ||||||||||| | || |    
T  10079097 caactcgaaaagcttgtcccaccatacaagcaaatattcagactcttcaaatttattggtggttgcaacatatcgagcaatactttcactttttgtgaat 10078998  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaa 380  Q
    ||||||||   ||||||||| |||  | |||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  10078997 cttcactttgctttccccatatcatctctaactcctcaatttggtctttgcttttaaggttggcatcacatgcctctgtggcatcaa 10078911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 547 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 10078744 - 10078565
Alignment:
Q  547 acttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaa 646  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  10078744 acttatatcaaggtgacgtaaactgactaaatttccaatatgtagcggcaattcagtgagactctcacaacttgataaaatcaaggtcttcaaattgtaa 10078645  T
Q  647 aggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaat 725  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||    
T  10078644 aggttgcatgttgcatcaggcaagctttcgatttcagtgaaggagagatctagatactgcaattgtactaaatttccaat 10078565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 71; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 574 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 10185546 - 10185392
Alignment:
Q  574 taaatttcccatatgtactggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagctt 672  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||    
T  10185546 taaatttccaatatgtactggcaatttagtgagaccctcacaacttgataaaatcaaggtctgcaaattgtaaaggttacatgttgcatcaggcaagctt 10185447  T
Q  673 ttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattg 727  Q
    |  || | |||| | |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  10185446 tcaatttcagtgaatgagagatctagatatcgcaattgcactaacttgccaattg 10185392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 5e-30
Query Start/End: Original strand, 547 - 725
Target Start/End: Complemental strand, 10185714 - 10185535
Alignment:
Q  547 acttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaa 646  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||| | ||||||||||    
T  10185714 acttatatcaaggtgacgtaaactgactaaatttccaatatgtagcggcaattcagtgagactctcacaacttgataaaatcaaggtcttcaaattgtaa 10185615  T
Q  647 aggttgcatattgtat-cagcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaat 725  Q
    ||||||||| ||| || | ||||||||| ||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||| || ||||| |||||    
T  10185614 aggttgcatgttgcatccggcaagctttcgatttcagtgaaggagagatctagatactgcaattgtactaaatttccaat 10185535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13172818 - 13172615
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |  |||||||||||||    |||  | | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  13172818 cttgagagaaggtagttgacctagtgatggaagtgttacacaatattcacaattcgagatacacaaggacaccatgttagaaaaaaaaggatcacccaac 13172719  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||| ||| | || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  13172718 caactcggaaagcttgtcccaccatacaagctaatgctcagtttcctcaggttaaatgatggttgcaacatatcaagcacatctttctctattcgcgagt 13172619  T
Q  294 cttc 297  Q
    ||||    
T  13172618 cttc 13172615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 574 - 727
Target Start/End: Complemental strand, 10078576 - 10078422
Alignment:
Q  574 taaatttcccatatgtactggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagctt 672  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |  ||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || | ||||||||    
T  10078576 taaatttccaatatgtactggtaatttagtgagaccctcacaacttgataaaatcaaggtctgcaaattgtaaaggttacatgttgcataaggcaagctt 10078477  T
Q  673 ttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattg 727  Q
    |  || | |||| | ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  10078476 tcaatttcagtgaatgagagatctagatttcgcaattgcactaacttgccaattg 10078422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 11147082 - 11147271
Alignment:
Q  40 atagaactcttggccaattgtctccagcatgaacatattcgttatactcagtttcttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatat 139  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||  |||||    ||||||| || | ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||    
T  11147082 atagaactctggaccaattgtctccaatatatacatacctcttatacttaggtccttgagagaagatagttgtcctagtggtggaagtgtcacacaatat 11147181  T
Q  140 tcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatg 229  Q
     ||||||  |  ||  | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11147182 ccacaatgttgaattgacagtgacaccatgttagaaaatgaagaatctcccaaccaacttggaaagcttgtcccaccatacaagtcaatg 11147271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 229
Target Start/End: Original strand, 11158245 - 11158434
Alignment:
Q  40 atagaactcttggccaattgtctccagcatgaacatattcgttatactcagtttcttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatat 139  Q
    |||||||||| | |||||||||||||  ||  |||||    ||||||| || ||||||||||  | |||||| ||||| ||||||||||| |  ||||||    
T  11158245 atagaactctggaccaattgtctccaatattgacatacctcttatacttaggttcttgagagcagatagttgtcctagtggtggaagtgttacacaatat 11158344  T
Q  140 tcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatg 229  Q
     ||||||  |  |||  ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11158345 ccacaattttctatgctaagtgacaccatgttagaaaatgaagaatctcccaaccaacttggaaagcttgtcccaccatacaagtcaatg 11158434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 13345873 - 13345670
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    |||  | | ||||||||| ||||||||  | | ||||||||||    
T  13345873 cttgagagaaggtagttggcctagtggtggaagtgttacacaatattcacaattcgagatacacaaggacaccatgttagaaaacaatggatcacccaac 13345774  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||  | ||| ||| | || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  13345773 caactcggaaagcttgtcccaccatacaaccgaatgctcagtttcctcaggttaaatgatggttgcaacatatcaagcacatctttctctattcgcgagt 13345674  T
Q  294 cttc 297  Q
    ||||    
T  13345673 cttc 13345670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 619 - 731
Target Start/End: Original strand, 11129836 - 11129949
Alignment:
Q  619 tgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatcag-caagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaa 717  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11129836 tgataaaatcaaggtttgcaaatagtagaggttgcatattatctcaggcaagcttttgattttagtgcaagatagatctagatagcgcaactgcaccaaa 11129935  T
Q  718 ttgccaattgaatc 731  Q
     | |||||||||||    
T  11129936 cttccaattgaatc 11129949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 619 - 731
Target Start/End: Original strand, 11158824 - 11158937
Alignment:
Q  619 tgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaa 717  Q
    |||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| | || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11158824 tgataaaatcaaggtttgcaagtagtagaggttgcatattgtatcaggcaagcttttgatttcagtgtaagatagatctagatagcgcaactgcaccaaa 11158923  T
Q  718 ttgccaattgaatc 731  Q
     | |||||||||||    
T  11158924 cttccaattgaatc 11158937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 11129311 - 11129446
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| | |||||| ||||| |||||||||||||  ||||||  |||||  |  ||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11129311 cttgagagaagatagttgtcctagtggtggaagtgtcacacaatatcgacaattttctatgcaaagtgacaccatgttagaaaatgaagaatctcccaac 11129410  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatg 229  Q
    ||| | |||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  11129411 caactaggaaaacttgtcccgccataaaagtaaatg 11129446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10891093 - 10890893
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  |  ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| || |||    
T  10891093 cttgagagaagatagtcgtcctagtggtggaagtgtcacacaatatccacaattttcaatgcacagtgacaccatgttagaaaatgaagaatctcctaac 10890994  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    |||   ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||  || | |||||  || || | |||| ||||||||||| ||||| |||| |||||||    
T  10890993 caacatggaaagcttgtcccaccatacatgtcaatgttcaatctgtttaggtttaccgggggtttcaacatatcaagcacatctttccctttaagcgagt 10890894  T
Q  294 c 294  Q
    |    
T  10890893 c 10890893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13397272 - 13397116
Alignment:
Q  95 ttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaacc 194  Q
    |||||| | |||| ||| ||||| || |||||||| |||||||| ||||||   |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  13397272 ttgagaaaaggtacttgtcctagtggaggaagtgttatgcaatactcacaagatttgatggaaaggtacaccatgttagaaaacgaacaatcccccaacc 13397173  T
Q  195 aattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattg 251  Q
    || | ||||| ||| |||||||||| || | |||||||| |  ||||||||||||||    
T  13397172 aacttggaaagcttatcccaccatagaatttaatgctcaatttcttcaagtttattg 13397116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 619 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 10890568 - 10890455
Alignment:
Q  619 tgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatcag-caagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaa 717  Q
    |||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| | |||| |||||||||||| || |||   || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10890568 tgataaaatcaaggtttgcaaatagcagaggttgcatattatgtcaggcaagcttttgatttttgtgtgagatagatctagatagcgcaactgcaccaaa 10890469  T
Q  718 ttgccaattgaatc 731  Q
     |||||||||||||    
T  10890468 ctgccaattgaatc 10890455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 619 - 731
Target Start/End: Original strand, 11147661 - 11147774
Alignment:
Q  619 tgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatcag-caagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaa 717  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| | ||||   |||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11147661 tgataagatcaaggtttgcaaatagtagaggttacatattgtgtcaggcaagcctttgatttgagtgtgagagagatctagatagcgcaactgcaccaaa 11147760  T
Q  718 ttgccaattgaatc 731  Q
     |||||||||||||    
T  11147761 ctgccaattgaatc 11147774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 106 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8863061 - 8862873
Alignment:
Q  106 tagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaa 205  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  |  ||| | || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   |||||     
T  8863061 tagttgtcctagtggtggaagtgtcacacaatatccacaattttcaatgcacagtgacaccatgttagaaaatgaagaatctcccaaccaacatggaaag 8862962  T
Q  206 cttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtc 294  Q
    ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||  || | ||||| ||| || | |||| |||| |||||| ||||| |||| || |||||    
T  8862961 cttgtcccaccgtacaaggcaatgttcaatcgatttaggtttactgggggtttcaacatatccagcacatctttccctttaagtgagtc 8862873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13334694 - 13334566
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    |||  | | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  13334694 cttgagagaaggtagttggcctagtggtggaagtgttacacaatattcacaattcgagatacacaaggacaccatgttagaaaacaaaggatcacccaac 13334595  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaa 222  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  13334594 caactcggaaagcttgttccaccatacaa 13334566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 619 - 731
Target Start/End: Original strand, 11245430 - 11245543
Alignment:
Q  619 tgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaa 717  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||    ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  11245430 tgatagaagcaaggtttgcaaatggtagaggttgcacattgtataaggcaagattttgattttagtgtgaaagagatcaagatagcgcaactgcaccaaa 11245529  T
Q  718 ttgccaattgaatc 731  Q
     | |||||||||||    
T  11245530 ctaccaattgaatc 11245543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13162770 - 13162642
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    |||  | | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  13162770 cttgagagaaggtagttggcctagtggtggaagtgttacacaatattcacaattcgagatacacaaggacaccatgttagaaaacaaaggatcacccaac 13162671  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaa 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  13162670 caactcgggaagcttgttccaccatacaa 13162642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 717
Target Start/End: Complemental strand, 8862548 - 8862449
Alignment:
Q  619 tgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaa 717  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| || |||   || ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  8862548 tgataaaatcaaggtttgcaaatagtagaggttgcatattatgtcaggcaagcttttgatttttgtgtgagatagatctagatagcgcaactgcaccaaa 8862449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 94 - 235
Target Start/End: Original strand, 11244908 - 11245049
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||| | ||||||| |||||  || || |||||||  |||||| || ||| || |||| |||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||     
T  11244908 cttgagacaaggtagtttccctactggaggtagtgtcacacaatatgcaaaattatcgatgcaaagagaaaccatgttagaaaatgaagaatctcccaat 11245007  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagt 235  Q
    |||   |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||    
T  11245008 caacatggaaaacttgtcctgccatacaagaaaatgctcagt 11245049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 3886931 - 3886874
Alignment:
Q  162 acaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaacttgtcccaccata 219  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  3886931 acaccatatgagcaaatgaagaatcaccaaaccaattcggaaagctagttccaccata 3886874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Complemental strand, 26908675 - 26908037
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||| | |||||||| ||||| |||||||||||   |||| ||||||||| | | |||| |||||||||||| |||||||||||||| || ||||||    
T  26908675 cttgagaaaaggtagttgtcctaggggtggaagtgttgggcaaaattcacaattagttatgtgaagggacaccatcttagaaaatgaagagtctcccaac 26908576  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||| || |    
T  26908575 caactcgggaaacttgtcccaccatacaagtcaattttcaggctcttcagatttattggtggatgcaacatatcaagcacaaatttcacttgtagtgaat 26908476  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||  |||||||||   ||  | |||   ||| |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26908475 cttcactttgttttccccaaagcaactctaactcctcgattttctcttttcttttcaagttggcatcttctgcctctgtggcatcaacgacattatgcag 26908376  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    |||||| |||||||   |||| |||||||   | ||||| || || ||||||||||||  |||||| ||| |||| ||||||| |||| |||||||||||    
T  26908375 gttcttaatggtaagttttccctgtaggttttgaaattttctgagctctttgatacttaaccctacatgtcgcttacccactacaaaaactgtcaaagtt 26908276  T
Q  494 tggagactttctagc-ccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtact 592  Q
    |||||  |||||||  |||||| ||||||  || |||||  |||| |  ||     ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||| |    
T  26908275 tggaggttttctagtgccacaa-tttccacaggaaactcacttatgttagtcccttttatatcaaggtgacgtaacttgactaaatttccaatatgtaat 26908177  T
Q  593 ggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggaga 691  Q
    |||||||||||||||  |  |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| |||||| ||||||    
T  26908176 ggcaattcagtgagagcctcacaatttgataaaatcaaggtttgcaaattgtaaaggttacatattgtatcaggcaatcttttgattttagtgaaggaga 26908077  T
Q  692 gatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    | |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26908076 ggtctaaataccgcaattgcaccaaattaccaattgaatc 26908037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 167; Significance: 5e-89; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 98 - 731
Target Start/End: Original strand, 17851212 - 17851846
Alignment:
Q  98 agagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaat 197  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||   | | |||| || |||||||| |||||||| || | ||||     
T  17851212 agagaaggtagctgccccagcggtggaagtgtcatgcaatgttcaccattactgatgcccaagaacacgatgttagaaaacgaagaatctcctagccaac 17851311  T
Q  198 tcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagtcttc 297  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||| |  | ||| |||||| ||||||||||  ||||  || || ||||||||||    
T  17851312 ttggaaaacttgtcccaccataaaagtcaatgcttagtttcttcaggttaaccgatggttgcaacatatcaagcacgtctttttctattcgcgagtcttc 17851411  T
Q  298 acttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcaggttc 397  Q
    | ||  ||  |||||||  || |  ||  |||| |||| |||||||||||| |  ||||||||  |||| ||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  17851412 agtttgttcgccccattgtagctccaacttctccattttctctttgcttttcaaattggcatcacctgcatctctggcctcaatgacatcatgcaggttc 17851511  T
Q  398 ttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtttgga 497  Q
    ||||||||||   |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||| | |||||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  17851512 ttgatggtaagtgttccttgtagatgtggaaattttctaagctctttgatacttaatcctacttgtcgtttccccactacaaaaacagtcaaagtttgaa 17851611  T
Q  498 gactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaa 597  Q
    |  ||||||| | |  ||||||||  ||||||||||||||   |||   ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  17851612 ggttttctagtctagcaatttccacaggcaactcctttattgtcgtcccacttatatcaaggtgacgtaaattgattaaatttccaatatgtaatggcaa 17851711  T
Q  598 ttcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgta-tcagcaagcttttgatattagtggaggagagatct 696  Q
    ||||||||||  || |||   || ||||| || ||||||||||||||||||||| | | ||||| |  ||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  17851712 ttcagtgagaacccgacaatatgctaaaatcatggtttgcaaattgtaaaggttacttgttgtattgggcaagcttttgattttagtgaaggagagatct 17851811  T
Q  697 agatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17851812 agataacgtaattgcaccaaattggcaactgaatc 17851846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 159; Significance: 3e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 731
Target Start/End: Original strand, 55884 - 56522
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||||  |||| |||||||| | ||||    || || ||||| ||| |||||||||||   ||||||    
T  55884 cttgagagaaggtaactgccctagggatggaagtgtcacacaattttcacaattactgatactgagagataccatgttataaaatgaagaacttcccaac 55983  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||   |||  |||  | |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  55984 caactcggaaagcttgtcccaccatacaaacaaatattcaagctcttcaaatttattggtggttgcaacatatcgagcacaactttcactttttgcgagt 56083  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||||||   ||||||||| |||| | |||   |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| | ||||||| |||||||||  ||||||| |||    
T  56084 cttcactttgatttccccatatcagctctaactcctcaattttctctttgcttttcaggtttgcatcgtgtgcctctctggcatcaacaacattatccag 56183  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||| ||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||  ||| || ||  |||| ||||||| ||||   || | ||||    
T  56184 gttattgatggtaagttttccttgtaggtttgggaatttccttagctctttgatacttaaccccacgtggcgcttacccactaaaaaaaaggtgagagtt 56283  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
    || ||  ||||||| ||   ||||||||  |||| ||| ||||| |  ||   ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||    
T  56284 tgaaggttttctagtcccgcaatttccacaggcagctcatttatgttagtcccacttatatcaaggtgacgtaaactgactaaatttccaatatgtattg 56383  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagag 692  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   |||| ||||||     
T  56384 gcaattcagtgagactccagcagtttgataaattcaaggtctgtaaattgtaaaggttacatattgtatcaggcaagctttcgattccagtgaaggagat 56483  T
Q  693 atctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  56484 atctagataccgcaactgcaccgaatttccaattgaatc 56522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 547 - 731
Target Start/End: Original strand, 57146 - 57331
Alignment:
Q  547 acttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaa 646  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| ||  ||||||||  |||||| || |||||||||    
T  57146 acttatatcaaggtgacgtaaactgactaaatttccaatatgtattggaaattcagtgagactccagcagtttgataaattcaaggtctgtaaattgtaa 57245  T
Q  647 aggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaaattgccaattgaatc 731  Q
    ||||| |||||||||||| | ||||||| |||   |||| |||||| ||||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  57246 aggttacatattgtatcaggaaagctttcgattccagtgaaggagatatctagataccgcaacagcaccaaattcccaattgaatc 57331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 29838427 - 29837861
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| | ||| |||||||| | ||||||||| | |||||||||||||| | |||||  |||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||||    
T  29838427 cttgagagaagatagatgccctagtgatggaagtgtaaggcaatattcacaattactgatgctaaggtacaccatgttaaagaatgaagaatctcccaac 29838328  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| | ||||| ||| | || |||||  || |||| ||||||  |||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||| |||| |  || |   ||    
T  29838327 caacttggaaagctttttccgccatagtagccaatactcagtttcttcaagtttattgatggtcgcaacatatcaagcacagttttctcagttcgatggt 29838228  T
Q  294 cttcacttaattttccccatttcagatttaatatctcaatttgctctttgcttttaaggttggcatcttctgcctctgtggcatcaatgacattatgcag 393  Q
    ||||| ||  || ||||||||  |    |||   ||||||||||||||||||||| | |||||||     ||||||  ||| |||| |||||||||||||    
T  29838227 cttcagtttgttctccccattgtaatactaactcctcaatttgctctttgctttttaagttggcagaaaatgcctccatggaatcagtgacattatgcag 29838128  T
Q  394 gttcttgatggtaaagcttccttgtaggtgggggaatttcctaagttctttgatacttggccctacttgtggcttccccactataaaatctgtcaaagtt 493  Q
    ||||  ||||||||   |||| |||||  | ||  ||||||| || ||||||||||||  ||| | |||   ||| |||||||||||| | || | ||||    
T  29838127 gttcaagatggtaagttttccctgtagacgtggatatttcctgagctctttgatacttaacccgatttgacccttacccactataaaaacagttagagtt 29838028  T
Q  494 tggagactttctagcccacaaatttccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactg 593  Q
     | ||   ||||||  |   ||||| |||||||||||| |||||||  ||   ||| ||||||||||||| ||| ||||| ||  |||| ||||||  ||    
T  29838027 cgaagttcttctagttcgacaatttgcattggcaactcttttatatttgtcccactaatatcaaggtgacgtaaattgatcaacattccaatatgtgttg 29837928  T
Q  594 gcaattcagtgagacaccaacatcttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgt 660  Q
    |||| ||||||||||   ||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  29837927 gcaaatcagtgagacgataacaatatgataaaatcaaggtttgcaaattgtataggttacatattgt 29837861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 297
Target Start/End: Original strand, 134170 - 134373
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| |  |||||||||||||    |||  | | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  134170 cttgagagaaggtagttgacctagtgatggaagtgttacacaatattcacaattcgagatacacaaggacaccatgttagaaaaaaaaggatcacccaac 134269  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagctttcacttttagcgagt 293  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||  | ||| ||| | || ||| |||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||    
T  134270 caactcggaaagcttgtcccaccatacaagctaatgctcagtttcctcaggttaaatgatggttgcaacatatcaagcacatctttctctattcgcgagt 134369  T
Q  294 cttc 297  Q
    ||||    
T  134370 cttc 134373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Original strand, 144218 - 144346
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    |||  | | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  144218 cttgagagaaggtagttggcctagtggtggaagtgttacacaatattcacaattcgagatacacaaggacaccatgttagaaaacaaaggatcacccaac 144317  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaa 222  Q
    ||| ||||||| ||||| |||||||||||    
T  144318 caactcggaaagcttgttccaccatacaa 144346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 94 - 222
Target Start/End: Original strand, 152523 - 152651
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||||||||||    |||  | | ||||||||| ||||||||  ||| ||||||||||    
T  152523 cttgagagaaggtagttggcctagtggtggaagtgttacacaatattcacaattcgagatacacaaggacaccatgttagaaaacaaaggatcacccaac 152622  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaa 222  Q
    ||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  152623 caactcgggaagcttgttccaccatacaa 152651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 279
Target Start/End: Original strand, 31678015 - 31678200
Alignment:
Q  94 cttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaac 193  Q
    ||||||||| ||||| |||||||  |||||||  || || ||||||  ||||| | ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||| || | |    
T  31678015 cttgagagaaggtagctgccctattggtggaatcgttatacaatatgtacaattactgatgaaaagggtcaccatgttagaaaatgaaaaatctccgagc 31678114  T
Q  194 caattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctcagtcccttcaagtttattggtggatgcaacgtatcaagcacagcttt 279  Q
    |||   |||| |||||| || ||||| ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||| ||||| | |||||| || |||||    
T  31678115 caacatggaagacttgttcctccatagaagtcgatgctcagtttcttcaagttaatcggtggttgcaatgcatcaagtactgcttt 31678200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 731
Target Start/End: Original strand, 31678439 - 31678653
Alignment:
Q  518 tccattggcaactcctttatatccgtagaacttatatcaaggtgacataagttgattaaatttcccatatgtactggcaattcagtgagacaccaacatc 617  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||  |  | ||||| ||||||| ||| || ||||| ||||| |||||||| || |||||| |||||    | ||      
T  31678439 tccattggcatctcctttatgttcgtccagttaatatctaggtgacgtaaattaattaactttccaatatgtaccggtaattcaatgagatgatagcaat 31678538  T
Q  618 ttgataaaagcaaggtttgcaaattgtaaaggttgcatattgtatca-gcaagcttttgatattagtggaggagagatctagatatcgcaattgcaccaa 716  Q
     |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||  ||  | |||  ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  31678539 atgataaaatcaatgtttgcaaattgtgaaggttacatgttgtatcaggcaagctttcaattctggtgttggatagatcaagataccgcaactgcaccaa 31678638  T
Q  717 attgccaattgaatc 731  Q
    | |||||||||||||    
T  31678639 actgccaattgaatc 31678653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 827679 - 827541
Alignment:
Q  95 ttgagagatggtagttgccctagcggtggaagtgtcatgcaatattcacaatcattgatgtaaagggacaccattttagaaaatgaagaatcacccaacc 194  Q
    |||||||| | |||||| ||||| || |||||||| |  |||||  |||||  | ||| | ||||| ||||||| |||||||||||| |||| |||||||    
T  827679 ttgagagaagttagttgtcctagtggaggaagtgttacacaatacacacaagaactgaggcaaaggtacaccatgttagaaaatgaacaatctcccaacc 827580  T
Q  195 aattcggaaaacttgtcccaccatacaagtcaatgctca 233  Q
    ||   |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||    
T  827579 aacgtggaaaactcgtcccaccatagaagtaaatgctca 827541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 162 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 1274 - 1217
Alignment:
Q  162 acaccattttagaaaatgaagaatcacccaaccaattcggaaaacttgtcccaccata 219  Q
    ||||||| | || ||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||    
T  1274 acaccatatgagcaaatgaagaatcaccaaaccaattcggaaagctagttccaccata 1217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University