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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF10049A_low_7 (Length: 587)
Name: NF10049A_low_7
Description: NF10049A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF10049A_low_7 |
 | |
|
Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 502; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 502; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14174283 - 14173716
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnn--ttaacaccaatatttaacgtggaaa |
115 |
Q |
| |
|
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| T |
14174283 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagtgataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaa |
14174184 |
T |
|
| Q |
116 |
accctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174183 |
accctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
14174084 |
T |
|
| Q |
216 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
315 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14174083 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
14173984 |
T |
|
| Q |
316 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttc |
413 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14173983 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttc |
14173884 |
T |
|
| Q |
414 |
attccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaa |
513 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14173883 |
attccttcaagtacccctctatttataggggaaatcggctgatgaagagttaaatgctatgccctcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaa |
14173784 |
T |
|
| Q |
514 |
aactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
581 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14173783 |
aactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
14173716 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 498; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 14179037 - 14178470
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnn--ttaacaccaatatttaacgtggaaa |
115 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14179037 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcaataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaa |
14178938 |
T |
|
| Q |
116 |
accctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178937 |
accctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
14178838 |
T |
|
| Q |
216 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178837 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
14178738 |
T |
|
| Q |
316 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttc |
413 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178737 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttcattgatttc |
14178638 |
T |
|
| Q |
414 |
attccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaa |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178637 |
attccttcaagtacccctttatttataggggaaatcggctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaa |
14178538 |
T |
|
| Q |
514 |
aactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14178537 |
aactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
14178470 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 44161930 - 44161366
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnn--ttaacaccaatatttaacgtggaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161930 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaa |
44161831 |
T |
|
| Q |
116 |
accctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
44161830 |
accctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaat--tctctccactctcttacacacaca |
44161733 |
T |
|
| Q |
216 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
315 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161732 |
agagatacaatatagtgtttcccgtaagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
44161633 |
T |
|
| Q |
316 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgt-attttcacttctgcttcattgatttca |
414 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
44161632 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctattattcctctcacacacctctacacacagaagctttgtgtttttcacttctgcttcgatgccttca |
44161533 |
T |
|
| Q |
415 |
ttccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaaa |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161532 |
ttccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaaa |
44161433 |
T |
|
| Q |
515 |
actatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
581 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
44161432 |
actatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
44161366 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 404
Target Start/End: Original strand, 28606825 - 28607215
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnn--ttaacaccaatatttaacgtggaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28606825 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaattaacaccaatatttaacgtgaaaa |
28606924 |
T |
|
| Q |
116 |
accctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28606925 |
accctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
28607024 |
T |
|
| Q |
216 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607025 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
28607124 |
T |
|
| Q |
316 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtattttcacttctgcttc |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28607125 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttc |
28607215 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 404
Target Start/End: Original strand, 28611587 - 28611977
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnn--ttaacaccaatatttaacgtggaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
28611587 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtgaaaa |
28611686 |
T |
|
| Q |
116 |
accctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611687 |
accctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
28611786 |
T |
|
| Q |
216 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611787 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
28611886 |
T |
|
| Q |
316 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtattttcacttctgcttc |
404 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28611887 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttc |
28611977 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 11104810 - 11104427
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnttaacaccaatatttaacgtggaaaac |
117 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
11104810 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagattggatcttgcagcgcagctgtagcgataaaaa-tgaacaccaatatttaacatagaaaat |
11104712 |
T |
|
| Q |
118 |
cctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaag |
217 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
11104711 |
cctctaatatcgagggtaaa-ccacgggacaaactccgaaaaatattccaccatatctaagaatattacaatattctctccactctcttacacaca-aag |
11104614 |
T |
|
| Q |
218 |
agatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttt |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11104613 |
agatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcaaatgctattattttataacacctagaagttatagagatgatatccacccggtgtatttt |
11104514 |
T |
|
| Q |
318 |
tcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
405 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
11104513 |
tcctacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacatagaagctttgta-tttgacttctgcttca |
11104427 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 9e-90
Query Start/End: Original strand, 18 - 300
Target Start/End: Original strand, 48826721 - 48827000
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnttaacaccaatatttaacgtggaaaac |
117 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826721 |
aacgcaattgtaaattaaaatttcaaaattcaa--gagattggatcttgcagcgcagcggtagcgatagaaaaagaacaccaatatttaacgtggaaaat |
48826818 |
T |
|
| Q |
118 |
cctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaag |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
48826819 |
cctctaataccgagggaaaaatcacgggacaa-ctccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctcttcgctctcttacacacacaag |
48826917 |
T |
|
| Q |
218 |
agatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata |
300 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48826918 |
agatacaatatagtgtttcccgtgagattcactcctatttgaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata |
48827000 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 273
Target Start/End: Original strand, 24726288 - 24726446
Alignment:
| Q |
112 |
gaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacaca |
211 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| | ||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||| ||||| || | |
|
|
| T |
24726288 |
gaaaaccatctaatatcaagggaaaagccacgagacaaactctgaaaaatattccattatattaaagaacataataatattctctccattctcttaccga |
24726387 |
T |
|
| Q |
212 |
cacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattatttta |
273 |
Q |
| |
|
||| |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
24726388 |
cac--gagatacactatattgttttccgtgagacc-actcctattcaaatgttattatttta |
24726446 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 197
Target Start/End: Original strand, 48708155 - 48708256
Alignment:
| Q |
96 |
accaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctc |
195 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||| || |||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48708155 |
accaatatttaacatgaaaaactctataatactaagagaaaaaccacgtgacaaactccaaaaaatatttcattatattaaaaaatattacaatattctc |
48708254 |
T |
|
| Q |
196 |
tc |
197 |
Q |
| |
|
|| |
|
|
| T |
48708255 |
tc |
48708256 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 342 - 441
Target Start/End: Original strand, 24726535 - 24726634
Alignment:
| Q |
342 |
acactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttatag |
441 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||| || |||| ||||||||| |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24726535 |
acactctatcttttcattcatacacttctacagacagaagctttgtatttcaacttcttcttagatgctttccttccttcaaatacccctcaatttatag |
24726634 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 378; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 378; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 581
Target Start/End: Original strand, 29106900 - 29107460
Alignment:
| Q |
21 |
gcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnttaacaccaatatttaacgtggaaaaccct |
120 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29106900 |
gcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagattggatcttgcagcgcagcggtagcgttaaaaa-tgaacaccaatatttaacgtggaaaaccct |
29106998 |
T |
|
| Q |
121 |
ctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagaga |
220 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29106999 |
ctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctcttacacacacaagaga |
29107098 |
T |
|
| Q |
221 |
tacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgata-cccacccggtgtatttttc |
319 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
29107099 |
tacaa-atagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttttagcacctagaagttataaagatgataccccacccaatgtatttttc |
29107197 |
T |
|
| Q |
320 |
ccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctac--acacagaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttcattc |
417 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||| |
|
|
| T |
29107198 |
ccacactctctggatttactcaaca--ctattttttctctcacacacttctacatacagagaagctttgtatttccacttctgcttcgatgctttcattc |
29107295 |
T |
|
| Q |
418 |
cttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtg-aaaac |
516 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
29107296 |
cttcaagtacccctttatttatagaggaaatcagttgatgatgagttaaatgctatgcactccttttacgccaaagttatgtcctcaatgtgtgaaaaac |
29107395 |
T |
|
| Q |
517 |
tatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
29107396 |
tatattttatgtcatgttttcaaactgcttcaccacaagctatgtgtgttctctgaacaacctat |
29107460 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 518
Target Start/End: Original strand, 42911012 - 42911513
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnttaacaccaatatttaacgtggaaaac |
117 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
42911012 |
aacgcaagtggaaattaaaattttaaaatccaaaagagattagatcttgcagcgcagcggcaacgataaaaa-tgaacaccaatatttaacatggaaaac |
42911110 |
T |
|
| Q |
118 |
cctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaag |
217 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911111 |
cctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaa-tattccactatatttaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaaa |
42911209 |
T |
|
| Q |
218 |
agatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttt |
317 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
42911210 |
agatacaatatagtgtttcccttgagacctacttctattctaatgctattattttatagcaccaagaagttatagagatgatacccacccagtgtatttt |
42911309 |
T |
|
| Q |
318 |
tcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgt-attttcacttctgcttcattgatttca |
414 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
42911310 |
ttccacactctctggatttactcaacactctattttttctctcacacacttctacacacacagaagctttgtgtttttcacttctgcttcgatgctttca |
42911409 |
T |
|
| Q |
415 |
ttccttcaagtaccc-ctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaa |
513 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42911410 |
ttccttcaagtaccctctctatttatagaggaaatcagcttat-aagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaa |
42911508 |
T |
|
| Q |
514 |
aacta |
518 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
42911509 |
aacta |
42911513 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 517 - 581
Target Start/End: Original strand, 42911787 - 42911851
Alignment:
| Q |
517 |
tatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
42911787 |
tatattttatgtcatgctttcaaactgctccatcgcaagctatgtgtgttctctgcacatcctat |
42911851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 93 - 182
Target Start/End: Original strand, 38997231 - 38997320
Alignment:
| Q |
93 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
182 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
38997231 |
aacagcaatattttacgtcgaaaaccctctaatatcgaacgaaaaactacgggacaaactccaaaaaataatccattatattaaagaata |
38997320 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 24 - 79
Target Start/End: Original strand, 38994724 - 38994779
Alignment:
| Q |
24 |
agtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggta |
79 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
38994724 |
agtgtaaattaaaattccaaaacccaaacaaaattggatcttgcagtgcagcggta |
38994779 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 343; Significance: 0; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 343; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15290575 - 15290016
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaa-gagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnn--ttaacaccaatatttaacgtggaa |
114 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290575 |
aacgcaattgtaaattaaaatttcaaaatccaaaaagagattggatcttgcagcgcagccttagcgataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaa |
15290476 |
T |
|
| Q |
115 |
aaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacac |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
15290475 |
aaccctctaataccgaggtataaaccacgggacaaactccaaaagattttccactatatttaagaatattacaatattctctccactctcttacacacac |
15290376 |
T |
|
| Q |
215 |
aagagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtat |
314 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290375 |
aagagatacaatatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgaatgctattattt--cagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtat |
15290279 |
T |
|
| Q |
315 |
ttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaac---tttgtattttcacttctgcttcattgatt |
411 |
Q |
| |
|
|||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | || || |
|
|
| T |
15290278 |
tttt-ccacactttctggatttagtcaacactctat------tctcacacacttctacacacagaagcttttttgtattttcacttctgctacgatgctt |
15290186 |
T |
|
| Q |
412 |
tcattccttcaagtacccctctatttataggggaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtg |
511 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
15290185 |
tcattccttcaagtacccctctatttatagaggaaatcagttgatgaagagttaaatgctatgcatttctttcacaccaaagtcatgtcttcaatgtgtg |
15290086 |
T |
|
| Q |
512 |
aaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
581 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15290085 |
aaaactatattttatgtcatgctttcaaactgctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
15290016 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Original strand, 37040445 - 37040836
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnn--ttaacaccaatatttaacgtggaaa |
115 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040445 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaaagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaa |
37040544 |
T |
|
| Q |
116 |
accctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacaca |
215 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040545 |
accctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattttctccactctctcacacacaca |
37040644 |
T |
|
| Q |
216 |
agagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatt |
315 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
37040645 |
agagatacaatatagtgttttccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccgatgtatt |
37040744 |
T |
|
| Q |
316 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
37040745 |
tttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttca |
37040836 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 346 - 581
Target Start/End: Complemental strand, 15302960 - 15302723
Alignment:
| Q |
346 |
tctatttttcctctcacacacttctacacaca--gaaactttgtattttcacttctgcttcattgatttcattccttcaagtacccctctatttataggg |
443 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15302960 |
tctatttttgctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcaattctgcttcgatgctttcattccttcaagtacccctctatttatagag |
15302861 |
T |
|
| Q |
444 |
gaaatcagctgatgaagagttaaatgctatgcactcctttcacaccaaagtcatgtccttaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactg |
543 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15302860 |
gaaatcagttgatgaagagttaaatgctatggactcctttcacacgaaagtcatgtcttcaatgtgtgaaaactatattttatgtcatgctttcaaactg |
15302761 |
T |
|
| Q |
544 |
ctccaccgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
581 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15302760 |
ctccactgcaagctatgtgtgttctctgcacaacctat |
15302723 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12099342 - 12098960
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnttaacaccaatatttaacgtggaaaac |
117 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| | || | |||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
12099342 |
aacgcgagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagatatgatcttgcagctcaccgatagcgataaaaa-tgaaaagcaatattttacgtgaaaaac |
12099244 |
T |
|
| Q |
118 |
cctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaag |
217 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
12099243 |
cctctaatgacgaaggaaaaaccaagggacaaactccgaaaaaatttcaactatattaaagaatattacaatattctctccactctcttacacgcacaag |
12099144 |
T |
|
| Q |
218 |
agatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttt |
317 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| | | |||||| |
|
|
| T |
12099143 |
agacacaatattgtgtttctagtgagactcactcctattcaaatgatattattttataacacctaaaagttatagagatgatactcactcaatctatttt |
12099044 |
T |
|
| Q |
318 |
tcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
405 |
Q |
| |
|
| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
12099043 |
--cgaga--ctctgaatttactcaacactctatttttcctttcacatacttctacacacaaaaactttgtagtttcacttctacttca |
12098960 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 148 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12082227 - 12081973
Alignment:
| Q |
148 |
aaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgtttcccgtgagacct |
247 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
12082227 |
aaactccaaaaaatattccactatattaa-gaatattacaatattttctccactctcttacacggaaaagagatacaatatagtgtttctaatgagactc |
12082129 |
T |
|
| Q |
248 |
acttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtatttttcccacactctctggatttactcaacactc |
347 |
Q |
| |
|
|| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
12082128 |
gctcctattcaaatgttattattttatagcgcctagaagttatagagataatacctacccgatatatttttccc-ctttttctggatttacccaacactc |
12082030 |
T |
|
| Q |
348 |
tatttttcctctcacacacttctacacacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
405 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12082029 |
taattttctgatcacacacttctacaca-aaaaactttgtatcttcacttatgcttca |
12081973 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 235
Target Start/End: Original strand, 2757370 - 2757448
Alignment:
| Q |
157 |
aaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatacaatatagtgttt |
235 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| || |||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2757370 |
aaaatattccactatatttaaaaatattgcactattctctccactctctttcacactcaagagatacaatatagtgttt |
2757448 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12084723 - 12084668
Alignment:
| Q |
27 |
gtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcg |
82 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||| |||||| |||||||| |
|
|
| T |
12084723 |
gtaaattaaaatttcaaaatccaatagacattggatcttgtagcgcaacggtagcg |
12084668 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 22 - 54
Target Start/End: Original strand, 2757236 - 2757268
Alignment:
| Q |
22 |
caagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaaga |
54 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2757236 |
caagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaaga |
2757268 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12931021 - 12930631
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnntt-aacaccaatatttaacgtggaaaa |
116 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12931021 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaa |
12930922 |
T |
|
| Q |
117 |
ccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaa |
216 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930921 |
ccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaa |
12930822 |
T |
|
| Q |
217 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
316 |
Q |
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||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
12930821 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
12930722 |
T |
|
| Q |
317 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12930721 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttca |
12930631 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 12935767 - 12935377
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnntt-aacaccaatatttaacgtggaaaa |
116 |
Q |
| |
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|
| T |
12935767 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaattcaaaagaaactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaa |
12935668 |
T |
|
| Q |
117 |
ccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaa |
216 |
Q |
| |
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| T |
12935667 |
ccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaa |
12935568 |
T |
|
| Q |
217 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
316 |
Q |
| |
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|
| T |
12935567 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttactctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
12935468 |
T |
|
| Q |
317 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12935467 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttca |
12935377 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 93 - 205
Target Start/End: Original strand, 26504945 - 26505055
Alignment:
| Q |
93 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatatt |
192 |
Q |
| |
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|
| T |
26504945 |
aacatcaatatttaacgtg-aataccgtctaataacaaggcaaaa-ccacagtacaaactccaaaaaatattcaactataataaaaaatattacaatatt |
26505042 |
T |
|
| Q |
193 |
ctctccactctct |
205 |
Q |
| |
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|| || ||||||| |
|
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| T |
26505043 |
ctttcaactctct |
26505055 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 332; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 405
Target Start/End: Complemental strand, 34907484 - 34907094
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnntt-aacaccaatatttaacgtggaaaa |
116 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34907484 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgataaaaaaatgaacaccaatatttaacgtggaaaa |
34907385 |
T |
|
| Q |
117 |
ccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaa |
216 |
Q |
| |
|
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|
| T |
34907384 |
ccctctaataccgagggaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaa |
34907285 |
T |
|
| Q |
217 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
316 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34907284 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttttattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
34907185 |
T |
|
| Q |
317 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcacttctgcttca |
405 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
34907184 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttca |
34907094 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 235; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 18 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 8539529 - 8539139
Alignment:
| Q |
18 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagcgnnnnnnnnttaacaccaatatttaacgtggaaaac |
117 |
Q |
| |
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| T |
8539529 |
aacgcaagtgtaaattaaaattccaaattctaaaagagattggatcttgcagcgcagcggtaacaataaaaaatgaacatcaatatttaacgtggaaaac |
8539430 |
T |
|
| Q |
118 |
cctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaag |
217 |
Q |
| |
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||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |
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| T |
8539429 |
cctctaataccgagggaaaaatcacgggacaaactccgaaagatattccactatatttaagaatattacaatattatctccactctcttacacacacaag |
8539330 |
T |
|
| Q |
218 |
agatacaa---tatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtat |
314 |
Q |
| |
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|||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |
|
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| T |
8539329 |
agatacaatattatagtgttt-ccgtgagacccactcctattcgattgctattattttacagcacctaaaagttatagagatgatacccatccgatgtat |
8539231 |
T |
|
| Q |
315 |
ttttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttct--acacacagaaactttgtattttcacttctgcttc |
404 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8539230 |
ttttcccacactctctgaatttactgaacactatatttttcctctcacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttctgcttc |
8539139 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 3)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 217 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 51302306 - 51302118
Alignment:
| Q |
217 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacctacttctattctaatgctattattttatagcacctagaagttatagagatgatacccacccggtgtattt |
316 |
Q |
| |
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|
|
| T |
51302306 |
gagatacaatatagtgtttcccgtgagacccactcctattcgaatgcaattgttttatagcacctagaagttatagagatgattcccacccggtgtattt |
51302207 |
T |
|
| Q |
317 |
ttcccacactctctggatttactcaacactctatttttcctctcacacacttctaca--cacagaaactttgtattttcacttctgctt |
403 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |
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|
| T |
51302206 |
tatccacactctctggatttactcaatactctatttttcctcacacacacttctacacacacagaagctttgtattttcacttatgctt |
51302118 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 51302997 - 51302937
Alignment:
| Q |
21 |
gcaagtgtaaattaaaattccaaaatccaaaagagactggatcttgcagcgcagcggtagc |
81 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302997 |
gcaagtgtaaattaaaatttcaaaatccaaaacagattggatcttgcagcgcagcggtagc |
51302937 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 51302342 - 51302304
Alignment:
| Q |
93 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
131 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
51302342 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgag |
51302304 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 93 - 182
Target Start/End: Original strand, 2100293 - 2100379
Alignment:
| Q |
93 |
aacaccaatatttaacgtggaaaaccctctaataccgaggaaaaaaccacgggacaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
182 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2100293 |
aacatcaatatttaaggtggaaaaccctttaataatgagcgaaaa---acggggcaaactccgaaaaatattccactatattaaagaata |
2100379 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 175 - 223
Target Start/End: Original strand, 2100723 - 2100771
Alignment:
| Q |
175 |
aaagaatattacaatattctctccactctctcacacacacaagagatac |
223 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
2100723 |
aaagaatattacaatattctctccactctcttacatacacaagagatac |
2100771 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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