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Alignment Overview

Query: NF10060_low_14 (Length: 313)

Name: NF10060_low_14
Description: NF10060
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10060_low_14
NF10060_low_14
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (1-306)||(16041174-16041479)
chr7 (1-306)||(16449985-16450290)
chr7 (1-306)||(31088451-31088756)
chr7 (1-306)||(45733311-45733616)
chr7 (1-278)||(16503395-16503675)
chr7 (1-278)||(16518431-16518711)
chr7 (24-278)||(10916883-10917137)
chr7 (150-306)||(2108992-2109148)
chr7 (150-306)||(26484694-26484850)
chr7 (150-306)||(39211010-39211166)
chr7 (39-299)||(5127878-5128141)
chr7 (150-306)||(2775359-2775515)
chr7 (39-278)||(11424791-11425033)
chr7 (150-298)||(18540799-18540947)
chr7 (39-278)||(2154459-2154701)
chr7 (21-299)||(5147334-5147615)
chr7 (21-299)||(26435125-26435406)
chr7 (21-298)||(5159390-5159667)
chr7 (42-278)||(4145138-4145377)
chr7 (45-278)||(45387235-45387471)
chr7 (39-299)||(16736454-16736717)
chr7 (39-299)||(16751508-16751771)
chr7 (39-299)||(17523418-17523681)
chr7 (39-299)||(17529534-17529797)
chr7 (157-278)||(31124927-31125048)
chr7 (159-278)||(3445315-3445434)
chr7 (135-278)||(9618636-9618779)
chr7 (135-278)||(26275109-26275252)
chr7 (135-278)||(26319884-26320027)
chr7 (157-278)||(31564405-31564526)
chr7 (135-278)||(26669929-26670072)
chr7 (168-278)||(11441590-11441700)
chr7 (135-278)||(24592556-24592699)
chr7 (159-278)||(26537885-26538004)
chr7 (159-257)||(26485759-26485857)
[»] chr5 (52 HSPs)
chr5 (1-306)||(22888329-22888634)
chr5 (1-306)||(25198888-25199193)
chr5 (1-306)||(13184646-13184951)
chr5 (1-306)||(33877106-33877411)
chr5 (1-306)||(13440492-13440797)
chr5 (1-306)||(11325653-11325958)
chr5 (1-306)||(23892062-23892370)
chr5 (1-278)||(24969880-24970154)
chr5 (150-306)||(29889080-29889236)
chr5 (24-278)||(30934515-30934769)
chr5 (39-278)||(11549248-11549490)
chr5 (39-299)||(23752455-23752718)
chr5 (39-278)||(23718014-23718256)
chr5 (39-278)||(24688183-24688425)
chr5 (39-299)||(33777381-33777644)
chr5 (39-299)||(22999119-22999382)
chr5 (42-299)||(32599477-32599734)
chr5 (39-299)||(9548548-9548811)
chr5 (21-298)||(33292404-33292681)
chr5 (39-299)||(41674603-41674866)
chr5 (39-278)||(8665501-8665743)
chr5 (135-278)||(2511044-2511187)
chr5 (135-278)||(15758883-15759026)
chr5 (135-278)||(18375438-18375581)
chr5 (157-299)||(37671488-37671630)
chr5 (42-278)||(30168366-30168605)
chr5 (135-299)||(6874298-6874462)
chr5 (42-278)||(34616418-34616654)
chr5 (135-278)||(26480385-26480528)
chr5 (135-278)||(33516349-33516492)
chr5 (54-299)||(15658765-15659013)
chr5 (157-299)||(28649250-28649392)
chr5 (157-278)||(3789556-3789677)
chr5 (135-278)||(5637903-5638046)
chr5 (135-278)||(9317444-9317587)
chr5 (135-278)||(12132148-12132291)
chr5 (135-278)||(30152011-30152154)
chr5 (159-278)||(31826433-31826552)
chr5 (156-278)||(28959812-28959934)
chr5 (157-299)||(37770992-37771134)
chr5 (157-278)||(37358669-37358790)
chr5 (157-299)||(18500735-18500877)
chr5 (168-278)||(31431466-31431576)
chr5 (157-298)||(13324835-13324976)
chr5 (157-278)||(37754995-37755116)
chr5 (159-299)||(43078269-43078409)
chr5 (135-278)||(29967092-29967235)
chr5 (135-278)||(30029408-30029551)
chr5 (42-100)||(31431325-31431383)
chr5 (159-256)||(24681457-24681554)
chr5 (159-256)||(24723984-24724081)
chr5 (159-256)||(40473597-40473694)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (1-306)||(1900122-1900427)
chr4 (1-306)||(15227735-15228040)
chr4 (1-306)||(24460706-24461011)
chr4 (5-306)||(15285029-15285330)
chr4 (4-306)||(14235626-14235931)
chr4 (17-306)||(15391439-15391725)
chr4 (6-299)||(17013867-17014163)
chr4 (39-278)||(24592443-24592682)
chr4 (39-278)||(14664918-14665160)
chr4 (39-299)||(6569753-6570016)
chr4 (21-299)||(14763412-14763693)
chr4 (51-299)||(36344623-36344871)
chr4 (21-298)||(24112547-24112824)
chr4 (21-298)||(34189069-34189346)
chr4 (135-278)||(14098540-14098683)
chr4 (45-278)||(27163446-27163682)
chr4 (45-299)||(5005776-5006036)
chr4 (157-278)||(18800742-18800863)
chr4 (159-278)||(30753777-30753896)
chr4 (135-278)||(40105767-40105910)
chr4 (21-299)||(54833272-54833550)
chr4 (159-299)||(33673906-33674046)
chr4 (135-278)||(31126647-31126790)
chr4 (51-193)||(21969613-21969758)
chr4 (159-256)||(39850661-39850758)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (1-306)||(21703254-21703559)
chr2 (1-306)||(27118534-27118839)
chr2 (1-306)||(34303393-34303698)
chr2 (1-306)||(19456511-19456816)
chr2 (1-306)||(34156857-34157162)
chr2 (1-306)||(3784500-3784805)
chr2 (1-306)||(16163445-16163750)
chr2 (1-278)||(31891446-31891723)
chr2 (150-306)||(27392964-27393120)
chr2 (1-306)||(27434534-27434842)
chr2 (1-278)||(23128684-23128964)
chr2 (39-278)||(28882095-28882337)
chr2 (1-278)||(12655385-12655665)
chr2 (1-278)||(20837761-20838041)
chr2 (39-278)||(21677300-21677542)
chr2 (45-299)||(11635283-11635543)
chr2 (39-299)||(34279330-34279593)
chr2 (39-299)||(34286235-34286498)
chr2 (39-299)||(34291295-34291558)
chr2 (159-306)||(40233515-40233662)
chr2 (45-299)||(11641472-11641732)
chr2 (135-299)||(22926125-22926289)
chr2 (135-278)||(16829456-16829599)
chr2 (135-278)||(16891882-16892025)
chr2 (42-278)||(37925377-37925616)
chr2 (135-278)||(31876261-31876404)
chr2 (135-278)||(34861660-34861803)
chr2 (135-278)||(37686027-37686170)
chr2 (135-278)||(37701292-37701435)
chr2 (156-278)||(39890075-39890197)
chr2 (168-299)||(260850-260981)
chr2 (39-256)||(13936684-13936904)
chr2 (45-278)||(32049685-32049921)
chr2 (157-299)||(37375163-37375305)
chr2 (17-126)||(27392852-27392961)
chr2 (171-278)||(19416617-19416724)
chr2 (159-256)||(12716742-12716839)
chr2 (159-256)||(27777226-27777323)
chr2 (159-256)||(27803711-27803808)
chr2 (159-256)||(27816984-27817081)
chr2 (159-256)||(39051962-39052059)
[»] chr3 (62 HSPs)
chr3 (3-306)||(18530207-18530504)
chr3 (1-306)||(16626648-16626953)
chr3 (1-306)||(17993926-17994231)
chr3 (1-306)||(4625755-4626060)
chr3 (1-306)||(5652198-5652503)
chr3 (1-278)||(15892876-15893156)
chr3 (1-278)||(8301437-8301714)
chr3 (39-278)||(18051108-18051350)
chr3 (150-306)||(32292712-32292868)
chr3 (1-278)||(8295783-8296060)
chr3 (150-306)||(31034259-31034415)
chr3 (1-278)||(5713035-5713315)
chr3 (1-278)||(5723945-5724225)
chr3 (1-278)||(5757252-5757532)
chr3 (1-278)||(5768143-5768423)
chr3 (1-299)||(22387727-22388025)
chr3 (39-278)||(4796823-4797065)
chr3 (42-299)||(29148904-29149164)
chr3 (39-278)||(35880612-35880854)
chr3 (67-278)||(18330543-18330757)
chr3 (39-299)||(4721477-4721740)
chr3 (42-299)||(4346836-4347093)
chr3 (21-298)||(32438985-32439262)
chr3 (45-299)||(6192168-6192425)
chr3 (39-299)||(10395982-10396242)
chr3 (21-299)||(18277201-18277482)
chr3 (21-299)||(18292502-18292783)
chr3 (21-299)||(18307803-18308084)
chr3 (21-298)||(4893041-4893318)
chr3 (157-278)||(6542632-6542753)
chr3 (42-299)||(28021127-28021384)
chr3 (45-299)||(28116103-28116363)
chr3 (39-278)||(15741264-15741494)
chr3 (135-278)||(17985126-17985269)
chr3 (45-278)||(7996414-7996650)
chr3 (1-299)||(8211549-8211847)
chr3 (45-278)||(10642922-10643158)
chr3 (39-256)||(20065892-20066109)
chr3 (42-278)||(47023302-47023541)
chr3 (135-299)||(5609471-5609635)
chr3 (159-299)||(11110498-11110638)
chr3 (135-299)||(21674638-21674802)
chr3 (135-299)||(28339247-28339411)
chr3 (135-299)||(31964622-31964786)
chr3 (135-299)||(50134220-50134384)
chr3 (135-278)||(18225136-18225279)
chr3 (39-299)||(7073058-7073321)
chr3 (157-278)||(18242706-18242827)
chr3 (135-299)||(4416864-4417028)
chr3 (159-299)||(48465896-48466036)
chr3 (42-278)||(5466834-5467073)
chr3 (157-278)||(5596527-5596648)
chr3 (159-278)||(36997247-36997366)
chr3 (135-278)||(5013657-5013800)
chr3 (156-299)||(22871005-22871148)
chr3 (156-299)||(22886064-22886207)
chr3 (168-278)||(51782001-51782111)
chr3 (135-278)||(24328104-24328247)
chr3 (168-270)||(51797090-51797192)
chr3 (21-100)||(29665336-29665415)
chr3 (159-256)||(20577039-20577136)
chr3 (159-256)||(29665162-29665259)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (1-306)||(2759-3064)
[»] chr6 (47 HSPs)
chr6 (1-306)||(13522117-13522422)
chr6 (1-306)||(33374300-33374605)
chr6 (3-306)||(28162506-28162809)
chr6 (1-306)||(8892354-8892659)
chr6 (1-306)||(8903589-8903894)
chr6 (2-306)||(22477317-22477624)
chr6 (41-304)||(20160588-20160851)
chr6 (41-304)||(22171980-22172243)
chr6 (113-306)||(22456978-22457174)
chr6 (154-306)||(27290414-27290566)
chr6 (1-306)||(22934924-22935229)
chr6 (1-306)||(23857369-23857674)
chr6 (150-306)||(14143329-14143485)
chr6 (150-306)||(26787940-26788096)
chr6 (150-306)||(27196313-27196469)
chr6 (150-306)||(27252771-27252927)
chr6 (24-278)||(24304690-24304947)
chr6 (1-278)||(13299023-13299303)
chr6 (1-278)||(15424389-15424669)
chr6 (39-278)||(26988883-26989125)
chr6 (39-278)||(26999955-27000197)
chr6 (39-299)||(16749736-16749999)
chr6 (39-299)||(26918262-26918525)
chr6 (1-278)||(24863561-24863841)
chr6 (42-278)||(4525174-4525410)
chr6 (21-299)||(29549342-29549620)
chr6 (42-299)||(27044275-27044532)
chr6 (159-306)||(27272624-27272771)
chr6 (135-278)||(29572994-29573137)
chr6 (135-278)||(30558088-30558231)
chr6 (157-299)||(27007730-27007872)
chr6 (157-278)||(4773009-4773130)
chr6 (157-278)||(27485132-27485253)
chr6 (159-278)||(3696086-3696205)
chr6 (156-278)||(26777687-26777809)
chr6 (157-278)||(4757767-4757888)
chr6 (157-278)||(26116482-26116603)
chr6 (157-278)||(29501418-29501539)
chr6 (159-299)||(16674144-16674284)
chr6 (168-278)||(4545847-4545957)
chr6 (168-278)||(4724206-4724316)
chr6 (168-278)||(28207468-28207578)
chr6 (157-278)||(27360064-27360185)
chr6 (157-278)||(27450407-27450528)
chr6 (159-299)||(34463397-34463537)
chr6 (132-278)||(16944099-16944248)
chr6 (157-256)||(17025280-17025379)
[»] chr1 (9 HSPs)
chr1 (1-306)||(20340436-20340741)
chr1 (17-306)||(16208132-16208418)
chr1 (140-299)||(20461069-20461228)
chr1 (150-306)||(28151860-28152016)
chr1 (4-126)||(20460957-20461079)
chr1 (45-299)||(41793416-41793673)
chr1 (135-278)||(28584964-28585107)
chr1 (135-278)||(10962653-10962796)
chr1 (135-299)||(51638201-51638365)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (1-306)||(9354472-9354777)
chr8 (1-306)||(19659099-19659404)
chr8 (1-306)||(44562951-44563256)
chr8 (1-306)||(16283296-16283604)
chr8 (17-306)||(22080938-22081224)
chr8 (39-278)||(27608993-27609235)
chr8 (150-306)||(33244664-33244820)
chr8 (1-278)||(2137347-2137627)
chr8 (1-278)||(16277401-16277681)
chr8 (24-278)||(14557497-14557751)
chr8 (39-278)||(19687983-19688225)
chr8 (42-299)||(31354412-31354672)
chr8 (21-299)||(18710453-18710734)
chr8 (42-278)||(31489838-31490077)
chr8 (135-278)||(19208448-19208591)
chr8 (157-278)||(3329595-3329716)
chr8 (135-299)||(19674425-19674589)
chr8 (135-278)||(28362043-28362186)
chr8 (21-299)||(19286332-19286610)
chr8 (157-279)||(29829328-29829450)
chr8 (157-278)||(12092812-12092933)
chr8 (135-278)||(33258707-33258850)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-306)||(20259-20543)
scaffold0124 (1-278)||(30300-30579)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (123-306)||(129-312)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (17-306)||(21430-21716)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (3-278)||(29612-29890)
scaffold0089 (4-278)||(40198-40475)
scaffold0089 (39-278)||(47114-47356)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (1-278)||(27139-27419)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
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scaffold0415 (219-299)||(6080-6160)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (39-278)||(258-501)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (135-278)||(15059-15202)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (135-278)||(9195-9338)
scaffold0159 (135-278)||(19999-20142)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (127-299)||(9542-9714)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (135-278)||(7368-7511)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (135-271)||(26338-26474)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (168-278)||(7966-8076)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16041174 - 16041479
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
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T  16041174 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgtcatcgggtcaacctcaggtacccgttaattc 16041273  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16041274 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgccgagtta 16041373  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||     
T  16041374 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatt 16041473  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  16041474 tccatc 16041479  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16450290 - 16449985
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16450290 cgtcgtacccgtacgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattttatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccattaatgc 16450191  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  16450190 cgtcgttcagcaagtgcaacaacagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagtta 16450091  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||     
T  16450090 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatt 16449991  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  16449990 tccatc 16449985  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31088756 - 31088451
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31088756 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 31088657  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  31088656 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 31088557  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  31088556 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 31088457  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  31088456 tccatc 31088451  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 45733311 - 45733616
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45733311 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 45733410  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  45733411 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 45733510  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    |||   ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  45733511 ctcttaactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 45733610  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  45733611 tccatc 45733616  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16503675 - 16503395
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16503675 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16503576  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      | | ||| |  ||| |||||||||  || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  16503575 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 16503476  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16503475 ttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 16503395  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16518711 - 16518431
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16518711 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16518612  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      | | ||| |  ||| |||||||||  || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  16518611 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 16518512  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16518511 ttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 16518431  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 24 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 10917137 - 10916883
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||    
T  10917137 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 10917038  T
Q  124 agccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagg 223  Q
    ||   ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  |||||    
T  10917037 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagg 10916938  T
Q  224 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10916937 gcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 10916883  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2109148 - 2108992
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2109148 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagc 2109049  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2109048 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2108992  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 26484694 - 26484850
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  26484694 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagc 26484793  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26484794 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26484850  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39211166 - 39211010
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  39211166 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagc 39211067  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
     ||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  39211066 ttccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 39211010  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 5127878 - 5128141
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  5127878 tttccgccattttatcatcagtatcctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 5127977  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  5127978 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 5128077  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5128078 cagacagggtaagcccccacctaatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5128141  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 2775359 - 2775515
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2775359 caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagtagctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagc 2775458  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  2775459 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 2775515  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 11425033 - 11424791
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  11425033 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 11424934  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| ||||||||    
T  11424933 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgcacaac 11424834  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11424833 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 11424791  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 150 - 298
Target Start/End: Original strand, 18540799 - 18540947
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18540799 caacaagctagacctacttttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagc 18540898  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    |||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  18540899 ctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 18540947  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 2154459 - 2154701
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||  | | ||| |  ||  ||||||||   |  |||||||    
T  2154459 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtatccgttaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgctggttcaac 2154558  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  2154559 aacaacaacaaaatcagcaagctagacatactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 2154658  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2154659 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 2154701  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5147615 - 5147334
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || |  ||| |||    
T  5147615 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 5147516  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttct 217  Q
    |||||   ||  ||||||| |||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |     
T  5147515 aacagatgccgattcaacaacaacaacaaaatcaacaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 5147416  T
Q  218 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5147415 aagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5147334  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Original strand, 26435125 - 26435406
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || |  ||| |||    
T  26435125 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaac 26435224  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttct 217  Q
    |||||   ||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |     
T  26435225 aacagatgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactcca 26435324  T
Q  218 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  26435325 gagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26435406  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 5159390 - 5159667
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  5159390 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 5159489  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  5159490 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagag 5159589  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  5159590 aggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 5159667  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4145377 - 4145138
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || |  || |||||||| |    
T  4145377 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaac 4145278  T
Q  142 aacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    ||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  4145277 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 4145178  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4145177 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 4145138  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 45387235 - 45387471
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  45387235 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 45387334  T
Q  145 aacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    |||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  45387335 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagaca 45387434  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  45387435 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 45387471  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16736717 - 16736454
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  16736717 tttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 16736618  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  16736617 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 16736518  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16736517 tagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16736454  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 16751771 - 16751508
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  16751771 tttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 16751672  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  16751671 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 16751572  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16751571 tagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16751508  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 17523418 - 17523681
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  17523418 tttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 17523517  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  17523518 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 17523617  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  17523618 tagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17523681  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17529797 - 17529534
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  17529797 tttccgccattttatcatcaataccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 17529698  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  17529697 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 17529598  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  17529597 tagacagggcaagcccccacctgatccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 17529534  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 31124927 - 31125048
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  31124927 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 31125026  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  31125027 tgatccgttgcctccaaggttc 31125048  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 278
Target Start/End: Original strand, 3445315 - 3445434
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  3445315 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 3445414  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttc 3445434  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 9618636 - 9618779
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  9618636 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9618735  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9618736 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 9618779  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26275252 - 26275109
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  26275252 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26275153  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26275152 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 26275109  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26320027 - 26319884
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  26320027 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26319928  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26319927 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 26319884  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31564526 - 31564405
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  31564526 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 31564427  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  31564426 tgatccgttgcctccaaggttc 31564405  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26670072 - 26669929
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  26670072 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26669973  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||| || ||||||    
T  26669972 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcccccaaggttc 26669929  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Original strand, 11441590 - 11441700
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  11441590 tttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 11441689  T
Q  268 ctcccaggttc 278  Q
    |||| ||||||    
T  11441690 ctccaaggttc 11441700  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24592699 - 24592556
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  24592699 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 24592600  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24592599 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24592556  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26538004 - 26537885
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| ||  | || |||||||||||||| ||||||     
T  26538004 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtgcgactagacagggcaagccaccacctg 26537905  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  26537904 atccgttgcctccaaggttc 26537885  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 26485857 - 26485759
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacct 257  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  26485857 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacct 26485759  T

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Target: chr5 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 52)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 22888329 - 22888634
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22888329 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtaaccgttaatgc 22888428  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22888429 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagtta 22888528  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  22888529 ctcccgactctatttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 22888628  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  22888629 tccatc 22888634  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 25198888 - 25199193
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25198888 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtactcgttaacgc 25198987  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25198988 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttttctccgataccaatgttgtatgccgagtta 25199087  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
T  25199088 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatt 25199187  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  25199188 tccatc 25199193  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13184951 - 13184646
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13184951 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13184852  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13184851 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 13184752  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  13184751 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 13184652  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  13184651 tccatc 13184646  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 33877106 - 33877411
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877106 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33877205  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  33877206 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 33877305  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  33877306 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 33877405  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  33877406 tccatc 33877411  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13440797 - 13440492
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440797 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13440698  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||    
T  13440697 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctaaatta 13440598  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  13440597 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 13440498  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  13440497 tccatc 13440492  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 11325653 - 11325958
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  11325653 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccattgggacaacctcaggtacccgttaatgc 11325752  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  11325753 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 11325852  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||     
T  11325853 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatt 11325952  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  11325953 tccatc 11325958  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 23892062 - 23892370
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23892062 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaacattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23892161  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  23892162 catcgttcagcaaatgcaacaacagccaccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatcatgtatgccgag 23892261  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtg 297  Q
    || || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||    
T  23892262 ttgcttccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtg 23892361  T
Q  298 atgtccatc 306  Q
    || ||||||    
T  23892362 atttccatc 23892370  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 24969880 - 24970154
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24969880 cgtcgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 24969979  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
      | | ||| |  ||| |||||||||  || ||||||   ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  24969980 aattgctcaacagatgaaacaacagctgccggttcaa---caacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 24970076  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24970077 cttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24970154  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29889236 - 29889080
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29889236 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgctgagctactcccaactctacttctcagagggcactgcaccaccagacagggcaagc 29889137  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| ||||||    
T  29889136 ctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatc 29889080  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 24 - 278
Target Start/End: Original strand, 30934515 - 30934769
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||    
T  30934515 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 30934614  T
Q  124 agccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagg 223  Q
    ||   ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |  |||||    
T  30934615 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagg 30934714  T
Q  224 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
     || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30934715 acattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 30934769  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 11549248 - 11549490
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  11549248 tttccaccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 11549347  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  11549348 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaac 11549447  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11549448 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 11549490  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 23752718 - 23752455
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  23752718 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 23752619  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  23752618 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaac 23752519  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  23752518 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 23752455  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23718256 - 23718014
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  23718256 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 23718157  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  23718156 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaac 23718057  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23718056 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 23718014  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24688425 - 24688183
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |  | | ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  24688425 tttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatacaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 24688326  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  24688325 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatattgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaac 24688226  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24688225 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 24688183  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 33777381 - 33777644
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  33777381 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 33777480  T
Q  139 agcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  33777481 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 33777580  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  33777581 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 33777644  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22999382 - 22999119
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  22999382 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccgccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 22999283  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || || |||||    
T  22999282 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaac 22999183  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   || || ||||||||||||    
T  22999182 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgat 22999119  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 32599734 - 32599477
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| |||||   | ||||| || || |||||||||||||    
T  32599734 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcagcaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 32599635  T
Q  142 aacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    | || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||    
T  32599634 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagaca 32599535  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  32599534 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 32599477  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 9548811 - 9548548
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   ||  ||||||    
T  9548811 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccgattcaac 9548712  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  9548711 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 9548612  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  9548611 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 9548548  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 33292404 - 33292681
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  33292404 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 33292503  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  33292504 atcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagag 33292603  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  33292604 aggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 33292681  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 41674603 - 41674866
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| |||||| |||||| |||||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  41674603 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtccacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 41674702  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  41674703 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 41674802  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  41674803 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 41674866  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8665743 - 8665501
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  8665743 tttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 8665644  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  8665643 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaac 8665544  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8665543 tagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 8665501  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 2511044 - 2511187
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  2511044 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 2511143  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2511144 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 2511187  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15759026 - 15758883
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  15759026 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 15758927  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15758926 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 15758883  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18375581 - 18375438
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  18375581 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 18375482  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18375481 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 18375438  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37671630 - 37671488
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||    
T  37671630 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggcaagccaccacc 37671531  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37671530 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37671488  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 30168366 - 30168605
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| |    
T  30168366 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaac 30168465  T
Q  142 aacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    ||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || || || ||    
T  30168466 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactag 30168565  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30168566 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 30168605  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 6874298 - 6874462
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  6874298 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagctgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 6874397  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6874398 ctagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6874462  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 34616418 - 34616654
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | ||  |||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || || |||||||||||||    
T  34616418 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggctaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 34616517  T
Q  142 aacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    | || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||    
T  34616518 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagaca 34616617  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34616618 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 34616654  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 26480385 - 26480528
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  26480385 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 26480484  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26480485 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 26480528  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 33516349 - 33516492
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || ||||| |  ||||| || || ||||    
T  33516349 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 33516448  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33516449 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 33516492  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 54 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15659013 - 15658765
Alignment:
Q  54 catcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tc 150  Q
    |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||    
T  15659013 catcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatc 15658914  T
Q  151 aacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcc 250  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  15658913 agcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcc 15658814  T
Q  251 tccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  15658813 cccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 15658765  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Original strand, 28649250 - 28649392
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  28649250 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 28649349  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28649350 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28649392  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 3789556 - 3789677
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3789556 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3789655  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  3789656 tgatccgttgcctccaaggttc 3789677  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 5637903 - 5638046
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  5637903 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 5638002  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5638003 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5638046  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 9317444 - 9317587
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  9317444 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9317543  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9317544 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 9317587  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 12132148 - 12132291
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  12132148 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 12132247  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12132248 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 12132291  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 30152011 - 30152154
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  30152011 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 30152110  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30152111 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 30152154  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31826552 - 31826433
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  31826552 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 31826453  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttc 31826433  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28959934 - 28959812
Alignment:
Q  156 gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 255  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  28959934 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 28959835  T
Q  256 ctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  28959834 ctgatccgttgcctccaaggttc 28959812  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 37771134 - 37770992
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  37771134 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 37771035  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37771034 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37770992  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37358790 - 37358669
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  37358790 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 37358691  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  37358690 tgatccgttgcctccaaggttc 37358669  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18500877 - 18500735
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18500877 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18500778  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18500777 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18500735  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Original strand, 31431466 - 31431576
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  31431466 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 31431565  T
Q  268 ctcccaggttc 278  Q
    |||| ||||||    
T  31431566 ctccaaggttc 31431576  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13324976 - 13324835
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  13324976 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 13324877  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
      | || || ||||| |||||||  ||||| ||||| |||||    
T  13324876 ggaccctttacctccaaggttccgctctgatctcaaatgtga 13324835  T

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Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 37754995 - 37755116
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || || || || ||||| |||||||| |||||    
T  37754995 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggtcattgtacgactagacaaggcaagccaccacc 37755094  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  37755095 tgatccgttgcctccaaggttc 37755116  T

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Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Original strand, 43078269 - 43078409
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || || || |||||||| ||||| ||||||     
T  43078269 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacagggtaagcccccacctg 43078368  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  43078369 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 43078409  T

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Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 29967235 - 29967092
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  29967235 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 29967136  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29967135 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 29967092  T

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Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 30029408 - 30029551
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  30029408 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 30029507  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30029508 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 30029551  T

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Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 100
Target Start/End: Original strand, 31431325 - 31431383
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  31431325 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgc 31431383  T

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Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 24681457 - 24681554
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24681457 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 24681554  T

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Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 24723984 - 24724081
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  24723984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 24724081  T

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Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 40473694 - 40473597
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  40473694 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 40473597  T

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Target: chr4 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 1900122 - 1900427
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1900122 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 1900221  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  1900222 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacatcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctgtatgccgagtta 1900321  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||| || |||||| | |||||||||||||||||||     
T  1900322 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacatggtaagcctccacctgatccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatt 1900421  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  1900422 tccatc 1900427  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 15227735 - 15228040
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227735 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcaatatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 15227834  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  15227835 tgtcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagtta 15227934  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  15227935 ctcccgactctacttctcagagggcactgtacaaccagacagggtaagcctccacctgatccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 15228034  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  15228035 tccatc 15228040  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 24461011 - 24460706
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24461011 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 24460912  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  24460911 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 24460812  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  24460811 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 24460712  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  24460711 tccatc 24460706  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 5 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15285330 - 15285029
Alignment:
Q  5 gtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtc 104  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15285330 gtacccatatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgccatc 15285231  T
Q  105 gttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcc 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  ||| |||||||    
T  15285230 gttcagcaaatgcaacaacagccaccaactcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatttcgagttactcc 15285131  T
Q  205 cgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtcca 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  15285130 cgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttcca 15285031  T
Q  305 tc 306  Q
    ||    
T  15285030 tc 15285029  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 4 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14235931 - 14235626
Alignment:
Q  4 cgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 103  Q
    |||||| ||||  |||||||||||||| | | || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |    
T  14235931 cgtaccagtatatgcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcatcagtaccctctaccatcgggtcacccataggtacccgttaatgccat 14235832  T
Q  104 cgttcagcgaatgcaacaacagccaccagtt---caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
     | ||||| ||||||||||||||| || | |   ||||| || || |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |     
T  14235831 tgctcagcaaatgcaacaacagccgccggctcagcaacaacagcagcaacaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttgtatgccgagctg 14235732  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||     
T  14235731 ctcccgactctgcttcttaaagggcactgtacaaccagacagggcaagcctccacctaaccctttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatt 14235632  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  14235631 tccatc 14235626  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 15391725 - 15391439
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcg---ggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcga 113  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||||   |||||||||||||||||| | |||||| | | ||||| |    
T  15391725 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccatcaatgccattgctcagcaa 15391629  T
Q  114 atgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttac 213  Q
    ||||| |||||||| |  | |||||| || || |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||| |    
T  15391628 atgcagcaacagccgctggctcaacaacagcagc---aacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagttgctcccgactttgc 15391532  T
Q  214 ttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  15391531 ttctcaaagggcactgcacaaccaggcaggggaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 15391439  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 6 - 299
Target Start/End: Original strand, 17013867 - 17014163
Alignment:
Q  6 tacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcg 105  Q
    ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |    
T  17013867 tacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattg 17013966  T
Q  106 ttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattact 202  Q
     ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || ||    
T  17013967 ctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgct 17014066  T
Q  203 cccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||    
T  17014067 tccgactttactccaaagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 17014163  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24592682 - 24592443
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  24592682 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 24592583  T
Q  139 agcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    | ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||||||    
T  24592582 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccag 24592483  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24592482 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24592443  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 14664918 - 14665160
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  14664918 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 14665017  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || || |||||    
T  14665018 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagaggacattgtacaac 14665117  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14665118 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 14665160  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 6569753 - 6570016
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | |  || |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  6569753 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccagttcaac 6569852  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    |||||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || |||||    
T  6569853 agcaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaac 6569952  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6569953 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6570016  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 14763693 - 14763412
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  14763693 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 14763594  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttct 217  Q
    | || |  || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |     
T  14763593 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 14763494  T
Q  218 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  14763493 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 14763412  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 36344871 - 36344623
Alignment:
Q  51 tatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtc 150  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||| || || |||||||||||||| || |  |    
T  36344871 tatcatcagtatcctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagc 36344772  T
Q  151 aacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcc 250  Q
    || |  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  36344771 aatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcc 36344672  T
Q  251 tccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  36344671 cccacctgatccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 36344623  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 24112547 - 24112824
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  24112547 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 24112646  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  24112647 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagag 24112746  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  24112747 aggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 24112824  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 34189346 - 34189069
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  34189346 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 34189247  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  34189246 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagag 34189147  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  34189146 aggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 34189069  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 14098540 - 14098683
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  14098540 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 14098639  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  14098640 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 14098683  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27163682 - 27163446
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  27163682 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 27163583  T
Q  145 aacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    |||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  27163582 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagaca 27163483  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27163482 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27163446  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Original strand, 5005776 - 5006036
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  5005776 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 5005875  T
Q  145 aacgtcaa------caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    |||  |||      |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  5005876 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 5005975  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5005976 acaaggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5006036  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 18800863 - 18800742
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| |||||    
T  18800863 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 18800764  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  18800763 tgatccgttgcctccaaggttc 18800742  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 278
Target Start/End: Original strand, 30753777 - 30753896
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  30753777 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 30753876  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttc 30753896  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40105910 - 40105767
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||| | || || |||||||| |  |||||||| || || |    
T  40105910 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgaacttcttccaactttactccagagagggcattgtacga 40105811  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40105810 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 40105767  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Original strand, 54833272 - 54833550
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || || |||||| | | ||| |   | ||||    
T  54833272 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaac 54833371  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| |  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  54833372 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaag 54833471  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  54833472 agggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 54833550  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 33674046 - 33673906
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||      
T  33674046 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccgg 33673947  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  33673946 acccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 33673906  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31126790 - 31126647
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  31126790 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 31126691  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||    
T  31126690 ctagacagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttc 31126647  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 51 - 193
Target Start/End: Original strand, 21969613 - 21969758
Alignment:
Q  51 tatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg-- 148  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||       
T  21969613 tatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaa 21969712  T
Q  149 -tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgc 193  Q
     ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  21969713 atcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgc 21969758  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 39850661 - 39850758
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  39850661 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 39850758  T

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Target: chr2 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21703559 - 21703254
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703559 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 21703460  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21703459 cgtcgttcaacaaatgcaacaacagccaccagttcaacaacaacagcatcaacaagctagacctaccttccctccgataccaatgttgtatgctgagtta 21703360  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  21703359 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacaggacaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 21703260  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  21703259 tccatc 21703254  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 27118534 - 27118839
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27118534 cgtcgtacccgcatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 27118633  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27118634 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgaatta 27118733  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  27118734 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 27118833  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  27118834 tccatc 27118839  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34303698 - 34303393
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34303698 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgt 34303599  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34303598 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 34303499  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  34303498 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 34303399  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  34303398 tccatc 34303393  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19456816 - 19456511
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19456816 cgtcgtacccatatgcgcaatactttcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaggtgcccgttaatgc 19456717  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  19456716 catcgtttagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagtta 19456617  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  19456616 ctcccgactctacttctcatagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 19456517  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  19456516 tccatc 19456511  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 34156857 - 34157162
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34156857 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 34156956  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  34156957 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 34157056  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  34157057 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 34157156  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  34157157 tccatc 34157162  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 3784500 - 3784805
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3784500 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 3784599  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | |||    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  3784600 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagtagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 3784699  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  3784700 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 3784799  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  3784800 tccatc 3784805  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16163445 - 16163750
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16163445 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 16163544  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  16163545 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 16163644  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  16163645 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 16163744  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  16163745 tccatc 16163750  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31891723 - 31891446
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31891723 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgc 31891624  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  31891623 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 31891524  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31891523 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 31891446  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 27392964 - 27393120
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27392964 caacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgatgtatgccgagctgctcccgactttgcttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggcaagc 27393063  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  27393064 ctccacctaacccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatc 27393120  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27434842 - 27434534
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27434842 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 27434743  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  27434742 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 27434643  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtg 297  Q
    || || ||| ||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||    
T  27434642 ttgcttccggctttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtg 27434543  T
Q  298 atgtccatc 306  Q
    || ||||||    
T  27434542 atttccatc 27434534  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 23128964 - 23128684
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23128964 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 23128865  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  23128864 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 23128765  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  23128764 ttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 23128684  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 28882095 - 28882337
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  28882095 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 28882194  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  28882195 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 28882294  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28882295 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 28882337  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 12655385 - 12655665
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12655385 cgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 12655484  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  12655485 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 12655584  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  12655585 ttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 12655665  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 20837761 - 20838041
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20837761 cgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 20837860  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  20837861 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 20837960  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||    
T  20837961 ttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatctgttgcctcccaggttc 20838041  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 21677542 - 21677300
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  21677542 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 21677443  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  21677442 aacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaac 21677343  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
     ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  21677342 tagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttc 21677300  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11635543 - 11635283
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  11635543 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 11635444  T
Q  145 aacgtcaa------caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    |||  |||      |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  11635443 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 11635344  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11635343 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11635283  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 34279330 - 34279593
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  34279330 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 34279429  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  34279430 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 34279529  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34279530 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34279593  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 34286235 - 34286498
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  34286235 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 34286334  T
Q  139 agcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  34286335 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 34286434  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34286435 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34286498  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 34291295 - 34291558
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| || | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  34291295 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctccagtacccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaac 34291394  T
Q  139 agcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  34291395 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccaataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaac 34291494  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34291495 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34291558  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 159 - 306
Target Start/End: Original strand, 40233515 - 40233662
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  40233515 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 40233614  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 40233662  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11641732 - 11641472
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  11641732 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 11641633  T
Q  145 aacgtcaa------caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    |||  |||      |||||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  11641632 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacagatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 11641533  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11641532 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11641472  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22926289 - 22926125
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  22926289 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 22926190  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22926189 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22926125  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16829599 - 16829456
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || ||||| |  ||||| || || ||||    
T  16829599 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 16829500  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16829499 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 16829456  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 16891882 - 16892025
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || ||||| |  ||||| || || ||||    
T  16891882 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 16891981  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16891982 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 16892025  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 37925377 - 37925616
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| |    
T  37925377 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaac 37925476  T
Q  142 aacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    ||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  37925477 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 37925576  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||||||    
T  37925577 acagggtaagcccccacccgacccgttgcctccaaggttc 37925616  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 31876261 - 31876404
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  31876261 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 31876360  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31876361 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 31876404  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 34861660 - 34861803
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  34861660 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 34861759  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  34861760 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 34861803  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37686170 - 37686027
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  37686170 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 37686071  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37686070 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 37686027  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 37701435 - 37701292
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  37701435 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 37701336  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  37701335 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 37701292  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 278
Target Start/End: Original strand, 39890075 - 39890197
Alignment:
Q  156 gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 255  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || ||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  39890075 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 39890174  T
Q  256 ctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  39890175 ctgatccgttgcctccaaggttc 39890197  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 168 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 260981 - 260850
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||| ||| |||||    
T  260981 tttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctgatctgttgc 260882  T
Q  268 ctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  260881 ctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 260850  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13936904 - 13936684
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| |||||||||  || |||||||    
T  13936904 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagctgccggttcaac 13936805  T
Q  139 agcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | ||||| |   |||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| ||    
T  13936804 aacaacagcaaagtcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgac 13936705  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacc 256  Q
     || |||||||||||||||||    
T  13936704 taggcagggcaagcctccacc 13936684  T

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Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 32049685 - 32049921
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  32049685 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 32049784  T
Q  145 aacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    |||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  32049785 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagaca 32049884  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| || || |||||  | ||||||||||| ||||||    
T  32049885 gggtaaacccccaccggacccgttgcctccaaggttc 32049921  T

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Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Original strand, 37375163 - 37375305
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  37375163 ctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 37375262  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  37375263 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 37375305  T

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Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 17 - 126
Target Start/End: Original strand, 27392852 - 27392961
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 116  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||  |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||    
T  27392852 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccgccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatg 27392951  T
Q  117 caacaacagc 126  Q
    ||||||||||    
T  27392952 caacaacagc 27392961  T

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Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 171 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19416724 - 19416617
Alignment:
Q  171 cctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctc 270  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  19416724 cctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctc 19416625  T
Q  271 ccaggttc 278  Q
    | ||||||    
T  19416624 caaggttc 19416617  T

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Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12716839 - 12716742
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  12716839 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 12716742  T

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Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 27777226 - 27777323
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  27777226 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 27777323  T

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Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 27803711 - 27803808
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  27803711 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 27803808  T

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Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Original strand, 27816984 - 27817081
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  27816984 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 27817081  T

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Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39052059 - 39051962
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  39052059 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 39051962  T

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Target: chr3 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 62)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Original strand, 18530207 - 18530504
Alignment:
Q  3 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  18530207 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctcaagtgcccgttaatgccg 18530306  T
Q  103 tcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattact 202  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18530307 tcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacagcagcaac------aagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgctgagttact 18530400  T
Q  203 cccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtc 302  Q
    || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  18530401 cctgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttc 18530500  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16626953 - 16626648
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16626953 cgtcgtacccgtatgcacaatactctcagcatcccttctttccaccgttctatcatcagtatcctctaccatcgggtcaacctccggtacccgttaatgc 16626854  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||    
T  16626853 catcgttcagcaaatgcaacaacagccaccagctcaacaacaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgatatatgtcgagtta 16626754  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  16626753 ctccctactctacttcttagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 16626654  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  16626653 tccatc 16626648  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 17994231 - 17993926
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994231 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 17994132  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  17994131 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 17994032  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||     
T  17994031 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatt 17993932  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  17993931 tccatc 17993926  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 4625755 - 4626060
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4625755 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgt 4625854  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  4625855 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 4625954  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  4625955 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 4626054  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  4626055 tccatc 4626060  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 5652198 - 5652503
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5652198 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcgtttgcaatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 5652297  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  5652298 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 5652397  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  5652398 ctcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagccttcacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 5652497  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  5652498 tccatc 5652503  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15893156 - 15892876
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15893156 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgcccttctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 15893057  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||     
T  15893056 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccaatgttgtatgctgag 15892957  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  15892956 ttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatcctttgcctcccaggttc 15892876  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 8301714 - 8301437
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| | |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8301714 cgtcgtactcatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 8301615  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
      | | ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  8301614 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 8301515  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  8301514 cttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 8301437  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 18051108 - 18051350
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  18051108 tttccgccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 18051207  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  ||||| || || |||||    
T  18051208 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaac 18051307  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18051308 cagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctcccaggttc 18051350  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 32292712 - 32292868
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||     
T  32292712 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagt 32292811  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  32292812 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 32292868  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 8295783 - 8296060
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| || || ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8295783 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgtcaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgc 8295882  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||| ||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  8295883 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccaattcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 8295982  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || ||||||||||| | ||||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||||||    
T  8295983 cttccgactttactccacagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccctacctgatctgttgcctcccaggttc 8296060  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 31034415 - 31034259
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  31034415 caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagc 31034316  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  31034315 ctccacctgatccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 31034259  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 5713035 - 5713315
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5713035 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5713134  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      |||  || |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  5713135 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5713234  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5713235 ttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5713315  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 5723945 - 5724225
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5723945 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5724044  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      |||  || |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  5724045 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5724144  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5724145 ttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5724225  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5757532 - 5757252
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5757532 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5757433  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      |||  || |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  5757432 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5757333  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5757332 ttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5757252  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5768423 - 5768143
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  5768423 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 5768324  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      |||  || |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||| ||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  5768323 aatcgcccaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagccagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 5768224  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5768223 ttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5768143  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22388025 - 22387727
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| ||||| | ||||||||||| | | || || ||| | || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||    
T  22388025 cgtcctacccttatgcaccatactctcagcatccgttcttcccatcgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgc 22387926  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    | ||| ||| |   ||||||| || || |||||||||||||| || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||     
T  22387925 catcgctcaacaggtgcaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcaacaatatgctagaccgacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagttg 22387826  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    || || |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22387825 cttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22387727  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4797065 - 4796823
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  4797065 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 4796966  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  4796965 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 4796866  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4796865 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 4796823  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 29149164 - 29148904
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |    
T  29149164 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaac 29149065  T
Q  142 aacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    ||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  29149064 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaactag 29148965  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  29148964 acagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29148904  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 35880612 - 35880854
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  35880612 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 35880711  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  35880712 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 35880811  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  35880812 caaacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttc 35880854  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 67 - 278
Target Start/End: Original strand, 18330543 - 18330757
Alignment:
Q  67 tgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacc 163  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||    
T  18330543 tgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacc 18330642  T
Q  164 tacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccg 263  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| ||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  18330643 tactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgaccttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccg 18330742  T
Q  264 ttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||||| ||||||    
T  18330743 ttgcctccaaggttc 18330757  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 4721477 - 4721740
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| |  ||  ||||||||   ||||||||||    
T  4721477 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagataaaacaacagttgccagttcaac 4721576  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  4721577 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 4721676  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  4721677 cagacagggcaagcccccacctgatccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 4721740  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 4347093 - 4346836
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || || |||||||||||||    
T  4347093 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 4346994  T
Q  142 aacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    | || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||    
T  4346993 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagaca 4346894  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  4346893 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4346836  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 32438985 - 32439262
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  32438985 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 32439084  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||    
T  32439085 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagag 32439184  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    ||| |||||||| || || |||||||||||||||||  | || || ||||| |||||||  ||||| || ||||||||    
T  32439185 aggacactgcacgactaggcagggcaagcctccaccggaccctttacctccaaggttccgctctgatcttaagtgtga 32439262  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Original strand, 6192168 - 6192425
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| |||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| ||||    
T  6192168 ccattttatcattagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaac 6192267  T
Q  145 aacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    |||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||||||||    
T  6192268 aacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagaca 6192367  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||   || |||||||| ||||||    
T  6192368 gggcaagcccccacctgatctgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgat 6192425  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 10395982 - 10396242
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   |   |||||||   ||||||||||    
T  10395982 tttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggt---acaacagttgccagttcaac 10396078  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  10396079 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacaac 10396178  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  10396179 tagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 10396242  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18277482 - 18277201
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  18277482 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18277383  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttct 217  Q
    | || |  || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |     
T  18277382 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 18277283  T
Q  218 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18277282 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18277201  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18292783 - 18292502
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  18292783 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18292684  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttct 217  Q
    | || |  || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |     
T  18292683 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 18292584  T
Q  218 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18292583 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18292502  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 18308084 - 18307803
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  18308084 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 18307985  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttct 217  Q
    | || |  || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |     
T  18307984 atcaactgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactcca 18307885  T
Q  218 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  18307884 aagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatcagttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 18307803  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 298
Target Start/End: Original strand, 4893041 - 4893318
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  4893041 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggtccctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 4893140  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  4893141 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagag 4893240  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    ||| |||||||| || || |||||||| ||||||||  | || || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||    
T  4893241 aggacactgcacgactaggcagggcaaacctccaccggaccctttacctccaaggttccactctgatcttaagtgtga 4893318  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 6542753 - 6542632
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  6542753 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacaactagacagggcaagccaccacc 6542654  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  6542653 tgatccgttgcctccaaggttc 6542632  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 28021127 - 28021384
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || || |||||||||||||    
T  28021127 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 28021226  T
Q  142 aacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    | || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  28021227 agcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactatactccagagagggcattgtacaactagaca 28021326  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||| |||||| |||| || ||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28021327 gggcaagccaccacctgatccattacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28021384  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 28116363 - 28116103
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  28116363 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 28116264  T
Q  145 aacgtcaa------caagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    |||  |||      |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  28116263 aacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgaattgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 28116164  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28116163 acagggcaagcccccacttgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28116103  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15741494 - 15741264
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |            ||||||   ||||||||||    
T  15741494 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgct------------caacagttgccagttcaac 15741407  T
Q  139 agcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  15741406 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 15741307  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||    
T  15741306 cagacagggcaagcccccacctgattcgttgcctccaaggttc 15741264  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17985269 - 17985126
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  17985269 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 17985170  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17985169 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 17985126  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 7996414 - 7996650
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  7996414 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 7996513  T
Q  145 aacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    |||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  7996514 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagaca 7996613  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  7996614 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 7996650  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 299
Target Start/End: Original strand, 8211549 - 8211847
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||    
T  8211549 cgtcatacccatatgcgccgtactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgc 8211648  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    | ||| ||| |   | ||||| || || |||||||||||||| || |  ||| |  ||||||  || |||||||| ||||||||||||||||| ||| |     
T  8211649 catcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagactaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaactt 8211748  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    || || ||| |||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  8211749 cttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 8211847  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 45 - 278
Target Start/End: Original strand, 10642922 - 10643158
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  10642922 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 10643021  T
Q  145 aacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    |||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  10643022 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagaca 10643121  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10643122 gggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 10643158  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 20065892 - 20066109
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || || ||||||||||    
T  20065892 tttccgccattttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaac 20065991  T
Q  139 agcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    |||| || |  ||| |  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || ||    
T  20065992 agcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactag 20066091  T
Q  239 acagggcaagcctccacc 256  Q
     |||||||||||||||||    
T  20066092 gcagggcaagcctccacc 20066109  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 47023302 - 47023541
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  | |  || |  ||| ||||||||   || |||||||| |    
T  47023302 ccaccgttttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaggtgcccgtcaatgcaattgcccaacagatgaaacaacagatgccggttcaacaac 47023401  T
Q  142 aacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    ||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  47023402 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 47023501  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47023502 acagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 47023541  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 5609635 - 5609471
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  5609635 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 5609536  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  5609535 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 5609471  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 11110638 - 11110498
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||     
T  11110638 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcctccacctg 11110539  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 11110498  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 21674638 - 21674802
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  21674638 caacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccaaagagggcattgtacga 21674737  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  21674738 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 21674802  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 28339247 - 28339411
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  28339247 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28339346  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  28339347 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 28339411  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 31964786 - 31964622
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  31964786 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 31964687  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  31964686 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31964622  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 50134384 - 50134220
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  50134384 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 50134285  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  50134284 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 50134220  T

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Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 18225136 - 18225279
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  18225136 caacaacaacaaaatcaacaagctaggcctaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 18225235  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  18225236 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 18225279  T

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Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 7073058 - 7073321
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| || |||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  7073058 tttccgccattttaccatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 7073157  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || || ||    
T  7073158 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccaaagagggcattgtacgac 7073257  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     ||||| || ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  7073258 tagacaaggtaagcccccgcctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 7073321  T

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Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 18242706 - 18242827
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  18242706 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 18242805  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  18242806 tgatccgttgcctccaaggttc 18242827  T

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Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 4416864 - 4417028
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  4416864 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 4416963  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  4416964 ctagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 4417028  T

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Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Original strand, 48465896 - 48466036
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  48465896 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccaaagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 48465995  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 48466036  T

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Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 5466834 - 5467073
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||  || || |||||||||||||    
T  5466834 ccaccattttatcatcagtaccctttgccacccggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacgtcaaccgccagttcaacagc 5466933  T
Q  142 aacaacgtcaacaa---gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    | || |  || |||   | |||||| || |||||||  ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  5466934 agcagcagcagcaatatgatagaccaacttttcctcttatacctatgttgtatgcagaactccttccaactctactccagagagggcattgtacaactag 5467033  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5467034 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 5467073  T

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Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 5596648 - 5596527
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  5596648 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 5596549  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  5596548 tgatccgttgcctccaaggttc 5596527  T

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Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 36997366 - 36997247
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||     
T  36997366 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctg 36997267  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttc 36997247  T

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Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 5013657 - 5013800
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || || |||||||| |||||||||||||| || ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  5013657 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcggaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 5013756  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5013757 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 5013800  T

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Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22871148 - 22871005
Alignment:
Q  156 gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 255  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22871148 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22871049  T
Q  256 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22871048 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22871005  T

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Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 156 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 22886207 - 22886064
Alignment:
Q  156 gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 255  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || || || || ||||| ||||| ||||    
T  22886207 gctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacgactaggcagggtaagcccccac 22886108  T
Q  256 ctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    || ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  22886107 ctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 22886064  T

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Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Original strand, 51782001 - 51782111
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||| | || |  ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51782001 tttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 51782100  T
Q  268 ctcccaggttc 278  Q
    |||| ||||||    
T  51782101 ctccaaggttc 51782111  T

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Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 24328104 - 24328247
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  24328104 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 24328203  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24328204 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24328247  T

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Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 168 - 270
Target Start/End: Original strand, 51797090 - 51797192
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| |||||||||||||| || ||| | || |  ||| |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  51797090 tttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttctaactctactccagagagggcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgc 51797189  T
Q  268 ctc 270  Q
    |||    
T  51797190 ctc 51797192  T

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Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 21 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 29665415 - 29665336
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||    
T  29665415 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgc 29665336  T

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Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20577136 - 20577039
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20577136 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 20577039  T

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Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 29665259 - 29665162
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  29665259 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 29665162  T

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Target: scaffold0260 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 3064 - 2759
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3064 cgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 2965  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  2964 cgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagcta 2865  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  2864 ctcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 2765  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  2764 tccatc 2759  T

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Target: chr6 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 47)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13522422 - 13522117
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522422 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 13522323  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  13522322 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 13522223  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  13522222 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 13522123  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  13522122 tccatc 13522117  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 33374605 - 33374300
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374605 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 33374506  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  33374505 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 33374406  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  33374405 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 33374306  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  33374305 tccatc 33374300  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 306
Target Start/End: Original strand, 28162506 - 28162809
Alignment:
Q  3 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccg 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28162506 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgccg 28162605  T
Q  103 tcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattact 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28162606 tcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaattact 28162705  T
Q  203 cccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtc 302  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||    
T  28162706 cccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacttgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttc 28162805  T
Q  303 catc 306  Q
    ||||    
T  28162806 catc 28162809  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8892659 - 8892354
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8892659 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattatatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8892560  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  8892559 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 8892460  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  8892459 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 8892360  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  8892359 tccatc 8892354  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8903894 - 8903589
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8903894 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatctcttctttccaccattctatcatcagtattctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 8903795  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  8903794 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 8903695  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  8903694 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 8903595  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  8903594 tccatc 8903589  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 2 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22477624 - 22477317
Alignment:
Q  2 gtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgcc 101  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22477624 gtcgtacccgtatgcgcagtactctcagcatcccttctttccaccattctatcattagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgca 22477525  T
Q  102 gtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac---aacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaat 198  Q
     | | ||| | ||||||||||||| |||| |||||||| ||||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |    
T  22477524 attgctcaacaaatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagt 22477425  T
Q  199 tactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtga 298  Q
    ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  22477424 tactcccgactctacttctcatatggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtga 22477325  T
Q  299 tgtccatc 306  Q
    | ||||||    
T  22477324 tttccatc 22477317  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Original strand, 20160588 - 20160851
Alignment:
Q  41 tccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacag 140  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  || ||||||||||||| ||||||     
T  20160588 tccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaa 20160687  T
Q  141 caacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagac 240  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  20160688 caacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggc 20160787  T
Q  241 agggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtcca 304  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  20160788 aaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 20160851  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 41 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 22172243 - 22171980
Alignment:
Q  41 tccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacag 140  Q
    ||||||||| || |||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||  || ||||||||||||| ||||||     
T  22172243 tccaccattttaccatcagtatcctctaccaccgggtcaacctcaggtacccgttaatgccattgctcagcaaaaacagcaacagccaccagctcaacaa 22172144  T
Q  141 caacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagac 240  Q
    |||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  22172143 caacaacagcaacaaactagacctacctttcctccgataccgatgttatatgctgagttactcccaactttacttcacagagggcattgcacaaccaggc 22172044  T
Q  241 agggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtcca 304  Q
    | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| || |||||||||||| ||||    
T  22172043 aaggcaagcctccacctgatccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttcca 22171980  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22457174 - 22456978
Alignment:
Q  113 aatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac---aacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgact 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||||   |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22457174 aatgcaacaacagtcaccggttcaacaacaacgacaacagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgatgtatgccgagttactcccgact 22457075  T
Q  210 ttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  22457074 ctacttctcataaggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatc 22456978  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27290566 - 27290414
Alignment:
Q  154 aagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctcc 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27290566 aagctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctcc 27290467  T
Q  254 acctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27290466 acctgatccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 27290414  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22935229 - 22934924
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  22935229 cgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 22935130  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
      | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||     
T  22935129 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttg 22935030  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    || ||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||     
T  22935029 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatt 22934930  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  22934929 tccatc 22934924  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23857674 - 23857369
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||| | | |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  23857674 cgtcatacccatatgcgccgtattctcaacatcccttctttccgccattctatcatcagtatcccttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 23857575  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
      | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||     
T  23857574 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttg 23857475  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    || ||||||||||| |  ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||     
T  23857474 cttccgactttactccatagaggacattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatt 23857375  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  23857374 tccatc 23857369  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 14143485 - 14143329
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  14143485 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagc 14143386  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  14143385 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 14143329  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 26787940 - 26788096
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  26787940 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagc 26788039  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  26788040 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 26788096  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 27196313 - 27196469
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  27196313 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagc 27196412  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27196413 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27196469  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27252927 - 27252771
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  27252927 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcgcaatcagacaggggaagc 27252828  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  27252827 ctccacctgatccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 27252771  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 24304947 - 24304690
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||    
T  24304947 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 24304848  T
Q  124 agccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    ||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||    
T  24304847 agtttccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatag 24304748  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24304747 agggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24304690  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 13299303 - 13299023
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13299303 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 13299204  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  13299203 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 13299104  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  13299103 ttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 13299023  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15424669 - 15424389
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15424669 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 15424570  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagtt---caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||   ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  15424569 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttgaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 15424470  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || ||||||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15424469 ttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 15424389  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 26988883 - 26989125
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagtt---c 135  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||   |    
T  26988883 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 26988982  T
Q  136 aacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    |||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||||||| |  ||||| || || |||||    
T  26988983 aacatcaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaac 26989082  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  26989083 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 26989125  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 26999955 - 27000197
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  26999955 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 27000054  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  27000055 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 27000154  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27000155 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27000197  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 16749736 - 16749999
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  16749736 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 16749835  T
Q  139 agcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || |||||    
T  16749836 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaac 16749935  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16749936 tagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16749999  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 39 - 299
Target Start/End: Original strand, 26918262 - 26918525
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| |||||  | | ||| |  | | ||||||||   || |||||||    
T  26918262 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgtcaatgcaattgctcaacagacgaaacaacagttgccggttcaac 26918361  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  26918362 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaac 26918461  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  26918462 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 26918525  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 24863561 - 24863841
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||| || ||||||||||||||    
T  24863561 cgtcctacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctctaccaccgagtcaaccccaagtacccgttaatgc 24863660  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  24863661 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 24863760  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  24863761 ttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 24863841  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Original strand, 4525174 - 4525410
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || || |||||||||||||    
T  4525174 ccaccgttttatcatcagtatcctttgccaccaggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 4525273  T
Q  142 aacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    | || |  ||  |  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || |||||||| |||||    
T  4525274 agcagcagcagtatactagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgcacaactagaca 4525373  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  4525374 gggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 4525410  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Original strand, 29549342 - 29549620
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   ||||||    
T  29549342 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtgcaac 29549441  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || ||||||||||| || || |  ||| | |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  ||    
T  29549442 atcaaccgccagttcaacaacagcagcagcaatacgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagag 29549541  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  29549542 agggcattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 29549620  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 27044275 - 27044532
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || || |||||||||||||    
T  27044275 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaaccgccagttcaacagc 27044374  T
Q  142 aacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    | || |  ||| |  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  27044375 agcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaagagggcattgtacaactagaca 27044474  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  27044475 gggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27044532  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 159 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 27272771 - 27272624
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || |||||| |||| |  |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||     
T  27272771 agacctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccgactctactccagagagggcattgtacaaccagacagggtaagcccccacctg 27272672  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||| |||||||||||||   || |||||||| |||||| ||||||    
T  27272671 atccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatc 27272624  T

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Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 29572994 - 29573137
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| |    
T  29572994 caacaacaacaaaatcagcaagctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacga 29573093  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | || ||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29573094 ctaggcagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 29573137  T

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Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 30558231 - 30558088
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || || ||||| |  ||||| || || ||||    
T  30558231 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaa 30558132  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30558131 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 30558088  T

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Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 157 - 299
Target Start/End: Original strand, 27007730 - 27007872
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  27007730 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 27007829  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  27007830 tgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 27007872  T

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Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 4773009 - 4773130
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  4773009 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 4773108  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  4773109 tgatccgttgcctccaaggttc 4773130  T

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Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 27485132 - 27485253
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  27485132 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggcaagccaccacc 27485231  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  27485232 tgatccgttgcctccaaggttc 27485253  T

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Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 159 - 278
Target Start/End: Original strand, 3696086 - 3696205
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||     
T  3696086 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctg 3696185  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttc 3696205  T

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Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 156 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26777809 - 26777687
Alignment:
Q  156 gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccac 255  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26777809 gctagaccaaccttccctcctataccgatgttgtatgccgaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccac 26777710  T
Q  256 ctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || ||||||||||||| ||||||    
T  26777709 ctgatccgttgcctccaaggttc 26777687  T

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Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 4757767 - 4757888
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  4757767 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 4757866  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  4757867 tgatccgttgcctccaaggttc 4757888  T

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Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 26116603 - 26116482
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| |  ||||| || || || || |||||||||||||| |||||    
T  26116603 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccgactttactccagagaggtcattgtacgactagacagggcaagccaccacc 26116504  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  26116503 tgatccgttgcctccaaggttc 26116482  T

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Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Original strand, 29501418 - 29501539
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||    
T  29501418 ctagaccaaccttccctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacc 29501517  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  29501518 tgatccgttgcctccaaggttc 29501539  T

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Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Original strand, 16674144 - 16674284
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||     
T  16674144 agaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacctg 16674243  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 16674284  T

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Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4545957 - 4545847
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  4545957 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgc 4545858  T
Q  268 ctcccaggttc 278  Q
    |||| ||||||    
T  4545857 ctccaaggttc 4545847  T

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Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 4724316 - 4724206
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  4724316 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 4724217  T
Q  268 ctcccaggttc 278  Q
    |||| ||||||    
T  4724216 ctccaaggttc 4724206  T

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Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Original strand, 28207468 - 28207578
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || || || ||| |||| |  |||||||| || || || ||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  28207468 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 28207567  T
Q  268 ctcccaggttc 278  Q
    |||| ||||||    
T  28207568 ctccaaggttc 28207578  T

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Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27360185 - 27360064
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27360185 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27360086  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  27360085 tgatccgttgcctccaaggttc 27360064  T

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Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27450528 - 27450407
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27450528 ctagaccaacttttcctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 27450429  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  27450428 tgatccgttgcctccaaggttc 27450407  T

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Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 34463537 - 34463397
Alignment:
Q  159 agacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccaccta 258  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||||     
T  34463537 agaccaacttttcctcctataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacaaggaaagcccccacctg 34463438  T
Q  259 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 34463397  T

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Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 16944248 - 16944099
Alignment:
Q  132 gttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcact 228  Q
    ||||||||||||||||    ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || |    
T  16944248 gttcaacagcaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcatt 16944149  T
Q  229 gcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||| |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  16944148 gtacaactagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 16944099  T

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Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 157 - 256
Target Start/End: Original strand, 17025280 - 17025379
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||    
T  17025280 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggacactgcacgactaggcagggcaagcctccacc 17025379  T

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Target: chr1 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 9)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 20340741 - 20340436
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20340741 cgtcgtacccgtacgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgtcaatgc 20340642  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||    
T  20340641 cgtcgttcaacaaatgcaacaacagcctccagctcaacaacaacagcatcagcaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagcta 20340542  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||     
T  20340541 ctcccaactctacttctcagagggcactacacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 20340442  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  20340441 tccatc 20340436  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16208418 - 16208132
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 116  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  16208418 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccatcgggtcagcctcaggtacccattaatgccatcgttcagcaaatg 16208319  T
Q  117 caacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttc 216  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||    
T  16208318 caacaacagccaccagttcaacaacaaca---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtataccgagttactcccgactctacttc 16208222  T
Q  217 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16208221 tcagagggcactgcacaaccagacagggaaaacctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 16208132  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 140 - 299
Target Start/End: Original strand, 20461069 - 20461228
Alignment:
Q  140 gcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccaga 239  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461069 gcaacaacagcaacaagctagacctacctttcctccgatactaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccaga 20461168  T
Q  240 cagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20461169 cagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgat 20461228  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 28151860 - 28152016
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28151860 caacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttgctcccgactctacttctcagagggcactgcacaatcagacaggggaagc 28151959  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| ||| ||| ||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||    
T  28151960 ctccacctgatctgttacctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatc 28152016  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 126
Target Start/End: Original strand, 20460957 - 20461079
Alignment:
Q  4 cgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20460957 cgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcaatatcctctaccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccat 20461056  T
Q  104 cgttcagcgaatgcaacaacagc 126  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  20461057 cgttcagcaaatgcaacaacagc 20461079  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 41793673 - 41793416
Alignment:
Q  45 ccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaac 144  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | | ||  |  ||| ||||||||   || |||||||| ||||    
T  41793673 ccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcaattgctccacagatgaaacaacagatgccggttcaacaacaac 41793574  T
Q  145 aacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagaca 241  Q
    |||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||    
T  41793573 aacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactagaca 41793474  T
Q  242 gggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  41793473 gggcaagcctccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 41793416  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 28584964 - 28585107
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  28584964 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28585063  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28585064 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 28585107  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 10962653 - 10962796
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || ||||| || |  |||||||| || ||||    
T  10962653 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttgctccagagagggcattgtacaa 10962752  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  10962753 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 10962796  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 51638201 - 51638365
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  |||||||| || || |    
T  51638201 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttcccttcgataccaatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggcattgtacga 51638300  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  51638301 ctaggcagggtaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 51638365  T

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Target: chr8 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 9354472 - 9354777
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9354472 cgtcgtacacgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 9354571  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  9354572 cgtcgtccagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 9354671  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  9354672 ctcccgactctactcctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 9354771  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  9354772 tccatc 9354777  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19659404 - 19659099
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19659404 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcccttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 19659305  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| | ||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  19659304 cgtcgtccagcgaatgcaacaacaacctccagctcaacaacgacagcagcaacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgctgaatta 19659205  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  19659204 ctcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagcctccacctgacccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 19659105  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  19659104 tccatc 19659099  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 44562951 - 44563256
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44562951 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagcatcctttctttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggacaacctcaggtacccgttaatgc 44563050  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| || ||     
T  44563051 cgccgttcagcgaatgcaacaacagcctccagctcaacaacgacagcagcaacaagctagacctacctttcctctgataccaatgctatatgctgagttg 44563150  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||     
T  44563151 ctcccgactctacttctcaaagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccatcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatt 44563250  T
Q  301 tccatc 306  Q
    ||||||    
T  44563251 tccatc 44563256  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 16283296 - 16283604
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||| | | || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||    
T  16283296 cgtcgtacccatatgcgccgtactctcagcatcctttctttccgccattctatcattagtatcctttgccaccaggtcaacctcaggtacccattaatgc 16283395  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  16283396 aattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctaccttccctccgataccgatgttgtatgctgag 16283495  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtg 297  Q
    || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||    
T  16283496 ttgcttccgactttactccttagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtg 16283595  T
Q  298 atgtccatc 306  Q
    || ||||||    
T  16283596 atttccatc 16283604  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 22081224 - 22080938
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcg---ggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcga 113  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||| ||||| ||||||||   |||||||   |||||||||||||||||||| |||||| | | ||||| |    
T  22081224 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattttatcaccagtatcc---gccatcgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaa 22081128  T
Q  114 atgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttac 213  Q
    ||||| ||||||||    | ||||||||| || |   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  | ||||||||||| |    
T  22081127 atgcagcaacagccgttggctcaacagcagcagc---aacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctgtacgccgagctgctcccgactttgc 22081031  T
Q  214 ttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  22081030 ttctcaaagggcactgcacaaccaggcagggaaagcctccacctaacccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 22080938  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 27609235 - 27608993
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  27609235 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 27609136  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  27609135 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaac 27609036  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27609035 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27608993  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 306
Target Start/End: Original strand, 33244664 - 33244820
Alignment:
Q  150 caacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagc 249  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33244664 caacaggctagacctacctttcctctgataccaatgttatatgttgaattactcccgactctacttctcaaagggcgctgcacaaccagacagggcaagc 33244763  T
Q  250 ctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| | |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  33244764 ctccacctgacccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatc 33244820  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 2137627 - 2137347
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || |||||  |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2137627 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgtcattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 2137528  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  2137527 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgag 2137428  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2137427 ttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 2137347  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 16277401 - 16277681
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16277401 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 16277500  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  16277501 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 16277600  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || || |||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16277601 ttgcttccaactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctcccaggttc 16277681  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 24 - 278
Target Start/End: Original strand, 14557497 - 14557751
Alignment:
Q  24 tctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaac 123  Q
    ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||    
T  14557497 tctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacctgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaac 14557596  T
Q  124 agccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagg 223  Q
    ||   ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||    
T  14557597 agttgccagttcaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccaatgttatatgctgagttgcttccaactttactccatagagg 14557696  T
Q  224 gcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||    
T  14557697 gcattgtacaaccagacagggcaagccctcgcctgatccgttgcctccaaggttc 14557751  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Original strand, 19687983 - 19688225
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |  ||| ||||||||    | |||||||    
T  19687983 tttccgccattctatcaccagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgtcggttcaac 19688082  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||    
T  19688083 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaac 19688182  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19688183 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 19688225  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 42 - 299
Target Start/End: Original strand, 31354412 - 31354672
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| || || |||||| ||| ||| |   | ||||| || |  || |||||||| |    
T  31354412 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccatcgctcaacaggtacaacatcaactgccggttcaacaac 31354511  T
Q  142 aacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    ||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  31354512 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgccgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 31354611  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  31354612 acagggcaagcctccacctgatcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 31354672  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Original strand, 18710453 - 18710734
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||| |  ||| |||    
T  18710453 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggccaacctcaggttcccgtcaatgcagttgctcaacagatgaaac 18710552  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaa---gctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttct 217  Q
    |||||   || |||||||| || || |  || |||   |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |     
T  18710553 aacagttgccggttcaacaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactcca 18710652  T
Q  218 cagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     |||||||| || ||||| |||||||| |||||  ||||| ||||| ||||||| ||||||   ||||| ||||||||||||    
T  18710653 aagagggcattgtacaactagacagggtaagccctcacctgatccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgat 18710734  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 42 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 31490077 - 31489838
Alignment:
Q  42 ccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagc 141  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||  | |  || |  ||| |||| |||   || |||||||| |    
T  31490077 ccaccgttttatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtgcccgtcaatgcgattgcccaacagatgaaacagcagatgccggttcaacaac 31489978  T
Q  142 aacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccag 238  Q
    ||||||    ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||| ||    
T  31489977 aacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaactag 31489878  T
Q  239 acagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31489877 acagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 31489838  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19208591 - 19208448
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  19208591 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 19208492  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  19208491 ctagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 19208448  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3329716 - 3329595
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  3329716 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactttactccagagaggacactgcacgactagacagggtaagcccccacc 3329617  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  3329616 tgatccgttgcctccaaggttc 3329595  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Original strand, 19674425 - 19674589
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  19674425 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 19674524  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    | ||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  19674525 ctagacagggcaaacccccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19674589  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 28362186 - 28362043
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  28362186 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 28362087  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28362086 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 28362043  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 21 - 299
Target Start/End: Original strand, 19286332 - 19286610
Alignment:
Q  21 tactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaac 120  Q
    |||||||||| | | || || ||||| || ||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||| || || |||||| | | ||| |   | ||||    
T  19286332 tactctcagcatccgttcttcccaccgttttatcatcagtaccctttaccaccgggccaacctcaggttcctgtcaatgccattgctcaacaggtacaac 19286431  T
Q  121 aacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcag 220  Q
    | || || |||||||||||||| || |  ||| |  ||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||  | || || |||||||| |  ||    
T  19286432 atcaaccgccagttcaacagcagcagcagcaatatactagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagagcttcttccaactttactccaaag 19286531  T
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||| || ||||| || ||||||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  19286532 agggcattgtacaactaggcagggcaagcccccacctgacccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 19286610  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 157 - 279
Target Start/End: Original strand, 29829328 - 29829450
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||| | || || |||||||| |  |||||||| || || ||||||||||| ||||| |||||    
T  29829328 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtacgcagaacttcttccaactttactccagagagggcattgtaccaccagacagggtaagcccccacc 29829427  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttcc 279  Q
    | ||||||||||||| |||||||    
T  29829428 tgatccgttgcctccaaggttcc 29829450  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 157 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 12092933 - 12092812
Alignment:
Q  157 ctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacc 256  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |||||    
T  12092933 ctagaccaacttttcctcctataccaatgttgtatgcggaacttcttccaactctactccagagaggacattgtacaactagacagggtaagcccccacc 12092834  T
Q  257 taatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | ||||||||||||| ||||||    
T  12092833 tgatccgttgcctccaaggttc 12092812  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 33258707 - 33258850
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| | || || ||| |||| |  ||||| || || ||||    
T  33258707 caacaacaacaaaatcagcaagccaggccaaccttccctcctataccgatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagaggtcattgtacaa 33258806  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  33258807 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 33258850  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 306
Target Start/End: Original strand, 20259 - 20543
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20259 cgtcgtacccatatgcgccatactctcagcatcccttctttccatcattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 20358  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||            ||||||         ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  20359 cgtcgttcagcaaatgcaacaacagc------------agcaac---------aagctagacctacctttcccccgataccaatgttgtatgctgagtta 20437  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatg 300  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20438 ctcccgactctacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatt 20537  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 30300 - 30579
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30300 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcccttctttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 30399  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaac---gtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  30400 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagaccta-ctttcctcctataccaatgttgtatgcagaa 30498  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
     | || || || ||||| |  ||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  30499 cttcttccaaccttactccagagaggtcattgtacaactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 30579  T

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Target: scaffold0558 (Bit Score: 128; Significance: 4e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 129
Alignment:
Q  123 cagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagag 222  Q
    |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  312 cagccaccagctcaacagcaacagcagcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagttactcccgactctacttctcagag 213  T
Q  223 ggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  212 ggcactgctcaaccagacatggcaagcctccacctgatccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 129  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 17 - 306
Target Start/End: Original strand, 21430 - 21716
Alignment:
Q  17 gcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatg 116  Q
    |||||||||||||| | | || || |||||||||||||| ||||||||    ||  |||||||||||||||||||||| |||||| | | ||||| ||||    
T  21430 gcaatactctcagcatcctttcttcccaccattctatcaccagtatccaccaccgccgggtcaacctcaggtacccgtcaatgccattgctcagcaaatg 21529  T
Q  117 caacaacagccaccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttc 216  Q
    ||||||||||  |  | | ||||||| ||||   ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | ||||||||||| ||||    
T  21530 caacaacagctgctggcttaacagcagcaac---aacaaaccagacctacctttcctccgataccaatgctatatgccgagctgctcccgactttgcttc 21626  T
Q  217 tcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  21627 tcaaaggacactgcacaaccaggcagggcaagcctccacctaacctgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatc 21716  T

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Target: scaffold0089 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 278
Target Start/End: Original strand, 29612 - 29890
Alignment:
Q  3 tcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccg 102  Q
    ||||||||||||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  29612 tcgtacccgtatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaa 29711  T
Q  103 tcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatt 199  Q
    | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  29712 tagctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaacatcaacaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagtt 29811  T
Q  200 actcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
     || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  29812 gcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 29890  T

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Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 4 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 40475 - 40198
Alignment:
Q  4 cgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgt 103  Q
    ||||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  40475 cgtacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttctgccattctatcatcagtaccctttgccaccgggtcaacctcaggtacccgtaaatgcaat 40376  T
Q  104 cgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaatta 200  Q
     | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || ||     
T  40375 tgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttg 40276  T
Q  201 ctcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  40275 cttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgccccccaggttc 40198  T

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Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 47356 - 47114
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||    
T  47356 tttccgccattttatcatcagtaccccctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaac 47257  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaac 235  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || || || ||||||||||| |  ||||| || || |||||    
T  47256 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttgtatgctgagttgcttccgactttactccatagaggacattgtacaac 47157  T
Q  236 cagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  47156 cagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 47114  T

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Target: scaffold0143 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Original strand, 27139 - 27419
Alignment:
Q  1 cgtcgtacccgtatgcgcaatactctcagccttccttatttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgc 100  Q
    |||| ||||| |||||||  || ||||||| | | || ||||| ||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27139 cgtcatacccatatgcgccgtattctcagcatcctttctttccgccattttatcatcagtaccctctaccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgc 27238  T
Q  101 cgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaacagcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa 197  Q
      ||| ||| |  ||| ||||||||   ||||||||||| |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  27239 aatcgctcaacagatgaaacaacagttgccagttcaacaacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctgag 27338  T
Q  198 ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    || || ||||||||||| |  |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  27339 ttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaaccagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 27419  T

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Target: scaffold0415 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 221 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 2018
Alignment:
Q  221 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatgtccatc 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2103 agggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctgatccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatc 2018  T

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Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 219 - 299
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6160
Alignment:
Q  219 agagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
    |||||||| || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  6080 agagggcattgtacgactagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgat 6160  T

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Target: scaffold0029 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 39 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 501 - 258
Alignment:
Q  39 tttccaccattctatcatcagtatcctttgccatcgggtcaacctcaggtacccgttaatgccgtcgttcagcgaatgcaacaacagccaccagttcaac 138  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  | | ||| |  ||| ||||||||   || |||||||    
T  501 tttccgccattttatcatcagtaccctctgccaccgggtcaacctcaagtacccgttaatgcaattgctcaacagatgaaacaacagttgccggttcaac 402  T
Q  139 agcaacaacg---tcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaa-ttactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    | |||||||    ||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||||   | || || ||||||||||| |  |||||||| || ||||    
T  401 aacaacaacaaaatcagcaagctagacctactttccctccgataccgatgttatatgctttagttgcttccgactttactccatagagggcattgtacaa 302  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||| ||||    
T  301 ccagacagggcaagcccccaccggatccgttgcctcccaagttc 258  T

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Target: scaffold0237 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 15202 - 15059
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  15202 caacaacaacaaaatcagcaagctagacctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagatcttcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 15103  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  15102 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 15059  T

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Target: scaffold0159 (Bit Score: 52; Significance: 8e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 9338 - 9195
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  9338 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 9239  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
    | |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9238 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 9195  T

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Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Original strand, 19999 - 20142
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  19999 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 20098  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
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T  20099 ctagacagggcaagccaccacctgatccgttgcctccaaggttc 20142  T

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Target: scaffold0336 (Bit Score: 49; Significance: 5e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 127 - 299
Target Start/End: Original strand, 9542 - 9714
Alignment:
Q  127 caccagttcaacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggca 226  Q
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T  9542 caccagttcaacagcagcagcagcaatatgctagaccaacttttcctcctatacctatgttgtatgcagaacttcttccaactctactccagagagggca 9641  T
Q  227 ctgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgat 299  Q
     || || || |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||    
T  9642 ttgtacgactagacagggcaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgat 9714  T

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Target: scaffold0350 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7511 - 7368
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || || || |||||||| |  |||||||| || ||||    
T  7511 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctactttccctccgataccgatgttatatgctgagttgcttccaactttactccagagagggcattgtacaa 7412  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcccaggttc 278  Q
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T  7411 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctccaaggttc 7368  T

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Target: scaffold0144 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26474 - 26338
Alignment:
Q  135 caacagcaacaacgtcaacaagctagacctacctttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaa 234  Q
    ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||  | || || ||| |||| |  |||||||| || ||||    
T  26474 caacaacaacaaaatcagcaagctaggcctacttttcctcctataccaatgttgtatgcagagcttcttccaactctactccagagagggcattgtacaa 26375  T
Q  235 ccagacagggcaagcctccacctaatccgttgcctcc 271  Q
    | |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  26374 ctagacagggtaagcccccacctgatccgttgcctcc 26338  T

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Target: scaffold0038 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 168 - 278
Target Start/End: Original strand, 7966 - 8076
Alignment:
Q  168 tttcctccgataccaatgttgtatgccgaattactcccgactttacttctcagagggcactgcacaaccagacagggcaagcctccacctaatccgttgc 267  Q
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T  7966 tttcctcctataccaatgttgtatgctgagttgcttccaactctactccagagagggcattgtacgactagacaaggcaagccaccacctgatccgttgc 8065  T
Q  268 ctcccaggttc 278  Q
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T  8066 ctccaaggttc 8076  T

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