View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF10070_low_11 (Length: 559)

Name: NF10070_low_11
Description: NF10070
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF10070_low_11
NF10070_low_11
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (87-551)||(31109407-31109872)
chr7 (87-551)||(24024151-24024618)
chr7 (109-544)||(12406149-12406585)
chr7 (87-551)||(12396710-12397172)
chr7 (86-521)||(19992103-19992544)
chr7 (108-521)||(21812092-21812508)
chr7 (87-381)||(4866528-4866820)
chr7 (137-470)||(20357463-20357797)
chr7 (115-470)||(2057786-2058147)
chr7 (110-521)||(24266054-24266471)
chr7 (87-521)||(24261175-24261617)
chr7 (110-521)||(16884745-16885162)
chr7 (110-521)||(16879889-16880306)
chr7 (137-470)||(1533359-1533690)
chr7 (180-470)||(21639701-21639988)
chr7 (269-470)||(18408742-18408943)
chr7 (180-470)||(21645899-21646186)
chr7 (269-470)||(18413619-18413819)
chr7 (472-549)||(4873310-4873387)
chr7 (470-549)||(20357331-20357410)
chr7 (470-549)||(1533228-1533307)
chr7 (470-549)||(2058202-2058281)
chr7 (291-386)||(29159802-29159900)
chr7 (293-376)||(21983285-21983370)
chr7 (291-386)||(46516310-46516408)
chr7 (291-386)||(49091660-49091758)
chr7 (292-386)||(44848685-44848781)
chr7 (291-386)||(2647696-2647794)
chr7 (291-386)||(33332450-33332548)
chr7 (291-374)||(9190021-9190106)
chr7 (291-374)||(20284088-20284173)
chr7 (291-432)||(2580389-2580531)
chr7 (470-549)||(21640039-21640118)
chr7 (291-386)||(55947-56044)
chr7 (470-532)||(21646237-21646299)
chr7 (470-549)||(18408993-18409072)
chr7 (291-375)||(35960815-35960901)
chr7 (291-374)||(9185178-9185263)
chr7 (470-549)||(18413869-18413948)
chr7 (291-386)||(4796667-4796765)
chr7 (292-371)||(47263678-47263757)
chr7 (292-375)||(2479337-2479421)
chr7 (295-355)||(28617258-28617319)
chr7 (293-376)||(21988909-21988992)
chr7 (296-355)||(31155911-31155971)
chr7 (470-532)||(20284318-20284378)
chr7 (470-532)||(23402821-23402881)
chr7 (470-531)||(4796477-4796536)
chr7 (472-532)||(44847933-44847991)
chr7 (296-355)||(1049296-1049356)
chr7 (470-549)||(2479565-2479642)
chr7 (296-355)||(2935497-2935557)
chr7 (296-355)||(3035953-3036013)
chr7 (292-355)||(5817303-5817366)
chr7 (296-355)||(7351652-7351712)
chr7 (292-339)||(8153466-8153514)
chr7 (296-355)||(9027194-9027254)
chr7 (470-529)||(21989137-21989194)
chr7 (296-355)||(22108295-22108355)
chr7 (296-355)||(22137306-22137366)
chr7 (296-355)||(40550055-40550115)
chr7 (296-355)||(40552333-40552393)
[»] chr2 (57 HSPs)
chr2 (85-551)||(39811812-39812280)
chr2 (85-534)||(32246575-32247031)
chr2 (87-436)||(44312563-44312910)
chr2 (87-521)||(19344212-19344655)
chr2 (87-521)||(19349070-19349513)
chr2 (115-470)||(11098843-11099196)
chr2 (139-470)||(14291337-14291669)
chr2 (137-470)||(9296317-9296651)
chr2 (180-470)||(25398386-25398675)
chr2 (292-470)||(3491751-3491930)
chr2 (180-470)||(25403524-25403813)
chr2 (470-549)||(11098711-11098790)
chr2 (291-377)||(8040059-8040147)
chr2 (470-549)||(9296186-9296265)
chr2 (470-549)||(14291722-14291801)
chr2 (295-468)||(13569331-13569506)
chr2 (292-374)||(40738844-40738926)
chr2 (291-386)||(21629943-21630040)
chr2 (322-470)||(25407653-25407802)
chr2 (292-386)||(28259178-28259274)
chr2 (291-386)||(10445444-10445542)
chr2 (291-386)||(17865202-17865300)
chr2 (291-386)||(20522219-20522317)
chr2 (291-386)||(34682334-34682432)
chr2 (293-386)||(34388859-34388955)
chr2 (291-386)||(14699008-14699105)
chr2 (293-386)||(10707252-10707348)
chr2 (295-386)||(8390150-8390244)
chr2 (470-532)||(25409860-25409922)
chr2 (292-377)||(31056044-31056131)
chr2 (291-386)||(33528621-33528719)
chr2 (291-386)||(39482930-39483028)
chr2 (291-377)||(16940219-16940307)
chr2 (291-377)||(17010884-17010972)
chr2 (292-386)||(23078471-23078567)
chr2 (292-386)||(42039670-42039766)
chr2 (291-376)||(33118135-33118222)
chr2 (470-532)||(3491981-3492043)
chr2 (292-432)||(36757718-36757859)
chr2 (295-355)||(1345574-1345635)
chr2 (295-355)||(2838063-2838124)
chr2 (296-355)||(35215586-35215646)
chr2 (296-355)||(35217963-35218023)
chr2 (470-549)||(40739063-40739140)
chr2 (313-375)||(27149306-27149369)
chr2 (470-532)||(36757570-36757630)
chr2 (470-532)||(39483162-39483222)
chr2 (295-375)||(2869705-2869787)
chr2 (470-530)||(21630174-21630232)
chr2 (296-352)||(45332181-45332238)
chr2 (492-532)||(20522471-20522511)
chr2 (470-533)||(23078278-23078339)
chr2 (296-355)||(23452237-23452297)
chr2 (470-533)||(29867780-29867840)
chr2 (296-355)||(36558864-36558924)
chr2 (296-355)||(36561141-36561201)
chr2 (470-532)||(41586358-41586419)
[»] chr6 (40 HSPs)
chr6 (87-549)||(14737403-14737866)
chr6 (87-549)||(14742263-14742725)
chr6 (87-551)||(22010521-22010983)
chr6 (87-551)||(11856765-11857235)
chr6 (87-540)||(28184297-28184757)
chr6 (87-534)||(28155412-28155861)
chr6 (87-534)||(6438294-6438743)
chr6 (110-521)||(6005234-6005650)
chr6 (110-521)||(16838561-16838977)
chr6 (110-521)||(33330297-33330715)
chr6 (110-521)||(33335794-33336212)
chr6 (137-470)||(5674685-5675017)
chr6 (110-337)||(5343297-5343527)
chr6 (470-549)||(5674554-5674633)
chr6 (292-386)||(5757479-5757575)
chr6 (292-386)||(21356036-21356132)
chr6 (291-376)||(10077176-10077263)
chr6 (291-386)||(5572241-5572339)
chr6 (291-375)||(31086485-31086571)
chr6 (292-376)||(4629954-4630040)
chr6 (291-386)||(31979512-31979610)
chr6 (137-236)||(30125944-30126044)
chr6 (291-386)||(22963699-22963796)
chr6 (291-386)||(23824597-23824694)
chr6 (304-386)||(21801344-21801429)
chr6 (314-374)||(22709041-22709102)
chr6 (313-386)||(18232867-18232942)
chr6 (291-374)||(5017482-5017567)
chr6 (291-355)||(31936586-31936651)
chr6 (296-355)||(12195515-12195575)
chr6 (470-532)||(5017304-5017364)
chr6 (472-549)||(22709241-22709316)
chr6 (397-470)||(22709116-22709188)
chr6 (296-355)||(4816231-4816291)
chr6 (296-355)||(5273216-5273276)
chr6 (296-355)||(19704567-19704627)
chr6 (296-355)||(20915356-20915416)
chr6 (296-355)||(26932562-26932622)
chr6 (296-355)||(29754709-29754769)
chr6 (296-355)||(33309110-33309170)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (87-549)||(25328105-25328568)
chr8 (87-551)||(7289750-7290210)
chr8 (85-534)||(39784665-39785116)
chr8 (115-470)||(6311121-6311477)
chr8 (110-521)||(35745208-35745624)
chr8 (115-470)||(36979205-36979558)
chr8 (137-469)||(33037724-33038056)
chr8 (137-470)||(30655488-30655827)
chr8 (137-470)||(18853083-18853418)
chr8 (110-521)||(10684116-10684533)
chr8 (137-470)||(4759991-4760325)
chr8 (137-470)||(18870477-18870809)
chr8 (115-470)||(10689058-10689412)
chr8 (292-470)||(1261871-1262050)
chr8 (470-551)||(6311532-6311613)
chr8 (470-549)||(18870345-18870424)
chr8 (458-549)||(25327979-25328070)
chr8 (470-549)||(30655880-30655959)
chr8 (292-470)||(31071146-31071326)
chr8 (470-549)||(10688924-10689003)
chr8 (470-549)||(18852951-18853030)
chr8 (292-374)||(26287902-26287985)
chr8 (292-374)||(26301159-26301242)
chr8 (292-374)||(26313153-26313236)
chr8 (470-549)||(33037592-33037671)
chr8 (291-377)||(26403240-26403328)
chr8 (470-550)||(4759857-4759938)
chr8 (292-386)||(4456028-4456124)
chr8 (470-549)||(1261741-1261820)
chr8 (470-549)||(36979611-36979689)
chr8 (295-386)||(7412344-7412437)
chr8 (292-386)||(19175755-19175851)
chr8 (291-386)||(23799577-23799675)
chr8 (291-374)||(4696609-4696694)
chr8 (291-386)||(5702483-5702581)
chr8 (295-386)||(6127224-6127318)
chr8 (294-355)||(9765852-9765914)
chr8 (291-374)||(19752407-19752492)
chr8 (470-530)||(31071035-31071095)
chr8 (470-532)||(26288121-26288183)
chr8 (470-532)||(26301378-26301440)
chr8 (470-532)||(26313372-26313434)
chr8 (470-532)||(7412569-7412629)
chr8 (296-355)||(43079877-43079937)
chr8 (296-355)||(43082248-43082308)
chr8 (470-532)||(4696416-4696476)
chr8 (292-358)||(6813683-6813750)
chr8 (322-355)||(18810982-18811015)
chr8 (473-532)||(23799384-23799441)
chr8 (296-355)||(44721118-44721178)
[»] chr5 (55 HSPs)
chr5 (87-551)||(15044484-15044947)
chr5 (86-551)||(43592079-43592540)
chr5 (87-551)||(43598525-43598985)
chr5 (87-551)||(43604017-43604477)
chr5 (87-551)||(43609509-43609969)
chr5 (87-551)||(1456986-1457445)
chr5 (84-551)||(27444768-27445231)
chr5 (87-551)||(27449615-27450075)
chr5 (87-521)||(28807429-28807868)
chr5 (109-521)||(37561300-37561715)
chr5 (113-521)||(37556478-37556889)
chr5 (115-469)||(30631231-30631586)
chr5 (110-521)||(2785192-2785608)
chr5 (110-521)||(33791133-33791549)
chr5 (214-470)||(31180138-31180394)
chr5 (110-521)||(31396843-31397261)
chr5 (110-521)||(31401700-31402118)
chr5 (110-521)||(33767996-33768417)
chr5 (115-470)||(24135680-24136028)
chr5 (180-470)||(38192064-38192353)
chr5 (180-470)||(38219289-38219578)
chr5 (292-470)||(35387663-35387842)
chr5 (470-549)||(30631640-30631719)
chr5 (470-549)||(31180447-31180526)
chr5 (470-549)||(24136080-24136159)
chr5 (292-386)||(9353333-9353429)
chr5 (292-386)||(36932351-36932447)
chr5 (292-386)||(10281751-10281848)
chr5 (292-386)||(15464532-15464628)
chr5 (293-386)||(11916972-11917068)
chr5 (470-549)||(35387893-35387972)
chr5 (292-386)||(14520230-14520326)
chr5 (291-377)||(17003970-17004058)
chr5 (291-386)||(3880298-3880396)
chr5 (295-386)||(12084176-12084269)
chr5 (292-386)||(19588746-19588843)
chr5 (291-374)||(28832258-28832343)
chr5 (470-549)||(38219629-38219708)
chr5 (291-374)||(42127423-42127508)
chr5 (296-355)||(4410241-4410301)
chr5 (291-371)||(31300612-31300694)
chr5 (296-355)||(15552464-15552524)
chr5 (470-549)||(24553318-24553395)
chr5 (296-355)||(31179371-31179431)
chr5 (296-355)||(31542953-31543013)
chr5 (296-355)||(31545299-31545359)
chr5 (470-531)||(11181641-11181700)
chr5 (296-349)||(27910675-27910729)
chr5 (472-532)||(7160712-7160770)
chr5 (472-532)||(14520461-14520519)
chr5 (291-374)||(24553520-24553604)
chr5 (470-530)||(28832486-28832544)
chr5 (296-355)||(3373137-3373197)
chr5 (296-355)||(10749919-10749979)
chr5 (296-355)||(15354575-15354635)
[»] chr3 (75 HSPs)
chr3 (87-551)||(22173019-22173484)
chr3 (87-534)||(18656228-18656677)
chr3 (115-470)||(7167072-7167425)
chr3 (108-521)||(2676939-2677358)
chr3 (134-470)||(28503780-28504107)
chr3 (108-521)||(2672783-2673202)
chr3 (110-521)||(8512032-8512450)
chr3 (110-521)||(8516912-8517330)
chr3 (141-521)||(24967957-24968340)
chr3 (137-470)||(2671502-2671836)
chr3 (137-467)||(8738982-8739314)
chr3 (137-467)||(9091220-9091552)
chr3 (110-521)||(32475301-32475717)
chr3 (110-521)||(32480158-32480575)
chr3 (335-470)||(28501613-28501750)
chr3 (274-470)||(40372712-40372908)
chr3 (137-470)||(8477212-8477545)
chr3 (269-470)||(26928507-26928709)
chr3 (110-340)||(10207750-10207983)
chr3 (292-470)||(32143321-32143501)
chr3 (470-550)||(8738846-8738926)
chr3 (470-549)||(2671370-2671449)
chr3 (470-549)||(40372580-40372659)
chr3 (292-470)||(1305949-1306128)
chr3 (470-549)||(7167478-7167558)
chr3 (470-546)||(8477598-8477674)
chr3 (470-549)||(9091085-9091164)
chr3 (470-549)||(28501480-28501560)
chr3 (470-549)||(28503647-28503727)
chr3 (292-470)||(27452958-27453138)
chr3 (292-386)||(8370477-8370573)
chr3 (292-386)||(27974943-27975039)
chr3 (291-386)||(18552873-18552971)
chr3 (291-386)||(21711222-21711319)
chr3 (292-386)||(16264350-16264446)
chr3 (292-374)||(27986449-27986533)
chr3 (293-386)||(36029094-36029190)
chr3 (295-386)||(1736295-1736389)
chr3 (292-386)||(30709780-30709877)
chr3 (292-374)||(33386669-33386753)
chr3 (291-386)||(3715992-3716090)
chr3 (291-386)||(40592772-40592870)
chr3 (291-386)||(48438213-48438311)
chr3 (291-386)||(6794704-6794801)
chr3 (291-386)||(26298987-26299085)
chr3 (291-374)||(1417493-1417578)
chr3 (292-386)||(25795781-25795878)
chr3 (291-386)||(47923896-47923994)
chr3 (291-374)||(37466290-37466375)
chr3 (470-530)||(1306179-1306239)
chr3 (292-374)||(39039995-39040079)
chr3 (291-386)||(40844651-40844748)
chr3 (291-374)||(3328359-3328444)
chr3 (292-358)||(4386947-4387014)
chr3 (291-386)||(24695154-24695252)
chr3 (473-532)||(4386774-4386831)
chr3 (470-549)||(27986236-27986313)
chr3 (296-355)||(38210569-38210629)
chr3 (139-203)||(40372980-40373043)
chr3 (296-355)||(50494198-50494258)
chr3 (296-359)||(53894055-53894119)
chr3 (470-532)||(23392106-23392166)
chr3 (470-532)||(24694963-24695023)
chr3 (470-532)||(26928396-26928456)
chr3 (470-532)||(36029322-36029382)
chr3 (470-532)||(40592579-40592639)
chr3 (313-374)||(3323693-3323755)
chr3 (296-355)||(458483-458543)
chr3 (296-355)||(6063444-6063504)
chr3 (296-355)||(10621528-10621588)
chr3 (473-532)||(21711454-21711511)
chr3 (473-532)||(23410529-23410586)
chr3 (470-549)||(32143552-32143629)
chr3 (292-339)||(39153357-39153405)
chr3 (470-529)||(47923704-47923761)
[»] chr4 (52 HSPs)
chr4 (87-551)||(9224231-9224698)
chr4 (87-551)||(9229018-9229484)
chr4 (78-534)||(45347658-45348118)
chr4 (78-534)||(45357138-45357597)
chr4 (87-548)||(51520258-51520715)
chr4 (85-549)||(3813814-3814281)
chr4 (87-534)||(5732458-5732907)
chr4 (87-521)||(18855519-18855956)
chr4 (87-422)||(56146664-56146995)
chr4 (137-470)||(24741788-24742121)
chr4 (115-468)||(29760470-29760821)
chr4 (464-551)||(18712590-18712677)
chr4 (470-549)||(24742174-24742253)
chr4 (470-549)||(29760874-29760954)
chr4 (292-374)||(28468542-28468625)
chr4 (291-386)||(10047378-10047476)
chr4 (291-386)||(39245993-39246091)
chr4 (292-470)||(31985552-31985730)
chr4 (291-386)||(36315230-36315327)
chr4 (291-386)||(36329439-36329536)
chr4 (291-386)||(16623293-16623391)
chr4 (292-386)||(5396672-5396768)
chr4 (291-377)||(38152449-38152537)
chr4 (289-374)||(5269204-5269291)
chr4 (292-386)||(3796519-3796616)
chr4 (293-376)||(5143260-5143345)
chr4 (293-376)||(5147678-5147763)
chr4 (291-377)||(24333808-24333896)
chr4 (293-386)||(3777550-3777645)
chr4 (297-377)||(6743425-6743507)
chr4 (291-386)||(16630680-16630778)
chr4 (291-374)||(25862035-25862120)
chr4 (470-549)||(28468325-28468404)
chr4 (470-529)||(5112466-5112523)
chr4 (296-355)||(16931789-16931849)
chr4 (296-355)||(16934143-16934203)
chr4 (296-355)||(22780373-22780433)
chr4 (296-355)||(44599838-44599898)
chr4 (470-532)||(3777778-3777838)
chr4 (470-532)||(5396479-5396539)
chr4 (470-532)||(16623101-16623161)
chr4 (470-532)||(16628680-16628740)
chr4 (313-386)||(39774305-39774380)
chr4 (291-376)||(54867183-54867269)
chr4 (147-177)||(3813734-3813764)
chr4 (472-532)||(5269008-5269066)
chr4 (470-529)||(6743226-6743283)
chr4 (296-355)||(6765117-6765177)
chr4 (296-355)||(7941596-7941656)
chr4 (296-355)||(18709164-18709224)
chr4 (296-355)||(22782738-22782798)
chr4 (473-532)||(25861841-25861898)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (87-551)||(34886-35352)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (87-551)||(41398032-41398497)
chr1 (82-534)||(25444931-25445387)
chr1 (189-551)||(41390483-41390842)
chr1 (87-534)||(44023716-44024163)
chr1 (87-534)||(39445292-39445742)
chr1 (86-534)||(1054854-1055305)
chr1 (137-470)||(24787280-24787617)
chr1 (110-521)||(43988314-43988734)
chr1 (180-470)||(24202686-24202973)
chr1 (87-193)||(41386543-41386650)
chr1 (396-534)||(25439738-25439875)
chr1 (292-470)||(19358760-19358939)
chr1 (292-470)||(19361349-19361528)
chr1 (292-470)||(19379989-19380168)
chr1 (471-549)||(24787148-24787226)
chr1 (292-386)||(26644898-26644994)
chr1 (291-377)||(47703946-47704034)
chr1 (470-549)||(24202556-24202635)
chr1 (292-386)||(19072928-19073025)
chr1 (292-386)||(19120818-19120915)
chr1 (20-86)||(50958683-50958747)
chr1 (291-386)||(16124516-16124614)
chr1 (291-386)||(27104372-27104470)
chr1 (292-386)||(3281708-3281804)
chr1 (291-377)||(9476260-9476348)
chr1 (291-377)||(13598397-13598485)
chr1 (291-377)||(29651810-29651898)
chr1 (292-384)||(37069770-37069864)
chr1 (291-377)||(775671-775759)
chr1 (291-374)||(47098837-47098922)
chr1 (292-386)||(13604624-13604720)
chr1 (292-386)||(21536570-21536666)
chr1 (470-549)||(19366095-19366174)
chr1 (291-374)||(32889438-32889523)
chr1 (470-549)||(19361220-19361298)
chr1 (295-355)||(47102874-47102935)
chr1 (296-355)||(9459419-9459479)
chr1 (296-355)||(9463246-9463306)
chr1 (296-355)||(16226386-16226446)
chr1 (470-549)||(19358631-19358709)
chr1 (403-470)||(19366225-19366292)
chr1 (470-532)||(47098633-47098693)
chr1 (470-532)||(47102647-47102707)
chr1 (470-531)||(3281936-3281995)
chr1 (470-549)||(13604413-13604490)
chr1 (296-355)||(23786058-23786118)
chr1 (472-531)||(37069998-37070055)
chr1 (296-355)||(51752582-51752642)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (87-505)||(9514-9930)
scaffold0355 (378-551)||(3672-3845)
scaffold0355 (88-234)||(28-170)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (87-534)||(155-605)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (110-521)||(148808-149224)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (110-521)||(2103-2519)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (110-521)||(19017-19433)
scaffold0197 (87-521)||(14161-14603)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (110-360)||(181980-182233)
scaffold0009 (427-521)||(176829-176925)
[»] scaffold0188 (4 HSPs)
scaffold0188 (180-470)||(17869-18157)
scaffold0188 (292-470)||(23962-24141)
scaffold0188 (470-549)||(17739-17818)
scaffold0188 (470-549)||(23832-23911)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (87-193)||(34132-34239)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (137-324)||(300-487)
[»] scaffold0140 (4 HSPs)
scaffold0140 (292-386)||(8420-8516)
scaffold0140 (470-549)||(8208-8285)
scaffold0140 (296-355)||(22343-22403)
scaffold0140 (296-355)||(24618-24678)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (293-386)||(85684-85779)
[»] scaffold0087 (3 HSPs)
scaffold0087 (292-386)||(43962-44058)
scaffold0087 (292-386)||(36833-36929)
scaffold0087 (470-532)||(36640-36700)
[»] scaffold0006 (4 HSPs)
scaffold0006 (291-377)||(5682-5770)
scaffold0006 (291-377)||(2491-2579)
scaffold0006 (292-386)||(133281-133377)
scaffold0006 (470-549)||(133070-133147)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (291-386)||(10728-10826)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (87-172)||(13141-13229)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (292-374)||(45253-45337)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (295-386)||(17266-17360)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (296-355)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (322-355)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (296-355)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 31109872 - 31109407
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31109872 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 31109773  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacac 286  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||    
T  31109772 agccaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataaacaagaaaaggaagaacaaaacac 31109673  T
Q  287 cgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109672 cgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga 31109573  T
Q  387 ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 486  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31109572 ctctagccttcaagctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttgatattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattacaa 31109473  T
Q  487 tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat-tggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31109472 tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatatggttccctcctttgct 31109407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24024618 - 24024151
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24024618 tgttgtgaatccggttccaaagaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 24024519  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccc-taactagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||| ||| |  | ||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  24024518 aagcaaacaacaacaaaacagcctatgactagtatatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaa 24024420  T
Q  284 -caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 382  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24024419 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaatgttac 24024320  T
Q  383 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  24024319 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacacgatgaaccctaaaacccacggtgatt 24024220  T
Q  483 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24024219 acaatgtttttccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 24024151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 351; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 109 - 544
Target Start/End: Original strand, 12406149 - 12406585
Alignment:
Q  109 aaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc 208  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12406149 aaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcc 12406248  T
Q  209 cta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgaccca 306  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12406249 ctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 12406346  T
Q  307 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga-ctctagccttcaagcttta 405  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12406347 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaactctagccttcaagcttta 12406446  T
Q  406 cacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 505  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406447 cacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaagccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaaga 12406546  T
Q  506 gacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctc 544  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12406547 gacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctc 12406585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 12396710 - 12397172
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12396710 tgttgtgaatccggttcaaaa---accttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 12396806  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  12396807 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaagggaagaacaaaac 12396905  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12396906 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 12397004  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12397005 gaactctagcctttaatctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactatcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 12397104  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12397105 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 12397172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 86 - 521
Target Start/End: Original strand, 19992103 - 19992544
Alignment:
Q  86 gtgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 181  Q
    |||||||||||||||||| |   | | |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||     
T  19992103 gtgttgtgaatccggttcaactaatggaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 19992202  T
Q  182 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaa 278  Q
     |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19992203 ttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaa 19992300  T
Q  279 caaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 378  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19992301 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaagg 19992400  T
Q  379 ttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaagg 477  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  19992401 ttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 19992499  T
Q  478 tgattacaatgttttt-cccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||    
T  19992500 tgattacaatgtttttccccaacctaagaaacactcacatcaaag 19992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 108 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 21812508 - 21812092
Alignment:
Q  108 gaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacag 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||    
T  21812508 gaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaa-cag 21812410  T
Q  207 ccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttgac 303  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  21812409 ccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaa-gcataaacaagataaacggtaaaagaaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 21812311  T
Q  304 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tc-aagc 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||||||||| | || ||||    
T  21812310 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtg-aagtcttacaaaaggttccaagactctagcttgtcaaagc 21812212  T
Q  402 tttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgttttt-cccaacc 500  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21812211 tttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgtttttccccaacc 21812113  T
Q  501 caagagacactctcaacaaag 521  Q
     |||| ||||||||| |||||    
T  21812112 taagaaacactctcatcaaag 21812092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 87 - 381
Target Start/End: Original strand, 4866528 - 4866820
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  4866528 tgttgtgaatccggttcaaaa---accttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctcca 4866624  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccacacaaga-gatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4866625 agcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaa 4866723  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 381  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4866724 caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 4866820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357463
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  235 aa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
    || |||||  |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20357698 aaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaatacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggg 20357602  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctacc 431  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  20357601 gagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagctttacacaagaacatgccctagattctacc 20357502  T
Q  432 ctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    | |  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20357501 catatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 20357463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 115 - 470
Target Start/End: Original strand, 2057786 - 2058147
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-a 212  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  2057786 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaaccgccctaga 2057882  T
Q  213 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaa----caagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 307  Q
    || || || ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||    ||||||||||  |||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  2057883 cttgtttagagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaaaaaaacaagataagcaataaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccag 2057981  T
Q  308 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagcttt 404  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| ||    
T  2057982 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-tt 2058080  T
Q  405 acacatgaacaaaccctagattctaccc-tttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2058081 acacaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2058147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24266471 - 24266054
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  24266471 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 24266372  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  24266371 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaggaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 24266277  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  24266276 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaa 24266177  T
Q  400 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24266176 gctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 24266078  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||    
T  24266077 acctaagatacactctcatcaaag 24266054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 87 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 24261617 - 24261175
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca--aagaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  24261617 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 24261518  T
Q  183 tccaagcaaa-caacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--g 276  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |    
T  24261517 tccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacg 24261423  T
Q  277 aacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaa 376  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  24261422 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 24261323  T
Q  377 g-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaaccca 474  Q
    | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || ||||    
T  24261322 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 24261224  T
Q  475 aggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || ||||||||||||  ||||||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  24261223 agatgattacaatgttgttttcccaacctaagattcactctcatcaaag 24261175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 16884745 - 16885162
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  16884745 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16884844  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16884845 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 16884939  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaag 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | |||||    
T  16884940 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaag 16885039  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  16885040 ctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttccca 16885138  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| ||||  |||||||| |||||    
T  16885139 acctaagattcactctcatcaaag 16885162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 16879889 - 16880306
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  16879889 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 16879988  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  16879989 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 16880083  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaag 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | |||||    
T  16880084 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttacaaagagttacaagaatctagcttatcaag 16880183  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||||||  |||| |||    
T  16880184 ctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgtttttcca 16880282  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| ||||  |||||||| |||||    
T  16880283 acctaagattcactctcatcaaag 16880306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1533690 - 1533359
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaac-agccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||  |||  || ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||||||| ||||| ||||||     
T  1533690 gatgtgtggagcaaaatatagtggtaatcaatgagaaaaaa--gtttccaagcaa-caacaacaaaaccagccccagtctagtgtagagcaacaccaca- 1533595  T
Q  235 aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
    ||||||   |||||||  ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1533594 aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc-aataagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 1533499  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatg-aacaaaccctagattcta 429  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||| | |||||  |||||||||||    
T  1533498 gagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattcta 1533400  T
Q  430 ccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1533399 ccctttggtgttttcccactctcacaatatgaaccctaaaa 1533359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Original strand, 21639701 - 21639988
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21639701 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 21639794  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  21639795 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaa 21639893  T
Q  376 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21639894 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21639988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 269 - 470
Target Start/End: Original strand, 18408742 - 18408943
Alignment:
Q  269 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 366  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18408742 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaag 18408839  T
Q  367 tgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccc 465  Q
    ||||||||| ||||||||| |   || | | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18408840 tgttacaaagggttacaagaaaaataacttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 18408938  T
Q  466 taaaa 470  Q
    |||||    
T  18408939 taaaa 18408943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Original strand, 21645899 - 21646186
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| ||||| ||||||  |||||   ||||  |||||||||||||||   ||| ||| ||    
T  21645899 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaa--acaaacaagataagcaagaaaggaa-ga 21645992  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  21645993 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaa 21646091  T
Q  376 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  21646092 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 21646186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 269 - 470
Target Start/End: Original strand, 18413619 - 18413819
Alignment:
Q  269 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 366  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  18413619 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaag 18413715  T
Q  367 tgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccc 465  Q
    ||||||||| ||||||||| |   |||  | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| ||||||||    
T  18413716 tgttacaaagggttacaagaaaaatagattgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccc 18413814  T
Q  466 taaaa 470  Q
    |||||    
T  18413815 taaaa 18413819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 472 - 549
Target Start/End: Original strand, 4873310 - 4873387
Alignment:
Q  472 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4873310 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 4873387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 20357410 - 20357331
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20357410 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 20357331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 1533307 - 1533228
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1533307 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 1533228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 2058202 - 2058281
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2058202 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 2058281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159900
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 29159900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 293 - 376
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983370
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 21983370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516310
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 46516310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091758
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 49091758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848685
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 44848685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647696
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 2647696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332450
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33332450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190021
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9190021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284173
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 20284173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 291 - 432
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580531
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagact 388  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||   |||||||||      
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaatgagttacaagaaa 2580488  T
Q  389 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 432  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  2580489 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctaccc 2580531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 21640039 - 21640118
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21640039 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 21640118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56044
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 56044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 21646237 - 21646299
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  21646237 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 21646299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 18408993 - 18409072
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  18408993 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 18409072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35960901
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    |||||||||||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaa 35960901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185178
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 9185178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 18413869 - 18413948
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  18413869 acccaaggtgtttacattgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 18413948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4796765 - 4796667
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||| ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  4796765 caagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 4796667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 371
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263757
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 371  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta 47263757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 292 - 375
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479421
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaa 2479421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 293 - 376
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21988992
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaa 21988992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 20284318 - 20284378
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  20284318 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 20284378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 23402881 - 23402821
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23402881 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23402821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 4796536 - 4796477
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 531  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  4796536 acccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 4796477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 44847991 - 44847933
Alignment:
Q  472 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  44847991 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 44847933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 2479565 - 2479642
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||||    |||||||||||||    
T  2479565 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactataaagacactcaaccctaaagttccctcctttg 2479642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 5817366 - 5817303
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5817366 aagattgttaactcagttcggtccaatatgacctactctgggg-agagagcagctctccaatcca 5817303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 529
Target Start/End: Original strand, 21989137 - 21989194
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 529  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  21989137 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaa 21989194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 57)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 85 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 39812280 - 39811812
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39812280 agtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 39812181  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 282  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812180 ccaagccaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 39812081  T
Q  283 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 382  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39812080 acaccgag-aagattgttgaaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 39811982  T
Q  383 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 482  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  39811981 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 39811882  T
Q  483 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39811881 acaatgtttttctcaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 39811812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 85 - 534
Target Start/End: Original strand, 32246575 - 32247031
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32246575 agtgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggt 32246674  T
Q  182 ctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaa---aga 277  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   |||| ||   |||    
T  32246675 ctccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaaga 32246774  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32246775 acaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 32246874  T
Q  378 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaagg 477  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||    
T  32246875 gttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattataccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaagg 32246974  T
Q  478 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  32246975 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 32247031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 44312910 - 44312563
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  44312910 tgttgtgaatccggttcaaaa---atcttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 44312814  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  44312813 agcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaac 44312715  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312714 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 44312616  T
Q  385 g-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 436  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44312615 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 87 - 521
Target Start/End: Original strand, 19344212 - 19344655
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19344212 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcc 19344311  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaaga 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||    
T  19344312 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaaga 19344407  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19344408 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 19344507  T
Q  378 -gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaa 475  Q
     ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||    
T  19344508 agttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaa 19344606  T
Q  476 ggtgattacaa---tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19344607 ggtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19344655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 87 - 521
Target Start/End: Original strand, 19349070 - 19349513
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19349070 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggcc 19349169  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaaga 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||    
T  19349170 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaaga 19349265  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  19349266 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 19349365  T
Q  378 -gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaa 475  Q
     ||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||    
T  19349366 agttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaa 19349464  T
Q  476 ggtgattacaa---tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||||||||||   |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19349465 ggtgattacaatgttgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 19349513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 115 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11099196 - 11098843
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-a 212  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  11099196 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacagccctaga 11099101  T
Q  213 ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 311  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |   |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11099100 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag-gaagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 11099004  T
Q  312 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacac 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||    
T  11099003 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacac 11098905  T
Q  409 atgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  11098904 aagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 11098843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 139 - 470
Target Start/End: Original strand, 14291337 - 14291669
Alignment:
Q  139 tgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac-a 235  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |    
T  14291337 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatg-ggcaaaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaa 14291435  T
Q  236 agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 335  Q
    ||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14291436 agagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 14291532  T
Q  336 gagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14291533 gagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctaccc 14291631  T
Q  433 tttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     |  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14291632 atatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 14291669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9296651 - 9296317
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||  | ||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||    
T  9296651 gatgtgtggagcaaaaggtagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagcaaaaccacac 9296553  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     |||||||  ||||||| |||||||| ||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9296552 aaagagataacaaagca-aaacaagaaaagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggg 9296456  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||    
T  9296455 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttatacaagaacaagccctagattctac 9296357  T
Q  431 cctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    || |  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9296356 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 9296317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Original strand, 25398386 - 25398675
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  25398386 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25398481  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25398482 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25398580  T
Q  376 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25398581 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25398675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491930
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 3491850  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  3491851 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 3491930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Original strand, 25403524 - 25403813
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  25403524 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 25403619  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25403620 acaaacacaccaaa-aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 25403718  T
Q  376 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25403719 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25403813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 11098790 - 11098711
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11098790 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 11098711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040147
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 8040147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 9296265 - 9296186
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9296265 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaatagacactttctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 9296186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 14291722 - 14291801
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  14291722 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactatctacaaagacgctcaaccctttggttccctcctttg 14291801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 295 - 468
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569506
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaagactcta 391  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||   ||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatta 13569430  T
Q  392 gccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaa 468  Q
    || |  ||| |||||||| ||||||  ||||  |||||||||||| |  |  ||||||||||||| ||||| |||||    
T  13569431 gcttataag-tttacacaagaacaagacctaatttctaccctttgtttgtcacccactctcacaatatgaatcctaa 13569506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738926
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630040
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 21630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 322 - 470
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407802
Alignment:
Q  322 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaacc 419  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtc 25407751  T
Q  420 ctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||| |||||||| || || |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  25407752 ctagtttctacccatttgtgtttctccactctcacaatatgaaccctaaaa 25407802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259178
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 28259178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445444
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10445444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865300
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagcc-aatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17865300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522317
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaaga 20522317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682334
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34682334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 386
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388955
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 34388955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14699008
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaaga 14699008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707252
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10707252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390150
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaaga 8390150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 25409860 - 25409922
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  25409860 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 25409922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 377
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056131
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    ||||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 31056131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528621
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 33528621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39483028
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaaga 39483028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16940307 - 16940219
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  16940307 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 16940219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17010972 - 17010884
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17010972 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 17010884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078471
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||| |||  |||||||||    
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttagaaagagttacaaga 23078471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039670
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttacgaagagttacaaga 42039670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118222
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    ||||||||||| | |||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaa 33118222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 3491981 - 3492043
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3491981 acccaaggtgtttacaatgttttttccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3492043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 432
Target Start/End: Complemental strand, 36757859 - 36757718
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaagactc 389  Q
    ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||| ||||       
T  36757859 aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaaagtgtttcaaagagttataagaaaa 36757760  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 432  Q
     ||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  36757759 aagctttcaagc-ttacacaagaacaaaacctaatttctaccc 36757718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 295 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345574
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 295 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838063
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatcca 2838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 40739063 - 40739140
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  40739063 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 40739140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 27149369 - 27149306
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||||||    
T  27149369 ccaatatgacctactatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgatacaaa 27149306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36757630 - 36757570
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36757630 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36757570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 39483162 - 39483222
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| ||||||| |||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  39483162 acccaaggtgtttacaatattt--cccaacccaagagatcctcacaacaaagacactcaaccc 39483222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 295 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869705
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaa 2869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 530
Target Start/End: Original strand, 21630174 - 21630232
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 530  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  21630174 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 21630232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 296 - 352
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 352  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 492 - 532
Target Start/End: Original strand, 20522471 - 20522511
Alignment:
Q  492 ttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  20522471 ttcccaacccaagagatactcactacaaagacactcaaccc 20522511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 23078339 - 23078278
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 533  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  |||   ||||||||||||||||||    
T  23078339 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagattctcatcacaaagacactcaaccca 23078278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 29867840 - 29867780
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca 533  Q
    |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||    
T  29867840 acccaaggtgtttacaatg--tttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaccctcaaccca 29867780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 41586419 - 41586358
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaa-tgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  41586419 acccaaggtgtttacaactgtttt--ccaacccaagagaagctctcaccaaagacactcaaccc 41586358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 387; Significance: 0; HSPs: 40)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 387; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 14737866 - 14737403
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14737866 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 14737767  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa--gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737766 agcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 14737668  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 383  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737667 caccgag-aagattgttgatccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 14737569  T
Q  384 agactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  14737568 agactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatta 14737469  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14737468 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 14737403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 14742725 - 14742263
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14742725 tgttgtgaatccggtttcaaataaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcca 14742626  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742625 agcatacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagca-aaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 14742527  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14742526 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 14742428  T
Q  385 gactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattac 484  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  14742427 gactctagccttcaagctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaagtgattac 14742328  T
Q  485 aatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14742327 aatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacacttaacccattggttccctcctttg 14742263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 358; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22010983 - 22010521
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||| |||   | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22010983 tgttgtgaatccggttcaaaa---atcttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 22010887  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  22010886 agcaaacaacaacaaagccgccctagacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcgataaaaggaagaacaaaac 22010788  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010787 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 22010689  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22010688 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttgatatttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 22010589  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22010588 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 22010521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 11856765 - 11857235
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa--ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctc 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11856765 tgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 11856864  T
Q  185 caagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  11856865 caagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagacaagcgataaaaggaagaacaaa 11856963  T
Q  283 a---caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 379  Q
    |   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11856964 aaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 11857062  T
Q  380 tacaaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggt 478  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11857063 tacaagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggt 11857162  T
Q  479 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11857163 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 11857235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 540
Target Start/End: Original strand, 28184297 - 28184757
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaa--tggtct 183  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||    
T  28184297 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtct 28184396  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaa-gaaagaacaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28184397 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcggtaaaaagaaagaacaa 28184496  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 381  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28184497 aacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 28184595  T
Q  382 caagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgat 481  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  28184596 caacactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 28184695  T
Q  482 tacaatgttttt---cccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttc 540  Q
    ||| ||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  28184696 tactatgtttttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagaccctcaacccatttgttc 28184757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 87 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 28155861 - 28155412
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  28155861 tgttgtgaatccggttctaaacaaaaccttcacaccaatgcaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttc 28155762  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcc-ctaactagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaa 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  28155761 aagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaa 28155663  T
Q  283 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155662 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 28155563  T
Q  383 aagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 482  Q
    |||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  28155562 aagaatttagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgatt 28155464  T
Q  483 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  28155463 acaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 28155412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 87 - 534
Target Start/End: Original strand, 6438294 - 6438743
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctc 184  Q
    |||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||  ||    
T  6438294 tgttgtgattccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggcttc 6438393  T
Q  185 caagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaa 281  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  6438394 caagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaacaa 6438491  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 381  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6438492 aacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtta 6438590  T
Q  382 caagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtga 480  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  6438591 caagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 6438689  T
Q  481 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  6438690 ttacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 6438743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 6005234 - 6005650
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  6005234 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 6005333  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6005334 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 6005428  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  6005429 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaag 6005528  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  6005529 ctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 6005627  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  6005628 cctaagaaacactctcatcaaag 6005650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 16838561 - 16838977
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||    
T  16838561 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggccttcaagctaacaacaacaaaacagc 16838660  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  16838661 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 16838755  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 400  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  16838756 cccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaag 16838855  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  16838856 ctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 16838954  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  16838955 cctaagatacactctcatcaaag 16838977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33330715 - 33330297
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||| | ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33330715 aaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 33330616  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| |||||||||||| |||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  33330615 c-taagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttg 33330520  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  33330519 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaa 33330420  T
Q  400 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33330419 gctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 33330321  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||    
T  33330320 acctaagaaacactctcatcaaag 33330297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 33336212 - 33335794
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||| | |||||||||||||||||    
T  33336212 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaaactaacaacaacaaaacagc 33336113  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaa-ccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||||||| |||| |||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | |||||||||||    
T  33336112 c-taagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgttg 33336017  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  33336016 acccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaa 33335917  T
Q  400 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  33335916 gctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 33335818  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||    
T  33335817 acctaagaaacactctcatcaaag 33335794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5675017 - 5674685
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc-aagcaaacaacaacaaaac-agccctaa-ctagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||  || ||| |||||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  5675017 gatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaa--agagtaaaaagtttcccaagcaa-caacaacaaaaccagccctagtctagtgtagagcaacaccaca 5674921  T
Q  234 caagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
     ||||||   |||||||  ||||| ||||||   ||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5674920 -aagagaatacaaagca--aacaatataagcaagaaa-gaaagaacaaacacaccaaaga-gattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 5674826  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatg-aacaaaccctagattct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||    
T  5674825 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaagaaacaagacctagattct 5674727  T
Q  429 accctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5674726 accctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 5674685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 110 - 337
Target Start/End: Original strand, 5343297 - 5343527
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  5343297 aaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag- 5343395  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagc-aaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    |||||  |||  ||||||| |||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  |||| ||||||||| |||||||||||    
T  5343396 cctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaa---gcatacaagataaacgataaaggaaaacgaac-aaacaccgagcaagattgttg 5343491  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggaga 337  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  5343492 acccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 5674633 - 5674554
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5674633 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 5674554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757479
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 5757479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356132
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttactaagagttacaaga 21356132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077176
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaa 10077176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572241
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5572241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086485
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 31086485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 376
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630040
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaa 4630040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979610
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||| |||||| |||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaaga 31979610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 137 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30126044 - 30125944
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  30126044 gatgtgtggagcaagaggtagtgataatctatgagc-caaatggtctccaagctaactacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 30125946  T
Q  235 aa 236  Q
    ||    
T  30125945 aa 30125944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963796
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 22963796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824597
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23824597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 304 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801344
Alignment:
Q  304 ccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaaga 21801344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 374
Target Start/End: Original strand, 22709041 - 22709102
Alignment:
Q  314 caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22709041 caatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 386
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232942
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18232942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017482
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagccaa-tatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 355
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936651
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5017364 - 5017304
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5017364 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5017304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 472 - 549
Target Start/End: Original strand, 22709241 - 22709316
Alignment:
Q  472 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  22709241 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 22709316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 470
Target Start/End: Original strand, 22709116 - 22709188
Alignment:
Q  397 caagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22709116 caagctt-acacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 22709188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273276
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 365; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 25328568 - 25328105
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25328568 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaacaatgaaataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 25328469  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa-gaacaaaac 284  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  25328468 aagccaacaacaacaaaacaaccctaactagtgtatagcaaaaccacacaagagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaac 25328369  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328368 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 25328270  T
Q  385 gactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattac 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25328269 gactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattac 25328170  T
Q  485 aatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25328169 aatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttg 25328105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 7290210 - 7289750
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7290210 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 7290117  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| || |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  7290116 aacaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 7290017  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7290016 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 7289918  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7289917 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctatattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 7289818  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7289817 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 7289750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 85 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 39785116 - 39784665
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  39785116 agtgttgtgaatctggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtct 39785017  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaacaa 281  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39785016 ccaagccaataacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaaggaaagaacaa 39784917  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 381  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39784916 aacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtta 39784818  T
Q  382 caagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtga 480  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||    
T  39784817 caagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtga 39784719  T
Q  481 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39784718 ttacaatgtttttcccaacctaagagactctctcatcaaaggcacacaccccat 39784665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 115 - 470
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311477
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6311121 tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctagac 6311220  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  6311221 tagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacaccg-agaagattgttgacccagttcag 6311318  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacat 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  6311319 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaa 6311418  T
Q  411 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6311419 g-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaagatgaaccctaaaa 6311477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 35745208 - 35745624
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  35745208 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 35745307  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  35745308 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 35745402  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  35745403 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaag 35745502  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35745503 ctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 35745601  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  35745602 cctaagaaacactctcatcaaag 35745624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 470
Target Start/End: Original strand, 36979205 - 36979558
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-a 212  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  36979205 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctaga 36979300  T
Q  213 ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttca 311  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  36979301 ctagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttca 36979397  T
Q  312 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacac 408  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||    
T  36979398 gccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacac 36979496  T
Q  409 atgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36979497 aagaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 36979558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 137 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33038056 - 33037724
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaa--aacagcccta-actagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  33038056 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaa-caacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 33037959  T
Q  234 caa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33037958 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaagaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 33037862  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctac 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33037861 ggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctac 33037763  T
Q  431 cctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaa 469  Q
    || |  || ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  33037762 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 33037724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Original strand, 30655488 - 30655827
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  30655488 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 30655585  T
Q  234 ca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa---agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 329  Q
    || ||||||  ||||||| |||||||||||||   |||   ||||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30655586 catagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 30655684  T
Q  330 gggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagatt 426  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  30655685 gggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagatt 30655783  T
Q  427 ctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30655784 ctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 30655827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 8e-84
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18853418 - 18853083
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca-gcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||| |||| | |||||| ||| || || |||||||||||||    
T  18853418 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-tcaaatggtttccaagcaaacaacaaaaaaaaacgccctagacttgtttagagcaaaaccacac 18853320  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18853319 aaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 18853223  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattcta 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18853222 gagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagatttta 18853124  T
Q  430 ccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18853123 ccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18853083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 10684533 - 10684116
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  10684533 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 10684434  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  10684433 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 10684339  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  10684338 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaa 10684239  T
Q  400 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  10684238 gctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 10684140  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||    
T  10684139 acctaagatacactctcatcaaag 10684116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 4760325 - 4759991
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  4760325 gatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgag-caaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 4760228  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4760227 aaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacatc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggg 4760130  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||    
T  4760129 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctac 4760031  T
Q  431 cctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    || |  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4760030 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 4759991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18870809 - 18870477
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac- 234  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||   ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || || |||||||||||||     
T  18870809 gatgtgtggagcaagagataatggtaatctatgag-ttaaatggtttccaagcaaacaacaa-aaaac-gccctagacttgtttagagcaaaaccacaca 18870713  T
Q  235 aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggg 334  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18870712 aagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctggggg 18870616  T
Q  335 agagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa-ggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctac 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  ||  |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18870615 agagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttacaaaagggttacaagaaacaatagcattcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctac 18870517  T
Q  431 cctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18870516 cctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 18870477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 115 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10689412 - 10689058
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagccctaac 213  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  | |||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||      
T  10689412 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagt-ctaatggtttccaagcaa-caacaacaaaaacaaccctagt 10689317  T
Q  214 -tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaa--aagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagtt 309  Q
     ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10689316 gtagtgtagagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataag---taagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagtt 10689222  T
Q  310 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttac 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||  ||  |||||||||||| ||||    
T  10689221 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacagagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttac 10689123  T
Q  407 acatgaacaaaccctagattctaccc-tttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||| | || | ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  10689122 acaagaacaagccctagattctacccatatgttgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 10689058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261871
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 1261951  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||| | ||||| ||||||| | ||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  1261950 tagcttgcaagc-ttacacaagtacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 1261871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 470 - 551
Target Start/End: Original strand, 6311532 - 6311613
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6311532 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttgct 6311613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 18870424 - 18870345
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18870424 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 18870345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 458 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 25328070 - 25327979
Alignment:
Q  458 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  25328070 atgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcatcaaagacacacaacccataggatccctcctttg 25327979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 30655880 - 30655959
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30655880 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 30655959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071146
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 388  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 31071227  T
Q  389 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31071226 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 31071146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 10689003 - 10688924
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10689003 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 10688924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 18853030 - 18852951
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18853030 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 18852951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287985
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301242
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313236
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 33037671 - 33037592
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33037671 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacgaagacactcaaccctttggttccctcctttg 33037592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403240
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 26403240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 470 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 4759938 - 4759857
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgttttt-cccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4759938 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagactctctctacaaagacactcaaccctttggttacctcctttgc 4759857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 4456028 - 4456124
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||| |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  4456028 aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 4456124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 1261820 - 1261741
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  1261820 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 1261741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 36979611 - 36979689
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36979611 acccaaggtgattacaatgtttt-cccaacctaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttcccttctttg 36979689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412437
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 7412437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175755
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 19175755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799577
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 23799577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696609
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaa 4696609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702483
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 5702483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127318
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 6127318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 294 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  294 gattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752407
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 19752407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 31071095 - 31071035
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 530  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  31071095 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 31071035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 26288121 - 26288183
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26288121 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26288183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 26301378 - 26301440
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26301378 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26301440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 26313372 - 26313434
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  26313372 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaactcaagagattctctctacaaagacattcaaccc 26313434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 7412569 - 7412629
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  7412569 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 7412629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4696476 - 4696416
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4696476 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 4696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 292 - 358
Target Start/End: Original strand, 6813683 - 6813750
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 358  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6813683 aagattgttaacccagttcggtccaatataacctacactaggggagagagcagctctccaatccaata 6813750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  322 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 473 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 23799441 - 23799384
Alignment:
Q  473 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  23799441 caaggtgtttacaatgttc--cccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccc 23799384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 15044484 - 15044947
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15044484 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataca--atgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 15044581  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaaca 285  Q
    | | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||   ||||| ||||||||||||    
T  15044582 aaccaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaagagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaaca 15044681  T
Q  286 ccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag 385  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044682 cc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag 15044780  T
Q  386 actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattaca 485  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044781 actctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattaca 15044880  T
Q  486 atgtttttccc-aacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15044881 atgtttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 15044947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 86 - 551
Target Start/End: Original strand, 43592079 - 43592540
Alignment:
Q  86 gtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    |||||||||||||||||||||||      ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43592079 gtgttgtgaatccggttccaaag------tcacatcaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 43592172  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  43592173 aagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaa 43592272  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 383  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592273 caccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 43592371  T
Q  384 aga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||    
T  43592372 agaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgatt 43592471  T
Q  483 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43592472 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43592540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 43598525 - 43598985
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43598525 tgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 43598618  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  43598619 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 43598718  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598719 accgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 43598817  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43598818 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 43598917  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43598918 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43598985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 43604017 - 43604477
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43604017 tgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 43604110  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  43604111 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 43604210  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604211 accgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 43604309  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43604310 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 43604409  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43604410 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43604477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 43609509 - 43609969
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  43609509 tgttgtgaatccggttccaaag------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 43609602  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  43609603 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 43609702  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609703 accgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 43609801  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  43609802 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 43609901  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43609902 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 43609969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 1457445 - 1456986
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1457445 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 1457352  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    ||| ||| |||||||||    
T  1457351 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaaggaa-gaacaaaac 1457253  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457252 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 1457154  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1457153 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 1457054  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1457053 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 1456986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 84 - 551
Target Start/End: Original strand, 27444768 - 27445231
Alignment:
Q  84 tagtgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27444768 tagtgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtct 27444861  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaa 281  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  27444862 ccaagcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaa 27444961  T
Q  282 aacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 381  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27444962 aacaccgag-aagattgttgacccagttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtta 27445060  T
Q  382 caaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtga 480  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  27445061 caagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtga 27445160  T
Q  481 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27445161 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 27445231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 27449615 - 27450075
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  27449615 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctcca 27449708  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  27449709 agcaaacaacaacatagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 27449808  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449809 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 27449907  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  27449908 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 27450007  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27450008 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 27450075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 28807868 - 28807429
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca---aagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||      
T  28807868 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 28807769  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaa--ccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaaga 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  28807768 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaaaccactcaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaaga 28807671  T
Q  278 acaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  28807670 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaag 28807572  T
Q  378 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaagg 477  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  28807571 gttacaagaatctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaagg 28807473  T
Q  478 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  28807472 tgattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaag 28807429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 109 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 37561715 - 37561300
Alignment:
Q  109 aaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacag 206  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  37561715 aaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag 37561616  T
Q  207 cc-ctaactagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgac 303  Q
    ||  | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37561615 cctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgac 37561517  T
Q  304 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagct 402  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||    
T  37561516 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagct 37561417  T
Q  403 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaaccca 502  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37561416 ttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatg-ttttcccaaccta 37561319  T
Q  503 agagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||||| || |||||    
T  37561318 agaaacactcacatcaaag 37561300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 113 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 37556889 - 37556478
Alignment:
Q  113 cttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcc-c 209  Q
    |||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||      
T  37556889 cttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagccta 37556790  T
Q  210 taactagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaa-agaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccag 307  Q
    | ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  | ||||| ||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37556789 tgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagcataaacaagataaacggtaaatggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttgacccag 37556691  T
Q  308 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaagctttac 406  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||    
T  37556690 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaaggttacaagtatctagcttatcaagctttac 37556591  T
Q  407 acatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagag 506  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||     
T  37556590 acatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgattacaatg-ttttcccaacctaagaa 37556493  T
Q  507 acactctcaacaaag 521  Q
    |||||| || |||||    
T  37556492 acactcacatcaaag 37556478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 115 - 469
Target Start/End: Original strand, 30631231 - 30631586
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  30631231 tcacacaaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagcaa-caacaacaaaacagccctagac 30631329  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacaca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaa--aagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttc 310  Q
    ||||||||||||||| |||| | | ||||  ||||||| ||||||||||||   |||  ||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||    
T  30631330 tagtgtatagcaaaatcacatatatagataacaaagcataaacaagataag---taagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgactcagttc 30631425  T
Q  311 agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacac 408  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  30631426 agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacac 30631525  T
Q  409 atgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaa 469  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  30631526 atgaacaaaccatagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaa 30631586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 2785192 - 2785608
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2785192 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 2785291  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2785292 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 2785386  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  2785387 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaag 2785486  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2785487 ctttactcatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 2785585  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  2785586 cctaagaaacactctcatcaaag 2785608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 33791133 - 33791549
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  33791133 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 33791232  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |  |||    || ||||||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33791233 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaag---catacaagataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 33791327  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  33791328 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaag 33791427  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  33791428 ctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttggtattttcccaccctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 33791526  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  33791527 cctaagaaacactctcatcaaag 33791549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 214 - 470
Target Start/End: Original strand, 31180138 - 31180394
Alignment:
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||    ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31180138 tagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagaaagaaa-gaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 31180235  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacat 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  31180236 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaa 31180335  T
Q  411 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31180336 g-acaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccataaaa 31180394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 31397261 - 31396843
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||| |    
T  31397261 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacatc 31397162  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaaca-aaacaccgaacaagattgttgac 303  Q
    | |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  | | ||||||||| |||||||||||||    
T  31397161 c-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacaaacaaacaccgagcaagattgttgac 31397066  T
Q  304 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaagc 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||    
T  31397065 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaagc 31396966  T
Q  402 tttacacatg--aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    |||||||| |  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31396965 tttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 31396867  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||    
T  31396866 acctaagatacactctcatcaaag 31396843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 31402118 - 31401700
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31402118 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 31402019  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||| ||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  31402018 c-taagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 31401924  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaag 400  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  31401923 cccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaag 31401824  T
Q  401 ctttacacatg--aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccc 496  Q
    ||||||||| |  || |||| ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||    
T  31401823 ctttacacaagacaaaaaactctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttccc 31401725  T
Q  497 aacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||    
T  31401724 aacctaagatacactctcatcaaag 31401700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 33767996 - 33768417
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    |||||||||| |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  33767996 aaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatgacctccaagctaacaacaacaaaacagc 33768095  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag--aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| ||||||||||||||||| | |||| |  |||    || ||| ||||| || ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  33768096 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaag---catacaggataaacgataaaaggaaaagaacaaa-caccgagcaagattgttga 33768190  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  33768191 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttttcaag 33768290  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctacccttt--ggtattttccc-actc--tcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--tttt 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||| || |   ||||  |||||||   || |||||||||||||||||||  ||||    
T  33768291 ctttacacatgaacaaaccctaga-cctaccctttcggttattttccctacccctccacactatgaaccaataatcccaaggtgattacaatgttgtttt 33768389  T
Q  494 cccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33768390 cccaacctaagaaacactctcatcaaag 33768417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 115 - 470
Target Start/End: Original strand, 24135680 - 24136028
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    ||||||||||||||   |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||   |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24135680 tcacaccaatgaaa---ataaagatgtgtggagcaaaagggagtggtaatctatgagt--aaagagtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagac 24135774  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||| |   |||||||  ||||||||||||   ||||| ||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  24135775 tagtgtagagcaacaccaca--agataatacaaagca--aacaagataagctagaaaaggaagaacaaacacacc-aagaagattgttgacccagttcag 24135869  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacat 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||||| ||||||||| |   |||| | ||||| |||||||     
T  24135870 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaa 24135968  T
Q  411 gaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  24135969 gaacaagtcctagattctaccctttggtgtttccccactctcacaatgtgaaccctaaaa 24136028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Original strand, 38192064 - 38192353
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  38192064 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38192159  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38192160 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 38192258  T
Q  376 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38192259 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38192353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Original strand, 38219289 - 38219578
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaaga 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| ||    
T  38219289 gtctccaagcaa-caacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaacaccacacaagagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-ga 38219384  T
Q  278 acaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa 375  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  38219385 acaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaa 38219483  T
Q  376 aggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  38219484 gggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 38219578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387842
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 35387762  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||| ||  ||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  35387763 tagcttgcaagc-ttacacaagaataagtcctagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 35387842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 30631640 - 30631719
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30631640 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 30631719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 31180447 - 31180526
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31180447 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 31180526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 24136080 - 24136159
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24136080 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactttctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 24136159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353333
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 9353333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932351
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36932351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281848
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10281848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464628
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 15464628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916972
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||    
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 11916972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 35387893 - 35387972
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  35387893 acccaaggtgattacaatgttttttccaacccaagagaccctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 35387972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 14520230 - 14520326
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  14520230 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 14520326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003970
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| || ||||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaag 17003970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880396
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3880396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 12084269 - 12084176
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  12084269 attgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 12084176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588843
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19588843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832343
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 28832343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 38219629 - 38219708
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  38219629 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 38219708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127423
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || || |||||||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttacaa 42127423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300612
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgtta 371  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||| ||||||||| | |||||||||||| || || ||||||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatccactaagatgaaagtgtta 31300612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 24553395 - 24553318
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |  ||| |||||||||    
T  24553395 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacccttaagttacctcctttg 24553318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 11181700 - 11181641
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 531  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  11181700 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaacc 11181641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 296 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctcc 349  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 7160770 - 7160712
Alignment:
Q  472 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  7160770 ccaaggtgattacaatgttt--cccaatccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 7160712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 532
Target Start/End: Original strand, 14520461 - 14520519
Alignment:
Q  472 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  14520461 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 14520519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 24553604 - 24553520
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  24553604 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctatgggagagagcagc-ctccactccactaagatgaaagtgttacaa 24553520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 530
Target Start/End: Original strand, 28832486 - 28832544
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 530  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  28832486 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaac 28832544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 75)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 22173484 - 22173019
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22173484 tgttgtgaatccggtttcaaacaaatcttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 22173385  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22173384 agcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaataagataagcggtaaaaggaagaacaaaac 22173286  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22173285 accgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 22173187  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22173186 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcctaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 22173087  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22173086 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctactttgct 22173019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 87 - 534
Target Start/End: Original strand, 18656228 - 18656677
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18656228 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 18656326  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa- 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  18656327 agctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaa 18656424  T
Q  284 ---caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 380  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18656425 aaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 18656524  T
Q  381 acaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtga 480  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || ||||||||||    
T  18656525 acaagactctagcattcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggtga 18656623  T
Q  481 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  18656624 ttacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 18656677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 115 - 470
Target Start/End: Original strand, 7167072 - 7167425
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  7167072 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgag-caaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagac 7167167  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  7167168 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 7167265  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacaca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| |||||||    
T  7167266 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacaca 7167364  T
Q  410 tgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  7167365 agaacaaaccctagattctaccctttggtatttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 7167425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 108 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2677358 - 2676939
Alignment:
Q  108 gaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2677358 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2677259  T
Q  206 gccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgtt 300  Q
    ||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  2677258 gcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgtt 2677163  T
Q  301 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tca 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||    
T  2677162 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatca 2677063  T
Q  399 agctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccc 496  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  2677062 agctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttccc 2676964  T
Q  497 aacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||    
T  2676963 aacctaagaaacactctcatcaaag 2676939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 134 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28504107 - 28503780
Alignment:
Q  134 aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccac 232  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  28504107 aatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagcaa-caacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaaccac 28504010  T
Q  233 acaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 331  Q
    |||| |||||  ||||||| ||||||||          ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28504009 acaaagagataacaaagcataaacaaga----------aaggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgg 28503921  T
Q  332 gggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattcta 429  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  28503920 ggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattcta 28503821  T
Q  430 ccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28503820 ccctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28503780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 108 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2673202 - 2672783
Alignment:
Q  108 gaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  2673202 gaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatggcctccaagctaacaacaacaaaaca 2673103  T
Q  206 gccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgtt 300  Q
    ||| |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  ||| ||| || |||||||| |  | |||||||| ||||||| |||| | ||||||||||    
T  2673102 gcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaa-gcataa-caagataaaccatgaaaagaaaagaacaaa-caccaagcaagattgtt 2673007  T
Q  301 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tca 398  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||    
T  2673006 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatca 2672907  T
Q  399 agctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccc 496  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||  |||||||    
T  2672906 agctttacacatgacaaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccatcctcacactatgaaccttaaatcccaaggtgattacaatgttgttttccc 2672808  T
Q  497 aacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||    
T  2672807 aacctaagaaacactctcatcaaag 2672783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 8512032 - 8512450
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8512032 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 8512131  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataag-cggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8512132 c-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaag---catacaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 8512227  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  8512228 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaa 8512327  T
Q  400 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8512328 gctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 8512426  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||    
T  8512427 acctaagatacactctcatcaaag 8512450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 8516912 - 8517330
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  8516912 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 8517011  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataag-cggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||| ||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||  || |||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  8517012 c-taagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaag---catacaagataaaacgataaacgaaaacgaacaaaacaccgagcaagattgttg 8517107  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  8517108 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaa 8517207  T
Q  400 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8517208 gctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttccca 8517306  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| |||| ||||||||| |||||    
T  8517307 acctaagatacactctcatcaaag 8517330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 141 - 521
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968340
Alignment:
Q  141 tgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aag 237  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaag 24968055  T
Q  238 agatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggggga 335  Q
    || |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||    
T  24968056 agctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttgggga 24968151  T
Q  336 gagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccct 433  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24968152 gagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgaga-tctaccct 24968250  T
Q  434 ttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24968251 ttggtactttcccatcctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 24968340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2671836 - 2671502
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| || ||||||||||    
T  2671836 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagtctagtgtagagaaaaaccacac 2671738  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     |||||||  ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2671737 aaagagataacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 2671641  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||  | ||||| ||||||| || ||| |||||||||||||    
T  2671640 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagattgcaagc-ttacacaagaccaagccctagattctac 2671542  T
Q  431 cctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    || |  || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2671541 ccatatgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 2671502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 8739314 - 8738982
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccaca 233  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||| || || | ||||| |||||    
T  8739314 gatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccaca 8739216  T
Q  234 caa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8739215 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 8739119  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattcta 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  8739118 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattcta 8739020  T
Q  430 ccctttggtattttcccactctcacaacatgaacccta 467  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  8739019 cccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 8738982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 137 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 9091552 - 9091220
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa-cagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccaca 233  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||| ||| || || | ||||| |||||    
T  9091552 gatgtgtggagcaagaaatagtggtaatctatgagt-caaatggtttccaagcaaataacaacaaaaaccgccctagacttgtttagaacaaaaaccaca 9091454  T
Q  234 caa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9091453 caaagagataccaaagca-aaacaagataagcaagaaaggaa-gaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 9091357  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattcta 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  9091356 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaatccctagattcta 9091258  T
Q  430 ccctttggtattttcccactctcacaacatgaacccta 467  Q
    ||| |  |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  9091257 cccatatgtatttccccactctcacaatatgaacccta 9091220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 32475301 - 32475717
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | || ||||||||||||||    
T  32475301 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaacag 32475400  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  32475401 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 32475495  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaag 400  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | |||||    
T  32475496 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaag 32475594  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccca 497  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||||||  ||||||||    
T  32475595 ctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttccca 32475693  T
Q  498 acccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||| ||||  |||||||| |||||    
T  32475694 acctaagattcactctcatcaaag 32475717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Original strand, 32480158 - 32480575
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat--aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaaca 205  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||| | || |||||||||||||    
T  32480158 aaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaaactaatcaacaacaaaaca 32480257  T
Q  206 gccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgtt 300  Q
    ||| |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | ||||||||||    
T  32480258 gcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaaccaagattgtt 32480352  T
Q  301 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||  ||||||||| |||||| | ||||    
T  32480353 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttacaaagagttacaagaatctagcttatcaa 32480451  T
Q  400 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggt-attttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttccc 496  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||| | | |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||| ||||||||||||  |||||||    
T  32480452 gctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttgataaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaagatgattacaatgttgttttccc 32480550  T
Q  497 aacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||| ||||  |||||||| |||||    
T  32480551 aacctaagattcactctcatcaaag 32480575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 335 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501613
Alignment:
Q  335 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaaga--ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccc 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaagaaactctagccttcaagctttacacaagaataaaccctagattctaccc 28501651  T
Q  433 tttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28501650 tttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 28501613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 274 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372712
Alignment:
Q  274 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttac 372  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40372908 aagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 40372810  T
Q  373 aaaaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||| ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |  || ||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  40372809 aaagggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagccctagattctacccatatgtgtttccccactctcataatatgaaccctaaaa 40372712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Original strand, 8477212 - 8477545
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc-aagcaaacaacaacaaaac-agcccta-actagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||  |||| |||  || ||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||||||    
T  8477212 gatgtgtggagcaaaagatagtggtaatcaa--agagtaaaaagtttcccaagcaa-caacaacaaaaccagccctagactagtgtagaacaacaccaca 8477308  T
Q  234 caagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 332  Q
     |||| |   |||||||  ||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8477309 -aagataatacaaagca--aacaagataagcaagaaa-gaaagaacaaacacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctggg 8477403  T
Q  333 ggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacac-atgaacaaaccctagattct 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||| | ||||| |||||| || |||||  ||||||||||    
T  8477404 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcttgcaagc-ttacacaataaacaagacctagattct 8477502  T
Q  429 accctttggtattt-tcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  8477503 accctttggtgtttcccccactctcacaatatgaaccctaaaa 8477545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 269 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26928709 - 26928507
Alignment:
Q  269 aaagaaagaacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaag 366  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  26928709 aaagaaagaacaaacacaccaaa--agattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaag 26928612  T
Q  367 tgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaacc 464  Q
    ||||||||| |||||||||  |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||    
T  26928611 tgttacaaagggttacaagaaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaacc 26928513  T
Q  465 ctaaaa 470  Q
    ||||||    
T  26928512 ctaaaa 26928507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 110 - 340
Target Start/End: Original strand, 10207750 - 10207983
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||     
T  10207750 aaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacag- 10207848  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggt-aaaag-aaagaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    |||||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  | |||||  |||||||||| |  | ||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  10207849 cctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaac-aagca-taacaagataaaccatgaaaagaaaagaac-aaacaccaagcaagattgttga 10207945  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagag 340  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10207946 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143501
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 388  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 32143420  T
Q  389 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  32143421 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 32143501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 470 - 550
Target Start/End: Complemental strand, 8738926 - 8738846
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgc 550  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8738926 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaacccattggttccctcctttgc 8738846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 2671449 - 2671370
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2671449 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 2671370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 40372659 - 40372580
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40372659 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 40372580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306128
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| |       
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 1306048  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||  | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  1306049 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 1306128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 7167478 - 7167558
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7167478 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 7167558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 546
Target Start/End: Original strand, 8477598 - 8477674
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcct 546  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8477598 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcct 8477674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 9091164 - 9091085
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9091164 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 9091085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 28501560 - 28501480
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-attggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  28501560 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcatcccttttggttccctcctttg 28501480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 28503727 - 28503647
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc-attggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28503727 acccaaggtgattacaatatttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccttttggttccctcctttg 28503647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453138
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 388  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 27453057  T
Q  389 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  27453058 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaattcctattttctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 27453138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8370573 - 8370477
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8370573 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8370477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974943
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 27974943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552873
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 18552873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711319
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21711319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264446
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 16264446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 386
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029190
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 36029190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736295
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 1736295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 30709877 - 30709780
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  30709877 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaaga 30709780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715992
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3715992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592772
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40592772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438311
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||| |||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 48438311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794704
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||| |||  | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 6794704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299085
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 26299085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417493
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-agaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatccactaagaagaaagtgttacaa 1417493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795878
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||| |||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaaga 25795878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923896
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttc-agccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaaga 47923896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466375
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 37466375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 530
Target Start/End: Original strand, 1306179 - 1306239
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaac 530  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||    
T  1306179 acccaaggtgtttacaatgtttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaac 1306239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 39040079 - 39039995
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39040079 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 40844651 - 40844748
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||  |||||| | |||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  40844651 caagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 40844748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328359
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || || |||||||||||||    
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttacaa 3328359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 4387014 - 4386947
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 358  Q
    ||||||||| |||||||| ||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4387014 aagattgtttacccagtttagttcagtatgacctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 24695252 - 24695154
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  24695252 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 24695154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 473 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 4386831 - 4386774
Alignment:
Q  473 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  4386831 caaggtgattacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 4386774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 27986313 - 27986236
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  27986313 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttg 27986236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 139 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 40373043 - 40372980
Alignment:
Q  139 tgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaa 203  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  40373043 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatg-ggcaaaatggtttccaagcaaacaacatcaaaa 40372980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 359
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 359  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 23392106 - 23392166
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23392106 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23392166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 24695023 - 24694963
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  24695023 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 24694963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 26928456 - 26928396
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  26928456 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 26928396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 36029322 - 36029382
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36029322 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36029382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 40592639 - 40592579
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  40592639 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 40592579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 313 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3323755 - 3323693
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  3323755 ccaatatgacctaatctgggagagagaacagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 3323693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 473 - 532
Target Start/End: Original strand, 21711454 - 21711511
Alignment:
Q  473 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  21711454 caaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 21711511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 473 - 532
Target Start/End: Original strand, 23410529 - 23410586
Alignment:
Q  473 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  23410529 caaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 23410586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 32143552 - 32143629
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||   || | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  32143552 acccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcatcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 32143629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 339
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagaga 339  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 47923761 - 47923704
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 529  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  47923761 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagattctcactacaaagacactcaa 47923704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 355; Significance: 0; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9224698 - 9224231
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa--ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctc 184  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9224698 tgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctc 9224599  T
Q  185 caagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaa 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9224598 caagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaa 9224500  T
Q  283 acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttac 382  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9224499 acaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttag 9224401  T
Q  383 aaga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgat 481  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  9224400 aagaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgat 9224301  T
Q  482 tacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9224300 tacaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 9224231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9229484 - 9229018
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9229484 tgttgtgaatccggttaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 9229385  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9229384 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaa 9229286  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 383  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9229285 caccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaga 9229187  T
Q  384 aga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  9229186 agaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 9229087  T
Q  483 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9229086 acaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 9229018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 45348118 - 45347658
Alignment:
Q  78 cacaggtagtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagca 175  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  45348118 cacaggttctgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaaca 45348019  T
Q  176 aatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-a 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45348018 aatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagga 45347919  T
Q  274 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 373  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45347918 aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 45347820  T
Q  374 aaaggttacaagac-tctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacc 472  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||    
T  45347819 aaaggttacaagacctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaccc 45347720  T
Q  473 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  45347719 caaggtgattacaatgtttttcccaacctaagagacactctcatcaaaggcacacaccccat 45347658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 78 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 45357597 - 45357138
Alignment:
Q  78 cacaggtagtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagca 175  Q
    |||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  45357597 cacaggttctgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaaca 45357498  T
Q  176 aatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaag-a 273  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45357497 aatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacacaagagattccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagga 45357398  T
Q  274 aagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 373  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45357397 aagaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 45357299  T
Q  374 aaaggttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaaccc 473  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||    
T  45357298 aaaggttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaacccc 45357199  T
Q  474 aaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  45357198 aaggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 45357138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 548
Target Start/End: Original strand, 51520258 - 51520715
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51520258 tgttgtgaatccggttccaaac------tcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 51520351  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  51520352 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 51520451  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520452 accgag-aagattgttgacccagttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 51520550  T
Q  385 ga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatta 483  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  51520551 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtgtttccccactctcttaatatgaaccctaaaacccaaggtgatta 51520650  T
Q  484 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctccttt 548  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51520651 caatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctccttt 51520715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 304; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 85 - 549
Target Start/End: Original strand, 3813814 - 3814281
Alignment:
Q  85 agtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 181  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813814 agtgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggt 3813913  T
Q  182 ctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaa-ccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||| |  | ||||| |||||||||||||   ||| ||| |||    
T  3813914 ctccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa-gaa 3814011  T
Q  279 caaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaagg 378  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3814012 caaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaagg 3814111  T
Q  379 ttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggt 478  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3814112 ttacaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggt 3814210  T
Q  479 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  3814211 gattacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaagacacacaccccataggatccctcctttg 3814281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 87 - 534
Target Start/End: Original strand, 5732458 - 5732907
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5732458 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaa-atacaatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctcca 5732556  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa- 283  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |  |||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||||||     
T  5732557 agctaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagca--aacaagataaacggtaaaggaaagaacaaaaa 5732654  T
Q  284 ---caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 380  Q
       ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5732655 aaacactgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 5732754  T
Q  381 acaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtga 480  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| || ||||||||||    
T  5732755 acaagactctagctttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactataaacccttaatcccaaggtga 5732853  T
Q  481 ttacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||| || |||||    
T  5732854 ttacaatgtttttcccaacctaagaaacactctcatcaaaggcacacaccccat 5732907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 87 - 521
Target Start/End: Original strand, 18855519 - 18855956
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    |||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  |    
T  18855519 tgttgtgaatccggttctacaagcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggctt 18855618  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaaca 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18855619 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 18855716  T
Q  281 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18855717 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 18855815  T
Q  381 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtg 479  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||    
T  18855816 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccacaatcccaaggtg 18855914  T
Q  480 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| |||||    
T  18855915 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaag 18855956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 87 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 56146995 - 56146664
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    |||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  56146995 tgttgtgaatccggttccaaa------ttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctcca 56146902  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||    
T  56146901 agcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtgataaaaggaagaacaaaac 56146802  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146801 accgag-aagattgttggtccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 56146703  T
Q  385 g-actctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 422  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  56146702 gaactctagccttcaagctttacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Original strand, 24741788 - 24742121
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaac-aaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  24741788 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 24741885  T
Q  235 -aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 333  Q
     ||||||| |||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24741886 aaagagataccaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 24741982  T
Q  334 gagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctac 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24741983 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagc-ttacacaagaacaaaccctagattctac 24742081  T
Q  431 cctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24742082 cctttggtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24742121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 115 - 468
Target Start/End: Original strand, 29760470 - 29760821
Alignment:
Q  115 tcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagcccta-ac 213  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | |  ||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  29760470 tcacaccaatgaaa--aacaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaat-aaacaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacaaccctagac 29760565  T
Q  214 tagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcag 312  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  29760566 tagtgtagagcaaaaccacacaaagagagaacaaagca-aaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcag 29760662  T
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacaca 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| ||||| |||||||    
T  29760663 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagcctgcaagc-ttacaca 29760761  T
Q  410 tg-aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaa 468  Q
     | |||||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  29760762 agaaacaagacctagattctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaa 29760821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 464 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 18712677 - 18712590
Alignment:
Q  464 cctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18712677 cctaaaacccaaggtgataacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 18712590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 24742174 - 24742253
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24742174 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 24742253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Original strand, 29760874 - 29760954
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttt-tcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29760874 acccaaggtgattacaatgttttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 29760954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468542
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047476
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10047476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246091
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 39246091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985552
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-act 388  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |      
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaa 31985632  T
Q  389 ctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
     |||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||  |||||||| || ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31985631 atagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcctaatttctacccatttgt-gtttcccactctcacaatgtgaaccctaaaa 31985552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315230
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36315230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329439
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36329439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623293
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16623293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396672
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||  |||||||||    
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgcaaagagttacaaga 5396672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152449
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gagaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaag 38152449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 289 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 5269291 - 5269204
Alignment:
Q  289 aacaagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  5269291 aacaagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796519
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 3796519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 293 - 376
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143345
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaa 5143345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 293 - 376
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147763
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaa 5147763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24333896
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||| || |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaag 24333896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 386
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777645
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3777645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 297 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743425
Alignment:
Q  297 tgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 6743425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16630778 - 16630680
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||| ||||||||| ||||| | |||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16630778 caaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16630680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 25862120 - 25862035
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  25862120 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 28468404 - 28468325
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | ||||||||||| |||||    |||||||||||||    
T  28468404 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacacttaaccctagagttccctcctttg 28468325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 529
Target Start/End: Original strand, 5112466 - 5112523
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 529  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  5112466 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcacaacaaagacactcaa 5112523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Original strand, 3777778 - 3777838
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  3777778 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 3777838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5396539 - 5396479
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5396539 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5396479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 16623161 - 16623101
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  16623161 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 16623101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 16628740 - 16628680
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  16628740 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 16628680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 39774380 - 39774305
Alignment:
Q  313 ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaa-aggttacaaga 386  Q
    |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||| |||||| |||||||||||    
T  39774380 ccaatatgacctactctgggggatagagcagctctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaataggttacaaga 39774305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 376
Target Start/End: Original strand, 54867183 - 54867269
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| | ||||| |||| ||||||||||    
T  54867183 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaa 54867269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 177
Target Start/End: Original strand, 3813734 - 3813764
Alignment:
Q  147 gcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaa 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3813734 gcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaa 3813764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 472 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 5269066 - 5269008
Alignment:
Q  472 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  5269066 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 5269008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 529
Target Start/End: Complemental strand, 6743283 - 6743226
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaa 529  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  6743283 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcgctacaaagacactcaa 6743226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 473 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 25861898 - 25861841
Alignment:
Q  473 caaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  25861898 caaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 25861841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 35352 - 34886
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaa-ccttcacaccaatgaaataaataatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35352 tgttgtgaatccggttaaaaaaaaaaccttcacaccaatgaaataaacaatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctcc 35253  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35252 aagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagca-aaacaagataagcggtaaaaggaagaacaaaa 35154  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 383  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35153 caccgag-aagattgttaacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaga 35055  T
Q  384 aga-ctctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 482  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  35054 agaactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttggtgtttccccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgatt 34955  T
Q  483 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34954 acaatgttttcccaaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttgct 34886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 87 - 551
Target Start/End: Original strand, 41398032 - 41398497
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  41398032 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctcc 41398131  T
Q  186 aagcaaacaacaacaa---aacagccctaactagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaac 279  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||      ||| ||||||    
T  41398132 aagcaaacaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaaagcataaacaagataag------aaggaagaac 41398225  T
Q  280 aaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 379  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41398226 aaaacaccgag-aagattgttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 41398324  T
Q  380 tacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtg 479  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  41398325 tacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtg 41398424  T
Q  480 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41398425 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 41398497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 82 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25445387 - 25444931
Alignment:
Q  82 ggtagtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaat 178  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||    
T  25445387 ggtagtgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaat 25445288  T
Q  179 ggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaa 275  Q
    ||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||  ||||||||||| ||||||||| |||    
T  25445287 ggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcgtaaacaagataaacggtaaaaggaaa 25445190  T
Q  276 gaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 375  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25445189 gaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaa 25445090  T
Q  376 aggttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaaccca 474  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  25445089 aggttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-gctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatccca 25444991  T
Q  475 aggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25444990 aggtgattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25444931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 189 - 551
Target Start/End: Original strand, 41390483 - 41390842
Alignment:
Q  189 caaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaa--ccacacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaaca 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||  ||||||| ||||||||||||      ||| ||||||||||||    
T  41390483 caaacaacaacaaaacagccctaactagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagatatcaaagcataaacaagataag------aaggaagaacaaaaca 41390576  T
Q  286 ccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag 385  Q
     |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390577 tcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag 41390675  T
Q  386 actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattaca 485  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41390676 actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattaca 41390775  T
Q  486 atgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  41390776 atgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaatccatttggttccctcctttgct 41390842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 87 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 44024163 - 44023716
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||  |||    
T  44024163 tgttgtgaatccgattccaaataaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttcc 44024064  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaa 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  44024063 aagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaatggtaaaggaaagaacaaaa 44023966  T
Q  284 caccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttaca 383  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44023965 caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggttaca 44023867  T
Q  384 agactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgatt 482  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||||||    
T  44023866 agactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtgatt 44023768  T
Q  483 acaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  44023767 acaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 44023716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 87 - 534
Target Start/End: Original strand, 39445292 - 39445742
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||  |    
T  39445292 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggctt 39445391  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaaca 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  39445392 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 39445489  T
Q  281 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  39445490 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 39445588  T
Q  381 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtg 479  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  39445589 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 39445687  T
Q  480 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  39445688 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 39445742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 86 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 1055305 - 1054854
Alignment:
Q  86 gtgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||       
T  1055305 gtgttgtgaatccggttctacaatcgaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtct 1055206  T
Q  183 tccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaac 279  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  1055205 tccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaac 1055108  T
Q  280 aaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggt 379  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  1055107 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggt 1055009  T
Q  380 tacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggt 478  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||||||||    
T  1055008 tacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggt 1054910  T
Q  479 gattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  1054909 gattacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 1054854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 137 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24787617 - 24787280
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaa--acaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaacca 231  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||  ||||||||||||  |||||||| |||  |||| ||||||||||    
T  24787617 gatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaacca 24787519  T
Q  232 cacaa-gagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 330  Q
    ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||   ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24787518 cacaaagagataacaaagca--aacaagataagcaagaaaaggaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 24787422  T
Q  331 ggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaag--actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattct 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24787421 ggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaagggttacaagaaacaatagccttcaagcattacacaagaacaaatcctagattct 24787322  T
Q  429 accctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  24787321 accctttggtgtttcccaactctcacaatatgaaccctaaaa 24787280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 43988734 - 43988314
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  43988734 aaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 43988635  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    | |||  ||| ||||||||| |||||||| ||||| |  |||    || |||||||||   |   |||||||| |||||||||||| | ||||||||||     
T  43988634 c-taagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttt 43988539  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaa 399  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  43988538 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaa 43988439  T
Q  400 gctttacacatg--aacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcc 495  Q
    |||||||||| |  || |||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||    
T  43988438 gctttacacaagacaaaaaaccctaga-tctaccctttggcattttcccatcctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcc 43988340  T
Q  496 caacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||    
T  43988339 caacctaagaaacactctcatcaaag 43988314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24202973 - 24202686
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaa 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| |||    
T  24202973 gtctccaagcaaacaacaacaaaacagccctaaactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-gaa 24202879  T
Q  279 caaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaa 376  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  24202878 caaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaag 24202780  T
Q  377 ggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24202779 ggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 24202686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Original strand, 41386543 - 41386650
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  41386543 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 41386642  T
Q  186 aagcaaac 193  Q
    ||||||||    
T  41386643 aagcaaac 41386650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 396 - 534
Target Start/End: Complemental strand, 25439875 - 25439738
Alignment:
Q  396 tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgtttttcc 495  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25439875 tcaagctttacacatgaacaaaccctagag-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaatcccaaggtgattacaatgtttttcc 25439777  T
Q  496 caacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    ||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  25439776 caacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 25439738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358760
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 19358840  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19358839 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19358760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361349
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 19361429  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||  | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19361428 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19361349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19379989
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 19380069  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||  | ||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19380068 tagtttgcaagc-ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19379989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 471 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 24787226 - 24787148
Alignment:
Q  471 cccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24787226 cccaaggtgattataatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccctttggttccctcctttg 24787148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26644994 - 26644898
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  26644994 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 26644898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703946
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 47703946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 24202635 - 24202556
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  24202635 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctctacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttg 24202556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073025
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19073025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120915
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 19120915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Original strand, 50958683 - 50958747
Alignment:
Q  20 aacacaagatgcatcctcccttgcttttatatgacagtgatacgttaattgtttttaacacaggtag 86  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50958683 aacacaagatgcatcctcccttgcttttat--gacagtgatacgttaattgtttttaacacaggtag 50958747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124516
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 16124516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104372
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 27104372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281804
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 3281804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476348
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaag 9476348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598485
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 13598485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651898
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 29651898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 292 - 384
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775759
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098837
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 47098837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604624
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 13604624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21536666 - 21536570
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaata-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| |  || | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  |||||||||    
T  21536666 aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaagagttacaaga 21536570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 19366174 - 19366095
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  19366174 acccaaggtgtttacaatatttttcccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 19366095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Original strand, 32889438 - 32889523
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  32889438 caagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaa 32889523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 19361298 - 19361220
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  19361298 acccaaggtgtttacaatgtttt-cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 19361220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 295 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102874
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 19358709 - 19358631
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  19358709 acccaaggtgtttacaatgtttt-cccaacccaaaagatcctcactacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 19358631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 403 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19366292 - 19366225
Alignment:
Q  403 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    ||||||| ||||||  |||||||||||||| || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19366292 ttacacaagaacaagacctagattctacccatttgtgtttccccactctctcaatatgaaccctaaaa 19366225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 47098693 - 47098633
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47098693 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcgctacaaagacactcaaccc 47098633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 47102707 - 47102647
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  47102707 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagaacctcactacaaagacactcaaccc 47102647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 470 - 531
Target Start/End: Original strand, 3281936 - 3281995
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 531  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  3281936 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 3281995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 13604490 - 13604413
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||    |||||||||||||    
T  13604490 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagatactcaaccctaaagttccctcctttg 13604413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 472 - 531
Target Start/End: Original strand, 37069998 - 37070055
Alignment:
Q  472 ccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacc 531  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||    
T  37069998 ccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaacc 37070055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 87 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 9930 - 9514
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9930 tgttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctcc 9831  T
Q  186 aagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaagaacaaaac 284  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||    |||| |||||||||||    
T  9830 aaccaaacaacaacaaaacagccctaagctagtatatagcaaaaccacacaagagctaac-aagcataaacaagataagc-aagaaaggaagaacaaaac 9733  T
Q  285 accgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 384  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732 accg-agaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggttacaa 9634  T
Q  385 gactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattac 484  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  9633 gactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctaga-tctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaaggtgattac 9535  T
Q  485 aatgtttttcccaacccaaga 505  Q
    |||||||||||||||| ||||    
T  9534 aatgtttttcccaacctaaga 9514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 378 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3672
Alignment:
Q  378 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaagg 477  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagat-ctaccctttggtattttcccactctcacactatgaaccctaaaacccaagg 3747  T
Q  478 tgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccca-ttggttccctcctttgct 551  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3746 tgattacaatgtttttcctaacctaagagacactctcaacaaagacactcaacccatttggttccctcctttgct 3672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 170 - 28
Alignment:
Q  88 gttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcca 186  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||    
T  170 gttgtgaatccggtttcaaacaaaccttcacaccaattaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctcca 77  T
Q  187 agcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacac 234  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  76 agtaaacaacaacaaaacagccctaagctagtgtatagcaaaaccacac 28  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 256; Significance: 1e-142; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 87 - 534
Target Start/End: Original strand, 155 - 605
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtct 183  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||  |    
T  155 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggctt 254  T
Q  184 ccaagcaaacaacaacaaaacagccctaa-ctagtgtatagcaaaaccacacaagagatccca-aagcacaaacaagataagcggtaaaag-aaagaaca 280  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  255 ccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagctagtgtatagcaaaaccacacaa-agagctaacaagcataaacaagataaacggtaaaaggaaagaaca 352  T
Q  281 aaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaaggtt 380  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  353 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtg-aagtgttacaaaaggtt 451  T
Q  381 acaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtg 479  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||    
T  452 acaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctaga-actaccctttggtattttcccactctcacactatgaacccaaaatcccaaggtg 550  T
Q  480 attacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccat 534  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||| ||| || |||||    
T  551 attacaatgtttttcccaacctaagaaactctctcatcaaaggcacacaccccat 605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 149224 - 148808
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  149224 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 149125  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  149124 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 149030  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  149029 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaag 148930  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  148929 ctttacacaagacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 148831  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  148830 cctaagatacactctcatcaaag 148808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 2519 - 2103
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  2519 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 2420  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||| ||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  2419 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaggaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 2325  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaag 400  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  2324 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaag 2225  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    ||||||||| ||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2224 ctttacacaagacaaaaccataga-tctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 2126  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  2125 cctaagatacactctcatcaaag 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 19433 - 19017
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  19433 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagc 19334  T
Q  208 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttga 302  Q
    | |||  ||| |||||||||||||||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19333 c-taagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttga 19239  T
Q  303 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagcct-tcaag 400  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  19238 cccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaagagttacaagaatctagcttatcaag 19139  T
Q  401 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaa 498  Q
    ||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  ||  ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  19138 ctttacacaagacaaaaccctaga-tctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataattccaaggtgattacaatgttgttttcccaa 19040  T
Q  499 cccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    || |||| ||||||||| |||||    
T  19039 cctaagaaacactctcatcaaag 19017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 87 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 14603 - 14161
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttcca--aagaaaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 182  Q
    ||||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |    
T  14603 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 14504  T
Q  183 tccaagcaaa-caacaacaaaacagccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--g 276  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |    
T  14503 tccaagctaatcaacaacaaaacagcc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacg 14409  T
Q  277 aacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaa 376  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  14408 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 14309  T
Q  377 g-gttacaagactctagcct-tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaaccca 474  Q
    | ||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || ||||    
T  14308 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctaga-cctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatccca 14210  T
Q  475 aggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14209 aggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 14161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 110 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 182233 - 181980
Alignment:
Q  110 aaccttcacaccaatga-aataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagcaaa-caacaacaaaacag 206  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||    
T  182233 aaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcctccaagctaatcaacaacaaaacag 182134  T
Q  207 ccctaa--ctagtgtatagcaaaaccacac-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaa--gaacaaaacaccgaacaagattgttg 301  Q
    || |||  ||| |||| |||||| |||||| ||||| |  |||    || ||||||||| || |||||||||  |||||||||||| | |||||||||||    
T  182133 cc-taagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaag---catacaagataaacgataaaagaaaacgaacaaaacaccaagcaagattgttg 182039  T
Q  302 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 360  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182038 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 181980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 427 - 521
Target Start/End: Complemental strand, 176925 - 176829
Alignment:
Q  427 ctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaacccaaggtgattacaatgt--ttttcccaacccaagagacactctcaacaaag 521  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  176925 ctaccctttggtaatttcccaacctcacactatgaacccataatcccaaggtgattacaatgttgttttcccaacctaagatacactctcatcaaag 176829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 180 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18157 - 17869
Alignment:
Q  180 gtctccaagcaaacaacaacaaaa--cagcccta-actagtgtatagcaaaaccacacaagagatcccaaagcacaaacaagataagcggtaaaagaaag 276  Q
    |||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||||  |||||   |||||||  ||||||||||||   ||| ||| |    
T  18157 gtctccaagcaa-caacaacaaaaaccagccctagactagtgtagagcaacaccaca--agagaatacaaagca--aacaagataagcaagaaaggaa-g 18064  T
Q  277 aacaaa-acaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18063 aacaaacacaccaaa-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 17965  T
Q  375 aaggttacaag-actctagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    | ||||||||| |   |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17964 agggttacaagaaaaatagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 17869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 292 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 23962
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaag-actc 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| |       
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagggttacaagaaaaa 24042  T
Q  390 tagccttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttggtattttcccactctcacaacatgaaccctaaaa 470  Q
    |||| | ||||| ||||||| ||||||  | ||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24041 tagcttgcaagc-ttacacaagaacaagtcatagtttctacccatttgtgtttccccactctcacaatatgaaccctaaaa 23962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 17818 - 17739
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  17818 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 17739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 23911 - 23832
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  23911 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagatcctctctacaaagacactcaaccctagagttccctcctttg 23832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 87 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34239 - 34132
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctcc 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  34239 tgttgtgaatccggttccaaagaaaccttcacaccaatgaaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctcc 34140  T
Q  186 aagcaaac 193  Q
    ||||||||    
T  34139 aagcaaac 34132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 137 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 487 - 300
Alignment:
Q  137 gatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtctccaagca--aacaacaacaaaacagccct-aactagtgtatagcaaaaccaca 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||||    
T  487 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagcaaaaatggtttccaagcaacaacaacaa-aaaacagccctaaactagtgaggagcaaaaccaca 389  T
Q  234 c-aagagatcccaaagcacaaacaagataagcggta-aaagaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgacccagttcagccaatatggcct 324  Q
    | |||||||   |||||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  388 caaagagataataaagca-aaacaagataagc--tagaaagaaagaacaaaacacc-aagaagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 4)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8420
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 8420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 8285 - 8208
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  8285 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccctaaagttccctcctttg 8208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 386
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85779
Alignment:
Q  293 agattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 85779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43962
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 43962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 36929 - 36833
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  36929 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatgaaagtgttacaaagagttacaaga 36833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 532
Target Start/End: Complemental strand, 36700 - 36640
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaaccc 532  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  36700 acccaaggtgtttacaatgtttt--ccaacccaagagatcctcactacaaagacactcaaccc 36640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5770
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 5770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 291 - 377
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2579
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag 377  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaag 2579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133281
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaaggttacaaga 386  Q
    ||||||||||||||||||  |  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||  |||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttacaaagagttacaaga 133281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 470 - 549
Target Start/End: Complemental strand, 133147 - 133070
Alignment:
Q  470 acccaaggtgattacaatgtttttcccaacccaagagacactctcaacaaagacactcaacccattggttccctcctttg 549  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||    |||||||||||||    
T  133147 acccaaggtgtttacaatgttt--cccaacccaagagatcctcactacaaagaaactcaaccctaaagttccctcctttg 133070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 51; Significance: 6e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 291 - 386
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10826
Alignment:
Q  291 caagattgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||| |||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 10826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 46; Significance: 6e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 87 - 172
Target Start/End: Original strand, 13141 - 13229
Alignment:
Q  87 tgttgtgaatccggttc--caaagaaaccttcacaccaatgaaataaat-aatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgaga 172  Q
    |||||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13141 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatgaaataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgaga 13229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 292 - 374
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45337
Alignment:
Q  292 aagattgttgacccagttcagc-caatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaa 374  Q
    |||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagcgttacaa 45337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 295 - 386
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17360
Alignment:
Q  295 attgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatga-gaaagtgttacaaaag-gttacaaga 386  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaaga 17360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 322 - 355
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  322 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 296 - 355
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  296 ttgttgacccagttcag-ccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 355  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University